Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	1640562	211	202	0.0056	NA	NA	NA	2.77115729929256e-08	1637771	1640562
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1652866	1669998	3	3	-1.1189	2.77115729929256e-08	1637771	1640562	8.21840260095262e-13	1669998	1673810
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1673810	15158665	4860	4741	0.0195	8.21840260095262e-13	1669998	1673810	1.09049144122959e-09	15158665	15158665
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15160803	15162189	2	2	-1.2015	1.09049144122959e-09	15158665	15158665	3.6133216699396e-09	15162189	15162189
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	15163929	16963812	719	696	0.024	3.6133216699396e-09	15162189	15162189	1.36475412514888e-11	16923767	17094326
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	17127039	12	12	0.5884	1.36475412514888e-11	16923767	17094326	3.62236630396358e-13	17114337	17154037
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	64609636	18938	18473	0.0103	3.62236630396358e-13	17114337	17154037	1.11096336887193e-12	64605783	64614172
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	64612267	64621287	5	5	-0.8695	1.11096336887193e-12	64605783	64614172	4.00920081661289e-13	64614172	64625944
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	64625944	72537426	3144	3069	-0.0018	4.00920081661289e-13	64614172	64625944	2.05072704012312e-25	72534975	72539143
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.7129	2.05072704012312e-25	72534975	72539143	3.0493567615472e-24	72574479	72589682
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11405	0.0038	3.0493567615472e-24	72574479	72589682	4.27764369400367e-24	110023268	110023268
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	1.3264	4.27764369400367e-24	110023268	110023268	2.68892664138959e-24	110041712	110041712
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	111177741	481	467	-0.0181	2.68892664138959e-24	110041712	110041712	3.21558759121909e-11	111173447	111177741
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111180807	111190763	4	4	-0.9278	3.21558759121909e-11	111173447	111177741	2.61005250087832e-11	111190763	111193625
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111193625	146297175	4069	3961	-0.0052	2.61005250087832e-11	111190763	111193625	2.2030721177907e-33	146286735	147311437
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147847659	39	39	-0.5084	2.2030721177907e-33	146286735	147311437	2.31825364580130e-34	147490608	148081769
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081741	150819879	1256	1223	0.0104	2.3182536458013e-34	147490608	148081769	2.19231560684041e-167	150819879	150823073
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	2.137	2.19231560684041e-167	150819879	150823073	7.28219676313144e-99	150848509	150851439
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	78	-0.0043	7.28219676313144e-99	150848509	150851439	5.08050811470296e-08	151024118	151026228
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8354	5.08050811470296e-08	151024118	151026228	5.3144847129486e-09	151036435	151038091
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2603	0.0136	5.3144847129486e-09	151036435	151038091	2.48469280512589e-28	157133150	157133150
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.0066	2.48469280512589e-28	157133150	157133150	5.99135875413287e-28	157136342	157136342
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	195009358	13297	12967	-0.0034	5.99135875413287e-28	157136342	157136342	9.07627898138937e-19	194978218	195014129
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-0.8305	9.07627898138937e-19	194978218	195014129	2.19244077995375e-19	195048208	195091758
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200596027	2157	2103	0.0103	2.19244077995375e-19	195048208	195091758	1.81134668839585e-08	200571339	200620756
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200678532	31	29	-0.2872	1.81134668839585e-08	200571339	200620756	1.13265397958612e-07	200649025	200802204
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200679934	246648963	17272	16861	1e-04	1.13265397958612e-07	200649025	200802204	1.50696144500764e-06	246622913	246713340
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246668425	246769018	20	20	0.3141	1.50696144500764e-06	246622913	246713340	1.08965377846496e-32	246755298	246794552
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	27	-0.886	1.08965377846496e-32	246755298	246794552	1.80657065470716e-22	246858820	246863179
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	246931601	20	20	-0.1174	1.80657065470716e-22	246858820	246863179	9.3696622095318e-15	246928454	246931601
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246933929	246940630	5	5	-1.2525	9.3696622095318e-15	246928454	246931601	1.41665396115466e-19	246940630	246940630
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246941904	247186514	73	72	-0.0171	1.41665396115466e-19	246940630	246940630	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34551222	11523	11235	-0.0039	NA	NA	NA	1.49043942600667e-16	34539740	34554208
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34591681	18	18	0.509	1.49043942600667e-16	34539740	34554208	5.58605107214954e-19	34583814	34599239
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	37800512	1366	1332	-0.0263	5.58605107214954e-19	34583814	34599239	6.524769090622e-42	37797909	37812045
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37855837	24	24	-0.7206	6.524769090622e-42	37797909	37812045	6.3983108201649e-45	37848754	37858379
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5647	-6e-04	6.3983108201649e-45	37848754	37858379	1.80436866804373e-14	52588009	52600588
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.9032	1.80436866804373e-14	52588009	52600588	1.45618631521193e-14	52635695	52639605
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	71195546	6247	6067	-0.0034	1.45618631521193e-14	52635695	52639605	5.12983224634561e-09	71195546	71195546
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	71198108	71200120	2	2	-1.1454	5.12983224634561e-09	71195546	71195546	8.3672622214799e-09	71200120	71200120
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	71202174	89057273	5302	5154	0.0037	8.3672622214799e-09	71200120	71200120	1.07685427908736e-37	89052785	89222214
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89093646	89093646	1	0	NA	1.07685427908736e-37	89052785	89222214	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89208480	89730278	47	47	-0.4769	NA	NA	NA	5.52210160856672e-08	89706844	89744398
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89742890	89885961	18	17	-0.9328	5.52210160856672e-08	89706844	89744398	2.23434416497349e-06	89877995	89902365
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89890854	91155301	11	10	-0.403	2.23434416497349e-06	89877995	89902365	2.80653866570369e-05	91131762	94784165
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91158269	106240400	3544	3440	-0.0101	2.80653866570369e-05	91131762	94784165	8.32321334521218e-22	106240400	106240400
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106244482	106244482	1	0	NA	8.32321334521218e-22	106240400	106240400	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.73	NA	NA	NA	2.42917498614185e-20	106250718	106250718
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	242689978	43915	42787	-2e-04	2.42917498614185e-20	106250718	106250718	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	17514137	6488	6318	0.0014	NA	NA	NA	6.71169841935802e-10	17511765	17514137
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17516200	17519829	3	3	-0.9781	6.71169841935802e-10	17511765	17514137	1.6686866725571e-14	17519829	17519829
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17521317	17691884	79	78	-0.0196	1.6686866725571e-14	17519829	17519829	3.58105518807354e-16	17691884	17691884
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17695581	17698866	3	3	-1.0326	3.58105518807354e-16	17691884	17691884	1.11943629795857e-10	17698866	17701487
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17701487	25822800	2454	2395	-0.0071	1.11943629795857e-10	17698866	17701487	5.97392991009583e-07	25819586	25822800
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	25825905	25828852	2	2	-1.0319	5.97392991009583e-07	25819586	25822800	3.49173007711059e-07	25828852	25834064
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	25834064	32074432	1767	1712	-0.0181	3.49173007711059e-07	25828852	25834064	1.27207004405017e-22	32074432	32074432
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.7435	1.27207004405017e-22	32074432	32074432	1.09559565118534e-20	32080848	32080848
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	41785316	3253	3167	-0.0046	1.09559565118534e-20	32080848	32080848	1.23149307531397e-08	41783744	41785316
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	41788057	41792849	3	3	-0.9431	1.23149307531397e-08	41783744	41785316	1.83945552816007e-08	41792849	41796941
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	41796941	164005577	39437	38451	4e-04	1.83945552816007e-08	41792849	41796941	3.04848261826492e-24	164005577	164009321
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.1895	3.04848261826492e-24	164005577	164009321	1.73817248061221e-24	164023502	164027724
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	176559755	4129	4025	-0.0023	1.73817248061221e-24	164023502	164027724	1.16010976881246e-23	176559755	176559755
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176563796	176566161	2	2	-1.8657	1.16010976881246e-23	176559755	176559755	6.25958459568098e-24	176566161	176566161
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176568986	194354505	6019	5870	-9e-04	6.25958459568098e-24	176566161	176566161	1.42601858637201e-290	194354505	194354505
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.6941	1.42601858637201e-290	194354505	194354505	2.40403083642023e-284	194366950	194366950
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1929	-0.003	2.40403083642023e-284	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3297	0.013	NA	NA	NA	1.34387309219158e-282	9815760	9815760
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.4555	1.34387309219158e-282	9815760	9815760	2.90078000720537e-288	9842644	9842644
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14657	1e-04	2.90078000720537e-288	9842644	9842644	3.02862627481674e-54	68901210	69069651
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	1.04	3.02862627481674e-54	68901210	69069651	1.33222344612631e-52	69163312	69643272
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	100541994	10619	10365	-2e-04	1.33222344612631e-52	69163312	69643272	5.34743905005247e-22	100535321	100545503
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	100545503	100588030	19	17	0.6161	5.34743905005247e-22	100535321	100545503	2.84411634440621e-22	100587102	100598737
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	100595794	173224400	20555	20036	6e-04	2.84411634440621e-22	100587102	100598737	9.65408364427202e-158	173224400	173224400
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.6949	9.65408364427202e-158	173224400	173224400	1.23824406568201e-146	173228860	173228860
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	186	0.0173	1.23824406568201e-146	173228860	173228860	9.47938126749148e-85	173660684	173660684
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	3.602	9.47938126749148e-85	173660684	173660684	2.67728195957698e-88	173666072	173666072
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	175860235	743	723	-0.0026	2.67728195957698e-88	173666072	173666072	2.51728252310527e-09	175860235	175860235
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	1.1942	2.51728252310527e-09	175860235	175860235	2.57620991912523e-10	175863396	175863396
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	191153613	4579	4458	-0.0023	2.57620991912523e-10	175863396	175863396	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3862	-0.0055	NA	NA	NA	2.37705635146171e-17	12857302	12857302
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.5413	2.37705635146171e-17	12857302	12857302	2.78236189135218e-16	12873052	12873052
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	150181399	39877	38885	-0.0018	2.78236189135218e-16	12873052	12873052	3.46038257678637e-16	150171154	150185190
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.8244	3.46038257678637e-16	150171154	150185190	1.14378618185849e-16	150201145	150204134
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180342860	9785	9512	0.0071	1.14378618185849e-16	150201145	150204134	2.96024999669280e-09	180192214	180348365
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.5966	2.9602499966928e-09	180192214	180348365	3.26271786770041e-10	180355807	180364670
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	109	-0.0388	3.26271786770041e-10	180355807	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	10325	0.0016	NA	NA	NA	6.99003264261624e-16	29937319	29972382
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30021908	16	16	-0.5213	6.99003264261624e-16	29937319	29972382	1.42994337226499e-15	30004636	30026699
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30025480	32564884	1076	1046	0.0074	1.42994337226499e-15	30004636	30026699	3.06351286488939e-12	32548736	32628420
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32590568	3	0	NA	3.06351286488939e-12	32548736	32628420	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32653710	15	15	-0.4871	NA	NA	NA	2.38714221778052e-12	32605300	32657601
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32654861	54033505	8291	8097	0.0039	2.38714221778052e-12	32605300	32657601	1.27250492326439e-17	54033505	54033505
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54035000	54035000	1	0	NA	1.27250492326439e-17	54033505	54033505	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.3002	NA	NA	NA	1.10960864892874e-17	54042734	54042734
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6267	0.0064	1.10960864892874e-17	54042734	54042734	7.86203328941432e-17	79011979	79024557
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.6011	7.86203328941432e-17	79011979	79024557	5.70418199278195e-16	79085247	79101978
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6570	-8e-04	5.70418199278195e-16	79085247	79101978	2.34474981750671e-13	103827105	103841482
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.9919	2.34474981750671e-13	103827105	103841482	1.72348728468231e-13	103868154	103873584
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	162416011	20102	19580	-0.0029	1.72348728468231e-13	103868154	103873584	9.99899102378525e-20	162416011	162416011
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162417523	162425280	4	4	-1.1942	9.99899102378525e-20	162416011	162416011	2.33523539273275e-14	162425280	162425280
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162427045	162502077	37	37	0.0031	2.33523539273275e-14	162425280	162425280	8.04871658518938e-07	162502077	162502077
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162504290	162505819	2	2	-1.1242	8.04871658518938e-07	162502077	162502077	5.64289782652759e-08	162505819	162508430
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162508430	167487496	1761	1718	-0.012	5.64289782652759e-08	162505819	162508430	2.01140928160371e-71	167481609	167492395
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	167489284	167752329	85	83	0.501	2.01140928160371e-71	167481609	167492395	9.35736040306434e-73	167745175	168045882
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	168040442	170753106	923	893	-0.016	9.35736040306434e-73	167745175	168045882	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	8790893	3160	3092	0.0154	NA	NA	NA	3.11424487582271e-15	8786329	8790893
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8793843	8829893	5	5	-0.9359	3.11424487582271e-15	8786329	8790893	1.6673083608193e-14	8829893	8838768
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8838768	141410894	46638	45426	0.0012	1.6673083608193e-14	8829893	8838768	0	141410894	141410894
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141429405	8	8	-3.8779	0	141410894	141410894	8.31706996043841e-07	141429405	141429405
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141431668	141440184	6	6	-5.2527	8.31706996043841e-07	141429405	141429405	0	141440184	141440184
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	116	0.0142	0	141440184	141440184	2.37013821388637e-138	141690753	141690753
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	7	-3.0621	2.37013821388637e-138	141690753	141690753	0.0128508122293801	141705163	141711513
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	141714168	2	2	-1.1695	0.0128508122293801	141705163	141711513	2.08899366257247e-07	141714168	141714168
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142156165	168	162	0.0732	2.08899366257247e-07	141714168	141714168	3.95910875024532e-10	142156165	142159173
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142166710	3	3	-1.127	3.95910875024532e-10	142156165	142159173	5.43133509372160e-07	142166710	142166710
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-4.1114	5.4313350937216e-07	142166710	142166710	7.71022154170316e-115	142167908	142167908
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	142176074	1	0	NA	7.71022154170316e-115	142167908	142167908	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142187073	149490766	3041	2967	-0.0015	NA	NA	NA	9.02508764394082e-09	149483098	149490766
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149492796	149510981	6	6	-0.6767	9.02508764394082e-09	149483098	149490766	9.42058061147871e-09	149510981	149514308
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149514308	158821263	3531	3430	-0.0072	9.42058061147871e-09	149510981	149514308	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	4496565	1717	1674	-0.0108	NA	NA	NA	3.54742311667216e-11	4493907	4496565
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4498757	4501564	3	3	-1.0466	3.54742311667216e-11	4493907	4496565	1.96018758274968e-11	4501564	4506683
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4506683	7327293	676	660	-0.0112	1.96018758274968e-11	4501564	4506683	8.11625701954007e-12	7322035	7327293
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7697025	7824059	5	5	-0.8289	8.11625701954007e-12	7322035	7327293	2.13657815702134e-11	7824059	8137794
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5606	-0.0017	2.13657815702134e-11	7824059	8137794	1.45861120692574e-21	25120552	25120552
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	1.45861120692574e-21	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.7741	NA	NA	NA	1.50808190775815e-22	25125700	25125700
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4799	-3e-04	1.50808190775815e-22	25125700	25125700	1.55978686701494e-89	39341524	39354149
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39504332	58	57	0.6597	1.55978686701494e-89	39341524	39354149	6.17322537691544e-86	39499752	39509423
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39505256	39505256	1	0	NA	6.17322537691544e-86	39499752	39509423	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	63377340	5761	5596	-0.0016	NA	NA	NA	2.86099920464487e-20	63377340	63377340
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	63379224	63386160	5	5	-1.0932	2.86099920464487e-20	63377340	63377340	7.51630494261552e-21	63386160	63386160
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	63388204	109343455	14405	14061	0.0026	7.51630494261552e-21	63386160	63386160	2.58465567334487e-11	109343455	109343455
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	109347506	109353160	3	3	-1.0557	2.58465567334487e-11	109343455	109343455	5.28665161796813e-11	109353160	109353160
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	109354420	115701209	1564	1527	0.0148	5.28665161796813e-11	109353160	109353160	3.31266070214234e-08	115701209	115701209
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-1.1246	3.31266070214234e-08	115701209	115701209	4.62742658981943e-09	115711730	115711730
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	118073523	613	591	-0.0025	4.62742658981943e-09	115711730	115711730	1.41480150142697e-11	118073523	118073523
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	118074824	118076452	2	2	-1.2656	1.41480150142697e-11	118073523	118073523	1.12771426116651e-10	118076452	118076452
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	118078247	146264846	9078	8852	0.0022	1.12771426116651e-10	118076452	118076452	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	634039	209	207	-0.0068	NA	NA	NA	1.0054596677317e-06	631305	634039
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	635871	637589	2	2	-1.0404	1.0054596677317e-06	631305	634039	5.56153029348976e-08	637589	639143
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	639143	5375239	1774	1728	-0.0021	5.56153029348976e-08	637589	639143	6.28211225813838e-23	5375239	5375239
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5376775	5389363	5	5	-1.095	6.28211225813838e-23	5375239	5375239	2.72568940829385e-21	5389363	5389363
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5392943	15802255	3468	3384	-0.0023	2.72568940829385e-21	5389363	5389363	6.98088568040289e-23	15802255	15802255
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.7873	6.98088568040289e-23	15802255	15802255	7.02531998044177e-22	15807123	15807123
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2313	-0.0066	7.02531998044177e-22	15807123	15807123	6.17772753159895e-23	22477358	22477358
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.8281	6.17772753159895e-23	22477358	22477358	1.08945541983650e-23	22492603	22492603
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	39146895	4892	4755	0.0051	1.0894554198365e-23	22492603	22492603	7.85013624275233e-10	39130211	39146895
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43599449	3	3	0.9807	7.85013624275233e-10	39130211	39146895	4.98162707296014e-11	43599449	43626920
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	70926188	338	329	-0.0173	4.98162707296014e-11	43599449	43626920	9.74011927428831e-11	70923005	70926188
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.1886	9.74011927428831e-11	70923005	70926188	4.86361740483923e-09	70930528	70930528
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	24217	-0.0029	4.86361740483923e-09	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	15020469	5390	5258	-4e-04	NA	NA	NA	4.95005382681665e-50	15018500	15020469
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	15026547	15099650	16	15	-0.9526	4.95005382681665e-50	15018500	15020469	7.35096248967703e-49	15055229	15109510
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	15109510	34557927	6901	6741	-0.0062	7.35096248967703e-49	15055229	15109510	1.61436437307465e-12	34557927	34557927
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	34559385	34561998	3	3	-1.0974	1.61436437307465e-12	34557927	34557927	8.313968636911e-12	34561998	34561998
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	34564394	135285645	32498	31665	-0.0016	8.313968636911e-12	34561998	34561998	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1728	-0.002	NA	NA	NA	2.25479229342689e-251	4923300	4923300
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	4	-4.4646	2.25479229342689e-251	4923300	4923300	1.26668270778227e-266	4932214	4932214
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	7758275	1238	1210	0.0142	1.26668270778227e-266	4932214	4932214	1.19972465130300e-22	7757329	7758275
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7762277	7797993	10	10	-0.8209	1.199724651303e-22	7757329	7758275	1.95364841383416e-22	7797993	7800021
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7800021	21951964	5535	5389	0.0025	1.95364841383416e-22	7797993	7800021	8.14783302145222e-11	21947480	21951964
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	21960197	21982952	3	3	-1.0556	8.14783302145222e-11	21947480	21951964	4.74231773917675e-11	21982952	21982952
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	21987785	55118214	8342	8158	0.0036	4.74231773917675e-11	21982952	21982952	6.96881638636721e-42	55112618	55124730
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55207305	38	37	0.579	6.96881638636721e-42	55112618	55124730	4.67807648982989e-42	55203706	55217189
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	56079118	366	356	0	4.67807648982989e-42	55203706	55217189	1.00383433951416e-44	56079118	56079118
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	56081428	56110647	12	12	-1.0173	1.00383433951416e-44	56079118	56079118	4.82343107946056e-42	56110647	56110647
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	56116739	60725222	1771	1721	-0.007	4.82343107946056e-42	56110647	56110647	3.2549481377577e-08	60720087	60725222
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	60770870	60774812	3	3	-0.9184	3.2549481377577e-08	60720087	60725222	2.52815411702319e-08	60774812	60778117
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	60778117	65328528	1984	1943	0.0316	2.52815411702319e-08	60774812	60778117	3.38168265322944e-15	65327335	65328528
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65329885	65336354	5	5	-0.9512	3.38168265322944e-15	65327335	65328528	1.47022318757650e-14	65336354	65338663
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65338663	66463477	498	490	0.0221	1.4702231875765e-14	65336354	65338663	1.01861361591940e-11	66463477	66463477
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.4023	1.0186136159194e-11	66463477	66463477	2.71431062634233e-13	66469412	66469412
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	124579236	20067	19537	0.0015	2.71431062634233e-13	66469412	66469412	6.98210184819767e-08	124578058	124579236
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124580889	124588223	5	4	-0.7781	6.98210184819767e-08	124578058	124579236	1.24999838633274e-08	124588223	124591102
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124591102	134450318	3648	3566	-0.0059	1.24999838633274e-08	124588223	124591102	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	942658	390	383	0.0241	NA	NA	NA	8.58825725635632e-15	942658	942658
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	944303	949316	3	3	-1.0237	8.58825725635632e-15	942658	942658	4.4898679639562e-10	949316	951112
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	951112	10464018	3692	3597	-0.0027	4.4898679639562e-10	949316	951112	2.6756629539603e-07	10457163	10474825
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10465787	10485848	9	9	-0.5102	2.6756629539603e-07	10457163	10474825	3.73514596717314e-06	10477903	10498541
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	227	-0.0332	3.73514596717314e-06	10477903	10498541	3.50764861341943e-41	11116883	11116883
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.3151	3.50764861341943e-41	11116883	11116883	5.81457194298408e-42	11140421	11140421
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	33270966	7600	7412	0.0026	5.81457194298408e-42	11140421	11140421	2.84168047491835e-179	33270966	33270966
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33278235	33283825	2	2	-5.037	2.84168047491835e-179	33270966	33270966	6.22265501178437e-180	33283825	33283825
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33290235	132289090	33223	32366	0.0065	6.22265501178437e-180	33283825	33283825	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	24464699	2144	2078	-0.0049	NA	NA	NA	9.06697117346142e-08	24464221	24464699
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	24471282	24477537	3	3	-0.8955	9.06697117346142e-08	24464221	24464699	5.74603859748254e-08	24477537	24482794
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	24482794	33030946	3448	3349	-0.0046	5.74603859748254e-08	24477537	24482794	1.04591083627148e-08	33028007	33030946
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-0.9341	1.04591083627148e-08	33028007	33030946	1.18274760407394e-09	33042557	33046417
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	37953582	1740	1694	1e-04	1.18274760407394e-09	33042557	33046417	4.19781677065436e-128	37953582	37953582
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.0629	4.19781677065436e-128	37953582	37953582	2.51361912417206e-136	37957844	37957844
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	38643792	305	295	-0.024	2.51361912417206e-136	37957844	37957844	3.43513835101161e-08	38642736	38643792
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	38645922	38649203	3	3	-0.8482	3.43513835101161e-08	38642736	38643792	1.21301773666236e-07	38649203	38651566
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	38651566	49964838	4571	4433	-0.0017	1.21301773666236e-07	38649203	38651566	6.24375924637574e-47	49964838	49964838
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.4907	6.24375924637574e-47	49964838	49964838	3.41675722424854e-39	49971732	49971732
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1765	3e-04	3.41675722424854e-39	49971732	49971732	2.37149990826365e-08	56606183	56660235
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	-0.4462	2.37149990826365e-08	56606183	56660235	7.16958100779914e-10	56677538	56691355
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	71703277	3731	3631	0.0073	7.16958100779914e-10	56677538	56691355	1.78714144640140e-11	71703277	71703277
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71705959	71708737	2	2	-1.2785	1.7871414464014e-11	71703277	71703277	5.0244758732187e-11	71708737	71708737
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71720727	114123340	13872	13495	-0.0046	5.0244758732187e-11	71708737	71708737	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	7	-0.0702	NA	NA	NA	3.75413661437669e-06	18798641	19287128
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19489920	50	48	-0.695	3.75413661437669e-06	18798641	19287128	5.42925260727603e-83	19483933	19497023
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19490630	19494416	3	0	NA	5.42925260727603e-83	19483933	19497023	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	100627779	29681	28932	0.0025	NA	NA	NA	1.96573426116905e-10	100627779	100627779
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	100633126	100633376	2	2	-1.2562	1.96573426116905e-10	100627779	100627779	4.99849416831136e-09	100633376	100636879
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	100636879	105787390	1932	1890	0.0059	4.99849416831136e-09	100633376	100636879	1.02197491204838e-10	105783533	105787390
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.7854	1.02197491204838e-10	105783533	105787390	1.38833915858046e-07	105798116	105800545
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105850033	21	20	-0.0196	1.38833915858046e-07	105798116	105800545	1.03106546456683e-16	105850033	105850033
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-1.6521	1.03106546456683e-16	105850033	105850033	4.16692576956632e-13	105881893	105881893
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105923686	14	14	-0.0975	4.16692576956632e-13	105881893	105881893	4.30785070551423e-05	105916075	105951399
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106002179	20	20	0.3231	4.30785070551423e-05	105916075	105951399	2.38854824435516e-06	105994646	106030444
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106218059	90	88	-0.0662	2.38854824435516e-06	105994646	106030444	2.19525922224321e-07	106207549	106221696
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	16	0.3837	2.19525922224321e-07	106207549	106221696	1.39193857477012e-06	106249962	106269748
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	0.0133	1.39193857477012e-06	106249962	106269748	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	20088256	156	154	0.3324	NA	NA	NA	2.25724405886223e-57	20022359	20339495
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	20978	0.002	2.25724405886223e-57	20022359	20339495	5.59047477816398e-11	74664249	74669752
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.923	5.59047477816398e-11	74664249	74669752	2.50524147415285e-11	74680439	74696127
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9373	-0.0027	2.50524147415285e-11	74680439	74696127	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5324	0.0041	NA	NA	NA	4.49600524016629e-09	14674185	14958374
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15037844	16	16	-0.4105	4.49600524016629e-09	14674185	14958374	1.65924467615874e-07	15028108	15047619
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15039224	15881167	285	280	-0.007	1.65924467615874e-07	15028108	15047619	2.0313564245346e-14	15876588	15891468
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15883105	15883105	1	0	NA	2.0313564245346e-14	15876588	15891468	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15885534	15927378	15	15	0.5827	NA	NA	NA	3.45533237176621e-16	15906137	15932371
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15927676	70647078	13327	12991	0.0135	3.45533237176621e-16	15906137	15932371	2.78471425334297e-29	70647078	70647078
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70653499	70665447	4	4	1.4792	2.78471425334297e-29	70647078	70647078	1.14988219411480e-35	70665447	70665447
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70669873	72170174	487	470	-0.0035	1.1498821941148e-35	70665447	70665447	1.23575874351541e-18	72170174	72170174
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72171424	72173767	3	3	-1.243	1.23575874351541e-18	72170174	72170174	2.23585090278705e-15	72173767	72173767
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72175070	75093957	917	892	0.01	2.23585090278705e-15	72173767	72173767	6.82121494302903e-32	75093957	75093957
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.7995	6.82121494302903e-32	75093957	75093957	2.07768232178144e-38	75100865	75100865
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	597	-0.0095	2.07768232178144e-38	75100865	75100865	1.9042736090405e-71	76925748	76925748
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.5138	1.9042736090405e-71	76925748	76925748	5.51335868581542e-58	76940218	76940218
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4403	-0.0048	5.51335868581542e-58	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	409	0.0486	NA	NA	NA	6.38609862446356e-18	1028979	1028979
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5849	6.38609862446356e-18	1028979	1028979	9.68137507475228e-17	1030766	1030766
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31457889	11618	11294	0.0158	9.68137507475228e-17	1030766	1030766	1.54162936800360e-09	31437168	31470227
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	0.4067	1.5416293680036e-09	31437168	31470227	6.37124678276498e-10	31489333	31897238
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36634734	1800	1747	0.0146	6.37124678276498e-10	31489333	31897238	2.62836144030761e-15	36633313	36637908
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36637908	36644182	5	5	-0.922	2.62836144030761e-15	36633313	36637908	7.78646493017942e-06	36644002	36649076
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36649076	36673853	10	9	-0.1073	7.78646493017942e-06	36644002	36649076	7.44375697258366e-18	36672710	36673853
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.1153	7.44375697258366e-18	36672710	36673853	6.67151676052318e-26	36684619	36684619
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40869151	1806	1753	0.0341	6.67151676052318e-26	36684619	36684619	9.46371298169627e-06	40847517	41007660
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41026062	6	6	-0.4912	9.46371298169627e-06	40847517	41007660	1.55996597257112e-06	41015177	41067756
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41031191	41031191	1	0	NA	1.55996597257112e-06	41015177	41067756	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41521544	199	194	0.0204	NA	NA	NA	8.51073232604971e-17	41515622	41527705
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41570512	22	22	-0.4255	8.5107323260497e-17	41515622	41527705	1.46640768710179e-07	41561017	41573295
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41572001	41624013	25	25	-0.8137	1.46640768710179e-07	41561017	41573295	0.0161467252660996	41594950	41647135
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41625390	41710400	19	19	-0.5861	0.0161467252660996	41594950	41647135	4.69988971876131e-22	41708551	42147225
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13326	0.0095	4.69988971876131e-22	41708551	42147225	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	9862913	3461	3361	-0.0038	NA	NA	NA	2.10779056242416e-10	9862913	9862913
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	9867676	9867818	2	2	-1.2223	2.10779056242416e-10	9862913	9862913	4.26687071385757e-10	9867818	9867818
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	9870834	45250903	10228	9991	-0.0052	4.26687071385757e-10	9867818	9867818	7.10378691086469e-27	45249898	45250903
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	45252448	45259224	7	7	-1.0444	7.10378691086469e-27	45249898	45250903	3.12018082266406e-26	45259224	45259224
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	45260353	53092949	2501	2433	-0.0115	3.12018082266406e-26	45259224	45259224	4.7046921166615e-20	53092949	53092949
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	1.681	4.7046921166615e-20	53092949	53092949	5.53722724811137e-20	53099601	53099601
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	59691502	2302	2240	-1e-04	5.53722724811137e-20	53099601	53099601	3.84897903429355e-15	59691502	59691502
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	59694886	59698305	3	3	-1.1993	3.84897903429355e-15	59691502	59691502	4.57922318651479e-14	59698305	59698305
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	59700377	76116026	4458	4344	-0.0108	4.57922318651479e-14	59698305	59698305	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	56823430	19873	19339	0.0212	NA	NA	NA	1.95419011844757e-19	56822197	56825794
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.8473	1.95419011844757e-19	56822197	56825794	4.76179072639106e-17	56837593	56842447
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58208527	586	572	0.0071	4.76179072639106e-17	56837593	56842447	3.1849399286476e-05	58192331	58214720
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58239871	13	13	-0.3685	3.1849399286476e-05	58192331	58214720	1.60697303949368e-05	58232649	58261341
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58241773	61404667	1440	1402	0.0034	1.60697303949368e-05	58232649	58261341	1.09863762320340e-08	61401425	61404667
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61405704	61412630	4	3	-0.9531	1.0986376232034e-08	61401425	61404667	6.52627178176426e-09	61412630	61415641
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61415641	63788698	1135	1106	-6e-04	6.52627178176426e-09	61412630	61415641	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	571	-0.0224	NA	NA	NA	8.4870645658917e-36	1506379	1511632
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.0107	8.4870645658917e-36	1506379	1511632	9.20259432912632e-36	1531162	1544485
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	8303692	2389	2324	0.0075	9.20259432912632e-36	1531162	1544485	2.02351882079671e-08	8301250	8303692
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8304958	8305019	2	2	1.1181	2.02351882079671e-08	8301250	8303692	4.94046933298325e-08	8305019	8316776
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8316776	62419534	18592	18067	-0.0014	4.94046933298325e-08	8305019	8316776	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13090	-5e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16521073	406	398	0.0196	NA	NA	NA	2.63896774332249e-112	16521073	16521073
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-4.324	2.63896774332249e-112	16521073	16521073	1.23785355398211e-127	16524408	16524408
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	22667608	2575	2506	0.0168	1.23785355398211e-127	16524408	16524408	2.08763527411285e-66	22667608	22677959
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	19	1.0404	2.08763527411285e-66	22667608	22677959	1.68661384580238e-69	22718614	22720195
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6370	0.0139	1.68661384580238e-69	22718614	22720195	1.77061956731145e-55	35472378	35472378
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	2.8373	1.77061956731145e-55	35472378	35472378	3.16351983457434e-54	35476942	35476942
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	36865292	786	773	0.0282	3.16351983457434e-54	35476942	35476942	7.815601675434e-07	36860605	36868339
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36866617	36873883	5	5	-0.6222	7.815601675434e-07	36860605	36868339	9.55608253619124e-07	36869386	36876540
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36876540	37621766	397	382	0.0324	9.55608253619124e-07	36869386	36876540	1.20805568907315e-10	37618187	37621766
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	1.3103	1.20805568907315e-10	37618187	37621766	3.77168683438433e-10	37626069	37626069
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	47767302	5024	4883	0.0107	3.77168683438433e-10	37626069	37626069	3.92215626536607e-11	47764755	47767302
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47774814	47777763	3	3	-1.0978	3.92215626536607e-11	47764755	47767302	3.73110277609658e-10	47777763	47782744
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47782744	49571068	786	768	-0.0015	3.73110277609658e-10	47777763	47782744	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	158967	52	52	-0.0503	NA	NA	NA	2.55848049778378e-06	151515	158967
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	159609	164913	6	6	-0.6008	2.55848049778378e-06	151515	158967	9.74675835735461e-08	164913	165816
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	164985	1427392	729	712	0.0287	9.74675835735461e-08	164913	165816	3.86581600533867e-09	1427338	1431240
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.8082	3.86581600533867e-09	1427338	1431240	7.10673498494578e-09	1432891	1434970
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1751766	260	255	0.0098	7.10673498494578e-09	1432891	1434970	7.30613051783122e-14	1751766	1751766
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1753446	1755168	3	3	-1.1513	7.30613051783122e-14	1751766	1751766	1.37539923237016e-13	1755168	1755974
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1755974	2708291	739	716	0.0129	1.37539923237016e-13	1755168	1755974	0	2708113	2711273
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154050185	45005	43830	0.9186	0	2708113	2711273	7.63459019236122e-12	154046681	154050185
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154051619	154078819	7	7	1.6316	7.63459019236122e-12	154046681	154050185	1.13784902213564e-08	154078819	154085354
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	87	0.8859	1.13784902213564e-08	154078819	154085354	3.29291109284309e-25	154441943	154442377
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	2.5419	3.29291109284309e-25	154441943	154442377	2.83950110020148e-41	154450309	154450309
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.9297	2.83950110020148e-41	154450309	154450309	8.17478049451715e-82	154582414	154586690
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.0203	8.17478049451715e-82	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	127	-3.7545	NA	NA	NA	9.51094134097774e-14	3777766	4174561
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.0403	9.51094134097774e-14	3777766	4174561	5.9715195424074e-08	5531459	6696721
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	108	-3.5661	5.9715195424074e-08	5531459	6696721	0.00070985369629345	6909375	6964172
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7013903	31	30	-2.4336	0.00070985369629345	6909375	6964172	0.000149677474085499	6999891	7025866
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7016002	7054924	26	26	-3.7009	0.000149677474085499	6999891	7025866	0.00077613025195665	7040494	7200061
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	121	-2.4855	0.00077613025195665	7040494	7200061	1.90083589767017e-05	7349064	7614571
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	74	-3.4848	1.90083589767017e-05	7349064	7614571	4.01957408765586e-05	7708716	7726921
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	14	-1.7623	4.01957408765586e-05	7708716	7726921	2.8643066250112e-06	7781968	7799614
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	10513747	429	402	-3.4763	2.8643066250112e-06	7781968	7799614	6.12312024628352e-18	10506718	10515697
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	18	-0.9429	6.12312024628352e-18	10506718	10515697	9.26162580156444e-19	11673476	11698871
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	11	-3.8925	9.26162580156444e-19	11673476	11698871	1.62309849954626e-08	12537944	12546917
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-1.8187	1.62309849954626e-08	12537944	12546917	6.71641957378273e-11	12658135	12700767
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-3.5968	6.71641957378273e-11	12658135	12700767	9.55088440229386e-08	12804329	12859309
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	108	-2.134	9.55088440229386e-08	12804329	12859309	2.79218718968166e-05	13086552	13153920
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13262997	46	45	-3.1155	2.79218718968166e-05	13086552	13153920	0.0290706015908638	13153920	13401077
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	14342834	363	342	-3.6756	0.0290706015908638	13153920	13401077	1.71055327383779e-05	14112932	14409975
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	92	-3.0328	1.71055327383779e-05	14112932	14409975	2.56074019171815e-06	14496442	14538156
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.56074019171815e-06	14496442	14538156	NA	NA	NA
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.5712	NA	NA	NA	2.32189679880699e-13	14563486	14598838
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	22192409	1531	1455	-3.4701	2.32189679880699e-13	14563486	14598838	2.24995419128975e-07	22165808	22202315
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22308420	25	25	-4.8608	2.24995419128975e-07	22165808	22202315	1.49158288679183e-05	22261337	22774861
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22367156	25737663	65	58	-3.7377	1.49158288679183e-05	22261337	22774861	1.75984325469538e-34	22930737	26872527
MSK_252152912790_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	75	-1.2751	1.75984325469538e-34	22930737	26872527	NA	NA	NA
