Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16838573	5788	5640	0.0044	NA	NA	NA	1.49043086049966e-10	16816180	16888048
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	17094475	11	11	-0.4813	1.49043086049966e-10	16816180	16888048	6.60568240861337e-11	17094326	17104345
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17102601	72537426	22095	21517	-0.0039	6.60568240861337e-11	17094326	17104345	0	72537426	72537426
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.8339	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110033018	11704	11378	2e-04	0	72579311	72579311	6.23333750760202e-11	110033018	110033018
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	1.0802	6.23333750760202e-11	110033018	110033018	8.4370294514448e-11	110039388	110039388
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	143697723	3914	3806	-0.0035	8.4370294514448e-11	110039388	110039388	2.17524652805230e-22	143651396	143706582
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143700072	143789484	45	44	-0.3232	2.1752465280523e-22	143651396	143706582	2.48516864892913e-21	143783358	143802400
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143791143	146297175	596	579	-0.0214	2.48516864892913e-21	143783358	143802400	1.73858916848171e-19	146283719	147315217
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147847659	39	39	-0.3647	1.73858916848171e-19	146283719	147315217	3.18816422556442e-23	147490553	148088285
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081741	150841957	1261	1240	-0.0034	3.18816422556442e-23	147490553	148088285	2.19322341333310e-68	150841957	150841957
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150843192	150843192	1	0	NA	2.1932234133331e-68	150841957	150841957	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150844444	150846148	2	2	-2.6451	NA	NA	NA	6.77937938670234e-67	150846148	150846148
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	6.77937938670234e-67	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	157133150	2763	2674	0.0016	NA	NA	NA	7.3594370661928e-25	157133150	157133150
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.6278	7.3594370661928e-25	157133150	157133150	6.51071535580246e-26	157136342	157136342
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	194978218	13296	12941	-0.0066	6.51071535580246e-26	157136342	157136342	5.58190338879509e-12	194977713	195009358
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.5395	5.58190338879509e-12	194977713	195009358	1.33874274198373e-11	195062793	195095156
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200598243	2158	2106	0.0032	1.33874274198373e-11	195062793	195095156	2.53855742147954e-13	200584100	200623556
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200787319	38	35	-0.2941	2.53855742147954e-13	200584100	200623556	1.89097243202214e-13	200676505	200804838
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	228802089	10220	9944	-0.0031	1.89097243202214e-13	200676505	200804838	4.06788607941369e-10	228802089	228811950
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228811950	228815844	3	3	0.8645	4.06788607941369e-10	228802089	228811950	3.30809493309796e-10	228813799	228815844
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228817158	246751473	7057	6892	-0.0019	3.30809493309796e-10	228813799	228815844	7.64403311218577e-20	246702361	246769018
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246753652	246862029	31	31	0.3689	7.64403311218577e-20	246702361	246769018	6.90568209643337e-12	246853406	246878405
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	96	0.0511	6.90568209643337e-12	246853406	246878405	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10573	2e-04	NA	NA	NA	3.6414862412544e-09	33074522	33076512
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	0.9983	3.6414862412544e-09	33074522	33076512	2.21579232873620e-10	33080437	33080437
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	628	-5e-04	2.2157923287362e-10	33080437	33080437	5.83280067639436e-27	34542224	34551222
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	-0.5596	5.83280067639436e-27	34542224	34551222	1.22033705608903e-23	34583814	34595734
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	473	-0.0068	1.22033705608903e-23	34583814	34595734	2.45878102547174e-08	35818921	35821494
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-0.9486	2.45878102547174e-08	35818921	35821494	1.09018841788086e-08	35844884	35844884
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37789939	878	846	-0.0205	1.09018841788086e-08	35844884	35844884	1.03575482612217e-12	37776576	37812045
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37858379	28	28	-0.3243	1.03575482612217e-12	37776576	37812045	1.08245519131087e-13	37848754	37868682
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	218970587	56491	54959	-0.0016	1.08245519131087e-13	37848754	37868682	1.01743108278048e-18	218970587	218970587
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218971708	218972428	2	2	1.3945	1.01743108278048e-18	218970587	218970587	2.50507903804243e-18	218972428	218972428
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218975318	227949124	2855	2781	-0.008	2.50507903804243e-18	218972428	218972428	6.47223277073773e-10	227946001	227949124
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227967126	8	8	0.5141	6.47223277073773e-10	227946001	227949124	3.46007958581929e-09	227967126	227973265
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227968956	241580552	5165	5021	-0.0025	3.46007958581929e-09	227967126	227973265	8.05249474706003e-08	241560913	241610737
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241583106	241638357	20	20	-0.3066	8.05249474706003e-08	241560913	241610737	3.91600074822047e-06	241608305	241656618
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	241642383	242501239	287	283	-0.0226	3.91600074822047e-06	241608305	241656618	2.67678017329126e-13	242483535	242523086
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242677011	62	62	0.2193	2.67678017329126e-13	242483535	242523086	0.00698899590196811	242607326	242677011
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242677069	242689978	5	5	-0.1107	0.00698899590196811	242607326	242677011	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	21224805	7470	7266	-6e-04	NA	NA	NA	1.72927144634759e-14	21210959	21224805
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	21239663	21310801	8	8	0.6166	1.72927144634759e-14	21210959	21224805	2.20127639729849e-16	21310801	21326830
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	21326830	32074432	3318	3231	-0.0129	2.20127639729849e-16	21310801	21326830	3.27256994056561e-21	32074432	32074432
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.4117	3.27256994056561e-21	32074432	32074432	9.77982392831516e-19	32080848	32080848
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	133189686	32911	32020	-8e-04	9.77982392831516e-19	32080848	32080848	4.31475901046921e-20	133189686	133189686
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.4593	4.31475901046921e-20	133189686	133189686	1.42444771269204e-20	133194685	133194685
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163992903	9777	9530	0.0032	1.42444771269204e-20	133194685	133194685	3.87707657683362e-54	163992903	164005577
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.1118	3.87707657683362e-54	163992903	164005577	0.0007006748687382	164001657	164036648
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	21	0.5311	0.0007006748687382	164001657	164036648	3.79318911498976e-29	164112873	164121847
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	199329592	12115	11808	-0.001	3.79318911498976e-29	164112873	164121847	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3291	0.0105	NA	NA	NA	1.33638591339205e-10	9800777	9815760
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.8191	1.33638591339205e-10	9800777	9815760	1.45346066104294e-12	9842644	9853710
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	26563737	4811	4681	-8e-04	1.45346066104294e-12	9842644	9853710	8.79678948810834e-10	26560797	26563737
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26565071	26566345	2	2	-1.0305	8.79678948810834e-10	26560797	26563737	2.37137081765862e-10	26566345	26568376
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26568376	54286069	6769	6600	1e-04	2.37137081765862e-10	26566345	26568376	2.67128682053516e-13	54286069	54291175
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	54291175	54297257	3	3	-0.9477	2.67128682053516e-13	54286069	54291175	2.25482047212598e-13	54293382	54297257
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	54301847	69075140	3453	3356	0.0023	2.25482047212598e-13	54293382	54297257	1.29873561974200e-29	69069651	69085386
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69085386	69165814	12	12	-0.6978	1.298735619742e-29	69069651	69085386	5.11081301082932e-29	69163312	69643272
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	115	0.0159	5.11081301082932e-29	69163312	69643272	2.94033037722146e-16	70130975	70150576
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.8491	2.94033037722146e-16	70130975	70150576	9.24015466280988e-14	70216707	70294312
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	173660684	31267	30451	0.0018	9.24015466280988e-14	70216707	70294312	4.35392994037872e-49	173660684	173660684
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.2187	4.35392994037872e-49	173660684	173660684	2.42673736443078e-50	173666072	173666072
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5185	-0.001	2.42673736443078e-50	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12840501	3973	3871	5e-04	NA	NA	NA	3.37913710053337e-14	12840501	12853151
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12853151	12873052	4	4	0.859	3.37913710053337e-14	12840501	12853151	4.47787169971885e-14	12866038	13263185
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	32133136	4750	4629	7e-04	4.47787169971885e-14	12866038	13263185	2.29149962074687e-42	32130155	32143140
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32137514	32203336	35	35	0.4991	2.29149962074687e-42	32130155	32143140	2.15430806843296e-43	32197362	32209048
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32206845	59318791	7385	7196	-0.0048	2.15430806843296e-43	32197362	32209048	8.13587180484022e-11	59318791	59320265
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59320265	59325340	3	3	-0.8815	8.13587180484022e-11	59318791	59320265	4.28054295451902e-05	59321944	59327219
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59327219	59521690	53	52	-0.0201	4.28054295451902e-05	59321944	59327219	6.2957768564972e-08	59519685	59521690
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59525396	59531344	3	3	-0.9945	6.2957768564972e-08	59519685	59521690	3.46668812666323e-14	59531344	59531344
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59535295	112290534	15005	14581	-0.0032	3.46668812666323e-14	59531344	59531344	2.88481919341920e-16	112286235	112290534
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112292424	112304734	5	5	-0.8226	2.8848191934192e-16	112286235	112290534	7.71433206296697e-17	112304734	112312110
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112312110	140533456	9008	8734	5e-04	7.71433206296697e-17	112304734	112312110	6.99975638735806e-12	140533456	140533456
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-1.1017	6.99975638735806e-12	140533456	140533456	2.25720972861837e-11	140538666	140538666
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	180342860	13420	13085	0.0049	2.25720972861837e-11	140538666	140538666	1.79240992780749e-12	180194323	180342860
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	7	0.6226	1.79240992780749e-12	180194323	180342860	1.20054752006185e-11	180358977	180364670
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	109	-0.0085	1.20054752006185e-11	180358977	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	236535	54	52	-0.0275	NA	NA	NA	7.31877143250846e-26	232366	240119
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	326323	47	46	-0.5072	7.31877143250846e-26	232366	240119	2.17124487880394e-60	322557	329100
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	32564884	11578	11274	-7e-04	2.17124487880394e-60	322557	329100	1.98780483108681e-183	32564884	32564884
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32590568	3	3	-3.4337	1.98780483108681e-183	32564884	32564884	7.2588481597971e-06	32590568	32595402
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32633691	12	12	-0.8724	7.2588481597971e-06	32590568	32595402	1.77592726258233e-41	32605300	32633691
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	54035000	8295	8081	-8e-04	1.77592726258233e-41	32605300	32633691	9.00314761464562e-28	54035000	54035000
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.4156	9.00314761464562e-28	54035000	54035000	1.14461608294674e-30	54042734	54042734
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	74647491	5288	5157	9e-04	1.14461608294674e-30	54042734	54042734	2.36851721318373e-90	74647491	74647491
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74655219	3	3	-2.4314	2.36851721318373e-90	74647491	74647491	1.37787887211768e-77	74655219	74655219
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74662644	79018959	1141	1115	0.0088	1.37787887211768e-77	74655219	74655219	2.67653615590214e-11	79008946	79032059
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79085247	12	12	-0.4507	2.67653615590214e-11	79008946	79032059	1.37937105910299e-11	79068331	79095415
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79091850	132748175	16506	16093	0.0017	1.37937105910299e-11	79068331	79095415	2.41789110609735e-10	132745678	132748175
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132749309	132752481	3	3	-0.8563	2.41789110609735e-10	132745678	132748175	6.32187610267794e-10	132752481	132754426
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132754426	170753106	13172	12836	-0.008	6.32187610267794e-10	132752481	132754426	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	71894353	21787	21199	-0.0022	NA	NA	NA	6.73001606569876e-13	71894353	71894353
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-1.1969	6.73001606569876e-13	71894353	71894353	3.53588257928109e-13	71912065	71912065
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	114615969	15607	15188	0.002	3.53588257928109e-13	71912065	71912065	1.69673724181800e-11	114614397	114615969
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	114617113	114619814	3	3	-0.9157	1.696737241818e-11	114614397	114615969	5.18281367226322e-12	114619814	114624566
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	114622075	114622075	1	0	NA	5.18281367226322e-12	114619814	114624566	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	114624566	118611324	1865	1809	-4e-04	NA	NA	NA	5.68166076220211e-23	118611324	118611324
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.2529	5.68166076220211e-23	118611324	118611324	8.50788603869292e-23	118620875	118620875
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	141410894	10535	10262	4e-04	8.50788603869292e-23	118620875	118620875	0	141410894	141413352
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-3.6202	0	141410894	141413352	2.21769243529888e-205	141438504	141440184
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	116	0.0039	2.21769243529888e-205	141438504	141440184	2.0928819036381e-25	141689547	141698634
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.8063	2.0928819036381e-25	141689547	141698634	4.86021885190371e-23	141712786	141720303
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	143503317	659	639	0.0247	4.86021885190371e-23	141712786	141720303	2.51980998144682e-09	143500499	143503317
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-0.8894	2.51980998144682e-09	143500499	143503317	5.48078918567538e-11	143584350	143705425
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	147702365	1850	1804	-0.0028	5.48078918567538e-11	143584350	143705425	1.99981201973622e-101	147702365	147702365
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.2317	1.99981201973622e-101	147702365	147702365	1.39719115983223e-91	147707161	147707161
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	151728811	1630	1580	-0.008	1.39719115983223e-91	147707161	147707161	5.68691971644998e-08	151701438	151730250
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151747905	10	10	-0.4458	5.68691971644998e-08	151701438	151730250	7.09328799124052e-08	151745100	151755714
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151750057	158821263	2598	2537	-0.0082	7.09328799124052e-08	151745100	151755714	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	6926661	2391	2337	-0.0039	NA	NA	NA	7.34877580637563e-19	6907624	7156900
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7824059	10	10	-0.6202	7.34877580637563e-19	6907624	7156900	1.29233394739016e-17	7790934	8137794
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	15441143	2661	2582	0.0021	1.29233394739016e-17	7790934	8137794	5.98257588599316e-11	15437205	15444819
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15444819	15453544	6	6	-0.6347	5.98257588599316e-11	15437205	15444819	2.14007379641786e-11	15452209	15457778
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15457778	40892587	8506	8267	-0.0011	2.14007379641786e-11	15452209	15457778	9.06066312409318e-116	40892587	40892587
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-3.4035	9.06066312409318e-116	40892587	40892587	1.39930613192044e-114	40897469	40897469
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	68002168	6721	6539	-0.0015	1.39930613192044e-114	40897469	40897469	1.69772678983049e-11	68000972	68003394
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68003394	68006533	3	3	-0.9059	1.69772678983049e-11	68000972	68003394	3.2188958548149e-12	68004667	68006533
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68008016	85687135	5057	4917	6e-04	3.2188958548149e-12	68004667	68006533	5.51967499833869e-11	85687135	85687135
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85690246	85696461	2	2	-1.0523	5.51967499833869e-11	85687135	85687135	6.57244493317461e-11	85696461	85698213
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85698213	100350912	4637	4534	0.0023	6.57244493317461e-11	85696461	85698213	0	100350912	100352764
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	100352764	100587464	101	100	-0.8523	0	100350912	100352764	0	100587464	100588563
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	100588563	146264846	14469	14102	0.001	0	100587464	100588563	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	6681606	2470	2405	0.0052	NA	NA	NA	1.53002372038900e-278	6681606	6681606
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6685358	6685358	1	0	NA	1.530023720389e-278	6681606	6681606	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6692831	6698290	3	3	-4.2412	NA	NA	NA	3.00566071819705e-269	6698290	6698290
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	6701392	39130211	10256	9966	-0.0032	3.00566071819705e-269	6698290	6698290	2.07697461652162e-08	39062211	43445839
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39146895	44199401	8	8	0.475	2.07697461652162e-08	39062211	43445839	9.4921823225775e-11	43644906	47002187
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	45359327	70926188	334	324	-0.039	9.4921823225775e-11	43644906	47002187	1.09610024023270e-19	70926188	70926188
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.4645	1.0961002402327e-19	70926188	70926188	1.22278515970996e-19	70930528	70930528
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	74211590	1403	1367	-0.0092	1.22278515970996e-19	70930528	70930528	6.57707704015891e-15	74210421	74211590
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	74212834	74217142	3	3	-1.0409	6.57707704015891e-15	74210421	74211590	6.38214681853003e-16	74217142	74217142
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	74219214	86960197	3954	3848	-0.0095	6.38214681853003e-16	74217142	74217142	9.11849886544274e-09	86956605	86960197
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	0.9399	9.11849886544274e-09	86956605	86960197	9.85342137440602e-09	86965458	86968271
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	116124007	10106	9860	-0.0122	9.85342137440602e-09	86965458	86968271	3.55517544635781e-13	116124007	116124007
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.1664	3.55517544635781e-13	116124007	116124007	1.42074591647973e-11	116130333	116130333
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137281150	8274	8029	-0.0081	1.42074591647973e-11	116130333	116130333	1.35703989564128e-63	137273032	137286520
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137283546	137449020	58	56	0.4953	1.35703989564128e-63	137273032	137286520	7.7015293980567e-47	137440943	137454550
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137452191	140145683	1068	1045	-0.01	7.7015293980567e-47	137440943	137454550	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9475	-0.0047	NA	NA	NA	6.4626456738983e-31	27038538	27038538
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.7841	6.4626456738983e-31	27038538	27038538	1.74469865947752e-31	27041812	27041812
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	46384985	4727	4613	-0.0135	1.74469865947752e-31	27041812	27041812	2.67317517442369e-79	45480572	46394835
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46388078	47172534	119	115	0.3661	2.67317517442369e-79	45480572	46394835	5.68193899074012e-83	47161232	47946216
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47938346	70949263	7098	6916	-0.0108	5.68193899074012e-83	47161232	47946216	1.75751911238514e-13	70947915	70949263
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.8337	1.75751911238514e-13	70947915	70949263	4.70646647465862e-12	70960187	70964344
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2838	-0.003	4.70646647465862e-12	70960187	70964344	1.21346908605465e-48	77917893	77917893
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-1.9034	1.21346908605465e-48	77917893	77917893	1.22468001171195e-54	77928738	77928738
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	124328915	16334	15882	-0.0039	1.22468001171195e-54	77928738	77928738	4.96826741733182e-09	124327243	124328915
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	-0.8044	4.96826741733182e-09	124327243	124328915	7.91875388922072e-08	124340356	124368725
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	135285645	3876	3773	-0.0041	7.91875388922072e-08	124340356	124368725	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1735	-0.0027	NA	NA	NA	2.61184222624271e-09	4915039	4926583
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	4	-0.7805	2.61184222624271e-09	4915039	4926583	1.30475337434122e-10	4929502	4934594
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	18896166	5595	5427	0.0012	1.30475337434122e-10	4929502	4934594	7.65488991380728e-11	18890351	18896166
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.6434	7.65488991380728e-11	18890351	18896166	1.43434230262683e-11	18917191	18932031
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55114405	9526	9265	9e-04	1.43434230262683e-11	18917191	18932031	1.42106281221686e-24	55095200	55129329
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55118214	55118214	1	0	NA	1.42106281221686e-24	55095200	55129329	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.3625	NA	NA	NA	2.12235986003419e-24	55202450	55229096
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	134450318	28359	27632	-3e-04	2.12235986003419e-24	55202450	55229096	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	290	0.0137	NA	NA	NA	9.80211920025236e-15	734832	736988
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.8155	9.80211920025236e-15	734832	736988	1.87906488574933e-11	743223	745410
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3357	0.0042	1.87906488574933e-11	743223	745410	3.77731884118214e-39	9516067	9543817
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	0.8706	3.77731884118214e-39	9516067	9543817	1.75173380858803e-36	9578398	9604633
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	10459455	328	318	-0.0045	1.75173380858803e-36	9578398	9604633	4.88155227777516e-08	10451870	10470425
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10462211	10484956	10	10	-0.4417	4.88155227777516e-08	10451870	10470425	5.05634089245782e-07	10470425	10493984
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10485848	11104973	232	228	-0.0216	5.05634089245782e-07	10470425	10493984	6.2486643591121e-11	11104085	11112600
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11121204	5	5	-0.7731	6.2486643591121e-11	11104085	11112600	1.95700080719725e-07	11121204	11123452
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11123452	11130871	5	5	-3.8498	1.95700080719725e-07	11121204	11123452	8.79711768479824e-92	11130871	11130871
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11395862	71	69	-0.0619	8.79711768479824e-92	11130871	11130871	3.39176896131845e-19	11393473	11395862
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11433210	5	5	-1.2822	3.39176896131845e-19	11393473	11395862	1.31912029268076e-39	11433210	11433210
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11435643	11435643	1	0	NA	1.31912029268076e-39	11433210	11433210	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	33184017	7510	7299	-0.0019	NA	NA	NA	6.53667220880171e-165	33184017	33184017
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-4.1027	6.53667220880171e-165	33184017	33184017	1.32639257864681e-165	33198331	33198331
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	46992235	3559	3478	-0.006	1.32639257864681e-165	33198331	33198331	9.96051833787782e-26	46992235	46992235
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-1.6487	9.96051833787782e-26	46992235	46992235	5.33935662263388e-26	46996769	46996769
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	125555014	27318	26630	0.0028	5.33935662263388e-26	46996769	46996769	1.68986194019801e-13	125555014	125555014
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	125558844	125570308	3	3	-0.9841	1.68986194019801e-13	125555014	125555014	2.21873715040455e-13	125570308	125570308
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	125576897	130694393	1709	1666	0.0056	2.21873715040455e-13	125570308	125570308	5.37315664705164e-13	130694393	130694393
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.2003	5.37315664705164e-13	130694393	130694393	5.89283864358803e-16	130701040	130701040
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	90	-0.0273	5.89283864358803e-16	130701040	130701040	1.30600166252028e-38	130943064	130943064
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.8826	1.30600166252028e-38	130943064	130943064	1.91038378668304e-31	130946248	130946248
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	538	0.004	1.91038378668304e-31	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	18194544	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18348833	36717348	7007	6819	-0.0049	NA	NA	NA	9.44220985230228e-11	36717348	36717348
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36719486	36729002	2	2	-1.0973	9.44220985230228e-11	36717348	36717348	1.38001295188675e-10	36729002	36729002
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36734427	37953582	328	322	-0.0056	1.38001295188675e-10	36729002	36729002	1.43606410191414e-86	37953582	37953582
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.0874	1.43606410191414e-86	37953582	37953582	7.26183672806435e-95	37957844	37957844
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	89659397	14953	14533	-3e-04	7.26183672806435e-95	37957844	37957844	1.16199173266412e-142	89659397	89659397
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-3.7805	1.16199173266412e-142	89659397	89659397	4.31981300723275e-143	89662326	89662326
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9109	-0.0033	4.31981300723275e-143	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	-0.6952	NA	NA	NA	5.45944849870643e-126	19492531	19497023
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21552515	1004	976	-0.0014	5.45944849870643e-126	19492531	19497023	1.13876230882194e-49	21533558	21575909
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21553669	22061243	255	250	0.2272	1.13876230882194e-49	21533558	21575909	3.03426180220343e-58	22046097	22081092
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22062453	34674458	4431	4312	9e-04	3.03426180220343e-58	22046097	22081092	2.19039323194393e-19	34674458	34674458
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1694	2.19039323194393e-19	34674458	34674458	2.58277454867101e-20	34683810	34683810
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	73307681	13768	13425	-0.0091	2.58277454867101e-20	34683810	34683810	3.05601496827868e-18	73307681	73307681
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73309616	73315317	4	4	-0.9782	3.05601496827868e-18	73307681	73307681	8.9798584566184e-17	73315317	73317195
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73317195	105597555	12117	11796	-0.003	8.9798584566184e-17	73315317	73317195	1.32068500378820e-14	105595302	105602602
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105623070	9	9	-0.6118	1.3206850037882e-14	105595302	105602602	1.31876259159577e-11	105622008	105630089
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105625010	106214372	180	174	-0.0238	1.31876259159577e-11	105622008	105630089	5.90205074770462e-05	106192329	106223137
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	18	-0.2996	5.90205074770462e-05	106192329	106223137	1.44536462886531e-10	106249962	106256498
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	35	0.0808	1.44536462886531e-10	106249962	106256498	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2076	NA	NA	NA	4.6062019057727e-33	18452491	18452491
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19150242	37	36	-0.9172	4.6062019057727e-33	18452491	18452491	1.17484093906023e-07	19146596	19150242
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19153319	19167541	4	4	-0.3379	1.17484093906023e-07	19146596	19150242	1.15963414863562e-06	19167541	19174556
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19172531	19427350	50	50	-0.8552	1.15963414863562e-06	19167541	19174556	1.39192080003221e-12	19415360	19822150
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19430207	20088256	60	58	-1.1629	1.39192080003221e-12	19415360	19822150	0	20088256	20088256
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	99632987	30892	30076	-0.0116	0	20088256	20088256	2.12300289753325e-43	99632987	99632987
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.1237	2.12300289753325e-43	99632987	99632987	6.15850032403808e-32	99635701	99635701
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	269	-0.0239	6.15850032403808e-32	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	460	0.0029	NA	NA	NA	9.91495690746896e-11	1296506	1296767
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.1853	9.91495690746896e-11	1296506	1296767	1.53632433324911e-10	1300341	1300341
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	4072412	1146	1114	-0.0113	1.53632433324911e-10	1300341	1300341	8.89511547818083e-19	4070847	4072412
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4074751	4080313	4	4	-1.1296	8.89511547818083e-19	4070847	4072412	2.00491466012851e-24	4080313	4080313
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	4083178	14876356	3843	3736	-0.0029	2.00491466012851e-24	4080313	4080313	6.75386295814695e-09	14674185	14956177
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.3737	6.75386295814695e-09	14674185	14956177	2.12280269212243e-09	15028108	15042407
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	21245809	1772	1730	-0.0033	2.12280269212243e-09	15028108	15042407	4.66013141149131e-07	21226631	21258019
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21258019	21501073	11	11	-0.3681	4.66013141149131e-07	21226631	21258019	2.58460504887680e-06	21493483	21513443
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21504151	22561536	287	277	-0.002	2.5846050488768e-06	21493483	21513443	7.17049488458485e-09	22338034	22561536
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22567551	22625780	8	8	-0.5074	7.17049488458485e-09	22338034	22561536	7.4081542796096e-09	22625780	22661197
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22636249	57203733	7349	7164	-0.0055	7.4081542796096e-09	22625780	22661197	7.16058166423003e-12	57203733	57203733
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1461	7.16058166423003e-12	57203733	57203733	6.56278073825167e-13	57206772	57206772
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3308	0.001	6.56278073825167e-13	57206772	57206772	2.46507857261519e-11	68681874	68710277
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.4806	2.46507857261519e-11	68681874	68710277	5.13781657502726e-10	68751390	68842364
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2141	-0.013	5.13781657502726e-10	68751390	68842364	3.96216408471656e-40	75093957	75093957
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.6616	3.96216408471656e-40	75093957	75093957	1.58591131276732e-41	75100865	75100865
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	592	-0.0081	1.58591131276732e-41	75100865	75100865	0	76925748	76925748
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-3.8627	0	76925748	76925748	0	76940218	76940218
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4376	-0.0069	0	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	402	0.0197	NA	NA	NA	2.83701398341017e-17	1028979	1028979
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.446	2.83701398341017e-17	1028979	1028979	5.53183353092274e-15	1030766	1030766
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	422	0.0169	5.53183353092274e-15	1030766	1030766	2.08437627646805e-25	1904451	1904451
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.5318	2.08437627646805e-25	1904451	1904451	1.21737020444001e-32	1906391	1906391
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	36673853	13014	12646	0.0014	1.21737020444001e-32	1906391	1906391	1.81706792880089e-14	36672710	36673853
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.7324	1.81706792880089e-14	36672710	36673853	1.2448558719105e-13	36684619	36686013
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1958	0.0121	1.2448558719105e-13	36684619	36686013	5.14534661872804e-76	41518222	41519702
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	21	0.9075	5.14534661872804e-76	41518222	41519702	1.97295313297374e-22	41564408	41570512
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41647135	37	36	0.4268	1.97295313297374e-22	41564408	41570512	2.77277591339819e-30	41644148	41697532
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41648545	78653545	13688	13316	0.0027	2.77277591339819e-30	41644148	41697532	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15774	-0.0045	NA	NA	NA	4.68480921853629e-17	53092949	53092949
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.3367	4.68480921853629e-17	53092949	53092949	4.86485264706559e-17	53099601	53099601
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6556	-0.0055	4.86485264706559e-17	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	239700	11	11	-0.0439	NA	NA	NA	8.80568397818631e-13	239700	239700
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	1.3112	8.80568397818631e-13	239700	239700	8.30016431196643e-12	243026	243026
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	1398325	478	463	0.0079	8.30016431196643e-12	243026	243026	5.6286584429863e-49	1398325	1398325
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.6236	5.6286584429863e-49	1398325	1398325	6.62464628090528e-57	1400840	1400840
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4567	0.0127	6.62464628090528e-57	1400840	1400840	6.09499562433132e-18	11448975	11448975
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.4964	6.09499562433132e-18	11448975	11448975	4.92746528995103e-19	11452390	11452390
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	19694025	3853	3775	0.0087	4.92746528995103e-19	11452390	11452390	6.80327059293793e-313	19694025	19694025
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-4.8378	6.80327059293793e-313	19694025	19694025	1.58028464293429e-310	19700620	19700620
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	59246409	11936	11615	-0.0011	1.58028464293429e-310	19700620	19700620	2.2911030466786e-246	59246409	59246409
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-4.3296	2.2911030466786e-246	59246409	59246409	5.5581932380055e-111	59251831	59251831
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	59414898	86	84	0.0367	5.5581932380055e-111	59251831	59251831	8.30929141491003e-25	59414645	59414898
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.7663	8.30929141491003e-25	59414645	59414898	2.73284947984186e-24	59434202	59440262
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1948	-0.0138	2.73284947984186e-24	59434202	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	568	-0.0113	NA	NA	NA	6.93123024605747e-30	1499421	1515948
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.837	6.93123024605747e-30	1499421	1515948	2.45879725899211e-33	1528899	1544485
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20418	-0.0039	2.45879725899211e-33	1528899	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	36789648	8545	8329	-0.0056	NA	NA	NA	4.14747567910656e-42	36789648	36789648
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	2.0601	4.14747567910656e-42	36789648	36789648	3.33360215695580e-38	36791668	36791668
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46922972	4894	4774	-0.007	3.3336021569558e-38	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22708012	2996	2920	0.0083	NA	NA	NA	1.31782688719614e-08	22702398	22708012
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22710302	22725305	9	9	-0.487	1.31782688719614e-08	22702398	22708012	3.87068393326512e-09	22725305	22736990
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6362	-0.0082	3.87068393326512e-09	22725305	22736990	6.7796796411113e-85	35472378	35472378
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.0079	6.7796796411113e-85	35472378	35472378	6.76338318071368e-76	35476942	35476942
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	35855916	216	207	-0.0121	6.76338318071368e-76	35476942	35476942	1.39538485283322e-20	35850235	35859121
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35857521	35899804	27	27	0.4369	1.39538485283322e-20	35850235	35859121	1.28510915748809e-22	35895445	35904346
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35900781	48448446	6258	6084	-0.0036	1.28510915748809e-22	35895445	35904346	1.86908577911467e-09	48446915	48448446
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48455492	3	3	0.8658	1.86908577911467e-09	48446915	48448446	3.93639278304324e-08	48455492	48458933
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48458933	49571068	499	485	0.0101	3.93639278304324e-08	48455492	48458933	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.2943	NA	NA	NA	2.38523548283771e-26	94062	94062
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	2.38523548283771e-26	94062	94062	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	104732	6	6	-1.4965	NA	NA	NA	6.33223045299022e-21	104732	106242
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	206524	51	51	-0.2094	6.33223045299022e-21	104732	106242	0.0401919965598573	122273	216381
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	207612	222034	18	18	0.0481	0.0401919965598573	122273	216381	0.000203365842420853	218354	222034
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	223009	224571	2	2	-1.0443	0.000203365842420853	218354	222034	2.99426959297324e-06	224571	225591
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	225591	264886	42	41	-0.0345	2.99426959297324e-06	224571	225591	6.07820789426064e-07	264190	264886
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	266212	266212	1	0	NA	6.07820789426064e-07	264190	264886	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.0265	NA	NA	NA	2.97772293989863e-08	267079	267079
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1431411	660	647	0.0098	2.97772293989863e-08	267079	267079	3.30066488356476e-12	1431411	1431411
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.2185	3.30066488356476e-12	1431411	1431411	5.50945881587562e-12	1432953	1432953
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2303192	610	596	-0.0087	5.50945881587562e-12	1432953	1432953	1.19159891374575e-51	2303192	2303192
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-2.0322	1.19159891374575e-51	2303192	2303192	1.05093329174475e-45	2304398	2304398
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2426938	136	131	-0.0452	1.05093329174475e-45	2304398	2304398	1.31407447630675e-05	2425776	2426938
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	0.8173	1.31407447630675e-05	2425776	2426938	1.82701932558773e-06	2428307	2430156
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2673365	226	223	-0.0022	1.82701932558773e-06	2428307	2430156	0.00255627466741799	2651918	2697588
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2708291	25	24	-0.1817	0.00255627466741799	2651918	2697588	8.13129996915114e-60	2708291	2711273
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	4244902	500	492	0.9054	8.13129996915114e-60	2708291	2711273	1.19701347433509e-06	4239811	4244902
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	4248488	4248488	1	0	NA	1.19701347433509e-06	4239811	4244902	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	4250413	4258174	4	4	0.0097	NA	NA	NA	8.96149934024203e-12	4258174	4261500
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	4261500	76998610	22434	21837	0.9824	8.96149934024203e-12	4258174	4261500	7.24547615766912e-46	76998610	76998610
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.6241	7.24547615766912e-46	76998610	76998610	9.95679135787286e-45	77010018	77010018
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	153329988	21777	21236	0.987	9.95679135787286e-45	77010018	77010018	7.80493402679765e-21	153329988	153329988
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153333629	2	2	-0.7763	7.80493402679765e-21	153329988	153329988	2.01819519316434e-15	153333629	153333629
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153335752	154582414	414	397	0.9492	2.01819519316434e-15	153333629	153333629	0	154578922	154582414
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	197	-0.0223	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-3.7979	NA	NA	NA	1.83319364782932e-34	3223585	3773948
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.7142	1.83319364782932e-34	3223585	3773948	2.79813966105435e-17	5422507	6652845
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	170	-3.4376	2.79813966105435e-17	5422507	6652845	8.29932426463423e-09	7022973	7177061
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7349064	98	93	-2.4632	8.29932426463423e-09	7022973	7177061	2.08414698300138e-06	7304209	7456245
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7350629	7723783	105	101	-3.4006	2.08414698300138e-06	7304209	7456245	0.00143151225818626	7659535	7782532
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7914104	58	57	-2.6269	0.00143151225818626	7659535	7782532	5.19347372262729e-08	7855856	7947666
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8289709	85	82	-3.6537	5.19347372262729e-08	7855856	7947666	6.55624058385684e-05	8229100	8293425
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	11	-2.2386	6.55624058385684e-05	8229100	8293425	1.66946344854688e-05	8308608	8334196
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	8538835	46	44	-3.5453	1.66946344854688e-05	8308608	8334196	0.000217968946011666	8493370	8558646
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8690572	55	53	-2.8267	0.000217968946011666	8493370	8558646	1.31169587947384e-06	8659109	8740174
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8692156	10513747	191	186	-3.6134	1.31169587947384e-06	8659109	8740174	3.86090596279476e-35	10512616	10515697
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	16	-0.6065	3.86090596279476e-35	10512616	10515697	4.18698443927378e-25	11660512	11698871
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12541506	13	13	-3.7483	4.18698443927378e-25	11660512	11698871	7.57433939788154e-06	12533900	12557151
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-2.0481	7.57433939788154e-06	12533900	12557151	2.16492744715556e-06	12646477	12725675
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12857197	30	30	-3.4371	2.16492744715556e-06	12646477	12725675	1.25793491070698e-08	12833424	12869489
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12859309	13048283	73	71	-2.0304	1.25793491070698e-08	12833424	12869489	1.75037438227968e-05	13031576	13052633
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13076862	11	11	-3.5469	1.75037438227968e-05	13031576	13052633	4.68948091692584e-22	13066849	13077621
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13077621	13128515	21	21	-1.4174	4.68948091692584e-22	13066849	13077621	5.65013056178153e-25	13121152	13128515
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	13	-3.816	5.65013056178153e-25	13121152	13128515	0.0443232891986784	13146483	13232295
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13254711	29	28	-2.8533	0.0443232891986784	13146483	13232295	2.63078166686118e-05	13175367	13271228
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13421917	69	69	-3.7677	2.63078166686118e-05	13175367	13271228	9.7133372071307e-09	13409104	13422642
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13422642	13453843	17	17	-2.6604	9.7133372071307e-09	13409104	13422642	1.09918958171868e-12	13450240	13457504
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13454651	13508638	30	30	-3.9196	1.09918958171868e-12	13450240	13457504	7.21680972702571e-08	13501633	13508638
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13508776	13520364	4	4	-2.0582	7.21680972702571e-08	13501633	13508638	5.22715614699141e-07	13520364	13522778
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13521449	13573345	35	34	-3.957	5.22715614699141e-07	13520364	13522778	5.64818895254192e-11	13566905	13584982
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13580493	13705594	22	22	-2.7585	5.64818895254192e-11	13566905	13584982	5.50424343411874e-07	13700962	13762594
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14122129	159	157	-3.8139	5.50424343411874e-07	13700962	13762594	8.02379163220896e-05	14116822	14122129
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14169526	4	4	-1.7936	8.02379163220896e-05	14116822	14122129	4.10780185797408e-05	14143748	14203911
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14203911	14343139	28	27	-3.6775	4.10780185797408e-05	14143748	14203911	0.0262571133645804	14325320	14464288
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14349668	14508021	95	92	-2.9336	0.0262571133645804	14325320	14464288	2.04027673430982e-05	14494397	14539230
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	2.04027673430982e-05	14494397	14539230	NA	NA	NA
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14572190	24	23	-1.6027	NA	NA	NA	0.00139382315236192	14553021	14598838
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	14707011	30	30	-2.9375	0.00139382315236192	14553021	14598838	0.0233523468487409	14597771	14708015
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14708015	14731122	11	11	-4.0958	0.0233523468487409	14597771	14708015	0.000446795864119945	14722593	14737877
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14734647	14758901	8	7	-2.993	0.000446795864119945	14722593	14737877	3.39107066409913e-06	14744771	14779054
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14765141	14883615	18	17	-4.3213	3.39107066409913e-06	14744771	14779054	0.053064327499367	14857726	15107365
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15124246	43	42	-3.4414	0.053064327499367	14857726	15107365	0.00474977711422423	15039182	15140278
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15126227	15165820	21	20	-2.4016	0.00474977711422423	15039182	15140278	2.38855746684081e-10	15165211	15165820
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15169415	15175926	5	5	-4.4718	2.38855746684081e-10	15165211	15165820	0.000943709889971287	15175926	15191780
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15176870	15251900	35	33	-2.7061	0.000943709889971287	15175926	15191780	8.57412219529191e-06	15222741	15272429
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15252823	15433122	121	118	-3.6548	8.5741221952919e-06	15222741	15272429	1.17828236436329e-06	15429742	15433122
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15447091	6	6	-1.5711	1.17828236436329e-06	15429742	15433122	0.000336700357410014	15447091	15458280
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15915466	120	117	-3.4552	0.000336700357410014	15447091	15458280	0.000181876203713605	15788556	15975479
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16042966	49	46	-2.601	0.000181876203713605	15788556	15975479	1.60784185401762e-06	15996118	16088722
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	22157319	1052	1021	-3.4816	1.60784185401762e-06	15996118	16088722	1.44339798953191e-05	22049641	22165808
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22181855	11	11	-1.8501	1.44339798953191e-05	22049641	22165808	4.0667860637019e-17	22179794	22192409
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22182080	22930737	90	87	-4.0671	4.0667860637019e-17	22179794	22192409	1.00973365178508e-83	22926726	22930737
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	31	-1.0832	1.00973365178508e-83	22926726	22930737	1.50292896752966e-12	26945084	26950080
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.4229	1.50292896752966e-12	26945084	26950080	0.000111446397237047	26957814	26989053
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27019256	12	10	-1.1602	0.000111446397237047	26957814	26989053	1.25319389718177e-10	27009433	27019256
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.2051	1.25319389718177e-10	27009433	27019256	1.08993114068051e-39	27039222	27039222
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	14	-0.466	1.08993114068051e-39	27039222	27039222	1.37905617891985e-12	27131764	27137064
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27171797	3	3	-2.838	1.37905617891985e-12	27131764	27137064	5.68515947370785e-10	27171797	27172283
MSK_252152912355_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27172283	57440809	13	13	-0.6084	5.68515947370785e-10	27171797	27172283	NA	NA	NA
