Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27286	0.0061	NA	NA	NA	0	72537426	72537426
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.6866	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	94060783	6990	6837	-0.0022	0	72579311	72579311	1.69880947221711e-48	94060783	94060783
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-2.7048	1.69880947221711e-48	94060783	94060783	4.63343303989806e-48	94062928	94062928
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	103904723	3113	3038	-0.0013	4.63343303989806e-48	94062928	94062928	6.67392694098476e-31	103901454	103906464
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103962495	15	15	0.7947	6.67392694098476e-31	103901454	103906464	8.41326939138354e-30	103956767	104012520
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	110014625	1581	1554	1e-04	8.41326939138354e-30	103956767	104012520	2.64164928936729e-07	110008873	110014625
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110062339	9	7	-0.5873	2.64164928936729e-07	110008873	110014625	4.53484189067117e-07	110062339	110068307
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110065530	143702972	3912	3814	-0.008	4.53484189067117e-07	110062339	110068307	9.8980252561349e-16	143644120	143718575
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143706304	143820820	61	59	-0.2969	9.8980252561349e-16	143644120	143718575	1.44318075047e-16	143809389	143923947
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143822873	150819879	1873	1828	0.0086	1.44318075047e-16	143809389	143923947	4.24007959247943e-16	150819879	150823073
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	1.1507	4.24007959247943e-16	150819879	150823073	1.18825044785482e-07	150839754	150839754
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	6	2.8089	1.18825044785482e-07	150839754	150839754	1.34606594990899e-125	150851439	150851439
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	78	-0.0125	1.34606594990899e-125	150851439	150851439	2.2997946558525e-11	151022179	151026228
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.9476	2.2997946558525e-11	151022179	151026228	1.95255905727521e-11	151036435	151038091
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	167483267	6789	6639	-0.0053	1.95255905727521e-11	151036435	151038091	2.5199605549764e-08	167477428	167495719
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5757	2.5199605549764e-08	167477428	167495719	7.13784681761459e-08	167506259	167525669
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	7038	-0.0052	7.13784681761459e-08	167506259	167525669	8.275645489241e-10	185979586	185979586
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.2814	8.275645489241e-10	185979586	185979586	5.21794191605344e-10	185988138	185988138
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200613454	4141	4059	0.0056	5.21794191605344e-10	185988138	185988138	4.62695287169577e-10	200589108	200642828
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200803726	37	37	-0.2934	4.62695287169577e-10	200589108	200642828	1.28806123430125e-09	200689399	200816497
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	227875096	9921	9710	-0.0012	1.28806123430125e-09	200689399	200816497	1.05969734713133e-08	227872808	227875096
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	3	-0.9785	1.05969734713133e-08	227872808	227875096	1.23024614568813e-08	227882805	227889619
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246751473	7351	7202	-0.0048	1.23024614568813e-08	227882805	227889619	1.77267808737276e-12	246696388	246755225
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246753652	246862029	31	31	0.3515	1.77267808737276e-12	246696388	246755225	1.46911937007965e-09	246855902	246907655
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	98	0.0284	1.46911937007965e-09	246855902	246907655	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	37789939	12904	12606	-0.003	NA	NA	NA	2.60001320065245e-50	37787637	37800512
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	27	-0.7565	2.60001320065245e-50	37787637	37800512	1.26747376083285e-50	37848754	37858379
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5680	3e-04	1.26747376083285e-50	37848754	37858379	1.43413647455434e-315	52600588	52600588
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-4.3424	1.43413647455434e-315	52600588	52600588	0	52635695	52635695
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	87149187	11156	10919	-0.0022	0	52635695	52635695	5.35647842335882e-13	86984833	87256833
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87245647	87721951	15	15	-0.5181	5.35647842335882e-13	86984833	87256833	2.1057421948765e-16	87661927	87721951
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87926461	88038874	6	6	0.4392	2.1057421948765e-16	87661927	87721951	6.60733976226863e-08	88015932	88097269
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88078497	242689978	47913	46860	-0.0053	6.60733976226863e-08	88015932	88097269	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37953375	12681	12374	-0.0057	NA	NA	NA	7.16558021485763e-11	37951628	37954819
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.7619	7.16558021485763e-11	37951628	37954819	2.57941485314875e-10	37960019	37963014
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	164005577	40804	39906	-0.0041	2.57941485314875e-10	37960019	37963014	3.91404461723884e-58	164005577	164005577
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.8874	3.91404461723884e-58	164005577	164005577	3.79371448332544e-62	164027724	164027724
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-0.4094	3.79371448332544e-62	164027724	164027724	3.23333043314960e-10	164093750	164126256
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	179595686	4844	4732	-0.0048	3.2333304331496e-10	164093750	164126256	1.41034811109997e-14	179588115	179605848
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	179600301	179639676	17	17	0.515	1.41034811109997e-14	179588115	179605848	1.24881232211242e-14	179632135	179645293
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	179641521	196822133	6271	6139	-0.004	1.24881232211242e-14	179632135	179645293	2.13772111374030e-22	196809098	196907040
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196952514	28	28	-0.5017	2.1377211137403e-22	196809098	196907040	1.53175827989954e-19	196943380	196964180
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196957322	199329592	956	933	-0.0039	1.53175827989954e-19	196943380	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	173069405	49564	48506	-0.0036	NA	NA	NA	8.03343154248963e-33	173067530	173069405
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173071188	173099052	15	15	-0.8243	8.03343154248963e-33	173067530	173069405	1.34414198935689e-34	173099052	173100225
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173100225	173224400	61	58	0.0273	1.34414198935689e-34	173099052	173100225	1.96246900046270e-12	173224400	173224400
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.2362	1.9624690004627e-12	173224400	173224400	1.17361279693440e-11	173228860	173229983
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	187	-0.0116	1.1736127969344e-11	173228860	173229983	2.75865728318753e-19	173660684	173660684
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.6658	2.75865728318753e-19	173660684	173660684	1.14643776186578e-18	173666072	173666072
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3692	-0.0046	1.14643776186578e-18	173666072	173666072	2.74156049088918e-69	186676034	186676034
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.1548	2.74156049088918e-69	186676034	186676034	7.35495200291161e-65	186680176	186680176
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1509	-0.0056	7.35495200291161e-65	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3897	-0.0015	NA	NA	NA	2.10251500978846e-19	12857302	12857302
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-1.7252	2.10251500978846e-19	12857302	12857302	6.37079525461347e-19	12873052	12873052
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	180342860	49669	48581	-0.0042	6.37079525461347e-19	12873052	12873052	1.14689381914026e-08	180192214	180346557
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.5984	1.14689381914026e-08	180192214	180346557	8.3964602799257e-09	180355807	180364670
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	110	-0.0249	8.3964602799257e-09	180355807	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29973024	10591	10368	6e-04	NA	NA	NA	7.1592018313385e-16	29972382	29973024
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29980445	30010234	11	11	-0.6666	7.1592018313385e-16	29972382	29973024	9.57318914005593e-14	30010234	30025480
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31385778	580	565	-0.002	9.57318914005593e-14	30010234	30025480	4.16299443895308e-11	31382291	31385778
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.8101	4.16299443895308e-11	31382291	31385778	9.82686351769317e-15	31418006	31425113
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	474	0.0416	9.82686351769317e-15	31418006	31425113	2.58360358184956e-23	32548736	32593151
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32634977	18	17	0.7064	2.58360358184956e-23	32548736	32593151	2.67095139161701e-27	32628420	32650672
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	103841482	21504	21007	-0.0031	2.67095139161701e-27	32628420	32650672	6.0998744238563e-112	103841482	103841482
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-2.9274	6.0998744238563e-112	103841482	103841482	1.76346823277004e-114	103868154	103868154
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20685	-0.0069	1.76346823277004e-114	103868154	103868154	1.33105913623494e-159	165643653	165643653
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-3.4508	1.33105913623494e-159	165643653	165643653	5.61494345190641e-146	165650610	165650610
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1769	-0.0177	5.61494345190641e-146	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	253	0.0155	NA	NA	NA	4.36575829288887e-07	1033418	1036135
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1038517	2	2	-1.1024	4.36575829288887e-07	1033418	1036135	7.42956395285873e-08	1038517	1047636
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	3331356	882	860	0.027	7.42956395285873e-08	1038517	1047636	1.72186582579178e-125	3330087	3332984
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3332984	3472782	65	63	-0.7908	1.72186582579178e-125	3330087	3332984	1.46989530385113e-132	3469781	3474241
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	3474241	16135701	4181	4088	6e-04	1.46989530385113e-132	3469781	3474241	1.19169985272214e-146	16135701	16135701
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.6236	1.19169985272214e-146	16135701	16135701	6.88364443180595e-142	16140018	16140018
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	64523575	14172	13855	-0.0056	6.88364443180595e-142	16140018	16140018	4.38944190260778e-09	64523575	64523575
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.2215	4.38944190260778e-09	64523575	64523575	6.5953066698197e-09	64532949	64534167
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	109967918	15703	15364	0.0051	6.5953066698197e-09	64532949	64534167	8.2805093042311e-167	109967918	109967918
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-5.084	8.2805093042311e-167	109967918	109967918	4.22725001013231e-170	109974402	109974402
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	125831554	7169	7005	-0.0039	4.22725001013231e-170	109974402	109974402	8.86839228330137e-95	125831554	125831554
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.1064	8.86839228330137e-95	125831554	125831554	3.77615211652505e-93	125837524	125837524
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	131424513	2655	2590	-0.0017	3.77615211652505e-93	125837524	125837524	4.36265139180815e-08	131422605	131424513
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131426580	131429932	3	3	-0.9442	4.36265139180815e-08	131422605	131424513	2.45033710643804e-08	131429932	131431668
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131431668	141690753	4834	4732	-0.0067	2.45033710643804e-08	131429932	131431668	1.14183557625914e-22	141689547	141690753
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.8226	1.14183557625914e-22	141689547	141690753	8.25879752137796e-20	141714168	141720324
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	8.25879752137796e-20	141714168	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2457	7e-04	NA	NA	NA	7.52931832702075e-18	147702365	147702365
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.7469	7.52931832702075e-18	147702365	147702365	1.15169034687181e-17	147707161	147707161
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	151728811	1630	1583	-0.0114	1.15169034687181e-17	147707161	147707161	8.6873036130458e-12	151724590	151730250
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.7245	8.6873036130458e-12	151724590	151730250	5.03884661486598e-12	151740878	151747905
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	158821263	2600	2527	-0.0048	5.03884661486598e-12	151740878	151747905	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	25120552	8159	7991	-0.0043	NA	NA	NA	4.08007434643167e-17	25120552	25120552
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	4.08007434643167e-17	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.6463	NA	NA	NA	3.9743615780475e-17	25125700	25125700
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	144968840	35951	35184	-9e-04	3.9743615780475e-17	25125700	25125700	3.33220502904124e-20	144968840	144968840
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.7803	3.33220502904124e-20	144968840	144968840	5.22535500985558e-16	144970777	144970777
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	440	0.0076	5.22535500985558e-16	144970777	144970777	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5344	0.0024	NA	NA	NA	4.71109553970195e-23	15802255	15802255
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-1.8699	4.71109553970195e-23	15802255	15802255	7.65046011110992e-22	15807123	15807123
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	137352394	31379	30693	-0.0062	7.65046011110992e-22	15807123	15807123	4.52875897185199e-41	137352394	137352394
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.5221	4.52875897185199e-41	137352394	137352394	6.74190782908726e-32	137356880	137356880
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1081	0.0126	6.74190782908726e-32	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	24089	-0.0067	NA	NA	NA	1.69052307294788e-71	77917893	77917893
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.3293	1.69052307294788e-71	77917893	77917893	1.21055336995309e-69	77928669	77928669
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	134739406	20003	19562	-0.0035	1.21055336995309e-69	77928669	77928669	4.97894969649472e-13	134739406	134739406
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	-1.4803	4.97894969649472e-13	134739406	134739406	4.63939181309504e-08	134743423	134746574
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135085997	155	154	0.0027	4.63939181309504e-08	134743423	134746574	5.72786311340302e-40	135082051	135104029
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135102317	135227463	44	43	-0.7814	5.72786311340302e-40	135082051	135104029	2.95543757853877e-12	135217656	135227463
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135229796	135285645	10	10	-0.0177	2.95543757853877e-12	135217656	135227463	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1735	-0.0062	NA	NA	NA	2.66494855191975e-216	4923300	4923300
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.0366	2.66494855191975e-216	4923300	4923300	8.28569536509083e-219	4932214	4932214
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	351	0.0076	8.28569536509083e-219	4932214	4932214	3.55565554229576e-15	5734978	5741031
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	14	-0.6357	3.55565554229576e-15	5734978	5741031	1.49940729177950e-17	5765438	5775970
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55112618	14750	14402	-0.0034	1.4994072917795e-17	5765438	5775970	2.28366236849310e-11	55073386	55127355
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55114405	55217189	42	41	-0.3046	2.2836623684931e-11	55073386	55127355	2.41800951590693e-11	55202450	55238200
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	27743	-0.0025	2.41800951590693e-11	55202450	55238200	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3650	0.0045	NA	NA	NA	6.4942571032609e-35	9516067	9543817
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9590351	12	12	0.9805	6.4942571032609e-35	9516067	9543817	3.29529868426109e-30	9578398	9599999
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9599999	10462211	330	323	-0.0203	3.29529868426109e-30	9578398	9599999	4.5962721295103e-05	10446776	10466791
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10464018	10485848	10	10	0.4155	4.5962721295103e-05	10446776	10466791	2.19015659140394e-05	10480460	10534393
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11116883	235	225	-0.043	2.19015659140394e-05	10480460	10534393	3.05414618580538e-101	11116883	11116883
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-2.8973	3.05414618580538e-101	11116883	11116883	1.11146879621677e-163	11130871	11130871
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	132289090	40826	39978	7e-04	1.11146879621677e-163	11130871	11130871	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7190	-0.0049	NA	NA	NA	2.57506013749077e-47	37953582	37953582
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.7284	2.57506013749077e-47	37953582	37953582	5.257009663935e-49	37957844	37957844
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	113788788	24152	23633	-0.0036	5.257009663935e-49	37957844	37957844	8.15961941757475e-13	113788788	113788788
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-1.4368	8.15961941757475e-13	113788788	113788788	2.45306234219489e-13	113792974	113792974
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	148	-0.0029	2.45306234219489e-13	113792974	113792974	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19441654	37	36	0.06	NA	NA	NA	0.00669653894536489	19407199	19461755
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	19484013	19	19	0.3569	0.00669653894536489	19407199	19461755	4.70138305841698e-07	19469681	19538610
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19489920	34674458	5694	5562	0.0075	4.70138305841698e-07	19469681	19538610	1.22899816228725e-12	34666996	34674458
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1616	1.22899816228725e-12	34666996	34674458	2.31891160666279e-12	34683810	34685308
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	79174722	16588	16213	-0.004	2.31891160666279e-12	34683810	34685308	7.83885547433596e-86	79174722	79174722
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79176037	1	0	NA	7.83885547433596e-86	79174722	79174722	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79177462	79183154	3	3	-2.9914	NA	NA	NA	6.35121458970175e-85	79183154	79183154
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105428694	9259	9075	-0.0025	6.35121458970175e-85	79183154	79183154	5.65525589018188e-08	105425440	105432521
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105432521	105461607	4	4	-0.8271	5.65525589018188e-08	105425440	105432521	6.57424736510692e-05	105460029	105469325
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105466912	105923686	115	110	-0.0212	6.57424736510692e-05	105460029	105469325	3.35785239029831e-05	105901394	105964382
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106002179	20	19	0.3871	3.35785239029831e-05	105901394	105964382	0.000237663073149508	105968122	106037440
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	138	0.0623	0.000237663073149508	105968122	106037440	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0953	NA	NA	NA	0.00281268833243069	18432558	18831600
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20316992	154	151	-0.3396	0.00281268833243069	18432558	18831600	3.29001902631062e-52	20065525	20366670
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20321772	74669752	21552	21109	-0.0067	3.29001902631062e-52	20065525	20366670	3.09468612688165e-19	74669752	74669752
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.2483	3.09468612688165e-19	74669752	74669752	6.11357426383926e-20	74680439	74680439
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	85614382	4033	3968	-0.0036	6.11357426383926e-20	74680439	74680439	6.48521641294434e-20	85600911	85614382
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	85634537	85671158	8	8	-0.8883	6.48521641294434e-20	85600911	85614382	7.15415942408163e-20	85671158	85678387
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	85678387	99632987	5292	5180	-0.0121	7.15415942408163e-20	85671158	85678387	2.61470792539481e-14	99632987	99632987
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.484	2.61470792539481e-14	99632987	99632987	8.92641711067391e-15	99635701	99635701
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	264	0.0067	8.92641711067391e-15	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	54348362	13695	13392	0.005	NA	NA	NA	5.0982556737704e-09	54339225	54362111
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	11	-0.5289	5.0982556737704e-09	54339225	54362111	3.03436349547908e-08	54366535	54405667
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	57203733	1203	1176	-0.0129	3.03436349547908e-08	54366535	54405667	3.56255382657818e-08	57201427	57203733
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57208375	3	3	0.9643	3.56255382657818e-08	57201427	57203733	1.48197297523737e-08	57208375	57211203
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57211203	75093957	5611	5491	0.0021	1.48197297523737e-08	57208375	57211203	7.2675845054332e-14	75093957	75093957
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.2108	7.2675845054332e-14	75093957	75093957	1.18401177446612e-14	75100865	75100865
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	599	-0.0261	1.18401177446612e-14	75100865	75100865	1.10875343925263e-20	76923844	76929598
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8794	1.10875343925263e-20	76923844	76929598	6.63930300471611e-18	76938723	76942679
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4416	-0.0041	6.63930300471611e-18	76938723	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	403	0.0179	NA	NA	NA	2.26092176946281e-10	1028979	1028979
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.3606	2.26092176946281e-10	1028979	1028979	1.86941933398062e-08	1030766	1030766
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1903358	434	427	0.0271	1.86941933398062e-08	1030766	1030766	3.94985029686717e-06	1899977	1903358
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1909874	6	5	0.75	3.94985029686717e-06	1899977	1903358	4.06119607060052e-08	1909874	1911059
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1910544	31443186	11175	10943	0.0085	4.06119607060052e-08	1909874	1911059	2.98962659823563e-07	31425181	31468896
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31447686	31889566	23	22	-0.3277	2.98962659823563e-07	31425181	31468896	2.03330264761152e-06	31479804	31913901
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31891535	32828797	364	355	-0.0108	2.03330264761152e-06	31479804	31913901	2.76128686215195e-162	32828797	32828797
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.9536	2.76128686215195e-162	32828797	32828797	1.13533913684134e-150	32832642	32832642
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36672710	1447	1414	0.0154	1.13533913684134e-150	32832642	32832642	1.60746084513394e-11	36665978	36675987
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36684619	7	7	0.768	1.60746084513394e-11	36665978	36675987	1.37433400966405e-11	36682031	36687917
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15397	0.0096	1.37433400966405e-11	36682031	36687917	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22455	-0.0075	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	479	0.0348	NA	NA	NA	8.28163695160582e-19	1398325	1398325
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.9968	8.28163695160582e-19	1398325	1398325	1.06877097289277e-17	1400840	1400840
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3591120	1042	1014	0.0171	1.06877097289277e-17	1400840	1400840	2.73122686506088e-08	3588389	3591120
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3592564	3593646	2	2	-1.3542	2.73122686506088e-08	3588389	3591120	3.88378407448462e-10	3593646	3593646
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3596968	9146708	2530	2478	0.0385	3.88378407448462e-10	3593646	3593646	9.93395350945598e-21	9146708	9146708
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9147742	9150878	2	2	2.0043	9.93395350945598e-21	9146708	9146708	6.67215221419036e-23	9150878	9150878
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9152145	63788698	18989	18533	0.0139	6.67215221419036e-23	9150878	9150878	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	569	-0.0166	NA	NA	NA	3.75450752063031e-26	1499421	1515948
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.948	3.75450752063031e-26	1499421	1515948	7.7554598498429e-28	1531162	1544485
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20512	-0.0016	7.7554598498429e-28	1531162	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13137	-0.0021	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2924	0.0146	NA	NA	NA	8.98210718983322e-11	22642519	22682428
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22712211	15	15	0.5248	8.98210718983322e-11	22642519	22682428	2.90402759074444e-12	22706166	22718614
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22713972	35472378	6554	6432	0.0046	2.90402759074444e-12	22706166	22718614	9.32387582076323e-75	35472378	35472378
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.4303	9.32387582076323e-75	35472378	35472378	9.64642301623673e-67	35476942	35476942
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6865	0.0097	9.64642301623673e-67	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.354	NA	NA	NA	6.23755820451964e-10	4893	95819
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-0.5149	6.23755820451964e-10	4893	95819	6.23250474800354e-09	106242	110583
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	124528	13	13	-0.0129	6.23250474800354e-09	106242	110583	7.17224112220849e-15	124528	127113
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-1.4709	7.17224112220849e-15	124528	127113	3.49729958648986e-26	129544	130528
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1427392	753	737	-0.0474	3.49729958648986e-26	129544	130528	5.85781764610748e-18	1427392	1431240
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.3743	5.85781764610748e-18	1427392	1431240	3.04210623684958e-17	1432891	1432953
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1894973	349	340	-0.0454	3.04210623684958e-17	1432891	1432953	1.13895089822069e-05	1891108	1898078
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1895343	1907678	5	5	-0.724	1.13895089822069e-05	1891108	1898078	2.17504950253642e-06	1901223	1910354
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1907912	2708291	648	633	-0.0538	2.17504950253642e-06	1901223	1910354	0	2708113	2711273
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	44113	0.975	0	2708113	2711273	0	154578922	154586690
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	198	-0.0331	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	119	-3.5567	NA	NA	NA	2.89511258656472e-21	3034907	3733715
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	17	-0.9449	2.89511258656472e-21	3034907	3733715	1.36413330835582e-09	5422507	6696721
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	169	-3.0665	1.36413330835582e-09	5422507	6696721	7.54896128261399e-06	7011055	7210986
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	127	-2.2666	7.54896128261399e-06	7011055	7210986	0.126418383598251	7250951	7626352
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7653082	31	31	-2.9446	0.126418383598251	7250951	7626352	0.103144309709830	7578636	7686527
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	42	-3.6727	0.10314430970983	7578636	7686527	2.22531153453686e-06	7707621	7755522
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7997485	77	75	-2.5954	2.22531153453686e-06	7707621	7755522	1.67494934323002e-08	7942730	8047462
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8219845	54	53	-3.6746	1.67494934323002e-08	7942730	8047462	0.00215196276616815	8161536	8414160
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8221620	8956787	205	199	-3.0664	0.00215196276616815	8161536	8414160	0.00263012350952112	8823361	9080779
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9160624	36	35	-3.7849	0.00263012350952112	8823361	9080779	0.000153934366811717	9126602	9186935
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10032083	15	14	-2.6334	0.000153934366811717	9126602	9186935	0.000611763550280148	10012024	10070462
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10049346	10515697	61	60	-3.7525	0.000611763550280148	10012024	10070462	2.55802760784692e-16	10511255	10617908
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12682301	84	82	-1.885	2.55802760784692e-16	10511255	10617908	0.000152048526200656	12625208	12721434
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-3.4462	0.000152048526200656	12625208	12721434	1.74726315849512e-07	12796639	12857197
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13133803	114	112	-1.8785	1.74726315849512e-07	12796639	12857197	2.31775826064934e-05	13080405	13155705
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13136828	13272362	47	44	-2.8332	2.31775826064934e-05	13080405	13155705	0.00400961654880868	13213249	13372112
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13279098	13566041	142	136	-3.5014	0.00400961654880868	13213249	13372112	0.00101344438366998	13524481	13584982
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13566905	13705594	28	27	-2.6283	0.00101344438366998	13524481	13584982	6.39672778273627e-05	13670791	13779192
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14352278	193	187	-3.5435	6.39672778273627e-05	13670791	13779192	1.67826580184587e-07	14318786	14404284
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508021	93	91	-2.7825	1.67826580184587e-07	14318786	14404284	1.20529309166840e-08	14500052	14530134
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.2052930916684e-08	14500052	14530134	NA	NA	NA
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.1638	NA	NA	NA	7.86970851681854e-09	14569287	14579298
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	5	-4.225	7.86970851681854e-09	14569287	14579298	2.60953387045196e-06	14598838	14605090
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14700040	17	17	-1.9686	2.60953387045196e-06	14598838	14605090	3.90423065138674e-06	14695441	14708015
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	15139441	90	86	-3.4226	3.90423065138674e-06	14695441	14708015	0.000261602304362950	15018205	15179500
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15299931	91	91	-2.6913	0.00026160230436295	15018205	15179500	1.27039686123405e-08	15279629	15312994
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15408015	69	66	-3.7423	1.27039686123405e-08	15279629	15312994	1.56742637847620e-05	15388044	15458280
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	16387273	306	298	-2.9472	1.5674263784762e-05	15388044	15458280	2.29688497069622e-05	16268810	16426834
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16575926	26	26	-4.1447	2.29688497069622e-05	16268810	16426834	7.67627241722262e-05	16548823	16672333
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16580693	17893954	237	233	-3.0874	7.67627241722262e-05	16548823	16672333	0.00080633519104166	17544651	19553092
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17901399	21036411	407	396	-3.4743	0.00080633519104166	17544651	19553092	7.79365079183217e-06	21025500	21036503
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.3199	7.79365079183217e-06	21025500	21036503	1.91245855913225e-06	21047798	21059229
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21952551	218	211	-3.398	1.91245855913225e-06	21047798	21059229	5.62384896867343e-06	21906618	21953893
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21953893	22006627	19	19	-4.6113	5.62384896867343e-06	21906618	21953893	0.000127018316784562	22005824	22033016
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22013074	22139807	24	22	-3.4546	0.000127018316784562	22005824	22033016	0.00183743853315281	22043133	22165808
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.9611	0.00183743853315281	22043133	22165808	1.14939861565547e-09	22175425	22179794
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	89	-3.9239	1.14939861565547e-09	22175425	22179794	4.79993117903458e-71	22926726	25737663
MSK_252152912353_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	85	-1.2001	4.79993117903458e-71	22926726	25737663	NA	NA	NA
