Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	2188149	426	420	0.0351	NA	NA	NA	2.68644765457158e-08	2176630	2193598
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2192552	2206276	8	8	-0.7059	2.68644765457158e-08	2176630	2193598	9.45978992801147e-09	2199693	2210121
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2208556	16236840	5152	5078	0.0301	9.45978992801147e-09	2199693	2210121	4.77760490225572e-08	16230368	16242789
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16239639	16260159	7	7	0.7867	4.77760490225572e-08	16230368	16242789	1.48062676576477e-08	16255838	16265269
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16262797	72537426	22301	21996	0.011	1.48062676576477e-08	16255838	16265269	0	72537426	72537426
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.4185	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	0	72579311	72579311	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	150823073	17556	17320	-0.0034	NA	NA	NA	6.33547674136571e-61	150823073	150823073
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	1.7109	6.33547674136571e-61	150823073	150823073	3.16461808382044e-69	150851439	150851439
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	77	0.0212	3.16461808382044e-69	150851439	150851439	2.17400998905757e-101	151026228	151026228
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-3.3925	2.17400998905757e-101	151026228	151026228	6.66219144463907e-103	151036435	151036435
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2634	0.0187	6.66219144463907e-103	151036435	151036435	5.5127740577563e-12	157133150	157133150
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.6579	5.5127740577563e-12	157133150	157133150	2.30377578934123e-12	157136342	157136342
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	173060997	6293	6209	-0.006	2.30377578934123e-12	157136342	157136342	7.4585960630455e-192	173060997	173060997
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	3	-5.1986	7.4585960630455e-192	173060997	173060997	2.28082459112561e-186	173067337	173067337
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	194978218	7000	6918	5e-04	2.28082459112561e-186	173067337	173067337	1.25189367690405e-10	194971624	195011344
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195095156	11	11	-0.6663	1.25189367690405e-10	194971624	195011344	1.56799855688990e-10	195065867	195103883
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195097118	247186514	19603	19331	0.0014	1.5679985568899e-10	195065867	195103883	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34551222	11523	11366	0.0045	NA	NA	NA	2.88237199547827e-12	34539740	34556434
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34591681	18	18	0.5599	2.88237199547827e-12	34539740	34556434	1.19519371597637e-12	34582272	34602813
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	178545984	44201	43619	-0.0045	1.19519371597637e-12	34582272	34602813	9.66591378404497e-09	178544895	178545984
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178552260	178555242	3	3	-1.1754	9.66591378404497e-09	178544895	178545984	8.3030968513416e-09	178555242	178556781
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178556781	242689978	22082	21787	1e-04	8.3030968513416e-09	178555242	178556781	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	89475107	30641	30215	6e-04	NA	NA	NA	4.93561860426387e-30	89473678	89475107
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89502757	14	14	-0.9689	4.93561860426387e-30	89473678	89475107	1.40533503823598e-28	89502757	89504141
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89504141	99891210	1528	1516	-1e-04	1.40533503823598e-28	89502757	89504141	3.35873037017788e-138	99891210	99891210
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-5.5753	3.35873037017788e-138	99891210	99891210	4.82315592940035e-144	99897201	99897201
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	163992903	21303	21007	-0.0036	4.82315592940035e-144	99897201	99897201	2.76767433768672e-152	163992903	164009321
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	-2.8919	2.76767433768672e-152	163992903	164009321	0.0199895249378092	164001657	164042397
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-4.622	0.0199895249378092	164001657	164042397	0	164107951	164107951
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9991	-0.0099	0	164107951	164107951	5.21441486769199e-314	194354505	194354505
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.6933	5.21441486769199e-314	194354505	194354505	9.98216404115531e-284	194366950	194366950
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	986	-0.0048	9.9821640411553e-284	194366950	194366950	2.62555343138036e-40	196820428	196904349
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196943380	24	24	-0.9012	2.62555343138036e-40	196820428	196904349	5.13943323907761e-41	196940125	196945209
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196945209	199329592	960	941	-0.0193	5.13943323907761e-41	196940125	196945209	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3337	0.0344	NA	NA	NA	4.08549942682097e-187	9815760	9815760
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.4578	4.08549942682097e-187	9815760	9815760	1.06597953060853e-189	9842644	9842644
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	191153613	51764	51053	-0.0083	1.06597953060853e-189	9842644	9842644	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	150181399	43854	43292	-0.0032	NA	NA	NA	4.69586407281271e-14	150171154	150181399
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.9531	4.69586407281271e-14	150171154	150181399	1.00009444295612e-15	150202601	150204134
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	155405839	1622	1605	0.0157	1.00009444295612e-15	150202601	150204134	8.01540313910711e-237	155405839	155405839
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	-4.3713	8.01540313910711e-237	155405839	155405839	1.83173984861845e-219	155421443	155421443
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180444863	8195	8098	0.0101	1.83173984861845e-219	155421443	155421443	2.71940200709357e-07	180432796	180451252
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180447292	180459673	5	5	-0.8251	2.71940200709357e-07	180432796	180451252	9.73981641570877e-06	180451904	180468139
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180465452	180644810	78	76	5e-04	9.73981641570877e-06	180451904	180468139	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	200350	39	39	0.0193	NA	NA	NA	6.3529360133222e-07	181361	228968
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	322557	59	59	-0.3341	6.3529360133222e-07	181361	228968	5.19381372352163e-15	302006	335212
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	323898	18371831	6439	6364	0.0029	5.19381372352163e-15	302006	335212	1.55078159377223e-06	18366499	18371831
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18373481	18378787	3	3	1.0091	1.55078159377223e-06	18366499	18371831	1.02825923710535e-06	18378787	18382523
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18380299	31889575	4846	4785	0.002	1.02825923710535e-06	18378787	18382523	2.31971909901475e-14	31887126	31889575
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31893557	31902818	6	6	-1.0175	2.31971909901475e-14	31887126	31889575	1.08468936843369e-13	31902818	31905636
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31905636	77490500	14749	14545	0.0034	1.08468936843369e-13	31902818	31905636	4.35052678198373e-95	77490500	77490500
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-3.7091	4.35052678198373e-95	77490500	77490500	2.08859227443867e-97	77509983	77509983
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	165643653	28164	27781	-0.0083	2.08859227443867e-97	77509983	77509983	2.96658339476172e-183	165643653	165643653
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-5.0736	2.96658339476172e-183	165643653	165643653	3.75030231451052e-177	165649379	165649379
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	170320194	1639	1616	0.0025	3.75030231451052e-177	165649379	165649379	1.11209787176725e-06	170316506	170320194
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	170324738	170333869	3	3	1.0203	1.11209787176725e-06	170316506	170320194	2.92262590391463e-06	170333869	170340138
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	170336511	170753106	163	161	0.0043	2.92262590391463e-06	170333869	170340138	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	125831554	42438	41917	1e-04	NA	NA	NA	1.09442953831835e-133	125831554	125831554
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.3698	1.09442953831835e-133	125831554	125831554	7.82625400980526e-126	125837524	125837524
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3599	0.0028	7.82625400980526e-126	125837524	125837524	0	133433384	133433384
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-4.4028	0	133433384	133433384	0	133448277	133448277
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3790	-0.0018	0	133448277	133448277	2.23913440859608e-18	141687978	141690753
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141720303	11	11	0.8492	2.23913440859608e-18	141687978	141690753	6.73786260900892e-17	141714168	141721894
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	158821263	6751	6673	0.0027	6.73786260900892e-17	141714168	141721894	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	0.0227	NA	NA	NA	2.58196760177991e-39	581533	581533
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.1653	2.58196760177991e-39	581533	581533	1.68461677122755e-45	588865	588865
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	39350798	12953	12767	-0.0027	1.68461677122755e-45	588865	588865	0	39350798	39350798
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	-4.2329	0	39350798	39350798	0	39505256	39505256
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	436	0.0242	0	39505256	39505256	3.5548767170871e-139	40892587	40892587
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-5.2906	3.5548767170871e-139	40892587	40892587	5.53391069970963e-131	40897469	40897469
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30597	-1e-04	5.53391069970963e-131	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5393	-0.0024	NA	NA	NA	3.23347778604060e-16	15802255	15802255
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.8697	3.2334777860406e-16	15802255	15802255	5.4862314291713e-16	15807123	15807123
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2350	-0.0086	5.4862314291713e-16	15807123	15807123	2.71275574296202e-14	22477358	22477358
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.769	2.71275574296202e-14	22477358	22477358	5.62206923206476e-14	22492603	22492603
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5151	-0.0012	5.62206923206476e-14	22492603	22492603	8.1436428828414e-41	70926188	70926188
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.9836	8.1436428828414e-41	70926188	70926188	4.30820093908991e-40	70930528	70930528
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	24548	-1e-04	4.30820093908991e-40	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9605	-0.0071	NA	NA	NA	2.73092673113585e-08	27036630	27038538
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.3623	2.73092673113585e-08	27036630	27038538	4.27804054794975e-08	27041812	27043861
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	53683740	6571	6484	-0.0107	4.27804054794975e-08	27041812	27043861	5.12118700429412e-25	53683740	53683740
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53686515	53687880	2	2	-2.3728	5.12118700429412e-25	53683740	53683740	5.10079595556097e-25	53687880	53687880
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53689554	135285645	28504	28107	8e-04	5.10079595556097e-25	53687880	53687880	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5738494	2137	2113	0.0147	NA	NA	NA	3.18570961059793e-11	5732077	5738494
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5765438	16	15	-0.6035	3.18570961059793e-11	5732077	5738494	8.07463741984978e-14	5765438	5769776
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	6003693	101	100	-0.0322	8.07463741984978e-14	5765438	5769776	1.33997785230502e-13	6003693	6003693
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6005573	6010275	4	4	-1.089	1.33997785230502e-13	6003693	6003693	1.01730433580466e-10	6010275	6011839
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6011839	7758275	757	748	0.0161	1.01730433580466e-10	6010275	6011839	9.15933003222254e-17	7757329	7762277
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7762277	7797993	10	10	-0.8561	9.15933003222254e-17	7757329	7762277	1.29734956786213e-16	7783492	7803570
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7800021	25561757	6405	6318	0.0011	1.29734956786213e-16	7783492	7803570	5.08962897075069e-14	25556811	25567254
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25565913	25582814	8	8	-0.8826	5.08962897075069e-14	25556811	25567254	1.09767449447445e-13	25577345	25591472
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25591472	55118214	7467	7370	0.0024	1.09767449447445e-13	25577345	25591472	1.63705134640062e-31	55097806	55124730
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	0.6035	1.63705134640062e-31	55097806	55124730	2.17413435716652e-30	55203706	55221692
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	93000699	13688	13511	0.0096	2.17413435716652e-30	55203706	55221692	5.70157242866097e-08	93000699	93000699
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93003167	93005517	2	2	-1.3675	5.70157242866097e-08	93000699	93000699	3.67593822112623e-08	93005517	93005517
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93008346	134450318	14670	14486	0.0038	3.67593822112623e-08	93005517	93005517	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3698	0.0177	NA	NA	NA	4.47135886185443e-222	9523923	9523923
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-4.3527	4.47135886185443e-222	9523923	9523923	1.16536240042051e-47	9554149	9554149
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	11	-1.0555	1.16536240042051e-47	9554149	9554149	1.48861697631525e-24	9607363	9626623
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11116883	571	562	-0.0187	1.48861697631525e-24	9607363	9626623	5.04244804700486e-38	11116883	11116883
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.5832	5.04244804700486e-38	11116883	11116883	4.0992231193808e-41	11140421	11140421
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31079618	6814	6727	-0.0078	4.0992231193808e-41	11140421	11140421	1.36565317643418e-10	31058854	31132716
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31081498	31248212	26	26	-0.4367	1.36565317643418e-10	31058854	31132716	1.27212421288421e-10	31237505	31257959
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31249495	46992235	4307	4254	-0.0113	1.27212421288421e-10	31237505	31257959	8.6904570314104e-13	46992235	46992235
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-1.6882	8.6904570314104e-13	46992235	46992235	3.83330727620735e-12	46996769	46996769
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	132289090	29676	29281	0.0053	3.83330727620735e-12	46996769	46996769	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	12059	-0.007	NA	NA	NA	5.64649178050032e-13	49964838	49964838
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.7062	5.64649178050032e-13	49964838	49964838	7.18489508802997e-12	49971732	49971732
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56658479	1806	1782	-0.0039	7.18489508802997e-12	49971732	49971732	3.16055043066837e-11	56646284	56662112
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56660235	56685341	13	13	0.6461	3.16055043066837e-11	56646284	56662112	1.34435735468453e-12	56680346	56691355
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	68142120	2694	2661	-0.0105	1.34435735468453e-12	56680346	56691355	3.20137054370962e-12	68136198	68142120
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	9	-0.7862	3.20137054370962e-12	68136198	68142120	6.64853561901239e-12	68163523	68169957
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	71375082	919	904	-2e-04	6.64853561901239e-12	68163523	68169957	9.46474601000658e-78	71375082	71375082
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.1899	9.46474601000658e-78	71375082	71375082	6.3463490213395e-83	71377671	71377671
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13801	-0.005	6.3463490213395e-83	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	106214372	31831	31440	5e-04	NA	NA	NA	2.15613922708145e-09	106205637	106216726
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	18	-0.4949	2.15613922708145e-09	106205637	106216726	2.49176891051968e-12	106252126	106256498
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	35	0.136	2.49176891051968e-12	106252126	106256498	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2351	NA	NA	NA	3.41260591089322e-18	18427151	19421704
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	99632987	31043	30588	-0.0014	3.41260591089322e-18	18427151	19421704	3.76336586142123e-20	99632987	99632987
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.5618	3.76336586142123e-20	99632987	99632987	7.06017006912708e-10	99635701	99636724
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	270	0.0195	7.06017006912708e-10	99635701	99636724	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5385	0.0136	NA	NA	NA	1.09611272951636e-08	14674185	14956177
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.5321	1.09611272951636e-08	14674185	14956177	2.56756691709218e-08	15028108	15042407
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	57203733	9427	9292	0.0064	2.56756691709218e-08	15028108	15042407	1.75491658232312e-86	57203733	57203733
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-4.4166	1.75491658232312e-86	57203733	57203733	6.88861526819651e-90	57206772	57206772
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5553	0.0035	6.88861526819651e-90	57206772	57206772	2.50426598470952e-55	75093957	75093957
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-3.4745	2.50426598470952e-55	75093957	75093957	1.14868210603244e-60	75100865	75100865
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	596	-0.0077	1.14868210603244e-60	75100865	75100865	1.55589886159396e-07	76919570	76929598
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	0.6619	1.55589886159396e-07	76919570	76929598	6.30704151348717e-06	76938723	76948299
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4462	0.011	6.30704151348717e-06	76938723	76948299	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	409	0.0351	NA	NA	NA	1.03215092624968e-11	1026339	1027736
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1030766	4	4	1.2535	1.03215092624968e-11	1026339	1027736	7.81388337469751e-13	1030715	1031233
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	32828797	12002	11844	0.013	7.81388337469751e-13	1030715	1031233	2.65157352568346e-122	32828797	32828797
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-5.2603	2.65157352568346e-122	32828797	32828797	1.49219223079436e-130	32832642	32832642
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	34442393	480	474	0.0095	1.49219223079436e-130	32832642	32832642	3.01847570203502e-06	34440834	34442393
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34445816	34446608	2	2	-1.1721	3.01847570203502e-06	34440834	34442393	8.6944585073778e-06	34446608	34451067
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34451067	36673853	966	941	0.0044	8.6944585073778e-06	34446608	34451067	4.58567436305804e-20	36672710	36673853
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.2429	4.58567436305804e-20	36672710	36673853	1.64737313266158e-19	36684619	36686013
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15538	0.0126	1.64737313266158e-19	36684619	36686013	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	16006	-0.0054	NA	NA	NA	5.57376392535755e-19	53092949	53092949
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-2.03	5.57376392535755e-19	53092949	53092949	6.50838466852079e-18	53099601	53099601
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6659	-0.0113	6.50838466852079e-18	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3766469	1608	1585	0.0338	NA	NA	NA	1.26984274587160e-06	3761517	3766469
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3768226	3774787	5	5	-0.8043	1.2698427458716e-06	3761517	3766469	6.41466855813066e-07	3774787	3780269
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3776124	3776124	1	0	NA	6.41466855813066e-07	3774787	3780269	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3777903	21533555	7921	7817	0.0305	NA	NA	NA	1.55901781633321e-156	21518786	21544189
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21537835	22777315	305	301	0.5271	1.55901781633321e-156	21518786	21544189	2.16544699837572e-172	22748694	22812447
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22780632	63788698	13219	13059	0.0176	2.16544699837572e-172	22748694	22812447	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	575	-0.0104	NA	NA	NA	2.80248435369144e-53	1506379	1515948
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-1.7774	2.80248435369144e-53	1506379	1515948	3.06121785397594e-65	1525300	1531162
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20689	0.0072	3.06121785397594e-65	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13274	-8e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	35472378	9552	9427	0.0208	NA	NA	NA	1.15323595477409e-26	35472378	35472378
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.4786	1.15323595477409e-26	35472378	35472378	3.29218230733321e-28	35476942	35476942
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1171	0.0456	3.29218230733321e-28	35476942	35476942	1.43135262135869e-09	37621766	37621766
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	1.539	1.43135262135869e-09	37621766	37621766	4.36227967412605e-09	37626069	37626069
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5731	0.0178	4.36227967412605e-09	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	775	0.0061	NA	NA	NA	2.30069395167647e-09	1427338	1431240
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.0331	2.30069395167647e-09	1427338	1431240	3.0616932146292e-09	1432891	1434970
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	993	4e-04	3.0616932146292e-09	1432891	1434970	0	2708113	2711273
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	88039167	25246	24896	0.9834	0	2708113	2711273	1.95678010893569e-14	88035247	88045012
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	88045012	88062186	7	7	-0.0401	1.95678010893569e-14	88035247	88045012	1.89325902862305e-14	88058497	88065425
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	88065425	154442377	19849	19615	0.988	1.89325902862305e-14	88058497	88065425	2.26033767209637e-54	154442377	154442377
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-1.9948	2.26033767209637e-54	154442377	154442377	1.81274691355791e-51	154450309	154450309
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	1.0223	1.81274691355791e-51	154450309	154450309	4.02469476737257e-68	154582414	154586690
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	200	-0.0231	4.02469476737257e-68	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	122	-4.129	NA	NA	NA	7.91265303511854e-32	3223585	3773948
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.9294	7.91265303511854e-32	3223585	3773948	9.26180155645244e-17	5422507	6652845
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	171	-3.6948	9.26180155645244e-17	5422507	6652845	1.37325199563174e-06	7016002	7210986
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	120	-2.8454	1.37325199563174e-06	7016002	7210986	0.000151123944302556	7331655	7612732
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7723783	82	80	-3.7174	0.000151123944302556	7331655	7612732	1.13678593762709e-05	7711759	7729757
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	18	-2.2451	1.13678593762709e-05	7711759	7729757	5.33363263875099e-05	7774773	7821554
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	37	-3.6182	5.33363263875099e-05	7774773	7821554	0.000303018259327099	7870400	7905286
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.8537	0.000303018259327099	7870400	7905286	7.40463736930376e-08	7914104	7919636
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8277707	83	80	-4.0846	7.40463736930376e-08	7914104	7919636	0.000197324455465400	8199414	8414160
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8280065	8681965	110	108	-3.4337	0.0001973244554654	8199414	8414160	7.11169740543064e-05	8547778	8769077
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8683710	10513747	196	192	-3.998	7.11169740543064e-05	8547778	8769077	2.30519911225721e-35	10512616	10515697
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.5607	2.30519911225721e-35	10512616	10515697	2.49625584005646e-11	10631941	11660512
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12536761	16	15	-3.6311	2.49625584005646e-11	10631941	11660512	0.00349754958004019	12511461	12563030
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12625208	43	42	-2.131	0.00349754958004019	12511461	12563030	2.10699644226830e-05	12604268	12679146
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12627138	12926941	69	65	-3.3821	2.1069964422683e-05	12604268	12679146	0.000198671526525742	12876008	12981244
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13104920	70	70	-2.3921	0.000198671526525742	12876008	12981244	0.37267884964465	12942170	13111594
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	9	-1.4352	0.37267884964465	12942170	13111594	4.44461648581604e-14	13128515	13133803
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13649497	209	206	-3.926	4.44461648581604e-14	13128515	13133803	0.000102755302676907	13584982	13649497
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13663517	13716000	11	11	-2.6062	0.000102755302676907	13584982	13649497	7.21589398394198e-07	13716000	13749720
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	14338189	186	184	-4.1139	7.21589398394198e-07	13716000	13749720	6.41394186613888e-07	14262916	14391767
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14339170	14508021	99	98	-3.4202	6.41394186613888e-07	14262916	14391767	8.59323776299532e-10	14500820	14530328
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	26	-1.6741	8.59323776299532e-10	14500820	14530328	1.04231374027870e-17	14563486	14587291
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	413	-3.7857	1.0423137402787e-17	14563486	14587291	0.00093505404347929	15566377	16025800
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16172539	100	98	-3.2358	0.00093505404347929	15566377	16025800	9.40176489008972e-10	16098683	16215750
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16173830	22139807	1000	986	-3.9828	9.40176489008972e-10	16098683	16215750	1.74301528932873e-09	22055660	22157319
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.6805	1.74301528932873e-09	22055660	22157319	0.000337570125162377	22171771	22177335
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-3.3567	0.000337570125162377	22171771	22177335	0.0116933191294959	22181855	22214320
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22836305	53	52	-4.4728	0.0116933191294959	22181855	22214320	0.0010561506297233	22774861	22878671
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22843728	25737663	37	37	-3.7926	0.0010561506297233	22774861	22878671	4.06900182046807e-48	23283689	25737663
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26952278	33	31	-1.0785	4.06900182046807e-48	23283689	25737663	0.000109552531258627	26945084	27007874
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26957814	27039222	19	18	-2.6337	0.000109552531258627	26945084	27007874	8.28709187956915e-05	27003308	27039222
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.6023	8.28709187956915e-05	27003308	27039222	4.00327267371975e-08	27137064	27163598
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-3.2957	4.00327267371975e-08	27137064	27163598	6.89115220907771e-08	27172283	27176933
MSK_252152912777_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.3555	6.89115220907771e-08	27172283	27176933	NA	NA	NA
