Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	25998	0.0157	NA	NA	NA	5.30776372301708e-14	72533856	72543019
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	13	0.7392	5.30776372301708e-14	72533856	72543019	2.55046240903258e-15	72559751	72589682
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	150839754	17561	16374	-9e-04	2.55046240903258e-15	72559751	72589682	1.27672609654484e-44	150839754	150839754
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150844444	3	3	-2.5845	1.27672609654484e-44	150839754	150839754	1.16280629620417e-30	150844444	150844444
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150846148	150847304	2	0	NA	1.16280629620417e-30	150844444	150844444	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	76	-0.0747	NA	NA	NA	7.72786601298903e-09	151024118	151026228
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151033188	3	3	1.1623	7.72786601298903e-09	151024118	151026228	2.99997389257183e-08	151033188	151036435
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151036435	157133150	2680	2521	0.0176	2.99997389257183e-08	151033188	151036435	6.71938000367445e-12	157133150	157133150
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.6547	6.71938000367445e-12	157133150	157133150	6.98993057412623e-12	157136342	157136342
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	194978218	13296	12439	-0.0018	6.98993057412623e-12	157136342	157136342	4.28452295283156e-317	194978218	194978218
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	8	-4.1483	4.28452295283156e-317	194978218	194978218	1.02803604839360e-300	195065867	195065867
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200612164	2162	2018	0.003	1.0280360483936e-300	195065867	195065867	3.94251322766243e-07	200572541	200634858
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200613454	200787319	34	33	-0.3209	3.94251322766243e-07	200572541	200634858	5.42118398221134e-07	200678532	200818194
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	16197	0.0015	5.42118398221134e-07	200678532	200818194	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10155	0.0031	NA	NA	NA	5.91548297208485e-85	33076512	33076512
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-4.2851	5.91548297208485e-85	33076512	33076512	6.67877331536668e-78	33080437	33080437
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	594	0.0168	6.67877331536668e-78	33080437	33080437	7.10103038076934e-08	34516600	34543992
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	18	0.485	7.10103038076934e-08	34516600	34543992	4.32590742769236e-11	34591681	34602813
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	37813211	1370	1279	-0.0349	4.32590742769236e-11	34591681	34602813	8.98772894472759e-22	37810001	37819785
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37815049	37855837	20	17	-0.7855	8.98772894472759e-22	37810001	37819785	2.120296572673e-23	37847519	37858379
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	106244482	20979	19570	-0.0027	2.120296572673e-23	37847519	37858379	4.71763560981047e-16	106244482	106244482
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.9071	4.71763560981047e-16	106244482	106244482	1.50607251795925e-15	106250718	106250718
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	242689978	43915	41053	-0.0029	1.50607251795925e-15	106250718	106250718	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	11383299	4087	3806	0.0055	NA	NA	NA	5.61544111936803e-13	11383299	11383299
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-1.3557	5.61544111936803e-13	11383299	11383299	1.45789305238535e-11	11389624	11389624
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	163992903	49398	46024	-0.0038	1.45789305238535e-11	11389624	11389624	3.56036499821061e-32	163987457	164005577
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164112873	29	27	0.7261	3.56036499821061e-32	163987457	164005577	6.87058567874393e-33	164100804	164126256
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	164115417	1	0	NA	6.87058567874393e-33	164100804	164126256	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164121847	199329592	12114	11294	-0.0091	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	17202	-0.0025	NA	NA	NA	3.08211957982100e-39	68899247	69069651
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	1.1457	3.082119579821e-39	68899247	69069651	3.81449807794317e-31	69163312	69643272
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	110	-0.0058	3.81449807794317e-31	69163312	69643272	9.54280568211534e-07	70130975	70150576
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	3	-1.0578	9.54280568211534e-07	70130975	70150576	8.75056195598123e-07	70216707	70338878
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	70336467	2	0	NA	8.75056195598123e-07	70216707	70338878	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70338878	191153613	36591	34158	-0.0064	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3684	0.0034	NA	NA	NA	2.80416828450213e-49	12857302	12857302
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-3.2156	2.80416828450213e-49	12857302	12857302	4.27063887478427e-47	12873052	12873052
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180644810	49789	46473	-0.0026	4.27063887478427e-47	12873052	12873052	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	232366	52	47	-0.0443	NA	NA	NA	6.71818716503864e-14	224667	241674
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	234115	323898	48	42	0.433	6.71818716503864e-14	224667	241674	3.58088122712464e-17	307231	335212
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	326323	326323	1	0	NA	3.58088122712464e-17	307231	335212	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	18371831	6437	6021	0.0032	NA	NA	NA	3.17386545880875e-08	18368026	18371831
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18373481	18378787	3	3	1.1337	3.17386545880875e-08	18368026	18371831	2.81007433823208e-08	18378787	18380299
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18380299	32558677	5136	4788	0.0045	2.81007433823208e-08	18378787	18380299	9.38410295005946e-75	32558677	32564884
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	14	-1.5285	9.38410295005946e-75	32558677	32564884	1.07926798430835e-15	32629848	32634977
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	26	0.0576	1.07926798430835e-15	32629848	32634977	7.0188750271961e-08	32709263	32716255
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728285	7	7	1.2364	7.0188750271961e-08	32709263	32716255	6.93624646345937e-21	32728285	32731072
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32728487	32728487	1	0	NA	6.93624646345937e-21	32728285	32731072	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	36515424	1644	1544	0.0244	NA	NA	NA	8.41540682018045e-09	36514036	36518498
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	36518498	36521308	3	3	1.241	8.41540682018045e-09	36514036	36518498	4.06090568747859e-10	36520159	36522639
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	36522639	94632118	17352	16186	-0.0026	4.06090568747859e-10	36520159	36522639	1.04754090776367e-10	94628672	94632118
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	94638337	94643221	4	4	-1.1078	1.04754090776367e-10	94628672	94632118	8.2249707065797e-11	94643221	94645663
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	94645663	103841482	2466	2329	-0.0019	8.2249707065797e-11	94643221	94645663	2.05954482637698e-82	103841482	103841482
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	3	-3.4509	2.05954482637698e-82	103841482	103841482	1.78766097259823e-84	103868154	103868154
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	139643729	12380	11533	-0.0054	1.78766097259823e-84	103868154	103868154	4.06294541933581e-168	139643729	139643729
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-4.8546	4.06294541933581e-168	139643729	139643729	6.96419068554606e-161	139648318	139648318
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8155	-0.011	6.96419068554606e-161	139648318	139648318	2.32293352345307e-15	165643653	165643653
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.312	2.32293352345307e-15	165643653	165643653	2.08597974625615e-15	165650610	165653315
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1688	-0.0129	2.08597974625615e-15	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	35	0.0533	NA	NA	NA	8.42150414187937e-11	240576	244720
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	4	-1.1172	8.42150414187937e-11	240576	244720	4.92492558255916e-11	254342	256802
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	1038517	215	199	0.0161	4.92492558255916e-11	254342	256802	1.34016165653491e-09	1038517	1038517
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	1.5101	1.34016165653491e-09	1038517	1038517	2.41140664577534e-09	1047707	1049599
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	118611324	39003	36425	0.0016	2.41140664577534e-09	1047707	1049599	1.07748113152946e-181	118611324	118611324
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-5.1609	1.07748113152946e-181	118611324	118611324	7.14991588995816e-178	118620875	118620875
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	2936	-0.0077	7.14991588995816e-178	118620875	118620875	8.45973465335207e-68	125831554	125831554
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.1985	8.45973465335207e-68	125831554	125831554	8.15334242171936e-68	125837524	125837524
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	6843	0.0044	8.15334242171936e-68	125837524	125837524	2.78212909358950e-22	141409512	141414719
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	12	-0.924	2.7821290935895e-22	141409512	141414719	2.78026789355638e-19	141434131	141442231
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141687978	114	110	0.0217	2.78026789355638e-19	141434131	141442231	5.3475608086452e-14	141684868	141689547
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141689547	141714168	12	11	0.8361	5.3475608086452e-14	141684868	141689547	3.39940935582161e-16	141712786	141721894
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	3.39940935582161e-16	141712786	141721894	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	158767781	6740	6271	-0.001	NA	NA	NA	7.06870023299335e-06	158587961	158811268
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158769132	158821263	11	9	0.351	7.06870023299335e-06	158587961	158811268	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25116684	8157	7637	-0.0018	NA	NA	NA	8.68984771169715e-38	25116684	25116684
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25119007	25120552	2	0	NA	8.68984771169715e-38	25116684	25116684	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	2	2.917	NA	NA	NA	8.12862379118146e-38	25125700	25125700
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	40892587	5412	5053	0.0021	8.12862379118146e-38	25125700	25125700	8.11644827148008e-30	40892587	40892587
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-2.6049	8.11644827148008e-30	40892587	40892587	1.21995296047063e-30	40897469	40897469
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	144355892	30295	28247	-7e-04	1.21995296047063e-30	40897469	40897469	4.91860524094803e-07	144350304	144363771
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144360602	144372354	6	6	0.7572	4.91860524094803e-07	144350304	144363771	3.38312866990758e-05	144365211	144380804
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144374639	146264846	689	648	0.0476	3.38312866990758e-05	144365211	144380804	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	11980600	4180	3899	-0.0011	NA	NA	NA	6.07568794897535e-39	11974884	11985387
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11985387	12117098	20	19	-0.942	6.07568794897535e-39	11974884	11985387	4.58842462626109e-40	12111258	12126147
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	12126147	15802255	1258	1182	-0.0014	4.58842462626109e-40	12111258	12126147	3.31926230040710e-17	15802255	15802255
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.905	3.3192623004071e-17	15802255	15802255	6.57100155080745e-16	15807123	15807123
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2215	-0.0143	6.57100155080745e-16	15807123	15807123	2.32997915425017e-11	22477358	22477358
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.6169	2.32997915425017e-11	22477358	22477358	8.44273927409209e-11	22492603	22492603
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	140145683	30105	28090	-0.0022	8.44273927409209e-11	22492603	22492603	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9085	-0.006	NA	NA	NA	3.74934653459244e-07	27036630	27038538
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.2905	3.74934653459244e-07	27036630	27038538	2.74381017616407e-07	27041812	27043861
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	44521469	4394	4104	-0.012	2.74381017616407e-07	27041812	27043861	1.72302475346215e-29	44494708	44529037
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44529037	44679038	39	39	0.5662	1.72302475346215e-29	44494708	44529037	3.86758932929737e-28	44673209	44693067
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44684091	77917893	10428	9683	-4e-04	3.86758932929737e-28	44673209	44693067	3.04785032587489e-17	77917893	77917893
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	2	1.9718	3.04785032587489e-17	77917893	77917893	1.19789900758461e-16	77928738	77928738
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	114100979	12392	11572	0.008	1.19789900758461e-16	77928738	77928738	1.45577297013354e-39	114100979	114100979
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.9804	1.45577297013354e-39	114100979	114100979	3.80256452725623e-38	114106460	114106460
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	135284109	7818	7259	-0.0067	3.80256452725623e-38	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135285645	135285645	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1670	0.0019	NA	NA	NA	1.01176468650540e-169	4923300	4923300
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.0699	1.0117646865054e-169	4923300	4923300	1.17110090894698e-185	4932214	4932214
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55118214	15128	14110	0.0019	1.17110090894698e-185	4932214	4932214	8.8330036491862e-24	55097806	55124730
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55197848	33	29	0.6161	8.8330036491862e-24	55097806	55124730	2.67658011906078e-21	55193014	55203706
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	66463477	4644	4326	0.0242	2.67658011906078e-21	55193014	55203706	4.60105467732001e-19	66463477	66463477
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.1084	4.60105467732001e-19	66463477	66463477	1.42409294616631e-19	66469412	66469412
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	22106	5e-04	1.42409294616631e-19	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11121204	4330	4042	0.0091	NA	NA	NA	1.45850222915081e-52	11121204	11121204
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11123452	11130871	5	5	-2.1605	1.45850222915081e-52	11121204	11121204	5.16671415686981e-28	11130871	11130871
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11395862	71	67	-0.01	5.16671415686981e-28	11130871	11130871	2.61464268089829e-13	11389830	11395862
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11440927	7	6	-1.2235	2.61464268089829e-13	11389830	11395862	1.58058090685309e-19	11440927	11452868
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11452868	130694393	40102	37402	0.0021	1.58058090685309e-19	11440927	11452868	2.27525947127265e-09	130694393	130694393
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.5149	2.27525947127265e-09	130694393	130694393	1.03979371635201e-10	130701040	130701040
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	594	0.0011	1.03979371635201e-10	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33030946	5595	5204	-0.0085	NA	NA	NA	2.46710254768417e-07	33028007	33030946
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-1.07	2.46710254768417e-07	33028007	33030946	3.51705901515302e-07	33042557	33046417
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	49958475	6620	6174	-0.0093	3.51705901515302e-07	33042557	33046417	1.05861340111601e-27	49958475	49958475
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49964838	49964838	1	0	NA	1.05861340111601e-27	49958475	49958475	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.4825	NA	NA	NA	5.73532581052551e-26	49971732	49971732
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1687	-0.0056	5.73532581052551e-26	49971732	49971732	1.59665918417835e-09	56602818	56658479
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	14	0.5721	1.59665918417835e-09	56602818	56658479	3.80977080116942e-10	56681665	56697807
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	89659397	8252	7686	-0.001	3.80977080116942e-10	56681665	56697807	4.10329496652831e-87	89659397	89659397
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-4.3134	4.10329496652831e-87	89659397	89659397	2.39353119894443e-84	89662326	89662326
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	8736	-0.0043	2.39353119894443e-84	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	40680589	7649	7141	0.0066	NA	NA	NA	3.60140612917040e-12	40676611	40680589
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.9588	3.6014061291704e-12	40676611	40680589	1.65913216078619e-11	40722360	40726930
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	105856972	24049	22328	-0.0016	1.65913216078619e-11	40722360	40726930	6.3534362072629e-40	105856972	105872360
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105881893	5	5	-1.9038	6.3534362072629e-40	105856972	105872360	5.86047406118191e-27	105881677	105881893
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106214372	122	118	0.0111	5.86047406118191e-27	105881677	105881893	1.42864125871922e-07	106196705	106218059
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	18	-0.5044	1.42864125871922e-07	106196705	106218059	1.32925898106423e-15	106252126	106256498
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	34	0.0995	1.32925898106423e-15	106252126	106256498	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	74664249	21709	20238	-0.0056	NA	NA	NA	6.56472246882775e-10	74653507	74665386
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74665386	74680439	6	6	0.8314	6.56472246882775e-10	74653507	74665386	8.13920497834469e-08	74680338	74696702
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	160	-0.0082	8.1392049783447e-08	74680338	74696702	2.30736171714608e-35	75115806	75115806
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-3.0506	2.30736171714608e-35	75115806	75115806	1.20184682784613e-41	75119713	75119713
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	95606006	7442	6943	8e-04	1.20184682784613e-41	75119713	75119713	6.00973768490793e-09	95598182	95606006
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95609756	95609756	1	0	NA	6.00973768490793e-09	95598182	95606006	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.8389	NA	NA	NA	4.44669557258856e-09	95632390	95656272
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	98232932	1072	1006	0.0058	4.44669557258856e-09	95632390	95656272	3.65911107371936e-97	98232932	98232932
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98234519	1	0	NA	3.65911107371936e-97	98232932	98232932	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98237721	98239454	2	2	-4.6691	NA	NA	NA	8.32017344420104e-95	98239454	98239454
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	589	-0.0365	8.32017344420104e-95	98239454	98239454	9.56199395638655e-08	99632987	99632987
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.3213	9.56199395638655e-08	99632987	99632987	5.33665980450611e-07	99635701	99635701
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	258	0.0071	5.33665980450611e-07	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1805520	692	640	0.0446	NA	NA	NA	3.58417671259101e-09	1800972	1806285
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1806285	1814723	4	3	-1.2398	3.58417671259101e-09	1800972	1806285	1.25108783649663e-09	1809552	1816023
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1816023	75093957	19827	18553	0.0111	1.25108783649663e-09	1809552	1816023	6.2099787943294e-26	75093957	75093957
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.4353	6.2099787943294e-26	75093957	75093957	1.60646258446335e-29	75100865	75100865
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76929598	611	564	-0.0148	1.60646258446335e-29	75100865	75100865	3.40781701684027e-08	76925748	76933534
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76931247	1	0	NA	3.40781701684027e-08	76925748	76933534	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76933534	76938723	5	5	0.8094	NA	NA	NA	2.4087878980554e-06	76937156	76942679
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76940218	88690571	4514	4185	0.0093	2.4087878980554e-06	76937156	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	399	0.032	NA	NA	NA	2.61189104839013e-14	1028979	1028979
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.8359	2.61189104839013e-14	1028979	1028979	1.85067235000911e-13	1030766	1030766
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	8147124	3123	2917	0.0276	1.85067235000911e-13	1030766	1030766	3.88475404706703e-07	8144634	8147124
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8149084	2	2	1.3658	3.88475404706703e-07	8144634	8147124	1.84952121218973e-07	8149084	8154339
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8154339	24195451	5425	5032	0.0161	1.84952121218973e-07	8149084	8154339	3.46223078718591e-10	24194191	24195451
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24198397	24201924	5	5	-0.9717	3.46223078718591e-10	24194191	24195451	1.51905664378920e-10	24201924	24204545
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24204545	31457889	3063	2848	0.006	1.5190566437892e-10	24201924	24204545	5.75740522490828e-07	31431640	31471890
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	15	-0.4601	5.75740522490828e-07	31431640	31471890	4.2424539262012e-07	31476283	31906515
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	31889566	1	0	NA	4.2424539262012e-07	31476283	31906515	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31891535	36673853	1814	1678	0.0101	NA	NA	NA	5.61322934067942e-20	36672710	36673853
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.2247	5.61322934067942e-20	36672710	36673853	2.8027437574997e-18	36684619	36686013
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	14679	0.0156	2.8027437574997e-18	36684619	36686013	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	13763381	4826	4510	0.0016	NA	NA	NA	4.19748815855441e-70	13746323	13768795
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	13766264	14142555	100	94	0.576	4.19748815855441e-70	13746323	13768795	4.71016156611753e-73	14112462	14148063
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	14144159	76116026	18038	16877	-0.0104	4.71016156611753e-73	14112462	14148063	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	11448975	5172	4830	0.0443	NA	NA	NA	2.60735930006121e-09	11448975	11448975
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.6135	2.60735930006121e-09	11448975	11448975	2.49251654393346e-10	11452390	11452390
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	63788698	17885	16690	0.0253	2.49251654393346e-10	11452390	11452390	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	550	-0.0183	NA	NA	NA	9.54732577242257e-46	1506379	1515948
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-1.596	9.54732577242257e-46	1506379	1515948	5.66172453787539e-52	1525300	1531162
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	57731345	19033	17763	0.0052	5.66172453787539e-52	1525300	1531162	1.14457514838057e-12	57727183	57734633
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	57732801	57748610	10	10	-0.7626	1.14457514838057e-12	57727183	57734633	2.1609103542333e-11	57746049	57751678
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	57750065	62419534	1941	1797	-0.0052	2.1609103542333e-11	57746049	57751678	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12552	-9e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2801	0.0227	NA	NA	NA	3.66548616388507e-32	22644243	22686690
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	0.9304	3.66548616388507e-32	22644243	22686690	8.21295251660196e-36	22718614	22736990
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	22735036	1	0	NA	8.21295251660196e-36	22718614	22736990	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22736990	35472378	6546	6065	0.014	NA	NA	NA	1.42219992876373e-11	35472378	35472378
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.6858	1.42219992876373e-11	35472378	35472378	3.53873145626419e-11	35476942	35476942
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	3.53873145626419e-11	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	49571068	7002	6525	0.0197	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	127779	31	30	0.0216	NA	NA	NA	3.35249305492527e-06	124528	127779
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	130528	3	3	-1.0397	3.35249305492527e-06	124528	127779	8.07168977161482e-06	130528	132689
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	266212	93	92	0.0224	8.07168977161482e-06	130528	132689	4.64775076754423e-05	264190	266212
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.235	4.64775076754423e-05	264190	266212	8.20655139030854e-07	267079	268402
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1427392	658	613	0.0353	8.20655139030854e-07	267079	268402	9.05050785338842e-14	1427338	1431240
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.1673	9.05050785338842e-14	1427338	1431240	1.73466809644592e-12	1432891	1432953
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1434970	1	0	NA	1.73466809644592e-12	1432891	1432953	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1435082	2708291	1001	934	6e-04	NA	NA	NA	0	2708113	2711273
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	21353	0.9454	0	2708113	2711273	1.26738078424288e-13	76998610	76998610
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.8319	1.26738078424288e-13	76998610	76998610	7.89866453826492e-14	77010018	77010018
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154050185	22064	20614	0.9454	7.89866453826492e-14	77010018	77010018	8.65653160204475e-05	154038318	154051619
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154051619	154070953	5	5	1.6667	8.65653160204475e-05	154038318	154051619	4.67765480077751e-05	154070179	154086636
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154078401	154442377	92	85	0.9662	4.67765480077751e-05	154070179	154086636	1.13739906875339e-51	154442377	154442377
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-1.8966	1.13739906875339e-51	154442377	154442377	1.55251738697317e-82	154450309	154450309
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	1.0106	1.55251738697317e-82	154450309	154450309	3.15026231282044e-57	154582414	154586690
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	188	-0.0191	3.15026231282044e-57	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	122	-3.9468	NA	NA	NA	1.58224567405346e-13	3777766	4413507
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.3794	1.58224567405346e-13	3777766	4413507	8.75186826120689e-08	4948824	6692482
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	160	-3.5042	8.75186826120689e-08	4948824	6692482	4.76856773348871e-05	6983447	7233066
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	113	-2.7781	4.76856773348871e-05	6983447	7233066	0.00542808176865066	7341847	7568006
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7606496	19	19	-3.9274	0.00542808176865066	7341847	7568006	0.00682188994755755	7584183	7626352
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7608619	7653082	19	18	-2.6002	0.00682188994755755	7584183	7626352	5.53097027540397e-06	7632577	7660965
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-4.0803	5.53097027540397e-06	7632577	7660965	2.46175629177252e-10	7705876	7713973
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	22	-2.3254	2.46175629177252e-10	7705876	7713973	0.0263668532808587	7745143	7865557
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7997485	59	56	-3.3274	0.0263668532808587	7745143	7865557	0.0184374502744577	7831268	8059682
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8178487	39	33	-4.1455	0.0184374502744577	7831268	8059682	1.41337047870812e-05	8168499	8179883
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8193270	5	5	-2.4935	1.41337047870812e-05	8168499	8179883	1.47009734401738e-06	8186463	8195174
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8195174	8280065	21	19	-4.0609	1.47009734401738e-06	8186463	8195174	0.000382459956184904	8254853	8333193
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8690572	114	105	-3.1454	0.000382459956184904	8254853	8333193	4.30870540571487e-07	8637652	8754898
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	10513747	191	174	-3.841	4.30870540571487e-07	8637652	8754898	7.45112084531654e-28	10512616	10513747
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.4454	7.45112084531654e-28	10512616	10513747	0.00174002951326655	10622062	11660512
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11698871	6	6	-2.3197	0.00174002951326655	10622062	11660512	0.0124271488073057	10655750	12502304
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12536761	10	10	-4.0929	0.0124271488073057	10655750	12502304	9.0756699473591e-06	12533900	12550566
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	53	-2.0354	9.0756699473591e-06	12533900	12550566	8.08864914702384e-06	12627412	12721434
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12852769	28	26	-3.4982	8.08864914702384e-06	12627412	12721434	0.000126971884890122	12809152	12898049
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12855363	13128515	107	101	-2.2616	0.000126971884890122	12809152	12898049	1.35532733433106e-39	13111594	13137597
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14359748	417	390	-3.8446	1.35532733433106e-39	13111594	13137597	6.51502117043915e-05	14118164	14440701
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14508021	88	85	-3.2365	6.51502117043915e-05	14118164	14440701	1.32020754702368e-06	14496442	14536962
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.32020754702368e-06	14496442	14536962	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.7113	NA	NA	NA	1.03176754465429e-15	14563486	14596156
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15521958	327	305	-3.6613	1.03176754465429e-15	14563486	14596156	7.53879511782773e-06	15517551	15521958
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15523178	15523178	1	0	NA	7.53879511782773e-06	15517551	15521958	NA	NA	NA
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15531144	5	5	-1.0752	NA	NA	NA	0.000883589811076593	15528826	15543194
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15532597	15583573	28	28	-3.1545	0.000883589811076593	15528826	15543194	1.67283624909601e-05	15559959	15630463
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	50	-4.3196	1.67283624909601e-05	15559959	15630463	1.21483878019198e-10	15867364	15949457
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	93	-3.0705	1.21483878019198e-10	15867364	15949457	1.96650692379325e-09	16115542	16206224
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	17778338	282	259	-3.9094	1.96650692379325e-09	16115542	16206224	6.07822692893608e-08	17709484	17802714
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17782139	17867218	34	30	-2.6667	6.07822692893608e-08	17709484	17802714	7.30494285833156e-08	17828001	17918818
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17873030	22139807	680	635	-3.8521	7.30494285833156e-08	17828001	17918818	1.61071800082922e-08	22052726	22139807
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-1.5342	1.61071800082922e-08	22052726	22139807	4.51110258517780e-06	22175425	22177335
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-3.5154	4.5111025851778e-06	22175425	22177335	0.000251489331379705	22181855	22203194
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	22	-4.7834	0.000251489331379705	22181855	22203194	4.44595391982836e-06	22252795	22400925
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	25737663	66	59	-3.6847	4.44595391982836e-06	22252795	22400925	2.67967889006174e-36	22930737	26870361
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	26	-1.1643	2.67967889006174e-36	22930737	26870361	0.00158719661606633	26943701	27011035
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27064654	24	22	-2.6238	0.00158719661606633	26943701	27011035	3.90880200773942e-05	27009433	27070887
MSK_252152912026_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27067889	57440809	29	27	-0.624	3.90880200773942e-05	27009433	27070887	NA	NA	NA
