Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	9134330	2961	2842	0.0119	NA	NA	NA	1.02579935502308e-07	9124303	9140329
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	9134946	9186021	28	28	0.2558	1.02579935502308e-07	9124303	9140329	4.39869301989253e-07	9162345	9222266
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	9190565	9190565	1	0	NA	4.39869301989253e-07	9162345	9222266	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	9194572	16963812	2805	2706	0.029	NA	NA	NA	5.37235701084753e-08	16921319	17086698
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	17127039	12	12	0.3946	5.37235701084753e-08	16921319	17086698	2.44924157817725e-08	17121583	17158730
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	34734522	7068	6781	0.0275	2.44924157817725e-08	17121583	17158730	5.8018247957514e-26	34734522	34739490
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34739490	34758017	3	3	-1.3154	5.8018247957514e-26	34734522	34739490	1.33497220442003e-25	34744470	34758017
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34761645	48608213	5475	5293	0.0164	1.33497220442003e-25	34744470	34758017	2.86597405950429e-09	48600659	48609818
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	48609818	48624489	8	7	0.5504	2.86597405950429e-09	48600659	48609818	5.5495578711428e-10	48623523	48630251
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	48628969	56831355	3270	3155	0.0017	5.5495578711428e-10	48623523	48630251	6.25883277233517e-07	56807343	56839483
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	56833773	56833773	1	0	NA	6.25883277233517e-07	56807343	56839483	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	56837302	56859706	9	9	0.2973	NA	NA	NA	3.48113292312860e-05	56858921	56874495
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	56863948	59803337	1245	1184	-0.0431	3.4811329231286e-05	56858921	56874495	5.50698911893882e-07	59798905	59805792
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	59805792	59812162	4	4	-0.632	5.50698911893882e-07	59798905	59805792	5.96888530444478e-08	59810341	59813981
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	59813981	72537426	5004	4803	-0.0034	5.96888530444478e-08	59810341	59813981	0	72537426	72537426
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72539143	1	0	NA	0	72537426	72537426	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72540240	72579311	13	12	-3.4373	NA	NA	NA	0	72579311	72579311
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	0	72579311	72579311	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	103929627	10116	9743	0.0026	NA	NA	NA	2.19414842758606e-20	103929627	103929627
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103932025	103932025	1	0	NA	2.19414842758606e-20	103929627	103929627	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	104012520	3	3	-1.1655	NA	NA	NA	4.36013661202328e-20	104012520	104012520
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	109987341	1567	1523	-0.0025	4.36013661202328e-20	104012520	104012520	4.81785625248995e-20	109987341	109987341
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.4197	4.81785625248995e-20	109987341	109987341	1.81813574542767e-14	109989998	109989998
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110014625	11	10	0.0108	1.81813574542767e-14	109989998	109989998	0.000637109383857736	110006354	110023268
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.4576	0.000637109383857736	110006354	110023268	4.95239084022598e-06	110034542	110065530
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	111396840	548	525	-0.0228	4.95239084022598e-06	110034542	110065530	1.34846665214684e-06	111390573	111396840
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111398104	111423823	3	2	-0.8045	1.34846665214684e-06	111390573	111396840	3.47449578148417e-06	111423823	111435786
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111435786	116029725	1670	1598	0.0122	3.47449578148417e-06	111423823	111435786	5.19471664783477e-08	116028595	116029725
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-0.9109	5.19471664783477e-08	116028595	116029725	1.74761987502147e-10	116033402	116033402
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	150819879	3626	3476	0.0091	1.74761987502147e-10	116033402	116033402	6.26918736578172e-103	150819879	150819879
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.3664	6.26918736578172e-103	150819879	150819879	4.81084685068974e-97	150851439	150851439
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157016700	2715	2624	0.0271	4.81084685068974e-97	150851439	150851439	4.53679255295297e-06	157010425	157016700
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157018042	157025338	6	5	-0.4884	4.53679255295297e-06	157010425	157016700	4.00771209069882e-06	157025338	157035743
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157032475	157133150	40	40	0.0059	4.00771209069882e-06	157025338	157035743	1.69426640316712e-161	157133150	157133150
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.9005	1.69426640316712e-161	157133150	157133150	1.01873102169708e-150	157136342	157136342
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1564	-0.0082	1.01873102169708e-150	157136342	157136342	1.47562965069800e-07	161099067	161099582
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-0.9067	1.475629650698e-07	161099067	161099582	1.96938875770589e-08	161104791	161104791
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167483267	2484	2391	-0.016	1.96938875770589e-08	161104791	161104791	0	167483267	167483267
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-3.8016	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	177595302	3988	3840	0.0015	0	167507898	167507898	2.77036171986206e-09	177593746	177595302
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177596757	177599597	3	3	-0.7788	2.77036171986206e-09	177593746	177595302	2.37378815667600e-08	177599597	177601540
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177601540	185979586	3218	3102	-0.0031	2.373788156676e-08	177599597	177601540	4.7989286099446e-15	185979586	185979586
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.2635	4.7989286099446e-15	185979586	185979586	4.14453120674928e-17	185988138	185988138
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1903	0.008	4.14453120674928e-17	185988138	185988138	3.67722117078866e-28	194977713	195011344
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.7581	3.67722117078866e-28	194977713	195011344	1.97412179746091e-25	195048208	195091758
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200613454	2163	2081	0.011	1.97412179746091e-25	195048208	195091758	1.17967672529522e-09	200594055	200623556
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200679934	26	25	-0.278	1.17967672529522e-09	200594055	200623556	1.32074599403130e-09	200672373	200787319
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200683992	228529602	10140	9776	0.0038	1.3207459940313e-09	200672373	200787319	3.24938487417594e-07	228501901	228541553
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228530851	228586562	33	33	-0.2113	3.24938487417594e-07	228501901	228541553	9.17879548691663e-07	228571315	228621948
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228589725	229989433	603	590	-0.0059	9.17879548691663e-07	228571315	228621948	1.68659684869638e-24	229988285	229991008
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229991008	230015230	13	12	0.622	1.68659684869638e-24	229988285	229991008	1.18708551579164e-24	230013928	230016373
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	230016373	244907498	5779	5555	-0.0059	1.18708551579164e-24	230013928	230016373	6.24583158195655e-09	244893736	244915107
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244907523	244935586	13	13	0.3652	6.24583158195655e-09	244893736	244915107	8.78944210675927e-09	244923438	244944058
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244937126	247186514	835	804	0.002	8.78944210675927e-09	244923438	244944058	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	186548	54	51	0.0343	NA	NA	NA	3.09070498114352e-12	183756	194007
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190527	208996	10	10	0.4801	3.09070498114352e-12	183756	194007	1.49718531495469e-19	206792	213556
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	211980	34543992	11458	11050	-0.0118	1.49718531495469e-19	206792	213556	1.4429962386521e-195	34543992	34543992
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	1.4684	1.4429962386521e-195	34543992	34543992	4.01483622005697e-190	34589997	34589997
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	6924	0.0058	4.01483622005697e-190	34589997	34589997	4.49552425653976e-14	52588009	52600588
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	4.49552425653976e-14	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.8437	NA	NA	NA	8.47953765067314e-15	52635695	52639605
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	55522309	1048	1002	-0.0012	8.47953765067314e-15	52635695	52639605	5.97160181001221e-12	55520090	55522309
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55532088	55535289	3	3	-0.8808	5.97160181001221e-12	55520090	55522309	1.21088089959195e-11	55535289	55539869
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55537790	55537790	1	0	NA	1.21088089959195e-11	55535289	55539869	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55539869	106244482	14121	13604	-0.0014	NA	NA	NA	4.48454144265004e-25	106244482	106244482
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.5547	4.48454144265004e-25	106244482	106244482	1.13482573758423e-24	106250718	106250718
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	228476029	38581	37109	-0.005	1.13482573758423e-24	106250718	106250718	1.90033998235106e-08	228470605	228477841
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	228477841	228491671	9	9	-0.4498	1.90033998235106e-08	228470605	228477841	9.19330036622734e-09	228489685	228497403
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	228494502	232438658	1477	1424	0.0047	9.19330036622734e-09	228489685	228497403	7.94522633715053e-08	232435445	232438658
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232440710	232450841	7	7	0.4925	7.94522633715053e-08	232435445	232438658	3.35881104931304e-09	232450841	232452428
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232451533	242689978	3841	3727	-0.0188	3.35881104931304e-09	232450841	232452428	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	75479859	26876	25896	-0.0064	NA	NA	NA	2.24474132023525e-14	75461860	75784655
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75875904	18	17	-0.368	2.24474132023525e-14	75461860	75784655	9.57990796025293e-11	75870144	76019295
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	86128722	2956	2845	-0.0139	9.57990796025293e-11	75870144	76019295	8.08200777544374e-08	86127477	86128722
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	86130210	86131721	2	2	0.8721	8.08200777544374e-08	86127477	86128722	2.36313850496305e-07	86131721	86134142
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	86134142	132366966	13507	12994	-0.0044	2.36313850496305e-07	86131721	86134142	5.57161454481314e-07	132342893	132379006
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	132368981	132430096	28	26	-0.2422	5.57161454481314e-07	132342893	132379006	5.15370666539124e-06	132403080	132462774
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	132433236	133189686	322	313	-0.0231	5.15370666539124e-06	132403080	132462774	2.41586621996931e-11	133189686	133189686
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.0101	2.41586621996931e-11	133189686	133189686	4.37235275776621e-10	133194685	133194685
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	4.37235275776621e-10	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	163992903	9776	9404	-0.0047	NA	NA	NA	4.53526719239547e-304	163992903	164005577
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	-2.7556	4.53526719239547e-304	163992903	164005577	0.00394618537397645	164005577	164048489
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	-4.5531	0.00394618537397645	164005577	164048489	0	164107951	164107951
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	187890040	7836	7518	0.0064	0	164107951	164107951	4.62027037752342e-36	187890040	187890040
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187891716	187901855	6	6	-1.0579	4.62027037752342e-36	187890040	187890040	1.67268496744074e-35	187901855	187901855
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187903422	191219222	1280	1231	-0.0239	1.67268496744074e-35	187901855	187901855	4.75014960176594e-45	191219222	191219222
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-2.1632	4.75014960176594e-45	191219222	191219222	1.07544759248117e-42	191222891	191222891
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	196822133	2008	1927	-0.0188	1.07544759248117e-42	191222891	191222891	1.43079944137578e-94	196822133	196835413
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	21	-0.9735	1.43079944137578e-94	196822133	196835413	8.19263800592556e-104	196929805	196929826
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	198012513	427	416	0.0402	8.19263800592556e-104	196929805	196929826	2.52414209526034e-09	198002627	198012513
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198014255	198027242	7	6	0.5943	2.52414209526034e-09	198002627	198012513	1.25950149109256e-08	198027242	198031296
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198029277	199329592	529	507	0.0026	1.25950149109256e-08	198027242	198031296	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3252	-0.0075	NA	NA	NA	1.64896355246765e-13	9800777	9815760
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.8232	1.64896355246765e-13	9800777	9815760	3.74792493234274e-14	9842644	9853710
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	39477051	7741	7442	-0.0138	3.74792493234274e-14	9842644	9853710	1.53060923503173e-09	39470164	39477051
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39481114	39490397	5	5	0.4782	1.53060923503173e-09	39470164	39477051	2.19325750870496e-09	39490397	39495229
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39493782	64376590	6208	5973	2e-04	2.19325750870496e-09	39490397	39495229	5.79204812529606e-10	64376590	64376590
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-0.9857	5.79204812529606e-10	64376590	64376590	1.40941026334538e-09	64390333	64390333
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1047	-0.0014	1.40941026334538e-09	64390333	64390333	2.49095348605846e-91	68905670	68905670
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	1.1329	2.49095348605846e-91	68905670	68905670	1.31803054888278e-80	69165814	69165814
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	112	0.0079	1.31803054888278e-80	69165814	69165814	3.31616062300498e-13	70150576	70150576
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	3	-0.8987	3.31616062300498e-13	70150576	70150576	3.40894987905351e-12	70216707	70216707
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	70294312	1	0	NA	3.40894987905351e-12	70216707	70216707	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70336467	107275274	12583	12158	6e-04	NA	NA	NA	3.2698154233602e-287	107275274	107275274
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-3.6758	3.2698154233602e-287	107275274	107275274	1.34304965889673e-288	107281410	107281410
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	173224400	18484	17806	-0.0047	1.34304965889673e-288	107281410	107281410	2.16904878728271e-42	173224400	173224400
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.0157	2.16904878728271e-42	173224400	173224400	4.21092413050462e-24	173228860	173228860
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	184	-0.0192	4.21092413050462e-24	173228860	173228860	7.88335072219185e-24	173660684	173660684
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.5761	7.88335072219185e-24	173660684	173660684	6.43438153221456e-27	173666072	173666072
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	185990783	3507	3373	-0.0129	6.43438153221456e-27	173666072	173666072	5.6140303008467e-11	185990783	185990783
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185992856	185992856	1	0	NA	5.6140303008467e-11	185990783	185990783	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185994077	185995739	2	2	-1.0261	NA	NA	NA	2.0805638315372e-10	185995739	185995739
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185998398	190749363	1709	1635	-0.0288	2.0805638315372e-10	185995739	185995739	7.65523468058117e-15	190678203	190772330
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190752920	190921041	60	59	-0.2497	7.65523468058117e-15	190678203	190772330	4.65953683695055e-05	190899545	190979524
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	43	-0.0356	4.65953683695055e-05	190899545	190979524	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	108250253	29915	28801	-0.0076	NA	NA	NA	2.59350586408779e-21	108231402	108266794
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	108252641	108300203	25	25	0.2381	2.59350586408779e-21	108231402	108266794	1.41574837677247e-07	108288515	108315981
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	108302683	112980134	1577	1516	-0.0113	1.41574837677247e-07	108288515	108315981	2.42936894893882e-12	112975717	112980134
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112994625	113009172	4	4	-0.7934	2.42936894893882e-12	112975717	112980134	9.00667308448804e-13	113009172	113018055
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	113018055	130634552	4674	4505	-0.0043	9.00667308448804e-13	113009172	113018055	2.4626965771807e-09	130631382	130640651
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130638815	130650977	8	8	0.4769	2.4626965771807e-09	130631382	130640651	4.43388251470184e-09	130647954	130655270
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130652439	155405839	9280	8960	-0.0059	4.43388251470184e-09	130647954	130655270	9.1525610716068e-09	155404062	155405839
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	0.5946	9.1525610716068e-09	155404062	155405839	7.69620311324149e-09	155421443	155427589
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	174084859	6003	5765	-0.0043	7.69620311324149e-09	155421443	155427589	3.67475314531192e-21	174078177	174086025
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174086025	174121702	13	13	0.5598	3.67475314531192e-21	174078177	174086025	5.92850506867317e-18	174117406	174131366
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174125438	180644810	2262	2190	0.0145	5.92850506867317e-18	174117406	174131366	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	37	-0.0104	NA	NA	NA	1.85960413093659e-15	191387	204881
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	16	0.4983	1.85960413093659e-15	191387	204881	1.1123442525225e-20	236535	244363
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	31382291	11124	10727	-9e-04	1.1123442525225e-20	236535	244363	1.77419217135206e-42	31382291	31382291
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31385778	2	2	-2.0159	1.77419217135206e-42	31382291	31382291	0.00200962225188380	31385778	31385778
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	0.6916	0.0020096222518838	31385778	31385778	3.38518801900718e-11	31390982	31425113
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32548736	488	472	0.0589	3.38518801900718e-11	31390982	31425113	2.15590015683313e-35	32548736	32548736
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32563252	2	0	NA	2.15590015683313e-35	32548736	32548736	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32564884	32590568	4	2	-1.8584	NA	NA	NA	1.15743256476200e-07	32590568	32593151
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32711957	39	38	0.0088	1.157432564762e-07	32590568	32593151	0.00220212076263376	32668835	32718991
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32728487	9	8	0.5292	0.00220212076263376	32668835	32718991	1.18340670932035e-10	32721872	32732764
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	72919733	12797	12273	0.0031	1.18340670932035e-10	32721872	32732764	2.65237492506352e-254	72919733	72919733
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-4.069	2.65237492506352e-254	72919733	72919733	5.30962025274816e-261	72924440	72924440
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	103841482	8669	8339	0.001	5.30962025274816e-261	72924440	72924440	3.93044550639778e-193	103841482	103841482
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-3.0148	3.93044550639778e-193	103841482	103841482	1.72145567384663e-193	103868154	103868154
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	10107	-0.0017	1.72145567384663e-193	103868154	103868154	1.60627739402395e-11	134627341	134629897
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-0.7585	1.60627739402395e-11	134627341	134629897	1.30651652707849e-13	134635779	134639397
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	139643729	1896	1821	0.0053	1.30651652707849e-13	134635779	134639397	1.16247629539749e-12	139643729	139643729
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-0.8455	1.16247629539749e-12	139643729	139643729	2.13349820124593e-10	139648318	139651247
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	152106445	4147	3979	-0.0011	2.13349820124593e-10	139648318	139651247	1.3377776017813e-17	152106445	152106445
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152108223	152108223	1	0	NA	1.3377776017813e-17	152106445	152106445	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152109867	152113479	3	3	-1.0879	NA	NA	NA	2.06833365838949e-16	152113479	152113479
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152114728	170753106	6380	6139	-0.0265	2.06833365838949e-16	152113479	152113479	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	136373	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	138059	1182977	324	309	-0.0168	NA	NA	NA	3.58840034694801e-09	1148577	1200432
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1185629	1293504	43	43	0.2064	3.58840034694801e-09	1148577	1200432	5.63635391941931e-15	1274938	1360571
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1296030	1296030	1	0	NA	5.63635391941931e-15	1274938	1360571	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1300064	71200243	21178	20317	-0.004	NA	NA	NA	1.44522691503482e-21	71197861	71203792
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71203792	71221375	12	12	0.6018	1.44522691503482e-21	71197861	71203792	1.82038472975552e-38	71219030	71223629
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71223629	93162991	6889	6641	0.0085	1.82038472975552e-38	71219030	71223629	2.65507258455248e-33	93162991	93162991
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.9505	2.65507258455248e-33	93162991	93162991	1.20283678171769e-08	93168978	93174734
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	93172507	1	0	NA	1.20283678171769e-08	93168978	93174734	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93174734	98646545	1945	1864	0.0144	NA	NA	NA	8.16791913227408e-07	98642522	98646545
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	98648490	98650383	2	2	0.8508	8.16791913227408e-07	98642522	98646545	1.18013311055034e-06	98650383	98652572
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	98652572	99014019	179	175	0.0465	1.18013311055034e-06	98650383	98652572	2.09780371995937e-06	99011831	99014019
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	99028753	99028796	2	2	-0.7433	2.09780371995937e-06	99011831	99014019	6.75508107128066e-43	99028796	99031710
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	99031710	125831554	11859	11423	0.0079	6.75508107128066e-43	99028796	99031710	1.31298188118289e-252	125831554	125831554
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.0286	1.31298188118289e-252	125831554	125831554	2.32641637298573e-242	125837524	125837524
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	131331090	2615	2500	0.0116	2.32641637298573e-242	125837524	125837524	8.13209732453214e-08	131297724	131364280
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131333773	131424513	40	39	0.2083	8.13209732453214e-08	131297724	131364280	2.55980629576551e-11	131408649	131437545
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131426580	133433384	999	952	-0.0288	2.55980629576551e-11	131408649	131437545	8.1862963493889e-07	133426938	133437464
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-0.4295	8.1862963493889e-07	133426938	133437464	1.47304614764445e-07	133444486	133456873
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	139833866	2976	2873	0.0038	1.47304614764445e-07	133444486	133456873	1.49784015708286e-09	139831752	139835966
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	139835966	139841431	3	3	0.7958	1.49784015708286e-09	139831752	139835966	1.2493727800217e-08	139839274	139844797
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	139844797	141690753	851	822	-0.0066	1.2493727800217e-08	139839274	139844797	6.44324799981329e-14	141687978	141690753
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	7	0.6504	6.44324799981329e-14	141687978	141690753	3.85493215829682e-15	141711513	141712786
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	144038049	817	784	-0.0065	3.85493215829682e-15	141711513	141712786	9.30581433547776e-09	144034197	144048625
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144039405	144058853	10	8	0.4679	9.30581433547776e-09	144034197	144048625	1.11537520835656e-08	144054697	144063347
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144061908	147168935	1423	1367	-0.0116	1.11537520835656e-08	144054697	144063347	4.10382026688111e-05	147167412	147168935
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147170276	147170312	2	2	0.7317	4.10382026688111e-05	147167412	147168935	1.79805161035081e-05	147170312	147176659
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147176659	147702365	262	255	0.0122	1.79805161035081e-05	147170312	147176659	1.41629728788803e-25	147702365	147702365
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.5723	1.41629728788803e-25	147702365	147702365	8.01787872007796e-22	147707161	147707161
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	147708382	1	0	NA	8.01787872007796e-22	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147710037	158821263	4237	4068	-0.0252	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	119	-0.0631	NA	NA	NA	1.29986481449559e-13	581533	581533
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.2891	1.29986481449559e-13	581533	581533	6.45820872112255e-14	588865	588865
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	1739645	396	382	-0.0549	6.45820872112255e-14	588865	588865	1.20247843628000e-06	1723479	1745018
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1740285	1762209	19	19	0.2219	1.20247843628e-06	1723479	1745018	2.91218483101853e-06	1757909	1776351
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1762817	2107880	167	161	-0.0549	2.91218483101853e-06	1757909	1776351	3.13350989859388e-05	2088136	2107880
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2111654	2137441	9	9	0.3015	3.13350989859388e-05	2088136	2107880	1.09631866669852e-10	2134012	2183619
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2139449	2139449	1	0	NA	1.09631866669852e-10	2134012	2183619	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2141996	25119007	7445	7175	-0.0177	NA	NA	NA	6.47509447978852e-111	25119007	25119007
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25123025	2	0	NA	6.47509447978852e-111	25119007	25119007	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-3.3041	NA	NA	NA	6.87285640073922e-115	25125700	25125700
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4726	0.0032	6.87285640073922e-115	25125700	25125700	1.88330022175965e-07	39323431	39356595
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39394527	17	17	-0.2969	1.88330022175965e-07	39323431	39356595	0.00100068334425191	39378051	39402433
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39401641	39423493	9	9	-0.0185	0.00100068334425191	39378051	39402433	2.50584008481998e-05	39420136	39435320
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39427807	39488281	25	24	-0.3084	2.50584008481998e-05	39420136	39435320	1.01654289053443e-21	39479971	39504332
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39490826	146264846	31441	30302	-0.0043	1.01654289053443e-21	39479971	39504332	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	262805	32	30	0.5866	NA	NA	NA	3.09739270705037e-57	261257	264530
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	264530	15802255	5426	5219	-0.0062	3.09739270705037e-57	261257	264530	7.00817522090156e-85	15802255	15802255
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-2.7871	7.00817522090156e-85	15802255	15802255	8.93606726968672e-78	15807123	15807123
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2279	-0.0055	8.93606726968672e-78	15807123	15807123	3.12122182903942e-09	22477358	22477358
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	0.9769	3.12122182903942e-09	22477358	22477358	1.18390548129589e-10	22492603	22492603
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	28173829	1341	1285	-0.0153	1.18390548129589e-10	22492603	22492603	1.07804929250252e-06	28168924	28175930
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28175930	28182921	5	5	0.4882	1.07804929250252e-06	28168924	28175930	6.62981721333745e-06	28181461	28189070
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28185232	39146895	3546	3410	0.0042	6.62981721333745e-06	28181461	28189070	5.65095354701984e-23	39146895	43530076
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43776365	6	6	0.859	5.65095354701984e-23	39146895	43530076	1.13768355491914e-21	43644906	44199401
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	44199401	70926188	335	326	-0.0353	1.13768355491914e-21	43644906	44199401	4.75384789576618e-22	70926188	70926188
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.7534	4.75384789576618e-22	70926188	70926188	5.56852335550925e-32	70930528	70930528
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	95532782	8130	7840	-0.0072	5.56852335550925e-32	70930528	70930528	2.10019255906832e-13	95532782	95532782
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	95541017	95562897	2	2	-1.1468	2.10019255906832e-13	95532782	95532782	2.17895501314981e-13	95562897	95562897
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	95567432	100348045	1787	1732	-0.0016	2.17895501314981e-13	95562897	95562897	5.6893661393621e-07	100346872	100348045
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	0.837	5.6893661393621e-07	100346872	100348045	4.58205650634959e-07	100350814	100353031
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	107564300	2308	2234	-0.0205	4.58205650634959e-07	100350814	100353031	1.00262297078867e-07	107561394	107564300
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	107567321	107567415	2	2	-0.9155	1.00262297078867e-07	107561394	107564300	1.39360378495966e-08	107567415	107571927
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	107571927	116116077	3234	3119	0.005	1.39360378495966e-08	107567415	107571927	7.5729870473579e-11	116113464	116116077
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116118907	116130333	5	5	-0.6461	7.5729870473579e-11	116113464	116116077	2.29397751492695e-09	116130333	116132839
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	128663966	4692	4496	-0.0135	2.29397751492695e-09	116130333	116132839	4.03516428488734e-08	128656749	128663966
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128667210	128678988	7	7	0.4862	4.03516428488734e-08	128656749	128663966	0.0143134679789211	128674722	128691535
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128681710	128710906	13	13	0.2382	0.0143134679789211	128674722	128691535	0.000219813082742361	128697140	128728203
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128712043	129070378	174	170	-0.0215	0.000219813082742361	128697140	128728203	3.23741564433461e-05	129062290	129070378
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129073783	129082497	6	6	-0.4323	3.23741564433461e-05	129062290	129070378	8.13250944654775e-05	129082497	129090806
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129084346	129219834	69	65	0.0079	8.13250944654775e-05	129082497	129090806	3.26006061137845e-06	129218343	129219834
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129221786	129224728	3	3	-0.6722	3.26006061137845e-06	129218343	129219834	7.75021785384409e-08	129224728	129226241
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129226241	129463244	111	107	0.0487	7.75021785384409e-08	129224728	129226241	0.000289222906647622	129433779	129479488
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129465544	129508476	24	24	-0.1587	0.000289222906647622	129433779	129479488	1.74660946132653e-10	129487329	129563505
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129510647	137352394	3196	3066	0.0212	1.74660946132653e-10	129487329	129563505	1.18965677698825e-15	137352394	137352394
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.3308	1.18965677698825e-15	137352394	137352394	1.78198445693836e-14	137356880	137356880
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1063	0.0087	1.78198445693836e-14	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	504010	168	164	-0.0661	NA	NA	NA	3.86591360063657e-08	489591	506195
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	506195	533688	13	13	0.2817	3.86591360063657e-08	489591	506195	3.86065635460923e-21	529713	551764
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	535766	98993621	31449	30274	-0.0016	3.86065635460923e-21	529713	551764	1.69001253026395e-23	98985067	98996169
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	98995967	99010856	8	8	0.4901	1.69001253026395e-23	98985067	98996169	8.95204783363214e-09	99007407	99019181
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	99013267	100676022	719	678	0.0047	8.95204783363214e-09	99007407	99019181	1.18847564088297e-10	100676022	100676022
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686753	3	3	-0.86	1.18847564088297e-10	100676022	100676022	2.70537282110943e-14	100686753	100686787
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	120828585	7199	6945	0.004	2.70537282110943e-14	100686753	100686787	1.09004021165888e-14	120815102	120840162
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	120831019	120852054	11	9	0.3303	1.09004021165888e-14	120815102	120840162	1.32957517380886e-11	120841685	120863440
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	120855133	135285645	5238	5022	-0.0342	1.32957517380886e-11	120841685	120863440	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	16280	-0.0053	NA	NA	NA	6.45066214436388e-20	55097753	55134486
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	37	-0.338	6.45066214436388e-20	55097753	55134486	3.72001031967341e-21	55197848	55221692
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	56379397	494	474	0.0027	3.72001031967341e-21	55197848	55221692	2.30395540763888e-06	56378231	56379397
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	56381250	56382664	2	2	0.7755	2.30395540763888e-06	56378231	56379397	9.32529703753966e-06	56382664	56384407
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	56384407	60055276	1382	1332	0.0072	9.32529703753966e-06	56382664	56384407	5.751971974767e-12	60053429	60055276
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	60066425	60068058	3	3	-0.8814	5.751971974767e-12	60053429	60055276	7.05885156569144e-13	60068058	60068058
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	60069441	63745293	1507	1447	0.0403	7.05885156569144e-13	60068058	60068058	4.4333160878581e-07	63723944	63755688
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	63746801	63778254	14	14	0.3629	4.4333160878581e-07	63723944	63755688	8.38456688089139e-07	63764128	63788958
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	63779767	65000428	594	577	0.0438	8.38456688089139e-07	63764128	63788958	4.51741883307367e-11	64989812	65011475
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65003889	65062840	25	25	0.3479	4.51741883307367e-11	64989812	65011475	2.81095820935962e-20	65054293	65072205
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65065965	106733851	14017	13504	-0.0063	2.81095820935962e-20	65054293	65072205	2.31711711789694e-14	106732431	106733851
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	0.6414	2.31711711789694e-14	106732431	106733851	1.01015949649146e-08	106747920	106754784
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	113976883	2648	2537	-2e-04	1.01015949649146e-08	106747920	106754784	9.57732089886254e-09	113970622	113976883
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113979934	113996548	5	5	-0.5962	9.57732089886254e-09	113970622	113976883	8.59215088088052e-21	113996548	114016954
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113999831	134450318	7665	7362	-0.0135	8.59215088088052e-21	113996548	114016954	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	281	0.0353	NA	NA	NA	1.36560417044523e-11	734832	736988
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.6963	1.36560417044523e-11	734832	736988	1.03997327034958e-08	743223	745410
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	4605327	1650	1594	-0.0141	1.03997327034958e-08	743223	745410	8.4124025767114e-06	4579106	4607037
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4607037	4627145	12	12	0.2816	8.4124025767114e-06	4579106	4607037	5.89645840118802e-05	4622293	4650595
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4629330	7899058	1290	1218	0.0087	5.89645840118802e-05	4622293	4650595	8.90812954046495e-14	7890143	7913049
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7900758	7951531	19	19	0.3593	8.90812954046495e-14	7890143	7913049	8.17279823288794e-12	7946271	7962973
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7955907	11116883	1058	1015	-0.0062	8.17279823288794e-12	7946271	7962973	4.322708497973e-59	11116883	11116883
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	1.4518	4.322708497973e-59	11116883	11116883	5.51086974764175e-66	11140421	11140421
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	94810929	26900	25960	0.0089	5.51086974764175e-66	11140421	11140421	1.77973684033405e-08	94799386	94815148
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	94812892	94841392	12	12	0.3919	1.77973684033405e-08	94799386	94815148	1.86268124248773e-35	94836701	94854699
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	94847520	132289090	13913	13383	0.0053	1.86268124248773e-35	94836701	94854699	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7067	-0.0103	NA	NA	NA	8.52835177602002e-25	37953582	37953582
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-1.5819	8.52835177602002e-25	37953582	37953582	7.5467147316528e-24	37957844	37957844
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	39663234	666	645	-0.0156	7.5467147316528e-24	37957844	37957844	3.81207596758768e-08	39638325	39676679
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	39667970	39698065	14	14	-0.3524	3.81207596758768e-08	39638325	39676679	5.9912659539358e-09	39690136	39706667
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	39700449	49964838	4199	4024	-5e-04	5.9912659539358e-09	39690136	39706667	6.12433821929806e-23	49964838	49964838
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.4624	6.12433821929806e-23	49964838	49964838	6.85387998102427e-20	49971732	49971732
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1742	-0.0064	6.85387998102427e-20	49971732	49971732	2.72831025474811e-17	56646284	56658479
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56686863	15	15	0.4901	2.72831025474811e-17	56646284	56658479	3.45689841454339e-19	56685341	56691355
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	63118944	1459	1395	-0.0068	3.45689841454339e-19	56685341	56691355	2.98490349203250e-08	63113626	63118944
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63123793	63130828	2	2	-0.9087	2.9849034920325e-08	63113626	63118944	8.01895008751478e-08	63130828	63130828
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	63140078	71703277	2268	2191	-0.0083	8.01895008751478e-08	63130828	63130828	2.01898571924119e-08	71703277	71703277
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71705959	71708737	2	2	-0.9404	2.01898571924119e-08	71703277	71703277	5.74816615815698e-09	71708737	71708737
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71720727	85647049	3729	3583	-0.0056	5.74816615815698e-09	71708737	71708737	9.06305319557644e-08	85638560	85647049
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	85708415	85717312	4	4	-0.624	9.06305319557644e-08	85638560	85647049	1.61952854004292e-07	85717312	85718877
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	85718877	99421920	5004	4816	-0.0084	1.61952854004292e-07	85717312	85718877	1.68338886753153e-15	99402556	99433595
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99423114	99554394	60	58	0.2204	1.68338886753153e-15	99402556	99433595	1.13619180030917e-17	99544691	99569401
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99556356	100689280	510	486	-0.0353	1.13619180030917e-17	99544691	99569401	3.06213633018631e-07	100689280	100689280
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100690991	100690991	1	0	NA	3.06213633018631e-07	100689280	100689280	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	0.8158	NA	NA	NA	6.4287090459675e-07	100693892	100695073
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4399	-0.0424	6.4287090459675e-07	100693892	100695073	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19475864	53	51	-0.198	NA	NA	NA	2.90114631809373e-11	19448755	19548246
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19478367	40680589	7596	7321	0.0151	2.90114631809373e-11	19448755	19548246	5.13124372587803e-27	40680589	40680589
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.9363	5.13124372587803e-27	40680589	40680589	3.579756405569e-27	40722360	40722360
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	51824933	3046	2908	-0.0034	3.579756405569e-27	40722360	40722360	5.97301293684045e-09	51824933	51824933
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	51826007	51827480	2	2	-0.9495	5.97301293684045e-09	51824933	51824933	4.46442877750620e-09	51827480	51827480
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	51831805	69086125	6925	6665	-5e-04	4.4644287775062e-09	51827480	51827480	1.42226808808507e-06	69084841	69086125
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69093444	4	4	0.5776	1.42226808808507e-06	69084841	69086125	1.03709553306817e-06	69093444	69095909
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69095909	73061942	1787	1723	-0.0045	1.03709553306817e-06	69093444	69095909	4.03243747075832e-71	73061942	73061942
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	-1.4043	4.03243747075832e-71	73061942	73061942	5.30085432174684e-07	73083141	73092112
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73112042	6	6	-0.2264	5.30085432174684e-07	73083141	73092112	3.9788911633366e-12	73104540	73213924
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73123455	89040835	5568	5384	6e-04	3.9788911633366e-12	73104540	73213924	5.72891602905623e-12	89035691	89045883
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	89043573	89052517	7	7	0.4372	5.72891602905623e-12	89035691	89045883	3.37175231067008e-10	89050065	89067496
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	89054730	89054730	1	0	NA	3.37175231067008e-10	89050065	89067496	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	89055872	105923686	6714	6447	-0.0045	NA	NA	NA	1.68837795638215e-20	105921895	105945006
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106002179	20	19	0.4671	1.68837795638215e-20	105921895	105945006	5.49848055074752e-16	106002179	106015449
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106214372	88	86	-0.046	5.49848055074752e-16	106002179	106015449	2.65272262413273e-09	106205848	106223507
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106255190	19	18	-0.4895	2.65272262413273e-09	106205848	106223507	1.30859212498080e-09	106251081	106260876
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	33	0.0414	1.3085921249808e-09	106251081	106260876	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19465359	98	91	0.1974	NA	NA	NA	5.22525037608094e-13	19405220	19819961
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20088256	58	53	0.4623	5.22525037608094e-13	19405220	19819961	1.328501929654e-51	20065525	20310916
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	22219332	327	318	-0.0223	1.328501929654e-51	20065525	20310916	5.67237293067308e-09	22219332	22219332
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22238807	22250971	2	2	-1.0064	5.67237293067308e-09	22219332	22219332	3.77063249901917e-09	22250971	22250971
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22351404	22351404	1	0	NA	3.77063249901917e-09	22250971	22250971	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22374850	32424552	3304	3180	-0.0215	NA	NA	NA	1.27088341264298e-08	32413169	32427407
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32425155	32454294	36	36	0.2048	1.27088341264298e-08	32413169	32427407	1.05897734207370e-06	32446136	32568086
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32456500	74669752	17885	17275	0.0024	1.0589773420737e-06	32446136	32568086	1.69428940380870e-221	74669752	74669752
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.2879	1.6942894038087e-221	74669752	74669752	7.48713134764661e-211	74680439	74680439
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	159	0.0638	7.48713134764661e-211	74680439	74680439	6.98829202125873e-17	75115806	75115806
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.3954	6.98829202125873e-17	75115806	75115806	1.34948321077812e-20	75119713	75119713
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	87698996	4653	4469	-0.0097	1.34948321077812e-20	75119713	75119713	1.51388167666270e-07	87693085	87700985
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87699805	87711177	14	14	0.3195	1.5138816766627e-07	87693085	87700985	1.53744197488939e-11	87709765	87715622
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87711585	91951638	1766	1701	-0.0097	1.53744197488939e-11	87709765	87715622	2.30271578054045e-09	91942638	91951638
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	91954418	91962960	3	3	0.5785	2.30271578054045e-09	91942638	91951638	4.76168573319086e-05	91962960	91968739
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	91965744	95606006	1006	970	0.0043	4.76168573319086e-05	91962960	91968739	1.46115435038832e-22	95600457	95606006
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95609756	95616750	2	0	NA	1.46115435038832e-22	95600457	95606006	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95617561	95632390	5	5	-0.9084	NA	NA	NA	1.36372760239502e-19	95632390	95632390
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	100298352	1986	1906	-0.0314	1.36372760239502e-19	95632390	95632390	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	8747325	3309	3182	0.0094	NA	NA	NA	6.14425017749471e-70	8743834	8751923
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8749118	8880054	59	58	0.5097	6.14425017749471e-70	8743834	8751923	2.17191886380655e-39	8870860	8882438
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	8882438	8998538	56	54	-0.0142	2.17191886380655e-39	8870860	8882438	2.33869456465833e-42	8995988	8998538
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	9003376	9112467	32	29	0.5723	2.33869456465833e-42	8995988	8998538	1.64665539926617e-42	9112467	9115370
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	9114246	32379126	7117	6874	0.0267	1.64665539926617e-42	9112467	9115370	4.34390228649756e-39	31854794	32515876
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33536526	43	40	0.4735	4.34390228649756e-39	31854794	32515876	2.39625752405006e-43	33527454	33559207
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33538171	75093957	9907	9551	0.0101	2.39625752405006e-43	33527454	33559207	1.39879925061281e-204	75093957	75093957
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-3.6343	1.39879925061281e-204	75093957	75093957	3.35914325542619e-201	75100865	75100865
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	585	-0.0326	3.35914325542619e-201	75100865	75100865	6.49041321599389e-15	76923844	76929598
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	0.6154	6.49041321599389e-15	76923844	76929598	8.2404211684557e-13	76938723	76944661
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4327	-0.0142	8.2404211684557e-13	76938723	76944661	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	15727076	6302	6061	0.0304	NA	NA	NA	9.25847254788291e-286	15727076	15727076
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-5.31	9.2584725478829e-286	15727076	15727076	6.71314876836943e-302	15733964	15733964
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	29421633	4961	4783	0.0137	6.71314876836943e-302	15733964	15733964	1.25657577155548e-13	29378421	29426615
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	29424111	29450938	11	11	0.239	1.25657577155548e-13	29378421	29426615	0.00342613011957798	29442781	29515561
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	29453082	36673853	2595	2495	0.0346	0.00342613011957798	29442781	29515561	0	36673853	36673853
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.8358	0	36673853	36673853	0	36683509	36683509
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	40874079	1808	1754	0.0571	0	36683509	36683509	7.71826556516762e-10	40869151	40874079
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41015177	3	3	-0.739	7.71826556516762e-10	40869151	40874079	4.136720056035e-08	41015177	41017338
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41017338	41508943	196	190	0.0092	4.136720056035e-08	41015177	41017338	5.06179723325322e-15	41494331	41518222
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41512318	41647135	63	62	-0.2348	5.06179723325322e-15	41494331	41518222	1.09837701790993e-20	41635536	41708551
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41648545	71384929	10692	10273	0.0255	1.09837701790993e-20	41635536	41708551	2.37992854529236e-16	71382007	71384929
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	71387054	71390222	3	3	-0.7622	2.37992854529236e-16	71382007	71384929	4.44520285495374e-08	71390222	71392902
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	71392902	78653545	2993	2870	0.0155	4.44520285495374e-08	71390222	71392902	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	10475193	3628	3484	-0.0158	NA	NA	NA	1.44058499426103e-06	10461555	10478437
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	10477045	10508258	13	13	-0.3431	1.44058499426103e-06	10461555	10478437	4.41670209576937e-07	10501631	10520812
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	10510416	10510416	1	0	NA	4.41670209576937e-07	10501631	10520812	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	10512770	11777456	379	368	-0.0195	NA	NA	NA	2.24311672102186e-06	11757823	11801637
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	11779314	11824167	22	22	0.2274	2.24311672102186e-06	11757823	11801637	7.09665476471245e-06	11799949	11842138
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	11826871	53092949	12156	11702	-0.0096	7.09665476471245e-06	11799949	11842138	3.42455159317295e-08	53090140	53092949
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-0.9209	3.42455159317295e-08	53090140	53092949	2.38519688519146e-19	53099601	53099601
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6528	-0.0256	2.38519688519146e-19	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	38709224	11943	11505	0.0572	NA	NA	NA	9.80545501710836e-46	38679128	38710858
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	38710858	38731420	9	9	0.3564	9.80545501710836e-46	38679128	38710858	0.00100312372869956	38729423	38783737
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	38735301	45733269	3056	2943	0.051	0.00100312372869956	38729423	38783737	3.02376642060962e-09	45733269	45733269
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45740459	45741767	2	2	-0.9351	3.02376642060962e-09	45733269	45733269	4.9390381321949e-09	45741767	45741767
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45744670	60898883	6670	6426	0.0623	4.9390381321949e-09	45741767	45741767	1.79137229831362e-07	60879072	60905890
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60900710	60940332	25	24	0.3153	1.79137229831362e-07	60879072	60905890	3.6676532043601e-10	60935872	60952353
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60941502	63788698	1353	1300	0.0142	3.6676532043601e-10	60935872	60952353	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	569	-0.0151	NA	NA	NA	2.91533940573197e-13	1506379	1506379
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-0.9993	2.91533940573197e-13	1506379	1506379	0.0157342302024037	1516966	1525300
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	6	-2.6637	0.0157342302024037	1516966	1525300	3.05839338510511e-182	1525300	1531162
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	3642833	875	834	0.0161	3.05839338510511e-182	1525300	1531162	1.15958199550705e-06	3640313	3642833
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3644952	3646711	2	2	-0.8256	1.15958199550705e-06	3640313	3642833	5.21351621780229e-11	3646711	3648936
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3648936	43771992	13285	12807	-0.0051	5.21351621780229e-11	3646711	3648936	2.04103899131025e-44	43770255	43785775
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	43783562	43783562	1	0	NA	2.04103899131025e-44	43770255	43785775	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	43784107	43811925	14	13	-0.8213	NA	NA	NA	7.33373211778973e-49	43810552	43811925
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	43813650	51906833	3000	2890	0.0142	7.33373211778973e-49	43810552	43811925	5.75048227423767e-07	51903443	51906833
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51910029	51916264	3	3	0.6893	5.75048227423767e-07	51903443	51906833	1.94400810820841e-06	51916264	51917762
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51917762	62419534	3804	3664	-0.0205	1.94400810820841e-06	51916264	51917762	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12958	-0.0099	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2884	0.0021	NA	NA	NA	5.52325020280038e-90	22667608	22677959
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.9787	5.52325020280038e-90	22667608	22677959	6.82181336337243e-99	22721042	22725305
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6284	0.0082	6.82181336337243e-99	22721042	22725305	3.86100628473276e-18	35472378	35472378
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.371	3.86100628473276e-18	35472378	35472378	1.17955299419892e-19	35476942	35476942
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	1.17955299419892e-19	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	36072484	337	325	0.0025	NA	NA	NA	6.28178289795636e-12	36071173	36072484
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36074159	36079268	4	4	-0.7607	6.28178289795636e-12	36071173	36072484	2.77484883948411e-12	36079268	36080448
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36080448	37621766	846	807	0.0469	2.77484883948411e-12	36079268	36080448	3.03337599520702e-16	37621766	37621766
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	1.3527	3.03337599520702e-16	37621766	37621766	1.53895287938271e-16	37626069	37626069
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	45182226	3820	3680	0.0274	1.53895287938271e-16	37626069	37626069	8.92121863986558e-06	45165092	45191574
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45184339	45217224	19	18	-0.2404	8.92121863986558e-06	45165092	45191574	5.13797350454589e-13	45202222	45258396
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45218383	49567768	1973	1882	-0.0271	5.13797350454589e-13	45202222	45258396	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.0429	NA	NA	NA	2.57049666741521e-14	94062	95819
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	106242	8	8	-1.0081	2.57049666741521e-14	94062	95819	9.35669721307424e-40	106242	106242
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	843648	552	535	0.0364	9.35669721307424e-40	106242	106242	4.12990784069852e-11	841738	843648
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	845758	845758	1	0	NA	4.12990784069852e-11	841738	843648	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	848806	859452	9	7	0.5625	NA	NA	NA	1.35231741399707e-08	859452	860688
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	1862931	539	524	0.0644	1.35231741399707e-08	859452	860688	0.00198792104151282	1853611	1862931
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1863993	1870412	6	5	-0.3141	0.00198792104151282	1853611	1862931	2.81004096912948e-17	1870412	1870412
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1870855	1873302	3	2	-1.2469	2.81004096912948e-17	1870412	1870412	1.48275262329101e-12	1873302	1873302
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1873761	1907678	21	19	-0.1837	1.48275262329101e-12	1873302	1873302	4.93121878658759e-05	1892736	1924112
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1907912	2143085	100	96	0.0698	4.93121878658759e-05	1892736	1924112	7.5766516117436e-08	2134838	2149650
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2145991	2161482	21	21	0.3848	7.5766516117436e-08	2134838	2149650	2.75501268338031e-12	2158389	2165850
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2162102	2229019	64	59	0.0294	2.75501268338031e-12	2158389	2165850	1.85842497237530e-12	2223971	2230192
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2230114	2260580	27	26	0.3094	1.8584249723753e-12	2223971	2230192	1.35672726806771e-12	2260134	2265471
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2261080	2708291	436	424	-0.018	1.35672726806771e-12	2260134	2265471	0	2708291	2708291
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	53341809	18018	17347	0.9378	0	2708291	2708291	1.15510419463844e-25	53341809	53341809
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53342769	53346650	2	2	-0.285	1.15510419463844e-25	53341809	53341809	3.79808018911427e-11	53346650	53346650
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53348024	70778179	3655	3513	0.9388	3.79808018911427e-11	53346650	53346650	1.67018446843806e-07	70765775	70809439
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	70786594	70994186	13	13	1.338	1.67018446843806e-07	70765775	70809439	1.08013718936998e-07	70952969	71024729
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	70995813	76998610	1251	1206	0.9567	1.08013718936998e-07	70952969	71024729	1.28987962995516e-160	76998610	76998610
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-3.3172	1.28987962995516e-160	76998610	76998610	7.49395121936721e-157	77010018	77010018
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154046681	22062	21250	0.9377	7.49395121936721e-157	77010018	77010018	2.42439528039680e-18	154031239	154050185
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154047749	154079002	10	10	1.3626	2.4243952803968e-18	154031239	154050185	1.86008052580257e-08	154078401	154088378
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	86	0.944	1.86008052580257e-08	154078401	154088378	1.19895543802486e-99	154442377	154442377
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-1.4756	1.19895543802486e-99	154442377	154442377	6.96600102467274e-97	154450309	154450309
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	1.0159	6.96600102467274e-97	154450309	154450309	3.48153631544464e-151	154582414	154582414
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0093	3.48153631544464e-151	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	119	-3.9499	NA	NA	NA	1.49982059394157e-28	3219200	3772482
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	1.49982059394157e-28	3219200	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	6652845	18	18	-1.1042	NA	NA	NA	1.96317936669236e-18	5672441	6696721
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6688691	6997136	137	128	-3.7225	1.96317936669236e-18	5672441	6696721	1.09144820852622e-07	6955902	7041712
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6998513	7495687	164	160	-2.8106	1.09144820852622e-07	6955902	7041712	0.0253352236550289	7302873	7495687
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7608619	13	13	-4.0724	0.0253352236550289	7302873	7495687	2.15404408047437e-17	7608619	7608619
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7619927	5	5	-1.9061	2.15404408047437e-17	7608619	7608619	0.000106096715437169	7619927	7645258
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7625006	7722458	56	53	-4.0536	0.000106096715437169	7619927	7645258	3.70986192113509e-10	7716001	7722458
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7749796	11	10	-1.7965	3.70986192113509e-10	7716001	7722458	2.65343775052119e-05	7744396	7774773
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7751430	7827650	20	20	-2.9917	2.65343775052119e-05	7744396	7774773	2.58789073374634e-05	7821554	7827650
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7828009	7831268	4	4	-4.6669	2.58789073374634e-05	7821554	7827650	3.49696372767392e-07	7831268	7831268
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7832896	7859390	13	13	-2.9394	3.49696372767392e-07	7831268	7831268	0.000969412457691108	7852359	7895945
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7860364	7914104	11	10	-1.8447	0.000969412457691108	7852359	7895945	6.78696722280898e-10	7905553	7926989
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8280065	84	82	-3.93	6.78696722280898e-10	7905553	7926989	0.000515236119054398	8199414	8324291
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8474062	42	38	-3.1515	0.000515236119054398	8199414	8324291	1.69173912626444e-05	8427047	8477958
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8477958	8538835	17	17	-4.3037	1.69173912626444e-05	8427047	8477958	6.2166216406388e-05	8536761	8550197
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8693820	57	57	-3.1134	6.2166216406388e-05	8536761	8550197	6.27107167422377e-05	8633358	8748423
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8695195	10513747	189	181	-3.838	6.27107167422377e-05	8633358	8748423	2.20984495809149e-40	10512616	10513747
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	16	-0.4535	2.20984495809149e-40	10512616	10513747	2.46755386105523e-06	11660512	11673476
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12452734	2	2	-2.578	2.46755386105523e-06	11660512	11673476	4.97377251742473e-07	12452734	12452734
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-4.602	4.97377251742473e-07	12452734	12452734	9.97929401279961e-09	12536761	12542979
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	55	-1.9959	9.9792940127996e-09	12536761	12542979	1.32187715954057e-07	12658135	12696242
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12733867	9	9	-4.5295	1.32187715954057e-07	12658135	12696242	9.73672212498995e-05	12721434	12772155
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12741404	12909643	40	38	-2.9522	9.73672212498995e-05	12721434	12772155	0.0397923095184623	12855363	12911576
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12911576	12924438	5	4	-4.3356	0.0397923095184623	12855363	12911576	3.55872207740076e-06	12924438	12928074
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12925401	13048283	49	46	-1.837	3.55872207740076e-06	12924438	12928074	6.2201201387919e-05	13032760	13048283
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13061201	7	7	-3.5114	6.2201201387919e-05	13032760	13048283	5.43894767362015e-05	13061201	13080405
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13062151	13062151	1	0	NA	5.43894767362015e-05	13061201	13080405	NA	NA	NA
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13066543	13128515	24	22	-1.8242	NA	NA	NA	5.40937231872008e-07	13114169	13146483
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13264329	47	46	-3.3906	5.40937231872008e-07	13114169	13146483	0.00174295105402182	13161955	13347152
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13271228	13597813	157	154	-4.0267	0.00174295105402182	13161955	13347152	7.92004814652293e-06	13568997	13606316
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13603478	13705594	15	14	-2.7994	7.92004814652293e-06	13568997	13606316	1.19024225551063e-10	13700962	13716331
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13823928	28	27	-4.1226	1.19024225551063e-10	13700962	13716331	1.47334899852357e-10	13816133	13851627
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.2026	1.47334899852357e-10	13816133	13851627	6.71445438021778e-10	13854528	13868296
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14122129	123	121	-4.28	6.71445438021778e-10	13854528	13868296	6.16266862247313e-06	14118164	14122129
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.7324	6.16266862247313e-06	14118164	14122129	2.97405964474451e-05	14131025	14203911
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14340202	27	26	-4.0789	2.97405964474451e-05	14131025	14203911	0.0268687217510723	14322984	14454048
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14342834	14508894	98	97	-3.2997	0.0268687217510723	14322984	14454048	2.56824525602819e-11	14502379	14530134
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.4743	2.56824525602819e-11	14502379	14530134	2.82573618514876e-17	14566592	14596156
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15690301	381	369	-3.6033	2.82573618514876e-17	14566592	14596156	0.000241800838355335	15551462	15707307
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15695261	15932535	39	38	-4.4753	0.000241800838355335	15551462	15707307	1.05852606262705e-15	15928904	15953710
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15937162	16175250	99	93	-2.8786	1.05852606262705e-15	15928904	15953710	2.94987888139453e-12	16143653	16201830
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16176562	22139807	998	959	-3.7821	2.94987888139453e-12	16143653	16201830	9.40115180733318e-08	22052726	22139807
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.5549	9.40115180733318e-08	22052726	22139807	1.79345830052618e-08	22175425	22177335
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-3.4688	1.79345830052618e-08	22175425	22177335	8.97988021564918e-10	22182080	22200078
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	23	-5.0392	8.97988021564918e-10	22182080	22200078	4.3433689488524e-10	22263267	22382215
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	25737663	66	62	-3.7158	4.3433689488524e-10	22263267	22382215	2.78068237454256e-46	23283689	25737663
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	29	-1.1376	2.78068237454256e-46	23283689	25737663	6.30059508492633e-17	26945893	26950080
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.8906	6.30059508492633e-17	26945893	26950080	0.000189077810237806	26965406	26980386
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	26989053	2	2	-0.5202	0.000189077810237806	26965406	26980386	4.21462418690253e-38	26989053	26989053
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26990807	27000085	4	4	-2.666	4.21462418690253e-38	26989053	26989053	3.93905237921559e-14	27000085	27000085
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27003308	27019256	6	5	-0.5605	3.93905237921559e-14	27000085	27000085	3.95744421678836e-25	27019256	27019256
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.0742	3.95744421678836e-25	27019256	27019256	1.29288088992951e-12	27039222	27053237
MSK_252152912027_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.7801	1.29288088992951e-12	27039222	27053237	NA	NA	NA
