Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34869589	12894	12562	0.0047	NA	NA	NA	1.03219431957667e-41	34869589	34869589
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-1.0217	1.03219431957667e-41	34869589	34869589	1.76353926152995e-44	34883375	34883375
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14650	-0.0018	1.76353926152995e-44	34883375	34883375	0	72537426	72537426
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-4.373	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	11412	-0.0083	0	72579311	72579311	2.31827050630954e-38	109987341	109987341
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.3376	2.31827050630954e-38	109987341	109987341	4.97349073907524e-17	109989998	109989998
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110023268	13	12	0.0882	4.97349073907524e-17	109989998	109989998	3.02761374022449e-12	110023268	110023268
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	1.1922	3.02761374022449e-12	110023268	110023268	2.12172575454604e-45	110039388	110039388
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	116029725	2222	2162	-0.0031	2.12172575454604e-45	110039388	110039388	5.77317178147035e-13	116029725	116029725
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-0.7943	5.77317178147035e-13	116029725	116029725	2.99394193269200e-15	116033402	116033402
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	143700072	1691	1649	-0.0022	2.993941932692e-15	116033402	116033402	2.91190080730579e-18	143648141	143706582
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143702972	143799153	48	45	-0.1858	2.91190080730579e-18	143648141	143706582	1.14606468359967e-14	143791143	143809389
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143800457	150819879	1887	1850	-0.0055	1.14606468359967e-14	143791143	143809389	0	150819879	150819879
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	1.917	0	150819879	150819879	3.88137642036583e-210	150851439	150851439
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	77	0.0059	3.88137642036583e-210	150851439	150851439	2.66820822378282e-21	151026228	151026228
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8765	2.66820822378282e-21	151026228	151026228	5.04658796954385e-31	151036435	151036435
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2621	3e-04	5.04658796954385e-31	151036435	151036435	5.48261917009715e-26	157133150	157133150
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.1363	5.48261917009715e-26	157133150	157133150	3.91252006015043e-28	157136342	157136342
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4010	-0.0092	3.91252006015043e-28	157136342	157136342	4.19319358485824e-26	167483267	167483267
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5434	4.19319358485824e-26	167483267	167483267	9.37126677117278e-26	167507898	167520743
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	174185321	2653	2576	-0.016	9.37126677117278e-26	167507898	167520743	2.19461661066738e-09	174185321	174185321
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	174187053	174187093	2	2	-0.7032	2.19461661066738e-09	174185321	174185321	8.06759662771566e-11	174187093	174187093
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	174193963	194978218	6525	6339	-4e-04	8.06759662771566e-11	174187093	174187093	8.29359812818514e-72	194978218	195009358
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.8339	8.29359812818514e-72	194978218	195009358	7.97322819437313e-67	195062793	195065867
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200598243	2158	2107	-0.0081	7.97322819437313e-67	195062793	195065867	3.63591479770741e-19	200592050	200618814
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200665389	23	23	-0.2906	3.63591479770741e-19	200592050	200618814	1.55112502852819e-23	200644068	200670407
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	200667381	1	0	NA	1.55112502852819e-23	200644068	200670407	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	247186514	17423	17013	-0.001	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11224	1e-04	NA	NA	NA	1.41453817511465e-235	34543992	34543992
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	1.0986	1.41453817511465e-235	34543992	34543992	5.61873579762242e-228	34589997	34589997
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37813211	1371	1339	-0.0102	5.61873579762242e-228	34589997	34589997	2.73544328659117e-16	37803744	37819785
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37815049	37855837	20	20	-0.2926	2.73544328659117e-16	37803744	37819785	3.2245898586101e-17	37848754	37862351
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	40797424	1347	1318	-0.0074	3.2245898586101e-17	37848754	37862351	1.14535915864293e-12	40797424	40797424
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40798586	40800199	2	2	-0.7785	1.14535915864293e-12	40797424	40797424	2.48440827995147e-12	40800199	40800199
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40801749	87721951	15628	15229	6e-04	2.48440827995147e-12	40800199	40800199	2.78081622291422e-09	87661927	87968898
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87926461	88038874	6	6	0.3951	2.78081622291422e-09	87661927	87968898	3.07552973217448e-10	88008343	88078497
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88078497	106621906	4044	3943	-0.0068	3.07552973217448e-10	88008343	88078497	4.5324769392269e-74	106621906	106621906
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106631921	106668811	10	10	-0.8233	4.5324769392269e-74	106621906	106621906	1.36943170624778e-73	106668811	106668811
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106671262	146571330	11106	10809	6e-04	1.36943170624778e-73	106668811	106668811	6.5593365495858e-17	146562545	146571330
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146589486	3	3	0.5233	6.5593365495858e-17	146562545	146571330	1.16041908619088e-08	146589486	146597405
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146592775	146592775	1	0	NA	1.16041908619088e-08	146589486	146597405	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2148	0.0024	NA	NA	NA	1.08616864858639e-23	154601442	154601442
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	1.0391	1.08616864858639e-23	154601442	154601442	3.44262630283797e-23	154606943	154606943
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	242689978	30544	29725	-0.0076	3.44262630283797e-23	154606943	154606943	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10524	-0.0038	NA	NA	NA	7.04124829836897e-10	32074432	32074432
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	0.7012	7.04124829836897e-10	32074432	32074432	8.64424838148523e-11	32080848	32080848
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	32279030	81	80	-0.0049	8.64424838148523e-11	32080848	32080848	8.4340622922228e-17	32279030	32279030
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32285101	32285133	2	2	0.8379	8.4340622922228e-17	32279030	32279030	2.34036656060901e-14	32285133	32285133
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32289181	97788189	20473	19947	-0.001	2.34036656060901e-14	32285133	32285133	4.50078260718353e-50	97788189	97788189
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	97792616	97809064	6	6	-0.8868	4.50078260718353e-50	97788189	97788189	5.92624317729053e-42	97809064	97809064
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	97810540	99914146	830	805	-0.01	5.92624317729053e-42	97809064	97809064	1.37163056672003e-26	99914146	99914146
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99916226	99916226	1	0	NA	1.37163056672003e-26	99914146	99914146	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99919457	99924129	3	3	-1.0014	NA	NA	NA	1.55465762701734e-31	99924129	99924129
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99927029	133189686	11515	11235	-0.0065	1.55465762701734e-31	99924129	99924129	4.23138029328747e-13	133189686	133189686
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	0.7916	4.23138029328747e-13	133189686	133189686	5.95898447611332e-13	133194685	133194685
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9549	-0.0024	5.95898447611332e-13	133194685	133194685	1.33545768353198e-11	163992903	163992903
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	0.6131	1.33545768353198e-11	163992903	163992903	2.35548905698315e-05	164005577	164012645
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.0069	2.35548905698315e-05	164005577	164012645	2.93467510351868e-23	164023502	164027724
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.5731	2.93467510351868e-23	164023502	164027724	4.14551266962143e-73	164101776	164107951
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	9326	-0.002	4.14551266962143e-73	164101776	164107951	0	192546280	192546280
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-3.1354	0	192546280	192546280	7.54076310084194e-141	192552734	192552734
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	193133137	114	109	-0.016	7.54076310084194e-141	192552734	192552734	2.52638357732145e-24	193133137	193133137
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193140532	193147523	3	3	-0.9495	2.52638357732145e-24	193133137	193133137	4.06440953942408e-28	193147523	193147523
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193152152	194354505	461	447	-0.0084	4.06440953942408e-28	193147523	193147523	0	194354505	194354505
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.298	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196835413	997	981	-0.0105	0	194366950	194366950	8.95102619906495e-10	196805434	196907040
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196943380	23	21	0.2104	8.95102619906495e-10	196805434	196907040	0.000441209069903889	196929805	196952514
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196945209	196961238	7	7	0.4464	0.000441209069903889	196929805	196952514	3.68722464642131e-14	196961238	196964180
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	923	-0.014	3.68722464642131e-14	196961238	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3308	0.0078	NA	NA	NA	1.93415403389694e-34	9815760	9815760
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9827233	2	2	1.3492	1.93415403389694e-34	9815760	9815760	0	9827233	9827233
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9832823	9842644	2	2	1.0393	0	9827233	9827233	2.94426547573997e-23	9842644	9842644
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	16268518	1750	1709	-0.002	2.94426547573997e-23	9842644	9842644	5.89715808923614e-12	16265709	16268518
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	16269632	16274560	3	3	0.6137	5.89715808923614e-12	16265709	16268518	2.27706483652051e-12	16274560	16274560
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	16276297	16276297	1	0	NA	2.27706483652051e-12	16274560	16274560	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	16277437	26563737	3057	2976	-0.0063	NA	NA	NA	6.99578798872037e-17	26563737	26563737
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26565071	26566345	2	2	-0.889	6.99578798872037e-17	26563737	26563737	5.1863310244156e-16	26566345	26566345
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26568376	34445002	1354	1316	-0.0043	5.1863310244156e-16	26566345	26566345	2.10432177831866e-15	34439897	34445002
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	0.4966	2.10432177831866e-15	34439897	34445002	2.11215402001226e-17	34491115	34506297
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	36581685	460	445	-0.0248	2.11215402001226e-17	34491115	34506297	2.97619609826517e-23	36581685	36581685
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	36592528	36609531	3	3	-0.8726	2.97619609826517e-23	36581685	36581685	3.07472230987388e-24	36609531	36609531
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	36623066	63346612	7190	6980	-8e-04	3.07472230987388e-24	36609531	36609531	2.48539841763469e-13	63346612	63346612
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63357811	63358506	2	2	-0.8013	2.48539841763469e-13	63346612	63346612	6.15369153800613e-13	63358506	63358506
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63360367	173224400	32415	31635	-0.006	6.15369153800613e-13	63358506	63358506	0	173224400	173224400
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-5.0142	0	173224400	173224400	0	173228860	173228860
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	186090290	3724	3630	0.0025	0	173228860	173228860	2.21617136158404e-11	186066246	186095662
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186095662	186166883	18	17	-0.2551	2.21617136158404e-11	186066246	186095662	9.16658601875741e-10	186165002	186174588
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186168483	187330240	534	519	-0.0194	9.16658601875741e-10	186165002	186174588	1.40279848548765e-76	187330240	187330240
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-2.7143	1.40279848548765e-76	187330240	187330240	2.33878467030237e-108	187333619	187333619
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1214	0.0132	2.33878467030237e-108	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	681141	197	193	-0.0153	NA	NA	NA	5.47484483644302e-13	681141	681141
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	0.9517	5.47484483644302e-13	681141	681141	5.27615286436368e-16	686701	689372
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	737829	23	23	0.0311	5.27615286436368e-16	686701	689372	2.90609233802579e-54	737829	737829
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	-1.3097	2.90609233802579e-54	737829	737829	2.05536938021489e-110	829954	829954
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	8638885	2343	2268	0.0134	2.05536938021489e-110	829954	829954	2.3079653521944e-21	8638885	8638885
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8645169	8650424	2	2	-1.0009	2.3079653521944e-21	8638885	8638885	3.33624439444219e-21	8650424	8650424
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8652974	59318791	13574	13253	-0.0023	3.33624439444219e-21	8650424	8650424	2.23979308958442e-11	59318791	59320265
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59320265	59325340	3	3	-0.6093	2.23979308958442e-11	59318791	59320265	3.43757993876434e-11	59321944	59325340
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59327219	180342860	37496	36602	-0.0024	3.43757993876434e-11	59321944	59325340	3.42228072597029e-23	180194323	180342860
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180362342	9	8	-0.525	3.42228072597029e-23	180194323	180342860	1.63519943194989e-15	180362342	180364670
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	108	0.0036	1.63519943194989e-15	180362342	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	37	0.0222	NA	NA	NA	1.33362339330991e-28	200350	200350
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	15	0.5195	1.33362339330991e-28	200350	200350	2.10011013907891e-44	240119	241674
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	29950805	10531	10276	-0.0059	2.10011013907891e-44	240119	241674	4.77020411639544e-21	29941766	29950805
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	13	0.3859	4.77020411639544e-21	29941766	29950805	1.16303640733480e-20	30005338	30021908
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	31385778	581	557	-0.0132	1.1630364073348e-20	30005338	30021908	6.22656944880164e-20	31382291	31385778
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.5879	6.22656944880164e-20	31382291	31385778	3.48495498341156e-18	31418006	31425113
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	473	0.004	3.48495498341156e-18	31418006	31425113	5.72382092415386e-176	32558677	32590568
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32588005	4	0	NA	5.72382092415386e-176	32558677	32590568	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32590568	32633691	13	12	-1.432	NA	NA	NA	8.50322633237638e-25	32631315	32633691
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32716255	29	28	-0.0467	8.50322633237638e-25	32631315	32633691	7.79260616293497e-16	32716255	32716255
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32718991	32721872	3	3	-1.738	7.79260616293497e-16	32716255	32716255	2.97075432629292e-05	32720656	32721872
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32723366	32728487	4	4	-0.4693	2.97075432629292e-05	32720656	32721872	1.53754195507098e-08	32728285	32731072
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	65767409	10660	10410	-0.0056	1.53754195507098e-08	32728285	32731072	1.36238019197215e-23	65767409	65767409
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.067	1.36238019197215e-23	65767409	65767409	2.21358483642468e-25	65771532	65771532
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	72919733	2135	2074	0.0011	2.21358483642468e-25	65771532	65771532	1.59372101695028e-30	72919733	72919733
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-0.9536	1.59372101695028e-30	72919733	72919733	3.75906804592971e-26	72924440	72924440
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	74647491	750	727	-0.0037	3.75906804592971e-26	72924440	72924440	7.42692353577673e-10	74644381	74647491
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74655219	3	3	0.5875	7.42692353577673e-10	74644381	74647491	1.28864069649523e-10	74655219	74662644
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74662644	79018959	1141	1115	0.0083	1.28864069649523e-10	74655219	74662644	0	79018959	79018959
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	11	-5.2313	0	79018959	79018959	0	79091850	79091850
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	81334248	728	702	-0.0102	0	79091850	79091850	1.94323033055726e-40	81334248	81334248
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81341711	81348170	3	3	-1.0793	1.94323033055726e-40	81334248	81334248	2.17308612803157e-39	81348170	81348170
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81350502	102039635	5541	5402	-0.0035	2.17308612803157e-39	81348170	81348170	2.81008663028710e-15	102036719	102039635
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-0.6823	2.8100866302871e-15	102036719	102039635	3.58431602254362e-14	102044331	102044331
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	132748175	10230	9966	-0.0112	3.58431602254362e-14	102044331	102044331	2.46270225825948e-13	132748175	132748175
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132749309	132752481	3	3	-0.6631	2.46270225825948e-13	132748175	132748175	7.43426734705611e-14	132752481	132752481
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132754426	151552684	6542	6382	-0.0105	7.43426734705611e-14	132752481	132752481	1.41402423358858e-40	151552684	151552684
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151554478	151563834	4	4	-0.9629	1.41402423358858e-40	151552684	151552684	9.64685774395026e-38	151563834	151563834
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151565998	170753106	6626	6442	-0.0047	9.64685774395026e-38	151563834	151563834	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1037402	259	256	0.0092	NA	NA	NA	5.9650778805869e-12	1036135	1037402
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1038517	1047707	3	3	-0.6352	5.9650778805869e-12	1036135	1037402	1.77856855799826e-10	1047707	1047707
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	2143375	412	400	0.0121	1.77856855799826e-10	1047707	1047707	0	2143375	2143375
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	2145036	2292505	69	68	-0.8681	0	2143375	2143375	0	2292505	2292505
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	2295664	16135701	4645	4507	-0.0017	0	2292505	2292505	1.28229179790380e-09	16135701	16135701
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	0.7027	1.2822917979038e-09	16135701	16135701	2.83306246017063e-11	16140018	16140018
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	66070280	14526	14154	-0.0015	2.83306246017063e-11	16140018	16140018	2.50428833330533e-29	66060295	66089361
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	66071883	66404011	61	59	0.2151	2.50428833330533e-29	66060295	66089361	9.98136131072135e-23	66266631	66446275
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	66411846	71624367	1762	1715	0.023	9.98136131072135e-23	66266631	66446275	1.88508154072113e-105	71618437	71635598
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71635598	71953235	61	57	0.435	1.88508154072113e-105	71618437	71635598	8.65741814659857e-85	71951075	72003747
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	72003747	76044574	968	954	0.031	8.65741814659857e-85	71951075	72003747	1.20420557279233e-20	76044574	76044574
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76046123	76051954	4	4	-0.7093	1.20420557279233e-20	76044574	76044574	2.94452858926135e-22	76051954	76051954
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76068083	92522688	5387	5267	-0.0049	2.94452858926135e-22	76051954	76051954	5.21163899215149e-08	92513169	92522688
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92530156	92562146	2	2	-0.6164	5.21163899215149e-08	92513169	92522688	1.94661447117017e-06	92562146	92563715
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92563715	93162991	287	285	-0.0153	1.94661447117017e-06	92562146	92563715	1.00318646409859e-13	93162991	93162991
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.856	1.00318646409859e-13	93162991	93162991	1.54941909695948e-15	93168978	93168978
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	100164752	2612	2560	0.0076	1.54941909695948e-15	93168978	93168978	4.58579005179945e-18	100162851	100164752
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.6373	4.58579005179945e-18	100162851	100164752	1.4572315935231e-15	100174991	100178968
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	100370059	87	84	0.0541	1.4572315935231e-15	100174991	100178968	7.10686437729554e-10	100366682	100370059
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100371669	100373585	2	2	-0.7236	7.10686437729554e-10	100366682	100370059	2.35800357945546e-10	100373585	100376911
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100376911	109216032	3805	3715	-8e-04	2.35800357945546e-10	100373585	100376911	5.63235632528288e-11	109214735	109230336
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109240210	6	6	0.4289	5.63235632528288e-11	109214735	109230336	1.89583953417620e-12	109233214	109245944
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	109244233	1	0	NA	1.8958395341762e-12	109233214	109245944	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	111027757	802	779	-0.009	NA	NA	NA	8.404041960571e-37	111027757	111027757
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	111031308	111035453	3	3	-1.0541	8.404041960571e-37	111027757	111027757	1.10153148777511e-35	111035453	111035453
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	111038692	118611324	3493	3403	-0.0159	1.10153148777511e-35	111035453	111035453	0	118611324	118611324
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-5.5132	0	118611324	118611324	0	118620875	118620875
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141690753	10665	10392	0.001	0	118620875	118620875	3.20211498039362e-31	141689547	141690753
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	0.5706	3.20211498039362e-31	141689547	141690753	1.35698381533119e-19	141714168	141720303
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142152205	167	165	0.0243	1.35698381533119e-19	141714168	141720303	4.11117301441092e-24	142152205	142152205
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142166710	4	4	-0.8809	4.11117301441092e-24	142152205	142152205	1.4526875510633e-37	142166710	142166710
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-4.3143	1.4526875510633e-37	142166710	142166710	0	142167908	142167908
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	143065411	345	335	-0.0166	0	142167908	142167908	1.21808597276325e-12	143065411	143065411
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143097006	143150737	2	2	0.7295	1.21808597276325e-12	143065411	143065411	9.958470734409e-10	143150737	143150737
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143178780	144546976	521	508	-0.0067	9.958470734409e-10	143150737	143150737	3.26352406579028e-14	144546976	144546976
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144548093	144551256	2	2	-0.892	3.26352406579028e-14	144546976	144546976	3.91698008311777e-15	144551256	144551256
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144554448	158821263	5709	5547	8e-04	3.91698008311777e-15	144551256	144551256	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	709	-0.0026	NA	NA	NA	4.64877827977598e-11	2231804	2234351
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.5906	4.64877827977598e-11	2231804	2234351	1.86945990975903e-14	2251011	2257255
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	39350798	12333	12013	0.0024	1.86945990975903e-14	2251011	2257255	9.62160209060422e-222	39350798	39350798
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	56	0.6105	9.62160209060422e-222	39350798	39350798	9.02856983997325e-204	39505256	39505256
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	51191560	2179	2122	0.0078	9.02856983997325e-204	39505256	39505256	1.54405039835764e-21	51191560	51191560
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.7201	1.54405039835764e-21	51191560	51191560	8.22868005666943e-22	51200291	51200291
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	8.22868005666943e-22	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	145687390	29042	28320	-0.003	NA	NA	NA	9.54836207039768e-23	145687390	145687390
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145690245	145691472	2	2	-1.0378	9.54836207039768e-23	145687390	145687390	5.13475029392481e-20	145691472	145691472
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145693004	146264846	205	199	0.0209	5.13475029392481e-20	145691472	145691472	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15750636	5441	5322	-0.0038	NA	NA	NA	1.754360769694e-12	15750636	15750636
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15752581	15757676	2	2	-0.766	1.754360769694e-12	15750636	15750636	5.3271441874467e-10	15757676	15757676
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15758998	15802255	15	15	0.0092	5.3271441874467e-10	15757676	15757676	1.18029216212731e-08	15801123	15802255
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15813356	3	3	0.6164	1.18029216212731e-08	15801123	15802255	9.05835399036898e-12	15813356	15813356
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	39130211	7269	7075	-0.0013	9.05835399036898e-12	15813356	15813356	7.14979374349126e-13	39088753	39146895
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39146895	44199401	8	8	0.3936	7.14979374349126e-13	39088753	39146895	1.85911994546841e-12	43776365	47002187
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	45359327	70926188	334	322	0.0028	1.85911994546841e-12	43776365	47002187	0	70926188	70926188
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.4921	0	70926188	70926188	0	70930528	70930528
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	77192566	2337	2279	-0.0066	0	70930528	70930528	2.1073120014941e-16	77192566	77192566
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77194207	77200826	3	3	-0.7214	2.1073120014941e-16	77192566	77192566	3.43871238680190e-17	77200826	77200826
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77202889	86960197	3020	2948	5e-04	3.4387123868019e-17	77200826	77200826	6.29201464706114e-14	86960197	86960197
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	0.799	6.29201464706114e-14	86960197	86960197	2.56039524482601e-13	86965458	86965458
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	116124007	10106	9874	-8e-04	2.56039524482601e-13	86965458	86965458	1.15034779407117e-16	116124007	116124007
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-0.8907	1.15034779407117e-16	116124007	116124007	5.30659078467947e-16	116130333	116130333
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	140145683	9400	9183	0.0052	5.30659078467947e-16	116130333	116130333	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	766548	289	279	-0.0121	NA	NA	NA	3.65654233450475e-13	766548	766548
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	771247	774846	2	2	0.769	3.65654233450475e-13	766548	766548	3.82350183253050e-12	774846	774846
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	777917	27038538	9438	9211	-0.0067	3.8235018325305e-12	774846	774846	5.58613463760025e-09	27038538	27038538
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	0.6668	5.58613463760025e-09	27038538	27038538	6.86152834777004e-09	27041812	27041812
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	45489823	4726	4621	-5e-04	6.86152834777004e-09	27041812	27041812	1.33170385205996e-157	45487335	46384985
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47021415	74	71	-0.4599	1.33170385205996e-157	45487335	46384985	1.17030380740809e-150	47017598	47040444
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47040444	53826913	1826	1789	-0.006	1.17030380740809e-150	47017598	47040444	4.19544746119558e-15	53826913	53828758
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53828758	53832408	3	3	-0.7122	4.19544746119558e-15	53826913	53828758	7.29795514951944e-16	53830907	53832408
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53837487	70949263	5315	5195	-0.0044	7.29795514951944e-16	53830907	53832408	6.92454511082696e-35	70949263	70949263
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.9009	6.92454511082696e-35	70949263	70949263	8.17276440114e-36	70960187	70960187
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2846	-0.0018	8.17276440114e-36	70960187	70960187	4.00168827292086e-100	77917893	77917893
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.7244	4.00168827292086e-100	77917893	77917893	2.00752976008579e-95	77928738	77928738
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	114100979	12392	12082	-0.0016	2.00752976008579e-95	77928738	77928738	0	114100979	114100979
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-4.1075	0	114100979	114100979	0	114106460	114106460
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	134739406	7608	7432	-0.0015	0	114106460	114106460	4.69342080909175e-30	134739406	134739406
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	1.1793	4.69342080909175e-30	134739406	134739406	1.58447343973366e-15	134743423	134743423
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	200	0.0371	1.58447343973366e-15	134743423	134743423	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2074	0.0037	NA	NA	NA	6.29463613022213e-66	5741031	5741031
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7155	6.29463613022213e-66	5741031	5741031	5.61658495941354e-82	5765438	5765438
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	26560681	7517	7307	2e-04	5.61658495941354e-82	5765438	5765438	6.64084255184193e-15	26560681	26560681
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	26562564	26563700	2	2	-0.8511	6.64084255184193e-15	26560681	26560681	4.3891803875155e-15	26563700	26563700
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	26565448	55118214	7233	7054	0.0056	4.3891803875155e-15	26563700	26563700	1.01253611327477e-147	55118214	55123719
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	0.6098	1.01253611327477e-147	55118214	55123719	1.48043075590346e-141	55207305	55209626
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4506	0.0064	1.48043075590346e-141	55207305	55209626	4.10221508786064e-17	66463477	66463477
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.9324	4.10221508786064e-17	66463477	66463477	5.63772874415557e-18	66469412	66469412
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	81177333	5234	5098	9e-04	5.63772874415557e-18	66469412	66469412	0	81177333	81177333
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81187470	81192409	2	2	-6.3451	0	81177333	81177333	0	81192409	81192409
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81202118	99025912	5618	5495	-0.0031	0	81192409	81192409	2.67520705065688e-11	99013072	99030209
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99027331	99051142	14	14	0.2714	2.67520705065688e-11	99013072	99030209	3.77290871419583e-11	99047765	99054841
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99052364	106733851	2530	2452	-0.0051	3.77290871419583e-11	99047765	99054841	1.21842982703343e-09	106732431	106733851
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	-0.4874	1.21842982703343e-09	106732431	106733851	1.56304827588372e-11	106747920	106754784
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	107284914	243	233	0.006	1.56304827588372e-11	106747920	106754784	1.34216592221363e-19	107284914	107284914
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-0.8842	1.34216592221363e-19	107284914	107284914	1.76530840423959e-16	107292148	107292148
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	133058985	9570	9325	-5e-04	1.76530840423959e-16	107292148	107292148	3.70359806869161e-11	133058985	133058985
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	133063598	133069677	2	2	-0.7349	3.70359806869161e-11	133058985	133058985	1.05676579203417e-12	133069677	133069677
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	133072657	134450318	501	485	0.0151	1.05676579203417e-12	133069677	133069677	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	4538227	1918	1879	-0.0034	NA	NA	NA	9.8302880116968e-11	4538227	4538227
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4539938	4542324	2	2	-0.7279	9.8302880116968e-11	4538227	4538227	6.58716879865908e-11	4542324	4542324
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4544254	9523923	1822	1769	-0.0022	6.58716879865908e-11	4542324	4542324	2.77242730606294e-09	9432943	9554149
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9589725	11	11	0.2861	2.77242730606294e-09	9432943	9554149	7.50254596122524e-11	9563866	9604633
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9590351	11116883	576	561	-0.0218	7.50254596122524e-11	9563866	9604633	0	11116883	11123452
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	-3.2702	0	11116883	11123452	0	11128557	11140421
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	41303729	9327	9105	-0.0089	0	11128557	11140421	5.41366547040536e-24	41303729	41303729
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41307749	41312478	3	3	-0.9009	5.41366547040536e-24	41303729	41303729	1.68646978378987e-27	41312478	41312478
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41315922	46992235	1817	1771	-0.016	1.68646978378987e-27	41312478	41312478	1.37123566511228e-12	46992235	46992235
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-0.7574	1.37123566511228e-12	46992235	46992235	1.53424158032797e-11	46996769	46996769
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	130694393	29030	28282	-9e-04	1.53424158032797e-11	46996769	46996769	3.70057266386804e-17	130694393	130694393
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.9091	3.70057266386804e-17	130694393	130694393	2.16073781311237e-17	130701040	130701040
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	86	-0.0152	2.16073781311237e-17	130701040	130701040	7.3956701858836e-47	130943064	130943064
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.5028	7.3956701858836e-47	130943064	130943064	1.0682983537769e-42	130946248	130946248
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	534	0.012	1.0682983537769e-42	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	20741511	883	868	0.0067	NA	NA	NA	1.81934722493204e-10	20741511	20741511
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	20743584	20743979	2	2	-0.7533	1.81934722493204e-10	20741511	20741511	7.19042213937619e-11	20743979	20743979
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	20748343	36969571	6154	6007	-0.004	7.19042213937619e-11	20743979	20743979	1.96619702390459e-12	36969571	36969571
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	0.7941	1.96619702390459e-12	36969571	36969571	2.04388765394960e-15	36982877	36982877
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	289	0.001	2.0438876539496e-15	36982877	36982877	1.72017848483682e-13	37953582	37953582
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	0.7465	1.72017848483682e-13	37953582	37953582	7.6926551552882e-13	37957844	37957844
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	47862717	3962	3863	-0.0149	7.6926551552882e-13	37957844	37957844	9.8833326897271e-08	47862424	47862717
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47865706	47865981	2	2	-0.6136	9.8833326897271e-08	47862424	47862717	2.12039145719560e-07	47865981	47869853
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47869853	49964838	915	890	-0.0208	2.1203914571956e-07	47865981	47869853	4.16357258546633e-53	49964838	49964838
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.7128	4.16357258546633e-53	49964838	49964838	2.58237989582405e-57	49971732	49971732
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1760	-0.0043	2.58237989582405e-57	49971732	49971732	2.09532146243578e-38	56646284	56657371
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	0.4876	2.09532146243578e-38	56646284	56657371	2.00435008460810e-40	56681665	56686863
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	71703277	3730	3636	-0.0017	2.0043500846081e-40	56681665	56686863	7.79124363289117e-22	71703277	71703277
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71705959	71708737	2	2	-0.9907	7.79124363289117e-22	71703277	71703277	3.77600968551005e-22	71708737	71708737
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71720727	89659397	4521	4415	-0.0021	3.77600968551005e-22	71708737	71708737	2.83677204897367e-66	89659397	89659397
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-1.7338	2.83677204897367e-66	89659397	89659397	3.03171303749158e-65	89662326	89662326
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4669	-0.0028	3.03171303749158e-65	89662326	89662326	8.93096915125019e-103	100690991	100690991
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-2.2068	8.93096915125019e-103	100690991	100690991	5.58079758907482e-99	100693892	100693892
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4309	-0.0015	5.58079758907482e-99	100693892	100693892	1.47921082289952e-59	113788788	113788788
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	1.3457	1.47921082289952e-59	113788788	113788788	3.27573914612839e-43	113794669	113794669
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	147	-0.0176	3.27573914612839e-43	113794669	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	-0.2248	NA	NA	NA	2.00482341840598e-29	19475864	19543544
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34498340	5601	5458	-0.0031	2.00482341840598e-29	19475864	19543544	3.73534088228654e-41	34498340	34498340
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34499884	34501839	2	2	-1.4044	3.73534088228654e-41	34498340	34498340	4.03950168940545e-17	34501839	34501839
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34505234	34674458	87	86	0.0128	4.03950168940545e-17	34501839	34501839	6.6568251679427e-06	34665545	34674458
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34685308	4	4	0.4207	6.6568251679427e-06	34665545	34674458	1.02068902774507e-07	34685308	34689453
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34689453	79174722	16587	16178	-0.0035	1.02068902774507e-07	34685308	34689453	1.94300443938174e-08	79172702	79174722
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-0.4621	1.94300443938174e-08	79172702	79174722	2.57178813690528e-09	79183154	79185548
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	82594434	1059	1039	0.009	2.57178813690528e-09	79183154	79185548	6.32703262565158e-10	82594434	82594434
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	82596960	82598594	2	2	-0.6774	6.32703262565158e-10	82594434	82594434	8.47270880875885e-10	82598594	82598594
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	82600752	85351640	573	551	0.0012	8.47270880875885e-10	82598594	82598594	1.77954082392465e-49	85351640	85351640
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85356918	85381909	7	6	-0.8656	1.77954082392465e-49	85351640	85351640	1.16489847873055e-45	85381909	85381909
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85390548	101704652	6112	5955	-0.0071	1.16489847873055e-45	85381909	85381909	4.61022228226424e-21	101704652	101704652
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101707771	101707860	2	2	-1.0257	4.61022228226424e-21	101704652	101704652	1.43461442716151e-18	101707860	101707860
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101713121	105597555	1542	1503	-0.005	1.43461442716151e-18	101707860	101707860	4.85134687854102e-20	105595302	105597555
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	9	0.4949	4.85134687854102e-20	105595302	105597555	1.82257290581941e-16	105632168	105673157
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	46	0.0053	1.82257290581941e-16	105632168	105673157	4.16053576705424e-29	105850033	105850033
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-0.7308	4.16053576705424e-29	105850033	105850033	1.58724890157998e-35	105881893	105881893
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105923686	14	13	-0.0356	1.58724890157998e-35	105881893	105881893	2.56712765627656e-18	105923159	105945006
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	105998412	19	19	0.3114	2.56712765627656e-18	105923159	105945006	6.56691275694066e-12	105996176	106019719
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106002179	106002179	1	0	NA	6.56691275694066e-12	105996176	106019719	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106218059	90	87	4e-04	NA	NA	NA	5.5210750760404e-16	106212061	106221696
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	16	-0.4025	5.5210750760404e-16	106212061	106221696	7.51739919458988e-23	106252126	106255190
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	35	0.0654	7.51739919458988e-23	106252126	106255190	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	5	0.1124	NA	NA	NA	3.87774138220523e-08	18692865	18692865
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	18810004	3	3	-0.4897	3.87774138220523e-08	18692865	18692865	3.89208019591967e-07	18810004	18810004
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18818949	18837737	6	6	-0.8926	3.89208019591967e-07	18810004	18810004	5.9166033142261e-07	18837737	18842565
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-1.3641	5.9166033142261e-07	18837737	18842565	1.62980843589606e-06	18848213	18854068
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19806497	84	82	-0.8657	1.62980843589606e-06	18848213	18854068	6.85963568868314e-12	19803092	19835471
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19819961	19882711	10	10	-0.4213	6.85963568868314e-12	19803092	19835471	0.00057343723774382	19835471	19927262
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20008227	28	28	-0.7485	0.00057343723774382	19835471	19927262	0.0005454735524959	19991828	20014017
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20009685	20088256	15	15	-0.5171	0.0005454735524959	19991828	20014017	1.27740521268207e-40	20079935	20308014
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	22038880	325	312	0.0092	1.27740521268207e-40	20079935	20308014	4.78550256276572e-29	22038880	22038880
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22138119	22250971	4	4	-0.8362	4.78550256276572e-29	22038880	22038880	7.07754999249607e-29	22250971	22250971
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22351404	37476468	4894	4758	-0.0048	7.07754999249607e-29	22250971	22250971	2.08030934191470e-28	37473502	37483173
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	37483173	37536104	10	9	0.5455	2.0803093419147e-28	37473502	37483173	3.22471325491984e-28	37523905	37544466
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	37544466	53316553	6842	6669	1e-04	3.22471325491984e-28	37523905	37544466	1.15935082576589e-08	53315011	53316553
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53318935	53320734	2	2	-0.6567	1.15935082576589e-08	53315011	53316553	1.07993383837203e-09	53320734	53320734
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53322717	56507534	1382	1355	-0.0039	1.07993383837203e-09	53320734	53320734	9.05560914347683e-38	56507534	56507534
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56509504	56516385	5	5	-0.8071	9.05560914347683e-38	56507534	56507534	3.31095876820297e-33	56516385	56516385
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56518657	74669752	8091	7893	-0.0081	3.31095876820297e-33	56516385	56516385	4.41374474642652e-35	74669752	74669752
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.909	4.41374474642652e-35	74669752	74669752	5.9198249450095e-34	74680439	74680439
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	95609756	7615	7409	0.0013	5.9198249450095e-34	74680439	74680439	1.03814180975265e-54	95609756	95609756
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.936	1.03814180975265e-54	95609756	95609756	5.26833319966097e-58	95632390	95632390
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	98232932	1072	1044	-0.0036	5.26833319966097e-58	95632390	95632390	5.5541042534305e-10	98228743	98232932
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	-0.5595	5.5541042534305e-10	98228743	98232932	2.97828548219243e-09	98239454	98243586
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100217283	907	886	-0.0116	2.97828548219243e-09	98239454	98243586	8.27381167387089e-10	100217181	100278665
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100278665	100298352	4	4	0.4786	8.27381167387089e-10	100217181	100278665	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	461	-0.0073	NA	NA	NA	6.64390661408197e-12	1296767	1296767
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	0.8636	6.64390661408197e-12	1296767	1296767	6.28096121796245e-14	1300341	1300341
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	32379126	10098	9831	0.009	6.28096121796245e-14	1300341	1300341	7.25106123117743e-63	31854794	32518665
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	42	0.3991	7.25106123117743e-63	31854794	32518665	1.13606068368524e-67	33528385	33559207
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	49035419	1575	1532	0.0122	1.13606068368524e-67	33528385	33559207	1.50810270759733e-12	49035419	49035419
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	49038212	49041773	2	2	-0.7407	1.50810270759733e-12	49035419	49035419	2.15779298598247e-11	49041773	49045751
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	49045751	54352394	1502	1468	0.0053	2.15779298598247e-11	49041773	49045751	1.17555991094476e-22	54348362	54363713
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.468	1.17555991094476e-22	54348362	54363713	9.2824697849138e-06	54376805	54379839
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54402057	4	4	0.4981	9.2824697849138e-06	54376805	54379839	1.16017537605468e-09	54399890	54405667
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	68693086	4589	4475	0.0075	1.16017537605468e-09	54399890	54405667	2.60318253944289e-14	68687301	68710277
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	9	-0.3864	2.60318253944289e-14	68687301	68710277	3.80584813914675e-13	68751390	68842364
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	70559172	767	746	-9e-04	3.80584813914675e-13	68751390	68842364	5.25376415710431e-09	70559172	70559172
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70561211	70562690	2	2	-0.6805	5.25376415710431e-09	70559172	70559172	2.82761500957103e-11	70562690	70562690
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70564931	72941901	686	663	0.0132	2.82761500957103e-11	70562690	70562690	2.18114828723767e-09	72929786	72951581
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	72964783	5	4	-0.4363	2.18114828723767e-09	72929786	72951581	2.86877132185291e-09	72963578	73022578
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	733	0.0177	2.86877132185291e-09	72963578	73022578	0	75093957	75093957
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-3.0634	0	75093957	75093957	0	75100865	75100865
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75782614	154	152	-0.0091	0	75100865	75100865	1.44183872393299e-08	75781470	75787597
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75784533	75793352	5	5	0.3848	1.44183872393299e-08	75781470	75787597	1.88640513857201e-07	75789102	75798005
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75795532	76923844	450	436	-0.0056	1.88640513857201e-07	75789102	75798005	0	76923844	76923844
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	0	76923844	76923844	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76938723	7	7	-4.415	NA	NA	NA	1.43144851704658e-10	76937156	76938723
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76940218	76942679	2	2	-0.7436	1.43144851704658e-10	76937156	76938723	3.84763028038932e-12	76942679	76942679
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	77212654	133	130	-0.0136	3.84763028038932e-12	76942679	76942679	4.16686766108902e-08	77196923	77225559
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77215726	77256703	21	21	0.1826	4.16686766108902e-08	77196923	77225559	2.01387808570850e-06	77245441	77272855
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77258422	88690571	4358	4243	5e-04	2.0138780857085e-06	77245441	77272855	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	47546	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	48858	15727076	6301	6159	0.0125	NA	NA	NA	6.22582390275038e-13	15727076	15727076
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	0.8428	6.22582390275038e-13	15727076	15727076	2.45886094311809e-14	15733964	15733964
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	41566540	9605	9342	0.0039	2.45886094311809e-14	15733964	15733964	5.72967666993347e-10	41539415	41592453
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42151941	51	51	-0.1366	5.72967666993347e-10	41539415	41592453	5.43499036991598e-09	41644979	42178009
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	70010802	10043	9777	-0.0024	5.43499036991598e-09	41644979	42178009	2.39906121231551e-09	70010420	70010802
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	70019913	70023071	3	3	0.5588	2.39906121231551e-09	70010420	70010802	1.71742834209619e-08	70023071	70025048
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	70025048	72774988	1260	1215	0.0088	1.71742834209619e-08	70023071	70025048	8.18511563211063e-28	72774988	72774988
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72776416	72780121	3	3	-0.9695	8.18511563211063e-28	72774988	72774988	1.08396036816488e-23	72780121	72780121
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72785841	78653545	2365	2319	-0.0074	1.08396036816488e-23	72780121	72780121	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22410	-0.0029	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	215	-0.003	NA	NA	NA	1.02446483718167e-26	790526	790526
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	-1.3535	1.02446483718167e-26	790526	790526	2.17787846945327e-27	794978	794978
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	2780008	934	906	-0.0064	2.17787846945327e-27	794978	794978	3.81309393978067e-08	2774170	2780008
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	2783259	2794594	6	6	0.4258	3.81309393978067e-08	2774170	2780008	2.94873597553845e-11	2794594	2798906
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	2798906	3353960	259	252	-9e-04	2.94873597553845e-11	2794594	2798906	6.34120924728946e-31	3353960	3353960
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	-1.2218	6.34120924728946e-31	3353960	3353960	1.81723648992442e-28	3356334	3356334
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	19694025	7605	7422	0.0079	1.81723648992442e-28	3356334	3356334	3.9541272730914e-15	19692626	19694025
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	0.7472	3.9541272730914e-15	19692626	19694025	8.05492202696553e-16	19700620	19700620
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	58208527	11437	11159	0.0123	8.05492202696553e-16	19700620	19700620	2.24799275005109e-15	58203159	58212113
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58244012	15	15	-0.312	2.24799275005109e-15	58203159	58212113	4.41922250935342e-13	58241773	58252109
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	59246409	484	469	0.0142	4.41922250935342e-13	58241773	58252109	2.89808739055523e-12	59246409	59246409
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-0.6903	2.89808739055523e-12	59246409	59246409	9.60353940502544e-19	59251831	59251831
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	59414898	86	85	0.0188	9.60353940502544e-19	59251831	59251831	6.85219320129517e-15	59412581	59414898
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59440274	12	12	-0.3046	6.85219320129517e-15	59412581	59414898	3.64695775049014e-09	59440274	59446274
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59441741	59441741	1	0	NA	3.64695775049014e-09	59440274	59446274	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59442709	61432570	865	847	-0.0088	NA	NA	NA	7.38767464183816e-30	61432570	61432570
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61436857	61445887	5	5	-0.8231	7.38767464183816e-30	61432570	61432570	2.56938617589765e-26	61445887	61445887
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61447075	61557826	51	51	-0.0278	2.56938617589765e-26	61445887	61445887	1.52091261560000e-14	61557826	61557826
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61559132	61560427	2	2	-0.9327	1.5209126156e-14	61557826	61557826	1.53976006493779e-17	61560427	61560427
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61566194	63788698	1068	1046	0.001	1.53976006493779e-17	61560427	61560427	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	570	0	NA	NA	NA	6.06933771489097e-170	1506379	1506379
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.2878	6.06933771489097e-170	1506379	1506379	8.77589712007197e-181	1532433	1532433
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	43633334	14117	13745	0.0041	8.77589712007197e-181	1532433	1532433	1.02381425114479e-16	43633334	43633334
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	43637768	43638107	2	2	-0.8868	1.02381425114479e-16	43633334	43633334	1.22491597501968e-15	43638107	43638107
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	43640726	62419534	6864	6684	0.0067	1.22491597501968e-15	43638107	43638107	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	22573420	3063	2998	-0.0048	NA	NA	NA	1.88766197055327e-27	22573420	22573420
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-0.9633	1.88766197055327e-27	22573420	22573420	5.58639754145584e-28	22585040	22585040
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	43980496	8998	8779	-0.0033	5.58639754145584e-28	22585040	22585040	2.05715631443085e-17	43980496	43980496
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43984707	43985080	2	2	-0.9379	2.05715631443085e-17	43980496	43980496	1.11661516234726e-13	43985080	43985080
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43986033	46922972	1375	1337	-0.009	1.11661516234726e-13	43985080	43985080	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	17001076	721	701	0.0122	NA	NA	NA	8.9717676579516e-14	17001076	17001076
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17006871	17008019	2	2	-0.9006	8.9717676579516e-14	17001076	17001076	2.56293742205695e-15	17008019	17008019
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17011485	37621766	10019	9754	0.0016	2.56293742205695e-15	17008019	17008019	1.34328453797924e-22	37621766	37621766
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	1.0894	1.34328453797924e-22	37621766	37621766	1.38973681598782e-21	37626069	37626069
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	48448446	5311	5180	-0.0044	1.38973681598782e-21	37626069	37626069	2.25481969638478e-10	48448446	48448446
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	-0.774	2.25481969638478e-10	48448446	48448446	6.4256075800493e-10	48452959	48452959
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	49571068	500	489	0.0156	6.4256075800493e-10	48452959	48452959	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	-0.002	NA	NA	NA	4.22460311952741e-37	124528	124528
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	3	1.1356	4.22460311952741e-37	124528	124528	4.12454482369139e-27	130528	130528
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	218354	46	46	0.0295	4.12454482369139e-27	130528	130528	2.77578147219325e-21	218354	218354
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	222004	222034	2	2	-1.1101	2.77578147219325e-21	218354	218354	5.30425412082135e-24	222034	222034
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	223009	845758	485	471	0.0174	5.30425412082135e-24	222034	222034	1.19679544510723e-12	843614	849437
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	848806	859452	9	8	0.4349	1.19679544510723e-12	843614	849437	2.05920291145845e-12	856619	859493
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	1682070	419	401	0.0101	2.05920291145845e-12	856619	859493	2.13618809030064e-19	1681621	1683884
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1683318	1688730	9	9	0.5095	2.13618809030064e-19	1681621	1683884	5.81151552872258e-25	1687568	1691644
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1691644	2203637	302	295	-0.0188	5.81151552872258e-25	1687568	1691644	3.34420330833995e-07	2203575	2203637
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2204563	2211208	3	3	0.4672	3.34420330833995e-07	2203575	2203637	3.33858700096988e-08	2211208	2211451
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2211451	2302065	91	90	0.003	3.33858700096988e-08	2211208	2211451	4.44141961597981e-08	2301365	2302065
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.405	4.44141961597981e-08	2301365	2302065	5.18914402026090e-07	2304398	2307282
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2672401	362	348	0.0018	5.1891440202609e-07	2304398	2307282	1.80375965835152e-08	2667268	2692523
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	26	-0.1835	1.80375965835152e-08	2667268	2692523	4.31439768149425e-103	2708291	2711273
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	3302617	241	236	0.8782	4.31439768149425e-103	2708291	2711273	2.03698631158777e-07	3294997	3306796
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3305160	3311494	4	4	0.1555	2.03698631158777e-07	3294997	3306796	6.64467637574339e-13	3308942	3312908
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3312908	6146726	862	850	0.9423	6.64467637574339e-13	3308942	3312908	3.89422732587826e-09	6145632	6146726
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6148661	6150055	2	2	0.0059	3.89422732587826e-09	6145632	6146726	9.51411585640588e-13	6150055	6152223
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6152223	8417817	668	654	0.9587	9.51411585640588e-13	6150055	6152223	2.31004030359753e-10	8408259	8447855
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8420787	8475091	23	22	0.6889	2.31004030359753e-10	8408259	8447855	6.72061296587498e-13	8447855	8481902
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8477126	22149643	5751	5620	0.9692	6.72061296587498e-13	8447855	8481902	3.0877718437897e-13	22149643	22149643
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	22151198	22152780	2	2	0.0339	3.0877718437897e-13	22149643	22149643	9.64172440728756e-13	22152780	22152780
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	22154140	142448982	33815	32955	0.9685	9.64172440728756e-13	22152780	22152780	3.62256980541921e-10	142446628	142464579
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	142450511	142472806	5	5	0.4352	3.62256980541921e-10	142446628	142464579	1.79069924305851e-08	142463002	142474365
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	142474365	154038318	3628	3525	0.957	1.79069924305851e-08	142463002	142474365	7.21027277008613e-06	154022916	154047749
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078401	10	10	1.253	7.21027277008613e-06	154022916	154047749	9.99863736751745e-06	154056623	154091384
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154078819	154442377	91	87	0.9716	9.99863736751745e-06	154056623	154091384	4.00560075876328e-37	154442377	154442377
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	2.0719	4.00560075876328e-37	154442377	154442377	2.41613339537023e-38	154450309	154450309
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.9602	2.41613339537023e-38	154450309	154450309	1.01602888358830e-231	154582414	154582414
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	0.0169	1.0160288835883e-231	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3034907	121	119	-4.6152	NA	NA	NA	3.17440527109454e-29	2973379	3219200
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	5593746	19	17	-1.4198	3.17440527109454e-29	2973379	3219200	1.9248298503796e-14	4948824	6688691
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	168	-4.0545	1.9248298503796e-14	4948824	6688691	4.82255912418002e-07	7016814	7205930
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7054924	2	0	NA	4.82255912418002e-07	7016814	7205930	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	125	-3.143	NA	NA	NA	8.042931888809e-09	7401540	7603458
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7722458	74	71	-4.4169	8.042931888809e-09	7401540	7603458	8.94326353646577e-09	7712882	7726921
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7782532	19	17	-2.543	8.94326353646577e-09	7712882	7726921	0.000291206090902289	7756907	7827650
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8005148	61	61	-3.7696	0.000291206090902289	7756907	7827650	1.10539811017621e-06	7936024	8057124
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8280065	63	56	-4.7522	1.10539811017621e-06	7936024	8057124	6.9795963013149e-08	8230756	8300654
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8486504	44	44	-3.7316	6.9795963013149e-08	8230756	8300654	7.18068744033715e-06	8442618	8490437
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8490437	8538835	15	15	-4.9839	7.18068744033715e-06	8442618	8490437	0.000175752494266810	8533866	8548774
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8698878	61	60	-3.9532	0.00017575249426681	8533866	8548774	2.58934612866901e-05	8659109	8760589
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8701183	10515697	186	176	-4.627	2.58934612866901e-05	8659109	8760589	1.81645407802118e-51	10513747	10515697
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.4982	1.81645407802118e-51	10513747	10515697	2.01545746784373e-30	10645500	10645500
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	10655750	2	2	-5.3329	2.01545746784373e-30	10645500	10645500	2.31687776623432e-151	10655750	10655750
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11249952	11698871	4	4	-0.7849	2.31687776623432e-151	10655750	10655750	6.75823470937501e-49	11698871	11698871
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12452734	1	0	NA	6.75823470937501e-49	11698871	11698871	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-5.0784	NA	NA	NA	1.40062064665654e-05	12536761	12550566
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	52	-2.5459	1.40062064665654e-05	12536761	12550566	0.000398249687015188	12615455	12710000
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-4.0438	0.000398249687015188	12615455	12710000	0.00413360249745404	12772155	12909643
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12997864	58	56	-2.9666	0.00413360249745404	12772155	12909643	2.85906371027400e-05	12965378	12997864
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12999095	13040293	19	18	-1.4992	2.859063710274e-05	12965378	12997864	7.55760340707481e-29	13040293	13041812
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13066849	13	12	-3.8964	7.55760340707481e-29	13040293	13041812	4.51901527086108e-07	13062151	13080405
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13076862	13128515	22	21	-2.1425	4.51901527086108e-07	13062151	13080405	3.21323195599417e-16	13119344	13133803
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13230706	33	30	-4.5144	3.21323195599417e-16	13119344	13133803	0.000520372513217326	13164641	13232295
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13232295	13262997	13	13	-3.298	0.000520372513217326	13164641	13232295	6.43018092288573e-06	13261173	13286708
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	14342834	363	349	-4.5673	6.43018092288573e-06	13261173	13286708	1.23545900120782e-08	14326935	14354682
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14383746	22	22	-3.365	1.23545900120782e-08	14326935	14354682	1.58889969078364e-07	14380301	14383746
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14384653	14409145	10	10	-5.0648	1.58889969078364e-07	14380301	14383746	4.02188579658088e-05	14409145	14415559
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409975	14451317	26	25	-3.7417	4.02188579658088e-05	14409145	14415559	2.92887668307009e-06	14445814	14451317
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14454048	14457286	4	4	-1.4586	2.92887668307009e-06	14445814	14451317	4.61394072301471e-05	14457286	14464288
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14458085	14508021	34	30	-3.9326	4.61394072301471e-05	14457286	14464288	4.91632122499564e-13	14503185	14526446
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14572190	25	23	-1.6893	4.91632122499564e-13	14503185	14526446	2.03396464193572e-12	14566592	14572190
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	14598838	7	7	-4.9295	2.03396464193572e-12	14566592	14572190	4.59692074613378e-05	14598838	14644293
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14691724	10	9	-2.2994	4.59692074613378e-05	14598838	14644293	3.24482628871596e-07	14684159	14695441
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14692847	15124246	93	86	-4.4108	3.24482628871596e-07	14684159	14695441	0.000355705434286283	15046358	15188324
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15126227	15284717	85	79	-3.6405	0.000355705434286283	15046358	15188324	7.0961312249552e-07	15255162	15309005
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15521958	133	130	-4.5083	7.0961312249552e-07	15255162	15309005	1.09745799667709e-10	15517551	15521958
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15523178	15523178	1	0	NA	1.09745799667709e-10	15517551	15521958	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15543194	12	10	-2.3407	NA	NA	NA	1.42653183670430e-06	15543194	15549637
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15546378	15573579	17	16	-4.6261	1.4265318367043e-06	15543194	15549637	0.000314157571763771	15560912	15582236
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15573648	15587741	6	6	-2.0256	0.000314157571763771	15560912	15582236	1.51412994916503e-05	15583573	15587741
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15617621	5	5	-5.0521	1.51412994916503e-05	15583573	15587741	2.27787996581202e-12	15617621	15617621
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15621613	15630463	3	3	-2.2013	2.27787996581202e-12	15617621	15617621	3.9976189428471e-13	15630463	15630463
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15639408	15682936	8	8	-3.7312	3.9976189428471e-13	15630463	15630463	0.000101391382323431	15682936	15716500
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15687088	15687088	1	0	NA	0.000101391382323431	15682936	15716500	NA	NA	NA
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15690301	15915466	37	36	-4.9793	NA	NA	NA	1.62969994757027e-06	15898644	15956978
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16035717	43	41	-3.6751	1.62969994757027e-06	15898644	15956978	0.197868917639566	15945921	16035717
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16040789	4	4	-2.2162	0.197868917639566	15945921	16035717	1.03880929574345e-40	16040789	16040789
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16042014	16042966	2	2	-0.5964	1.03880929574345e-40	16040789	16040789	4.16443443715252e-05	16042966	16043782
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16177411	55	52	-3.7338	4.16443443715252e-05	16042966	16043782	0.000558695282889446	16107406	16279279
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	17789346	286	279	-4.3583	0.000558695282889446	16107406	16279279	3.7313378846695e-08	17782139	17789346
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17791088	17801068	6	6	-1.8439	3.7313378846695e-08	17782139	17789346	1.42086371871263e-10	17801068	17804686
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17802714	17893954	29	28	-3.9624	1.42086371871263e-10	17801068	17804686	2.42438778789192e-05	17880585	17893954
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17901399	17922872	6	5	-5.6066	2.42438778789192e-05	17880585	17893954	5.66005141490665e-08	17922872	17928492
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17928492	18012839	14	14	-4.296	5.66005141490665e-08	17922872	17928492	0.000864764415831494	17990521	18029447
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	18021017	18073675	7	6	-5.1951	0.000864764415831494	17990521	18029447	1.93969262641098e-06	18067360	19261931
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19261931	19268543	5	5	-3.63	1.93969262641098e-06	18067360	19261931	9.4910418257706e-10	19268543	19269893
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19269893	19296273	16	16	-5.3124	9.4910418257706e-10	19268543	19269893	9.52182579748783e-05	19287655	19503755
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19297709	19610243	66	64	-4.3254	9.52182579748783e-05	19287655	19503755	1.81025399338045e-10	19608039	19610243
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.357	1.81025399338045e-10	19608039	19610243	4.30069833389757e-08	19613864	19614809
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21036411	291	278	-4.4218	4.30069833389757e-08	19613864	19614809	4.40943618922212e-05	21026715	21036411
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	6	-2.5401	4.40943618922212e-05	21026715	21036411	1.50562991930804e-08	21054519	21057446
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21497583	140	132	-4.5772	1.50562991930804e-08	21054519	21057446	5.44645234924706e-05	21490803	21497583
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21523522	21534077	3	3	-2.3932	5.44645234924706e-05	21490803	21497583	3.95743546539633e-36	21534077	21534077
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21559551	21616877	6	6	-5.2136	3.95743546539633e-36	21534077	21534077	1.57113877581700e-08	21616877	21634923
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21634923	21657525	4	4	-3.2581	1.571138775817e-08	21616877	21634923	2.4165896948061e-16	21657525	21657525
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21666200	21687813	10	10	-5.515	2.4165896948061e-16	21657525	21657525	3.97758137587999e-28	21687813	21687813
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21689031	21763911	14	14	-3.3439	3.97758137587999e-28	21687813	21687813	6.03286878104741e-06	21755980	21792078
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21768635	22139807	84	78	-4.5138	6.03286878104741e-06	21755980	21792078	2.28210614461366e-11	22058759	22158616
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.467	2.28210614461366e-11	22058759	22158616	9.81287797771647e-17	22176501	22177335
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22367156	31	29	-5.0759	9.81287797771647e-17	22176501	22177335	0.00024961410835722	22252446	22371003
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22371003	22395796	8	7	-3.7496	0.00024961410835722	22252446	22371003	7.93651606578596e-07	22393417	22400925
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22400925	22827867	17	16	-4.8808	7.93651606578596e-07	22393417	22400925	9.293761984418e-12	22827867	22833133
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22833133	22854382	8	7	-3.2513	9.293761984418e-12	22827867	22833133	0.00410390846240047	22850980	22876519
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22855219	22930737	29	28	-4.6108	0.00410390846240047	22850980	22876519	7.81445795413688e-36	22926726	25737663
MSK_252152912692_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	80	-1.2509	7.81445795413688e-36	22926726	25737663	NA	NA	NA
