Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	749625	4	4	0.7228	NA	NA	NA	0.00328470467573039	736471	770859
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	750051	2226783	438	430	-0.0403	0.00328470467573039	736471	770859	0.0171896604981779	2195514	2226783
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2229298	2240503	4	4	0.6297	0.0171896604981779	2195514	2226783	1.58679573131151e-06	2240503	2243512
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2243512	2263680	9	8	1.6207	1.58679573131151e-06	2240503	2243512	7.75977968034152e-38	2263680	2263680
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2265120	5956360	1171	1153	0.0058	7.75977968034152e-38	2263680	2263680	8.60724313858107e-10	5953653	5956360
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	5958702	5969894	5	5	1.0618	8.60724313858107e-10	5953653	5956360	3.05996003900062e-09	5969894	5973573
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	5971608	16704522	4150	4082	-0.0063	3.05996003900062e-09	5969894	5973573	3.78021993984931e-20	16698906	16713074
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	16961001	13	12	-1.0087	3.78021993984931e-20	16698906	16713074	2.479799078674e-20	16926444	16963812
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16963812	72536231	22099	21746	0.0019	2.479799078674e-20	16926444	16963812	2.80600943350649e-20	72533856	72537426
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72579311	15	15	0.9048	2.80600943350649e-20	72533856	72537426	8.69569610980469e-21	72574479	72596993
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	11539	0.0037	8.69569610980469e-21	72574479	72596993	8.49571731609667e-28	109987341	109987341
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-2.8356	8.49571731609667e-28	109987341	109987341	5.22178498557573e-28	109989998	109989998
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	150839754	5870	5779	-0.0092	5.22178498557573e-28	109989998	109989998	2.39998566426310e-57	150839754	150839754
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-2.8576	2.3999856642631e-57	150839754	150839754	1.40003121405227e-57	150846148	150846148
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	1.40003121405227e-57	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	157133150	2763	2720	0.0178	NA	NA	NA	4.34078033326368e-33	157133150	157133150
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.0645	4.34078033326368e-33	157133150	157133150	6.07232376303192e-34	157136342	157136342
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	173060997	6293	6205	-0.0016	6.07232376303192e-34	157136342	157136342	1.68033725434247e-123	173060997	173060997
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173063537	173067337	3	3	-4.7547	1.68033725434247e-123	173060997	173060997	2.03067399378834e-115	173067337	173067337
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	173068576	185979586	5029	4948	-0.0012	2.03067399378834e-115	173067337	173067337	2.01485015402626e-10	185979586	185979586
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.791	2.01485015402626e-10	185979586	185979586	1.62934328860335e-10	185988138	185988138
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1943	0.0195	1.62934328860335e-10	185988138	185988138	2.43014573813424e-212	194978218	194978218
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-3.7728	2.43014573813424e-212	194978218	194978218	3.84438083186744e-220	195065867	195065867
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200592050	2155	2123	-0.0068	3.84438083186744e-220	195065867	195065867	7.23292509409822e-07	200567550	200620756
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200594055	200676505	32	31	-0.3768	7.23292509409822e-07	200567550	200620756	1.7556217781073e-07	200649025	200803726
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200678532	200678532	1	0	NA	1.7556217781073e-07	200649025	200803726	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200679934	229989433	10777	10594	0.0063	NA	NA	NA	1.06455453876773e-26	229988285	229989433
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229991008	230015230	13	12	1.1292	1.06455453876773e-26	229988285	229989433	1.60508715667810e-26	230015230	230016373
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	230016373	239894109	3795	3743	0.0105	1.6050871566781e-26	230015230	230016373	1.22083368058614e-10	239888696	239898412
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	239896986	239908024	7	7	0.9526	1.22083368058614e-10	239888696	239898412	5.46684080846468e-11	239906833	239913076
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	239910237	244909016	1979	1944	-0.0062	5.46684080846468e-11	239906833	239913076	8.43259082883682e-10	244899897	244915107
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244912161	244930655	10	10	0.7528	8.43259082883682e-10	244899897	244915107	8.77659750738191e-09	244927770	244939759
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244935586	247186514	836	824	0.0062	8.77659750738191e-09	244927770	244939759	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	186548	54	52	0.0428	NA	NA	NA	3.54174496146669e-11	179761	186548
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190527	205023	8	8	1.0335	3.54174496146669e-11	179761	186548	4.03441312554311e-15	205023	206792
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	206792	34554208	11463	11293	-0.001	4.03441312554311e-15	205023	206792	8.31691424819766e-11	34542224	34556434
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34556434	34582272	13	12	0.7202	8.31691424819766e-11	34542224	34556434	5.71600864564213e-10	34580533	34591681
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34583814	232433938	62438	61478	0.0024	5.71600864564213e-10	34580533	34591681	2.10105374820271e-10	232392044	232438658
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232435445	232457549	16	16	0.6358	2.10105374820271e-10	232392044	232438658	3.55810026596545e-11	232453941	232464519
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232458325	242689978	3835	3776	-0.016	3.55810026596545e-11	232453941	232464519	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	194354505	63646	62699	0.0044	NA	NA	NA	1.78778895733338e-172	194354505	194354505
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.994	1.78778895733338e-172	194354505	194354505	1.13480972151522e-163	194366950	194366950
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	981	-0.0225	1.13480972151522e-163	194366950	194366950	5.61852256219199e-39	196820428	196904349
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196943380	24	23	-1.0253	5.61852256219199e-39	196820428	196904349	1.35505773938566e-39	196940125	196945209
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196945209	198012513	424	414	0.0153	1.35505773938566e-39	196940125	196945209	4.38046438815417e-26	198003896	198017057
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198014255	198046895	17	17	0.9861	4.38046438815417e-26	198003896	198017057	1.58561049448049e-26	198042681	198049128
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198049128	199329592	519	511	-0.0104	1.58561049448049e-26	198042681	198049128	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	645010	199	197	-0.0284	NA	NA	NA	1.70406879307339e-08	643573	645010
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	646459	649222	3	3	-1.2406	1.70406879307339e-08	643573	645010	2.36836638395514e-07	649222	652014
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	652014	7488703	2490	2445	-0.0173	2.36836638395514e-07	649222	652014	1.5235798861499e-08	7474683	7500153
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	7492691	7525796	15	15	0.5714	1.5235798861499e-08	7474683	7500153	6.63390952134931e-08	7518684	7540464
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	7528231	7528231	1	0	NA	6.63390952134931e-08	7518684	7540464	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	7530371	68905670	15725	15469	0.0084	NA	NA	NA	1.57565775049747e-30	68899247	69069651
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	1.1122	1.57565775049747e-30	68899247	69069651	2.63695569228606e-30	69163312	69643272
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	187330240	35471	34927	0.0022	2.63695569228606e-30	69163312	69643272	2.39462634148294e-74	187330240	187330240
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-4.554	2.39462634148294e-74	187330240	187330240	2.77745915150341e-76	187333619	187333619
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1217	0.0367	2.77745915150341e-76	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	52954	1e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32548736	11676	11512	0.0043	NA	NA	NA	1.00033669965780e-60	32548736	32595402
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32633691	18	16	-1.4596	1.0003366996578e-60	32548736	32595402	3.14612305074065e-10	32613538	32633691
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	0.0424	3.14612305074065e-10	32613538	32633691	2.00522997772428e-05	32709263	32721872
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-0.7467	2.00522997772428e-05	32709263	32721872	1.74022081851062e-07	32723366	32732764
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	8125	0.0058	1.74022081851062e-07	32723366	32732764	3.59029898589971e-70	54035000	54035000
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.6108	3.59029898589971e-70	54035000	54035000	1.57912617400374e-69	54042734	54042734
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	165643653	34317	33793	0.0017	1.57912617400374e-69	54042734	54042734	2.03675335143136e-124	165643653	165643653
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.17	2.03675335143136e-124	165643653	165643653	2.40467871837701e-121	165650610	165650610
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1779	-0.0157	2.40467871837701e-121	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	125831554	42438	41818	0.0069	NA	NA	NA	4.38030125039067e-72	125831554	125831554
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.705	4.38030125039067e-72	125831554	125831554	3.43768587481603e-67	125837524	125837524
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	131338391	2618	2573	0.0116	3.43768587481603e-67	125837524	125837524	3.27558368333064e-07	131327773	131352821
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131341451	131374950	13	12	0.6413	3.27558368333064e-07	131327773	131352821	6.35469248855104e-07	131366399	131383455
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131376396	131850199	254	248	0.0224	6.35469248855104e-07	131366399	131383455	0.00145578283615696	131792644	131872143
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131851601	131900393	26	26	0.339	0.00145578283615696	131792644	131872143	1.63345110264491e-06	131877237	131925344
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131901929	133414697	736	722	-0.0374	1.63345110264491e-06	131877237	131925344	5.00871525441162e-09	133404118	133419940
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133417179	133455682	17	17	0.4985	5.00871525441162e-09	133404118	133419940	1.40981471456074e-06	133444486	133472391
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133456873	141410894	3698	3629	0.0175	1.40981471456074e-06	133444486	133472391	1.98626689799216e-13	141406414	141414719
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141443577	16	16	-0.6783	1.98626689799216e-13	141406414	141414719	5.27491392672842e-10	141440184	141452085
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141446728	141690753	114	112	-0.016	5.27491392672842e-10	141440184	141452085	2.82183900202824e-93	141690753	141690753
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	-2.8837	2.82183900202824e-93	141690753	141690753	1.93072155845578e-126	141714168	141714168
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158821263	6752	6633	-0.0013	1.93072155845578e-126	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0142	NA	NA	NA	1.89071796920141e-36	581533	581533
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.3491	1.89071796920141e-36	581533	581533	1.08033887020277e-41	588865	588865
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	5574577	1889	1857	-0.0058	1.08033887020277e-41	588865	588865	1.27287630787242e-47	5574577	5574577
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5585615	5591702	2	2	-3.5681	1.27287630787242e-47	5574577	5574577	3.82173479344505e-46	5591702	5591702
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5596343	39350798	11062	10887	0.0018	3.82173479344505e-46	5591702	5591702	1.02465413791064e-50	39339800	39354149
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	54	0.7233	1.02465413791064e-50	39339800	39354149	1.48904660257445e-49	39500219	39509423
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30932	0.0039	1.48904660257445e-49	39500219	39509423	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	5291815	1952	1919	0.0021	NA	NA	NA	6.47702878652383e-21	5289324	5296737
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5294864	5327449	14	14	-0.8955	6.47702878652383e-21	5289324	5296737	1.51904584224333e-20	5322559	5330015
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5330015	11833914	2188	2153	0.0072	1.51904584224333e-20	5322559	5330015	3.73528501878396e-46	11826288	11841585
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11841585	11985387	27	26	-0.9785	3.73528501878396e-46	11826288	11841585	1.1232130390157e-47	11980600	11993863
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11993863	15802255	1277	1253	0.0172	1.1232130390157e-47	11980600	11993863	5.91184060027595e-12	15802255	15802255
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.8273	5.91184060027595e-12	15802255	15802255	2.055451560291e-11	15807123	15807123
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2337	-0.0036	2.055451560291e-11	15807123	15807123	5.77129354174889e-14	22477358	22477358
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	2.0135	5.77129354174889e-14	22477358	22477358	8.67983203332659e-14	22492603	22492603
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5154	0.0135	8.67983203332659e-14	22492603	22492603	1.44784356983685e-21	70926188	70926188
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.4689	1.44784356983685e-21	70926188	70926188	4.40416337952831e-21	70930528	70930528
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	128654320	20158	19899	-0.0089	4.40416337952831e-21	70930528	70930528	1.77750858904132e-13	128646157	128660686
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128656749	128693556	18	18	0.6546	1.77750858904132e-13	128646157	128660686	9.84129015138721e-12	128685682	128699467
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128695681	137352394	3589	3531	-0.0106	9.8412901513872e-12	128685682	128699467	3.12908692046888e-09	137347945	137352394
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.7645	3.12908692046888e-09	137347945	137352394	5.48071592797777e-09	137356880	137356880
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	139345200	783	772	-0.0186	5.48071592797777e-09	137356880	137356880	1.87331800283498e-07	139322515	139368626
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139355210	139404030	19	19	0.5158	1.87331800283498e-07	139322515	139368626	3.26057596843503e-08	139398990	139422404
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139407449	140145683	301	295	-0.0744	3.26057596843503e-08	139398990	139422404	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9580	-0.0021	NA	NA	NA	4.63486374943732e-54	27038538	27038538
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.8868	4.63486374943732e-54	27038538	27038538	6.09567843376945e-52	27041812	27041812
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14622	-0.0051	6.09567843376945e-52	27041812	27041812	6.31176447794618e-17	77917893	77917893
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77926390	1	0	NA	6.31176447794618e-17	77917893	77917893	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928669	77928738	2	2	2.2452	NA	NA	NA	5.62417181429437e-17	77928738	77928738
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19881	-0.0063	5.62417181429437e-17	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55123719	16906	16651	0.001	NA	NA	NA	6.26368796856526e-32	55112618	55127355
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55197848	32	32	0.7627	6.26368796856526e-32	55112618	55127355	1.04956909612311e-30	55194990	55203706
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	64989812	3995	3941	0.0145	1.04956909612311e-30	55194990	55203706	4.74958606696257e-10	64967952	65011475
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	64990593	65067194	34	34	0.4387	4.74958606696257e-10	64967952	65011475	5.77844482131092e-10	65044878	65085512
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65069108	66463477	615	611	-0.0126	5.77844482131092e-10	65044878	65085512	2.15402796075842e-07	66460753	66463477
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.5386	2.15402796075842e-07	66460753	66463477	1.25940771174712e-07	66469412	66473397
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	23392	-0.0011	1.25940771174712e-07	66469412	66473397	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	292	0.027	NA	NA	NA	8.34676956077449e-103	736988	736988
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-3.3945	8.34676956077449e-103	736988	736988	8.30495078246036e-80	743223	743223
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	11112600	4028	3968	-0.0104	8.30495078246036e-80	743223	743223	2.29106003959306e-52	11112600	11112600
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11140421	8	7	2.0688	2.29106003959306e-52	11112600	11112600	2.08512291079296e-52	11140421	11140421
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	33184017	7586	7458	0.0058	2.08512291079296e-52	11140421	11140421	1.60328443275719e-123	33184017	33184017
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-5.8899	1.60328443275719e-123	33184017	33184017	7.03141634466951e-122	33198331	33198331
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	128871574	31874	31406	0.012	7.03141634466951e-122	33198331	33198331	2.23539484207795e-20	128869663	128874699
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128874699	128887216	8	8	1.2423	2.23539484207795e-20	128869663	128874699	5.38809471519589e-22	128885243	128888941
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128888941	130694393	709	703	-0.0238	5.38809471519589e-22	128885243	128888941	5.70758576878458e-09	130694393	130694393
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.6018	5.70758576878458e-09	130694393	130694393	2.23397458776638e-08	130701040	130701040
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	637	-0.003	2.23397458776638e-08	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	51296396	12808	12614	-0.0067	NA	NA	NA	1.60066007955386e-10	51296396	51296396
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51298094	51300398	3	3	-1.4505	1.60066007955386e-10	51296396	51296396	7.14365799936504e-10	51300398	51301682
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	56657371	1215	1198	0.0274	7.14365799936504e-10	51300398	51301682	7.26013883310922e-13	56610886	56658479
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56691355	17	16	0.7569	7.26013883310922e-13	56610886	56658479	1.43789322758425e-15	56686863	56708261
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56693033	99461191	12486	12283	0.0122	1.43789322758425e-15	56686863	56708261	6.7991978239454e-18	99450562	99472287
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99465493	99537679	31	31	0.5847	6.7991978239454e-18	99450562	99472287	1.00260224307332e-17	99524407	99543251
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99538892	100690991	520	517	-0.0211	1.00260224307332e-17	99524407	99543251	3.52837744472497e-68	100690991	100690991
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.4964	3.52837744472497e-68	100690991	100690991	5.30566671014098e-72	100693892	100693892
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4494	-0.0142	5.30566671014098e-72	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	60	-0.7808	NA	NA	NA	6.97828932654203e-66	19490630	19535787
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	40680589	7589	7469	0.0135	6.97828932654203e-66	19490630	19535787	4.22770873699273e-08	40670538	40680589
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.894	4.22770873699273e-08	40670538	40680589	1.20734237083135e-07	40722360	40741934
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	73092112	11772	11588	-0.005	1.20734237083135e-07	40722360	40741934	2.64491832310803e-08	73092018	73092112
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73107419	4	4	-1.1358	2.64491832310803e-08	73092018	73092112	1.17209480234573e-08	73107419	73112029
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73112029	74152538	520	515	0.0056	1.17209480234573e-08	73107419	73112029	2.25679186342323e-11	74152538	74152538
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74154117	74155334	2	2	-1.8285	2.25679186342323e-11	74152538	74152538	8.44266818354453e-11	74155334	74155334
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74157425	106218059	11880	11695	-0.01	8.44266818354453e-11	74155334	74155334	3.25864866719485e-10	106209063	106221696
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	16	-0.6368	3.25864866719485e-10	106209063	106221696	1.38177837966046e-11	106253648	106260876
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	0.1222	1.38177837966046e-11	106253648	106260876	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1522	NA	NA	NA	4.57130143440371e-06	18432558	18837737
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20308014	152	150	-0.5254	4.57130143440371e-06	18432558	18837737	2.2226043525808e-68	20042683	20330200
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	100298352	31165	30687	-0.006	2.2226043525808e-68	20042683	20330200	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	57203733	14909	14668	0.0025	NA	NA	NA	7.96250848679966e-13	57203733	57203733
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-1.976	7.96250848679966e-13	57203733	57203733	1.65916651093237e-13	57206772	57206772
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5520	0.0208	1.65916651093237e-13	57206772	57206772	2.79671872388137e-53	75093957	75093957
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-3.1572	2.79671872388137e-53	75093957	75093957	8.95604174658273e-55	75100865	75100865
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75718125	132	131	-0.0715	8.95604174658273e-55	75100865	75100865	2.58309607031143e-12	75718125	75718125
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75720298	75723993	2	2	1.6833	2.58309607031143e-12	75718125	75718125	1.67855544879744e-10	75723993	75723993
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75726940	76925748	476	469	2e-04	1.67855544879744e-10	75723993	75723993	3.07890495183611e-37	76925748	76929598
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.584	3.07890495183611e-37	76925748	76929598	4.63294702153776e-34	76938723	76940218
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4457	-0.0342	4.63294702153776e-34	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	8147124	3542	3487	0.0239	NA	NA	NA	1.16292256675850e-07	8144634	8149046
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8155479	4	4	1.109	1.1629225667585e-07	8144634	8149046	6.80524744470018e-08	8154339	8156763
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8156763	32828797	8875	8753	0	6.80524744470018e-08	8154339	8156763	2.84364496752715e-85	32828797	32828797
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.9548	2.84364496752715e-85	32828797	32828797	2.88745255241312e-88	32832642	32832642
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1422	0.0113	2.88745255241312e-88	32832642	32832642	2.06306034508477e-197	36673853	36673853
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-4.3244	2.06306034508477e-197	36673853	36673853	1.56993761217620e-208	36684619	36684619
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41521544	2012	1977	0.0229	1.5699376121762e-208	36684619	36684619	1.10326502122764e-69	41518222	41526558
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41710400	66	66	-0.7419	1.10326502122764e-69	41518222	41526558	1.19830299429402e-61	41706870	42143048
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13456	0.0025	1.19830299429402e-61	41706870	42143048	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22621	-0.0075	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	59601217	21147	20838	0.0375	NA	NA	NA	5.05342685854845e-17	59594145	59604742
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59602882	59629931	12	12	0.9793	5.05342685854845e-17	59594145	59604742	7.91038163620058e-16	59624976	59634275
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59632147	60898883	522	515	0.0364	7.91038163620058e-16	59624976	59634275	7.72688203026319e-06	60868231	60907170
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60900710	60938618	24	23	0.4575	7.72688203026319e-06	60868231	60907170	3.88555595435615e-08	60932964	60948969
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60940332	61557826	284	280	-0.0127	3.88555595435615e-08	60932964	60948969	3.81068266696056e-34	61557826	61557826
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61559132	61560427	2	2	-3.1604	3.81068266696056e-34	61557826	61557826	4.45186964643059e-32	61560427	61560427
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61566194	63788698	1068	1053	0.0466	4.45186964643059e-32	61560427	61560427	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	576	-0.043	NA	NA	NA	1.70736633735589e-35	1499421	1515948
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.3278	1.70736633735589e-35	1499421	1515948	1.57200608990258e-30	1531162	1544485
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20644	-0.0049	1.57200608990258e-30	1531162	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	44627824	12378	12155	-0.0049	NA	NA	NA	6.91010203943477e-20	44622136	44627824
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44634707	44667779	13	13	0.9402	6.91010203943477e-20	44622136	44627824	9.68835427600582e-19	44667779	44671482
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44669596	46922972	1050	1032	-0.0142	9.68835427600582e-19	44667779	44671482	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2938	-0.0147	NA	NA	NA	2.28087394335840e-71	22667608	22682428
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22704683	11	11	-2.0481	2.2808739433584e-71	22667608	22682428	4.46710141808446e-05	22696162	22704683
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22706166	22720195	9	8	-4.2231	4.46710141808446e-05	22696162	22704683	1.21142394473932e-246	22720195	22720195
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6445	-0.0014	1.21142394473932e-246	22720195	22720195	5.35373555381472e-14	35472378	35472378
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	2.0525	5.35373555381472e-14	35472378	35472378	1.81884400570519e-13	35476942	35476942
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	36861482	785	771	0.019	1.81884400570519e-13	35476942	35476942	1.56425258919467e-05	36856168	36866617
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36865292	36873883	6	6	-0.7506	1.56425258919467e-05	36856168	36866617	1.16365896207503e-05	36869386	36877753
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36876540	37621766	397	396	0.0234	1.16365896207503e-05	36869386	36877753	6.31402830740522e-09	37618187	37621766
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	1.6787	6.31402830740522e-09	37618187	37621766	1.10273810885636e-08	37626069	37633961
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5718	-0.0223	1.10273810885636e-08	37626069	37633961	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.1414	NA	NA	NA	7.48743575987925e-07	4893	95819
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	1.4391	7.48743575987925e-07	4893	95819	7.8713741113939e-38	104732	104732
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	124528	16	16	-0.0762	7.8713741113939e-38	104732	104732	1.01536101614453e-17	124528	124528
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	127113	1	0	NA	1.01536101614453e-17	124528	124528	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127779	130528	4	4	1.0792	NA	NA	NA	2.15296832314704e-06	129544	132721
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	2146705	1213	1190	0.0887	2.15296832314704e-06	129544	132721	2.32095143770667e-18	2140385	2149650
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2146753	2169266	28	28	0.7204	2.32095143770667e-18	2140385	2149650	3.05428057307679e-10	2165456	2172347
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2171287	2228949	54	52	0.1262	3.05428057307679e-10	2165456	2172347	6.2986279278814e-07	2221170	2234289
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2229019	2248657	16	16	0.6604	6.2986279278814e-07	2221170	2234289	3.24178312130988e-14	2243461	2252307
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2248762	2711273	449	441	1e-04	3.24178312130988e-14	2243461	2252307	0	2708291	2712641
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2712641	154017980	44991	44333	1.0283	0	2708291	2712641	5.35920187831201e-11	153997984	154025967
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154019921	154079002	21	21	1.5382	5.35920187831201e-11	153997984	154025967	4.08791768606445e-07	154056623	154097201
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	85	1.0126	4.08791768606445e-07	154056623	154097201	1.08972681729005e-24	154442377	154442377
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-1.3081	1.08972681729005e-24	154442377	154442377	1.09962002407818e-61	154450309	154450309
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	1.138	1.09962002407818e-61	154450309	154450309	4.10160101709262e-55	154578922	154586690
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	197	-0.0163	4.10160101709262e-55	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	122	-3.9243	NA	NA	NA	4.22440819786027e-23	3219200	3772482
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.6985	4.22440819786027e-23	3219200	3772482	1.35167355103636e-12	5422507	6692482
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	170	-3.4504	1.35167355103636e-12	5422507	6692482	1.4062449947098e-08	7024303	7200061
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	127	-2.3435	1.4062449947098e-08	7024303	7200061	5.89273961439416e-08	7401540	7606496
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	73	-3.7037	5.89273961439416e-08	7401540	7606496	7.17347896150761e-08	7712882	7726921
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	18	-1.6848	7.17347896150761e-08	7712882	7726921	7.06209650603845e-08	7776265	7806605
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8956787	318	310	-3.4708	7.06209650603845e-08	7776265	7806605	2.01494702114669e-05	8893817	8961669
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9133230	29	29	-4.6522	2.01494702114669e-05	8893817	8961669	0.000325272166365198	9118845	10025706
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9135034	9135034	1	0	NA	0.000325272166365198	9118845	10025706	NA	NA	NA
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9145335	10515697	82	80	-3.708	NA	NA	NA	6.08773330745208e-19	10512616	10550419
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12452734	19	19	-0.9932	6.08773330745208e-19	10512616	10550419	8.15348699660102e-10	11249952	12452734
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.0891	8.15348699660102e-10	11249952	12452734	1.51593665622962e-05	12537944	12559410
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-1.9728	1.51593665622962e-05	12537944	12559410	1.49189207600584e-06	12637987	12710000
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-3.728	1.49189207600584e-06	12637987	12710000	3.31289539454735e-06	12792780	12859309
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12999095	59	59	-2.2414	3.31289539454735e-06	12792780	12859309	0.000190484788306728	12964087	13004854
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13040293	18	18	-0.9749	0.000190484788306728	12964087	13004854	0.000281992010319912	13035511	13066849
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13129843	36	35	-2.3962	0.000281992010319912	13035511	13066849	0.000698331056089307	13086552	13149825
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13241181	38	37	-3.5505	0.000698331056089307	13086552	13149825	0.000184111868646078	13233514	13241181
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13241682	13254711	3	3	-0.888	0.000184111868646078	13233514	13241181	2.90758053933264e-05	13254711	13259414
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	14342834	367	356	-3.8463	2.90758053933264e-05	13254711	13259414	9.95734005917298e-10	14266331	14388689
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508894	97	95	-2.9906	9.95734005917298e-10	14266331	14388689	0.00443591448896553	14479475	14550971
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.7627	0.00443591448896553	14479475	14550971	2.00385274636811e-06	14553021	14605090
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15208612	153	153	-3.4254	2.00385274636811e-06	14553021	14605090	6.58465289701771e-05	15200639	15220050
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15241527	10	9	-1.2649	6.58465289701771e-05	15200639	15220050	1.16797882005831e-08	15240367	15245772
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15433122	128	125	-3.5924	1.16797882005831e-08	15240367	15245772	2.24967273141580e-08	15431247	15433122
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-0.8425	2.2496727314158e-08	15431247	15433122	1.03210687887530e-10	15447091	15448670
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	30	-3.7692	1.0321068788753e-10	15447091	15448670	1.74629588337906e-06	15518749	15528826
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15546378	13	13	-1.7836	1.74629588337906e-06	15518749	15528826	0.00254182348941526	15532597	15560912
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15547576	15713288	44	43	-3.2095	0.00254182348941526	15532597	15560912	0.00157635446694544	15617621	15784249
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15716500	15915466	32	31	-4.1976	0.00157635446694544	15617621	15784249	0.000111534078961976	15867364	15970911
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16035717	43	40	-2.9052	0.000111534078961976	15867364	15970911	0.00235868461193305	16006096	16035717
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16042966	6	6	-0.8022	0.00235868461193305	16006096	16035717	5.79663420084717e-07	16042966	16062961
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	21036411	783	767	-3.6331	5.79663420084717e-07	16042966	16062961	2.0765945381428e-06	21026715	21036411
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.1074	2.0765945381428e-06	21026715	21036411	2.74773817555172e-08	21054519	21057446
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	252	-3.731	2.74773817555172e-08	21054519	21057446	2.75189203807767e-09	22055660	22139807
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.3048	2.75189203807767e-09	22055660	22139807	9.92032650161242e-28	22177335	22178964
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22371003	32	32	-4.217	9.92032650161242e-28	22177335	22178964	9.6434881932423e-08	22308420	22371003
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22373608	22407622	9	8	-2.5607	9.6434881932423e-08	22308420	22371003	0.0003041837419746	22393417	22782417
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22767553	22930737	52	49	-4.031	0.0003041837419746	22393417	22782417	8.42651582911726e-44	22926726	25737663
MSK_252152912787_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	84	-1.2491	8.42651582911726e-44	22926726	25737663	NA	NA	NA
