Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	1557012	198	189	-0.0222	NA	NA	NA	5.35945874534116e-33	1555814	1575554
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1575554	1640562	13	13	-0.6122	5.35945874534116e-33	1555814	1575554	1.06794771247289e-37	1637771	1652866
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1652866	6360237	1594	1536	0.005	1.06794771247289e-37	1637771	1652866	2.37011885950847e-09	6360237	6360237
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	6361493	6368094	2	2	-0.7905	2.37011885950847e-09	6360237	6360237	4.1581751139156e-10	6368094	6368094
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	6369598	12793354	2711	2611	-0.0035	4.1581751139156e-10	6368094	6368094	6.00444303105987e-13	12793354	12793354
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12831942	12835156	2	2	-0.8894	6.00444303105987e-13	12793354	12793354	2.8829515284061e-12	12835156	12835156
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	12839991	24391166	4314	4128	-0.0084	2.8829515284061e-12	12835156	12835156	3.66527641593537e-13	24391166	24391166
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-0.9196	3.66527641593537e-13	24391166	24391166	1.03646241928743e-14	24395691	24395691
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	26828762	1003	959	0.0098	1.03646241928743e-14	24395691	24395691	5.02632588214492e-45	26828762	26828762
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	26836789	26850941	6	6	-0.92	5.02632588214492e-45	26828762	26828762	5.00813911234437e-44	26850941	26850941
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	26853708	48014764	8305	8011	-0.0044	5.00813911234437e-44	26850941	26850941	2.9159886870302e-13	48014764	48014764
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	48016776	48016776	1	0	NA	2.9159886870302e-13	48014764	48014764	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	48018603	48019839	2	2	-0.8903	NA	NA	NA	6.29043897424264e-13	48019839	48019839
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	48022815	61884298	5478	5257	-0.0117	6.29043897424264e-13	48019839	48019839	1.09349187318469e-08	61881731	61884298
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61890388	3	3	-0.6062	1.09349187318469e-08	61881731	61884298	4.97524659825691e-08	61890388	61892291
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61892291	62535802	311	305	-0.005	4.97524659825691e-08	61890388	61892291	2.88939671960814e-18	62535802	62535802
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62538092	62543233	3	3	-0.9028	2.88939671960814e-18	62535802	62535802	1.09261769224683e-20	62543233	62543233
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62544584	72533856	3943	3765	-0.0039	1.09261769224683e-20	62543233	62543233	2.95112770020407e-69	72533856	72536231
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72534975	72579311	17	17	0.6844	2.95112770020407e-69	72533856	72536231	7.90506687806473e-71	72571158	72579311
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109373255	11406	10956	0.0011	7.90506687806473e-71	72571158	72579311	8.32101777045876e-66	109373255	109373255
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-1.9294	8.32101777045876e-66	109373255	109373255	4.46773455227736e-43	109376249	109376249
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109987341	280	272	-0.0023	4.46773455227736e-43	109376249	109376249	2.13592544479531e-18	109987341	109987341
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	0.9917	2.13592544479531e-18	109987341	109987341	7.14336808580282e-18	109989998	109989998
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	113841017	1486	1423	-0.006	7.14336808580282e-18	109989998	109989998	2.03839819429945e-10	113841017	113841017
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113847479	113848985	2	2	-0.7745	2.03839819429945e-10	113841017	113841017	8.80799695877625e-11	113848985	113848985
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113850483	150819879	4378	4210	0.0017	8.80799695877625e-11	113848985	113848985	1.84938223994634e-85	150819879	150819879
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	1.5106	1.84938223994634e-85	150819879	150819879	3.02669178143671e-13	150839754	150839754
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	7	2.5132	3.02669178143671e-13	150839754	150839754	0	150851439	150851439
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2662	-0.0013	0	150851439	150851439	3.66061121531514e-50	157133150	157133150
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.6604	3.66061121531514e-50	157133150	157133150	1.04071950885545e-48	157136342	157136342
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	177489318	8060	7764	-0.0089	1.04071950885545e-48	157136342	157136342	3.05975774599523e-25	177487559	177489318
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177491855	177508786	8	8	0.596	3.05975774599523e-25	177487559	177489318	8.25921307408443e-25	177508786	177516941
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177516941	185979586	3257	3144	-0.0033	8.25921307408443e-25	177508786	177516941	4.99357968210227e-17	185979586	185979586
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	0.9941	4.99357968210227e-17	185979586	185979586	6.71188433252127e-18	185988138	185988138
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1427	0.0136	6.71188433252127e-18	185988138	185988138	1.1392548531982e-20	192715640	192715640
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	1.0658	1.1392548531982e-20	192715640	192715640	2.79027481639809e-20	192719540	192719540
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	196570662	1057	1018	0.014	2.79027481639809e-20	192719540	192719540	4.74967940836054e-24	196570662	196570662
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196572806	196576204	3	3	-0.9197	4.74967940836054e-24	196570662	196570662	6.4602121546615e-20	196576204	196576204
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196578227	200602881	1585	1531	5e-04	6.4602121546615e-20	196576204	196576204	4.63577652039123e-17	200592050	200625002
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200609726	200804838	41	39	-0.2412	4.63577652039123e-17	200592050	200625002	2.46764062050946e-18	200693672	200810641
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200806319	214647830	5289	5093	-0.0027	2.46764062050946e-18	200693672	200810641	8.81907843079586e-14	214646530	214647830
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	214651209	214656991	4	4	0.6422	8.81907843079586e-14	214646530	214647830	2.81012238415683e-14	214656991	214658594
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	214658594	238544291	8683	8362	-0.0057	2.81012238415683e-14	214656991	214658594	2.1380349043e-313	238542980	238545731
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	238545731	238788245	114	108	0.5681	2.1380349043e-313	238542980	238545731	1.97469095388384e-278	238784449	238791145
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	238791145	247186514	3314	3187	8e-04	1.97469095388384e-278	238784449	238791145	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	20231737	5876	5623	0.0046	NA	NA	NA	5.32553762413471e-24	20231737	20231737
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20234103	20236210	2	2	-1.1712	5.32553762413471e-24	20231737	20231737	4.41625184040358e-24	20236210	20236210
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20237659	34543992	5644	5426	-0.0072	4.41625184040358e-24	20236210	20236210	0	34543992	34551222
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	15	-3.734	0	34543992	34551222	0	34580533	34589997
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	469	0.002	0	34580533	34589997	6.01973034144776e-23	35821494	35821494
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.1647	6.01973034144776e-23	35821494	35821494	2.36836300153280e-25	35844884	35844884
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37789939	878	851	-0.0045	2.3683630015328e-25	35844884	35844884	5.7908881422493e-24	37781427	37800512
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	26	-0.3264	5.7908881422493e-24	37781427	37800512	1.38506669228805e-22	37847519	37862351
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	50326003	4969	4782	-0.0064	1.38506669228805e-22	37847519	37862351	1.24111529047426e-26	50326003	50326003
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50327637	50330765	3	3	-1.0243	1.24111529047426e-26	50326003	50326003	8.71617996218814e-27	50330765	50330765
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50331153	50331153	1	0	NA	8.71617996218814e-27	50330765	50330765	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50335387	52600588	828	791	0.0111	NA	NA	NA	1.00520538155902e-18	52600588	52600588
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	1.00520538155902e-18	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.7614	NA	NA	NA	2.51473533260070e-20	52635695	52635695
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	79180906	8856	8558	-0.0034	2.5147353326007e-20	52635695	52635695	2.35039008366332e-12	79172532	79180906
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79182762	79196200	6	6	0.4888	2.35039008366332e-12	79172532	79180906	1.45507948638231e-12	79196200	79198028
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79198028	132753228	12762	12281	-0.0036	1.45507948638231e-12	79196200	79198028	1.49075321698912e-300	132750789	132754617
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132754617	133073531	121	118	0.5276	1.49075321698912e-300	132750789	132754617	1.89282677561449e-283	133072295	133077875
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	133077875	154601442	6799	6530	0.0014	1.89282677561449e-283	133072295	133077875	2.85875795231971e-16	154601442	154601442
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	0.9763	2.85875795231971e-16	154601442	154601442	5.86324705465253e-16	154606943	154606943
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	158681162	1136	1086	6e-04	5.86324705465253e-16	154606943	154606943	5.89917328287712e-20	158681162	158681162
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	158682492	158685948	3	3	-0.8892	5.89917328287712e-20	158681162	158681162	3.99337408240826e-20	158685948	158685948
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	158687752	179767214	7860	7536	-0.0037	3.99337408240826e-20	158685948	158685948	7.63379945692965e-12	179767214	179767214
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.6832	7.63379945692965e-12	179767214	179767214	1.01565955907174e-11	179778919	179778919
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	217978950	12753	12254	-4e-04	1.01565955907174e-11	179778919	179778919	2.35577889919178e-34	217978950	217978950
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	217980882	217991546	4	4	-0.9931	2.35577889919178e-34	217978950	217978950	1.90906866565768e-32	217991546	217991546
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	217994293	242501239	8718	8423	-0.0034	1.90906866565768e-32	217991546	217991546	1.09210948024911e-277	242501239	242505261
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242689978	67	65	-0.7179	1.09210948024911e-277	242501239	242505261	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10378	-0.0025	NA	NA	NA	3.80767094581571e-31	32074432	32074432
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-1.345	3.80767094581571e-31	32074432	32074432	2.34931496827300e-31	32080848	32080848
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	46685057	5084	4898	-0.003	2.349314968273e-31	32080848	32080848	1.71453423305957e-10	46685057	46685057
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46687043	46688279	2	2	-0.7876	1.71453423305957e-10	46685057	46685057	4.24677242835929e-10	46688279	46688279
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46690457	133189686	27825	26750	-0.001	4.24677242835929e-10	46688279	46688279	6.14258886673144e-13	133189686	133189686
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	0.8804	6.14258886673144e-13	133189686	133189686	1.25676741515272e-13	133194685	133194685
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	156961489	7376	7121	-0.004	1.25676741515272e-13	133194685	133194685	5.3539729278959e-25	156960037	156961489
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	156963885	156980258	9	9	0.5549	5.3539729278959e-25	156960037	156961489	6.81560509492442e-23	156980258	156981857
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	156981857	163992903	2392	2298	9e-04	6.81560509492442e-23	156980258	156981857	4.25259944717884e-58	163992903	163997228
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	0.9338	4.25259944717884e-58	163992903	163997228	0.0152779953970198	164005577	164042397
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	18	0.6495	0.0152779953970198	164005577	164042397	2.83020843872426e-65	164107951	164112873
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	191219222	9122	8791	0.0037	2.83020843872426e-65	164107951	164112873	1.23716005666997e-104	191219222	191219222
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-2.4881	1.23716005666997e-104	191219222	191219222	5.17888370173196e-63	191222891	191222891
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	192546280	424	412	0.0051	5.17888370173196e-63	191222891	191222891	4.43037661894021e-10	192544305	192546280
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	3	-0.598	4.43037661894021e-10	192544305	192546280	3.52145863905876e-09	192552734	192554451
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	194354505	578	545	-0.005	3.52145863905876e-09	192552734	192554451	0	194354505	194354505
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.1726	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196820428	995	967	-0.0027	0	194366950	194366950	5.95980854111179e-41	196810503	196835413
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196822133	196822133	1	0	NA	5.95980854111179e-41	196810503	196835413	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	21	-0.4634	NA	NA	NA	3.41230290220000e-38	196929805	196940125
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	926	0.0095	3.4123029022e-38	196929805	196940125	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	682752	214	203	-0.0045	NA	NA	NA	1.33403649719893e-08	679789	682752
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	685953	685953	1	0	NA	1.33403649719893e-08	679789	682752	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	0.7546	NA	NA	NA	1.34057982218924e-08	691065	693668
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	9815760	3176	3034	0.0124	1.34057982218924e-08	691065	693668	0	9815760	9815760
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.3267	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	26563737	4811	4624	-0.0111	0	9842644	9842644	2.27798539366740e-22	26563737	26563737
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26565071	26566345	2	2	-1.1254	2.2779853936674e-22	26563737	26563737	6.85064478357268e-22	26566345	26566345
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26568376	34445002	1354	1307	0.0061	6.85064478357268e-22	26566345	26566345	1.13676778970108e-09	34433787	34445002
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.4337	1.13676778970108e-09	34433787	34445002	1.79166686805242e-09	34491115	34509895
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	36581685	460	442	0.0113	1.79166686805242e-09	34491115	34509895	2.31474791119508e-15	36571113	36581685
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	36592528	36609531	3	3	-0.7891	2.31474791119508e-15	36571113	36581685	2.66912596707773e-16	36609531	36609531
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	36623066	64376590	7318	7000	0.0029	2.66912596707773e-16	36609531	36609531	7.57535966208191e-09	64367819	64376590
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-0.723	7.57535966208191e-09	64367819	64376590	6.674412705878e-09	64390333	64398986
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1039	0.0066	6.674412705878e-09	64390333	64398986	2.58160113455297e-95	68905670	68905670
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	0.9275	2.58160113455297e-95	68905670	68905670	1.54458547860988e-96	69165814	69165814
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	84133314	4880	4696	0.0021	1.54458547860988e-96	69165814	69165814	4.10323658662913e-16	84133314	84133314
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	84135103	84138286	3	3	-0.7968	4.10323658662913e-16	84133314	84133314	1.25572071463007e-17	84138286	84138286
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	84143520	94073863	3565	3440	-2e-04	1.25572071463007e-17	84138286	84138286	2.85623990274184e-13	94073863	94073863
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94078581	2	2	-0.851	2.85623990274184e-13	94073863	94073863	3.22907817427303e-12	94078581	94078581
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94084961	173224400	22743	21864	0.0039	3.22907817427303e-12	94078581	94078581	2.28371195869162e-66	173224400	173224400
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-1.9422	2.28371195869162e-66	173224400	173224400	2.74599772979348e-62	173228860	173228860
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	191153613	5519	5298	-0.0026	2.74599772979348e-62	173228860	173228860	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	681141	197	187	0.0203	NA	NA	NA	7.56349288558295e-14	675947	681141
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	0.9796	7.56349288558295e-14	675947	681141	6.10981057463508e-17	686701	686701
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	737829	23	23	0.0162	6.10981057463508e-17	686701	686701	8.32786460008904e-08	729262	812169
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	911839	11	11	0.3153	8.32786460008904e-08	729262	812169	6.5106626536447e-09	905462	923602
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	913468	10643376	3000	2887	0.0074	6.5106626536447e-09	905462	923602	2.28092608718668e-07	10641292	10643376
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	10644670	10646318	2	2	-0.6517	2.28092608718668e-07	10641292	10643376	4.14967981180368e-07	10646318	10647800
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	10647800	12837736	737	707	-0.0034	4.14967981180368e-07	10646318	10647800	9.11977924872339e-10	12835355	12857302
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12840501	12873052	5	5	0.4812	9.11977924872339e-10	12835355	12857302	1.93251939220143e-09	12853151	13263185
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	56579735	11226	10792	-0.0014	1.93251939220143e-09	12853151	13263185	5.51200546349559e-22	56579735	56579735
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56580969	56582581	2	2	1.1373	5.51200546349559e-22	56579735	56579735	4.63226159386504e-23	56582581	56582581
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56584732	137833920	23884	22976	-0.002	4.63226159386504e-23	56582581	56582581	2.49535979416662e-23	137833920	137833920
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137836466	137843309	4	4	-0.8122	2.49535979416662e-23	137833920	137833920	1.47001807164652e-24	137843309	137843309
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137844931	140533456	1131	1101	0.0044	1.47001807164652e-24	137843309	137843309	9.99435286878721e-35	140533456	140533456
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	1.3684	9.9943528687872e-35	140533456	140533456	9.01194106593438e-34	140538666	140538666
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	155405839	5257	5054	-0.0043	9.01194106593438e-34	140538666	140538666	6.16387198070128e-14	155404062	155405839
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155411053	1	0	NA	6.16387198070128e-14	155404062	155405839	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155416484	155421443	4	4	0.6274	NA	NA	NA	1.31564122208295e-13	155421443	155427589
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180346557	8160	7828	7e-04	1.31564122208295e-13	155421443	155427589	9.99161106036707e-19	180344964	180346557
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	0.597	9.99161106036707e-19	180344964	180346557	3.19314659984846e-13	180358977	180362342
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	105	-0.0026	3.19314659984846e-13	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	0.0153	NA	NA	NA	1.35882604869204e-19	183349	204881
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	326323	61	61	-0.2676	1.35882604869204e-19	183349	204881	1.09411619519185e-38	322557	332608
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	17482872	6025	5815	-0.0021	1.09411619519185e-38	322557	332608	8.05123434198162e-09	17477799	17482872
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17486309	17488010	2	2	-0.7186	8.05123434198162e-09	17477799	17482872	2.72956834012961e-09	17488010	17488010
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17490237	26811016	3238	3126	-0.0093	2.72956834012961e-09	17488010	17488010	4.82452207396369e-22	26811016	26811016
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.7694	4.82452207396369e-22	26811016	26811016	3.11368100476021e-20	26861184	26861184
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29950805	1217	1172	-0.0061	3.11368100476021e-20	26861184	26861184	7.41344597993696e-21	29939288	29966336
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	14	-0.4241	7.41344597993696e-21	29939288	29966336	5.2972199626317e-18	29998009	30021908
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	31385778	581	557	-0.0101	5.2972199626317e-18	29998009	30021908	1.82498225579126e-19	31385778	31385778
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31390982	3	3	-0.9247	1.82498225579126e-19	31385778	31385778	3.30337804500961e-21	31390982	31390982
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	54035000	8804	8420	-0.0049	3.30337804500961e-21	31390982	31390982	1.40335465830806e-43	54035000	54035000
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.3034	1.40335465830806e-43	54035000	54035000	5.17074955923086e-45	54042734	54042734
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67060622	2771	2663	0.0056	5.17074955923086e-45	54042734	54042734	9.4841111109291e-22	67060622	67068673
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-0.6369	9.4841111109291e-22	67060622	67068673	6.08212672974154e-21	67101355	67109079
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	72919733	1758	1688	0.0101	6.08212672974154e-21	67101355	67109079	1.70548407456790e-305	72919733	72919733
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-3.491	1.7054840745679e-305	72919733	72919733	5.95380377197095e-289	72924440	72924440
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	79024557	1895	1816	0.0063	5.95380377197095e-289	72924440	72924440	1.56694371422807e-10	79011979	79024557
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79028813	79091850	12	10	0.3752	1.56694371422807e-10	79011979	79024557	5.42932871929782e-12	79091850	79101978
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	110498221	9022	8658	0.003	5.42932871929782e-12	79091850	79101978	3.14837097977499e-43	110498221	110498221
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110503513	110520229	7	6	-0.8907	3.14837097977499e-43	110498221	110498221	2.82376664939690e-42	110520229	110520229
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	110521603	124469271	4368	4197	1e-04	2.8237666493969e-42	110520229	110520229	5.28487648275733e-40	124467598	124469271
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	124478061	124509956	14	14	0.5677	5.28487648275733e-40	124467598	124469271	3.87728249602596e-40	124509956	124513895
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	124513895	165643653	14461	13905	-0.0046	3.87728249602596e-40	124509956	124513895	0	165643653	165643653
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-3.6031	0	165643653	165643653	0	165650610	165650610
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1726	-0.0013	0	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	250	0.0247	NA	NA	NA	1.74089724984668e-14	1038517	1038517
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	1.0053	1.74089724984668e-14	1038517	1038517	2.45292758113564e-17	1047707	1047707
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	38257171	13337	12841	-0.0019	2.45292758113564e-17	1047707	1047707	4.45682021830035e-29	38251281	38264758
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38258332	38335964	39	39	0.2913	4.45682021830035e-29	38251281	38264758	1.11091968929138e-27	38330907	38341239
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	75186980	8848	8517	-0.0019	1.11091968929138e-27	38330907	38341239	4.67105236253188e-12	75180849	75186980
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75188956	75207560	8	8	0.4312	4.67105236253188e-12	75180849	75186980	2.36444071247165e-13	75207560	75212042
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75210882	100164752	8568	8270	-0.0015	2.36444071247165e-13	75207560	75212042	8.17958771052108e-16	100164752	100164752
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.6648	8.17958771052108e-16	100164752	100164752	2.68830598188915e-14	100174991	100178968
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109216032	3894	3744	-0.0075	2.68830598188915e-14	100174991	100178968	2.78711939799631e-10	109214735	109216032
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109240210	6	6	0.4511	2.78711939799631e-10	109214735	109216032	6.76502459259938e-10	109240210	109244233
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	125831554	7472	7178	-7e-04	6.76502459259938e-10	109240210	109244233	0	125831554	125831554
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.2226	0	125831554	125831554	0	125837524	125837524
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3512	-0.0049	0	125837524	125837524	0	133433384	133436265
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	7	-3.4283	0	133433384	133436265	0	133447868	133448277
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3572	-2e-04	0	133447868	133448277	2.9432713425432e-80	141410894	141413352
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	-0.8152	2.9432713425432e-80	141410894	141413352	2.48238735019356e-74	141435643	141438504
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141440184	1	0	NA	2.48238735019356e-74	141435643	141438504	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	111	0.0042	NA	NA	NA	3.89052651170186e-34	141690753	141690753
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	0.69	3.89052651170186e-34	141690753	141690753	3.43140466364745e-17	141711513	141712786
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	141965993	101	100	0.0825	3.43140466364745e-17	141711513	141712786	1.57812826514244e-72	141965993	141967554
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141967554	142005505	22	22	-0.7715	1.57812826514244e-72	141965993	141967554	6.04074194375554e-57	142004104	142007171
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142007171	142161005	49	48	0.1688	6.04074194375554e-57	142004104	142007171	1.38179408388023e-32	142161005	142161005
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142166710	142167908	3	3	-2.1957	1.38179408388023e-32	142161005	142161005	7.08740869414134e-119	142167908	142167908
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	155624379	5209	5007	0.0016	7.08740869414134e-119	142167908	142167908	1.59194661651721e-22	155624379	155624379
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	155627215	155630221	2	2	-1.1707	1.59194661651721e-22	155624379	155624379	6.5345939045358e-20	155630221	155630221
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	155632974	158191657	1154	1108	0.0134	6.5345939045358e-20	155630221	155630221	2.89636725337601e-08	158191657	158191657
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158193795	158195947	2	2	-0.7589	2.89636725337601e-08	158191657	158191657	4.67184067720059e-10	158195947	158195947
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158197662	158821263	212	209	0.037	4.67184067720059e-10	158195947	158195947	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.0163	NA	NA	NA	8.9950799367834e-210	581533	581533
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.0198	8.9950799367834e-210	581533	581533	1.09184979520429e-234	588865	588865
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	586	0.0247	1.09184979520429e-234	588865	588865	1.50692053373498e-06	2229727	2234351
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	0.5163	1.50692053373498e-06	2229727	2234351	1.74416435996908e-09	2251011	2257255
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	5574577	1269	1213	-0.0049	1.74416435996908e-09	2251011	2257255	2.6922884470869e-15	5574577	5574577
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5585615	5591702	2	2	-0.933	2.6922884470869e-15	5574577	5574577	3.78806888755622e-16	5591702	5591702
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5596343	7156900	380	373	-0.0011	3.78806888755622e-16	5591702	5591702	6.61698892891143e-13	6909487	7327293
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	0.4085	6.61698892891143e-13	6909487	7327293	5.42866142369570e-12	7709141	8139999
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5546	-0.0013	5.4286614236957e-12	7709141	8139999	2.68206841802568e-53	25120552	25120552
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.4616	2.68206841802568e-53	25120552	25120552	4.70449243437192e-58	25125700	25125700
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4699	-0.007	4.70449243437192e-58	25125700	25125700	1.8037117966672e-235	39350798	39352361
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	0.6674	1.8037117966672e-235	39350798	39352361	7.6978470219826e-230	39504332	39505256
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	58274145	4359	4210	-0.0022	7.6978470219826e-230	39504332	39505256	5.61626090193015e-10	58274145	58274145
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58277102	58280459	2	2	0.7653	5.61626090193015e-10	58274145	58274145	5.25930731878179e-10	58280459	58280459
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58290326	115701209	17377	16682	-6e-04	5.25930731878179e-10	58280459	58280459	1.88337392751021e-11	115701209	115701209
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.8157	1.88337392751021e-11	115701209	115701209	1.39354272996019e-10	115711730	115711730
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	146264846	9693	9321	0.0026	1.39354272996019e-10	115711730	115711730	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	5632749	2090	1994	-0.005	NA	NA	NA	1.03516935181669e-09	5632749	5634019
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5634019	5647674	3	3	-0.6219	1.03516935181669e-09	5632749	5634019	1.46468528776679e-09	5646414	5647674
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5660083	6685358	378	366	-6e-04	1.46468528776679e-09	5646414	5647674	2.6438305612012e-09	6681606	6685358
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-0.5783	2.6438305612012e-09	6681606	6685358	1.75796648429695e-09	6698290	6701392
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	14274818	2368	2272	0.0072	1.75796648429695e-09	6698290	6701392	4.29029148996419e-16	14274818	14274818
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	14276209	14276209	1	0	NA	4.29029148996419e-16	14274818	14274818	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	14278423	14281088	2	2	-0.9171	NA	NA	NA	2.08070350507878e-14	14281088	14281088
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	14283592	15802255	613	588	-0.0193	2.08070350507878e-14	14281088	14281088	3.78696706336299e-60	15802255	15802255
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.7947	3.78696706336299e-60	15802255	15802255	9.58940649921617e-56	15807123	15807123
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2452	-0.0051	9.58940649921617e-56	15807123	15807123	1.87869144536184e-10	23338535	23343915
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.6446	1.87869144536184e-10	23338535	23343915	3.76388740022522e-10	23365926	23377660
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39130211	4727	4533	0.002	3.76388740022522e-10	23365926	23377660	2.07132026783219e-13	39091349	43445839
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39146895	39146895	1	0	NA	2.07132026783219e-13	39091349	43445839	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	44199401	7	7	0.4828	NA	NA	NA	9.39222782528815e-18	43776365	45359327
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	45359327	70926188	334	317	-0.0189	9.39222782528815e-18	43776365	45359327	1.15114278576696e-48	70926188	70926188
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.9724	1.15114278576696e-48	70926188	70926188	5.48915959263257e-65	70930528	70930528
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	23920	-0.0073	5.48915959263257e-65	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9348	-0.0027	NA	NA	NA	9.14272917983214e-31	27038538	27038538
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.3314	9.14272917983214e-31	27038538	27038538	1.69805429197479e-30	27041812	27041812
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14247	-0.0035	1.69805429197479e-30	27041812	27041812	3.41793384343245e-33	77917893	77917893
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77926390	1	0	NA	3.41793384343245e-33	77917893	77917893	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928669	77928738	2	2	1.3904	NA	NA	NA	2.866197770334e-34	77928738	77928738
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	103842275	9083	8747	-0.0059	2.866197770334e-34	77928738	77928738	1.54015906952305e-12	103840794	103842275
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	103845286	103850058	3	3	-0.7054	1.54015906952305e-12	103840794	103842275	4.9935155776682e-12	103850058	103850058
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	103852046	135285645	11127	10724	-0.0024	4.9935155776682e-12	103850058	103850058	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1704	0.0037	NA	NA	NA	1.26487614149620e-10	4920907	4923300
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-0.5468	1.2648761414962e-10	4920907	4923300	2.7223054740918e-11	4932214	4934594
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	345	-0.0078	2.7223054740918e-11	4932214	4934594	1.33426653978558e-10	5730121	5745329
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5766615	16	16	0.2899	1.33426653978558e-10	5730121	5745329	5.41998663550155e-11	5762182	5775970
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5769776	37720432	11213	10772	-0.0017	5.41998663550155e-11	5762182	5775970	1.17682964612193e-21	37699815	37735900
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	37725223	37793502	9	9	0.5354	1.17682964612193e-21	37699815	37735900	1.94437738421901e-21	37774763	37800849
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	37800849	49666382	3342	3213	0.0018	1.94437738421901e-21	37774763	37800849	1.48313127485452e-19	49663240	49666382
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49671267	49710027	9	8	-0.539	1.48313127485452e-19	49663240	49666382	8.2727598394036e-18	49710027	49721954
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	55118214	178	174	-0.0072	8.2727598394036e-18	49710027	49721954	1.34847158473865e-60	55114405	55127355
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55123719	1	0	NA	1.34847158473865e-60	55114405	55127355	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	38	0.5105	NA	NA	NA	7.24109848912707e-83	55205278	55217189
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	58383355	1246	1203	-0.0052	7.24109848912707e-83	55205278	55217189	2.40272113773536e-10	58383355	58383355
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58389208	58390670	2	2	-0.7921	2.40272113773536e-10	58383355	58383355	3.48502175829119e-10	58390670	58390670
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58404501	66463477	3390	3255	-1e-04	3.48502175829119e-10	58390670	58390670	1.77704245848966e-20	66463477	66463477
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-1.1138	1.77704245848966e-20	66463477	66463477	8.80846309842765e-21	66469412	66469412
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	88555894	7909	7606	-0.0084	8.80846309842765e-21	66469412	66469412	7.83555355486748e-11	88553783	88555894
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88558170	88558170	1	0	NA	7.83555355486748e-11	88553783	88555894	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88560991	88562255	2	2	-0.8162	NA	NA	NA	5.8153723608536e-11	88562255	88562255
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	88563902	99021938	2941	2828	-9e-04	5.8153723608536e-11	88562255	88562255	4.74964018531671e-16	99010068	99030209
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99025912	99074552	23	23	0.289	4.74964018531671e-16	99010068	99030209	3.51500221453149e-16	99064450	99079857
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	134450318	12844	12339	-0.0023	3.51500221453149e-16	99064450	99079857	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	10465787	4086	3949	0.0041	NA	NA	NA	2.35221861138292e-19	10464018	10474825
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10466791	10485848	8	8	-0.5265	2.35221861138292e-19	10464018	10474825	2.52887928651316e-14	10482217	10491341
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	226	0.0018	2.52887928651316e-14	10482217	10491341	8.40117769763524e-217	11116883	11116883
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	2.145	8.40117769763524e-217	11116883	11116883	4.62798340361119e-242	11140421	11140421
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	68	0.0242	4.62798340361119e-242	11140421	11140421	2.13096012647809e-12	11393473	11395862
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-0.4492	2.13096012647809e-12	11393473	11395862	7.75102979876221e-10	11435643	11452868
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	78676440	22142	21319	-0.0029	7.75102979876221e-10	11435643	11452868	1.05290982895676e-23	78676440	78676440
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78679297	78686371	4	4	0.8239	1.05290982895676e-23	78676440	78676440	2.31843902658383e-23	78686371	78686371
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	130943064	18051	17353	-0.0036	2.31843902658383e-23	78686371	78686371	2.282196219194e-77	130943064	130943064
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.1001	2.282196219194e-77	130943064	130943064	1.94052853537228e-65	130946248	130946248
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	533	0.0113	1.94052853537228e-65	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6773	-0.0075	NA	NA	NA	4.32085211692536e-103	36969571	36969571
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-2.5389	4.32085211692536e-103	36969571	36969571	1.64233134948878e-51	36982877	36982877
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	282	0.0191	1.64233134948878e-51	36982877	36982877	7.73577361276125e-72	37953582	37953582
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.8172	7.73577361276125e-72	37953582	37953582	2.23280045651238e-61	37957844	37957844
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	52255511	5820	5609	-0.006	2.23280045651238e-61	37957844	37957844	2.95318794111996e-41	52255511	52255511
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	52256260	52261110	6	6	-0.8716	2.95318794111996e-41	52255511	52255511	5.18563778148409e-43	52261110	52261110
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	52261881	56650373	859	834	0.0052	5.18563778148409e-43	52261110	52261110	2.21934669865586e-35	56646284	56650373
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	0.5144	2.21934669865586e-35	56646284	56650373	2.01380252022292e-33	56685341	56686863
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	89659397	8253	7953	0.0108	2.01380252022292e-33	56685341	56686863	2.70764619618778e-09	89659397	89659397
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	0.7559	2.70764619618778e-09	89659397	89659397	9.80247059331074e-10	89662326	89662326
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4602	-0.0021	9.80247059331074e-10	89662326	89662326	0	100690991	100690991
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.7192	0	100690991	100690991	0	100693892	100693892
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	112638921	3932	3788	-0.0014	0	100693892	100693892	2.81959665376559e-08	112637234	112638921
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	112640972	112643095	2	2	0.7032	2.81959665376559e-08	112637234	112638921	5.93251719605049e-05	112643095	112647268
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	112645264	113788788	476	454	0.0272	5.93251719605049e-05	112643095	112647268	3.08086964534188e-09	113787620	113788788
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113794669	3	3	0.7729	3.08086964534188e-09	113787620	113788788	2.46639845724947e-10	113794669	113797828
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114123340	149	143	0.0312	2.46639845724947e-10	113794669	113797828	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19441654	37	37	-0.1838	NA	NA	NA	6.6937474892897e-12	19441654	19441654
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	19448755	3	3	-0.8185	6.6937474892897e-12	19441654	19441654	7.23054659717712e-11	19448755	19448755
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19453177	19497023	21	20	-0.2582	7.23054659717712e-11	19448755	19448755	2.33696750437255e-12	19492531	19542388
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19535787	21443020	950	909	0.004	2.33696750437255e-12	19492531	19542388	6.41938966406133e-109	21430511	21452603
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21444352	22051630	302	289	0.2454	6.41938966406133e-109	21430511	21452603	1.02475384967716e-150	22041571	22057437
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22052799	105597555	30329	29163	-0.0023	1.02475384967716e-150	22041571	22057437	3.72389385562725e-20	105595302	105606424
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.4485	3.72389385562725e-20	105595302	105606424	1.32926628289833e-09	105625010	105673157
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	19	-0.0999	1.32926628289833e-09	105625010	105673157	8.74980880304248e-07	105776293	105787390
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.6907	8.74980880304248e-07	105776293	105787390	6.83589281542714e-08	105798116	105800545
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105856591	22	21	0.0035	6.83589281542714e-08	105798116	105800545	1.55662789968196e-58	105856591	105856591
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105875924	4	4	-2.2256	1.55662789968196e-58	105856591	105856591	1.9099315883122e-18	105875924	105875924
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105881893	2	2	-0.944	1.9099315883122e-18	105875924	105875924	1.95795615584398e-13	105881893	105881893
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105923686	14	14	-0.0571	1.95795615584398e-13	105881893	105881893	2.39113440661712e-08	105923159	105948347
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106002179	20	20	0.36	2.39113440661712e-08	105923159	105948347	8.21782175885018e-12	105989160	106017453
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106221696	92	89	0.0048	8.21782175885018e-12	105989160	106017453	2.01555747033536e-08	106214372	106223507
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106223137	106255190	15	13	-0.3491	2.01555747033536e-08	106214372	106223507	3.65665926217192e-09	106249962	106256498
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106355517	34	33	0.0025	3.65665926217192e-09	106249962	106256498	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106358491	106358491	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.0032	NA	NA	NA	0.0122717500574148	18432558	18876677
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	19465359	92	88	0.29	0.0122717500574148	18432558	18876677	3.59654098067736e-10	19391934	19833542
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20088256	58	57	0.5036	3.59654098067736e-10	19391934	19833542	7.76943398177275e-128	20079935	20308014
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	52516459	11843	11382	-0.0076	7.76943398177275e-128	20079935	20308014	9.41748266748481e-14	52516459	52516459
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52517110	52517110	1	0	NA	9.4174826674848e-14	52516459	52516459	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52519074	52533227	2	2	-0.9222	NA	NA	NA	6.1172688866649e-14	52533227	52533227
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52540479	56507534	1613	1548	-9e-04	6.1172688866649e-14	52533227	52533227	4.59655535660427e-31	56507534	56507534
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56509504	56516385	5	5	-0.8631	4.59655535660427e-31	56507534	56507534	3.43654055604946e-31	56516385	56516385
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56518657	74669752	8091	7748	-0.0102	3.43654055604946e-31	56516385	56516385	4.280697553293e-36	74669752	74669752
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.0143	4.280697553293e-36	74669752	74669752	6.19557106424582e-37	74680439	74680439
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	99632987	9333	8971	-0.0057	6.19557106424582e-37	74680439	74680439	1.48491224079487e-60	99632987	99632987
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.8337	1.48491224079487e-60	99632987	99632987	1.34379923391944e-49	99635701	99635701
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	260	0.0017	1.34379923391944e-49	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	9717023	3608	3477	-0.0037	NA	NA	NA	2.20259219510899e-10	9717023	9721317
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	9721317	9729750	3	3	-0.7079	2.20259219510899e-10	9717023	9721317	1.46461000117159e-11	9726999	9729750
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	9733962	14876356	1857	1788	-0.0098	1.46461000117159e-11	9726999	9729750	2.35894505434071e-17	14683004	14956177
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	13	-0.4145	2.35894505434071e-17	14683004	14956177	3.17371406286651e-18	15029941	15037844
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	32379126	5091	4883	-0.0028	3.17371406286651e-18	15029941	15037844	2.51542299632071e-31	31845232	32521360
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33559207	45	40	-0.3098	2.51542299632071e-31	31845232	32521360	1.37380754724755e-32	33527454	33830585
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	74095899	9604	9264	-0.003	1.37380754724755e-32	33527454	33830585	2.14265046532004e-09	74085073	74103442
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74097511	74134999	17	16	-0.2697	2.14265046532004e-09	74085073	74103442	2.95297894129211e-10	74127552	74144645
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74137609	75093957	284	274	-9e-04	2.95297894129211e-10	74127552	74144645	4.15884019509571e-216	75093957	75093957
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.8028	4.15884019509571e-216	75093957	75093957	3.16399135922842e-202	75100865	75100865
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	581	-0.0092	3.16399135922842e-202	75100865	75100865	8.56823188751457e-29	76925748	76925748
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.638	8.56823188751457e-29	76925748	76925748	3.47891558659247e-26	76940218	76942679
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4343	-0.0048	3.47891558659247e-26	76940218	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	405	0.0252	NA	NA	NA	1.00272603596128e-49	1028979	1028979
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.7167	1.00272603596128e-49	1028979	1028979	4.35471691545191e-51	1030766	1030766
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	10285551	4094	3943	3e-04	4.35471691545191e-51	1030766	1030766	1.01252944003029e-38	10285551	10288778
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	10288778	10297380	5	5	-0.9488	1.01252944003029e-38	10285551	10288778	6.0366246956933e-35	10295612	10297380
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	10299609	15727076	1784	1724	-0.006	6.0366246956933e-35	10295612	10297380	1.16361867048083e-13	15727076	15727076
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	0.9323	1.16361867048083e-13	15727076	15727076	1.12162865516878e-14	15733964	15733964
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	24195451	2665	2560	0.0017	1.12162865516878e-14	15733964	15733964	1.13992569991437e-31	24195451	24195451
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24198397	24201924	5	5	-0.8545	1.13992569991437e-31	24195451	24195451	1.62795643890725e-31	24201924	24201924
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24204545	31457889	3063	2927	-0.0068	1.62795643890725e-31	24201924	24201924	2.62867460182066e-41	31451114	31461588
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	-0.5054	2.62867460182066e-41	31451114	31461588	1.46213949101488e-42	31493990	31889566
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1751	-0.0014	1.46213949101488e-42	31493990	31889566	0	36673853	36673853
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-4.6819	0	36673853	36673853	0	36683509	36683509
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	36684619	1	0	NA	0	36683509	36683509	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	36785286	47	46	-7e-04	NA	NA	NA	1.87942396720591e-13	36785286	36785286
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36787465	36792511	4	4	0.5923	1.87942396720591e-13	36785286	36785286	3.20711274051616e-11	36792511	36793796
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36793796	78653545	15706	15097	-0.0027	3.20711274051616e-11	36792511	36793796	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	40226609	11794	11359	-0.0034	NA	NA	NA	1.31248831248705e-11	40223036	40226609
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40230827	40235901	3	3	-0.6705	1.31248831248705e-11	40223036	40226609	4.8061282758785e-11	40235901	40244566
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	40244566	65357415	7969	7640	0.0014	4.8061282758785e-11	40235901	40244566	1.05627431316391e-25	65357415	65357415
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65359770	65367911	4	4	-0.8715	1.05627431316391e-25	65357415	65357415	7.22707887041368e-26	65367911	65367911
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	65369843	76116026	3194	3075	0.0063	7.22707887041368e-26	65367911	65367911	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	9138936	4063	3904	0.0015	NA	NA	NA	1.67673986854301e-14	9138936	9138936
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9141894	9144715	3	3	-0.8306	1.67673986854301e-14	9138936	9138936	2.61807134840710e-16	9144715	9144715
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9145735	19694025	4961	4772	-0.002	2.6180713484071e-16	9144715	9144715	6.57459832478591e-11	19692626	19694025
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	0.6815	6.57459832478591e-11	19692626	19694025	2.52100392310684e-09	19700620	19702214
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	23105894	867	826	0.0116	2.52100392310684e-09	19700620	19702214	8.05622216340336e-15	23105894	23108527
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23108527	23113720	3	3	0.8619	8.05622216340336e-15	23105894	23108527	1.85612686766429e-19	23110685	23113720
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23114764	41532062	3248	3124	0.0013	1.85612686766429e-19	23110685	23113720	2.35515655777231e-08	41530835	41532062
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41533405	41538649	2	2	-0.6982	2.35515655777231e-08	41530835	41532062	1.16321725344832e-07	41538649	41542955
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41542955	55769042	6205	5979	-0.0068	1.16321725344832e-07	41538649	41542955	1.29430914948540e-08	55766650	55769042
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-0.7369	1.2943091494854e-08	55766650	55769042	6.18731698996984e-07	55772729	55776055
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	56823430	516	495	-0.0103	6.18731698996984e-07	55772729	55776055	2.34907726529017e-45	56823430	56823430
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.9243	2.34907726529017e-45	56823430	56823430	2.69938135703075e-48	56840346	56840346
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	56844304	2	0	NA	2.69938135703075e-48	56840346	56840346	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56846683	58194876	576	558	-0.0176	NA	NA	NA	1.90067368239198e-06	58163925	58197961
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58196296	58244012	23	20	-0.2333	1.90067368239198e-06	58163925	58197961	5.14976282762161e-08	58239871	58261341
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	59246409	484	457	-0.003	5.14976282762161e-08	58239871	58261341	2.07161897859042e-07	59244965	59246409
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-0.5683	2.07161897859042e-07	59244965	59246409	2.06538748775098e-07	59251831	59253728
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	59414898	86	83	0.0225	2.06538748775098e-07	59251831	59253728	5.39007032129259e-10	59410642	59421197
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59443697	15	14	-0.3054	5.39007032129259e-10	59410642	59421197	4.06104916683902e-10	59442709	59450162
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59445015	63788698	1989	1913	-0.01	4.06104916683902e-10	59442709	59450162	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	560	0.0027	NA	NA	NA	2.93669273658249e-157	1506379	1506379
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	-1.6347	2.93669273658249e-157	1506379	1506379	1.14105295100804e-181	1531162	1531162
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	26147112	8439	8099	-0.0037	1.14105295100804e-181	1531162	1531162	6.63683570475501e-11	26142400	26153866
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148060	26173123	14	14	0.3064	6.63683570475501e-11	26142400	26153866	4.30661189436754e-12	26158310	28252024
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	28247413	49816022	8045	7725	-0.0058	4.30661189436754e-12	26158310	28252024	1.15566641961775e-10	49816022	49817852
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	49817852	49820963	3	3	0.6294	1.15566641961775e-10	49816022	49817852	2.76594799839150e-09	49819451	49823341
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	49823341	62419534	4483	4318	0.0015	2.7659479983915e-09	49819451	49823341	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12928	-0.0017	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2873	0.0023	NA	NA	NA	2.76465028059122e-129	22667608	22667608
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	0.9344	2.76465028059122e-129	22667608	22667608	1.41150404968539e-151	22725305	22725305
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	27386252	2565	2453	-0.0112	1.41150404968539e-151	22725305	22725305	1.85822241465576e-17	27386252	27386252
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27387298	27396032	4	3	0.8277	1.85822241465576e-17	27386252	27386252	1.67445757575217e-16	27396032	27396032
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27400339	49571068	10983	10563	-0.0018	1.67445757575217e-16	27396032	27396032	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1091	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529	94062	5	5	0.1855	NA	NA	NA	5.96403723771315e-09	94062	95819
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	5	1.0047	5.96403723771315e-09	94062	95819	1.90586864899519e-30	104732	104732
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	124528	16	15	0.0197	1.90586864899519e-30	104732	104732	2.34414010014245e-22	124528	127113
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	1.1325	2.34414010014245e-22	124528	127113	3.41139387770262e-45	129544	130528
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	2670510	1730	1662	0.0212	3.41139387770262e-45	129544	130528	5.37253564656199e-15	2668419	2686115
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2671030	2708291	29	28	-0.2555	5.37253564656199e-15	2668419	2686115	1.81484211183039e-239	2708291	2708291
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	29424906	10006	9618	0.9404	1.81484211183039e-239	2708291	2708291	7.60380130139833e-24	29424906	29424906
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	29427771	29435644	2	2	1.8213	7.60380130139833e-24	29424906	29424906	2.58665647207647e-11	29435644	29435644
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	29436712	148437616	32867	31552	0.941	2.58665647207647e-11	29435644	29435644	2.12564436738726e-12	148431291	148437616
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148452844	148461889	4	4	0.2009	2.12564436738726e-12	148431291	148437616	6.04117591472197e-08	148461889	148495064
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148491866	148653616	47	46	0.912	6.04117591472197e-08	148461889	148495064	6.76945246032255e-21	148653435	148694272
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148694251	148835531	25	25	1.493	6.76945246032255e-21	148653435	148694272	4.55939070572247e-41	148777814	148850158
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148850158	154037006	2049	1976	0.9063	4.55939070572247e-41	148777814	148850158	1.30301947602086e-12	154028488	154050185
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154038318	154038318	1	0	NA	1.30301947602086e-12	154028488	154050185	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154078819	11	11	1.4026	NA	NA	NA	5.06205791665608e-09	154051619	154085354
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154079002	154442377	90	89	0.9593	5.06205791665608e-09	154051619	154085354	8.78068161348929e-81	154442377	154442377
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	2	-1.7649	8.78068161348929e-81	154442377	154442377	1.26545130548277e-108	154450309	154450309
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.9748	1.26545130548277e-108	154450309	154450309	6.6883605257736e-177	154582414	154582414
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	0.0132	6.6883605257736e-177	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	123	-4.0863	NA	NA	NA	2.61571184382473e-21	3219200	3773948
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-1.224	2.61571184382473e-21	3219200	3773948	6.48433377357799e-17	5531459	6652845
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	111	-3.9051	6.48433377357799e-17	5531459	6652845	3.74380856811589e-08	6930012	7007724
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7653082	216	199	-2.9628	3.74380856811589e-08	6930012	7007724	6.89196180025853e-12	7630477	7655293
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7722458	43	40	-4.6016	6.89196180025853e-12	7630477	7655293	3.73105222454153e-35	7719658	7723783
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7782532	19	14	-1.8975	3.73105222454153e-35	7719658	7723783	2.88649244428014e-12	7756907	7785973
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7841425	21	20	-3.7755	2.88649244428014e-12	7756907	7785973	0.000303326688014501	7831268	7870400
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7843166	7914104	19	19	-2.7897	0.000303326688014501	7831268	7870400	1.64037923965988e-07	7897073	7930528
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8174858	56	51	-4.1995	1.64037923965988e-07	7897073	7930528	0.000627566058554781	8090502	8178487
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8176058	8176058	1	0	NA	0.000627566058554781	8090502	8178487	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8178487	8211300	12	11	-3.088	NA	NA	NA	3.41576226111199e-06	8204414	8225409
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8212681	8289709	16	14	-3.961	3.41576226111199e-06	8204414	8225409	5.81680742869932e-13	8277707	8289709
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	11	-2.6846	5.81680742869932e-13	8277707	8289709	1.39900516742432e-05	8324291	8335081
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	8547778	54	53	-3.9638	1.39900516742432e-05	8324291	8335081	0.00224135513268977	8490437	8568582
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8548774	8693820	49	48	-3.3364	0.00224135513268977	8490437	8568582	0.000117517255370843	8663007	8747044
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8695195	9160624	114	106	-4.0818	0.000117517255370843	8663007	8747044	0.00010883156861748	9102367	9164547
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10050351	17	16	-2.9206	0.00010883156861748	9102367	9164547	1.05821082217939e-11	10049346	10055462
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10051663	10513747	58	56	-4.2395	1.05821082217939e-11	10049346	10055462	4.42707819187772e-38	10513747	10535786
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	16	-1.2009	4.42707819187772e-38	10513747	10535786	1.76092056361198e-14	11249952	11698871
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12452734	1	0	NA	1.76092056361198e-14	11249952	11698871	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	10	-4.4221	NA	NA	NA	3.98702497760793e-08	12541506	12554612
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12542979	1	0	NA	3.98702497760793e-08	12541506	12554612	NA	NA	NA
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12545716	12679146	52	46	-2.2604	NA	NA	NA	1.66066227496598e-10	12649357	12682301
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12682301	12796639	19	19	-4.1502	1.66066227496598e-10	12649357	12682301	4.22365038453185e-11	12792780	12833424
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12804329	13128515	117	110	-2.355	4.22365038453185e-11	12792780	12833424	1.00502732512733e-06	13090026	13149825
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13262997	46	43	-3.4359	1.00502732512733e-06	13090026	13149825	0.00018568803966386	13165652	13329968
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13264329	14310145	347	329	-4.0944	0.00018568803966386	13165652	13329968	3.65267770098370e-05	14102074	14382361
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14312365	14454048	75	71	-3.5135	3.6526777009837e-05	14102074	14382361	0.000216890496047355	14413754	14546195
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14455003	14644293	73	69	-2.7171	0.000216890496047355	14413754	14546195	3.08123741555109e-12	14557473	14697315
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15915466	407	382	-3.8943	3.08123741555109e-12	14557473	14697315	0.0104863234164509	15564959	15980898
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16035717	43	39	-3.2047	0.0104863234164509	15564959	15980898	0.00101255636437734	16017681	16036892
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16042966	6	6	-1.5002	0.00101255636437734	16017681	16036892	1.07597795791534e-06	16042966	16062961
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16387273	113	107	-3.6047	1.07597795791534e-06	16042966	16062961	0.00370031716084577	16190541	16764847
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	22157319	939	880	-4.0364	0.00370031716084577	16190541	16764847	2.93858361408648e-05	22051284	22157319
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-2.1159	2.93858361408648e-05	22051284	22157319	1.13254059735428e-10	22177335	22181855
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	87	-4.278	1.13254059735428e-10	22177335	22181855	8.03390251928297e-63	22926726	25737663
MSK_252152911529_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	81	-1.3273	8.03390251928297e-63	22926726	25737663	NA	NA	NA
