Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16232578	5585	5373	0.0033	NA	NA	NA	9.57980020767836e-13	16230368	16236840
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16236840	16255838	7	7	0.5563	9.57980020767836e-13	16230368	16236840	1.99538320081528e-13	16253782	16260159
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16260159	61881731	18038	17364	0.0027	1.99538320081528e-13	16253782	16260159	6.33718201898647e-09	61878187	61889151
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61884298	61884298	1	0	NA	6.33718201898647e-09	61878187	61889151	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61893807	5	5	-0.5397	NA	NA	NA	1.6052603422447e-09	61890388	61897802
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61897802	72533804	4254	4064	4e-04	1.6052603422447e-09	61890388	61897802	2.55469830741333e-41	72528790	72533804
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72533856	72574479	17	16	0.6158	2.55469830741333e-41	72528790	72533804	8.86366378216094e-44	72574479	72579311
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	110023268	11704	11234	0.0031	8.86366378216094e-44	72574479	72579311	9.02848976411753e-41	110023268	110023268
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	1.369	9.02848976411753e-41	110023268	110023268	1.60524801268787e-36	110039388	110039388
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	111177741	482	467	-0.006	1.60524801268787e-36	110039388	110039388	3.71791776538616e-15	111177741	111177741
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111180807	111188857	3	3	-0.8842	3.71791776538616e-15	111177741	111177741	4.36988026397163e-17	111188857	111188857
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111190763	143700072	3430	3295	-0.0036	4.36988026397163e-17	111188857	111188857	8.27294471250545e-17	143648141	143706582
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143702972	143802400	50	46	-0.2275	8.27294471250545e-17	143648141	143706582	1.84001710672987e-17	143793256	143810544
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143803856	150819879	1885	1809	0.0079	1.84001710672987e-17	143793256	143810544	2.81586424139998e-51	150819879	150819879
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-1.3427	2.81586424139998e-51	150819879	150819879	1.96861393236475e-07	150839754	150841957
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-4.0888	1.96861393236475e-07	150839754	150841957	0	150851439	150851439
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2662	0.0087	0	150851439	150851439	7.22160297067863e-57	157133150	157133150
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.111	7.22160297067863e-57	157133150	157133150	1.99326077861678e-16	157136342	157136342
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	157278016	54	53	-0.0256	1.99326077861678e-16	157136342	157136342	3.05806921210414e-16	157278016	157278016
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157280738	157282939	2	2	-1.019	3.05806921210414e-16	157278016	157278016	4.72403579402014e-14	157282939	157282939
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157286510	167483267	4052	3903	-0.0032	4.72403579402014e-14	157282939	157282939	1.09972706443312e-10	167477428	167495719
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167520743	9	9	0.4175	1.09972706443312e-10	167477428	167495719	1.41196194184687e-10	167507882	167525669
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167523140	185979586	7208	6890	-5e-04	1.41196194184687e-10	167507882	167525669	7.67104058689805e-317	185979586	185979586
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-4.7034	7.67104058689805e-317	185979586	185979586	0	185988138	185988138
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200609726	4139	3959	0.005	0	185988138	185988138	4.61316932098153e-12	200594055	200618814
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200668993	22	19	-0.2949	4.61316932098153e-12	200594055	200618814	3.80787775380011e-10	200654700	200678532
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200670407	247186514	17422	16787	-0.0057	3.80787775380011e-10	200654700	200678532	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	37789939	12904	12403	-0.0022	NA	NA	NA	4.42150583602333e-10	37775420	37812045
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37792669	1	0	NA	4.42150583602333e-10	37775420	37812045	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37797909	37858379	27	27	-0.2385	NA	NA	NA	7.72291529604463e-11	37846240	37874432
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	59675285	7994	7705	0.004	7.72291529604463e-11	37846240	37874432	5.66059160169782e-11	59675285	59675285
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	59677562	59680417	2	2	-0.8906	5.66059160169782e-11	59675285	59675285	1.86999668919585e-10	59680417	59680417
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	59681919	153167113	26022	24919	-0.0018	1.86999668919585e-10	59680417	59680417	2.75887075764617e-09	153167113	153167113
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	153168326	153169656	2	2	-0.844	2.75887075764617e-09	153167113	153167113	8.47894550889277e-10	153169656	153169656
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	153172033	154601442	329	318	0.009	8.47894550889277e-10	153169656	153169656	1.34970895314659e-11	154601442	154601442
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	0.935	1.34970895314659e-11	154601442	154601442	4.46447110066209e-12	154606943	154606943
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	158681162	1136	1085	-0.006	4.46447110066209e-12	154606943	154606943	2.20005306590703e-21	158681162	158681162
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	158682492	158685948	3	3	-1.0202	2.20005306590703e-21	158681162	158681162	7.1212086071027e-22	158685948	158685948
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	158687752	182359102	8620	8270	-0.0029	7.1212086071027e-22	158685948	158685948	1.92382093789476e-12	182359102	182359102
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	182364227	182369954	2	2	-0.9536	1.92382093789476e-12	182359102	182359102	6.4917108577345e-13	182369954	182369954
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	182380316	212478484	9893	9490	0.005	6.4917108577345e-13	182369954	182369954	9.7763177313244e-21	212478484	212478484
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212479949	212481171	2	2	-1.1976	9.7763177313244e-21	212478484	212478484	3.60558453207555e-20	212481171	212481171
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212484178	232104208	6884	6614	0.002	3.60558453207555e-20	212481171	212481171	1.71516458082211e-21	232104208	232104208
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232106074	232108169	2	2	-1.2354	1.71516458082211e-21	232104208	232104208	2.38040601104431e-18	232108169	232108169
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232113152	242689978	4002	3836	-0.0057	2.38040601104431e-18	232108169	232108169	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10393	-0.0028	NA	NA	NA	3.65778587124360e-08	32064724	32074432
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	0.7881	3.6577858712436e-08	32064724	32074432	1.97099001095544e-08	32080848	32080848
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1804	0.0021	1.97099001095544e-08	32080848	32080848	6.7675666918668e-32	37953375	37953375
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	5	-0.946	6.7675666918668e-32	37953375	37953375	5.64554519335496e-31	37961110	37961110
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	114354921	23734	22808	-9e-04	5.64554519335496e-31	37961110	37961110	5.74564731258133e-12	114352421	114354921
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	114360746	114376393	4	4	0.6707	5.74564731258133e-12	114352421	114354921	5.09994075460119e-12	114376393	114378826
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	114378826	150748947	12796	12266	-0.0045	5.09994075460119e-12	114376393	114378826	1.79730941738987e-52	150748947	150748947
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150751433	150752600	2	2	-1.9664	1.79730941738987e-52	150748947	150748947	4.93560136357975e-51	150752600	150752600
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150753766	163992903	4265	4092	-0.0041	4.93560136357975e-51	150752600	150752600	1.07106726542141e-87	163989367	163997228
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	28	0.6766	1.07106726542141e-87	163989367	163997228	1.53096479431231e-89	164105613	164107951
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	171429649	2051	1971	0.0015	1.53096479431231e-89	164105613	164107951	3.39723438279681e-17	171429649	171429649
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	171431763	171433858	2	2	1.0903	3.39723438279681e-17	171429649	171429649	7.82782927164369e-16	171433858	171433858
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	171435585	177369007	2313	2223	0.0049	7.82782927164369e-16	171433858	171433858	1.84424569549418e-18	177369007	177369007
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	177375389	177393195	3	3	-0.9505	1.84424569549418e-18	177369007	177369007	1.63544551505607e-19	177393195	177393195
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	177401961	193785530	5564	5353	0.0048	1.63544551505607e-19	177393195	177393195	2.00399748098616e-30	193785530	193785530
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193787655	193794411	4	4	-1.0222	2.00399748098616e-30	193785530	193785530	4.02919883975764e-25	193794411	193794411
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193797190	194354505	193	189	-0.0296	4.02919883975764e-25	193794411	193794411	3.66201276934728e-08	194351567	194354505
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194368145	7	7	0.413	3.66201276934728e-08	194351567	194354505	1.90467995067971e-07	194366950	194376974
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194371608	199329592	1979	1897	-0.0062	1.90467995067971e-07	194366950	194376974	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	5560951	1865	1786	-0.0035	NA	NA	NA	4.93084570689976e-10	5560951	5560951
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	5561147	5566928	2	2	-0.8978	4.93084570689976e-10	5560951	5560951	6.17196019203086e-11	5566928	5566928
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	5567010	68905670	16566	15898	0.0019	6.17196019203086e-11	5566928	5566928	1.25844446247535e-93	68905670	69069651
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.9666	1.25844446247535e-93	68905670	69069651	1.16773612219021e-96	69163312	69165814
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	188112032	35784	34355	6e-04	1.16773612219021e-96	69163312	69165814	1.62542055563505e-10	188112032	188112032
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188116287	188131744	2	2	0.879	1.62542055563505e-10	188112032	188112032	2.87030537885653e-11	188131744	188131744
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	188134132	191153613	928	889	-0.0174	2.87030537885653e-11	188131744	188131744	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180344964	53647	51502	-0.0013	NA	NA	NA	1.94033877173035e-09	180194323	180344964
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180346557	180362342	8	8	-0.4276	1.94033877173035e-09	180194323	180344964	3.23879784800662e-08	180362342	180365977
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	108	-0.0223	3.23879784800662e-08	180362342	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	40	-0.0134	NA	NA	NA	8.97750391302326e-22	198124	204881
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	16	-0.5547	8.97750391302326e-22	198124	204881	1.47276517558304e-06	232366	251128
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	43	-0.8922	1.47276517558304e-06	232366	251128	8.45296898236463e-255	323898	326323
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29941766	10485	10070	0.0027	8.45296898236463e-255	323898	326323	4.29333112282775e-11	29931329	29966336
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29950805	30031367	21	19	0.292	4.29333112282775e-11	29931329	29966336	3.29829499265485e-10	30025480	30046181
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30033946	31385778	575	553	-0.0028	3.29829499265485e-10	30025480	30046181	2.89692131817494e-15	31383925	31385778
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.6385	2.89692131817494e-15	31383925	31385778	1.35118167024114e-14	31418006	31418006
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	31457884	12	11	0.0983	1.35118167024114e-14	31418006	31418006	2.07925240692145e-06	31454845	31474518
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31467551	31532358	18	17	-0.2205	2.07925240692145e-06	31454845	31474518	1.46394388449341e-05	31515322	31556889
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31534436	32548736	458	444	0.0059	1.46394388449341e-05	31515322	31556889	7.43674729441869e-46	32548736	32548736
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	4	-1.3112	7.43674729441869e-46	32548736	32548736	2.25616445284393e-11	32595402	32597877
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32713363	38	37	0.0675	2.25616445284393e-11	32595402	32597877	0.000649412213655119	32695015	32720656
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	0.6424	0.000649412213655119	32695015	32720656	2.04668872144849e-22	32723722	32731072
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	7933	7e-04	2.04668872144849e-22	32723722	32731072	1.21351030713271e-41	54035000	54035000
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.4165	1.21351030713271e-41	54035000	54035000	1.39983657054547e-42	54042734	54042734
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	72919733	4535	4384	0.0028	1.39983657054547e-42	54042734	54042734	7.70447989792502e-22	72919733	72919733
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-1.0182	7.70447989792502e-22	72919733	72919733	3.74204312069254e-22	72924440	72924440
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	77499382	1613	1557	0.0094	3.74204312069254e-22	72924440	72924440	1.58856402928701e-07	77499382	77499382
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77504936	77509983	2	2	-0.7352	1.58856402928701e-07	77499382	77499382	4.25250413741005e-08	77509983	77509983
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	79018959	279	266	-0.01	4.25250413741005e-08	77509983	77509983	0	79018959	79018959
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-5.4304	0	79018959	79018959	0	79091850	79091850
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	110671926	9093	8735	-0.0012	0	79091850	79091850	5.44775567132797e-11	110671926	110671926
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110674072	110676867	2	2	-0.8908	5.44775567132797e-11	110671926	110671926	5.52292561386694e-11	110676867	110676867
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110679277	134629897	8151	7821	6e-04	5.52292561386694e-11	110676867	110676867	6.18153491576929e-17	134629897	134629897
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134631701	1	0	NA	6.18153491576929e-17	134629897	134629897	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-0.8935	NA	NA	NA	6.9993128222025e-17	134635779	134635779
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	10190	-0.0032	6.9993128222025e-17	134635779	134635779	1.79095225350564e-47	165643653	165643653
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.2723	1.79095225350564e-47	165643653	165643653	2.09990725498191e-45	165650610	165650610
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	169357462	1350	1303	-0.0163	2.09990725498191e-45	165650610	165650610	3.92229276784077e-08	169357462	169357462
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	169359279	169361741	2	2	0.7722	3.92229276784077e-08	169357462	169357462	1.23009653054343e-07	169361741	169363046
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	169363046	170753106	452	432	-0.028	1.23009653054343e-07	169361741	169363046	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	136373	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138059	1038517	259	249	-0.0024	NA	NA	NA	7.23772952740481e-09	1038517	1038517
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	0.8275	7.23772952740481e-09	1038517	1038517	1.29063818545542e-08	1047707	1049599
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	16135701	5126	4946	0.0038	1.29063818545542e-08	1047707	1049599	2.34444162312875e-60	16135701	16135701
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-2.1414	2.34444162312875e-60	16135701	16135701	2.3917648624383e-63	16140018	16140018
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	38254010	8208	7892	-0.0059	2.3917648624383e-63	16140018	16140018	2.5075896748178e-22	38247267	38269153
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38257171	38335964	40	37	0.2903	2.5075896748178e-22	38247267	38269153	9.1763553653699e-21	38323325	38343026
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	86771217	12502	11974	0.0022	9.1763553653699e-21	38323325	38343026	2.90784186946842e-27	86771217	86771217
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86777920	86785324	4	4	-0.9954	2.90784186946842e-27	86771217	86771217	4.5701999754495e-27	86785324	86785324
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86789967	86789967	1	0	NA	4.5701999754495e-27	86785324	86785324	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86790013	93162991	2303	2206	5e-04	NA	NA	NA	1.46468431958868e-11	93162991	93162991
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.9313	1.46468431958868e-11	93162991	93162991	2.44867610883798e-11	93168978	93168978
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	100166257	2613	2518	0.0044	2.44867610883798e-11	93168978	93168978	6.1026610022982e-10	100166257	100166257
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100171204	2	2	-0.8662	6.1026610022982e-10	100166257	100166257	7.42237168512015e-10	100171204	100171204
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100174991	118611324	8200	7889	0	7.42237168512015e-10	100171204	100171204	5.84761354176447e-11	118609124	118611324
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	0.7433	5.84761354176447e-11	118609124	118611324	4.83767070481378e-11	118620875	118622742
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6538	0.0014	4.83767070481378e-11	118620875	118622742	0	133433384	133433384
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-4.6405	0	133433384	133433384	0	133448277	133448277
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3542	0.004	0	133448277	133448277	4.12542684517372e-63	141410894	141413352
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	12	-0.8625	4.12542684517372e-63	141410894	141413352	8.18092375611156e-50	141438504	141440184
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	111	-0.0033	8.18092375611156e-50	141438504	141440184	3.75601126984455e-25	141690753	141690753
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	0.695	3.75601126984455e-25	141690753	141690753	2.48852659420658e-14	141711513	141714168
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	142118024	159	148	0.1244	2.48852659420658e-14	141711513	141714168	1.73326598507053e-06	142090029	142129738
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142125961	142187073	18	16	0.4037	1.73326598507053e-06	142090029	142129738	0.0142637555154676	142140540	142192030
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142187097	142202274	7	7	0.1827	0.0142637555154676	142140540	142192030	0.335566379355739	142194531	142299064
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142205830	142205830	1	0	NA	0.335566379355739	142194531	142299064	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142207147	147702365	2329	2224	-0.003	NA	NA	NA	2.07431612624041e-36	147702365	147702365
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.6962	2.07431612624041e-36	147702365	147702365	5.53956925594799e-36	147707161	147707161
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	157140419	3498	3356	-0.0086	5.53956925594799e-36	147707161	147707161	4.09735619663858e-08	157140419	157140419
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	157141595	157145546	3	2	0.8087	4.09735619663858e-08	157140419	157140419	6.91601796489127e-08	157145546	157149328
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	157147735	157147735	1	0	NA	6.91601796489127e-08	157145546	157149328	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	157149328	158821263	736	703	0.0062	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7156900	2392	2312	-0.0026	NA	NA	NA	5.73886468356631e-19	6926661	7226901
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	-0.5727	5.73886468356631e-19	6926661	7226901	7.05438586239514e-20	7790934	8137794
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	21753763	4524	4346	0.0021	7.05438586239514e-20	7790934	8137794	3.92952190522965e-16	21753763	21753763
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	21756924	21759487	2	2	-1.0977	3.92952190522965e-16	21753763	21753763	1.6430946663539e-15	21759487	21759487
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	21763443	25120552	1232	1171	-0.0021	1.6430946663539e-15	21759487	21759487	1.12154160435437e-114	25120552	25120552
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	2.3981	1.12154160435437e-114	25120552	25120552	8.12802721833432e-94	25125700	25125700
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	25127887	1	0	NA	8.12802721833432e-94	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25129043	25462525	161	156	0.0133	NA	NA	NA	4.1081109110665e-20	25462525	25462525
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25463846	25463846	1	0	NA	4.1081109110665e-20	25462525	25462525	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25467611	25470598	3	3	-1.091	NA	NA	NA	7.45190504160899e-26	25470598	25470598
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25472648	39350798	4746	4554	0.0022	7.45190504160899e-26	25470598	25470598	1.92123540428496e-138	39345557	39352361
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.5808	1.92123540428496e-138	39345557	39352361	2.59955069158179e-103	39504332	39508035
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40482659	263	254	0.0099	2.59955069158179e-103	39504332	39508035	0.000169755120274968	40462162	40482659
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40489564	40500552	4	4	0.4201	0.000169755120274968	40462162	40482659	2.61523089034822e-06	40500552	40506209
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40503867	40892587	174	165	-0.0023	2.61523089034822e-06	40500552	40506209	1.64533866011802e-14	40892587	40892587
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	0.8971	1.64533866011802e-14	40892587	40892587	2.4161105190773e-11	40897469	40897469
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	58274145	3916	3774	-0.0015	2.4161105190773e-11	40897469	40897469	6.91519751822835e-09	58274145	58274145
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58277102	58280459	2	2	0.799	6.91519751822835e-09	58274145	58274145	5.90789422410457e-09	58280459	58280459
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58290326	85422157	7744	7404	0.001	5.90789422410457e-09	58280459	58280459	9.52210643052771e-23	85422157	85422157
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85423938	85423938	1	0	NA	9.52210643052771e-23	85422157	85422157	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85426957	85431319	4	4	-0.8789	NA	NA	NA	1.32438534631471e-22	85431319	85431319
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85434122	87255865	577	550	6e-04	1.32438534631471e-22	85431319	85431319	9.09647498904388e-14	87249754	87255865
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87265435	4	4	-0.6914	9.09647498904388e-14	87249754	87255865	1.05471461575503e-12	87265435	87269233
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87269233	146264846	18742	18060	0.0019	1.05471461575503e-12	87265435	87269233	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5250	1e-04	NA	NA	NA	2.7481773037156e-41	15802255	15802255
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.7049	2.7481773037156e-41	15802255	15802255	5.4121963102784e-40	15807123	15807123
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2295	-0.0023	5.4121963102784e-40	15807123	15807123	4.68494164074274e-38	22477358	22477358
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.6636	4.68494164074274e-38	22477358	22477358	6.61595259315902e-39	22492603	22492603
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	159	-0.0051	6.61595259315902e-39	22492603	22492603	2.77280137114615e-08	23343915	23343915
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.6319	2.77280137114615e-08	23343915	23343915	3.7686483565385e-08	23365926	23377660
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39130211	4727	4499	0.0022	3.7686483565385e-08	23365926	23377660	4.08358991939656e-08	39091349	39130211
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39146895	43599449	4	4	0.5467	4.08358991939656e-08	39091349	39130211	0.0241881366908613	43445839	43599449
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	43776365	3	3	0.1286	0.0241881366908613	43445839	43599449	0.000960420110762894	43644906	45359327
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	44199401	67923904	14	13	-0.2441	0.000960420110762894	43644906	45359327	9.49807195746721e-05	67913672	70217543
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67927172	67927172	1	0	NA	9.49807195746721e-05	67913672	70217543	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	299	-0.0136	NA	NA	NA	9.05762591245964e-17	70926188	70926188
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.0591	9.05762591245964e-17	70926188	70926188	1.18398681644231e-15	70930528	70930528
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14892	-0.0045	1.18398681644231e-15	70930528	70930528	6.41797601939924e-24	116124007	116124007
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	1.2989	6.41797601939924e-24	116124007	116124007	1.5851971984286e-21	116130333	116130333
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	140145683	9400	9008	-0.0027	1.5851971984286e-21	116130333	116130333	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23596	-0.0028	NA	NA	NA	6.35382212596323e-58	77917893	77917893
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	2.0001	6.35382212596323e-58	77917893	77917893	2.69446535675422e-53	77928669	77928669
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	82866553	1495	1426	-0.0026	2.69446535675422e-53	77928669	77928669	1.46946373334601e-33	82866553	82866553
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82869426	82869426	1	0	NA	1.46946373334601e-33	82866553	82866553	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82871659	82881204	5	5	-1.0114	NA	NA	NA	1.54960186612234e-34	82881204	82881204
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82884042	84393299	440	426	0.003	1.54960186612234e-34	82881204	82881204	1.43467856685504e-15	84388775	84399853
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	84395740	84421526	11	11	0.4709	1.43467856685504e-15	84388775	84399853	2.38795003929238e-16	84416352	84423965
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	84423965	135285645	18262	17550	-0.0018	2.38795003929238e-16	84416352	84423965	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2069	-0.0113	NA	NA	NA	7.86486402499617e-50	5738494	5741031
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.779	7.86486402499617e-50	5738494	5741031	2.04957668092962e-63	5765438	5765438
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55114405	14751	14159	-8e-04	2.04957668092962e-63	5765438	5765438	7.47336915774605e-97	55112618	55114405
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55118214	55118214	1	0	NA	7.47336915774605e-97	55112618	55114405	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	36	0.619	NA	NA	NA	5.3644652776037e-94	55209626	55217189
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	65826905	4354	4205	0.004	5.3644652776037e-94	55209626	55217189	3.33404439420010e-07	65821697	65835174
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65830097	65848334	9	9	0.3566	3.3340443942001e-07	65821697	65835174	3.28631757777035e-07	65836725	65853383
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65849993	66463477	275	265	0.0044	3.28631757777035e-07	65836725	65853383	5.97832727980951e-27	66463477	66463477
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-1.5161	5.97832727980951e-27	66463477	66463477	2.14964888910626e-31	66469412	66469412
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	99030209	10856	10403	-0.003	2.14964888910626e-31	66469412	66469412	5.51714885421314e-11	99020067	99035340
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99031550	99064450	17	17	0.3099	5.51714885421314e-11	99020067	99035340	2.68834232669327e-11	99052364	99076224
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99068718	106733851	2525	2442	1e-04	2.68834232669327e-11	99052364	99076224	6.1143160428517e-09	106732431	106733851
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	0.5695	6.1143160428517e-09	106732431	106733851	1.13090864040559e-08	106747920	106754784
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134450318	10318	9925	7e-04	1.13090864040559e-08	106747920	106754784	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	33854	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	59822	11104973	4324	4164	0.0011	NA	NA	NA	1.95741480777159e-07	11104085	11110735
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11116883	4	4	0.5371	1.95741480777159e-07	11104085	11110735	7.88295644921152e-23	11116883	11116883
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.8389	7.88295644921152e-23	11116883	11116883	2.40686362070323e-95	11140421	11140421
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11393473	69	67	0.0055	2.40686362070323e-95	11140421	11140421	3.33150002383711e-37	11393473	11393473
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11395862	11395862	1	0	NA	3.33150002383711e-37	11393473	11393473	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11433210	5	5	-1.3553	NA	NA	NA	8.94059875276457e-64	11433210	11433210
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11435643	11435643	1	0	NA	8.94059875276457e-64	11433210	11433210	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	132289090	40749	39134	0.0033	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7079	-0.0029	NA	NA	NA	7.70611984717328e-42	37953582	37953582
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.7705	7.70611984717328e-42	37953582	37953582	4.84694889370660e-47	37957844	37957844
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	47862717	3962	3801	-0.0011	4.8469488937066e-47	37957844	37957844	1.08745707958302e-11	47862717	47862717
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47865706	47865981	2	2	-0.9013	1.08745707958302e-11	47862717	47862717	7.31841024051304e-11	47865981	47865981
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47869853	56646284	2720	2613	-0.0026	7.31841024051304e-11	47865981	47865981	4.98464757232763e-26	56610886	56650373
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56650373	56685341	16	15	0.4965	4.98464757232763e-26	56610886	56650373	0.0165784392953593	56672324	56693033
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	56708261	7	7	0.2551	0.0165784392953593	56672324	56693033	0.0119978165581728	56691355	56777182
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56711774	114123340	17597	16885	0.0012	0.0119978165581728	56691355	56777182	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	21528132	1051	1007	0.017	NA	NA	NA	8.22978155533832e-96	21511829	21538431
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21529816	22041571	255	249	0.2756	8.22978155533832e-96	21511829	21538431	2.43986203014986e-126	22032374	22047168
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22042671	40676611	6342	6088	0.0045	2.43986203014986e-126	22032374	22047168	1.55829538847704e-18	40670538	40676611
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	-0.5714	1.55829538847704e-18	40670538	40676611	3.0616905675807e-19	40726930	40741934
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	49893301	2255	2145	0.0023	3.0616905675807e-19	40726930	40741934	1.70902656684217e-08	49890907	49893301
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	49895498	49896548	2	2	-0.7701	1.70902656684217e-08	49890907	49893301	1.62561323138574e-07	49896548	49897617
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	49897617	79176037	12429	11933	0.0017	1.62561323138574e-07	49896548	49897617	2.38017114708312e-10	79174722	79176037
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79177462	79183154	3	3	-0.7284	2.38017114708312e-10	79174722	79176037	1.49303062882111e-09	79183154	79185548
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105602602	9298	8910	-0.0062	1.49303062882111e-09	79183154	79185548	7.34351597418132e-13	105592583	105606424
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105606424	105632168	11	11	-0.4399	7.34351597418132e-13	105592583	105606424	1.50926781734943e-12	105632168	105681007
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	20	0.0264	1.50926781734943e-12	105632168	105681007	2.01823986471256e-19	105787390	105787390
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.7444	2.01823986471256e-19	105787390	105787390	9.06042294832074e-13	105798116	105800545
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105799261	1	0	NA	9.06042294832074e-13	105798116	105800545	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105800545	105948347	44	43	-0.0211	NA	NA	NA	1.02522000131839e-05	105919618	105951399
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	12	0.3167	1.02522000131839e-05	105919618	105951399	1.43231100025426e-06	105985458	106002179
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106358491	146	140	0.0133	1.43231100025426e-06	105985458	106002179	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19537035	99	94	0.041	NA	NA	NA	2.58419828209676e-06	19415360	19805960
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19845942	11	11	0.3437	2.58419828209676e-06	19415360	19805960	0.00366008791982501	19822150	19943194
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	20009685	32	31	0.1072	0.00366008791982501	19822150	19943194	0.00487345804610467	19985258	20009685
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20010559	20022359	6	6	0.3837	0.00487345804610467	19985258	20009685	0.000184121209262267	20022359	20060061
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20029653	22219332	335	314	-0.0079	0.000184121209262267	20022359	20060061	5.01507650857803e-10	22219332	22219332
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22238807	22250971	2	2	-1.0147	5.01507650857803e-10	22219332	22219332	5.31613617314201e-14	22250971	22250971
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22351404	43010528	7619	7299	-2e-04	5.31613617314201e-14	22250971	22250971	1.95462460823958e-08	43009351	43014929
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43014929	43019499	3	3	-0.6528	1.95462460823958e-08	43009351	43014929	3.64617343351453e-08	43015037	43025619
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43024361	43024361	1	0	NA	3.64617343351453e-08	43015037	43025619	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43025619	52517110	3892	3742	-0.0049	NA	NA	NA	2.01393440156728e-08	52517110	52517110
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52519074	52533227	2	2	-0.8094	2.01393440156728e-08	52517110	52517110	1.22834249548116e-08	52533227	52540479
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52540479	53439868	297	288	-0.0038	1.22834249548116e-08	52533227	52540479	8.64186872821504e-19	53439868	53440850
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53440850	53443742	4	4	-0.8811	8.64186872821504e-19	53439868	53440850	1.10445613174599e-20	53442883	53443742
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53444740	99632987	18745	18015	-0.0017	1.10445613174599e-20	53442883	53443742	6.43352734744852e-16	99632987	99632987
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.095	6.43352734744852e-16	99632987	99632987	4.09412262673150e-18	99635701	99635701
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217181	267	262	-0.0231	4.0941226267315e-18	99635701	99635701	5.2006547703404e-10	100212401	100278665
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	-0.5581	5.2006547703404e-10	100212401	100278665	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	454	-0.0131	NA	NA	NA	9.59963375552954e-12	1296767	1296767
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.0642	9.59963375552954e-12	1296767	1296767	7.88324156525969e-14	1300341	1300341
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	31862577	10097	9695	0.0041	7.88324156525969e-14	1300341	1300341	3.83800880878464e-54	31845232	32513457
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33868686	52	52	-0.4008	3.83800880878464e-54	31845232	32513457	1.73273476398726e-57	33841331	34056516
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34054713	75092501	9898	9478	-8e-04	1.73273476398726e-57	33841331	34056516	2.44256171041229e-160	75092501	75092501
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75093957	1	0	NA	2.44256171041229e-160	75092501	75092501	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-3.381	NA	NA	NA	4.8411055297248e-142	75100865	75100865
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	585	0.0014	4.8411055297248e-142	75100865	75100865	1.51165620045527e-08	76922411	76931247
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76938723	7	7	0.4563	1.51165620045527e-08	76922411	76931247	4.01181401133368e-09	76935880	76942679
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76940218	88690571	4514	4307	-0.0075	4.01181401133368e-09	76935880	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	393	0.0225	NA	NA	NA	4.57766560655673e-30	1028979	1028979
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5666	4.57766560655673e-30	1028979	1028979	2.31861640838108e-30	1030766	1030766
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	423	0.0276	2.31861640838108e-30	1030766	1030766	4.06388232159475e-17	1904451	1904451
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	0.9805	4.06388232159475e-17	1904451	1904451	1.28684260895866e-18	1906391	1906391
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	31457889	11180	10728	0.0067	1.28684260895866e-18	1906391	1906391	8.51846607920778e-19	31447686	31461588
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	17	-0.4045	8.51846607920778e-19	31447686	31461588	7.76136742262984e-19	31499568	31891535
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	34442393	847	808	0.0053	7.76136742262984e-19	31499568	31891535	2.23555855582747e-10	34442393	34442393
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34445816	34446608	2	2	-0.8805	2.23555855582747e-10	34442393	34442393	6.22884785302228e-10	34446608	34446608
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34451067	36673853	966	930	0.0087	6.22884785302228e-10	34446608	34446608	0	36673853	36673853
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-4.9542	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	37505165	416	399	0.0112	0	36684619	36684619	8.02817650304894e-07	37501221	37505165
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	37506951	37511441	3	3	-0.599	8.02817650304894e-07	37501221	37505165	3.20276233660581e-07	37511441	37512944
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	37512944	41527705	1596	1528	0.016	3.20276233660581e-07	37511441	37512944	4.31551210421894e-17	41521544	41529227
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41529227	41568539	18	18	-0.3493	4.31551210421894e-17	41521544	41529227	1.33844484988185e-08	41564408	41577520
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41708551	44	42	-0.6419	1.33844484988185e-08	41564408	41577520	2.88106176483435e-115	41706870	42142363
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41710400	41710400	1	0	NA	2.88106176483435e-115	41706870	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13141	0.0029	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22083	-0.0023	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	790526	218	212	0.0192	NA	NA	NA	1.78657377679657e-09	790492	790526
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.0496	1.78657377679657e-09	790492	790526	4.52671295299505e-11	794978	794978
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	11448975	4951	4766	0.0137	4.52671295299505e-11	794978	794978	5.21375383286875e-52	11448975	11448975
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	2.2112	5.21375383286875e-52	11448975	11448975	1.24795381579120e-59	11452390	11452390
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	58208527	15293	14662	0.0092	1.2479538157912e-59	11452390	11452390	2.71002155014459e-15	58204170	58212113
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58239871	13	13	-0.4367	2.71002155014459e-15	58204170	58212113	6.2385454344388e-17	58237461	58244012
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58241773	59246409	486	469	0.0219	6.2385454344388e-17	58237461	58244012	2.05062472944407e-07	59244965	59246409
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-0.6134	2.05062472944407e-07	59244965	59246409	2.04241602443186e-08	59251831	59253728
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	59414645	85	82	0.0414	2.04241602443186e-08	59251831	59253728	1.34991272417450e-21	59412581	59421197
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59414898	59414898	1	0	NA	1.3499127241745e-21	59412581	59421197	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.5829	NA	NA	NA	7.62421126201736e-14	59433190	59440262
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	59491509	22	22	-0.0665	7.62421126201736e-14	59433190	59440262	2.85322907735568e-25	59491509	59491509
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-1.0416	2.85322907735568e-25	59491509	59491509	1.22226042269082e-12	59497049	59497049
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	60871654	579	553	0.0014	1.22226042269082e-12	59497049	59497049	8.06058133750351e-09	60868231	60879072
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60873389	60882128	6	5	0.5645	8.0605813375035e-09	60868231	60879072	1.40165151106879e-09	60875830	60884879
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60884879	61557826	315	298	-0.0044	1.40165151106879e-09	60875830	60884879	1.57223355619908e-07	61556428	61557826
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61559132	61560427	2	2	-0.7813	1.57223355619908e-07	61556428	61557826	2.07279213283945e-08	61560427	61566194
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61566194	63788698	1068	1032	-0.0031	2.07279213283945e-08	61560427	61566194	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	559	-0.0151	NA	NA	NA	3.16495608527432e-97	1506379	1506379
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.1986	3.16495608527432e-97	1506379	1506379	4.98938598614776e-102	1532433	1532433
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	26148060	8439	8110	-0.0066	4.98938598614776e-102	1532433	1532433	1.78496685049367e-11	26145205	26148060
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148764	26161111	9	7	-0.5024	1.78496685049367e-11	26145205	26148060	1.98259458761399e-11	26161111	26168610
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	56896329	10272	9885	0	1.98259458761399e-11	26161111	26168610	4.20815109362599e-14	56896329	56896329
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56898026	56899350	2	2	-1.0381	4.20815109362599e-14	56896329	56896329	2.13110063220279e-11	56899350	56899350
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56901438	62419534	2261	2155	-0.0191	2.13110063220279e-11	56899350	56899350	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12872	-0.0024	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2869	-0.0039	NA	NA	NA	1.80363221709723e-131	22667608	22667608
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22721042	21	20	1.0647	1.80363221709723e-131	22667608	22667608	1.63676326597381e-149	22721042	22721042
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	32110063	5043	4851	2e-04	1.63676326597381e-149	22721042	22721042	1.47027929096642e-13	32110063	32110063
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-1.0319	1.47027929096642e-13	32110063	32110063	1.31290608143414e-13	32112051	32112051
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	37618187	2692	2576	0.0085	1.31290608143414e-13	32112051	32112051	5.22548445526853e-18	37618187	37618187
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37621766	37626069	3	3	0.982	5.22548445526853e-18	37618187	37618187	1.67685351687771e-17	37626069	37626069
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5575	-0.0037	1.67685351687771e-17	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	24	0.1197	NA	NA	NA	0.00482887502381836	110583	124528
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	0.522	0.00482887502381836	110583	124528	5.58467660336512e-07	130528	132721
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	2708291	1759	1686	6e-04	5.58467660336512e-07	130528	132721	0	2708291	2711273
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	3305160	242	232	0.9104	0	2708291	2711273	5.57433766465628e-08	3302617	3305160
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3306796	3308942	2	2	-0.0959	5.57433766465628e-08	3302617	3305160	2.15718820154978e-11	3308942	3308942
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3311494	6931835	1046	1008	0.9703	2.15718820154978e-11	3308942	3308942	2.72626575881946e-08	6930462	6931835
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6940471	6948351	2	2	0.0693	2.72626575881946e-08	6930462	6931835	6.62017655415308e-09	6948351	6949872
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6949872	8452395	499	485	0.9783	6.62017655415308e-09	6948351	6949872	1.30594622838772e-11	8452395	8452395
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8458058	2	2	-0.058	1.30594622838772e-11	8452395	8452395	1.9420756560475e-11	8458058	8458058
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8459880	69646994	19418	18629	0.9828	1.9420756560475e-11	8458058	8458058	2.86299888272295e-12	69646994	69646994
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69649160	69650824	2	2	-0.0925	2.86299888272295e-12	69646994	69646994	2.20811528778463e-11	69650824	69659613
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	69659613	154038318	23788	22787	0.9779	2.20811528778463e-11	69650824	69659613	2.39949415084322e-21	154031239	154038318
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154085354	13	13	0.4133	2.39949415084322e-21	154031239	154038318	1.51352392072915e-29	154085354	154086636
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154086636	154442377	88	86	0.9865	1.51352392072915e-29	154085354	154086636	1.12600370438028e-120	154442377	154442377
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	3.1644	1.12600370438028e-120	154442377	154442377	1.33572885123517e-86	154450309	154450309
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.9215	1.33572885123517e-86	154450309	154450309	1.18132599763558e-147	154582414	154582414
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-0.0099	1.18132599763558e-147	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	119	-4.757	NA	NA	NA	6.31295946498955e-36	3219200	3772482
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	16	-1.4513	6.31295946498955e-36	3219200	3772482	7.11370361823443e-19	5422507	6652845
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	167	-4.175	7.11370361823443e-19	5422507	6652845	0.000112517551984988	7003768	7242656
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7485594	128	123	-3.4888	0.000112517551984988	7003768	7242656	1.18074485251227e-08	7368837	7578636
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7722458	76	74	-4.6002	1.18074485251227e-08	7368837	7578636	1.09769627626082e-09	7713973	7729757
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7782532	19	18	-3.1389	1.09769627626082e-09	7713973	7729757	3.23943488967210e-05	7745143	7798534
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	34	-4.2544	3.2394348896721e-05	7745143	7798534	2.10069861518830e-05	7893056	7905286
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-2.1596	2.1006986151883e-05	7893056	7905286	6.53721124316992e-14	7914104	7914104
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7936024	6	6	-4.9739	6.53721124316992e-14	7914104	7914104	9.86872562545283e-05	7930528	7942730
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7938700	7996758	12	10	-3.1107	9.86872562545283e-05	7930528	7942730	2.530247291461e-06	7985459	8036254
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	10513747	371	344	-4.557	2.530247291461e-06	7985459	8036254	8.02524394614444e-49	10512616	10535786
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	18	-1.4677	8.02524394614444e-49	10512616	10535786	3.51897842201065e-11	10655750	12527445
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12999095	147	138	-3.8091	3.51897842201065e-11	10655750	12527445	1.53345725004027e-05	12940175	13026029
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13129843	54	50	-2.7587	1.53345725004027e-05	12940175	13026029	1.69361879011186e-26	13114169	13138841
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13524481	164	157	-4.3677	1.69361879011186e-26	13114169	13138841	0.000403677468771765	13508776	13524481
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13525650	13525650	1	0	NA	0.000403677468771765	13508776	13524481	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13526852	13532107	5	5	-6.0114	NA	NA	NA	1.23144143397347e-05	13532107	13537520
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13533021	13533021	1	0	NA	1.23144143397347e-05	13532107	13537520	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13533864	13716000	48	46	-4.3651	NA	NA	NA	0.0248002751619858	13566041	13956735
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	14342834	189	178	-4.7856	0.0248002751619858	13566041	13956735	3.31804706092694e-06	14262916	14409975
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14524829	98	90	-4.1802	3.31804706092694e-06	14262916	14409975	1.40865915248328e-21	14508894	14524829
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	8	-0.5091	1.40865915248328e-21	14508894	14524829	5.52160958088644e-30	14547168	14549297
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	21041164	1264	1199	-4.4618	5.52160958088644e-30	14547168	14549297	4.83674921171219e-08	21036411	21041164
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21042490	21054519	5	4	-1.5108	4.83674921171219e-08	21036411	21041164	2.77128097580675e-14	21054519	21054519
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	2.77128097580675e-14	21054519	21054519	NA	NA	NA
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	21435511	125	118	-4.7798	NA	NA	NA	9.2531983341885e-05	21403482	21449924
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21439923	21569358	19	18	-3.8221	9.2531983341885e-05	21403482	21449924	0.000196397166573937	21478199	21674296
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21574425	22157319	117	106	-4.7023	0.000196397166573937	21478199	21674296	6.80570499599318e-16	22139807	22165808
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22175425	6	6	-1.9725	6.80570499599318e-16	22139807	22165808	8.62150185407872e-09	22169951	22177335
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22176501	22930737	95	85	-4.5659	8.62150185407872e-09	22169951	22177335	2.88069773193664e-66	22926726	22930737
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	29	-1.1936	2.88069773193664e-66	22926726	22930737	1.05691802523050e-14	26945084	26945893
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.8062	1.0569180252305e-14	26945084	26945893	0.000389443966298578	26980386	27006628
MSK_252152911477_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	57440809	48	42	-1.3296	0.000389443966298578	26980386	27006628	NA	NA	NA
