Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34739490	12876	12594	0.0264	NA	NA	NA	1.38859927134109e-09	34739490	34739490
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34744470	34758017	2	2	-1.8702	1.38859927134109e-09	34739490	34739490	7.65658689750323e-10	34758017	34758017
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34761645	72537426	15016	14752	0.0191	7.65658689750323e-10	34758017	34758017	2.02892283324448e-244	72537426	72537426
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.412	2.02892283324448e-244	72537426	72537426	2.17079504352657e-242	72579311	72579311
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	147203277	16262	15941	1e-04	2.17079504352657e-242	72579311	72579311	7.5529428488242e-10	146259710	147346399
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	148084402	41	41	-0.4176	7.5529428488242e-10	146259710	147346399	4.4889964710906e-10	147471665	148132857
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148088285	150823073	1254	1226	0.0077	4.4889964710906e-10	147471665	148132857	1.27920927994621e-76	150823073	150823073
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	10	2.305	1.27920927994621e-76	150823073	150823073	1.82937398432658e-78	150851439	150851439
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	186808951	14219	13937	0.0059	1.82937398432658e-78	150851439	150851439	2.5974271851571e-08	186802575	186808951
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186816123	186821017	2	2	1.7488	2.5974271851571e-08	186802575	186808951	1.68914558806922e-09	186821017	186821017
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186825802	195009358	1839	1803	-0.0023	1.68914558806922e-09	186821017	186821017	9.45751810772708e-11	194977713	195022854
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-0.9385	9.45751810772708e-11	194977713	195022854	9.97048798645249e-10	195022854	195095156
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	247186514	19605	19243	0.0029	9.9704879864525e-10	195022854	195095156	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11305	0.0122	NA	NA	NA	1.45771127753112e-47	34542224	34551222
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	19	1.2988	1.45771127753112e-47	34542224	34551222	1.92042147554631e-51	34589997	34595734
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	37186338	1083	1066	-0.0257	1.92042147554631e-51	34589997	34595734	3.3151508132446e-09	37181755	37188359
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37188359	37200643	8	8	-0.8975	3.3151508132446e-09	37181755	37188359	7.40472041474531e-10	37199271	37203371
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37201972	37789939	272	270	0	7.40472041474531e-10	37199271	37203371	3.46963460863704e-13	37779760	37815049
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	27	-0.6173	3.46963460863704e-13	37779760	37815049	1.77544825650695e-14	37839335	37866455
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	242564224	64853	63603	-6e-04	1.77544825650695e-14	37839335	37866455	1.17348084216342e-10	242559149	242572731
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242566796	242566796	1	0	NA	1.17348084216342e-10	242559149	242572731	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242571223	242596654	14	13	-0.7742	NA	NA	NA	1.13147650658022e-10	242591308	242602220
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242596873	242689978	28	27	0.046	1.13147650658022e-10	242591308	242602220	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	164005577	53491	52399	0.0047	NA	NA	NA	6.7775129910454e-16	164005577	164019640
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	-1.4907	6.7775129910454e-16	164005577	164019640	4.65907175059736e-16	164012645	164027724
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9963	-0.0123	4.65907175059736e-16	164012645	164027724	5.7969692793913e-196	194354505	194354505
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.6259	5.7969692793913e-196	194354505	194354505	7.73190249457315e-182	194366950	194366950
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1937	-0.0217	7.73190249457315e-182	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	18087	-2e-04	NA	NA	NA	2.16168509941617e-31	68901210	69069651
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	1.2153	2.16168509941617e-31	68901210	69069651	6.16355395091239e-32	69163312	69643272
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	191153613	36714	35947	-0.015	6.16355395091239e-32	69163312	69643272	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3897	0.0236	NA	NA	NA	1.85227559447891e-49	12857302	12857302
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-3.9243	1.85227559447891e-49	12857302	12857302	2.08890911346394e-46	12873052	12873052
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	140691295	36317	35588	-0.0116	2.08890911346394e-46	12873052	12873052	4.63680440619885e-25	140688982	140693269
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140693269	140741308	26	26	-0.8164	4.63680440619885e-25	140688982	140693269	5.14011819654447e-27	140739375	140745016
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140743487	150156233	3528	3452	0.0112	5.14011819654447e-27	140739375	140745016	5.32311564130575e-11	150155049	150166447
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150181399	6	6	-1.1124	5.32311564130575e-11	150155049	150166447	0.0145008378165120	150162435	150181399
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-3.2014	0.014500837816512	150162435	150181399	2.98448370916011e-107	150202601	150202601
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9711	0.0146	2.98448370916011e-107	150202601	150202601	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11436	0.0108	NA	NA	NA	6.6266359060735e-40	32558677	32558677
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32588005	4	4	-2.5655	6.6266359060735e-40	32558677	32558677	3.61799508362345e-14	32588005	32588005
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32590568	32590568	1	0	NA	3.61799508362345e-14	32588005	32588005	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32600962	4	4	-1.1848	NA	NA	NA	6.16047735695895e-09	32600962	32605300
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	35	0.1373	6.16047735695895e-09	32600962	32605300	7.72879242880242e-08	32711957	32720656
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	1.2498	7.72879242880242e-08	32711957	32720656	4.31285610361997e-18	32723366	32731072
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	8097	0.0098	4.31285610361997e-18	32723366	32731072	2.27298339121418e-74	54035000	54035000
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.0323	2.27298339121418e-74	54035000	54035000	7.943704735127e-75	54042734	54042734
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	77490500	6150	6022	-0.0057	7.943704735127e-75	54042734	54042734	4.27174284220573e-60	77490500	77490500
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-3.6169	4.27174284220573e-60	77490500	77490500	4.31459278411355e-60	77509983	77509983
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	103841482	7054	6914	-0.0136	4.31459278411355e-60	77509983	77509983	2.80792849269335e-52	103841482	103841482
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-2.9264	2.80792849269335e-52	103841482	103841482	1.63734481115479e-51	103868154	103868154
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20707	-0.0097	1.63734481115479e-51	103868154	103868154	6.29001502270438e-11	165642393	165643653
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.3758	6.29001502270438e-11	165642393	165643653	1.93432351011251e-11	165650610	165653315
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1769	2e-04	1.93432351011251e-11	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	256	0.0229	NA	NA	NA	6.12450271120629e-08	1037402	1038517
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	1.58	6.12450271120629e-08	1037402	1038517	4.54594382916387e-07	1047707	1049599
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	26097755	8536	8375	-0.0077	4.54594382916387e-07	1047707	1049599	1.33727770390158e-51	26097755	26097755
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-4.127	1.33727770390158e-51	26097755	26097755	2.88519632401346e-50	26108369	26108369
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	125831554	33638	33000	-0.002	2.88519632401346e-50	26108369	26108369	2.18019007133744e-46	125831554	125831554
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.2401	2.18019007133744e-46	125831554	125831554	1.24640922446560e-45	125837524	125837524
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141690753	7492	7334	0.015	1.2464092244656e-45	125837524	125837524	9.41232518205619e-16	141687978	141698634
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.078	9.41232518205619e-16	141687978	141698634	8.41069260387137e-16	141712786	141720303
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158821263	6752	6604	0.0236	8.41069260387137e-16	141712786	141720303	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7156900	2392	2357	0.0112	NA	NA	NA	2.46869084485446e-21	6926661	7226901
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	-1.1814	2.46869084485446e-21	6926661	7226901	1.82080047863618e-17	7790934	8137794
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5649	-0.0122	1.82080047863618e-17	7790934	8137794	2.91637544049949e-18	25120552	25120552
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	-2.0774	2.91637544049949e-18	25120552	25120552	8.80966374315034e-19	25125700	25125700
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	146264846	36404	35722	0.0021	8.80966374315034e-19	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7667	-0.0173	NA	NA	NA	1.99776775911211e-10	22477358	22477358
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.8668	1.99776775911211e-10	22477358	22477358	3.92282518146721e-10	22492603	22499541
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5125	-0.0064	3.92282518146721e-10	22492603	22499541	4.27480529018232e-59	70926188	70926188
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.4185	4.27480529018232e-59	70926188	70926188	1.23443306291374e-59	70930528	70930528
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	122673784	17555	17214	-0.0079	1.23443306291374e-59	70930528	70930528	2.46796269911422e-08	122670362	122678597
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	122676419	122676419	1	0	NA	2.46796269911422e-08	122670362	122678597	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	122678597	122686622	6	6	0.9851	NA	NA	NA	3.12286122563646e-07	122685111	122690591
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	122687864	140145683	7308	7154	0.0128	3.12286122563646e-07	122685111	122690591	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	31284926	11292	11068	-0.0083	NA	NA	NA	5.85601464632365e-142	31284926	31284926
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-5.5574	5.85601464632365e-142	31284926	31284926	7.4866084307068e-138	31291525	31291525
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	77917893	13297	13034	-0.0076	7.4866084307068e-138	31291525	31291525	3.2850740089883e-18	77917893	77917893
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	2.0471	3.2850740089883e-18	77917893	77917893	1.08685804355738e-17	77928738	77928738
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	132797428	19277	18895	0.0025	1.08685804355738e-17	77928738	77928738	1.05514005769696e-49	132797428	132797428
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	-4.1315	1.05514005769696e-49	132797428	132797428	1.62675815096955e-46	132801463	132801463
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	917	0.0053	1.62675815096955e-46	132801463	132801463	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5732077	2133	2095	0.0148	NA	NA	NA	5.69488243108839e-10	5718917	5738494
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5733442	5766615	21	20	-0.5983	5.69488243108839e-10	5718917	5738494	1.49498897975629e-10	5762182	5779534
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5769776	55124730	14753	14471	0.0157	1.49498897975629e-10	5762182	5779534	1.44410007108695e-19	55097806	55131703
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55127355	55197848	31	31	0.6764	1.44410007108695e-19	55097806	55131703	1.67216082400405e-19	55193014	55205278
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	134450318	28366	27790	0.0152	1.67216082400405e-19	55193014	55205278	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	10470425	4088	4007	0.026	NA	NA	NA	9.90898187318911e-18	10466791	10482217
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10474825	10491341	7	7	-1.3029	9.9089818731891e-18	10466791	10482217	8.67455451403309e-14	10480460	10493984
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10493984	11104973	230	223	-0.0315	8.67455451403309e-14	10480460	10493984	2.26686776168508e-46	11104973	11109483
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	11	1.8197	2.26686776168508e-46	11104973	11109483	1.94255071116324e-53	11128557	11140421
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	132289090	40825	40044	0.006	1.94255071116324e-53	11128557	11140421	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	114123340	31644	31062	-0.0169	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	40680589	7649	7483	0.0064	NA	NA	NA	2.88191959560239e-12	40676611	40680589
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40712006	5	5	-1.1395	2.88191959560239e-12	40676611	40680589	1.21432279061087e-19	40712006	40726930
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40722360	40722360	1	0	NA	1.21432279061087e-19	40712006	40726930	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	106358491	24230	23769	0.0011	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	22038880	481	470	0.0701	NA	NA	NA	3.33345320515627e-14	22021181	22038880
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22138119	22250971	4	4	-1.3521	3.33345320515627e-14	22021181	22038880	1.07829847060082e-09	22219332	22374850
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22351404	22351404	1	0	NA	1.07829847060082e-09	22219332	22374850	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22374850	53441637	11815	11579	-0.0096	NA	NA	NA	3.44222100324542e-37	53441637	53441637
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53442883	53443742	2	2	-3.6249	3.44222100324542e-37	53441637	53441637	1.97055872334422e-37	53443742	53443742
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53444740	74669752	9408	9223	0.009	1.97055872334422e-37	53443742	53443742	4.39326466031028e-60	74669752	74669752
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680338	3	3	-3.7405	4.39326466031028e-60	74669752	74669752	1.63019442490479e-50	74680338	74680338
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74680439	74680439	1	0	NA	1.63019442490479e-50	74680338	74680338	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	164	0.0168	NA	NA	NA	8.21946977297767e-16	75115806	75115806
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.4202	8.21946977297767e-16	75115806	75115806	7.825112690933e-17	75119713	75119713
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100287000	9434	9243	0.0059	7.825112690933e-17	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100298352	100298352	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	10375	0.0125	NA	NA	NA	3.21490906721085e-11	31818957	32534410
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	45	0.4442	3.21490906721085e-11	31818957	32534410	6.69812247741035e-13	33517367	34056516
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	76925748	10518	10313	-0.0042	6.69812247741035e-13	33517367	34056516	7.29119198301247e-19	76923844	76925748
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	1.3563	7.29119198301247e-19	76923844	76925748	3.08019348426421e-17	76940218	76942679
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88676988	4512	4421	0.0031	3.08019348426421e-17	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88690571	88690571	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	409	0.0228	NA	NA	NA	1.63876635650631e-08	1026339	1027248
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1030766	4	4	1.2482	1.63876635650631e-08	1026339	1027248	3.17166838152272e-08	1030766	1031233
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	13161	0.0061	3.17166838152272e-08	1030766	1031233	1.18580174074251e-108	36673853	36673853
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.8651	1.18580174074251e-108	36673853	36673853	1.35328482027134e-109	36683509	36683509
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	36684619	1	0	NA	1.35328482027134e-109	36683509	36683509	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	74880525	14288	13996	0.0291	NA	NA	NA	2.38970180475957e-09	74870707	74884216
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74882413	74904114	13	13	0.7614	2.38970180475957e-09	74870707	74884216	1.80124863507007e-09	74900777	74912549
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74905971	78653545	1456	1431	0.0132	1.80124863507007e-09	74900777	74912549	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22552	-0.0164	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	481	0.0114	NA	NA	NA	6.1052647828279e-10	1398325	1398325
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.8791	6.1052647828279e-10	1398325	1398325	5.40102408789567e-09	1400840	1405308
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4590	0.0271	5.40102408789567e-09	1400840	1405308	4.90935048177821e-08	11445761	11448975
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.7841	4.90935048177821e-08	11445761	11448975	2.01027446091035e-08	11452390	11452390
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	63788698	17885	17547	0.0109	2.01027446091035e-08	11452390	11452390	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	577	0	NA	NA	NA	2.48165269105131e-46	1506379	1515948
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-1.9295	2.48165269105131e-46	1506379	1515948	1.66222578419023e-49	1525300	1531162
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20572	0.0133	1.66222578419023e-49	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13194	-0.003	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2929	0.0089	NA	NA	NA	7.7518942146126e-199	22667608	22679305
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	-2.6994	7.7518942146126e-199	22667608	22679305	1.04026703890146e-158	22720195	22725305
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	23966733	599	592	-0.0144	1.04026703890146e-158	22720195	22725305	3.16412511036456e-18	23942085	24010608
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	23974713	24258091	98	94	0.3858	3.16412511036456e-18	23942085	24010608	2.89065750225168e-18	24223585	24284957
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24259822	35472378	5850	5730	0.01	2.89065750225168e-18	24223585	24284957	1.55101325236974e-10	35469770	35472378
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35478503	3	3	1.6134	1.55101325236974e-10	35469770	35472378	2.4851050539656e-10	35478503	35479767
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	49571068	7002	6878	0.0134	2.4851050539656e-10	35478503	35479767	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	775	0.0217	NA	NA	NA	1.63911371376389e-08	1427338	1431240
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.1132	1.63911371376389e-08	1427338	1431240	7.64593487128107e-08	1432891	1434970
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	979	-0.0016	7.64593487128107e-08	1432891	1434970	0	2706218	2712641
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154442377	45102	44195	0.968	0	2706218	2712641	2.66102062603729e-20	154442377	154442377
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154446801	1	0	NA	2.66102062603729e-20	154442377	154442377	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154447839	154450309	3	2	-1.801	NA	NA	NA	1.12693742923533e-65	154450309	154450309
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.0635	1.12693742923533e-65	154450309	154450309	6.73663541445353e-46	154582414	154599547
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	199	-0.0207	6.73663541445353e-46	154582414	154599547	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	120	-4.0508	NA	NA	NA	3.79321943544459e-22	3034907	3772482
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	17	-1.3068	3.79321943544459e-22	3034907	3772482	4.24194311976652e-10	4948824	6692482
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	172	-3.5911	4.24194311976652e-10	4948824	6692482	3.63771933519456e-05	7003768	7241740
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7653082	159	157	-2.8276	3.63771933519456e-05	7003768	7241740	9.99758528433838e-05	7598374	7663037
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	35	-4.0509	9.99758528433838e-05	7598374	7663037	1.52646644310574e-09	7705876	7714929
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	27	-2.364	1.52646644310574e-09	7705876	7714929	0.0104318964562711	7744396	7860364
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8010446	62	60	-3.3859	0.0104318964562711	7744396	7860364	0.0153354927785488	7831268	8088838
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8280065	62	60	-4.1073	0.0153354927785488	7831268	8088838	4.99395013558935e-07	8218072	8327502
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8697715	119	115	-3.1842	4.99395013558935e-07	8218072	8327502	1.49151982383074e-06	8623889	8761847
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	10513747	186	185	-3.9054	1.49151982383074e-06	8623889	8761847	3.11355384634901e-25	10512616	10513747
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.5492	3.11355384634901e-25	10512616	10513747	3.98088865910776e-05	10631941	12511461
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12999095	154	148	-2.6233	3.98088865910776e-05	10631941	12511461	0.000314387370367509	12928074	13004854
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13050965	22	22	-1.1553	0.000314387370367509	12928074	13004854	0.000267762190776453	13041812	13077621
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13052633	13129843	32	32	-2.4126	0.000267762190776453	13041812	13077621	5.9447216704025e-14	13112411	13140274
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14342834	408	405	-3.9519	5.9447216704025e-14	13112411	13140274	2.62941854543853e-08	14214157	14404979
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	95	-3.182	2.62941854543853e-08	14214157	14404979	7.92327464321191e-05	14492454	14546195
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14524829	2	0	NA	7.92327464321191e-05	14492454	14546195	NA	NA	NA
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14579298	24	24	-1.7592	NA	NA	NA	0.0065464454301409	14550971	14605090
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14703568	26	26	-3.136	0.0065464454301409	14550971	14605090	0.00146904311603472	14605090	14713609
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14705129	14883615	40	40	-4.2531	0.00146904311603472	14605090	14713609	0.0303891479202519	14779054	15165211
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15687088	314	309	-3.5694	0.0303891479202519	14779054	15165211	0.00146237477772977	15582236	15690301
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15765251	13	13	-5.004	0.00146237477772977	15582236	15690301	1.80637085745983e-05	15750379	15798021
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15774136	15867364	18	18	-3.7356	1.80637085745983e-05	15750379	15798021	0.00179317229169670	15826121	15867364
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15873423	15915466	6	6	-5.1133	0.0017931722916967	15826121	15867364	0.00480458062244721	15915466	15955821
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	100	-3.0622	0.00480458062244721	15915466	15955821	2.05860143980978e-07	16091622	16223144
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	21036411	728	711	-3.8155	2.05860143980978e-07	16091622	16223144	1.01399323051875e-05	21025500	21041164
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.4984	1.01399323051875e-05	21025500	21041164	2.33488453249032e-07	21047798	21059229
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	255	-3.8636	2.33488453249032e-07	21047798	21059229	2.48419793507943e-07	22052726	22158616
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-1.6554	2.48419793507943e-07	22052726	22158616	9.6999171127425e-10	22176501	22181855
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	95	-4.1785	9.6999171127425e-10	22176501	22181855	1.88960881537545e-51	23283689	26870361
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	31	-1.1272	1.88960881537545e-51	23283689	26870361	9.07392564168126e-05	26943701	27006628
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-2.605	9.07392564168126e-05	26943701	27006628	5.71640883194602e-06	27006628	27067889
MSK_252152912029_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.8202	5.71640883194602e-06	27006628	27067889	NA	NA	NA
