Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	554287	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	736471	72537426	27893	26358	0.0055	NA	NA	NA	0	72537426	72539143
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-4.0356	0	72537426	72539143	0	72574479	72579311
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11050	6e-04	0	72574479	72579311	2.73729757820195e-08	110015739	110023268
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110033018	1	0	NA	2.73729757820195e-08	110015739	110023268	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110041712	3	3	-1.0258	NA	NA	NA	3.09054277940783e-07	110041712	110060587
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	110058441	1	0	NA	3.09054277940783e-07	110041712	110060587	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110060587	145209321	4264	4023	-0.0114	NA	NA	NA	4.87643306218472e-05	145208141	145209321
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	145210914	145212735	2	2	-1.0632	4.87643306218472e-05	145208141	145209321	2.77878901702873e-06	145212735	145214357
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	145214357	147308557	290	275	0.0123	2.77878901702873e-06	145212735	145214357	1.24909992932799e-09	146274661	147346371
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147311437	147510532	34	29	0.3764	1.24909992932799e-09	146274661	147346371	2.51926144291281e-10	147460661	148088285
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150819879	1258	1178	0.0027	2.51926144291281e-10	147460661	148088285	9.40789605033888e-121	150819879	150819879
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	9	2.2607	9.40789605033888e-121	150819879	150819879	1.73704403097055e-88	150851439	150851439
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	-0.0232	1.73704403097055e-88	150851439	150851439	2.81893668003492e-10	151024118	151028700
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.9339	2.81893668003492e-10	151024118	151028700	1.55371162861510e-08	151033188	151038091
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2555	0.0031	1.5537116286151e-08	151033188	151038091	8.33557381080064e-12	157133150	157133150
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.5378	8.33557381080064e-12	157133150	157133150	1.7741047509308e-12	157136342	157136342
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200609726	15466	14634	-0.0026	1.7741047509308e-12	157136342	157136342	6.66412011316011e-08	200572541	200638221
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200803726	39	38	-0.2893	6.66412011316011e-08	200572541	200638221	7.2500243604217e-08	200679934	200827476
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	200804838	1	0	NA	7.2500243604217e-08	200679934	200827476	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200806319	246769018	17279	16321	-0.0021	NA	NA	NA	2.01650997849165e-19	246753652	246806669
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246794552	1	0	NA	2.01650997849165e-19	246753652	246806669	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246805521	246860551	25	25	-0.5416	NA	NA	NA	5.46917899700231e-12	246855902	246882156
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246862029	247186514	99	94	0.0045	5.46917899700231e-12	246855902	246882156	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10867	-0.0012	NA	NA	NA	0	34543992	34543992
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	-4.9308	0	34543992	34543992	0	34589997	34589997
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	451	0.0073	0	34589997	34589997	7.80205922604481e-10	35818921	35821494
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.3483	7.80205922604481e-10	35818921	35821494	2.25791850115876e-09	35844884	35851593
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37789939	878	827	-0.0161	2.25791850115876e-09	35844884	35851593	3.16927260049057e-10	37776576	37815049
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	25	-0.4272	3.16927260049057e-10	37776576	37815049	5.90895719944827e-12	37842223	37863712
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	146571330	32143	30344	6e-04	5.90895719944827e-12	37842223	37863712	0	146571330	146571330
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.4686	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	179767214	11204	10603	-0.0046	0	146592775	146592775	2.56715693528251e-84	179767214	179767214
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	-3.1071	2.56715693528251e-84	179767214	179767214	6.48340619180641e-86	179778919	179778919
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	212890878	10850	10251	0.001	6.48340619180641e-86	179778919	179778919	2.35366269557873e-15	212890878	212890878
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-1.1591	2.35366269557873e-15	212890878	212890878	7.72027332431944e-14	212898875	212900857
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242689978	10688	10148	-0.0065	7.72027332431944e-14	212898875	212900857	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37953375	12681	11974	-0.0017	NA	NA	NA	1.68670366186907e-09	37949781	37953375
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.7644	1.68670366186907e-09	37949781	37953375	7.07885887020775e-09	37961110	37963736
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	97788189	18667	17548	-1e-04	7.07885887020775e-09	37961110	37963736	4.54260097634615e-14	97784263	97788189
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	97792616	97809064	6	6	-0.9461	4.54260097634615e-14	97784263	97788189	6.62980080499183e-14	97809064	97810540
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	97810540	133189686	12349	11696	-0.0049	6.62980080499183e-14	97809064	97810540	8.1601221586054e-17	133189686	133189686
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.7792	8.1601221586054e-17	133189686	133189686	1.08646759614903e-17	133194685	133194685
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	1.08646759614903e-17	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	9229	-0.0014	NA	NA	NA	1.79926294698428e-74	164005577	164005577
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	2.5455	1.79926294698428e-74	164005577	164005577	5.74125683019053e-24	164019640	164027724
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	21	0.5657	5.74125683019053e-24	164019640	164027724	6.69994324074843e-19	164105613	164123806
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	194354505	10129	9548	-0.0049	6.69994324074843e-19	164105613	164123806	0	194354505	194354505
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-5.2407	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1874	-0.0042	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3214	0.0223	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.8093	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	173660684	46438	43814	-0.0026	0	9842644	9842644	7.46462421727335e-22	173660684	173660684
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.9598	7.46462421727335e-22	173660684	173660684	4.59721941882647e-23	173666072	173666072
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3846	-0.0053	4.59721941882647e-23	173666072	173666072	7.22115363899106e-159	187330240	187330240
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-5.0586	7.22115363899106e-159	187330240	187330240	5.6490714408534e-155	187333619	187333619
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1155	0.0133	5.6490714408534e-155	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	180644810	53766	50763	-0.0012	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11017	-8e-04	NA	NA	NA	1.67230218301753e-177	32558677	32564884
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-2.6562	1.67230218301753e-177	32558677	32564884	0.0446892355925658	32588005	32613538
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32633691	8	7	-1.0209	0.0446892355925658	32588005	32613538	0.00176698498054846	32609525	32633691
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	25	-0.0455	0.00176698498054846	32609525	32633691	6.7431538724703e-07	32707427	32721872
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32731072	9	8	0.6747	6.7431538724703e-07	32707427	32721872	2.74253787661834e-09	32721872	32734957
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32732764	54035000	8258	7825	-0.0031	2.74253787661834e-09	32721872	32734957	4.14830883365181e-170	54035000	54035000
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.579	4.14830883365181e-170	54035000	54035000	1.07648092967503e-195	54042734	54042734
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67060622	2771	2617	-0.0051	1.07648092967503e-195	54042734	54042734	2.34476249071636e-11	67055837	67078860
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-0.8018	2.34476249071636e-11	67055837	67078860	8.92186001226847e-11	67093216	67109079
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	74647491	2511	2340	0	8.92186001226847e-11	67093216	67109079	2.35986340656511e-190	74647491	74647491
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	-5.6928	2.35986340656511e-190	74647491	74647491	2.86884906498233e-178	74653360	74653360
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	86523662	3190	3027	0.0028	2.86884906498233e-178	74653360	74653360	2.45630718458680e-28	86522085	86530599
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	86530599	86592120	13	12	-0.934	2.4563071845868e-28	86522085	86530599	1.37881240042154e-29	86578889	86635530
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	86635530	170753106	27632	26135	-0.0055	1.37881240042154e-29	86578889	86635530	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	125831554	42438	40018	6e-04	NA	NA	NA	3.68230629750633e-21	125831554	125831554
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.6108	3.68230629750633e-21	125831554	125831554	1.66275720018914e-20	125837524	125837524
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3434	-0.0047	1.66275720018914e-20	125837524	125837524	2.43410882154710e-12	133426996	133433384
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7691	2.4341088215471e-12	133426996	133433384	2.10631565503696e-12	133448277	133455682
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3507	0.008	2.10631565503696e-12	133448277	133455682	0	141410894	141413352
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	13	-4.2253	0	141410894	141413352	3.42076610214896e-227	141438504	141440184
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	113	0.027	3.42076610214896e-227	141438504	141440184	2.15576516596195e-14	141687978	141690753
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.835	2.15576516596195e-14	141687978	141690753	1.46771306963156e-18	141714168	141720324
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	1.46771306963156e-18	141714168	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2374	0.0062	NA	NA	NA	1.20353137360929e-23	147702365	147702365
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.0801	1.20353137360929e-23	147702365	147702365	2.58583066728577e-20	147707161	147707161
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	3996	-0.0185	2.58583066728577e-20	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.0177	NA	NA	NA	3.48137186740925e-17	581533	581533
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.1237	3.48137186740925e-17	581533	581533	9.47571256083778e-25	588865	588865
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	39350798	12953	12248	-0.002	9.47571256083778e-25	588865	588865	0	39350798	39352361
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	-4.4454	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	39508035	1	0	NA	0	39504332	39505256	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39509423	87255865	12686	11992	-6e-04	NA	NA	NA	4.36910040757151e-09	87249754	87255865
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-1.0583	4.36910040757151e-09	87249754	87255865	9.9331354624981e-09	87262662	87265435
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	146264846	18743	17686	0.0027	9.9331354624981e-09	87262662	87265435	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5140	0.0043	NA	NA	NA	1.21103454017454e-88	15802255	15802255
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-3.8333	1.21103454017454e-88	15802255	15802255	4.35126629195128e-83	15807123	15807123
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70926188	7612	7179	-0.0019	4.35126629195128e-83	15807123	15807123	3.08075387223077e-53	70926188	70926188
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	3.0726	3.08075387223077e-53	70926188	70926188	3.16719554905298e-62	70930528	70930528
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	71281397	150	138	-0.0126	3.16719554905298e-62	70930528	70930528	5.06366325831525e-15	71276700	71288892
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	71281749	71281749	1	0	NA	5.06366325831525e-15	71276700	71288892	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	71287975	71310390	14	14	0.6003	NA	NA	NA	2.31983761869680e-13	71305338	71318334
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	71316860	100348045	9754	9170	-0.0065	2.3198376186968e-13	71305338	71318334	2.71854866166155e-101	100348045	100348045
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-4.3232	2.71854866166155e-101	100348045	100348045	2.91437218503595e-99	100350814	100350814
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	140145683	14949	14084	-0.0034	2.91437218503595e-99	100350814	100350814	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	47021415	14531	13717	-0.0029	NA	NA	NA	3.73113921476510e-20	46554074	47063200
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47040444	47943524	48	44	0.4013	3.7311392147651e-20	46554074	47063200	1.04795096175494e-18	47164591	47960542
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47946216	77917893	10013	9434	-0.0018	1.04795096175494e-18	47164591	47960542	2.07361860766461e-65	77917893	77917893
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.4921	2.07361860766461e-65	77917893	77917893	4.08340151637601e-63	77928669	77928669
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19046	-0.0062	4.08340151637601e-63	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2035	0.0024	NA	NA	NA	0	5741031	5741031
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-5.0127	0	5741031	5741031	0	5765438	5765438
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	7758275	862	814	0.0013	0	5765438	5765438	3.24712375264557e-16	7757329	7762277
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7762277	7783492	9	9	-0.791	3.24712375264557e-16	7757329	7762277	1.92659250319704e-14	7783344	7804964
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	7800021	2	0	NA	1.92659250319704e-14	7783344	7804964	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7803570	18896166	4346	4109	-0.0128	NA	NA	NA	1.91686950576074e-29	18896166	18896166
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-1.3589	1.91686950576074e-29	18896166	18896166	8.1761384670996e-31	18917191	18917191
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55118214	9527	8951	0.0031	8.1761384670996e-31	18917191	18917191	1.36073186447048e-14	55092628	55127355
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	36	0.391	1.36073186447048e-14	55092628	55127355	2.34140307704657e-14	55205278	55231935
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	26771	-5e-04	2.34140307704657e-14	55205278	55231935	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	275	0.0201	NA	NA	NA	9.07250389412421e-14	734832	736988
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-1.0565	9.07250389412421e-14	734832	736988	9.38270891790465e-11	743223	745410
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3239	-0.0065	9.38270891790465e-11	743223	745410	3.89154311752501e-187	9523923	9523923
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-3.8282	3.89154311752501e-187	9523923	9523923	3.85706129969268e-204	9554149	9554149
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	132289090	41414	39108	-5e-04	3.85706129969268e-204	9554149	9554149	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	114123340	31644	29883	-0.0059	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	105597555	31642	29769	-0.0021	NA	NA	NA	0	105597555	105602602
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-3.1842	0	105597555	105602602	1.43870406301399e-138	105630089	105632168
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106234009	186	176	0.0466	1.43870406301399e-138	105630089	105632168	2.04923823404525e-05	106218059	106235367
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106235367	106252126	8	8	0.6542	2.04923823404525e-05	106218059	106235367	0.000105563678429787	106249962	106269748
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106253648	106358491	37	33	0.1743	0.000105563678429787	106249962	106269748	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	100298352	31322	29582	-0.0061	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	75093957	20523	19438	0.0057	NA	NA	NA	8.20603835917985e-16	75093957	75093957
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-1.7814	8.20603835917985e-16	75093957	75093957	7.9106651642137e-15	75100865	75100865
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4829	-0.0078	7.9106651642137e-15	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	32828797	12421	11759	0.0073	NA	NA	NA	5.23898508065598e-156	32828797	32828797
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-5.3952	5.23898508065598e-156	32828797	32828797	7.22310319975048e-143	32832642	32832642
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	34535277	524	493	9e-04	7.22310319975048e-143	32832642	32832642	3.74432703788027e-19	34532597	34535277
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34537061	34564354	13	12	0.8223	3.74432703788027e-19	34532597	34535277	8.03499102283929e-20	34564354	34566579
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34566579	36673853	911	846	0.0193	8.0349910228393e-20	34564354	34566579	7.33080589292722e-51	36673853	36673853
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.8179	7.33080589292722e-51	36673853	36673853	2.14238746029895e-48	36684619	36684619
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1914	0.0168	2.14238746029895e-48	36684619	36684619	1.04885497450008e-26	41561017	41573295
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41708551	45	43	-0.4905	1.04885497450008e-26	41561017	41573295	1.56760607063282e-26	41702238	42147225
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41710400	41710400	1	0	NA	1.56760607063282e-26	41702238	42147225	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	12882	0.0058	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21681	-0.0053	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3353960	1420	1338	0.0248	NA	NA	NA	3.18405576320174e-07	3349931	3353960
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	-1.289	3.18405576320174e-07	3349931	3353960	1.09096297790671e-07	3356334	3357750
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	56823430	18451	17404	0.0206	1.09096297790671e-07	3356334	3357750	1.30106799635284e-09	56819531	56823430
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.7039	1.30106799635284e-09	56819531	56823430	2.43992801972292e-09	56840346	56844304
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1116	0.0197	2.43992801972292e-09	56840346	56844304	8.73338675543616e-11	59411618	59421197
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434159	9	9	-0.7122	8.73338675543616e-11	59411618	59421197	2.88689671547217e-11	59433190	59440274
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59434202	59434202	1	0	NA	2.88689671547217e-11	59433190	59440274	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	62648767	1436	1345	0.0056	NA	NA	NA	3.8705043328841e-10	62647139	62648767
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	62653275	62660645	5	5	-0.9094	3.8705043328841e-10	62647139	62648767	1.06178190920278e-08	62660645	62661790
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	62661790	63788698	553	523	0.0082	1.06178190920278e-08	62660645	62661790	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	557	-0.0063	NA	NA	NA	1.53511045604322e-24	1499034	1511632
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.9822	1.53511045604322e-24	1499034	1511632	6.51929530145939e-25	1531162	1544485
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	19824	-0.0053	6.51929530145939e-25	1531162	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12711	-0.0033	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	49567768	16555	15610	0.0044	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2302065	1400	1334	0.0302	NA	NA	NA	2.3562438247544e-16	2302065	2302065
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.2786	2.3562438247544e-16	2302065	2302065	3.14793590698017e-17	2304398	2304398
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2673365	364	346	0.007	3.14793590698017e-17	2304398	2304398	0.00103455837038268	2659101	2697588
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2708291	25	24	-0.254	0.00103455837038268	2659101	2697588	2.72179838477922e-92	2708291	2711273
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	21630	1.0068	2.72179838477922e-92	2708291	2711273	1.57493381109673e-19	76998610	76998610
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.0492	1.57493381109673e-19	76998610	76998610	4.7178410458559e-20	77010018	77010018
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154038318	22060	20843	1.0053	4.7178410458559e-20	77010018	77010018	2.27504870867245e-20	154037006	154038318
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154085354	13	13	0.1974	2.27504870867245e-20	154037006	154038318	3.69365913216455e-26	154085354	154086636
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154086636	154582414	120	109	1.0494	3.69365913216455e-26	154085354	154086636	9.80683188606953e-222	154578922	154586690
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	189	-2e-04	9.80683188606953e-222	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	116	-4.5038	NA	NA	NA	2.95012569670181e-30	3034907	3772482
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	2.95012569670181e-30	3034907	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.1124	NA	NA	NA	5.28226728156137e-14	5422507	6688691
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	161	-3.8434	5.28226728156137e-14	5422507	6688691	1.87192557270006e-05	7013903	7237274
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	117	-2.9447	1.87192557270006e-05	7013903	7237274	0.0575495253493058	7274653	7491280
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7608619	20	19	-4.1112	0.0575495253493058	7274653	7491280	0.0455956232286171	7590569	7643041
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7653082	18	17	-2.808	0.0455956232286171	7590569	7643041	6.25390728108882e-07	7631265	7656915
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	42	-4.4854	6.25390728108882e-07	7631265	7656915	1.35276210725292e-20	7722458	7726921
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-2.2949	1.35276210725292e-20	7722458	7726921	1.04146954041116e-05	7756907	7806091
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7897073	36	36	-3.7057	1.04146954041116e-05	7756907	7806091	3.62259408606309e-06	7893056	7897073
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905286	7905286	1	0	NA	3.62259408606309e-06	7893056	7897073	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.0369	NA	NA	NA	8.31827865257873e-10	7914104	7918899
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8289709	85	78	-4.3514	8.31827865257873e-10	7914104	7918899	4.84335832936334e-11	8254853	8289709
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	12	-2.5444	4.84335832936334e-11	8254853	8289709	1.22289119259542e-05	8316416	8341218
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	10513747	292	273	-4.0681	1.22289119259542e-05	8316416	8341218	1.67614436496236e-31	10512616	10515697
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	12	-0.5605	1.67614436496236e-31	10512616	10515697	0.0068929902410477	10620136	11673476
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	6	-2.7448	0.0068929902410477	10620136	11673476	0.00378410457572624	10655750	12452734
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.9193	0.00378410457572624	10655750	12452734	3.24444016954438e-07	12541506	12550566
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	51	-2.4143	3.24444016954438e-07	12541506	12550566	3.37077638612192e-06	12627412	12725675
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12857197	30	28	-4.0806	3.37077638612192e-06	12627412	12725675	7.51074038952463e-07	12845704	12887023
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12859309	13128515	105	101	-2.4648	7.51074038952463e-07	12845704	12887023	1.51259413506571e-05	13081856	13146483
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13254711	42	40	-3.7155	1.51259413506571e-05	13081856	13146483	0.0027128085202403	13159901	13323419
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13256555	1	0	NA	0.0027128085202403	13159901	13323419	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13532107	128	119	-4.3991	NA	NA	NA	0.00108683832480014	13478231	13559743
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13533021	13705594	48	42	-3.7389	0.00108683832480014	13478231	13559743	0.00025762623662711	13591921	13863616
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13716331	2	0	NA	0.00025762623662711	13591921	13863616	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13717328	14352278	191	175	-4.4406	NA	NA	NA	1.45688571924848e-09	14322984	14383746
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	88	-3.526	1.45688571924848e-09	14322984	14383746	3.88587591810990e-13	14500820	14526446
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	3.8858759181099e-13	14500820	14526446	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.3642	NA	NA	NA	1.46244815059105e-10	14569287	14579298
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.2799	1.46244815059105e-10	14569287	14579298	0.0077388869870434	14596156	14687556
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14700040	17	17	-2.4948	0.0077388869870434	14596156	14687556	8.36783931967907e-05	14694578	14731122
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15915466	394	372	-3.9824	8.36783931967907e-05	14694578	14731122	1.35976156456995e-08	15788556	15958396
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16088722	70	64	-2.9094	1.35976156456995e-08	15788556	15958396	1.13673809434064e-14	16067790	16118971
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16090556	16090556	1	0	NA	1.13673809434064e-14	16067790	16118971	NA	NA	NA
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16091622	21036411	761	711	-4.1312	NA	NA	NA	1.29559398327532e-05	21025500	21042490
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.8964	1.29559398327532e-05	21025500	21042490	2.39486705281049e-08	21043581	21057446
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	247	-4.1804	2.39486705281049e-08	21043581	21057446	1.45509897676232e-09	22055660	22157319
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22178964	10	9	-2.0831	1.45509897676232e-09	22055660	22157319	1.09307919759172e-13	22178964	22179794
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22261337	26	24	-4.9294	1.09307919759172e-13	22178964	22179794	0.000216451947740226	22210081	22379285
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22263267	22877495	48	43	-4.0449	0.000216451947740226	22210081	22379285	0.0368855267795254	22833133	22916746
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22930737	18	16	-4.6891	0.0368855267795254	22833133	22916746	5.44139130552415e-20	22930737	26870361
MSK_252152911456_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	82	-1.2757	5.44139130552415e-20	22930737	26870361	NA	NA	NA
