Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	554287	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	736471	34869589	12893	12602	0.0274	NA	NA	NA	6.12006352238088e-10	34859068	34869589
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-0.9901	6.12006352238088e-10	34859068	34869589	1.96019041176997e-09	34883375	34884849
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72537426	14996	14667	0.0019	1.96019041176997e-09	34883375	34884849	0	72537426	72537426
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-4.1238	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	11456	-0.0032	0	72579311	72579311	2.69976753715373e-14	110023268	110023268
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110033018	1	0	NA	2.69976753715373e-14	110023268	110023268	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110039388	2	2	1.6737	NA	NA	NA	2.45060656768979e-14	110039388	110039388
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	150819879	5850	5725	0.0016	2.45060656768979e-14	110039388	110039388	8.4923963538357e-129	150819879	150819879
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	2.0099	8.4923963538357e-129	150819879	150819879	5.57344221034984e-101	150852858	150852858
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151026228	77	76	-0.0289	5.57344221034984e-101	150852858	150852858	7.69923641034618e-08	151022179	151026228
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8624	7.69923641034618e-08	151022179	151026228	4.30397976972539e-07	151036435	151040463
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2609	0.0128	4.30397976972539e-07	151036435	151040463	4.61643129375579e-22	157133150	157133150
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.0821	4.61643129375579e-22	157133150	157133150	1.73216795786583e-23	157136342	157136342
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1581	-0.015	1.73216795786583e-23	157136342	157136342	9.16580031771261e-07	161099067	161099582
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.1667	9.16580031771261e-07	161099067	161099582	1.47233249711393e-06	161104791	161108722
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	192715640	11194	10935	-0.0039	1.47233249711393e-06	161104791	161108722	1.82359701102068e-18	192715640	192715640
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	-1.8888	1.82359701102068e-18	192715640	192715640	3.7762001376512e-18	192719540	192719540
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	247186514	20090	19679	3e-04	3.7762001376512e-18	192719540	192719540	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10635	4e-04	NA	NA	NA	2.53069795786366e-149	33076512	33076512
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-5.266	2.53069795786366e-149	33076512	33076512	3.80013652536755e-152	33080437	33080437
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	35553983	1043	1024	0.0108	3.80013652536755e-152	33080437	33080437	4.11149325357493e-06	35552710	35553983
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-1.082	4.11149325357493e-06	35552710	35553983	1.23523935341855e-06	35562007	35564203
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	35821494	101	99	-0.0127	1.23523935341855e-06	35562007	35564203	5.83342313481409e-45	35821494	35821494
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-2.7868	5.83342313481409e-45	35821494	35821494	5.1345425498641e-42	35844884	35844884
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	89208480	18264	17824	1e-04	5.1345425498641e-42	35844884	35844884	2.26433358594051e-69	89057273	89222963
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89210958	91057122	67	66	0.6223	2.26433358594051e-69	89057273	89222963	1.60376687781965e-67	89885961	91129939
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91127894	179767214	25925	25384	-0.0032	1.60376687781965e-67	89885961	91129939	8.49852345986127e-192	179767214	179767214
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	-4.9224	8.49852345986127e-192	179767214	179767214	1.35015140541153e-190	179778919	179778919
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242689978	21542	21051	4e-04	1.35015140541153e-190	179778919	179778919	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	164005577	53491	52323	-0.0029	NA	NA	NA	5.04781950228701e-79	164005577	164005577
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.4423	5.04781950228701e-79	164005577	164005577	4.67767276635816e-80	164027724	164027724
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9913	-0.0033	4.67767276635816e-80	164027724	164027724	9.87235202557065e-285	194354505	194354505
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.2082	9.87235202557065e-285	194354505	194354505	9.86446031631293e-270	194366950	194366950
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1939	-0.0087	9.86446031631293e-270	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	18000	-0.0019	NA	NA	NA	0	68905670	68905670
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-4.5381	0	68905670	68905670	0	69165814	69165814
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	92678951	8031	7861	-1e-04	0	69165814	69165814	2.45725085566468e-08	92675029	92678951
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	92692317	92696451	2	2	-1.31	2.45725085566468e-08	92675029	92678951	1.36349927011476e-08	92696451	92696451
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	92699481	119334954	8265	8093	-0.0112	1.36349927011476e-08	92696451	92696451	3.70272881887184e-190	119334954	119334954
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-4.8287	3.70272881887184e-190	119334954	119334954	1.01238428003611e-190	119348829	119348829
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	173660684	15087	14784	-0.0035	1.01238428003611e-190	119348829	119348829	3.86050185608799e-15	173660684	173660684
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.7067	3.86050185608799e-15	173660684	173660684	2.78962210399477e-15	173666072	173666072
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5197	-0.0052	2.78962210399477e-15	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	221	0.0049	NA	NA	NA	6.23124090266406e-12	730853	737829
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	4	-1.0902	6.23124090266406e-12	730853	737829	7.3703794171757e-12	829954	870657
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	166873209	48359	47282	-0.0022	7.3703794171757e-12	829954	870657	1.19117778594453e-10	166870379	166875838
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	166875838	166881828	5	5	-0.9293	1.19117778594453e-10	166870379	166875838	1.97473507568934e-10	166880597	166883148
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	166883148	180346557	5056	4957	0.0063	1.97473507568934e-10	166880597	166883148	0	180346557	180346557
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180358977	6	6	-5.6675	0	180346557	180346557	0	180358977	180358977
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	111	-0.0429	0	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	251128	62	59	-0.0277	NA	NA	NA	7.67444631317262e-11	237952	259527
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	252939	326323	39	39	-0.3846	7.67444631317262e-11	237952	259527	2.35862851093231e-15	318496	339279
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29907822	10473	10257	3e-04	2.35862851093231e-15	318496	339279	1.42544945725831e-12	29894694	29937319
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29912020	30010234	28	26	-0.4288	1.42544945725831e-12	29894694	29937319	7.33077994615883e-13	29986370	30031367
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31385778	580	567	0.0194	7.33077994615883e-13	29986370	30031367	1.91094249337650e-12	31383925	31389372
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.873	1.9109424933765e-12	31383925	31389372	2.87822255542475e-14	31393624	31425113
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	480	0.0491	2.87822255542475e-14	31393624	31425113	4.70771386732255e-173	32558677	32563252
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-2.8162	4.70771386732255e-173	32558677	32563252	4.85014647262505e-190	32595402	32600962
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	62397350	9781	9551	0.0033	4.85014647262505e-190	32595402	32600962	2.98072669809124e-14	62392606	62397350
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	62403960	62425017	6	6	-0.9593	2.98072669809124e-14	62392606	62397350	2.89322041384335e-14	62425017	62428005
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	62428005	108715741	13254	12961	-0.0022	2.89322041384335e-14	62425017	62428005	3.13502859559400e-37	108715741	108715741
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	108718515	108720533	2	2	-2.6443	3.135028595594e-37	108715741	108715741	1.07652727278138e-36	108720533	108720533
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	108722228	134629897	8954	8789	-0.0039	1.07652727278138e-36	108720533	108720533	2.52842001137196e-06	134622620	134629897
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134639397	5	5	-0.7249	2.52842001137196e-06	134622620	134629897	1.41292037258817e-07	134639397	134642596
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134641054	139609094	1877	1844	0.0015	1.41292037258817e-07	134639397	134642596	2.56233306643589e-95	139607641	139609094
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139610451	139670701	32	32	-0.9918	2.56233306643589e-95	139607641	139609094	1.3091289601126e-80	139670701	139672082
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139672082	170753106	10520	10283	-0.0075	1.3091289601126e-80	139670701	139672082	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1037402	259	253	0.0194	NA	NA	NA	4.0636357758885e-10	1036135	1037402
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1038517	1047707	3	3	-1.1393	4.0636357758885e-10	1036135	1037402	1.05549219664786e-09	1047707	1049599
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	16135701	5126	5009	0.0011	1.05549219664786e-09	1047707	1049599	4.56490364370342e-107	16135701	16135701
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.5065	4.56490364370342e-107	16135701	16135701	2.10453254646601e-107	16140018	16140018
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	118611324	33875	33107	0.0016	2.10453254646601e-107	16140018	16140018	1.31410304374574e-225	118611324	118611324
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-5.3208	1.31410304374574e-225	118611324	118611324	2.7129064412342e-222	118620875	118620875
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125829681	3169	3089	-0.0037	2.7129064412342e-222	118620875	118620875	1.96619592735685e-207	125829681	125829681
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125831554	125831554	1	0	NA	1.96619592735685e-207	125829681	125829681	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-5.1417	NA	NA	NA	1.59709748611075e-209	125837524	125837524
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141413352	7363	7201	0.0021	1.59709748611075e-209	125837524	125837524	1.39060233803168e-22	141409512	141414719
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141414719	141440184	13	13	-0.8213	1.39060233803168e-22	141409512	141414719	4.86759466330433e-18	141438504	141442231
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141689547	115	112	-0.0247	4.86759466330433e-18	141438504	141442231	4.37226684173286e-202	141689547	141689547
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141690753	141690753	1	0	NA	4.37226684173286e-202	141689547	141689547	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	-4.196	NA	NA	NA	0	141711513	141711513
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	147702365	2514	2463	0.0033	0	141711513	141711513	6.8244409849418e-117	147702365	147702365
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-4.7852	6.8244409849418e-117	147702365	147702365	9.18598671032137e-122	147707161	147707161
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4135	-0.0126	9.18598671032137e-122	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	-0.0165	NA	NA	NA	2.28935547941731e-101	581533	581533
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.5837	2.28935547941731e-101	581533	581533	1.19367425025091e-113	588865	588865
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	15987191	5086	4969	-0.0082	1.19367425025091e-113	588865	588865	2.41349020168379e-75	15982454	15990019
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	15990019	16067927	32	31	-0.9603	2.41349020168379e-75	15982454	15990019	2.68501958143139e-70	16066056	16069607
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	16069607	25022606	2890	2830	-0.0121	2.68501958143139e-70	16066056	16069607	2.61312691545252e-143	25022606	25022606
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	-4.346	2.61312691545252e-143	25022606	25022606	8.117819060481e-152	25039370	25039370
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	39350798	4942	4834	0.0035	8.117819060481e-152	25039370	25039370	5.56966828829284e-14	39314620	39375581
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39516978	64	63	-0.2912	5.56966828829284e-14	39314620	39375581	3.04733009399085e-13	39499752	39552040
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39528069	146264846	31428	30667	-2e-04	3.04733009399085e-13	39499752	39552040	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	189055	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	194104	8115385	2843	2784	-0.0165	NA	NA	NA	2.43117645086746e-26	8115385	8115385
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	8122786	8177842	8	8	-1.0921	2.43117645086746e-26	8115385	8115385	6.31863963301482e-25	8177842	8187014
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	8187014	70926188	10220	10004	-0.006	6.31863963301482e-25	8177842	8187014	6.17584737032494e-115	70926188	70926188
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.616	6.17584737032494e-115	70926188	70926188	6.2026294982562e-117	70930528	70930528
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	75130596	1784	1746	-0.0065	6.2026294982562e-117	70930528	70930528	5.24891732537938e-08	75128148	75130596
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75138490	75146270	3	3	1.0073	5.24891732537938e-08	75128148	75130596	1.20345151906756e-07	75146270	75153381
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75153381	100348045	8132	7975	-8e-04	1.20345151906756e-07	75146270	75153381	4.00519591702412e-163	100348045	100348045
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-5.4683	4.00519591702412e-163	100348045	100348045	4.00098371524291e-165	100350814	100350814
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	104052828	1333	1305	-0.0102	4.00098371524291e-165	100350814	100350814	1.61873659379841e-22	104040295	104055605
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	104054114	104239415	33	31	0.5119	1.61873659379841e-22	104040295	104055605	4.57017706848804e-20	104205654	104286435
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	104248211	137352394	12478	12238	0.0019	4.57017706848804e-20	104205654	104286435	8.41591504295289e-76	137352394	137352394
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-3.844	8.41591504295289e-76	137352394	137352394	7.21736069961674e-62	137356880	137356880
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1070	0.0047	7.21736069961674e-62	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9506	-0.0065	NA	NA	NA	3.19698102303326e-109	27038538	27038538
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-4.4646	3.19698102303326e-109	27038538	27038538	8.28158965229315e-106	27041812	27041812
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	77917893	14861	14539	-0.0016	8.28158965229315e-106	27041812	27041812	6.46613688870637e-46	77917893	77917893
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-2.4143	6.46613688870637e-46	77917893	77917893	1.07935052755980e-45	77928738	77928738
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19778	-0.0022	1.0793505275598e-45	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	7758275	3015	2949	-0.0024	NA	NA	NA	4.812805875461e-13	7753067	7762277
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7762277	7783492	9	9	-0.792	4.812805875461e-13	7753067	7762277	2.46053369239078e-13	7781505	7803570
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	7797993	1	0	NA	2.46053369239078e-13	7781505	7803570	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7800021	20799632	5121	5005	-0.0075	NA	NA	NA	2.51364423156450e-206	20799632	20799632
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20801973	20806094	3	3	-5.2419	2.5136442315645e-206	20799632	20799632	4.48431967891909e-218	20806094	20806094
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	20809631	55118214	8756	8559	0.0025	4.48431967891909e-218	20806094	20806094	9.56839581259244e-35	55097806	55124730
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55197848	33	33	0.6395	9.56839581259244e-35	55097806	55124730	7.78896042145881e-34	55194990	55202450
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	57354307	910	894	0.011	7.78896042145881e-34	55194990	55202450	1.62498865575819e-05	57344296	57356078
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	57356078	57379893	6	6	0.6159	1.62498865575819e-05	57344296	57356078	0.000123828198059999	57364245	57405437
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	57382904	66463477	3728	3645	0.0324	0.000123828198059999	57364245	57405437	1.21326196261127e-07	66460753	66463477
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.3039	1.21326196261127e-07	66460753	66463477	2.61928577906053e-08	66469412	66473397
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	93000699	9048	8847	-0.0016	2.61928577906053e-08	66469412	66473397	4.84455645550208e-07	92998398	93000699
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93003167	93005517	2	2	-1.212	4.84455645550208e-07	92998398	93000699	4.55236842450557e-07	93005517	93008346
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93008346	134450318	14670	14345	-0.0044	4.55236842450557e-07	93005517	93008346	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	291	0.0294	NA	NA	NA	2.15413485761052e-11	734832	736988
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	741193	3	3	-1.0749	2.15413485761052e-11	734832	736988	3.98258144263002e-08	741193	743223
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	743223	9523923	3443	3365	-0.0086	3.98258144263002e-08	741193	743223	5.66229260789573e-30	9516067	9531133
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9589725	11	11	1.0394	5.66229260789573e-30	9516067	9531133	1.73487133031316e-29	9578398	9590351
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9590351	11112600	575	564	-0.0194	1.73487133031316e-29	9578398	9590351	1.91368728384060e-14	11109483	11112600
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11140421	8	7	0.9025	1.9136872838406e-14	11109483	11112600	5.75792337811182e-14	11140421	11147675
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	130694393	40179	39333	0.0031	5.75792337811182e-14	11140421	11147675	1.37083586780051e-10	130694393	130694393
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.4857	1.37083586780051e-10	130694393	130694393	9.6405567121205e-12	130701040	130701040
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132287226	643	629	-0.0116	9.6405567121205e-12	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132289090	132289090	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7191	-0.0022	NA	NA	NA	8.69481394952868e-16	37953582	37953582
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.7522	8.69481394952868e-16	37953582	37953582	1.08220033747259e-16	37957844	37957844
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4754	-0.0038	1.08220033747259e-16	37957844	37957844	5.3749168852615e-51	49964838	49964838
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.0345	5.3749168852615e-51	49964838	49964838	2.81004329567890e-46	49971732	49971732
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	71375082	5442	5315	-0.0112	2.8100432956789e-46	49971732	49971732	3.04159838930097e-91	71375082	71375082
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.2415	3.04159838930097e-91	71375082	71375082	1.10843544195057e-95	71377671	71377671
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4518	-0.0037	1.10843544195057e-95	71377671	71377671	3.65003368558963e-173	89659397	89659397
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-5.6937	3.65003368558963e-173	89659397	89659397	9.02897743940903e-175	89662326	89662326
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9136	-0.0094	9.02897743940903e-175	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	0.3001	NA	NA	NA	0.00887334942534549	18508651	19442895
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19535787	56	52	0.6884	0.0088733494253455	18508651	19442895	6.72854664717663e-64	19497023	19540294
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19538610	106358491	31823	31150	0.0012	6.72854664717663e-64	19497023	19540294	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	100298352	31322	30631	-0.0046	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2600740	1013	992	0.0271	NA	NA	NA	1.67748811821177e-109	2600740	2638581
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	-4.2329	1.67748811821177e-109	2600740	2638581	1.93625538089579e-140	2638643	2639798
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	27499312	8212	8041	0.0113	1.93625538089579e-140	2638643	2639798	1.05377423268316e-07	27497844	27499312
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	27501247	27505768	3	3	-1.0159	1.05377423268316e-07	27497844	27499312	8.41617481573007e-08	27505768	27507566
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	27507566	54340649	4462	4350	0.0131	8.41617481573007e-08	27505768	27507566	7.50482469612581e-09	54331124	54353978
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54343465	54379839	13	12	-0.5273	7.50482469612581e-09	54331124	54353978	9.7051618890689e-07	54368717	54390060
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54402057	4	4	0.6947	9.7051618890689e-07	54368717	54390060	0.00043014165236273	54399890	54410800
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	88690571	11947	11683	0.0051	0.00043014165236273	54399890	54410800	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11727	0.0159	NA	NA	NA	1.59166119892651e-07	31431640	31468896
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31889566	20	20	-0.3856	1.59166119892651e-07	31431640	31468896	3.29197558480871e-08	31492553	31906639
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31891535	36673853	1814	1778	0.0194	3.29197558480871e-08	31492553	31906639	3.62809348455273e-278	36673853	36673853
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-4.1857	3.62809348455273e-278	36673853	36673853	7.45469890580647e-280	36684619	36684619
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	52440878	5558	5445	0.0235	7.45469890580647e-280	36684619	36684619	1.44578582354109e-07	52438207	52440878
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52454171	4	4	-0.8443	1.44578582354109e-07	52438207	52440878	3.66554547019049e-07	52454171	52455229
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52455229	78653545	10195	9953	0.0217	3.66554547019049e-07	52454171	52455229	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15841	-0.0086	NA	NA	NA	6.1844860021444e-10	53092949	53092949
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	1.385	6.1844860021444e-10	53092949	53092949	8.1883116874833e-10	53099601	53099601
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6613	-0.0222	8.1883116874833e-10	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	63788698	23059	22576	0.0356	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	573	-0.0237	NA	NA	NA	6.35575242928447e-196	1506379	1506379
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-3.1307	6.35575242928447e-196	1506379	1506379	6.43500125970264e-230	1531162	1531162
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20520	0	6.43500125970264e-230	1531162	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13155	-0.0051	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2925	0.0321	NA	NA	NA	3.73903697260696e-44	22644243	22679305
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	20	1.0003	3.73903697260696e-44	22644243	22679305	6.2902725089576e-50	22718614	22721042
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6401	0.0128	6.2902725089576e-50	22718614	22721042	6.63509816357707e-12	35472378	35472378
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.5646	6.63509816357707e-12	35472378	35472378	3.98730549482568e-11	35476942	35476942
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37685496	1211	1185	0.0398	3.98730549482568e-11	35476942	35476942	1.43566591504635e-27	37683516	37689058
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.8044	1.43566591504635e-27	37683516	37689058	3.52947051150805e-26	37715370	37718669
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5658	0.0138	3.52947051150805e-26	37715370	37718669	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1427392	787	759	0.0112	NA	NA	NA	3.31088210210052e-11	1427338	1431240
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.0482	3.31088210210052e-11	1427338	1431240	8.70951228451644e-12	1432891	1434970
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	967	-0.0071	8.70951228451644e-12	1432891	1434970	0	2708113	2711273
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	19375467	6473	6338	0.9771	0	2708113	2711273	6.78462601039877e-09	19375467	19375467
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19376772	19378637	2	2	-0.4333	6.78462601039877e-09	19375467	19375467	5.29463869109408e-09	19378637	19378637
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19381726	76998610	16464	16112	0.9864	5.29463869109408e-09	19378637	19378637	1.06968512989268e-07	76998610	76998610
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.3091	1.06968512989268e-07	76998610	76998610	7.75569841567061e-08	77010018	77014050
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	111597886	8777	8599	0.9806	7.75569841567061e-08	77010018	77014050	4.40851297008324e-16	111591635	111597886
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111598647	111621331	7	7	-0.0151	4.40851297008324e-16	111591635	111597886	4.90341026980088e-16	111621331	111641549
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111641549	154442377	13377	13131	0.981	4.90341026980088e-16	111621331	111641549	1.47104527988392e-41	154442377	154442377
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	3.3953	1.47104527988392e-41	154442377	154442377	1.91740254158654e-67	154450309	154450309
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	1.0964	1.91740254158654e-67	154450309	154450309	2.93518951903679e-93	154582414	154586690
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	-0.0618	2.93518951903679e-93	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2721922	10	10	-5.1581	NA	NA	NA	0.103243506070141	2716461	2807441
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2722729	2856959	53	53	-4.202	0.103243506070141	2716461	2807441	0.000141417877886529	2797460	2870982
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2858235	3223585	60	58	-4.9928	0.000141417877886529	2797460	2870982	1.24803060309874e-36	3219200	3772482
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	17	-1.5964	1.24803060309874e-36	3219200	3772482	5.30087394078775e-19	4948824	6652845
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	174	-4.4129	5.30087394078775e-19	4948824	6652845	8.87444719591084e-08	7020318	7196517
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	125	-3.5472	8.87444719591084e-08	7020318	7196517	5.81147517597375e-05	7346510	7614417
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	74	-4.4073	5.81147517597375e-05	7346510	7614417	0.0434694251556531	7665429	7911990
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7997485	77	76	-3.8411	0.0434694251556531	7665429	7911990	8.59472187010008e-06	7859390	8106151
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	10515697	371	362	-4.5071	8.59472187010008e-06	7859390	8106151	8.20870651125107e-42	10513747	10535786
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	15	-0.9655	8.20870651125107e-42	10513747	10535786	4.4468399063883e-10	10655750	12514978
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	11698871	1	0	NA	4.4468399063883e-10	10655750	12514978	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12999095	148	144	-3.7107	NA	NA	NA	6.07437152994366e-05	12965878	13007725
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13040293	18	18	-1.9463	6.07437152994366e-05	12965878	13007725	1.9568023159659e-05	13029929	13052633
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13128515	35	35	-3.3435	1.9568023159659e-05	13029929	13052633	5.65023627484763e-11	13111594	13146483
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13553112	185	176	-4.5098	5.65023627484763e-11	13111594	13146483	0.00210393521245199	13489773	13570660
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13555650	13716000	35	34	-3.8774	0.00210393521245199	13489773	13570660	4.32697247221511e-06	13691319	13779192
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	14359748	197	195	-4.6884	4.32697247221511e-06	13691319	13779192	1.11950264856304e-08	14358464	14359748
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14368151	3	3	-1.5808	1.11950264856304e-08	14358464	14359748	1.4005239056011e-06	14368151	14370346
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14370346	14404979	19	19	-4.6964	1.4005239056011e-06	14368151	14370346	0.0121041202831946	14383746	14444446
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14407293	14407293	1	0	NA	0.0121041202831946	14383746	14444446	NA	NA	NA
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14484126	47	47	-3.6578	NA	NA	NA	0.0390476782789437	14423860	14488060
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14484920	14508021	18	16	-4.6147	0.0390476782789437	14423860	14488060	1.00075241276965e-06	14506319	14530328
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	26	-2.4278	1.00075241276965e-06	14506319	14530328	2.80687190018484e-20	14559651	14587291
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	19610243	956	935	-4.4393	2.80687190018484e-20	14559651	14587291	3.37906706104971e-06	19608039	19610243
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.4588	3.37906706104971e-06	19608039	19610243	2.99300093032117e-09	19613864	19614809
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22139807	559	545	-4.6309	2.99300093032117e-09	19613864	19614809	1.97093433727388e-08	22052726	22158616
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22178964	10	10	-2.8351	1.97093433727388e-08	22052726	22158616	6.23542410922216e-07	22176501	22192409
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	25737663	94	92	-4.7004	6.23542410922216e-07	22176501	22192409	3.85656481384368e-54	23283689	26870361
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	31	-1.3904	3.85656481384368e-54	23283689	26870361	3.79616511760208e-06	26941769	26980386
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27003308	12	12	-3.638	3.79616511760208e-06	26941769	26980386	3.05665262538074e-05	26990807	27019306
MSK_252152912382_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	57440809	41	38	-1.1595	3.05665262538074e-05	26990807	27019306	NA	NA	NA
