Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27282	0.0164	NA	NA	NA	6.99114442088367e-17	72534975	72539143
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.7867	6.99114442088367e-17	72534975	72539143	2.44177223483506e-19	72571158	72596993
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	108533257	11128	10883	-0.0032	2.44177223483506e-19	72571158	72596993	4.03151715300631e-156	108533257	108535814
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-4.7817	4.03151715300631e-156	108533257	108535814	2.83924755728878e-135	108537259	108538662
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	109984914	556	545	0.0177	2.83924755728878e-135	108537259	108538662	8.37419270129496e-07	109983588	109984914
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109987341	109987341	1	0	NA	8.37419270129496e-07	109983588	109984914	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.2847	NA	NA	NA	7.72933395211217e-05	109989998	109994195
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110023268	13	13	-0.0885	7.72933395211217e-05	109989998	109994195	4.75967241244554e-05	110011494	110023268
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	-1.145	4.75967241244554e-05	110011494	110023268	2.36057432826062e-11	110041712	110058441
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	150819879	5849	5722	-0.0014	2.36057432826062e-11	110041712	110058441	3.22517574248382e-98	150819879	150819879
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	9	-2.1973	3.22517574248382e-98	150819879	150819879	7.2680147746556e-99	150851439	150851439
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2720	0.0241	7.2680147746556e-99	150851439	150851439	2.51664178225724e-104	157133150	157133150
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-4.7731	2.51664178225724e-104	157133150	157133150	4.62637866942447e-103	157136342	157136342
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	185979586	11325	11069	-0.0105	4.62637866942447e-103	157136342	157136342	5.48067546718073e-93	185979586	185979586
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-4.5367	5.48067546718073e-93	185979586	185979586	1.25039706056486e-85	185988138	185988138
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	187491701	259	256	0.0211	1.25039706056486e-85	185988138	185988138	7.86016895044787e-25	187482775	187499840
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	187495451	187604700	20	19	-0.8107	7.86016895044787e-25	187482775	187499840	2.1829803853129e-28	187594597	187614028
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	187614028	194978218	1690	1645	0.0066	2.1829803853129e-28	187594597	187614028	0	194978218	194978218
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195062793	8	7	-4.8669	0	194978218	194978218	0	195062793	195062793
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195065867	247186514	19606	19197	-0.0021	0	195062793	195062793	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	115249749	36130	35368	-0.0013	NA	NA	NA	1.65977530092128e-10	115247758	115249749
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115251898	115258615	5	5	-0.9985	1.65977530092128e-10	115247758	115249749	1.17773060860857e-12	115258615	115260545
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115260545	115796599	242	233	-0.0085	1.17773060860857e-12	115258615	115260545	3.05082096386306e-06	115785068	115811080
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115799330	115828114	13	13	0.4442	3.05082096386306e-06	115785068	115811080	1.59625667727532e-05	115819193	115847623
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115836143	117491798	356	348	-0.0107	1.59625667727532e-05	115819193	115847623	4.33017356658372e-36	117488436	117494730
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	117494730	117640394	17	17	0.9881	4.33017356658372e-36	117488436	117494730	4.55905284387674e-37	117628618	117649285
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	117649285	146571330	8311	8129	-0.0034	4.55905284387674e-37	117628618	117649285	0	146571330	146571330
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.9857	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2154	-0.008	0	146592775	146592775	2.32809315556933e-174	154601442	154601442
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-6.0278	2.32809315556933e-174	154601442	154601442	7.02024368365114e-165	154606943	154606943
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	214806793	20612	20191	-0.0076	7.02024368365114e-165	154606943	154606943	1.28747255463875e-07	214797479	214809649
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	214807911	214828017	11	11	0.5745	1.28747255463875e-07	214797479	214809649	2.34724352823016e-07	214824593	214842329
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	214828475	242689978	9921	9695	-0.0061	2.34724352823016e-07	214824593	214842329	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	164005577	53491	52296	-0.0051	NA	NA	NA	3.74542276200504e-26	164005577	164005577
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.5375	3.74542276200504e-26	164005577	164005577	1.64900688567597e-26	164027724	164027724
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	199329592	12136	11854	-0.006	1.64900688567597e-26	164027724	164027724	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3323	0.0229	NA	NA	NA	2.80866617291986e-194	9815760	9815760
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.6967	2.80866617291986e-194	9815760	9815760	5.76348201727533e-203	9842644	9842644
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	191153613	51764	50695	-0.0088	5.76348201727533e-203	9842644	9842644	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	217	0.0165	NA	NA	NA	2.46607729200434e-10	729262	737829
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	0.9092	2.46607729200434e-10	729262	737829	7.2875469887984e-12	829954	873365
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	8750027	2375	2306	-0.0113	7.2875469887984e-12	829954	873365	6.97279588876792e-10	8744438	8768055
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.8556	6.97279588876792e-10	8744438	8768055	5.31185692703686e-09	8782193	8809384
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	167012359	46049	45028	-0.0059	5.31185692703686e-09	8782193	8809384	4.17837566606749e-08	167010748	167012359
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167015034	167020614	4	4	-1	4.17837566606749e-08	167010748	167012359	4.51815042513062e-08	167020614	167022098
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167022098	180644810	5104	5010	0.0093	4.51815042513062e-08	167020614	167022098	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	40	-0.0153	NA	NA	NA	2.35783245576725e-30	198124	210326
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	326323	61	58	-0.7941	2.35783245576725e-30	198124	210326	1.37459054883277e-83	320854	327962
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	17482872	6025	5872	0.0028	1.37459054883277e-83	320854	327962	2.77857630347271e-28	17482872	17482872
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17486309	17488010	2	2	-2.5152	2.77857630347271e-28	17482872	17482872	4.59152235502686e-25	17488010	17488010
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17490237	18371831	410	398	-0.0154	4.59152235502686e-25	17488010	17488010	1.74833114385404e-10	18368026	18371831
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18373481	18378787	3	3	1.1911	1.74833114385404e-10	18368026	18371831	4.4779069321608e-11	18378787	18378787
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18380299	18594469	101	101	-0.016	4.4779069321608e-11	18378787	18378787	2.59385411986196e-08	18592593	18594469
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18597901	18600015	2	2	1.236	2.59385411986196e-08	18592593	18594469	7.11762464887165e-07	18600015	18605515
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18605515	26811016	2722	2660	-0.0108	7.11762464887165e-07	18600015	18605515	9.40740051171775e-11	26801068	26811016
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-1.1004	9.40740051171775e-11	26801068	26811016	7.55237164098897e-11	26861184	26863540
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	32548736	2306	2247	0.0334	7.55237164098897e-11	26861184	26863540	1.94098982360215e-43	32548736	32548736
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	8	1.6143	1.94098982360215e-43	32548736	32548736	4.07011761269623e-06	32593151	32609525
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32760574	58	58	0.4108	4.07011761269623e-06	32593151	32609525	2.86792371225254e-22	32703109	32775858
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32762061	165643653	42567	41652	-0.0024	2.86792371225254e-22	32703109	32775858	1.35527584323657e-171	165643653	165643653
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-4.9651	1.35527584323657e-171	165643653	165643653	1.04704324233477e-169	165649379	165649379
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	165650610	1	0	NA	1.04704324233477e-169	165649379	165649379	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1768	-0.0147	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	250	0.025	NA	NA	NA	1.69468890796934e-07	1038517	1038517
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	1.4492	1.69468890796934e-07	1038517	1038517	2.24486381326294e-08	1047707	1049599
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	118611324	39003	38153	-2e-04	2.24486381326294e-08	1047707	1049599	4.23064115959639e-167	118611324	118611324
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.9913	4.23064115959639e-167	118611324	118611324	1.15687057798797e-163	118620875	118620875
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3082	-0.0049	1.15687057798797e-163	118620875	118620875	4.38205031089053e-180	125831554	125831554
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-5.2273	4.38205031089053e-180	125831554	125831554	2.12122084108197e-178	125837524	125837524
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133417179	3648	3548	-0.0033	2.12122084108197e-178	125837524	125837524	3.32676866606833e-07	133405371	133426938
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133418420	133448277	14	13	0.5207	3.32676866606833e-07	133405371	133426938	1.06202140108718e-07	133443388	133459759
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3618	-0.0011	1.06202140108718e-07	133443388	133459759	4.59546528090389e-20	141409512	141417702
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-0.7978	4.59546528090389e-20	141409512	141417702	1.19474213647034e-18	141434131	141446728
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	156483966	5821	5707	-0.0037	1.19474213647034e-18	141434131	141446728	1.28028409302887e-06	156476426	156492262
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156497496	7	6	0.7389	1.28028409302887e-06	156476426	156492262	1.49201102146016e-06	156492262	156501951
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156498994	158821263	1050	1034	-0.0184	1.49201102146016e-06	156492262	156501951	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	117	-0.021	NA	NA	NA	3.52695263942012e-42	581533	581533
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.0651	3.52695263942012e-42	581533	581533	4.73194970295102e-42	588865	588865
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25120552	8038	7869	-0.008	4.73194970295102e-42	588865	588865	4.15762682442916e-20	25120552	25120552
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.7333	4.15762682442916e-20	25120552	25120552	6.5469057772677e-20	25125700	25125700
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4806	-0.0076	6.5469057772677e-20	25125700	25125700	1.1449112936111e-52	39339800	39354149
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	0.6273	1.1449112936111e-52	39339800	39354149	3.77760496659400e-52	39500219	39511632
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30768	-0.0015	3.777604966594e-52	39500219	39511632	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	140145683	37944	37140	-0.0025	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	68404853	20539	20094	-0.0073	NA	NA	NA	3.7973761468367e-64	68398010	68407474
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68407474	68581141	90	85	0.5693	3.7973761468367e-64	68398010	68407474	2.32827622747087e-57	68578383	68596408
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68582322	77917893	3963	3860	0.0114	2.32827622747087e-57	68578383	68596408	1.31266895378652e-44	77917893	77917893
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	2.6127	1.31266895378652e-44	77917893	77917893	5.67029972798054e-45	77928738	77928738
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19778	-0.0038	5.67029972798054e-45	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	10180233	4061	3964	0.012	NA	NA	NA	4.45201296016824e-09	10180233	10180233
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	10185604	10187640	2	2	-1.5124	4.45201296016824e-09	10180233	10180233	3.14916031265499e-09	10187640	10187640
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	10189286	134450318	41241	40316	0.0011	3.14916031265499e-09	10187640	10187640	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11112600	4328	4249	0.0085	NA	NA	NA	1.06511710692005e-12	11109483	11112600
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11116883	11140421	8	8	0.8822	1.06511710692005e-12	11109483	11112600	2.83732679794804e-13	11140421	11147675
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	16363230	2107	2062	0.0027	2.83732679794804e-13	11140421	11147675	2.95981094300910e-72	16359665	16369990
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	16369990	16453240	32	31	-1.0255	2.9598109430091e-72	16359665	16369990	2.14184341791802e-72	16447212	16454628
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	16454628	46992235	9008	8818	-0.0025	2.14184341791802e-72	16447212	16454628	4.79922373329144e-92	46992235	46992235
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-4.5353	4.79922373329144e-92	46992235	46992235	1.00277073480407e-92	46996769	46996769
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	130694393	29030	28383	0.0083	1.00277073480407e-92	46996769	46996769	2.63419046999432e-10	130694393	130694393
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.5852	2.63419046999432e-10	130694393	130694393	3.36344364242035e-12	130701040	130701040
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132289090	644	629	0.009	3.36344364242035e-12	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	29059780	4075	3978	-0.0068	NA	NA	NA	6.63549533617307e-10	29058752	29063854
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	29061544	29066721	4	4	1.0639	6.63549533617307e-10	29058752	29063854	1.99116024375399e-10	29063854	29068496
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	29068496	37953582	3259	3194	-0.0019	1.99116024375399e-10	29063854	29068496	4.61960665280045e-103	37953582	37953582
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.6114	4.61960665280045e-103	37953582	37953582	5.96089004676605e-97	37957844	37957844
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56657371	6686	6538	-0.0018	5.96089004676605e-97	37957844	37957844	8.43282586392647e-08	56602818	56663137
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56691355	17	17	0.4644	8.43282586392647e-08	56602818	56663137	7.78789950769962e-08	56681665	56711774
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56693033	71375082	3620	3540	-0.0052	7.78789950769962e-08	56681665	56711774	4.0410002091638e-82	71375082	71375082
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.2899	4.0410002091638e-82	71375082	71375082	1.12971942894730e-83	71377671	71377671
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13684	-0.0092	1.1297194289473e-83	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	7	-0.0415	NA	NA	NA	1.22887778028743e-07	18798641	19273289
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19494416	53	53	-0.7957	1.22887778028743e-07	18798641	19273289	3.23894149454364e-75	19490630	19497023
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	73061942	19359	18974	0.0012	3.23894149454364e-75	19490630	19497023	1.90909399400256e-75	73061942	73061942
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	7	-2.1933	1.90909399400256e-75	73061942	73061942	2.66320321912695e-68	73092112	73092112
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79174722	2914	2857	0.0124	2.66320321912695e-68	73092112	73092112	1.10789376518738e-88	79174722	79174722
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	3	-3.8088	1.10789376518738e-88	79174722	79174722	4.79665710382204e-95	79183154	79183154
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105607572	9300	9090	0.0019	4.79665710382204e-95	79183154	79183154	1.46274700752464e-06	105592583	105607572
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105609466	105632168	9	9	0.6084	1.46274700752464e-06	105592583	105607572	7.4383415350758e-08	105632168	105703388
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856591	49	46	-0.0314	7.4383415350758e-08	105632168	105703388	7.2569007756048e-11	105850033	105872360
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105881893	6	6	-1.0422	7.2569007756048e-11	105850033	105872360	3.28721323722820e-11	105875924	105897061
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	106358491	176	168	0.0125	3.2872132372282e-11	105875924	105897061	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1037	NA	NA	NA	2.15768167718284e-05	18452491	18810004
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20308014	152	150	-0.6487	2.15768167718284e-05	18452491	18810004	3.31885128900861e-130	20065525	20316992
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	32456500	3670	3591	-0.0066	3.31885128900861e-130	20065525	20316992	3.26816741281947e-30	32454294	32514939
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32557616	13	13	-1.0381	3.26816741281947e-30	32454294	32514939	0.0184581062943225	32536263	32570228
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32560268	32594200	12	12	-0.6821	0.0184581062943225	32536263	32570228	1.35647837298744e-11	32594200	32664506
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	74669752	17859	17490	0.002	1.35647837298744e-11	32594200	32664506	8.10765489617282e-134	74669752	74669752
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.8952	8.10765489617282e-134	74669752	74669752	1.43180132344856e-136	74680439	74680439
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9384	-7e-04	1.43180132344856e-136	74680439	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	2600740	1013	981	0.037	NA	NA	NA	1.99307254125989e-101	2600740	2638581
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	-4.4673	1.99307254125989e-101	2600740	2638581	1.97226002193421e-127	2638643	2639798
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	31854794	9555	9341	0.019	1.97226002193421e-127	2638643	2639798	6.84578273897031e-16	31813741	32513457
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	31862577	34063575	60	58	-0.347	6.84578273897031e-16	31813741	32513457	1.48533507056886e-15	34056516	34083742
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34065120	75093957	9892	9668	0.0073	1.48533507056886e-15	34056516	34083742	1.53428393260614e-08	75092501	75093957
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.1799	1.53428393260614e-08	75092501	75093957	9.4223862044593e-09	75100865	75102639
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	83730032	3278	3204	-0.0061	9.4223862044593e-09	75100865	75102639	3.15110878300916e-07	83727459	83730032
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83735082	83741493	3	3	1.0785	3.15110878300916e-07	83727459	83730032	4.70722706612856e-06	83741493	83751647
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83748460	88690571	1850	1809	0.0088	4.70722706612856e-06	83741493	83751647	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	407	0.0637	NA	NA	NA	5.89878682962816e-19	1028979	1028979
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	2.1509	5.89878682962816e-19	1028979	1028979	1.29535722767996e-17	1030766	1030766
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	425	0.0793	1.29535722767996e-17	1030766	1030766	4.3269754870242e-16	1904451	1904451
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.7136	4.3269754870242e-16	1904451	1904451	5.5882675170357e-18	1906391	1906391
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	32828797	11564	11324	0.0235	5.5882675170357e-18	1906391	1906391	1.90431666600948e-152	32828797	32828797
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-5.8909	1.90431666600948e-152	32828797	32828797	5.50871050327626e-153	32832642	32832642
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36634734	1433	1402	0.0378	5.50871050327626e-153	32832642	32832642	1.73352222792630e-10	36633313	36637908
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36637908	36644182	5	5	-0.9684	1.7335222279263e-10	36633313	36637908	5.28985298537071e-05	36644002	36649076
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36649076	36673853	10	10	-0.0487	5.28985298537071e-05	36644002	36649076	6.94837347106465e-15	36672710	36673853
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.2957	6.94837347106465e-15	36672710	36673853	8.22408271670718e-20	36684619	36686013
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41553226	2026	1984	0.0489	8.22408271670718e-20	36684619	36686013	6.0252747333641e-54	41550918	41555295
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41555295	41710400	52	50	-0.6613	6.0252747333641e-54	41550918	41555295	3.8257421114305e-50	41708551	42143048
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13403	0.0261	3.8257421114305e-50	41708551	42143048	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22477	-0.0081	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	475	0.0674	NA	NA	NA	1.48673322772589e-09	1398325	1398325
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.7184	1.48673322772589e-09	1398325	1398325	5.00497598758314e-10	1400840	1400840
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4577	0.0633	5.00497598758314e-10	1400840	1400840	7.75311724448885e-12	11448975	11448975
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.8546	7.75311724448885e-12	11448975	11448975	5.66844354728823e-13	11452390	11452390
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	56825794	14700	14401	0.0434	5.66844354728823e-13	11452390	11452390	9.82412444399288e-08	56822197	56828073
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	7	-0.7192	9.82412444399288e-08	56822197	56828073	2.52710376969086e-07	56837593	56846683
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414898	1174	1145	0.0201	2.52710376969086e-07	56837593	56846683	1.58438120327024e-06	59404710	59424729
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59441741	13	12	-0.5167	1.58438120327024e-06	59404710	59424729	1.26046578913277e-06	59433190	59451659
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59442709	63788698	1991	1958	0.0165	1.26046578913277e-06	59433190	59451659	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	579	-0.0138	NA	NA	NA	3.04888692465441e-161	1506379	1506379
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	7	-3.4811	3.04888692465441e-161	1506379	1506379	4.87093194574043e-193	1531162	1531162
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	52080395	17246	16852	0.0075	4.87093194574043e-193	1531162	1531162	3.09261306924766e-09	52076473	52081719
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.9324	3.09261306924766e-09	52076473	52081719	3.45239447265981e-08	52089160	52092989
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3645	9e-04	3.45239447265981e-08	52089160	52092989	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	43645627	11898	11664	0.0025	NA	NA	NA	9.35679085012165e-08	43639857	43648176
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43648176	43660918	8	8	0.689	9.35679085012165e-08	43639857	43648176	1.51166489691288e-06	43659103	43666311
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43661998	46922972	1535	1505	0.0123	1.51166489691288e-06	43659103	43666311	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	49571068	16557	16201	0.0303	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.4395	NA	NA	NA	2.03985696440890e-12	94062	94062
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	2.0398569644089e-12	94062	94062	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	104732	6	6	-1.3543	NA	NA	NA	9.98591906156646e-22	104732	106242
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1427392	774	747	0.0123	9.98591906156646e-22	104732	106242	4.39637957596334e-14	1427338	1431240
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.3499	4.39637957596334e-14	1427338	1431240	1.47600736332675e-15	1432891	1432953
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2510846	821	802	-0.001	1.47600736332675e-15	1432891	1432953	7.4710821849953e-10	2510846	2510846
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	1.5211	7.4710821849953e-10	2510846	2510846	2.68954039528788e-10	2512881	2514651
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2708291	179	179	-0.0648	2.68954039528788e-10	2512881	2514651	0	2708113	2711273
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154442377	45102	44164	0.9884	0	2708113	2711273	2.06264818700147e-30	154442377	154442377
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154447839	2	2	3.7152	2.06264818700147e-30	154442377	154442377	4.74272468976522e-51	154447839	154447839
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154449960	154450309	2	0	NA	4.74272468976522e-51	154447839	154447839	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	1.0698	NA	NA	NA	4.0438063445857e-73	154582414	154586690
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	193	-0.0363	4.0438063445857e-73	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	123	-4.7408	NA	NA	NA	3.14291121214735e-18	3780462	4421500
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.7237	3.14291121214735e-18	3780462	4421500	1.24526877083495e-07	4846477	6696721
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	168	-4.2209	1.24526877083495e-07	4846477	6696721	5.76958136942855e-05	7007724	7238863
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7424495	116	111	-3.3745	5.76958136942855e-05	7007724	7238863	2.57488340491816e-06	7338262	7568006
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7436876	7723783	87	85	-4.4912	2.57488340491816e-06	7338262	7568006	0.000129048339409638	7707621	7733351
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-2.9667	0.000129048339409638	7707621	7733351	4.66890609673641e-06	7751430	7788596
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	35	-4.3338	4.66890609673641e-06	7751430	7788596	7.97401860952898e-11	7897073	7905286
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.2137	7.97401860952898e-11	7897073	7905286	1.21981004278647e-08	7914104	7919636
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8280065	84	80	-4.73	1.21981004278647e-08	7914104	7919636	8.00186553846702e-07	8241630	8289709
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8316416	12	12	-3.1419	8.00186553846702e-07	8241630	8289709	6.4805851663485e-06	8313045	8340407
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324291	8550197	57	56	-4.6268	6.4805851663485e-06	8313045	8340407	2.15848532899913e-05	8543430	8552999
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8551584	8551584	1	0	NA	2.15848532899913e-05	8543430	8552999	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8552999	8566630	10	9	-2.9878	NA	NA	NA	0.000205067815195171	8562424	8581286
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8568582	10515697	226	215	-4.4996	0.000205067815195171	8562424	8581286	2.38914604097619e-37	10513747	10535786
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	14	-0.9506	2.38914604097619e-37	10513747	10535786	2.62647607459904e-07	10655750	12527445
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	13129843	203	196	-3.2589	2.62647607459904e-07	10655750	12527445	1.03814845545748e-40	13089124	13140274
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	14407293	439	413	-4.5825	1.03814845545748e-40	13089124	13140274	1.04007471279912e-13	14404979	14407293
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14413754	5	4	-0.9061	1.04007471279912e-13	14404979	14407293	4.80222209075966e-07	14413754	14416385
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14415559	14508894	61	60	-3.9521	4.80222209075966e-07	14413754	14416385	1.3825115922916e-15	14506319	14508894
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	11	-1.0624	1.3825115922916e-15	14506319	14508894	0.000373413842789307	14539230	14555872
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14563486	9	9	-3.0612	0.000373413842789307	14539230	14555872	0.00068812275796375	14550971	14563486
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14566592	14579298	4	4	-0.8606	0.00068812275796375	14550971	14563486	8.66396518116004e-21	14579298	14579298
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14601309	7	7	-4.7924	8.66396518116004e-21	14579298	14579298	1.75348964341246e-10	14601309	14601309
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14603508	14681738	4	4	-1.3023	1.75348964341246e-10	14601309	14601309	6.02595459660158e-05	14681738	14687556
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14684159	15283393	182	174	-4.0841	6.02595459660158e-05	14681738	14687556	5.19985772704112e-07	15249591	15298885
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15284717	15284717	1	0	NA	5.19985772704112e-07	15249591	15298885	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15408015	79	75	-4.9188	NA	NA	NA	1.57906061088436e-07	15396500	15448670
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	16387273	306	293	-4.0783	1.57906061088436e-07	15396500	15448670	1.04148559788635e-05	16166281	16710218
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	19610243	377	362	-4.5305	1.04148559788635e-05	16166281	16710218	1.18659608389299e-06	19608039	19610243
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.3635	1.18659608389299e-06	19608039	19610243	9.38484355020118e-08	19613864	19614809
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21036411	291	270	-4.6603	9.38484355020118e-08	19613864	19614809	2.42353426983702e-05	21025500	21042490
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-2.7079	2.42353426983702e-05	21025500	21042490	5.25447804282064e-07	21043581	21060047
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	5.25447804282064e-07	21043581	21060047	NA	NA	NA
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	21403482	116	112	-4.7753	NA	NA	NA	0.000125069294889240	21350597	21446513
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21406812	21657525	36	34	-3.9156	0.00012506929488924	21350597	21446513	0.000205441152424596	21490803	21693283
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21666200	22139807	108	98	-4.7582	0.000205441152424596	21490803	21693283	6.93364023026923e-08	22052726	22158616
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22178964	10	10	-2.9559	6.93364023026923e-08	22052726	22158616	3.53238036360317e-10	22176501	22181855
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	25737663	94	87	-4.9212	3.53238036360317e-10	22176501	22181855	1.41158584258108e-74	25737663	26872527
MSK_252152912386_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	79	-1.5549	1.41158584258108e-74	25737663	26872527	NA	NA	NA
