Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34869589	12894	12168	0.0091	NA	NA	NA	1.07853646532190e-36	34869589	34869589
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.9896	1.0785364653219e-36	34869589	34869589	6.82544373120882e-37	34883375	34883375
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	43122135	3290	3069	-5e-04	6.82544373120882e-37	34883375	34883375	8.2405788567378e-09	43116239	43131392
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	43124945	43139091	4	4	-0.496	8.2405788567378e-09	43116239	43131392	2.14202950154141e-09	43131392	43142878
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	43142878	54862228	4832	4575	0.0012	2.14202950154141e-09	43131392	43142878	2.41652879600919e-27	54862228	54862228
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54864879	54866506	2	2	-1.1755	2.41652879600919e-27	54862228	54862228	6.10537058007898e-25	54866506	54866506
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	54876067	61881731	2604	2454	-0.0149	6.10537058007898e-25	54866506	54866506	0	61881731	61881731
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61884298	61884298	1	0	NA	0	61881731	61881731	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61890388	3	3	-6.3287	NA	NA	NA	0	61890388	61890388
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61892291	72537426	4260	4031	-0.0012	0	61890388	61890388	0	72537426	72537426
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	11	-4.6892	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109373255	11406	10833	-0.0058	0	72579311	72579311	1.62215641463091e-10	109373255	109373255
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-0.7514	1.62215641463091e-10	109373255	109373255	9.36551480029555e-11	109376249	109376249
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	110023268	295	277	-3e-04	9.36551480029555e-11	109376249	109376249	4.3510482979615e-45	110023268	110023268
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	1.1057	4.3510482979615e-45	110023268	110023268	1.51342629269653e-46	110041712	110041712
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	116029725	2221	2101	-0.0094	1.51342629269653e-46	110041712	110041712	3.39008593953249e-12	116029725	116029725
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-0.8266	3.39008593953249e-12	116029725	116029725	2.31118431990164e-14	116033402	116033402
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	147329819	2339	2206	-0.0075	2.31118431990164e-14	116033402	116033402	9.4334596892713e-09	146297175	147346399
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147346371	147441409	17	17	0.2148	9.4334596892713e-09	146297175	147346399	2.90841605467078e-07	147428649	147490553
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147446204	150819879	1270	1199	0.0096	2.90841605467078e-07	147428649	147490553	2.95833755077149e-116	150819879	150823073
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	0.9655	2.95833755077149e-116	150819879	150823073	6.13120376542267e-52	150851439	150857070
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151024118	76	70	0.0188	6.13120376542267e-52	150851439	150857070	6.58752792618446e-19	151020826	151024118
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151026228	151026228	1	0	NA	6.58752792618446e-19	151020826	151024118	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.9296	NA	NA	NA	1.41032949068786e-32	151036435	151036435
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2530	0.0078	1.41032949068786e-32	151036435	151036435	6.24937139529131e-27	157133150	157133150
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.1943	6.24937139529131e-27	157133150	157133150	8.53343288860401e-29	157136342	157136342
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1540	-0.0062	8.53343288860401e-29	157136342	157136342	4.68350309790675e-12	161099582	161099582
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-0.7927	4.68350309790675e-12	161099582	161099582	1.39377181940575e-11	161104791	161104791
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167479184	2482	2372	-0.0122	1.39377181940575e-11	161104791	161104791	2.31964191215197e-09	167473499	167497116
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167481271	167525669	13	12	-0.3011	2.31964191215197e-09	167473499	167497116	1.00125473943202e-09	167507882	167534190
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167529221	185979586	7206	6780	-0.0068	1.00125473943202e-09	167507882	167534190	1.56997294944566e-17	185979586	185979586
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	0.9457	1.56997294944566e-17	185979586	185979586	7.54870021797088e-18	185988138	185988138
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194977713	1968	1856	-0.0018	7.54870021797088e-18	185988138	185988138	4.00950517018214e-43	194977713	195009358
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	194978218	195065867	10	9	-0.6981	4.00950517018214e-43	194977713	195009358	2.32783078288726e-41	195048208	195091758
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200613454	2163	2044	-1e-04	2.32783078288726e-41	195048208	195091758	3.6162436138387e-14	200609726	200638221
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200665389	18	16	-0.3116	3.6162436138387e-14	200609726	200638221	3.67438758778357e-14	200642828	200670407
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	200667381	1	0	NA	3.67438758778357e-14	200642828	200670407	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	211067168	4053	3831	-0.0053	NA	NA	NA	3.89797738113323e-19	211067168	211067168
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211070042	211076091	3	3	-0.8171	3.89797738113323e-19	211067168	211067168	7.15047328842309e-19	211076091	211076091
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	211079988	227872808	5882	5561	-0.0048	7.15047328842309e-19	211076091	211076091	3.26854011322906e-12	227871579	227872808
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227875096	227875096	1	0	NA	3.26854011322906e-12	227871579	227872808	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.5761	NA	NA	NA	9.09685667032781e-13	227882805	227889619
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	240439057	4898	4595	-0.007	9.09685667032781e-13	227882805	227889619	3.83765572220289e-10	240438487	240439057
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240448364	240451154	3	2	-0.728	3.83765572220289e-10	240438487	240439057	1.85550789807203e-10	240451154	240453535
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240453535	247186514	2579	2453	-5e-04	1.85550789807203e-10	240451154	240453535	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	35821494	12024	11353	-0.0045	NA	NA	NA	2.8645754968501e-177	35821494	35821494
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-2.9713	2.8645754968501e-177	35821494	35821494	3.16237258277502e-202	35844884	35844884
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37789939	878	828	0.0071	3.16237258277502e-202	35844884	35844884	2.44449050174613e-20	37781427	37810001
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37852371	25	25	-0.2706	2.44449050174613e-20	37781427	37810001	5.82426542900078e-17	37842223	37859985
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37854350	201607123	49874	47057	-0.004	5.82426542900078e-17	37842223	37859985	1.35829829223946e-09	201607000	201607123
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	201612512	201612718	2	2	-0.7302	1.35829829223946e-09	201607000	201607123	9.87426682299711e-10	201612718	201612718
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	201617119	242501239	14955	14065	-0.0029	9.8742668229971e-10	201612718	201612718	8.24468642108908e-09	242469806	242523086
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242625709	46	42	0.149	8.24468642108908e-09	242469806	242523086	0.00478087441031952	242572731	242653323
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242628911	242689978	21	20	0.0177	0.00478087441031952	242572731	242653323	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	127151545	41166	38846	-0.0051	NA	NA	NA	5.67052724977426e-21	127151545	127151545
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127155887	127158321	2	2	-1.0444	5.67052724977426e-21	127151545	127151545	5.33963945941423e-19	127158321	127158321
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127159473	129911635	1248	1182	-0.0144	5.33963945941423e-19	127158321	127158321	3.27679276371281e-17	129911635	129911635
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129913114	129914858	2	2	-0.9857	3.27679276371281e-17	129911635	129911635	2.80194332057081e-18	129914858	129914858
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129916977	150748947	6803	6390	-0.0068	2.80194332057081e-18	129914858	129914858	0	150748947	150748947
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150751433	150752600	2	2	-5.3705	0	150748947	150748947	0	150752600	150752600
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150753766	163992903	4265	4024	-0.0026	0	150752600	150752600	0	163992903	163992903
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	7	-3.155	0	163992903	163992903	1.56138921852758e-09	164019640	164036648
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-5.5662	1.56138921852758e-09	164019640	164036648	0	164107951	164107951
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	174710245	3347	3157	-0.0025	0	164107951	164107951	5.05621645670036e-10	174692234	174734126
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174711559	174772331	27	26	-0.2033	5.05621645670036e-10	174692234	174734126	1.33895792238211e-10	174743307	174785195
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174775059	194354505	6756	6408	-5e-04	1.33895792238211e-10	174743307	174785195	0	194354505	194354505
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.5718	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	943	-0.0126	0	194366950	194366950	7.99400450945005e-15	196807153	196904349
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196942158	23	22	0.2566	7.99400450945005e-15	196807153	196904349	3.99995702633327e-10	196929826	196945209
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	196958467	7	7	0.6738	3.99995702633327e-10	196929826	196945209	2.04009139550515e-30	196958467	196958467
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196961238	196961238	1	0	NA	2.04009139550515e-30	196958467	196958467	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	904	0.0055	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	5560951	1865	1766	9e-04	NA	NA	NA	4.98406132360445e-11	5560951	5560951
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	5561147	5566928	2	2	-0.75	4.98406132360445e-11	5560951	5560951	6.86829334596758e-11	5566928	5566928
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	5567010	34445002	7697	7276	-0.004	6.86829334596758e-11	5566928	5566928	0	34445002	34445002
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34457648	1	0	NA	0	34445002	34445002	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34463523	34491115	5	4	-5.8337	NA	NA	NA	0	34491115	34491115
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	63808626	7714	7260	-0.0043	0	34491115	34491115	1.69606702067003e-23	63808626	63808626
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63817412	63830459	3	3	-0.8723	1.69606702067003e-23	63808626	63808626	1.85350426655565e-21	63830459	63830459
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63842706	68905670	1146	1074	0.0023	1.85350426655565e-21	63830459	63830459	1.60203710495918e-127	68905670	69069651
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.9986	1.60203710495918e-127	68905670	69069651	2.96119736319447e-138	69163312	69165814
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	79388563	3254	3064	-0.0062	2.96119736319447e-138	69163312	69165814	7.41194934303766e-10	79385310	79388563
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	79390048	79395699	4	4	0.5061	7.41194934303766e-10	79385310	79388563	2.51288032241215e-10	79395699	79398036
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	79398036	87193253	2662	2518	-0.0054	2.51288032241215e-10	79395699	79398036	2.78371942406840e-22	87193253	87193253
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87196350	87198840	2	2	-1.0536	2.7837194240684e-22	87193253	87193253	2.52879246227419e-22	87198840	87198840
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87201443	107275274	6783	6407	-0.0042	2.52879246227419e-22	87198840	87198840	1.62034860053799e-12	107274138	107275274
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	0.5575	1.62034860053799e-12	107274138	107275274	3.064338370793e-12	107281410	107283257
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	185998398	22192	20979	-0.0052	3.064338370793e-12	107281410	107283257	2.9101235904493e-44	185998398	185998398
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186000309	186005749	4	4	-1.0483	2.9101235904493e-44	185998398	185998398	3.04838294640686e-41	186005749	186005749
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186009719	187330240	566	532	-0.0102	3.04838294640686e-41	186005749	186005749	3.17325297028241e-19	187330240	187330240
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	0.9969	3.17325297028241e-19	187330240	187330240	8.31342967834821e-20	187333619	187333619
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1174	-0.0144	8.31342967834821e-20	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	8750027	2603	2445	-0.0041	NA	NA	NA	4.07465513354428e-59	8750027	8750027
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-1.0017	4.07465513354428e-59	8750027	8750027	9.75220013506963e-61	8800001	8800001
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	12857302	1366	1291	-0.016	9.75220013506963e-61	8800001	8800001	0	12857302	12857302
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.6696	0	12857302	12857302	0	12873052	12873052
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	155405839	41506	39175	-0.0057	0	12873052	12873052	1.05598211936109e-23	155405839	155405839
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	0.6881	1.05598211936109e-23	155405839	155405839	2.53761812136203e-22	155421443	155421443
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180348365	8161	7714	-0.0024	2.53761812136203e-22	155421443	155421443	2.98039817513489e-19	180348365	180348365
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180351118	180358977	5	5	0.6404	2.98039817513489e-19	180348365	180348365	3.8266134245937e-12	180358977	180362342
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	105	0.0245	3.8266134245937e-12	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	198124	39	37	-0.0148	NA	NA	NA	5.6564689427473e-26	191387	204881
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	200350	1	0	NA	5.6564689427473e-26	191387	204881	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	16	0.4487	NA	NA	NA	3.26621063041571e-33	236535	241674
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	29950805	10531	9937	-0.0041	3.26621063041571e-33	236535	241674	8.72799236098202e-20	29939288	29966336
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30025480	17	15	0.3594	8.72799236098202e-20	29939288	29966336	2.02823946810802e-17	30004636	30030032
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30026699	31385778	578	548	5e-04	2.02823946810802e-17	30004636	30030032	5.93594100685179e-21	31383925	31385778
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.6139	5.93594100685179e-21	31383925	31385778	1.06548848565643e-21	31418006	31425144
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	31425113	1	0	NA	1.06548848565643e-21	31418006	31425144	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425144	32543054	486	469	0.0193	NA	NA	NA	6.39231256774014e-22	32543054	32543054
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32548736	32567462	5	4	-0.76	6.39231256774014e-22	32543054	32543054	5.23603449979091e-06	32567462	32605300
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32588005	32590568	2	0	NA	5.23603449979091e-06	32567462	32605300	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32628420	9	7	0.375	NA	NA	NA	0.0169705449559277	32609525	32720656
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32745036	47	43	-0.4306	0.0169705449559277	32609525	32720656	5.62787440909737e-71	32689775	32745036
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32745693	54035000	8251	7788	-8e-04	5.62787440909737e-71	32689775	32745036	5.48970654102088e-10	54035000	54035000
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	0.5973	5.48970654102088e-10	54035000	54035000	2.3981512908318e-10	54042734	54045472
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	55398442	455	433	-0.0043	2.3981512908318e-10	54042734	54045472	1.07915136216463e-09	55398442	55398442
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55400385	55402231	2	2	0.7095	1.07915136216463e-09	55398442	55398442	1.69626316341230e-09	55402231	55402231
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55403414	72919733	4078	3877	-6e-04	1.6962631634123e-09	55402231	55402231	1.97703373219645e-22	72919733	72919733
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-0.8769	1.97703373219645e-22	72919733	72919733	1.33826946178956e-22	72924440	72924440
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	72931542	1	0	NA	1.33826946178956e-22	72924440	72924440	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931789	77490500	1611	1523	0.0015	NA	NA	NA	2.86196669090916e-07	77484980	77490500
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-0.5067	2.86196669090916e-07	77484980	77490500	2.12538240706491e-08	77509983	77517630
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	79018959	279	267	-0.0039	2.12538240706491e-08	77509983	77517630	6.49396519362116e-36	79015901	79018959
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-0.5261	6.49396519362116e-36	79015901	79018959	1.51096116695493e-33	79091850	79095415
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	139643729	19146	18045	-0.0042	1.51096116695493e-33	79091850	79095415	0	139643729	139643729
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-4.5951	0	139643729	139643729	0	139648318	139648318
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	170753106	10531	9985	-0.0066	0	139648318	139648318	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	244	0.0216	NA	NA	NA	8.78056047089714e-09	1038517	1038517
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	0.74	8.78056047089714e-09	1038517	1038517	5.46405620576107e-10	1047707	1047707
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	26097755	8536	8077	0.0033	5.46405620576107e-10	1047707	1047707	8.07373373013545e-93	26097755	26097755
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-2.2148	8.07373373013545e-93	26097755	26097755	5.92757776445327e-87	26108369	26108369
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	38258332	4800	4550	-0.0117	5.92757776445327e-87	26108369	26108369	2.19957693319041e-15	38247267	38270942
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38262701	38333171	37	35	0.2074	2.19957693319041e-15	38247267	38270942	5.88279787573128e-14	38327469	38347160
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38335964	64353539	5862	5516	-0.0046	5.88279787573128e-14	38327469	38347160	2.45380044948602e-10	64353539	64353539
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64357426	64358351	2	2	-0.7718	2.45380044948602e-10	64353539	64353539	6.48890059967886e-11	64358351	64358351
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64364689	71894353	2286	2153	0.0045	6.48890059967886e-11	64358351	64358351	1.83745743250785e-68	71894353	71894353
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-1.9831	1.83745743250785e-68	71894353	71894353	3.71489757937535e-77	71912065	71912065
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	86771217	4351	4092	0.002	3.71489757937535e-77	71912065	71912065	7.8091483060359e-39	86771217	86771217
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86777920	86781265	3	3	-1.1246	7.8091483060359e-39	86771217	86771217	1.03603150654225e-37	86781265	86781265
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86785324	89499550	904	858	-0.0112	1.03603150654225e-37	86781265	86781265	3.27260399953078e-124	89499550	89499550
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89505851	89566165	13	13	-0.9809	3.27260399953078e-124	89499550	89499550	7.4229021746352e-125	89566165	89566165
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89571310	118611324	12205	11517	-0.0013	7.4229021746352e-125	89566165	89566165	2.44403562027161e-20	118611324	118611324
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	0.8344	2.44403562027161e-20	118611324	118611324	1.49023596251780e-20	118620875	118620875
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	139833866	9811	9238	-0.003	1.4902359625178e-20	118620875	118620875	3.38635614846246e-08	139831752	139835966
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	139835966	139841431	3	3	0.5393	3.38635614846246e-08	139831752	139835966	3.36443388465948e-08	139839274	139844797
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	139844797	140490809	287	274	0.0152	3.36443388465948e-08	139839274	139844797	7.02735393678634e-08	140484140	140493296
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	140491295	140501468	5	5	-0.3815	7.02735393678634e-08	140484140	140493296	3.47204799535435e-07	140497109	140505281
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	140502914	141689547	558	533	0.0031	3.47204799535435e-07	140497109	140505281	7.23161300139942e-24	141687978	141689547
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141690753	141690753	1	0	NA	7.23161300139942e-24	141687978	141689547	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	8	0.5476	NA	NA	NA	1.50162923233939e-20	141714168	141720303
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2372	0.0032	1.50162923233939e-20	141714168	141720303	1.33543082900274e-289	147702365	147702365
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-4.0255	1.33543082900274e-289	147702365	147702365	2.41713817349648e-298	147707161	147707161
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4000	-0.0052	2.41713817349648e-298	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	690	-0.0012	NA	NA	NA	2.66236779657017e-07	2231804	2234351
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	0.4707	2.66236779657017e-07	2231804	2234351	5.05018521672242e-08	2251011	2257255
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	12655273	3278	3097	-0.0012	5.05018521672242e-08	2251011	2257255	2.37150001682949e-11	12655273	12657580
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	12657580	12661536	4	3	-0.6463	2.37150001682949e-11	12655273	12657580	4.96663803902721e-11	12660179	12661536
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	12663145	25574735	4354	4109	-0.003	4.96663803902721e-11	12660179	12661536	2.08153964047003e-263	25574735	25574735
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25576477	25643641	30	29	-0.9887	2.08153964047003e-263	25574735	25574735	4.06603020357694e-294	25643641	25643641
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25649804	39350798	4667	4377	-0.0018	4.06603020357694e-294	25643641	25643641	2.07031497326991e-215	39350798	39352361
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	0.6146	2.07031497326991e-215	39350798	39352361	1.62526127175029e-176	39504332	39505256
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	427	-0.0081	1.62526127175029e-176	39504332	39505256	2.68236551396621e-79	40892587	40892587
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-3.094	2.68236551396621e-79	40892587	40892587	1.42529278760772e-145	40897469	40897469
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	51191560	1736	1638	-0.0036	1.42529278760772e-145	40897469	40897469	7.5937177404578e-31	51191560	51191560
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.8687	7.5937177404578e-31	51191560	51191560	4.12587743764022e-30	51200291	51200291
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	137748793	26398	25016	-0.0059	4.12587743764022e-30	51200291	51200291	0	137748793	137748793
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137751905	137922591	32	32	-1.0219	0	137748793	137748793	4.14648255383952e-281	137922591	137922591
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137931707	146264846	2820	2650	-0.0053	4.14648255383952e-281	137922591	137922591	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	5623484	2089	1976	-0.0121	NA	NA	NA	5.07306533638632e-15	5623484	5623484
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5632749	5634019	2	2	-0.8416	5.07306533638632e-15	5623484	5623484	1.95534638958208e-14	5634019	5634019
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5646414	22473542	5745	5449	-0.0053	1.95534638958208e-14	5634019	5634019	5.53575483566148e-59	22473542	22473542
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22477358	22477358	1	0	NA	5.53575483566148e-59	22473542	22473542	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.6567	NA	NA	NA	1.04160949148774e-57	22492603	22492603
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	154	-0.0162	1.04160949148774e-57	22492603	22492603	0	23343915	23343915
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23353267	1	0	NA	0	23343915	23343915	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23357805	23365926	2	2	-5.7321	NA	NA	NA	0	23365926	23365926
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4729	-5e-04	0	23365926	23365926	7.34657695301642e-110	70926188	70926188
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.4231	7.34657695301642e-110	70926188	70926188	6.72228181095924e-112	70930528	70930528
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	70935055	1	0	NA	6.72228181095924e-112	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70939069	95532782	8129	7688	-0.0052	NA	NA	NA	5.15064105866824e-13	95532782	95532782
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	95541017	95562897	2	2	-0.8306	5.15064105866824e-13	95532782	95532782	3.22698093596437e-13	95562897	95562897
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	95567432	112062107	5640	5346	-0.0038	3.22698093596437e-13	95562897	95562897	8.53360649264165e-12	112062107	112062107
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-0.7869	8.53360649264165e-12	112062107	112062107	3.84867458524715e-12	112069192	112069192
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	116124007	1694	1598	0.0036	3.84867458524715e-12	112069192	112069192	5.75834871163157e-26	116124007	116124007
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	1.1467	5.75834871163157e-26	116124007	116124007	9.79390426289125e-25	116130333	116130333
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	140145683	9400	8867	-6e-04	9.79390426289125e-25	116130333	116130333	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9180	-0.0046	NA	NA	NA	6.72357338500386e-44	27038538	27038538
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-1.4879	6.72357338500386e-44	27038538	27038538	8.10254465583191e-43	27041812	27041812
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	100676022	22626	21354	-0.0044	8.10254465583191e-43	27041812	27041812	1.78158584817021e-22	100676022	100676022
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-0.7698	1.78158584817021e-22	100676022	100676022	7.30493637144615e-24	100686787	100686787
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	124328915	8568	8072	7e-04	7.30493637144615e-24	100686787	100686787	1.26535803758233e-23	124328915	124328915
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	-0.8845	1.26535803758233e-23	124328915	124328915	6.78708950582458e-21	124340356	124340356
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	124368725	1	0	NA	6.78708950582458e-21	124340356	124340356	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124370487	135285645	3875	3650	-0.0093	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2024	0.0017	NA	NA	NA	3.11263118773392e-62	5741031	5742476
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	14	-0.7254	3.11263118773392e-62	5741031	5742476	1.93378377971624e-69	5763749	5765438
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	35519709	10598	10019	-0.0071	1.93378377971624e-69	5763749	5765438	3.52816025052379e-29	35519709	35519709
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	35522820	35532595	4	4	-0.8831	3.52816025052379e-29	35519709	35519709	2.03091672318595e-30	35532595	35532595
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	35536714	55114405	4149	3903	-0.0015	2.03091672318595e-30	35532595	35532595	6.79130310058475e-32	55097753	55131703
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55118214	55118214	1	0	NA	6.79130310058475e-32	55097753	55131703	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	37	-0.3006	NA	NA	NA	2.60432630255445e-32	55203706	55223056
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	66463477	4637	4389	0.0067	2.60432630255445e-32	55203706	55223056	2.26785816368720e-17	66463477	66463477
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.9771	2.2678581636872e-17	66463477	66463477	1.80323041756361e-18	66469412	66469412
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	85565280	6947	6542	-0.003	1.80323041756361e-18	66469412	66469412	1.06355817396693e-24	85565280	85565280
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85567562	85576174	3	3	-0.9244	1.06355817396693e-24	85565280	85565280	6.62280693858266e-25	85576174	85576174
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	85580062	99030209	3906	3673	-0.0067	6.62280693858266e-25	85576174	85576174	2.74421679971447e-12	99016880	99032916
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99031550	99072015	19	19	0.2528	2.74421679971447e-12	99016880	99032916	1.55728424049626e-12	99064450	99079857
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99074552	106744337	2524	2387	-0.0074	1.55728424049626e-12	99064450	99079857	4.85663791398955e-13	106744337	106744337
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106745403	106746568	2	2	-0.8223	4.85663791398955e-13	106744337	106744337	1.41521312602559e-13	106746568	106746568
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106747920	107284914	244	234	-0.0082	1.41521312602559e-13	106746568	106746568	6.29727033624639e-12	107284914	107284914
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-0.7716	6.29727033624639e-12	107284914	107284914	1.52111693922371e-11	107292148	107292148
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9526	-0.0033	1.52111693922371e-11	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	7891273	3248	3081	-0.0036	NA	NA	NA	4.37075837499148e-09	7859373	7905005
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7894681	7978723	35	32	0.1713	4.37075837499148e-09	7859373	7905005	3.25110111709664e-09	7969578	8011957
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7979868	9516067	458	437	-0.0097	3.25110111709664e-09	7969578	8011957	0	9516067	9516067
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9523923	9523923	1	0	NA	0	9516067	9516067	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	4	-4.7987	NA	NA	NA	6.49180118511497e-92	9554149	9554149
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	8	-0.7711	6.49180118511497e-92	9554149	9554149	3.69592370278323e-42	9610054	9610054
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11104085	566	533	-0.0035	3.69592370278323e-42	9610054	9610054	8.68802428126374e-17	11104085	11104085
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11104973	11109483	2	0	NA	8.68802428126374e-17	11104085	11104085	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11110735	11116883	3	3	0.7821	NA	NA	NA	1.02834450709017e-15	11116883	11116883
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.9053	1.02834450709017e-15	11116883	11116883	6.84948119460509e-252	11140421	11140421
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31084265	6816	6410	-0.0033	6.84948119460509e-252	11140421	11140421	2.23446722134035e-19	31077480	31169263
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31098259	31242528	21	21	-0.3146	2.23446722134035e-19	31077480	31169263	5.76581776576165e-20	31230579	31248212
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31245432	33270966	763	706	0.0031	5.76581776576165e-20	31230579	31248212	1.57130106417021e-15	33270966	33270966
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33278235	33283825	2	2	-0.8853	1.57130106417021e-15	33270966	33270966	4.00439813039066e-15	33283825	33283825
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33290235	53572021	6464	6100	0.0014	4.00439813039066e-15	33283825	33283825	8.21191275026666e-07	53553057	53589151
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	53574272	53621275	15	15	-0.211	8.21191275026666e-07	53553057	53589151	3.53432256299944e-06	53604579	53638094
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	53622528	69942800	5554	5222	1e-04	3.53432256299944e-06	53604579	53638094	7.93614909795056e-48	69942800	69942800
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69946930	69956884	6	6	-0.8906	7.93614909795056e-48	69942800	69942800	3.54735701136825e-48	69956884	69956884
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69959412	98316278	8502	8036	-0.0037	3.54735701136825e-48	69956884	69956884	1.14510677370921e-18	98316278	98316278
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98318378	98320165	3	3	-0.7929	1.14510677370921e-18	98316278	98316278	7.11195548822732e-19	98320165	98320165
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98327582	100624427	953	897	-0.0054	7.11195548822732e-19	98320165	98320165	1.11589408080017e-10	100620923	100624427
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100626837	100629832	3	3	-0.6028	1.11589408080017e-10	100620923	100624427	1.36170432853301e-10	100629832	100631726
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100631726	130694393	11077	10500	0.0014	1.36170432853301e-10	100629832	100631726	6.27516798380203e-29	130694393	130694393
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.1989	6.27516798380203e-29	130694393	130694393	1.78521451617099e-25	130701040	130701040
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	611	0.0049	1.78521451617099e-25	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6647	-8e-04	NA	NA	NA	1.77006149259994e-15	36969571	36969571
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	0.9089	1.77006149259994e-15	36969571	36969571	1.24890786399636e-16	36982877	36982877
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	281	0.0127	1.24890786399636e-16	36982877	36982877	2.37088625520053e-58	37953582	37953582
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.6794	2.37088625520053e-58	37953582	37953582	6.58741042474963e-57	37957844	37957844
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4586	-0.0085	6.58741042474963e-57	37957844	37957844	0	49964838	49964838
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-4.8989	0	49964838	49964838	0	49971732	49971732
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1707	-0.0068	0	49971732	49971732	9.11110207624708e-30	56646284	56657371
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	0.4507	9.11110207624708e-30	56646284	56657371	1.4322807068956e-33	56681665	56686863
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	57484503	207	189	-0.0044	1.4322807068956e-33	56681665	56686863	1.07083322914415e-17	57484503	57484503
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	57489902	57497079	2	2	-0.8746	1.07083322914415e-17	57484503	57484503	2.72967067485780e-15	57497079	57497079
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	57500241	71375082	3414	3221	-0.0012	2.7296706748578e-15	57497079	57497079	1.39541012922932e-07	71373779	71375082
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-0.6265	1.39541012922932e-07	71373779	71375082	2.78728714049158e-08	71377671	71379555
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	71703277	105	100	-0.0077	2.78728714049158e-08	71377671	71379555	1.43137391403548e-21	71703277	71703277
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71705959	71708737	2	2	-1.0024	1.43137391403548e-21	71703277	71703277	3.47391159683695e-20	71708737	71708737
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71720727	89659397	4521	4267	-0.0013	3.47391159683695e-20	71708737	71708737	4.46634168710259e-160	89659397	89659397
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-2.9818	4.46634168710259e-160	89659397	89659397	6.16355051535634e-143	89662326	89662326
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	97327189	3186	3024	-0.0103	6.16355051535634e-143	89662326	89662326	3.11503579828913e-15	97327189	97327189
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97329413	97330568	2	2	-0.9129	3.11503579828913e-15	97327189	97327189	2.38991559749142e-16	97330568	97330568
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97331794	100690991	1597	1500	-0.0019	2.38991559749142e-16	97330568	97330568	6.10813968303252e-15	100690991	100690991
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	0.8689	6.10813968303252e-15	100690991	100690991	3.20604259949802e-14	100693892	100693892
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4165	-0.0084	3.20604259949802e-14	100693892	100693892	3.99895480753357e-09	113786144	113788788
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	0.5716	3.99895480753357e-09	113786144	113788788	3.627840973324e-08	113794669	113797828
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	137	-0.0093	3.627840973324e-08	113794669	113797828	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18508651	3	3	-0.1693	NA	NA	NA	1.57693601284904e-13	18508651	18508651
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18527871	18527871	1	0	NA	1.57693601284904e-13	18508651	18508651	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18537177	19442895	34	32	0.4694	NA	NA	NA	2.41509139222115e-11	19442895	19442895
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19446048	19448755	2	2	-0.2012	2.41509139222115e-11	19442895	19442895	9.50734023920726e-14	19448755	19448755
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19453177	19494416	20	19	0.4429	9.50734023920726e-14	19448755	19448755	3.28903746737464e-32	19490630	19497023
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21573262	1013	966	0.0195	3.28903746737464e-32	19490630	19497023	1.41992778887102e-79	21558492	21585953
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21575909	22044438	235	227	0.2312	1.41992778887102e-79	21558492	21585953	9.49555997551952e-117	22038206	22051630
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22046097	34674458	4442	4168	-8e-04	9.49555997551952e-117	22038206	22051630	0	34674458	34674458
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-5.6232	0	34674458	34674458	0	34683810	34683810
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1795	0.0023	0	34683810	34683810	8.27947235836994e-13	40663660	40676611
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.408	8.27947235836994e-13	40663660	40676611	1.84820279093210e-12	40726930	40746865
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	79172702	14684	13808	-0.0016	1.8482027909321e-12	40726930	40746865	1.32105662662171e-88	79172702	79172702
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79174722	79176037	2	0	NA	1.32105662662171e-88	79172702	79172702	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79177462	79183154	3	2	-2.15	NA	NA	NA	1.31493753770863e-87	79183154	79183154
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	8818	-0.0055	1.31493753770863e-87	79183154	79183154	8.30575746117421e-42	105594189	105602602
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105681007	14	14	0.5486	8.30575746117421e-42	105594189	105602602	5.19697270987490e-23	105673157	105703388
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105703388	105850033	46	44	0.0589	5.1969727098749e-23	105673157	105703388	1.97585732165428e-30	105850033	105850033
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	6	-0.7242	1.97585732165428e-30	105850033	105850033	1.54027468049923e-29	105881893	105881893
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105945006	15	13	0.0576	1.54027468049923e-29	105881893	105881893	1.22457655161588e-08	105921895	105948347
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106002179	19	16	0.346	1.22457655161588e-08	105921895	105948347	1.73382266097207e-10	105998412	106019719
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106205848	84	76	0.0107	1.73382266097207e-10	105998412	106019719	9.89879668538672e-09	106195565	106223137
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106207549	106253648	22	21	-0.3265	9.89879668538672e-09	106195565	106223137	2.96138056559807e-07	106236795	106255190
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	33	0.0487	2.96138056559807e-07	106236795	106255190	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19465359	98	94	0.117	NA	NA	NA	4.16233222154862e-63	19430207	19803092
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	19537035	1	0	NA	4.16233222154862e-63	19430207	19803092	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20088256	57	55	0.5698	NA	NA	NA	6.38120463002119e-180	20079935	20088256
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	20308014	1	0	NA	6.38120463002119e-180	20079935	20088256	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	74669752	21554	20350	-0.0028	NA	NA	NA	0	74669752	74669752
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.086	0	74669752	74669752	0	74680439	74680439
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	82332155	2794	2638	-9e-04	0	74680439	74680439	3.04845356839973e-13	82332155	82332155
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-0.8386	3.04845356839973e-13	82332155	82332155	5.71940174143142e-13	82334704	82334704
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	88197277	2299	2194	-0.0071	5.71940174143142e-13	82334704	82334704	1.02156759804538e-21	88197277	88197277
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	88200443	88211136	7	7	0.5639	1.02156759804538e-21	88197277	88197277	1.68045587023121e-21	88211136	88213844
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	88213844	98232932	3591	3403	-0.0065	1.68045587023121e-21	88211136	88213844	1.42759765165803e-08	98228743	98232932
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	-0.5667	1.42759765165803e-08	98228743	98232932	1.37277227201968e-08	98239454	98243586
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	854	-0.0173	1.37277227201968e-08	98239454	98243586	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	20403990	6902	6509	0.0021	NA	NA	NA	6.59537552572824e-73	20403990	20431426
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	20405572	20405572	1	0	NA	6.59537552572824e-73	20403990	20431426	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	20428322	20440778	7	7	-1.0478	NA	NA	NA	7.39099055425534e-72	20438853	20440778
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	20455951	31862577	3662	3469	0.0091	7.39099055425534e-72	20438853	20440778	9.05576164758935e-62	31854794	32481309
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33559207	46	44	0.3997	9.05576164758935e-62	31854794	32481309	1.77726502574931e-50	33538171	33830585
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	34317157	89	86	-0.052	1.77726502574931e-50	33538171	33830585	5.08792247487033e-74	34310087	34317157
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34602318	52	48	0.4626	5.08792247487033e-74	34310087	34317157	2.29946598060435e-93	34596655	34617260
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	57201427	4149	3914	0.0012	2.29946598060435e-93	34596655	34617260	8.59229880253615e-09	57201427	57201427
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57203733	57203733	1	0	NA	8.59229880253615e-09	57201427	57201427	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	0.7127	NA	NA	NA	4.8563275813985e-23	57206772	57206772
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	57230251	10	10	-0.0041	4.8563275813985e-23	57206772	57206772	0.000948372924005978	57230251	57230251
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57232392	57233657	2	2	-1.5989	0.000948372924005978	57230251	57230251	2.18058587012834e-48	57233657	57233657
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57235636	68693086	3376	3202	0.0019	2.18058587012834e-48	57233657	57233657	4.09677204364871e-15	68687301	68712507
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.3961	4.09677204364871e-15	68687301	68712507	4.61050963244766e-16	68747578	68838384
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72941901	1455	1354	0.0016	4.61050963244766e-16	68747578	68838384	1.57660298003988e-08	72917554	72941901
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	72964783	5	5	-0.4101	1.57660298003988e-08	72917554	72941901	1.12503914228727e-09	72964783	73022578
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	74095899	453	424	0.0076	1.12503914228727e-09	72964783	73022578	1.45906067814161e-06	74077075	74099704
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74097511	74134999	17	17	-0.1815	1.45906067814161e-06	74077075	74099704	1.25398905957777e-05	74129982	74165435
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74137609	75092501	283	264	0.0134	1.25398905957777e-05	74129982	74165435	1.32490794658700e-15	75092501	75092501
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75093957	1	0	NA	1.324907946587e-15	75092501	75092501	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75099083	2	2	0.9351	NA	NA	NA	1.51220574732871e-18	75099083	75099083
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75100865	75100865	1	0	NA	1.51220574732871e-18	75099083	75099083	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	577	-0.01	NA	NA	NA	1.72590369310222e-15	76923844	76925748
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.4236	1.72590369310222e-15	76923844	76925748	1.26598957991037e-12	76940218	76944661
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4245	0	1.26598957991037e-12	76940218	76944661	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	15527827	6289	5932	0.0118	NA	NA	NA	5.8979681361421e-19	15527827	15527827
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15546643	15561420	5	5	-0.6144	5.8979681361421e-19	15527827	15527827	9.15618303995903e-07	15552419	15561420
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15564807	15727076	8	7	-0.0051	9.15618303995903e-07	15552419	15561420	3.43634903139055e-13	15727076	15727076
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	0.8421	3.43634903139055e-13	15727076	15727076	1.54154025987256e-11	15733964	15733964
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	15737241	1	0	NA	1.54154025987256e-11	15733964	15733964	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15742071	18505820	1056	1001	0.0172	NA	NA	NA	2.47419494548619e-09	18503376	18505820
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	18508189	18519526	4	4	0.5444	2.47419494548619e-09	18503376	18505820	4.31372739121304e-11	18519526	18543177
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	18543177	31457889	4672	4417	0.0068	4.31372739121304e-11	18519526	18543177	5.31586812215783e-32	31451114	31457889
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.4165	5.31586812215783e-32	31451114	31457889	3.39006402246585e-31	31503774	31891535
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	338	0.0012	3.39006402246585e-31	31503774	31891535	7.76060187541613e-16	32828797	32828797
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	0.888	7.76060187541613e-16	32828797	32828797	8.7317720819176e-15	32832642	32832642
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1359	0.0137	8.7317720819176e-15	32832642	32832642	0	36673853	36673853
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-5.0239	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1885	0.0226	0	36684619	36684619	1.16558192820459e-27	41506317	41539415
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	42168548	81	78	-0.1714	1.16558192820459e-27	41506317	41539415	1.87459265499284e-22	42151941	42189064
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42170272	78653545	13665	12933	0.0059	1.87459265499284e-22	42151941	42189064	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	164	0.0189	NA	NA	NA	2.70328565065466e-16	500897	500897
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	-0.8492	2.70328565065466e-16	500897	500897	2.32998307369055e-14	505456	505456
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	48378588	14508	13731	-0.0047	2.32998307369055e-14	505456	505456	1.65320559077552e-42	48375560	48378588
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	48381369	48411728	16	15	0.5165	1.65320559077552e-42	48375560	48378588	5.82084045587809e-42	48411728	48414580
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	48414580	53092949	1498	1397	-0.0127	5.82084045587809e-42	48411728	48414580	1.90317608167884e-88	53092949	53092949
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-2.3971	1.90317608167884e-88	53092949	53092949	4.31740941383492e-105	53099601	53099601
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	65357415	3565	3362	-0.003	4.31740941383492e-105	53099601	53099601	2.44714605160412e-25	65357415	65357415
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65359770	65367911	4	4	-0.7935	2.44714605160412e-25	65357415	65357415	9.61335589653988e-25	65367911	65367911
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65369843	76116026	3194	3024	-0.0056	9.61335589653988e-25	65367911	65367911	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	19692626	9025	8570	0.0227	NA	NA	NA	1.88137852877192e-131	19692626	19692626
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19694025	19699024	2	0	NA	1.88137852877192e-131	19692626	19692626	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699485	19700620	2	2	-2.7566	NA	NA	NA	9.7988627790155e-83	19700620	19700620
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	22984756	845	803	0.0264	9.7988627790155e-83	19700620	19700620	5.37421672204103e-14	22975100	22984756
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23010575	23012951	2	2	-0.8954	5.37421672204103e-14	22975100	22984756	7.22477054922773e-16	23012951	23012951
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23015440	58208527	10590	10014	0.0161	7.22477054922773e-16	23012951	23012951	1.39221416645325e-13	58201323	58212113
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58244012	15	14	-0.3039	1.39221416645325e-13	58201323	58212113	1.71686661803117e-12	58241773	58254174
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	59246409	484	458	0.0206	1.71686661803117e-12	58241773	58254174	6.7975138456805e-12	59244965	59246409
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-0.6604	6.7975138456805e-12	59244965	59246409	6.96529581436078e-14	59251831	59253728
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	59414898	86	76	0.0388	6.96529581436078e-14	59251831	59253728	1.69724708426148e-14	59411618	59421197
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59441741	13	13	-0.3178	1.69724708426148e-14	59411618	59421197	9.33253819878835e-12	59440262	59446274
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59442709	63788698	1991	1899	0.0028	9.33253819878835e-12	59440262	59446274	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	549	-0.0031	NA	NA	NA	0	1506379	1518825
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1515948	2	0	NA	0	1506379	1518825	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1516966	1531162	7	6	-3.145	NA	NA	NA	0	1525300	1531162
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	3767748	931	866	0.0014	0	1525300	1531162	1.48894157384118e-18	3767748	3767748
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3771151	3772462	2	2	-1.0306	1.48894157384118e-18	3767748	3767748	4.12103634185036e-20	3772462	3772462
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	3774394	24364470	7019	6651	-0.0118	4.12103634185036e-20	3772462	3772462	1.67722970629923e-13	24364470	24364470
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	24366891	24373694	4	4	0.5831	1.67722970629923e-13	24364470	24364470	5.58233906430327e-13	24373694	24375768
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	24375768	52080395	9290	8785	0.002	5.58233906430327e-13	24373694	24375768	1.50441553107261e-51	52080395	52080395
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-1.0134	1.50441553107261e-51	52080395	52080395	9.77405372443338e-46	52090393	52090393
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3541	-0.0057	9.77405372443338e-46	52090393	52090393	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12685	-0.0027	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	15996603	157	141	0.002	NA	NA	NA	1.92716476151975e-70	15996603	15996603
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15998460	16021647	13	12	-0.9148	1.92716476151975e-70	15996603	15996603	2.21024062508148e-92	16021647	16021647
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16023930	22354945	2679	2512	0.0092	2.21024062508148e-92	16021647	16021647	8.80773007339332e-11	22354945	22354945
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22356179	22357051	2	2	-0.779	8.80773007339332e-11	22354945	22354945	8.76470024552428e-08	22357051	22358386
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22358386	22667608	132	126	-0.006	8.76470024552428e-08	22357051	22358386	1.64428880531650e-125	22667608	22667608
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	1.0732	1.6442888053165e-125	22667608	22667608	2.87550415554587e-216	22725305	22725305
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6190	0.0027	2.87550415554587e-216	22725305	22725305	4.26965021691407e-34	35472378	35472378
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.3547	4.26965021691407e-34	35472378	35472378	1.00326935485134e-31	35476942	35476942
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	40408530	2642	2482	0.0183	1.00326935485134e-31	35476942	35476942	1.36678021205563e-07	40406549	40408530
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40413308	40416329	3	3	0.5654	1.36678021205563e-07	40406549	40408530	1.35443052947382e-09	40416329	40419353
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40419353	41220567	406	381	0.005	1.35443052947382e-09	40416329	40419353	2.33216626030369e-15	41219395	41237593
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41226643	41279485	11	11	0.3779	2.33216626030369e-15	41219395	41237593	6.3792949411606e-13	41274958	41287060
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41286119	44940074	1821	1729	0.0086	6.3792949411606e-13	41274958	41287060	1.05640511284619e-19	44940074	44940074
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44944398	44945115	2	2	-1.0512	1.05640511284619e-19	44940074	44940074	2.41987774816332e-18	44945115	44945115
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44947972	49571068	2118	1991	0.007	2.41987774816332e-18	44945115	44945115	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.1116	NA	NA	NA	2.14482230992653e-09	94062	98390
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	2.14482230992653e-09	94062	98390	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	104732	6	6	-0.8458	NA	NA	NA	1.06420818927819e-36	104486	104732
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	106242	1	0	NA	1.06420818927819e-36	104486	104732	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	845758	553	530	0.0187	NA	NA	NA	4.45031381667667e-13	843614	848806
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	848806	856655	8	8	0.4669	4.45031381667667e-13	843614	848806	6.6591960122046e-14	856619	859493
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859452	859452	1	0	NA	6.6591960122046e-14	856619	859493	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	2672401	1190	1125	0.016	NA	NA	NA	1.58179915364934e-09	2669410	2674375
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2693493	12	12	-0.2915	1.58179915364934e-09	2669410	2674375	0.0342352124413530	2676476	2699364
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695630	2708291	15	15	-0.0875	0.034235212441353	2676476	2699364	2.68387197339881e-91	2708291	2708291
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1691	0.9557	2.68387197339881e-91	2708291	2708291	1.93349801210415e-10	8450789	8452395
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8458058	2	2	-0.0287	1.93349801210415e-10	8450789	8452395	4.916918413397e-14	8458058	8458058
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8459880	154025967	43204	40808	0.9826	4.916918413397e-14	8458058	8458058	5.31587581745204e-09	154019921	154037006
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154028488	154079002	16	15	1.2667	5.31587581745204e-09	154019921	154037006	1.25538250069783e-08	154070179	154091384
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154582414	121	113	0.9503	1.25538250069783e-08	154070179	154091384	6.03427053578401e-225	154582414	154582414
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154666428	53	49	-0.0417	6.03427053578401e-225	154582414	154582414	1.06985245268099e-47	154666428	154667352
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154667352	154689387	16	15	-0.8742	1.06985245268099e-47	154666428	154667352	1.64002012878880e-77	154688917	154689387
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154698452	154888224	132	123	0.0104	1.6400201287888e-77	154688917	154689387	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	115	-4.964	NA	NA	NA	7.91585640542548e-38	3223585	3773948
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.5233	7.91585640542548e-38	3223585	3773948	2.66944165862677e-19	4948824	6652845
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	162	-4.5604	2.66944165862677e-19	4948824	6652845	0.000210076357475217	7007724	7267235
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	112	-3.7842	0.000210076357475217	7007724	7267235	6.81519462248818e-07	7338262	7491280
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7726921	83	79	-4.8973	6.81519462248818e-07	7338262	7491280	2.30072333628288e-12	7719658	7731490
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7729757	7782532	17	13	-2.9714	2.30072333628288e-12	7719658	7731490	3.43846186417202e-09	7755522	7785973
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	36	-4.6503	3.43846186417202e-09	7755522	7785973	5.74419969644728e-09	7897073	7905286
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.6712	5.74419969644728e-09	7897073	7905286	8.55182124782436e-10	7914104	7914104
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7985612	15	15	-4.8081	8.55182124782436e-10	7914104	7914104	1.93382432185025e-09	7985527	7985612
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7992095	7996758	3	3	-1.9157	1.93382432185025e-09	7985527	7985612	5.07957896497852e-16	7996758	7996758
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	8182880	42	38	-5.2677	5.07957896497852e-16	7996758	7996758	1.43662377489949e-05	8121402	8334196
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8185182	8956787	218	197	-4.6939	1.43662377489949e-05	8121402	8334196	9.61697707704954e-05	8888511	8959151
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9126602	25	23	-5.5037	9.61697707704954e-05	8888511	8959151	3.05138135707466e-05	9118845	9145335
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9128508	9186935	14	10	-4.7035	3.05138135707466e-05	9118845	9145335	3.41236775506427e-08	9171109	9186935
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9208277	9208277	1	0	NA	3.41236775506427e-08	9171109	9186935	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9228616	10025706	9	8	-3.0883	NA	NA	NA	4.9147308361037e-15	10025706	10032083
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10030654	10513747	62	57	-4.9989	4.9147308361037e-15	10025706	10032083	3.35192238768762e-57	10513747	10535786
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	16	-1.2593	3.35192238768762e-57	10513747	10535786	9.3802588233974e-09	10646662	12518008
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	13121152	201	179	-3.6863	9.3802588233974e-09	10646662	12518008	0.00471358000506712	12999095	13137597
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13128515	13241181	40	36	-4.6448	0.00471358000506712	12999095	13137597	4.84349453878851e-05	13233514	13241181
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13241682	13262997	7	6	-3.2358	4.84349453878851e-05	13233514	13241181	0.000925191246550475	13261173	13279098
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	13286708	8	7	-4.2478	0.000925191246550475	13261173	13279098	0.0703219522631182	13281871	13430638
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13296819	13649497	155	138	-4.9888	0.0703219522631182	13281871	13430638	4.03966050399961e-07	13633041	13649497
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13663517	13699223	7	4	-2.7787	4.03966050399961e-07	13633041	13649497	2.96749729574045e-06	13699223	13701755
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13700962	14354682	198	180	-4.9132	2.96749729574045e-06	13699223	13701755	4.66531500497917e-09	14343139	14354682
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14356069	14356069	1	0	NA	4.66531500497917e-09	14343139	14354682	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14358464	14377844	11	9	-3.2246	NA	NA	NA	5.31125840436631e-12	14377844	14380301
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14379418	14407293	14	14	-4.8515	5.31125840436631e-12	14377844	14380301	2.54399764675669e-16	14404979	14407293
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14411113	3	3	-1.8101	2.54399764675669e-16	14404979	14407293	3.67086976834923e-05	14411113	14416385
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14411982	14411982	1	0	NA	3.67086976834923e-05	14411113	14416385	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14413754	14508021	61	55	-4.2731	NA	NA	NA	5.75659726819116e-23	14506319	14508021
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	5.75659726819116e-23	14506319	14508021	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	9	-1.0039	NA	NA	NA	2.04128502687498e-07	14539230	14550971
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14563486	9	9	-3.5184	2.04128502687498e-07	14539230	14550971	7.2746489657257e-05	14557473	14563486
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14566592	14572190	3	3	-1.0803	7.2746489657257e-05	14557473	14563486	2.95956254779045e-09	14572190	14579298
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	15126227	111	100	-4.7113	2.95956254779045e-09	14572190	14579298	0.000199232101437502	15025974	15170627
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15136369	15257187	64	61	-3.9599	0.000199232101437502	15025974	15170627	3.24153604238043e-07	15222741	15284717
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15258525	15915466	243	219	-4.8339	3.24153604238043e-07	15222741	15284717	1.07780698959954e-06	15699459	15975479
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16180512	107	96	-4.1459	1.07780698959954e-06	15699459	15975479	2.11760265874926e-14	16160997	16198927
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16182565	17718554	270	247	-4.9817	2.11760265874926e-14	16160997	16198927	1.80091122448153e-06	17635173	17786688
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17728168	17867218	43	40	-4.2184	1.80091122448153e-06	17635173	17786688	7.25109520770154e-05	17820725	17981197
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17873030	19610243	119	110	-4.9056	7.25109520770154e-05	17820725	17981197	1.39655007422651e-15	19610243	19610243
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.3341	1.39655007422651e-15	19610243	19610243	1.37138025721431e-17	19613864	19613864
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21041164	293	267	-4.9536	1.37138025721431e-17	19613864	19613864	2.11023376741657e-13	21036503	21043581
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21042490	21054519	5	5	-2.2967	2.11023376741657e-13	21036503	21043581	4.32907583241482e-10	21047798	21057446
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	4.32907583241482e-10	21047798	21057446	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	21443476	129	121	-5.0236	NA	NA	NA	6.91338547217303e-05	21401063	21490803
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21444509	21446513	2	0	NA	6.91338547217303e-05	21401063	21490803	NA	NA	NA
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21449924	21657525	21	20	-4.0581	NA	NA	NA	4.58367155216174e-06	21569358	21683523
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21666200	22139807	108	99	-4.9895	4.58367155216174e-06	21569358	21683523	1.55772862636631e-10	22055660	22165808
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22175425	7	7	-3.0125	1.55772862636631e-10	22055660	22165808	2.36926701058581e-13	22169951	22176501
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22176501	22367156	33	29	-5.4328	2.36926701058581e-13	22169951	22176501	0.00184630303486964	22240294	22782417
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22371003	22930737	62	53	-4.8169	0.00184630303486964	22240294	22782417	6.17720052486612e-51	22930737	26870361
MSK_252152913069_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	76	-1.5074	6.17720052486612e-51	22930737	26870361	NA	NA	NA
