Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	17102601	5800	5690	0.0211	NA	NA	NA	5.1021303130795e-22	17102601	17102601
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17104345	17107476	2	2	1.4003	5.1021303130795e-22	17102601	17102601	1.49873911872707e-23	17107476	17107476
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17112697	72537426	22092	21649	0.0077	1.49873911872707e-23	17107476	17107476	0	72537426	72537426
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-4.0529	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	76939856	1302	1278	-0.0099	0	72579311	72579311	6.41019372399544e-17	76935395	76939856
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	76941813	76962818	9	9	0.5262	6.41019372399544e-17	76935395	76939856	3.17945457769242e-16	76962818	76964627
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	76964627	84484082	2177	2134	7e-04	3.17945457769242e-16	76962818	76964627	1.73037700290122e-10	84484082	84484082
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84485205	84487429	2	2	-0.9014	1.73037700290122e-10	84484082	84484082	1.2923603771761e-09	84487429	84487429
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84488775	110023268	8213	8047	-0.001	1.2923603771761e-09	84487429	84487429	1.66219182924518e-48	110023268	110023268
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	1.6053	1.66219182924518e-48	110023268	110023268	1.43126906234331e-48	110039388	110039388
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	110041712	1	0	NA	1.43126906234331e-48	110039388	110039388	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	116029725	2221	2171	0.0027	NA	NA	NA	4.88533767815593e-12	116029725	116029725
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116031670	116033402	2	2	-0.9903	4.88533767815593e-12	116029725	116029725	9.84251337447643e-12	116033402	116033402
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	116035435	143702972	1692	1649	-0.0141	9.84251337447643e-12	116033402	116033402	2.10462218583822e-40	143659690	143706304
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143706304	143789484	43	43	-0.4014	2.10462218583822e-40	143659690	143706304	5.85508099935318e-07	143783358	143806379
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143791143	144003068	33	33	-0.1803	5.85508099935318e-07	143783358	143806379	5.07731566145017e-08	143827741	144113654
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144093719	150819879	1858	1812	0.0127	5.07731566145017e-08	143827741	144113654	5.37124469514231e-103	150819879	150823073
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	11	1.1902	5.37124469514231e-103	150819879	150823073	7.23219162092462e-64	150848509	150851439
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	78	-0.027	7.23219162092462e-64	150848509	150851439	3.32000518784479e-19	151026228	151026228
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.9112	3.32000518784479e-19	151026228	151026228	3.64066813105453e-18	151036435	151036435
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2625	0.0144	3.64066813105453e-18	151036435	151036435	8.6111441624012e-163	157133150	157133150
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.721	8.6111441624012e-163	157133150	157133150	2.22252114009747e-181	157136342	157136342
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4038	-0.008	2.22252114009747e-181	157136342	157136342	4.81099204642209e-19	167481271	167483267
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	7	0.6454	4.81099204642209e-19	167481271	167483267	5.84845683026461e-20	167507898	167520743
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	177595302	3988	3919	-0.0132	5.84845683026461e-20	167507898	167520743	0	177595302	177595302
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177596757	177599597	3	3	-5.4541	0	177595302	177595302	0	177599597	177599597
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177601540	185979586	3218	3150	-0.0052	0	177599597	177599597	3.81199802245942e-11	185979586	185979586
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	0.979	3.81199802245942e-11	185979586	185979586	3.00116710643301e-13	185988138	185988138
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	187224389	202	201	0.0033	3.00116710643301e-13	185988138	185988138	1.63150566497713e-12	187215877	187224389
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	187229169	187232308	2	2	-0.9452	1.63150566497713e-12	187215877	187224389	1.66677848709405e-13	187232308	187232308
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	187237813	192715640	1287	1254	0.0081	1.66677848709405e-13	187232308	187232308	1.67775966338751e-28	192715640	192715640
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	1.3803	1.67775966338751e-28	192715640	192715640	5.06276600775146e-28	192719540	192719540
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	195009358	477	472	0.0053	5.06276600775146e-28	192719540	192719540	6.57665407808605e-29	194978218	195011344
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-0.7071	6.57665407808605e-29	194978218	195011344	2.33331085317605e-23	195062793	195091758
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200596027	2157	2121	0.0053	2.33331085317605e-23	195062793	195091758	2.07387488389884e-11	200580745	200625002
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200787319	39	35	-0.237	2.07387488389884e-11	200580745	200625002	1.56365213410022e-11	200673525	200808717
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	247186514	17409	17091	-0.0027	1.56365213410022e-11	200673525	200808717	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	24452394	7082	6949	-0.0128	NA	NA	NA	1.31864401541918e-15	24452394	24452394
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24455322	24462631	4	4	-0.8094	1.31864401541918e-15	24452394	24452394	3.37769321479761e-16	24462631	24462631
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24467164	34543992	4436	4347	0.0061	3.37769321479761e-16	24462631	24462631	4.83435735172992e-242	34543992	34543992
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	1.4679	4.83435735172992e-242	34543992	34543992	3.3740707073627e-253	34589997	34589997
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	7068	-0.0027	3.3740707073627e-253	34589997	34589997	1.83639731726369e-23	52600588	52600588
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.8574	1.83639731726369e-23	52600588	52600588	1.01628242463666e-24	52635695	52635695
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	65884943	4433	4335	-0.0044	1.01628242463666e-24	52635695	52635695	4.10287610245472e-18	65884943	65884943
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	65886900	65889165	2	2	-1.1759	4.10287610245472e-18	65884943	65884943	4.34584738516509e-16	65889165	65889165
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	65892198	71195546	1812	1782	-0.0054	4.34584738516509e-16	65889165	65889165	3.6934310424624e-13	71195546	71195546
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	71198108	71200120	2	2	-1.0675	3.6934310424624e-13	71195546	71195546	5.02814033076865e-14	71200120	71200120
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	71202174	85794338	4453	4364	-0.0094	5.02814033076865e-14	71200120	71200120	7.7064732416269e-09	85792014	85794338
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85796574	85798974	2	2	-0.8594	7.7064732416269e-09	85792014	85794338	6.31810812898163e-09	85798974	85798974
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85800695	112749123	5900	5779	-0.0051	6.31810812898163e-09	85798974	85798974	1.27322196057711e-12	112749123	112749123
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112750646	112752277	2	2	-1.011	1.27322196057711e-12	112749123	112749123	2.26819682742125e-13	112752277	112752277
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112761950	159077828	13246	12988	-0.0047	2.26819682742125e-13	112752277	112752277	1.88531000899151e-10	159077828	159077828
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	159080844	159083227	2	2	-0.9016	1.88531000899151e-10	159077828	159077828	8.24613427221765e-11	159083227	159083227
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	159084623	166863256	2805	2730	-0.0072	8.24613427221765e-11	159083227	159083227	7.7004294489591e-14	166863256	166863256
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	166865397	166866527	2	2	-1.0127	7.7004294489591e-14	166863256	166863256	6.80837556172805e-13	166866527	166866527
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	166867813	179767214	4884	4783	-0.0094	6.80837556172805e-13	166866527	166866527	5.0890693973184e-10	179767214	179767214
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	2	0.8806	5.0890693973184e-10	179767214	179767214	7.80804559504848e-13	179778919	179778919
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	180117780	104	102	0.0094	7.80804559504848e-13	179778919	179778919	1.49983725789845e-40	180117780	180117780
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	6	-0.887	1.49983725789845e-40	180117780	180117780	1.06072451336551e-29	180129680	180129680
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	232126456	17434	17107	-0.0041	1.06072451336551e-29	180129680	180129680	7.51291625453001e-10	232118244	232126456
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232129418	232131993	2	2	-0.9095	7.51291625453001e-10	232118244	232126456	7.71988320479951e-10	232131993	232131993
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	232136170	242689978	3996	3930	0.0013	7.71988320479951e-10	232131993	232131993	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	17514137	6488	6364	-0.0039	NA	NA	NA	8.00944210682361e-17	17514137	17514137
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17516200	17519829	3	3	-0.9865	8.00944210682361e-17	17514137	17514137	6.72771671051321e-19	17519829	17519829
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	17521317	32074432	4305	4233	-0.0184	6.72771671051321e-19	17519829	17519829	8.49586930116638e-16	32074432	32074432
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.0686	8.49586930116638e-16	32074432	32074432	6.30661657037077e-14	32080848	32080848
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	46769081	5127	5027	-0.0027	6.30661657037077e-14	32080848	32080848	7.88498365890313e-37	46769081	46769081
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.8626	7.88498365890313e-37	46769081	46769081	2.07569097410295e-37	46825048	46825048
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	163989367	37554	36823	-0.0029	2.07569097410295e-37	46825048	46825048	0	163989367	164009321
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163992903	163992903	1	0	NA	0	163989367	164009321	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	8	-3.2309	NA	NA	NA	0.149481893537314	164001657	164042397
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	-4.5431	0.149481893537314	164001657	164042397	0	164107951	164107951
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	178171303	4500	4400	-0.0055	0	164107951	164107951	1.04903873582155e-30	178171303	178171303
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	178177064	178189013	4	4	-1.1002	1.04903873582155e-30	178171303	178171303	1.21897934759198e-31	178189013	178189013
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	178193140	194354505	5626	5510	-0.0022	1.21897934759198e-31	178189013	178189013	0	194354505	194354505
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.7643	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196929826	1017	994	-0.0117	0	194366950	194366950	4.36650778929394e-10	196929805	196929826
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	196946355	5	5	0.5617	4.36650778929394e-10	196929805	196929826	1.19502164552072e-08	196946355	196950095
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196950095	198306094	549	538	0.0072	1.19502164552072e-08	196946355	196950095	7.18975268770283e-09	198303616	198306094
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198308315	198310261	2	2	-0.8761	7.18975268770283e-09	198303616	198306094	1.95181317523062e-08	198310261	198312999
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198312999	199329592	407	400	-0.0041	1.95181317523062e-08	198310261	198312999	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3327	0.0106	NA	NA	NA	0	9815760	9815760
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.313	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	25897361	4559	4471	-0.0178	0	9842644	9842644	2.88214082322181e-10	25897361	25897361
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	25901935	25904406	2	2	-0.9301	2.88214082322181e-10	25897361	25897361	7.035002234841e-12	25904406	25904406
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	25907149	26563737	250	246	-0.0149	7.035002234841e-12	25904406	25904406	6.18669490090903e-11	26563737	26563737
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26565071	26566345	2	2	-0.8949	6.18669490090903e-11	26563737	26563737	2.87228004281772e-09	26566345	26568376
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26568376	34445002	1354	1335	-0.0018	2.87228004281772e-09	26566345	26568376	6.77968341815654e-08	34433787	34445002
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	0.4759	6.77968341815654e-08	34433787	34445002	3.47996291019549e-08	34491115	34509895
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	43708890	3059	3009	-0.0042	3.47996291019549e-08	34491115	34509895	1.59872230206586e-09	43700367	43708890
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	43715772	43730871	3	3	-0.734	1.59872230206586e-09	43700367	43708890	8.06468125292912e-10	43730871	43736349
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	43736349	68905670	5801	5708	-0.0042	8.06468125292912e-10	43730871	43736349	5.28122921477826e-98	68905670	69069651
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	13	1.0754	5.28122921477826e-98	68905670	69069651	2.98559646140090e-64	69163312	69165814
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	70150576	117	114	-0.0037	2.9855964614009e-64	69163312	69165814	2.2925718073809e-12	70130975	70150576
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.768	2.2925718073809e-12	70130975	70150576	1.54369475811879e-14	70216707	70294312
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	156811828	26415	25872	-0.0072	1.54369475811879e-14	70216707	70294312	7.77852178407354e-14	156811828	156811828
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	156813933	156816254	2	2	-1.0585	7.77852178407354e-14	156811828	156811828	1.6236934257263e-14	156816254	156816254
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	156819284	173224400	4655	4577	-0.0037	1.6236934257263e-14	156816254	156816254	8.60024084925738e-274	173224400	173224400
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-4.4874	8.60024084925738e-274	173224400	173224400	1.74501791594860e-280	173228860	173228860
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	175860235	938	922	-0.0062	1.7450179159486e-280	173228860	173228860	3.90131661220032e-18	175860235	175860235
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	1.1524	3.90131661220032e-18	175860235	175860235	7.56424423261095e-17	175863396	175863396
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	191153613	4579	4476	-0.0079	7.56424423261095e-17	175863396	175863396	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	829954	228	221	-0.0095	NA	NA	NA	7.85424155107285e-10	819038	829954
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	0.9359	7.85424155107285e-10	819038	829954	4.46183938017424e-11	873365	873365
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	12857302	3745	3680	-0.013	4.46183938017424e-11	873365	873365	9.10578686784854e-36	12857302	12857302
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.6625	9.10578686784854e-36	12857302	12857302	5.12300707212432e-37	12873052	12873052
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	23297364	2988	2933	-0.0098	5.12300707212432e-37	12873052	12873052	3.49920122119506e-13	23297364	23297364
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	23301762	23303896	2	2	-1.0212	3.49920122119506e-13	23297364	23297364	3.93305592673141e-13	23303896	23303896
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	23307629	40357647	4503	4410	-0.0044	3.93305592673141e-13	23303896	23303896	2.24089484860891e-12	40357647	40357647
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	40370936	40383173	2	2	-0.9929	2.24089484860891e-12	40357647	40357647	5.81997329370809e-12	40383173	40383173
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	40389808	140201609	28607	28039	-0.0064	5.81997329370809e-12	40383173	40383173	4.9042542460051e-40	140201609	140201609
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	-0.8845	4.9042542460051e-40	140201609	140201609	2.71563160062279e-39	140216524	140216524
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	150181399	3767	3709	-0.0054	2.71563160062279e-39	140216524	140216524	7.1515042571636e-31	150171154	150185190
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150202601	7	7	-0.8409	7.1515042571636e-31	150171154	150185190	3.13777525920266e-32	150202601	150202601
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	155405839	1622	1595	0.0014	3.13777525920266e-32	150202601	150202601	1.48057984157177e-20	155405839	155416484
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155421443	5	5	0.8051	1.48057984157177e-20	155405839	155416484	4.94372399963483e-20	155418745	155421443
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180348365	8161	7985	-7e-04	4.94372399963483e-20	155418745	155421443	1.65162642507506e-13	180346557	180348365
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180351118	180358977	5	5	0.6654	1.65162642507506e-13	180346557	180348365	1.12138469123656e-11	180358977	180362342
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	111	0.0026	1.12138469123656e-11	180358977	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	198124	39	39	-0.0746	NA	NA	NA	1.43473292750222e-16	191387	202063
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	244363	19	19	0.4365	1.43473292750222e-16	191387	202063	2.37262207052445e-23	240119	248239
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	246974	29950805	10529	10343	-0.0044	2.37262207052445e-23	240119	248239	3.86007148678270e-20	29941766	29972382
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	-0.4665	3.8600714867827e-20	29941766	29972382	1.05147889448690e-12	30005338	30010234
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	30031367	5	5	0.5292	1.0514788944869e-12	30005338	30010234	8.05250774712879e-07	30031367	30040901
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30033946	31382291	573	568	0.0176	8.05250774712879e-07	30031367	30040901	6.46198815617385e-09	31381060	31382291
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31385778	2	2	-0.9007	6.46198815617385e-09	31381060	31382291	1.35444271155084e-07	31385778	31385778
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	0.7702	1.35444271155084e-07	31385778	31385778	8.1914453103348e-18	31393624	31425113
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	481	0.0414	8.1914453103348e-18	31393624	31425113	1.58161276708882e-10	32548736	32593151
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32563252	1	0	NA	1.58161276708882e-10	32548736	32593151	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32564884	32609525	10	6	-0.5189	NA	NA	NA	9.38771802970986e-05	32600962	32628420
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32613538	32711957	33	32	0.1018	9.38771802970986e-05	32600962	32628420	0.000251898897566254	32700719	32721872
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32713363	32728487	9	9	0.6175	0.000251898897566254	32700719	32721872	7.62575468883341e-23	32721872	32731072
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	74647491	13550	13284	-0.0015	7.62575468883341e-23	32721872	32731072	5.29470008262607e-11	74647491	74647491
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	0.9247	5.29470008262607e-11	74647491	74647491	2.15996530612774e-10	74653360	74655219
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	74762234	22	22	-0.0164	2.15996530612774e-10	74653360	74655219	1.49691256515027e-20	74759340	74762234
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74766480	74773321	5	5	0.8838	1.49691256515027e-20	74759340	74762234	3.20032647172763e-24	74773321	74773321
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74780074	79011979	1113	1087	0.0029	3.20032647172763e-24	74773321	74773321	1.59372666835705e-09	78990768	79028813
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79015901	79091850	15	14	0.3389	1.59372666835705e-09	78990768	79028813	1.68225394046627e-10	79079988	79112799
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6603	-0.003	1.68225394046627e-10	79079988	79112799	1.51328229405613e-28	103841482	103841482
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0307	1.51328229405613e-28	103841482	103841482	7.27486319113945e-29	103868154	103868154
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	153678908	17170	16831	-0.0052	7.27486319113945e-29	103868154	103868154	4.15192278663063e-19	153678908	153678908
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	153686896	153697484	3	3	-0.9856	4.15192278663063e-19	153678908	153678908	1.08759578357770e-17	153697484	153697484
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	153703058	165643653	3933	3853	-0.0144	1.0875957835777e-17	153697484	153697484	3.33300703574356e-35	165643653	165643653
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1611	3.33300703574356e-35	165643653	165643653	8.09547809367186e-34	165650610	165650610
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1772	-0.0235	8.09547809367186e-34	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5287	0.0036	NA	NA	NA	5.56946060252379e-10	16135701	16135701
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	0.901	5.56946060252379e-10	16135701	16135701	1.99729180484089e-20	16140018	16140018
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	75977218	17373	17033	-0.0018	1.99729180484089e-20	16140018	16140018	3.61704894204992e-23	75898652	76026227
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	75982631	76421843	20	20	0.3867	3.61704894204992e-23	75898652	76026227	5.26731882373302e-19	76349713	76561367
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76539954	92522688	5376	5276	-0.0042	5.26731882373302e-19	76349713	76561367	2.15511418937794e-12	92522688	92522688
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92530156	92562146	2	2	-1.009	2.15511418937794e-12	92522688	92522688	1.40437310163538e-17	92562146	92562146
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92563715	92671646	46	45	0.0119	1.40437310163538e-17	92562146	92562146	3.96230625042891e-10	92671646	92671646
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92672824	92674095	2	2	-0.7349	3.96230625042891e-10	92671646	92671646	9.03211869039189e-06	92674095	92675286
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	92675286	93158300	238	235	-0.0092	9.03211869039189e-06	92674095	92675286	6.64598745703471e-287	93158300	93158300
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93162991	93162991	1	0	NA	6.64598745703471e-287	93158300	93158300	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	-5.0687	NA	NA	NA	0	93168978	93168978
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	99566452	2387	2340	0.0035	0	93168978	93168978	2.25063213577866e-13	99564034	99566452
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	99568269	99574724	5	5	-0.6496	2.25063213577866e-13	99564034	99566452	9.21288855074395e-13	99574724	99577336
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	99577336	118939850	8548	8385	4e-04	9.21288855074395e-13	99574724	99577336	7.58428823305555e-20	118939850	118939850
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118941494	118949641	4	4	-0.8972	7.58428823305555e-20	118939850	118939850	4.96840152121436e-20	118949641	118949641
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118951702	133433384	6701	6576	-0.0044	4.96840152121436e-20	118949641	118949641	2.75241971493693e-19	133432281	133437464
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133455682	10	10	0.5506	2.75241971493693e-19	133432281	133437464	2.67257549672949e-19	133448277	133456873
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133456873	141690753	3828	3753	0.0018	2.67257549672949e-19	133448277	133456873	2.09289542242735e-31	141690753	141690753
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	8	0.7793	2.09289542242735e-31	141690753	141690753	1.27293438933459e-29	141714168	141720303
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2459	-0.0032	1.27293438933459e-29	141714168	141720303	3.98115975193239e-38	147702365	147702365
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.7939	3.98115975193239e-38	147702365	147702365	1.11318378128003e-34	147707161	147707161
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4156	-0.0109	1.11318378128003e-34	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7156900	2392	2361	-0.0116	NA	NA	NA	2.94503262827880e-12	6909487	7322035
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	0.4923	2.9450326282788e-12	6909487	7322035	3.93196872747058e-12	7709141	8137794
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	13648457	1999	1955	-0.0092	3.93196872747058e-12	7709141	8137794	1.67124582994992e-11	13642330	13648457
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	13660743	13684222	3	3	-0.8517	1.67124582994992e-11	13642330	13648457	1.06810480997560e-12	13684222	13695841
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	13695841	24200321	3490	3419	-0.0054	1.0681048099756e-12	13684222	13695841	1.21639625922325e-91	24200321	24200321
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	24202837	24205866	2	2	-2.8492	1.21639625922325e-91	24200321	24200321	5.10426977315378e-42	24205866	24205866
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	24208869	25022606	234	229	-0.024	5.10426977315378e-42	24205866	24205866	1.39892789603012e-05	25017905	25022606
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25030003	25039370	3	3	0.5506	1.39892789603012e-05	25017905	25022606	4.57994501997722e-07	25039370	25047250
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25047250	25120552	27	26	-0.0456	4.57994501997722e-07	25039370	25047250	8.60997290087036e-133	25120552	25120552
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	2.7034	8.60997290087036e-133	25120552	25120552	6.18256272604164e-110	25125700	25125700
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	25174666	21	20	0.0159	6.18256272604164e-110	25125700	25125700	1.03453128754636e-08	25171214	25174666
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25177391	25180278	2	2	-0.8975	1.03453128754636e-08	25171214	25174666	1.98921317823142e-09	25180278	25180278
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25183187	39350798	4889	4767	-0.0049	1.98921317823142e-09	25180278	25180278	2.93440020972999e-149	39345557	39352361
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	55	0.6571	2.93440020972999e-149	39345557	39352361	1.15817587675206e-154	39504332	39508035
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	64115560	6076	5947	-0.0071	1.15817587675206e-154	39504332	39508035	1.60740697199716e-11	64115560	64115560
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	64125972	64127873	3	3	-0.7987	1.60740697199716e-11	64115560	64115560	1.68360879642574e-13	64127873	64127873
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	64130065	68708619	1394	1369	0.0028	1.68360879642574e-13	64127873	64127873	1.03665674570031e-20	68708619	68708619
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68710028	68716099	4	4	-0.8512	1.03665674570031e-20	68708619	68708619	1.17867862241216e-17	68716099	68716099
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68718709	75470767	2299	2253	-0.0104	1.17867862241216e-17	68716099	68716099	2.43774963240361e-19	75470767	75470767
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	75477572	75486872	3	3	-1.0256	2.43774963240361e-19	75470767	75470767	7.81785656471669e-20	75486872	75486872
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	75496260	102688379	8021	7881	-0.0037	7.81785656471669e-20	75486872	75486872	6.9458965169512e-24	102688379	102688379
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102690502	102695889	4	4	-0.9727	6.9458965169512e-24	102688379	102688379	2.14949093154583e-22	102695889	102695889
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102697333	146264846	13629	13359	-0.0071	2.14949093154583e-22	102695889	102695889	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	634039	209	205	-0.0184	NA	NA	NA	1.41722721008108e-07	631305	634039
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	635871	637589	2	2	-0.8643	1.41722721008108e-07	631305	634039	1.05052111786955e-08	637589	637589
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	639143	15802255	5247	5148	-0.0093	1.05052111786955e-08	637589	637589	1.02991153052642e-13	15802255	15802255
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.0512	1.02991153052642e-13	15802255	15802255	3.46200039058871e-14	15807123	15807123
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2325	-0.0137	3.46200039058871e-14	15807123	15807123	1.07939267377248e-32	22477358	22477358
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-1.6385	1.07939267377248e-32	22477358	22477358	2.51116327681614e-26	22492603	22492603
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23338535	160	157	-0.0082	2.51116327681614e-26	22492603	22492603	3.19936132789651e-09	23321923	23338535
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23365926	4	4	0.5431	3.19936132789651e-09	23321923	23338535	5.2472404623788e-09	23365926	23377660
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	24495765	256	247	-0.0196	5.2472404623788e-09	23365926	23377660	1.08355748969380e-14	24495765	24495765
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	24501872	24506914	2	2	-1.0269	1.0835574896938e-14	24495765	24495765	1.81330805039512e-13	24506914	24506914
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	24509107	39146895	4470	4385	0.0042	1.81330805039512e-13	24506914	24506914	1.27148748848359e-09	39091349	43599449
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	44199401	7	7	0.4747	1.27148748848359e-09	39091349	43599449	3.76667835742802e-12	43599449	45359327
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	45359327	70926188	334	330	-0.0204	3.76667835742802e-12	43599449	45359327	2.13242336436694e-16	70926188	70926188
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.0312	2.13242336436694e-16	70926188	70926188	8.73467960793466e-15	70930528	70930528
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	77192566	2337	2284	-0.0053	8.73467960793466e-15	70930528	70930528	9.22799804583753e-15	77192566	77192566
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77194207	77200826	3	3	-0.8506	9.22799804583753e-15	77192566	77192566	5.52592977759414e-15	77200826	77202889
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77202889	137352394	21425	21004	-0.0027	5.52592977759414e-15	77200826	77202889	2.56134341448135e-59	137352394	137352394
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-2.1844	2.56134341448135e-59	137352394	137352394	4.71269657001168e-50	137356880	137356880
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1081	-4e-04	4.71269657001168e-50	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	24109	-0.0046	NA	NA	NA	2.82506887019109e-84	77917893	77917893
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	2.1087	2.82506887019109e-84	77917893	77917893	1.80004140700637e-83	77928738	77928738
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	100676022	7762	7630	-0.003	1.80004140700637e-83	77928738	77928738	1.23627262781373e-08	100672415	100676022
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100679373	2	2	-0.8633	1.23627262781373e-08	100672415	100676022	4.1342935975113e-09	100679373	100679373
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686753	100686753	1	0	NA	4.1342935975113e-09	100679373	100679373	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100686787	110289009	3586	3511	5e-04	NA	NA	NA	4.24519849776208e-20	110289009	110289009
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	110293389	110299832	2	2	-1.2628	4.24519849776208e-20	110289009	110289009	7.91520152285335e-19	110299832	110299832
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	110309165	118965200	3014	2952	-0.0058	7.91520152285335e-19	110299832	110299832	6.42257875947016e-16	118965200	118965200
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	118967183	118971372	3	3	-0.9526	6.42257875947016e-16	118965200	118965200	1.31410213636343e-16	118971372	118971372
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	118974857	128576010	3531	3460	-0.0063	1.31410213636343e-16	118971372	118971372	8.9881679765441e-90	128576010	128576010
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	128579198	128581784	2	2	-2.7863	8.9881679765441e-90	128576010	128576010	2.78771556708413e-74	128581784	128581784
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	128582991	135285645	2310	2273	-0.0204	2.78771556708413e-74	128581784	128581784	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5738494	2137	2095	-0.0029	NA	NA	NA	1.58843020250567e-18	5733442	5738494
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5765438	16	12	-0.5628	1.58843020250567e-18	5733442	5738494	7.36181814045747e-24	5765438	5766615
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	6305096	230	226	-0.0144	7.36181814045747e-24	5765438	5766615	9.25265676479181e-15	6305096	6306970
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6306970	6312218	3	3	0.871	9.25265676479181e-15	6305096	6306970	4.93578442945388e-13	6309611	6312218
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6313841	7758275	629	619	-0.005	4.93578442945388e-13	6309611	6312218	7.45832579098944e-29	7758275	7762277
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7762277	7783492	9	8	-0.7999	7.45832579098944e-29	7758275	7762277	1.81475881489001e-29	7783344	7783492
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7797993	9893598	919	902	0.0034	1.81475881489001e-29	7783344	7783492	5.86138084606562e-10	9890946	9893598
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	9895007	9896149	2	2	-0.9328	5.86138084606562e-10	9890946	9893598	4.01182372584238e-10	9896149	9896149
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	9898583	49663240	12772	12541	-0.0042	4.01182372584238e-10	9896149	9896149	1.90037674423763e-22	49659817	49671267
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49666382	49710027	10	10	-0.6109	1.90037674423763e-22	49659817	49671267	6.57637177807966e-21	49699428	49710027
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	49721954	1	0	NA	6.57637177807966e-21	49699428	49710027	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49725462	55118214	177	177	0.0028	NA	NA	NA	2.20584807222607e-54	55112618	55124730
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	0.5296	2.20584807222607e-54	55112618	55124730	1.88624539809793e-65	55205278	55217189
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	81329446	9905	9714	0.0132	1.88624539809793e-65	55205278	55217189	9.38433568311543e-18	81324349	81329446
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81333047	81361396	11	11	0.526	9.38433568311543e-18	81324349	81329446	2.88761324532396e-19	81361396	81363283
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81363283	99031550	5581	5467	-0.0079	2.88761324532396e-19	81361396	81363283	5.44938657446259e-09	99020067	99037126
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99032916	99074552	19	18	0.2824	5.44938657446259e-09	99020067	99037126	9.8568007565478e-13	99064450	99082451
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	134450318	12844	12598	-0.0101	9.8568007565478e-13	99064450	99082451	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	291	-0.0143	NA	NA	NA	5.98999857742443e-18	734832	736988
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.8281	5.98999857742443e-18	734832	736988	2.44174162635631e-16	743223	743223
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	11116883	4029	3954	0.0061	2.44174162635631e-16	743223	743223	3.35759947481269e-77	11116883	11116883
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	1.3597	3.35759947481269e-77	11116883	11116883	2.84336850167935e-52	11140421	11140421
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	70	0.0293	2.84336850167935e-52	11140421	11140421	4.86400290044593e-57	11395862	11395862
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-1.3261	4.86400290044593e-57	11395862	11395862	6.54336438348395e-68	11435643	11435643
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	129795292	39783	39078	0.0022	6.54336438348395e-68	11435643	11435643	4.25877125745639e-13	129795292	129795292
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	129798907	129801793	2	2	-1.0403	4.25877125745639e-13	129795292	129795292	7.5431676423976e-09	129801793	129803521
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	129803521	130694393	318	312	-0.0044	7.5431676423976e-09	129801793	129803521	1.04033470014828e-13	130694393	130694393
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.2763	1.04033470014828e-13	130694393	130694393	4.94804933503159e-18	130701040	130701040
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	132287226	643	632	-0.0045	4.94804933503159e-18	130701040	130701040	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132289090	132289090	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	38643792	7645	7502	-0.0071	NA	NA	NA	4.85733909165662e-17	38643792	38643792
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	38645922	38649203	3	3	-1.0011	4.85733909165662e-17	38643792	38643792	2.21210521129283e-18	38649203	38649203
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	38651566	56650373	6377	6251	-0.0045	2.21210521129283e-18	38649203	38649203	3.41492435298328e-12	56607869	56657371
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56677538	11	11	-0.4323	3.41492435298328e-12	56607869	56657371	1.08622799952035e-12	56673183	56680346
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56679017	69929023	3190	3134	0.0027	1.08622799952035e-12	56673183	56680346	4.06534601243651e-32	69926437	69929023
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	69935702	69960543	10	10	0.7186	4.06534601243651e-32	69926437	69929023	1.93363470067278e-34	69960543	69960543
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	69967098	100690991	9844	9635	-0.0025	1.93363470067278e-34	69960543	69960543	4.41807813867016e-50	100690991	100690991
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.935	4.41807813867016e-50	100690991	100690991	1.07841592570810e-46	100693892	100693892
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4460	-0.0154	1.0784159257081e-46	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	5	-0.3273	NA	NA	NA	1.70060562954244e-05	18527871	18864561
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	53	-0.8004	1.70060562954244e-05	18527871	18864561	2.81633486776926e-213	19492531	19494416
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21641118	1042	1034	0.0175	2.81633486776926e-213	19492531	19494416	9.54798060260123e-61	21624686	21654727
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21644027	22047168	208	208	0.2508	9.54798060260123e-61	21624686	21654727	4.30863657908202e-80	22034704	22054604
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22048569	30636982	2707	2647	0.0038	4.30863657908202e-80	22034704	22054604	2.57521020950994e-10	30636503	30636982
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	30638597	30642060	3	3	0.7267	2.57521020950994e-10	30636503	30636982	8.19086356016576e-10	30642060	30644343
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	30644343	34181664	1491	1468	-0.0025	8.19086356016576e-10	30642060	30644343	1.56927582294596e-13	34179872	34186009
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34186009	34189146	4	4	-0.7409	1.56927582294596e-13	34179872	34186009	8.52438645840564e-14	34188666	34195251
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34195251	73071404	13905	13615	3e-04	8.52438645840564e-14	34188666	34195251	2.75557994964148e-16	73061942	73071404
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73092112	7	7	0.6063	2.75557994964148e-16	73061942	73071404	4.70558797607973e-15	73092112	73101327
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105787390	12248	12003	0.0014	4.70558797607973e-15	73092112	73101327	6.78665307044467e-20	105783533	105787390
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-0.7454	6.78665307044467e-20	105783533	105787390	0.000131730738518156	105795807	105804040
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105856972	23	23	-0.1111	0.000131730738518156	105795807	105804040	3.34312694183813e-27	105856972	105856972
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-2.3008	3.34312694183813e-27	105856972	105856972	5.24994273100916e-24	105875924	105881677
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	105923686	16	15	-0.1831	5.24994273100916e-24	105875924	105881677	1.29252214674163e-07	105921895	105946993
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106002179	20	20	0.3722	1.29252214674163e-07	105921895	105946993	5.5348398439985e-12	105989160	106017453
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106218059	90	90	-0.011	5.5348398439985e-12	105989160	106017453	4.17495753938957e-10	106207549	106232699
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106303994	34	32	0.2836	4.17495753938957e-10	106207549	106232699	8.35973313375548e-05	106279632	106308263
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106305325	106358491	18	18	0.014	8.35973313375548e-05	106279632	106308263	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18692865	6	6	0.0604	NA	NA	NA	1.12040116023558e-06	18452491	18749895
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18741716	18837737	9	9	-0.3471	1.12040116023558e-06	18452491	18749895	2.08358334266180e-19	18837737	18837737
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	0.4904	2.0835833426618e-19	18837737	18837737	2.33568322812062e-20	18848213	18848213
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19537035	80	79	-0.5278	2.33568322812062e-20	18848213	18848213	9.34954698454646e-14	19427350	19833542
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20053008	53	53	-0.1771	9.34954698454646e-14	19427350	19833542	1.12110260400470e-07	19982333	20364680
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20060061	22548372	377	369	0.0058	1.1211026040047e-07	19982333	20364680	1.80931255185316e-11	22548372	22548372
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22554240	22566552	2	2	-0.9861	1.80931255185316e-11	22548372	22548372	2.57225245482788e-11	22566552	22569215
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22569215	32456500	3296	3252	-0.0063	2.57225245482788e-11	22566552	22569215	1.47880161038989e-92	32454294	32514939
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32661846	26	25	-0.7893	1.47880161038989e-92	32454294	32514939	2.29262682982317e-96	32594200	32661846
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	74669752	17858	17511	-7e-04	2.29262682982317e-96	32594200	32661846	4.04041693243743e-30	74669752	74669752
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.1099	4.04041693243743e-30	74669752	74669752	5.72222474003942e-25	74680439	74680439
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	75115806	170	164	0.0249	5.72222474003942e-25	74680439	74680439	6.14162491787796e-31	75115806	75115806
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.725	6.14162491787796e-31	75115806	75115806	1.11295705845318e-40	75119713	75119713
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	75121466	1	0	NA	1.11295705845318e-40	75119713	75119713	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75124365	82394483	2653	2601	-0.0022	NA	NA	NA	8.8115247182432e-249	82394483	82394483
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82396121	82397719	2	2	-4.2457	8.8115247182432e-249	82394483	82394483	1.80812451233573e-216	82397719	82397719
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82400613	99012581	6228	6124	-0.0086	1.80812451233573e-216	82397719	82397719	8.69373762622952e-18	99012581	99012581
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99013625	99018948	3	3	-1.0183	8.69373762622952e-18	99012581	99012581	6.21744066427889e-17	99018948	99018948
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99020079	100298352	548	534	-0.0263	6.21744066427889e-17	99018948	99018948	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	6938727	2732	2685	0.0125	NA	NA	NA	7.19744197984888e-10	6937500	6938727
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6942078	6945539	3	3	0.7894	7.19744197984888e-10	6937500	6938727	3.92544882338254e-11	6945539	6949338
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6948325	6948325	1	0	NA	3.92544882338254e-11	6945539	6949338	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6949338	14956177	2733	2678	0.006	NA	NA	NA	2.9281761712195e-10	14683004	14956252
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956252	15028108	12	11	-0.3878	2.9281761712195e-10	14683004	14956252	7.45875092161407e-11	15023848	15037844
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15029941	32379126	5092	5005	0.0183	7.45875092161407e-11	15023848	15037844	2.20888946962644e-44	31854794	32515876
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	43	0.4269	2.20888946962644e-44	31854794	32515876	4.83051111264277e-48	33528385	33647856
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	72170174	8986	8822	0.0047	4.83051111264277e-48	33528385	33647856	1.39921464318614e-09	72169698	72170174
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72171424	72171424	1	0	NA	1.39921464318614e-09	72169698	72170174	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72172999	72173767	2	2	-0.8922	NA	NA	NA	1.54806867492032e-10	72173767	72173767
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72175070	74095899	616	602	0.0084	1.54806867492032e-10	72173767	72173767	2.0646010753461e-07	74079468	74109031
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74097511	74137609	18	18	-0.2497	2.0646010753461e-07	74079468	74109031	4.91376570701486e-06	74124510	74159227
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74139612	75093957	283	281	0.0085	4.91376570701486e-06	74124510	74159227	1.22800590786645e-71	75093957	75093957
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.0686	1.22800590786645e-71	75093957	75093957	8.61618871596391e-74	75100865	75100865
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	75102639	1	0	NA	8.61618871596391e-74	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75104836	76925748	609	597	-0.0157	NA	NA	NA	7.17255485646241e-28	76923844	76929598
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.7827	7.17255485646241e-28	76923844	76929598	3.01799705924236e-26	76938723	76940218
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4425	-0.0016	3.01799705924236e-26	76938723	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	3193637	1427	1402	0.0174	NA	NA	NA	1.68194843205494e-08	3193433	3193637
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	3206786	3208028	2	2	-0.8503	1.68194843205494e-08	3193433	3193637	1.54370660180827e-08	3208028	3214123
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	3214123	15727076	4873	4761	0.0153	1.54370660180827e-08	3208028	3214123	4.89964900980764e-320	15727076	15727076
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-5.1022	4.89964900980764e-320	15727076	15727076	0	15733964	15733964
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	31457889	5733	5611	0.0102	0	15733964	15733964	1.28274310867333e-18	31447686	31467971
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31499568	18	18	-0.4035	1.28274310867333e-18	31447686	31467971	9.50202532911598e-22	31490899	31889566
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31503774	36760017	1854	1818	0.0241	9.50202532911598e-22	31490899	31889566	6.17560995375066e-57	36760017	36761288
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36761288	36778929	12	12	-0.8157	6.17560995375066e-57	36760017	36761288	1.74668182639181e-51	36777085	36778929
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36780629	52440878	5514	5410	0.0187	1.74668182639181e-51	36777085	36778929	3.49647862292585e-14	52440878	52440878
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-0.8245	3.49647862292585e-14	52440878	52440878	3.93127141950122e-12	52447064	52447064
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	78653545	10196	9979	0.0164	3.93127141950122e-12	52447064	52447064	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	294153	77	75	-0.0084	NA	NA	NA	1.10731263917338e-17	293306	297183
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	297183	308381	7	7	0.4865	1.10731263917338e-17	293306	297183	1.34302921232543e-10	306867	313246
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	309690	1961897	573	564	-0.0075	1.34302921232543e-10	306867	313246	1.25762380474494e-42	1959391	1965766
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1965766	2062628	30	29	0.4809	1.25762380474494e-42	1959391	1965766	3.32153116642923e-45	2058902	2065218
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	2065218	53110731	15519	15191	-0.0099	3.32153116642923e-45	2058902	2065218	4.031654033754e-10	53110731	53110731
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53114028	53116053	2	2	-0.9206	4.031654033754e-10	53110731	53110731	1.03008764190625e-09	53116053	53116053
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53118362	76116026	6756	6623	-0.0137	1.03008764190625e-09	53116053	53116053	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3353960	1420	1382	0.0161	NA	NA	NA	1.09394930968807e-09	3353960	3353960
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	-1.0082	1.09394930968807e-09	3353960	3353960	1.73458354877706e-11	3356334	3356334
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	14773105	5185	5088	0.0377	1.73458354877706e-11	3356334	3356334	2.37850773608516e-35	14773105	14773105
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14776890	14783573	6	6	-1.0033	2.37850773608516e-35	14773105	14773105	2.56619232005387e-36	14783573	14783573
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14787533	44486106	7835	7703	0.0243	2.56619232005387e-36	14783573	14783573	8.30462385149554e-09	44486106	44486106
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44487452	44489058	2	2	0.9257	8.30462385149554e-09	44486106	44486106	5.29355452205549e-10	44489058	44489058
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44491521	51237610	2826	2772	0.0292	5.29355452205549e-10	44489058	44489058	1.14264147191091e-24	51237610	51237610
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51247833	51258559	6	6	-0.772	1.14264147191091e-24	51237610	51237610	1.14265966509650e-18	51258559	51258559
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51261234	51313257	18	18	-0.0335	1.1426596650965e-18	51258559	51258559	3.24430635403644e-19	51313257	51313257
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51316654	51319006	3	3	-0.9131	3.24430635403644e-19	51313257	51313257	3.35042804887345e-18	51319006	51319006
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51320617	51320617	1	0	NA	3.35042804887345e-18	51319006	51319006	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51322506	51649093	132	127	0.0464	NA	NA	NA	2.33606455461261e-09	51649093	51649093
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51650847	51653207	2	2	-0.7954	2.33606455461261e-09	51649093	51649093	8.16874568504323e-09	51653207	51653207
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51656983	52259544	281	273	0.0352	8.16874568504323e-09	51653207	51653207	1.07845593466142e-06	52244591	52262203
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52260872	52266684	5	5	-0.4296	1.07845593466142e-06	52244591	52262203	3.19245881754450e-06	52263707	52269011
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52267887	55247874	1419	1398	0.046	3.1924588175445e-06	52263707	52269011	1.04662341577180e-08	55245444	55247874
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55250187	55252420	2	2	-0.8341	1.0466234157718e-08	55245444	55247874	1.60119242465528e-07	55252420	55252420
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55253699	58208527	1322	1288	0.0229	1.60119242465528e-07	55252420	55252420	6.90229395590368e-08	58198955	58212113
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58239871	13	13	-0.3218	6.90229395590368e-08	58198955	58212113	2.59890401756124e-08	58234974	58249435
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58241773	58616879	160	158	0.0073	2.59890401756124e-08	58234974	58249435	1.12690390074926e-21	58615499	58616879
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58620201	58620201	1	0	NA	1.12690390074926e-21	58615499	58616879	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58624300	58646156	7	7	0.7157	NA	NA	NA	1.73337711739003e-06	58646156	58652487
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58648456	58701688	14	13	0.3381	1.73337711739003e-06	58646156	58652487	1.32263062982994e-05	58694189	58714174
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58704345	59414898	393	379	0.0437	1.32263062982994e-05	58694189	58714174	2.2020821704984e-10	59406523	59421197
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59442709	14	14	-0.3383	2.2020821704984e-10	59406523	59421197	9.01482569192625e-10	59440274	59446274
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59443697	63788698	1990	1948	0.0076	9.01482569192625e-10	59440274	59446274	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	12719	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15778	1511632	586	571	-0.0102	NA	NA	NA	1.91975785134812e-203	1511632	1511632
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1515948	1525300	6	6	-2.6233	1.91975785134812e-203	1511632	1511632	0.000201412419239060	1521410	1525300
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	1532433	3	3	-0.7322	0.00020141241923906	1521410	1525300	3.57416449317319e-09	1532433	1544485
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	2447049	339	331	-0.0147	3.57416449317319e-09	1532433	1544485	0.0375887916475716	2409440	2447049
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	2448631	2450686	2	2	-0.4435	0.0375887916475716	2409440	2447049	1.28374640488786e-10	2450686	2491620
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	2452972	41014986	12686	12420	-0.0054	1.28374640488786e-10	2450686	2491620	6.78693668592329e-11	41011088	41014986
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	41016736	41023049	4	4	0.4872	6.78693668592329e-11	41011088	41014986	3.47834564829172e-06	41023049	41028922
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	41024326	62419534	7952	7792	-0.0015	3.47834564829172e-06	41023049	41028922	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	30850540	5690	5587	-0.0036	NA	NA	NA	2.77677987604114e-12	30850540	30850540
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	30852906	30854440	2	2	-0.9987	2.77677987604114e-12	30850540	30850540	2.74460042441128e-11	30854440	30854440
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	30855571	46922972	7749	7609	-0.004	2.74460042441128e-11	30854440	30854440	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	21357082	2392	2352	0.0194	NA	NA	NA	2.91601566891419e-89	21355668	21362255
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21358456	21358456	1	0	NA	2.91601566891419e-89	21355668	21362255	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21362255	21417094	28	28	-0.7507	NA	NA	NA	2.52961672518601e-83	21415608	21422524
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21422524	22667608	562	550	0.0353	2.52961672518601e-83	21415608	21422524	2.05949831678551e-317	22667608	22679305
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	-2.5464	2.05949831678551e-317	22667608	22679305	0	22720195	22725305
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6434	0.0118	0	22720195	22725305	2.59557767382842e-18	35472378	35472378
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	1.251	2.59557767382842e-18	35472378	35472378	1.37513360268009e-15	35476942	35476942
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	36306651	467	462	0.0331	1.37513360268009e-15	35476942	35476942	5.34515077923591e-18	36302453	36306651
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36308378	36316051	5	5	-0.7717	5.34515077923591e-18	36302453	36306651	4.73944652199771e-19	36316051	36316051
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36318848	37621766	716	707	0.0375	4.73944652199771e-19	36316051	36316051	1.49723317471078e-15	37621766	37621766
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	1.1936	1.49723317471078e-15	37621766	37621766	4.7764686969888e-11	37626069	37626069
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	37685496	21	20	0.0942	4.7764686969888e-11	37626069	37626069	2.38428331824997e-10	37681158	37690142
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	0.6016	2.38428331824997e-10	37681158	37690142	2.14798941893899e-31	37709300	37718669
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	47764755	4986	4887	0.0115	2.14798941893899e-31	37709300	37718669	6.55865778366538e-14	47762763	47764755
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47767302	47777763	4	4	-0.7823	6.55865778366538e-14	47762763	47764755	5.64860574749294e-12	47777763	47782744
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	47782744	49571068	786	773	-8e-04	5.64860574749294e-12	47777763	47782744	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.3795	NA	NA	NA	1.55957250723026e-17	94062	94062
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-0.388	1.55957250723026e-17	94062	94062	6.42717264570253e-08	108902	113927
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	662876	422	415	-0.0085	6.42717264570253e-08	108902	113927	1.805400271765e-08	662876	662876
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	665402	665552	2	2	0.8632	1.805400271765e-08	662876	662876	1.39723160188338e-07	665552	667172
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	667172	2672401	1326	1300	0.0275	1.39723160188338e-07	665552	667172	5.20261402759257e-11	2668419	2687501
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2488	5.20261402759257e-11	2668419	2687501	8.32343661053295e-89	2708291	2711273
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	4244902	500	491	0.886	8.32343661053295e-89	2708291	2711273	8.77990807784329e-09	4239811	4244902
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	4248488	4258174	5	5	0.055	8.77990807784329e-09	4239811	4244902	1.60139460385764e-19	4258174	4261500
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	4261500	49268306	16499	16173	0.9819	1.60139460385764e-19	4258174	4261500	1.75623023673365e-15	49268306	49268306
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	49270920	49277793	3	3	-0.0894	1.75623023673365e-15	49268306	49268306	2.54977364811878e-13	49277793	49279631
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	49279631	53492597	1082	1055	0.9522	2.54977364811878e-13	49277793	49279631	1.06227698769529e-31	53491343	53492597
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53493883	53507035	7	7	-0.0896	1.06227698769529e-31	53491343	53492597	2.46913027550859e-32	53507035	53510020
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53510020	76998610	4843	4739	0.969	2.46913027550859e-32	53507035	53510020	9.7637272844563e-46	76998610	76998610
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.3171	9.7637272844563e-46	76998610	76998610	1.63867204734242e-50	77010018	77010018
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	139313497	17658	17262	0.9826	1.63867204734242e-50	77010018	77010018	4.04314252862085e-11	139313301	139313497
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	139320935	139328851	3	3	0.0624	4.04314252862085e-11	139313301	139313497	1.24233909366930e-09	139328851	139332660
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	139332660	152655026	3859	3757	0.9604	1.2423390936693e-09	139328851	139332660	2.44070492146853e-15	152655026	152655026
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.4128	2.44070492146853e-15	152655026	152655026	4.75752012466821e-09	152657445	152669192
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	154038318	538	524	0.9027	4.75752012466821e-09	152657445	152669192	2.19152833161805e-05	154023900	154038318
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154044828	154070953	9	9	1.3869	2.19152833161805e-05	154023900	154038318	9.73073823738326e-08	154070953	154079002
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154078401	154442377	92	92	0.9464	9.73073823738326e-08	154070953	154079002	2.06103181219486e-22	154442377	154442377
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154449960	3	3	2.2409	2.06103181219486e-22	154442377	154442377	5.04271113915676e-33	154449960	154449960
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154450309	154582414	29	28	1.0237	5.04271113915676e-33	154449960	154449960	3.93444302547819e-137	154582414	154582414
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.0177	3.93444302547819e-137	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	122	-3.9776	NA	NA	NA	3.23344588860921e-32	3223585	3733715
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.7487	3.23344588860921e-32	3223585	3733715	1.23092482584656e-18	5531459	6688691
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	170	-3.6612	1.23092482584656e-18	5531459	6688691	7.22410643719354e-09	7029972	7197846
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7461576	121	120	-2.6446	7.22410643719354e-09	7029972	7197846	0.000317424696357019	7294545	7652302
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7970340	152	146	-3.3943	0.000317424696357019	7294545	7652302	3.84237975658215e-05	7831268	8036254
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7985459	8289709	73	70	-4.2197	3.84237975658215e-05	7831268	8036254	5.45803057633992e-13	8259766	8289709
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8316416	11	10	-2.1194	5.45803057633992e-13	8259766	8289709	0.000487442322862691	8316416	8348968
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324291	8949553	179	172	-3.4971	0.000487442322862691	8316416	8348968	0.0539232491115208	8817788	8949553
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.7264	0.0539232491115208	8817788	8949553	3.12244400455451e-08	8956787	8958121
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9160624	36	34	-4.7642	3.12244400455451e-08	8956787	8958121	1.48540217955767e-11	9155283	9164547
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10014777	12	12	-2.8019	1.48540217955767e-11	9155283	9164547	7.00946028462985e-07	10001056	10025706
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10025706	10251061	17	17	-4.0901	7.00946028462985e-07	10001056	10025706	0.000324758788419926	10062417	10251061
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10254943	10368218	5	4	-2.873	0.000324758788419926	10062417	10251061	2.70374115046261e-13	10368218	10370293
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10370293	10404607	17	17	-4.7907	2.70374115046261e-13	10368218	10370293	0.00130274255035643	10399102	10473791
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10429196	10515697	25	24	-3.7974	0.00130274255035643	10399102	10473791	4.02876471211532e-32	10515697	10515697
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.4321	4.02876471211532e-32	10515697	10515697	0.00677220973852319	10645500	11660512
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	11698871	6	6	-2.087	0.00677220973852319	10645500	11660512	0.00428720427328237	10655750	12502304
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	12	-4.1981	0.00428720427328237	10655750	12502304	2.02995832418405e-08	12536761	12546917
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	53	-2.1219	2.02995832418405e-08	12536761	12546917	5.5405557651814e-09	12658135	12715696
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	20	-3.9567	5.5405557651814e-09	12658135	12715696	5.57214811541912e-06	12796639	12861657
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	111	-2.3486	5.57214811541912e-06	12796639	12861657	0.000321189379575429	13100625	13137597
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	12	-4.0361	0.000321189379575429	13100625	13137597	0.000768429060351318	13147329	13159901
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13202163	15	15	-2.5046	0.000768429060351318	13147329	13159901	5.08957985474463e-08	13173328	13232295
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13208776	14342834	381	371	-4.0309	5.08957985474463e-08	13173328	13232295	1.20435524621293e-09	14330251	14349668
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14380301	19	19	-2.5516	1.20435524621293e-09	14330251	14349668	8.99714971470123e-14	14379418	14381372
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	14407293	12	12	-4.6682	8.99714971470123e-14	14379418	14381372	0.00352090419398558	14404284	14434912
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14508021	65	64	-3.3282	0.00352090419398558	14404284	14434912	2.81275022224614e-05	14498784	14508021
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14545228	11	10	-1.4424	2.81275022224614e-05	14498784	14508021	0.000117215164010876	14538156	14545228
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14546195	14554415	6	5	-3.2146	0.000117215164010876	14538156	14545228	2.83444792287166e-08	14554415	14554415
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14555872	14579298	9	9	-1.4412	2.83444792287166e-08	14554415	14554415	0.00110891064540590	14579298	14603508
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14700040	23	23	-3.1132	0.0011089106454059	14579298	14603508	0.000265473300196549	14644293	14708015
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14883615	43	43	-4.2775	0.000265473300196549	14644293	14708015	1.97686105544755e-05	14857726	14883615
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	14909937	4	4	-2.0571	1.97686105544755e-05	14857726	14883615	1.43047695727353e-06	14909937	14916784
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14913412	14994704	12	12	-3.8672	1.43047695727353e-06	14909937	14916784	2.4720674609612e-07	14994704	15005207
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15005207	15018205	3	3	-1.2759	2.4720674609612e-07	14994704	15005207	1.29779193625928e-10	15018205	15018205
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15022037	15139441	28	28	-4.3967	1.29779193625928e-10	15018205	15018205	2.40722367699557e-06	15124246	15159692
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15284717	81	77	-3.1078	2.40722367699557e-06	15124246	15159692	2.59912120357069e-10	15273305	15293299
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15388044	66	66	-4.4094	2.59912120357069e-10	15273305	15293299	2.03880846442472e-10	15378329	15410566
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15389388	15642822	113	110	-3.109	2.03880846442472e-10	15378329	15410566	4.79601790567397e-05	15553682	15661862
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15650200	15915466	44	42	-4.1601	4.79601790567397e-05	15553682	15661862	2.96897780047036e-07	15892492	15967120
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16224597	133	126	-3.1272	2.96897780047036e-07	15892492	15967120	4.98794694732297e-19	16215750	16247995
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16228031	16679419	78	76	-4.5034	4.98794694732297e-19	16215750	16247995	6.37608972412225e-05	16607621	16911197
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16680383	22157319	890	863	-3.9015	6.37608972412225e-05	16607621	16911197	8.17298076240865e-08	22056953	22158616
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-1.5878	8.17298076240865e-08	22056953	22158616	3.69172330407622e-24	22177335	22178964
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22268552	29	29	-4.6537	3.69172330407622e-24	22177335	22178964	1.12405627358246e-05	22243796	22395796
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22877495	46	44	-3.714	1.12405627358246e-05	22243796	22395796	0.00100459096584692	22845338	22894379
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22930737	18	16	-4.5877	0.00100459096584692	22845338	22894379	1.00282673413781e-108	22930737	22930737
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.0135	1.00282673413781e-108	22930737	22930737	3.46832047112665e-20	26945893	26950080
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.8292	3.46832047112665e-20	26945893	26950080	9.76373998838231e-05	26965406	26980386
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	26989053	2	2	-0.4608	9.76373998838231e-05	26965406	26980386	7.08912816813216e-39	26989053	26989053
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26990807	26990807	1	0	NA	7.08912816813216e-39	26989053	26989053	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26995399	27003308	4	4	-2.6748	NA	NA	NA	1.51267246840158e-31	27003308	27003308
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	27019256	5	5	-0.6989	1.51267246840158e-31	27003308	27003308	2.74067117085577e-23	27019256	27019256
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27019306	1	0	NA	2.74067117085577e-23	27019256	27019256	NA	NA	NA
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27031809	27039222	3	3	-4.0758	NA	NA	NA	4.24935742490325e-19	27039222	27053237
MSK_252152912687_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.5101	4.24935742490325e-19	27039222	27053237	NA	NA	NA
