Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16799711	5783	5683	0.0168	NA	NA	NA	4.28689416178069e-13	16698906	16816180
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16814050	16963812	12	12	-0.4444	4.28689416178069e-13	16698906	16816180	3.03092983091788e-13	16926444	17086698
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	34869589	7099	6961	0.0131	3.03092983091788e-13	16926444	17086698	1.47942480156256e-16	34859068	34869589
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.8676	1.47942480156256e-16	34859068	34869589	2.41082416710712e-16	34883375	34884849
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14705	-8e-04	2.41082416710712e-16	34883375	34884849	0	72537426	72537426
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	9	-3.9298	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	78420864	1944	1903	-0.0134	0	72579311	72579311	1.06249635415085e-47	78420864	78420864
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	78422595	78424172	2	2	-2.1205	1.06249635415085e-47	78420864	78420864	3.43855609457419e-45	78424172	78424172
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	78431623	84484082	1542	1517	-0.0176	3.43855609457419e-45	78424172	78424172	1.67574997942930e-15	84484082	84484082
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84485205	84487429	2	2	-1.2095	1.6757499794293e-15	84484082	84484082	1.6286042672285e-16	84487429	84487429
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84488775	103932025	6628	6508	-0.0067	1.6286042672285e-16	84487429	84487429	8.85819585092575e-75	103932025	103932025
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103956767	103962495	2	2	-2.5466	8.85819585092575e-75	103932025	103932025	1.05040133684087e-64	103962495	103962495
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	110015739	1582	1556	-0.0128	1.05040133684087e-64	103962495	103962495	1.97251842891197e-15	110015739	110015739
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110023268	110041712	5	5	0.7556	1.97251842891197e-15	110015739	110015739	3.35753699286226e-16	110041712	110041712
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147326097	4561	4455	-0.0063	3.35753699286226e-16	110041712	110041712	2.36317239233001e-08	146294654	147427208
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147329819	147644831	31	31	0.2183	2.36317239233001e-08	146294654	147427208	1.34828531362108e-07	147438471	148125527
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147847659	150823073	1258	1225	0.0064	1.34828531362108e-07	147438471	148125527	1.34199955843786e-106	150823073	150823073
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	1.4362	1.34199955843786e-106	150823073	150823073	1.53442856030511e-60	150851439	150851439
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	78	0.0092	1.53442856030511e-60	150851439	150851439	2.0065648046117e-14	151024118	151026228
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.849	2.0065648046117e-14	151024118	151026228	2.31278249611272e-15	151036435	151038091
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2619	0.0049	2.31278249611272e-15	151036435	151038091	2.62889125728995e-25	157133150	157133150
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.5259	2.62889125728995e-25	157133150	157133150	4.04274579515168e-26	157136342	157136342
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4027	-0.0051	4.04274579515168e-26	157136342	157136342	0	167483267	167483267
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	7	-3.9341	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	194978218	9180	8991	-0.0119	0	167507898	167507898	6.76539283228207e-23	194977713	195009358
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.691	6.76539283228207e-23	194977713	195009358	1.87827125324246e-23	195062793	195091758
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	247186514	19605	19228	-0.0028	1.87827125324246e-23	195062793	195091758	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11333	-0.0054	NA	NA	NA	5.31594564131067e-178	34543992	34552935
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34551222	1	0	NA	5.31594564131067e-178	34543992	34552935	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34552935	34589997	17	16	1.4091	NA	NA	NA	6.17409910035519e-179	34583814	34589997
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	7066	0.0022	6.17409910035519e-179	34583814	34589997	1.90256571299516e-14	52588009	52600588
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.90256571299516e-14	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.817	NA	NA	NA	2.5496832069387e-14	52635695	52635695
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	146571330	26337	25780	-0.0049	2.5496832069387e-14	52635695	52635695	0	146571330	146571330
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.2705	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	149327840	661	646	-0.0048	0	146592775	146592775	1.25896455083070e-10	149324514	149327840
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	149330356	149335297	2	2	-0.9779	1.2589645508307e-10	149324514	149327840	3.32706651518289e-10	149335297	149338365
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	149338365	179767214	10541	10351	-0.0093	3.32706651518289e-10	149335297	149338365	5.01336423704144e-12	179767214	179767214
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.845	5.01336423704144e-12	179767214	179767214	2.58130782884855e-11	179778919	179778919
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242689978	21542	21086	-0.0022	2.58130782884855e-11	179778919	179778919	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10604	-0.0104	NA	NA	NA	2.00557786048492e-181	32074432	32074432
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.9669	2.00557786048492e-181	32074432	32074432	2.02942112952863e-177	32080848	32080848
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	133189686	32911	32259	-0.0064	2.02942112952863e-177	32080848	32080848	9.35360376888722e-12	133189686	133189686
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.0529	9.35360376888722e-12	133189686	133189686	3.98815682133763e-12	133194685	133194685
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	3.98815682133763e-12	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	163992903	9776	9581	-0.0043	NA	NA	NA	7.62405216383626e-107	163992903	164005577
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.4308	7.62405216383626e-107	163992903	164005577	0.000727680875515498	164001657	164036648
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.6289	0.000727680875515498	164001657	164036648	4.58162160866566e-44	164107951	164112873
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	9329	-0.0014	4.58162160866566e-44	164107951	164112873	7.34264494026824e-12	192544305	192546280
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.7477	7.34264494026824e-12	192544305	192546280	1.29695490286807e-11	192552734	192554451
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	199329592	2564	2508	2e-04	1.29695490286807e-11	192552734	192554451	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9406	-0.0089	NA	NA	NA	2.80051487877293e-13	34439897	34445002
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	0.6341	2.80051487877293e-13	34439897	34445002	3.27369912986902e-13	34491115	34506297
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	39380124	1522	1490	-0.0016	3.27369912986902e-13	34491115	34506297	4.06134592609842e-22	39380124	39380124
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39382435	39387900	4	4	-1.0009	4.06134592609842e-22	39380124	39380124	4.7511607575402e-23	39387900	39391819
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39391819	59698479	5358	5260	-0.0041	4.7511607575402e-23	39387900	39391819	1.49639883542510e-07	59687306	59698479
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	59705886	59732262	4	4	-0.5896	1.4963988354251e-07	59687306	59698479	1.04357329664784e-07	59732262	59745951
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	59739727	68905670	1975	1937	-0.0022	1.04357329664784e-07	59732262	59745951	9.0694794181611e-83	68905670	68905670
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	1.0002	9.0694794181611e-83	68905670	68905670	7.9881708704445e-84	69165814	69165814
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	78842923	3009	2944	-0.0083	7.9881708704445e-84	69165814	69165814	3.83967407361805e-11	78842923	78842923
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78846032	78847980	2	2	-1.0007	3.83967407361805e-11	78842923	78842923	1.17646603340509e-10	78847980	78847980
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78850888	107275274	9694	9514	-0.0102	1.17646603340509e-10	78847980	78847980	0	107275274	107275274
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-4.9549	0	107275274	107275274	0	107281410	107281410
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	119334954	3589	3525	-0.004	0	107281410	107281410	6.92571217180488e-160	119334954	119334954
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-3.0932	6.92571217180488e-160	119334954	119334954	7.91972295045093e-133	119348829	119348829
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	122500822	943	929	-0.0181	7.91972295045093e-133	119348829	119348829	1.22149384643873e-10	122499680	122500822
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122502339	122511771	4	4	-0.7454	1.22149384643873e-10	122499680	122500822	1.28696920655901e-11	122511771	122512921
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	122512921	152093694	7707	7565	-0.0091	1.28696920655901e-11	122511771	122512921	1.03468419644553e-13	152092912	152093694
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	152101303	152103171	3	3	-0.9283	1.03468419644553e-13	152092912	152093694	8.52262599491124e-14	152103171	152106790
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	152106790	173224400	6235	6119	-0.0097	8.52262599491124e-14	152103171	152106790	1.04024680048472e-41	173224400	173224400
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-1.9536	1.04024680048472e-41	173224400	173224400	2.05155176678739e-29	173228860	173228860
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	188	6e-04	2.05155176678739e-29	173228860	173228860	2.40094905583980e-97	173660684	173660684
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.719	2.4009490558398e-97	173660684	173660684	3.96996804058142e-86	173666072	173666072
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5218	-0.0104	3.96996804058142e-86	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	681141	197	195	-0.0288	NA	NA	NA	7.71380557184107e-09	678417	681141
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	0.936	7.71380557184107e-09	678417	681141	6.14880820261205e-07	686701	686701
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	776194	24	24	0.06	6.14880820261205e-07	686701	686701	2.78481294461985e-13	737829	776194
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	812169	873365	7	7	-0.6446	2.78481294461985e-13	737829	776194	2.39591537788401e-16	873365	905462
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	7222660	1943	1912	-0.0029	2.39591537788401e-16	873365	905462	2.60452351974500e-19	7222660	7222660
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7232549	7246064	4	4	-0.9218	2.604523519745e-19	7222660	7222660	1.51402384460262e-19	7246064	7246064
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7253683	12857302	1798	1768	-0.0048	1.51402384460262e-19	7246064	7246064	9.94792768232403e-09	12857302	12857302
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	0.8744	9.94792768232403e-09	12857302	12857302	1.69237496942675e-08	12873052	12873052
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	28670737	3974	3909	-0.0117	1.69237496942675e-08	12873052	12873052	1.59020478402318e-10	28667337	28685584
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	28674607	28691349	6	6	-0.5795	1.59020478402318e-10	28667337	28685584	6.7638436805049e-11	28676439	28701361
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	28695400	59745401	8316	8163	-0.0085	6.7638436805049e-11	28676439	28701361	5.78473996627828e-49	59742717	59745401
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59749078	59808838	25	24	0.5819	5.78473996627828e-49	59742717	59745401	8.64779902418928e-47	59808838	59811658
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59811658	80569341	6393	6271	-0.0044	8.64779902418928e-47	59808838	59811658	9.9229808311776e-36	80569341	80569341
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	80570920	80580381	6	6	-1.0308	9.9229808311776e-36	80569341	80569341	1.82196398815239e-36	80580381	80580381
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	80583260	120444524	10732	10509	-0.0094	1.82196398815239e-36	80580381	80580381	2.96126345701029e-27	120444524	120444524
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	120454795	120489243	5	5	-0.9798	2.96126345701029e-27	120444524	120444524	4.14086157857271e-29	120489243	120489243
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	120495666	125967001	1353	1331	-0.0143	4.14086157857271e-29	120489243	120489243	4.75625209528382e-28	125964315	125967001
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	125969301	125980892	6	6	-0.8802	4.75625209528382e-28	125964315	125967001	1.33735966793688e-25	125980892	125983568
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	125983568	180644810	18973	18616	-4e-04	1.33735966793688e-25	125980892	125983568	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	31382291	11180	10954	-0.0035	NA	NA	NA	2.06582739910516e-11	31382291	31382291
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31385778	2	2	-1.0364	2.06582739910516e-11	31382291	31382291	7.85472294831567e-09	31385778	31385778
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	0.5117	7.85472294831567e-09	31385778	31385778	1.12199067995417e-08	31390982	31425144
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32548736	488	481	0.0094	1.12199067995417e-08	31390982	31425144	6.88247272885617e-32	32543054	32600962
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32633691	18	14	-0.6654	6.88247272885617e-32	32543054	32600962	1.45829381631717e-07	32605300	32634977
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.0144	1.45829381631717e-07	32605300	32634977	5.90158677365818e-07	32713363	32728285
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32739800	14	14	-0.9061	5.90158677365818e-07	32713363	32728285	4.80458843182372e-62	32723722	32739800
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32742767	47830399	6187	6077	0.0074	4.80458843182372e-62	32723722	32739800	7.55465600710709e-11	47828258	47833813
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	47833813	47836649	3	3	-0.8246	7.55465600710709e-11	47828258	47833813	1.76392337774509e-10	47835333	47840368
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	47840368	72919733	6601	6472	-0.0136	1.76392337774509e-10	47835333	47840368	2.94003388484356e-21	72919733	72919733
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-1.1496	2.94003388484356e-21	72919733	72919733	6.5333760764168e-23	72924440	72924440
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	74647491	750	732	0.001	6.5333760764168e-23	72924440	72924440	0	74647491	74647491
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	-5.532	0	74647491	74647491	0	74653360	74653360
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	79018959	1142	1122	-0.0049	0	74653360	74653360	1.07734456274426e-10	79005118	79035891
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79105311	16	15	0.3625	1.07734456274426e-10	79005118	79035891	1.70464807037133e-11	79085247	79127731
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79112799	102039635	6269	6155	-0.0062	1.70464807037133e-11	79085247	79127731	9.74769045755802e-11	102036719	102039635
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-0.8035	9.74769045755802e-11	102036719	102039635	7.32354695614039e-11	102044331	102046884
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	477	0.0093	7.32354695614039e-11	102044331	102046884	6.35677514240549e-17	103841482	103841482
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.8836	6.35677514240549e-17	103841482	103841482	2.51747656421507e-17	103868154	103868154
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	132154299	9540	9356	-0.0092	2.51747656421507e-17	103868154	103868154	1.91238811412453e-10	132154299	132154299
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132156778	132159522	2	2	-1.0024	1.91238811412453e-10	132154299	132154299	2.90256034214900e-11	132159522	132159522
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132161292	139643729	2838	2787	-0.0091	2.902560342149e-11	132159522	132159522	5.25876721536999e-17	139643729	139643729
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-0.9977	5.25876721536999e-17	139643729	139643729	7.04881555811777e-16	139648318	139648318
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	170753106	10531	10352	-0.0056	7.04881555811777e-16	139648318	139648318	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	38248761	13595	13350	-0.0021	NA	NA	NA	8.59705558626843e-11	38225937	38270942
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38251281	38335964	43	43	0.221	8.59705558626843e-11	38225937	38270942	3.58623058911102e-11	38320617	38378554
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	100380806	17520	17194	-8e-04	3.58623058911102e-11	38320617	38378554	9.26157527432182e-07	100366682	100382347
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100382347	100409126	13	13	-0.3216	9.26157527432182e-07	100366682	100382347	2.19124388438908e-06	100405440	100434685
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100411645	119873687	8593	8402	-0.0125	2.19124388438908e-06	100405440	100434685	7.22570535282665e-10	119873687	119873687
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	119875263	119879200	3	2	-0.9752	7.22570535282665e-10	119873687	119873687	7.29099494606672e-10	119879200	119883341
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	119883341	133433384	6328	6189	-0.0106	7.29099494606672e-10	119879200	119883341	1.07802866664754e-16	133432281	133433384
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.609	1.07802866664754e-16	133432281	133433384	1.05508066152769e-16	133448277	133453811
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3770	-0.001	1.05508066152769e-16	133448277	133453811	7.12975894089678e-34	141690753	141690753
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141698634	1	0	NA	7.12975894089678e-34	141690753	141690753	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141700432	141714168	9	9	0.8115	NA	NA	NA	5.69089443954968e-20	141714168	141720324
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	5.69089443954968e-20	141714168	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142156165	167	163	0.0874	NA	NA	NA	7.1201643417681e-82	142156165	142159173
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142167908	5	5	-2.4488	7.1201643417681e-82	142156165	142159173	3.65751327731572e-127	142167901	142167908
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	143500499	485	480	-0.0117	3.65751327731572e-127	142167901	142167908	8.26578706165334e-14	143497023	143503317
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143503317	143706194	6	6	-0.6596	8.26578706165334e-14	143497023	143503317	1.56283185614591e-12	143705425	143709272
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143709272	147702365	1848	1818	-0.0125	1.56283185614591e-12	143705425	143709272	2.28870868212911e-21	147702365	147702365
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.4766	2.28870868212911e-21	147702365	147702365	2.15885142717913e-22	147707161	147707161
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4143	-0.0035	2.15885142717913e-22	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	115	0.0025	NA	NA	NA	2.96029603150447e-100	581533	581533
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.3279	2.96029603150447e-100	581533	581533	1.01930204935662e-124	588865	588865
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	9533226	2763	2717	-0.0108	1.01930204935662e-124	588865	588865	1.54482014606577e-09	9510433	9549606
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9575624	18	17	-0.337	1.54482014606577e-09	9510433	9549606	3.3937576787559e-09	9548146	9584480
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9577405	15444819	2161	2123	-8e-04	3.3937576787559e-09	9548146	9584480	8.39644375025878e-20	15441143	15444819
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15446571	15457778	6	6	-0.812	8.39644375025878e-20	15441143	15444819	1.14117049811740e-20	15457778	15464010
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15464010	25120552	3090	3038	-9e-04	1.1411704981174e-20	15457778	15464010	3.08491822600428e-91	25120552	25120552
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	2.382	3.08491822600428e-91	25120552	25120552	1.77989712462370e-78	25125700	25125700
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	25463846	163	159	-0.0118	1.7798971246237e-78	25125700	25125700	3.47338495413075e-15	25463846	25467611
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25467611	25470598	3	3	-1.0952	3.47338495413075e-15	25463846	25467611	1.26563628739010e-19	25469017	25470598
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25472648	39350798	4746	4670	-0.0022	1.2656362873901e-19	25469017	25470598	1.94675528921171e-143	39345557	39352361
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.6678	1.94675528921171e-143	39345557	39352361	1.47031605966546e-141	39504332	39508035
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	51345531	2236	2200	-0.0052	1.47031605966546e-141	39504332	39508035	2.13294232855354e-20	51345531	51345531
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51348335	51359923	5	5	0.8609	2.13294232855354e-20	51345531	51345531	8.50290197095499e-21	51359923	51359923
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51361569	146264846	29192	28585	-0.0095	8.50290197095499e-21	51359923	51359923	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	4249876	1540	1526	-0.0223	NA	NA	NA	2.48543951925174e-38	4249876	4249876
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4252004	4265023	8	8	-0.96	2.48543951925174e-38	4249876	4249876	2.84864085880207e-44	4265023	4265023
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4267561	11267711	2532	2490	-0.0056	2.84864085880207e-44	4265023	4265023	9.97302925100664e-199	11267711	11267711
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11279107	11558441	33	32	-1.0181	9.97302925100664e-199	11267711	11267711	1.29118055459659e-185	11558441	11558441
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11563531	15802255	1345	1324	-0.0119	1.29118055459659e-185	11558441	11558441	3.22761597544383e-19	15802255	15802255
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15813356	3	3	1.0459	3.22761597544383e-19	15802255	15802255	7.04358450759595e-19	15813356	15813356
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813954	22477358	2376	2325	-0.0121	7.04358450759595e-19	15813356	15813356	9.7638017305764e-27	22477358	22477358
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.5205	9.7638017305764e-27	22477358	22477358	2.56512058848699e-40	22492603	22492603
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	159	-0.0235	2.56512058848699e-40	22492603	22492603	0	23343915	23343915
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.8789	0	23343915	23343915	5.42916323665818e-252	23365926	23365926
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39146895	4728	4619	-0.0067	5.42916323665818e-252	23365926	23365926	3.47418235043403e-148	39146895	43445839
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43599449	3	3	-3.0377	3.47418235043403e-148	39146895	43445839	0.00451960619163996	43530076	43599449
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	47002187	6	5	-0.5172	0.00451960619163996	43530076	43599449	0.00133523525330113	43776365	66245109
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	66245109	67942846	13	13	-0.0971	0.00133523525330113	43776365	66245109	1.25126930139683e-06	67927172	68483889
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	68483889	70217543	7	6	-0.5173	1.25126930139683e-06	67927172	68483889	2.94222328458052e-09	70215204	70223138
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70221479	70926188	312	308	-0.0039	2.94222328458052e-09	70215204	70223138	1.11318550572854e-16	70926188	70926188
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.2361	1.11318550572854e-16	70926188	70926188	7.71907635169404e-16	70930528	70930528
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	77192566	2337	2283	-0.0073	7.71907635169404e-16	70930528	70930528	0	77192566	77192566
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77194207	77200826	3	3	-5.7871	0	77192566	77192566	0	77200826	77200826
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77202889	127396727	17369	17033	-0.004	0	77200826	77200826	4.07614749272645e-13	127396727	127396727
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	127399643	127402894	2	2	-1.1076	4.07614749272645e-13	127396727	127396727	5.98774369365401e-13	127402894	127402894
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	127406257	127406257	1	0	NA	5.98774369365401e-13	127402894	127402894	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	127407472	134612031	3037	2969	0.0181	NA	NA	NA	3.52567389780386e-15	134612031	134612031
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134613502	134616971	3	3	-0.9741	3.52567389780386e-15	134612031	134612031	2.63952001226204e-14	134616971	134616971
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134619449	140145683	2118	2075	0.0161	2.63952001226204e-14	134616971	134616971	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	130325	3	3	-0.9006	NA	NA	NA	4.42397229377190e-13	130325	133799
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	133799	27038538	9726	9537	-0.0035	4.4239722937719e-13	130325	133799	8.95053788811097e-27	27038538	27038538
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.547	8.95053788811097e-27	27038538	27038538	2.52264354590321e-25	27041812	27041812
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	46384985	4727	4635	0.0016	2.52264354590321e-25	27041812	27041812	1.24793954740833e-34	45478103	46393097
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46388078	46568496	71	71	0.306	1.24793954740833e-34	45478103	46393097	7.22226606048624e-38	46552024	47058901
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47017598	132797428	29343	28781	-0.0051	7.22226606048624e-38	46552024	47058901	9.55109495237873e-10	132797428	132797428
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	0.9686	9.55109495237873e-10	132797428	132797428	8.71461356387757e-08	132801463	132802775
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	134739406	723	711	0.0042	8.71461356387757e-08	132801463	132802775	8.51177396108962e-09	134739406	134739406
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	1.0266	8.51177396108962e-09	134739406	134739406	2.24323350856756e-06	134743423	134746574
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	207	0.032	2.24323350856756e-06	134743423	134746574	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1743	0.01	NA	NA	NA	9.80000746037016e-13	4920907	4923300
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.6996	9.80000746037016e-13	4920907	4923300	9.27810847007575e-13	4932214	4934594
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5738494	360	353	-0.0191	9.27810847007575e-13	4932214	4934594	1.21370622473754e-08	5727997	5742476
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5765438	16	16	0.3	1.21370622473754e-08	5727997	5742476	6.07851249850375e-08	5762182	5777496
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	20799632	5993	5858	-0.0083	6.07851249850375e-08	5762182	5777496	3.16161490550034e-19	20799632	20799632
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20801973	20806094	3	3	-1.091	3.16161490550034e-19	20799632	20799632	5.60482394548446e-19	20806094	20806094
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20809631	49666382	8569	8411	-0.0073	5.60482394548446e-19	20806094	20806094	1.78502362503304e-19	49663240	49666382
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49671267	49701463	8	8	-0.6793	1.78502362503304e-19	49663240	49666382	4.88447950452658e-21	49701463	49710027
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49710027	55124730	181	178	-0.0108	4.88447950452658e-21	49701463	49710027	8.44721493328887e-23	55114405	55131703
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55127355	55197848	31	31	-0.3975	8.44721493328887e-23	55114405	55131703	2.94829016593467e-28	55193014	55203706
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	66463477	4644	4560	0.0113	2.94829016593467e-28	55193014	55203706	3.31948470616750e-73	66463477	66463477
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.5528	3.3194847061675e-73	66463477	66463477	2.00045551229717e-71	66469412	66469412
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	107284914	13645	13375	-0.0046	2.00045551229717e-71	66469412	66469412	2.05577189491551e-307	107284914	107284914
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-5.2666	2.05577189491551e-307	107284914	107284914	0	107292148	107292148
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	123444993	5941	5840	-1e-04	0	107292148	107292148	1.21736867012029e-11	123444993	123444993
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	123447609	123449698	2	2	-1.0165	1.21736867012029e-11	123444993	123444993	1.46835823345007e-10	123449698	123452977
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	123452977	134450318	4130	4053	-0.0191	1.46835823345007e-10	123449698	123452977	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	7891273	3248	3193	-0.0115	NA	NA	NA	3.96703881142767e-11	7865499	7905005
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7894681	7978723	35	34	0.2381	3.96703881142767e-11	7865499	7905005	9.21521889375518e-10	7962973	8009244
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7979868	11116883	1046	1016	0.0018	9.21521889375518e-10	7962973	8009244	1.70446103616411e-113	11116883	11116883
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	5	-2.0451	1.70446103616411e-113	11116883	11116883	1.82043228301871e-118	11140421	11140421
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	118923305	35895	35250	-0.005	1.82043228301871e-118	11140421	11140421	4.82992661038952e-06	118921998	118923305
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	118924623	118925820	2	2	-0.7923	4.82992661038952e-06	118921998	118923305	1.54928889352893e-10	118925820	118929474
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	118929474	130694393	4282	4191	0.0079	1.54928889352893e-10	118925820	118929474	1.85318590678135e-10	130690343	130694393
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.9082	1.85318590678135e-10	130690343	130694393	1.38949481818458e-08	130701040	130718440
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	620	0.0058	1.38949481818458e-08	130701040	130718440	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7189	-0.0055	NA	NA	NA	1.35443983027576e-48	37953582	37953582
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-2.1259	1.35443983027576e-48	37953582	37953582	2.36602299961361e-51	37957844	37957844
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4800	-0.0071	2.36602299961361e-51	37957844	37957844	7.19212047003509e-18	49964838	49964838
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	1.2403	7.19212047003509e-18	49964838	49964838	1.00516143011713e-16	49971732	49971732
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1780	-0.0112	1.00516143011713e-16	49971732	49971732	8.77338155066994e-17	56646284	56660235
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56685341	14	13	-0.5055	8.77338155066994e-17	56646284	56660235	4.32111545255284e-18	56680346	56688605
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	100690991	13040	12806	-0.0065	4.32111545255284e-18	56680346	56688605	1.41794797734298e-17	100690991	100690991
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.2472	1.41794797734298e-17	100690991	100690991	1.01848531918034e-16	100693892	100693892
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4467	-0.009	1.01848531918034e-16	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	0.9106	NA	NA	NA	7.82654019836033e-21	18544772	18544772
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	21458875	1015	999	0.0146	7.82654019836033e-21	18544772	18544772	6.56512653737963e-59	21445390	21485351
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21461222	22047168	289	282	0.2426	6.56512653737963e-59	21445390	21485351	4.26080574274205e-95	22034704	22056148
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22048569	73071404	18110	17778	-0.0049	4.26080574274205e-95	22034704	22056148	1.37461991305633e-111	73071404	73075500
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	1.37461991305633e-111	73071404	73075500	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	-1.8284	NA	NA	NA	2.59797012677116e-70	73092018	73092112
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73307681	94	90	0.0669	2.59797012677116e-70	73092018	73092112	9.4414566407514e-16	73306411	73307681
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73309616	73315317	4	4	-0.7788	9.4414566407514e-16	73306411	73307681	1.47860297837037e-11	73315317	73317195
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73317195	75502058	1066	1046	0.0145	1.47860297837037e-11	73315317	73317195	1.40169319853058e-08	75500318	75502058
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	75504531	75506232	2	2	-0.9566	1.40169319853058e-08	75500318	75502058	1.99105227167327e-09	75506232	75506232
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	75507725	105597555	11049	10832	-0.0016	1.99105227167327e-09	75506232	75506232	0	105597555	105602602
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-3.6184	0	105597555	105602602	1.16950228847084e-132	105630089	105632168
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	47	0.0401	1.16950228847084e-132	105630089	105632168	1.18436761666583e-14	105848335	105850033
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881677	6	6	-0.6666	1.18436761666583e-14	105848335	105850033	1.46257717177496e-14	105881677	105881893
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881893	105964382	22	21	0.0237	1.46257717177496e-14	105881677	105881893	1.13995101819047e-07	105961558	105968122
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105966378	105989160	9	8	0.4826	1.13995101819047e-07	105961558	105968122	5.32508428863067e-08	105985422	105998412
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106358491	146	145	0.0253	5.32508428863067e-08	105985422	105998412	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19835471	107	105	-0.4524	NA	NA	NA	1.07652883626179e-75	19835471	19835471
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19844217	2	2	-4.1447	1.07652883626179e-75	19835471	19835471	1.2366136559501e-97	19844217	19844217
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	20088256	47	47	-0.5833	1.2366136559501e-97	19844217	19844217	1.1687945067695e-87	20079935	20308014
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	21116	-0.0017	1.1687945067695e-87	20079935	20308014	4.61414317236977e-27	74669752	74669752
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.1166	4.61414317236977e-27	74669752	74669752	5.23766824276085e-26	74680439	74680439
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	78855195	1660	1623	0.0021	5.23766824276085e-26	74680439	74680439	6.7016244551154e-13	78855195	78855195
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78856680	78858227	2	2	1.1234	6.7016244551154e-13	78855195	78855195	3.23590786561803e-15	78858227	78858227
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78861458	82332155	1132	1116	0.0052	3.23590786561803e-15	78858227	78858227	7.96521287372953e-15	82332155	82332155
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-1.0979	7.96521287372953e-15	82332155	82332155	3.25534053716419e-12	82334704	82334704
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	100298352	6811	6683	-0.007	3.25534053716419e-12	82334704	82334704	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	28512937	9615	9413	0.0015	NA	NA	NA	1.85842203766023e-10	28511295	28512937
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28523145	28529948	4	4	0.7176	1.85842203766023e-10	28511295	28512937	2.14302659448658e-14	28529948	28529948
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	28912454	84	82	-0.0093	2.14302659448658e-14	28529948	28529948	8.1058325425018e-10	28911314	28912454
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28913809	28915840	2	2	-0.8439	8.1058325425018e-10	28911314	28912454	4.67689170838135e-07	28915840	28918291
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28918291	33395114	892	879	0.0101	4.67689170838135e-07	28915840	28918291	3.89130468159033e-16	33320529	33445329
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33396966	33647856	22	22	-0.3782	3.89130468159033e-16	33320529	33445329	3.91562797045035e-17	33536526	33846647
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	33830585	1	0	NA	3.91562797045035e-17	33536526	33846647	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33841331	54352394	3076	3014	-0.0018	NA	NA	NA	9.01242597448577e-11	54343465	54363713
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.449	9.01242597448577e-11	54343465	54363713	4.07107825065746e-11	54366535	54399890
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	75093957	6817	6703	0.0021	4.07107825065746e-11	54366535	54399890	5.18237872063417e-55	75093957	75093957
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.7897	5.18237872063417e-55	75093957	75093957	2.26595814922932e-58	75100865	75100865
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	597	-0.0094	2.26595814922932e-58	75100865	75100865	1.48662881581398e-15	76923844	76931247
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.5656	1.48662881581398e-15	76923844	76931247	4.07523150241743e-13	76937156	76942679
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4434	0.0056	4.07523150241743e-13	76937156	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	15727076	6302	6179	0.0139	NA	NA	NA	1.01656309570259e-10	15727076	15727076
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	1.0365	1.01656309570259e-10	15727076	15727076	1.40023454213447e-11	15733964	15733964
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	15737241	1	0	NA	1.40023454213447e-11	15733964	15733964	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15742071	31457889	5732	5607	0.0107	NA	NA	NA	7.12215507962388e-29	31447686	31462463
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	18	-0.5217	7.12215507962388e-29	31447686	31462463	9.36301620927102e-31	31493990	31503774
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	34442393	848	829	0.0139	9.36301620927102e-31	31493990	31503774	2.93816263476299e-10	34440834	34442393
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34445816	34446608	2	2	-0.9131	2.93816263476299e-10	34440834	34442393	2.35492805278209e-09	34446608	34451067
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34451067	41522429	2985	2927	0.0266	2.35492805278209e-09	34446608	34451067	1.51632529386370e-122	41521544	41526558
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41526558	42142363	66	65	-0.5619	1.5163252938637e-122	41521544	41526558	9.21689771923602e-116	41710400	42143048
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42143048	78653545	13678	13377	0.0104	9.21689771923602e-116	41710400	42143048	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	172	0.0155	NA	NA	NA	3.10869360557149e-11	500897	500897
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	-1.0192	3.10869360557149e-11	500897	500897	7.31004356709388e-11	505456	506827
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	76116026	22787	22357	-0.0096	7.31004356709388e-11	505456	506827	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	212	0.0308	NA	NA	NA	3.86432391974197e-07	790492	790526
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	0.9406	3.86432391974197e-07	790492	790526	1.85114696953290e-07	794978	798817
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	3353960	1199	1168	0.0346	1.8511469695329e-07	794978	798817	6.06195514901868e-09	3349931	3353960
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	1.0238	6.06195514901868e-09	3349931	3353960	2.51933023366788e-10	3356334	3356334
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	63788698	21637	21201	0.015	2.51933023366788e-10	3356334	3356334	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	576	-0.002	NA	NA	NA	1.08258458092296e-75	1506379	1506379
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.2333	1.08258458092296e-75	1506379	1506379	3.41632848062581e-84	1532433	1532433
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20555	-0.0027	3.41632848062581e-84	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	43645627	11898	11673	-0.0053	NA	NA	NA	1.67583701100217e-12	43644038	43648176
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43648176	43661998	9	9	0.5065	1.67583701100217e-12	43644038	43648176	1.42674026508326e-10	43660918	43664367
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43663166	46922972	1534	1508	0.0146	1.42674026508326e-10	43660918	43664367	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16521073	406	399	0.0086	NA	NA	NA	0	16521073	16521073
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-5.3554	0	16521073	16521073	0	16524408	16524408
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	16998110	311	306	-0.0124	0	16524408	16524408	5.54138732436994e-12	16998110	16998110
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17000032	17001076	2	2	0.9797	5.54138732436994e-12	16998110	16998110	1.32087766256504e-09	17001076	17001076
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17006871	35472378	8831	8664	0.0102	1.32087766256504e-09	17001076	17001076	2.48837151702423e-21	35472378	35472378
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.4275	2.48837151702423e-21	35472378	35472378	9.47937411957943e-21	35476942	35476942
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	9.47937411957943e-21	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	47767302	6213	6085	0.0119	NA	NA	NA	1.91951012657716e-12	47767302	47767302
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47774814	47777763	3	3	-0.8923	1.91951012657716e-12	47767302	47767302	2.84129966383374e-11	47777763	47782744
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47782744	49571068	786	761	0.004	2.84129966383374e-11	47777763	47782744	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	0.0268	NA	NA	NA	6.57183729633764e-19	122273	127113
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	1.3184	6.57183729633764e-19	122273	127113	2.00392928641342e-36	129544	130528
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	2708291	1759	1734	-0.0019	2.00392928641342e-36	129544	130528	0	2708291	2712641
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	3588422	362	352	0.8487	0	2708291	2712641	2.18590119446131e-06	3587369	3588422
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3589914	3596261	2	2	-0.3408	2.18590119446131e-06	3587369	3588422	3.07439967660795e-13	3596261	3596261
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3598437	134584985	38658	37840	0.9572	3.07439967660795e-13	3596261	3596261	4.37853561517231e-19	134570023	134584985
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134585636	134627936	13	13	1.5614	4.37853561517231e-19	134570023	134584985	3.8884106002333e-20	134627936	134635130
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	134635130	154442377	6067	5945	0.9382	3.8884106002333e-20	134627936	134635130	1.09567465273692e-25	154442377	154442377
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154447839	2	2	-0.8535	1.09567465273692e-25	154442377	154442377	2.14721990815366e-11	154447839	154447839
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154449960	154450309	2	0	NA	2.14721990815366e-11	154447839	154447839	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	0.9085	NA	NA	NA	7.26128035029157e-104	154578922	154582414
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.0351	7.26128035029157e-104	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	117	-4.2054	NA	NA	NA	4.14284776764959e-37	3219200	3223585
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	4.14284776764959e-37	3219200	3223585	NA	NA	NA
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-1.1514	NA	NA	NA	7.77027209561079e-19	5531459	6652845
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	166	-3.8741	7.77027209561079e-19	5531459	6652845	2.26171970072759e-08	7019523	7191629
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7461576	123	117	-2.9717	2.26171970072759e-08	7019523	7191629	2.14873449052887e-08	7365306	7581867
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7709619	73	72	-4.1294	2.14873449052887e-08	7365306	7581867	9.00467190629839e-06	7685425	7740117
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7914104	67	65	-3.1217	9.00467190629839e-06	7685425	7740117	1.85514515387708e-07	7847379	7985527
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8538835	143	140	-3.9739	1.85514515387708e-07	7847379	7985527	2.04021245266882e-06	8474062	8550197
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8695195	58	57	-3.22	2.04021245266882e-06	8474062	8550197	3.77477266130949e-08	8678888	8730690
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8696392	10513747	188	177	-4.0982	3.77477266130949e-08	8678888	8730690	5.98474586753082e-32	10512616	10515697
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	11	-0.5383	5.98474586753082e-32	10512616	10515697	0.0568583261135355	10620136	11660512
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11698871	6	6	-2.4398	0.0568583261135355	10620136	11660512	0.0130889513805160	10655750	11698871
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12536761	10	9	-4.6718	0.013088951380516	10655750	11698871	6.07047214239166e-07	12536761	12545716
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	54	-2.4216	6.07047214239166e-07	12536761	12545716	6.42463583193529e-08	12649357	12710000
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-4.1402	6.42463583193529e-08	12649357	12710000	1.56281686041810e-05	12792780	12871057
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	109	-2.657	1.5628168604181e-05	12792780	12871057	0.0393293708205627	12978637	13149825
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13202163	28	27	-3.5085	0.0393293708205627	12978637	13149825	0.00232364838732654	13149825	13285595
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13208776	14122129	350	336	-4.1544	0.00232364838732654	13149825	13285595	3.79531447603296e-05	14118164	14122129
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.7574	3.79531447603296e-05	14118164	14122129	1.74075207640011e-06	14143748	14169526
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14353244	32	30	-4.3587	1.74075207640011e-06	14143748	14169526	0.0100125598027799	14330251	14451317
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14354682	14508021	92	91	-3.5867	0.0100125598027799	14330251	14451317	1.23079339622324e-06	14500052	14539230
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14572190	25	24	-2.0878	1.23079339622324e-06	14500052	14539230	9.9424686009651e-13	14557473	14596156
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	15915466	418	403	-3.9059	9.9424686009651e-13	14557473	14596156	0.000381532217966818	15552815	16018437
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16182565	108	102	-3.3618	0.000381532217966818	15552815	16018437	1.29000563056015e-12	16139806	16212418
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	19610243	431	418	-4.1582	1.29000563056015e-12	16139806	16212418	5.61940405568395e-07	19608039	19610243
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.4554	5.61940405568395e-07	19608039	19610243	1.33230067594914e-05	19613864	19614809
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22139807	559	534	-4.0075	1.33230067594914e-05	19613864	19614809	8.87751328754103e-09	22052726	22139807
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.9246	8.87751328754103e-09	22052726	22139807	7.28859250006315e-09	22177335	22177335
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-3.9818	7.28859250006315e-09	22177335	22177335	0.0381700356631166	22181855	22232997
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22308420	25	24	-4.8592	0.0381700356631166	22181855	22232997	4.02873704764934e-05	22249988	22400925
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22367156	25737663	65	58	-3.9776	4.02873704764934e-05	22249988	22400925	1.04794454019385e-77	25737663	25737663
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	30	-0.9848	1.04794454019385e-77	25737663	25737663	8.69699267554402e-23	26945893	26952278
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27000085	11	10	-3.6138	8.69699267554402e-23	26945893	26952278	1.63588606824108e-07	26995399	27000085
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27003308	27019256	6	6	-0.763	1.63588606824108e-07	26995399	27000085	1.07639761039293e-23	27019256	27019256
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.1325	1.07639761039293e-23	27019256	27019256	5.90891233347379e-35	27039222	27039222
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.5773	5.90891233347379e-35	27039222	27039222	1.22647140448917e-08	27137064	27167148
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-3.4499	1.22647140448917e-08	27137064	27167148	1.90799825970505e-09	27172283	27176933
MSK_252152912794_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.2526	1.90799825970505e-09	27172283	27176933	NA	NA	NA
