Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	26676	9e-04	NA	NA	NA	0	72537426	72537426
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	12	-3.3754	0	72537426	72537426	0	72574479	72574479
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	146297175	16262	15552	-0.0014	0	72574479	72574479	1.23334016024557e-14	146274661	147315217
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147644831	38	36	-0.3701	1.23334016024557e-14	146274661	147315217	1.49498553950247e-14	147471665	148088434
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147847659	150819879	1257	1189	0.0024	1.49498553950247e-14	147471665	148088434	3.55021504536845e-120	150819879	150836481
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	2.056	3.55021504536845e-120	150819879	150836481	4.95777270472379e-57	150846148	150851439
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	73	-0.0272	4.95777270472379e-57	150846148	150851439	6.43993290609869e-14	151024118	151026228
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.9992	6.43993290609869e-14	151024118	151026228	1.55754676511393e-12	151036435	151038091
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2574	-8e-04	1.55754676511393e-12	151036435	151038091	3.15107810786791e-40	157133150	157133150
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.4958	3.15107810786791e-40	157133150	157133150	1.61896354586222e-38	157136342	157136342
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	247186514	32910	31489	-0.0021	1.61896354586222e-38	157136342	157136342	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10416	-0.003	NA	NA	NA	2.72286046467904e-32	33076512	33076512
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-2.2614	2.72286046467904e-32	33076512	33076512	1.13494822725303e-32	33080437	33080437
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34554208	647	617	0.0187	1.13494822725303e-32	33080437	33080437	9.98370071537455e-17	34543992	34556434
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34556434	34597294	18	18	-0.531	9.98370071537455e-17	34543992	34556434	1.42649859938274e-14	34595734	34608979
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34599239	34599239	1	0	NA	1.42649859938274e-14	34595734	34608979	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34602813	35821494	480	458	0.0038	NA	NA	NA	1.38247550420977e-10	35821494	35821494
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.3687	1.38247550420977e-10	35821494	35821494	1.31291537258406e-11	35844884	35844884
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37810001	883	849	-0.032	1.31291537258406e-11	35844884	35844884	5.84420719279118e-42	37803744	37815049
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.8544	5.84420719279118e-42	37803744	37815049	1.29938246474651e-51	37848754	37858379
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	89635398	17391	16593	-5e-04	1.29938246474651e-51	37848754	37858379	1.17276180241135e-12	89400088	89669803
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89649638	89876334	29	27	0.3899	1.17276180241135e-12	89400088	89669803	2.39442062002554e-12	89871269	89902365
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89877995	155403613	17242	16474	-0.0019	2.39442062002554e-12	89871269	89902365	4.83789275407803e-10	155401955	155403613
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	155410177	155412712	3	3	-1.0691	4.83789275407803e-10	155401955	155403613	7.77784339792757e-10	155412712	155415544
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	155415544	242677220	30228	28902	-6e-04	7.77784339792757e-10	155412712	155415544	5.91172811949902e-06	242488979	242677220
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242682950	242689978	3	3	-0.3478	5.91172811949902e-06	242488979	242677220	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460892	16218	15487	-0.0064	NA	NA	NA	8.3084701675198e-09	47460892	47460892
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.2097	8.3084701675198e-09	47460892	47460892	1.29551063044191e-08	47466921	47469018
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	101659041	16556	15842	7e-04	1.29551063044191e-08	47466921	47469018	5.01032285339223e-09	101657801	101659041
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101662581	101667772	4	4	-0.8726	5.01032285339223e-09	101657801	101659041	1.56307002756177e-08	101667772	101683079
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	101683079	133189686	10929	10483	-0.0053	1.56307002756177e-08	101667772	101683079	9.530944329814e-17	133189686	133189686
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.6788	9.530944329814e-17	133189686	133189686	5.78065197341294e-18	133194685	133194685
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	5.78065197341294e-18	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	164005577	9779	9386	-0.0027	NA	NA	NA	4.34977086980905e-45	164005577	164005577
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.6652	4.34977086980905e-45	164005577	164005577	1.77142106573977e-09	164012645	164036648
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	19	0.4925	1.77142106573977e-09	164012645	164036648	3.52390168157483e-14	164100804	164123806
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	194354505	10129	9718	-0.0015	3.52390168157483e-14	164100804	164123806	5.25344971287739e-283	194354505	194354505
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.8394	5.25344971287739e-283	194354505	194354505	8.75845676378388e-291	194366950	194366950
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196822133	996	960	-0.0086	8.75845676378388e-291	194366950	194366950	1.00024568472879e-63	196810503	196904349
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196958467	30	28	-0.842	1.00024568472879e-63	196810503	196904349	1.51142677723662e-53	196952514	196964180
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196961238	196961238	1	0	NA	1.51142677723662e-53	196952514	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	910	-0.0088	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	69099817	18439	17625	2e-04	NA	NA	NA	9.16823747244538e-17	69097336	69099817
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69109815	69165814	8	7	-0.8795	9.16823747244538e-17	69097336	69099817	1.39026717378506e-16	69165814	69643272
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	190710812	36604	35067	0.001	1.39026717378506e-16	69165814	69643272	1.63566629336999e-17	190669216	190756763
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190921041	65	63	-0.3005	1.63566629336999e-17	190669216	190756763	7.5172804127892e-08	190891595	190940021
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191041481	38	35	0.0307	7.5172804127892e-08	190891595	190940021	0.000802973345975504	191021815	191117375
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191111451	191153613	7	7	-0.3915	0.000802973345975504	191021815	191117375	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	7218599	2172	2069	-0.0021	NA	NA	NA	1.72551843581001e-15	7218599	7218599
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7222660	7222660	1	0	NA	1.72551843581001e-15	7218599	7218599	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7232549	7246064	4	4	-1.0979	NA	NA	NA	2.98080429531807e-15	7246064	7246064
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	7253683	32144814	6555	6255	-0.0038	2.98080429531807e-15	7246064	7246064	5.70173460820566e-67	32143140	32146491
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32146491	32203336	30	30	0.8208	5.70173460820566e-67	32143140	32146491	1.17627872758878e-65	32202136	32206845
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32206845	140200229	31316	29925	-0.0035	1.17627872758878e-65	32202136	32206845	1.36479506891761e-17	140198797	140200229
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.7976	1.36479506891761e-17	140198797	140200229	1.32600447188319e-17	140216524	140221835
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	180194323	13558	12993	-0.0014	1.32600447188319e-17	140216524	140221835	7.67954442840237e-13	180194323	180194323
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180346557	3	3	-1.189	7.67954442840237e-13	180194323	180194323	0.00116285840070801	180346557	180351118
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	-3.2441	0.00116285840070801	180346557	180351118	3.27611912246668e-110	180358977	180358977
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	108	-0.0323	3.27611912246668e-110	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29651892	10467	10046	-0.0024	NA	NA	NA	3.43906361847523e-08	29650667	29651892
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29653815	29659892	4	4	-0.8219	3.43906361847523e-08	29650667	29651892	1.24152209721495e-07	29659892	29663246
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29661580	31383925	710	666	-0.0042	1.24152209721495e-07	29659892	29663246	6.86911290270149e-21	31382291	31383925
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31385778	31385778	1	0	NA	6.86911290270149e-21	31382291	31383925	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-1.0953	NA	NA	NA	2.20733892715521e-24	31418006	31418006
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32548736	488	475	0.0333	2.20733892715521e-24	31418006	31418006	1.09684639638785e-69	32548736	32563252
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	8	-1.737	1.09684639638785e-69	32548736	32563252	4.19266593011987e-72	32590568	32595402
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	55931287	8979	8572	-0.0018	4.19266593011987e-72	32590568	32595402	9.76169028521358e-16	55927729	55931287
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55934816	55950498	5	5	-0.893	9.76169028521358e-16	55927729	55931287	2.76169532606519e-12	55950498	55954697
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	55954697	77490500	5474	5242	0.0058	2.76169532606519e-12	55950498	55954697	1.30232433241518e-74	77490500	77490500
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-2.7924	1.30232433241518e-74	77490500	77490500	5.1086864791577e-75	77509983	77509983
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	124464088	13686	13134	-0.0015	5.1086864791577e-75	77509983	77509983	2.71434678071101e-10	124458521	124469271
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	124466262	124509956	17	16	0.4608	2.71434678071101e-10	124458521	124469271	1.82174002629682e-10	124503875	124521619
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	124513895	165643653	14461	13860	-0.0046	1.82174002629682e-10	124503875	124521619	2.93526713061348e-97	165643653	165643653
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-2.7499	2.93526713061348e-97	165643653	165643653	4.86528332834113e-91	165650610	165650610
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1738	-0.0188	4.86528332834113e-91	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	133433384	46095	44031	0.0014	NA	NA	NA	4.39875248679439e-13	133426996	133437464
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.748	4.39875248679439e-13	133426996	133437464	7.73436293366343e-15	133444486	133453811
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3527	-0.0041	7.73436293366343e-15	133444486	133453811	1.75644104095612e-09	141406414	141426846
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141435643	12	11	0.5154	1.75644104095612e-09	141406414	141426846	4.84562669764766e-08	141425306	141442231
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	158821263	6880	6613	-0.0029	4.84562669764766e-08	141425306	141442231	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0281	NA	NA	NA	2.32363895037114e-30	581533	581533
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.2937	2.32363895037114e-30	581533	581533	3.77229227342292e-32	588865	588865
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2185528	602	574	0.0075	3.77229227342292e-32	588865	588865	3.82315251109777e-10	2163225	2209252
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2190452	2251011	18	18	-0.4377	3.82315251109777e-10	2163225	2209252	6.7675892164574e-12	2229727	2269984
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	7697025	1656	1588	0.0013	6.7675892164574e-12	2229727	2269984	2.77061672095541e-11	7327293	7709141
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7709141	7824059	4	4	-0.8997	2.77061672095541e-11	7327293	7709141	2.83293122452534e-09	7790934	8137794
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5523	-0.0012	2.83293122452534e-09	7790934	8137794	1.33641834736473e-20	25120552	25120552
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	1.33641834736473e-20	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.859	NA	NA	NA	1.59248917308737e-21	25125700	25125700
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	87255865	17658	16927	-2e-04	1.59248917308737e-21	25125700	25125700	1.05647188687306e-203	87255865	87255865
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-4.5918	1.05647188687306e-203	87255865	87255865	2.47982179085013e-202	87262662	87262662
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	144968840	18290	17550	-9e-04	2.47982179085013e-202	87262662	87262662	5.25828044926211e-09	144968042	144968840
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.2377	5.25828044926211e-09	144968042	144968840	1.38802125249244e-08	144970777	144972090
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	431	0.005	1.38802125249244e-08	144970777	144972090	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	43626920	12735	12168	0.0033	NA	NA	NA	1.77636964006305e-07	39088753	43644906
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43644906	67923904	16	15	-0.4043	1.77636964006305e-07	39088753	43644906	1.75544804215677e-08	67917803	70212537
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67927172	67927172	1	0	NA	1.75544804215677e-08	67917803	70212537	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	309	-0.0223	NA	NA	NA	8.12208595585037e-30	70926188	70926188
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.8833	8.12208595585037e-30	70926188	70926188	1.20431912917032e-22	70930528	70930528
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14797	-0.0102	1.20431912917032e-22	70930528	70930528	1.48317930249709e-08	116122595	116124007
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.2074	1.48317930249709e-08	116122595	116124007	6.67826000465344e-08	116130333	116132839
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	140145683	9400	9001	-0.0048	6.67826000465344e-08	116130333	116132839	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	23679640	8415	8060	-0.0094	NA	NA	NA	7.835603110973e-12	23676317	23679640
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	23682414	23693410	6	6	-0.8087	7.835603110973e-12	23676317	23679640	3.3970306680707e-12	23693410	23697775
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	23697775	27038538	1308	1243	3e-04	3.3970306680707e-12	23693410	23697775	9.21964917100085e-15	27038538	27038538
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-1.5481	9.21964917100085e-15	27038538	27038538	1.86120731935595e-14	27041812	27041812
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14211	-0.0054	1.86120731935595e-14	27041812	27041812	7.3551612186021e-20	77917893	77917893
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-1.4705	7.3551612186021e-20	77917893	77917893	7.22162230923572e-20	77928738	77928738
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	134739406	20002	19085	-0.0055	7.22162230923572e-20	77928738	77928738	1.28324952599512e-08	134736198	134739406
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	-1.2199	1.28324952599512e-08	134736198	134739406	4.39509664693319e-06	134743423	134746574
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	200	-0.0073	4.39509664693319e-06	134743423	134746574	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	16169	-0.0028	NA	NA	NA	0	55118214	55123719
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-3.5153	0	55118214	55123719	0	55207305	55209626
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	27115	-0.0023	0	55207305	55209626	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3580	9e-04	NA	NA	NA	1.01452441227938e-68	9523923	9531133
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-2.1398	1.01452441227938e-68	9523923	9531133	3.59536542430104e-71	9543817	9554149
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	130943064	40862	39073	4e-04	3.59536542430104e-71	9543817	9554149	2.10714030244083e-08	130936199	130943064
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.2261	2.10714030244083e-08	130936199	130943064	1.26106271744171e-08	130946248	130946248
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	526	0.0151	1.26106271744171e-08	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7010	-0.0044	NA	NA	NA	2.42817935401919e-83	37953582	37953582
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.613	2.42817935401919e-83	37953582	37953582	4.07741550146456e-82	37957844	37957844
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	113788788	24152	23122	-8e-04	4.07741550146456e-82	37957844	37957844	8.76788386841423e-08	113787620	113788788
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-1.1721	8.76788386841423e-08	113787620	113788788	7.01348243520366e-07	113792974	113794669
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	146	0.0017	7.01348243520366e-07	113792974	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-0.7682	NA	NA	NA	0.00578696795916192	18527871	19273289
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19441654	31	29	-0.3214	0.00578696795916192	18527871	19273289	3.51924957131892e-09	19422841	19461755
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	34674458	5713	5466	0.0103	3.51924957131892e-09	19422841	19461755	1.13112753145915e-10	34674458	34674458
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34679959	2	2	1.3632	1.13112753145915e-10	34674458	34674458	1.01776316916969e-10	34679959	34679959
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34683810	106358491	26133	24962	-0.005	1.01776316916969e-10	34679959	34679959	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	100298352	31322	29943	-0.0081	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	57203733	14909	14228	-0.0015	NA	NA	NA	2.84238848878073e-07	57201427	57203733
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1402	2.84238848878073e-07	57201427	57203733	5.70162531152512e-08	57206772	57208375
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5357	-0.0061	5.70162531152512e-08	57206772	57208375	1.22739504721508e-13	75093957	75093957
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-1.2126	1.22739504721508e-13	75093957	75093957	2.41566238263223e-12	75100865	75100865
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4921	-0.0111	2.41566238263223e-12	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	32828797	12421	11860	0.0043	NA	NA	NA	1.42909208341854e-18	32828797	32828797
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-1.7587	1.42909208341854e-18	32828797	32828797	4.14391934173716e-18	32832642	32832642
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1377	0.0055	4.14391934173716e-18	32832642	32832642	9.39492637301234e-108	36673853	36673853
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.6637	9.39492637301234e-108	36673853	36673853	4.26587569672386e-110	36683509	36683509
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	78653545	15758	15024	0.0044	4.26587569672386e-110	36683509	36683509	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21956	-0.0067	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	463	0.0105	NA	NA	NA	1.07152178538472e-08	1395246	1398325
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.3267	1.07152178538472e-08	1395246	1398325	8.74583015622808e-10	1400840	1400840
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	56825794	19380	18533	0.0104	8.74583015622808e-10	1400840	1400840	0	56825794	56825794
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-3.9619	0	56825794	56825794	6.42129858617071e-315	56840346	56840346
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1126	-0.0012	6.42129858617071e-315	56840346	56840346	5.83498621475233e-16	59412581	59414898
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.7415	5.83498621475233e-16	59412581	59414898	1.05864091342152e-14	59434202	59441741
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	59440262	1	0	NA	1.05864091342152e-14	59434202	59441741	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	63787171	1992	1903	-0.0067	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	562	-0.019	NA	NA	NA	1.17880931626007e-23	1499034	1515948
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1506379	1	0	NA	1.17880931626007e-23	1499034	1515948	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.8573	NA	NA	NA	1.00258235689748e-22	1528899	1544485
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20113	-0.0045	1.00258235689748e-22	1528899	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12878	-0.0015	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16521073	406	385	0.001	NA	NA	NA	7.06845696591022e-77	16521073	16521073
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-3.4668	7.06845696591022e-77	16521073	16521073	2.90818949777711e-76	16524408	16524408
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	35472378	9144	8759	-0.0028	2.90818949777711e-76	16524408	16524408	7.63840239328322e-79	35472378	35472378
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.5244	7.63840239328322e-79	35472378	35472378	4.97484922607105e-75	35476942	35476942
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6686	-0.0012	4.97484922607105e-75	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.2442	NA	NA	NA	5.77822868223157e-34	94062	94062
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.6189	5.77822868223157e-34	94062	94062	8.46666225971073e-09	104486	104732
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	109064	3	3	-0.6681	8.46666225971073e-09	104486	104732	1.29326907689288e-16	109064	109064
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	124528	13	13	-0.0247	1.29326907689288e-16	109064	109064	2.02962070637456e-09	124528	127113
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	4	-1.5361	2.02962070637456e-09	124528	127113	6.81355439705953e-25	129544	130528
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1431411	755	725	-0.0468	6.81355439705953e-25	129544	130528	2.16106925740818e-21	1431411	1431411
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.9567	2.16106925740818e-21	1431411	1431411	5.15365414465813e-20	1432953	1432953
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	586	-0.0409	5.15365414465813e-20	1432953	1432953	7.18628981474175e-10	2301365	2302065
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.9226	7.18628981474175e-10	2301365	2302065	3.57097546417915e-09	2304398	2306110
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2372138	72	66	0.0324	3.57097546417915e-09	2304398	2306110	1.07261952238591e-07	2369390	2374133
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2373235	2373235	1	0	NA	1.07261952238591e-07	2369390	2374133	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2374031	2380631	9	9	-0.5328	NA	NA	NA	0.00400749697489982	2375499	2390126
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2382584	2415262	39	36	-0.1911	0.00400749697489982	2375499	2390126	0.00403500591538757	2407672	2416516
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2415736	2415736	1	0	NA	0.00403500591538757	2407672	2416516	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2416516	2418497	4	4	-0.6331	NA	NA	NA	0.000150956263517424	2418497	2419541
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2418980	2708291	263	253	-0.0441	0.000150956263517424	2418497	2419541	0	2708113	2711273
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	43183	0.9876	0	2708113	2711273	0	154578922	154586690
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	-0.0133	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	118	-3.1113	NA	NA	NA	7.61829049005926e-17	3219200	3733715
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.9269	7.61829049005926e-17	3219200	3733715	1.03516758880211e-08	5422507	6696721
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	166	-2.7046	1.03516758880211e-08	5422507	6696721	1.79544886382432e-05	6998513	7211779
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7485594	126	123	-2.0377	1.79544886382432e-05	6998513	7211779	2.66788458860181e-05	7347578	7656915
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	8078570	170	166	-2.7118	2.66788458860181e-05	7347578	7656915	0.000169846535542405	7999759	8088838
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8080093	8178487	23	19	-3.9514	0.000169846535542405	7999759	8088838	2.72822552262303e-06	8161536	8211300
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8968640	228	219	-2.7355	2.72822552262303e-06	8161536	8211300	5.57127444630382e-07	8955579	9071723
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8970039	9160624	28	26	-3.849	5.57127444630382e-07	8955579	9071723	0.000596689783279478	9129443	10058016
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10515697	76	74	-2.9002	0.000596689783279478	9129443	10058016	1.06062072419651e-10	10511255	10595079
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12452734	19	18	-1.0112	1.06062072419651e-10	10511255	10595079	4.77937035175789e-09	11660512	12452734
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	10	-3.4348	4.77937035175789e-09	11660512	12452734	4.20138398935338e-06	12536761	12554612
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-1.6725	4.20138398935338e-06	12536761	12554612	0.000285203733816181	12627412	12730281
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	21	-2.8049	0.000285203733816181	12627412	12730281	8.17083782087101e-06	12786515	12869489
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	108	-1.638	8.170837820871e-06	12786515	12869489	6.34015449757445e-31	13109337	13138841
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13863657	255	240	-2.8838	6.34015449757445e-31	13109337	13138841	0.000262797582900631	13573345	13979944
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14342834	154	145	-3.3077	0.000262797582900631	13573345	13979944	2.75297702176628e-07	14310145	14390028
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508894	97	93	-2.5449	2.75297702176628e-07	14310145	14390028	0.000303281649372614	14487022	14528771
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14566592	22	18	-1.312	0.000303281649372614	14487022	14528771	1.08615520834781e-05	14559651	14605090
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14569287	16214032	545	519	-2.611	1.08615520834781e-05	14559651	14605090	3.06319133554476e-07	16002819	16670950
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16215750	22139807	975	925	-2.945	3.06319133554476e-07	16002819	16670950	0.000126982448661111	22040373	22157319
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22181855	12	12	-1.5346	0.000126982448661111	22040373	22157319	6.71693339286745e-23	22181855	22182080
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22268552	26	24	-4.0882	6.71693339286745e-23	22181855	22182080	0.00217542469498382	22243796	22774861
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22930737	64	57	-3.244	0.00217542469498382	22243796	22774861	2.07225473295545e-35	22924754	22930737
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.0011	2.07225473295545e-35	22924754	22930737	0.000274674050042113	26945084	27011035
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-2.3157	0.000274674050042113	26945084	27011035	2.04588770398000e-06	27003308	27053237
MSK_252152912354_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.5836	2.04588770398e-06	27003308	27053237	NA	NA	NA
