Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27003	0.0055	NA	NA	NA	0	72537426	72537426
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.8849	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	94060783	6990	6792	2e-04	0	72579311	72579311	2.00827132089986e-82	94060783	94060783
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-3.2622	2.00827132089986e-82	94060783	94060783	3.14191032794639e-80	94062928	94062928
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	103904723	3113	3005	0.0046	3.14191032794639e-80	94062928	94062928	2.03065916435053e-11	103898005	103909053
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103906464	1	0	NA	2.03065916435053e-11	103898005	103909053	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103907903	103962495	14	14	0.4814	NA	NA	NA	1.51063317779537e-13	103932025	104108153
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	109168265	1197	1162	-0.0074	1.51063317779537e-13	103932025	104108153	2.24574937803157e-12	109167083	109168265
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109169839	109173218	3	3	-1.0132	2.24574937803157e-12	109167083	109168265	2.64742147105520e-11	109173218	109173218
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109175307	110023268	383	367	0.0294	2.6474214710552e-11	109173218	109173218	3.93304571393607e-10	110014625	110023268
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-0.9614	3.93304571393607e-10	110014625	110023268	5.2691585085285e-10	110039388	110041712
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	146268572	4546	4407	-0.0132	5.2691585085285e-10	110039388	110041712	2.03256719139814e-15	146242212	146286735
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146273215	148081741	49	47	-0.3084	2.03256719139814e-15	146242212	146286735	5.47579904260027e-19	147508217	148119298
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	150839754	1259	1221	0.0279	5.47579904260027e-19	147508217	148119298	3.09501267043768e-39	150839754	150839754
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	5	-1.4321	3.09501267043768e-39	150839754	150839754	6.96959554560899e-37	150851439	150851439
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2663	0.0099	6.96959554560899e-37	150851439	150851439	1.94280306223472e-17	157133150	157133150
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.5716	1.94280306223472e-17	157133150	157133150	3.07392147915897e-18	157136342	157136342
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	10958	-0.0084	3.07392147915897e-18	157136342	157136342	5.23186923460431e-09	185973975	185979586
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.1111	5.23186923460431e-09	185973975	185979586	1.57343137215225e-09	185988138	185988138
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194943390	1953	1892	0.0155	1.57343137215225e-09	185988138	185988138	2.00418935547244e-12	194928003	194962590
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	194943773	195106051	31	29	-0.3146	2.00418935547244e-12	194928003	194962590	2.51318839789909e-10	195062793	195127881
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195108311	237722355	15811	15274	-0.001	2.51318839789909e-10	195062793	195127881	7.44187030241597e-09	237720397	237722355
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	237726884	237729095	2	2	-1.1125	7.44187030241597e-09	237720397	237722355	1.09608300215851e-08	237729095	237729095
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	237737483	246471311	3574	3470	-0.0033	1.09608300215851e-08	237729095	237729095	4.94189985478617e-20	246448361	246509083
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246475624	246769018	87	85	0.2551	4.94189985478617e-20	246448361	246509083	1.63663644138647e-159	246769018	246794552
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	27	-3.9055	1.63663644138647e-159	246769018	246794552	3.80614074979241e-158	246860551	246862029
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	95	0.0027	3.80614074979241e-158	246860551	246862029	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11130	-0.0048	NA	NA	NA	0	34543992	34551222
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34583814	17	16	-4.4086	0	34543992	34551222	0	34582272	34583814
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34589997	34589997	1	0	NA	0	34582272	34583814	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37789939	1364	1321	-0.0182	NA	NA	NA	9.2914871739157e-48	37787637	37800512
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	27	-0.73	9.2914871739157e-48	37787637	37800512	3.10094723997261e-54	37848754	37858379
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5608	0.0034	3.10094723997261e-54	37848754	37858379	3.65129480758637e-12	52588009	52604016
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.8225	3.65129480758637e-12	52588009	52604016	2.80607070586104e-12	52622353	52639605
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	179767214	37545	36292	-0.0027	2.80607070586104e-12	52622353	52639605	2.45472594276089e-10	179764819	179767214
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.9823	2.45472594276089e-10	179764819	179767214	1.00661453811277e-10	179778919	179791128
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	197880750	5252	5095	0.0048	1.00661453811277e-10	179778919	179791128	9.6888854547195e-13	197880750	197880750
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197883024	197884226	2	2	-1.2954	9.6888854547195e-13	197880750	197880750	5.90853436083102e-12	197884226	197884226
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197885450	227949124	10741	10391	8e-04	5.90853436083102e-12	197884226	197884226	3.06753990745315e-08	227939305	227950459
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227990692	14	14	0.4129	3.06753990745315e-08	227939305	227950459	1.34180954196194e-08	227990692	228016799
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227996401	242501239	5466	5290	-0.0142	1.34180954196194e-08	227990692	228016799	4.1466224962845e-12	242471854	242530542
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242689978	67	64	0.222	4.1466224962845e-12	242471854	242530542	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37953375	12681	12251	-0.0083	NA	NA	NA	4.57131881746275e-16	37951628	37954819
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.8481	4.57131881746275e-16	37951628	37954819	1.15767528448248e-14	37960019	37963014
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	46769081	3238	3126	-0.0123	1.15767528448248e-14	37960019	37963014	9.83111928882e-22	46767765	46769081
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.8887	9.83111928882e-22	46767765	46769081	2.92645910817534e-22	46825048	46827727
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	47460892	285	276	0.0185	2.92645910817534e-22	46825048	46827727	1.08485157665850e-137	47460892	47460892
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.3763	1.0848515766585e-137	47460892	47460892	2.20835638396799e-134	47466921	47466921
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	53001678	2442	2372	0.0196	2.20835638396799e-134	47466921	47466921	2.69806552215543e-08	52997045	53001678
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.6926	2.69806552215543e-08	52997045	53001678	1.38144533580539e-08	53011885	53016261
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	89475107	11974	11586	-0.0086	1.38144533580539e-08	53011885	53016261	2.31970695826258e-38	89473678	89475107
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	12	-0.9118	2.31970695826258e-38	89473678	89475107	3.96502541458897e-37	89500935	89502757
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	116137442	6578	6363	0.0036	3.96502541458897e-37	89500935	89502757	7.88334169786623e-13	116136208	116137442
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116140997	116146946	4	4	-0.9437	7.88334169786623e-13	116136208	116137442	1.4909124223249e-12	116146946	116155373
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116155373	129861428	5165	4994	-0.0162	1.4909124223249e-12	116146946	116155373	4.48351088305299e-44	129861428	129861428
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129867158	129887890	8	8	1.1916	4.48351088305299e-44	129861428	129861428	1.02247630081987e-43	129887890	129887890
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129899070	150748947	6812	6583	-0.0035	1.02247630081987e-43	129887890	129887890	1.14243309720123e-33	150748947	150748947
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150751433	150752600	2	2	-2.1168	1.14243309720123e-33	150748947	150748947	7.64840797874354e-33	150752600	150752600
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150753766	163992903	4265	4111	0.001	7.64840797874354e-33	150752600	150752600	0	163992903	163992903
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	-6.0042	0	163992903	163992903	3.06077866354749e-28	164005577	164005577
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-0.5257	3.06077866354749e-28	164005577	164005577	4.17476625839488e-19	164027724	164027724
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-4.5868	4.17476625839488e-19	164027724	164027724	0	164107951	164107951
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	164112873	1	0	NA	0	164107951	164107951	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	196835413	11132	10771	0.0015	NA	NA	NA	3.57106762663528e-27	196810503	196907040
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196957322	28	28	-0.5072	3.57106762663528e-27	196810503	196907040	2.90195751175359e-25	196950095	196964180
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	199329592	955	925	0.0126	2.90195751175359e-25	196950095	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3281	-0.0026	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.3288	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	5960	-0.0074	0	9842644	9842644	4.56144785490222e-10	34433787	34445002
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.6812	4.56144785490222e-10	34433787	34445002	9.46281371913203e-10	34491115	34506297
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	173224400	40070	38805	3e-04	9.46281371913203e-10	34491115	34506297	1.70132714230465e-11	173224400	173224400
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.2718	1.70132714230465e-11	173224400	173224400	7.50863557341405e-13	173228860	173228860
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	184	0.011	7.50863557341405e-13	173228860	173228860	1.19614724867850e-19	173660684	173660684
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.5675	1.1961472486785e-19	173660684	173660684	6.74576601852829e-19	173666072	173666072
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5144	-0.0028	6.74576601852829e-19	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	681141	197	194	0.0386	NA	NA	NA	1.01859719019747e-11	681141	681141
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	-1.2326	1.01859719019747e-11	681141	681141	2.08367995538103e-10	686701	689372
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	737829	23	22	-0.127	2.08367995538103e-10	686701	689372	8.64767139111231e-14	730853	737829
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	0.7346	8.64767139111231e-14	730853	737829	3.91435501381432e-13	829954	870657
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	17395391	5238	5074	-0.0158	3.91435501381432e-13	829954	870657	2.07908904043717e-23	17392850	17395391
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17397258	17409796	8	8	-0.8744	2.07908904043717e-23	17392850	17395391	9.14522666810078e-23	17409796	17411379
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17411379	63300765	11697	11313	-0.0011	9.14522666810078e-23	17409796	17411379	5.12203290762793e-14	63300765	63300765
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	63305918	63312618	2	2	-1.3851	5.12203290762793e-14	63300765	63300765	2.45723792631801e-15	63312618	63312618
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	63315903	68785515	1841	1768	-0.0108	2.45723792631801e-15	63312618	63312618	9.35743485974856e-07	68778212	68785515
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68786286	68792873	3	3	-0.7696	9.35743485974856e-07	68778212	68785515	1.73514696089218e-06	68792873	68799690
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68796062	72772661	683	663	0.0051	1.73514696089218e-06	68792873	68799690	4.05715363433565e-23	72765558	72777815
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	72774052	72837341	28	27	0.489	4.05715363433565e-23	72765558	72777815	4.31483710974123e-24	72832599	72844351
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	72839031	140201609	20351	19660	0.0014	4.31483710974123e-24	72832599	72844351	0	140201609	140201609
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	-5.0418	0	140201609	140201609	0	140216524	140216524
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	150156233	3761	3631	-0.0077	0	140216524	140216524	3.14681902373532e-20	150156233	150162435
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150159466	150181399	6	5	-1.076	3.14681902373532e-20	150156233	150162435	0.0496315251128668	150161037	150181399
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-3.1791	0.0496315251128668	150161037	150181399	4.61325201111963e-266	150202601	150202601
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	180644810	9905	9574	-0.0051	4.61325201111963e-266	150202601	150202601	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	26801068	9365	9060	-0.0037	NA	NA	NA	5.29813547881081e-14	26797255	26801068
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26811016	26861184	5	5	-0.8485	5.29813547881081e-14	26797255	26801068	1.55337806941124e-14	26861184	26863540
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29941766	1216	1176	0.0098	1.55337806941124e-14	26861184	26863540	1.63990201459595e-27	29939288	29972382
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29950805	29950805	1	0	NA	1.63990201459595e-27	29939288	29972382	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30030032	19	17	-0.6362	NA	NA	NA	3.53277439898200e-23	30021908	30033946
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30031367	31382291	574	551	0.0039	3.532774398982e-23	30021908	30033946	2.94090976301472e-12	31381060	31383925
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31390982	5	5	-0.8409	2.94090976301472e-12	31381060	31383925	2.73395291354008e-15	31389372	31393624
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	32558677	492	480	0.029	2.73395291354008e-15	31389372	31393624	1.61957644936645e-27	32548736	32595402
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	14	0.7603	1.61957644936645e-27	32548736	32595402	2.52406194872188e-06	32613538	32650672
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	0.0595	2.52406194872188e-06	32613538	32650672	0.0133559706623946	32695015	32723722
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	0.541	0.0133559706623946	32695015	32723722	1.72536539083354e-08	32720656	32732764
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	65767409	10660	10285	-0.0017	1.72536539083354e-08	32720656	32732764	3.92264993391421e-09	65765501	65767409
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.1229	3.92264993391421e-09	65765501	65767409	2.96648532138730e-09	65771532	65778663
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	79018959	4032	3900	0.0084	2.9664853213873e-09	65771532	65778663	1.17863062222676e-12	79008946	79024557
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	0.524	1.17863062222676e-12	79008946	79024557	3.67037488660323e-13	79085247	79105311
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	100744933	5890	5685	3e-04	3.67037488660323e-13	79085247	79105311	9.88000390077372e-09	100741006	100744933
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	100746925	100749503	2	2	-1.0986	9.88000390077372e-09	100741006	100744933	3.4361912556086e-09	100749503	100750708
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	100750708	103841482	870	842	0.0097	3.4361912556086e-09	100749503	100750708	4.4392783300532e-25	103841482	103841482
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.2874	4.4392783300532e-25	103841482	103841482	5.24453485818931e-25	103868154	103868154
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22160	-0.0043	5.24453485818931e-25	103868154	103868154	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	249	-0.0092	NA	NA	NA	5.31767943687352e-14	1036135	1036135
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1038517	2	2	-1.489	5.31767943687352e-14	1036135	1036135	2.11917930832079e-16	1038517	1038517
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	26097755	8538	8277	0.0019	2.11917930832079e-16	1038517	1038517	1.82284794983094e-27	26097755	26097755
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26103844	26108369	2	2	-1.9158	1.82284794983094e-27	26097755	26097755	6.49996543909224e-19	26108369	26108369
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26112566	26400538	119	116	0.0125	6.49996543909224e-19	26108369	26108369	3.38154985702339e-17	26400538	26400538
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26403038	26404540	2	2	1.6279	3.38154985702339e-17	26400538	26400538	3.40096272060918e-20	26404540	26404540
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26406021	48551463	8143	7902	-0.0087	3.40096272060918e-20	26404540	26404540	3.17737222363213e-13	48548875	48551463
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48554059	48562631	7	7	-0.7229	3.17737222363213e-13	48548875	48551463	1.94273819600878e-13	48562631	48572106
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48572106	86771217	9069	8787	0.0071	1.94273819600878e-13	48562631	48572106	1.32783845105207e-09	86771217	86771217
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86777920	86779294	2	2	-1.1585	1.32783845105207e-09	86771217	86771217	0	86779294	86779294
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86781265	86785324	2	2	-0.7171	0	86779294	86779294	0.00381694477131266	86785324	86798594
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86789967	125831554	16294	15765	0.0032	0.00381694477131266	86785324	86798594	1.12588969753099e-133	125831554	125831554
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.4209	1.12588969753099e-133	125831554	125831554	2.01163698334541e-137	125837524	125837524
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3552	-0.0011	2.01163698334541e-137	125837524	125837524	1.07865466823488e-18	133432281	133437464
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7842	1.07865466823488e-18	133432281	133437464	7.69655542833499e-20	133444486	133453811
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3595	-0.0013	7.69655542833499e-20	133444486	133453811	2.50727528059728e-15	141408013	141413352
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	11	0.5895	2.50727528059728e-15	141408013	141413352	1.35685084234008e-13	141435643	141442231
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	147702365	2639	2561	0.0013	1.35685084234008e-13	141435643	141442231	3.50795185437511e-118	147702365	147702365
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.9835	3.50795185437511e-118	147702365	147702365	9.0813440305858e-113	147707161	147707161
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4089	-0.018	9.0813440305858e-113	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0105	NA	NA	NA	1.97055210793104e-14	581533	581533
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.7485	1.97055210793104e-14	581533	581533	1.72242872298146e-23	588865	588865
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	7156900	2271	2191	-0.0166	1.72242872298146e-23	588865	588865	3.17296588159113e-16	6909487	7260442
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	-0.694	3.17296588159113e-16	6909487	7260442	8.72532768981651e-16	7790934	8137794
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	39350798	10673	10308	-0.0037	8.72532768981651e-16	7790934	8137794	2.79756244298790e-152	39345557	39352361
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.8327	2.7975624429879e-152	39345557	39352361	1.78303421895823e-151	39504332	39508035
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30386	-0.0014	1.78303421895823e-151	39504332	39508035	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	39146895	12731	12290	-0.0015	NA	NA	NA	7.6453993107381e-09	38758232	43776365
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	67923904	20	18	-0.3688	7.6453993107381e-09	38758232	43776365	9.4085997775321e-09	67907649	70207320
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67927172	70926188	321	307	-0.0271	9.4085997775321e-09	67907649	70207320	4.33878020421483e-110	70926188	70926188
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.4135	4.33878020421483e-110	70926188	70926188	6.13321645139395e-93	70930528	70930528
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	93434678	7285	7054	-0.0116	6.13321645139395e-93	70930528	70930528	3.98676046943212e-08	93432783	93434678
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93436073	93439862	3	3	-0.8634	3.98676046943212e-08	93432783	93434678	6.5343414930639e-08	93439862	93443960
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93443960	112055479	6480	6278	-0.0113	6.5343414930639e-08	93439862	93443960	1.17870625453167e-08	112048301	112055479
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112057107	112059104	2	2	-1.0996	1.17870625453167e-08	112048301	112055479	2.01616578327099e-09	112059104	112060652
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112060652	116118907	1696	1636	0.0073	2.01616578327099e-09	112059104	112060652	9.56558712808267e-12	116116077	116118907
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116122595	116130333	4	4	-0.8633	9.56558712808267e-12	116116077	116118907	4.28218644782304e-10	116130333	116132839
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137344988	8293	7982	-0.0028	4.28218644782304e-10	116130333	116132839	4.82534668819634e-08	137339424	137347945
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137347945	137356880	4	4	0.7715	4.82534668819634e-08	137339424	137347945	1.69082530299418e-06	137354256	137361870
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1051	0.0019	1.69082530299418e-06	137354256	137361870	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4539	-0.0113	NA	NA	NA	8.41164207451096e-11	13553503	13553503
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.2189	8.41164207451096e-11	13553503	13553503	2.47421768524165e-10	13556315	13556315
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	124328915	36245	35063	-0.0034	2.47421768524165e-10	13556315	13556315	1.23336573715998e-12	124327243	124328915
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	-1.0912	1.23336573715998e-12	124327243	124328915	6.9014505089716e-12	124340356	124368725
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	135285645	3876	3750	-0.0233	6.9014505089716e-12	124340356	124368725	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	1103180	363	350	-0.0154	NA	NA	NA	4.50661884095157e-07	1101187	1103180
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1104014	1105351	3	3	-1.0603	4.50661884095157e-07	1101187	1103180	1.36824957205189e-11	1105351	1106234
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1106234	4923300	1406	1360	-0.0118	1.36824957205189e-11	1105351	1106234	0	4923300	4923300
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.4185	0	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	55118214	15128	14634	-0.0051	0	4932214	4932214	8.26371503334206e-21	55097753	55134486
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	-0.3885	8.26371503334206e-21	55097753	55134486	1.08649008513407e-21	55196550	55229096
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	55217189	1	0	NA	1.08649008513407e-21	55196550	55229096	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	66463477	4637	4505	0.0055	NA	NA	NA	1.96505631889413e-07	66460753	66463477
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.0195	1.96505631889413e-07	66460753	66463477	1.08680551090203e-07	66469412	66469412
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	92995711	9046	8749	-0.0065	1.08680551090203e-07	66469412	66469412	1.38706790659294e-10	92994078	92995711
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	92998398	93005517	4	3	-0.9784	1.38706790659294e-10	92994078	92995711	2.09384134412162e-10	93005517	93008346
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93008346	134450318	14670	14197	-0.0081	2.09384134412162e-10	93005517	93008346	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	4538227	1918	1858	0.0012	NA	NA	NA	3.35294714760953e-09	4536434	4538227
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4539938	4542324	2	2	-1.0935	3.35294714760953e-09	4536434	4538227	3.32528436367932e-09	4542324	4542324
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	4544254	9523923	1822	1765	0.0055	3.32528436367932e-09	4542324	4542324	1.76642565095094e-62	9523923	9523923
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	15	1.035	1.76642565095094e-62	9523923	9523923	1.36610309665935e-51	9610054	9610054
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10470425	330	319	0.0047	1.36610309665935e-51	9610054	9610054	4.13236186475934e-08	10465787	10470425
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10474825	10485848	6	6	-0.6295	4.13236186475934e-08	10465787	10470425	4.0659016051369e-07	10485848	10497371
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	225	-0.0333	4.0659016051369e-07	10485848	10497371	1.63604080586189e-28	11116883	11116883
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.056	1.63604080586189e-28	11116883	11116883	1.06617734776489e-28	11140421	11140421
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31132762	6819	6598	-5e-04	1.06617734776489e-28	11140421	11140421	1.71616650427147e-52	31098259	31171313
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31298659	43	43	0.5747	1.71616650427147e-52	31098259	31171313	2.62073852035447e-53	31296973	31301891
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	132289090	33963	32874	0.0042	2.62073852035447e-53	31296973	31301891	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33030946	5595	5418	-0.0092	NA	NA	NA	6.91340229811361e-08	33028007	33030946
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33042557	3	3	-0.8669	6.91340229811361e-08	33028007	33030946	3.22579111101599e-07	33042557	33046417
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	36969571	1441	1380	-0.0061	3.22579111101599e-07	33042557	33046417	1.30917561800469e-173	36969571	36969571
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-5.016	1.30917561800469e-173	36969571	36969571	6.57704492795397e-196	36982877	36982877
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	56650373	6984	6749	-0.001	6.57704492795397e-196	36982877	36982877	3.17322001904675e-25	56646284	56657371
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	14	-0.6902	3.17322001904675e-25	56646284	56657371	3.14012063915161e-25	56681665	56686863
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	89659397	8253	7997	0.0069	3.14012063915161e-25	56681665	56686863	5.99315424560197e-14	89659397	89659397
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.3923	5.99315424560197e-14	89659397	89659397	1.31353735061951e-14	89662326	89662326
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	113788788	9197	8881	-0.0113	1.31353735061951e-14	89662326	89662326	1.08703895528759e-18	113788788	113788788
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-1.5913	1.08703895528759e-18	113788788	113788788	1.3616396171907e-19	113792974	113792974
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	147	0.0019	1.3616396171907e-19	113792974	113792974	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34674458	5750	5538	0.016	NA	NA	NA	5.30639998676898e-20	34674458	34674458
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.4057	5.30639998676898e-20	34674458	34674458	5.10579527476662e-22	34683810	34683810
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	79174722	16588	16054	7e-04	5.10579527476662e-22	34683810	34683810	3.05914407655594e-176	79174722	79174722
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.393	3.05914407655594e-176	79174722	79174722	1.00664015592205e-163	79183154	79183154
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	106358491	9540	9237	-0.0089	1.00664015592205e-163	79183154	79183154	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	32454294	3826	3693	-0.0186	NA	NA	NA	2.41353692163546e-30	32451841	32514939
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32456500	32594200	26	25	-0.6004	2.41353692163546e-30	32451841	32514939	2.62179240180414e-33	32581730	32661846
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	64467406	13481	13022	-0.0024	2.62179240180414e-33	32581730	32661846	6.28667474133375e-10	64465792	64467406
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	64469540	64471254	2	2	-1.1866	6.28667474133375e-10	64465792	64467406	1.58807758116143e-09	64471254	64474382
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	64474382	65338146	382	365	-0.0021	1.58807758116143e-09	64471254	64474382	6.47566779478058e-13	65338146	65338146
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	65339353	65340826	2	2	-1.3668	6.47566779478058e-13	65338146	65338146	3.13539743336566e-13	65340826	65340826
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	65341994	75115806	4166	4026	0.0074	3.13539743336566e-13	65340826	65340826	2.17150018473212e-09	75115806	75115806
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.1748	2.17150018473212e-09	75115806	75115806	4.69703662285303e-10	75119713	75119713
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	99632987	9161	8872	-0.0096	4.69703662285303e-10	75119713	75119713	1.34001796412457e-08	99632987	99632987
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.0918	1.34001796412457e-08	99632987	99632987	7.6968678797029e-09	99635701	99635701
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	261	-6e-04	7.6968678797029e-09	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34325501	10708	10391	0.0045	NA	NA	NA	5.95862300604075e-34	34302966	34333833
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34329518	34602318	51	51	0.4319	5.95862300604075e-34	34302966	34333833	6.3281428939905e-35	34588639	34621068
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	68710277	7541	7308	0.0042	6.3281428939905e-35	34588639	34621068	3.91310447617970e-09	68687301	68732367
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68712507	68753209	9	8	-0.5374	3.9131044761797e-09	68687301	68732367	4.17018193969032e-08	68747578	68844016
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2151	-0.0029	4.17018193969032e-08	68747578	68844016	1.20399789429625e-100	75093957	75093957
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.9925	1.20399789429625e-100	75093957	75093957	5.13834479240868e-94	75100865	75100865
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	593	-0.0268	5.13834479240868e-94	75100865	75100865	8.87934778705888e-320	76925748	76929598
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	-3.8539	8.87934778705888e-320	76925748	76929598	0	76938723	76940218
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4369	-0.0132	0	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	403	0.0215	NA	NA	NA	3.65400701087653e-16	1028979	1028979
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.5394	3.65400701087653e-16	1028979	1028979	7.23067976823066e-17	1030766	1030766
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1903358	434	416	0.0303	7.23067976823066e-17	1030766	1030766	6.56431285438691e-11	1902148	1904451
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1906391	4	4	0.9002	6.56431285438691e-11	1902148	1904451	3.27388381050152e-11	1906391	1909371
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	19349828	6722	6492	0.0117	3.27388381050152e-11	1906391	1909371	1.67638121589426e-08	19347933	19349828
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19352211	19357709	3	3	-0.8891	1.67638121589426e-08	19347933	19349828	1.14021392113208e-08	19357709	19359103
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19359103	31462463	4457	4278	0.0073	1.14021392113208e-08	19357709	19359103	6.93358484737839e-08	31441419	31474518
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31467971	31503774	17	16	-0.3651	6.93358484737839e-08	31441419	31474518	4.21960296968848e-08	31476283	31897238
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	354	0.0059	4.21960296968848e-08	31476283	31897238	1.58436615341637e-179	32828797	32828797
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.6748	1.58436615341637e-179	32828797	32828797	3.03186178865852e-165	32832642	32832642
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1401	0.0277	3.03186178865852e-165	32832642	32832642	7.26446600702103e-12	36672710	36673853
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.7705	7.26446600702103e-12	36672710	36673853	1.03694793343360e-11	36684619	36686013
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	1974	0.0187	1.0369479334336e-11	36684619	36686013	5.14875510719505e-37	41562786	41574775
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42147225	48	46	-0.4634	5.14875510719505e-37	41562786	41574775	3.3434721551323e-38	41710400	42153189
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42148637	78653545	13676	13254	0.0143	3.3434721551323e-38	41710400	42153189	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	4316	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	108760	53090140	16197	15704	-0.0075	NA	NA	NA	4.10898187776448e-19	53090140	53090140
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53092949	53092949	1	0	NA	4.10898187776448e-19	53090140	53090140	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.587	NA	NA	NA	2.94316402221543e-18	53099601	53099601
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	54078204	378	363	-0.0192	2.94316402221543e-18	53099601	53099601	1.68364165870865e-13	54075623	54078204
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54082209	54087468	4	4	-0.9317	1.68364165870865e-13	54075623	54078204	3.92377590105374e-12	54087468	54089357
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54089357	76116026	6381	6185	-0.0136	3.92377590105374e-12	54087468	54089357	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3591120	1536	1478	0.0294	NA	NA	NA	9.4962450104467e-08	3588389	3591120
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.1189	9.4962450104467e-08	3588389	3591120	1.96279125215765e-08	3593646	3596968
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	11448975	3634	3497	0.0282	1.96279125215765e-08	3593646	3596968	1.26639895795877e-10	11448975	11448975
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.3083	1.26639895795877e-10	11448975	11448975	1.40648567037985e-11	11452390	11452390
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	56823430	14699	14237	0.018	1.40648567037985e-11	11452390	11452390	2.38752464590736e-13	56822197	56823430
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.6718	2.38752464590736e-13	56822197	56823430	5.71265759645657e-13	56840346	56844304
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3077	0.012	5.71265759645657e-13	56840346	56844304	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	564	-0.0256	NA	NA	NA	1.77948518327732e-32	1499421	1511632
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.9092	1.77948518327732e-32	1499421	1511632	2.31278925427501e-33	1531162	1544485
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	14456121	4459	4320	-0.0079	2.31278925427501e-33	1531162	1544485	1.22541674807164e-14	14453685	14456121
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14459507	14464735	4	4	-0.9772	1.22541674807164e-14	14453685	14456121	1.46195220555329e-13	14464735	14464735
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14466602	62419534	16520	15949	-0.0063	1.46195220555329e-13	14464735	14464735	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	40520958	10399	10060	-0.0023	NA	NA	NA	5.48377751405838e-18	40520958	40520958
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	40524769	40530580	5	5	-0.985	5.48377751405838e-18	40520958	40520958	2.81756881738922e-16	40530580	40532662
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	40532662	46922972	3037	2935	-0.007	2.81756881738922e-16	40530580	40532662	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2890	0.0082	NA	NA	NA	3.40106056431741e-13	22618049	22686731
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22718614	19	18	0.4854	3.40106056431741e-13	22618049	22686731	1.55889432287776e-15	22712211	22725305
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22720195	22720195	1	0	NA	1.55889432287776e-15	22712211	22725305	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	37683516	7761	7520	-0.0013	NA	NA	NA	6.11187998170196e-40	37681158	37689058
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37685496	37685496	1	0	NA	6.11187998170196e-40	37681158	37689058	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	15	-0.8443	NA	NA	NA	5.91380307773976e-39	37715370	37718669
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	41237593	1826	1773	0.0087	5.91380307773976e-39	37715370	37718669	6.56513238967207e-19	41226643	41246992
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41237731	41287060	11	11	0.7071	6.56513238967207e-19	41226643	41246992	2.32995153740835e-19	41279485	41289552
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41289552	49571068	3939	3822	-0.0089	2.32995153740835e-19	41279485	41289552	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	0.189	NA	NA	NA	4.13574403457982e-05	94062	98390
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-0.3918	4.13574403457982e-05	94062	98390	0.00027191418853071	103089	110583
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	124528	13	11	-0.0331	0.00027191418853071	103089	110583	6.44014281039502e-12	124528	127113
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-1.4838	6.44014281039502e-12	124528	127113	2.93867099164297e-35	129544	130528
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1431411	755	731	-0.0191	2.93867099164297e-35	129544	130528	1.99543548606589e-27	1431411	1431411
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-2.0262	1.99543548606589e-27	1431411	1431411	7.57573672629952e-25	1432953	1432953
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	584	-0.0247	7.57573672629952e-25	1432953	1432953	1.14169885364938e-09	2301365	2302065
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.8741	1.14169885364938e-09	2301365	2302065	2.02030138173501e-11	2304398	2306110
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	376	-0.0729	2.02030138173501e-11	2304398	2306110	0	2708291	2711273
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	63362704	19453	18776	0.9928	0	2708291	2711273	2.61615825104805e-16	63361143	63362704
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	63364917	63366019	2	2	-0.3245	2.61615825104805e-16	63361143	63362704	1.65280864716889e-10	63366019	63368676
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	63368676	153329988	25263	24383	0.9888	1.65280864716889e-10	63366019	63368676	9.34486280485422e-13	153327171	153342841
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153348763	8	8	0.2672	9.34486280485422e-13	153327171	153342841	1.51680606672973e-08	153335752	153352463
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153351248	154582414	408	400	0.9723	1.51680606672973e-08	153335752	153352463	0	154578922	154582414
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0113	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	124	-3.8508	NA	NA	NA	4.82694435331588e-24	3219200	3733715
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.0092	4.82694435331588e-24	3219200	3733715	6.60646568868011e-13	5531459	6692482
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	172	-3.5118	6.60646568868011e-13	5531459	6692482	1.58016377371866e-06	7011055	7204505
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	120	-2.6409	1.58016377371866e-06	7011055	7204505	1.37668066280811e-06	7350629	7598374
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7723783	82	79	-3.6879	1.37668066280811e-06	7350629	7598374	4.92635706910652e-06	7705876	7726921
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	18	-2.1823	4.92635706910652e-06	7705876	7726921	8.52872348595406e-07	7776265	7821554
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	9069601	329	320	-3.5761	8.52872348595406e-07	7776265	7821554	7.20068877409428e-06	8953090	9080779
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9070629	9160624	25	21	-4.7762	7.20068877409428e-06	8953090	9080779	9.767965916997e-05	9155283	10032083
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10515697	76	72	-3.7675	9.767965916997e-05	9155283	10032083	1.78166219757811e-29	10515697	10515697
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10631941	11	11	-0.4095	1.78166219757811e-29	10515697	10515697	7.52052989695054e-05	10622062	12514978
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	12682301	73	71	-2.236	7.52052989695054e-05	10622062	12514978	7.38852356061668e-06	12634446	12710000
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	23	-3.7385	7.38852356061668e-06	12634446	12710000	7.05545926906014e-08	12804329	12859309
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13040293	77	73	-2.212	7.05545926906014e-08	12804329	12859309	0.000238050067315110	13022741	13048283
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13062151	11	11	-3.7396	0.00023805006731511	13022741	13048283	7.38761276556146e-08	13061201	13077621
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13066543	13128515	24	21	-1.6685	7.38761276556146e-08	13061201	13077621	1.99935675324271e-08	13114169	13137597
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13256555	43	42	-3.3395	1.99935675324271e-08	13114169	13137597	0.0160354638985304	13146483	13405447
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	14342834	366	360	-3.7692	0.0160354638985304	13146483	13405447	2.01146019558137e-06	14244120	14413754
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508894	97	91	-3.1363	2.01146019558137e-06	14244120	14413754	1.55117592270233e-07	14500052	14536962
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	23	-1.5446	1.55117592270233e-07	14500052	14536962	1.24634966589194e-16	14561228	14587291
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15137457	112	108	-3.7257	1.24634966589194e-16	14561228	14587291	0.0120505597035660	14754064	15287893
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15139441	15587741	251	242	-3.3581	0.012050559703566	14754064	15287893	0.00724997413050845	15563346	15587741
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15614125	4	4	-5.3807	0.00724997413050845	15563346	15587741	0.00094852050294543	15614125	15639408
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15617621	15848986	41	40	-3.862	0.00094852050294543	15614125	15639408	0.000518934703180415	15801779	15867364
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15854496	15915466	9	9	-4.9557	0.000518934703180415	15801779	15867364	0.000160327589068738	15911389	15947948
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16035717	43	40	-3.1908	0.000160327589068738	15911389	15947948	0.000848465667236756	16007396	16037646
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16062175	10	8	-1.4976	0.000848465667236756	16007396	16037646	3.65634444579072e-06	16062175	16066990
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16062961	16217583	74	73	-3.4006	3.65634444579072e-06	16062175	16066990	0.183561007831749	16090556	16680383
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16218742	21036503	706	677	-3.7633	0.183561007831749	16090556	16680383	5.69367760917336e-07	21028489	21041164
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	6	-1.2508	5.69367760917336e-07	21028489	21041164	9.9651960577371e-08	21048365	21059229
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	22139807	261	248	-3.8244	9.9651960577371e-08	21048365	21059229	1.96404277162932e-06	22051284	22157319
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.9165	1.96404277162932e-06	22051284	22157319	1.81979166936583e-11	22177335	22181855
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	90	-4.1331	1.81979166936583e-11	22177335	22181855	3.35145733965918e-65	22926726	23283689
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26952278	35	32	-1.1358	3.35145733965918e-65	22926726	23283689	6.4688888393743e-07	26945893	26984336
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26957814	27000085	9	9	-2.9352	6.4688888393743e-07	26945893	26984336	4.63234879205587e-05	26990807	27011035
MSK_252152912352_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27003308	57440809	42	40	-0.9484	4.63234879205587e-05	26990807	27011035	NA	NA	NA
