Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	2240503	446	431	0.0443	NA	NA	NA	1.26129819844258e-06	2229298	2245662
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2243512	2259532	8	8	0.6208	1.26129819844258e-06	2229298	2245662	1.13134430229660e-07	2253351	2269096
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2263680	21530950	7252	7061	0.0237	1.1313443022966e-07	2253351	2269096	1.41602645969688e-06	21508717	21539230
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21532455	21636472	23	22	0.3577	1.41602645969688e-06	21508717	21539230	1.75998932033632e-16	21570058	21695957
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	21655095	34869589	5165	5039	0.05	1.75998932033632e-16	21570058	21695957	1.99529423504818e-18	34859068	34869589
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-1.0295	1.99529423504818e-18	34859068	34869589	5.87838890134546e-13	34883375	34884849
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	39893738	1893	1848	0.0375	5.87838890134546e-13	34883375	34884849	2.58202781355308e-09	39886404	39899835
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	39896556	39923484	15	15	0.5094	2.58202781355308e-09	39886404	39899835	9.4027643620421e-11	39919639	39929959
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	39925886	72537426	13088	12781	-8e-04	9.4027643620421e-11	39919639	39929959	1.08085280637170e-106	72537426	72537426
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.6142	1.0808528063717e-106	72537426	72537426	9.98376397859082e-112	72579311	72579311
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	94060783	6990	6842	-0.0034	9.98376397859082e-112	72579311	72579311	8.32699124208168e-10	94059721	94060783
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-1.1719	8.32699124208168e-10	94059721	94060783	1.96221305216850e-07	94062928	94064124
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	109168265	4325	4237	-0.0144	1.9622130521685e-07	94062928	94064124	1.08471503137522e-06	109167083	109168265
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109169839	109173218	3	3	-0.9145	1.08471503137522e-06	109167083	109168265	4.46557439438625e-07	109173218	109175307
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109175307	110014625	381	373	0.0329	4.46557439438625e-07	109173218	109175307	2.66262931503865e-09	110010176	110014625
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.7378	2.66262931503865e-09	110010176	110014625	7.08136850334269e-09	110041712	110060587
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	116029725	2221	2164	-0.0041	7.08136850334269e-09	110041712	110060587	1.39403454407042e-11	116029725	116029725
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-1.4451	1.39403454407042e-11	116029725	116029725	1.14018287704321e-22	116033402	116033402
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	150819879	3626	3532	0.0077	1.14018287704321e-22	116033402	116033402	4.84591106893878e-21	150819879	150819879
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-1.3204	4.84591106893878e-21	150819879	150819879	0.000136381700696259	150839754	150843192
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-3.6355	0.000136381700696259	150839754	150843192	6.41582480986436e-238	150851439	150851439
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	167483267	6871	6722	0.0035	6.41582480986436e-238	150851439	150851439	0	167483267	167483267
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-4.3576	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	7026	-0.0061	0	167507898	167507898	3.47390618587303e-21	185979586	185979586
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.9151	3.47390618587303e-21	185979586	185979586	4.8247433356998e-21	185988138	185988138
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1916	0.0038	4.8247433356998e-21	185988138	185988138	7.97623178751153e-15	194977713	195011344
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.7566	7.97623178751153e-15	194977713	195011344	4.27432229403781e-15	195048208	195091758
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	229988285	12964	12650	2e-04	4.27432229403781e-15	195048208	195091758	1.12255303166851e-16	229985455	229989433
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229989433	230015230	14	14	0.6365	1.12255303166851e-16	229985455	229989433	7.81272816390008e-17	230013928	230020468
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	230016373	239898412	3797	3697	0.0055	7.81272816390008e-17	230013928	230020468	9.33328589147758e-09	239896986	239898412
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	239900277	239906833	4	4	0.8681	9.33328589147758e-09	239896986	239898412	1.70391605348654e-08	239906833	239908024
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	239908024	244915107	1982	1930	0.0044	1.70391605348654e-08	239906833	239908024	5.154341316772e-11	244909016	244917651
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244917651	244930655	8	8	0.6968	5.154341316772e-11	244909016	244917651	8.15245334194626e-11	244930004	244937126
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	244935586	246620921	680	666	0.0059	8.15245334194626e-11	244930004	244937126	9.70028095616343e-05	246580098	246669591
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246622216	246769018	31	30	0.2497	9.70028095616343e-05	246580098	246669591	1.50114240836129e-43	246755298	246794552
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246875016	30	30	-0.7932	1.50114240836129e-43	246755298	246794552	5.79972409753681e-53	246864725	246878405
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	93	0.0148	5.79972409753681e-53	246864725	246878405	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	186548	54	52	0.0408	NA	NA	NA	2.32001528371992e-12	179761	186548
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190527	205023	8	8	0.7267	2.32001528371992e-12	179761	186548	8.39761581376388e-15	205023	206792
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	206792	3708749	1326	1297	-0.045	8.39761581376388e-15	205023	206792	4.88630755689833e-07	3707057	3713664
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3713664	3714236	3	3	-0.9278	4.88630755689833e-07	3707057	3713664	6.18376195918581e-11	3714236	3718746
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3718746	41091579	13024	12701	-0.0016	6.18376195918581e-11	3714236	3718746	1.20400852789384e-10	41087172	41091579
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41092989	41101640	5	5	-0.8522	1.20400852789384e-10	41087172	41091579	3.45092744835906e-11	41101640	41105253
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41105253	52600588	4312	4193	0.0103	3.45092744835906e-11	41101640	41105253	0	52600588	52600588
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-5.4441	0	52600588	52600588	0	52635695	52635695
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	81363444	9644	9389	0.0033	0	52635695	52635695	1.06865185516505e-17	81358084	81363444
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	81373819	81408721	5	5	-1.0762	1.06865185516505e-17	81358084	81363444	1.44431666223270e-16	81408721	81417420
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	81417420	106244482	5524	5388	-0.0109	1.4443166622327e-16	81408721	81417420	1.63673723595922e-15	106244482	106244482
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.6433	1.63673723595922e-15	106244482	106244482	2.49554561570142e-15	106250718	106250718
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	211327807	32687	31921	-0.005	2.49554561570142e-15	106250718	106250718	3.39525958517594e-14	211319520	211327807
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	211337987	211378789	7	6	-0.9176	3.39525958517594e-14	211319520	211327807	2.17196419859179e-14	211378789	211389906
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	211389906	242689978	11221	10953	-0.007	2.17196419859179e-14	211378789	211389906	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	53001678	18662	18235	0.0017	NA	NA	NA	0	53001678	53001678
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-5.3391	0	53001678	53001678	0	53011885	53011885
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	89475107	11974	11701	-0.0158	0	53011885	53011885	2.21507923540850e-30	89473678	89475107
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	13	-0.8909	2.2150792354085e-30	89473678	89475107	4.83889923413874e-30	89500935	89502757
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	129640125	11644	11352	-0.0077	4.83889923413874e-30	89500935	89502757	3.69402206420314e-11	129635409	129640125
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129641800	129652489	7	7	-0.7563	3.69402206420314e-11	129635409	129640125	6.87626312550665e-12	129652489	129657285
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129655469	133189686	1404	1380	-9e-04	6.87626312550665e-12	129652489	129657285	2.5949247581931e-20	133189686	133189686
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-1.8414	2.5949247581931e-20	133189686	133189686	2.74909794428734e-20	133194685	133194685
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9536	-0.0089	2.74909794428734e-20	133194685	133194685	1.27522356548627e-74	164005577	164005577
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.1831	1.27522356548627e-74	164005577	164005577	1.06076718793520e-26	164027724	164036648
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	20	0.5946	1.0607671879352e-26	164027724	164036648	1.19570465959013e-21	164107951	164123806
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	182092892	5730	5584	-0.0039	1.19570465959013e-21	164107951	164123806	5.32131759763006e-07	182087266	182105148
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	182101482	182115582	8	8	0.5486	5.32131759763006e-07	182087266	182105148	3.27210824836249e-15	182110149	182124915
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	182118986	194354505	4391	4300	0.0084	3.27210824836249e-15	182110149	182124915	2.02223068658204e-20	194353315	194354505
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	1.0632	2.02223068658204e-20	194353315	194354505	2.04588819341705e-20	194366950	194368145
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196835413	997	969	-0.0092	2.04588819341705e-20	194366950	194368145	5.90710594101803e-10	196807153	196907040
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196929826	20	18	-0.4476	5.90710594101803e-10	196807153	196907040	1.09529864824154e-14	196927528	196942158
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	198012513	427	416	0.0665	1.09529864824154e-14	196927528	196942158	7.08876531393266e-13	197998939	198021943
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198014255	198052526	19	19	0.5442	7.08876531393266e-13	197998939	198021943	7.43049577407084e-15	198044259	198061819
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198055355	199329592	517	507	0.0016	7.43049577407084e-15	198044259	198061819	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3290	-0.0047	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.1986	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68905670	15036	14663	-0.0063	0	9842644	9842644	5.84984293905979e-49	68901210	69069651
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	1.0683	5.84984293905979e-49	68901210	69069651	9.98362643204678e-50	69163312	69643272
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	132135793	19582	19141	-0.0057	9.98362643204678e-50	69163312	69643272	2.95578131314539e-52	132115766	132157483
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	132144090	132566146	63	63	0.5136	2.95578131314539e-52	132115766	132157483	2.01979257538774e-52	132553941	132588597
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	132571968	151758350	5165	5043	-0.0097	2.01979257538774e-52	132553941	132588597	7.44161965531504e-12	151736958	151783666
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151759577	151884740	56	54	0.2645	7.44161965531504e-12	151736958	151783666	5.49063104583082e-11	151858781	151921126
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	151886627	163280246	3505	3417	-0.0061	5.49063104583082e-11	151858781	151921126	1.33091151411931e-17	163280246	163280246
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	163284051	163292962	5	5	-1.1129	1.33091151411931e-17	163280246	163280246	6.56821058612453e-19	163292962	163292962
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	163295457	191153613	8338	8120	-0.0058	6.56821058612453e-19	163292962	163292962	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	79142	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	90722	737829	221	217	-0.0546	NA	NA	NA	8.76361088300657e-07	727098	737829
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	0.5327	8.76361088300657e-07	727098	737829	5.32837907798446e-07	829954	905462
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	21480789	6124	5973	-0.0295	5.32837907798446e-07	829954	905462	4.98434776507688e-13	21480789	21480789
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.4804	4.98434776507688e-13	21480789	21480789	1.27752123850961e-12	21487474	21487474
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	78489361	15489	15100	-0.0074	1.27752123850961e-12	21487474	21487474	3.43954079719871e-14	78485582	78497296
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78493792	78535112	19	18	0.5114	3.43954079719871e-14	78485582	78497296	5.91016345758335e-13	78528240	78545391
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78538241	78890384	156	153	0.0393	5.91016345758335e-13	78528240	78545391	5.00226305801993e-11	78890384	78890384
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78892931	78900308	3	3	-0.9584	5.00226305801993e-11	78890384	78890384	1.02850227039024e-07	78900308	78907697
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	78907697	130634552	14174	13847	-0.0072	1.02850227039024e-07	78900308	78907697	3.15098751851003e-13	130632946	130638815
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130638815	130649467	7	7	0.7922	3.15098751851003e-13	130632946	130638815	0.00370235871865856	130641919	130652439
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130650977	130663522	8	8	0.2521	0.00370235871865856	130641919	130652439	0.00626295442698502	130656570	130803352
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130665376	130665376	1	0	NA	0.00626295442698502	130656570	130803352	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130666522	155411053	9273	9060	-0.005	NA	NA	NA	1.79966288217583e-11	155405839	155411053
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155416484	155421443	4	4	1.0009	1.79966288217583e-11	155405839	155411053	3.59241999780564e-12	155421443	155427589
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	174093883	6007	5868	-0.0072	3.59241999780564e-12	155421443	155427589	1.78591439569221e-13	174089673	174093883
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174098587	174105496	4	4	1.0508	1.78591439569221e-13	174089673	174093883	7.18940727896829e-37	174105496	174105496
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174107239	174112421	3	3	0.5553	7.18940727896829e-37	174105496	174105496	0.0182225393684327	174112421	174176586
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174117406	174117406	1	0	NA	0.0182225393684327	174112421	174176586	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174121702	178040439	1233	1203	0.0234	NA	NA	NA	1.13899036443397e-06	178037603	178040439
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	-1.0843	1.13899036443397e-06	178037603	178040439	1.55155096493783e-06	178045608	178047480
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	180644810	1028	1006	0.0278	1.55155096493783e-06	178045608	178047480	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	771840	290	284	-0.0242	NA	NA	NA	4.85520738678469e-08	763954	771840
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	776477	786196	4	4	0.8089	4.85520738678469e-08	763954	771840	8.10406978891484e-15	786196	789608
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	789608	32564884	11385	11134	0.0083	8.10406978891484e-15	786196	789608	4.42925317936476e-50	32564884	32593151
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32588005	2	0	NA	4.42925317936476e-50	32564884	32593151	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32590568	32600962	5	5	-1.7894	NA	NA	NA	0.150728941109309	32595402	32653710
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32668835	17	17	-0.5448	0.150728941109309	32595402	32653710	0.255221430394162	32609525	32673823
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32672983	32711957	18	18	-0.0155	0.255221430394162	32609525	32673823	1.08334069469601e-08	32711957	32716255
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32721872	5	5	-1.0015	1.08334069469601e-08	32711957	32716255	1.57685204661830e-14	32718991	32723366
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32723366	51940597	7372	7198	0.0091	1.5768520466183e-14	32718991	32723366	2.81555960846736e-12	51932600	51944280
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	51944280	51969378	14	14	0.5663	2.81555960846736e-12	51932600	51944280	8.31145555522443e-14	51967227	51974674
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	51970683	54035000	877	856	-0.0222	8.31145555522443e-14	51967227	51974674	1.30078523870707e-193	54035000	54035000
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.7161	1.30078523870707e-193	54035000	54035000	1.58646161572429e-205	54042734	54042734
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	74647491	5288	5161	5e-04	1.58646161572429e-205	54042734	54042734	8.38079494665995e-66	74647491	74647491
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	-3.2963	8.38079494665995e-66	74647491	74647491	4.68089779496873e-66	74653360	74653360
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	165643653	29027	28341	-0.0066	4.68089779496873e-66	74653360	74653360	8.51276967766658e-18	165643653	165643653
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.2226	8.51276967766658e-18	165643653	165643653	2.50280651289212e-19	165650610	165650610
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1769	-0.0552	2.50280651289212e-19	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	5807913	2107	2048	0.0454	NA	NA	NA	3.57415458365444e-12	5797706	5807913
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5823755	5848555	6	6	-0.7881	3.57415458365444e-12	5797706	5807913	1.46555821517222e-10	5848555	5851216
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5851216	26097755	6685	6520	-0.0046	1.46555821517222e-10	5848555	5851216	1.07105663916156e-112	26097755	26097755
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-4.3141	1.07105663916156e-112	26097755	26097755	6.83455478783057e-110	26108369	26108369
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	131338391	36259	35417	0.0045	6.83455478783057e-110	26108369	26108369	1.04686256028961e-26	131327773	131352821
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131341451	131374950	13	13	0.495	1.04686256028961e-26	131327773	131352821	8.9690565478346e-09	131366399	131383455
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131376396	141690753	4861	4726	0.0024	8.9690565478346e-09	131366399	131383455	4.79074128450224e-09	141686875	141690753
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141720303	11	10	0.5715	4.79074128450224e-09	141686875	141690753	1.13651076903099e-08	141720303	141725033
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2450	0.002	1.13651076903099e-08	141720303	141725033	8.28118931543498e-102	147702365	147702365
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-4.24	8.28118931543498e-102	147702365	147702365	2.5239273959206e-109	147707161	147707161
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	154525027	2445	2386	-0.0109	2.5239273959206e-109	147707161	147707161	5.55982329233826e-06	154523855	154525027
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	154526573	154530165	2	2	1.0173	5.55982329233826e-06	154523855	154525027	3.06765439793641e-06	154530165	154533634
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	154531887	154531887	1	0	NA	3.06765439793641e-06	154530165	154533634	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	154533634	158821263	1790	1749	-0.0456	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	151472	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	166493	581533	118	116	-0.0714	NA	NA	NA	1.72166715565178e-94	581533	581533
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.3776	1.72166715565178e-94	581533	581533	2.16766112517357e-118	588865	588865
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	39350798	12953	12636	-0.0065	2.16766112517357e-118	588865	588865	2.27252990728328e-62	39339800	39354149
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	0.5808	2.27252990728328e-62	39339800	39354149	1.30360862573428e-54	39500219	39511632
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	51191560	2179	2124	0.0142	1.30360862573428e-54	39500219	39511632	2.1021607470827e-210	51191560	51191560
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	2.1021607470827e-210	51191560	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-4.8651	NA	NA	NA	4.21187614673636e-219	51200291	51200291
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	4.21187614673636e-219	51200291	51200291	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	58271240	2174	2128	-0.0049	NA	NA	NA	3.1543519143387e-08	58268002	58277102
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58274145	58300815	6	6	0.6791	3.1543519143387e-08	58268002	58277102	1.28329059941067e-11	58290326	58313875
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58306259	146264846	27069	26404	-0.007	1.28329059941067e-11	58290326	58313875	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5336	-0.0037	NA	NA	NA	3.14840728264427e-14	15802255	15802255
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-1.5172	3.14840728264427e-14	15802255	15802255	4.05643523132883e-13	15807123	15807123
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	15813356	1	0	NA	4.05643523132883e-13	15807123	15807123	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	22477358	2376	2306	-0.0097	NA	NA	NA	3.23711146585186e-17	22477358	22477358
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.7076	3.23711146585186e-17	22477358	22477358	3.33279208695063e-17	22492603	22492603
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5093	0.007	3.33279208695063e-17	22492603	22492603	1.44664584055236e-138	70926188	70926188
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.7423	1.44664584055236e-138	70926188	70926188	2.06738126046211e-139	70930528	70930528
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9693	-0.0119	2.06738126046211e-139	70930528	70930528	1.39086089980065e-29	100348045	100348045
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-2.2185	1.39086089980065e-29	100348045	100348045	6.25671229459946e-29	100350814	100350814
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	128651975	10236	10000	-0.0123	6.25671229459946e-29	100350814	100350814	1.84277042066801e-19	128646157	128654320
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128654320	128695681	20	20	0.5623	1.84277042066801e-19	128646157	128654320	5.63645482582795e-15	128693556	128709553
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	128697140	134542664	2543	2487	0.0433	5.63645482582795e-15	128693556	128709553	1.15858154602478e-07	134540844	134542664
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134544331	134545846	2	2	1.2323	1.15858154602478e-07	134540844	134542664	1.44842596348642e-07	134545846	134548747
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134548747	140145683	2148	2083	0.0173	1.44842596348642e-07	134545846	134548747	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	23998	0.001	NA	NA	NA	6.8392629539194e-24	77917893	77917893
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.632	6.8392629539194e-24	77917893	77917893	1.44345581215248e-23	77928738	77928738
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	98995967	7036	6856	-0.003	1.44345581215248e-23	77928738	77928738	2.87034694015832e-09	98986029	99000466
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	98996169	99010856	7	7	0.6816	2.87034694015832e-09	98986029	99000466	8.2676251275071e-14	99007407	99015755
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	99013267	123947043	9114	8892	0.0029	8.2676251275071e-14	99007407	99015755	2.57014842323721e-13	123935064	123956449
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123948905	123969584	11	11	-0.4252	2.57014842323721e-13	123935064	123956449	0.000174054522557708	123957735	123991409
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123971172	126436757	923	905	-0.0421	0.000174054522557708	123957735	123991409	7.8052244297723e-06	126405227	126452585
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126437980	126502158	24	24	0.2526	7.8052244297723e-06	126405227	126452585	1.72406182589504e-06	126486462	126531028
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126505109	135285645	3098	3032	-0.0579	1.72406182589504e-06	126486462	126531028	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	7335246	2824	2756	-7e-04	NA	NA	NA	3.71619722540644e-33	7333186	7335246
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7339560	7368490	14	13	-0.9696	3.71619722540644e-33	7333186	7335246	9.23533017249786e-42	7368490	7383659
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7382558	7382558	1	0	NA	9.23533017249786e-42	7368490	7383659	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7383659	7679090	146	143	-0.0693	NA	NA	NA	0.000101865790948948	7655813	7700478
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7680398	7727344	19	17	0.209	0.000101865790948948	7655813	7700478	0.0082983986365963	7702110	7742419
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7730596	7758275	11	10	-0.1591	0.0082983986365963	7702110	7742419	9.27862124103611e-13	7753067	7758275
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7762277	7783492	9	9	-0.9032	9.27862124103611e-13	7753067	7758275	1.13184288357475e-21	7783492	7797993
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	18892456	4347	4252	-0.0058	1.13184288357475e-21	7783492	7797993	3.25616961164593e-11	18888184	18892456
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18896166	18917191	7	7	0.7357	3.25616961164593e-11	18888184	18892456	5.39860845491546e-11	18917191	18932031
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55118214	9527	9297	-0.0068	5.39860845491546e-11	18917191	18932031	1.83669556842057e-11	55088012	55136234
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55219985	41	41	-0.3202	1.83669556842057e-11	55088012	55136234	4.45865225922857e-14	55202450	55231935
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55221692	64989812	3987	3896	0.0286	4.45865225922857e-14	55202450	55231935	4.37834441946865e-12	64969065	64995657
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	64990593	65062840	32	30	0.3664	4.37834441946865e-12	64969065	64995657	3.24984061480392e-07	65052102	65085512
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65065965	66463477	617	592	0.0647	3.24984061480392e-07	65052102	65085512	4.40480723387052e-12	66463477	66463477
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-1.4267	4.40480723387052e-12	66463477	66463477	1.39687440723828e-11	66469412	66469412
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	118712459	17801	17369	-0.0029	1.39687440723828e-11	66469412	66469412	4.64866929546402e-07	118699846	118712459
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118714207	118732455	10	10	0.5053	4.64866929546402e-07	118699846	118712459	8.0377633629445e-11	118732455	118736142
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118734825	118854073	50	49	-0.0417	8.0377633629445e-11	118732455	118736142	3.34108908849323e-05	118829574	118877973
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118858983	118948068	24	24	0.2554	3.34108908849323e-05	118829574	118877973	1.70914995904725e-05	118907951	118994562
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118951305	121432643	891	880	-0.0202	1.70914995904725e-05	118907951	118994562	2.09140903452238e-07	121430998	121432643
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	121438882	121442434	3	3	-0.9186	2.09140903452238e-07	121430998	121432643	4.25685601905567e-07	121442434	121444803
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	121444803	134450318	4941	4817	-0.024	4.25685601905567e-07	121442434	121444803	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	291	0.0548	NA	NA	NA	1.45436257933092e-13	734832	736988
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.9496	1.45436257933092e-13	734832	736988	1.81506293129647e-11	743223	745410
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3377	0.0088	1.81506293129647e-11	743223	745410	6.62812258592558e-305	9523923	9523923
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-4.5637	6.62812258592558e-305	9523923	9523923	2.06295224954514e-121	9554149	9554149
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9626623	12	12	-0.655	2.06295224954514e-121	9554149	9554149	6.23093189752386e-14	9607363	9628897
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626736	11104973	566	550	-0.0224	6.23093189752386e-14	9607363	9628897	0.0436543004313749	11052064	11110735
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11116883	4	4	-0.4287	0.0436543004313749	11052064	11110735	9.45773323299074e-05	11116883	11125311
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.0667	9.45773323299074e-05	11116883	11125311	4.95573132749341e-127	11130871	11130871
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	12422129	467	453	-0.0045	4.95573132749341e-127	11130871	11130871	4.81491729454949e-14	12419910	12422129
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12423720	12433043	5	5	-1.0304	4.81491729454949e-14	12419910	12422129	5.97201020127978e-15	12433043	12435301
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12435301	31079618	6343	6186	-0.0035	5.97201020127978e-15	12433043	12435301	8.48063322534756e-13	31058854	31098259
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31081498	31248212	26	26	-0.4222	8.48063322534756e-13	31058854	31098259	5.79318278242933e-14	31242528	31254651
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31249495	94810929	20060	19571	0.0112	5.79318278242933e-14	31242528	31254651	1.20235968522410e-14	94806578	94815148
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	94812892	94840021	11	11	0.6496	1.2023596852241e-14	94806578	94815148	4.01547899745079e-13	94835150	94848716
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	94841392	94841392	1	0	NA	4.01547899745079e-13	94835150	94848716	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	94847520	108579001	5128	5009	-0.0026	NA	NA	NA	0.0763811591255749	108546676	108579001
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	108581103	108585026	3	3	-0.5239	0.0763811591255749	108546676	108579001	0.00402855456232945	108585026	108597860
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	108586308	110409014	788	774	0.0454	0.00402855456232945	108585026	108597860	0.0485680649029864	110383168	110409014
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	110410827	110411410	2	2	-0.5278	0.0485680649029864	110383168	110409014	5.22145125260906e-25	110411410	110485921
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	110423372	128877382	6631	6505	0.0281	5.22145125260906e-25	110411410	110485921	7.4104256760172e-24	128871574	128877382
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128878823	128887216	6	5	0.7646	7.4104256760172e-24	128871574	128877382	4.43570742052437e-09	128887216	128888941
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128888941	132289090	1355	1319	-0.0171	4.43570742052437e-09	128887216	128888941	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11927	-0.0078	NA	NA	NA	8.05412392389707e-73	49964838	49964838
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.4805	8.05412392389707e-73	49964838	49964838	1.80017080781711e-71	49971732	49971732
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	51294959	586	565	-0.0298	1.80017080781711e-71	49971732	49971732	8.05693521863507e-06	51292613	51294959
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51296396	51300398	4	4	-0.7448	8.05693521863507e-06	51292613	51294959	5.68105888603898e-06	51300398	51302823
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	56650373	1214	1184	-0.0061	5.68105888603898e-06	51300398	51302823	2.92628475263154e-08	56602818	56658479
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56680346	13	13	-0.4865	2.92628475263154e-08	56602818	56658479	2.83861321858951e-08	56675588	56688605
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56681665	71375082	3625	3562	-0.011	2.83861321858951e-08	56675588	56688605	1.47527437415446e-124	71375082	71375082
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.5573	1.47527437415446e-124	71375082	71375082	2.18262982722706e-124	71377671	71377671
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4524	-0.0037	2.18262982722706e-124	71377671	71377671	1.34377167381602e-180	89659397	89659397
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-5.4854	1.34377167381602e-180	89659397	89659397	1.07305204680031e-191	89662326	89662326
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	89663261	1	0	NA	1.07305204680031e-191	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89664425	99445188	4226	4141	-0.0067	NA	NA	NA	3.49476723299981e-20	99438497	99450562
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99447027	99537679	38	37	0.4144	3.49476723299981e-20	99438497	99450562	3.20183456821074e-21	99524407	99543251
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99538892	100690991	520	506	-0.0274	3.20183456821074e-21	99524407	99543251	3.4202727237445e-143	100690991	100690991
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.7847	3.4202727237445e-143	100690991	100690991	2.95653655312849e-140	100693892	100693892
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4434	-0.0399	2.95653655312849e-140	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18537177	5	5	-0.3359	NA	NA	NA	0.0142628976098659	18505611	19377290
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18544772	19494416	55	53	-0.7856	0.0142628976098659	18505611	19377290	9.2084123674518e-77	19492531	19497023
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	20035793	264	261	0.0318	9.2084123674518e-77	19492531	19497023	1.28517703787215e-09	20028610	20035793
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20037770	20052836	9	8	0.7228	1.28517703787215e-09	20028610	20035793	8.7073579513813e-15	20052836	20057281
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20055469	40680589	7316	7146	0.018	8.7073579513813e-15	20052836	20057281	2.21205842147210e-15	40676611	40680589
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.9242	2.2120584214721e-15	40676611	40680589	1.96373569814249e-14	40722360	40726930
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	105948347	24071	23532	-0.0013	1.96373569814249e-14	40722360	40726930	0.000114029554037425	105897061	105962305
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	13	0.3132	0.000114029554037425	105897061	105962305	4.87379486424641e-05	105985422	106019719
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106214372	92	91	-0.085	4.87379486424641e-05	105985422	106019719	8.5171220587927e-05	106185891	106221696
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	18	-0.4244	8.5171220587927e-05	106185891	106221696	5.31999840450854e-14	106251081	106256498
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	34	0.1267	5.31999840450854e-14	106251081	106256498	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1994	NA	NA	NA	5.18685100211878e-08	18450562	18741716
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19835471	102	98	-0.5381	5.18685100211878e-08	18450562	18741716	3.85325214106212e-25	19835471	19835471
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19844217	2	2	-3.2209	3.85325214106212e-25	19835471	19835471	5.95548518969632e-14	19844217	19844217
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	20308014	48	48	-0.6084	5.95548518969632e-14	19844217	19844217	3.606296070449e-50	20065525	20316992
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	32456500	3670	3581	-0.011	3.606296070449e-50	20065525	20316992	9.52067073311956e-39	32452971	32514939
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	24	-0.7505	9.52067073311956e-39	32452971	32514939	3.35543611960342e-40	32583146	32661846
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	75098815	18025	17596	0.0079	3.35543611960342e-40	32583146	32661846	9.21458688242011e-11	75090928	75105789
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75100480	75130268	16	16	0.5021	9.2145868824201e-11	75090928	75105789	2.84392591222026e-12	75125735	75134126
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75131479	100287000	9428	9197	-0.012	2.84392591222026e-12	75125735	75134126	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100298352	100298352	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2593067	1012	987	0.0486	NA	NA	NA	4.13102979909928e-07	2583238	2638581
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2600740	2666932	9	9	0.5973	4.13102979909928e-07	2583238	2638581	4.51169172002364e-11	2662050	2677004
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2671203	14687636	4446	4353	0.026	4.51169172002364e-11	2662050	2677004	5.00170370430873e-10	14666341	14956177
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	15029941	15	14	-0.3879	5.00170370430873e-10	14666341	14956177	6.61785548897737e-10	15023848	15043869
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	34310087	5224	5095	0.0461	6.61785548897737e-10	15023848	15043869	6.48194677645443e-21	34280904	34339543
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34317157	34317157	1	0	NA	6.48194677645443e-21	34280904	34339543	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34602318	52	51	0.4299	NA	NA	NA	2.77720913004096e-25	34584793	34630537
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	70647078	8353	8162	0.0167	2.77720913004096e-25	34584793	34630537	1.20304344008469e-25	70645378	70647078
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70653499	70665447	4	4	1.1366	1.20304344008469e-25	70645378	70647078	2.14879974117079e-18	70665447	70669873
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70669873	72170174	487	472	0.0102	2.14879974117079e-18	70665447	70669873	9.42286939100387e-14	72170174	72170174
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72171424	72173767	3	3	-1.1172	9.42286939100387e-14	72170174	72170174	1.14307554980484e-11	72173767	72173767
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72175070	75093957	917	890	0.0418	1.14307554980484e-11	72173767	72173767	9.1266138027249e-06	75089974	75093957
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	0.8689	9.1266138027249e-06	75089974	75093957	2.59594446073446e-07	75100865	75102639
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	600	-0.0281	2.59594446073446e-07	75100865	75102639	5.80916368768999e-271	76925748	76925748
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-3.4147	5.80916368768999e-271	76925748	76925748	5.50217460676156e-271	76940218	76940218
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88208878	4304	4195	-0.0068	5.50217460676156e-271	76940218	76940218	4.77828821612513e-06	88191121	88216091
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88210523	88245955	16	16	0.3685	4.77828821612513e-06	88191121	88216091	0.00060263644625458	88239736	88293259
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88248356	88690571	193	186	0.0224	0.00060263644625458	88239736	88293259	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	58435991	21866	21340	0.041	NA	NA	NA	2.32411677593526e-08	58419953	58435991
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58439971	58452260	7	7	0.6077	2.32411677593526e-08	58419953	58435991	3.03238188479534e-06	58452260	58459873
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58454995	73935216	5852	5709	0.0376	3.03238188479534e-06	58452260	58459873	1.99244478799693e-08	73916911	73942213
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73936627	73986989	24	24	0.3916	1.99244478799693e-08	73916911	73942213	6.12291771782046e-09	73976073	74003643
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	73988199	78653545	1885	1839	0.0208	6.12291771782046e-09	73976073	74003643	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	489057	171	163	-0.011	NA	NA	NA	1.23507783326749e-08	486856	489057
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	491448	500897	4	4	0.7055	1.23507783326749e-08	486856	489057	1.11680883428409e-05	500897	505456
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	36509250	10807	10534	-0.0121	1.11680883428409e-05	500897	505456	6.25116020969359e-300	36509250	36509250
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-6.947	6.25116020969359e-300	36509250	36509250	1.71714846810547e-300	36519728	36519728
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	45349779	2763	2693	-0.0133	1.71714846810547e-300	36519728	36519728	3.41072724772764e-15	45346544	45352243
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	45352243	45372526	12	12	0.6363	3.41072724772764e-15	45346544	45352243	2.35211596511586e-15	45370166	45376317
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	45374875	76116026	9205	8966	-0.0261	2.35211596511586e-15	45370166	45376317	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	20841320	9322	9097	0.103	NA	NA	NA	4.03515373215811e-06	20791480	20854536
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20900139	16	15	-0.2931	4.03515373215811e-06	20791480	20854536	2.38625134579024e-06	20887746	20914739
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20901410	21533555	197	194	0.0581	2.38625134579024e-06	20887746	20914739	4.22444495147798e-08	21530823	21533555
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21537835	21549627	5	5	0.7337	4.22444495147798e-08	21530823	21533555	2.23568735887446e-14	21549627	21555247
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21553424	45335536	5270	5160	0.0413	2.23568735887446e-14	21549627	21555247	6.88266900004934e-17	45314752	45357523
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45338401	45403160	26	26	0.3851	6.88266900004934e-17	45314752	45357523	5.5998837325757e-06	45384145	45428279
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45404470	56823430	5037	4923	0.0912	5.5998837325757e-06	45384145	45428279	3.7950448751877e-13	56819531	56823430
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.6738	3.7950448751877e-13	56819531	56823430	1.47692885444163e-10	56840346	56844304
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1144	0.0517	1.47692885444163e-10	56840346	56844304	1.22965806445037e-41	59414898	59414898
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-1.216	1.22965806445037e-41	59414898	59414898	7.39646253483923e-45	59434202	59434202
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1953	0.0494	7.39646253483923e-45	59434202	59434202	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	572	-0.0245	NA	NA	NA	9.69157688819471e-164	1506379	1506379
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	7	-2.9211	9.6915768881947e-164	1506379	1506379	6.03239361262968e-151	1531162	1531162
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	2733903	479	465	0.0052	6.03239361262968e-151	1531162	1531162	5.91160331551252e-08	2722089	2736501
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	2736371	2762041	10	10	0.5469	5.91160331551252e-08	2722089	2736501	8.36062324652093e-10	2751099	2770175
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	2763967	8303692	1901	1864	0.0237	8.36062324652093e-10	2751099	2770175	9.16289906542497e-11	8303692	8303692
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8304958	8305019	2	2	1.3967	9.16289906542497e-11	8303692	8303692	5.75918442752663e-14	8305019	8305019
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8316776	12095485	1299	1271	-0.0401	5.75918442752663e-14	8305019	8305019	1.00138130681090e-06	12089020	12095485
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	0.9726	1.0013813068109e-06	12089020	12095485	6.16218438308436e-06	12113855	12127349
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	14217486	664	646	-0.0225	6.16218438308436e-06	12113855	12127349	1.9889325138286e-08	14215568	14217486
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14221701	14224436	3	3	-0.9836	1.9889325138286e-08	14215568	14217486	1.13844688238184e-12	14224436	14228704
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14228704	62419534	16624	16238	-0.0029	1.13844688238184e-12	14224436	14228704	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10075714	12	12	0.5828	NA	NA	NA	3.22751472504921e-12	10004854	10101956
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10079654	42126693	11125	10865	-0.0095	3.22751472504921e-12	10004854	10101956	1.42665097535569e-07	42109576	42131510
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	42128478	42165982	23	23	0.3331	1.42665097535569e-07	42109576	42131510	9.73879166552513e-08	42160415	42181724
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	42167609	44627824	1218	1181	-0.024	9.73879166552513e-08	42160415	42181724	1.81551261632467e-08	44620601	44634707
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44634707	44667779	13	12	0.4918	1.81551261632467e-08	44620601	44634707	3.31606100682915e-08	44666832	44673205
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44669596	46922972	1050	1026	-0.0135	3.31606100682915e-08	44666832	44673205	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2905	0.0244	NA	NA	NA	1.24028919647163e-58	22644243	22679305
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	1.0495	1.24028919647163e-58	22644243	22679305	1.09388580203491e-65	22718614	22735036
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	37621766	7737	7548	0.0225	1.09388580203491e-65	22718614	22735036	1.84766761702358e-11	37621766	37621766
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	1.2461	1.84766761702358e-11	37621766	37621766	4.89702185104846e-28	37626069	37633961
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5688	0.0182	4.89702185104846e-28	37626069	37633961	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1387546	753	732	0.0926	NA	NA	NA	1.86993840845529e-05	1370492	1388323
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1388323	1415434	22	22	0.378	1.86993840845529e-05	1370492	1388323	8.9797396593127e-05	1413829	1420674
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1416262	1427392	12	11	0.1347	8.9797396593127e-05	1413829	1420674	6.785394802932e-10	1427392	1431240
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.6566	6.785394802932e-10	1427392	1431240	1.07359082818830e-06	1432891	1435082
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1862931	324	319	0.1114	1.0735908281883e-06	1432891	1435082	2.74299974539028e-08	1848984	1870855
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1863993	1907678	30	30	-0.2163	2.74299974539028e-08	1848984	1870855	2.5318635571138e-09	1892736	1917245
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1907912	2303192	256	245	0.1674	2.5318635571138e-09	1892736	1917245	1.31205780771569e-97	2303192	2303192
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-3.483	1.31205780771569e-97	2303192	2303192	4.20179145356535e-122	2304398	2304398
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	382	-0.0034	4.20179145356535e-122	2304398	2304398	0	2708113	2711273
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	19392639	6484	6331	0.9574	0	2708113	2711273	3.10652942162468e-09	19388574	19392639
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19394773	19410825	7	7	1.6821	3.10652942162468e-09	19388574	19392639	1.17828415325129e-09	19410825	19414718
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19412765	23756923	1572	1539	0.9744	1.17828415325129e-09	19410825	19414718	8.26133098177838e-12	23750682	23758236
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	23758236	23778330	11	10	1.6199	8.26133098177838e-12	23750682	23758236	1.64353880461285e-11	23774781	23784282
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	23779771	37699655	4989	4865	0.9664	1.64353880461285e-11	23774781	23784282	1.35753799226751e-08	37698330	37699655
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	37700374	37706063	2	2	-0.0661	1.35753799226751e-08	37698330	37699655	2.78283022102984e-05	37706063	37720697
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	37718969	154442377	32037	31287	0.9627	2.78283022102984e-05	37706063	37720697	4.16540563566126e-11	154441943	154442377
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	2.18	4.16540563566126e-11	154441943	154442377	2.07179407612227e-17	154450309	154450309
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.0222	2.07179407612227e-17	154450309	154450309	4.11986462348823e-86	154578922	154582414
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.045	4.11986462348823e-86	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	125	-4.6544	NA	NA	NA	1.09773875333889e-29	4174561	4413507
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.355	1.09773875333889e-29	4174561	4413507	8.15103328835438e-12	4948824	6688691
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-4.2279	8.15103328835438e-12	4948824	6688691	1.39291136888649e-06	7020318	7228333
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	116	-3.3133	1.39291136888649e-06	7020318	7228333	4.73918131973556e-06	7313003	7572591
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7726921	83	83	-4.3253	4.73918131973556e-06	7313003	7572591	5.29387510341313e-06	7713973	7734410
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7729757	7782532	17	14	-2.8722	5.29387510341313e-06	7713973	7734410	0.000646717041346148	7751430	7806605
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7870400	33	32	-4.1823	0.000646717041346148	7751430	7806605	1.11119227494137e-05	7859390	7895945
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7893056	7914104	7	7	-2.1384	1.11119227494137e-05	7859390	7895945	8.89588276025674e-07	7911990	7926989
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10501368	383	363	-4.2704	8.89588276025674e-07	7911990	7926989	0.155104250874509	10050351	10511255
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10503821	10515697	7	6	-3.2036	0.155104250874509	10050351	10511255	1.05724381384753e-19	10515697	10515697
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10535786	1	0	NA	1.05724381384753e-19	10515697	10515697	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10537808	10645500	11	10	-0.3785	NA	NA	NA	2.81691005069153e-07	10645500	12452734
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	65	-3.0662	2.81691005069153e-07	10645500	12452734	0.000586403617053381	12599162	12745259
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12928074	57	52	-4.09	0.000586403617053381	12599162	12745259	2.04513268034441e-12	12919413	12960717
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12939004	13128515	78	75	-2.538	2.04513268034441e-12	12919413	12960717	1.22929543948406e-09	13101234	13138841
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13262997	46	43	-3.9931	1.22929543948406e-09	13101234	13138841	0.0299158731756284	13150942	13405447
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	14342834	363	352	-4.4614	0.0299158731756284	13150942	13405447	3.86174080624226e-08	14262916	14411113
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	89	-3.7857	3.86174080624226e-08	14262916	14411113	8.00146860916987e-10	14498784	14530328
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	24	-1.8551	8.00146860916987e-10	14498784	14530328	1.22644323779969e-19	14559651	14587291
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15920478	418	396	-4.1691	1.22644323779969e-19	14559651	14587291	1.62593332500240e-05	15848986	15937162
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15928904	15975479	18	17	-2.749	1.6259333250024e-05	15848986	15937162	2.53423773988379e-07	15970911	15982684
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15977755	16035717	24	24	-4.2818	2.53423773988379e-07	15970911	15982684	3.5643962892446e-07	16027648	16035717
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16042966	6	6	-1.9347	3.5643962892446e-07	16027648	16035717	6.69560707697515e-07	16042966	16062175
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	19610243	490	478	-4.2725	6.69560707697515e-07	16042966	16062175	4.22141921961848e-06	19608039	19610243
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.479	4.22141921961848e-06	19608039	19610243	2.39595373389419e-06	19613864	19614809
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21036411	291	274	-4.3638	2.39595373389419e-06	19613864	19614809	2.98079708637581e-07	21028489	21036503
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-2.1207	2.98079708637581e-07	21028489	21036503	8.39286484495563e-08	21054519	21059229
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21689031	164	157	-4.4011	8.39286484495563e-08	21054519	21059229	8.79827399147685e-05	21666200	21692175
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21691199	21761022	12	12	-3.0376	8.79827399147685e-05	21666200	21692175	1.90590071232230e-07	21752451	21776479
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21763911	22139807	85	80	-4.4637	1.9059007123223e-07	21752451	21776479	4.01266532286224e-09	22056953	22165808
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.5867	4.01266532286224e-09	22056953	22165808	7.01796852675479e-09	22175425	22179794
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	91	-4.5549	7.01796852675479e-09	22175425	22179794	5.63809935469636e-61	25737663	26873861
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26870361	1	0	NA	5.63809935469636e-61	25737663	26873861	NA	NA	NA
MSK_252152912793_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26871442	57440809	83	76	-1.353	NA	NA	NA	NA	NA	NA
