Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	7478363	2261	2182	0.0175	NA	NA	NA	1.83648049797815e-14	7476217	7478363
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	7480467	7489671	5	5	-0.7461	1.83648049797815e-14	7476217	7478363	1.90041239242386e-16	7489671	7491033
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	7491033	12760663	2246	2172	0.019	1.90041239242386e-16	7489671	7491033	5.18910909497104e-14	12752518	12831942
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12761998	13668371	21	20	-0.338	5.18910909497104e-14	12752518	12831942	3.48263587889055e-13	13647633	13673299
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13670010	34869589	8361	8043	0.0161	3.48263587889055e-13	13647633	13673299	2.1860368730199e-21	34869589	34869589
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.9802	2.1860368730199e-21	34869589	34869589	1.14332584371668e-21	34883375	34883375
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	42035647	2852	2747	0.0064	1.14332584371668e-21	34883375	34883375	8.91968714710981e-12	42035647	42035647
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	42037938	42039733	2	2	-1.0338	8.91968714710981e-12	42035647	42035647	1.14515168918501e-11	42039733	42039733
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	42042132	43131392	438	428	-0.0147	1.14515168918501e-11	42039733	42039733	1.62730110239698e-08	43124945	43131392
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	43132077	43139091	2	2	-0.8828	1.62730110239698e-08	43124945	43131392	1.39505724330012e-08	43139091	43139091
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	43142878	72537426	11702	11258	-8e-04	1.39505724330012e-08	43139091	43139091	0	72537426	72537426
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	10	-4.6047	0	72537426	72537426	0	72574479	72574479
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	72579311	1	0	NA	0	72574479	72574479	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	86800503	4454	4304	9e-04	NA	NA	NA	1.90351454175969e-21	86798583	86801675
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86801675	86811798	7	6	-0.7503	1.90351454175969e-21	86798583	86801675	1.18827485815416e-19	86809511	86816047
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86813797	86813797	1	0	NA	1.18827485815416e-19	86809511	86816047	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86816047	109987341	7226	6986	-0.0042	NA	NA	NA	6.43732046471845e-20	109987341	109987341
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.2959	6.43732046471845e-20	109987341	109987341	9.70557947189748e-14	109989998	109989998
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110033018	14	14	0.0272	9.70557947189748e-14	109989998	109989998	1.11299500514968e-15	110033018	110033018
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	1.3773	1.11299500514968e-15	110033018	110033018	9.40114331336328e-21	110039388	110039388
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	116029725	2222	2143	0.0036	9.40114331336328e-21	110039388	110039388	6.67248739759327e-12	116029725	116029725
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-1.0463	6.67248739759327e-12	116029725	116029725	2.19605455660551e-13	116033402	116033402
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	150818222	3625	3482	0.0066	2.19605455660551e-13	116033402	116033402	1.85206463983644e-27	150818222	150818222
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150839754	5	5	-0.9389	1.85206463983644e-27	150818222	150818222	7.05376744767691e-11	150839754	150841957
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-3.8209	7.05376744767691e-11	150839754	150841957	0	150851439	150851439
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2662	0.0091	0	150851439	150851439	2.71741521124864e-272	157133150	157133150
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-4.796	2.71741521124864e-272	157133150	157133150	3.96197629261086e-284	157136342	157136342
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3962	-0.0062	3.96197629261086e-284	157136342	157136342	3.12619337160076e-12	167479184	167483267
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.503	3.12619337160076e-12	167479184	167483267	8.4949719091131e-13	167507898	167520743
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	179014530	4580	4398	-0.005	8.4949719091131e-13	167507898	167520743	1.08923833402366e-13	179014530	179014530
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179017844	179017844	1	0	NA	1.08923833402366e-13	179014530	179014530	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179019188	179021834	2	2	-1.0548	NA	NA	NA	1.66997095464891e-12	179021834	179021834
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179023488	185973975	2625	2516	-0.0048	1.66997095464891e-12	179021834	179021834	9.09339986832038e-50	185973975	185973975
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185979586	185979586	1	0	NA	9.09339986832038e-50	185973975	185973975	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-2.1167	NA	NA	NA	1.79536187083782e-53	185988138	185988138
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1891	0.0061	1.79536187083782e-53	185988138	185988138	8.45623580111871e-50	194978218	194978218
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.929	8.45623580111871e-50	194978218	194978218	1.9619543866827e-45	195065867	195065867
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200598243	2158	2083	0.0085	1.9619543866827e-45	195065867	195065867	5.600268607909e-15	200584100	200623556
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200804838	43	42	-0.2468	5.600268607909e-15	200584100	200623556	6.89868720284341e-16	200693672	200813827
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200806319	200806319	1	0	NA	6.89868720284341e-16	200693672	200813827	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200807586	211067168	4033	3878	0.0067	NA	NA	NA	0	211067168	211067168
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211070042	211079988	4	4	-4.744	0	211067168	211067168	0	211079988	211079988
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211082419	247186514	13366	12874	-0.0027	0	211079988	211079988	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11083	0.0062	NA	NA	NA	0	34543992	34543992
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34583814	17	13	-5.0046	0	34543992	34543992	0	34583814	34583814
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34589997	35553983	382	370	-0.0114	0	34583814	34583814	1.31085294028428e-27	35553983	35553983
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-1.8313	1.31085294028428e-27	35553983	35553983	5.07657575921067e-46	35562007	35562007
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	35821494	101	99	-0.0011	5.07657575921067e-46	35562007	35562007	2.22125014307751e-13	35821494	35821494
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	0.9814	2.22125014307751e-13	35821494	35821494	8.13910337517157e-13	35844884	35844884
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37787637	877	851	-0.0142	8.13910337517157e-13	35844884	35844884	1.97968283942200e-12	37775420	37800512
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37789939	37855837	28	28	-0.2809	1.979682839422e-12	37775420	37800512	4.87834285361252e-11	37847519	37872988
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	41091579	1484	1435	-0.009	4.87834285361252e-11	37847519	37872988	8.2674646485661e-15	41087172	41091579
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41092989	41101640	5	5	-0.7445	8.2674646485661e-15	41087172	41091579	3.34222858053018e-16	41101640	41108548
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41105253	41105253	1	0	NA	3.34222858053018e-16	41101640	41108548	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41108548	52600588	4311	4164	0.0039	NA	NA	NA	2.86680864613488e-14	52588009	52600588
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.7079	2.86680864613488e-14	52588009	52600588	8.7938662303674e-16	52635695	52642716
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	52639605	1	0	NA	8.7938662303674e-16	52635695	52642716	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52642716	66038336	4483	4303	-0.0024	NA	NA	NA	1.79492780880216e-16	66038336	66038336
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66041319	66049853	3	3	-0.9383	1.79492780880216e-16	66038336	66038336	2.53967902763738e-15	66049853	66049853
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66055464	212890878	43911	42316	-0.0019	2.53967902763738e-15	66049853	66049853	1.59992309033818e-20	212890878	212890878
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-0.9323	1.59992309033818e-20	212890878	212890878	2.45255746863991e-19	212898875	212898875
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242689978	10688	10288	-5e-04	2.45255746863991e-19	212898875	212898875	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460892	16218	15604	0.0011	NA	NA	NA	2.7294341724851e-76	47460892	47460892
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-2.5329	2.7294341724851e-76	47460892	47460892	1.20283779551417e-77	47466921	47466921
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	163992903	37268	35870	-8e-04	1.20283779551417e-77	47466921	47466921	1.34239047048360e-60	163992903	164001657
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	7	1.1704	1.3423904704836e-60	163992903	164001657	0.000104984010426759	164012645	164038917
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	0.5548	0.000104984010426759	164012645	164038917	4.74034426616399e-35	164100804	164112873
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	9182	-0.005	4.74034426616399e-35	164100804	164112873	0	192546280	192546280
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-4.9567	0	192546280	192546280	0	192550989	192550989
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	194354505	579	564	-0.0105	0	192550989	192550989	9.87256251997901e-171	194354505	194354505
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194358882	1	0	NA	9.872562519979e-171	194354505	194354505	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194360242	194362272	2	2	-4.0812	NA	NA	NA	3.24711375332461e-163	194362272	194362272
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194364470	199329592	1983	1912	-0.0068	3.24711375332461e-163	194362272	194362272	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3260	0.0135	NA	NA	NA	5.2213716866081e-28	9815760	9815760
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	1.161	5.2213716866081e-28	9815760	9815760	4.38106435935822e-33	9842644	9842644
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34457648	6168	5941	-0.004	4.38106435935822e-33	9842644	9842644	9.89115457108407e-11	34445002	34457648
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34463523	34491115	5	5	-0.6093	9.89115457108407e-11	34445002	34457648	1.31681759849394e-10	34491115	34506297
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	70150576	8994	8666	-0.0062	1.31681759849394e-10	34491115	34506297	2.48932368034016e-25	70150576	70150576
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-1.0292	2.48932368034016e-25	70150576	70150576	1.75667441131035e-26	70216707	70216707
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	75159698	1563	1499	-0.0107	1.75667441131035e-26	70216707	70216707	6.4653282391954e-14	75159698	75159698
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	75161613	75164009	2	2	-1.0626	6.4653282391954e-14	75159698	75159698	1.31741172655529e-13	75164009	75164009
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	75166548	94073863	6762	6497	-0.0023	1.31741172655529e-13	75164009	75164009	4.73201036609877e-14	94073863	94073863
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94084961	3	3	-0.8819	4.73201036609877e-14	94073863	94073863	1.29408683912079e-13	94084961	94084961
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94086315	173224400	22742	21956	-0.0056	1.29408683912079e-13	94084961	94084961	2.26257024251228e-288	173224400	173224400
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.7955	2.26257024251228e-288	173224400	173224400	2.11434697781336e-270	173228860	173228860
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	175860235	938	904	-0.002	2.11434697781336e-270	173228860	173228860	6.90982944811022e-10	175857109	175860235
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	0.9374	6.90982944811022e-10	175857109	175860235	8.23680086070885e-11	175863396	175863396
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	187330240	3336	3201	-0.0024	8.23680086070885e-11	175863396	175863396	2.43895065192531e-15	187330240	187330240
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	1.1083	2.43895065192531e-15	187330240	187330240	2.44975577769578e-15	187333619	187333619
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1188	-0.018	2.44975577769578e-15	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	829954	228	222	0.03	NA	NA	NA	2.04431217803982e-09	829954	829954
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-0.9962	2.04431217803982e-09	829954	829954	2.53450738313489e-11	873365	873365
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	68885350	18820	18108	-0.0048	2.53450738313489e-11	873365	873365	3.83827498446581e-30	68885350	68885350
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70343857	70345552	2	2	1.5763	3.83827498446581e-30	68885350	68885350	2.53017922068706e-30	70345552	70345552
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70405656	103534382	9770	9407	-9e-04	2.53017922068706e-30	70345552	70345552	1.53153987182173e-16	103534382	103534382
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	103548612	103560318	3	3	-0.9611	1.53153987182173e-16	103534382	103534382	1.34271757685255e-16	103560318	103560318
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	103565575	140533456	11399	10963	-0.0015	1.34271757685255e-16	103560318	103560318	3.82283708260672e-41	140533456	140533456
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	1.8247	3.82283708260672e-41	140533456	140533456	1.40184271776153e-39	140538666	140538666
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	155411053	5258	5061	0.003	1.40184271776153e-39	140538666	140538666	3.55279295972079e-16	155411053	155411053
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155416484	155421443	4	4	0.836	3.55279295972079e-16	155411053	155411053	9.87412541185805e-16	155421443	155427589
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180351118	8162	7869	0.0024	9.87412541185805e-16	155421443	155427589	1.47102953406842e-09	180348365	180351118
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180352261	180358977	4	4	0.6609	1.47102953406842e-09	180348365	180351118	7.9146240903699e-11	180358977	180362342
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	107	-0.0145	7.9146240903699e-11	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	-0.0201	NA	NA	NA	3.33726833547841e-30	198124	200350
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	14	0.4859	3.33726833547841e-30	198124	200350	4.26817952816582e-05	232366	240119
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	251128	6	6	0.2519	4.26817952816582e-05	232366	240119	0.00205732817675729	251128	292329
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	252939	29950805	10525	10153	-8e-04	0.00205732817675729	251128	292329	1.62570245812712e-10	29927310	29992946
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30040917	23	23	0.2794	1.62570245812712e-10	29927310	29992946	4.30361373981636e-08	30004636	30062908
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30046181	31382291	570	544	0.0152	4.30361373981636e-08	30004636	30062908	3.73703814938558e-07	31381060	31382291
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31385778	2	2	-0.79	3.73703814938558e-07	31381060	31382291	9.24886573036439e-08	31385778	31385778
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	0.5654	9.24886573036439e-08	31385778	31385778	6.90099158240556e-10	31390982	31425144
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	473	0.0337	6.90099158240556e-10	31390982	31425144	5.21809105243187e-226	32558677	32564884
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32563252	1	0	NA	5.21809105243187e-226	32558677	32564884	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32564884	32633691	16	13	-1.9299	NA	NA	NA	1.82385242179222e-32	32631315	32633691
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32709263	26	25	0.0911	1.82385242179222e-32	32631315	32633691	0.0240701619072744	32685188	32732764
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32711957	32742767	17	17	0.4342	0.0240701619072744	32685188	32732764	4.80558853982464e-18	32728285	32745693
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32745036	54035000	8252	7962	0.0041	4.80558853982464e-18	32728285	32745693	0	54035000	54035000
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.6457	0	54035000	54035000	0	54042734	54042734
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	66154458	2502	2422	-5e-04	0	54042734	54042734	1.50541783631108e-06	66153104	66154458
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66157656	66160998	3	3	0.5994	1.50541783631108e-06	66153104	66154458	3.68780552875961e-06	66160998	66168641
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66165935	66165935	1	0	NA	3.68780552875961e-06	66160998	66168641	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	66168641	72919733	2029	1944	0.0039	NA	NA	NA	5.28999730643354e-11	72917267	72919733
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-0.7804	5.28999730643354e-11	72917267	72919733	2.44616948942448e-10	72924440	72931542
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	79018959	1894	1807	-0.005	2.44616948942448e-10	72924440	72931542	1.89485187009502e-22	79008946	79024557
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.5478	1.89485187009502e-22	79008946	79024557	1.57888398435899e-21	79085247	79095415
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	81334248	728	698	-0.0131	1.57888398435899e-21	79085247	79095415	2.77397943945376e-16	81334248	81334248
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81341711	81348170	3	3	-0.9779	2.77397943945376e-16	81334248	81334248	5.25488713890507e-17	81348170	81348170
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81350502	95576956	3715	3571	-0.0092	5.25488713890507e-17	81348170	81348170	4.70752443161934e-18	95567077	95576956
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	95582337	95674205	10	10	0.5375	4.70752443161934e-18	95567077	95576956	7.10092909990724e-18	95674205	95682003
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	95682003	103841482	2306	2211	0.0018	7.10092909990724e-18	95674205	95682003	5.91307064080858e-24	103841482	103841482
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.9782	5.91307064080858e-24	103841482	103841482	6.87389400932271e-24	103868154	103868154
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	10076	-0.0028	6.87389400932271e-24	103868154	103868154	5.76397496119417e-22	134629897	134629897
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-0.9448	5.76397496119417e-22	134629897	134629897	5.8051864656748e-21	134635779	134635779
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	10231	-0.0088	5.8051864656748e-21	134635779	134635779	4.73048352317199e-34	165643653	165643653
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1763	4.73048352317199e-34	165643653	165643653	8.29974399961715e-37	165650610	165650610
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1735	-5e-04	8.29974399961715e-37	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	163711	12	12	0.6245	NA	NA	NA	1.12753120363583e-27	163711	176344
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	176344	34306214	12186	11753	-0.0013	1.12753120363583e-27	163711	176344	3.17847889440425e-08	34304884	34306214
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	34311774	34312556	2	2	-0.8629	3.17847889440425e-08	34304884	34306214	3.12460307348167e-08	34312556	34313898
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	34313898	38257171	1399	1337	-0.0076	3.12460307348167e-08	34312556	34313898	7.02676099143834e-16	38244071	38270942
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38258332	38372692	48	45	0.2427	7.02676099143834e-16	38244071	38270942	2.52956825394585e-14	38341239	38392155
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38375502	71450660	8021	7716	5e-04	2.52956825394585e-14	38341239	38392155	1.03329257673034e-11	71450660	71450660
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71454833	71454833	1	0	NA	1.03329257673034e-11	71450660	71450660	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71459402	71460656	2	2	-1.0412	NA	NA	NA	2.29830692920889e-12	71460656	71460656
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71462083	120092153	18202	17534	2e-04	2.29830692920889e-12	71460656	71460656	3.34736169918663e-28	120092153	120092153
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120093440	120098907	4	4	-1.0915	3.34736169918663e-28	120092153	120092153	1.29345001963681e-27	120098907	120098907
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120101979	133433384	6218	5975	-0.0011	1.29345001963681e-27	120098907	120098907	1.54677423208733e-14	133426996	133433384
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.5643	1.54677423208733e-14	133426996	133433384	6.82289072718755e-15	133448277	133453811
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141687978	3828	3677	-0.0036	6.82289072718755e-15	133448277	133453811	2.05129198583701e-11	141686875	141689547
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141689547	141709835	9	8	0.4963	2.05129198583701e-11	141686875	141689547	8.4631195888404e-19	141707826	141714168
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141711513	141711513	1	0	NA	8.4631195888404e-19	141707826	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	158821263	6754	6518	0.0015	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7156900	2392	2306	-0.0052	NA	NA	NA	1.33704053973030e-48	7156900	7156900
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	8	-1.0102	1.3370405397303e-48	7156900	7156900	9.7436048826370e-48	7824059	7824059
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	19890053	4135	3999	-0.0034	9.743604882637e-48	7824059	7824059	4.69876851154517e-117	19890053	19890053
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	19895398	20013229	22	22	-0.951	4.69876851154517e-117	19890053	19890053	2.07705903066191e-117	20013229	20013229
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	20016760	25119007	1600	1527	0.0046	2.07705903066191e-117	20013229	20013229	6.22136631972218e-106	25119007	25119007
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25120552	1	0	NA	6.22136631972218e-106	25119007	25119007	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	2.4549	NA	NA	NA	1.57817351351126e-109	25125700	25125700
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4709	-0.0053	1.57817351351126e-109	25125700	25125700	0	39350798	39350798
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	-5.2118	0	39350798	39350798	0	39505256	39505256
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	85422157	12105	11657	-0.0021	0	39505256	39505256	2.27553223653674e-27	85422157	85422157
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85423938	85431319	5	5	-0.9381	2.27553223653674e-27	85422157	85422157	1.68714968720605e-25	85431319	85431319
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85434122	115701209	9628	9310	-1e-04	1.68714968720605e-25	85431319	85431319	3.31530262380996e-25	115701209	115701209
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-1.4808	3.31530262380996e-25	115701209	115701209	1.42465746160911e-25	115711730	115711730
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	146264846	9693	9337	0.0029	1.42465746160911e-25	115711730	115711730	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	14276209	4843	4681	-0.0041	NA	NA	NA	3.7213789523961e-09	14276209	14276209
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	14278423	14281088	2	2	-0.8875	3.7213789523961e-09	14276209	14276209	1.89854463092287e-08	14281088	14281088
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	14283592	15802255	613	594	-0.0179	1.89854463092287e-08	14281088	14281088	9.2716192754583e-42	15802255	15802255
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.8885	9.2716192754583e-42	15802255	15802255	2.13802971039967e-42	15807123	15807123
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70926188	7612	7363	-0.0037	2.13802971039967e-42	15807123	15807123	7.10780049105262e-13	70926188	70926188
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.0576	7.10780049105262e-13	70926188	70926188	6.01595965416965e-13	70930528	70930528
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9572	-0.0052	6.01595965416965e-13	70930528	70930528	2.97904712197271e-09	100346872	100348045
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	0.9027	2.97904712197271e-09	100346872	100348045	5.3128902469113e-09	100350814	100354878
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	100353031	1	0	NA	5.3128902469113e-09	100350814	100354878	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100354878	133250165	12204	11747	-8e-04	NA	NA	NA	1.49140522333919e-11	133250165	133250165
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133251786	133254922	2	2	-1.0154	1.49140522333919e-11	133250165	133250165	1.15060629905601e-09	133254922	133254922
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133257756	140145683	2742	2648	0.0122	1.15060629905601e-09	133254922	133254922	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	2535102	956	920	-0.0034	NA	NA	NA	7.54365755016215e-08	2521265	2535102
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	2538414	2573842	11	11	0.3453	7.54365755016215e-08	2521265	2535102	4.98698023251546e-08	2573842	2593492
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	2578288	27038538	8762	8459	-0.007	4.98698023251546e-08	2573842	2593492	5.21988820788584e-61	27038538	27038538
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-2.2197	5.21988820788584e-61	27038538	27038538	7.07324388874435e-58	27041812	27041812
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14302	-0.0019	7.07324388874435e-58	27041812	27041812	1.07852703812888e-56	77917893	77917893
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.783	1.07852703812888e-56	77917893	77917893	1.37839867140823e-56	77928738	77928738
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	111545211	11574	11181	0.0014	1.37839867140823e-56	77928738	77928738	8.96750939468667e-09	111545211	111545211
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	111551295	111562050	2	2	-0.8884	8.96750939468667e-09	111545211	111545211	2.23892505254112e-09	111562050	111562050
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	111568228	114100979	816	793	0.0018	2.23892505254112e-09	111562050	111562050	7.03833030718106e-08	114100979	114100979
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	0.8181	7.03833030718106e-08	114100979	114100979	1.49117864842362e-07	114106460	114106460
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	114108041	1	0	NA	1.49117864842362e-07	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114109303	124328915	3939	3785	1e-04	NA	NA	NA	8.81844510779835e-14	124328915	124328915
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124337128	1	0	NA	8.81844510779835e-14	124328915	124328915	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337860	124340356	2	2	-1.0878	NA	NA	NA	3.09969612306050e-13	124340356	124340356
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	135285645	3876	3734	-0.0019	3.0996961230605e-13	124340356	124340356	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	20799632	8146	7833	0.0028	NA	NA	NA	5.86908623996818e-12	20797855	20799632
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20801973	20806094	3	3	-0.8645	5.86908623996818e-12	20797855	20799632	5.39886127943997e-13	20806094	20809631
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20809631	55114405	8755	8449	-0.002	5.39886127943997e-13	20806094	20809631	1.11597238198437e-73	55112618	55118214
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55118214	55209626	40	39	0.5561	1.11597238198437e-73	55112618	55118214	3.24475216670915e-74	55207305	55217189
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	60519556	2065	1993	-0.0072	3.24475216670915e-74	55207305	55217189	1.52034870737694e-15	60518025	60519556
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	60522072	60529232	5	5	0.7188	1.52034870737694e-15	60518025	60519556	1.10517800373836e-14	60529232	60530824
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	60530824	134450318	26290	25235	0.0014	1.10517800373836e-14	60529232	60530824	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11112600	4328	4166	0.0115	NA	NA	NA	2.29525335873828e-38	11112600	11112600
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11140421	8	8	0.9242	2.29525335873828e-38	11112600	11112600	3.63317372342055e-41	11140421	11140421
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11143592	1	0	NA	3.63317372342055e-41	11140421	11140421	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11147675	46992235	11146	10702	0.0018	NA	NA	NA	5.29377157176909e-10	46992235	46992235
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-0.9321	5.29377157176909e-10	46992235	46992235	7.85805727972567e-10	46996769	46996769
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	98517420	17071	16387	0.0036	7.85805727972567e-10	46996769	46996769	9.76567486473008e-31	98517420	98517420
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98519108	98532494	6	6	-0.9258	9.76567486473008e-31	98517420	98517420	1.26222201788568e-29	98532494	98532494
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98535730	132289090	12599	12131	0.0028	1.26222201788568e-29	98532494	98532494	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	18194544	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18348833	31428172	4883	4706	-0.0054	NA	NA	NA	5.52850219289506e-18	31428172	31428172
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31431833	31436314	2	2	-1.2618	5.52850219289506e-18	31428172	31428172	4.69938832262981e-19	31436314	31436314
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31441218	36604695	2077	1994	3e-04	4.69938832262981e-19	31436314	31436314	2.26378697233389e-11	36604695	36604695
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36606314	36608193	2	2	-0.9846	2.26378697233389e-11	36604695	36604695	5.07154715938407e-11	36608193	36608193
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36611461	56650373	7060	6777	-0.0056	5.07154715938407e-11	36608193	36608193	8.85512528669055e-17	56610886	56650373
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	0.4465	8.85512528669055e-17	56610886	56650373	2.04556219439359e-16	56681665	56686863
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	89659397	8254	7932	0.0037	2.04556219439359e-16	56681665	56686863	0	89659397	89659397
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-5.7326	0	89659397	89659397	0	89662326	89662326
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	113787620	9196	8832	-0.0034	0	89662326	89662326	5.5539604921321e-09	113787620	113787620
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113788788	113788788	1	0	NA	5.5539604921321e-09	113787620	113787620	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	0.8897	NA	NA	NA	8.11759384708922e-08	113792974	113794669
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	143	0.012	8.11759384708922e-08	113792974	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	21528132	1051	1010	0.0085	NA	NA	NA	4.434048729966e-85	21511994	21540156
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21529816	22061243	268	255	0.2732	4.434048729966e-85	21511994	21540156	1.51750238292956e-116	22051630	22071780
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22062453	76195295	19541	18811	-0.0014	1.51750238292956e-116	22051630	22071780	2.23876081102101e-11	76195295	76195295
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	76202172	76205095	2	2	-0.9957	2.23876081102101e-11	76195295	76195295	1.48521717569971e-10	76205095	76205095
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	76209370	105597555	10780	10375	9e-04	1.48521717569971e-10	76205095	76205095	7.47611656861058e-11	105592583	105618927
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105681007	14	13	-0.3957	7.47611656861058e-11	105592583	105618927	0.000730023922075166	105611671	105707746
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105703388	105787390	19	19	-0.0563	0.000730023922075166	105611671	105707746	2.45696021260269e-26	105787390	105787390
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.8925	2.45696021260269e-26	105787390	105787390	9.22772333856497e-18	105798116	105798116
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105848335	20	18	-0.0215	9.22772333856497e-18	105798116	105798116	1.61741014783193e-30	105848335	105848335
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105850033	105850033	1	0	NA	1.61741014783193e-30	105848335	105848335	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	1.0706	NA	NA	NA	1.87865944602199e-25	105881893	105897061
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106214372	122	116	0.0574	1.87865944602199e-25	105881893	105897061	5.35770083744133e-12	106209063	106219784
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106255190	19	17	-0.4185	5.35770083744133e-12	106209063	106219784	3.28621172124466e-13	106249962	106260876
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	35	0.0812	3.28621172124466e-13	106249962	106260876	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18882292	28	26	-0.0196	NA	NA	NA	4.00351873655034e-12	18874259	19117783
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18884436	19341502	41	38	0.2684	4.00351873655034e-12	18874259	19117783	1.78603783694891e-15	19231679	19356869
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19346028	95609756	29261	28257	-0.0014	1.78603783694891e-15	19231679	19356869	1.35484236117719e-33	95609756	95609756
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-0.9852	1.35484236117719e-33	95609756	95609756	7.85963984668134e-34	95632390	95632390
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	100298352	1986	1912	3e-04	7.85963984668134e-34	95632390	95632390	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	33628	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	37560	6161572	2354	2257	0.012	NA	NA	NA	2.38035669234003e-33	6161572	6161572
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6163381	6163381	1	0	NA	2.38035669234003e-33	6161572	6161572	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6165240	6172284	4	4	-1.2761	NA	NA	NA	1.32160229561642e-38	6172284	6172284
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6176127	32379126	8213	7914	0.0051	1.32160229561642e-38	6172284	6172284	4.05385343930941e-52	31854794	32481309
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	42	0.4642	4.05385343930941e-52	31854794	32481309	8.4321957031119e-54	33536526	33647856
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	57203733	4292	4127	-0.0015	8.4321957031119e-54	33536526	33647856	1.4971306627164e-48	57203733	57203733
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-2.0573	1.4971306627164e-48	57203733	57203733	1.78508464311999e-47	57206772	57206772
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3285	0.0024	1.78508464311999e-47	57206772	57206772	1.78635025632172e-07	68674071	68712507
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.3669	1.78635025632172e-07	68674071	68712507	3.28345249008402e-07	68747578	68851938
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2119	-0.0053	3.28345249008402e-07	68747578	68851938	2.15506398689406e-14	75093957	75093957
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	0.913	2.15506398689406e-14	75093957	75093957	8.42074987719424e-15	75100865	75100865
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	589	-0.0136	8.42074987719424e-15	75100865	75100865	0	76925748	76925748
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76938723	7	7	-3.9572	0	76925748	76925748	0	76938723	76938723
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76940218	88690571	4514	4334	-0.0022	0	76938723	76938723	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31451114	12036	11552	0.0096	NA	NA	NA	1.64846636572136e-15	31441419	31462463
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31457889	31503774	20	19	-0.3726	1.64846636572136e-15	31441419	31462463	1.99047996563539e-16	31492553	31893451
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1742	0.0071	1.99047996563539e-16	31492553	31893451	0	36673853	36673853
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-4.1094	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41017338	1811	1732	0.0281	0	36684619	36684619	1.78150119078884e-09	41017338	41017338
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41026062	41031191	2	2	-0.9129	1.78150119078884e-09	41017338	41017338	4.83818229027983e-09	41031191	41062669
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41508943	193	188	0.0417	4.83818229027983e-09	41031191	41062669	7.54264299750165e-07	41491006	41518222
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41512318	41561017	23	21	-0.2226	7.54264299750165e-07	41491006	41518222	1.01323563637519e-18	41555295	41564408
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41562786	41710400	49	48	-0.6714	1.01323563637519e-18	41555295	41564408	7.13332824111974e-132	41708551	42142363
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	68326225	9412	9066	0.0065	7.13332824111974e-132	41708551	42142363	1.04708366456850e-17	68326225	68326225
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68327352	68331629	3	3	-1.0018	1.0470836645685e-17	68326225	68326225	1.48233804213533e-16	68331629	68331629
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68335510	78653545	4264	4084	0.0052	1.48233804213533e-16	68331629	68331629	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	1890337	640	614	-0.0055	NA	NA	NA	2.64102027458756e-135	1890337	1890337
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1896337	1973621	21	21	-0.9715	2.64102027458756e-135	1890337	1890337	4.29640961958694e-122	1973621	1973621
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1975578	76116026	22303	21452	-0.0058	4.29640961958694e-122	1973621	1973621	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	59414645	21054	20286	0.0171	NA	NA	NA	4.25814069030948e-121	59412581	59414898
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59414898	59576207	82	80	0.5508	4.25814069030948e-121	59412581	59414898	9.34431519258338e-138	59574136	59581707
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59577300	59577300	1	0	NA	9.34431519258338e-138	59574136	59581707	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59581707	63788698	1922	1839	-0.001	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	573	-0.0117	NA	NA	NA	1.43273623861268e-218	1516966	1516966
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1531162	6	5	-3.4497	1.43273623861268e-218	1516966	1516966	1.56636076711967e-282	1531162	1531162
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	3767748	931	893	0.0146	1.56636076711967e-282	1531162	1531162	2.35612528355614e-08	3765522	3767748
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3771151	3772462	2	2	-0.8805	2.35612528355614e-08	3765522	3767748	1.61469806992302e-08	3772462	3772462
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3774394	52080395	16313	15709	0.0014	1.61469806992302e-08	3772462	3772462	5.33349227863506e-25	52080395	52080395
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.9254	5.33349227863506e-25	52080395	52080395	8.57174208832077e-23	52090393	52090393
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3593	0.0043	8.57174208832077e-23	52090393	52090393	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12932	8e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	20634871	2066	1971	0.0119	NA	NA	NA	9.36292935369544e-210	20627777	20636275
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20636275	20904936	151	146	0.5591	9.36292935369544e-210	20627777	20636275	1.00817913909963e-186	20903557	20912342
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20911250	22667608	766	732	0.0233	1.00817913909963e-186	20903557	20912342	3.72899662830042e-91	22667608	22679305
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.9521	3.72899662830042e-91	22667608	22679305	3.36194785224453e-111	22720195	22725305
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6289	0.0096	3.36194785224453e-111	22720195	22725305	2.56495406351666e-19	35472378	35472378
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.3246	2.56495406351666e-19	35472378	35472378	3.11773703269749e-16	35476942	35476942
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1138	0.0223	3.11773703269749e-16	35476942	35476942	8.47787959536653e-09	37621766	37621766
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	0.9923	8.47787959536653e-09	37621766	37621766	2.38552006019621e-09	37626069	37626069
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49567768	5812	5572	0.0118	2.38552006019621e-09	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	4893	4	4	0.0598	NA	NA	NA	0.00175767449527738	1529	94062
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	4926	104732	9	8	0.6649	0.00175767449527738	1529	94062	1.74093253648954e-09	103089	108902
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	127779	18	18	0.0743	1.74093253648954e-09	103089	108902	4.91296274488223e-25	127779	127779
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	130528	3	3	1.2549	4.91296274488223e-25	127779	127779	3.76786117089581e-24	130528	130528
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	2303192	1367	1324	0.0189	3.76786117089581e-24	130528	130528	2.89427501986059e-193	2303192	2303192
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-3.4833	2.89427501986059e-193	2303192	2303192	1.22569477780403e-211	2304398	2304398
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2672401	362	343	0.0139	1.22569477780403e-211	2304398	2304398	2.47345978083080e-10	2669225	2692523
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2552	2.4734597808308e-10	2669225	2692523	3.09239939271161e-188	2708291	2708291
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22107	0.9508	3.09239939271161e-188	2708291	2708291	1.81193550596430e-20	76998610	76998610
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.2173	1.8119355059643e-20	76998610	76998610	3.68069374996410e-15	77010018	77010018
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154050185	22064	21263	0.9528	3.6806937499641e-15	77010018	77010018	1.65227927087114e-07	154044828	154054530
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154051619	154078819	7	7	1.4425	1.65227927087114e-07	154044828	154054530	2.89518222255349e-10	154070953	154086636
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	85	0.9494	2.89518222255349e-10	154070953	154086636	1.43261686500447e-84	154442377	154442377
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154447839	2	2	-1.6118	1.43261686500447e-84	154442377	154442377	7.79839820710405e-122	154447839	154447839
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154449960	154450309	2	0	NA	7.79839820710405e-122	154447839	154447839	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	0.9319	NA	NA	NA	2.29039097508285e-158	154582414	154582414
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	-0.0047	2.29039097508285e-158	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2721922	10	10	-5.1499	NA	NA	NA	0.00231789334615121	2718806	2756034
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2722729	2784560	25	25	-3.7906	0.00231789334615121	2718806	2756034	3.9070543838347e-06	2773629	2799341
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	3223585	88	82	-4.8852	3.9070543838347e-06	2773629	2799341	9.7142043154431e-48	3223585	3777766
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3772482	2	0	NA	9.7142043154431e-48	3223585	3777766	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3773948	5593746	15	15	-1.0161	NA	NA	NA	4.48420747372846e-22	5422507	6652845
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	164	-4.3129	4.48420747372846e-22	5422507	6652845	2.73578245969842e-07	7022973	7211779
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	113	-3.3495	2.73578245969842e-07	7022973	7211779	0.000577233227832212	7352452	7477381
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7608619	20	19	-4.9068	0.000577233227832212	7352452	7477381	1.15442059819003e-05	7603458	7619476
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7653082	18	18	-3.0875	1.15442059819003e-05	7603458	7619476	3.37313142175237e-09	7643041	7656915
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	44	-4.6908	3.37313142175237e-09	7643041	7656915	2.31906905526165e-15	7719658	7729757
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7788596	21	17	-2.8684	2.31906905526165e-15	7719658	7729757	2.18694332351022e-08	7782532	7807668
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7789562	10515697	427	404	-4.4444	2.18694332351022e-08	7782532	7807668	7.92134563354696e-42	10513747	10515697
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.3795	7.92134563354696e-42	10513747	10515697	1.82108296499709e-09	10645500	11673476
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	70	-3.3543	1.82108296499709e-09	10645500	11673476	0.0119919999859594	12580737	12730281
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12852769	28	27	-4.5035	0.0119919999859594	12580737	12730281	1.40660218031183e-06	12809152	12872417
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12855363	13129843	108	100	-3.086	1.40660218031183e-06	12809152	12872417	1.65739284550856e-05	13062151	13147329
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13272362	48	44	-4.1085	1.65739284550856e-05	13062151	13147329	0.000198780068470606	13202163	13348970
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13279098	14358464	367	345	-4.7146	0.000198780068470606	13202163	13348970	5.50558183918725e-09	14325320	14422395
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	80	-4.0059	5.50558183918725e-09	14325320	14422395	1.15467006642378e-07	14494397	14546195
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14644293	36	34	-2.3432	1.15467006642378e-07	14494397	14546195	0.00256339931958733	14554415	14644293
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14700040	13	13	-4.0514	0.00256339931958733	14554415	14644293	5.39938842140542e-10	14700040	14702545
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14731122	17	16	-5.3689	5.39938842140542e-10	14700040	14702545	4.24059866003362e-05	14722593	14765141
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14734647	14823549	18	16	-4.268	4.24059866003362e-05	14722593	14765141	0.00270932765964216	14779054	14849277
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14836085	14883615	8	8	-5.3921	0.00270932765964216	14779054	14849277	0.00189167905931178	14875973	14952770
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15225775	93	88	-4.0947	0.00189167905931178	14875973	14952770	3.96205846416501e-07	15222741	15227049
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15227049	15241527	4	4	-1.4095	3.96205846416501e-07	15222741	15227049	9.70469589698595e-08	15240367	15242592
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15299931	41	35	-4.182	9.70469589698595e-08	15240367	15242592	2.70879069830794e-06	15282186	15310611
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15408015	69	67	-5.0365	2.70879069830794e-06	15282186	15310611	3.94682994777993e-09	15400529	15432050
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15690301	108	104	-4.0536	3.94682994777993e-09	15400529	15432050	0.0299979060253487	15472479	15727116
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15695261	15843146	26	24	-4.787	0.0299979060253487	15472479	15727116	0.00534394690077818	15765251	15867364
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15848986	15911389	9	9	-5.6955	0.00534394690077818	15765251	15867364	1.93275413836569e-08	15898644	15920478
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15915466	15969469	17	16	-4.1229	1.93275413836569e-08	15898644	15920478	5.89965365738607e-08	15967120	15969469
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15970911	15975479	3	3	-1.8611	5.89965365738607e-08	15967120	15969469	1.59487328228144e-05	15975479	15979526
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15977755	16033774	23	23	-4.3374	1.59487328228144e-05	15975479	15979526	2.37661796516026e-09	16027648	16035717
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16035717	16042966	7	6	-1.7111	2.37661796516026e-09	16027648	16035717	1.81353582520673e-14	16042966	16043782
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	19610243	490	464	-4.6045	1.81353582520673e-14	16042966	16043782	9.2847174436149e-10	19608039	19610243
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.5009	9.2847174436149e-10	19608039	19610243	2.75367489941902e-08	19613864	19614809
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22139807	559	532	-4.584	2.75367489941902e-08	19613864	19614809	3.79533848832605e-14	22056953	22157319
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-1.9252	3.79533848832605e-14	22056953	22157319	8.41194200013569e-29	22176501	22177335
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22178964	1	0	NA	8.41194200013569e-29	22176501	22177335	NA	NA	NA
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22767553	41	39	-5.0358	NA	NA	NA	0.00161056978582507	22263267	22850980
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22768795	25737663	53	47	-4.4413	0.00161056978582507	22263267	22850980	3.42647949785326e-41	25737663	26872527
MSK_252152912729_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	80	-1.4061	3.42647949785326e-41	25737663	26872527	NA	NA	NA
