Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	773763	9	8	-0.1058	NA	NA	NA	0.00209422017758066	770859	845171
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	777693	1030789	67	59	0.1716	0.00209422017758066	770859	845171	4.22870490223641e-17	995370	1053033
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1036115	10558863	3492	3292	-0.0368	4.22870490223641e-17	995370	1053033	1.1838521435745e-75	10547903	10571752
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10561022	10975462	167	158	0.2325	1.1838521435745e-75	10547903	10571752	3.77262836497595e-75	10963734	10984053
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10978968	16704522	2046	1907	-0.0309	3.77262836497595e-75	10963734	10984053	1.42847885304324e-16	16698906	16713074
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16713074	16961001	13	11	-0.4811	1.42847885304324e-16	16698906	16713074	1.49211574753955e-14	16923767	17080364
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16963812	22026615	2101	1946	-0.0413	1.49211574753955e-14	16923767	17080364	1.38359524510621e-55	22009985	22036669
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	22028941	22329891	124	118	0.2246	1.38359524510621e-55	22009985	22036669	5.0474287719916e-49	22318794	22343048
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	22331646	26673245	1758	1649	-0.0212	5.0474287719916e-49	22318794	22343048	0	26673245	26677068
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	26677068	27480077	335	306	-0.7218	0	26673245	26677068	0	27478944	27480077
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27482297	27482297	1	0	NA	0	27478944	27480077	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27483586	72537426	17781	16617	-0.0398	NA	NA	NA	2.13949580766825e-123	72537426	72537426
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	1.0716	2.13949580766825e-123	72537426	72537426	9.58091606374814e-134	72579311	72579311
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	110023268	11703	10912	-0.0447	9.58091606374814e-134	72579311	72579311	6.65015333854443e-89	110023268	110023268
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	1.5987	6.65015333854443e-89	110023268	110023268	9.37034330887713e-85	110041712	110041712
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	146297175	4554	4253	-0.0427	9.37034330887713e-85	110041712	110041712	8.12723825861915e-128	146297175	147306304
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147644831	38	33	0.6637	8.12723825861915e-128	146297175	147306304	4.54969233325578e-110	147508217	147644831
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147847659	150818222	1256	1174	-0.0254	4.54969233325578e-110	147508217	147644831	3.36074878387583e-101	150818222	150818222
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150819879	150852858	13	13	1.01	3.36074878387583e-101	150818222	150818222	9.73057615295202e-73	150852858	150852858
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	151028700	78	76	-0.0485	9.73057615295202e-73	150852858	150852858	2.95461684309151e-06	151026228	151028700
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151032967	151036435	3	3	-0.5786	2.95461684309151e-06	151026228	151028700	9.10808279296162e-07	151036435	151038091
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	152865617	826	786	-0.0344	9.10808279296162e-07	151036435	151038091	0	152862693	152872568
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	152867121	152867121	1	0	NA	0	152862693	152872568	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	152871166	153552685	318	303	0.4258	NA	NA	NA	0	153551392	153555642
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153553761	157133150	1534	1432	-0.0349	0	153551392	153555642	1.60269461970217e-20	157133150	157133150
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.1849	1.60269461970217e-20	157133150	157133150	2.38009122695853e-23	157136342	157136342
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	159600761	1019	949	-0.058	2.38009122695853e-23	157136342	157136342	5.07072780656436e-14	159592496	159605927
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	159602561	159663153	27	27	0.2093	5.07072780656436e-14	159592496	159605927	1.00739815402227e-13	159652445	159733698
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	159664666	167483267	3062	2849	-0.053	1.00739815402227e-13	159652445	159733698	1.59429608706618e-29	167481271	167483267
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.6445	1.59429608706618e-29	167481271	167483267	1.55134201916014e-30	167507898	167520743
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	6766	-0.0437	1.55134201916014e-30	167507898	167520743	3.9512829824018e-32	185979586	185979586
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.4597	3.9512829824018e-32	185979586	185979586	2.17730325739385e-31	185988138	185988138
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1407	-0.0651	2.17730325739385e-31	185988138	185988138	8.88466870107147e-31	192715640	192715640
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	1.2874	8.88466870107147e-31	192715640	192715640	2.85507951547781e-27	192719540	192719540
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	196570662	1057	978	-0.0565	2.85507951547781e-27	192719540	192719540	1.39272266890013e-12	196569486	196570662
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196572806	196576204	3	3	-0.8085	1.39272266890013e-12	196569486	196570662	6.8781220050469e-13	196576204	196578227
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	196578227	200600795	1584	1471	-0.0308	6.8781220050469e-13	196576204	196578227	3.03183116631355e-09	200587846	200629099
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200602881	200667381	23	21	-0.2853	3.03183116631355e-09	200587846	200629099	8.8174978200302e-09	200642828	200676505
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	203558452	1235	1159	-0.0371	8.8174978200302e-09	200642828	200676505	1.51573800512320e-69	203547794	203567209
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	203561566	203875561	179	167	0.2143	1.5157380051232e-69	203547794	203567209	2.11445786417371e-88	203869010	203881592
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	203876911	246433956	15785	14752	-0.051	2.11445786417371e-88	203869010	203881592	1.81382720421347e-17	246392258	246501319
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246440949	246806669	102	96	0.1075	1.81382720421347e-17	246392258	246501319	2.67790542435079e-12	246696388	246828744
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246811355	247186514	122	114	-0.087	2.67790542435079e-12	246696388	246828744	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	23948169	6852	6437	-0.0636	NA	NA	NA	2.70624674007727e-31	23942160	23952154
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	23949403	24034760	39	38	0.2674	2.70624674007727e-31	23942160	23952154	1.37327231705957e-24	24028271	24046272
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24036747	33617141	4241	3957	-0.0316	1.37327231705957e-24	24028271	24046272	2.90489657662215e-25	33617141	33617141
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33619260	33621111	2	2	-1.3467	2.90489657662215e-25	33617141	33617141	8.38802245110879e-29	33621111	33621111
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33622478	34543992	388	364	-0.0452	8.38802245110879e-29	33621111	33621111	1.61537831316620e-221	34543992	34543992
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	15	1.3319	1.6153783131662e-221	34543992	34543992	9.20540304850445e-228	34589997	34589997
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37800512	1367	1268	-0.0412	9.20540304850445e-228	34589997	34589997	1.60789154038055e-11	37781427	37803744
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37855837	24	23	-0.2933	1.60789154038055e-11	37781427	37803744	4.71183170970855e-11	37852371	37868682
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5437	-0.0425	4.71183170970855e-11	37852371	37868682	1.04638369281951e-13	52588009	52600588
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-0.638	1.04638369281951e-13	52588009	52600588	8.47311779449898e-13	52635695	52639605
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	87721951	11171	10460	-0.0439	8.47311779449898e-13	52635695	52639605	8.31468627414222e-09	87592184	87721951
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87926461	88038874	6	6	0.4114	8.31468627414222e-09	87592184	87721951	1.02030326901525e-09	88038874	88080817
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88078497	106244482	3996	3746	-0.0487	1.02030326901525e-09	88038874	88080817	6.85695687456663e-13	106244482	106244482
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-0.9608	6.85695687456663e-13	106244482	106244482	1.37883247979040e-12	106250718	106253229
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	113590317	1738	1634	-0.0477	1.3788324797904e-12	106250718	106253229	4.05723001549321e-36	113578031	113602359
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	113592721	113799802	83	81	0.1985	4.05723001549321e-36	113578031	113602359	2.17204727507952e-42	113757824	113853515
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	113809679	132753228	4628	4322	-0.0618	2.17204727507952e-42	113757824	113853515	4.4900772921057e-11	132753228	132753228
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132754617	132763461	3	3	0.6361	4.4900772921057e-11	132753228	132753228	1.00662216715454e-10	132763461	132765513
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132765513	183360524	17056	15975	-0.0489	1.00662216715454e-10	132763461	132765513	1.10087554964978e-10	183360524	183361702
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	183361702	183364949	3	3	0.6354	1.10087554964978e-10	183360524	183361702	4.12959988219627e-11	183363053	183364949
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	183367825	197880750	4114	3854	-0.0466	4.12959988219627e-11	183363053	183364949	2.6715426483837e-09	197880750	197880750
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197883024	197884226	2	2	0.7185	2.6715426483837e-09	197880750	197880750	1.44839093308320e-09	197884226	197884226
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197885450	200029609	702	651	-0.0459	1.4483909330832e-09	197884226	197884226	2.73986555969072e-12	200029609	200029609
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	200030937	200033249	2	2	0.8216	2.73986555969072e-12	200029609	200029609	5.61900777875177e-11	200033249	200033249
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	200036208	219307853	7350	6859	-0.0407	5.61900777875177e-11	200033249	200033249	2.63072961017101e-41	219305947	219307853
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	219309702	219339144	15	13	-0.6828	2.63072961017101e-41	219305947	219307853	9.91006960513953e-38	219339144	219350778
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	219347021	219348529	2	0	NA	9.91006960513953e-38	219339144	219350778	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	219350778	242689978	8217	7728	-0.0514	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	586636	198	188	0.1901	NA	NA	NA	9.30177401621271e-07	566767	592415
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	589224	632762	11	11	-0.1129	9.30177401621271e-07	566767	592415	9.43540035964994e-09	613770	649496
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	635754	635754	1	0	NA	9.43540035964994e-09	613770	649496	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	641257	13614659	4732	4422	0.2026	NA	NA	NA	5.68906312310987e-148	13610528	13621639
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	13618631	13939360	117	113	0.5996	5.68906312310987e-148	13610528	13621639	2.17971990945911e-140	13931999	13947628
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	13942874	13942874	1	0	NA	2.17971990945911e-140	13931999	13947628	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	13944352	32074432	5736	5335	0.2079	NA	NA	NA	9.87662712261967e-10	32074432	32074432
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	0.9981	9.87662712261967e-10	32074432	32074432	3.14627351132052e-09	32080848	32080848
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	46769081	5127	4759	0.2138	3.14627351132052e-09	32080848	32080848	1.73601286241941e-60	46769081	46769081
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.7642	1.73601286241941e-60	46769081	46769081	7.1895956052673e-63	46825048	46825048
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	124752688	24267	22671	0.2123	7.1895956052673e-63	46825048	46825048	3.4355165235196e-17	124737132	124762882
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	124756641	124855381	49	42	-0.0147	3.4355165235196e-17	124737132	124762882	2.28170529151868e-18	124847853	124870878
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	124857899	124857899	1	0	NA	2.28170529151868e-18	124847853	124870878	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	124860642	163992903	13238	12397	0.2177	NA	NA	NA	6.99024590909535e-56	163992903	164001657
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	1.1342	6.99024590909535e-56	163992903	164001657	0.0131924726887048	164005577	164048489
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.8001	0.0131924726887048	164005577	164048489	6.49735942233323e-55	164105613	164112873
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	178228842	4520	4192	0.2203	6.49735942233323e-55	164105613	164112873	0	178227152	178230895
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	178230895	179428191	288	278	0.6599	0	178227152	178230895	0	179423676	179433922
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	179433922	193133137	4858	4580	0.2259	0	179423676	179433922	6.87572661551309e-18	193133137	193133137
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193140532	193140532	1	0	NA	6.87572661551309e-18	193133137	193133137	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193144815	193147523	2	2	-0.8092	NA	NA	NA	1.97860849273598e-17	193147523	193147523
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193152152	196942158	1486	1386	0.2096	1.97860849273598e-17	193147523	193147523	2.90874161128433e-27	196942158	196945209
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	196961238	8	8	0.8491	2.90874161128433e-27	196942158	196945209	3.59832434178555e-22	196957322	196964180
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	199329592	953	899	0.231	3.59832434178555e-22	196957322	196964180	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	685953	215	200	-0.0661	NA	NA	NA	3.19149461465563e-12	685953	685953
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	0.8883	3.19149461465563e-12	685953	685953	2.22323240076300e-12	691065	691065
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	16911133	5119	4780	-0.0599	2.223232400763e-12	691065	691065	1.98732385061081e-13	16911133	16911133
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	16913769	16920235	2	2	-1.0454	1.98732385061081e-13	16911133	16911133	1.42348973011489e-15	16920235	16920235
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	16922923	19525267	604	565	-0.0675	1.42348973011489e-15	16920235	16920235	9.94897982051571e-19	19513930	19536366
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	19536366	19631453	15	14	-0.4756	9.94897982051571e-19	19513930	19536366	2.62062453253128e-19	19626844	19642271
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	19636168	34445002	3607	3396	-0.0625	2.62062453253128e-19	19626844	19642271	3.90063802747901e-12	34439897	34445002
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	0.4411	3.90063802747901e-12	34439897	34445002	8.91463847559603e-11	34491115	34509895
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	68905670	8863	8256	-0.0548	8.91463847559603e-11	34491115	34509895	9.59599770581588e-110	68905670	69069651
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.9548	9.59599770581588e-110	68905670	69069651	1.66602045908422e-113	69163312	69165814
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	119334954	16298	15260	-0.0476	1.66602045908422e-113	69163312	69165814	7.3937631584583e-14	119333701	119334954
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-0.8224	7.3937631584583e-14	119333701	119334954	5.24014784236178e-14	119348829	119350354
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	173224400	14892	13912	-0.054	5.24014784236178e-14	119348829	119350354	0	173224400	173224400
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.6846	0	173224400	173224400	0	173228860	173228860
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	175857109	937	880	-0.0497	0	173228860	173228860	8.54996059033798e-15	175857109	175857109
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175860235	175863396	3	3	0.7533	8.54996059033798e-15	175857109	175857109	7.02711833513885e-14	175863396	175863396
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	182383047	1475	1372	-0.0559	7.02711833513885e-14	175863396	175863396	3.92800417317326e-27	182362353	182390126
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	182390126	182613913	33	33	-0.3952	3.92800417317326e-27	182362353	182390126	1.79042569593613e-30	182607099	182640907
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	182623493	187330240	1828	1702	-0.0484	1.79042569593613e-30	182607099	182640907	1.4266406805942e-14	187330240	187330240
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	0.9288	1.4266406805942e-14	187330240	187330240	9.58393208559181e-15	187333619	187333619
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190708316	1130	1062	-0.0763	9.5839320855918e-15	187333619	187333619	4.10197628125244e-36	190692881	190725579
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190710812	190921041	66	61	-0.365	4.10197628125244e-36	190692881	190725579	3.32745291532569e-24	190915643	190924564
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	42	-0.0148	3.32745291532569e-24	190915643	190924564	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	206	0.1629	NA	NA	NA	3.97414367261237e-09	729262	737829
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	-0.3143	3.97414367261237e-09	729262	737829	1.47976082167140e-11	829954	870657
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	12857302	3747	3509	0.1863	1.4797608216714e-11	829954	870657	7.95381478743289e-10	12857302	12857302
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	0.9888	7.95381478743289e-10	12857302	12857302	1.18644467961425e-09	12873052	12873052
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	28670737	3974	3710	0.207	1.18644467961425e-09	12873052	12873052	1.53695580554743e-11	28670737	28674607
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	28674607	28678779	3	3	-0.4898	1.53695580554743e-11	28670737	28674607	1.00373465247348e-11	28676439	28678779
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	28685584	33230535	1185	1117	0.2276	1.00373465247348e-11	28676439	28678779	5.81492010710301e-21	33230535	33230535
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	33234733	33237644	2	2	-0.9276	5.81492010710301e-21	33230535	33230535	3.62762372599049e-21	33237644	33237644
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	33239915	38577986	1854	1736	0.2188	3.62762372599049e-21	33237644	33237644	1.00650417688344e-14	38577986	38577986
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	38581888	38585008	2	2	-0.7426	1.00650417688344e-14	38577986	38577986	3.69459820797732e-15	38585008	38585008
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	38586240	60146976	5421	5089	0.2125	3.69459820797732e-15	38585008	38585008	1.79939060726307e-32	60130052	60167367
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	60149957	60149957	1	0	NA	1.79939060726307e-32	60130052	60167367	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	60152642	60454300	118	112	0.026	NA	NA	NA	2.90162001865607e-33	60432639	60472365
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	60455772	68864742	2512	2338	0.2251	2.90162001865607e-33	60432639	60472365	4.48127357763028e-17	68862665	68864742
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68885350	70405656	4	4	-0.5232	4.48127357763028e-17	68862665	68864742	1.87992135715887e-18	70405656	70405656
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70693444	74245778	1163	1085	0.2302	1.87992135715887e-18	70405656	70405656	3.40699523608836e-12	74233599	74245778
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	74249555	74297606	10	8	0.6657	3.40699523608836e-12	74233599	74245778	7.463989603415e-13	74297606	74303917
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	74300293	74300293	1	0	NA	7.463989603415e-13	74297606	74303917	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	74303917	80569341	2464	2314	0.2254	NA	NA	NA	8.23779663213788e-37	80569341	80569341
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	80570920	80578884	5	5	-0.7031	8.23779663213788e-37	80569341	80569341	8.63356470213715e-36	80578884	80578884
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	80580381	80580381	1	0	NA	8.63356470213715e-36	80578884	80578884	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	80583260	90715395	2765	2576	0.2089	NA	NA	NA	2.39819782843899e-96	90714078	90718126
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	90718126	90849757	41	38	-0.3359	2.39819782843899e-96	90714078	90718126	1.32743155808913e-96	90844213	90857303
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	90857303	137833920	13586	12641	0.2109	1.32743155808913e-96	90844213	90857303	2.54261699675239e-31	137833920	137833920
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137836466	137843309	4	4	-0.7552	2.54261699675239e-31	137833920	137833920	4.15476281583372e-32	137843309	137843309
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137844931	140201609	986	920	0.2382	4.15476281583372e-32	137843309	137843309	1.43898604166774e-55	140201609	140201609
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	-0.6836	1.43898604166774e-55	140201609	140201609	1.65189357664125e-50	140216524	140216524
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	180342860	13559	12683	0.2095	1.65189357664125e-50	140216524	140216524	0	180342860	180344964
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180357210	7	7	-4.5536	0	180342860	180344964	1.11853242247421e-194	180355807	180357210
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180358977	180358977	1	0	NA	1.11853242247421e-194	180355807	180357210	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180632269	111	102	0.2013	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180644810	180644810	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	191387	38	37	-0.0255	NA	NA	NA	2.87633679601842e-16	183349	191387
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	198124	198124	1	0	NA	2.87633679601842e-16	183349	191387	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	237952	16	14	0.4849	NA	NA	NA	4.37401878762958e-28	237952	241674
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	240119	240119	1	0	NA	4.37401878762958e-28	237952	241674	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	3551360	1356	1267	-0.0317	NA	NA	NA	7.50876720442164e-70	3540778	3569385
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	3555617	3555617	1	0	NA	7.50876720442164e-70	3540778	3569385	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	3558476	3927948	134	128	0.2492	NA	NA	NA	2.78979102021214e-68	3909163	3943619
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	3929731	3929731	1	0	NA	2.78979102021214e-68	3909163	3943619	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	3932065	26801068	7817	7352	-0.0101	NA	NA	NA	6.11843919227914e-15	26797255	26801068
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26811016	26811016	1	0	NA	6.11843919227914e-15	26797255	26801068	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.7016	NA	NA	NA	3.12389758875276e-14	26861184	26863540
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29966336	1219	1126	-0.0152	3.12389758875276e-14	26861184	26863540	5.33758748101835e-18	29966336	29966336
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29972382	29973024	2	2	1.0722	5.33758748101835e-18	29966336	29966336	0	29973024	29973024
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29980445	29981912	2	2	0.5014	0	29973024	29973024	1.63419221497371e-05	29981912	29981912
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29985620	29998009	5	3	-0.3456	1.63419221497371e-05	29981912	29981912	3.02745506235217e-06	29998009	29998009
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30000990	30031367	9	8	0.465	3.02745506235217e-06	29998009	29998009	3.63518976130851e-09	30025480	30040901
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30033946	31383925	574	544	0.0028	3.63518976130851e-09	30025480	30040901	1.98523528752678e-09	31381060	31385778
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31385778	31418006	7	7	0.5019	1.98523528752678e-09	31381060	31385778	1.43854906371313e-13	31418006	31425144
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	31425113	1	0	NA	1.43854906371313e-13	31418006	31425144	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425144	32558677	488	452	-0.02	NA	NA	NA	2.25025216393419e-134	32558677	32563252
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	7	1.7379	2.25025216393419e-134	32558677	32563252	2.89373230005628e-08	32595402	32600962
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32634977	9	8	0.3415	2.89373230005628e-08	32595402	32600962	4.83043569325878e-06	32631315	32654861
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	32673823	10	10	-0.2057	4.83043569325878e-06	32631315	32654861	4.82694940122119e-07	32654861	32721872
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32677939	41664077	3758	3504	-0.0023	4.82694940122119e-07	32654861	32721872	1.5685942398512e-162	41650219	41680970
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	41666424	42704023	457	429	-0.2526	1.5685942398512e-162	41650219	41680970	1.82813904182399e-261	42701923	42706256
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	42706256	42968946	118	111	0.3793	1.82813904182399e-261	42701923	42706256	3.17263592916069e-12	42961923	42968946
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	42981235	43003213	10	9	-0.075	3.17263592916069e-12	42961923	42968946	0.0520863217611611	42989405	43148279
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	43005615	43429856	196	185	-0.2563	0.0520863217611611	42989405	43148279	2.82553119019639e-73	43416922	43438526
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	43431597	46178562	1017	952	-0.0063	2.82553119019639e-73	43416922	43438526	2.31049837665186e-270	46176970	46189193
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	46189193	46590000	187	173	0.4682	2.31049837665186e-270	46176970	46189193	1.38369012905591e-318	46585114	46592589
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	46592589	54035000	2541	2373	-0.0233	1.38369012905591e-318	46585114	46592589	0	54035000	54035000
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-5.1157	0	54035000	54035000	0	54042734	54042734
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	72919733	4535	4251	-0.0248	0	54042734	54042734	1.55550976208352e-24	72919733	72919733
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-1.0243	1.55550976208352e-24	72919733	72919733	1.11013234687283e-24	72924440	72924440
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	74647491	750	695	8e-04	1.11013234687283e-24	72924440	72924440	2.24209038174286e-08	74644381	74647491
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	0.7397	2.24209038174286e-08	74644381	74647491	4.92344963295485e-09	74653360	74655219
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	79018959	1142	1073	-0.0033	4.92344963295485e-09	74653360	74655219	6.93190208133573e-08	79005118	79018959
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79095415	14	14	0.2609	6.93190208133573e-08	79005118	79018959	5.16939792380505e-08	79095415	79146664
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79101978	83322616	1082	1006	-0.0166	5.16939792380505e-08	79095415	79146664	1.17476428405102e-11	83258104	83355865
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	83334619	83564711	27	24	0.2401	1.17476428405102e-11	83258104	83355865	3.4186651185056e-06	83529186	83602408
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	83569406	83675070	26	26	-0.0375	3.4186651185056e-06	83529186	83602408	8.34891706267945e-20	83675070	83675070
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	83677356	83678787	2	2	-1.3244	8.34891706267945e-20	83675070	83675070	2.67094885038369e-27	83678787	83678787
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	83679918	85261891	562	515	-0.0089	2.67094885038369e-27	83678787	83678787	0	85231853	85277527
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	85267604	165643653	26172	24465	-0.3683	0	85231853	85277527	1.16605699141474e-25	165643653	165643653
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.5782	1.16605699141474e-25	165643653	165643653	1.51184950493114e-25	165650610	165650610
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	165653315	1	0	NA	1.51184950493114e-25	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165655123	170753106	1803	1677	-0.391	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	244	0.1957	NA	NA	NA	4.34367043920258e-21	1033418	1036135
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1047707	4	4	1.0707	4.34367043920258e-21	1033418	1036135	3.06442295012445e-20	1047707	1047707
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	6158175	1922	1801	0.2129	3.06442295012445e-20	1047707	1047707	7.62805556407602e-10	6158175	6158175
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	6159818	6161560	2	2	1.0687	7.62805556407602e-10	6158175	6158175	6.98128274417406e-11	6161560	6161560
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	6162986	9449812	1083	999	0.2259	6.98128274417406e-11	6161560	6161560	1.97582199227633e-21	9449812	9449812
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	9454978	9494032	4	4	1.0538	1.97582199227633e-21	9449812	9449812	1.91829366230515e-24	9494032	9494032
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	9503576	19627792	3309	3088	0.204	1.91829366230515e-24	9494032	9494032	1.92545985090267e-09	19621286	19627792
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	19643888	19654756	3	2	-0.5557	1.92545985090267e-09	19621286	19627792	8.70864761813466e-09	19654756	19671118
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	19671118	38257171	7014	6531	0.2099	8.70864761813466e-09	19654756	19671118	4.36292779068309e-17	38244071	38270942
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38258332	38345457	44	39	0.4483	4.36292779068309e-17	38244071	38270942	2.7124816143855e-17	38332055	38380333
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38347160	93158300	14804	13782	0.207	2.7124816143855e-17	38332055	38380333	6.72829139740836e-31	93158300	93158300
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93162991	93162991	1	0	NA	6.72829139740836e-31	93158300	93158300	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	-1.2016	NA	NA	NA	3.2356713785408e-32	93168978	93168978
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	100164752	2612	2429	0.2233	3.2356713785408e-32	93168978	93168978	2.39594392580377e-158	100164752	100164752
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-1.9972	2.39594392580377e-158	100164752	100164752	4.97032454841638e-151	100174991	100174991
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	104392120	1726	1610	0.2249	4.97032454841638e-151	100174991	100174991	4.52910652655922e-22	104374024	104407440
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	104393579	104396024	2	0	NA	4.52910652655922e-22	104374024	104407440	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	104397443	104534196	67	62	0.446	NA	NA	NA	1.84136740899052e-28	104527961	104544854
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	104536181	109967918	2406	2247	0.2112	1.84136740899052e-28	104527961	104544854	8.67939276094817e-80	109967918	109967918
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-1.9344	8.67939276094817e-80	109967918	109967918	1.14989299980278e-72	109974402	109974402
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3714	0.2028	1.14989299980278e-72	109974402	109974402	6.91826321567024e-13	118611324	118611324
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	0.9517	6.91826321567024e-13	118611324	118611324	3.3759453597688e-13	118620875	118620875
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	2970	0.1955	3.3759453597688e-13	118620875	118620875	5.34427848351471e-08	125829681	125831554
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	0.7914	5.34427848351471e-08	125829681	125831554	3.04966681449828e-07	125837524	125839386
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3427	0.2125	3.04966681449828e-07	125837524	125839386	7.34962369278029e-10	133426996	133436265
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.6226	7.34962369278029e-10	133426996	133436265	2.27550838285743e-10	133447868	133455682
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141473270	3731	3479	0.2141	2.27550838285743e-10	133447868	133455682	2.04345373666761e-09	141471956	141473270
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141477170	141478502	2	2	0.9941	2.04345373666761e-09	141471956	141473270	3.32521566645663e-13	141478502	141478502
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141480515	141689547	96	86	0.1569	3.32521566645663e-13	141478502	141478502	1.53120176781607e-206	141689547	141689547
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141690753	141690753	1	0	NA	1.53120176781607e-206	141689547	141689547	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	1.9286	NA	NA	NA	5.61671733494059e-180	141714168	141714168
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	143503317	659	619	0.2209	5.61671733494059e-180	141714168	141714168	2.75623406372426e-10	143495552	143582864
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143709272	6	6	-0.1755	2.75623406372426e-10	143495552	143582864	6.6770316860443e-06	143706194	143715763
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143710780	144546976	376	354	0.1804	6.6770316860443e-06	143706194	143715763	1.59754220903794e-73	144546976	144546976
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144548093	144551256	2	2	-1.9361	1.59754220903794e-73	144546976	144546976	4.66589143663308e-70	144551256	144551256
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144554448	147699576	1468	1380	0.186	4.66589143663308e-70	144551256	144551256	1.33941296801639e-51	147699576	147699576
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147702365	147702365	1	0	NA	1.33941296801639e-51	147699576	147699576	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.7405	NA	NA	NA	1.88852865183669e-49	147707161	147707161
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	156483966	3181	2983	0.1944	1.88852865183669e-49	147707161	147707161	5.70826387182902e-16	156483966	156485711
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	3	1.0884	5.70826387182902e-16	156483966	156485711	1.2880169200806e-14	156488598	156490484
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	987	0.1799	1.2880169200806e-14	156488598	156490484	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	151472	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	166493	581533	118	111	-0.0904	NA	NA	NA	6.69816308236463e-18	581533	581533
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.3185	6.69816308236463e-18	581533	581533	1.14130734461315e-20	588865	588865
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	591112	1	0	NA	1.14130734461315e-20	588865	588865	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	594169	2234351	615	586	-0.0785	NA	NA	NA	1.84988991377562e-08	2229727	2234351
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	0.474	1.84988991377562e-08	2229727	2234351	1.77015751317797e-11	2251011	2261571
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	25013753	7386	6897	-0.0535	1.77015751317797e-11	2251011	2261571	6.97269324577873e-13	25007239	25022606
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25017905	25039370	5	5	0.4682	6.97269324577873e-13	25007239	25022606	1.52524631954695e-09	25030003	25047250
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	31814234	2582	2418	-0.0443	1.52524631954695e-09	25030003	25047250	7.04849676108875e-09	31811829	31814234
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31815721	31817573	2	2	-0.825	7.04849676108875e-09	31811829	31814234	2.53797415080482e-09	31817573	31817573
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31818925	39341524	2356	2184	-0.0416	2.53797415080482e-09	31817573	31817573	4.77190009963771e-116	39339800	39352361
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39345557	39350798	2	0	NA	4.77190009963771e-116	39339800	39352361	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	52	-0.577	NA	NA	NA	2.98574544258911e-112	39504332	39508035
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	51191560	2179	2036	-0.0443	2.98574544258911e-112	39504332	39508035	2.93383884072595e-39	51191560	51191560
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51193977	1	0	NA	2.93383884072595e-39	51191560	51191560	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51196227	51200291	3	3	-1.3438	NA	NA	NA	2.78701602877455e-40	51200291	51200291
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	79338031	8411	7863	-0.0493	2.78701602877455e-40	51200291	51200291	7.36565043297599e-17	79338031	79338031
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	79343549	79348545	2	2	-1.0869	7.36565043297599e-17	79338031	79338031	1.08603783071025e-16	79348545	79348545
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	79356622	129604499	15590	14548	-0.0424	1.08603783071025e-16	79348545	79348545	3.27294573587222e-17	129594445	129615855
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	129609846	129705069	16	16	0.3326	3.27294573587222e-17	129594445	129615855	2.07916746696978e-19	129691460	129720515
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	129711118	140101617	3015	2815	-0.0694	2.07916746696978e-19	129691460	129720515	5.66041005187892e-07	140044162	140116827
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	140107463	140251416	18	18	0.1627	5.66041005187892e-07	140044162	140116827	3.5815075417124e-05	140225123	140386929
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	140256036	146264846	2198	2063	-0.053	3.5815075417124e-05	140225123	140386929	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5132	-0.372	NA	NA	NA	3.88665214869605e-42	15802255	15802255
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.2831	3.88665214869605e-42	15802255	15802255	2.00160427719155e-41	15807123	15807123
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	20605481	1686	1560	-0.3728	2.00160427719155e-41	15807123	15807123	1.69146359960780e-19	20601795	20609561
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	20607752	20636352	13	11	0.1178	1.6914635996078e-19	20601795	20609561	1.32365164908492e-17	20628875	20638309
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	20638309	23338535	840	781	-0.3676	1.32365164908492e-17	20628875	20638309	9.4619143638426e-14	23338535	23338535
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23343915	1	0	NA	9.4619143638426e-14	23338535	23338535	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.4501	NA	NA	NA	8.03316320065323e-16	23365926	23365926
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	24491341	255	236	-0.4114	8.03316320065323e-16	23365926	23365926	6.54502717556849e-52	24491341	24491341
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	24495765	24501872	2	2	-2.2973	6.54502717556849e-52	24491341	24491341	1.79606410571894e-47	24501872	24501872
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	24506914	24506914	1	0	NA	1.79606410571894e-47	24501872	24501872	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	24509107	28036840	854	802	-0.3787	NA	NA	NA	1.97833972459624e-42	28036840	28036840
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28039058	28040562	2	2	-2.1964	1.97833972459624e-42	28036840	28036840	1.87340225733996e-44	28040562	28040562
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28041684	39130211	3613	3358	-0.351	1.87340225733996e-44	28040562	28040562	1.28116580839305e-09	39091349	39130211
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39146895	39146895	1	0	NA	1.28116580839305e-09	39091349	39130211	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43599449	3	3	0.3186	NA	NA	NA	5.89818146095675e-08	43599449	43599449
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43626920	67927172	18	18	-0.2343	5.89818146095675e-08	43599449	43599449	2.57640430595897e-23	67927172	68483889
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	297	0.1868	2.57640430595897e-23	67927172	68483889	4.8495588832453e-54	70926188	70926188
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.4636	4.8495588832453e-54	70926188	70926188	4.02239774066463e-112	70930528	70930528
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	93434678	7285	6824	0.2013	4.02239774066463e-112	70930528	70930528	1.75677681564138e-18	93434678	93434678
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93436073	93439862	3	3	-0.6771	1.75677681564138e-18	93434678	93434678	7.188954396131e-17	93439862	93439862
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93443960	100348045	2631	2455	0.213	7.188954396131e-17	93439862	93439862	4.10172696317102e-08	100346872	100348045
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	0.9805	4.10172696317102e-08	100346872	100348045	3.10032584155201e-09	100350814	100350814
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5174	0.2035	3.10032584155201e-09	100350814	100350814	5.90894941651276e-35	116124007	116124007
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	1.6797	5.90894941651276e-35	116124007	116124007	9.33372564428755e-34	116130333	116130333
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	126251111	3690	3461	0.1933	9.33372564428755e-34	116130333	116130333	0	126240513	126262124
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	126252308	138786186	5176	4846	0.4442	0	126240513	126262124	1.61122267022708e-09	138784969	138786186
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138787852	138794487	3	3	-0.2522	1.61122267022708e-09	138784969	138786186	3.44823946316508e-06	138794487	138806983
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138804983	140145683	531	496	0.4063	3.44823946316508e-06	138794487	138806983	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9110	-0.0163	NA	NA	NA	1.11041333493021e-19	27038538	27038538
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	0.8462	1.11041333493021e-19	27038538	27038538	7.73191961351362e-11	27041812	27041812
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	67745379	10522	9851	-0.0149	7.73191961351362e-11	27041812	27041812	7.108597421534e-91	67745379	67745379
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67746619	67746619	1	0	NA	7.108597421534e-91	67745379	67745379	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67748408	67784457	16	16	-0.8719	NA	NA	NA	1.57745408527783e-91	67784457	67784457
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67787935	73429882	2363	2208	0.0046	1.57745408527783e-91	67784457	67784457	2.26684342650842e-47	73425784	73435699
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	73431569	73524236	44	43	0.3948	2.26684342650842e-47	73425784	73435699	1.57113177283492e-48	73513753	73528667
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	73526854	77917893	1915	1799	0.0123	1.57113177283492e-48	73513753	73528667	1.23921362556002e-17	77917893	77917893
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77926390	1	0	NA	1.23921362556002e-17	77917893	77917893	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928669	77928738	2	2	1.0772	NA	NA	NA	1.32761485828903e-20	77928738	77928738
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	132797428	19277	18051	-0.0181	1.32761485828903e-20	77928738	77928738	1.92036135133087e-19	132787561	132797428
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	0.7893	1.92036135133087e-19	132787561	132797428	3.67642389979404e-08	132801463	132802775
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	867	-0.0387	3.67642389979404e-08	132801463	132802775	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	1996	-0.0467	NA	NA	NA	1.97785439714283e-108	5741031	5741031
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-1.1013	1.97785439714283e-108	5741031	5741031	3.54794831301576e-123	5765438	5765438
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	8763036	1274	1179	-0.062	3.54794831301576e-123	5765438	5765438	6.89653508054523e-10	8763036	8763036
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	8764304	8767136	3	2	-0.8755	6.89653508054523e-10	8763036	8763036	4.59029551993519e-10	8767136	8767136
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	8768462	62874768	16542	15488	-0.0454	4.59029551993519e-10	8767136	8767136	2.64201238690742e-10	62867246	62878222
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62876766	62897536	10	10	0.3301	2.64201238690742e-10	62867246	62878222	2.25927336400327e-08	62893178	62907437
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62899604	62899604	1	0	NA	2.25927336400327e-08	62893178	62907437	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62900524	66463477	1599	1502	-0.0185	NA	NA	NA	1.37917418989530e-27	66463477	66463477
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.3607	1.3791741898953e-27	66463477	66463477	1.93847369608598e-31	66469412	66469412
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	134450318	23720	22170	-0.0496	1.93847369608598e-31	66469412	66469412	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	278	-0.3816	NA	NA	NA	2.20813396737831e-69	736988	736988
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-2.0067	2.20813396737831e-69	736988	736988	4.04457091943611e-76	743223	743223
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	6673224	2482	2314	-0.3714	4.04457091943611e-76	743223	743223	6.1562711556823e-10	6667817	6673224
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	6675167	6683466	5	5	0.1705	6.1562711556823e-10	6667817	6673224	2.26930680648742e-08	6683466	6700034
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	6683482	7890143	460	429	-0.3452	2.26930680648742e-08	6683466	6700034	1.01097535937211e-10	7850944	7913049
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7891273	8013470	48	45	-0.1432	1.01097535937211e-10	7850944	7913049	1.51287122616501e-15	7985677	8026718
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8015452	9523923	447	422	-0.36	1.51287122616501e-15	7985677	8026718	3.04076323865572e-88	9523923	9523923
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9626623	17	17	0.4493	3.04076323865572e-88	9523923	9523923	1.37393371893760e-83	9626623	9626623
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626736	11116883	570	538	-0.3743	1.3739337189376e-83	9626623	9626623	9.43054703067234e-16	11112600	11116883
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11128557	5	5	0.2751	9.43054703067234e-16	11112600	11116883	3.16039670709155e-14	11128557	11130871
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11130871	28043762	5985	5581	-0.3641	3.16039670709155e-14	11128557	11130871	1.24412671429240e-304	28037963	28054446
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28054446	28486517	137	131	0.2058	1.2441267142924e-304	28037963	28054446	2.2927148109431e-08	28483247	28499777
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28489394	28502988	10	10	-0.1855	2.2927148109431e-08	28483247	28499777	9.8748965653366e-12	28490565	28507921
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	28505789	33184017	1456	1349	0.2118	9.8748965653366e-12	28490565	28507921	1.48018588735735e-15	33184017	33184017
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-0.7788	1.48018588735735e-15	33184017	33184017	1.99551288935827e-15	33198331	33198331
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	46992235	3559	3309	0.2108	1.99551288935827e-15	33198331	33198331	4.9945552679876e-10	46992235	46992235
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-0.5943	4.9945552679876e-10	46992235	46992235	2.30925879752542e-09	46996769	46998876
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	52763146	2585	2429	0.217	2.30925879752542e-09	46996769	46998876	5.14927433440122e-120	52755878	52812573
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52808865	53047362	127	116	0.5967	5.14927433440122e-120	52755878	52812573	2.78497089114798e-138	53043590	53053388
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	53048399	53048399	1	0	NA	2.78497089114798e-138	53043590	53053388	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	53050997	67919254	4999	4692	0.2116	NA	NA	NA	1.07184190449204e-11	67919254	67919254
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	67920408	67922267	2	2	1.0748	1.07184190449204e-11	67919254	67919254	1.51412876652199e-12	67922267	67922267
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	67922679	70159055	864	808	0.2083	1.51412876652199e-12	67922267	67922267	1.30184649312476e-84	70156326	70160579
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	70160579	70280409	62	59	0.6273	1.30184649312476e-84	70156326	70160579	1.84625052236853e-83	70279014	70283500
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	70281800	130694393	20390	19010	0.2053	1.84625052236853e-83	70279014	70283500	3.07177841620203e-21	130694393	130694393
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.3547	3.07177841620203e-21	130694393	130694393	2.06118493577388e-24	130701040	130701040
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	85	0.1802	2.06118493577388e-24	130701040	130701040	7.02314341858298e-89	130943064	130943064
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.4245	7.02314341858298e-89	130943064	130943064	5.23423719579209e-66	130946248	130946248
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	524	0.1873	5.23423719579209e-66	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	32270076	5292	4924	0.2127	NA	NA	NA	2.50001556722746e-117	32249300	32301132
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	32274284	33241892	356	332	-0.0108	2.50001556722746e-117	32249300	32301132	1.31664455450258e-79	33195092	33261897
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33246037	34849893	499	458	0.2107	1.31664455450258e-79	33195092	33261897	4.55311274652877e-14	34849893	34853399
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34853399	34856446	3	3	-0.512	4.55311274652877e-14	34849893	34853399	3.08686609167771e-12	34854926	34856446
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34857880	49964838	6069	5661	0.218	3.08686609167771e-12	34854926	34856446	3.98697200355754e-155	49964838	49964838
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.879	3.98697200355754e-155	49964838	49964838	3.11267208470266e-157	49971732	49971732
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	50819012	360	339	0.2165	3.11267208470266e-157	49971732	49971732	4.23015031174329e-13	50819012	50819012
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50820905	50822114	2	2	-0.68	4.23015031174329e-13	50819012	50819012	3.4203407484605e-11	50822114	50822114
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50826116	50826116	1	0	NA	3.4203407484605e-11	50822114	50822114	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50827725	56650373	1441	1355	0.2004	NA	NA	NA	4.17653439133439e-26	56646284	56657371
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	13	0.7239	4.17653439133439e-26	56646284	56657371	2.98396327735888e-29	56680346	56686863
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	62507943	1366	1267	0.2031	2.98396327735888e-29	56680346	56686863	1.41594791432325e-11	62499779	62516280
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	62516280	62530764	5	5	-0.331	1.41594791432325e-11	62499779	62516280	2.30456632831185e-11	62527115	62534030
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	62534030	71703277	2359	2219	0.1973	2.30456632831185e-11	62527115	62534030	5.95407915721686e-96	71703277	71703277
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71705959	71708737	2	2	-2.1738	5.95407915721686e-96	71703277	71703277	1.78140283088042e-94	71708737	71708737
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71720727	100690991	9308	8716	0.2101	1.78140283088042e-94	71708737	71708737	0	100690991	100690991
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.0792	0	100690991	100690991	0	100693892	100693892
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4124	0.1956	0	100693892	100693892	2.85804511261316e-15	113788788	113788788
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	1.1868	2.85804511261316e-15	113788788	113788788	8.3711143663009e-14	113792974	113792974
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	113794669	1	0	NA	8.3711143663009e-14	113792974	113792974	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113797828	114115707	147	138	0.2044	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114118270	114123340	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	-0.2091	NA	NA	NA	9.6820525356211e-20	18544772	18798641
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	47	-1.0811	9.6820525356211e-20	18544772	18798641	9.96815490358642e-169	19492531	19494416
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21420105	941	898	-0.348	9.96815490358642e-169	19492531	19494416	1.92782429114727e-82	21404592	21438704
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21423930	22049850	311	297	-0.1142	1.92782429114727e-82	21404592	21438704	1.52136355440173e-127	22040315	22057437
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22051630	73061942	18107	16919	-0.3591	1.52136355440173e-127	22040315	22057437	8.46260366181818e-20	73060301	73072457
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	8	0.2329	8.46260366181818e-20	73060301	73072457	8.37324004071968e-15	73091980	73101327
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	74794692	846	795	-0.3285	8.37324004071968e-15	73091980	73101327	7.01928072865301e-212	74763791	74806568
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74797390	79174722	2068	1935	-0.0965	7.01928072865301e-212	74763791	74806568	1.30122563210855e-318	79174722	79174722
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.4359	1.30122563210855e-318	79174722	79174722	0	79183154	79183154
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	80647457	585	546	-0.1037	0	79183154	79183154	1.62839684638056e-06	80641054	80663027
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	80648549	80669676	11	11	-0.3789	1.62839684638056e-06	80641054	80663027	4.68694506220376e-10	80659243	80679195
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	80672063	104453122	8374	7820	-0.099	4.68694506220376e-10	80659243	80679195	9.79836516381467e-130	104435928	104465955
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	104454279	105597555	327	304	-0.3412	9.79836516381467e-130	104435928	104465955	1.91772960432697e-89	105597555	105602602
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-1.497	1.91772960432697e-89	105597555	105602602	1.21969795998769e-36	105630089	105673157
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	44	-0.3971	1.21969795998769e-36	105630089	105673157	8.17995454404663e-10	105846004	105850033
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105875924	5	4	-1.1909	8.17995454404663e-10	105846004	105850033	1.61687906201706e-07	105875924	105875924
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105948347	19	17	-0.3713	1.61687906201706e-07	105875924	105875924	6.81581058923897e-74	105948347	105948347
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105989160	13	12	-2.0035	6.81581058923897e-74	105948347	105948347	1.93263756692396e-119	105989160	105989160
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105994646	106160175	69	63	-0.3965	1.93263756692396e-119	105989160	105989160	3.31785435002920e-42	106160175	106160175
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106163349	106163349	1	0	NA	3.3178543500292e-42	106160175	106160175	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106165044	106176454	4	4	-2.0736	NA	NA	NA	3.42735155695115e-39	106176454	106176454
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106178391	106358491	72	66	-0.2993	3.42735155695115e-39	106176454	106176454	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18432558	3	3	-0.1289	NA	NA	NA	8.18868179984675e-23	18432558	18432558
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18450562	18452491	2	2	0.1246	8.18868179984675e-23	18432558	18432558	0.00135358467407671	18452491	18818949
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	8	0.5174	0.00135358467407671	18452491	18818949	3.51525350001715e-07	18831600	18837737
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	1.0224	3.51525350001715e-07	18831600	18837737	4.56586349360815e-12	18848213	18851513
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19465359	79	74	0.3749	4.56586349360815e-12	18848213	18851513	4.33788103577377e-102	19427350	19800789
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	39490508	6238	5815	-0.0537	4.33788103577377e-102	19427350	19800789	0	39490508	39493709
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39493709	39817049	188	178	0.7736	0	39490508	39493709	0	39815918	39817049
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39818053	99632987	24524	22924	-0.0441	0	39815918	39817049	8.15292600881964e-71	99632987	99632987
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.1067	8.15292600881964e-71	99632987	99632987	1.65197758431490e-74	99635701	99635701
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217181	267	253	-0.0967	1.6519775843149e-74	99635701	99635701	4.75853638312188e-05	100212401	100278665
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100287000	4	4	-0.5244	4.75853638312188e-05	100212401	100278665	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100298352	100298352	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1997948	784	734	-0.3285	NA	NA	NA	1.96716224194513e-10	1995829	1997948
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1999192	2000527	2	2	0.6522	1.96716224194513e-10	1995829	1997948	4.08370255347308e-13	2000527	2000527
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2005613	2600740	227	215	-0.3246	4.08370255347308e-13	2000527	2000527	4.97554871382705e-27	2600740	2638581
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	-1.596	4.97554871382705e-27	2600740	2638581	1.30877240538617e-27	2638643	2639798
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	14346292	4328	4034	-0.3617	1.30877240538617e-27	2638643	2639798	0	14341049	14351678
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14351678	17695943	835	771	0.1284	0	14341049	14351678	1.25393884665476e-226	17645700	17743885
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	17703108	31862577	4393	4116	-0.0847	1.25393884665476e-226	17645700	17743885	9.95488183316252e-60	31845232	32481309
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33536526	44	44	0.3435	9.95488183316252e-60	31845232	32481309	1.96623620729899e-39	33528385	33559207
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33538171	34317157	91	83	-0.13	1.96623620729899e-39	33528385	33559207	8.97842935082294e-146	34317157	34317157
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34602318	52	47	0.6874	8.97842935082294e-146	34317157	34317157	4.37536691594711e-144	34602318	34602318
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	34969229	45	44	-0.1222	4.37536691594711e-144	34602318	34602318	2.83414379984428e-16	34930597	34995910
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34976429	57203733	4105	3832	-0.3594	2.83414379984428e-16	34930597	34995910	7.12516724155296e-20	57203733	57203733
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-1.5837	7.12516724155296e-20	57203733	57203733	1.75079213560317e-26	57206772	57206772
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	73809039	5182	4828	-0.3514	1.75079213560317e-26	57206772	57206772	1.04056514182089e-24	73805719	73809039
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73811135	73812685	2	2	-1.1071	1.04056514182089e-24	73805719	73809039	3.34563001026059e-06	73812685	73815706
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73815706	75093957	428	393	-0.3563	3.34563001026059e-06	73812685	73815706	9.576433930635e-40	75093957	75093957
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.1626	9.576433930635e-40	75093957	75093957	6.7300220102537e-44	75100865	75100865
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88675835	5129	4812	-0.3743	6.7300220102537e-44	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88676988	88690571	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	386	-0.3396	NA	NA	NA	7.04285453382558e-30	1028979	1028979
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.1837	7.04285453382558e-30	1028979	1028979	5.92941199328555e-28	1030766	1030766
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	399	-0.3229	5.92941199328555e-28	1030766	1030766	2.74580330702797e-11	1903358	1904451
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	0.4727	2.74580330702797e-11	1903358	1904451	8.62717440797367e-13	1906391	1909371
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	15727076	5445	5063	-0.3513	8.62717440797367e-13	1906391	1909371	1.46842616525018e-09	15629313	15727076
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	0.5271	1.46842616525018e-09	15629313	15727076	9.15079850766416e-10	15733964	15737241
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	31457889	5733	5345	-0.3415	9.15079850766416e-10	15733964	15737241	1.49663551287796e-27	31451114	31461588
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	16	-0.8477	1.49663551287796e-27	31451114	31461588	2.5692415793443e-27	31493990	31503774
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36673853	1816	1700	-0.333	2.5692415793443e-27	31493990	31503774	0	36673853	36673853
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-4.0973	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1887	-0.3339	0	36684619	36684619	1.82440111970902e-10	41546807	41585817
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	42	-0.1304	1.82440111970902e-10	41546807	41585817	3.64174799600015e-11	41647135	42161364
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	43704308	686	641	-0.3344	3.64174799600015e-11	41647135	42161364	0	43701549	43705719
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	43705719	55527482	4166	3879	0.2256	0	43701549	43705719	1.38587876692098e-10	55527482	55527482
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55538378	55542646	2	2	-0.6053	1.38587876692098e-10	55527482	55527482	2.79762082478917e-09	55542646	55542646
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55561018	78653545	8825	8285	0.2257	2.79762082478917e-09	55542646	55542646	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	21519	-0.0711	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	203	-0.0048	NA	NA	NA	5.47418607501886e-14	790492	790526
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	0.9738	5.47418607501886e-14	790492	790526	4.96751175095764e-10	794978	798817
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	255	-0.0261	4.96751175095764e-10	794978	798817	4.83095869791695e-09	1398325	1398325
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	0.933	4.83095869791695e-09	1398325	1398325	6.81378551152579e-12	1400840	1400840
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3353960	926	857	-0.0176	6.81378551152579e-12	1400840	1400840	3.63549127582094e-09	3349931	3353960
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	0.8178	3.63549127582094e-09	3349931	3353960	3.05269986982915e-09	3356334	3356334
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	9138936	2641	2477	-0.0269	3.05269986982915e-09	3356334	3356334	4.85794073549973e-11	9134840	9138936
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9141894	9144715	3	3	-0.7775	4.85794073549973e-11	9134840	9138936	1.18629273155643e-12	9144715	9144715
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	9145735	11448975	1106	1021	-0.0205	1.18629273155643e-12	9144715	9144715	6.83031310180135e-22	11448975	11448975
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.19	6.83031310180135e-22	11448975	11448975	3.16463878136571e-21	11452390	11452390
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	18780911	3361	3148	-0.0257	3.16463878136571e-21	11452390	11452390	1.23775763761e-09	18776933	18780911
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	18784197	18799630	4	4	0.5627	1.23775763761e-09	18776933	18780911	1.58225464534583e-08	18799630	18800822
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	18800822	22984756	1336	1262	-0.0185	1.58225464534583e-08	18799630	18800822	1.10883730307895e-13	22984756	22984756
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23010575	23012951	2	2	-1.048	1.10883730307895e-13	22984756	22984756	3.87810786135802e-14	23012951	23012951
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23015440	51620161	7549	7075	-0.0407	3.87810786135802e-14	23012951	23012951	1.37227402720559e-19	51615604	51620161
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51622586	51656983	13	13	0.4216	1.37227402720559e-19	51615604	51620161	1.19351322854180e-17	51656983	51660438
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51659025	58198955	3023	2815	-0.0344	1.1935132285418e-17	51656983	51660438	1.16562693451774e-09	58191244	58204170
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58201323	58261341	26	23	-0.2914	1.16562693451774e-09	58191244	58204170	1.10341374586286e-08	58249435	58278526
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58262497	63788698	2571	2413	-0.0524	1.10341374586286e-08	58249435	58278526	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	549	0.1952	NA	NA	NA	7.79249339213438e-91	1506379	1511632
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.3361	7.79249339213438e-91	1506379	1511632	4.16706943865912e-101	1531162	1532433
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	29632664	8594	8032	0.2007	4.16706943865912e-101	1531162	1532433	0	29632664	29632664
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29635963	29635963	1	0	NA	0	29632664	29632664	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29636986	29812143	76	72	1.4831	NA	NA	NA	2.04214266997566e-105	29808749	29818017
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29816230	29816230	1	0	NA	2.04214266997566e-105	29808749	29818017	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29818017	30458272	296	278	0.9134	NA	NA	NA	5.78946556320884e-49	30441413	30480675
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	30463973	30968224	230	218	1.1752	5.78946556320884e-49	30441413	30480675	6.37498901032428e-93	30947914	30997268
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	30973204	60557051	10978	10244	0.9196	6.37498901032428e-93	30947914	30997268	9.39897951291495e-17	60557051	60559058
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60559058	60561656	3	3	0.0712	9.39897951291495e-17	60557051	60559058	2.59645596737163e-07	60560625	60562422
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60562422	60777857	60	59	0.8578	2.59645596737163e-07	60560625	60562422	1.26163539003611e-08	60771419	60777857
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60779191	60783367	2	2	-0.1477	1.26163539003611e-08	60771419	60777857	3.9334128026878e-10	60783367	60784851
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60784851	62168226	644	601	0.8753	3.9334128026878e-10	60783367	60784851	7.26975199974979e-07	62168210	62168226
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62174093	62176540	4	3	0.1817	7.26975199974979e-07	62168210	62168226	2.15926623654604e-08	62174991	62180751
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62180751	62419534	94	90	0.8643	2.15926623654604e-08	62174991	62180751	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12577	-0.0686	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	20744191	2128	1985	0.2161	NA	NA	NA	0	20743140	20747679
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20746589	22354945	721	669	-0.3448	0	20743140	20747679	7.80985596433027e-11	22354945	22354945
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22356179	22357051	2	2	-1.4035	7.80985596433027e-11	22354945	22354945	4.83252567005814e-09	22357051	22358386
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22358386	22667608	132	126	-0.341	4.83252567005814e-09	22357051	22358386	2.37090308106530e-71	22667608	22667608
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.5951	2.3709030810653e-71	22667608	22667608	1.36994750517751e-128	22725305	22725305
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6112	-0.3572	1.36994750517751e-128	22725305	22725305	8.59213042015549e-65	35472378	35472378
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.8378	8.59213042015549e-65	35472378	35472378	7.46134510232933e-58	35476942	35476942
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37618187	1187	1099	-0.3343	7.46134510232933e-58	35476942	35476942	6.41500444322169e-08	37615031	37618187
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37621766	37626069	3	3	0.337	6.41500444322169e-08	37615031	37618187	5.08641430304945e-12	37626069	37633961
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	48448446	5311	4951	-0.3515	5.08641430304945e-12	37626069	37633961	3.70673535344164e-15	48448446	48448446
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	0.7652	3.70673535344164e-15	48448446	48448446	1.90835336558579e-11	48452959	48452959
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	49571068	500	468	-0.3328	1.90835336558579e-11	48452959	48452959	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	104732	13	11	0.2602	NA	NA	NA	1.15718815476874e-05	95819	106242
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	124528	16	15	-0.0434	1.15718815476874e-05	95819	106242	1.27222836839027e-23	124528	127113
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	1.3931	1.27222836839027e-23	124528	127113	3.23497976983256e-56	129544	130528
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	849437	535	494	-0.0273	3.23497976983256e-56	129544	130528	5.70621820322037e-09	843648	849437
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	851066	859452	7	6	0.4849	5.70621820322037e-09	843648	849437	3.18400152713098e-11	859452	859493
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	2301365	823	767	-0.0456	3.18400152713098e-11	859452	859493	4.25833977301642e-178	2301365	2301365
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2302065	1	0	NA	4.25833977301642e-178	2301365	2301365	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	-2.6638	NA	NA	NA	2.04122491105205e-155	2304398	2304398
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2510846	208	192	-0.059	2.04122491105205e-155	2304398	2304398	6.76859279005585e-09	2510821	2510846
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	0.724	6.76859279005585e-09	2510821	2510846	3.06079922194207e-11	2512881	2514651
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2594488	64	57	-0.041	3.06079922194207e-11	2512881	2514651	4.92382876820491e-06	2592168	2594488
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2594593	2594593	1	0	NA	4.92382876820491e-06	2592168	2594488	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2595753	2603529	7	6	-0.3788	NA	NA	NA	0.000226864698108747	2603529	2608123
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2603986	2672401	80	76	-0.0352	0.000226864698108747	2603529	2608123	3.48868641376752e-09	2669225	2686565
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.3272	3.48868641376752e-09	2669225	2686565	5.03025022736301e-239	2708291	2708291
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	40885418	14140	13220	0.921	5.03025022736301e-239	2708291	2708291	1.67502555757099e-126	40884282	40885418
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	40886844	40886844	1	0	NA	1.67502555757099e-126	40884282	40885418	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	40888956	40974555	47	44	0.2088	NA	NA	NA	1.41283635295298e-121	40974555	40975989
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	40975989	149939759	29225	27264	0.9119	1.41283635295298e-121	40974555	40975989	7.9096406614609e-09	149937835	149945356
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	149942881	149949162	4	4	0.2656	7.9096406614609e-09	149937835	149945356	7.75421222475515e-06	149945356	149952829
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	149951291	153329988	1301	1211	0.8624	7.75421222475515e-06	149945356	149952829	2.06162788670622e-08	153327171	153333629
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153344155	6	5	0.2254	2.06162788670622e-08	153327171	153333629	4.02445640120488e-09	153335752	153344718
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153344718	154582414	410	384	0.8945	4.02445640120488e-09	153335752	153344718	0	154582414	154582414
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888033	200	186	-0.0958	0	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154888224	154888224	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3034907	121	111	-4.6008	NA	NA	NA	2.05218688598679e-29	2969891	3223585
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	5593746	19	19	-1.6259	2.05218688598679e-29	2969891	3223585	3.34751303954338e-12	4948824	6696721
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	164	-3.9063	3.34751303954338e-12	4948824	6696721	4.92628200442288e-10	7031936	7184431
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7296153	73	66	-2.5741	4.92628200442288e-10	7031936	7184431	5.99306317391812e-08	7266323	7333934
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7300600	7726921	131	119	-3.8809	5.99306317391812e-08	7266323	7333934	0.000930536839458822	7709619	7726921
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7729757	7745143	8	8	-1.9098	0.000930536839458822	7709619	7726921	0.135853299174755	7745143	7776265
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7749796	7782532	9	8	-2.8453	0.135853299174755	7745143	7776265	0.00076337311162903	7751430	7799614
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	35	-4.3925	0.00076337311162903	7751430	7799614	1.72698648121353e-08	7897073	7905286
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.0729	1.72698648121353e-08	7897073	7905286	2.63668075345097e-09	7914104	7918899
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7985612	15	12	-3.4539	2.63668075345097e-09	7914104	7918899	0.000309884624040417	7964586	7992095
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7992095	7997485	4	4	-1.8904	0.000309884624040417	7964586	7992095	7.84148380494949e-09	7996758	7999759
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8280065	65	58	-4.395	7.84148380494949e-09	7996758	7999759	2.82219293852778e-08	8241630	8280065
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8324291	13	13	-3.048	2.82219293852778e-08	8241630	8280065	0.00981863313999988	8313045	8414160
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	8463583	28	25	-3.8638	0.00981863313999988	8313045	8414160	0.000775093365394535	8378918	8477958
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8474062	8538835	18	18	-4.7186	0.000775093365394535	8378918	8477958	1.79207034987525e-05	8533866	8544417
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8539855	8554113	13	13	-3.7594	1.79207034987525e-05	8533866	8544417	0.000218462469132436	8551584	8557343
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8555993	8562424	6	5	-2.2389	0.000218462469132436	8551584	8557343	0.0166126332504521	8559479	8591072
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8564257	8678888	30	28	-3.7424	0.0166126332504521	8559479	8591072	2.86504344773704e-06	8647327	8687580
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8681965	8681965	1	0	NA	2.86504344773704e-06	8647327	8687580	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8683710	8725431	23	23	-5.0709	NA	NA	NA	8.86779974893364e-05	8714581	8765425
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8730690	8949553	59	57	-4.1899	8.86779974893364e-05	8714581	8765425	3.90508220631635e-06	8938284	8949553
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.7425	3.90508220631635e-06	8938284	8949553	6.61554526871164e-11	8956787	8956787
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9155283	34	30	-5.0235	6.61554526871164e-11	8956787	8956787	9.80769729291978e-10	9132086	9157232
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9157232	10014777	14	13	-3.4474	9.80769729291978e-10	9132086	9157232	1.97972546641877e-10	10012024	10049346
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10025706	10515697	64	62	-4.719	1.97972546641877e-10	10012024	10049346	6.06059445303107e-61	10515697	10537808
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10535786	1	0	NA	6.06059445303107e-61	10515697	10537808	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10537808	11698871	17	16	-1.0368	NA	NA	NA	8.79769555872419e-16	11673476	11698871
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	11	-4.6992	8.79769555872419e-16	11673476	11698871	1.16997012847022e-06	12537944	12554612
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	50	-2.4564	1.16997012847022e-06	12537944	12554612	0.00275368597543026	12607539	12839975
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12687167	1	0	NA	0.00275368597543026	12607539	12839975	NA	NA	NA
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12696242	12926941	55	50	-3.4972	NA	NA	NA	6.99772880708385e-07	12888523	12953078
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13048283	47	45	-2.0824	6.99772880708385e-07	12888523	12953078	6.41821281112268e-07	13035511	13048283
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13062151	8	8	-4.13	6.41821281112268e-07	13035511	13048283	9.47044383733765e-05	13062151	13081856
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13066543	13129843	25	23	-2.3153	9.47044383733765e-05	13062151	13081856	5.79038432346512e-07	13114969	13137597
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13153117	12	12	-4.5874	5.79038432346512e-07	13114969	13137597	0.016924862132023	13140274	13167862
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13254711	29	26	-3.245	0.016924862132023	13140274	13167862	3.97158579603583e-10	13215006	13264329
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13537520	133	116	-4.5283	3.97158579603583e-10	13215006	13264329	5.83465918225881e-07	13508638	13549185
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13539170	13705594	44	40	-3.7438	5.83465918225881e-07	13508638	13549185	1.13054685038696e-06	13683483	13784030
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14122129	159	154	-4.5909	1.13054685038696e-06	13683483	13784030	2.94790749216636e-06	14118164	14122129
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.7778	2.94790749216636e-06	14118164	14122129	1.82150788009663e-07	14143748	14143748
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14358464	35	33	-4.5303	1.82150788009663e-07	14143748	14143748	7.78370184629482e-11	14356069	14361297
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14379418	11	9	-2.2659	7.78370184629482e-11	14356069	14361297	2.04075299804910e-05	14372581	14383746
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14380301	14451317	40	35	-3.8856	2.0407529980491e-05	14372581	14383746	1.08827539460853e-05	14442815	14455003
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14454048	14466597	10	9	-2.3609	1.08827539460853e-05	14442815	14455003	0.000187216102981008	14464288	14481337
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14473497	14508894	29	24	-3.9313	0.000187216102981008	14464288	14481337	1.08279094746253e-09	14508021	14508894
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14530328	5	5	-0.8758	1.08279094746253e-09	14508021	14508894	1.86926855524018e-05	14530134	14538156
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14536962	14554415	11	10	-3.1613	1.86926855524018e-05	14530134	14538156	0.000209373299860585	14546195	14555872
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14555872	14579298	9	9	-1.5938	0.000209373299860585	14546195	14555872	6.52283111790946e-13	14579298	14587291
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15140278	114	104	-4.4159	6.52283111790946e-13	14579298	14587291	4.02262262725151e-06	15122414	15140278
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15141311	15149506	6	6	-2.0258	4.02262262725151e-06	15122414	15140278	2.04187749157042e-08	15149506	15149506
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15152354	15157004	5	5	-4.6018	2.04187749157042e-08	15149506	15149506	5.64874373987086e-09	15157004	15157004
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15158623	15165820	5	4	-1.9278	5.64874373987086e-09	15157004	15157004	0.000228613183102186	15165820	15175926
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15169415	15523178	198	182	-4.2981	0.000228613183102186	15165820	15175926	4.15561900106624e-05	15465845	15563346
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15682936	51	50	-3.411	4.15561900106624e-05	15465845	15563346	5.66716325292994e-06	15614125	15687088
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15687088	15807366	22	21	-5.0594	5.66716325292994e-06	15614125	15687088	5.4440974970508e-05	15784249	15810752
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15810752	15848986	7	7	-4.0467	5.4440974970508e-05	15784249	15810752	1.99230213525555e-07	15848986	15862122
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15854496	15911389	8	8	-5.6053	1.99230213525555e-07	15848986	15862122	3.31541468492153e-06	15911389	15937162
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15915466	16067790	59	56	-3.209	3.31541468492153e-06	15911389	15937162	4.09311497478742e-13	16040789	16087502
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16068838	21036503	775	715	-4.3482	4.09311497478742e-13	16040789	16087502	8.66503864472499e-08	21035621	21036503
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21041164	21047798	4	4	-1.1804	8.66503864472499e-08	21035621	21036503	1.48179853994644e-10	21047798	21048365
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21048365	22930737	365	338	-4.4125	1.48179853994644e-10	21047798	21048365	3.84083078914035e-46	22926726	22930737
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26905954	17	16	-1.0532	3.84083078914035e-46	22926726	22930737	5.45707191378788e-05	26894692	26907147
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26907147	26920247	6	5	-2.2102	5.45707191378788e-05	26894692	26907147	5.85227935724739e-12	26920247	26924187
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26924187	26945893	10	10	-0.7429	5.85227935724739e-12	26920247	26924187	0.00237324224551406	26945893	27006628
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	18	-2.714	0.00237324224551406	26945893	27006628	4.02327718026603e-06	27003308	27063070
MSK_252152912685_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	30	-0.6314	4.02327718026603e-06	27003308	27063070	NA	NA	NA
