Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	24391166	8834	7799	0.0076	NA	NA	NA	8.37312409364687e-42	24391166	24391166
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-1.7002	8.37312409364687e-42	24391166	24391166	3.70285319885891e-08	24395691	24395691
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	24485987	30	28	0.0083	3.70285319885891e-08	24395691	24395691	0.000105796918415092	24450563	24501862
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24489027	24527204	22	20	0.2097	0.000105796918415092	24450563	24501862	4.01358122428303e-06	24520058	24546901
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24528913	34869589	4006	3518	-0.002	4.01358122428303e-06	24520058	24546901	1.72059544828613e-13	34869589	34869589
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34878816	2	2	-0.972	1.72059544828613e-13	34869589	34869589	5.29207744337484e-14	34878816	34878816
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34881595	34883375	2	0	NA	5.29207744337484e-14	34878816	34878816	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72534975	14994	13141	-0.0037	NA	NA	NA	1.12775678700143e-39	72533856	72539143
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72536231	72579311	16	15	0.582	1.12775678700143e-39	72533856	72539143	3.16897545609237e-41	72571158	72589682
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	94060783	6990	6107	-0.0079	3.16897545609237e-41	72571158	72589682	5.8568256466386e-13	94060783	94060783
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-0.926	5.8568256466386e-13	94060783	94060783	2.58060173675933e-13	94062928	94062928
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	110023268	4711	4110	-0.0037	2.58060173675933e-13	94062928	94062928	1.27323006484049e-26	110023268	110023268
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	0.9094	1.27323006484049e-26	110023268	110023268	3.44099775716697e-24	110041712	110041712
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	143923947	3985	3524	0.0152	3.44099775716697e-24	110041712	110041712	7.41643132212209e-14	143829340	143928815
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143928815	144093719	7	6	0.3608	7.41643132212209e-14	143829340	143928815	1.14422615466661e-05	144003068	144105332
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	144099302	1	0	NA	1.14422615466661e-05	144003068	144105332	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099712	147306304	563	484	0.0152	NA	NA	NA	9.91022720169685e-50	147203277	147313991
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147644831	36	30	-0.4809	9.91022720169685e-50	147203277	147313991	4.97402918549032e-49	147497268	147847659
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147847659	150823073	1258	1103	-0.0085	4.97402918549032e-49	147497268	147847659	0	150823073	150836484
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	-2.916	0	150823073	150836484	2.79839380930468e-79	150846148	150851439
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	68	0.0284	2.79839380930468e-79	150846148	150851439	7.39130320985381e-19	151026228	151026228
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8021	7.39130320985381e-19	151026228	151026228	1.22082890648735e-18	151036435	151036435
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	151040463	2	0	NA	1.22082890648735e-18	151036435	151036435	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151042365	157133150	2677	2365	0.0021	NA	NA	NA	7.13261466642528e-63	157133150	157133150
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.0571	7.13261466642528e-63	157133150	157133150	4.70280750198231e-67	157136342	157136342
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3594	0.0031	4.70280750198231e-67	157136342	157136342	4.75710481597061e-11	167481271	167483267
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167506259	6	4	0.6062	4.75710481597061e-11	167481271	167483267	9.0903981496196e-12	167506259	167507882
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167507882	179014530	4582	4016	-0.0051	9.0903981496196e-12	167506259	167507882	1.37155263262991e-26	179014530	179014530
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179017844	179021834	3	3	-1.0511	1.37155263262991e-26	179014530	179014530	1.43942822855676e-28	179021834	179021834
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179023488	179023488	1	0	NA	1.43942822855676e-28	179021834	179021834	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179026073	181427692	923	808	0.0129	NA	NA	NA	1.17870514644218e-07	181427692	181427692
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	181429536	181431556	2	2	0.7002	1.17870514644218e-07	181427692	181427692	8.33703880118272e-08	181431556	181431556
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	181434214	192712721	3192	2774	-0.0037	8.33703880118272e-08	181431556	181431556	2.03593368830136e-09	192710566	192712721
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192715640	192715640	1	0	NA	2.03593368830136e-09	192710566	192712721	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-0.773	NA	NA	NA	6.75045605927382e-09	192719540	192719540
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	200598243	2643	2330	0.0106	6.75045605927382e-09	192719540	192719540	2.68277495284179e-14	200587846	200629099
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200701140	37	30	-0.2463	2.68277495284179e-14	200587846	200629099	2.11441789440771e-14	200672373	200804838
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200787319	200787319	1	0	NA	2.11441789440771e-14	200672373	200804838	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	227875096	9925	8676	0.0082	NA	NA	NA	2.62616774655463e-14	227875096	227875096
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	3	-0.7916	2.62616774655463e-14	227875096	227875096	1.27400444339563e-14	227882805	227882805
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	237866190	3736	3288	0.0032	1.27400444339563e-14	227882805	227882805	1.27389103118485e-12	237866190	237866190
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	237867621	237873835	2	2	-0.9047	1.27389103118485e-12	237866190	237866190	1.57416681593997e-11	237873835	237873835
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	237875245	247186514	3742	3253	-0.0136	1.57416681593997e-11	237873835	237873835	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	35821494	12024	10506	0.0041	NA	NA	NA	8.94474017393071e-23	35821494	35821494
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-1.2161	8.94474017393071e-23	35821494	35821494	1.56295381186342e-25	35844884	35844884
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37812045	884	772	9e-04	1.56295381186342e-25	35844884	35844884	5.44065285941864e-13	37797909	37819785
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37813211	37855837	21	19	-0.2796	5.44065285941864e-13	37797909	37819785	3.85039423377553e-11	37848754	37863712
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	86892655	16941	14800	4e-04	3.85039423377553e-11	37848754	37863712	5.46671047096283e-33	86887569	86894794
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	86894794	87136601	20	17	0.4982	5.46671047096283e-33	86887569	86894794	5.23132148319085e-33	86984833	87149187
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87149187	146571330	15182	13238	0.0049	5.23132148319085e-33	86984833	87149187	2.03315415999757e-12	146562545	146571330
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	0.6402	2.03315415999757e-12	146562545	146571330	2.42974672916283e-19	146592775	146592775
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	28660	6e-04	2.42974672916283e-19	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37953375	12681	11143	9e-04	NA	NA	NA	2.03868910928606e-28	37953375	37953375
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	4	-0.9527	2.03868910928606e-28	37953375	37953375	1.60475211867691e-28	37961110	37961110
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	45606401	2824	2497	0.0148	1.60475211867691e-28	37961110	37961110	1.28767794667286e-12	45606401	45606401
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	45608481	45610996	3	3	0.7659	1.28767794667286e-12	45606401	45606401	6.38345872775963e-13	45610996	45610996
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	45612874	129867158	26888	23627	0.0025	6.38345872775963e-13	45610996	45610996	2.31249766924196e-06	129857112	129872915
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129872915	129903593	10	9	-0.3179	2.31249766924196e-06	129857112	129872915	8.76060982650909e-07	129899070	129913114
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129904900	133189686	1297	1157	0.011	8.7606098265091e-07	129899070	129913114	4.81550104817802e-66	133189686	133189686
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-2.3137	4.81550104817802e-66	133189686	133189686	4.22066941389403e-82	133194685	133194685
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	8592	0.004	4.22066941389403e-82	133194685	133194685	1.29246890480078e-57	164005577	164005577
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-1.3513	1.29246890480078e-57	164005577	164005577	1.87899552517167e-16	164027724	164027724
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	17	-0.3969	1.87899552517167e-16	164027724	164027724	4.54454392193045e-21	164093750	164121847
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	8376	0.0027	4.54454392193045e-21	164093750	164121847	2.88796450711746e-13	192546280	192546280
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192548135	1	0	NA	2.88796450711746e-13	192546280	192546280	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192549325	192552734	3	3	-0.7583	NA	NA	NA	1.18756732813744e-13	192552734	192554451
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	494	-0.0206	1.18756732813744e-13	192552734	192554451	1.16391339942814e-231	194354505	194360242
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	5	-3.4678	1.16391339942814e-231	194354505	194360242	1.82952839032523e-306	194362272	194366950
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196810503	994	861	0.0126	1.82952839032523e-306	194362272	194366950	8.61167376481888e-22	196805434	196904349
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196820428	196961238	33	28	0.3234	8.61167376481888e-22	196805434	196904349	1.65432723321528e-22	196950095	196968244
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	852	-0.0114	1.65432723321528e-22	196950095	196968244	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	61552	10	9	0.3888	NA	NA	NA	1.75026712584159e-08	61552	81744
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	65688	9815760	3383	2933	0.0183	1.75026712584159e-08	61552	81744	0	9815760	9815760
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	3	-3.9853	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34425046	6164	5412	-0.0091	0	9842644	9842644	4.86562195449004e-12	34418775	34433787
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34433787	34485596	8	7	-0.4789	4.86562195449004e-12	34418775	34433787	1.3425754539444e-11	34479475	34506297
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34491115	68905670	8864	7764	-0.0129	1.3425754539444e-11	34479475	34506297	1.36863085242731e-113	68905670	68905670
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.9935	1.36863085242731e-113	68905670	68905670	1.41671296279195e-113	69165814	69165814
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173224400	31193	27225	-0.0078	1.41671296279195e-113	69165814	69165814	0	173224400	173224400
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.6191	0	173224400	173224400	0	173228860	173228860
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	190756763	5417	4738	-0.0107	0	173228860	173228860	8.30834693436505e-16	190692881	190784435
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190761029	190930709	60	54	0.1822	8.30834693436505e-16	190692881	190784435	1.68850102845585e-09	190910126	190950585
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190936155	191153613	42	39	-0.0158	1.68850102845585e-09	190910126	190950585	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12837736	3972	3452	0.0066	NA	NA	NA	7.71599875432435e-11	12837736	12853151
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12840501	12840501	1	0	NA	7.71599875432435e-11	12837736	12853151	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12853151	12866038	3	3	0.7087	NA	NA	NA	6.32461181892594e-12	12857302	12866038
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12873052	32141434	4754	4199	-0.0114	6.32461181892594e-12	12857302	12866038	3.17170722426523e-67	32139800	32146491
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32143140	32203336	32	28	0.5388	3.17170722426523e-67	32139800	32146491	1.34651185550457e-65	32199918	32206845
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32206845	72845576	10970	9642	-0.0053	1.34651185550457e-65	32199918	32206845	5.13457003936216e-10	72844351	72848204
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	72846906	72854418	5	4	0.5736	5.13457003936216e-10	72844351	72848204	3.44165034114598e-10	72848204	72856646
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	72856646	140533456	20487	17973	-0.0018	3.44165034114598e-10	72848204	72856646	1.58966819583411e-25	140533456	140533456
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	1.2544	1.58966819583411e-25	140533456	140533456	2.36381226394792e-24	140538666	140538666
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	150156233	3622	3167	0.0107	2.36381226394792e-24	140538666	140538666	1.71472150360344e-18	150156233	150156233
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150161037	2	2	-1.077	1.71472150360344e-18	150156233	150156233	1.12986740410486e-42	150161037	150161037
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150162435	150181399	4	4	-0.0669	1.12986740410486e-42	150161037	150161037	1.4181482109654e-39	150181399	150181399
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150201145	6	6	-0.7876	1.4181482109654e-39	150181399	150181399	1.37910086407168e-29	150201145	150201145
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150202601	150202601	1	0	NA	1.37910086407168e-29	150201145	150201145	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	155404062	1621	1419	0.0103	NA	NA	NA	2.53250031219403e-09	155401645	155404062
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155405839	155405839	1	0	NA	2.53250031219403e-09	155401645	155404062	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	3	0.6554	NA	NA	NA	2.08108956455434e-09	155421443	155427589
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180342860	8158	7180	0.0037	2.08108956455434e-09	155421443	155427589	1.07063527034689e-10	180192214	180342860
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	7	-0.4494	1.07063527034689e-10	180192214	180342860	3.69007483133964e-08	180358977	180365977
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180362342	1	0	NA	3.69007483133964e-08	180358977	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	97	0.013	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	200350	39	33	0.062	NA	NA	NA	1.57805567946256e-20	191387	202063
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	15	0.531	1.57805567946256e-20	191387	202063	7.24495950680153e-08	234115	244363
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	288930	25	22	0.2624	7.24495950680153e-08	234115	244363	4.52450723290117e-14	284743	297953
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	290771	26811016	9285	8152	0.002	4.52450723290117e-14	284743	297953	1.31951452504385e-12	26811016	26811016
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	3	-0.7374	1.31951452504385e-12	26811016	26811016	1.27832268847442e-12	26861184	26861184
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29950805	1217	1058	0.0035	1.27832268847442e-12	26861184	26861184	2.50068767836318e-13	29935438	29992946
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30040917	23	21	0.2986	2.50068767836318e-13	29935438	29992946	5.08615364416426e-10	30010234	30054565
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30046181	32558677	1067	943	0.0149	5.08615364416426e-10	30010234	30054565	1.67648271643622e-164	32558677	32558677
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	9	1.7137	1.67648271643622e-164	32558677	32558677	0.000487618560842033	32600962	32626619
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	32633691	7	7	0.682	0.000487618560842033	32600962	32626619	0.00265725386663475	32613538	32634977
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32707427	25	21	-0.0121	0.00265725386663475	32613538	32634977	0.000913971088650895	32686456	32713363
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32709263	32728487	11	9	0.4127	0.000913971088650895	32686456	32713363	6.62824649761204e-11	32723366	32732764
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	7226	0.0036	6.62824649761204e-11	32723366	32732764	0	54035000	54035000
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.0447	0	54035000	54035000	0	54042734	54042734
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	66453686	2632	2286	-0.0058	0	54042734	54042734	5.25206634916428e-12	66453686	66453686
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66456250	66460548	2	2	-0.8607	5.25206634916428e-12	66453686	66453686	7.00074447362318e-11	66460548	66460548
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66461980	67078860	139	128	-0.0203	7.00074447362318e-11	66460548	66460548	6.80202389651705e-22	67078860	67078860
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67086412	67105238	4	4	-0.883	6.80202389651705e-22	67078860	67078860	4.66063574872002e-24	67105238	67105238
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	72919733	1758	1534	-0.0044	4.66063574872002e-24	67105238	67105238	8.19420014756502e-22	72919733	72919733
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-0.9696	8.19420014756502e-22	72919733	72919733	4.74423263513567e-24	72924440	72924440
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	74647491	750	652	-0.021	4.74423263513567e-24	72924440	72924440	3.78152294848141e-12	74647491	74647491
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	0.8106	3.78152294848141e-12	74647491	74647491	4.89925620211933e-11	74653360	74653360
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	77484980	859	756	-0.0129	4.89925620211933e-11	74653360	74653360	4.18035238634599e-07	77468091	77504936
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77490500	77490500	1	0	NA	4.18035238634599e-07	77468091	77504936	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77551944	8	7	-0.3705	NA	NA	NA	7.14574537248028e-07	77525039	77579261
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77558013	77558013	1	0	NA	7.14574537248028e-07	77525039	77579261	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77560692	79018959	273	235	-0.0193	NA	NA	NA	1.59971521443446e-20	79015901	79024557
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79095415	14	13	0.4237	1.59971521443446e-20	79015901	79024557	4.45271060350422e-18	79091850	79105311
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79101978	170753106	29679	25938	-0.0042	4.45271060350422e-18	79091850	79105311	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1037402	259	217	0.0105	NA	NA	NA	2.36813128236811e-06	1032351	1037402
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1038517	1038517	1	0	NA	2.36813128236811e-06	1032351	1037402	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1050231	4	4	0.5146	NA	NA	NA	1.99485317626207e-07	1050231	1051367
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1051367	16135701	5124	4520	-0.0053	1.99485317626207e-07	1050231	1051367	1.2424975777422e-08	16132924	16135701
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	0.7831	1.2424975777422e-08	16132924	16135701	4.59440269035116e-09	16140018	16140018
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	16141776	1	0	NA	4.59440269035116e-09	16140018	16140018	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16145480	38258332	8209	7219	0.0038	NA	NA	NA	8.0340133662818e-16	38251281	38270942
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38262701	38335964	38	30	0.2663	8.0340133662818e-16	38251281	38270942	1.06123425252247e-16	38329228	38345457
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	45444609	2533	2191	-5e-04	1.06123425252247e-16	38329228	38345457	2.03519243264949e-15	45444609	45444609
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45449329	45453517	2	2	-0.9868	2.03519243264949e-15	45444609	45444609	1.46421138884644e-14	45453517	45453517
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45462921	45462921	1	0	NA	1.46421138884644e-14	45453517	45453517	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	45488118	52276932	1837	1604	0.0145	NA	NA	NA	6.09862568364399e-10	52273151	52279938
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52279938	52287180	3	3	0.6995	6.09862568364399e-10	52273151	52279938	1.98881094086117e-11	52284751	52287180
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52289210	52289210	1	0	NA	1.98881094086117e-11	52284751	52287180	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52290833	93162991	10433	9160	-0.0116	NA	NA	NA	1.28135270850497e-09	93162991	93162991
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.7908	1.28135270850497e-09	93162991	93162991	8.36191552639234e-10	93168978	93168978
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	100162851	2611	2283	-0.0073	8.36191552639234e-10	93168978	93168978	2.07402084833969e-15	100160244	100162851
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100164752	100164752	1	0	NA	2.07402084833969e-15	100160244	100162851	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.7086	NA	NA	NA	2.30751761925363e-14	100174991	100178968
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109217320	3895	3378	-0.0104	2.30751761925363e-14	100174991	100178968	3.01598488563404e-07	109216032	109217320
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109240210	5	4	-0.515	3.01598488563404e-07	109216032	109217320	1.25141558569983e-07	109240210	109245944
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	109967918	301	271	-0.0161	1.25141558569983e-07	109240210	109245944	4.05257000780155e-07	109966116	109967918
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-0.6961	4.05257000780155e-07	109966116	109967918	7.86514594524721e-08	109974402	109976628
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3495	-0.001	7.86514594524721e-08	109974402	109976628	2.80365684743981e-10	118611324	118611324
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118619693	2	2	0.7894	2.80365684743981e-10	118611324	118611324	7.81911305596857e-10	118619693	118619693
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118620875	118622742	2	0	NA	7.81911305596857e-10	118619693	118619693	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118629597	133432281	6825	5992	-0.0022	NA	NA	NA	1.00691399357396e-22	133426996	133432281
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133433384	133433384	1	0	NA	1.00691399357396e-22	133426996	133432281	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.5894	NA	NA	NA	1.07567506184547e-21	133448277	133453811
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3247	-0.0014	1.07567506184547e-21	133448277	133453811	8.59879057101095e-59	141410894	141414719
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	10	-0.8682	8.59879057101095e-59	141410894	141414719	3.83237385417553e-38	141434131	141438504
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141440184	1	0	NA	3.83237385417553e-38	141434131	141438504	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	99	0.0035	NA	NA	NA	7.24727909409285e-135	141690753	141690753
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.4673	7.24727909409285e-135	141690753	141690753	1.37523190579617e-160	141714168	141714168
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	1.37523190579617e-160	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2205	-0.0027	NA	NA	NA	7.34540299608065e-148	147702365	147702365
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.1494	7.34540299608065e-148	147702365	147702365	1.29199575750094e-151	147707161	147707161
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	157604480	3724	3249	0.0081	1.29199575750094e-151	147707161	147707161	1.49058387183524e-05	157596077	157613345
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	157606966	157606966	1	0	NA	1.49058387183524e-05	157596077	157613345	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	157609084	157628156	10	9	-0.2907	NA	NA	NA	6.91903116557124e-06	157622108	157639882
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	157629639	158821263	503	430	0.0053	6.91903116557124e-06	157622108	157639882	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	16304869	5295	4648	-0.0026	NA	NA	NA	1.37092844352662e-10	16304869	16304869
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16309306	16315130	2	2	-0.8569	1.37092844352662e-10	16304869	16304869	1.56822138263190e-10	16315130	16315130
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16373516	39350798	7777	6768	-0.0033	1.5682213826319e-10	16315130	16315130	8.84914743128803e-130	39345557	39354149
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	52	0.5707	8.84914743128803e-130	39345557	39354149	5.59894457430425e-136	39504332	39508035
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	27506	3e-04	5.59894457430425e-136	39504332	39508035	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	4838	-0.0057	NA	NA	NA	1.29045165853071e-52	15802255	15802255
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.8379	1.29045165853071e-52	15802255	15802255	1.13276555055945e-56	15807123	15807123
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	15813356	1	0	NA	1.13276555055945e-56	15807123	15807123	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	22477358	2376	2072	-0.0124	NA	NA	NA	6.16646732431942e-35	22477358	22477358
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.4458	6.16646732431942e-35	22477358	22477358	2.25981185280059e-33	22492603	22492603
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	22499541	1	0	NA	2.25981185280059e-33	22492603	22492603	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22502565	23343915	160	143	-0.0136	NA	NA	NA	1.22254869609675e-257	23343915	23343915
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.3255	1.22254869609675e-257	23343915	23343915	9.23518364397545e-254	23365926	23365926
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39130211	4727	4139	-0.0077	9.23518364397545e-254	23365926	23365926	1.19045471193523e-07	38716226	45359327
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39146895	70223138	32	26	0.1962	1.19045471193523e-07	38716226	45359327	3.76396538848305e-05	67907649	70263525
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70225166	70225166	1	0	NA	3.76396538848305e-05	67907649	70263525	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70227334	70926188	309	268	0.0263	NA	NA	NA	0	70926188	70926188
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.7962	0	70926188	70926188	0	70930528	70930528
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	78959163	3005	2613	-0.0057	0	70930528	70930528	3.60479548225757e-11	78959163	78959163
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	78961754	78966636	3	3	0.6873	3.60479548225757e-11	78959163	78959163	2.06863550903147e-10	78966636	78966636
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	78970032	125874393	16027	14070	-9e-04	2.06863550903147e-10	78966636	78966636	9.11205866489025e-06	125854953	125874393
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	125876712	125876712	1	0	NA	9.11205866489025e-06	125854953	125874393	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	125880077	125985140	13	10	-0.2898	NA	NA	NA	2.29822924391588e-06	125985140	126036738
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	125999160	125999160	1	0	NA	2.29822924391588e-06	125985140	126036738	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	126003794	137352394	4715	4125	0.0108	NA	NA	NA	2.6052320356999e-170	137352394	137352394
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-3.4768	2.6052320356999e-170	137352394	137352394	2.84773581136386e-157	137356880	137356880
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	975	0.0076	2.84773581136386e-157	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	31341908	11319	9949	-0.0055	NA	NA	NA	1.00465637376613e-11	31340572	31341908
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31344233	31352180	5	5	0.5498	1.00465637376613e-11	31340572	31341908	5.68963031287431e-11	31352180	31354376
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31354376	78123731	13319	11709	-0.0045	5.68963031287431e-11	31352180	31354376	1.97616558741512e-12	78123731	78123731
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	78127505	78132093	2	2	-0.9338	1.97616558741512e-12	78123731	78123731	5.98141705795431e-13	78132093	78132093
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	78152894	108551868	10884	9574	0	5.98141705795431e-13	78132093	78132093	1.19301243888960e-18	108551868	108551868
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	108553461	108553461	1	0	NA	1.1930124388896e-18	108551868	108551868	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	108555187	108558809	3	3	-0.9074	NA	NA	NA	3.87304442645942e-20	108558809	108558809
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	108560401	114100979	1454	1279	0.0032	3.87304442645942e-20	108558809	108558809	1.98843435989479e-10	114100979	114100979
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	0.8144	1.98843435989479e-10	114100979	114100979	1.10077157086098e-09	114106460	114106460
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	114108041	1	0	NA	1.10077157086098e-09	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114109303	132797428	6882	6061	0.0144	NA	NA	NA	6.57546342098638e-12	132797428	132797428
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	0.8963	6.57546342098638e-12	132797428	132797428	4.91621977492756e-11	132801463	132801463
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135082051	878	754	0.0185	4.91621977492756e-11	132801463	132801463	2.4289668592441e-80	135066116	135104029
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135084777	135084777	1	0	NA	2.4289668592441e-80	135066116	135104029	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135085997	135229796	46	44	0.5377	NA	NA	NA	1.97905960557765e-06	135217656	135254461
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135252519	135281503	7	7	0.0683	1.97905960557765e-06	135217656	135254461	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135284109	135285645	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	2020604	741	655	0.0077	NA	NA	NA	4.05317633704126e-06	2002328	2022931
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2022931	2043108	7	7	-0.3622	4.05317633704126e-06	2002328	2022931	5.4955291531553e-06	2040532	2073899
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2048826	2051903	2	0	NA	5.4955291531553e-06	2040532	2073899	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	2063502	4923300	1022	884	0.0124	NA	NA	NA	7.99207720965119e-12	4915039	4923300
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.6023	7.99207720965119e-12	4915039	4923300	2.01376775316502e-13	4932214	4934594
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55118214	15128	13258	0.0022	2.01376775316502e-13	4932214	4934594	6.1530948830358e-71	55114405	55124730
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55221692	42	34	0.5244	6.1530948830358e-71	55114405	55124730	1.05040724266349e-71	55207305	55223056
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55223056	134450318	28357	24869	0.003	1.05040724266349e-71	55207305	55223056	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3293	9e-04	NA	NA	NA	0	9523923	9523923
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	4	-4.0446	0	9523923	9523923	3.65711791845826e-21	9554149	9554149
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9555181	1	0	NA	3.65711791845826e-21	9554149	9554149	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9563866	9604633	8	6	-0.9032	NA	NA	NA	2.96972539872746e-35	9604633	9604633
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9607363	9610054	2	0	NA	2.96972539872746e-35	9604633	9604633	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11104973	567	495	-0.0063	NA	NA	NA	5.68522112454375e-07	11104085	11104973
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11116883	4	3	0.5554	5.68522112454375e-07	11104085	11104973	9.7583415246005e-34	11116883	11116883
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	4	1.573	9.7583415246005e-34	11116883	11116883	2.59356576333763e-50	11130871	11130871
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11143592	2	0	NA	2.59356576333763e-50	11130871	11130871	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11147675	11393473	68	57	-0.001	NA	NA	NA	1.04978240672661e-07	11387995	11393473
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11395862	11395862	1	0	NA	1.04978240672661e-07	11387995	11393473	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-0.5521	NA	NA	NA	3.79790063851022e-11	11435643	11440927
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	31084265	6740	5892	-0.005	3.79790063851022e-11	11435643	11440927	7.53996416336651e-19	31077480	31132762
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31098259	31233136	19	19	-0.3667	7.53996416336651e-19	31077480	31132762	1.21959326246904e-18	31225941	31248212
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31237505	31237505	1	0	NA	1.21959326246904e-18	31225941	31248212	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	120553385	29784	26142	-0.0074	NA	NA	NA	3.74498425699486e-08	120530857	120559848
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	120554822	120624086	30	28	-0.2094	3.74498425699486e-08	120530857	120559848	4.33514021465672e-08	120616576	120656264
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	120625658	130694393	3529	3098	-0.0066	4.33514021465672e-08	120616576	120656264	6.42027005555982e-10	130694393	130694393
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.8275	6.42027005555982e-10	130694393	130694393	1.929424648446e-09	130701040	130718440
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	557	-0.0099	1.929424648446e-09	130701040	130718440	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33030946	5595	4878	-1e-04	NA	NA	NA	5.9473746547702e-28	33030946	33030946
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-1.103	5.9473746547702e-28	33030946	33030946	1.18980174530672e-28	33042557	33042557
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	37953582	1740	1550	0.0021	1.18980174530672e-28	33042557	33042557	0	37953582	37953582
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.6543	0	37953582	37953582	0	37957844	37957844
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56650373	6685	5873	-0.0021	0	37957844	37957844	1.86495360983494e-19	56610886	56650373
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	15	0.4028	1.86495360983494e-19	56610886	56650373	2.40205764581083e-20	56686863	56688605
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	68142120	2693	2371	-0.0057	2.40205764581083e-20	56686863	56688605	7.119549192769e-48	68142120	68142120
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	8	-0.8576	7.119549192769e-48	68142120	68142120	1.21165588535559e-42	68163523	68163523
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	70809457	644	567	-0.0183	1.21165588535559e-42	68163523	68163523	1.62506745930717e-19	70809457	70809457
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	70814916	70819824	2	2	-1.1505	1.62506745930717e-19	70809457	70809457	9.70618988295697e-20	70819824	70819824
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	70824802	71375082	273	244	0.0161	9.70618988295697e-20	70819824	70819824	4.28354914944361e-321	71375082	71375082
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.6871	4.28354914944361e-321	71375082	71375082	0	71377671	71377671
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	97840033	8058	7074	-0.0071	0	71377671	71377671	2.95308083210688e-08	97827784	97856071
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97841189	97898611	30	26	0.1941	2.95308083210688e-08	97827784	97856071	3.6781944961921e-07	97876037	97915079
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97899988	100690991	1327	1183	0.006	3.6781944961921e-07	97876037	97915079	1.10335910767311e-55	100690991	100690991
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.8214	1.10335910767311e-55	100690991	100690991	7.57362256838876e-53	100693892	100693892
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113571085	4354	3789	0.0029	7.57362256838876e-53	100693892	100693892	3.11194177230893e-08	113571085	113571085
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113574877	113576560	2	2	0.742	3.11194177230893e-08	113571085	113571085	8.72432622278512e-06	113576560	113577853
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113577853	114123340	206	170	0.0221	8.72432622278512e-06	113576560	113577853	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18537177	5	4	0.6082	NA	NA	NA	8.63009150902576e-06	18527871	18864561
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18544772	18544772	1	0	NA	8.63009150902576e-06	18527871	18864561	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19538610	57	51	0.156	NA	NA	NA	3.8656092244779e-11	19475864	19566615
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19540294	21440580	947	825	-0.0246	3.8656092244779e-11	19475864	19566615	9.33372595960451e-85	21426967	21451210
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21443020	22059557	308	265	0.2198	9.33372595960451e-85	21426967	21451210	6.65011596419558e-108	22046097	22073028
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22061243	22061243	1	0	NA	6.65011596419558e-108	22046097	22073028	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22062453	64082640	14133	12348	-0.0062	NA	NA	NA	2.86901286150459e-07	64080611	64082640
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64084922	64084922	1	0	NA	2.86901286150459e-07	64080611	64082640	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64087420	64090553	3	3	0.5645	NA	NA	NA	5.70541165253943e-07	64090553	64092458
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64092458	79174722	6885	6006	0.0025	5.70541165253943e-07	64090553	64092458	9.08320885673475e-08	79172702	79176037
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-0.5092	9.08320885673475e-08	79172702	79176037	8.68131743395691e-08	79180204	79185548
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	82594434	1059	934	-0.0118	8.6813174339569e-08	79180204	79185548	4.17781328609256e-10	82586816	82594434
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	82596960	82598594	2	2	-0.8098	4.17781328609256e-10	82586816	82594434	6.61197119391726e-10	82598594	82598594
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	82600752	96409644	4761	4186	0.0028	6.61197119391726e-10	82598594	82598594	3.80373915038763e-08	96408258	96412034
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	96410653	96419065	5	5	-0.4662	3.80373915038763e-08	96408258	96412034	7.71994970139431e-08	96413738	96421089
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	96421089	105595302	3469	3084	0.0097	7.71994970139431e-08	96413738	96421089	7.78927555776078e-16	105592583	105602602
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105597555	1	0	NA	7.78927555776078e-16	105592583	105602602	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-0.4392	NA	NA	NA	9.79206809034285e-05	105623070	105736025
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105804040	31	29	-0.1185	9.79206809034285e-05	105623070	105736025	4.21719008532318e-05	105789767	105823416
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105805371	105904455	30	29	0.118	4.21719008532318e-05	105789767	105823416	0.00150477349425261	105875924	105916075
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105906483	105923686	8	6	-0.183	0.00150477349425261	105875924	105916075	7.55299628758142e-13	105923686	105945006
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	105998412	19	17	0.3831	7.55299628758142e-13	105923686	105945006	7.13004803946888e-16	105994646	106013552
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106002179	106214372	89	81	0.0011	7.13004803946888e-16	105994646	106013552	1.96086561981726e-07	106199156	106232699
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106279632	25	23	-0.2364	1.96086561981726e-07	106199156	106232699	5.67544858364856e-09	106260876	106285879
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106280415	106358491	29	24	0.1062	5.67544858364856e-09	106260876	106285879	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18824622	11	11	0.1781	NA	NA	NA	1.50944633851068e-06	18810004	18824622
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18826924	18874259	15	12	-0.1246	1.50944633851068e-06	18810004	18824622	8.91427356567936e-05	18874259	19137963
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18876677	19882711	87	70	0.1598	8.91427356567936e-05	18874259	19137963	3.36751677066168e-13	19424067	19983398
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	39274290	6112	5346	-0.0012	3.36751677066168e-13	19424067	19983398	4.17400230983695e-08	39270740	39284893
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39275397	39290354	7	6	-0.4346	4.17400230983695e-08	39270740	39284893	1.64874205359593e-07	39277062	39296314
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39290931	41638388	1278	1132	-0.0167	1.64874205359593e-07	39277062	39296314	1.33646002105190e-29	41638388	41638388
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41676219	41706959	6	6	0.7928	1.3364600210519e-29	41638388	41638388	1.22446750374833e-28	41706959	41706959
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41711522	74669752	14195	12444	-6e-04	1.22446750374833e-28	41706959	41706959	4.0917658951614e-20	74669752	74669752
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.8181	4.0917658951614e-20	74669752	74669752	3.51034900316298e-19	74680439	74680439
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	95609756	7615	6664	0.0066	3.51034900316298e-19	74680439	74680439	4.7917001003817e-40	95609756	95609756
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95616750	1	0	NA	4.7917001003817e-40	95609756	95609756	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95617561	95632390	5	5	-1.0326	NA	NA	NA	4.31351396940409e-41	95632390	95632390
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	100298352	1986	1761	0.0071	4.31351396940409e-41	95632390	95632390	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	9248	-0.0103	NA	NA	NA	2.33038190227806e-63	31862577	32481309
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	39	0.4512	2.33038190227806e-63	31862577	32481309	2.02211991171983e-63	33538171	33647856
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	75093957	9906	8688	-0.0058	2.02211991171983e-63	33538171	33647856	4.41663340890384e-11	75093957	75093957
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75099083	2	2	0.8587	4.41663340890384e-11	75093957	75093957	1.56312685499708e-10	75099083	75099083
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75100865	88690571	5132	4472	0.0054	1.56312685499708e-10	75099083	75099083	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	370	-0.0408	NA	NA	NA	5.31768552986967e-16	1028979	1028979
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.0229	5.31768552986967e-16	1028979	1028979	4.09796730875429e-17	1030766	1030766
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1903358	434	393	-0.029	4.09796730875429e-17	1030766	1030766	4.90430655618279e-11	1903358	1903358
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1904451	1	0	NA	4.90430655618279e-11	1903358	1903358	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	2	0.8212	NA	NA	NA	2.69372865135618e-09	1906391	1906391
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	28816095	10114	8903	1e-04	2.69372865135618e-09	1906391	1906391	1.96321225289095e-10	28816095	28816095
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	28819328	28819328	1	0	NA	1.96321225289095e-10	28816095	28816095	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	28820893	28822011	2	2	-0.8667	NA	NA	NA	2.97480271535560e-11	28822011	28822011
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	28824466	31451114	1062	924	0.0063	2.9748027153556e-11	28822011	28822011	5.15187568991356e-22	31443186	31462463
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31457889	31457889	1	0	NA	5.15187568991356e-22	31443186	31462463	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.4022	NA	NA	NA	4.00776077112889e-20	31490899	31893451
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	41007660	3629	3188	-0.0026	4.00776077112889e-20	31490899	31893451	1.48360756940894e-09	40869151	41015177
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41011530	41062669	6	5	-0.5317	1.48360756940894e-09	40869151	41015177	7.97199120288622e-09	41062669	41066163
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41066163	41519702	197	169	0.012	7.97199120288622e-09	41062669	41066163	8.63838603276117e-14	41514481	41522429
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41521544	1	0	NA	8.63838603276117e-14	41514481	41522429	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41566540	20	17	-0.3475	NA	NA	NA	1.05613084850757e-09	41562786	41572001
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	43	-0.6856	1.05613084850757e-09	41562786	41572001	5.68427294524564e-152	41708551	41710400
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	12017	0	5.68427294524564e-152	41708551	41710400	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	40226609	11794	10374	-0.0059	NA	NA	NA	1.37331607007567e-17	40226609	40226609
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40230827	40230827	1	0	NA	1.37331607007567e-17	40226609	40226609	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40233436	40235901	2	2	-1.0672	NA	NA	NA	2.92993243280423e-17	40235901	40235901
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40244566	42780631	996	870	0.0107	2.92993243280423e-17	40235901	40235901	1.20634043739175e-11	42779279	42780631
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	42782777	42782777	1	0	NA	1.20634043739175e-11	42779279	42780631	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	42784219	42794592	6	5	0.5727	NA	NA	NA	1.37802546874037e-12	42794592	42812186
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	42812186	53092949	3399	2968	-0.0042	1.37802546874037e-12	42794592	42812186	2.23925844049119e-43	53092949	53092949
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.6995	2.23925844049119e-43	53092949	53092949	5.8646649030362e-32	53099601	53099601
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	54022090	353	316	-0.0138	5.8646649030362e-32	53099601	53099601	2.90636494394832e-19	54022090	54022090
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54023539	54027809	3	2	1.1414	2.90636494394832e-19	54022090	54022090	2.4797376702423e-19	54027809	54027809
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54029609	76116026	6407	5612	-8e-04	2.4797376702423e-19	54027809	54027809	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1395246	491	436	-0.0011	NA	NA	NA	6.03722344731365e-15	1395246	1395246
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1398325	1398325	1	0	NA	6.03722344731365e-15	1395246	1395246	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.1304	NA	NA	NA	5.50618057966346e-17	1400840	1400840
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	4788575	1614	1413	-0.0287	5.50618057966346e-17	1400840	1400840	9.44872916627697e-23	4788575	4788575
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4789893	4795870	3	3	-1.122	9.44872916627697e-23	4788575	4788575	4.40889822806151e-25	4795870	4795870
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4799466	59006399	18730	16318	-0.0232	4.40889822806151e-25	4795870	4795870	7.18894243803724e-07	59005579	59006399
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59009788	59009788	1	0	NA	7.18894243803724e-07	59005579	59006399	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59009969	59009984	2	2	0.7112	NA	NA	NA	3.16698261414898e-09	59009984	59013780
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59013780	59246409	122	115	-0.0685	3.16698261414898e-09	59009984	59013780	8.8226325091451e-09	59246409	59246409
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	2	-0.8302	8.8226325091451e-09	59246409	59246409	5.85602744755763e-11	59251831	59253728
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	59414898	86	75	-0.0125	5.85602744755763e-11	59251831	59253728	2.56693435321832e-08	59411618	59424729
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.3536	2.56693435321832e-08	59411618	59424729	1.79311691970549e-07	59433190	59441741
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1706	-0.0294	1.79311691970549e-07	59433190	59441741	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	526	-0.0102	NA	NA	NA	5.21426534090106e-89	1506379	1506379
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	1.1501	5.21426534090106e-89	1506379	1506379	1.75227654392315e-90	1532433	1532433
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	1544485	1	0	NA	1.75227654392315e-90	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1546858	62419534	20982	18358	0.0073	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	18087499	1533	1369	2e-04	NA	NA	NA	1.73312755056449e-09	18087499	18087499
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	18088897	18091232	2	2	0.7767	1.73312755056449e-09	18087499	18087499	2.14726461316924e-09	18091232	18091232
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	18092798	32545895	4927	4348	-0.0132	2.14726461316924e-09	18091232	18091232	4.83463486411745e-28	32545895	32545895
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	32548748	32554109	4	4	-0.9587	4.83463486411745e-28	32545895	32545895	2.08211145736797e-27	32554109	32554109
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	32556131	46922972	6975	6089	0.0142	2.08211145736797e-27	32554109	32554109	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	49571068	16557	14491	0.0087	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	3237	3	3	-0.035	NA	NA	NA	0.000201031330197698	3237	4926
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	4893	106242	11	9	0.6763	0.000201031330197698	3237	4926	2.57395501753882e-23	104486	108902
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	742385	482	411	-0.0253	2.57395501753882e-23	104486	108902	6.52169797013385e-07	739199	742385
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	742470	747220	3	3	-0.6892	6.52169797013385e-07	739199	742385	1.09678658786610e-08	747220	747220
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	747837	774894	19	15	0.0099	1.0967865878661e-08	747220	747220	0.00215075286404633	765191	780855
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	775073	797536	16	16	0.2206	0.00215075286404633	765191	780855	0.000263944805139245	788996	811913
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	800669	849437	35	32	-0.0103	0.000263944805139245	788996	811913	1.87453124451093e-11	848806	849437
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	851066	859452	7	5	0.5973	1.87453124451093e-11	848806	849437	5.69606183876348e-13	859452	859493
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	1894973	564	496	-0.0363	5.69606183876348e-13	859452	859493	1.99312229616399e-08	1892736	1894973
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1895343	1898078	2	2	-0.8474	1.99312229616399e-08	1892736	1894973	6.06928539325251e-08	1898078	1901223
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1901223	2708291	651	578	-0.0299	6.06928539325251e-08	1898078	1901223	0	2708291	2711273
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	2962174	107	94	0.7994	0	2708291	2711273	2.11502269305613e-06	2959695	2965671
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2963896	2987012	5	5	0.2218	2.11502269305613e-06	2959695	2965671	5.4577900468441e-22	2985133	2994172
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2994172	13679455	3963	3444	0.898	5.4577900468441e-22	2985133	2994172	2.75540892932893e-18	13677276	13679455
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13681110	13686085	3	2	-0.0783	2.75540892932893e-18	13677276	13679455	2.38058897902105e-11	13686085	13686085
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13688061	33948621	7911	6934	0.9135	2.38058897902105e-11	13686085	13686085	3.03095367157447e-18	33939974	33948621
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33953232	33981492	5	5	0.1264	3.03095367157447e-18	33939974	33948621	9.70255557149695e-16	33981492	33988646
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33988646	52909690	5888	5195	0.8997	9.70255557149695e-16	33981492	33988646	7.25610721399672e-10	52909690	52909690
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	52921839	52921841	2	2	-0.0789	7.25610721399672e-10	52909690	52909690	3.83912232939663e-09	52921841	52968251
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	52968251	82683914	6003	5216	0.8819	3.83912232939663e-09	52921841	52968251	6.03802611979944e-20	82683914	82683914
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	82692561	82692561	1	0	NA	6.03802611979944e-20	82683914	82683914	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	82696516	82703351	4	4	-0.1051	NA	NA	NA	1.12375477322557e-22	82703351	82703351
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	82713359	154038318	21109	18412	0.9036	1.12375477322557e-22	82703351	82703351	9.94656623287108e-05	154019921	154046681
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	10	1.2154	9.94656623287108e-05	154019921	154046681	8.50117383696122e-06	154070953	154093013
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	79	0.9062	8.50117383696122e-06	154070953	154093013	2.54035067198923e-192	154442377	154442377
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-2.298	2.54035067198923e-192	154442377	154442377	3.92713074829393e-177	154450309	154450309
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.8761	3.92713074829393e-177	154450309	154450309	2.2930300719084e-162	154582414	154582414
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154828892	155	143	-0.0584	2.2930300719084e-162	154582414	154582414	1.79069623994194e-07	154812674	154836713
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154830421	154888224	46	43	0.1072	1.79069623994194e-07	154812674	154836713	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	109	-4.259	NA	NA	NA	8.86677306319188e-32	3219200	3773948
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	8.86677306319188e-32	3219200	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	13	-0.7786	NA	NA	NA	9.9288381203984e-19	4846477	6688691
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	5672441	1	0	NA	9.9288381203984e-19	4846477	6688691	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7054924	174	147	-3.7751	NA	NA	NA	2.73723584315075e-05	7020318	7231063
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7401540	113	101	-2.9739	2.73723584315075e-05	7020318	7231063	3.45503301556871e-05	7346510	7424495
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7410906	7608619	28	25	-4.4197	3.45503301556871e-05	7346510	7424495	5.63637364210632e-07	7605311	7614571
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7645258	13	11	-2.49	5.63637364210632e-07	7605311	7614571	8.08932707171433e-10	7632577	7647060
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7647060	7693408	29	23	-4.5298	8.08932707171433e-10	7632577	7647060	3.07483742761878e-08	7693377	7693408
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7694197	7700496	4	4	-2.4627	3.07483742761878e-08	7693377	7693408	1.63233114223345e-13	7700496	7700496
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7701303	7709619	7	7	-4.9442	1.63233114223345e-13	7700496	7700496	1.61383687458882e-17	7709619	7711759
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	20	-2.1916	1.61383687458882e-17	7709619	7711759	4.35903615180866e-12	7776265	7798534
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	367	-3.9678	4.35903615180866e-12	7776265	7798534	7.00115787087518e-37	10512616	10515697
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	16	-0.5987	7.00115787087518e-37	10512616	10515697	5.46631169783958e-31	11660512	11673476
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12541506	13	11	-4.286	5.46631169783958e-31	11660512	11673476	1.03212724906523e-19	12537944	12541506
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12558585	8	7	-1.5604	1.03212724906523e-19	12537944	12541506	5.35541125135549e-12	12558585	12558585
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12559410	12574148	6	5	-3.5425	5.35541125135549e-12	12558585	12558585	0.00216832633226270	12574148	12586920
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12575215	12590969	10	9	-1.698	0.0021683263322627	12574148	12586920	1.28946230046273e-05	12586920	12591908
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12591908	12611624	11	11	-3.776	1.28946230046273e-05	12586920	12591908	2.71945334530670e-05	12607539	12619162
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12646477	12	9	-1.6805	2.7194533453067e-05	12607539	12619162	3.55638937999002e-10	12637987	12649357
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12649357	12825903	29	26	-3.8905	3.55638937999002e-10	12637987	12649357	1.48119839021220e-09	12804329	12852769
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12833424	13128515	113	99	-2.4037	1.4811983902122e-09	12804329	12852769	2.33824961401071e-05	13090512	13155705
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13256555	43	38	-3.4745	2.33824961401071e-05	13090512	13155705	2.66113703569331e-06	13161955	13285595
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	14358464	373	319	-4.3186	2.66113703569331e-06	13161955	13285595	6.26402593795505e-12	14326935	14391767
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	78	-3.4741	6.26402593795505e-12	14326935	14391767	7.85578596838973e-10	14502379	14508894
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14547168	13	11	-1.2634	7.85578596838973e-10	14502379	14508894	3.77516217615852e-05	14539230	14547168
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14561228	8	6	-2.8009	3.77516217615852e-05	14539230	14547168	2.83710109821565e-15	14561228	14561228
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14563486	14579298	5	4	-0.8213	2.83710109821565e-15	14561228	14561228	4.08288803357913e-88	14579298	14579298
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	5	-4.5831	4.08288803357913e-88	14579298	14579298	0.0074944916416526	14598838	14689490
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14601309	1	0	NA	0.0074944916416526	14598838	14689490	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14603508	14695441	12	10	-2.52	NA	NA	NA	1.15243964086522e-09	14684159	14696387
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14696387	14883615	47	38	-4.6552	1.15243964086522e-09	14684159	14696387	2.62498345737829e-08	14852617	14952770
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15284717	128	111	-3.4606	2.62498345737829e-08	14852617	14952770	8.22700367972115e-07	15221212	15309005
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15523178	134	114	-4.1859	8.22700367972115e-07	15221212	15309005	4.97144150308157e-08	15499052	15537260
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15558235	23	20	-2.8787	4.97144150308157e-08	15499052	15537260	9.06675843425878e-06	15543194	15573648
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15559959	15559959	1	0	NA	9.06675843425878e-06	15543194	15573648	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15560912	15915466	65	55	-4.2505	NA	NA	NA	1.91900586877610e-08	15848986	15956978
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16085263	68	57	-3.1363	1.9190058687761e-08	15848986	15956978	0.00139367023044969	16035717	16175250
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16087502	16387273	94	73	-3.8431	0.00139367023044969	16035717	16175250	0.031277534588235	16173830	16764847
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	19610243	377	332	-4.2577	0.031277534588235	16173830	16764847	9.20212874212485e-07	19608039	19610243
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.4551	9.20212874212485e-07	19608039	19610243	0	19613864	19613864
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	19615891	2	2	-2.4995	0	19613864	19613864	0.0417669193098251	19615891	19864526
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19617348	21036411	289	246	-4.2313	0.0417669193098251	19615891	19864526	1.1846934074418e-05	21028489	21036411
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	4	-1.7329	1.1846934074418e-05	21028489	21036411	2.38406914231828e-05	21054519	21059229
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22058759	260	221	-4.1804	2.38406914231828e-05	21054519	21059229	4.41511681245915e-07	22052726	22157319
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22139807	22139807	1	0	NA	4.41511681245915e-07	22052726	22157319	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	7	-2.0581	NA	NA	NA	3.84331443370245e-15	22176501	22178964
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22926726	92	80	-4.5222	3.84331443370245e-15	22176501	22178964	1.31602368372115e-85	22926726	25737663
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22930737	22930737	1	0	NA	1.31602368372115e-85	22926726	25737663	NA	NA	NA
MSK_252152911438_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	71	-1.3144	NA	NA	NA	NA	NA	NA
