Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16236840	5586	5277	-0.3619	NA	NA	NA	9.49176410234616e-13	16225139	16242789
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16239639	16276091	14	13	0.1309	9.49176410234616e-13	16225139	16242789	1.26177525755015e-07	16270504	16288498
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16279764	16704522	181	171	-0.3176	1.26177525755015e-07	16270504	16288498	1.14649882689751e-17	16668773	16799711
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	17086698	16	16	-0.9398	1.14649882689751e-17	16668773	16799711	4.24015560419809e-17	16963812	17094475
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17094326	34869589	7097	6690	-0.3593	4.24015560419809e-17	16963812	17094475	6.09840448309965e-81	34869589	34869589
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34878816	2	2	-3.8719	6.09840448309965e-81	34869589	34869589	2.8163873854286e-105	34878816	34878816
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34881595	34883375	2	0	NA	2.8163873854286e-105	34878816	34878816	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	35684495	326	305	-0.3815	NA	NA	NA	0	35682995	35687109
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	35685975	41452247	2284	2140	0.2953	0	35682995	35687109	0	41443241	41457795
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	41453855	61961534	8160	7688	-0.3792	0	41443241	41457795	1.71164590487538e-15	61956609	61964044
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61964044	62002449	20	19	0.1069	1.71164590487538e-15	61956609	61964044	5.1546317848247e-15	61998688	62010429
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62004569	62004569	1	0	NA	5.1546317848247e-15	61998688	62010429	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62007388	62966057	424	393	-0.3623	NA	NA	NA	3.57844469711891e-08	62959598	62966057
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62971341	63001065	5	5	0.3109	3.57844469711891e-08	62959598	62966057	2.63362717431413e-09	63001065	63003119
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	63003119	72536231	3775	3527	-0.3797	2.63362717431413e-09	63001065	63003119	0	72536231	72536231
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72537426	1	0	NA	0	72536231	72536231	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-4.461	NA	NA	NA	0	72579311	72579311
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	81472004	2642	2487	-0.3858	0	72579311	72579311	2.61168918396821e-14	81469370	81472004
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	81474624	81481066	4	4	0.5424	2.61168918396821e-14	81469370	81472004	2.85502704389301e-13	81481066	81489610
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	81483462	81483462	1	0	NA	2.85502704389301e-13	81481066	81489610	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	81489610	108533257	8481	7958	-0.3821	NA	NA	NA	8.88118325659051e-180	108533257	108535814
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-4.244	8.8811832565905e-180	108533257	108535814	3.98217678029313e-117	108537259	108538662
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	109373255	275	263	-0.3625	3.98217678029313e-117	108537259	108538662	1.60976514542938e-58	109373255	109373255
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-3.2057	1.60976514542938e-58	109373255	109373255	1.65390993659124e-59	109376249	109376249
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109739852	133	125	-0.3392	1.65390993659124e-59	109376249	109376249	6.95649521163914e-06	109735805	109739852
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109741426	109743299	2	2	0.5715	6.95649521163914e-06	109735805	109739852	5.55903233711803e-06	109743299	109743299
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109745398	109987341	145	132	-0.3462	5.55903233711803e-06	109743299	109743299	3.7415278494762e-14	109987341	109987341
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.0575	3.7415278494762e-14	109987341	109987341	2.70796805974243e-09	109989998	109989998
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	109994195	1	0	NA	2.70796805974243e-09	109989998	109989998	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109997318	110023268	12	11	-0.3277	NA	NA	NA	2.48826035071714e-06	110015739	110023268
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-1.3638	2.48826035071714e-06	110015739	110023268	1.59191257615628e-12	110039388	110039388
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	110509028	190	181	-0.3313	1.59191257615628e-12	110039388	110039388	3.33829828338925e-05	110494305	110515534
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110512737	110512737	1	0	NA	3.33829828338925e-05	110494305	110515534	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110513950	110530638	9	9	0.0584	NA	NA	NA	4.08395225407369e-65	110529665	110534906
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110532006	119667776	3334	3138	-0.4852	4.08395225407369e-65	110529665	110534906	0	119663699	119672136
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	119669737	120333077	282	267	0.1592	0	119663699	119672136	3.17870022683838e-11	120329400	120347824
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120338395	120415520	12	11	-0.4123	3.17870022683838e-11	120329400	120347824	9.30029468966981e-06	120404156	120415520
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120705146	120854952	3	3	0.4007	9.30029468966981e-06	120404156	120415520	0.00094117410222369	120854952	120863550
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120857377	120918959	17	16	-0.0555	0.00094117410222369	120854952	120863550	1.32574223452744e-05	120902680	120942233
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120920215	121052394	39	38	0.2624	1.32574223452744e-05	120902680	120942233	2.15855602242978e-11	121024339	142723311
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	141559466	143700072	28	27	-0.1686	2.15855602242978e-11	121024339	142723311	3.71869868608764e-16	143658181	143706304
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143702972	143793256	47	42	-0.6215	3.71869868608764e-16	143658181	143706304	1.65831717036497e-05	143787504	143817037
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143799153	144099712	33	32	-0.3171	1.65831717036497e-05	143787504	143817037	2.17608014357901e-23	143994475	144107002
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099998	150819879	1855	1754	0.1845	2.17608014357901e-23	143994475	144107002	1.46257342314611e-65	150819879	150819879
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-2.1505	1.46257342314611e-65	150819879	150819879	0.00121293310046678	150839754	150844444
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	7	-4.0292	0.00121293310046678	150839754	150844444	0	150851439	150851439
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2597	0.2219	0	150851439	150851439	7.46653541803735e-14	157133150	157133150
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.7776	7.46653541803735e-14	157133150	157133150	1.88913387062358e-16	157136342	157136342
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3854	0.1885	1.88913387062358e-16	157136342	157136342	5.95433866453788e-09	167479184	167483267
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167506259	6	5	0.94	5.95433866453788e-09	167479184	167483267	4.70186349080072e-10	167506259	167520743
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167507882	207071183	13911	13050	0.2043	4.70186349080072e-10	167506259	167520743	1.51783321990217e-201	207065587	207088412
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	207082207	207082207	1	0	NA	1.51783321990217e-201	207065587	207088412	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	207088412	207656503	123	115	-0.5302	NA	NA	NA	2.24484915220610e-95	207656503	207656503
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	207658199	207660379	3	3	-3.1207	2.2448491522061e-95	207656503	207656503	8.78981406513269e-85	207660379	207660379
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	207662313	211616721	1582	1477	-0.4988	8.78981406513269e-85	207660379	207660379	9.85910486117524e-10	211602204	211616721
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211623452	211644789	6	6	0.1419	9.85910486117524e-10	211602204	211616721	6.01327500909134e-24	211644789	211644789
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211647514	211649544	2	2	-0.2762	6.01327500909134e-24	211644789	211644789	6.13204207100462e-25	211649544	211649544
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211652194	211660436	5	5	-2.0051	6.13204207100462e-25	211649544	211649544	1.91449477377718e-46	211660436	211660436
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211661860	223463905	3966	3726	-0.5109	1.91449477377718e-46	211660436	211660436	0	223461055	223486303
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	223484585	238148003	5597	5271	0.0966	0	223461055	223486303	0	238138081	238159744
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	238150822	240466768	1029	972	0.5133	0	238138081	238159744	2.27764339072122e-11	240451154	240489591
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240468647	240566493	32	32	0.1691	2.27764339072122e-11	240451154	240489591	4.55751010538321e-09	240544811	240599783
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240568872	241078315	130	120	0.5019	4.55751010538321e-09	240544811	240599783	9.45380014284138e-05	241002445	241389327
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241091628	241431284	36	34	0.2639	9.45380014284138e-05	241002445	241389327	8.03409939408622e-08	241401041	241455316
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241433682	242093780	306	285	0.5408	8.03409939408622e-08	241401041	241455316	6.82215914302439e-70	242079219	242154898
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	242098392	247186514	2067	1930	0.8434	6.82215914302439e-70	242079219	242154898	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	11473457	3649	3414	-0.3941	NA	NA	NA	1.92582080143819e-21	11464291	11482331
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	11479978	11479978	1	0	NA	1.92582080143819e-21	11464291	11482331	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	11482331	11517867	17	16	0.2115	NA	NA	NA	6.59057551096631e-34	11517867	11520580
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	11520580	27654420	4876	4595	-0.5273	6.59057551096631e-34	11517867	11520580	5.24619967391145e-16	27652323	27654420
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27656043	27657376	2	2	0.4467	5.24619967391145e-16	27652323	27654420	9.28696846854687e-08	27657376	27657376
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27659717	28280738	280	264	-0.5337	9.28696846854687e-08	27657376	27657376	3.27238374288748e-29	28278859	28280738
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28282325	28282325	1	0	NA	3.27238374288748e-29	28278859	28280738	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28284200	28315497	16	16	0.1436	NA	NA	NA	1.98260889159091e-23	28315497	28318836
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28317701	31582559	1419	1329	-0.4955	1.98260889159091e-23	28315497	28318836	0	31582559	31582559
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	31584755	31895065	62	58	-3.1891	0	31582559	31582559	0	31895065	31895065
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	31910234	33076512	553	512	-0.4864	0	31895065	31895065	2.8699332657751e-109	33076512	33076512
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-4.0128	2.8699332657751e-109	33076512	33076512	7.38320144786728e-107	33080437	33080437
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	33599881	245	231	-0.5676	7.38320144786728e-107	33080437	33080437	8.41266883353533e-34	33587388	33613715
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33603079	33603079	1	0	NA	8.41266883353533e-34	33587388	33613715	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33604578	33928550	135	128	-0.2639	NA	NA	NA	1.25360124091715e-93	33924133	33935517
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33928618	34543992	263	252	0.2802	1.25360124091715e-93	33924133	33935517	1.70298099398795e-89	34543992	34551222
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	1.5564	1.70298099398795e-89	34543992	34551222	9.41666736261062e-42	34583814	34591681
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	461	0.6225	9.41666736261062e-42	34583814	34591681	7.80706103805774e-13	35818921	35821494
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.8414	7.80706103805774e-13	35818921	35821494	1.75228739735292e-08	35844884	35844884
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37810001	883	835	0.6532	1.75228739735292e-08	35844884	35844884	1.85638188193655e-42	37803744	37813211
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37858379	23	22	-0.1501	1.85638188193655e-42	37803744	37813211	1.93511953732398e-38	37854350	37859985
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	46849832	3722	3516	0.609	1.93511953732398e-38	37854350	37859985	1.0091783654783e-296	46840581	46862075
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	46851706	48699631	734	688	0.2019	1.0091783654783e-296	46840581	46862075	0.000179520274518535	48693847	48699631
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	48701555	48712782	3	3	0.9243	0.000179520274518535	48693847	48699631	2.13646990983231e-06	48712782	48713406
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	48713406	52600588	1341	1274	0.1458	2.13646990983231e-06	48712782	48713406	1.11359590202647e-10	52588009	52600588
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.9157	1.11359590202647e-10	52588009	52600588	2.97400906987965e-09	52635695	52639605
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	61113722	2649	2496	0.1568	2.97400906987965e-09	52635695	52639605	1.47738137871349e-172	61111370	61122099
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	61121980	61553429	198	181	-0.3878	1.47738137871349e-172	61111370	61122099	2.5032448284985e-44	61546077	61566642
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	61555986	61920259	139	135	0.0182	2.5032448284985e-44	61546077	61566642	1.66902534709231e-87	61910682	61928974
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	61922341	71541433	3389	3205	-0.4018	1.66902534709231e-87	61910682	61928974	0	71537752	71546446
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	71544378	89319930	5196	4859	0.1693	0	71537752	71546446	9.266093081271e-06	89261600	89387596
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89377705	89377705	1	0	NA	9.266093081271e-06	89261600	89387596	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89379689	89650684	15	14	-0.1981	NA	NA	NA	4.58130929853444e-05	89410161	89700690
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89669803	89890854	31	31	0.1415	4.58130929853444e-05	89410161	89700690	2.3456086096372e-13	89877995	89902365
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89902365	91270311	15	14	-0.3844	2.3456086096372e-13	89877995	89902365	3.8278011730816e-13	91179406	94892766
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94784165	95713002	223	211	0.2197	3.8278011730816e-13	91179406	94892766	1.85774614614639e-06	95622754	95713002
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	95722700	95722700	1	0	NA	1.85774614614639e-06	95622754	95713002	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	95796016	95974614	3	3	-0.6959	NA	NA	NA	1.86240599491878e-07	95974614	96103035
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	96103035	109796400	4214	3954	0.1808	1.86240599491878e-07	95974614	96103035	3.98871232089733e-07	109749838	109800836
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	109800836	110206301	13	13	-0.2316	3.98871232089733e-07	109749838	109800836	2.80703899280894e-06	110202447	110234644
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	110210249	113730516	892	845	0.1789	2.80703899280894e-06	110202447	110234644	2.10255056646178e-06	113719776	113735435
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	113733154	113757824	13	12	0.6115	2.10255056646178e-06	113719776	113735435	1.13603115079855e-06	113754907	113813042
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	113767572	127873966	3663	3468	0.1794	1.13603115079855e-06	113754907	113813042	0	127871460	127879811
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	127876753	127876753	1	0	NA	0	127871460	127879811	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	127879811	142514772	4429	4156	-0.5229	NA	NA	NA	0	142512822	142516719
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142516719	146571330	1252	1173	0.1649	0	142512822	142516719	0	146571330	146571330
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.9158	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2062	0.192	0	146592775	146592775	1.33957267017561e-07	154599133	154601442
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	1.2103	1.33957267017561e-07	154599133	154601442	3.40213535750338e-07	154606943	154608095
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	165745502	3637	3437	0.1881	3.40213535750338e-07	154606943	154608095	1.54026167384636e-09	165737933	165751370
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	165747878	165781438	19	17	0.5891	1.54026167384636e-09	165737933	165751370	9.61951523720357e-09	165776894	165791134
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	165784099	222956936	19740	18561	0.1855	9.61951523720357e-09	165776894	165791134	3.14664861669241e-05	222943953	222956936
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	222959511	222966367	4	4	0.8491	3.14664861669241e-05	222943953	222956936	2.20623049577604e-05	222966367	222972322
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	222970131	237061582	5097	4772	0.1783	2.20623049577604e-05	222966367	222972322	0	237058767	237067119
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	237063795	242689978	2047	1935	-0.3695	0	237058767	237067119	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	12761304	4634	4355	-0.5555	NA	NA	NA	0	12761304	12761304
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	12764067	12832731	30	29	-3.6401	0	12761304	12761304	0	12832731	12832731
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	12834579	12834579	1	0	NA	0	12832731	12832731	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	12835741	28998789	5119	4813	-0.5406	NA	NA	NA	3.7557152460395e-193	28994879	29007532
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	29001830	29001830	1	0	NA	3.7557152460395e-193	28994879	29007532	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	29007532	29390053	111	102	0.1549	NA	NA	NA	8.06083580983894e-64	29380899	29400006
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	29394444	29394444	1	0	NA	8.06083580983894e-64	29380899	29400006	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	29395694	31381134	635	600	0.5955	NA	NA	NA	2.07075462768194e-116	31347108	31400428
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	31390784	32074432	264	244	0.178	2.07075462768194e-116	31347108	31400428	4.52449626488044e-153	32074432	32074432
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-4.2973	4.52449626488044e-153	32074432	32074432	8.51694787737086e-128	32080848	32080848
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	35625741	1032	966	0.1959	8.51694787737086e-128	32080848	32080848	5.91776196386698e-175	35561113	35648703
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	35631395	37951628	850	802	0.5502	5.91776196386698e-175	35561113	35648703	2.58146830468881e-08	37948655	37951628
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37953375	37958685	5	5	1.2911	2.58146830468881e-08	37948655	37951628	1.74935881044955e-07	37958685	37963014
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37960019	37960019	1	0	NA	1.74935881044955e-07	37958685	37963014	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37961110	40076321	822	774	0.5541	NA	NA	NA	5.31714430631e-249	40062192	40088274
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	40079362	51872007	4613	4336	0.2003	5.31714430631e-249	40062192	40088274	0	51869635	51882502
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	51882502	53001678	541	503	-0.4618	0	51869635	51882502	2.93074991424987e-201	53001678	53001678
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-3.9889	2.93074991424987e-201	53001678	53001678	7.20984387020892e-240	53011885	53011885
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	56628485	1485	1410	-0.5611	7.20984387020892e-240	53011885	53011885	2.09253830090523e-51	56627215	56631065
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	56631065	56693822	29	29	0.1048	2.09253830090523e-51	56627215	56631065	5.86377414163669e-54	56690814	56695850
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	56695850	70117990	5056	4783	-0.5611	5.86377414163669e-54	56690814	56695850	2.80944013242002e-11	70115114	70119159
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	70119159	70130252	6	6	0.0219	2.80944013242002e-11	70115114	70119159	1.99275355844838e-08	70128756	70136669
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	70132509	89475107	5398	5071	-0.5545	1.99275355844838e-08	70128756	70136669	0	89475107	89475107
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	13	-3.9745	0	89475107	89475107	0	89500935	89500935
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	99891210	1529	1440	-0.5273	0	89500935	89500935	1.23055911922675e-77	99891210	99891210
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-3.4572	1.23055911922675e-77	99891210	99891210	3.67808651253933e-72	99897201	99897201
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	116720941	5231	4913	-0.534	3.67808651253933e-72	99897201	99897201	0	116715107	116735720
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116722906	116722906	1	0	NA	0	116715107	116735720	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116727878	129861428	4984	4694	0.1716	NA	NA	NA	5.32412908492624e-26	129860301	129861428
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129867158	129885779	7	7	-0.903	5.32412908492624e-26	129860301	129861428	1.68788876760639e-27	129885779	129885779
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129887890	164005577	11083	10416	0.1816	1.68788876760639e-27	129885779	129885779	1.25132811044772e-51	164005577	164005577
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164019640	3	3	-2.0757	1.25132811044772e-51	164005577	164005577	4.36544072172724e-53	164019640	164019640
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164023502	169587362	1359	1299	0.1688	4.36544072172724e-53	164019640	164019640	0	169569656	169604391
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	169595404	173538899	1606	1500	0.6562	0	169569656	169604391	5.71971108374612e-11	173535363	173544971
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	173541520	173556933	10	10	1.2383	5.71971108374612e-11	173535363	173544971	1.14619336842559e-10	173551025	173562486
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	173558060	182113897	2785	2623	0.663	1.14619336842559e-10	173551025	173562486	2.71570968063335e-21	182107482	182126847
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	182115582	182115582	1	0	NA	2.71570968063335e-21	182107482	182126847	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	182118986	182173144	28	28	0.1812	NA	NA	NA	4.14366690692931e-14	182164909	182179956
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	182175761	182620089	95	88	0.6537	4.14366690692931e-14	182164909	182179956	4.58560368643551e-27	182578414	182669953
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	182625790	191360394	3336	3137	0.9745	4.58560368643551e-27	182578414	182669953	7.81840257809615e-07	191360394	191360394
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191360683	191367634	2	2	-0.1106	7.81840257809615e-07	191360394	191360394	2.22772538632817e-07	191367634	191367634
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191370690	191370690	1	0	NA	2.22772538632817e-07	191367634	191367634	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191373371	194354505	929	872	0.9483	NA	NA	NA	0	194354505	194354505
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	5	-4.6517	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1866	0.9697	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	8	-1.5202	NA	NA	NA	4.03394202165352e-24	53781	61552
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	7987600	2917	2725	-0.4998	4.03394202165352e-24	53781	61552	0	7985679	7994772
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	7989886	7992859	2	0	NA	0	7985679	7994772	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	7994772	8609010	255	236	0.2955	NA	NA	NA	9.06758503422708e-197	8602926	8613484
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	8613484	9800777	209	192	-0.4947	9.06758503422708e-197	8602926	8613484	0	9800777	9800777
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9815760	9815760	1	0	NA	0	9800777	9800777	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.5718	NA	NA	NA	0	9842644	9842644
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	27124588	4942	4641	-0.5589	0	9842644	9842644	6.24650654025413e-29	27124588	27124588
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	27135323	27151415	3	3	-2.0416	6.24650654025413e-29	27124588	27124588	3.22556706208153e-40	27151415	27151415
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	27159155	28250292	153	144	-0.5693	3.22556706208153e-40	27151415	27151415	1.76806327399283e-11	28236963	28265557
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	28258957	28304180	9	9	-0.0953	1.76806327399283e-11	28236963	28265557	8.5246298991874e-09	28296882	28307791
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	28305997	34445002	1060	1000	-0.5745	8.5246298991874e-09	28296882	28307791	1.23628588114684e-07	34425046	34445002
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.0283	1.23628588114684e-07	34425046	34445002	1.32168393783513e-06	34491115	34519267
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	37820545	898	843	-0.5491	1.32168393783513e-06	34491115	34519267	0	37819227	37822478
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	37822478	38538139	234	218	0.1322	0	37819227	37822478	3.28731736081605e-256	38535967	38542682
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	38542682	40478136	848	792	-0.4988	3.28731736081605e-256	38535967	38542682	0	40473728	40486731
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	40485411	41313335	389	360	0.1371	0	40473728	40486731	0	41313335	41313335
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	41315160	45253377	1058	988	-0.7402	0	41313335	41313335	0	45246953	45277348
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	45262920	45262920	1	0	NA	0	45246953	45277348	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	45277348	48777988	1273	1197	0.0701	NA	NA	NA	0	48771190	52385001
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	52380712	63346612	2952	2786	-0.3781	0	48771190	52385001	2.80735006760582e-52	63346612	63346612
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63357811	63358506	2	2	-3.03	2.80735006760582e-52	63346612	63346612	3.25484174569525e-49	63358506	63358506
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63360367	68905670	1208	1124	-0.5396	3.25484174569525e-49	63358506	63358506	3.66684005985363e-75	68905670	69069651
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.5716	3.66684005985363e-75	68905670	69069651	1.07916737418627e-75	69163312	69165814
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	78054523	2685	2521	-0.5178	1.07916737418627e-75	69163312	69165814	9.82499494069255e-36	78049921	78068650
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78065320	78065320	1	0	NA	9.82499494069255e-36	78049921	78068650	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78068650	78108634	19	19	0.1251	NA	NA	NA	2.10462991089842e-32	78106361	78111845
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	78110404	82254728	1589	1488	-0.5232	2.10462991089842e-32	78106361	78111845	1.60438690618429e-15	82250792	82262528
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	82261983	82288756	13	13	0.0233	1.60438690618429e-15	82250792	82262528	2.51007138842140e-17	82284026	82292478
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	82290754	98844811	5693	5368	-0.5343	2.5100713884214e-17	82284026	82292478	0	98844811	98844811
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	98849005	99084104	91	86	-3.2812	0	98844811	98844811	0	99084104	99084104
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	99085137	107275274	2614	2453	-0.5279	0	99084104	99084104	2.79381896803077e-162	107275274	107275274
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-3.5254	2.79381896803077e-162	107275274	107275274	9.00353895006483e-153	107281410	107281410
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	110374668	964	903	-0.5324	9.00353895006483e-153	107281410	107281410	1.63945604104629e-07	110374668	110374668
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	110377446	110379664	2	2	0.4284	1.63945604104629e-07	110374668	110374668	1.91630410482682e-07	110379664	110382851
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	110381194	110381194	1	0	NA	1.91630410482682e-07	110379664	110382851	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	110382851	116373928	2078	1947	-0.515	NA	NA	NA	1.17838962118079e-112	116373928	116373928
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	116387109	116392122	2	2	-4.0772	1.17838962118079e-112	116373928	116373928	1.77634942171215e-116	116392122	116392122
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	116396677	119649083	640	601	-0.5361	1.77634942171215e-116	116392122	116392122	1.55825634649284e-15	119646260	119661914
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119650402	119696168	13	13	-0.0139	1.55825634649284e-15	119646260	119661914	1.89045779496491e-13	119681225	119700930
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119698139	121809189	576	549	-0.5204	1.89045779496491e-13	119681225	119700930	2.50418582427588e-27	121802541	121809189
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	121825048	121852501	11	11	-1.2877	2.50418582427588e-27	121802541	121809189	5.87325642840879e-27	121852501	121854817
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	121854817	129949524	2161	2031	-0.5286	5.87325642840879e-27	121852501	121854817	1.40148198775424e-07	129949524	129949524
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	129950848	129952427	2	2	0.4354	1.40148198775424e-07	129949524	129949524	1.14812592701249e-07	129952427	129956213
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	129954909	129954909	1	0	NA	1.14812592701249e-07	129952427	129956213	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	129956213	130423939	151	146	-0.4988	NA	NA	NA	6.04027365962206e-251	130414929	130433836
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	130433836	158192623	7619	7113	0.1966	6.04027365962206e-251	130414929	130433836	0	158190097	158194715
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	158194715	159660710	430	406	-0.5326	0	158190097	158194715	2.39459841898069e-13	159658435	159660710
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	159662569	159668492	5	5	0.2275	2.39459841898069e-13	159658435	159660710	5.99144851271678e-10	159668492	159670936
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	159669734	159669734	1	0	NA	5.99144851271678e-10	159668492	159670936	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	159670936	159973656	144	134	-0.4994	NA	NA	NA	4.52005475573906e-192	159971957	159975087
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	159975087	162728957	599	569	0.1861	4.52005475573906e-192	159971957	159975087	1.71660824501307e-47	162726560	162732758
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	162732758	162855876	55	52	-0.3286	1.71660824501307e-47	162726560	162732758	5.79992287352937e-48	162854103	162859409
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	162858077	165590118	826	783	0.1896	5.79992287352937e-48	162854103	162859409	0	165585887	165605591
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	165605591	175860235	3143	2940	-0.535	0	165585887	165605591	7.12871284256276e-14	175860235	175860235
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	-1.86	7.12871284256276e-14	175860235	175860235	5.09258843679646e-14	175863396	175863396
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	187330240	3336	3121	-0.5533	5.09258843679646e-14	175863396	175863396	6.81585675490263e-174	187330240	187330240
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-5.0456	6.81585675490263e-174	187330240	187330240	2.37806135271498e-164	187333619	187333619
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1156	-0.5721	2.37806135271498e-164	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	681141	197	186	0.2021	NA	NA	NA	2.63951763039391e-09	675947	681141
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	1.6614	2.63951763039391e-09	675947	681141	5.82934045040605e-08	686701	686701
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	730853	22	21	0.1874	5.82934045040605e-08	686701	686701	0.000335578072047943	723342	776194
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	737829	737829	1	0	NA	0.000335578072047943	723342	776194	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	-0.4464	NA	NA	NA	1.83201978928831e-11	816789	910211
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	4010810	1006	932	0.1562	1.83201978928831e-11	816789	910211	2.28380482006216e-14	4007472	4015026
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	4015026	4021286	4	4	-0.6804	2.28380482006216e-14	4007472	4015026	1.12500659268017e-08	4021195	4029362
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	4029362	11535358	2373	2241	0.1146	1.12500659268017e-08	4021195	4029362	2.14500987267371e-125	11525074	11547967
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	11537493	12857302	364	331	0.4614	2.14500987267371e-125	11525074	11547967	1.03439290839062e-29	12857302	12857302
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-1.9031	1.03439290839062e-29	12857302	12857302	1.06374771430866e-38	12873052	12873052
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	19682933	1909	1797	0.507	1.06374771430866e-38	12873052	12873052	5.34992378306175e-221	19671812	19693598
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	19685128	21969254	634	603	0.1344	5.34992378306175e-221	19671812	19693598	9.8812974351386e-119	21959487	22053425
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21971250	23553207	503	470	0.4968	9.8812974351386e-119	21959487	22053425	2.5902695812548e-05	23545555	23556775
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	23556775	23563889	6	6	-0.0321	2.5902695812548e-05	23545555	23556775	1.46873088027791e-08	23561348	23570280
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	23565018	41479386	4817	4528	0.5324	1.46873088027791e-08	23561348	23570280	0	41479386	41479386
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	41480382	46150784	1281	1216	-0.5524	0	41479386	41479386	0	46136065	49595677
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	49595677	62664007	3934	3687	0.1718	0	46136065	49595677	0	62658861	62669824
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	62669824	76737886	4082	3833	-0.5479	0	62658861	62669824	4.10456046820169e-15	76736260	76737886
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76740443	76749054	5	5	0.3254	4.10456046820169e-15	76736260	76737886	5.88131406347758e-16	76749054	76752466
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	76752466	91667418	4472	4214	-0.5471	5.88131406347758e-16	76749054	76752466	0	91658414	91671107
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	91671107	95765051	1445	1360	0.1717	0	91658414	91671107	1.31933300193233e-41	95756827	95769150
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	95766713	96026391	70	68	0.5929	1.31933300193233e-41	95756827	95769150	1.01960770424139e-45	96019698	96033305
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	96027641	116500003	5306	4963	0.1584	1.01960770424139e-45	96019698	96033305	0	116455726	116529620
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	116504964	140201609	7638	7184	0.5665	0	116455726	116529620	6.94044390405022e-41	140201609	140201609
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	7	-0.7587	6.94044390405022e-41	140201609	140201609	1.13169934455419e-39	140216524	140216524
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	165602574	8261	7772	0.5736	1.13169934455419e-39	140216524	140216524	0	165565441	165637462
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	165607835	179429409	4994	4695	0.1248	0	165565441	165637462	1.48299599783048e-06	179426090	179429409
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179430821	179431937	2	2	1.2104	1.48299599783048e-06	179426090	179429409	8.31008943803693e-06	179431937	179433578
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179433578	180342860	302	286	0.1458	8.31008943803693e-06	179431937	179433578	2.08611042648931e-184	180342860	180342860
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180362342	9	9	-2.9737	2.08611042648931e-184	180342860	180342860	9.4790952409434e-134	180362342	180362342
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	100	0.155	9.4790952409434e-134	180362342	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	7388186	2876	2685	0.1683	NA	NA	NA	0	7378106	7399903
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	7391717	15600228	2644	2517	0.5946	0	7378106	7399903	7.09056414849135e-14	15596122	15603245
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	15601978	15624221	13	11	1.2272	7.09056414849135e-14	15596122	15603245	1.01983495711683e-12	15619177	15631055
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	15626585	18842558	1206	1129	0.5992	1.01983495711683e-12	15619177	15631055	0	18807516	18873710
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18851023	24721967	1679	1568	0.1626	0	18807516	18873710	0	24719756	24724231
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	24724231	27995172	1354	1275	-0.5442	0	24719756	24724231	0	27995172	27995172
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	27996606	29966336	816	774	0.5597	0	27995172	27995172	1.12572534558523e-10	29950805	29985620
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29972382	30004636	11	9	1.2182	1.12572534558523e-10	29950805	29985620	3.18045912086604e-09	29995247	30021908
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30005338	31385778	582	546	0.5747	3.18045912086604e-09	29995247	30021908	8.69189039746254e-07	31382291	31387708
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	1.2459	8.69189039746254e-07	31382291	31387708	2.08727773808161e-06	31395330	31429184
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	461	0.5972	2.08727773808161e-06	31395330	31429184	1.14569897443119e-50	32558677	32564884
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	2.1436	1.14569897443119e-50	32558677	32564884	4.7455694326e-09	32593151	32609525
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32762061	57	56	0.902	4.7455694326e-09	32593151	32609525	4.18288591966879e-15	32707427	32785011
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	45779306	5394	5076	0.583	4.18288591966879e-15	32707427	32785011	0	45757386	45812258
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	45786691	54035000	2852	2668	0.1409	0	45757386	45812258	6.73480561998534e-198	54035000	54035000
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.2041	6.73480561998534e-198	54035000	54035000	1.82730900492357e-206	54042734	54042734
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	57307563	1251	1182	0.1611	1.82730900492357e-206	54042734	54042734	1.05905683569439e-19	57288447	57328286
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57313645	57473192	70	63	-0.1444	1.05905683569439e-19	57288447	57328286	3.16952261938687e-20	57464041	57482077
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57475656	57704050	75	73	-0.5332	3.16952261938687e-20	57464041	57482077	5.78726425162848e-87	57689850	57718525
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57718525	62655584	184	175	0.1369	5.78726425162848e-87	57689850	57718525	7.60558246145347e-194	62650490	62662300
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	62658179	72919733	2955	2779	-0.3857	7.60558246145347e-194	62650490	62662300	4.63910976438203e-52	72919733	72919733
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-2.3903	4.63910976438203e-52	72919733	72919733	8.81403713284759e-51	72924440	72924440
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	103841482	8669	8152	-0.37	8.8140371328476e-51	72924440	72924440	1.55606920414576e-09	103827105	103841482
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.4099	1.55606920414576e-09	103827105	103841482	1.05714043884228e-45	103868154	103873584
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	115325521	3878	3645	-0.4799	1.05714043884228e-45	103868154	103873584	0	115319275	115334426
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	115334426	149171163	11419	10689	0.2089	0	115319275	115334426	0	149170042	149173067
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	149173067	152378698	1360	1270	-0.504	0	149170042	149173067	1.195968087129e-62	152378698	152378698
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152381670	152382915	2	2	-3.2613	1.195968087129e-62	152378698	152378698	1.19639936901938e-67	152382915	152382915
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152384321	155344211	1039	978	-0.5217	1.19639936901938e-67	152382915	152382915	3.88079480106051e-31	155340637	155349955
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155349955	155377643	10	9	0.3622	3.88079480106051e-31	155340637	155349955	1.45179406530703e-28	155374938	155380640
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155380640	165643653	3398	3188	-0.5193	1.45179406530703e-28	155374938	155380640	2.34299240408539e-10	165642393	165643653
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.2895	2.34299240408539e-10	165642393	165643653	1.04050970450666e-08	165650610	165653315
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170599658	1749	1658	-0.5052	1.04050970450666e-08	165650610	165653315	1.62859558036978e-14	170596705	170604532
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	170601704	170629428	10	8	0.2154	1.62859558036978e-14	170596705	170604532	1.12222033462615e-15	170622106	170631652
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	170631652	170753106	45	41	-0.5653	1.12222033462615e-15	170622106	170631652	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	4938494	1812	1681	-0.4821	NA	NA	NA	1.32512693906572e-14	4931742	4938494
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	4940738	4957420	9	8	0.2576	1.32512693906572e-14	4931742	4938494	3.76230748450234e-19	4957420	4961541
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	4961541	16135701	3567	3364	-0.5389	3.76230748450234e-19	4957420	4961541	1.34159306593133e-14	16135701	16135701
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-1.9162	1.34159306593133e-14	16135701	16135701	1.43930823327261e-14	16140018	16140018
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	38269153	8213	7777	-0.5499	1.43930823327261e-14	16140018	16140018	1.21487109403870e-17	38254010	38280664
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38270942	38360187	43	40	-0.2147	1.2148710940387e-17	38254010	38280664	1.73857367314166e-17	38341239	38385708
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38372692	54999561	4911	4609	-0.5471	1.73857367314166e-17	38341239	38385708	0	54995921	55003542
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	55003542	57625302	577	544	0.182	0	54995921	55003542	8.381352224959e-15	57573857	62106070
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	62090591	62303155	43	40	0.5666	8.381352224959e-15	57573857	62106070	1.89286542255077e-46	62262998	62622879
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	62313533	62313533	1	0	NA	1.89286542255077e-46	62262998	62622879	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	62466030	118611324	20087	18876	0.1992	NA	NA	NA	1.73318565378721e-234	118611324	118611324
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.7764	1.73318565378721e-234	118611324	118611324	1.18087064937931e-265	118620875	118620875
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	118622742	1	0	NA	1.18087064937931e-265	118620875	118620875	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118629597	125831554	3169	2972	0.2398	NA	NA	NA	2.26932617269829e-306	125831554	125831554
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-5.1006	2.26932617269829e-306	125831554	125831554	3.23618723222895e-272	125837524	125837524
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133432281	3653	3420	0.2552	3.23618723222895e-272	125837524	125837524	1.58870762142158e-07	133417179	133437464
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133433384	133433384	1	0	NA	1.58870762142158e-07	133417179	133437464	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133455682	10	10	0.7613	NA	NA	NA	1.22908369035933e-07	133448277	133460976
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133456873	141406414	3695	3475	0.2595	1.22908369035933e-07	133448277	133460976	9.37342529721834e-21	141402937	141410894
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141408013	141442231	18	15	-0.4029	9.37342529721834e-21	141402937	141410894	2.8451491282334e-14	141434131	141449014
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141443577	141690753	115	108	0.2064	2.8451491282334e-14	141434131	141449014	9.57394233022952e-99	141690753	141690753
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	2.0458	9.57394233022952e-99	141690753	141690753	1.64511973076726e-103	141714168	141714168
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2334	0.2526	1.64511973076726e-103	141714168	141714168	6.73316214437121e-95	147702365	147702365
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.5856	6.73316214437121e-95	147702365	147702365	7.19893897862208e-86	147707161	147707161
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	151726377	1629	1530	0.2921	7.19893897862208e-86	147707161	147707161	1.50920811559837e-16	151724590	151726377
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151728811	151728811	1	0	NA	1.50920811559837e-16	151724590	151726377	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.57	NA	NA	NA	6.8718506110375e-16	151743145	151745100
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	152697404	212	198	0.28	6.8718506110375e-16	151743145	151745100	0	152692269	152705456
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	152705456	158778383	2380	2231	1.0865	0	152692269	152705456	7.52235252838477e-06	158751580	158804557
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158781338	158821263	8	7	0.6795	7.52235252838477e-06	158751580	158804557	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.5528	NA	NA	NA	1.57695720941491e-101	581533	581533
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.62	1.57695720941491e-101	581533	581533	7.98008387593851e-112	588865	588865
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2163225	598	554	-0.4914	7.98008387593851e-112	588865	588865	0.116336817865088	2044493	2183619
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2165688	2195811	7	7	-0.7799	0.116336817865088	2044493	2183619	0.00137303473726352	2185528	2206185
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2201180	2229727	9	9	-1.121	0.00137303473726352	2185528	2206185	1.60612475618570e-09	2229727	2243659
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2231804	4032755	755	713	-0.5903	1.6061247561857e-09	2229727	2243659	0	4032755	4032755
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4034552	4034552	1	0	NA	0	4032755	4032755	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4037583	4586560	270	257	-3.3419	NA	NA	NA	0	4586560	4586560
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4588175	25022606	6368	5962	-0.5279	0	4586560	4586560	3.8659087768659e-19	25022606	25022606
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25034970	2	2	-2.1399	3.8659087768659e-19	25022606	25022606	2.0636517964252e-11	25034970	25034970
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25039370	25039370	1	0	NA	2.0636517964252e-11	25034970	25034970	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	25	-0.5553	NA	NA	NA	2.85492783675059e-19	25120552	25120552
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	2.85492783675059e-19	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-2.4765	NA	NA	NA	4.62568744457823e-27	25125700	25125700
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	25127887	1	0	NA	4.62568744457823e-27	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25129043	25462525	161	149	-0.5472	NA	NA	NA	2.39663928925771e-87	25462525	25462525
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25463846	25463846	1	0	NA	2.39663928925771e-87	25462525	25462525	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25467611	25470598	3	3	-3.6539	NA	NA	NA	3.25745210636321e-113	25470598	25470598
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25472648	25472648	1	0	NA	3.25745210636321e-113	25470598	25470598	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25474661	26934767	601	565	-0.5284	NA	NA	NA	0	26934767	26934767
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26935578	26951292	15	13	-3.2969	0	26934767	26934767	0	26951292	26951292
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	26952162	39350798	4129	3865	-0.5153	0	26951292	26951292	3.70531216501298e-111	39345557	39350798
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	54	0.1862	3.70531216501298e-111	39345557	39350798	1.97677277116624e-98	39505256	39508035
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40508728	270	255	-0.5154	1.97677277116624e-98	39505256	39508035	2.02057332221457e-183	40506209	40511212
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40511212	40892587	171	160	0.165	2.02057332221457e-183	40506209	40511212	5.30065259957103e-242	40892587	40892587
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-5.7102	5.30065259957103e-242	40892587	40892587	1.93997209402756e-232	40897469	40897469
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	53608261	2551	2375	0.2026	1.93997209402756e-232	40897469	40897469	0	53591456	53615059
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	53609798	62868951	2672	2502	0.5858	0	53591456	53615059	0	62849727	62901315
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	62874006	123178389	18345	17228	0.1831	0	62849727	62901315	0	123164812	123193685
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	123181517	130887801	2493	2330	0.5741	0	123164812	123193685	9.00572124893654e-09	130885922	130887801
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	130890892	130898556	2	2	1.7848	9.00572124893654e-09	130885922	130887801	1.08726955969822e-08	130898556	130898556
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	130901586	143496826	3977	3752	0.5663	1.08726955969822e-08	130898556	130898556	8.15676114312103e-13	143472288	143523237
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143498228	143585014	36	34	0.8954	8.15676114312103e-13	143472288	143523237	0.00127473620715659	143537307	143656435
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143586865	143889160	112	105	0.6365	0.00127473620715659	143537307	143656435	2.43765375359513e-09	143879196	143912987
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143893146	144005097	30	30	0.1877	2.43765375359513e-09	143879196	143912987	3.39430003552393e-10	143985544	144143541
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144106507	146264846	772	715	0.6309	3.39430003552393e-10	143985544	144143541	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	4055626	1456	1369	-0.5872	NA	NA	NA	0	4055626	4055626
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4058270	4675241	258	244	-3.2522	0	4055626	4055626	0	4675241	4675241
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4677136	4677136	1	0	NA	0	4675241	4675241	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4678542	5900390	481	440	-0.4922	NA	NA	NA	1.73311448501468e-11	5898258	5900390
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5903345	5913083	6	6	0.2093	1.73311448501468e-11	5898258	5900390	9.02246472989472e-11	5913083	5913083
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5914640	5984467	33	31	-0.5123	9.02246472989472e-11	5913083	5913083	5.02165644587408e-64	5984467	5987246
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5987246	22477358	5602	5280	0.2698	5.02165644587408e-64	5984467	5987246	3.48148579712989e-22	22477358	22477358
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	2.0951	3.48148579712989e-22	22477358	22477358	8.82872879062494e-28	22492603	22492603
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	26109083	693	653	0.2255	8.82872879062494e-28	22492603	22492603	2.13381877445293e-13	26107783	26109083
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	26111990	26123251	5	5	-0.6027	2.13381877445293e-13	26107783	26109083	4.55406142366735e-12	26123251	26128269
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	26128269	37750851	3873	3623	0.2712	4.55406142366735e-12	26123251	26128269	0	37748503	37753942
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	37753942	39146895	321	301	-0.4914	0	37748503	37753942	5.62994460333939e-13	39062211	47002187
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	70221479	30	28	-0.0666	5.62994460333939e-13	39062211	47002187	0.000195223084845772	45359327	70262170
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70223138	70926188	311	287	0.165	0.000195223084845772	45359327	70262170	1.91972196684346e-11	70926188	70926188
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.4602	1.91972196684346e-11	70926188	70926188	7.79507187341138e-12	70930528	70930528
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	76867305	2243	2094	0.1662	7.79507187341138e-12	70930528	70930528	7.41135705581157e-08	76862389	76867305
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	76869414	76880019	5	5	0.8399	7.41135705581157e-08	76862389	76867305	1.42678739853078e-07	76880019	76883762
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	76882100	94841120	5601	5282	0.1496	1.42678739853078e-07	76880019	76883762	5.40828387235604e-08	94838268	94841120
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	94842494	94845369	3	3	1.0634	5.40828387235604e-08	94838268	94841120	2.50569708621314e-07	94845369	94851407
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	94851407	116124007	7616	7188	0.1595	2.50569708621314e-07	94845369	94851407	3.67329072212245e-08	116124007	116124007
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.0037	3.67329072212245e-08	116124007	116124007	2.31103541916973e-27	116130333	116132839
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	7778	0.147	2.31103541916973e-27	116130333	116132839	2.45078370387284e-114	137352394	137352394
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-4.2835	2.45078370387284e-114	137352394	137352394	4.43383570482569e-77	137356880	137356880
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140055882	1068	1006	0.0561	4.43383570482569e-77	137356880	137356880	2.99397530274128e-06	139982325	140112387
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	140058573	140145683	35	34	-0.1949	2.99397530274128e-06	139982325	140112387	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	7952791	2947	2768	-0.557	NA	NA	NA	0	7948093	7954260
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	7954260	69276114	17947	16828	0.2118	0	7948093	7954260	0	69249936	69279965
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69278585	69292997	8	7	0.692	0	69249936	69279965	5.0539921390478e-08	69292997	69306033
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69297238	77042447	3271	3090	0.0635	5.0539921390478e-08	69292997	69306033	0	77032855	77056352
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77044022	84660788	2489	2323	0.4504	0	77032855	77056352	2.3083694572666e-34	84654324	84667529
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	84665200	84834339	65	59	0.8905	2.3083694572666e-34	84654324	84667529	1.0024381521924e-31	84825157	84879019
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	84845226	121105657	12962	12194	0.4724	1.0024381521924e-31	84825157	84879019	0	121102932	121109129
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	121107096	127563278	2401	2273	-0.2192	0	121102932	121109129	1.70898321525408e-09	127556450	127569849
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127590461	12	11	-0.7247	1.70898321525408e-09	127556450	127569849	9.2526965654972e-33	127582694	127599309
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127592138	135285645	2706	2533	-0.2195	9.2526965654972e-33	127582694	127599309	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	21663000	8527	8010	-0.4886	NA	NA	NA	0	21637047	21691948
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	21667900	25955584	964	908	-0.0174	0	21637047	21691948	1.28401452474425e-141	25948983	25955584
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25961845	26334317	76	72	0.724	1.28401452474425e-141	25948983	25955584	1.88189468288273e-133	26332269	26338569
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	26338569	30239682	1115	1063	-0.0011	1.88189468288273e-133	26332269	26338569	3.37960324953455e-07	30233661	30253907
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	30247665	30263206	5	5	0.637	3.37960324953455e-07	30233661	30253907	2.52940384234004e-06	30250172	30272885
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	30268237	35772652	2163	2020	0.0101	2.52940384234004e-06	30250172	30272885	0	35768398	35777561
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	35775084	46096588	2701	2545	-0.513	0	35768398	35777561	1.54848788851647e-09	46096588	46096588
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46099212	46101080	2	2	0.659	1.54848788851647e-09	46096588	46096588	1.03289543519101e-08	46101080	46101080
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46102470	47224276	502	473	-0.4792	1.03289543519101e-08	46101080	46101080	1.39030849872125e-07	47217134	47228714
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47226539	47226539	1	0	NA	1.39030849872125e-07	47217134	47228714	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47228714	47241308	8	7	0.0922	NA	NA	NA	2.9510821529938e-06	47240084	47248743
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47243519	48135455	386	357	-0.4543	2.9510821529938e-06	47240084	47248743	0	48135455	48135455
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48138014	48387101	73	67	-3.2133	0	48135455	48135455	2.05361955011003e-20	48340988	48394676
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48387525	48501942	24	21	-2.0073	2.05361955011003e-20	48340988	48394676	2.87268808700786e-15	48479437	48515145
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48515145	48959014	19	16	-3.1751	2.87268808700786e-15	48479437	48515145	5.87406360215761e-28	48953023	48986600
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48986600	49110283	13	13	-1.203	5.87406360215761e-28	48953023	48986600	2.21458343345857e-13	49104852	49110283
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49112715	49125530	5	5	-3.2755	2.21458343345857e-13	49104852	49110283	4.79001461364562e-06	49125530	49130679
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49126728	49230780	33	31	-1.4002	4.79001461364562e-06	49125530	49130679	2.40279636728598e-25	49204036	49230780
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49236069	49236069	1	0	NA	2.40279636728598e-25	49204036	49230780	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49242301	49671267	101	99	-0.3935	NA	NA	NA	5.5076025956043e-100	49671267	49671267
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49689576	3	3	-3.6909	5.5076025956043e-100	49671267	49671267	5.00299187124756e-33	49689576	49694659
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49694659	49962478	29	26	-0.5977	5.00299187124756e-33	49689576	49694659	1.16097323389442e-40	49958139	49989322
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49965216	50258707	55	52	-2.7889	1.16097323389442e-40	49958139	49989322	6.10056211801118e-15	50256017	50258707
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	50323907	51250003	13	12	-0.8906	6.10056211801118e-15	50256017	50258707	0.0832154804116938	50326188	54869255
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	51252032	55123719	87	79	-0.6103	0.0832154804116938	50326188	54869255	8.81193714387685e-32	55114405	55127355
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	33	0.0879	8.81193714387685e-32	55114405	55127355	1.91678874614865e-42	55205278	55221692
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	55217189	1	0	NA	1.91678874614865e-42	55205278	55221692	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	62824932	3012	2837	-0.5174	NA	NA	NA	0	62823662	62826238
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62826238	88958710	9697	9114	0.2299	0	62823662	62826238	8.05615033173712e-28	88936369	88996206
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88961148	88961148	1	0	NA	8.05615033173712e-28	88936369	88996206	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88964566	89094703	44	43	-0.2457	NA	NA	NA	3.26577530339836e-29	89069529	89100161
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	89097131	95539598	1912	1804	0.2232	3.26577530339836e-29	89069529	89100161	5.47980663888847e-09	95532078	95543230
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	95542025	95561775	10	10	0.7554	5.47980663888847e-09	95532078	95543230	6.11941927942211e-10	95556649	95564828
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	95562938	99013072	813	768	0.224	6.11941927942211e-10	95556649	95564828	1.04472030409338e-08	98997346	99027331
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99016880	99074552	26	26	0.5342	1.04472030409338e-08	98997346	99027331	9.17448144901165e-07	99054423	99094549
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	113976883	5174	4859	0.243	9.17448144901165e-07	99054423	99094549	9.85225718346704e-06	113970268	113976883
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113979934	113996548	5	5	-0.3715	9.85225718346704e-06	113970268	113976883	1.48070664558764e-05	113996548	114022843
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113999831	116838577	813	769	0.2071	1.48070664558764e-05	113996548	114022843	0	116836422	116841764
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	116840348	129287343	4716	4462	-0.4661	0	116836422	116841764	0	129286234	129289584
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	129289584	131426009	896	834	0.2836	0	129286234	129289584	1.84429245952279e-05	131418374	131426009
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131427991	131434659	5	5	0.893	1.84429245952279e-05	131418374	131426009	1.48803166949555e-05	131434659	131441189
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131436397	134450318	1235	1172	0.2842	1.48803166949555e-05	131434659	131441189	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	1944210	844	806	0.8895	NA	NA	NA	9.14373348867461e-180	1925526	1968449
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	1947922	9523923	2898	2707	0.5661	9.14373348867461e-180	1925526	1968449	2.83229351133926e-193	9523923	9523923
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9531133	2	2	-5.285	2.83229351133926e-193	9523923	9523923	0.00982588422734535	9531133	9543817
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9543817	9563866	5	3	-1.1561	0.00982588422734535	9531133	9543817	9.59403388122696e-22	9550789	9563866
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9573313	10470425	339	317	0.5402	9.59403388122696e-22	9550789	9563866	1.58521803801379e-24	10470425	10482217
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10474825	10485848	6	6	-0.7866	1.58521803801379e-24	10470425	10482217	5.53468610279254e-29	10477903	10485848
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	220	0.6057	5.53468610279254e-29	10477903	10485848	1.03034966304866e-104	11116883	11116883
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	5	-1.9864	1.03034966304866e-104	11116883	11116883	1.50963513732693e-89	11130871	11130871
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11143592	2	0	NA	1.50963513732693e-89	11130871	11130871	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11147675	13507936	988	920	0.585	NA	NA	NA	0	13501879	13511684
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	13510275	23042640	3022	2821	1.2405	0	13501879	13511684	3.39263256122347e-164	23042640	23042640
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23046487	23048397	2	2	-3.8203	3.39263256122347e-164	23042640	23042640	2.32301739952047e-145	23048397	23048397
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23052510	23052510	1	0	NA	2.32301739952047e-145	23048397	23048397	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23055151	28410192	2075	1949	1.1856	NA	NA	NA	1.46484736485231e-160	28388667	28435556
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28418353	31862327	1016	951	0.8859	1.46484736485231e-160	28388667	28435556	6.3067740806744e-96	31831657	31916711
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31864207	34276451	727	688	0.6	6.3067740806744e-96	31831657	31916711	0	34261331	34302633
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	34282100	44179345	2441	2294	0.1661	0	34261331	34302633	1.90574748867347e-119	44150287	44213195
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	44182678	45292057	329	307	0.5152	1.90574748867347e-119	44150287	44213195	3.52034992134435e-110	45283300	45337910
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	45297241	62795959	6429	6041	0.1674	3.52034992134435e-110	45283300	45337910	8.72328991482557e-223	62788242	62808921
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	62800512	62800512	1	0	NA	8.72328991482557e-223	62788242	62808921	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	62802242	63822172	443	414	0.5962	NA	NA	NA	1.58174478874697e-93	63806865	63838747
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	63825606	66355388	866	819	0.9193	1.58174478874697e-93	63806865	63838747	7.1920553554735e-189	66336544	66381990
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	66356462	73170183	2236	2101	0.6	7.1920553554735e-189	66336544	66381990	5.34355478043903e-20	73129375	73192322
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	73181231	73370292	48	44	0.2085	5.34355478043903e-20	73129375	73192322	7.90951772315404e-15	73355619	73424096
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	73378958	73784583	90	86	0.5992	7.90951772315404e-15	73355619	73424096	9.91319361710825e-07	73782425	73788595
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	73788595	73793215	3	3	-0.3204	9.91319361710825e-07	73782425	73788595	6.76393119069629e-08	73789955	73793215
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	73795671	74486263	240	223	0.63	6.76393119069629e-08	73789955	73793215	2.25923178416682e-39	74466438	74513456
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	74496513	75166850	120	111	0.2268	2.25923178416682e-39	74466438	74513456	2.21348582781101e-36	75101614	75193671
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	75173081	75730404	200	190	0.6029	2.21348582781101e-36	75101614	75193671	2.28771877674768e-73	75715359	75740126
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	75731563	77533197	472	444	0.2044	2.28771877674768e-73	75715359	75740126	0	77524714	77542465
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	77542465	100444376	7278	6863	-0.5373	0	77524714	77542465	0	100434094	100454202
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100454202	115290863	5429	5113	0.1906	0	100434094	100454202	2.98667047845382e-05	115267899	115295536
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	115295536	115336301	8	7	0.7001	2.98667047845382e-05	115267899	115295536	6.37098354444564e-06	115329763	115368220
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	115345472	119562261	1719	1630	0.194	6.37098354444564e-06	115329763	115368220	0	119556960	119564006
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	119564006	121525929	820	775	-0.4434	0	119556960	119564006	2.10566935867058e-06	121521916	121525929
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121528688	121534180	5	5	0.1641	2.10566935867058e-06	121521916	121525929	1.85271574613483e-36	121534180	121540890
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121539002	130694393	3170	2970	-0.5074	1.85271574613483e-36	121534180	121540890	6.56880670505683e-34	130694393	130694393
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.8078	6.56880670505683e-34	130694393	130694393	1.14401188062155e-14	130701040	130701040
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	85	-0.5517	1.14401188062155e-14	130701040	130701040	1.00159186471293e-46	130943064	130943064
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.8795	1.00159186471293e-46	130943064	130943064	4.39949288596362e-31	130946248	130946248
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	506	-0.4332	4.39949288596362e-31	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6913	-0.5379	NA	NA	NA	1.01253879837694e-96	37953582	37953582
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.0553	1.01253879837694e-96	37953582	37953582	1.55652197089543e-93	37957844	37957844
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	47472113	3787	3580	-0.463	1.55652197089543e-93	37957844	37957844	3.68060786735138e-88	47469564	47472113
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47473625	47498234	12	12	0.2335	3.68060786735138e-88	47469564	47472113	1.15733816632626e-29	47498234	47499949
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	47499949	49241315	777	738	-0.5218	1.15733816632626e-29	47498234	47499949	2.17826834419395e-36	49238807	49241315
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49245536	49266974	14	12	0.3157	2.17826834419395e-36	49238807	49241315	5.0055019596839e-34	49266974	49268459
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49268459	49964838	289	271	-0.5398	5.0055019596839e-34	49266974	49268459	2.78588153815695e-11	49964838	49964838
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	0.6456	2.78588153815695e-11	49964838	49964838	1.57879359087817e-11	49971732	49971732
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	51019958	452	424	-0.5306	1.57879359087817e-11	49971732	49971732	3.34253258807783e-07	51012522	51019958
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51024001	51029860	3	3	0.2347	3.34253258807783e-07	51012522	51019958	3.98480253655399e-07	51029860	51033248
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51033248	52823809	700	660	-0.5041	3.98480253655399e-07	51029860	51033248	0	52821424	52827723
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	52827723	56650373	649	617	0.1757	0	52821424	52827723	2.10332457911396e-19	56610886	56650373
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	15	0.7463	2.10332457911396e-19	56610886	56650373	6.26996884612389e-17	56686863	56691355
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	71375082	3622	3421	0.1699	6.26996884612389e-17	56686863	56691355	4.04804285412825e-113	71375082	71375082
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-3.8432	4.04804285412825e-113	71375082	71375082	6.30738891974746e-121	71377671	71377671
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	72517558	383	361	0.179	6.30738891974746e-121	71377671	71377671	5.56368809366622e-06	72513384	72517558
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	72519631	72525301	3	3	-0.566	5.56368809366622e-06	72513384	72517558	1.36660549973222e-101	72525301	72528550
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	72528550	100690991	9029	8499	0.255	1.36660549973222e-101	72525301	72528550	1.04812358700249e-196	100690991	100690991
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.2262	1.04812358700249e-196	100690991	100690991	2.17901485028850e-219	100693892	100693892
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	110600168	3264	3081	0.2711	2.1790148502885e-219	100693892	100693892	0	110597851	110604969
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	110603037	113788788	1146	1057	-0.3244	0	110597851	110604969	2.43804421451852e-11	113788788	113788788
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	0.7743	2.43804421451852e-11	113788788	113788788	2.91794376749978e-09	113794669	113794669
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	135	-0.3206	2.91794376749978e-09	113794669	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	21511994	1045	979	0.622	NA	NA	NA	1.71425094706749e-58	21490267	21533558
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21516349	21516349	1	0	NA	1.71425094706749e-58	21490267	21533558	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21518235	22034704	256	243	0.9511	NA	NA	NA	3.93925388766907e-67	22019726	22047168
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22035729	22035729	1	0	NA	3.93925388766907e-67	22019726	22047168	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22038206	25534602	1292	1211	0.6155	NA	NA	NA	0	25516130	25559144
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	25544451	55509815	9455	8896	0.1649	0	25516130	25559144	0.000451001843774644	55213412	55520652
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	55514257	55518934	2	0	NA	0.000451001843774644	55213412	55520652	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	55520652	55536882	4	4	-0.1403	NA	NA	NA	0.164050912871143	55523822	55662124
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	55537892	56453682	329	304	-0.4627	0.164050912871143	55523822	55662124	1.35207851462362e-239	56447412	56462368
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	56455665	73071404	7035	6623	0.0198	1.35207851462362e-239	56447412	56462368	1.25272036041339e-76	73071404	73071404
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	1.7916	1.25272036041339e-76	73071404	73071404	8.79318896888864e-75	73092112	73092112
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	90561688	6272	5907	0.013	8.79318896888864e-75	73092112	73092112	6.31411418535534e-12	90552553	90570002
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90564117	90564117	1	0	NA	6.31411418535534e-12	90552553	90570002	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90565177	90585338	11	10	0.5425	NA	NA	NA	5.0938321806546e-08	90578193	90594720
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90586969	101467525	4260	3985	0.0179	5.0938321806546e-08	90578193	90594720	1.70199139363033e-48	101464382	101473472
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101469126	101469126	1	0	NA	1.70199139363033e-48	101464382	101473472	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101471703	101524755	29	29	0.7565	NA	NA	NA	7.47605902165388e-30	101520384	101528578
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	101526605	105597555	1641	1553	0.0987	7.47605902165388e-30	101520384	101528578	1.49504754298168e-05	105414975	105609466
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105736164	19	19	0.3457	1.49504754298168e-05	105414975	105609466	5.56982286784947e-07	105707746	105742795
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105739770	105789767	16	15	-0.0299	5.56982286784947e-07	105707746	105742795	4.3180335027163e-11	105788623	105789767
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105790917	105798116	4	4	-0.8799	4.3180335027163e-11	105788623	105789767	2.40623401716451e-08	105798116	105800545
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105799261	1	0	NA	2.40623401716451e-08	105798116	105800545	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105800545	105850033	20	19	0.1046	NA	NA	NA	1.76131478661852e-28	105848335	105850033
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-1.5021	1.76131478661852e-28	105848335	105850033	3.77436327770467e-20	105881893	105897061
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105923686	14	13	-0.111	3.77436327770467e-20	105881893	105897061	4.6638578277742e-09	105919618	105945006
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106002179	20	19	0.482	4.6638578277742e-09	105919618	105945006	1.0671907023748e-08	105996176	106028863
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106218059	90	82	0.0369	1.0671907023748e-08	105996176	106028863	1.61909185779508e-10	106209063	106223137
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	16	-0.5016	1.61909185779508e-10	106209063	106223137	1.98097674723466e-07	106249962	106269543
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	32	0.0128	1.98097674723466e-07	106249962	106269543	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2003	NA	NA	NA	0.00595248350326555	18427151	18848213
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19465359	93	85	-0.2294	0.00595248350326555	18427151	18848213	3.02528896723549e-14	19412049	19839695
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20490569	119	112	0.1335	3.02528896723549e-14	19412049	19839695	3.9028717099113e-05	20468603	20499019
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20492823	20529781	16	15	0.5875	3.9028717099113e-05	20468603	20499019	1.58322712135017e-08	20521879	20541768
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20531513	36262166	4762	4456	0.163	1.58322712135017e-08	20521879	20541768	0	36255432	36265338
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	36265338	41336820	2325	2196	-0.5107	0	36255432	36265338	0	41335690	41340343
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41337943	41337943	1	0	NA	0	41335690	41340343	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41339336	55308107	5813	5472	0.1378	NA	NA	NA	7.67892287705228e-22	55297789	55308107
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	55310381	55313401	3	3	0.7416	7.67892287705228e-22	55297789	55308107	0.00294649444484102	55313401	55319574
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	55315035	57493261	982	933	0.1463	0.00294649444484102	55313401	55319574	1.04297700494346e-09	57491826	57493261
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	57495306	57505616	6	5	0.9194	1.04297700494346e-09	57491826	57493261	2.47828443728829e-09	57505616	57507852
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	57507852	66342321	4042	3806	0.1368	2.47828443728829e-09	57505616	57507852	0	66313886	66351166
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	66343615	69573488	1277	1193	0.4906	0	66313886	66351166	4.88373617037907e-07	69565929	69575684
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69575684	69592364	11	11	0.9716	4.88373617037907e-07	69565929	69575684	6.22774115148485e-08	69590211	69600300
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69594085	70752880	591	559	0.4665	6.22774115148485e-08	69590211	69600300	1.69754952065596e-44	70678762	70764675
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	70755169	71292387	194	188	0.1496	1.69754952065596e-44	70678762	70764675	6.35952254181108e-09	71287056	71307583
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	71305757	71323700	10	10	0.6487	6.35952254181108e-09	71287056	71307583	9.07843035005763e-06	71321092	71334352
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	71325744	74669752	1461	1366	0.169	9.07843035005763e-06	71321092	71334352	9.40946231928133e-12	74665386	74669752
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.2307	9.40946231928133e-12	74665386	74669752	3.72046532244678e-13	74680439	74680439
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	153	0.1199	3.72046532244678e-13	74680439	74680439	3.65696828389231e-35	75115806	75115806
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	2.6983	3.65696828389231e-35	75115806	75115806	4.20935901411081e-38	75119713	75119713
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	77475539	963	907	0.1517	4.20935901411081e-38	75119713	75119713	2.36076134278688e-186	77464018	77483804
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	77481240	78367098	310	289	-0.3703	2.36076134278688e-186	77464018	77483804	4.52941968371829e-15	78364204	78367098
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78371107	78395948	10	10	0.2902	4.52941968371829e-15	78364204	78367098	2.12701939408016e-15	78395948	78399373
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78399373	84806618	2259	2120	-0.3575	2.12701939408016e-15	78395948	78399373	0	84801532	84812439
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	84812287	97256610	4552	4272	0.2232	0	84801532	84812439	3.50597496714889e-10	97253340	97256610
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	97258012	97269110	8	7	0.9334	3.50597496714889e-10	97253340	97256610	8.809608363548e-09	97269110	97273767
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	97271093	98867134	705	669	0.2575	8.809608363548e-09	97269110	97273767	1.90261689372657e-251	98863041	98872086
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98870431	99632987	354	341	-0.3426	1.90261689372657e-251	98863041	98872086	3.08764371587968e-27	99632987	99632987
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.6205	3.08764371587968e-27	99632987	99632987	7.91761558007555e-29	99635701	99635701
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217283	268	254	-0.39	7.91761558007555e-29	99635701	99635701	3.01662522048552e-09	100217181	100282819
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100278665	100298352	4	4	0.4221	3.01662522048552e-09	100217181	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2280246	898	843	-0.3635	NA	NA	NA	0	2274390	2285027
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2282110	14956177	4571	4297	0.1938	0	2274390	2285027	1.71068620748198e-10	14678535	14956177
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956252	14956252	1	0	NA	1.71068620748198e-10	14678535	14956177	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14958374	15029941	12	12	-0.3532	NA	NA	NA	3.76944152474909e-11	15029941	15039224
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	18772626	810	764	0.1988	3.76944152474909e-11	15029941	15039224	0	18768242	18856358
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	18852722	18852722	1	0	NA	0	18768242	18856358	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	18856358	20378166	602	566	-0.4899	NA	NA	NA	4.94696081652427e-09	20328456	20403990
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	20384653	20518906	29	28	-0.8121	4.94696081652427e-09	20328456	20403990	2.63752489118371e-16	20473223	20539107
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	20524506	34056516	3702	3487	-0.4964	2.63752489118371e-16	20473223	20539107	0	34054713	34058222
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34058222	54161586	2998	2802	0.166	0	34054713	34058222	0	54153663	54163479
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54163479	68693086	4675	4398	-0.5035	0	54153663	54163479	4.66144573507761e-31	68693014	68693086
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68710277	1	0	NA	4.66144573507761e-31	68693014	68693086	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68712507	68753209	9	9	-1.4846	NA	NA	NA	2.30885365831922e-33	68753209	68753209
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1347	-0.493	2.30885365831922e-33	68753209	68753209	3.94987110000732e-16	72917554	72929786
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-1.2806	3.94987110000732e-16	72917554	72929786	2.92007225906089e-16	72963578	73022578
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	73924957	378	350	-0.4705	2.92007225906089e-16	72963578	73022578	7.2763674994757e-12	73922165	73926621
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73926621	73941955	9	8	0.1763	7.2763674994757e-12	73922165	73926621	3.69528728997622e-12	73939929	73949819
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73945891	75093957	367	343	-0.5197	3.69528728997622e-12	73939929	73949819	2.3905218008628e-31	75093957	75093957
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.2845	2.3905218008628e-31	75093957	75093957	2.19320423004569e-37	75100865	75100865
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	570	-0.5624	2.19320423004569e-37	75100865	75100865	4.13869700076213e-60	76925748	76925748
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8758	4.13869700076213e-60	76925748	76925748	1.23252094035155e-59	76940218	76940218
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	81511032	1628	1518	-0.5217	1.23252094035155e-59	76940218	76940218	5.63183083925418e-07	81507714	81511032
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	81513392	81517501	3	3	0.1606	5.63183083925418e-07	81507714	81511032	5.11462141591702e-11	81517501	81524137
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	81519961	83858867	1059	1004	-0.489	5.11462141591702e-11	81517501	81524137	7.27947240405712e-42	83858867	83858867
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83860254	83861596	2	2	-2.8837	7.27947240405712e-42	83858867	83858867	7.47054214492409e-33	83861596	83861596
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83864368	88690571	1821	1692	-0.4448	7.47054214492409e-33	83861596	83861596	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	391	0.2184	NA	NA	NA	1.63570568006475e-33	1028979	1028979
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	2.574	1.63570568006475e-33	1028979	1028979	2.15668317679259e-27	1030766	1030766
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	411	0.2306	2.15668317679259e-27	1030766	1030766	3.50669846110428e-07	1903358	1904451
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.2257	3.50669846110428e-07	1903358	1904451	1.04414882176880e-08	1906391	1909371
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	13139804	4734	4430	0.1906	1.0441488217688e-08	1906391	1909371	0	13134727	13145478
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	13145478	15727076	711	673	-0.5678	0	13134727	13145478	2.17570086567338e-63	15727076	15727076
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-3.319	2.17570086567338e-63	15727076	15727076	3.49319815508698e-48	15733964	15733964
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	19438939	1317	1232	-0.4864	3.49319815508698e-48	15733964	15733964	3.89531943074167e-277	19438939	19438939
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19442291	19478144	11	10	-3.6071	3.89531943074167e-277	19438939	19438939	0	19478144	19478144
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19486276	21130611	490	461	-0.5086	0	19478144	19478144	2.35440295281026e-12	21111949	21142297
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21132919	21201106	28	27	-0.8463	2.35440295281026e-12	21111949	21142297	2.03569860406639e-08	21184447	21206027
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21204422	21244934	19	18	-0.3912	2.03569860406639e-08	21184447	21206027	1.56610297977318e-12	21243246	21244934
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21247217	21260658	8	7	-1.0038	1.56610297977318e-12	21243246	21244934	3.92613092871356e-10	21260658	21289073
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21262137	31451114	3859	3611	-0.5314	3.92613092871356e-10	21260658	21289073	2.77964007855671e-22	31443186	31461588
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31457889	31499568	19	18	-1.1131	2.77964007855671e-22	31443186	31461588	1.06636422720665e-22	31492553	31503774
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	32850723	377	354	-0.5381	1.06636422720665e-22	31492553	31503774	6.02865765992675e-37	32850723	32850723
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32853293	32854956	2	2	-3.0071	6.02865765992675e-37	32850723	32850723	1.11666686434513e-39	32854956	32854956
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32857473	36673853	1437	1360	-0.5021	1.11666686434513e-39	32854956	32854956	1.04978093615524e-19	36673853	36673853
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.4883	1.04978093615524e-19	36673853	36673853	1.91357713778602e-18	36684619	36686013
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40874079	1807	1687	-0.4786	1.91357713778602e-18	36684619	36686013	7.5592163972283e-09	40869151	40874079
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41015177	3	3	-1.4383	7.5592163972283e-09	40869151	40874079	3.27601135403769e-10	41015177	41026062
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41017338	41017338	1	0	NA	3.27601135403769e-10	41015177	41026062	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41026062	41519702	200	191	-0.5163	NA	NA	NA	6.97450577695543e-13	41498950	41542491
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41648545	59	54	-0.7957	6.97450577695543e-13	41498950	41542491	4.20755910817234e-14	41627814	42143048
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41652861	45107084	1350	1271	-0.5152	4.20755910817234e-14	41627814	42143048	2.90646621992591e-08	45094699	45110828
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	45109067	45133724	13	12	-0.063	2.90646621992591e-08	45094699	45110828	2.40903814243326e-39	45129293	45145096
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	45135881	45135881	1	0	NA	2.40903814243326e-39	45129293	45145096	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	45137943	65933911	7490	7066	-0.5028	NA	NA	NA	0	65925327	65940626
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	65940626	78653545	4833	4517	0.2186	0	65925327	65940626	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	604976	214	205	0.2013	NA	NA	NA	6.01011849365452e-255	600058	606234
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	606234	9151273	2924	2749	-0.3923	6.01011849365452e-255	600058	606234	0	9148020	9167229
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	9164831	34461891	7419	7006	0.1802	0	9148020	9167229	2.90990739059035e-188	34427487	34497577
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	34468029	36161985	380	353	0.5756	2.90990739059035e-188	34427487	34497577	1.49698883404257e-198	36161985	36161985
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36174230	36509250	45	42	-0.6053	1.49698883404257e-198	36161985	36161985	6.19287083681417e-163	36509250	36509250
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-3.8076	6.19287083681417e-163	36509250	36509250	4.28765113063185e-91	36519728	36519728
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	44757471	2502	2333	-0.5442	4.28765113063185e-91	36519728	36519728	2.30026910253332e-08	44752474	44757471
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	44765690	44777966	2	2	-1.5232	2.30026910253332e-08	44752474	44757471	1.97151487341725e-07	44777966	44788235
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	44788235	53092949	2711	2542	-0.5543	1.97151487341725e-07	44777966	44788235	8.53970484093292e-22	53092949	53092949
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	1.0692	8.53970484093292e-22	53092949	53092949	2.28330226840782e-21	53099601	53099601
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	58328294	1766	1659	-0.5342	2.28330226840782e-21	53099601	53099601	3.73610463440624e-13	58319366	58349381
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	58333333	58368791	17	17	-0.0931	3.73610463440624e-13	58319366	58349381	8.62828428156481e-16	58354216	58372701
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	58369979	76116026	4980	4719	-0.5463	8.62828428156481e-16	58354216	58372701	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	239700	11	11	-0.595	NA	NA	NA	3.91067940416267e-25	239700	239700
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	1.6859	3.91067940416267e-25	239700	239700	5.58966324849659e-20	243026	243026
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	1395246	477	445	-0.3291	5.58966324849659e-20	243026	243026	2.53658274001105e-16	1395246	1395246
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1398325	1398325	1	0	NA	2.53658274001105e-16	1395246	1395246	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.4861	NA	NA	NA	8.08412666682604e-18	1400840	1400840
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	6434824	2396	2263	-0.4149	8.08412666682604e-18	1400840	1400840	0	6431374	6441097
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	6434860	6434860	1	0	NA	0	6431374	6441097	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	6440256	11448975	2281	2138	0.1929	NA	NA	NA	3.03918586461969e-16	11448975	11448975
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.9799	3.03918586461969e-16	11448975	11448975	1.99338543929324e-15	11452390	11452390
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	11453579	1	0	NA	1.99338543929324e-15	11452390	11452390	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11455241	18832339	3382	3172	0.1878	NA	NA	NA	2.34584819552029e-06	18829542	18832339
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	18834253	18834253	1	0	NA	2.34584819552029e-06	18829542	18832339	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	18835924	18844942	5	5	0.9321	NA	NA	NA	1.08767448499833e-05	18843862	18850574
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	18846704	20386500	652	607	0.2436	1.08767448499833e-05	18843862	18850574	6.16961264354189e-18	20383210	20386500
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20399700	20474417	15	13	-0.5007	6.16961264354189e-18	20383210	20386500	2.30124591587944e-16	20474417	20507235
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20493401	44003115	5014	4691	0.1839	2.30124591587944e-16	20474417	20507235	4.7817290189503e-07	43997949	44020233
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44012734	44033223	14	12	0.6621	4.7817290189503e-07	43997949	44020233	1.53667356070781e-07	44030512	44052183
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44035070	53081474	3870	3619	0.1545	1.53667356070781e-07	44030512	44052183	0	53076006	53085898
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53084887	56999424	1849	1733	-0.5028	0	53076006	53085898	3.35071891025716e-26	56977922	57019414
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57008532	57227385	111	104	-0.809	3.35071891025716e-26	56977922	57019414	5.11092238245057e-20	57203478	57246615
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57228598	59246409	878	826	-0.5488	5.11092238245057e-20	57203478	57246615	5.52386055775544e-50	59246409	59246409
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	2	-3.3738	5.52386055775544e-50	59246409	59246409	1.33191581624785e-47	59251831	59251831
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	63788698	2090	1955	-0.5364	1.33191581624785e-47	59251831	59251831	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	557	-0.5424	NA	NA	NA	9.3047203860066e-43	1506379	1506379
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1528899	8	8	-1.8045	9.3047203860066e-43	1506379	1506379	6.01344693097778e-45	1528899	1528899
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1531162	1531162	1	0	NA	6.01344693097778e-45	1528899	1528899	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	2981221	583	547	-0.5296	NA	NA	NA	5.13525418864965e-19	2979423	2982557
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	2982557	3004573	9	9	0.2445	5.13525418864965e-19	2979423	2982557	3.26952666245804e-21	3001121	3007090
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3007090	10897038	2867	2693	-0.5241	3.26952666245804e-21	3001121	3007090	0	10889994	10904728
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	10904728	13496648	607	573	0.1166	0	10889994	10904728	1.81444662555678e-24	13484644	13501618
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	13498860	13577625	28	28	0.6074	1.81444662555678e-24	13484644	13501618	1.34456906309589e-19	13570940	13585232
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	13580491	24668049	3973	3735	0.1604	1.34456906309589e-19	13570940	13585232	2.28670904869819e-10	24636515	24689915
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	24675840	24790597	16	14	0.6254	2.28670904869819e-10	24636515	24689915	7.70980458449342e-06	24765934	24866308
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	24795970	26142400	353	334	0.2166	7.70980458449342e-06	24765934	24866308	0.0226900391825482	25576270	26145205
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26144661	26148060	4	4	-0.1504	0.0226900391825482	25576270	26145205	6.9063841873717e-07	26148060	26148060
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148764	26158310	8	6	-0.8132	6.9063841873717e-07	26148060	26148060	3.29625304253265e-06	26158310	26161111
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26161111	28266113	9	8	-0.2445	3.29625304253265e-06	26158310	26161111	0.000846907596176184	26173123	29325913
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	35632283	2782	2606	0.1887	0.000846907596176184	26173123	29325913	0	35620512	35637368
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	35637368	49409580	5070	4772	-0.5121	0	35620512	35637368	0	49405851	49414806
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	49414806	62419534	4675	4358	0.2222	0	49405851	49414806	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10167413	22	22	-0.8731	NA	NA	NA	1.71989361578762e-41	10167413	10167413
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13342486	1	0	NA	1.71989361578762e-41	10167413	10167413	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13435755	13889359	35	32	0.2557	NA	NA	NA	0.0010527589839116	13868917	13889359
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13893162	13992109	5	5	-0.349	0.0010527589839116	13868917	13889359	1.75537256508588e-06	13992109	14088878
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14047236	18982113	1870	1780	0.274	1.75537256508588e-06	13992109	14088878	3.07260886491845e-06	18972397	18982113
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	18985550	19002321	6	5	0.8859	3.07260886491845e-06	18972397	18982113	5.24311181393383e-07	19002321	19005587
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	19004062	19127830	64	61	0.2494	5.24311181393383e-07	19002321	19005587	0.000220681261089310	19117986	19148150
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	19135103	19158059	12	11	0.636	0.00022068126108931	19117986	19148150	1.71020479694926e-06	19142547	19191125
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	19173277	20075847	214	199	0.2409	1.71020479694926e-06	19142547	19191125	8.42333222974871e-43	20071355	20086234
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	20079737	20377183	44	42	-0.3137	8.42333222974871e-43	20071355	20086234	7.44169411372889e-39	20347223	20388807
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	20384100	36789648	6272	5892	0.2143	7.44169411372889e-39	20347223	20388807	5.94872134856598e-26	36789648	36789648
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.7375	5.94872134856598e-26	36789648	36789648	1.31708676632780e-18	36791668	36791668
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	37018943	97	93	0.1757	1.3170867663278e-18	36791668	36791668	3.90256549555899e-159	37016518	37020604
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	37020604	45824411	4287	4012	-0.5226	3.90256549555899e-159	37016518	37020604	1.01759470403939e-89	45824411	45824411
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	45827900	45837309	5	5	-2.7692	1.01759470403939e-89	45824411	45824411	1.15237396041199e-73	45837309	45837309
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	45839056	46922972	505	469	-0.5047	1.15237396041199e-73	45837309	45837309	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	15457366	4	4	-0.3746	NA	NA	NA	1.29655254736975e-05	14866086	15466819
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15459877	18125356	1128	1067	0.245	1.29655254736975e-05	14866086	15466819	3.39906333808018e-07	18123761	18125356
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	1.4413	3.39906333808018e-07	18123761	18125356	4.63968934801184e-07	18129194	18131561
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	22426759	1751	1637	0.2318	4.63968934801184e-07	18129194	18131561	8.45164168254287e-117	22422647	22431895
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22431895	22667608	98	91	-0.4972	8.45164168254287e-117	22422647	22431895	1.22834447001488e-52	22667608	22677959
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.7017	1.22834447001488e-52	22667608	22677959	3.60188086743602e-118	22721042	22725305
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6172	-0.5253	3.60188086743602e-118	22721042	22725305	4.76858999386073e-44	35472378	35472378
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.9629	4.76858999386073e-44	35472378	35472378	3.45981845558898e-36	35476942	35476942
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6580	-0.4794	3.45981845558898e-36	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	104732	13	12	0.0522	NA	NA	NA	0.00086931365886698	94062	117763
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	207641	53	48	-0.4509	0.00086931365886698	94062	117763	1.40116050643836e-06	207641	207641
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	208495	208682	2	2	0.9628	1.40116050643836e-06	207641	207641	2.03385343454704e-07	208682	210518
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	210518	2372138	1408	1322	-0.4593	2.03385343454704e-07	208682	210518	8.08434704179662e-09	2357093	2378088
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2373235	2412914	47	46	-0.7843	8.08434704179662e-09	2357093	2378088	0.000270922274159402	2405441	2418497
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2414151	2425776	16	16	-0.4446	0.000270922274159402	2405441	2418497	2.30252363847305e-11	2425776	2425776
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2426938	2426938	1	0	NA	2.30252363847305e-11	2425776	2425776	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.1591	NA	NA	NA	5.80944256994803e-11	2428307	2428307
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2430156	1	0	NA	5.80944256994803e-11	2428307	2428307	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430633	2708291	250	242	-0.3939	NA	NA	NA	0	2708291	2708291
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	22149643	7551	7096	1.2948	0	2708291	2708291	2.12890105480847e-16	22149643	22149643
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	22151198	22152780	2	2	-0.2182	2.12890105480847e-16	22149643	22149643	4.8587539632532e-15	22152780	22152780
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	22154140	95156213	18433	17277	1.287	4.8587539632532e-15	22152780	22152780	2.80891769671755e-29	95143761	95157541
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95157541	95211883	14	12	0.4405	2.80891769671755e-29	95143761	95157541	1.97174641204365e-34	95193459	95213832
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95213832	98857975	1027	960	1.2796	1.97174641204365e-34	95193459	95213832	7.24401617635682e-11	98857975	98857975
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98861302	98862790	2	2	0.1237	7.24401617635682e-11	98857975	98857975	2.84804537284766e-09	98862790	98873791
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98873791	104472819	1927	1806	1.2783	2.84804537284766e-09	98862790	98873791	0	104470895	104474021
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	104474021	132287215	9060	8490	0.5621	0	104470895	104474021	1.14249517706433e-35	132287215	132287215
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132288463	132291690	3	3	-1.0034	1.14249517706433e-35	132287215	132287215	2.68007297552655e-33	132291690	132291690
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132293652	154037006	6981	6551	0.551	2.68007297552655e-33	132291690	132291690	8.18525759458275e-08	154021108	154044828
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154038318	154079002	13	13	0.8891	8.18525759458275e-08	154021108	154044828	3.93877579401892e-09	154078401	154088378
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154582414	121	113	0.508	3.93877579401892e-09	154078401	154088378	1.45555575436569e-277	154582414	154582414
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	189	-0.5769	1.45555575436569e-277	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	119	-4.6888	NA	NA	NA	3.34434770146801e-34	3733715	3777766
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	14	-0.6936	3.34434770146801e-34	3733715	3777766	7.44611697191119e-27	4846477	5672441
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	160	-4.3	7.44611697191119e-27	4846477	5672441	6.0580019170102e-05	7007724	7201478
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7271632	62	58	-3.4377	6.0580019170102e-05	7007724	7201478	1.94867610504482e-05	7264547	7271632
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7273713	7280349	5	4	-0.1645	1.94867610504482e-05	7264547	7271632	1.27927365582199e-05	7280349	7287810
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7284775	7394617	47	43	-3.457	1.27927365582199e-05	7280349	7287810	1.04561390366616e-05	7341847	7477381
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7401540	7726921	92	89	-4.505	1.04561390366616e-05	7341847	7477381	0.000114527296989295	7698960	7799614
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7729757	7729757	1	0	NA	0.000114527296989295	7698960	7799614	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7731490	7926989	59	52	-3.5772	NA	NA	NA	1.56904176257912e-09	7843166	7996758
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7928317	10513747	386	356	-4.5362	1.56904176257912e-09	7843166	7996758	2.77075874520788e-49	10512616	10515697
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	15	-0.9342	2.77075874520788e-49	10512616	10515697	4.35754104573805e-13	11660512	12511461
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12994193	146	140	-3.6832	4.35754104573805e-13	11660512	12511461	1.56701904527731e-08	12975651	12997864
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12996552	13040293	21	20	-1.7198	1.56701904527731e-08	12975651	12997864	3.12507831805045e-08	13031576	13048283
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13104920	26	23	-3.609	3.12507831805045e-08	13031576	13048283	0.000184132647547121	13089124	13104920
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13106723	13128515	9	7	-1.7115	0.000184132647547121	13089124	13104920	1.03402262562055e-09	13128515	13133803
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13286708	54	52	-4.1406	1.03402262562055e-09	13128515	13133803	0.000169381093907784	13213249	13360252
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13296819	14122129	324	302	-4.7082	0.000169381093907784	13213249	13360252	5.53220072187448e-05	14118164	14122129
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-2.4757	5.53220072187448e-05	14118164	14122129	3.98973976709279e-08	14143748	14169526
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14342834	28	27	-4.9663	3.98973976709279e-08	14143748	14169526	4.76254699026138e-07	14335755	14354682
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14380301	19	18	-3.7584	4.76254699026138e-07	14335755	14354682	6.50851856525634e-05	14374313	14382361
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	14404979	11	11	-4.9486	6.50851856525634e-05	14374313	14382361	0.0087168677081096	14391767	14444446
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14407293	14524829	68	63	-3.9119	0.0087168677081096	14391767	14444446	8.5484438608765e-08	14508021	14538156
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	11	-1.6359	8.5484438608765e-08	14508021	14538156	0.00561098656299387	14536962	14559651
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14697315	34	31	-3.6056	0.00561098656299387	14536962	14559651	0.000263784194561297	14557473	14712496
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14698076	15180502	117	111	-4.6096	0.000263784194561297	14557473	14712496	2.41632168921212e-05	15165211	15188324
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15181501	15181501	1	0	NA	2.41632168921212e-05	15165211	15188324	NA	NA	NA
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15182292	15203221	9	9	-2.9086	NA	NA	NA	7.68679661620807e-09	15200639	15203221
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15204346	15208612	5	5	-5.2295	7.68679661620807e-09	15200639	15203221	0.000699510224505714	15208612	15222741
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15251900	17	12	-2.7163	0.000699510224505714	15208612	15222741	3.30510535853881e-12	15241527	15253683
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15252823	15523178	158	146	-4.7082	3.30510535853881e-12	15241527	15253683	7.44935788126847e-15	15521958	15527805
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15542314	11	11	-2.4572	7.44935788126847e-15	15521958	15527805	3.34218548835422e-05	15537260	15551462
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15543194	16194420	194	177	-4.1911	3.34218548835422e-05	15537260	15551462	1.19662585545689e-06	16071977	16309997
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16195788	17789346	274	254	-4.7344	1.19662585545689e-06	16071977	16309997	7.27946327607258e-09	17778338	17795392
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17791088	17823594	16	16	-3.2735	7.27946327607258e-09	17778338	17795392	8.18512833600475e-10	17817586	17828001
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17824715	19263983	48	43	-4.788	8.18512833600475e-10	17817586	17828001	2.72411313548065e-08	19261931	19263983
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19265164	19268543	3	3	-2.1631	2.72411313548065e-08	19261931	19263983	9.5194559113465e-08	19268543	19272042
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19269893	19539425	43	40	-4.8151	9.5194559113465e-08	19268543	19272042	0.00823226942584638	19512741	19575507
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19540606	19610243	39	38	-4.0864	0.00823226942584638	19512741	19575507	2.35469998196905e-05	19608039	19610243
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.5459	2.35469998196905e-05	19608039	19610243	2.42059495882072e-08	19613864	19614809
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22139807	559	519	-4.6519	2.42059495882072e-08	19613864	19614809	1.12089594030411e-09	22055660	22158616
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.5499	1.12089594030411e-09	22055660	22158616	4.08258297167639e-08	22175425	22181855
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	88	-4.692	4.08258297167639e-08	22175425	22181855	6.5898506018937e-58	22926726	26870361
MSK_252152913067_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	73	-1.6631	6.5898506018937e-58	22926726	26870361	NA	NA	NA
