Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34849815	12891	11404	0.1178	NA	NA	NA	1.37731426236616e-61	34827650	34876833
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34853835	35143819	127	113	-0.4108	1.37731426236616e-61	34827650	34876833	0.000363294356540459	35125044	35151353
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	35146450	35166290	12	8	-0.8972	0.000363294356540459	35125044	35151353	3.92114348286028e-05	35164244	35184807
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	35170315	35461277	103	91	-0.3724	3.92114348286028e-05	35164244	35184807	5.71162097704744e-45	35441891	35494817
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	35466276	85745222	18819	16567	0.1047	5.71162097704744e-45	35441891	35494817	2.06546486700022e-12	85723768	85754728
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85753561	85781420	15	12	-0.3233	2.06546486700022e-12	85723768	85754728	2.84394731235415e-06	85778723	85789378
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85782624	86171390	161	142	0.1695	2.84394731235415e-06	85778723	85789378	1.64087506645899e-09	86171390	86171390
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86173546	86175273	2	2	-1.3246	1.64087506645899e-09	86171390	86171390	2.77582720579553e-08	86175273	86175273
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	86179068	110023268	7481	6609	0.097	2.77582720579553e-08	86175273	86175273	6.80832976456011e-17	110023268	110023268
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	1.7232	6.80832976456011e-17	110023268	110023268	1.30440684184484e-17	110039388	110039388
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	110041712	1	0	NA	1.30440684184484e-17	110039388	110039388	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	120333077	3815	3354	0.0875	NA	NA	NA	7.9823375967769e-10	120329400	120347824
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120338395	120415520	12	10	-0.5902	7.9823375967769e-10	120329400	120347824	5.14906073330237e-11	120404156	120705146
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120705146	121052394	59	53	0.105	5.14906073330237e-11	120404156	120705146	2.46198726985443e-28	121024339	142725580
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	141559466	150819879	1963	1730	-0.3885	2.46198726985443e-28	121024339	142725580	1.97614375361948e-06	150818222	150819879
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-1.2577	1.97614375361948e-06	150818222	150819879	3.95803207929727e-05	150839754	150839754
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	-3.316	3.95803207929727e-05	150839754	150839754	1.29577840691987e-113	150851439	150851439
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2453	-0.3808	1.29577840691987e-113	150851439	150851439	1.83833963635425e-70	157133150	157133150
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-4.3575	1.83833963635425e-70	157133150	157133150	1.36262637025651e-72	157136342	157136342
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	247186514	32910	28931	-0.397	1.36262637025651e-72	157136342	157136342	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	10159	0.0387	NA	NA	NA	1.77897970007366e-40	34542224	34543992
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	19	1.0218	1.77897970007366e-40	34542224	34543992	1.03317285653200e-43	34591681	34595734
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	35821494	483	417	0.0267	1.033172856532e-43	34591681	34595734	8.71071435768705e-08	35818921	35821494
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.3207	8.71071435768705e-08	35818921	35821494	7.48696915656762e-08	35844884	35851593
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37785655	876	768	0.0206	7.48696915656762e-08	35844884	35851593	6.46451252407075e-12	37767547	37800512
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37787637	37858379	30	28	-0.4117	6.46451252407075e-12	37767547	37800512	1.98188081282538e-13	37848754	37868682
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	52600588	5800	5114	0.0546	1.98188081282538e-13	37848754	37868682	2.07824671386533e-09	52580357	52600588
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.7801	2.07824671386533e-09	52580357	52600588	8.33156192795825e-06	52635695	52645468
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	72645254	6743	5948	0.0475	8.33156192795825e-06	52635695	52645468	4.2850252924851e-250	72623326	72668218
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	72649538	75630471	1164	1011	0.3982	4.2850252924851e-250	72623326	72668218	1.18878704414392e-175	75606322	75658626
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	75632474	83698359	2124	1867	0.0409	1.18878704414392e-175	75606322	75658626	7.10485061972264e-215	83601357	83734931
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	83704543	89890854	1587	1368	0.4069	7.10485061972264e-215	83601357	83734931	0	89755931	91151411
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89902365	191412495	29420	25905	0.0512	0	89755931	91151411	1.30662389188551e-32	191320447	191452878
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	191419937	191425388	2	0	NA	1.30662389188551e-32	191320447	191452878	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	191428033	191747945	145	128	0.3905	NA	NA	NA	1.32849625802946e-22	191725202	191761523
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	191750020	191896501	61	58	0.8645	1.32849625802946e-22	191725202	191761523	0.00453174479357067	191881401	191899511
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	191899511	191904229	3	3	0.2488	0.00453174479357067	191881401	191899511	0.009922018777182	191904229	191925693
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	191907379	195147777	612	542	-0.4112	0.009922018777182	191904229	191925693	1.88537611680065e-32	195109252	195170494
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	195156882	195735967	90	83	0.0283	1.88537611680065e-32	195109252	195170494	1.08710263882575e-33	195707863	195848162
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	195745918	195745918	1	0	NA	1.08710263882575e-33	195707863	195848162	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	195752978	212253752	6145	5441	-0.393	NA	NA	NA	2.99904562101609e-49	212239489	212265980
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212259836	212566503	144	125	0.0232	2.99904562101609e-49	212239489	212265980	7.76232614716e-54	212558044	212587627
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212568600	230351785	6116	5369	-0.4176	7.76232614716e-54	212558044	212587627	2.82146631764453e-12	230331007	230360461
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	230352889	230352889	1	0	NA	2.82146631764453e-12	230331007	230360461	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	230355337	230422431	35	34	-0.0101	NA	NA	NA	8.04124642554216e-12	230416272	230446027
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	230424903	238217378	3009	2644	-0.4133	8.04124642554216e-12	230416272	230446027	8.14751185924482e-116	238217378	238217378
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238219154	238223192	4	4	-4.0017	8.14751185924482e-116	238217378	238217378	9.88477538520916e-104	238223192	238223192
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238224411	238902160	306	278	-0.4413	9.88477538520916e-104	238223192	238223192	1.05793296087041e-110	238902160	238902160
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238904143	238908940	4	4	-4.1294	1.05793296087041e-110	238902160	238902160	1.18676616880780e-123	238908940	238908940
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238911803	238914007	2	0	NA	1.1867661688078e-123	238908940	238908940	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238915851	238994999	41	38	-0.452	NA	NA	NA	6.11693959386783e-10	238993804	238994999
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238997323	238999739	2	2	1.033	6.11693959386783e-10	238993804	238994999	4.957935266065e-10	238999739	239002088
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	239002088	239571820	164	139	-0.491	4.957935266065e-10	238999739	239002088	2.13123781683625e-05	239528281	239580879
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	239574589	239627111	20	19	-0.1216	2.13123781683625e-05	239528281	239580879	0.025919888872188	239614031	239628730
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	239628730	239631901	3	3	-0.5777	0.025919888872188	239614031	239628730	0.0214087802764925	239630271	239681594
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	239633211	239633211	1	0	NA	0.0214087802764925	239630271	239681594	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	239634551	240304927	284	248	-0.0219	NA	NA	NA	1.63670093371854e-19	240281625	240317604
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	240308034	240416345	56	46	-0.4914	1.63670093371854e-19	240281625	240317604	1.99024621702719e-18	240410653	240439487
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	240417884	240419236	2	0	NA	1.99024621702719e-18	240410653	240439487	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	240420750	242689978	799	711	-0.0208	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	586636	198	170	0.3365	NA	NA	NA	1.58975461432906e-15	584043	589224
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	589224	635754	12	10	-0.6426	1.58975461432906e-15	584043	589224	2.42461202982983e-21	626604	643285
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	641257	641257	1	0	NA	2.42461202982983e-21	626604	643285	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	643285	37953375	12470	11001	0.3403	NA	NA	NA	1.64916670515450e-08	37951628	37955930
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.4789	1.6491667051545e-08	37951628	37955930	1.51375018589993e-08	37960019	37964405
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	75479859	14189	12521	0.362	1.51375018589993e-08	37960019	37964405	6.55057020060922e-18	75469606	75799026
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	76000715	19	17	-0.3461	6.55057020060922e-18	75469606	75799026	0.000729181744016233	75858339	76034950
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76006248	76066005	15	13	0.3641	0.000729181744016233	75858339	76034950	9.11931676658625e-05	76057688	76066005
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76067455	76081578	7	6	-0.5042	9.11931676658625e-05	76057688	76066005	5.60578011998315e-18	76081578	76083514
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76083514	115056375	9795	8663	0.3391	5.60578011998315e-18	76081578	76083514	1.38614193093087e-21	115055058	115061087
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	115057294	115099774	16	15	-0.4838	1.38614193093087e-21	115055058	115061087	1.16432952026429e-22	115094864	115103716
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	115103716	133189686	6981	6183	0.3652	1.16432952026429e-22	115094864	115103716	2.51384995385945e-132	133189686	133189686
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-5.175	2.51384995385945e-132	133189686	133189686	9.65703523261468e-144	133194685	133194685
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	9.65703523261468e-144	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	139133523	1941	1730	0.3727	NA	NA	NA	0	139045659	139163040
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	139139070	164005577	7838	6903	0.8189	0	139045659	139163040	1.26203404912664e-53	164005577	164005577
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	3.2967	1.26203404912664e-53	164005577	164005577	3.52343438553323e-27	164027724	164027724
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	1.4074	3.52343438553323e-27	164027724	164027724	6.70264632379075e-14	164101776	164126256
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	196820428	11131	9810	0.816	6.70264632379075e-14	164101776	164126256	1.01691654638251e-11	196807153	196907040
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196822133	196822133	1	0	NA	1.01691654638251e-11	196807153	196907040	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196940125	22	20	0.2841	NA	NA	NA	9.9357578476261e-12	196925203	196946355
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196942158	199321387	960	852	0.8193	9.9357578476261e-12	196925203	196946355	2.76588142275192e-07	199320046	199321387
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199324677	199329592	2	2	-0.5077	2.76588142275192e-07	199320046	199321387	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	58159	8	6	-0.7861	NA	NA	NA	1.11667155853137e-12	53781	61552
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	1726422	557	503	0.3096	1.11667155853137e-12	53781	61552	3.49439669013262e-16	1716626	1748519
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1732474	1808510	27	24	0.9486	3.49439669013262e-16	1716626	1748519	1.75858918506258e-10	1788415	1824451
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1812509	2509412	288	260	1.5197	1.75858918506258e-10	1788415	1824451	2.20069613321491e-13	2438536	2579019
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	2511313	3053850	201	171	1.2413	2.20069613321491e-13	2438536	2579019	8.24793540412194e-07	3006126	3080161
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	3056967	3056967	1	0	NA	8.24793540412194e-07	3006126	3080161	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	3058672	3153521	41	36	0.9085	NA	NA	NA	1.19298658614175e-66	3153521	3155285
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	3155285	34445002	8440	7414	0.0057	1.19298658614175e-66	3153521	3155285	9.03845037289033e-10	34433787	34445002
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34485596	5	5	-0.9472	9.03845037289033e-10	34433787	34445002	1.81262136306674e-11	34485596	34491115
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34491115	39517718	1586	1417	0.0404	1.81262136306674e-11	34485596	34491115	4.94339460901502e-09	39513300	39517718
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39520158	39525169	5	5	0.832	4.94339460901502e-09	39513300	39517718	2.13234941346078e-16	39525169	39528779
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39527607	68905670	7273	6388	0.0054	2.13234941346078e-16	39525169	39528779	6.64967613101143e-32	68901210	69069651
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.9922	6.64967613101143e-32	68901210	69069651	2.75736135590491e-30	69153675	69643272
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	180603072	33334	29289	0.0126	2.75736135590491e-30	69153675	69643272	0	180582381	180639958
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	180610214	190767854	3281	2869	-0.4782	0	180582381	180639958	1.29447356860058e-12	190708316	190802789
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190772330	190921041	54	47	-0.8265	1.29447356860058e-12	190708316	190802789	5.30928218469576e-07	190891595	190953947
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	40	-0.4627	5.30928218469576e-07	190891595	190953947	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3497	-0.0184	NA	NA	NA	4.87579939468876e-82	12857302	12857302
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.3188	4.87579939468876e-82	12857302	12857302	2.05734348064156e-87	12873052	12873052
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	64495490	13602	12057	0.0325	2.05734348064156e-87	12873052	12873052	0	64487600	64517282
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	64501740	64501740	1	0	NA	0	64487600	64517282	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	64503001	103083523	11174	9886	-0.4271	NA	NA	NA	9.56993703981797e-195	103071387	103092342
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	103092342	104039248	157	140	-1.2036	9.56993703981797e-195	103071387	103092342	2.26361884494887e-158	104039248	104050789
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104050789	104148204	26	23	0.5589	2.26361884494887e-158	104039248	104050789	2.26179607243182e-107	104145969	104148204
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104151464	104151464	1	0	NA	2.26179607243182e-107	104145969	104148204	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104153463	104294127	27	25	-1.3892	NA	NA	NA	2.51491126595362e-52	104294127	104300193
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	104300193	117968720	3750	3291	-0.4335	2.51491126595362e-52	104294127	104300193	1.36412267110129e-146	117938073	117996135
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	117973446	118913910	354	302	0.0446	1.36412267110129e-146	117938073	117996135	1.89021581013221e-43	118901547	118919948
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	118918183	119267486	69	60	0.6662	1.89021581013221e-43	118901547	118919948	8.75719215400476e-08	119247525	119267486
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	119281850	119332489	8	8	-0.0162	8.75719215400476e-08	119247525	119267486	3.83287710985246e-08	119332489	119356757
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	119337096	119401232	10	7	0.9312	3.83287710985246e-08	119332489	119356757	0.00319344834841806	119377405	119401232
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	119406535	119409956	2	2	2.235	0.00319344834841806	119377405	119401232	7.3995875727876e-11	119409956	119409956
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	119421269	120139707	217	193	0.653	7.3995875727876e-11	119409956	119409956	4.00523567150073e-34	120139707	120139707
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	120145645	120145645	1	0	NA	4.00523567150073e-34	120139707	120139707	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	120155113	120170923	4	4	-1.3037	NA	NA	NA	4.72450971109218e-07	120170923	120186898
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	120186898	121314387	181	162	-0.4864	4.72450971109218e-07	120170923	120186898	2.06141632492855e-70	121303779	121324992
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	121321656	122246712	317	281	0.0433	2.06141632492855e-70	121303779	121324992	8.65057778681892e-117	122235911	122258420
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	122248574	127432675	1439	1272	-0.4084	8.65057778681892e-117	122235911	122258420	4.31071506196337e-87	127432675	127432675
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127434789	127434789	1	0	NA	4.31071506196337e-87	127432675	127432675	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	-4.5705	NA	NA	NA	3.37015323345928e-83	127438118	127438118
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	130495135	823	748	-0.4216	3.37015323345928e-83	127438118	127438118	1.59622290357808e-113	130460673	130512062
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	130502810	131180294	287	259	0.0725	1.59622290357808e-113	130460673	130512062	5.44464801393266e-123	131164193	131220895
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	131183095	162493557	11359	10030	-0.3865	5.44464801393266e-123	131164193	131220895	5.36320546452294e-173	162448545	162538109
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	162504945	165666639	568	499	0.0091	5.36320546452294e-173	162448545	162538109	0	165666639	165672410
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	165672410	180644810	5409	4792	-1.1796	0	165666639	165672410	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	240119	55	48	0.255	NA	NA	NA	2.13641203340237e-16	234115	244363
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	326323	45	42	-0.387	2.13641203340237e-16	234115	244363	1.22431804684058e-56	323898	327962
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	18371831	6437	5694	0.3817	1.22431804684058e-56	323898	327962	6.02928166881947e-11	18368026	18373481
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18373481	18378787	3	3	1.6732	6.02928166881947e-11	18368026	18373481	1.61677296808671e-09	18375068	18378787
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18380299	18594469	101	90	0.3913	1.61677296808671e-09	18375068	18378787	5.4478734203515e-08	18594469	18594469
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18597901	18600015	2	2	1.735	5.4478734203515e-08	18594469	18594469	9.24903158941608e-08	18600015	18605515
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18605515	29966336	3945	3469	0.3815	9.24903158941608e-08	18600015	18605515	6.40599937379792e-07	29930018	30000990
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29972382	30049982	23	19	0.7993	6.40599937379792e-07	29930018	30000990	0.000121917554447036	30021908	30089884
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30052053	32558677	1065	943	0.4198	0.000121917554447036	30021908	30089884	3.52985466765228e-177	32558677	32558677
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	8	-3.0302	3.52985466765228e-177	32558677	32558677	0.000709699628777975	32605300	32626619
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	32633691	7	7	-1.5967	0.000709699628777975	32605300	32626619	5.45903201957091e-18	32629848	32634977
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	24	0.4393	5.45903201957091e-18	32629848	32634977	3.57191897106156e-08	32709263	32718991
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	6	1.4707	3.57191897106156e-08	32709263	32718991	4.07693943931581e-14	32721872	32731072
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	7253	0.3914	4.07693943931581e-14	32721872	32731072	1.92100470384792e-108	54035000	54037199
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.7672	1.92100470384792e-108	54035000	54037199	1.93167601218143e-110	54039814	54042734
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	63195003	1774	1559	0.3328	1.93167601218143e-110	54039814	54042734	3.05619823861127e-165	63137067	63218892
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	63198022	64894780	430	367	0.824	3.05619823861127e-165	63137067	63218892	0	64894780	64894780
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	64902828	72919733	2331	2046	-0.4577	0	64894780	64894780	7.2123489850451e-104	72919733	72919733
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-4.2572	7.2123489850451e-104	72919733	72919733	4.79692931348461e-100	72924440	72924440
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	81334248	2635	2303	-0.4144	4.79692931348461e-100	72924440	72924440	1.54231008778073e-112	81334248	81334248
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81341711	81344819	2	2	-5.398	1.54231008778073e-112	81334248	81334248	2.37072080208655e-117	81344819	81344819
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81348170	81348170	1	0	NA	2.37072080208655e-117	81344819	81344819	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	81350502	170753106	28949	25490	-0.4285	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	4735	-0.4555	NA	NA	NA	2.89100580547996e-55	16135701	16135701
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.0384	2.89100580547996e-55	16135701	16135701	3.2492193499586e-61	16140018	16140018
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	38257171	8209	7221	-0.4319	3.2492193499586e-61	16140018	16140018	5.61315946463967e-09	38227478	38284077
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38258332	38347160	45	41	-0.1164	5.61315946463967e-09	38227478	38284077	1.81796358554854e-08	38330907	38395279
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38349033	38349033	1	0	NA	1.81796358554854e-08	38330907	38395279	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38360187	52276932	4366	3832	-0.4296	NA	NA	NA	8.83517185212698e-10	52273151	52279938
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52279938	52287180	3	3	0.8085	8.83517185212698e-10	52273151	52279938	9.54994962269215e-09	52284751	52290833
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52289210	52289210	1	0	NA	9.54994962269215e-09	52284751	52290833	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52290833	71894353	3772	3326	-0.4003	NA	NA	NA	1.89522925606244e-09	71894353	71894353
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-1.9293	1.89522925606244e-09	71894353	71894353	1.65338040438395e-19	71912065	71912065
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	93162991	6659	5875	-0.4263	1.65338040438395e-19	71912065	71912065	1.38486748665641e-48	93162991	93162991
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	-3.7503	1.38486748665641e-48	93162991	93162991	9.13231414950102e-53	93168978	93168978
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	95327399	798	707	-0.4199	9.13231414950102e-53	93168978	93168978	0	95297247	95335252
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	95327680	116450686	9017	7920	0.0699	0	95297247	95335252	1.49976031876747e-12	116426888	116470951
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	116452385	116452385	1	0	NA	1.49976031876747e-12	116426888	116470951	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	116454345	116507966	26	24	0.4534	NA	NA	NA	7.40721756126535e-09	116490113	116522640
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	116510269	118611324	973	843	0.0415	7.40721756126535e-09	116490113	116522640	9.48278478150833e-21	118611324	118611324
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118619693	2	2	-2.0974	9.48278478150833e-21	118611324	118611324	1.71797252177173e-19	118619693	118619693
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118620875	118622742	2	0	NA	1.71797252177173e-19	118619693	118619693	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118629597	125831554	3169	2805	0.0134	NA	NA	NA	5.28664711774184e-157	125831554	125831554
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.808	5.28664711774184e-157	125831554	125831554	1.57196377941085e-150	125837524	125837524
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133432281	3653	3213	0.0675	1.57196377941085e-150	125837524	125837524	4.63604314840962e-177	133432281	133432281
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133433384	133433384	1	0	NA	4.63604314840962e-177	133432281	133432281	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-3.1818	NA	NA	NA	2.46505150298943e-180	133448277	133448277
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3398	0.0652	2.46505150298943e-180	133448277	133448277	7.57913822712253e-54	141690753	141690753
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.6517	7.57913822712253e-54	141690753	141690753	1.10944020341851e-36	141714168	141720324
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	1.10944020341851e-36	141714168	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	142156165	167	143	0.2044	NA	NA	NA	6.31998072911092e-43	142156165	142161005
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142167908	5	5	-2.4192	6.31998072911092e-43	142156165	142161005	2.60297061331686e-57	142166710	142167908
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	144578280	879	774	0.0332	2.60297061331686e-57	142166710	142167908	5.07439858893484e-06	144570592	144578280
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144579506	144582865	3	3	1.0418	5.07439858893484e-06	144570592	144578280	4.67322491014083e-07	144582865	144590376
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144590376	147168935	1193	1055	0.0182	4.67322491014083e-07	144582865	144590376	5.05847782944647e-06	147167412	147168935
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147170276	147170312	2	2	1.1809	5.05847782944647e-06	147167412	147168935	8.96205240064942e-06	147170312	147177396
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147176659	147176659	1	0	NA	8.96205240064942e-06	147170312	147177396	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147177396	147702365	261	233	0.0668	NA	NA	NA	1.50987615979130e-108	147702365	147702365
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-4.6764	1.5098761597913e-108	147702365	147702365	2.56803816716749e-93	147707161	147707161
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	151728811	1630	1439	0.0337	2.56803816716749e-93	147707161	147707161	5.16169488923624e-11	151723833	151728811
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.7932	5.16169488923624e-11	151723833	151728811	2.01740651306107e-09	151743145	151747905
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	158821263	2600	2254	-0.0099	2.01740651306107e-09	151743145	151747905	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	112	-0.1275	NA	NA	NA	1.59766232482753e-14	581533	581533
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.1567	1.59766232482753e-14	581533	581533	5.83969981391497e-19	588865	588865
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	12627630	3882	3424	-0.0442	5.83969981391497e-19	588865	588865	0	11943616	12641733
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	12630784	16105013	1254	1089	-0.4954	0	11943616	12641733	5.05251480760614e-12	16087634	16111556
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16109524	16304869	38	35	-0.0901	5.05251480760614e-12	16087634	16111556	3.37837914942014e-10	16285339	16403986
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16309306	16869117	92	84	-0.438	3.37837914942014e-10	16285339	16403986	8.58263797276076e-19	16856956	16885246
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16874181	16956370	35	32	0.0777	8.58263797276076e-19	16856956	16885246	5.34944134110229e-15	16952401	16966994
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16957726	16957726	1	0	NA	5.34944134110229e-15	16952401	16966994	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16959516	17085753	63	58	-0.4873	NA	NA	NA	7.9142530735456e-28	17076385	17099517
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	17088496	25119007	2672	2344	-0.014	7.9142530735456e-28	17076385	17099517	1.02027999026300e-48	25119007	25119007
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25120552	1	0	NA	1.020279990263e-48	25119007	25119007	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	2.6985	NA	NA	NA	7.10830325501441e-51	25125700	25125700
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	30105225	1950	1691	0.0147	7.10830325501441e-51	25125700	25125700	0	30089953	30119866
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	30107252	30108712	2	0	NA	0	30089953	30119866	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	30109992	34699057	1532	1357	-0.4505	NA	NA	NA	9.807518911466e-237	34658302	34723346
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	34703797	38154487	953	822	-0.0124	9.807518911466e-237	34658302	34723346	5.24651727687995e-07	38131282	38168564
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38156465	38200127	18	16	0.4173	5.24651727687995e-07	38131282	38168564	7.60520994887433e-05	38184465	38235501
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38204506	38204506	1	0	NA	7.60520994887433e-05	38184465	38235501	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38206640	39350798	456	402	0.0396	NA	NA	NA	1.90341342859271e-48	39339800	39350798
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	52	0.7067	1.90341342859271e-48	39339800	39350798	1.51877759521844e-40	39504332	39511632
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	39986321	177	157	0.052	1.51877759521844e-40	39504332	39511632	7.1107431930438e-21	39971727	39993009
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39988882	40161956	44	39	0.6044	7.1107431930438e-21	39971727	39993009	4.51267181152616e-11	40132923	40267147
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40165904	42703142	874	794	1.0051	4.51267181152616e-11	40132923	40267147	0	42681879	42733461
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	42703350	145051910	29930	26368	0.6338	0	42681879	42733461	0	145045691	145065081
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145062148	145081795	8	5	-0.1642	0	145045691	145065081	1.20835936262288e-05	145078093	145088337
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145083122	146264846	400	343	0.7586	1.20835936262288e-05	145078093	145088337	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	496225	146	125	0.0435	NA	NA	NA	3.39134796828772e-15	496225	496225
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	499521	499521	1	0	NA	3.39134796828772e-15	496225	496225	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	501710	507485	4	4	-1.238	NA	NA	NA	1.43300831282781e-12	507485	507485
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	509666	2135333	609	537	0.0113	1.43300831282781e-12	507485	507485	2.48691359968799e-09	2135333	2135333
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2138129	2139868	2	2	-1.5174	2.48691359968799e-09	2135333	2135333	1.38350640651249e-10	2139868	2139868
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2143843	15802255	4696	4162	0.0085	1.38350640651249e-10	2139868	2139868	3.75899481948551e-36	15802255	15802255
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-2.7584	3.75899481948551e-36	15802255	15802255	1.38814040581600e-33	15807123	15807123
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70221479	7301	6398	0.0185	1.388140405816e-33	15807123	15807123	1.22025949209348e-67	67915082	70240985
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70223138	70926188	311	278	0.3571	1.22025949209348e-67	67915082	70240985	4.33857900704932e-09	70923005	70926188
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.7042	4.33857900704932e-09	70923005	70926188	0	70930528	70935055
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	104187961	11280	9917	0.1401	0	70930528	70935055	0	104146472	104205654
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	104195508	104359749	41	37	-0.5357	0	104146472	104205654	5.91596437030179e-26	104351685	104366562
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	104363043	112062107	2451	2171	0.0087	5.91596437030179e-26	104351685	104366562	3.92837213183507e-137	112062107	112062107
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-5.2835	3.92837213183507e-137	112062107	112062107	0	112069192	112069192
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	140145683	11096	9766	0.1655	0	112069192	112069192	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	8653	-0.0467	NA	NA	NA	3.39347156584567e-85	27038538	27038538
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.3555	3.39347156584567e-85	27038538	27038538	1.08233970663792e-87	27041812	27041812
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1349	-0.0246	1.08233970663792e-87	27041812	27041812	1.31782861491853e-282	31284926	31284926
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-6.3556	1.31782861491853e-282	31284926	31284926	2.23904821503534e-259	31291525	31291525
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	46396163	3169	2798	-0.0417	2.23904821503534e-259	31291525	31291525	2.50972879311909e-15	45476905	46427571
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46399272	47068616	75	62	-0.3898	2.50972879311909e-15	45476905	46427571	2.35453948906074e-24	46568496	47099857
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47072924	77917893	10053	8868	-0.0247	2.35453948906074e-24	46568496	47099857	4.47167193127235e-22	77917893	77917893
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.2986	4.47167193127235e-22	77917893	77917893	1.07545561154764e-22	77928669	77928669
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	122014085	15453	13678	-0.0145	1.07545561154764e-22	77928669	77928669	7.9353474104374e-22	121922418	122046821
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	122022424	122022424	1	0	NA	7.9353474104374e-22	121922418	122046821	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	122027124	122281877	82	72	0.3596	NA	NA	NA	3.74012633349127e-22	122271711	122297484
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	122285393	123957735	628	560	-0.012	3.74012633349127e-22	122271711	122297484	1.9301124985048e-06	123955023	123957735
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123959854	123969584	5	4	-0.8436	1.9301124985048e-06	123955023	123957735	5.90130549669924e-05	123969584	123980403
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123971172	125442778	539	479	-0.059	5.90130549669924e-05	123969584	123980403	1.85213407057149e-27	125435595	125449125
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	125444649	125551184	52	46	-0.6121	1.85213407057149e-27	125435595	125449125	5.6634937678387e-30	125546145	125563284
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	125554440	127563278	736	645	-0.0551	5.6634937678387e-30	125546145	125563284	9.48523585661031e-26	127560827	127563278
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127598425	14	12	-1.046	9.4852358566103e-26	127560827	127563278	2.79396287912125e-21	127598425	127599309
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127599309	135285645	2704	2371	-0.11	2.79396287912125e-21	127598425	127599309	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1555	0.2999	NA	NA	NA	2.23104764927036e-209	4923300	4923300
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.4785	2.23104764927036e-209	4923300	4923300	4.25007136359977e-252	4932214	4932214
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	4934594	1	0	NA	4.25007136359977e-252	4932214	4932214	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4937118	106733851	33204	29248	0.3801	NA	NA	NA	9.85714306714103e-264	106733851	106733851
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	-5.1821	9.85714306714103e-264	106733851	106733851	1.64294653766215e-240	106747920	106747920
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	108814628	796	694	0.4144	1.64294653766215e-240	106747920	106747920	7.33008278452114e-209	108797198	108869033
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	108816072	134450318	9522	8377	0.0398	7.33008278452114e-209	108797198	108869033	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	262	0.0288	NA	NA	NA	2.52060203181023e-254	736988	736988
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-5.1693	2.52060203181023e-254	736988	736988	7.58888871221544e-235	743223	743223
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9516067	3441	3057	0.0076	7.58888871221544e-235	743223	743223	3.37836436681766e-205	9516067	9516067
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9523923	9523923	1	0	NA	3.37836436681766e-205	9516067	9516067	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-4.3167	NA	NA	NA	9.549013137741e-191	9554149	9554149
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9555181	1	0	NA	9.549013137741e-191	9554149	9554149	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9563866	11116883	581	510	-0.0031	NA	NA	NA	6.20211846323876e-18	11110735	11116883
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11128557	5	4	1.4736	6.20211846323876e-18	11110735	11116883	2.03839275681723e-18	11128557	11128557
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	11140421	2	0	NA	2.03839275681723e-18	11128557	11128557	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	116961617	35159	31038	0.0097	NA	NA	NA	8.92188101479422e-37	116950124	116974302
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	116964247	117152457	92	79	-0.4503	8.92188101479422e-37	116950124	116974302	2.29870990153829e-34	117139166	117165141
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	117154507	130943064	5022	4426	0.0089	2.29870990153829e-34	117139166	117165141	6.44279652051881e-25	130943064	130943064
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.661	6.44279652051881e-25	130943064	130943064	3.58488803859334e-13	130946248	130946248
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	478	-0.1036	3.58488803859334e-13	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	10742	0.3123	NA	NA	NA	4.17610379998489e-20	49964838	49964838
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.8431	4.17610379998489e-20	49964838	49964838	1.84457229533766e-20	49971732	49971732
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	52355687	1022	893	0.3236	1.84457229533766e-20	49971732	49971732	2.34551849475254e-07	52340263	52363854
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	52359086	52393225	7	7	1.0191	2.34551849475254e-07	52340263	52363854	2.44427155832399e-07	52388404	52414605
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	52400289	56650373	775	698	0.2681	2.44427155832399e-07	52388404	52414605	1.40155216930939e-07	56596626	56658479
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56686863	16	15	0.7918	1.40155216930939e-07	56596626	56658479	2.83387761864003e-10	56685341	56699800
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56688605	68142120	2693	2374	0.2213	2.83387761864003e-10	56685341	56699800	1.04359799741363e-09	68134536	68142120
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	8	-0.5376	1.04359799741363e-09	68134536	68142120	3.16223436111594e-11	68163523	68168882
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	89659397	5549	4925	0.2671	3.16223436111594e-11	68163523	68168882	3.67695602244157e-152	89659397	89659397
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-5.505	3.67695602244157e-152	89659397	89659397	2.19094592123863e-147	89662326	89662326
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	8220	0.2849	2.19094592123863e-147	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18537177	5	4	-0.3889	NA	NA	NA	4.01013190519692e-07	18537177	18864561
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18544772	18544772	1	0	NA	4.01013190519692e-07	18537177	18864561	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	50	-1.2593	NA	NA	NA	1.07852417080524e-83	19492531	19497023
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	32803673	4909	4306	-0.3961	1.07852417080524e-83	19492531	19497023	4.42905902920598e-09	32801029	32804750
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	32804750	32814590	6	4	-1.3722	4.42905902920598e-09	32801029	32804750	4.17121271477313e-08	32813512	32816083
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	32816083	40676611	2673	2369	-0.4102	4.17121271477313e-08	32813512	32816083	0	40676611	40676611
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	7	-5.3363	0	40676611	40676611	0	40726930	40726930
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	51700546	3015	2665	-0.4428	0	40726930	40726930	0	51663990	51730932
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	51709763	54450902	939	814	0.0403	0	51663990	51730932	1.36558640144953e-307	54442882	54466179
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	54452114	67118131	5058	4459	-0.3992	1.36558640144953e-307	54442882	54466179	3.67531778543781e-66	67106787	67128530
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	67120168	67120168	1	0	NA	3.67531778543781e-66	67106787	67128530	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	67121500	67420391	141	125	0.0921	NA	NA	NA	5.12596395474311e-69	67404469	67436507
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	67422396	67424192	2	0	NA	5.12596395474311e-69	67404469	67436507	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	67426129	93949667	10426	9197	-0.4118	NA	NA	NA	5.23291739566103e-09	93938868	93957261
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	93953672	93978452	12	12	0.1909	5.23291739566103e-09	93938868	93957261	6.53399329136692e-09	93974640	93984889
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	93980445	104235131	3970	3505	-0.4271	6.53399329136692e-09	93974640	93984889	1.00484945754977e-104	104220081	104255496
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	104237816	105595302	421	368	-0.0322	1.00484945754977e-104	104220081	104255496	1.62726321528422e-197	105595302	105595302
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105597555	1	0	NA	1.62726321528422e-197	105595302	105595302	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-3.5321	NA	NA	NA	2.02135304916621e-134	105632168	105632168
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	49	0.0258	2.02135304916621e-134	105632168	105632168	1.20482790423232e-08	105856591	105856972
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-1.1976	1.20482790423232e-08	105856591	105856972	4.14415814122043e-08	105875924	105881677
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106121319	83	75	0.0936	4.14415814122043e-08	105875924	105881677	4.78863760324435e-09	106092825	106135105
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106125325	106214372	41	37	-0.3686	4.78863760324435e-09	106092825	106135105	6.84387174564105e-06	106199156	106221696
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	17	-0.8727	6.84387174564105e-06	106199156	106221696	4.2310423058876e-08	106249962	106260876
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	30	-0.3188	4.2310423058876e-08	106249962	106260876	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	-0.8657	NA	NA	NA	0.00121374537367859	18427151	18824622
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	18886649	24	20	-0.1466	0.00121374537367859	18427151	18824622	2.44633049287277e-09	18874259	19130748
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19109124	19109124	1	0	NA	2.44633049287277e-09	18874259	19130748	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19117783	19537035	68	57	-0.8434	NA	NA	NA	3.95956149346534e-22	19412049	19819961
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	22038880	382	331	-0.3201	3.95956149346534e-22	19412049	19819961	4.97937546643075e-33	22038880	22038880
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22138119	22250971	4	3	-2.8649	4.97937546643075e-33	22038880	22038880	1.11264043124256e-16	22238807	22250971
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22351404	22351404	1	0	NA	1.11264043124256e-16	22238807	22250971	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22374850	32244771	3202	2823	-1.1953	NA	NA	NA	0	32242963	32254977
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32254977	33125060	344	295	-0.1286	0	32242963	32254977	6.47667192828594e-130	33108594	33159708
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	33129213	33129213	1	0	NA	6.47667192828594e-130	33108594	33159708	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	33133666	36922510	1207	1069	0.383	NA	NA	NA	0	36892283	36951489
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	36930928	45138966	3481	3104	-0.1292	0	36892283	36951489	0	45095753	45215827
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	45147458	47597042	1202	1057	-0.5602	0	45095753	45215827	5.70024834200112e-71	47597042	47597042
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	47609502	47609502	1	0	NA	5.70024834200112e-71	47597042	47597042	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	47609675	47612300	2	2	-4.4232	NA	NA	NA	6.20223014335112e-71	47612300	47612300
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	47618825	47618825	1	0	NA	6.20223014335112e-71	47612300	47612300	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	47619913	49491872	817	723	-0.5067	NA	NA	NA	3.01880082671562e-215	49487386	49531021
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	49527563	50313419	384	347	-1.1376	3.01880082671562e-215	49487386	49531021	1.60606947417480e-191	50304986	50320476
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50314995	52677106	940	832	-0.5564	1.6060694741748e-191	50304986	50320476	2.29700170848943e-99	52677106	52677106
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52678335	52679547	2	2	-5.1794	2.29700170848943e-99	52677106	52677106	1.46875871910795e-118	52679547	52679547
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52680612	53179332	77	64	-0.6329	1.46875871910795e-118	52679547	52679547	1.15012981841379e-18	53134897	53234609
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	53188144	56853053	1648	1477	-0.2649	1.15012981841379e-18	53134897	53234609	2.02156971209194e-08	56820920	56869628
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56854326	56854326	1	0	NA	2.02156971209194e-08	56820920	56869628	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56856874	56938933	39	34	0.0763	NA	NA	NA	2.58395173284614e-06	56919804	56968004
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56940096	57513899	294	268	-0.2389	2.58395173284614e-06	56919804	56968004	2.33362557215906e-117	57501009	57521684
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	57515320	62886718	2382	2106	0.2338	2.33362557215906e-117	57501009	57521684	0	62871651	62896461
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	62887968	67074769	1974	1742	-0.2685	0	62871651	62896461	4.75313454451717e-72	67051417	67094090
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67076482	67899249	332	291	0.0939	4.75313454451717e-72	67051417	67094090	3.40842363541132e-192	67893128	67910385
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	67903028	71137325	1340	1205	-0.517	3.40842363541132e-192	67893128	67910385	2.20384965978939e-144	71120773	71149552
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	71139157	72617696	668	590	-0.0971	2.20384965978939e-144	71120773	71149552	3.68378902898979e-107	72598247	72639038
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	72619932	75084803	1044	902	-0.4938	3.68378902898979e-107	72598247	72639038	2.98193571309995e-133	75064672	75098815
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75086633	77817620	1062	951	-0.122	2.98193571309995e-133	75064672	75098815	1.08931456166408e-47	77789459	77834980
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	77821632	78277285	201	174	-0.5016	1.08931456166408e-47	77789459	77834980	2.12937261581161e-30	78256875	78291183
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78278530	78843913	237	209	-0.135	2.12937261581161e-30	78256875	78291183	3.6676471194844e-48	78827624	78858227
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78846330	78846330	1	0	NA	3.6676471194844e-48	78827624	78858227	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78848347	80015244	434	371	-0.5411	NA	NA	NA	4.35296910148268e-169	79979837	80027059
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	80020591	81885256	502	431	0.0638	4.35296910148268e-169	79979837	80027059	1.24532655729554e-37	81829612	81917178
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	81887799	81887799	1	0	NA	1.24532655729554e-37	81829612	81917178	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	81889885	82509953	286	254	-0.2524	NA	NA	NA	7.66104856468515e-15	82491251	82531707
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82513473	82513473	1	0	NA	7.66104856468515e-15	82491251	82531707	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82515867	82582481	28	26	0.2948	NA	NA	NA	1.74782088557829e-17	82572495	82603638
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82585342	84501538	656	584	-0.2435	1.74782088557829e-17	82572495	82603638	0	84498343	84504828
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	84504828	95147091	3901	3418	-1.1656	0	84498343	84504828	7.89226827236097e-96	95141457	95153333
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95149546	95656272	158	137	-0.5679	7.89226827236097e-96	95141457	95153333	1.64793632468769e-109	95629886	95663717
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95658438	98232932	1071	949	0.0688	1.64793632468769e-109	95629886	95663717	3.77692578682793e-51	98232932	98232932
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98234519	1	0	NA	3.77692578682793e-51	98232932	98232932	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98237721	98239454	2	2	-3.3312	NA	NA	NA	3.46816855059493e-48	98239454	98239454
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	808	0.0162	3.46816855059493e-48	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14687636	5467	4821	-0.4178	NA	NA	NA	1.07448080148406e-21	14683004	14956177
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	14876356	1	0	NA	1.07448080148406e-21	14683004	14956177	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	12	-1.367	NA	NA	NA	4.54678431127221e-23	15029941	15034210
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	32521360	5096	4500	-0.3953	4.54678431127221e-23	15029941	15034210	5.18024411913152e-14	31854794	32545350
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32525705	32525705	1	0	NA	5.18024411913152e-14	31854794	32545350	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32527388	34054713	46	42	-0.8014	NA	NA	NA	1.74323012515409e-28	33527454	34067812
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34056516	69146594	7825	6917	-0.4264	1.74323012515409e-28	33527454	34067812	3.80472501428292e-31	69140759	69150684
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69148706	69204019	25	23	0.1496	3.80472501428292e-31	69140759	69150684	4.59493490152403e-15	69195953	69227049
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69206055	75093957	2048	1777	-0.4175	4.59493490152403e-15	69195953	69227049	2.48025893280074e-11	75089974	75093957
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	0.8192	2.48025893280074e-11	75089974	75093957	1.34509725871122e-09	75100865	75102639
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4524	-0.463	1.34509725871122e-09	75100865	75102639	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	374	-0.3891	NA	NA	NA	1.31366354118642e-16	1028979	1028979
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.7327	1.31366354118642e-16	1028979	1028979	1.06367738787139e-18	1030766	1030766
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36672710	13451	11855	-0.39	1.06367738787139e-18	1030766	1030766	5.47275154715669e-22	36668730	36672710
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36684619	7	6	0.9353	5.47275154715669e-22	36668730	36672710	3.06052934190154e-22	36684619	36684619
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	39373438	1161	1020	-0.3702	3.06052934190154e-22	36684619	36684619	0	39347732	39387417
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	39375725	55081839	5574	4900	0.1196	0	39347732	39387417	0	55067392	55094261
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55083495	72294735	6470	5706	0.5419	0	55067392	55094261	3.58857531174079e-27	72294735	72294735
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72297674	72299153	2	2	-2.0473	3.58857531174079e-27	72294735	72294735	6.1321076707239e-22	72299153	72299153
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72303321	78604710	2533	2239	0.4738	6.1321076707239e-22	72299153	72299153	4.87656144685831e-08	78589001	78623171
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78607501	78653545	17	16	-0.0501	4.87656144685831e-08	78589001	78623171	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	37455476	11114	9839	0.0289	NA	NA	NA	0	37393737	37556785
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	37464744	48806856	3758	3322	0.3539	0	37393737	37556785	7.14893421584413e-245	48788376	48828359
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	48809070	53092949	1327	1168	-0.0062	7.14893421584413e-245	48788376	48828359	2.74104006350414e-97	53092949	53092949
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-4.5799	2.74104006350414e-97	53092949	53092949	3.84411846661621e-160	53099601	53099601
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	74112578	6037	5338	0.2488	3.84411846661621e-160	53099601	53099601	2.51406054311089e-103	74063563	74161698
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	74115363	76116026	726	635	-0.0607	2.51406054311089e-103	74063563	74161698	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1395246	491	428	0.2359	NA	NA	NA	7.46395265558328e-17	1395246	1395246
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1398325	1398325	1	0	NA	7.46395265558328e-17	1395246	1395246	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.6977	NA	NA	NA	4.05655021964855e-19	1400840	1400840
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4102	0.3196	4.05655021964855e-19	1400840	1400840	6.68430191609431e-09	11448975	11448975
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.9699	6.68430191609431e-09	11448975	11448975	7.63580690856261e-10	11452390	11452390
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	11453579	1	0	NA	7.63580690856261e-10	11452390	11452390	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11455241	32545047	4990	4405	0.3329	NA	NA	NA	0	32545047	32545047
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	32929768	32929768	1	0	NA	0	32545047	32545047	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	32956938	33226960	48	43	2.4544	NA	NA	NA	2.75153535208342e-25	33203217	33240559
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33240559	33612848	66	61	3.0959	2.75153535208342e-25	33203217	33240559	9.58466672961876e-10	33574285	33649849
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33614112	34200290	204	177	3.3759	9.58466672961876e-10	33574285	33649849	1.55254886710242e-153	34196745	34204267
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	34202752	35614376	451	383	4.1972	1.55254886710242e-153	34196745	34204267	7.60698231054081e-07	35609465	35614376
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35615436	35616917	2	2	2.9745	7.60698231054081e-07	35609465	35614376	1.86731181029726e-14	35616917	35616917
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35618378	36074722	138	115	1.2982	1.86731181029726e-14	35616917	35616917	0	36074722	36074722
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	36083141	36083141	1	0	NA	0	36074722	36074722	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	36093646	39683903	1281	1125	-0.4458	NA	NA	NA	0	39679213	39691619
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39686800	43864611	1828	1617	0.22	0	39679213	39691619	0	43858625	43869034
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43866192	48321523	1773	1550	-0.4557	0	43858625	43869034	1.29300730939757e-163	48321523	48321523
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48381822	48536890	10	10	-3.3853	1.29300730939757e-163	48321523	48321523	1.37904891939329e-185	48536890	48536890
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48548254	52124494	1686	1491	-0.4252	1.37904891939329e-185	48536890	48536890	7.31217155845045e-322	52114493	52136358
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52126649	56823430	2219	1941	0.0045	7.31217155845045e-322	52114493	52136358	6.18369995491824e-274	56823430	56823430
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-4.2574	6.18369995491824e-274	56823430	56823430	6.03931200553091e-270	56840346	56840346
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	2779	-0.037	6.03931200553091e-270	56840346	56840346	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	528	0.2869	NA	NA	NA	3.88832760340256e-193	1506379	1506379
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	-3.1179	3.88832760340256e-193	1506379	1506379	4.00567353422865e-264	1532433	1532433
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	1544485	1	0	NA	4.00567353422865e-264	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1546858	26148060	8438	7443	0.3339	NA	NA	NA	1.09172317500344e-20	26148060	26148060
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148764	26161111	9	7	-0.8317	1.09172317500344e-20	26148060	26148060	3.69950927132317e-07	26158310	26170594
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	28266113	8	6	0.16	3.69950927132317e-07	26158310	26170594	7.51794639677878e-35	28266113	28266113
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	29297270	1	0	NA	7.51794639677878e-35	28266113	28266113	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29306447	31807681	1114	972	2.0306	NA	NA	NA	0	31805756	31809662
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	31809662	37104556	2305	2037	0.6583	0	31805756	31809662	1.65127169928968e-218	37099888	37112627
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	37107705	38784169	278	242	-0.0415	1.65127169928968e-218	37099888	37112627	4.09214867268229e-66	38759841	38826325
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	38788115	62419534	8829	7771	0.3314	4.09214867268229e-66	38759841	38826325	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10022306	10	10	-0.0386	NA	NA	NA	1.46982127222900e-07	10022306	10075714
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10057408	10167413	12	9	-0.8245	1.469821272229e-07	10022306	10075714	6.14591609718378e-58	10154777	13435755
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13342486	1	0	NA	6.14591609718378e-58	10154777	13435755	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13435755	19432994	2036	1825	0.1209	NA	NA	NA	0	19392388	19469978
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	19439176	30997262	3694	3258	-0.3335	0	19392388	19469978	0	30974272	31008220
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	31003519	32795816	832	741	0.2233	0	30974272	31008220	1.72544130398749e-06	32780773	32810942
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	32806404	32824508	10	9	0.794	1.72544130398749e-06	32780773	32810942	1.09671150823849e-05	32817433	32838117
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	32826529	35498573	1321	1161	0.2396	1.09671150823849e-05	32817433	32838117	8.20388865578112e-202	35491821	35507478
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	35501143	36382627	413	359	-0.3378	8.20388865578112e-202	35491821	35507478	8.70257647813699e-106	36373622	36408845
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36384467	36789648	216	190	0.2925	8.702576478137e-106	36373622	36408845	2.02291453050072e-07	36789648	36789648
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.6354	2.02291453050072e-07	36789648	36789648	9.29570905295234e-09	36791668	36792708
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	37755305	476	416	0.3322	9.29570905295234e-09	36791668	36792708	5.90465649171015e-88	37743265	37773650
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	37757658	39970867	1117	1000	0.6885	5.90465649171015e-88	37743265	37773650	5.70915735339579e-94	39954818	39986419
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	39973423	40774570	402	350	0.292	5.70915735339579e-94	39954818	39986419	1.24389172266104e-48	40763649	40784554
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	40776545	41414667	270	238	0.6784	1.24389172266104e-48	40763649	40784554	1.86076387000739e-76	41367753	41447201
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	41421665	43648176	1087	959	0.2338	1.86076387000739e-76	41367753	41447201	9.51015981127695e-06	43636103	43648176
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43649217	43659103	6	6	0.8599	9.51015981127695e-06	43636103	43648176	5.03796977265108e-05	43659103	43667288
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43660918	43661998	2	0	NA	5.03796977265108e-05	43659103	43667288	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43663166	46922972	1534	1339	0.1607	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16521073	406	367	-0.3923	NA	NA	NA	4.69326188807126e-14	16521073	16521073
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-2.4152	4.69326188807126e-14	16521073	16521073	4.91179939793876e-15	16524408	16524408
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	22667608	2575	2278	-0.4024	4.91179939793876e-15	16524408	16524408	2.15831138783250e-29	22644243	22679305
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	18	0.5281	2.1583113878325e-29	22644243	22679305	3.09108565356767e-33	22720195	22735036
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35469770	6546	5776	-0.3982	3.09108565356767e-33	22720195	22735036	1.26984516522237e-23	35469770	35469770
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35472378	35472378	1	0	NA	1.26984516522237e-23	35469770	35469770	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.7461	NA	NA	NA	2.58237217934921e-22	35476942	35476942
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	2.58237217934921e-22	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	37685496	1210	1059	-0.3808	NA	NA	NA	0	37685496	37685496
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-3.9804	0	37685496	37685496	0	37715385	37715385
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5142	-0.4211	0	37715385	37715385	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.7828	NA	NA	NA	1.99639322609468e-05	4893	94062
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	1.99639322609468e-05	4893	94062	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	109064	9	8	-2.3421	NA	NA	NA	1.72754314823325e-11	106242	110101
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	266212	111	101	-1.0718	1.72754314823325e-11	106242	110101	3.18820178256289e-07	264886	266212
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	0.8765	3.18820178256289e-07	264886	266212	2.30748653491085e-10	267079	267079
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	268402	1	0	NA	2.30748653491085e-10	267079	267079	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268555	1403541	633	553	-1.0303	NA	NA	NA	2.8029719501688e-08	1397383	1404483
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1403586	1416262	13	12	-0.3242	2.8029719501688e-08	1397383	1404483	0.00168343083082717	1413791	1432953
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1418067	1528282	78	71	-0.9794	0.00168343083082717	1413791	1432953	0.000373507033332406	1522369	1528282
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-2.1679	0.000373507033332406	1522369	1528282	4.34041565007756e-06	1530474	1534998
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	1533361	1	0	NA	4.34041565007756e-06	1530474	1534998	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533546	2303192	542	485	-1.0607	NA	NA	NA	1.77455721719759e-08	2303192	2303192
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2303218	1	0	NA	1.77455721719759e-08	2303192	2303192	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2304008	2304398	2	2	-2.8956	NA	NA	NA	9.49832909009651e-08	2304398	2304398
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2306110	1	0	NA	9.4983290900965e-08	2304398	2304398	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2307282	2708291	388	346	-1.1588	NA	NA	NA	0	2706218	2711273
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	56315798	18933	16648	-0.1643	0	2706218	2711273	8.6155509227837e-19	56312022	56315798
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56323084	56403390	14	12	0.6889	8.6155509227837e-19	56312022	56315798	3.55608309444678e-15	56403390	56454826
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56412085	56412085	1	0	NA	3.55608309444678e-15	56403390	56454826	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56448022	56810806	51	45	-0.2403	NA	NA	NA	5.77340894812273e-71	56806966	56824123
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	56824123	76998610	3940	3450	0.6132	5.77340894812273e-71	56806966	56824123	1.68620147575550e-21	76998610	76998610
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-1.6242	1.6862014757555e-21	76998610	76998610	4.4277629565923e-22	77010018	77010018
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	153332114	21778	19183	0.604	4.4277629565923e-22	77010018	77010018	1.17684510539714e-07	153327171	153335752
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153333629	153344718	6	6	-0.0848	1.17684510539714e-07	153327171	153335752	1.18664529974357e-06	153342841	153352463
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153348763	154442377	377	337	0.6448	1.18664529974357e-06	153342841	153352463	1.15027127882214e-43	154442377	154442377
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-1.9339	1.15027127882214e-43	154442377	154442377	3.77759678069707e-67	154450309	154450309
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	0.6662	3.77759678069707e-67	154450309	154450309	1.40440004654791e-50	154578922	154586690
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	182	-0.4824	1.40440004654791e-50	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	116	-4.5703	NA	NA	NA	2.76574833240409e-12	4174561	4272867
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	4425391	4	4	-0.8095	2.76574833240409e-12	4174561	4272867	4.24907647320282e-05	4421500	4948824
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4431527	4431527	1	0	NA	4.24907647320282e-05	4421500	4948824	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7914104	442	387	-3.9716	NA	NA	NA	7.90127374713565e-05	7756907	7985612
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8280065	84	70	-4.7337	7.90127374713565e-05	7756907	7985612	4.77140816358756e-07	8251785	8294345
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8289709	1	0	NA	4.77140816358756e-07	8251785	8294345	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8316416	11	11	-3.1226	NA	NA	NA	0.000646751114573557	8300654	8347344
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324291	10513747	293	262	-4.4172	0.000646751114573557	8300654	8347344	1.39118145395483e-32	10512616	10515697
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	14	-1.2049	1.39118145395483e-32	10512616	10515697	4.28701289797694e-11	11660512	12518008
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12452734	1	0	NA	4.28701289797694e-11	11660512	12518008	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	13119344	198	179	-3.6252	NA	NA	NA	0.0061070148678844	12899653	13119344
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-1.5162	0.0061070148678844	12899653	13119344	0.000227798451964289	13128515	13133803
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13716000	220	199	-4.3678	0.000227798451964289	13128515	13133803	2.24257342217065e-06	13529620	13823928
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	13716331	1	0	NA	2.24257342217065e-06	13529620	13823928	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13717328	14358464	195	169	-4.845	NA	NA	NA	1.36841407235622e-07	14325320	14404979
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	76	-4.1443	1.36841407235622e-07	14325320	14404979	0.000260414784330373	14489032	14547168
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	0.000260414784330373	14489032	14547168	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	23	-2.9677	NA	NA	NA	7.15252506850016e-10	14553021	14603508
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15521958	327	285	-4.4221	7.15252506850016e-10	14553021	14603508	4.41401992159229e-05	15497443	15525955
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15523178	15523178	1	0	NA	4.41401992159229e-05	15497443	15525955	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15541293	10	10	-2.9249	NA	NA	NA	1.74083057457215e-07	15540379	15549637
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15542314	15915466	79	64	-4.5943	1.74083057457215e-07	15540379	15549637	2.08878350546827e-06	15829553	15958396
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16042966	49	39	-3.5746	2.08878350546827e-06	15829553	15958396	7.85226373166927e-08	16002819	16083793
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	19610243	490	423	-4.5172	7.85226373166927e-08	16002819	16083793	3.11481357364725e-07	19608039	19610243
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.7202	3.11481357364725e-07	19608039	19610243	1.3205197533373e-06	19613864	19614809
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22058759	558	487	-4.5105	1.3205197533373e-06	19613864	19614809	2.10015751336563e-06	22044579	22157319
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22139807	22139807	1	0	NA	2.10015751336563e-06	22044579	22157319	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-2.6356	NA	NA	NA	5.92345447402352e-09	22176501	22182080
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22926726	92	83	-4.7067	5.92345447402352e-09	22176501	22182080	1.25039829621445e-44	22924754	26871442
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22930737	22930737	1	0	NA	1.25039829621445e-44	22924754	26871442	NA	NA	NA
MSK_252152911467_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	71	-1.8948	NA	NA	NA	NA	NA	NA
