Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16704522	5781	5666	0.0135	NA	NA	NA	2.57866805009663e-11	16668773	16817525
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	16926444	12	12	-0.3853	2.57866805009663e-11	16668773	16817525	1.99078824619284e-11	16838573	16963812
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16961001	54862228	15231	14913	0.0118	1.99078824619284e-11	16838573	16963812	4.38938644578515e-14	54862228	54862228
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54864879	54866506	2	2	-1.0604	4.38938644578515e-14	54862228	54862228	9.24874489491824e-14	54866506	54866506
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54876067	72525842	6862	6721	-0.0102	9.24874489491824e-14	54866506	54866506	8.1506766054108e-41	72524413	72533804
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72579311	20	20	0.5541	8.1506766054108e-41	72524413	72533804	2.87901301237042e-43	72571158	72589682
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11476	-0.0101	2.87901301237042e-43	72571158	72589682	1.79831357934206e-25	110023268	110023268
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	0.9621	1.79831357934206e-25	110023268	110023268	2.04429470228525e-23	110041712	110041712
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	116029725	2221	2187	6e-04	2.04429470228525e-23	110041712	110041712	5.6426050623293e-11	116029725	116029725
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-0.9413	5.6426050623293e-11	116029725	116029725	7.55056652985012e-12	116033402	116033402
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	150819879	3626	3552	0.0058	7.55056652985012e-12	116033402	116033402	1.84131165865827e-304	150819879	150819879
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	1.9345	1.84131165865827e-304	150819879	150819879	1.72999836339353e-285	150852858	150852858
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	157133150	2760	2723	0.0064	1.72999836339353e-285	150852858	150852858	6.63036514993601e-27	157133150	157133150
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.4552	6.63036514993601e-27	157133150	157133150	7.93734033800141e-28	157136342	157136342
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1604	-0.0051	7.93734033800141e-28	157136342	157136342	9.8421365957341e-12	161099582	161099582
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-0.9446	9.8421365957341e-12	161099582	161099582	3.50985220443185e-11	161104791	161104791
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	185979586	9701	9530	-0.0093	3.50985220443185e-11	161104791	161104791	6.47961453110431e-70	185979586	185979586
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-2.3096	6.47961453110431e-70	185979586	185979586	1.26866079809377e-64	185988138	185988138
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1460	-0.0183	1.26866079809377e-64	185988138	185988138	5.71963871646273e-11	192715640	192715640
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	0.8848	5.71963871646273e-11	192715640	192715640	4.76783998347866e-10	192719540	192719540
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	196570662	1057	1036	0.0022	4.76783998347866e-10	192719540	192719540	2.02046550112063e-19	196570662	196570662
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196572806	196576204	3	3	-0.9893	2.02046550112063e-19	196570662	196570662	3.02862877597751e-17	196576204	196576204
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196578227	200613454	1588	1564	0.0045	3.02862877597751e-17	196576204	196576204	3.58771168994426e-09	200594055	200618814
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200665389	18	18	-0.2961	3.58771168994426e-09	200594055	200618814	1.26507809040570e-09	200654700	200676505
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	200667381	1	0	NA	1.2650780904057e-09	200654700	200676505	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	247186514	17423	17105	-0.0011	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11302	-0.0027	NA	NA	NA	3.40825135581613e-137	34543992	34543992
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	1.0764	3.40825135581613e-137	34543992	34543992	1.12140142315127e-117	34589997	34589997
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	471	-0.0076	1.12140142315127e-117	34589997	34589997	1.00318314104827e-15	35821494	35821494
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.1635	1.00318314104827e-15	35821494	35821494	5.29921236509402e-18	35844884	35844884
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	52600588	6706	6577	-0.0016	5.29921236509402e-18	35844884	35844884	1.10913720077868e-12	52588009	52600588
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.6215	1.10913720077868e-12	52588009	52600588	1.62583875751651e-12	52635695	52639605
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	76393140	8057	7904	-0.0015	1.62583875751651e-12	52635695	52639605	2.57415280749924e-29	76393140	76393140
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	76401064	76441763	5	5	-0.9405	2.57415280749924e-29	76393140	76393140	4.58716334050598e-27	76441763	76450708
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	76450708	79180906	794	776	-0.0041	4.58716334050598e-27	76441763	76450708	8.8431288670667e-13	79180906	79180906
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79182762	79182762	1	0	NA	8.8431288670667e-13	79180906	79180906	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79184112	79193832	4	4	0.7209	NA	NA	NA	1.98599954081793e-13	79193832	79193832
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79196200	154601442	19683	19320	-0.0039	1.98599954081793e-13	79193832	79193832	5.46729121692375e-13	154601442	154601442
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	1.0052	5.46729121692375e-13	154601442	154601442	2.13040563538256e-13	154606943	154606943
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	179767214	8999	8841	-0.0105	2.13040563538256e-13	154606943	154606943	0	179767214	179767214
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	-5.0884	0	179767214	179767214	0	179778919	179778919
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242501239	21475	21099	-0.0014	0	179778919	179778919	8.26997532373589e-313	242501239	242505261
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242682950	65	64	-0.8479	8.26997532373589e-313	242501239	242505261	0.000100495728169791	242677220	242682950
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242686945	242689978	2	2	-0.0856	0.000100495728169791	242677220	242682950	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460892	16218	15920	-0.0036	NA	NA	NA	1.09226787353522e-289	47460892	47460892
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.639	1.09226787353522e-289	47460892	47460892	7.9825783314134e-293	47466921	47466921
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	97788189	15134	14850	-0.001	7.9825783314134e-293	47466921	47466921	1.69050241914444e-42	97788189	97788189
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	97792616	97809064	6	6	-1.0298	1.69050241914444e-42	97788189	97788189	1.66244009891446e-39	97809064	97809064
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	97810540	99891210	823	801	-0.0094	1.66244009891446e-39	97809064	97809064	0	99891210	99891210
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-5.4747	0	99891210	99891210	0	99897201	99897201
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	163992903	21303	20905	-0.0055	0	99897201	99897201	0.000240668079480502	163987457	163992903
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	0.5081	0.000240668079480502	163987457	163992903	5.36946142234316e-14	164005577	164005577
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.373	5.36946142234316e-14	164005577	164005577	8.2862071724664e-20	164027724	164027724
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.5824	8.2862071724664e-20	164027724	164027724	8.80551561928907e-47	164105613	164112873
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	192546280	9548	9350	-0.0057	8.80551561928907e-47	164105613	164112873	8.8799756774825e-13	192544305	192546280
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-0.7063	8.8799756774825e-13	192544305	192546280	1.04604786525286e-11	192552734	192554451
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	196822133	1580	1555	-0.0087	1.04604786525286e-11	192552734	192554451	2.65495794199405e-28	196809098	196905767
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196961238	31	31	0.3798	2.65495794199405e-28	196809098	196905767	1.99944725565497e-26	196952514	196968244
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	932	0.0094	1.99944725565497e-26	196952514	196968244	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3338	0.0131	NA	NA	NA	2.20635265555799e-32	9815760	9815760
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	1.1703	2.20635265555799e-32	9815760	9815760	7.18373796520342e-38	9842644	9842644
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	92678951	23081	22649	-0.0124	7.18373796520342e-38	9842644	9842644	2.39233665198000e-16	92678951	92678951
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	92692317	92696451	2	2	-1.128	2.39233665198e-16	92678951	92678951	4.14091497806077e-16	92696451	92696451
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	92699481	175860235	24100	23645	-0.0107	4.14091497806077e-16	92696451	92696451	0	175860235	175860235
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	-5.4102	0	175860235	175860235	0	175863396	175863396
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	187330240	3336	3268	-0.0036	0	175863396	175863396	3.52560155996161e-317	187330240	187330240
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-4.7581	3.52560155996161e-317	187330240	187330240	1.92001201122455e-303	187333619	187333619
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190772330	1143	1127	-0.0069	1.92001201122455e-303	187333619	187333619	1.34997552890254e-17	190749363	190789240
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190777444	190921041	53	51	0.2255	1.34997552890254e-17	190749363	190789240	3.12034107335771e-10	190907865	190950585
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	45	-0.0082	3.12034107335771e-10	190907865	190950585	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	68785515	19014	18664	-0.0079	NA	NA	NA	2.21739933046529e-13	68785515	68785515
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68786286	68792873	3	3	-0.842	2.21739933046529e-13	68785515	68785515	5.18807819620553e-14	68792873	68796062
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68796062	102396822	9549	9376	-0.0063	5.18807819620553e-14	68792873	68796062	3.49361172388762e-41	102396822	102396822
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	102399965	102420380	6	6	-1.003	3.49361172388762e-41	102396822	102396822	5.49374673632802e-41	102420380	102420380
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	102423670	180342860	25074	24589	-5e-04	5.49374673632802e-41	102420380	102420380	4.0212403159242e-14	180192214	180342860
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180364670	10	10	-0.4659	4.0212403159242e-14	180192214	180342860	2.27248905557348e-10	180364670	180365977
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180365950	180644810	110	107	0.0023	2.27248905557348e-10	180364670	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	26811016	9365	9168	-0.0072	NA	NA	NA	1.08513936888240e-13	26801068	26811016
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.7362	1.0851393688824e-13	26801068	26811016	2.9044547459312e-14	26861184	26863540
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29941766	1216	1196	-0.0066	2.9044547459312e-14	26861184	26863540	1.47417815172911e-12	29927310	29985620
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29950805	30052053	27	25	0.273	1.47417815172911e-12	29927310	29985620	2.20902273491192e-10	30025480	30062908
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30053354	31385778	569	560	-0.0092	2.20902273491192e-10	30025480	30062908	8.67398298638111e-12	31383925	31389372
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.6071	8.67398298638111e-12	31383925	31389372	8.95223817391693e-11	31393624	31425113
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32711957	533	517	0.0041	8.95223817391693e-11	31393624	31425113	2.58068429159921e-11	32709263	32720656
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32728487	9	9	0.5239	2.58068429159921e-11	32709263	32720656	7.49178052609509e-13	32721872	32731072
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35862502	1346	1321	0.0161	7.49178052609509e-13	32721872	32731072	2.37919673482059e-10	35856922	35862502
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35878656	8	8	0.4961	2.37919673482059e-10	35856922	35862502	5.00623172835857e-13	35878656	35880489
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35880489	72917267	11442	11228	-0.0021	5.00623172835857e-13	35878656	35880489	1.29363331365609e-17	72916886	72917267
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72919733	72924440	4	4	-0.8156	1.29363331365609e-17	72916886	72917267	5.52540097661249e-17	72924440	72931542
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	77484980	1611	1581	-0.012	5.52540097661249e-17	72924440	72931542	0	77484980	77484980
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77490500	77490500	1	0	NA	0	77484980	77484980	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-4.7111	NA	NA	NA	0	77509983	77509983
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	79018959	279	274	-0.0322	0	77509983	77509983	1.00644015471784e-18	79011979	79024557
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79095415	14	14	0.4253	1.00644015471784e-18	79011979	79024557	1.50348878881533e-17	79091850	79105311
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79101978	94595241	4284	4216	-0.0082	1.50348878881533e-17	79091850	79105311	0	94595241	94604464
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	94604464	95318254	128	126	-0.9798	0	94595241	94604464	0	95311959	95318254
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	95332069	103841482	2349	2301	-0.004	0	95311959	95318254	7.61045890291144e-25	103841482	103841482
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.9411	7.61045890291144e-25	103841482	103841482	9.91373841420223e-23	103868154	103868154
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	110498221	2256	2198	-0.0052	9.91373841420223e-23	103868154	103868154	3.66864894850553e-44	110498221	110498221
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110503513	110520229	7	7	-0.9967	3.66864894850553e-44	110498221	110498221	5.00509547720354e-45	110520229	110520229
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110521603	139643729	10117	9916	-0.0114	5.00509547720354e-45	110520229	110520229	9.45181634533049e-13	139643729	139643729
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-0.8284	9.45181634533049e-13	139643729	139643729	6.30582612499528e-13	139648318	139648318
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	155159371	5241	5160	-0.0068	6.30582612499528e-13	139648318	139648318	5.41370667114639e-15	155159371	155159371
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155160734	155163895	3	3	-0.8886	5.41370667114639e-15	155159371	155159371	1.08818163064702e-14	155163895	155163895
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155165959	165643653	3479	3398	-0.0076	1.08818163064702e-14	155163895	155163895	3.49958324588229e-18	165643653	165643653
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.8386	3.49958324588229e-18	165643653	165643653	5.57005581869724e-18	165650610	165650610
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1775	-0.0067	5.57005581869724e-18	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	43205129	15295	15010	-0.0044	NA	NA	NA	2.45637510709307e-23	43203702	43205129
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43207998	43217398	6	6	-0.779	2.45637510709307e-23	43203702	43205129	1.13738055635788e-22	43217398	43220160
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43220160	69105046	5332	5245	0.0042	1.13738055635788e-22	43217398	43220160	1.15152906087923e-11	69103387	69105046
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	69107470	69115795	6	6	0.5727	1.15152906087923e-11	69103387	69105046	1.12722330767213e-12	69115795	69118997
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	69118997	109967918	14628	14336	-0.0034	1.12722330767213e-12	69115795	69118997	0	109967918	109967918
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-6.576	0	109967918	109967918	0	109974402	109974402
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3902	-0.0087	0	109974402	109974402	3.76493123364118e-10	118611324	118611324
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118619693	2	2	0.8596	3.76493123364118e-10	118611324	118611324	1.96298375357908e-09	118619693	118619693
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118620875	118620875	1	0	NA	1.96298375357908e-09	118619693	118619693	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3105	-0.0091	NA	NA	NA	3.18904370909190e-21	125831554	125831554
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.039	3.1890437090919e-21	125831554	125831554	6.30302297694801e-22	125837524	125837524
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3570	3e-04	6.30302297694801e-22	125837524	125837524	0	133433384	133433384
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-5.3539	0	133433384	133433384	0	133448277	133448277
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3638	-0.0012	0	133448277	133448277	1.74369913411365e-82	141410894	141410894
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	13	-0.9546	1.74369913411365e-82	141410894	141410894	9.21200493402396e-50	141440184	141440184
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	113	-0.0425	9.21200493402396e-50	141440184	141440184	4.68103513377997e-15	141689547	141700432
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141709835	7	7	0.6366	4.68103513377997e-15	141689547	141700432	7.9353130359108e-14	141706426	141711513
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141711513	142133796	164	162	0.0292	7.9353130359108e-14	141706426	141711513	8.89663865572974e-06	142097873	142161005
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142135117	142217406	27	26	0.2417	8.89663865572974e-06	142097873	142161005	9.27071384906609e-09	142202274	142235705
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142218998	158821263	6564	6439	-7e-04	9.27071384906609e-09	142202274	142235705	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	15951532	5202	5108	-0.0066	NA	NA	NA	7.51027881186276e-25	15951532	15951532
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15957300	15987191	5	5	-0.9086	7.51027881186276e-25	15951532	15951532	4.13074319243057e-18	15987191	15987191
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15990019	16000077	4	4	0.034	4.13074319243057e-18	15987191	15987191	1.80872440591500e-11	16000077	16000077
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16007459	16028363	11	11	0.6047	1.808724405915e-11	16000077	16000077	4.23003901353218e-27	16028363	16030618
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16030618	39345557	7851	7702	-0.0073	4.23003901353218e-27	16028363	16030618	1.00805801349401e-57	39339800	39352361
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39350798	39493887	55	53	-0.4129	1.00805801349401e-57	39339800	39352361	1.74139131393876e-58	39490826	39499752
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39497514	108566463	19959	19584	-0.0112	1.74139131393876e-58	39490826	39499752	5.25985981663695e-15	108566463	108566463
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	108570496	108574410	2	2	-1.079	5.25985981663695e-15	108566463	108566463	8.71681103345082e-15	108574410	108574410
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	108577665	146264846	11477	11262	-0.0048	8.71681103345082e-15	108574410	108574410	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7713	-0.0121	NA	NA	NA	8.81368457134385e-31	22477358	22477358
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.4942	8.81368457134385e-31	22477358	22477358	2.43974049169181e-29	22492603	22492603
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5119	-0.0022	2.43974049169181e-29	22492603	22492603	0	70926188	70926188
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-5.002	0	70926188	70926188	0	70930528	70930528
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	24367	0.0018	0	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	45489823	14457	14204	-0.0061	NA	NA	NA	6.47568951034244e-76	45480572	46389734
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46384985	47040444	75	75	0.3857	6.47568951034244e-76	45480572	46389734	3.86617913008929e-06	46529536	47072924
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47057097	47172534	45	45	0.5585	3.86617913008929e-06	46529536	47072924	3.08246634974969e-92	47167144	47938346
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47938346	82866553	11512	11294	-0.0019	3.08246634974969e-92	47167144	47938346	0	82866553	82866553
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82869426	82881204	6	6	-6.2037	0	82866553	82866553	0	82881204	82881204
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	82884042	94340717	3610	3556	-0.007	0	82881204	82881204	1.40216062674234e-20	94338275	94340717
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	94343730	94353740	4	4	-0.8846	1.40216062674234e-20	94338275	94340717	4.47746405080146e-20	94353740	94356407
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	94356407	100676022	2648	2591	0.0017	4.47746405080146e-20	94353740	94356407	2.8943579121661e-179	100676022	100676022
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686753	3	3	-3.1259	2.8943579121661e-179	100676022	100676022	1.01313280389098e-184	100686753	100686753
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	114100979	4627	4527	-1e-04	1.01313280389098e-184	100686753	100686753	3.71359044352328e-72	114100979	114100979
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-2.3922	3.71359044352328e-72	114100979	114100979	2.26658637279381e-76	114106460	114106460
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	114108041	1	0	NA	2.26658637279381e-76	114106460	114106460	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114109303	124328915	3939	3864	0.0021	NA	NA	NA	1.05060000477333e-12	124327243	124328915
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	-0.7931	1.05060000477333e-12	124327243	124328915	8.99583431550623e-11	124340356	124368725
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	135285645	3876	3802	0.0046	8.99583431550623e-11	124340356	124368725	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2095	0.0087	NA	NA	NA	1.07714627822547e-50	5738494	5741031
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5763749	14	14	-0.7845	1.07714627822547e-50	5738494	5741031	7.77386939610346e-51	5763749	5763749
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	6301891	229	227	-0.0248	7.77386939610346e-51	5763749	5763749	1.74091802973408e-09	6301891	6303665
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6303665	6306970	3	3	-0.7585	1.74091802973408e-09	6301891	6303665	1.41098240822543e-10	6305096	6306970
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6309611	55118214	14521	14251	-0.0037	1.41098240822543e-10	6305096	6306970	3.60833337401336e-79	55114405	55124730
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	0.5519	3.60833337401336e-79	55114405	55124730	1.07237051090232e-77	55205278	55217189
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	27814	7e-04	1.07237051090232e-77	55205278	55217189	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11104085	4324	4257	-9e-04	NA	NA	NA	6.22044470299264e-45	11104085	11109483
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11104973	11140421	12	12	0.7733	6.22044470299264e-45	11104085	11109483	1.04172094798894e-24	11128557	11143592
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	70	0.0152	1.04172094798894e-24	11128557	11143592	2.32743661158927e-07	11387995	11395862
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-0.4817	2.32743661158927e-07	11387995	11395862	2.29686886156148e-08	11435643	11452868
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	78676440	22142	21676	-0.0055	2.29686886156148e-08	11435643	11452868	5.06155743586601e-13	78675711	78676440
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78679297	78686371	4	4	0.7086	5.06155743586601e-13	78675711	78676440	5.4211913748782e-13	78686371	78688893
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	119423245	13903	13670	-0.0078	5.4211913748782e-13	78686371	78688893	1.27747153191760e-07	119423245	119423245
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	119426254	119429370	2	2	0.784	1.2774715319176e-07	119423245	119423245	2.60274788882465e-07	119429370	119430610
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	119430610	130943064	4146	4041	0.0013	2.60274788882465e-07	119429370	119430610	6.08293611712354e-11	130943064	130943064
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	0.9478	6.08293611712354e-11	130943064	130943064	7.09358041344158e-10	130946248	130946248
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	539	-0.0027	7.09358041344158e-10	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7201	-0.0049	NA	NA	NA	4.46332984862429e-12	37953582	37953582
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	0.9728	4.46332984862429e-12	37953582	37953582	5.7881445542304e-13	37957844	37957844
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56650373	6685	6557	-0.0106	5.7881445542304e-13	37957844	37957844	5.39498915514341e-18	56610886	56660235
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	15	0.4103	5.39498915514341e-18	56610886	56660235	3.0620761057693e-20	56681665	56688605
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	57484503	206	202	-0.0115	3.0620761057693e-20	56681665	56688605	1.52453394397981e-13	57484503	57484503
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	57489902	57497079	2	2	-0.9014	1.52453394397981e-13	57484503	57484503	3.80383813256557e-10	57497079	57497079
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	57500241	71375082	3414	3358	-0.0072	3.80383813256557e-10	57497079	57497079	1.19928618849997e-86	71375082	71375082
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-2.6628	1.19928618849997e-86	71375082	71375082	4.33046676530071e-94	71377671	71377671
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13698	-0.008	4.33046676530071e-94	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	-0.6322	NA	NA	NA	1.17246326587643e-21	18537177	18798641
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	53	0.1822	1.17246326587643e-21	18537177	18798641	1.42065932020646e-10	19467512	19556419
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	105606424	31584	30979	0.0011	1.42065932020646e-10	19467512	19556419	6.31490657870159e-12	105597555	105607572
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105607572	105632168	10	10	-0.4391	6.31490657870159e-12	105597555	105607572	2.85338823397373e-05	105625010	105736025
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	48	-0.0414	2.85338823397373e-05	105625010	105736025	4.78450221011842e-06	105843086	105856972
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-0.5273	4.78450221011842e-06	105843086	105856972	7.88985295563056e-14	105875924	105897061
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105945006	15	13	0.0452	7.88985295563056e-14	105875924	105897061	6.76333335657016e-06	105923686	105964382
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	105998412	18	17	0.3668	6.76333335657016e-06	105923686	105964382	1.46635194869194e-11	105989160	106015449
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106002179	106218059	91	90	0.0198	1.46635194869194e-11	105989160	106015449	2.01560351123725e-13	106214372	106231012
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106279632	23	23	-0.3366	2.01560351123725e-13	106214372	106231012	2.49283163133329e-05	106253648	106287213
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106280415	106358491	29	29	-0.0147	2.49283163133329e-05	106253648	106287213	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18749895	8	8	-8e-04	NA	NA	NA	0.000181019352777804	18741716	18835660
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18810004	20088256	148	145	-0.4417	0.000181019352777804	18741716	18835660	1.79146833779401e-172	20053008	20310916
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	33463805	3988	3907	-0.0013	1.79146833779401e-172	20053008	20310916	1.02786063213403e-14	33463805	33463805
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	33471569	33471941	2	2	-1.0757	1.02786063213403e-14	33463805	33463805	1.83306715600762e-14	33471941	33471941
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	33473604	74669752	17565	17243	0.0018	1.83306715600762e-14	33471941	33471941	0	74669752	74671626
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.7246	0	74669752	74671626	3.80101007154461e-166	74680338	74680439
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	167	-0.0114	3.80101007154461e-166	74680338	74680439	1.31345881208037e-61	75115806	75115806
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.3895	1.31345881208037e-61	75115806	75115806	3.61063879146505e-75	75119713	75119713
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9271	-1e-04	3.61063879146505e-75	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2600740	1013	993	0.0215	NA	NA	NA	3.68668657334379e-08	2593067	2638581
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	0.7529	3.68668657334379e-08	2593067	2638581	1.58043119853196e-10	2638643	2639798
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	57203733	13893	13617	0.0053	1.58043119853196e-10	2638643	2639798	1.12001414948084e-88	57203733	57203733
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-2.5903	1.12001414948084e-88	57203733	57203733	2.26665904899552e-85	57206772	57206772
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68534408	3375	3311	0.0047	2.26665904899552e-85	57206772	57206772	1.71247334037152e-07	68524131	68687301
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68606309	68850394	29	28	-0.1805	1.71247334037152e-07	68524131	68687301	2.15801054404802e-07	68744086	68876125
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68851938	70162042	580	567	0.0303	2.15801054404802e-07	68744086	68876125	3.70492429139033e-10	70162042	70162042
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70164776	70166877	2	2	-0.863	3.70492429139033e-10	70162042	70162042	2.47016185600489e-10	70166877	70166877
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70168399	75092501	1625	1586	-0.0052	2.47016185600489e-10	70166877	70166877	1.00834459693742e-16	75092501	75092501
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75100865	4	4	0.7619	1.00834459693742e-16	75092501	75092501	2.42334354094286e-15	75100865	75100865
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	597	-0.0022	2.42334354094286e-15	75100865	75100865	4.92627946426935e-09	76922411	76931247
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.4162	4.92627946426935e-09	76922411	76931247	4.77469667186799e-08	76937156	76946579
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4416	0.002	4.77469667186799e-08	76937156	76946579	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11809	0.0103	NA	NA	NA	4.51510027446576e-22	31447686	31468896
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.4367	4.51510027446576e-22	31447686	31468896	6.53999522940756e-22	31492553	31891535
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1774	0.0109	6.53999522940756e-22	31492553	31891535	0	36673853	36673853
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-4.8439	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41518222	2010	1965	0.0261	0	36684619	36684619	3.53027554231983e-39	41508943	41521544
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41519702	41710400	68	66	0.3355	3.53027554231983e-39	41508943	41521544	7.56928766528721e-47	41706870	42147225
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52440878	3480	3415	0.0088	7.56928766528721e-47	41706870	42147225	6.17852919854479e-09	52438207	52440878
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-0.6737	6.17852919854479e-09	52438207	52440878	2.28050385737984e-08	52447064	52454171
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	78653545	10196	10013	0.0126	2.28050385737984e-08	52447064	52454171	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	36509250	10982	10765	-0.0082	NA	NA	NA	7.81943494194524e-122	36509250	36509250
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-3.014	7.81943494194524e-122	36509250	36509250	4.53867467782678e-112	36519728	36519728
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	49454374	4160	4077	-0.0107	4.53867467782678e-112	36519728	36519728	1.00019246930579e-11	49454374	49454374
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	49460662	49464433	2	2	-0.9608	1.00019246930579e-11	49454374	49454374	7.10320221549247e-12	49464433	49464433
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	49468722	53092949	1053	1028	-0.0109	7.10320221549247e-12	49464433	49464433	6.49093446405727e-53	53092949	53092949
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-2.1837	6.49093446405727e-53	53092949	53092949	1.87029027769592e-60	53099601	53099601
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6655	-0.0069	1.87029027769592e-60	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	7356211	3283	3202	0.0115	NA	NA	NA	1.28109289927857e-08	7356211	7356211
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7357939	7359006	2	2	-0.882	1.28109289927857e-08	7356211	7356211	5.37575912569591e-09	7359006	7359006
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7360730	19694025	5742	5620	0.0132	5.37575912569591e-09	7359006	7359006	1.98907468482951e-11	19692626	19694025
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	0.8316	1.98907468482951e-11	19692626	19694025	6.72407971026503e-12	19700620	19702214
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	55769042	10325	10131	0.0123	6.72407971026503e-12	19700620	19702214	1.06088854418463e-09	55769042	55769042
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-0.8996	1.06088854418463e-09	55769042	55769042	6.40071502344775e-10	55772729	55772729
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	58198955	1105	1078	-0.0039	6.40071502344775e-10	55772729	55772729	4.02100031379886e-07	58176026	58203159
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58201323	58244012	20	20	-0.2465	4.02100031379886e-07	58176026	58203159	4.68327557798943e-07	58239871	58264130
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	60716134	1107	1088	-3e-04	4.68327557798943e-07	58239871	58264130	1.33441384730300e-24	60716134	60716134
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60719936	60724720	3	3	-1.1586	1.334413847303e-24	60716134	60716134	7.63876163937852e-27	60724720	60724720
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60728591	63788698	1467	1433	-0.0031	7.63876163937852e-27	60724720	60724720	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	12719	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15778	312490	113	113	-0.0226	NA	NA	NA	6.9997800653375e-28	312490	312490
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	314877	325932	6	6	-0.9653	6.9997800653375e-28	312490	312490	8.85506559794447e-32	325932	325932
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	328788	1506379	466	457	0.0095	8.85506559794447e-32	325932	325932	0	1506379	1511632
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	7	-3.27	0	1506379	1511632	0	1528899	1531162
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	57731345	19033	18691	4e-04	0	1528899	1531162	1.58310641155472e-72	57731345	57731345
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	57732801	57748610	10	10	-1.0443	1.58310641155472e-72	57731345	57731345	7.63129371496635e-65	57748610	57748610
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	57750065	62419534	1941	1912	0.0119	7.63129371496635e-65	57748610	57748610	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13170	-0.0023	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	18125356	1132	1114	0.0086	NA	NA	NA	6.15741818489227e-24	18125356	18125356
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	-1.3248	6.15741818489227e-24	18125356	18125356	7.46463798899088e-21	18129194	18129194
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	22667608	1849	1815	0.0249	7.46463798899088e-21	18129194	18129194	4.18127006941969e-116	22667608	22667608
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.98	4.18127006941969e-116	22667608	22667608	1.13240785747034e-129	22725305	22725305
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	32110063	5042	4939	0.014	1.13240785747034e-129	22725305	22725305	1.09015755258453e-12	32110063	32110063
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-1.0088	1.09015755258453e-12	32110063	32110063	1.83855275903128e-12	32112051	32112051
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	49571068	8508	8331	0.0156	1.83855275903128e-12	32112051	32112051	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.0225	NA	NA	NA	4.10524205828075e-21	94062	94062
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	1.3017	4.10524205828075e-21	94062	94062	4.47726964859096e-71	104732	104732
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1571340	877	860	0.0184	4.47726964859096e-71	104732	104732	5.22476657530376e-13	1571340	1571340
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1572418	1572553	2	2	-1.0238	5.22476657530376e-13	1571340	1571340	2.42106082820730e-12	1572553	1572553
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1573461	2670510	872	862	0.0109	2.4210608282073e-12	1572553	1572553	7.52737637730994e-11	2666368	2674375
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2671030	2708291	29	29	-0.2482	7.52737637730994e-11	2666368	2674375	4.03272342996022e-206	2708291	2708291
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	52908484	17881	17538	0.9315	4.03272342996022e-206	2708291	2708291	9.86033343768699e-28	52908484	52908484
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	52909690	52909690	1	0	NA	9.86033343768699e-28	52908484	52908484	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	52921839	52921841	2	2	-0.1141	NA	NA	NA	1.25544647105537e-10	52921841	52921841
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	52968251	52968251	1	0	NA	1.25544647105537e-10	52921841	52921841	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	52971245	150892025	25893	25379	0.9321	NA	NA	NA	1.00773375647432e-12	150892025	150892025
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	150893197	150893705	2	2	-0.2046	1.00773375647432e-12	150892025	150892025	1.95716506812806e-10	150893705	150894325
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	150894325	154044828	1222	1198	0.9059	1.95716506812806e-10	150893705	150894325	5.01856776134042e-07	154031239	154044828
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154046681	154078401	9	8	1.3657	5.01856776134042e-07	154031239	154044828	9.81948752654453e-08	154056623	154085354
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154078819	154582414	123	117	0.9166	9.81948752654453e-08	154056623	154085354	2.8432256483277e-182	154582414	154582414
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154667352	54	54	-0.0597	2.8432256483277e-182	154582414	154582414	6.73700399218968e-40	154666428	154668774
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154668774	154689387	15	15	-0.9097	6.73700399218968e-40	154666428	154668774	8.62852258190048e-58	154688917	154698452
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154698452	154888224	132	130	-4e-04	8.62852258190048e-58	154688917	154698452	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	128	-4.7015	NA	NA	NA	5.43662824332015e-20	3780462	4421500
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	10	-1.7276	5.43662824332015e-20	3780462	4421500	2.62042256869972e-12	4948824	6652845
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	165	-4.4156	2.62042256869972e-12	4948824	6652845	9.31658353433298e-13	7030763	7190466
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7461576	123	122	-3.2631	9.31658353433298e-13	7030763	7190466	1.37521300997598e-07	7355550	7572591
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7709619	73	70	-4.4525	1.37521300997598e-07	7355550	7572591	0.0153257262231740	7660965	7835361
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8010446	89	85	-3.8466	0.015325726223174	7660965	7835361	3.61573207820396e-06	7918899	8048263
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8289709	63	57	-4.7285	3.61573207820396e-06	7918899	8048263	2.71237823664737e-09	8259766	8292347
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8316416	11	11	-3.351	2.71237823664737e-09	8259766	8292347	0.000338314366026743	8313045	8363122
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324291	10515697	294	285	-4.5507	0.000338314366026743	8313045	8363122	5.87623788299972e-54	10515697	10535786
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11698871	18	16	-0.9405	5.87623788299972e-54	10515697	10535786	2.93596060996294e-31	11673476	11698871
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-4.9474	2.93596060996294e-31	11673476	11698871	2.69400356350623e-06	12541506	12556034
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12625208	41	40	-2.6244	2.69400356350623e-06	12541506	12556034	0.000609061974268342	12585240	12700767
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12627138	12997864	94	92	-3.7037	0.000609061974268342	12585240	12700767	6.25584783750691e-11	12981244	13001517
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12999095	13045641	21	20	-1.6428	6.25584783750691e-11	12981244	13001517	1.29922725865845e-15	13035511	13045641
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13048283	13076862	12	11	-3.8338	1.29922725865845e-15	13035511	13045641	5.21778617588549e-15	13066849	13078432
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13077621	13121152	20	19	-2.2676	5.21778617588549e-15	13066849	13078432	9.99289385337816e-23	13119344	13129843
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13128515	13272362	50	47	-4.2571	9.99289385337816e-23	13119344	13129843	0.0459760306384409	13148290	13414670
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13279098	14359748	368	356	-4.6295	0.0459760306384409	13148290	13414670	7.3141885449831e-07	14321882	14425003
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14508021	88	84	-4.087	7.3141885449831e-07	14321882	14425003	7.73470416642409e-21	14503927	14508021
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14547168	13	11	-1.1697	7.73470416642409e-21	14503927	14508021	1.01521383180344e-13	14547168	14547168
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14554415	4	4	-4.7478	1.01521383180344e-13	14547168	14547168	9.86743859284505e-07	14554415	14557473
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14555872	14579298	9	9	-1.6034	9.86743859284505e-07	14554415	14557473	3.15768436320762e-12	14569287	14596156
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14581797	1	0	NA	3.15768436320762e-12	14569287	14596156	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14585542	15139441	112	108	-4.4296	NA	NA	NA	0.000171459402584791	15018205	15170627
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15284717	81	75	-3.6738	0.000171459402584791	15018205	15170627	1.70396138100017e-15	15274383	15287893
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15390599	68	67	-4.9333	1.70396138100017e-15	15274383	15287893	9.3825173811537e-07	15382506	15433122
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15396500	16195788	272	263	-4.1436	9.3825173811537e-07	15382506	15433122	0.0359832658645336	16018437	16218742
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16198927	16362978	41	37	-4.7361	0.0359832658645336	16018437	16218742	1.92180936009669e-07	16357759	16362978
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16371504	16387273	4	4	-2.697	1.92180936009669e-07	16357759	16362978	7.58527982044666e-08	16387273	16399608
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16679419	49	48	-4.922	7.58527982044666e-08	16387273	16399608	2.64723594748639e-10	16678578	16679419
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16680383	16705038	6	6	-2.7815	2.64723594748639e-10	16678578	16679419	3.53310244167358e-07	16689244	16719600
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16707690	17772524	167	162	-4.6906	3.53310244167358e-07	16689244	16719600	4.04360387681114e-07	17718554	17792907
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17775484	17822399	21	21	-3.6133	4.04360387681114e-07	17718554	17792907	7.59534718070738e-06	17804686	17841801
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17823594	19610243	134	131	-4.6231	7.59534718070738e-06	17804686	17841801	8.36570391489014e-13	19610243	19610243
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.2227	8.36570391489014e-13	19610243	19610243	5.51852105166674e-12	19613864	19614809
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22139807	559	524	-4.6521	5.51852105166674e-12	19613864	19614809	3.42873955038159e-09	22055660	22158616
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.7979	3.42873955038159e-09	22055660	22158616	1.39455376360962e-10	22175425	22181855
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	86	-4.7866	1.39455376360962e-10	22175425	22181855	7.35251316159262e-78	23283689	25737663
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26913408	18	17	-1.0244	7.35251316159262e-78	23283689	25737663	3.10607702956216e-08	26909069	26913408
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26915670	26920247	3	3	-2.5088	3.10607702956216e-08	26909069	26913408	2.20920701782138e-25	26920247	26920247
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26924187	26945893	10	10	-0.7789	2.20920701782138e-25	26920247	26920247	0.0113170233430285	26945893	27006628
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	20	-2.3449	0.0113170233430285	26945893	27006628	3.76324585366993e-05	27006628	27039222
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.4279	3.76324585366993e-05	27006628	27039222	3.0661669671429e-30	27137064	27137064
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27167148	2	2	-4.339	3.0661669671429e-30	27137064	27137064	3.19257797554982e-37	27167148	27167148
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27171797	27171797	1	0	NA	3.19257797554982e-37	27167148	27167148	NA	NA	NA
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27172283	27193424	5	5	-1.0114	NA	NA	NA	7.77586392011541e-14	27193424	27193424
MSK_252152912844_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	57411732	57440809	8	8	0.0135	7.77586392011541e-14	27193424	27193424	NA	NA	NA
