Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	13110044	4524	4406	0.0378	NA	NA	NA	1.94264439417269e-10	13110044	13110044
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13647633	13649201	2	2	-1.2622	1.94264439417269e-10	13110044	13110044	2.02188122092796e-10	13649201	13649201
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	13654754	16704522	1255	1214	0.0304	2.02188122092796e-10	13649201	13649201	1.46361738527546e-28	16668773	16713074
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	16926444	12	12	-0.8356	1.46361738527546e-28	16668773	16713074	2.08377317831065e-27	16923767	16961001
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16961001	57417887	16126	15721	0.0185	2.08377317831065e-27	16923767	16961001	1.21913573325948e-12	57414920	57422318
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	57419697	57431952	7	7	-0.7539	1.21913573325948e-12	57414920	57422318	2.48443709528928e-12	57427741	57433208
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	57433208	72537426	5968	5820	-0.0082	2.48443709528928e-12	57427741	57433208	2.64861842083178e-29	72536231	72539143
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.7934	2.64861842083178e-29	72536231	72539143	2.47020620077623e-28	72574479	72589682
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	150819879	17556	17118	-0.0039	2.47020620077623e-28	72574479	72589682	1.10270053510411e-60	150819879	150819879
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	1.2466	1.10270053510411e-60	150819879	150819879	2.36337030486176e-67	150852858	150852858
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151936219	449	435	-0.0036	2.36337030486176e-67	150852858	150852858	7.63997332730855e-12	151929606	151938534
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151938534	151966172	13	13	0.502	7.63997332730855e-12	151929606	151938534	2.47688927880639e-09	151962672	151973927
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151968128	157128689	2297	2242	0.0205	2.47688927880639e-09	151962672	151973927	2.16929650163969e-14	157128689	157128689
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157133150	157133150	1	0	NA	2.16929650163969e-14	157128689	157128689	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.5274	NA	NA	NA	8.47351273607925e-16	157136342	157136342
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4029	-0.0181	8.47351273607925e-16	157136342	157136342	0	167483267	167483267
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	7	-4.0212	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	200609726	11350	11068	-4e-04	0	167507898	167507898	3.38030648532157e-09	200585836	200629099
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200787319	35	32	-0.3102	3.38030648532157e-09	200585836	200629099	3.30608319260632e-09	200673525	200808717
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	16985	-4e-04	3.30608319260632e-09	200673525	200808717	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	24452394	7082	6911	-0.0071	NA	NA	NA	9.69238301680144e-10	24448885	24452394
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24455322	24462631	4	4	-0.8705	9.69238301680144e-10	24448885	24452394	1.75243539299443e-09	24462631	24467164
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24467164	34543992	4436	4322	0.0107	1.75243539299443e-09	24462631	24467164	2.09652814025236e-102	34543992	34543992
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	19	1.3048	2.09652814025236e-102	34543992	34543992	1.96534289130108e-123	34591681	34591681
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	37789939	1363	1326	-0.0214	1.96534289130108e-123	34591681	34591681	2.30632401546658e-09	37776576	37819785
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	27	-0.3385	2.30632401546658e-09	37776576	37819785	1.46533422026575e-09	37837974	37872988
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5649	-0.002	1.46533422026575e-09	37837974	37872988	1.42797075109938e-300	52600588	52600588
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-4.24	1.42797075109938e-300	52600588	52600588	1.92229509297397e-298	52635695	52635695
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	242689978	59090	57593	-0.0048	1.92229509297397e-298	52635695	52635695	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10520	-0.0093	NA	NA	NA	1.06525939011505e-87	32074432	32074432
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-3.6335	1.06525939011505e-87	32074432	32074432	2.45292349866735e-86	32080848	32080848
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5265	0.0045	2.45292349866735e-86	32080848	32080848	3.27916763762417e-163	47460892	47460892
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.9846	3.27916763762417e-163	47460892	47460892	3.29319781423551e-164	47466921	47466921
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	60042280	5241	5115	0.0173	3.29319781423551e-164	47466921	47466921	4.42755012943285e-283	60040600	60045383
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	60045383	60251511	107	105	-0.8996	4.42755012943285e-283	60040600	60045383	5.1297074956229e-269	60250180	60254070
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	60254070	99891210	10615	10332	-0.0136	5.1297074956229e-269	60250180	60254070	1.18344718628491e-207	99891210	99891210
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-5.621	1.18344718628491e-207	99891210	99891210	2.60081747104731e-208	99897201	99897201
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	164005577	21306	20767	-0.0081	2.60081747104731e-208	99897201	99897201	5.89691714547321e-29	164005577	164005577
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.3327	5.89691714547321e-29	164005577	164005577	5.15062583586522e-34	164027724	164027724
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164093750	16	16	-0.4013	5.15062583586522e-34	164027724	164027724	1.76978259093112e-07	164077288	164115417
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164100804	194354505	10134	9873	-0.0068	1.76978259093112e-07	164077288	164115417	4.62429335130612e-16	194353315	194354505
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	0.9142	4.62429335130612e-16	194353315	194354505	9.70846981301882e-16	194366950	194368145
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1931	-0.0079	9.70846981301882e-16	194366950	194368145	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34020	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	35882	68905670	18432	17996	-9e-04	NA	NA	NA	3.13719020543371e-40	68905670	68905670
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69099817	6	6	1.438	3.13719020543371e-40	68905670	68905670	0.000475816781038499	69099817	69120776
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69109815	69165814	8	7	0.9015	0.000475816781038499	69099817	69120776	1.68492132255336e-17	69163312	69643272
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	114	0.0083	1.68492132255336e-17	69163312	69643272	4.1156661742801e-12	70130975	70150576
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.9391	4.1156661742801e-12	70130975	70150576	9.98416797366446e-11	70216707	70294312
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	135127780	19884	19394	-0.0058	9.98416797366446e-11	70216707	70294312	1.15825282769513e-105	135122906	135140771
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	135140771	135403175	46	44	-0.8594	1.15825282769513e-105	135122906	135140771	5.98176964410943e-100	135399560	135409951
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	135409951	152093694	4904	4773	-0.0128	5.98176964410943e-100	135399560	135409951	5.67996904320002e-09	152092912	152093694
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	152101303	152103171	3	3	-1.0099	5.67996904320002e-09	152092912	152093694	2.11957515610014e-09	152103171	152106790
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	152106790	191153613	11756	11419	-0.0083	2.11957515610014e-09	152103171	152106790	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	155416484	45485	44313	-0.0074	NA	NA	NA	6.15069053498475e-12	155411053	155416484
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155418745	155421443	3	3	1.1261	6.15069053498475e-12	155411053	155416484	3.22389480523892e-12	155421443	155427589
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	177319638	6962	6803	-0.0012	3.22389480523892e-12	155421443	155427589	1.04232919912337e-08	177317688	177322431
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177322431	177333426	5	4	-0.834	1.04232919912337e-08	177317688	177322431	2.98162506994636e-09	177327715	177340297
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177340297	180342860	1191	1159	0.0293	2.98162506994636e-09	177327715	177340297	2.31596544216764e-08	180192214	180346557
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6114	2.31596544216764e-08	180192214	180346557	6.3523920508579e-09	180355807	180364670
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	108	-0.0277	6.3523920508579e-09	180355807	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	183349	36	35	-0.0329	NA	NA	NA	3.8583275151201e-11	173437	210326
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	186875	186875	1	0	NA	3.8583275151201e-11	173437	210326	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	191387	326323	64	64	-0.3731	NA	NA	NA	1.03034385547712e-28	314877	334423
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29950805	10486	10247	-0.0032	1.03034385547712e-28	314877	334423	1.63568705257312e-11	29937319	29973024
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	13	-0.5318	1.63568705257312e-11	29937319	29973024	2.63310155868496e-12	29995247	30026699
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	30010234	1	0	NA	2.63310155868496e-12	29995247	30026699	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31390982	583	561	0.0192	NA	NA	NA	1.47817588298895e-06	31389372	31390982
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	31418006	3	3	0.8458	1.47817588298895e-06	31389372	31390982	1.53899547123694e-06	31418006	31425113
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32548736	488	475	0.0518	1.53899547123694e-06	31418006	31425113	6.61705777026614e-26	32548736	32548736
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32564884	3	3	-1.5083	6.61705777026614e-26	32548736	32548736	9.45041673315101e-12	32564884	32593151
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32590568	3	0	NA	9.45041673315101e-12	32564884	32593151	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32713363	40	39	0.0778	NA	NA	NA	0.000294338702925602	32703109	32718991
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	0.7341	0.000294338702925602	32703109	32718991	2.07682170088585e-11	32723722	32731072
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	8052	0.0025	2.07682170088585e-11	32723722	32731072	2.85425322051443e-136	54035000	54037199
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.7941	2.85425322051443e-136	54035000	54037199	2.38147027691908e-138	54039814	54042734
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	77490500	6150	5996	-0.0031	2.38147027691908e-138	54039814	54042734	1.04753951948107e-138	77490500	77490500
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-3.7407	1.04753951948107e-138	77490500	77490500	4.50292048101760e-140	77509983	77509983
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	103841482	7054	6868	-0.0083	4.5029204810176e-140	77509983	77509983	5.18966590181998e-257	103841482	103841482
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.3936	5.18966590181998e-257	103841482	103841482	2.62914366554278e-258	103868154	103868154
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22361	-0.0091	2.62914366554278e-258	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	93162991	28448	27755	3e-04	NA	NA	NA	2.74695536568267e-186	93162991	93162991
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	-5.3374	2.74695536568267e-186	93162991	93162991	9.50638800114688e-185	93168978	93168978
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	109967918	6817	6624	0.0153	9.50638800114688e-185	93168978	93168978	3.42865217186756e-52	109967918	109967918
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-2.8627	3.42865217186756e-52	109967918	109967918	2.54375481830877e-52	109974402	109974402
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	125831554	7169	6984	-0.0115	2.54375481830877e-52	109974402	109974402	1.03537276284784e-165	125831554	125831554
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.1112	1.03537276284784e-165	125831554	125831554	5.30113388544958e-166	125837524	125837524
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	125839386	1	0	NA	5.30113388544958e-166	125837524	125837524	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125840585	133433384	3653	3549	0.0041	NA	NA	NA	0	133433384	133436265
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-3.7376	0	133433384	133436265	0	133447868	133448277
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141690753	3830	3734	0.0021	0	133447868	133448277	4.05471122042841e-19	141689547	141690753
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	8	0.8536	4.05471122042841e-19	141689547	141690753	4.51428632368559e-18	141714168	141720303
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	158821263	6752	6557	-0.0036	4.51428632368559e-18	141714168	141720303	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25120552	8159	7934	-0.0045	NA	NA	NA	1.66213963293361e-14	25120552	25120552
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.2362	1.66213963293361e-14	25120552	25120552	4.83613932427566e-15	25125700	25125700
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4779	-0.0018	4.83613932427566e-15	25125700	25125700	0	39350798	39350798
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39394527	17	17	-4.12	0	39350798	39350798	0.000138907910545225	39379539	39420136
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39401641	39441842	16	15	-5.1797	0.000138907910545225	39379539	39420136	1.21249819658496e-05	39438454	39444658
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39443394	39457650	7	7	-3.4343	1.21249819658496e-05	39438454	39444658	4.08090930844279e-05	39451583	39457650
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39461775	39475979	7	6	-5.3938	4.08090930844279e-05	39451583	39457650	1.69660643518949e-09	39475979	39475979
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39479971	39505256	12	12	-3.4567	1.69660643518949e-09	39475979	39475979	0	39505256	39505256
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	144968840	30980	30203	-0.0029	0	39505256	39505256	6.71591329666585e-10	144968840	144968840
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.2857	6.71591329666585e-10	144968840	144968840	2.33912573181415e-09	144970777	144972090
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	436	0.0205	2.33912573181415e-09	144970777	144972090	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5336	-0.0074	NA	NA	NA	1.09730194376668e-21	15802255	15802255
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.7958	1.09730194376668e-21	15802255	15802255	4.13837468793849e-21	15807123	15807123
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2309	-0.0175	4.13837468793849e-21	15807123	15807123	1.5072238587735e-19	22477358	22477358
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.7279	1.5072238587735e-19	22477358	22477358	1.49759670250651e-19	22492603	22492603
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5086	3e-04	1.49759670250651e-19	22492603	22492603	1.3226469836772e-112	70926188	70926188
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.0888	1.3226469836772e-112	70926188	70926188	2.12316432432962e-112	70930528	70930528
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	96302442	8320	8119	-0.0099	2.12316432432962e-112	70930528	70930528	1.24360079552801e-09	96299993	96302442
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	96304674	96304822	2	2	1.2237	1.24360079552801e-09	96299993	96302442	5.04630975354647e-13	96304822	96304822
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	96311789	140145683	16548	16106	0.0036	5.04630975354647e-13	96304822	96304822	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9477	-0.0055	NA	NA	NA	2.66562524421548e-13	27038538	27038538
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.4397	2.66562524421548e-13	27038538	27038538	6.53140826158299e-13	27041812	27041812
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	100676022	22626	22059	-0.0033	6.53140826158299e-13	27041812	27041812	4.15603180047445e-08	100672415	100676022
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-0.8283	4.15603180047445e-08	100672415	100676022	3.81862664835129e-08	100686787	100693036
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	135285645	12447	12141	-0.0026	3.81862664835129e-08	100686787	100693036	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1726	0.0047	NA	NA	NA	0	4923300	4923300
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.6729	0	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	66463477	19805	19287	0.0039	0	4932214	4932214	9.64254997514284e-16	66463477	66463477
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-1.4083	9.64254997514284e-16	66463477	66463477	2.64669815747766e-12	66469412	66469412
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	23103	-0.0034	2.64669815747766e-12	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3659	0.0068	NA	NA	NA	1.57513663425031e-23	9516067	9543817
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	0.7612	1.57513663425031e-23	9516067	9543817	6.3778702822298e-23	9578398	9607363
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11116883	574	559	-0.0176	6.3778702822298e-23	9578398	9607363	2.93208932481218e-97	11116883	11116883
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	6	2.2533	2.93208932481218e-97	11116883	11116883	2.70948331411217e-98	11140421	11140421
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	132287226	40824	39744	0.0035	2.70948331411217e-98	11140421	11140421	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132289090	132289090	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7164	-0.0036	NA	NA	NA	5.98149467961086e-122	37953582	37953582
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.3224	5.98149467961086e-122	37953582	37953582	3.49866122820591e-130	37957844	37957844
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4756	-0.0072	3.49866122820591e-130	37957844	37957844	3.74370500438979e-92	49964838	49964838
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.6399	3.74370500438979e-92	49964838	49964838	2.06521206755897e-77	49971732	49971732
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1742	-0.0115	2.06521206755897e-77	49971732	49971732	1.14346615930816e-14	56607869	56650373
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56657371	1	0	NA	1.14346615930816e-14	56607869	56650373	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56685341	14	14	0.5965	NA	NA	NA	6.77894649288576e-16	56681665	56691355
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	114123340	17604	17166	-0.007	6.77894649288576e-16	56681665	56691355	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	59	-0.2588	NA	NA	NA	7.20863008643635e-12	19463384	19553991
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73061942	19359	18867	-0.0014	7.20863008643635e-12	19463384	19553991	6.36339670229073e-78	73061942	73075500
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	-1.8594	6.36339670229073e-78	73061942	73075500	1.10003709381879e-75	73091980	73092112
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	85499876	4575	4471	-0.0027	1.10003709381879e-75	73091980	73092112	5.41898781624844e-07	85479527	85513358
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85503920	85557854	10	10	-0.489	5.41898781624844e-07	85479527	85513358	3.85044934225014e-07	85550112	85591494
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	85567783	105597555	7630	7419	0.0059	3.85044934225014e-07	85550112	85591494	1.44381933258478e-08	105590641	105606424
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	0.4973	1.44381933258478e-08	105590641	105606424	7.16071507285765e-10	105625010	105681007
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856591	49	48	-0.0347	7.16071507285765e-10	105625010	105681007	1.0885914982011e-07	105848335	105874293
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105881893	6	6	-0.7054	1.0885914982011e-07	105848335	105874293	2.81851366089714e-06	105874293	105897061
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105923686	14	14	-0.0048	2.81851366089714e-06	105874293	105897061	0.00053013639269747	105906483	105961558
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	105945006	1	0	NA	0.00053013639269747	105906483	105961558	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106002179	19	19	0.291	NA	NA	NA	6.52863796311906e-05	105996176	106039587
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106212061	87	84	-0.0324	6.52863796311906e-05	105996176	106039587	2.14932682052049e-08	106199156	106216726
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106214372	106214372	1	0	NA	2.14932682052049e-08	106199156	106216726	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	18	-0.4843	NA	NA	NA	2.59316117575584e-08	106252126	106260962
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	35	0.0595	2.59316117575584e-08	106252126	106260962	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19537035	99	94	-0.0406	NA	NA	NA	5.92679300813678e-17	19421704	19833542
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19800789	1	0	NA	5.92679300813678e-17	19421704	19833542	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19803092	20088256	56	55	0.3811	NA	NA	NA	7.34611224450966e-25	20022359	20330200
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	75115806	21729	21229	-0.001	7.34611224450966e-25	20022359	20330200	7.92624060049936e-18	75115806	75115806
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-1.7076	7.92624060049936e-18	75115806	75115806	1.47936941999761e-18	75119713	75119713
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100298352	9435	9202	-0.0036	1.47936941999761e-18	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	14876356	5468	5328	0.0135	NA	NA	NA	8.29363467462462e-10	14672496	14956252
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15037844	16	16	-0.4374	8.29363467462462e-10	14672496	14956252	3.63966768324827e-10	15028108	15045430
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15039224	28512937	4131	4036	0.0179	3.63966768324827e-10	15028108	15045430	3.12206576341075e-07	28508727	28512937
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28523145	28529948	4	4	0.793	3.12206576341075e-07	28508727	28512937	2.08081747485414e-06	28529948	28539481
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	28536745	32379126	954	931	0.0542	2.08081747485414e-06	28529948	28539481	4.27288099394042e-22	31841022	32515876
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	34061926	57	56	-0.3106	4.27288099394042e-22	31841022	32515876	1.52261434841999e-17	34056516	34074667
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34063575	75093957	9893	9648	0.0046	1.52261434841999e-17	34056516	34074667	1.46449308211848e-39	75093957	75093957
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.0226	1.46449308211848e-39	75093957	75093957	1.00200321979404e-43	75100865	75100865
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76929598	611	601	-0.0149	1.00200321979404e-43	75100865	75100865	5.25952606608659e-09	76919570	76931247
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76931247	76944661	9	9	0.5313	5.25952606608659e-09	76919570	76931247	3.93482444549717e-07	76942679	76951532
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76946579	88690571	4511	4399	0.0036	3.93482444549717e-07	76942679	76951532	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	409	0.0304	NA	NA	NA	1.38492951482795e-07	1027736	1028979
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.1386	1.38492951482795e-07	1027736	1028979	2.03268983277062e-07	1030766	1031233
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	31451114	11617	11310	0.0207	2.03268983277062e-07	1030766	1031233	6.43709013265557e-14	31439551	31468896
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31457889	31457889	1	0	NA	6.43709013265557e-14	31439551	31468896	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	-0.4658	NA	NA	NA	5.40195682455112e-14	31490899	31895551
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	78653545	17578	17147	0.024	5.40195682455112e-14	31490899	31895551	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15782	-0.0078	NA	NA	NA	2.91600871007302e-52	53092949	53092949
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-2.8057	2.91600871007302e-52	53092949	53092949	2.03276552525524e-49	53099601	53099601
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6586	-0.0142	2.03276552525524e-49	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	46046859	15153	14753	0.0459	NA	NA	NA	3.01669544733998e-10	46032427	46046859
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46054503	46063357	5	5	-0.7957	3.01669544733998e-10	46032427	46046859	1.85562434087301e-11	46063357	46086240
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46086240	56823430	4715	4602	0.0482	1.85562434087301e-11	46063357	46086240	5.58477710812075e-12	56819531	56823430
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56842447	9	9	0.6911	5.58477710812075e-12	56819531	56823430	2.42704156141361e-12	56842447	56846683
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56844304	58208527	585	575	0.0242	2.42704156141361e-12	56842447	56846683	4.65706447349069e-07	58196296	58213220
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58241773	14	14	-0.3838	4.65706447349069e-07	58196296	58213220	8.82310380586725e-07	58239871	58261341
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58244012	63788698	2578	2520	0.0219	8.82310380586725e-07	58239871	58261341	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	569	-0.0106	NA	NA	NA	7.1986295941101e-14	1506379	1506379
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1516966	3	3	-1.2145	7.1986295941101e-14	1506379	1506379	0.00270473940300663	1516966	1521410
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1525300	4	4	-2.8433	0.00270473940300663	1516966	1521410	1.20486491060096e-106	1525300	1525300
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	52078884	17247	16810	0.0034	1.20486491060096e-106	1525300	1525300	1.56427072880292e-11	52076473	52081719
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52080395	52080395	1	0	NA	1.56427072880292e-11	52076473	52081719	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.8597	NA	NA	NA	5.10335508211102e-11	52089160	52092989
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3633	-0.0012	5.10335508211102e-11	52089160	52092989	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13091	-0.0028	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16964804	695	679	0.0388	NA	NA	NA	1.60395699788348e-08	16962280	16964804
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16966803	16972213	5	5	-0.7421	1.60395699788348e-08	16962280	16964804	1.04938850881769e-08	16972213	16975371
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16974227	22354945	2149	2087	0.0325	1.04938850881769e-08	16972213	16975371	9.61218861446037e-07	22353852	22354945
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22356179	22357051	2	2	-1.0519	9.61218861446037e-07	22353852	22354945	6.13122745311647e-07	22357051	22358386
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22358386	35472378	6701	6532	0.0222	6.13122745311647e-07	22357051	22358386	5.6593719334567e-15	35472378	35472378
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.5637	5.6593719334567e-15	35472378	35472378	3.09393174857961e-14	35476942	35476942
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35478503	1	0	NA	3.09393174857961e-14	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35479767	41237731	3053	2958	0.036	NA	NA	NA	4.80372351500743e-07	41213175	41254513
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41246992	41295673	13	13	0.466	4.80372351500743e-07	41213175	41254513	3.01449287741558e-07	41286119	41318860
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41310667	49571068	3936	3850	0.0165	3.01449287741558e-07	41286119	41318860	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	0.1738	NA	NA	NA	0.00240127077791969	4926	99430
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	0.9209	0.00240127077791969	4926	99430	1.77461615537023e-16	103089	106242
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2673365	1755	1716	0.0298	1.77461615537023e-16	103089	106242	1.57742474695697e-06	2669225	2674962
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2693493	10	10	-0.4471	1.57742474695697e-06	2669225	2674962	0.000911224009988577	2692498	2698769
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695630	2711273	16	16	-0.0357	0.000911224009988577	2692498	2698769	1.2585261619043e-47	2711273	2712641
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2712641	88039167	25245	24579	0.9922	1.2585261619043e-47	2711273	2712641	9.7404770296923e-15	88035247	88039167
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	88045012	88062186	7	7	0.1097	9.7404770296923e-15	88035247	88039167	8.55193942662262e-15	88062186	88065425
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	88065425	154017980	19739	19216	0.989	8.55193942662262e-15	88062186	88065425	3.20995120463737e-08	153999014	154025967
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154019921	154079002	21	21	1.3762	3.20995120463737e-08	153999014	154025967	6.52695186383035e-08	154056623	154094350
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154085354	154442377	89	88	0.9729	6.52695186383035e-08	154056623	154094350	4.38165243447971e-11	154441943	154442377
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	1.9687	4.38165243447971e-11	154441943	154442377	3.74846936064865e-16	154450309	154456891
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.0007	3.74846936064865e-16	154450309	154456891	1.22600161380786e-83	154578922	154582414
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0196	1.22600161380786e-83	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	123	-4.1524	NA	NA	NA	4.69872679541548e-32	3223585	3772482
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.9005	4.69872679541548e-32	3223585	3772482	7.24223448913703e-17	5422507	6688691
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6997136	139	134	-3.7053	7.24223448913703e-17	5422507	6688691	4.19717724226016e-06	6983447	6997136
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6998513	7013903	10	10	-1.6354	4.19717724226016e-06	6983447	6997136	1.67486015829417e-13	7013903	7016814
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7016002	7054924	26	24	-4.1772	1.67486015829417e-13	7013903	7016814	0.00127589346131343	7047579	7204505
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	125	-2.8775	0.00127589346131343	7047579	7204505	8.23387335153778e-05	7350629	7608619
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	73	-3.8549	8.23387335153778e-05	7350629	7608619	5.64082951501386e-05	7707621	7731490
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	17	-2.3708	5.64082951501386e-05	7707621	7731490	5.09320793598181e-06	7774773	7807668
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8956787	318	308	-3.7503	5.09320793598181e-06	7774773	7807668	1.35667890365267e-05	8869690	8965553
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9160624	36	35	-4.6913	1.35667890365267e-05	8869690	8965553	4.04966717869669e-11	9153682	9208277
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10368218	34	34	-3.3302	4.04966717869669e-11	9153682	9208277	3.17038500206837e-08	10251061	10379409
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10370293	10492142	33	33	-4.5925	3.17038500206837e-08	10251061	10379409	0.00300298622136475	10451527	10501368
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10494395	10515697	9	8	-3.403	0.00300298622136475	10451527	10501368	1.75767724951995e-11	10515697	10537808
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	17	-0.7564	1.75767724951995e-11	10515697	10537808	5.03237021022576e-08	10655750	12514978
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12999095	149	145	-2.7725	5.03237021022576e-08	10655750	12514978	4.00988085016246e-05	12972283	13001517
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13040293	18	16	-1.1326	4.00988085016246e-05	12972283	13001517	0.000226665313311128	13032760	13040293
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13050965	4	4	-2.6643	0.000226665313311128	13032760	13040293	0.0096914420280197	13045641	13058512
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13052633	13076862	10	10	-3.7696	0.0096914420280197	13045641	13058512	1.53686844123389e-05	13076862	13081856
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13077621	13119344	19	19	-2.2203	1.53686844123389e-05	13076862	13081856	0.0206139922849050	13090512	13119344
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.2051	0.020613992284905	13090512	13119344	1.52136831763397e-07	13128515	13129843
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	13	-4.367	1.52136831763397e-07	13128515	13129843	0.00528407694501374	13146483	13167862
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13254711	29	29	-3.1287	0.00528407694501374	13146483	13167862	6.11591896093349e-07	13215006	13285595
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	14358464	374	362	-4.1592	6.11591896093349e-07	13215006	13285595	1.61265254789637e-08	14322984	14418116
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14359748	1	0	NA	1.61265254789637e-08	14322984	14418116	NA	NA	NA
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14508021	88	87	-3.4132	NA	NA	NA	1.08089930852281e-09	14500052	14530134
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	25	-1.5617	1.08089930852281e-09	14500052	14530134	7.98183351105088e-14	14563486	14597771
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	16217583	544	525	-3.5465	7.98183351105088e-14	14563486	14597771	4.49021953373907e-10	16072965	16548823
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	21036411	705	683	-4.0054	4.49021953373907e-10	16072965	16548823	2.33604958689402e-06	21026715	21036411
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.7186	2.33604958689402e-06	21026715	21036411	2.21037466278067e-09	21054519	21057446
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	250	-4.1112	2.21037466278067e-09	21054519	21057446	5.51964344925635e-12	22056953	22139807
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.7261	5.51964344925635e-12	22056953	22139807	3.00741116055838e-16	22177335	22178964
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	86	-4.2672	3.00741116055838e-16	22177335	22178964	3.56196498522968e-56	22926726	26871442
MSK_252152912335_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	80	-1.3781	3.56196498522968e-56	22926726	26871442	NA	NA	NA
