Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16838573	5788	5652	0.0255	NA	NA	NA	2.20114516531453e-14	16817525	16838573
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16888048	16926444	5	5	-0.9637	2.20114516531453e-14	16817525	16838573	6.99976525313493e-14	16926444	16961001
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16961001	72536231	22100	21558	0.0084	6.99976525313493e-14	16926444	16961001	4.95898466242322e-102	72536231	72536231
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72537426	72537426	1	0	NA	4.95898466242322e-102	72536231	72536231	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	1.542	NA	NA	NA	7.79362657857882e-107	72579311	72579311
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	94060783	6990	6823	-0.0037	7.79362657857882e-107	72579311	72579311	4.16137784169419e-91	94060783	94060783
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-3.7779	4.16137784169419e-91	94060783	94060783	1.24774140219976e-93	94062928	94062928
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	103899771	3111	3043	-1e-04	1.24774140219976e-93	94062928	94062928	8.6278591039209e-12	103842977	103906464
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103901454	103962495	17	17	0.4707	8.6278591039209e-12	103842977	103906464	6.23984513450863e-12	103932025	104109172
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	108533257	1008	987	-0.0075	6.23984513450863e-12	103932025	104109172	9.29717837835871e-282	108533257	108533257
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-5.4166	9.29717837835871e-282	108533257	108533257	1.08944890714386e-264	108538662	108538662
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	110023268	572	555	-0.0063	1.08944890714386e-264	108538662	108538662	2.73679330781951e-39	110023268	110023268
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	1.8153	2.73679330781951e-39	110023268	110023268	7.14593329659084e-43	110041712	110041712
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147306304	4556	4431	-0.0073	7.14593329659084e-43	110041712	110041712	3.01266862394068e-45	146297175	147308557
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147510532	35	32	0.6557	3.01266862394068e-45	146297175	147308557	9.65921892948869e-39	147508217	147847659
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150819879	1258	1216	0.0232	9.65921892948869e-39	147508217	147847659	4.65682802548627e-37	150818222	150819879
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	1.0262	4.65682802548627e-37	150818222	150819879	9.91542613968537e-42	150852858	150857070
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151026228	77	73	0.0154	9.91542613968537e-42	150852858	150857070	1.79167693055260e-10	151024118	151026228
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151032967	2	2	1.1507	1.7916769305526e-10	151024118	151026228	1.4558545731852e-07	151032967	151036435
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151033188	151033188	1	0	NA	1.4558545731852e-07	151032967	151036435	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151036435	157133150	2680	2616	0.0181	NA	NA	NA	2.59983316658505e-125	157133150	157133150
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-4.4445	2.59983316658505e-125	157133150	157133150	6.03845855467707e-127	157136342	157136342
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	11042	-0.0062	6.03845855467707e-127	157136342	157136342	1.11726123997242e-08	185973975	185979586
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.2004	1.11726123997242e-08	185973975	185979586	2.36430465229936e-09	185988138	185988138
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1447	-0.0015	2.36430465229936e-09	185988138	185988138	3.27190186319626e-08	192712721	192715640
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	1.1284	3.27190186319626e-08	192712721	192715640	2.69585240446454e-09	192719540	192719540
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	194978218	476	462	-0.004	2.69585240446454e-09	192719540	192719540	5.6939588931305e-26	194977713	195011344
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.9013	5.6939588931305e-26	194977713	195011344	3.65134137482782e-22	195048208	195091758
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	246928454	19526	19065	0.0017	3.65134137482782e-22	195048208	195091758	3.09442085997658e-16	246926903	246928454
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246931601	246931601	1	0	NA	3.09442085997658e-16	246926903	246928454	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246933929	246940630	5	5	-1.042	NA	NA	NA	1.73346626391753e-22	246940630	246940630
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246941904	247186514	73	72	0.0066	1.73346626391753e-22	246940630	246940630	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11235	-0.0016	NA	NA	NA	2.51069778072610e-56	34542224	34543992
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	0.9813	2.5106977807261e-56	34542224	34543992	5.59062648005309e-57	34589997	34591681
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35553983	381	374	0.0018	5.59062648005309e-57	34589997	34591681	7.8779040507146e-06	35552710	35553983
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35556102	35562007	2	2	-0.9465	7.8779040507146e-06	35552710	35553983	1.7497717366189e-06	35562007	35564203
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35564203	36185671	243	236	-0.0293	1.7497717366189e-06	35562007	35564203	9.00239109276498e-14	36185671	36185671
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	36189813	36192912	2	2	-1.353	9.00239109276498e-14	36185671	36185671	4.26478087921831e-11	36192912	36192912
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	36199329	131914089	28161	27428	-0.001	4.26478087921831e-11	36192912	36192912	1.66393010178071e-11	131914089	131914089
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131921816	131925547	3	3	-1.1235	1.66393010178071e-11	131914089	131914089	3.29857067423753e-11	131925547	131925547
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131933903	242689978	37495	36544	-0.0044	3.29857067423753e-11	131925547	131925547	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	46769081	15925	15542	-0.0043	NA	NA	NA	1.12432556328924e-20	46767765	46769081
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.9123	1.12432556328924e-20	46767765	46769081	1.15910381916816e-20	46825048	46827727
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	56582241	4208	4100	0.023	1.15910381916816e-20	46825048	46827727	1.23052262201453e-13	56582241	56582241
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	56583582	56594585	3	3	-1.2261	1.23052262201453e-13	56582241	56582241	3.84155391352043e-14	56594585	56594585
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	56598693	75803353	6739	6593	-0.0136	3.84155391352043e-14	56594585	56594585	1.20061280317793e-09	75791158	75857081
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75845446	75875904	11	11	0.5153	1.20061280317793e-09	75791158	75857081	1.20916411353585e-08	75870144	76013273
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	164005577	26597	25940	-0.0065	1.20916411353585e-08	75870144	76013273	1.37628342615261e-38	164005577	164005577
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.5627	1.37628342615261e-38	164005577	164005577	5.01634067298925e-37	164027724	164027724
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-0.4595	5.01634067298925e-37	164027724	164027724	5.47284563236059e-13	164086905	164123806
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9874	-8e-04	5.47284563236059e-13	164086905	164123806	0	194354505	194354505
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.9833	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196835413	997	974	-0.0059	0	194366950	194366950	3.64252227382276e-08	196805434	196911055
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196929826	20	18	-0.4095	3.64252227382276e-08	196805434	196911055	2.47830122203563e-08	196924340	196950095
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	199329592	963	940	0.0032	2.47830122203563e-08	196924340	196950095	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	107156970	31113	30364	-0.0053	NA	NA	NA	2.18114117086198e-08	107155095	107156970
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107159916	107161814	2	2	-1.2013	2.18114117086198e-08	107155095	107156970	6.36349671160278e-09	107161814	107161814
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107163423	138307863	7847	7637	-0.005	6.36349671160278e-09	107161814	107161814	6.86638506756784e-09	138307863	138307863
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-1.1992	6.86638506756784e-09	138307863	138307863	8.80288172822096e-09	138319409	138319409
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	173660684	10871	10628	-0.0073	8.80288172822096e-09	138319409	138319409	1.67765139232401e-27	173660684	173660684
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	2.0452	1.67765139232401e-27	173660684	173660684	7.94997250310267e-27	173666072	173666072
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5184	-0.0018	7.94997250310267e-27	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	341610	72	72	-0.0391	NA	NA	NA	8.6587486256184e-59	332285	360041
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	358234	686701	127	123	0.5626	8.6587486256184e-59	332285	360041	3.62596868238733e-131	681141	690545
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	32144814	8533	8341	-0.0068	3.62596868238733e-131	681141	690545	3.79235999448931e-32	32139800	32149912
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32146491	32228793	41	40	0.4894	3.79235999448931e-32	32139800	32149912	6.60460515472275e-31	32224052	32234873
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32230421	42662906	3436	3348	-0.0121	6.60460515472275e-31	32224052	32234873	2.88371161627225e-17	42662906	42662906
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	42664919	42666538	2	2	-1.6961	2.88371161627225e-17	42662906	42662906	6.37261659758728e-18	42666538	42666538
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	42667950	180187846	41431	40388	-0.0016	6.37261659758728e-18	42666538	42666538	9.94516439190047e-08	180178589	180194323
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180189516	180364670	14	13	-0.4551	9.94516439190047e-08	180178589	180194323	4.35573832041809e-06	180355807	180391341
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180365950	180644810	110	108	-0.0031	4.35573832041809e-06	180355807	180391341	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	186875	37	36	-0.0022	NA	NA	NA	9.55216756568091e-08	173437	212208
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	191387	322557	62	57	-0.3448	9.5521675656809e-08	173437	212208	8.50574896927709e-23	303353	332608
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	323898	32548736	11577	11284	0.0074	8.50574896927709e-23	303353	332608	1.42391626638470e-193	32548736	32563252
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	8	-2.6993	1.4239162663847e-193	32548736	32563252	3.6323071361985e-06	32588005	32609525
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32756637	56	56	-0.6294	3.6323071361985e-06	32588005	32609525	5.6591871238593e-64	32685188	32758904
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32758904	54035000	8249	8012	0.0046	5.6591871238593e-64	32685188	32758904	2.31935948359934e-157	54035000	54035000
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.0644	2.31935948359934e-157	54035000	54035000	1.84199171372052e-165	54042734	54042734
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79018959	6432	6260	-0.0046	1.84199171372052e-165	54042734	54042734	9.93541521053802e-08	78999263	79032059
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79024557	1	0	NA	9.93541521053802e-08	78999263	79032059	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79028813	79091850	12	12	0.4521	NA	NA	NA	5.74252299172811e-08	79085247	79112799
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6608	-0.0116	5.74252299172811e-08	79085247	79112799	7.6469324930121e-16	103841482	103841482
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0988	7.6469324930121e-16	103841482	103841482	1.81373935854857e-15	103868154	103873584
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	10222	-0.0031	1.81373935854857e-15	103868154	103873584	4.63097889753717e-12	134627341	134629897
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-0.9828	4.63097889753717e-12	134627341	134629897	7.36030372514716e-12	134635779	134639397
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	165643653	10622	10358	-0.0075	7.36030372514716e-12	134635779	134639397	1.50315672679864e-254	165643653	165643653
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.416	1.50315672679864e-254	165643653	165643653	2.99722809521356e-222	165650610	165650610
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1770	-0.0296	2.99722809521356e-222	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	12480592	4158	4065	0.0055	NA	NA	NA	7.80734131656133e-15	12475643	12482458
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	12482458	12531133	18	18	0.5224	7.80734131656133e-15	12475643	12482458	1.14705798872590e-15	12529253	12536850
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	12532508	51348670	13695	13374	-0.0054	1.1470579887259e-15	12529253	12536850	4.39192323977348e-11	51348670	51348670
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	51350959	51352821	2	2	1.3397	4.39192323977348e-11	51348670	51348670	4.85094174872873e-10	51352821	51352821
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	51355060	71894353	3914	3809	0.0187	4.85094174872873e-10	51352821	51352821	1.70130445471731e-38	71894353	71894353
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71911940	71912065	2	2	-2.5489	1.70130445471731e-38	71894353	71894353	1.53738114904692e-40	71912065	71912065
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	71914572	100166257	9274	9059	0.0051	1.53738114904692e-40	71912065	71912065	5.4569320481863e-08	100164752	100166257
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100171204	2	2	-0.9891	5.4569320481863e-08	100164752	100166257	1.35834591465342e-05	100171204	100174991
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100174991	109217320	3896	3786	0.012	1.35834591465342e-05	100171204	100174991	2.83045735584643e-239	109217320	109217320
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-5.1037	2.83045735584643e-239	109217320	109217320	6.06536742324558e-06	109233214	109233214
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	109240210	2	2	-1.6819	6.06536742324558e-06	109233214	109233214	2.15690666224608e-17	109240210	109240210
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	133417179	11123	10842	-0.0071	2.15690666224608e-17	109240210	109240210	1.85502292297150e-07	133404118	133426938
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133418420	133455682	16	16	0.3914	1.8550229229715e-07	133404118	133426938	2.87809180757528e-07	133444486	133465974
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133456873	141410894	3698	3592	0.0087	2.87809180757528e-07	133444486	133465974	9.91770248084127e-28	141409512	141414719
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-0.7705	9.91770248084127e-28	141409512	141414719	1.22276663562171e-18	141435643	141443577
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	112	-0.0104	1.22276663562171e-18	141435643	141443577	1.01088220598745e-189	141690753	141690753
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	7	-3.8916	1.01088220598745e-189	141690753	141690753	1.77719228676586e-162	141711513	141711513
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	141890215	71	66	0.0437	1.77719228676586e-162	141711513	141711513	1.20914940949028e-10	141882706	141892876
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141892876	141904745	4	4	-0.976	1.20914940949028e-10	141882706	141892876	3.54072945869873e-10	141902417	141908206
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141908206	143503317	586	572	0.0088	3.54072945869873e-10	141902417	141908206	4.20435523395338e-30	143503317	143503317
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-1.9115	4.20435523395338e-30	143503317	143503317	1.22816486509432e-35	143584350	143584350
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	147702365	1850	1795	6e-04	1.22816486509432e-35	143584350	143584350	1.3090073402128e-143	147702365	147702365
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-4.6662	1.3090073402128e-143	147702365	147702365	9.56810296238677e-130	147707161	147707161
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4134	-0.0132	9.56810296238677e-130	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	8434128	2494	2430	-0.0083	NA	NA	NA	1.63041070706327e-07	8427198	8434128
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8437290	8453194	4	4	-0.7688	1.63041070706327e-07	8427198	8434128	7.07333327844212e-10	8453194	8457416
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8457416	9533226	386	375	0.018	7.07333327844212e-10	8453194	8457416	5.19745457375067e-12	9533226	9533226
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	3	-0.98	5.19745457375067e-12	9533226	9533226	1.65784793545238e-08	9538031	9539424
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	25120552	5272	5147	-0.0074	1.65784793545238e-08	9538031	9539424	1.88472817723605e-43	25120552	25120552
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	1.88472817723605e-43	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-2.6247	NA	NA	NA	4.26525168612056e-44	25125700	25125700
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39352361	4913	4779	0.003	4.26525168612056e-44	25125700	25125700	1.08904271387227e-29	39339800	39367542
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39354149	39516978	63	62	-0.3887	1.08904271387227e-29	39339800	39367542	3.64647734971945e-29	39505256	39538268
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39528069	51191560	2174	2116	0.0078	3.64647734971945e-29	39505256	39538268	4.86627852270894e-07	51189068	51191560
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	4.86627852270894e-07	51189068	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-0.8857	NA	NA	NA	2.57791135851492e-07	51200291	51202490
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51386469	72	69	0.039	2.57791135851492e-07	51200291	51202490	3.41233706522729e-08	51383626	51386469
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51389250	51390466	2	2	-1.1485	3.41233706522729e-08	51383626	51386469	8.06115945510988e-08	51390466	51392561
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51392561	144968840	28723	28008	-0.0037	8.06115945510988e-08	51390466	51392561	8.1647634974518e-09	144968840	144968840
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.2035	8.1647634974518e-09	144968840	144968840	3.15406199313654e-07	144970777	144972090
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	441	0.0249	3.15406199313654e-07	144970777	144972090	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5344	-0.003	NA	NA	NA	6.13226354455389e-17	15802255	15802255
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.634	6.13226354455389e-17	15802255	15802255	1.27088452706783e-16	15807123	15807123
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2309	-0.0133	1.27088452706783e-16	15807123	15807123	2.22343795970709e-15	22477358	22477358
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.5737	2.22343795970709e-15	22477358	22477358	7.87059468157216e-16	22492603	22492603
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5091	-0.0016	7.87059468157216e-16	22492603	22492603	1.51076929168261e-08	70926188	70926188
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.1735	1.51076929168261e-08	70926188	70926188	2.00834421489495e-08	70930528	70930528
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	95532782	8130	7932	-0.0043	2.00834421489495e-08	70930528	70930528	4.10666365537458e-08	95527435	95532782
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	95541017	95562897	2	2	-1.1617	4.10666365537458e-08	95527435	95532782	1.13510488965396e-07	95562897	95567432
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	95567432	140145683	16738	16327	0.0035	1.13510488965396e-07	95562897	95567432	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	5928266	2107	2055	-0.0121	NA	NA	NA	2.14153859792091e-11	5928266	5928266
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	5932300	5934406	2	2	1.2921	2.14153859792091e-11	5928266	5928266	4.0733822738276e-10	5934406	5934406
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	5936486	45487335	12347	12061	-6e-04	4.0733822738276e-10	5934406	5934406	1.3232988506059e-46	45476905	46389734
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	45489823	46568496	73	70	-0.4577	1.3232988506059e-46	45476905	46389734	1.27329557864901e-43	46554074	47057097
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47017598	70949263	7146	6969	-0.006	1.27329557864901e-43	46554074	47057097	2.48216066567269e-13	70947915	70949263
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-1.0642	2.48216066567269e-13	70947915	70949263	5.31636778433039e-15	70960187	70960187
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2841	0.0167	5.31636778433039e-15	70960187	70960187	4.93589741465604e-29	77917893	77917893
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.7366	4.93589741465604e-29	77917893	77917893	5.42365708005525e-28	77928738	77928738
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	100676022	7762	7561	0.004	5.42365708005525e-28	77928738	77928738	2.13959749373254e-14	100676022	100676022
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-1.0841	2.13959749373254e-14	100676022	100676022	1.00478626290171e-13	100686787	100693036
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	135285645	12447	12136	-0.0057	1.00478626290171e-13	100686787	100693036	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1723	-6e-04	NA	NA	NA	0	4923300	4923300
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-5.3563	0	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	18896166	5595	5446	-0.0066	0	4932214	4932214	5.07573264150033e-27	18892456	18896166
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-1.2232	5.07573264150033e-27	18892456	18896166	4.96736130114392e-28	18917191	18917191
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	25556811	2051	2004	-0.0061	4.96736130114392e-28	18917191	18917191	3.95175726650195e-20	25555305	25565913
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25561757	25561757	1	0	NA	3.95175726650195e-20	25555305	25565913	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25565913	25579086	7	7	-0.9649	NA	NA	NA	4.24546308302244e-20	25577345	25582814
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	25582814	55118214	7468	7269	0.0024	4.24546308302244e-20	25577345	25582814	3.34343969017614e-18	55097806	55123719
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55178955	22	21	0.5349	3.34343969017614e-18	55097806	55123719	6.10862137505473e-05	55173374	55178955
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55180693	55187282	5	5	0.9809	6.10862137505473e-05	55173374	55178955	7.48414167762245e-06	55187282	55193014
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55190146	55209626	12	11	0.4331	7.48414167762245e-06	55187282	55193014	1.7148464448054e-05	55205278	55231935
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	66463477	4638	4522	0.0187	1.7148464448054e-05	55205278	55231935	7.61597122001874e-12	66463477	66463477
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.4086	7.61597122001874e-12	66463477	66463477	4.31086123671264e-12	66469412	66469412
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	23125	-0.0056	4.31086123671264e-12	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	3220946	1431	1404	0.0185	NA	NA	NA	1.75085055800796e-13	3219407	3225183
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	3222505	3228225	4	4	-1.0269	1.75085055800796e-13	3219407	3225183	3.01686618003459e-12	3225183	3230558
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	3230558	11116883	2894	2821	-8e-04	3.01686618003459e-12	3225183	3230558	0	11116883	11116883
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11130871	6	6	-4.2304	0	11116883	11116883	0	11130871	11130871
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	130943064	40274	39313	0.0043	0	11130871	11130871	1.40799362268204e-13	130943064	130943064
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.5115	1.40799362268204e-13	130943064	130943064	9.9324513085109e-12	130946248	130946248
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	540	0.0022	9.9324513085109e-12	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33028007	5594	5454	-0.0017	NA	NA	NA	5.51866220574262e-08	33026172	33028007
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33030946	33042557	4	4	-0.8024	5.51866220574262e-08	33026172	33028007	2.50292887088276e-07	33042557	33049401
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33046417	37953582	1740	1700	-0.013	2.50292887088276e-07	33042557	33049401	4.93292391541421e-15	37953582	37953582
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.5604	4.93292391541421e-15	37953582	37953582	5.9817076102165e-16	37957844	37957844
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4758	2e-04	5.9817076102165e-16	37957844	37957844	8.46534891610976e-141	49964838	49964838
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-4.5529	8.46534891610976e-141	49964838	49964838	2.07535506148296e-127	49971732	49971732
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1760	-0.0054	2.07535506148296e-127	49971732	49971732	1.70841036316651e-06	56602818	56660235
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56685341	14	13	0.4124	1.70841036316651e-06	56602818	56660235	3.46154879296529e-07	56680346	56697807
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	68142120	2694	2630	-0.0131	3.46154879296529e-07	56680346	56697807	1.93317120925767e-23	68138912	68142120
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	9	-0.9155	1.93317120925767e-23	68138912	68142120	9.84943671660994e-24	68163523	68167758
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	114123340	14900	14517	-0.0081	9.84943671660994e-24	68163523	68167758	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34674458	5750	5595	0.0067	NA	NA	NA	2.43576444426125e-07	34665545	34674458
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	0.9242	2.43576444426125e-07	34665545	34674458	2.05843938226980e-08	34683810	34685308
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1856	0.001	2.0584393822698e-08	34683810	34685308	0	40676611	40676611
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-6.0101	0	40676611	40676611	0	40722360	40722360
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	43557798	524	516	-0.0088	0	40722360	40722360	2.85561320623062e-14	43555063	43557798
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	43569142	43597665	6	6	-0.9457	2.85561320623062e-14	43555063	43557798	3.76545247941605e-16	43597665	43607609
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	43607609	105948347	23541	23004	0.0011	3.76545247941605e-16	43597665	43607609	5.66616387225352e-11	105923686	105964382
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	12	-0.5582	5.66616387225352e-11	105923686	105964382	2.09723283300932e-08	105973615	105998412
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106214372	92	92	0.0072	2.09723283300932e-08	105973615	105998412	6.33203384547387e-07	106196705	106218059
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	18	-0.3853	6.33203384547387e-07	106196705	106218059	1.60237961815802e-05	106251081	106284363
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	-0.0155	1.60237961815802e-05	106251081	106284363	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1346	NA	NA	NA	4.09436292442896e-05	18432558	18818949
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20308014	152	137	-0.5288	4.09436292442896e-05	18432558	18818949	1.96445294382763e-120	20053008	20316992
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	56244772	13369	13043	-0.003	1.96445294382763e-120	20053008	20316992	1.12685604818926e-08	56242903	56249063
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56246737	56252577	4	4	-0.8578	1.12685604818926e-08	56242903	56249063	1.20816195842972e-08	56249063	56254799
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	56254799	100298352	17792	17361	5e-04	1.20816195842972e-08	56249063	56254799	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	756456	283	269	0.0402	NA	NA	NA	7.65304903405971e-12	756456	756456
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	759120	764070	2	2	-1.4365	7.65304903405971e-12	756456	756456	1.84191173775780e-12	764070	764070
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	768304	32481309	10289	10044	0.0223	1.8419117377578e-12	764070	764070	5.18187380731101e-18	31842335	32521360
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32513457	33647856	45	44	-0.3489	5.18187380731101e-18	31842335	32521360	1.76873624732489e-17	33528385	34056516
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	75093957	9904	9639	0.0099	1.76873624732489e-17	33528385	34056516	1.24952743656225e-23	75093957	75093957
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-1.9382	1.24952743656225e-23	75093957	75093957	3.27996238690931e-22	75100865	75100865
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	589	-0.0235	3.27996238690931e-22	75100865	75100865	4.25468085050167e-43	76925748	76925748
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	1.2589	4.25468085050167e-43	76925748	76925748	1.12704705000436e-37	76940218	76940218
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4402	-0.0013	1.12704705000436e-37	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13521	0.0218	NA	NA	NA	0	36673853	36673853
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-4.4567	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41007660	1808	1752	0.041	0	36684619	36684619	3.29844563989435e-09	40874079	41007660
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41011530	41031191	5	4	-0.8483	3.29844563989435e-09	40874079	41007660	1.7481979758873e-07	41031191	41062669
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41501967	190	185	0.0418	1.7481979758873e-07	41031191	41062669	3.70346137540199e-05	41475011	41512318
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41504832	41566540	29	27	-0.2513	3.70346137540199e-05	41475011	41512318	1.01736214967090e-16	41562786	41572001
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	46	-0.6751	1.0173621496709e-16	41562786	41572001	7.6967066116392e-69	41708551	42142363
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52440878	3480	3393	0.0143	7.6967066116392e-69	41708551	42142363	2.65258243599596e-14	52438207	52440878
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52454171	4	4	-1.0649	2.65258243599596e-14	52438207	52440878	2.71710734530597e-15	52454171	52455229
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52455229	54487113	910	895	0.0356	2.71710734530597e-15	52454171	52455229	1.61131430718882e-07	54485471	54487113
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54489161	54493030	3	3	0.9393	1.61131430718882e-07	54485471	54487113	4.75831064259308e-08	54493030	54496442
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54496442	55273077	364	352	0.0268	4.75831064259308e-08	54493030	54496442	2.09410770993771e-14	55270788	55275562
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55274375	55274375	1	0	NA	2.09410770993771e-14	55270788	55275562	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55274849	55285818	13	13	0.6156	NA	NA	NA	1.57811151627253e-13	55283671	55288933
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55288016	68605063	4774	4678	0.0188	1.57811151627253e-13	55283671	55288933	1.16986870158792e-08	68603537	68605063
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68607574	68613453	4	4	-0.8509	1.16986870158792e-08	68603537	68605063	3.74638290152857e-08	68613453	68615130
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68615130	78653545	4126	4016	0.0116	3.74638290152857e-08	68613453	68615130	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15816	-0.0076	NA	NA	NA	4.1995808296463e-94	53092949	53092949
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-3.7475	4.1995808296463e-94	53092949	53092949	5.31442227514793e-88	53099601	53099601
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6600	-0.0193	5.31442227514793e-88	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1395246	491	471	0.0415	NA	NA	NA	1.33577821833257e-08	1392959	1395246
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1398325	1398325	1	0	NA	1.33577821833257e-08	1392959	1395246	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.3778	NA	NA	NA	1.17254603343892e-09	1400840	1400840
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	63788698	22565	22007	0.0371	1.17254603343892e-09	1400840	1400840	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	574	-0.0136	NA	NA	NA	3.41344854182337e-44	1506379	1511632
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.1749	3.41344854182337e-44	1506379	1511632	6.38133716497902e-44	1531162	1532433
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	58998797	19499	18982	0.0025	6.38133716497902e-44	1531162	1532433	1.66656598016904e-09	58986759	58998797
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	59002447	59023253	9	8	0.6335	1.66656598016904e-09	58986759	58998797	2.23555117288601e-08	59023253	59035570
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	59025342	62419534	1475	1441	-0.0121	2.23555117288601e-08	59023253	59035570	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	22573420	3063	2985	-0.0058	NA	NA	NA	5.93258294777333e-11	22564705	22573420
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-1.0879	5.93258294777333e-11	22564705	22573420	6.8406359684075e-11	22585040	22589739
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	36789648	5479	5338	-0.0041	6.8406359684075e-11	22585040	22589739	1.62310203300518e-16	36789648	36789648
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.6165	1.62310203300518e-16	36789648	36789648	3.93959082398536e-16	36791668	36791668
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	44472935	3762	3671	0.0025	3.93959082398536e-16	36791668	36791668	8.34894300125634e-08	44472935	44472935
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44474243	44475718	2	2	-1.1392	8.34894300125634e-08	44472935	44472935	8.78893591804722e-07	44475718	44479688
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	44479688	46922972	1130	1093	-0.0082	8.78893591804722e-07	44475718	44479688	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	37621766	10742	10465	0.0188	NA	NA	NA	7.33666216822976e-26	37621766	37621766
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.0809	7.33666216822976e-26	37621766	37621766	2.36548939490357e-07	37626069	37626069
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	37685496	21	20	0.0935	2.36548939490357e-07	37626069	37626069	1.49595232193809e-88	37685496	37685496
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-4.9089	1.49595232193809e-88	37685496	37685496	0	37715385	37715385
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	49571068	5776	5647	0.0101	0	37715385	37715385	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2708291	1793	1742	0.0354	NA	NA	NA	0	2708113	2711273
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154442377	45102	43943	0.9696	0	2708113	2711273	2.89264487943903e-85	154442377	154442377
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	2	-2.9007	2.89264487943903e-85	154442377	154442377	3.02761568878693e-153	154450309	154450309
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	1.0786	3.02761568878693e-153	154450309	154450309	1.22833761347989e-103	154582414	154582414
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154586690	1	0	NA	1.22833761347989e-103	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154599547	154888224	200	192	-0.0257	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	120	-4.6705	NA	NA	NA	4.60719524424548e-29	3223585	3733715
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	4425391	9	9	-0.9018	4.60719524424548e-29	3223585	3733715	1.52965427256215e-15	4425391	4846477
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4431527	4431527	1	0	NA	1.52965427256215e-15	4425391	4846477	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4597974	7259689	235	231	-4.2612	NA	NA	NA	2.78136619196871e-05	7241740	7289497
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7261174	7304209	23	23	-2.9013	2.78136619196871e-05	7241740	7289497	1.86280187846874e-08	7277048	7313003
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	10513747	573	554	-4.3345	1.86280187846874e-08	7277048	7313003	6.68080249604142e-36	10512616	10515697
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	15	-0.9515	6.68080249604142e-36	10512616	10515697	4.29855259044262e-27	11660512	11673476
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12541506	13	13	-4.8119	4.29855259044262e-27	11660512	11673476	3.85413564303467e-05	12537944	12559410
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12590969	24	20	-2.4724	3.85413564303467e-05	12537944	12559410	1.42955732161475e-05	12563030	12604268
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12591908	13001517	113	112	-3.9164	1.42955732161475e-05	12563030	12604268	3.94216080577103e-08	12992839	13014163
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13004854	13058512	25	23	-2.3587	3.94216080577103e-08	12992839	13014163	0.0216592661952848	13022741	13089124
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13059372	13114169	23	20	-3.3548	0.0216592661952848	13022741	13089124	0.000186970406847496	13106723	13114169
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13114969	13128515	4	4	-1.2984	0.000186970406847496	13106723	13114169	1.68250578799248e-06	13128515	13129843
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13256555	43	42	-4.1535	1.68250578799248e-06	13128515	13129843	0.000842182335367932	13159901	13330707
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	14358464	373	362	-4.7537	0.000842182335367932	13159901	13330707	1.50235579561303e-09	14326935	14413754
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	86	-4.025	1.50235579561303e-09	14326935	14413754	3.72881907158264e-06	14491287	14539230
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	25	-2.4989	3.72881907158264e-06	14491287	14539230	2.04708183560451e-17	14559651	14597771
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	402	-4.5079	2.04708183560451e-17	14559651	14597771	0.00546353817736384	15713288	15928904
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15982684	23	20	-3.5934	0.00546353817736384	15713288	15928904	2.69854851010063e-09	15979526	15987432
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15985027	16017681	14	13	-4.8189	2.69854851010063e-09	15979526	15987432	0.000413728889525346	16015301	16042014
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16018437	16018437	1	0	NA	0.000413728889525346	16015301	16042014	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16019249	16083793	29	26	-3.4468	NA	NA	NA	1.27892865121572e-07	16065378	16094964
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16085263	17083649	199	196	-4.5689	1.27892865121572e-07	16065378	16094964	8.94415436107502e-06	17062567	17083649
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17087869	17101969	4	4	-2.2837	8.94415436107502e-06	17062567	17083649	2.50946599179052e-06	17101969	17113261
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17107617	17767311	113	108	-4.8926	2.50946599179052e-06	17101969	17113261	8.76981229536643e-05	17673986	17786688
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17772524	17772524	1	0	NA	8.76981229536643e-05	17673986	17786688	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17775484	17823594	22	22	-3.8617	NA	NA	NA	0.000604190950294144	17804686	17901399
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17824715	19610243	133	129	-4.6971	0.000604190950294144	17804686	17901399	2.57263937018777e-11	19610243	19610243
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.3694	2.57263937018777e-11	19610243	19610243	9.3065562383404e-08	19613864	19614809
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21036503	292	281	-4.6021	9.3065562383404e-08	19613864	19614809	2.52082347917237e-06	21034708	21036503
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21054519	6	5	-2.1629	2.52082347917237e-06	21034708	21036503	4.75488973430918e-10	21054519	21057446
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	4.75488973430918e-10	21054519	21057446	NA	NA	NA
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	22171771	266	256	-4.6985	NA	NA	NA	2.24860286623595e-07	22166564	22175425
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22175425	22179794	5	5	-2.5195	2.24860286623595e-07	22166564	22175425	8.6018565099568e-08	22179794	22182080
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22181855	25737663	93	89	-4.8779	8.6018565099568e-08	22179794	22182080	9.19651538720568e-71	23283689	26870361
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	27	-1.4426	9.19651538720568e-71	23283689	26870361	0.00113348238088485	26938967	27006628
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-3.064	0.00113348238088485	26938967	27006628	0.000527837439257778	27006628	27082748
MSK_252152912384_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	26	-0.9907	0.000527837439257778	27006628	27082748	NA	NA	NA
