Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34739490	12876	12692	0.037	NA	NA	NA	4.37207815879915e-09	34739490	34739490
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34744470	34758017	2	2	-1.8335	4.37207815879915e-09	34739490	34739490	3.01312657894482e-09	34758017	34758017
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34761645	72537426	15016	14784	0.0028	3.01312657894482e-09	34758017	34758017	3.84964273738762e-272	72537426	72537426
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.7551	3.84964273738762e-272	72537426	72537426	7.72468693392154e-280	72579311	72579311
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109987341	11688	11527	-0.002	7.72468693392154e-280	72579311	72579311	6.04690630550849e-23	109987341	109987341
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-2.7766	6.04690630550849e-23	109987341	109987341	7.27411013603615e-14	109989998	109989998
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110023268	13	13	-0.1223	7.27411013603615e-14	109989998	109989998	8.43825273165812e-09	110023268	110023268
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-1.6236	8.43825273165812e-09	110023268	110023268	3.0472510564387e-11	110039388	110039388
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	147313991	4560	4485	-0.0097	3.0472510564387e-11	110039388	110039388	5.63483424321615e-254	147313991	147346371
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147315217	147510532	32	32	-2.4158	5.63483424321615e-254	147313991	147346371	4.38460992309847e-207	147490553	147510532
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150819879	1258	1239	0.0232	4.38460992309847e-207	147490553	147510532	1.54427364378976e-21	150818222	150823073
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.1817	1.54427364378976e-21	150818222	150823073	4.73214427237177e-31	150848509	150851439
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	-0.0809	4.73214427237177e-31	150848509	150851439	3.60291151606529e-10	151024118	151026228
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151033188	3	3	1.228	3.60291151606529e-10	151024118	151026228	5.6235913459622e-06	151032967	151038091
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151036435	157128689	2679	2636	0.025	5.6235913459622e-06	151032967	151038091	1.91931396502669e-41	157128689	157128689
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157133150	157133150	1	0	NA	1.91931396502669e-41	157128689	157128689	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.721	NA	NA	NA	3.05847675722543e-41	157136342	157136342
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	227875096	25426	25048	-0.0021	3.05847675722543e-41	157136342	157136342	1.35665384154503e-88	227875096	227875096
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	3	-4.4273	1.35665384154503e-88	227875096	227875096	3.6484155773162e-91	227882805	227882805
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246620921	7324	7222	-0.0032	3.6484155773162e-91	227882805	227882805	9.1277353812023e-07	246593134	246639998
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246622216	246738832	25	24	0.4429	9.1277353812023e-07	246593134	246639998	0.05358961420184	246633505	246738832
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246750352	246769018	6	6	-0.0671	0.05358961420184	246633505	246738832	1.07374434094680e-05	246755298	246811355
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246875016	30	30	-0.8369	1.0737443409468e-05	246755298	246811355	1.61640249776752e-23	246863179	246882156
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	93	-0.0067	1.61640249776752e-23	246863179	246882156	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10725	-0.0015	NA	NA	NA	7.14620738845742e-16	33076512	33076512
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-2.31	7.14620738845742e-16	33076512	33076512	2.56557220657379e-15	33080437	33080437
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	634	0.0212	2.56557220657379e-15	33080437	33080437	6.21426959455574e-20	34527334	34551222
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	19	0.8752	6.21426959455574e-20	34527334	34551222	1.71830137227517e-22	34583814	34597294
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	91179406	18828	18547	-0.0021	1.71830137227517e-22	34583814	34597294	1.46642048731132e-94	91148554	94925331
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91270311	95722700	225	218	0.5248	1.46642048731132e-94	91148554	94925331	4.5571907365486e-90	95600380	96113362
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	95796016	146571330	14480	14283	-8e-04	4.5571907365486e-90	95600380	96113362	1.40707474594238e-202	146571330	146571330
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.7574	1.40707474594238e-202	146571330	146571330	1.86158672335768e-202	146592775	146592775
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	32291	-0.0039	1.86158672335768e-202	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460892	16218	15966	-4e-04	NA	NA	NA	1.56502905684375e-20	47460892	47460892
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-2.6224	1.56502905684375e-20	47460892	47460892	5.38586626588695e-20	47466921	47466921
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	163992903	37268	36709	-0.0042	5.38586626588695e-20	47466921	47466921	1.16506341716293e-150	163992903	163997228
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	7	-3.7686	1.16506341716293e-150	163992903	163997228	0.217841952904485	164001657	164063626
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-4.8117	0.217841952904485	164001657	164063626	0	164107951	164107951
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9982	-0.0085	0	164107951	164107951	8.72267038451072e-218	194354505	194354505
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.8284	8.72267038451072e-218	194354505	194354505	9.29492325865075e-199	194366950	194366950
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1952	-0.0047	9.29492325865075e-199	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	18193	0.001	NA	NA	NA	0	68905670	68905670
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-3.9657	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	138307863	20515	20211	-0.0045	0	69165814	69165814	3.14988592801288e-98	138307863	138307863
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-5.6314	3.14988592801288e-98	138307863	138307863	1.11154589301250e-99	138319409	138319409
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	187330240	14954	14760	-0.0046	1.1115458930125e-99	138319409	138319409	2.81508884512419e-07	187327270	187330240
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	1.125	2.81508884512419e-07	187327270	187330240	2.39946165001808e-08	187338465	187346058
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	189275452	698	685	0.0052	2.39946165001808e-08	187338465	187346058	4.55628893249629e-07	189271694	189277553
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	189277553	189284725	5	5	-0.9227	4.55628893249629e-07	189271694	189277553	9.20305820723596e-06	189281244	189291741
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	189287160	191153613	536	524	-0.0085	9.20305820723596e-06	189281244	189291741	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	140569554	40242	39632	-0.0059	NA	NA	NA	5.34656795833648e-15	140568417	140571327
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140571327	140583440	7	7	-1.2066	5.34656795833648e-15	140568417	140571327	7.20620763376625e-15	140581914	140586061
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140586061	150181399	3605	3559	-0.0015	7.20620763376625e-15	140581914	140586061	3.32519488605961e-09	150166447	150181399
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.96	3.32519488605961e-09	150166447	150181399	2.58156907646058e-09	150202601	150207307
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9766	0.0081	2.58156907646058e-09	150202601	150207307	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	26801068	9365	9236	-0.0015	NA	NA	NA	6.56398896575415e-08	26797255	26801068
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26811016	26811016	1	0	NA	6.56398896575415e-08	26797255	26801068	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26855591	3	3	-1.3202	NA	NA	NA	1.00313905687502e-07	26855591	26863540
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26861184	26861184	1	0	NA	1.00313905687502e-07	26855591	26863540	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	32548736	2306	2277	0.0401	NA	NA	NA	3.17357291316516e-66	32548736	32590568
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32633691	18	18	1.6776	3.17357291316516e-66	32548736	32590568	7.67548704465842e-08	32600962	32634977
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	0.3121	7.67548704465842e-08	32600962	32634977	2.60019278991007e-07	32709263	32720656
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	1.3459	2.60019278991007e-07	32709263	32720656	5.48999262201152e-21	32723722	32731072
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	8107	0.0078	5.48999262201152e-21	32723722	32731072	5.37263194713266e-72	54035000	54035000
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.9886	5.37263194713266e-72	54035000	54035000	5.08685347930412e-75	54042734	54042734
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	13020	-0.0035	5.08685347930412e-75	54042734	54042734	1.52975996806011e-07	103827105	103841482
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103860573	3	3	1.3178	1.52975996806011e-07	103827105	103841482	1.92103721215162e-07	103860573	103868154
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103868154	134631701	10482	10336	-0.0016	1.92103721215162e-07	103860573	103868154	1.27738418815317e-07	134629897	134631701
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-1.3354	1.27738418815317e-07	134629897	134631701	1.96919821751771e-07	134635779	134639397
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	170753106	12430	12253	-0.0114	1.96919821751771e-07	134635779	134639397	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	163711	12	12	0.7568	NA	NA	NA	2.79426165780887e-08	160641	181901
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	176344	244720	28	27	0.0326	2.79426165780887e-08	160641	181901	2.21345073164033e-08	240576	246786
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	5	-1.1653	2.21345073164033e-08	240576	246786	2.8503683824056e-09	251565	256802
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	141690753	49888	49131	0.0027	2.8503683824056e-09	251565	256802	4.47642784418375e-189	141690753	141690753
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	-3.7169	4.47642784418375e-189	141690753	141690753	7.3821704975268e-138	141714168	141714168
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142156165	168	166	0.0283	7.3821704975268e-138	141714168	141714168	1.15025797140620e-07	142152205	142156165
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142166710	3	3	-1.4215	1.1502579714062e-07	142152205	142156165	6.36808780793583e-14	142166710	142166710
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-4.6857	6.36808780793583e-14	142166710	142166710	3.54287150091981e-65	142167908	142167908
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	158821263	6579	6479	-0.0068	3.54287150091981e-65	142167908	142167908	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	39350798	13074	12862	-0.0013	NA	NA	NA	5.40493487572266e-35	39333915	39356595
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	0.623	5.40493487572266e-35	39333915	39356595	1.94170834151059e-34	39499752	39514180
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30966	0.0018	1.94170834151059e-34	39499752	39514180	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5376	-0.0061	NA	NA	NA	7.7329551276591e-10	15801123	15802255
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.7894	7.7329551276591e-10	15801123	15802255	2.26405083335527e-09	15807123	15813356
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	70926188	7612	7512	-0.0016	2.26405083335527e-09	15807123	15813356	1.98951235826915e-12	70926188	70926188
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.0482	1.98951235826915e-12	70926188	70926188	2.74653909989253e-12	70930528	70930528
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	112062107	13772	13555	-0.0115	2.74653909989253e-12	70930528	70930528	3.04011475194484e-21	112062107	112062107
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-2.6561	3.04011475194484e-21	112062107	112062107	8.72225497933007e-20	112069192	112069192
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	112070666	1	0	NA	8.72225497933007e-20	112069192	112069192	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112072386	140145683	11095	10932	0.0092	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	126361	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	128878	70949263	21674	21344	-0.0072	NA	NA	NA	2.21927805936299e-161	70949263	70949263
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-5.0925	2.21927805936299e-161	70949263	70949263	5.8595041248622e-158	70960187	70960187
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2863	0.0188	5.8595041248622e-158	70960187	70960187	1.21659409638919e-10	77917870	77926390
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.5879	1.21659409638919e-10	77917870	77926390	2.0528602302771e-10	77928669	77936034
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19909	-2e-04	2.0528602302771e-10	77928669	77936034	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5733442	2134	2104	0.0065	NA	NA	NA	1.20222617610618e-10	5725459	5736384
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5734978	5763749	18	18	-0.6703	1.20222617610618e-10	5725459	5736384	1.62151564348557e-11	5760117	5774108
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	55118214	14753	14544	-1e-04	1.62151564348557e-11	5760117	5774108	3.3395024906651e-20	55097753	55124730
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55197848	33	32	0.6563	3.3395024906651e-20	55097753	55124730	8.89302894752712e-19	55193014	55205278
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	58383355	1252	1235	0.007	8.89302894752712e-19	55193014	55205278	6.51826355944113e-15	58383355	58383355
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58389208	58390670	2	2	-2.3109	6.51826355944113e-15	58383355	58383355	2.87288436414571e-15	58390670	58390670
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58404501	134450318	27112	26715	0.004	2.87288436414571e-15	58390670	58390670	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3684	0.0131	NA	NA	NA	2.58359028996408e-118	9523923	9523923
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-3.9608	2.58359028996408e-118	9523923	9523923	3.15929527269186e-39	9554149	9554149
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9607363	10	9	-0.9777	3.15929527269186e-39	9554149	9554149	1.87896068051968e-11	9607363	9626623
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9610054	11112600	571	559	-0.0357	1.87896068051968e-11	9607363	9626623	1.60549881084412e-08	11104085	11112600
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11140421	8	8	0.8304	1.60549881084412e-08	11104085	11112600	7.09279107408524e-08	11140421	11151185
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	33270966	7600	7475	-0.0029	7.09279107408524e-08	11140421	11151185	2.54923531196113e-111	33270966	33270966
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33278235	33283825	2	2	-6.0284	2.54923531196113e-111	33270966	33270966	5.88515244212322e-109	33283825	33283825
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33290235	85140147	16518	16294	0.0082	5.88515244212322e-109	33283825	33283825	1.7644992777815e-08	85138493	85148955
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85144290	85152301	5	5	-1.1048	1.7644992777815e-08	85138493	85148955	1.39408598080806e-08	85145529	85152301
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85154731	85217891	28	28	0.0456	1.39408598080806e-08	85145529	85152301	3.46528869752825e-114	85217891	85217891
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85219810	85227102	4	4	-3.9868	3.46528869752825e-114	85217891	85217891	5.48475655589112e-96	85227102	85227102
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85228436	132289090	16668	16433	0.0083	5.48475655589112e-96	85227102	85227102	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	12025	-0.0046	NA	NA	NA	2.85007750430856e-36	49964838	49964838
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.4262	2.85007750430856e-36	49964838	49964838	2.78411608404792e-33	49971732	49971732
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1770	-0.0065	2.78411608404792e-33	49971732	49971732	0	56650373	56650373
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	-4.8329	0	56650373	56650373	0	56685341	56685341
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	100690991	13040	12857	-0.004	0	56685341	56685341	9.49336593449892e-74	100690991	100690991
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.8567	9.49336593449892e-74	100690991	100690991	3.44513888293738e-71	100693892	100693892
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4495	-0.0166	3.44513888293738e-71	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19441654	37	36	-0.3451	NA	NA	NA	7.44294235587231e-06	19403640	19478367
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	40680589	7612	7508	-0.002	7.44294235587231e-06	19403640	19478367	2.78967578709890e-09	40676611	40680589
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	5	-1.135	2.7896757870989e-09	40676611	40680589	1.31691381966790e-08	40722360	40726930
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	105856972	24049	23678	-8e-04	1.3169138196679e-08	40722360	40726930	5.54187451422156e-25	105856972	105856972
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-2.4121	5.54187451422156e-25	105856972	105856972	1.71492363417914e-19	105875924	105875924
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106214372	124	119	-0.0353	1.71492363417914e-19	105875924	105875924	6.05809957586719e-05	106188152	106221696
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	18	-0.5527	6.05809957586719e-05	106188152	106221696	3.3651318099221e-08	106242757	106260876
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	0.0741	3.3651318099221e-08	106242757	106260876	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19407585	91	90	-0.2631	NA	NA	NA	0.000427802447404153	19371539	19465359
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19412049	19835471	16	16	-0.7016	0.000427802447404153	19371539	19465359	8.40622783398975e-34	19835471	19835471
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19839695	19844217	2	2	-4.3587	8.40622783398975e-34	19835471	19835471	4.74723788757656e-37	19844217	19844217
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19845942	20308014	48	47	-0.6537	4.74723788757656e-37	19844217	19844217	3.16154770304776e-29	20053008	20321772
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	82332155	24352	24024	-7e-04	3.16154770304776e-29	20053008	20321772	9.83828213059334e-16	82332155	82332155
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-2.3536	9.83828213059334e-16	82332155	82332155	8.54649773286071e-16	82334704	82334704
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	100298352	6811	6706	-0.0023	8.54649773286071e-16	82334704	82334704	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5387	0.019	NA	NA	NA	8.33807243549385e-16	14683004	14956177
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.8777	8.33807243549385e-16	14683004	14956177	7.2438718979957e-16	15023848	15037844
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	75093957	15041	14838	0.0169	7.2438718979957e-16	15023848	15037844	1.87231469650428e-05	75089974	75093957
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.203	1.87231469650428e-05	75089974	75093957	2.11806798695138e-06	75100865	75102639
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	599	-0.0225	2.11806798695138e-06	75100865	75102639	3.30055064927627e-18	76923844	76929598
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.2346	3.30055064927627e-18	76923844	76929598	3.13386102703259e-16	76938723	76942679
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4433	0.0051	3.13386102703259e-16	76938723	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	408	0.0459	NA	NA	NA	3.46543801536053e-07	1026339	1027736
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1030766	4	4	1.1944	3.46543801536053e-07	1026339	1027736	8.28419109567737e-07	1030715	1032051
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	8147124	3123	3069	0.0386	8.28419109567737e-07	1030715	1032051	7.03453389280223e-07	8144634	8147124
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8149084	2	2	1.6796	7.03453389280223e-07	8144634	8147124	1.65021201198896e-07	8149084	8149084
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8154339	41549217	12356	12188	0.0226	1.65021201198896e-07	8149084	8149084	1.40112637418865e-39	41539415	41552048
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41550918	42151941	60	57	-0.6637	1.40112637418865e-39	41539415	41552048	1.02344638140831e-39	42143048	42158650
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	58435991	5906	5814	0.0222	1.02344638140831e-39	42143048	42158650	2.98927676591997e-07	58427073	58435991
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58439971	58452260	7	7	0.8841	2.98927676591997e-07	58427073	58435991	9.84342887899103e-07	58452260	58459873
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58454995	78653545	7761	7657	0.0234	9.84342887899103e-07	58452260	58459873	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15989	-0.009	NA	NA	NA	3.3730204442254e-10	53092949	53092949
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.8689	3.3730204442254e-10	53092949	53092949	1.10685976762759e-09	53099601	53099601
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6650	-0.0155	1.10685976762759e-09	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	20399700	9216	9076	0.0601	NA	NA	NA	4.23398139967922e-22	20384757	20422223
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20420327	20507235	16	16	-0.9704	4.23398139967922e-22	20384757	20422223	1.84110253233736e-22	20472156	20517399
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20510787	53888515	9274	9127	0.0383	1.84110253233736e-22	20472156	20517399	3.76798677172536e-08	53877281	53892641
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53889671	53901719	9	9	-0.7006	3.76798677172536e-08	53877281	53892641	3.13375084921586e-06	53898065	53911014
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	53903470	63788698	4544	4460	0.0283	3.13375084921586e-06	53898065	53911014	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	579	-0.0248	NA	NA	NA	2.14772099290525e-92	1506379	1511632
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	-2.7558	2.14772099290525e-92	1506379	1511632	7.5445645178993e-113	1528899	1532433
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20683	0.0033	7.5445645178993e-113	1528899	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13232	3e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	21571489	2521	2481	0.0282	NA	NA	NA	2.11150306331076e-05	21568861	21571489
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.225	2.11150306331076e-05	21568861	21571489	1.16551605733029e-05	21576859	21580865
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	35472378	7028	6928	0.0234	1.16551605733029e-05	21576859	21580865	1.15510566818037e-15	35472378	35472378
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.3426	1.15510566818037e-15	35472378	35472378	1.30000868740383e-15	35476942	35476942
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37685496	1211	1194	0.0598	1.30000868740383e-15	35476942	35476942	0	37685496	37685496
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-4.708	0	37685496	37685496	0	37715385	37715385
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5681	0.0203	0	37715385	37715385	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	778	0.02	NA	NA	NA	5.47290632075559e-10	1427338	1431240
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.2944	5.47290632075559e-10	1427338	1431240	6.63372292652291e-10	1432891	1434970
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2415736	735	721	0.0278	6.63372292652291e-10	1432891	1434970	0.000940425075695987	2412897	2415736
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2416516	2418497	4	4	-0.8017	0.000940425075695987	2412897	2415736	0.000146656856222398	2418497	2421183
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2418980	2708291	263	263	-0.0263	0.000146656856222398	2418497	2421183	0	2708113	2711273
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154442377	45102	44447	0.9879	0	2708113	2711273	1.72431043627343e-22	154442377	154442377
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-1.3152	1.72431043627343e-22	154442377	154442377	7.8446991572055e-49	154450309	154450309
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	1.0629	7.8446991572055e-49	154450309	154450309	2.35527571161366e-48	154578922	154586690
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	198	-0.0423	2.35527571161366e-48	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2965000	118	117	-4.3937	NA	NA	NA	4.38175193995366e-14	2954827	3733715
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2969891	4431527	16	16	-2.2375	4.38175193995366e-14	2954827	3733715	1.15104826219765e-06	3772482	6652845
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7054924	181	177	-3.9688	1.15104826219765e-06	3772482	6652845	1.32898321757441e-05	7011055	7211779
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7401540	113	113	-3.1557	1.32898321757441e-05	7011055	7211779	1.75931733409893e-13	7320048	7572591
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7410906	10515697	538	528	-4.061	1.75931733409893e-13	7320048	7572591	2.1215541638957e-32	10513747	10515697
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.4419	2.1215541638957e-32	10513747	10515697	4.68918210548722e-09	10631941	11698871
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13128515	207	202	-3.0742	4.68918210548722e-09	10631941	11698871	0.0825202268917984	12928074	13159901
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13259414	44	44	-3.7339	0.0825202268917984	12928074	13159901	0.0606521366350174	13147329	13397939
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13261173	13663517	166	161	-4.2031	0.0606521366350174	13147329	13397939	0.000128184858398823	13597813	13691261
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13670791	13705594	9	9	-2.8147	0.000128184858398823	13597813	13691261	9.69294930025e-08	13700962	13718946
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14358464	197	196	-4.3695	9.69294930025e-08	13700962	13718946	4.59265086745883e-10	14340202	14409145
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508894	90	87	-3.5491	4.59265086745883e-10	14340202	14409145	1.95855085209861e-08	14500052	14536962
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.796	1.95855085209861e-08	14500052	14536962	2.82308742652556e-19	14566592	14596156
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	410	-4.0553	2.82308742652556e-19	14566592	14596156	0.00150058338244974	15580942	16025800
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	102	-3.5207	0.00150058338244974	15580942	16025800	6.43374785140368e-10	16103913	16217583
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	25737663	1100	1071	-4.2503	6.43374785140368e-10	16103913	16217583	3.29232282961079e-34	23283689	25737663
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26909069	17	17	-1.1599	3.29232282961079e-34	23283689	25737663	5.60633669375411e-05	26904563	26909069
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26913408	26920247	4	4	-2.8109	5.60633669375411e-05	26904563	26909069	5.01523916188748e-11	26920247	26924187
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26924187	26945893	10	10	-0.8437	5.01523916188748e-11	26920247	26924187	0.00197039996689144	26945084	27000085
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-2.6461	0.00197039996689144	26945084	27000085	7.46154994864615e-06	27006628	27067889
MSK_252152911917_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.7997	7.46154994864615e-06	27006628	27067889	NA	NA	NA
