Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26532	0.0034	NA	NA	NA	1.81223997218871e-20	72536231	72540240
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.6849	1.81223997218871e-20	72536231	72540240	8.61831765741397e-21	72571158	72602597
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	8.61831765741397e-21	72571158	72602597	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	120870913	15542	14788	2e-04	NA	NA	NA	3.42792852605807e-31	120857377	120876592
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120872774	121052394	50	48	0.4506	3.42792852605807e-31	120857377	120876592	2.54308613657366e-40	121030970	142721264
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	141559466	146294654	667	632	-0.049	2.54308613657366e-40	121030970	142721264	1.46464505080565e-14	146286735	147308557
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	147346399	11	10	-0.6975	1.46464505080565e-14	146286735	147308557	0.0518073200300362	147311437	147421614
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147352661	147490553	23	22	-0.3968	0.0518073200300362	147311437	147421614	3.21805055726108e-12	147458669	147510532
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147490608	150819879	1262	1199	5e-04	3.21805055726108e-12	147458669	147510532	2.91600054265584e-57	150819879	150819879
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	1.1837	2.91600054265584e-57	150819879	150819879	7.1196755591715e-54	150852858	150852858
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	157133150	2760	2644	0.0075	7.1196755591715e-54	150852858	150852858	2.99568123557417e-12	157133150	157133150
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.3978	2.99568123557417e-12	157133150	157133150	1.54365267444123e-12	157136342	157136342
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200609726	15466	14712	-0.0032	1.54365267444123e-12	157136342	157136342	2.15253775538031e-08	200576669	200633348
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200804838	40	39	-0.2672	2.15253775538031e-08	200576669	200633348	2.81588325824503e-08	200693672	200822564
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200806319	247186514	17404	16561	-0.005	2.81588325824503e-08	200693672	200822564	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33617141	11132	10562	3e-04	NA	NA	NA	2.77340825340086e-185	33617141	33617141
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33619260	33621111	2	2	-5.2205	2.77340825340086e-185	33617141	33617141	2.84097982951788e-184	33621111	33621111
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33622478	34543992	388	373	-0.0044	2.84097982951788e-184	33621111	33621111	1.71115710752990e-09	34524344	34556434
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34582272	16	15	0.4464	1.7111571075299e-09	34524344	34556434	9.00061892036408e-10	34574224	34595734
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34583814	41091579	2877	2732	-0.0116	9.00061892036408e-10	34574224	34595734	8.47022825835122e-12	41087172	41091579
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41092989	41101640	5	4	-0.9785	8.47022825835122e-12	41087172	41091579	2.03174352046439e-12	41101640	41108548
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41105253	41105253	1	0	NA	2.03174352046439e-12	41101640	41108548	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	41108548	44368336	1212	1146	0.0028	NA	NA	NA	2.53635176716500e-70	44368336	44371811
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	44371811	44398519	16	15	1.2033	2.536351767165e-70	44368336	44371811	5.88724360686613e-68	44395148	44398519
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	44400034	45505993	386	368	2e-04	5.88724360686613e-68	44395148	44398519	2.96617081804896e-154	45505505	45505993
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45512431	45512431	1	0	NA	2.96617081804896e-154	45505505	45505993	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45513711	45640161	63	59	-0.9254	NA	NA	NA	1.63049399372652e-169	45640161	45643533
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45643533	146571330	28975	27527	-0.0017	1.63049399372652e-169	45640161	45643533	4.92538982995597e-319	146571330	146571330
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-4.8618	4.92538982995597e-319	146571330	146571330	4.26181026102659e-320	146592775	146592775
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	242689978	32749	31211	-7e-04	4.26181026102659e-320	146592775	146592775	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	164001657	53490	50894	-0.0032	NA	NA	NA	3.94027306493909e-76	164001657	164001657
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164005577	1	0	NA	3.94027306493909e-76	164001657	164001657	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.1441	NA	NA	NA	1.36175215076851e-20	164027724	164036648
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	20	0.5855	1.36175215076851e-20	164027724	164036648	1.29121183672974e-22	164105613	164126256
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	192546280	9547	9090	-0.0012	1.29121183672974e-22	164105613	164126256	2.14969483616131e-08	192542511	192546280
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-0.946	2.14969483616131e-08	192542511	192546280	1.66040954775675e-08	192550989	192552734
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	199329592	2565	2446	-0.0027	1.66040954775675e-08	192550989	192552734	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	187330240	53918	51336	7e-04	NA	NA	NA	3.25702701813542e-13	187329037	187330240
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187338465	4	4	1.0286	3.25702701813542e-13	187329037	187330240	9.76527201310023e-14	187338465	187346058
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187346058	191153613	1239	1181	-0.0146	9.76527201310023e-14	187338465	187346058	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	523562	139	126	0.013	NA	NA	NA	1.75577099575098e-05	500389	542756
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	525008	569884	21	20	0.2913	1.75577099575098e-05	500389	542756	1.39898221067782e-06	561872	589249
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	571442	737829	62	60	-0.0438	1.39898221067782e-06	561872	589249	1.8452044039571e-13	730853	737829
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	819038	5	5	0.8325	1.8452044039571e-13	730853	737829	8.82083520729667e-11	819038	829954
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	829954	180644810	53539	50911	-0.0028	8.82083520729667e-11	819038	829954	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	198124	39	36	0.0357	NA	NA	NA	6.80788031674786e-07	171344	211079
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	200350	1	0	NA	6.80788031674786e-07	171344	211079	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	244363	18	18	0.3625	NA	NA	NA	7.9863036380913e-08	240119	258187
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	246974	26811016	9308	8895	-0.0049	7.9863036380913e-08	240119	258187	2.73699221343549e-08	26801068	26811016
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	3	-0.9288	2.73699221343549e-08	26801068	26811016	2.11659712164418e-08	26861184	26863540
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	32626619	2320	2218	0.0152	2.11659712164418e-08	26861184	26863540	7.05889084121129e-26	32613538	32650672
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32628420	32668835	13	12	-0.8147	7.05889084121129e-26	32613538	32650672	0.000315897420111161	32650672	32668835
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32672983	32711957	18	17	0.0233	0.000315897420111161	32650672	32668835	4.82220695935575e-12	32711957	32711957
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32716255	2	2	-1.3754	4.82220695935575e-12	32711957	32711957	4.33690990385086e-16	32716255	32716255
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32718991	32721872	3	3	-0.8946	4.33690990385086e-16	32716255	32716255	1.01462104834226e-07	32721872	32723366
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32723366	54035000	8263	7842	-0.0034	1.01462104834226e-07	32721872	32723366	3.41955087442856e-159	54035000	54035000
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.0027	3.41955087442856e-159	54035000	54035000	1.15240460603223e-159	54042734	54042734
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	103841482	13207	12631	0.0043	1.15240460603223e-159	54042734	54042734	1.75491429850863e-12	103810611	103841482
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.002	1.75491429850863e-12	103810611	103841482	6.8646381159135e-13	103868154	103873584
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	162502077	20143	19178	-0.0037	6.8646381159135e-13	103868154	103873584	1.54069787082681e-08	162502077	162502077
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162504290	162505819	2	2	-1.1807	1.54069787082681e-08	162502077	162502077	1.86839190360544e-08	162505819	162505819
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162508430	165643653	961	916	-0.0153	1.86839190360544e-08	162505819	162505819	5.4663797733971e-16	165642393	165643653
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1039	5.4663797733971e-16	165642393	165643653	5.53070466035367e-16	165650610	165653315
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1711	-6e-04	5.53070466035367e-16	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	98646545	30396	28952	2e-04	NA	NA	NA	1.74860029479242e-12	98646545	98646545
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	98648490	98650383	2	2	1.4129	1.74860029479242e-12	98646545	98646545	1.12032725893241e-11	98650383	98650383
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	98652572	109967918	4869	4631	0.0101	1.12032725893241e-11	98650383	98650383	8.71708485394023e-206	109967918	109967918
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-5.7313	8.71708485394023e-206	109967918	109967918	2.85595124077805e-208	109974402	109974402
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	120870445	4975	4717	0.0026	2.85595124077805e-208	109974402	109974402	4.07373549738502e-09	120868807	120870445
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120872125	120874365	2	2	1.2406	4.07373549738502e-09	120868807	120870445	1.17836743232058e-09	120874365	120878194
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120878194	126247850	2380	2251	0.0014	1.17836743232058e-09	120874365	120878194	5.11178965725936e-10	126247850	126247850
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126250698	126250698	1	0	NA	5.11178965725936e-10	126247850	126247850	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126252946	126259126	2	2	-1.2597	NA	NA	NA	8.77182070014215e-10	126259126	126259126
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126259691	126259691	1	0	NA	8.77182070014215e-10	126259126	126259126	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126261918	141410894	7173	6810	-0.0024	NA	NA	NA	0	141410894	141413352
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	13	-4.0879	0	141410894	141413352	8.13556905227664e-173	141438504	141440184
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	111	-0.0103	8.13556905227664e-173	141438504	141440184	6.13305851052537e-71	141690753	141690753
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.6633	6.13305851052537e-71	141690753	141690753	1.14279686578933e-90	141714168	141714168
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	151728811	4144	3975	-0.0053	1.14279686578933e-90	141714168	141714168	3.36948314785436e-07	151724590	151734110
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151730250	1	0	NA	3.36948314785436e-07	151724590	151734110	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151732266	151743145	7	7	-0.5878	NA	NA	NA	1.60086267200183e-07	151739173	151747905
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	158821263	2600	2471	3e-04	1.60086267200183e-07	151739173	151747905	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	0.03	NA	NA	NA	5.70716999353846e-104	581533	581533
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.541	5.70716999353846e-104	581533	581533	5.85528776156801e-83	588865	588865
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	591112	1	0	NA	5.85528776156801e-83	588865	588865	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	594169	25123025	8038	7685	-0.0052	NA	NA	NA	5.93509369914216e-61	25123025	25123025
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-3.0412	5.93509369914216e-61	25123025	25123025	2.37755110813552e-64	25125700	25125700
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4667	-0.0054	2.37755110813552e-64	25125700	25125700	3.6036417523262e-88	39341524	39352361
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	54	0.6808	3.6036417523262e-88	39341524	39352361	1.09351206331634e-83	39504332	39508035
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	425	0.0111	1.09351206331634e-83	39504332	39508035	4.33451531919339e-227	40892587	40892587
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-5.434	4.33451531919339e-227	40892587	40892587	3.22398452107846e-198	40897469	40897469
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	29540	5e-04	3.22398452107846e-198	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5195	4e-04	NA	NA	NA	1.57866454548234e-34	15802255	15802255
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-2.2401	1.57866454548234e-34	15802255	15802255	2.94446884316291e-32	15807123	15807123
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22473542	2376	2260	-0.0057	2.94446884316291e-32	15807123	15807123	7.90877328486278e-24	22473542	22473542
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22477358	22477358	1	0	NA	7.90877328486278e-24	22473542	22473542	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.9202	NA	NA	NA	4.31667188996157e-25	22492603	22492603
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	4974	-0.0012	4.31667188996157e-25	22492603	22492603	6.4969014375311e-14	70926188	70926188
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.4436	6.4969014375311e-14	70926188	70926188	2.042862424705e-14	70930528	70930528
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	75177268	1792	1726	-0.0107	2.042862424705e-14	70930528	70930528	2.27396809999338e-11	75177268	75177268
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75208977	75213550	2	2	-1.3079	2.27396809999338e-11	75177268	75177268	1.51024133281194e-10	75213550	75213550
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75221525	137352394	21971	20895	-0.009	1.51024133281194e-10	75213550	75213550	5.75771141683156e-16	137352394	137352394
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.5671	5.75771141683156e-16	137352394	137352394	7.2477078289311e-14	137356880	137356880
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1047	0.0036	7.2477078289311e-14	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	69736364	21098	20096	-0.0077	NA	NA	NA	1.42277333871095e-14	69736364	69736364
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69738782	69739927	2	2	-1.5326	1.42277333871095e-14	69736364	69736364	2.28379976104428e-15	69739927	69739927
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69743286	77917893	3492	3342	-0.0016	2.28379976104428e-15	69739927	69739927	1.45694256413700e-19	77917893	77917893
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-1.7223	1.456942564137e-19	77917893	77917893	3.67581537570733e-19	77928669	77928669
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	127566573	17497	16652	-0.0031	3.67581537570733e-19	77928669	77928669	3.40111255740495e-08	127556450	127569849
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127568592	127584239	10	10	-0.5203	3.40111255740495e-08	127556450	127569849	3.29158005583236e-08	127582694	127599309
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127590461	134739406	2496	2373	-0.0139	3.29158005583236e-08	127582694	127599309	4.89424552109736e-08	134736198	134739406
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	1.1054	4.89424552109736e-08	134736198	134739406	3.30893016704577e-06	134743423	134746574
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	197	0.0084	3.30893016704577e-06	134743423	134746574	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	84024067	27886	26486	-0.0025	NA	NA	NA	6.72687053505427e-67	84022927	84027361
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84025895	84025895	1	0	NA	6.72687053505427e-67	84022927	84027361	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84027361	84078252	28	27	-0.8724	NA	NA	NA	1.45151059272645e-67	84075351	84080025
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84080025	106733851	7067	6739	-0.0011	1.45151059272645e-67	84075351	84080025	4.15233044574287e-59	106733851	106733851
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	2	-2.9936	4.15233044574287e-59	106733851	106733851	5.75562807700937e-61	106747920	106747920
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134450318	10318	9811	-0.0044	5.75562807700937e-61	106747920	106747920	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	10470425	4088	3902	0.0017	NA	NA	NA	2.06909318500202e-50	10470425	10470425
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10474825	10485848	6	6	-1.5991	2.06909318500202e-50	10470425	10470425	2.51313536533149e-41	10485848	10485848
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	225	-0.0179	2.51313536533149e-41	10485848	10485848	1.12942036248273e-48	11116883	11116883
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.4613	1.12942036248273e-48	11116883	11116883	3.26691438474379e-49	11140421	11140421
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	130694393	40179	38237	7e-04	3.26691438474379e-49	11140421	11140421	9.44227954958616e-16	130694393	130694393
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.5805	9.44227954958616e-16	130694393	130694393	6.02884174438872e-16	130701040	130701040
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	609	0.0283	6.02884174438872e-16	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11611	-0.0067	NA	NA	NA	5.62507998814993e-13	49964838	49964838
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.4339	5.62507998814993e-13	49964838	49964838	1.88494122101390e-12	49971732	49971732
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1697	0.001	1.8849412210139e-12	49971732	49971732	1.63961206172080e-23	56610886	56657371
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56691355	18	17	0.6707	1.6396120617208e-23	56610886	56657371	1.71478805645166e-24	56686863	56697807
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56693033	89659397	8250	7876	0.0088	1.71478805645166e-24	56686863	56697807	3.51788918090743e-26	89659397	89659397
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-1.9882	3.51788918090743e-26	89659397	89659397	4.03742336814885e-26	89662326	89662326
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	8876	-0.0059	4.03742336814885e-26	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.3306	NA	NA	NA	1.17897546578218e-21	19475864	19548246
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	40680589	7589	7192	0.0052	1.17897546578218e-21	19475864	19548246	3.01438396476584e-11	40676611	40680589
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40722360	6	6	-0.7609	3.01438396476584e-11	40676611	40680589	5.97134122258685e-11	40722360	40726930
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	73061942	11764	11190	-0.0036	5.97134122258685e-11	40722360	40726930	3.3242157581656e-44	73061942	73061942
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	-1.3802	3.3242157581656e-44	73061942	73061942	6.73666033365314e-41	73092112	73092112
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	73101327	1	0	NA	6.73666033365314e-41	73092112	73092112	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	79174722	2913	2786	-0.0036	NA	NA	NA	6.99132751598531e-157	79174722	79174722
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.5722	6.99132751598531e-157	79174722	79174722	2.84173451980156e-168	79183154	79183154
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105923686	9378	8896	-0.0034	2.84173451980156e-168	79183154	79183154	2.3759439242575e-14	105919618	105961558
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106002179	20	20	0.4721	2.3759439242575e-14	105919618	105961558	2.73942537703263e-07	105985458	106021453
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106214372	88	84	0.0207	2.73942537703263e-07	105985458	106021453	9.0802480288953e-05	106188152	106231012
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	17	-0.3652	9.0802480288953e-05	106188152	106231012	3.01520264276453e-09	106242757	106260876
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106255190	1	0	NA	3.01520264276453e-09	106242757	106260876	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	31	0.1083	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	20060061	153	141	-0.2683	NA	NA	NA	8.3084001608647e-31	20009685	20335887
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20065525	74669752	21558	20518	-0.0061	8.3084001608647e-31	20009685	20335887	5.94020307904563e-59	74669752	74669752
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-2.1416	5.94020307904563e-59	74669752	74669752	1.23550859483421e-43	74680439	74680439
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	158	0.0346	1.23550859483421e-43	74680439	74680439	1.36388343342885e-33	75115806	75115806
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-2.4826	1.36388343342885e-33	75115806	75115806	6.46394674219098e-41	75119713	75119713
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	8974	-0.0083	6.46394674219098e-41	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	32379126	10573	10089	-1e-04	NA	NA	NA	8.90275003285786e-20	31841022	32521360
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	42	0.3921	8.90275003285786e-20	31841022	32521360	6.77024288308622e-22	33525500	33846647
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	57203733	4292	4092	-0.0079	6.77024288308622e-22	33525500	33846647	9.8001132178978e-87	57203733	57203733
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-3.593	9.8001132178978e-87	57203733	57203733	3.45885097567194e-91	57206772	57206772
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3227	0.0097	3.45885097567194e-91	57206772	57206772	9.14477777674664e-23	68693014	68693086
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	9	-0.849	9.14477777674664e-23	68693014	68693086	9.46579829284476e-19	68753209	68838384
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2121	-0.0142	9.46579829284476e-19	68753209	68838384	3.81390500340119e-07	75092501	75093957
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75097331	1	0	NA	3.81390500340119e-07	75092501	75093957	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75099083	75100865	2	2	1.0991	NA	NA	NA	3.10194834441353e-08	75100865	75102639
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	584	-0.033	3.10194834441353e-08	75100865	75102639	1.43830159898929e-208	76925748	76929598
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-3.124	1.43830159898929e-208	76925748	76929598	2.10652862994691e-237	76938723	76940218
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4290	-0.0104	2.10652862994691e-237	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31443186	12034	11398	0.0095	NA	NA	NA	3.08503616782100e-15	31437168	31451114
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31447686	31503774	22	21	-0.4663	3.085036167821e-15	31437168	31451114	2.56587223859892e-13	31492553	31895551
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	348	-0.0213	2.56587223859892e-13	31492553	31895551	1.78004562471117e-126	32828797	32828797
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.3457	1.78004562471117e-126	32828797	32828797	3.41958704885677e-129	32832642	32832642
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	40869151	3260	3099	0.0187	3.41958704885677e-129	32832642	32832642	1.17714698178578e-11	40866844	40869151
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41031191	7	7	-0.6976	1.17714698178578e-11	40866844	40869151	5.88748967524894e-11	41031191	41066163
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41521544	199	193	0.0214	5.88748967524894e-11	41031191	41066163	6.8837222125285e-11	41515622	41522429
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41566540	20	19	-0.4226	6.8837222125285e-11	41515622	41522429	0.000130481770913047	41555295	41587723
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41568539	1	0	NA	0.000130481770913047	41555295	41587723	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42147225	48	46	-0.7368	NA	NA	NA	9.97791032212099e-82	42143048	42148637
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42148637	78653545	13676	12985	0.0056	9.97791032212099e-82	42143048	42148637	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	76116026	22963	21834	-0.0061	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	15420382	6945	6574	0.0244	NA	NA	NA	2.41233864991446e-09	15420382	15420382
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15420954	15422784	2	2	-1.2266	2.41233864991446e-09	15420382	15420382	6.01990426648354e-10	15422784	15422784
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15422978	19694025	2080	1987	0.0188	6.01990426648354e-10	15422784	15422784	2.0502528069113e-190	19694025	19694025
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.331	2.0502528069113e-190	19694025	19694025	8.10841162341458e-163	19700620	19700620
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	19702214	1	0	NA	8.10841162341458e-163	19700620	19700620	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19703888	20399700	185	176	-0.028	NA	NA	NA	4.34080507056743e-26	20386500	20422223
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20420327	20493401	15	15	-0.8484	4.34080507056743e-26	20386500	20422223	6.37751940626711e-36	20472156	20507235
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20507235	56825794	10643	10133	0.0093	6.37751940626711e-36	20472156	20507235	3.3401628320628e-15	56823430	56825794
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.8169	3.3401628320628e-15	56823430	56825794	4.291892569272e-15	56840346	56842447
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58208527	586	554	0.006	4.291892569272e-15	56840346	56842447	8.37050708092634e-08	58201323	58213220
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58239871	13	13	-0.4355	8.37050708092634e-08	58201323	58213220	6.85396941947355e-08	58234974	58252109
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58241773	59414898	575	548	0.0178	6.85396941947355e-08	58234974	58252109	6.94827853762732e-09	59411618	59421197
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.5272	6.94827853762732e-09	59411618	59421197	9.1184036983343e-09	59434159	59442709
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1911	0.0131	9.1184036983343e-09	59434159	59442709	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	12719	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15778	1506379	585	542	-0.0104	NA	NA	NA	5.45232548299525e-42	1506379	1506379
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	8	1.286	5.45232548299525e-42	1506379	1506379	1.12960722722234e-43	1532433	1532433
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20036	-0.0034	1.12960722722234e-43	1532433	1532433	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12810	-0.002	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	35472378	9552	9100	5e-04	NA	NA	NA	2.6488655871339e-23	35472378	35472378
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.9231	2.6488655871339e-23	35472378	35472378	3.46590323777251e-22	35476942	35476942
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1130	0.0258	3.46590323777251e-22	35476942	35476942	1.39919348276768e-13	37621766	37621766
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	1.5204	1.39919348276768e-13	37621766	37621766	1.72507026902894e-13	37626069	37626069
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49565816	5811	5512	0.0098	1.72507026902894e-13	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49567768	49571068	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2303192	1401	1342	0.0177	NA	NA	NA	1.84615888629835e-60	2303192	2303192
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-2.4488	1.84615888629835e-60	2303192	2303192	3.45949352076171e-65	2304398	2304398
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2672401	362	344	-0.03	3.45949352076171e-65	2304398	2304398	7.10384091832313e-05	2667362	2674375
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2693493	12	11	-0.3856	7.10384091832313e-05	2667362	2674375	0.000852601396133136	2686565	2697588
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695630	2708291	15	14	-0.0214	0.000852601396133136	2686565	2697588	1.13034371275751e-38	2708291	2711273
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	111597886	31718	30119	0.9757	1.13034371275751e-38	2708291	2711273	1.91691221815803e-14	111591635	111597886
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111598647	111621331	7	7	0.0961	1.91691221815803e-14	111591635	111597886	1.1906257974258e-14	111621331	111641549
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111641549	154442377	13377	12690	0.9781	1.1906257974258e-14	111621331	111641549	2.25255299752879e-09	154441943	154442377
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154449960	3	3	2.0713	2.25255299752879e-09	154441943	154442377	2.79053507973232e-07	154449960	154449960
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154450309	154582414	29	29	1.0325	2.79053507973232e-07	154449960	154449960	1.92829642873862e-83	154578922	154586690
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	-0.019	1.92829642873862e-83	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3034907	121	118	-3.7439	NA	NA	NA	0.0735683691159712	2752027	3034907
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	3733715	3	3	-2.9983	0.0735683691159712	2752027	3034907	1.97030105162607e-17	3733715	3733715
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	3772482	1	0	NA	1.97030105162607e-17	3733715	3733715	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3773948	4431527	9	8	-0.7602	NA	NA	NA	4.25879846677509e-10	4431527	4431527
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	4597974	1	0	NA	4.25879846677509e-10	4431527	4431527	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4846477	5422507	3	3	-2.3451	NA	NA	NA	6.1642425950569e-62	5422507	5422507
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5531459	5593746	2	2	-0.6057	6.1642425950569e-62	5422507	5422507	0.019413029355956	5593746	6735310
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	160	-3.359	0.019413029355956	5593746	6735310	0.0139432691995121	6983447	7228333
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7259689	56	54	-2.6699	0.0139432691995121	6983447	7228333	0.156588040887219	7135609	7286087
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	23	-1.7588	0.156588040887219	7135609	7286087	0.00480753506118685	7284775	7384405
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7653082	82	76	-2.8805	0.00480753506118685	7284775	7384405	0.000884261400065421	7485594	7660965
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7707621	33	32	-3.8922	0.000884261400065421	7485594	7660965	7.84125401193218e-05	7700496	7751430
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7708716	7997485	88	84	-2.7906	7.84125401193218e-05	7700496	7751430	6.69909376332057e-07	7853950	8114544
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	10515697	371	343	-3.5068	6.69909376332057e-07	7853950	8114544	2.90989278608421e-21	10512616	10595079
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	17	-1.0605	2.90989278608421e-21	10512616	10595079	1.60342453842429e-08	10645500	12452734
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	11698871	1	0	NA	1.60342453842429e-08	10645500	12452734	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	11	-3.6704	NA	NA	NA	1.89891878285436e-06	12537944	12556034
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-1.8869	1.89891878285436e-06	12537944	12556034	1.19755223445191e-16	12661168	12696242
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-4.0778	1.19755223445191e-16	12661168	12696242	9.1399283409763e-13	12820920	12850287
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	109	-2.225	9.1399283409763e-13	12820920	12850287	3.78231901850974e-09	13112411	13129843
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	12	-4.2491	3.78231901850974e-09	13112411	13129843	0.000390611326086575	13151875	13165652
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13254711	29	28	-2.6661	0.000390611326086575	13151875	13165652	1.18816385528363e-05	13208776	13296819
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	14354682	372	356	-3.6844	1.18816385528363e-05	13208776	13296819	2.74127863514152e-15	14331599	14391767
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14356069	14697315	138	133	-2.7371	2.74127863514152e-15	14331599	14391767	3.80328472689588e-05	14581797	14707011
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14698076	14883615	45	43	-3.8741	3.80328472689588e-05	14581797	14707011	0.0173550079859015	14734647	15165820
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15675166	312	298	-3.2499	0.0173550079859015	14734647	15165820	0.000460009870469202	15546378	15713288
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15682936	15915466	39	39	-4.0788	0.000460009870469202	15546378	15713288	8.80145231119238e-14	15902561	15945921
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16042966	49	45	-2.4988	8.80145231119238e-14	15902561	15945921	3.23433835064908e-10	16025800	16072965
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16043782	1	0	NA	3.23433835064908e-10	16025800	16072965	NA	NA	NA
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16059723	22139807	1050	1000	-3.5974	NA	NA	NA	5.05105469423858e-07	22052726	22139807
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.5866	5.05105469423858e-07	22052726	22139807	4.13100143516263e-05	22176501	22179794
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22182080	4	4	-3.4593	4.13100143516263e-05	22176501	22179794	0.0103953174064192	22179794	22204143
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22192409	22268552	25	22	-4.6907	0.0103953174064192	22179794	22204143	2.19309728117349e-08	22252795	22387293
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	61	-3.5409	2.19309728117349e-08	22252795	22387293	3.39803075589200e-52	22926726	22930737
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	30	-1.1091	3.398030755892e-52	22926726	22930737	1.06215275168331e-05	26945893	27000085
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-2.7732	1.06215275168331e-05	26945893	27000085	1.73324439385885e-05	27006628	27053237
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.6159	1.73324439385885e-05	27006628	27053237	2.97116764914872e-14	27137064	27137064
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	3	-3.4056	2.97116764914872e-14	27137064	27137064	2.72998585630864e-22	27176933	27176933
MSK_252152912334_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.5078	2.72998585630864e-22	27176933	27176933	NA	NA	NA
