Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	2520052	553	538	0.1164	NA	NA	NA	8.14101671666057e-42	2502801	2538040
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2524180	3021638	170	169	-0.1993	8.14101671666057e-42	2502801	2538040	7.384576485909e-50	3012011	3038306
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	3023387	3023387	1	0	NA	7.384576485909e-50	3012011	3038306	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	3026602	4129090	430	419	0.1265	NA	NA	NA	3.58444205722891e-169	4115535	4170885
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	4130818	4132520	2	0	NA	3.58444205722891e-169	4115535	4170885	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	4135348	10044402	2175	2109	-0.1955	NA	NA	NA	0	10029435	10053459
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10045982	15054001	1689	1639	0.1283	0	10029435	10053459	2.18178098929099e-102	15032973	15084148
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15056732	15056732	1	0	NA	2.18178098929099e-102	15032973	15084148	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15058611	16704522	760	726	-0.0822	NA	NA	NA	2.37719359834224e-32	16698906	16713074
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	16926444	12	12	-0.8531	2.37719359834224e-32	16698906	16713074	2.87079768647034e-23	16923767	16961001
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16961001	17514568	174	170	-0.0975	2.87079768647034e-23	16923767	16961001	5.5428079406908e-80	17505705	17530357
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17516696	21685945	1769	1717	-0.4347	5.5428079406908e-80	17505705	17530357	1.94633039907899e-225	21685945	21685945
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21685978	21738501	26	25	-1.8331	1.94633039907899e-225	21685945	21685945	3.97390787834136e-228	21738501	21738501
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21740683	29372120	3215	3132	-0.4201	3.97390787834136e-228	21738501	21738501	0	29370095	29374161
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	29374161	44938947	5982	5809	0.288	0	29370095	29374161	2.30319511716617e-192	44930871	44941338
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	44941338	44993023	23	20	0.7134	2.30319511716617e-192	44930871	44941338	2.52778774769519e-10	44991659	44999912
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	44994408	54862228	4042	3942	0.374	2.52778774769519e-10	44991659	44999912	2.8577491909138e-13	54862228	54862228
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54864879	54866506	2	2	-0.8358	2.8577491909138e-13	54862228	54862228	6.24074226314396e-254	54866506	54866506
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54876067	72537426	6868	6680	0.2457	6.24074226314396e-254	54866506	54866506	4.95556218343077e-243	72537426	72537426
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.5145	4.95556218343077e-243	72537426	72537426	6.65536432426191e-133	72579311	72579311
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	75893380	874	848	0.1635	6.65536432426191e-133	72579311	72579311	7.8898581772045e-210	75881246	75941948
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	75900933	82423050	2171	2110	-0.0965	7.8898581772045e-210	75881246	75941948	4.22424386964795e-171	82409203	82452209
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	82437567	83994421	241	236	-0.4964	4.22424386964795e-171	82409203	82452209	3.90932651263960e-152	83982800	84003628
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	83997304	91667779	2672	2604	-0.1352	3.9093265126396e-152	83982800	84003628	0	91667779	91667779
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	91671532	91990553	131	126	0.8628	0	91667779	91667779	1.56238588149735e-194	91990553	91992976
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	91992976	92062480	38	37	-0.1774	1.56238588149735e-194	91990553	91992976	3.28030669329162e-19	92053883	92072067
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92065147	92407190	156	151	0.1624	3.28030669329162e-19	92053883	92072067	7.33766234288916e-10	92403590	92407190
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92408666	92414300	4	4	0.8393	7.33766234288916e-10	92403590	92407190	2.32908332668204e-06	92414300	92419114
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92415628	92415628	1	0	NA	2.32908332668204e-06	92414300	92419114	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92417773	92529087	45	41	0.1783	NA	NA	NA	1.32266342861332e-17	92506888	92541371
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92530224	108136797	4653	4543	-0.1221	1.32266342861332e-17	92506888	92541371	1.83723058152952e-213	108119819	108153831
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108137992	110033018	718	702	0.145	1.83723058152952e-213	108119819	108153831	1.15348001495797e-14	110033018	110033018
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	1.4324	1.15348001495797e-14	110033018	110033018	8.8363841823797e-17	110039388	110039388
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	121052394	3887	3756	0.1205	8.8363841823797e-17	110039388	110039388	4.47254726481992e-39	121015302	142727791
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	141559466	144099712	108	105	-0.1561	4.47254726481992e-39	121015302	142727791	1.59231314340513e-36	143971430	144111397
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099998	150819879	1855	1795	0.1197	1.59231314340513e-36	143971430	144111397	5.926542472036e-181	150819879	150819879
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	2.0666	5.926542472036e-181	150819879	150819879	5.27761905356145e-173	150851439	150851439
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	154070834	1451	1414	0.1354	5.27761905356145e-173	150851439	150851439	3.84457253427939e-59	154052120	154088695
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154073948	154511427	215	208	0.3992	3.84457253427939e-59	154052120	154088695	1.83380274801483e-21	154495228	154528838
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154513301	154513301	1	0	NA	1.83380274801483e-21	154495228	154528838	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154515352	154671137	99	93	0.1271	NA	NA	NA	5.58269632310409e-21	154665084	154684134
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154672405	157128689	994	960	0.3653	5.58269632310409e-21	154665084	154684134	1.18919909688267e-40	157128689	157133150
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157133150	157136342	3	3	-1.2675	1.18919909688267e-40	157128689	157133150	1.10798798207563e-27	157134796	157136342
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	179437526	8864	8594	0.1171	1.10798798207563e-27	157134796	157136342	0	179402584	179461018
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179441399	185979586	2461	2387	-0.1607	0	179402584	179461018	3.81080635249881e-126	185979586	185979586
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-3.797	3.81080635249881e-126	185979586	185979586	1.39598673095369e-138	185988138	185988138
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200613454	4141	4042	-0.1365	1.39598673095369e-138	185988138	185988138	1.73539614818422e-21	200609726	200620756
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200665389	18	17	-0.6386	1.73539614818422e-21	200609726	200620756	3.91398858826028e-17	200654700	200668993
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	229734059	10673	10347	-0.1818	3.91398858826028e-17	200654700	200668993	5.82238696702121e-278	229714735	229749635
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229735861	232288899	957	931	0.0726	5.82238696702121e-278	229714735	229749635	1.2235834792989e-235	232272703	232303808
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	232292008	241096220	3387	3280	0.3348	1.2235834792989e-235	232272703	232303808	3.39787914980812e-13	241011402	241370219
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241104851	241450857	41	40	0.0916	3.39787914980812e-13	241011402	241370219	5.78570263828095e-11	241425575	241474995
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241452274	246430621	2140	2080	0.3252	5.78570263828095e-11	241425575	241474995	2.23854531581967e-17	246383544	246477760
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246432511	246755225	99	96	0.5264	2.23854531581967e-17	246383544	246477760	1.16034961228600e-11	246691241	246828744
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246755298	247186514	127	123	0.2972	1.160349612286e-11	246691241	246828744	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	3696777	1382	1350	-0.2073	NA	NA	NA	0	3691428	3702714
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3699588	6938641	724	714	-0.6088	0	3691428	3702714	0	6934138	6944637
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	6940927	6940927	1	0	NA	0	6934138	6944637	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	6943266	34543992	9415	9157	-0.1591	NA	NA	NA	1.08174532252286e-105	34543992	34551222
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.9309	1.08174532252286e-105	34543992	34551222	1.19963196178900e-107	34583814	34589997
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	473	-0.1293	1.199631961789e-107	34583814	34589997	9.13163915778833e-12	35821494	35821494
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	0.915	9.13163915778833e-12	35821494	35821494	7.55962202214096e-14	35844884	35844884
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	36043713	79	78	-0.1509	7.55962202214096e-14	35844884	35844884	1.56664998667622e-46	36038867	36053088
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	36045531	40258396	1915	1852	-0.504	1.56664998667622e-46	36038867	36053088	2.05036084534387e-183	40246598	40263289
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40259904	40951066	334	321	-0.138	2.05036084534387e-183	40246598	40263289	6.58501236571656e-158	40943280	40957909
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40952684	42542338	538	521	-0.5283	6.58501236571656e-158	40943280	40957909	6.04903542587981e-13	42541102	42543967
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	42543967	42550536	3	3	0.4019	6.04903542587981e-13	42541102	42543967	1.28156559862542e-12	42545685	42550536
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	42553061	45800329	1285	1251	-0.517	1.28156559862542e-12	42545685	42550536	0	45791598	45807933
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45803351	52600588	2552	2485	-0.1673	0	45791598	45807933	1.97005508142597e-15	52588009	52600588
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.6328	1.97005508142597e-15	52588009	52600588	2.40886444631377e-15	52635695	52639605
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	54452900	578	562	-0.1756	2.40886444631377e-15	52635695	52639605	0	54452900	54455199
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	54455199	55686204	538	522	-1.0873	0	54452900	54455199	0	55684187	55686204
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55688525	78836501	7662	7430	-0.1605	0	55684187	55686204	1.03799876655061e-17	78785355	78879137
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	78849782	78849782	1	0	NA	1.03799876655061e-17	78785355	78879137	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	78855897	79048628	42	41	0.1375	NA	NA	NA	2.47824458721337e-09	78994023	79096277
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79058290	80394243	570	553	0.3665	2.47824458721337e-09	78994023	79096277	4.08869481674888e-112	80373833	80417456
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	80398153	87721951	1780	1732	0.133	4.08869481674888e-112	80373833	80417456	9.88594942711194e-08	87589248	87721951
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87926461	88038874	6	6	0.6606	9.88594942711194e-08	87589248	87721951	7.14630673145921e-09	88038874	88080817
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88078497	99332364	1765	1705	0.0943	7.14630673145921e-09	88038874	88080817	1.06759419323916e-11	99332364	99332364
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99340305	99342959	2	2	1.2131	1.06759419323916e-11	99332364	99332364	9.00606531539e-13	99342959	99342959
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99344621	101693865	970	946	0.076	9.00606531539e-13	99342959	99342959	1.09117841999823e-61	101675189	101710322
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	101695720	102350920	282	271	0.3184	1.09117841999823e-61	101675189	101710322	2.92621955576238e-75	102329919	102369345
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	102352613	111589334	2153	2080	0.0691	2.92621955576238e-75	102329919	102369345	1.92233289489591e-07	111587934	111589334
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	111592522	111598246	4	4	-0.5532	1.92233289489591e-07	111587934	111589334	5.15737332957589e-10	111598246	111600831
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	111600831	132366131	5257	5100	0.0599	5.15737332957589e-10	111598246	111600831	2.69899833648274e-20	132186430	132397397
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132377818	132820205	30	28	-0.336	2.69899833648274e-20	132186430	132397397	3.30734305364574e-19	132793108	132841126
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132823716	146571330	4697	4559	0.0314	3.30734305364574e-19	132793108	132841126	6.15264739630749e-07	146552736	146571330
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	0.6279	6.15264739630749e-07	146552736	146571330	2.22353940232414e-06	146592775	146601593
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	148541675	377	363	0.0606	2.22353940232414e-06	146592775	146601593	7.76455536868877e-91	148517717	148561004
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	148545788	154601442	1826	1774	0.2945	7.76455536868877e-91	148517717	148561004	3.69181106133085e-09	154599133	154601442
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	1.2234	3.69181106133085e-09	154599133	154601442	1.28580750436839e-10	154606943	154608095
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	179767214	8999	8725	0.2789	1.28580750436839e-10	154606943	154608095	1.64893719506651e-188	179767214	179767214
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	-3.2528	1.64893719506651e-188	179767214	179767214	2.81559792989196e-164	179778919	179778919
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	183882768	1342	1306	0.3516	2.81559792989196e-164	179778919	179778919	0	183851287	183911997
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	183887533	189292162	1393	1352	0.6834	0	183851287	183911997	4.18777990279628e-06	189278326	189292162
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	189294139	189300853	4	4	1.2524	4.18777990279628e-06	189278326	189292162	2.71088223666811e-98	189300853	189303865
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	189302293	201661721	3803	3707	0.598	2.71088223666811e-98	189300853	189303865	0	201652046	201671680
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	201664754	242501239	14933	14522	0.2493	0	201652046	201671680	3.53923171760424e-248	242501239	242505261
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242689978	67	64	-0.6521	3.53923171760424e-248	242501239	242505261	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460892	16218	15699	-0.1318	NA	NA	NA	4.23811573483598e-52	47460892	47460892
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-2.4391	4.23811573483598e-52	47460892	47460892	1.68208335390317e-49	47466921	47466921
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	69052405	8584	8346	-0.1654	1.68208335390317e-49	47466921	47466921	0	69032670	69062598
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	69054278	75479859	2072	2005	0.1139	0	69032670	69062598	2.97141638955539e-12	75464737	75787094
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	76000715	19	19	-0.2298	2.97141638955539e-12	75464737	75787094	6.37017330402411e-05	75871755	76039417
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76006248	76066005	15	14	0.1254	6.37017330402411e-05	75871755	76039417	1.21070438868553e-05	76053398	76066005
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76067455	76081578	7	7	-0.3676	1.21070438868553e-05	76053398	76066005	1.36419171319483e-08	76081578	76086048
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76083514	97788189	4437	4302	0.1506	1.36419171319483e-08	76081578	76086048	1.44423815314695e-23	97788189	97788189
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	97792616	97809064	6	6	-0.7584	1.44423815314695e-23	97788189	97788189	4.68091689268505e-23	97809064	97809064
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	97810540	99891210	823	795	0.1572	4.68091689268505e-23	97809064	97809064	3.62197603993892e-54	99891210	99891210
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-2.4981	3.62197603993892e-54	99891210	99891210	1.31910520806813e-66	99897201	99897201
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	113890623	4105	3979	0.1305	1.31910520806813e-66	99897201	99897201	0	113871878	113922417
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	113899111	118296776	1692	1647	-0.1495	0	113871878	113922417	4.08801462107174e-29	118281786	118307920
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	118302535	118499089	31	31	-0.5759	4.08801462107174e-29	118281786	118307920	6.02603968572262e-29	118483099	118513138
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	118506732	122354730	1145	1120	-0.1515	6.02603968572262e-29	118483099	118513138	3.05496090710457e-08	122325111	122408385
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	122357470	122479931	38	38	0.0621	3.05496090710457e-08	122325111	122408385	6.17251478923241e-07	122421047	122527744
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	122479985	146574031	9004	8735	-0.139	6.17251478923241e-07	122421047	122527744	3.81792404070762e-07	146559277	146574031
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	146582664	146609405	4	4	0.4864	3.81792404070762e-07	146559277	146574031	1.36977765553987e-06	146609405	146625672
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	146620833	159584763	3832	3717	-0.1121	1.36977765553987e-06	146609405	146625672	5.71278107991691e-08	159552188	159600482
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	159587019	159647319	30	30	0.1275	5.71278107991691e-08	159552188	159600482	4.07269608433544e-08	159632451	159675287
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	159648550	163984178	1419	1376	-0.1157	4.07269608433544e-08	159632451	159675287	8.50636339082174e-07	163977334	163987457
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163987457	164005577	6	5	0.4275	8.50636339082174e-07	163977334	163987457	9.6978882610546e-10	164005577	164005577
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.2107	9.6978882610546e-10	164005577	164005577	1.70495598134685e-08	164027724	164038917
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164105613	19	19	0.5227	1.70495598134685e-08	164027724	164038917	1.47824490017443e-36	164101776	164112873
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164107951	164107951	1	0	NA	1.47824490017443e-36	164101776	164112873	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9827	-0.1031	NA	NA	NA	1.36094256167762e-15	194353315	194354505
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	0.6329	1.36094256167762e-15	194353315	194354505	7.71712071180487e-17	194366950	194368145
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	197335486	1144	1114	-0.1157	7.71712071180487e-17	194366950	194368145	7.76167318712408e-163	197320736	197359169
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	197338264	199320046	833	811	0.1489	7.76167318712408e-163	197320736	197359169	0.00223666067510111	199187361	199320046
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199321387	199329592	3	3	-0.1926	0.00223666067510111	199187361	199320046	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	-0.9984	NA	NA	NA	1.34548636351388e-14	53781	61552
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	211373	48	45	-0.3606	1.34548636351388e-14	53781	61552	3.83141650663778e-36	200459	216149
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	211449	9815760	3336	3260	0.0894	3.83141650663778e-36	200459	216149	9.20760671519988e-19	9815760	9815760
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	3	1.3509	9.20760671519988e-19	9815760	9815760	3.88102713964212e-25	9842644	9842644
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	20486949	2899	2809	0.0712	3.88102713964212e-25	9842644	9842644	4.39396737548522e-135	20475941	20496679
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20488411	21198084	351	341	-0.2187	4.39396737548522e-135	20475941	20496679	1.35539401522916e-138	21190644	21209638
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	21200237	34439897	2916	2843	0.0856	1.35539401522916e-138	21190644	21209638	3.73069415440252e-08	34408264	34439897
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34445002	34445002	1	0	NA	3.73069415440252e-08	34408264	34439897	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	0.6333	NA	NA	NA	3.46309159192822e-08	34491115	34509895
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	74617671	10378	10050	0.0941	3.46309159192822e-08	34491115	34509895	0	74593716	74643419
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	74620619	79388563	1753	1704	-0.2093	0	74593716	74643419	2.47218699868220e-08	79385310	79388563
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	79390048	79395699	4	4	0.4392	2.4721869986822e-08	79385310	79388563	2.11854659731934e-07	79395699	79402112
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	79398036	80551249	435	417	-0.2107	2.11854659731934e-07	79395699	79402112	2.58386024450764e-07	80539769	80557169
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	80552977	80600342	11	11	0.1831	2.58386024450764e-07	80539769	80557169	1.19898084895964e-08	80575345	80621249
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	80607778	94073863	4744	4614	-0.2205	1.19898084895964e-08	80575345	80621249	1.24335805158168e-12	94073863	94073863
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94078581	2	2	-1.3515	1.24335805158168e-12	94073863	94073863	5.09273246910309e-12	94078581	94078581
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94084961	95429680	516	505	-0.2019	5.09273246910309e-12	94078581	94078581	0.0857357056158662	95368481	95432898
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	95431624	95441273	4	4	0.1279	0.0857357056158662	95368481	95432898	5.42640209164824e-11	95441273	95442942
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	95442942	119514714	7413	7196	-0.6148	5.42640209164824e-11	95441273	95442942	2.31597463714005e-12	119496933	119633379
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119520357	119816015	35	34	-0.3326	2.31597463714005e-12	119496933	119633379	6.43058247599594e-13	119684734	119826969
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119817891	167222573	13076	12682	-0.6152	6.43058247599594e-13	119684734	119826969	1.91454340331069e-08	167218749	167222573
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	167223753	167226389	2	2	0.3391	1.91454340331069e-08	167218749	167222573	7.41274448499277e-09	167226389	167228153
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	167228153	175860235	2637	2558	-0.6159	7.41274448499277e-09	167226389	167228153	2.51800845266236e-28	175860235	175860235
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	-2.3157	2.51800845266236e-28	175860235	175860235	2.02204664090389e-28	175863396	175863396
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	187330240	3336	3225	-0.6292	2.02204664090389e-28	175863396	175863396	2.73462982711034e-27	187330240	187330240
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.2819	2.73462982711034e-27	187330240	187330240	7.25269477217748e-23	187333619	187333619
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1204	-0.67	7.25269477217748e-23	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	523562	139	134	0.3204	NA	NA	NA	5.40430854704721e-06	506607	542756
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	525008	525008	1	0	NA	5.40430854704721e-06	506607	542756	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	528214	569884	20	20	0.6235	NA	NA	NA	1.18010278120062e-06	557129	575383
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	571442	681141	37	36	0.3025	1.18010278120062e-06	557129	575383	4.11167717055482e-16	681141	681141
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	1.5373	4.11167717055482e-16	681141	681141	2.68015266003299e-13	686701	686701
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	12837736	3773	3663	0.3474	2.68015266003299e-13	686701	686701	4.35613507128463e-10	12835355	12857302
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12840501	12840501	1	0	NA	4.35613507128463e-10	12835355	12857302	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12853151	12873052	4	4	1.087	NA	NA	NA	2.18564267028392e-09	12857302	13263185
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	21488938	2378	2290	0.3772	2.18564267028392e-09	12857302	13263185	9.4067218939648e-10	21475818	21493505
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21490654	21606184	17	17	0.0278	9.4067218939648e-10	21475818	21493505	2.35022475601174e-10	21596630	21622685
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21610433	43855397	6245	6059	0.3892	2.35022475601174e-10	21596630	21622685	2.71025327967188e-106	43762092	43926062
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	43871042	49595677	511	497	0.6046	2.71025327967188e-106	43762092	43926062	2.28628778997298e-198	46136065	49631356
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	49606346	51473544	394	386	0.1964	2.28628778997298e-198	46136065	49631356	6.56008816992203e-40	51406111	51555039
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	51478444	52452784	244	235	0.4268	6.56008816992203e-40	51406111	51555039	8.51427418558751e-67	52439966	52484277
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	52456634	54599226	717	698	0.1667	8.51427418558751e-67	52439966	52484277	5.01675605166048e-55	54579631	54621304
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	54600481	55354504	329	324	0.383	5.01675605166048e-55	54579631	54621304	0	55354504	55354504
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	55356995	58295257	819	792	-0.6437	0	55354504	55354504	0	58291445	58296611
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	58296611	99408563	12219	11893	-0.1149	0	58291445	58296611	2.56854949221911e-10	99403928	99412268
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	99410686	99418325	4	4	0.6261	2.56854949221911e-10	99403928	99412268	4.32061724637388e-10	99412268	99447496
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	99444081	99444081	1	0	NA	4.32061724637388e-10	99412268	99447496	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	99447496	121442891	5762	5579	-0.0953	NA	NA	NA	0	121424736	121465305
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	121445832	155405839	11866	11519	0.145	0	121424736	121465305	3.32636948661427e-128	155405839	155405839
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	-2.1185	3.32636948661427e-128	155405839	155405839	1.77238313312749e-121	155421443	155421443
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180644810	8278	8037	0.1583	1.77238313312749e-121	155421443	155421443	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	4218406	1659	1613	0.0923	NA	NA	NA	0	4209908	4224906
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	4222228	26811016	7707	7476	0.6081	0	4209908	4224906	4.9459811115504e-183	26811016	26811016
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.7122	4.9459811115504e-183	26811016	26811016	1.21133008924045e-77	26861184	26861184
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	32558677	2307	2252	0.475	1.21133008924045e-77	26861184	26861184	5.03720608259539e-114	32558677	32558677
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32593151	6	4	-2.4549	5.03720608259539e-114	32558677	32558677	0.000132963850875848	32590568	32593151
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32595402	32609525	5	5	-0.4389	0.000132963850875848	32590568	32593151	0.00773850079035648	32597877	32633691
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32613538	32709263	32	32	0.4886	0.00773850079035648	32597877	32633691	0.000153935173962669	32695015	32716255
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32711957	32728487	10	10	1.3073	0.000153935173962669	32695015	32716255	4.16039555118513e-34	32723722	32728487
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	34112528	594	569	0.3236	4.16039555118513e-34	32723722	32728487	7.75037737083312e-51	34095859	34134492
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	34114050	35066397	397	389	0.085	7.75037737083312e-51	34095859	34134492	1.15439677761113e-97	35050638	35083449
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35067640	38597731	1582	1527	-0.1762	1.15439677761113e-97	35050638	35083449	0	38591052	38612881
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	38600259	42624335	1584	1543	-0.5716	0	38591052	38612881	0	42608928	42630702
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	42627849	56151194	4853	4713	-0.1753	0	42608928	42630702	1.08900645723879e-11	56129885	56155833
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	56153164	56232395	34	34	0.0937	1.08900645723879e-11	56129885	56155833	2.47786382146293e-10	56226008	56257138
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	56233518	77490500	5368	5207	-0.1595	2.47786382146293e-10	56226008	56257138	2.30525069242912e-165	77490500	77490500
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-3.4691	2.30525069242912e-165	77490500	77490500	4.50586974253752e-138	77509983	77509983
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	79018959	279	273	-0.1693	4.50586974253752e-138	77509983	77509983	4.17483184238471e-10	79005118	79028813
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	0.2717	4.17483184238471e-10	79005118	79028813	2.74201253401244e-12	79079988	79105311
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	88411575	2570	2502	-0.1745	2.74201253401244e-12	79079988	79105311	0	88402788	88421571
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	88412750	103841482	4192	4067	-0.5558	0	88402788	88421571	1.21357116690101e-30	103841482	103841482
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.7046	1.21357116690101e-30	103841482	103841482	4.56983062016797e-33	103868154	103868154
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	110498221	2256	2192	-0.566	4.56983062016797e-33	103868154	103868154	1.33276270173687e-232	110498221	110498221
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110503513	110520229	7	7	-3.1005	1.33276270173687e-232	110498221	110498221	8.99300073963231e-234	110520229	110520229
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110521603	152109867	14269	13807	-0.5376	8.99300073963231e-234	110520229	110520229	8.41398184608411e-16	152106445	152109867
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152111079	152116760	4	4	0.1023	8.4139818460841e-16	152106445	152109867	1.37974809050082e-07	152116760	152116760
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152121026	152121026	1	0	NA	1.37974809050082e-07	152116760	152116760	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152123234	152136584	8	8	0.5806	NA	NA	NA	2.02443051848666e-07	152136584	152138866
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152138866	152146264	5	5	0.0548	2.02443051848666e-07	152136584	152138866	3.61092339428792e-08	152146264	152153315
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152149278	165643653	4556	4415	-0.5522	3.61092339428792e-08	152146264	152153315	2.6669569187941e-24	165643653	165643653
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.5926	2.6669569187941e-24	165643653	165643653	1.65979100374607e-25	165650610	165650610
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1753	-0.5742	1.65979100374607e-25	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	252	-0.4525	NA	NA	NA	3.94089617818632e-05	1036135	1038517
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	0.4522	3.94089617818632e-05	1036135	1038517	3.14637728035439e-07	1047707	1049599
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	10800846	3293	3191	-0.4706	3.14637728035439e-07	1047707	1049599	2.01375640314654e-287	10777000	10821011
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	10805952	12718769	709	686	-0.1403	2.01375640314654e-287	10777000	10821011	2.67430793782206e-181	12704296	12737536
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	12721277	16135701	1124	1085	0.1529	2.67430793782206e-181	12704296	12737536	7.7801450910656e-10	16132924	16135701
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	1.1738	7.7801450910656e-10	16132924	16135701	1.37122286640608e-10	16140018	16140018
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	38269153	8213	7994	0.1293	1.37122286640608e-10	16140018	16140018	1.92231981858273e-14	38251281	38281765
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38270942	38345457	40	39	0.4041	1.92231981858273e-14	38251281	38281765	1.28472180327430e-19	38333171	38380333
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38347160	43207998	1653	1605	0.0892	1.2847218032743e-19	38333171	38380333	3.84399001963893e-15	43207998	43207998
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43210429	43217398	5	5	-0.6751	3.84399001963893e-15	43207998	43207998	3.41543094976816e-14	43217398	43220160
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43220160	81774336	9426	9146	0.1222	3.41543094976816e-14	43217398	43220160	3.42420738619542e-08	81772460	81774336
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	81774372	81781045	2	2	1.0965	3.42420738619542e-08	81772460	81774336	1.91157259880101e-08	81781045	81782040
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	81782040	93162991	3719	3628	0.1448	1.91157259880101e-08	81781045	81782040	4.59523322259123e-08	93158300	93162991
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	1.0761	4.59523322259123e-08	93158300	93162991	1.97079636344329e-07	93168978	93172507
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	109967918	6817	6606	0.139	1.97079636344329e-07	93168978	93172507	0	109967918	109967918
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-5.924	0	109967918	109967918	0	109974402	109974402
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3872	0.1643	0	109974402	109974402	4.29253139002139e-10	118605955	118620875
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118645208	9	9	0.6508	4.29253139002139e-10	118605955	118620875	5.59478960138635e-10	118630829	118653907
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118649408	125831554	3164	3058	0.1718	5.59478960138635e-10	118630829	118653907	5.15117835381662e-17	125831554	125831554
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.2822	5.15117835381662e-17	125831554	125831554	3.46972618430788e-17	125837524	125837524
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	130658355	2300	2238	0.1448	3.46972618430788e-17	125837524	125837524	2.64406580587903e-29	130627438	130669461
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	130660277	130897929	115	110	0.393	2.64406580587903e-29	130627438	130669461	3.18680942162795e-09	130884159	130922031
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	130899557	131017675	59	57	0.6206	3.18680942162795e-09	130884159	130922031	7.00149081508258e-18	130998199	131030303
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131018829	133433384	1180	1146	0.3574	7.00149081508258e-18	130998199	131030303	0	133433384	133433384
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-4.4413	0	133433384	133433384	0	133448277	133448277
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3592	0.3788	0	133448277	133448277	4.989251385709e-172	141410894	141413352
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-1.2163	4.989251385709e-172	141410894	141413352	4.41912679788016e-160	141438504	141440184
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	147702365	2638	2551	0.3744	4.41912679788016e-160	141438504	141440184	4.42387226962971e-08	147699576	147702365
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	1.3458	4.42387226962971e-08	147699576	147702365	6.50906618965373e-08	147707161	147708382
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	149239606	664	643	0.3746	6.50906618965373e-08	147707161	147708382	0.000114057516048424	149199841	149247151
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149243561	149383502	15	15	0.0963	0.000114057516048424	149199841	149247151	5.64015194656084e-06	149383502	149383502
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149384183	149408996	4	4	0.6699	5.64015194656084e-06	149383502	149383502	7.70955095026256e-06	149408996	149417076
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149410229	149618691	38	38	0.1581	7.70955095026256e-06	149408996	149417076	5.27257895819672e-06	149579172	149667537
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149619471	151728811	909	882	0.3568	5.27257895819672e-06	149579172	149667537	1.17418718111835e-33	151728811	151728811
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.6274	1.17418718111835e-33	151728811	151728811	2.81739628576203e-32	151743145	151743145
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	151745100	1	0	NA	2.81739628576203e-32	151743145	151743145	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151747905	158821263	2599	2521	0.3476	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.3352	NA	NA	NA	5.2510778106914e-08	579405	581533
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	0.6326	5.2510778106914e-08	579405	581533	8.68209200558245e-08	588865	591112
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	597	-0.3231	8.68209200558245e-08	588865	591112	6.63783341027952e-16	2234351	2234351
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-1.2784	6.63783341027952e-16	2234351	2234351	2.36124984304479e-18	2251011	2251011
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	15946238	4460	4333	-0.3032	2.36124984304479e-18	2251011	2251011	1.03514147632101e-31	15946238	15946238
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15951532	15951532	1	0	NA	1.03514147632101e-31	15946238	15946238	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15957300	15987191	5	5	-1.4423	NA	NA	NA	4.29862606840165e-14	15987191	15987191
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15990019	15996382	3	3	-0.3673	4.29862606840165e-14	15987191	15987191	3.87461964395093e-05	15996382	16007459
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16000077	16028363	12	12	0.3804	3.87461964395093e-05	15996382	16007459	1.26456103854058e-24	16026500	16030618
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16030618	25120552	2937	2854	-0.2903	1.26456103854058e-24	16026500	16030618	3.56276568630950e-66	25120552	25120552
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	3.5627656863095e-66	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-2.9541	NA	NA	NA	8.42594543492395e-74	25125700	25125700
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	35937423	3886	3797	-0.2878	8.42594543492395e-74	25125700	25125700	0	35916735	35950703
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	35945362	39358419	1030	1001	0.1813	0	35916735	35950703	1.16010444797912e-22	39345557	39368509
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39363050	39504332	54	50	-0.1339	1.16010444797912e-22	39345557	39368509	6.13668456856348e-20	39497514	39530374
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39505256	39505256	1	0	NA	6.13668456856348e-20	39497514	39530374	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	50512258	2020	1964	0.1723	NA	NA	NA	1.97042655558830e-274	50410191	50595364
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	50522918	62571337	3518	3406	0.3861	1.9704265555883e-274	50410191	50595364	0	62547680	62592979
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	62575107	104821463	13117	12724	0.1659	0	62547680	62592979	0	104802964	104845293
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	104823483	143888195	11975	11620	0.4216	0	104802964	104845293	1.07930022547051e-149	143859939	143948892
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143889160	144000241	29	27	0.1859	1.07930022547051e-149	143859939	143948892	4.01319663038985e-10	143982029	144140391
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144003086	144003086	1	0	NA	4.01319663038985e-10	143982029	144140391	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144005097	146264846	773	749	0.5672	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5304	-0.5832	NA	NA	NA	2.13876960247568e-87	15802255	15802255
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-3.5407	2.13876960247568e-87	15802255	15802255	2.83348672685696e-83	15807123	15807123
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2314	-0.5617	2.83348672685696e-83	15807123	15807123	8.62295729170563e-24	22477358	22477358
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.0461	8.62295729170563e-24	22477358	22477358	1.09010764803668e-27	22492603	22492603
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	27228847	994	963	-0.5744	1.09010764803668e-27	22492603	22492603	4.38505784435661e-07	27220105	27228847
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27229184	27229298	2	2	0.2613	4.38505784435661e-07	27220105	27228847	5.28959831204993e-06	27229298	27235542
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27235542	67903104	3908	3813	-0.5488	5.28959831204993e-06	27229298	27235542	1.09394499989835e-131	44199401	67915082
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67907649	70926188	329	316	-0.2503	1.09394499989835e-131	44199401	67915082	8.85394793279435e-77	70926188	70926188
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.77	8.85394793279435e-77	70926188	70926188	2.90567600471424e-74	70930528	70930528
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	71517915	259	253	-0.2164	2.90567600471424e-74	70930528	70930528	5.78161208447777e-166	71512176	71522948
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	71520038	86154416	4816	4683	-0.5794	5.78161208447777e-166	71512176	71522948	0	86146913	86160202
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86156843	100272052	4807	4688	-0.1714	0	86146913	86160202	0	100257296	100285625
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100274092	131492454	11555	11238	0.0999	0	100257296	100285625	0	131481346	131511780
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	131495919	140145683	3433	3321	-0.189	0	131481346	131511780	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	26175671	9400	9140	0.1026	NA	NA	NA	1.61266247038184e-136	26160727	26190654
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26178160	27038538	329	318	-0.1947	1.61266247038184e-136	26160727	26190654	6.74577674618553e-11	27038538	27038538
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	0.8263	6.74577674618553e-11	27038538	27038538	1.90155935005301e-09	27041812	27043861
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	82866553	16358	15865	-0.1868	1.90155935005301e-09	27041812	27043861	0	82866553	82866553
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82869426	82881204	6	6	-4.4555	0	82866553	82866553	0	82881204	82881204
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82884042	94340717	3610	3510	-0.1888	0	82881204	82881204	5.6127569338213e-39	94340717	94340717
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	94343730	94353740	4	4	-1.572	5.6127569338213e-39	94340717	94340717	4.94289191028671e-38	94353740	94353740
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	94356407	100676022	2648	2557	-0.176	4.94289191028671e-38	94353740	94353740	3.10515253848713e-141	100676022	100676022
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686753	3	3	-3.33	3.10515253848713e-141	100676022	100676022	3.25998090405035e-144	100686753	100686753
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	114100979	4627	4498	-0.1795	3.25998090405035e-144	100686753	100686753	3.23675401847341e-91	114100979	114100979
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-3.2156	3.23675401847341e-91	114100979	114100979	3.47069210131609e-93	114106460	114106460
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	124328915	3940	3816	-0.181	3.47069210131609e-93	114106460	114106460	2.54183431065699e-12	124328915	124328915
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	-1.1016	2.54183431065699e-12	124328915	124328915	1.46002113201175e-11	124340356	124340356
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	135285645	3876	3767	-0.1871	1.46002113201175e-11	124340356	124340356	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4829190	1730	1673	-0.532	NA	NA	NA	3.32477137959059e-09	4826071	4829190
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4837066	4844138	5	5	-1.1635	3.32477137959059e-09	4826071	4829190	1.31287762266014e-06	4842171	4850245
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4849195	4928045	39	37	-0.5771	1.31287762266014e-06	4842171	4850245	1.16081577527392e-06	4920907	4928045
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4929502	4932214	3	3	0.1562	1.16081577527392e-06	4920907	4928045	1.66161939616382e-07	4932214	4934594
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5546180	273	265	-0.5717	1.66161939616382e-07	4932214	4934594	1.56090045177074e-21	5537471	5556388
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5548543	5648706	46	42	-0.2251	1.56090045177074e-21	5537471	5556388	7.0844526383089e-25	5641215	5664267
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5655713	14520037	3622	3491	-0.5822	7.0844526383089e-25	5641215	5664267	0	14511900	14525961
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	14521714	47859098	10620	10342	-0.2164	0	14511900	14525961	4.59697550873015e-240	47837046	47897528
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47864266	55118214	567	554	0.087	4.59697550873015e-240	47837046	47897528	4.60529599547781e-72	55114405	55123719
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	37	0.7843	4.60529599547781e-72	55114405	55123719	2.55307999837092e-68	55207305	55217189
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66770083	4771	4626	0.1174	2.55307999837092e-68	55207305	55217189	1.97122617522049e-14	66741311	66791680
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66771824	66985541	86	82	0.3275	1.97122617522049e-14	66741311	66791680	2.2394217753494e-20	66960462	67015819
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66987214	124956543	20008	19427	0.1002	2.2394217753494e-20	66960462	67015819	0	124951311	124964484
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124958466	134450318	3495	3391	-0.2437	0	124951311	124964484	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3634	0.9087	NA	NA	NA	1.01718787731236e-24	9516067	9550789
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.6013	1.01718787731236e-24	9516067	9550789	1.03357442735655e-35	9582696	9604633
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	23452842	4683	4530	0.8181	1.03357442735655e-35	9582696	9604633	2.44550050359413e-162	23441744	23457647
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23457647	23727308	96	91	1.4488	2.44550050359413e-162	23441744	23457647	1.82160193933467e-26	23712657	23751443
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23730699	25004159	595	585	1.1932	1.82160193933467e-26	23712657	23751443	1.20560597528073e-10	25004159	25004159
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	25012245	25016193	3	3	0.3785	1.20560597528073e-10	25004159	25004159	1.88270049072313e-07	25016193	25018539
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	25018539	26034992	362	351	1.1707	1.88270049072313e-07	25016193	25018539	0	26033353	26037472
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	26036253	46172830	5674	5503	0.5623	0	26033353	26037472	0	46172830	46172830
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46190092	47438878	490	477	-0.5715	0	46172830	46172830	1.73046249457281e-43	47438878	47438878
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47440155	47440942	2	2	-2.7069	1.73046249457281e-43	47438878	47438878	4.63753544217021e-43	47440942	47440942
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	47443146	68643833	7860	7637	-0.554	4.63753544217021e-43	47440942	47440942	7.85858499386014e-08	68641546	68643833
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	68645512	68648768	2	2	-1.4564	7.85858499386014e-08	68641546	68643833	2.02562144385376e-07	68648768	68648768
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	68650485	78676440	3032	2943	-0.5667	2.02562144385376e-07	68648768	68648768	3.66816257297784e-09	78675711	78676440
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78679297	78686371	4	4	0.1279	3.66816257297784e-09	78675711	78676440	1.41865609952909e-09	78686371	78688893
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	94534104	4548	4404	-0.568	1.41865609952909e-09	78686371	78688893	0	94528556	94541440
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	94537029	98443248	1422	1388	-0.1836	0	94528556	94541440	0	98426687	98461782
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98445183	109524628	4266	4161	0.1105	0	98426687	98461782	0	109509025	109535249
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	109526257	129942728	7462	7240	-0.1905	0	109509025	109535249	1.82985941351833e-270	129934432	129951433
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	129946612	130943064	353	339	-0.6044	1.82985941351833e-270	129934432	129951433	1.60844444929394e-33	130943064	130943064
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.4284	1.60844444929394e-33	130943064	130943064	1.67088003606128e-31	130946248	130946248
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	538	-0.5528	1.67088003606128e-31	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7125	-0.5744	NA	NA	NA	9.48671727711466e-14	37953582	37953582
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-1.7998	9.48671727711466e-14	37953582	37953582	5.23465406737827e-13	37957844	37957844
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4737	-0.6214	5.23465406737827e-13	37957844	37957844	1.60149255778163e-27	49964838	49964838
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.3259	1.60149255778163e-27	49964838	49964838	8.50552117995687e-24	49971732	49971732
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56664197	1810	1767	-0.6287	8.50552117995687e-24	49971732	49971732	5.43647792089936e-17	56660235	56664197
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56666220	56685341	9	9	0.0413	5.43647792089936e-17	56660235	56664197	4.35799367222258e-17	56681665	56691355
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	56686863	1	0	NA	4.35799367222258e-17	56681665	56691355	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	57484503	206	202	-0.5983	NA	NA	NA	1.44298298368956e-68	57484503	57484503
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	57489902	57497079	2	2	-3.2571	1.44298298368956e-68	57484503	57484503	6.9481480542691e-67	57497079	57497079
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	57500241	71375082	3414	3327	-0.6154	6.9481480542691e-67	57497079	57497079	4.47957566228703e-129	71375082	71375082
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.2751	4.47957566228703e-129	71375082	71375082	9.72102096303308e-131	71377671	71377671
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	110796395	12770	12428	-0.6447	9.72102096303308e-131	71377671	71377671	1.10661984888624e-09	110785571	110807535
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	110798324	110798324	1	0	NA	1.10661984888624e-09	110785571	110807535	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	110805380	110847534	17	17	-0.2932	NA	NA	NA	1.69528473088232e-56	110847534	110851075
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	110851075	112128257	313	308	-1.197	1.69528473088232e-56	110847534	110851075	0	112125875	112133046
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	112133046	114118270	877	852	-0.5473	0	112125875	112133046	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114123340	114123340	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	7	-1.1024	NA	NA	NA	1.29470627185748e-06	18527871	19271102
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19415745	21	18	-0.4926	1.29470627185748e-06	18527871	19271102	0	19408583	19422841
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19417432	73061942	19391	18822	-0.1014	0	19408583	19422841	0	73054937	73075500
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73101327	9	8	-0.5812	0	73054937	73075500	2.47580049595176e-13	73092112	73104540
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	80244733	3313	3227	0.0222	2.47580049595176e-13	73092112	73104540	1.94841677634481e-28	80233458	80249963
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	80246730	80367093	65	64	-0.2873	1.94841677634481e-28	80233458	80249963	7.52647382545527e-29	80361795	80376451
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	80368407	105789767	8871	8615	0.0243	7.52647382545527e-29	80361795	80376451	2.61010543263322e-10	105788623	105789767
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105790917	105798116	4	4	-0.7348	2.61010543263322e-10	105788623	105789767	4.08588452168897e-08	105798116	105799261
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105850033	21	20	0.029	4.08588452168897e-08	105798116	105799261	5.10659337090693e-13	105850033	105850033
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-0.879	5.10659337090693e-13	105850033	105850033	1.96458277435702e-08	105875924	105897061
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105923686	14	14	-0.1193	1.96458277435702e-08	105875924	105897061	1.50082750625304e-09	105923159	105946993
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	105994646	17	17	0.3779	1.50082750625304e-09	105923159	105946993	1.33972267902897e-11	105985458	106002179
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105996176	106218059	93	90	-0.0248	1.33972267902897e-11	105985458	106002179	0.000229062391565767	106205637	106221696
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106236795	9	8	-0.372	0.000229062391565767	106205637	106221696	0.0315167452171654	106221696	106240343
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106238148	106253648	7	7	-0.59	0.0315167452171654	106221696	106240343	1.60739535694717e-11	106253648	106256498
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	0.0778	1.60739535694717e-11	106253648	106256498	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0048	NA	NA	NA	5.12266565482245e-10	18452491	18741716
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	147	-0.8906	5.12266565482245e-10	18452491	18741716	4.52570212947237e-258	20053008	20308014
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	26017004	1663	1622	-0.2542	4.52570212947237e-258	20053008	20308014	2.24233911088348e-06	26014477	26017004
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	26018387	26022598	3	3	0.4157	2.24233911088348e-06	26014477	26017004	3.78101151146455e-06	26022598	26026954
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	26026954	33328634	2277	2193	-0.2415	3.78101151146455e-06	26022598	26026954	5.04955168154996e-44	33324455	33337819
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	33331174	33495871	57	54	-0.6473	5.04955168154996e-44	33324455	33337819	7.87040818097786e-41	33486742	33501708
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	33497219	39428530	2149	2071	-0.2585	7.87040818097786e-41	33486742	33501708	9.27612163562852e-10	39424886	39430624
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39430624	39442287	7	7	0.2731	9.27612163562852e-10	39424886	39430624	5.50259106132619e-09	39437367	39445066
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39443305	43475909	1991	1925	-0.2566	5.50259106132619e-09	39437367	39445066	1.18141741687051e-08	43472161	43475909
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43477471	43484975	6	6	0.3054	1.18141741687051e-08	43472161	43475909	5.28187287196575e-10	43484975	43487392
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	43486107	66091033	9748	9466	-0.2841	5.28187287196575e-10	43484975	43487392	2.30856039339456e-09	66053107	66109546
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	66094768	66094768	1	0	NA	2.30856039339456e-09	66053107	66109546	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	66100884	66154062	21	21	0.0217	NA	NA	NA	1.15476574727228e-06	66146237	66174786
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	66157397	74669752	3632	3532	-0.2442	1.15476574727228e-06	66146237	66174786	2.73983931564942e-122	74669752	74678353
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-2.837	2.73983931564942e-122	74669752	74678353	6.27318297209355e-113	74678353	74680439
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	78855195	1660	1627	-0.2385	6.27318297209355e-113	74678353	74680439	6.62004288258897e-11	78855195	78855195
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78856680	78858227	2	2	0.8735	6.62004288258897e-11	78855195	78855195	9.5371987856737e-12	78858227	78861458
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78861458	91034382	4622	4469	-0.2433	9.5371987856737e-12	78858227	78861458	0	91017378	91046240
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	91036272	99632987	3049	2951	0.0461	0	91017378	91046240	3.91678496639827e-46	99632987	99632987
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.1935	3.91678496639827e-46	99632987	99632987	1.33703977538608e-37	99635701	99635701
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100212174	265	255	0.0326	1.33703977538608e-37	99635701	99635701	0.142401995045089	100089883	100217283
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100212401	100298352	7	7	-0.2067	0.142401995045089	100089883	100217283	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1195632	445	432	0.1701	NA	NA	NA	7.86717201278354e-87	1177134	1214878
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1196791	2587173	565	548	-0.1434	7.86717201278354e-87	1177134	1214878	5.14599226104441e-06	2580393	2600740
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2589724	2639798	6	6	0.4019	5.14599226104441e-06	2580393	2600740	2.92047785623741e-08	2600740	2660804
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	6195813	1357	1322	-0.1612	2.92047785623741e-08	2600740	2660804	0.0939685969696375	6082445	6195813
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6197266	6199827	2	2	0.2143	0.0939685969696375	6082445	6195813	0	6199827	6199827
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6203559	6206579	2	2	0.5152	0	6199827	6199827	6.71489743713302e-05	6206579	6210289
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6208940	14687636	3090	3001	-0.1879	6.71489743713302e-05	6206579	6210289	2.73165115059673e-27	14683004	14876356
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	15029941	15	15	-0.7918	2.73165115059673e-27	14683004	14876356	2.50665855295888e-26	15028108	15034210
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	30098010	4421	4286	-0.1655	2.50665855295888e-26	15028108	15034210	2.8046786968314e-08	30096248	30098010
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	30099559	30102195	2	2	0.8177	2.8046786968314e-08	30096248	30098010	2.53060517984139e-07	30102195	30106054
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	30104791	30104791	1	0	NA	2.53060517984139e-07	30102195	30106054	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	30106054	34634686	860	828	-0.1144	NA	NA	NA	4.26136047479523e-164	34617260	34661255
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34635765	47447628	916	898	0.1834	4.26136047479523e-164	34617260	34661255	3.35237052437978e-168	47425525	47462859
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	47453492	48282089	232	221	-0.2823	3.35237052437978e-168	47425525	47462859	1.70901678298971e-76	48268016	48296857
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	48284137	57203733	2995	2917	-0.5613	1.70901678298971e-76	48268016	48296857	1.05933201335910e-124	57203733	57203733
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-4.1936	1.0593320133591e-124	57203733	57203733	7.27885750014924e-142	57206772	57206772
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	62923383	1168	1137	-0.5708	7.27885750014924e-142	57206772	57206772	0	62916738	62944485
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	62932215	68693086	2220	2171	-1.0763	0	62916738	62944485	6.5146987958118e-21	68693014	68693086
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-1.8604	6.5146987958118e-21	68693014	68693086	1.51968347518308e-22	68753209	68838384
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	69273814	192	185	-1.0412	1.51968347518308e-22	68753209	68838384	1.15775752969969e-06	69268950	69273814
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69275492	69280807	4	4	-0.3302	1.15775752969969e-06	69268950	69273814	9.521601792586e-09	69280807	69282221
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69282221	69401319	59	59	-1.03	9.521601792586e-09	69280807	69282221	2.49070141531626e-43	69397102	69406035
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69402880	69758635	161	157	-0.58	2.49070141531626e-43	69397102	69406035	7.49528194276112e-177	69755375	69763173
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69761372	72918129	1037	1009	-1.1242	7.49528194276112e-177	69755375	69763173	2.926487234392e-06	72914152	72941901
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-1.5962	2.926487234392e-06	72914152	72941901	1.52922916651152e-06	72963578	73030029
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75393316	831	813	-1.0926	1.52922916651152e-06	72963578	73030029	4.76561660945535e-36	75393316	75393316
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75396598	75424740	7	7	-2.2449	4.76561660945535e-36	75393316	75393316	9.99793666153263e-37	75424740	75424740
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75430432	76923844	528	514	-1.13	9.99793666153263e-37	75424740	75424740	6.67415304007255e-09	76919570	76931247
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76942679	10	10	-1.6001	6.67415304007255e-09	76919570	76931247	1.91232930676139e-28	76938723	76948299
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	87736938	4090	3983	-1.0945	1.91232930676139e-28	76938723	76948299	6.99710158531665e-26	87720112	87744023
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87738452	87756689	8	8	-1.4753	6.99710158531665e-26	87720112	87744023	5.46795696246134e-05	87748226	87774184
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87757502	88690571	414	404	-1.0194	5.46795696246134e-05	87748226	87774184	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	412	-0.177	NA	NA	NA	3.49580704907142e-13	1028979	1028979
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.0524	3.49580704907142e-13	1028979	1028979	5.56103640354246e-11	1030766	1031233
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	424	-0.1436	5.56103640354246e-11	1030766	1031233	5.289166773129e-16	1903358	1904451
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.0323	5.289166773129e-16	1903358	1904451	2.82345935468666e-22	1906391	1906391
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	2566165	317	312	-0.1495	2.82345935468666e-22	1906391	1906391	2.33023158465481e-06	2549314	2572596
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	2568453	2584842	13	13	0.1652	2.33023158465481e-06	2549314	2572596	9.7346877750281e-07	2580648	2597016
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	2586017	10383899	3373	3259	-0.1837	9.7346877750281e-07	2580648	2597016	0	10376838	10391640
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	10387685	25437309	4983	4808	-0.5403	0	10376838	10391640	9.34667167948667e-19	25426363	25439547
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25438174	25447737	10	10	-0.1046	9.34667167948667e-19	25426363	25439547	2.03102468871604e-08	25446907	25456737
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25453730	30543860	2118	2052	-0.5357	2.03102468871604e-08	25446907	25456737	4.06541659090043e-12	30543860	30543860
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	30562246	30564576	2	2	0.6093	4.06541659090043e-12	30543860	30543860	1.45376972077169e-10	30564576	30564576
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	30566574	31461588	365	352	-0.5252	1.45376972077169e-10	30564576	30564576	7.77646358575763e-18	31451114	31467971
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31503774	18	18	-1.0209	7.77646358575763e-18	31451114	31467971	3.86969982612746e-18	31493990	31891535
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32850723	376	367	-0.5319	3.86969982612746e-18	31493990	31891535	8.02831504231702e-38	32850723	32850723
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32853293	32854956	2	2	-2.5986	8.02831504231702e-38	32850723	32850723	6.87682638366487e-42	32854956	32854956
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32857473	36673853	1437	1397	-0.5041	6.87682638366487e-42	32854956	32854956	4.39718424798709e-322	36673853	36673853
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-4.1953	4.39718424798709e-322	36673853	36673853	1.37046293919579e-248	36683509	36683509
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	37418175	374	361	-0.4937	1.37046293919579e-248	36683509	36683509	5.14037469434508e-12	37412772	37423944
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	37420059	37437076	11	11	0.0551	5.14037469434508e-12	37412772	37423944	1.17479116357439e-14	37429871	37440884
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	37439347	41519702	1627	1588	-0.474	1.17479116357439e-14	37429871	37440884	1.17672888486016e-14	41512318	41522429
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	20	-0.0823	1.17672888486016e-14	41512318	41522429	2.47867230809352e-17	41566540	41572001
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	50415206	2856	2764	-0.5086	2.47867230809352e-17	41566540	41572001	0	50405861	50423132
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	50417988	68975944	6912	6707	-0.1433	0	50405861	50423132	0	68963329	68988623
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68978367	78653545	3957	3830	0.161	0	68963329	68988623	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	108760	2	2	-0.6041	NA	NA	NA	0.0489628290842740	108760	212096
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	112131	1752656	586	574	-0.1965	0.048962829084274	108760	212096	5.59186459268828e-11	1743896	1753991
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1753201	1768552	17	17	0.1761	5.59186459268828e-11	1743896	1753991	5.9161804615876e-10	1764591	1773663
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1770011	4355692	921	888	-0.1737	5.9161804615876e-10	1764591	1773663	0	4350585	4363782
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4358899	10195596	2025	1973	-0.5736	0	4350585	4363782	0	10183714	10204503
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	10200951	12368148	684	664	-0.1776	0	10183714	10204503	2.05624302659776e-227	12361962	12380100
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	12378798	14332948	697	681	-0.5426	2.05624302659776e-227	12361962	12380100	2.79009755700868e-19	14114512	14685718
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	14348262	14968075	57	53	-0.2619	2.79009755700868e-19	14114512	14685718	6.54387254181309e-17	14925542	16793775
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	15055953	18037840	539	534	-0.5349	6.54387254181309e-17	14925542	16793775	2.46527840449794e-52	18029159	18050091
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	18040780	18528229	102	99	-0.1861	2.46527840449794e-52	18029159	18050091	1.23217841369456e-70	18502518	18551122
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	18533141	36509250	5352	5198	-0.5601	1.23217841369456e-70	18502518	18551122	4.2080214233508e-42	36509250	36509250
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-2.5997	4.2080214233508e-42	36509250	36509250	1.58290904664872e-39	36519728	36519728
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	53092949	5215	5066	-0.5725	1.58290904664872e-39	36519728	36519728	3.47554575524495e-13	53092949	53092949
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.7543	3.47554575524495e-13	53092949	53092949	6.52013140954248e-13	53099601	53099601
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6571	-0.5777	6.52013140954248e-13	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	239700	12	12	-0.6281	NA	NA	NA	7.5742207930069e-30	239700	239700
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	0.9439	7.5742207930069e-30	239700	239700	2.61632659829856e-11	243026	243026
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	1398325	478	460	-0.4631	2.61632659829856e-11	243026	243026	4.66350576410916e-25	1398325	1398325
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.6192	4.66350576410916e-25	1398325	1398325	9.30241920278887e-34	1400840	1400840
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	9470752	3719	3596	-0.5097	9.30241920278887e-34	1400840	1400840	0	9462418	9479638
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9471194	11257953	868	842	-0.1442	0	9462418	9479638	3.67972427192184e-22	11230040	11286080
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11262188	11448975	91	87	0.1088	3.67972427192184e-22	11230040	11286080	5.37737777293264e-17	11448975	11448975
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.6328	5.37737777293264e-17	11448975	11448975	5.73435373558804e-18	11452390	11452390
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	23105894	4723	4591	0.1093	5.73435373558804e-18	11452390	11452390	1.96071253812709e-11	23101617	23108527
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23108527	23113720	3	3	1.1125	1.96071253812709e-11	23101617	23108527	9.90210646466277e-32	23110685	23113720
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23114764	58204170	10565	10271	0.093	9.90210646466277e-32	23110685	23113720	9.63838162741687e-30	58196296	58204170
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58206232	58244012	17	16	-0.2782	9.63838162741687e-30	58196296	58204170	2.04770960121676e-09	58244012	58254174
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	60716134	1107	1070	0.1217	2.04770960121676e-09	58244012	58254174	2.16493730715945e-13	60716134	60716134
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60719936	60724720	3	3	-0.971	2.16493730715945e-13	60716134	60716134	1.84942471164027e-19	60724720	60724720
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60728591	63788698	1467	1425	0.2991	1.84942471164027e-19	60724720	60724720	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	312490	114	113	-0.1835	NA	NA	NA	4.18364057965327e-06	304213	312490
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	314877	328788	7	7	-0.6183	4.18364057965327e-06	304213	312490	5.88992257028287e-06	328788	346371
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	331742	1506379	465	456	-0.1828	5.88992257028287e-06	328788	346371	3.01779608562127e-153	1506379	1511632
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-2.3572	3.01779608562127e-153	1506379	1511632	2.84513669977031e-187	1528899	1531162
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	26148060	8440	8188	-0.1823	2.84513669977031e-187	1528899	1531162	4.95981259013347e-39	26144661	26148764
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148764	26161111	9	9	-0.6115	4.95981259013347e-39	26144661	26148764	8.3069268154876e-08	26161111	26170594
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	33599815	1935	1878	-0.1506	8.3069268154876e-08	26161111	26170594	0	33594279	33608161
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	33599948	43633334	3734	3626	-0.5694	0	33594279	33608161	0	43624767	43642971
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	43637768	55600747	4075	3970	-0.1722	0	43624767	43642971	0	55592779	55607736
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	55601968	55601968	1	0	NA	0	55592779	55607736	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	55603165	57678370	815	801	-0.5887	NA	NA	NA	8.28724086528721e-08	57673520	57682600
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	57680390	57694510	6	5	-0.0188	8.2872408652872e-08	57673520	57682600	8.7508000412433e-06	57686240	57697410
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	57696117	57732801	19	19	-0.6481	8.7508000412433e-06	57686240	57697410	2.80954073753776e-13	57731345	57732801
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	57734633	57748610	9	9	-1.352	2.80954073753776e-13	57731345	57732801	1.03657120313204e-26	57748610	57748610
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	57750065	62419534	1941	1881	-0.5275	1.03657120313204e-26	57748610	57748610	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13084	-0.5532	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	15562736	21	20	0.2209	NA	NA	NA	1.66713009104969e-08	15528564	15579871
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15566748	18617267	1412	1372	0.5621	1.66713009104969e-08	15528564	15579871	1.81849009911422e-07	18615581	18617267
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18618206	18618798	2	2	1.5699	1.81849009911422e-07	18615581	18617267	5.03483167830909e-08	18618798	18619942
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18619942	22667608	1548	1499	0.5364	5.03483167830909e-08	18618798	18619942	4.72511171201919e-77	22667608	22679305
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	1.4971	4.72511171201919e-77	22667608	22679305	1.41398071435839e-126	22721042	22725305
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	32110063	5042	4881	0.3829	1.41398071435839e-126	22721042	22725305	8.1725864286565e-102	32110063	32110063
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-1.399	8.1725864286565e-102	32110063	32110063	4.24446455055891e-20	32112051	32112051
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	32251471	86	84	0.3096	4.24446455055891e-20	32112051	32112051	2.3787618837162e-266	32250438	32253502
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32253502	35472378	1417	1376	-0.5527	2.3787618837162e-266	32250438	32253502	6.56877147346942e-60	35472378	35472378
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.1143	6.56877147346942e-60	35472378	35472378	1.42802637341845e-60	35476942	35476942
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1157	-0.5059	1.42802637341845e-60	35476942	35476942	2.57864945795451e-22	37621766	37621766
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.1377	2.57864945795451e-22	37621766	37621766	1.63594954979986e-20	37626069	37626069
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	40025517	1240	1206	-0.5352	1.63594954979986e-20	37626069	37626069	3.15687670493930e-11	40025517	40025517
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40027630	40028911	2	2	0.6371	3.1568767049393e-11	40025517	40025517	1.12504158066604e-10	40028911	40028911
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40030431	48000356	3873	3752	-0.5391	1.12504158066604e-10	40028911	40028911	3.7201690508989e-92	47975707	48039024
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48004760	49571068	698	676	-0.7422	3.7201690508989e-92	47975707	48039024	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	104486	12	10	0.0166	NA	NA	NA	0.00262817092502837	95819	106242
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	104732	104732	1	0	NA	0.00262817092502837	95819	106242	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	109064	3	3	-1.0739	NA	NA	NA	0.0286877681672545	108902	122211
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	266212	111	108	-0.4954	0.0286877681672545	108902	122211	8.47853638587458e-06	264190	266212
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	0.5999	8.47853638587458e-06	264190	266212	2.06280445742800e-08	267079	268402
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1431411	660	646	-0.5573	2.062804457428e-08	267079	268402	3.82370239859196e-09	1431411	1431411
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.7621	3.82370239859196e-09	1431411	1431411	1.31089474126190e-08	1432953	1432953
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2374031	687	665	-0.5611	1.3108947412619e-08	1432953	1432953	1.40415451736744e-06	2344220	2390126
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2374133	2426938	62	62	-0.7586	1.40415451736744e-06	2344220	2390126	1.09158470020753e-20	2426938	2426938
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.0284	1.09158470020753e-20	2426938	2426938	5.59203039311387e-33	2428307	2428307
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2510846	70	67	-0.5504	5.59203039311387e-33	2428307	2428307	4.59597200884842e-16	2510846	2510846
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	0.4912	4.59597200884842e-16	2510846	2510846	1.97603366032686e-09	2512881	2512881
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2665042	141	135	-0.6023	1.97603366032686e-09	2512881	2512881	2.78610671205921e-05	2653509	2673365
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2666344	2708291	38	34	-0.8318	2.78610671205921e-05	2653509	2673365	5.64510653398957e-233	2708291	2708291
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	22149643	7551	7328	0.4138	5.64510653398957e-233	2708291	2708291	1.53697792501057e-22	22148144	22149643
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	22151198	22152780	2	2	-0.6406	1.53697792501057e-22	22148144	22149643	1.95450256784875e-144	22152780	22154140
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	22154140	71422338	14272	13823	0.3814	1.95450256784875e-144	22152780	22154140	0	71413067	71436712
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	71422410	76998610	1114	1084	0.7844	0	71413067	71436712	7.69913442300298e-19	76998610	76998610
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-0.7355	7.69913442300298e-19	76998610	76998610	4.1384930143955e-22	77010018	77010018
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	93700610	2796	2728	0.8059	4.1384930143955e-22	77010018	77010018	0	93690754	93718101
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	93710437	111945181	6093	5919	0.3418	0	93690754	93718101	0	111945181	111945181
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111946364	116405186	1219	1179	1.4545	0	111945181	111945181	5.04887527060164e-22	116403615	116405186
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	116407959	116417628	3	3	0.6671	5.04887527060164e-22	116403615	116405186	3.53849815624446e-75	116417628	116419781
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	116419781	144319600	8663	8412	1.6059	3.53849815624446e-75	116417628	116419781	0	144311622	144319600
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	144324198	145034744	178	171	0.841	0	144311622	144319600	6.23781993856594e-35	144987117	145079401
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	145045895	145690566	121	115	1.1468	6.23781993856594e-35	144987117	145079401	6.7381949866566e-74	145672334	145738484
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	145713006	152655026	2447	2375	1.6243	6.7381949866566e-74	145672334	145738484	3.06790713124279e-16	152655026	152655026
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.0759	3.06790713124279e-16	152655026	152655026	9.64914912157912e-12	152657445	152669192
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	154442377	639	628	1.6517	9.64914912157912e-12	152657445	152669192	6.99611896382408e-55	154442377	154442377
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	2	-2.0288	6.99611896382408e-55	154442377	154442377	5.02225600944123e-308	154450309	154450309
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.6925	5.02225600944123e-308	154450309	154450309	1.54495041455049e-99	154582414	154582414
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154667352	54	52	0.5608	1.54495041455049e-99	154582414	154582414	3.69972560744765e-145	154667352	154667352
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154668774	154689387	15	15	-1.4436	3.69972560744765e-145	154667352	154667352	5.33734541055659e-119	154689387	154689387
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154698452	154880306	123	122	0.562	5.33734541055659e-119	154689387	154689387	3.74713130661886e-05	154869036	154882362
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154881198	154888224	9	9	0.0234	3.74713130661886e-05	154869036	154882362	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	124	-4.1231	NA	NA	NA	2.94990318222180e-15	3777766	4272867
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.4843	2.9499031822218e-15	3777766	4272867	1.70173012757723e-09	5422507	6692482
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	172	-3.7729	1.70173012757723e-09	5422507	6692482	1.55354140705425e-07	7021965	7210018
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	125	-2.9305	1.55354140705425e-07	7021965	7210018	7.16518364226074e-07	7386947	7612732
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	73	-3.9946	7.16518364226074e-07	7386947	7612732	1.29779092063297e-06	7709619	7729757
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	17	-2.2786	1.29779092063297e-06	7709619	7729757	5.36971709254356e-05	7756907	7806091
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	37	-3.5313	5.36971709254356e-05	7756907	7806091	7.82582180803803e-05	7893056	7905286
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.0708	7.82582180803803e-05	7893056	7905286	7.91797602599581e-06	7914104	7928317
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8280065	84	79	-4.2366	7.91797602599581e-06	7914104	7928317	1.02442230726021e-10	8245608	8280065
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8324291	13	13	-2.141	1.02442230726021e-10	8245608	8280065	9.1081484010366e-10	8324291	8333193
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	8324328	1	0	NA	9.1081484010366e-10	8324291	8333193	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8327467	10515697	292	283	-4.015	NA	NA	NA	7.44197904765335e-29	10513747	10515697
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.7023	7.44197904765335e-29	10513747	10515697	0.000135940948523602	10631941	12527445
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	70	-2.6155	0.000135940948523602	10631941	12527445	0.000435919128926168	12613725	12721434
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-4.0802	0.000435919128926168	12613725	12721434	2.04344102402696e-10	12804329	12850287
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	111	-2.4733	2.04344102402696e-10	12804329	12850287	3.73720502812255e-14	13111594	13137597
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13240240	38	37	-3.9265	3.73720502812255e-14	13111594	13137597	0.000123101067804194	13232295	13240240
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13241181	13262997	8	7	-2.2819	0.000123101067804194	13232295	13240240	1.29264007875326e-06	13262997	13279098
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	14342834	363	351	-4.1831	1.29264007875326e-06	13262997	13279098	2.8832324461355e-13	14323815	14372581
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14473497	69	66	-3.2119	2.8832324461355e-13	14323815	14372581	0.00120641430004813	14440701	14487022
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14474414	14508894	28	27	-4.2065	0.00120641430004813	14440701	14487022	5.01159144438366e-12	14503927	14530328
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14644293	35	34	-1.9829	5.01159144438366e-12	14503927	14530328	1.63035132488416e-17	14598838	14687556
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15137457	102	102	-4.1153	1.63035132488416e-17	14598838	14687556	1.67809387553353e-05	15072515	15158623
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15139441	15241527	51	51	-3.0803	1.67809387553353e-05	15072515	15158623	2.76217169846606e-05	15191780	15261976
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15429742	125	123	-3.9209	2.76217169846606e-05	15191780	15261976	1.24080018192326e-08	15425463	15429742
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15431247	15431247	1	0	NA	1.24080018192326e-08	15425463	15429742	NA	NA	NA
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15432050	15447091	8	7	-1.6677	NA	NA	NA	6.76831633338394e-12	15447091	15448670
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15518749	28	28	-4.0189	6.76831633338394e-12	15447091	15448670	0.0672401728965181	15471179	15595870
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15519963	15687088	55	52	-3.244	0.0672401728965181	15471179	15595870	5.68105503734034e-05	15582236	15713288
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15915466	37	37	-4.404	5.68105503734034e-05	15582236	15713288	5.72827006845687e-12	15892492	15937162
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16042966	49	48	-2.8798	5.72827006845687e-12	15892492	15937162	0.0020602540800942	16002819	16091622
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16190541	65	62	-3.6562	0.0020602540800942	16002819	16091622	0.0510550174674437	16072965	16541139
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16191571	21036411	718	700	-4.0755	0.0510550174674437	16072965	16541139	1.88995546642949e-05	21025500	21042490
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-2.0868	1.88995546642949e-05	21025500	21042490	8.37551505355558e-07	21047798	21059229
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	254	-4.149	8.37551505355558e-07	21047798	21059229	0.000157247583250314	22043133	22165808
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-2.5851	0.000157247583250314	22043133	22165808	2.52650016229099e-07	22176501	22181855
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	91	-4.3578	2.52650016229099e-07	22176501	22181855	3.50600586811322e-83	22926726	25737663
MSK_252152912691_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	79	-1.4295	3.50600586811322e-83	22926726	25737663	NA	NA	NA
