Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	554287	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	736471	108533257	39035	30072	0.0039	NA	NA	NA	6.43242098103938e-271	108533257	108533257
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-4.6625	6.43242098103938e-271	108533257	108533257	1.67868441932137e-276	108538662	108538662
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	147311437	5134	3976	-5e-04	1.67868441932137e-276	108538662	108538662	7.0109424897081e-11	146283719	147357754
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147313991	147313991	1	0	NA	7.0109424897081e-11	146283719	147357754	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147315217	148081769	36	29	-0.3056	NA	NA	NA	1.73925811564482e-12	147475854	148120872
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148084402	150819879	1254	962	0.0193	1.73925811564482e-12	147475854	148120872	1.45483234677632e-81	150819879	150823073
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	7	1.6987	1.45483234677632e-81	150819879	150823073	2.56617978644042e-88	150851439	150852858
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	190163609	14920	11511	-3e-04	2.56617978644042e-88	150851439	150852858	4.6654470894659e-11	190163609	190163609
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	190177875	190183757	2	2	-1.1559	4.6654470894659e-11	190163609	190163609	1.06293844956111e-10	190183757	190183757
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	190189716	200598243	3303	2549	0.0071	1.06293844956111e-10	190183757	190183757	5.33152159922145e-12	200580745	200625002
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200797743	39	29	-0.3175	5.33152159922145e-12	200580745	200625002	3.01188364356692e-11	200676505	200810641
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200801004	246769018	17283	13260	-0.0024	3.01188364356692e-11	200676505	200810641	2.46319204398933e-30	246753652	246794552
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246860551	26	23	-0.5709	2.46319204398933e-30	246753652	246794552	1.13216845359278e-46	246858820	246862029
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246862029	247185356	98	81	0.0489	1.13216845359278e-46	246858820	246862029	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	247186514	247186514	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	17082016	5089	3928	-0.0076	NA	NA	NA	2.39857268894427e-12	17074335	17082016
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17087488	17102047	4	3	-1.0105	2.39857268894427e-12	17074335	17082016	2.11088868442027e-12	17102047	17105804
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17105804	34543992	6429	4942	0.0014	2.11088868442027e-12	17102047	17105804	7.10393040781676e-14	34539603	34552935
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	14	0.4962	7.10393040781676e-14	34539603	34552935	6.4063102441097e-13	34579933	34599239
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	377	0.0071	6.4063102441097e-13	34579933	34599239	7.93269953757782e-12	35821494	35821494
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.229	7.93269953757782e-12	35821494	35821494	2.49149059536194e-12	35844884	35844884
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37789939	878	697	-0.0164	2.49149059536194e-12	35844884	35844884	4.56809277617603e-12	37775420	37812045
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37858379	28	24	-0.3797	4.56809277617603e-12	37775420	37812045	6.29152093772799e-14	37843380	37868682
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	99205201	18695	14417	-0.0037	6.29152093772799e-14	37843380	37868682	1.58953456214543e-77	99205201	99205201
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99221389	99221389	1	0	NA	1.58953456214543e-77	99205201	99205201	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99222939	99278820	24	19	0.9696	NA	NA	NA	8.60087917529724e-07	99274745	99279984
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99279984	99290960	7	7	0.6032	8.60087917529724e-07	99274745	99279984	9.5938082055351e-11	99290960	99293858
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	99293858	106091102	2201	1717	-0.0033	9.5938082055351e-11	99290960	99293858	7.36470783592944e-14	106091102	106091102
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106092506	106095769	2	2	-1.2867	7.36470783592944e-14	106091102	106091102	6.54980340030007e-13	106095769	106095769
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106097149	112747508	1478	1154	-0.0089	6.54980340030007e-13	106095769	106095769	2.78243469368642e-11	112747508	112747508
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112749123	112750646	2	2	-1.2032	2.78243469368642e-11	112747508	112747508	2.38915448678471e-11	112750646	112750646
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112752277	112752277	1	0	NA	2.38915448678471e-11	112750646	112750646	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112761950	179767214	20939	16228	-0.0096	NA	NA	NA	3.48402272946592e-11	179767214	179767214
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179777850	1	0	NA	3.48402272946592e-11	179767214	179767214	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179778489	179778919	2	2	1.176	NA	NA	NA	2.37195382001190e-11	179778919	179778919
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	230187822	16734	12939	-0.0115	2.3719538200119e-11	179778919	179778919	2.65231650613537e-10	230187822	230187822
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	230188968	230194055	4	2	1.1236	2.65231650613537e-10	230187822	230187822	2.06449058098238e-09	230194055	230194055
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	230197663	242686945	4803	3726	0.0122	2.06449058098238e-09	230194055	230194055	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242689978	242689978	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	1902159	632	474	-0.0143	NA	NA	NA	1.03800773457915e-20	1902159	1902159
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	1904563	1904563	1	0	NA	1.03800773457915e-20	1902159	1902159	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	1910523	1924533	7	4	-1.0776	NA	NA	NA	3.83843500571405e-20	1924533	1924533
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	1926905	1928653	2	0	NA	3.83843500571405e-20	1924533	1924533	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	1929854	5458792	1399	1072	-0.0195	NA	NA	NA	1.97090117784442e-258	5453213	5480494
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	5467236	5467236	1	0	NA	1.97090117784442e-258	5453213	5480494	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	5480494	6111471	83	67	-0.9693	NA	NA	NA	9.43903512198483e-266	6105141	6111471
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	6119637	6123241	2	0	NA	9.43903512198483e-266	6105141	6111471	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	6128946	89475107	28514	21941	-0.0031	NA	NA	NA	7.11494037908832e-46	89475107	89475107
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	11	-1.0003	7.11494037908832e-46	89475107	89475107	3.75243433731103e-45	89500935	89500935
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	164005577	22837	17623	-0.0091	3.75243433731103e-45	89500935	89500935	7.50650255351273e-15	163989367	164023502
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164019640	3	0	NA	7.50650255351273e-15	163989367	164023502	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164023502	164107951	22	12	-0.5634	NA	NA	NA	7.148544131252e-15	164100804	164115417
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	181192621	5472	4220	-0.0228	7.148544131252e-15	164100804	164115417	1.14841198623169e-12	181192621	181192621
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	181194844	181203270	3	2	-1.2489	1.14841198623169e-12	181192621	181192621	3.48401336662481e-13	181203270	181203270
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	181204585	191137282	3606	2780	-0.0011	3.48401336662481e-13	181203270	181203270	6.8099802916063e-11	191137282	191140693
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191140693	191145329	3	3	-0.9336	6.8099802916063e-11	191137282	191140693	8.17847222126572e-10	191142656	191145329
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191147675	192544305	463	369	-0.0396	8.17847222126572e-10	191142656	191145329	4.03318171946868e-11	192540351	192544305
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192546280	192546280	1	0	NA	4.03318171946868e-11	192540351	192544305	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	3	-0.9694	NA	NA	NA	1.24747133387285e-10	192552734	192554451
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	196929826	1601	1248	-0.0141	1.24747133387285e-10	192552734	192554451	5.16155162985421e-16	196929805	196945209
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	196942158	2	0	NA	5.16155162985421e-16	196929805	196945209	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	196961238	8	8	0.7007	NA	NA	NA	7.58321472092328e-14	196957322	196964180
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	729	0.0031	7.58321472092328e-14	196957322	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	2605	0.0219	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.5811	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34439897	6166	4741	-0.0174	0	9842644	9842644	4.9410869862549e-13	34425046	34439897
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34445002	34445002	1	0	NA	4.9410869862549e-13	34425046	34439897	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	5	-0.8077	NA	NA	NA	2.76541243521779e-13	34491115	34506297
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	60359620	6984	5369	-0.0113	2.76541243521779e-13	34491115	34506297	7.63508131272046e-09	60359620	60359620
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	60362012	60363691	2	2	-1.0498	7.63508131272046e-09	60359620	60359620	5.70091417145924e-09	60363691	60369602
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	60367562	60367562	1	0	NA	5.70091417145924e-09	60363691	60369602	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	60369602	68901210	1875	1434	-0.009	NA	NA	NA	3.65686027496754e-13	68897538	69069651
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68905670	69165814	15	9	-0.6013	3.65686027496754e-13	68897538	69069651	1.71466056134015e-14	69144974	69656183
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	69643272	1	0	NA	1.71466056134015e-14	69144974	69656183	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69656183	70150576	116	90	-0.0074	NA	NA	NA	2.08689713666936e-18	70150576	70150576
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.9478	2.08689713666936e-18	70150576	70150576	3.98674223560416e-14	70216707	70216707
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	191153613	36593	28177	-0.0137	3.98674223560416e-14	70216707	70216707	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	730853	221	171	-0.0048	NA	NA	NA	5.416839075527e-13	727098	730853
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	737829	829954	7	6	0.8612	5.416839075527e-13	727098	730853	5.96197987280016e-21	829954	873365
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	870657	1	0	NA	5.96197987280016e-21	829954	873365	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	873365	12857302	3746	2889	-0.0081	NA	NA	NA	1.51088812028458e-234	12857302	12857302
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.9706	1.51088812028458e-234	12857302	12857302	1.14206082699916e-205	12873052	12873052
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	13269140	2	0	NA	1.14206082699916e-205	12873052	12873052	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13274531	45890934	9136	7036	-0.0131	NA	NA	NA	1.20983520375473e-10	45865353	45890934
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	45894590	45916407	6	4	-0.8349	1.20983520375473e-10	45865353	45890934	1.11707502470209e-10	45916407	45924620
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	45924620	148629049	29968	23207	-0.0124	1.11707502470209e-10	45916407	45924620	4.85938723712736e-15	148629049	148629049
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	148630832	148631961	2	2	-1.3761	4.85938723712736e-15	148629049	148629049	2.65384496460646e-15	148631961	148631961
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	148633665	180644810	10675	8141	0.0032	2.65384496460646e-15	148631961	148631961	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	249566	61	50	-0.0628	NA	NA	NA	1.23262553274007e-11	236535	256810
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	251128	326323	40	26	-0.4418	1.23262553274007e-11	236535	256810	3.96268899671734e-21	318496	334423
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	327962	1	0	NA	3.96268899671734e-21	318496	334423	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	32539864	11572	8978	0.0013	NA	NA	NA	6.92660979078971e-27	32538115	32588005
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32543054	32563252	4	0	NA	6.92660979078971e-27	32538115	32588005	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32564884	32613538	11	8	0.9002	NA	NA	NA	1.68821818592811e-28	32600962	32613538
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32626619	32626619	1	0	NA	1.68821818592811e-28	32600962	32613538	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32628420	95602178	19196	14742	-0.0079	NA	NA	NA	1.08863331237778e-13	95590494	95602178
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	95611089	95641352	5	5	-0.836	1.08863331237778e-13	95590494	95602178	5.38229062440336e-14	95634385	95663974
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	95663974	151150778	18419	14203	-0.013	5.38229062440336e-14	95634385	95663974	2.6162360113266e-12	151149171	151150778
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151152312	151154106	2	2	-1.2377	2.6162360113266e-12	151149171	151150778	6.73702411070219e-12	151154106	151154106
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151157788	170753106	6805	5252	-0.0147	6.73702411070219e-12	151154106	151154106	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	4154	0.007	NA	NA	NA	7.6776030904999e-203	16135701	16135701
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.9983	7.6776030904999e-203	16135701	16135701	1.11715848057920e-212	16140018	16140018
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	16141776	1	0	NA	1.1171584805792e-212	16140018	16140018	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16145480	90069357	21846	16819	-0.0053	NA	NA	NA	1.39921339597478e-11	90069357	90069357
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	90071000	90071000	1	0	NA	1.39921339597478e-11	90069357	90069357	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	90073076	90075384	2	2	-1.2102	NA	NA	NA	1.93602887083036e-11	90075384	90075384
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	90077135	118609124	12024	9309	-0.0057	1.93602887083036e-11	90075384	90075384	5.14200526092940e-17	118609124	118609124
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118611324	118618468	2	0	NA	5.1420052609294e-17	118609124	118609124	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118619693	118620875	2	2	1.4487	NA	NA	NA	3.75401666161218e-18	118620875	118620875
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	2444	-0.0132	3.75401666161218e-18	118620875	118620875	1.93619066245404e-16	125831554	125831554
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125833251	1	0	NA	1.93619066245404e-16	125831554	125831554	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125836353	125837524	2	2	1.3792	NA	NA	NA	2.97240070398044e-15	125837524	125837524
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141410894	7362	5679	7e-04	2.97240070398044e-15	125837524	125837524	3.88090756650026e-13	141405145	141413352
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	10	0.575	3.88090756650026e-13	141405145	141413352	3.43864808160368e-14	141438504	141446728
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141442231	1	0	NA	3.43864808160368e-14	141438504	141446728	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141443577	148416647	2961	2286	-0.0163	NA	NA	NA	6.5348308030875e-15	148416647	148416647
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	148418227	148419737	2	2	-1.3688	6.5348308030875e-15	148416647	148416647	4.50215978474714e-14	148419737	148419737
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	148421193	158191657	3700	2850	0.0037	4.50215978474714e-14	148419737	148419737	1.35900144539347e-166	158191657	158191657
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158193795	158195947	2	2	-4.6275	1.35900144539347e-166	158191657	158191657	2.39936467714077e-140	158195947	158195947
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158197662	158821263	212	167	0.0174	2.39936467714077e-140	158195947	158195947	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	107733564	32834	25416	-0.0083	NA	NA	NA	3.10617623614813e-14	107733564	107733564
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107737273	107739119	2	2	-1.3333	3.10617623614813e-14	107733564	107733564	3.03306611142338e-14	107739119	107739119
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107741928	146264846	11730	9011	-0.0064	3.03306611142338e-14	107739119	107739119	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70923005	13071	10095	-0.01	NA	NA	NA	1.36998865323721e-22	70923005	70923005
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70926188	70926188	1	0	NA	1.36998865323721e-22	70923005	70923005	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.6199	NA	NA	NA	2.15901942051177e-22	70930528	70930528
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	93434678	7285	5607	-0.0186	2.15901942051177e-22	70930528	70930528	1.53212471130558e-17	93434678	93434678
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93436073	93439862	3	3	-1.2071	1.53212471130558e-17	93434678	93434678	4.91397219492496e-17	93439862	93439862
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93443960	140145632	17581	13539	0.0052	4.91397219492496e-17	93439862	93439862	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	140145683	140145683	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	53830907	16359	12623	-0.0095	NA	NA	NA	5.93651276410115e-20	53830907	53830907
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53832408	53837487	2	2	-1.5876	5.93651276410115e-20	53830907	53830907	2.56227883540523e-21	53837487	53837487
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	53839618	70949263	5314	4023	-0.0135	2.56227883540523e-21	53837487	53837487	1.79974344201227e-13	70947915	70949263
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.9052	1.79974344201227e-13	70947915	70949263	6.70736342501898e-13	70960187	70966034
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	70964344	1	0	NA	6.70736342501898e-13	70960187	70966034	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70966034	135285645	23128	17786	-9e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1366	0.0311	NA	NA	NA	8.53975681033166e-13	4920907	4923300
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4926583	1	0	NA	8.53975681033166e-13	4920907	4923300	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4928045	4932214	4	4	-0.9581	NA	NA	NA	4.42495012791204e-15	4932214	4937118
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	4934594	1	0	NA	4.42495012791204e-15	4932214	4937118	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4937118	55118214	15127	11652	-0.0014	NA	NA	NA	6.0897402784502e-33	55112618	55127355
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55123719	1	0	NA	6.0897402784502e-33	55112618	55127355	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55217189	39	35	-0.4738	NA	NA	NA	3.52590168500422e-32	55205278	55221692
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	21968	0.002	3.52590168500422e-32	55205278	55221692	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	734832	295	222	0.0264	NA	NA	NA	4.66780187677473e-14	730254	734832
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	736988	736988	1	0	NA	4.66780187677473e-14	730254	734832	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.9488	NA	NA	NA	9.84969452902293e-15	743223	751484
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	750147	3	0	NA	9.84969452902293e-15	743223	751484	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	751484	9543817	3442	2619	0.0137	NA	NA	NA	8.06063588933002e-30	9543817	9563866
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9550789	9599999	10	9	0.9273	8.06063588933002e-30	9543817	9563866	1.90068722862223e-30	9573313	9604633
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11112600	573	444	-0.0201	1.90068722862223e-30	9573313	9604633	1.44579665744576e-294	11112600	11112600
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11116883	1	0	NA	1.44579665744576e-294	11112600	11112600	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-3.569	NA	NA	NA	5.72330041623187e-313	11130871	11130871
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	18622648	2613	2071	-0.0143	5.72330041623187e-313	11130871	11130871	1.12686037211422e-16	18620105	18622648
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	18623793	18623793	1	0	NA	1.12686037211422e-16	18620105	18622648	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	18625661	18640625	5	5	-0.918	NA	NA	NA	4.62745911298427e-17	18640625	18644963
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	18644963	92321076	23281	17990	-0.0062	4.62745911298427e-17	18640625	18644963	9.54881092048992e-15	92321076	92321076
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	92324218	92324218	1	0	NA	9.54881092048992e-15	92321076	92321076	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	92326757	92329384	2	2	-1.3516	NA	NA	NA	2.16392198349145e-14	92329384	92329384
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	92332880	128871574	13560	10309	0.0018	2.16392198349145e-14	92329384	92329384	7.02138948699097e-11	128871574	128871574
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128874699	128874699	1	0	NA	7.02138948699097e-11	128871574	128871574	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128877382	128878823	2	2	-1.1845	NA	NA	NA	2.82986328759407e-10	128878823	128881386
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128880277	128880277	1	0	NA	2.82986328759407e-10	128878823	128881386	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128881386	132287226	1358	1056	-0.0026	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132289090	132289090	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	9461	-0.009	NA	NA	NA	2.79287948350509e-29	49964838	49964838
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.9108	2.79287948350509e-29	49964838	49964838	8.6997307978303e-30	49971732	49971732
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	71375082	5442	4193	-0.0155	8.6997307978303e-30	49971732	49971732	1.00038580318133e-151	71375082	71375082
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.2107	1.00038580318133e-151	71375082	71375082	6.31974473768263e-156	71377671	71377671
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	3558	-0.0136	6.31974473768263e-156	71377671	71377671	1.79268177771419e-11	89659397	89659397
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.1529	1.79268177771419e-11	89659397	89659397	6.04234105277177e-11	89662326	89662326
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	113787620	9196	7176	-0.011	6.04234105277177e-11	89662326	89662326	1.77810857533742e-13	113787620	113787620
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113788788	113788788	1	0	NA	1.77810857533742e-13	113787620	113787620	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-1.2955	NA	NA	NA	1.44739748162318e-09	113792974	113792974
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	111	0.041	1.44739748162318e-09	113792974	113792974	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34674458	5750	4427	-0.0079	NA	NA	NA	2.24861366497983e-09	34674458	34674458
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34679959	2	2	1.0887	2.24861366497983e-09	34674458	34674458	4.38403100395372e-10	34679959	34679959
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34683810	34683810	1	0	NA	4.38403100395372e-10	34679959	34679959	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40663660	1893	1462	-0.0092	NA	NA	NA	1.57932256249327e-12	40659171	40680589
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40670538	40676611	2	0	NA	1.57932256249327e-12	40659171	40680589	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	7	0.6442	NA	NA	NA	7.51605138816522e-12	40722360	40741934
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	100126443	21740	16661	-0.0038	7.51605138816522e-12	40722360	40741934	3.73779570774734e-14	100126443	100126443
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	100129373	100140747	2	2	-1.3212	3.73779570774734e-14	100126443	100126443	2.08921800109545e-13	100140747	100140747
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	100144528	105584008	2236	1724	0.0329	2.08921800109545e-13	100140747	100140747	0.139078490128566	105049262	105590641
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105585666	105597555	8	6	-0.2086	0.139078490128566	105049262	105590641	3.87979363747027e-05	105594189	105597555
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105606424	2	0	NA	3.87979363747027e-05	105594189	105597555	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105607572	105623070	7	5	-0.668	NA	NA	NA	3.85092961622052e-07	105623070	105632168
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105625010	106358491	234	177	0.0035	3.85092961622052e-07	105623070	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0726	NA	NA	NA	8.0036698968146e-09	18452491	18741716
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18692865	1	0	NA	8.0036698968146e-09	18452491	18741716	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	20088256	150	120	-0.677	NA	NA	NA	3.78362186587035e-224	20060061	20308014
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74115754	21309	16438	0.0019	3.78362186587035e-224	20060061	20308014	2.46915570510405e-13	74113558	74115754
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74127210	74133391	4	4	-0.9273	2.46915570510405e-13	74113558	74115754	1.42876311842508e-13	74133391	74137073
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74137073	100298352	9853	7591	2e-04	1.42876311842508e-13	74133391	74137073	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	31862577	10572	8118	0.0128	NA	NA	NA	7.96022748058127e-27	31854794	31862577
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	32809658	18	14	0.7142	7.96022748058127e-27	31854794	31862577	2.4794645096335e-06	32558526	33320529
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33278944	33278944	1	0	NA	2.4794645096335e-06	32558526	33320529	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33293241	33445329	8	7	0.1753	NA	NA	NA	4.32955854652966e-05	33320529	33501907
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33469289	33469289	1	0	NA	4.32955854652966e-05	33320529	33501907	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33495501	33559207	18	16	0.659	NA	NA	NA	1.08179427958158e-15	33538171	33830585
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33647856	34285301	83	61	-0.0439	1.08179427958158e-15	33538171	33830585	9.89454385319555e-13	34232059	34317157
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34292521	34635765	66	48	0.39	9.89454385319555e-13	34232059	34317157	2.80663599824166e-28	34617260	34646477
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34640193	76925748	10369	8060	0.0043	2.80663599824166e-28	34617260	34646477	6.68905360231683e-37	76925748	76925748
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76931247	2	0	NA	6.68905360231683e-37	76925748	76925748	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76933534	76938723	5	4	-1.5152	NA	NA	NA	4.58546272590848e-36	76938723	76938723
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76940218	76940218	1	0	NA	4.58546272590848e-36	76938723	76938723	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	3469	0.0124	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	9328	0.0137	NA	NA	NA	1.31565068998945e-12	31439551	31462463
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31891535	21	14	-0.4672	1.31565068998945e-12	31439551	31462463	9.5679632520188e-13	31503774	31897238
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31893451	36673853	1813	1405	0.019	9.5679632520188e-13	31503774	31897238	2.30507434472244e-268	36673853	36673853
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.6451	2.30507434472244e-268	36673853	36673853	1.03158716090643e-269	36683509	36683509
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41570512	2035	1561	0.0416	1.03158716090643e-269	36683509	36683509	3.38331338913213e-29	41564408	41572001
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41572001	41710400	44	36	0.499	3.38331338913213e-29	41564408	41572001	2.06661552737991e-38	41708551	42148637
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	42143048	2	0	NA	2.06661552737991e-38	41708551	42148637	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42147225	56203479	5110	3906	0.0054	NA	NA	NA	1.43406268864309e-14	56203281	56203479
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56207298	56210366	2	0	NA	1.43406268864309e-14	56203281	56203479	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56212932	56222363	6	6	-0.7463	NA	NA	NA	5.02052375126273e-13	56222363	56231318
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56223433	56223433	1	0	NA	5.02052375126273e-13	56222363	56231318	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56231318	78653545	8558	6628	0.0102	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	1890337	640	470	0.001	NA	NA	NA	9.42757208676584e-75	1888264	1896337
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1896337	1973621	21	19	-0.9427	9.42757208676584e-75	1888264	1896337	4.42992679918804e-73	1970787	1975578
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1975578	53092949	15538	11850	-0.0098	4.42992679918804e-73	1970787	1975578	4.643126859248e-28	53092949	53092949
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.8092	4.643126859248e-28	53092949	53092949	1.54115152309161e-26	53099601	53099601
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	53104196	2	0	NA	1.54115152309161e-26	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53106665	76113758	6760	5247	-0.0167	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	76116026	76116026	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	63788698	23059	17821	0.0314	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	12719	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15778	1506379	585	448	1e-04	NA	NA	NA	7.18425067267357e-136	1506379	1511632
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	7	-2.5618	7.18425067267357e-136	1506379	1511632	1.07842797392291e-187	1525300	1531162
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	48240743	15875	12220	0.001	1.07842797392291e-187	1525300	1531162	8.49551305085496e-15	48240743	48240743
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48242515	48242575	3	3	-1.1163	8.49551305085496e-15	48240743	48240743	3.31161118631283e-15	48242575	48242575
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48244104	48244104	1	0	NA	3.31161118631283e-15	48242575	48242575	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48245351	56554727	2666	2058	0.0047	NA	NA	NA	4.15520802495264e-12	56554727	56554727
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56556447	56560480	2	2	-1.2241	4.15520802495264e-12	56554727	56554727	2.29045175961298e-10	56560480	56560480
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56564179	56566910	2	0	NA	2.29045175961298e-10	56560480	56560480	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56569188	62419534	2435	1880	0.0129	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	10309	-0.0059	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2282	0.0277	NA	NA	NA	1.03450582700179e-12	22603439	22679305
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22715919	18	17	0.4853	1.03450582700179e-12	22603439	22679305	4.58553219703085e-14	22713972	22736990
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22718614	22720195	2	0	NA	4.58553219703085e-14	22713972	22736990	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	43269964	10619	8175	0.0183	NA	NA	NA	1.98441857825566e-14	43269964	43269964
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	43271304	43271304	1	0	NA	1.98441857825566e-14	43269964	43269964	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	43272352	43273481	2	2	-1.3585	NA	NA	NA	4.46631101684755e-14	43273481	43273481
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	43277353	43277353	1	0	NA	4.46631101684755e-14	43273481	43273481	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	43289688	45756464	1255	956	0.0123	NA	NA	NA	2.26025597170454e-11	45752536	45756464
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45757878	45769413	6	4	-0.8625	2.26025597170454e-11	45752536	45756464	6.42264566701486e-11	45769413	45770467
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45770467	49567768	1669	1299	0.0337	6.42264566701486e-11	45769413	45770467	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1091	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529	122273	27	19	0.1659	NA	NA	NA	3.17772987510652e-08	122159	127113
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	124528	124528	1	0	NA	3.17772987510652e-08	122159	127113	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	129544	4	4	-1.0349	NA	NA	NA	1.92216136332229e-14	129104	132689
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	130528	130528	1	0	NA	1.92216136332229e-14	129104	132689	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1431411	755	566	-0.0149	NA	NA	NA	7.06839557156836e-19	1431411	1431411
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.6503	7.06839557156836e-19	1431411	1431411	6.91060899969636e-24	1432953	1432953
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1434970	1	0	NA	6.91060899969636e-24	1432953	1432953	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1435082	1863993	324	246	-3e-04	NA	NA	NA	3.80340459087452e-12	1863993	1863993
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1866084	1867235	2	2	-1.173	3.80340459087452e-12	1863993	1863993	1.15652399269868e-11	1867235	1867235
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1868923	1868923	1	0	NA	1.15652399269868e-11	1867235	1867235	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1869264	2302065	281	207	-0.0034	NA	NA	NA	1.50226802347274e-63	2302065	2302065
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2303192	1	0	NA	1.50226802347274e-63	2302065	2302065	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-2.2733	NA	NA	NA	3.31039791104849e-69	2304398	2304398
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2510821	207	163	0.0105	3.31039791104849e-69	2304398	2304398	2.03668405880110e-13	2510821	2510821
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2510846	2510846	1	0	NA	2.0366840588011e-13	2510821	2510821	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	-1.1877	NA	NA	NA	1.51348840834385e-06	2512881	2514651
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2708291	179	129	-0.0816	1.51348840834385e-06	2512881	2514651	0	2708113	2712641
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	2711273	1	0	NA	0	2708113	2712641	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2712641	48339561	16666	12956	0.9311	NA	NA	NA	2.99459893138283e-17	48337518	48339561
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48340652	48344969	4	4	0.0681	2.99459893138283e-17	48337518	48339561	3.46430759078693e-08	48344969	48355457
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48346270	48349677	3	0	NA	3.46430759078693e-08	48344969	48355457	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	48351995	76998610	6265	4806	0.9356	NA	NA	NA	2.81325921782851e-17	76998610	76998610
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.6854	2.81325921782851e-17	76998610	76998610	8.36912059402805e-19	77010018	77010018
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154441943	22160	17188	0.9339	8.36912059402805e-19	77010018	77010018	6.65391051457535e-71	154441943	154441943
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154442377	154442377	1	0	NA	6.65391051457535e-71	154441943	154441943	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154447839	2	2	4.281	NA	NA	NA	2.23321200718726e-78	154447839	154447839
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154449960	154450309	2	0	NA	2.23321200718726e-78	154447839	154447839	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154578922	27	21	0.952	NA	NA	NA	1.14193692178523e-75	154578922	154586690
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154582414	154582414	1	0	NA	1.14193692178523e-75	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154835787	165	129	-0.0743	NA	NA	NA	5.33270246624644e-07	154826863	154851690
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154836713	154837684	3	0	NA	5.33270246624644e-07	154826863	154851690	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154838626	154888224	33	27	0.2088	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2710450	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2711665	3733715	123	98	-4.0636	NA	NA	NA	3.37156546922199e-15	3223585	3733715
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	3772482	1	0	NA	3.37156546922199e-15	3223585	3733715	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3773948	4431527	9	5	-0.5864	NA	NA	NA	1.15457172769483e-11	4431527	4597974
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	6953343	124	95	-4.045	1.15457172769483e-11	4431527	4597974	0.000464385098237107	6912779	6964172
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7013903	31	27	-3.0804	0.000464385098237107	6912779	6964172	0.188192365380248	6965062	7029972
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7016002	7031936	14	9	-3.9134	0.188192365380248	6965062	7029972	0.0800504214839606	7024303	7039999
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7034323	7051884	10	8	-4.8646	0.0800504214839606	7024303	7039999	0.00212711891760512	7051884	7165588
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7054924	2	0	NA	0.00212711891760512	7051884	7165588	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7365306	103	80	-2.8172	NA	NA	NA	1.52560538298599e-10	7292494	7461576
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7367173	10513747	547	406	-3.8182	1.52560538298599e-10	7292494	7461576	5.25023035301506e-22	10503821	10535786
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10515697	1	0	NA	5.25023035301506e-22	10503821	10535786	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12452734	19	13	-0.7364	NA	NA	NA	3.76155460388422e-37	12452734	12452734
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12527445	5	5	-5.2631	3.76155460388422e-37	12452734	12452734	4.23211001735825e-23	12527445	12527445
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12530596	12541506	6	3	-4.0757	4.23211001735825e-23	12527445	12527445	0.0258490354047895	12541506	12593244
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12637987	45	34	-2.0525	0.0258490354047895	12541506	12593244	9.9789590401788e-07	12614562	12715696
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12638022	12960717	73	57	-3.4742	9.9789590401788e-07	12614562	12715696	1.26888571169043e-10	12928074	12965878
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12963078	13050965	40	30	-1.7007	1.26888571169043e-10	12928074	12965878	1.92814881365756e-09	13041812	13050965
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13052633	13076862	10	8	-3.938	1.92814881365756e-09	13041812	13050965	0.000126009195804941	13066849	13087750
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13077621	13128515	21	19	-2.1848	0.000126009195804941	13066849	13087750	2.95079973146024e-13	13114169	13137597
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13705594	219	167	-3.9839	2.95079973146024e-13	13114169	13137597	7.4636298165134e-05	13491995	13869106
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13716331	2	0	NA	7.4636298165134e-05	13491995	13869106	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13717328	14122129	157	126	-4.4756	NA	NA	NA	0.0130683930554633	14056906	14340202
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14356069	37	30	-3.8769	0.0130683930554633	14056906	14340202	4.08648004419645e-05	14338189	14358464
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14358464	14375855	9	8	-1.9384	4.08648004419645e-05	14338189	14358464	0.00546013438695319	14372581	14409145
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14376942	14376942	1	0	NA	0.00546013438695319	14372581	14409145	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14377844	14508021	80	59	-3.5041	NA	NA	NA	0.000407838522355339	14482624	14553021
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14644293	36	32	-2.2653	0.000407838522355339	14482624	14553021	1.59572517674457e-10	14581797	14689490
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15182292	130	105	-3.964	1.59572517674457e-10	14581797	14689490	0.000502767152562782	15159692	15203221
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15188324	15221212	16	14	-2.5413	0.000502767152562782	15159692	15203221	1.49243066196840e-07	15204346	15225775
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15222741	15433122	135	100	-4.2353	1.4924306619684e-07	15204346	15225775	3.06140376545176e-06	15427777	15433122
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	5	-1.9765	3.06140376545176e-06	15427777	15433122	1.15394434654376e-30	15447091	15447091
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15455932	5	4	-5.2968	1.15394434654376e-30	15447091	15447091	0.00154035754944118	15455932	15468160
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15458280	15559959	50	36	-3.5875	0.00154035754944118	15455932	15468160	0.0285389447400882	15532597	15559959
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15560912	15564959	3	3	-5.2077	0.0285389447400882	15532597	15559959	4.73372159646834e-15	15564959	15564959
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15566377	15566377	1	0	NA	4.73372159646834e-15	15564959	15564959	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15573579	15587741	7	3	-0.8281	NA	NA	NA	9.26721871276727e-11	15587741	15590299
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15902561	52	37	-4.4641	9.26721871276727e-11	15587741	15590299	6.87463762447125e-06	15848986	15977755
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15911389	15915466	2	0	NA	6.87463762447125e-06	15848986	15977755	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16180512	107	85	-3.4198	NA	NA	NA	1.05701750869374e-06	16093439	16300643
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16182565	22165808	996	733	-4.0586	1.05701750869374e-06	16093439	16300643	1.94773256334514e-07	22056953	22166564
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22166564	22179794	8	7	-1.8628	1.94773256334514e-07	22056953	22166564	6.06620146300708e-11	22178964	22200078
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22181855	25737663	93	71	-4.3461	6.06620146300708e-11	22178964	22200078	1.25487888442691e-60	23283689	26873861
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57437557	83	65	-1.1709	1.25487888442691e-60	23283689	26873861	NA	NA	NA
MSK_252152911536_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	57440809	57440809	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
