Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34739490	12876	12539	0.0288	NA	NA	NA	2.67657698305493e-10	34739490	34739490
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34744470	34758017	2	2	-1.794	2.67657698305493e-10	34739490	34739490	7.9527797709202e-11	34758017	34758017
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34761645	72537426	15016	14644	0.0055	7.9527797709202e-11	34758017	34758017	0	72537426	72537426
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.6955	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	94060783	6990	6818	-0.0038	0	72579311	72579311	2.90445316500083e-27	94060783	94060783
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-2.7283	2.90445316500083e-27	94060783	94060783	6.24569260645884e-26	94062928	94062928
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	150839754	10568	10304	-0.008	6.24569260645884e-26	94062928	94062928	8.67322673456159e-19	150839754	150839754
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	3	-1.9091	8.6732267345616e-19	150839754	150839754	5.7599217002456e-19	150846148	150846148
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	5.7599217002456e-19	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	157133150	2763	2683	0.0202	NA	NA	NA	3.19147187931072e-41	157133150	157133150
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.4313	3.19147187931072e-41	157133150	157133150	7.22486948562999e-42	157136342	157136342
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	227875096	25426	24758	-0.0032	7.22486948562999e-42	157136342	157136342	2.86336639311998e-103	227875096	227875096
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882087	3	3	-4.3719	2.86336639311998e-103	227875096	227875096	2.34839703340821e-104	227882087	227882087
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227882805	247186514	7481	7293	-0.0023	2.34839703340821e-104	227882087	227882087	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10612	0.0029	NA	NA	NA	3.70191394952502e-40	33076512	33076512
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-3.3313	3.70191394952502e-40	33076512	33076512	2.70442115649197e-42	33080437	33080437
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	629	0.009	2.70442115649197e-42	33080437	33080437	0	34543992	34551222
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	-4.3841	0	34543992	34551222	0	34583814	34589997
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	179767214	44742	43582	-0.0069	0	34583814	34589997	1.32472367615041e-45	179767214	179767214
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	-2.8802	1.32472367615041e-45	179767214	179767214	4.77691222809574e-45	179778919	179778919
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242689978	21542	20975	-0.004	4.77691222809574e-45	179778919	179778919	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10502	-0.0034	NA	NA	NA	3.02206086272628e-15	32074432	32074432
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.018	3.02206086272628e-15	32074432	32074432	1.72626371465331e-14	32080848	32080848
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	37953375	1883	1833	0.0072	1.72626371465331e-14	32080848	32080848	1.52025218457483e-07	37949781	37953375
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.8425	1.52025218457483e-07	37949781	37953375	2.35556573344041e-07	37961110	37963736
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	47460892	3531	3426	0.0135	2.35556573344041e-07	37961110	37963736	3.3663066026427e-48	47460892	47460892
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-3.6669	3.3663066026427e-48	47460892	47460892	1.10196037896080e-48	47466921	47466921
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	75479859	10656	10395	4e-04	1.1019603789608e-48	47466921	47466921	1.78131134011138e-27	75474341	75787094
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75875904	18	18	-0.925	1.78131134011138e-27	75474341	75787094	2.84473651647706e-27	75868882	76000715
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	194354505	36752	35852	-0.0106	2.84473651647706e-27	75868882	76000715	2.99427827112629e-159	194354505	194354505
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	5	-4.1397	2.99427827112629e-159	194354505	194354505	1.28810507204858e-143	194366950	194366950
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1935	-0.0134	1.28810507204858e-143	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	162234201	46416	45241	-0.0087	NA	NA	NA	3.97100780874536e-15	162220154	162239402
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	162239402	162313725	10	10	-0.9007	3.97100780874536e-15	162220154	162239402	2.84038188648813e-14	162308553	162333923
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	162321802	173659100	3408	3319	-0.0121	2.84038188648813e-14	162308553	162333923	1.03090330975723e-45	173659100	173659100
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173660684	173660684	1	0	NA	1.03090330975723e-45	173659100	173659100	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.5146	NA	NA	NA	4.09893117784482e-48	173666072	173666072
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3977	-0.0104	4.09893117784482e-48	173666072	173666072	5.89607746512908e-60	187330240	187330240
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-3.9204	5.89607746512908e-60	187330240	187330240	2.22825609710668e-57	187333619	187333619
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1214	-0.015	2.22825609710668e-57	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	140200229	40078	39078	-0.0106	NA	NA	NA	7.18359670940812e-14	140198797	140200229
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140216524	9	9	-0.9401	7.18359670940812e-14	140198797	140200229	4.03123368319896e-14	140216524	140221835
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	160168056	7120	6934	0.0011	4.03123368319896e-14	140216524	140221835	4.46267968061832e-15	160164910	160185202
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	160184606	160208033	11	11	-0.8777	4.46267968061832e-15	160164910	160185202	4.65157429645794e-15	160198224	160211347
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	160209581	175491949	4596	4471	0.0086	4.65157429645794e-15	160198224	160211347	8.80082812709908e-09	175274600	175498081
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	175494003	175551666	15	15	0.5959	8.80082812709908e-09	175274600	175498081	1.45003307419807e-07	175543375	175655394
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	175589765	180644810	1937	1902	0.0274	1.45003307419807e-07	175543375	175655394	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	183349	36	34	0.003	NA	NA	NA	0.100577115700626	114126	191387
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	186875	204881	6	5	-0.3426	0.100577115700626	114126	191387	1.16563847646491e-07	204881	210326
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	210326	234115	11	11	-0.8482	1.16563847646491e-07	204881	210326	1.82027084351698e-14	234115	237952
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	236535	26801068	9312	9089	0	1.82027084351698e-14	234115	237952	1.66023557566738e-07	26797255	26801068
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26811016	26861184	5	5	-0.9259	1.66023557566738e-07	26797255	26801068	2.28657344973815e-07	26861184	26865624
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	32558677	2307	2241	0.0235	2.28657344973815e-07	26861184	26865624	6.56386516619496e-120	32558677	32558677
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32590568	5	5	-3.6824	6.56386516619496e-120	32558677	32558677	4.45067705616543e-09	32590568	32593151
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32593151	32633691	12	11	-1.6809	4.45067705616543e-09	32590568	32593151	1.38027265130281e-55	32631315	32633691
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	54035000	8295	8073	0.009	1.38027265130281e-55	32631315	32633691	2.85094437914541e-08	54033505	54035000
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.2975	2.85094437914541e-08	54033505	54035000	2.21972378781105e-09	54042734	54045472
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67060622	2771	2702	-0.025	2.21972378781105e-09	54042734	54045472	9.84142735665501e-07	67043365	67060622
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67109079	7	7	-0.7663	9.84142735665501e-07	67043365	67060622	5.26154006712908e-07	67109079	67115306
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67111812	103841482	10429	10163	-0.012	5.26154006712908e-07	67109079	67115306	4.95560088910956e-14	103827105	103841482
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.366	4.95560088910956e-14	103827105	103841482	1.54630167792433e-13	103868154	103873584
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	170753106	22914	22355	-0.0078	1.54630167792433e-13	103868154	103873584	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	48551463	17064	16609	-0.003	NA	NA	NA	6.03122896846783e-09	48548875	48551463
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48554059	48562631	7	7	-0.8669	6.03122896846783e-09	48548875	48551463	2.68164848127508e-09	48562631	48575004
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48572106	64523575	2491	2432	0.0022	2.68164848127508e-09	48562631	48575004	9.08392488138042e-08	64516764	64523575
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64532019	64532949	2	2	-1.4907	9.08392488138042e-08	64516764	64523575	2.59014214970252e-07	64532949	64534167
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64534167	100166257	11499	11223	-5e-04	2.59014214970252e-07	64532949	64534167	3.58626561454837e-95	100166257	100166257
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100174991	3	3	-4.2003	3.58626561454837e-95	100166257	100166257	6.07297769764595e-94	100174991	100174991
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	103863630	1477	1440	0.0236	6.07297769764595e-94	100174991	100174991	9.45722899159886e-08	103862413	103863630
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103868277	103868375	2	2	-1.4871	9.45722899159886e-08	103862413	103863630	2.38992655457863e-07	103868375	103870016
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103870016	125831554	9893	9620	-0.0088	2.38992655457863e-07	103868375	103870016	1.73500492106969e-49	125831554	125831554
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.0198	1.73500492106969e-49	125831554	125831554	4.98723186864209e-49	125837524	125837524
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141690753	7492	7312	0.001	4.98723186864209e-49	125837524	125837524	4.15249482178886e-15	141687978	141690753
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.9334	4.15249482178886e-15	141687978	141690753	9.6287045284329e-14	141714168	141720324
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	145624787	1491	1453	0.0107	9.6287045284329e-14	141714168	141720324	1.26484148804207e-49	145617215	145628790
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145628790	145719392	43	41	-0.8503	1.26484148804207e-49	145617215	145628790	2.94483456923391e-50	145718184	145723569
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145720817	158821263	5218	5086	-0.0062	2.94483456923391e-50	145718184	145723569	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	112	-0.0333	NA	NA	NA	6.68850450999483e-13	581533	581533
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.0356	6.68850450999483e-13	581533	581533	1.47757338898642e-14	588865	588865
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	25120552	8038	7847	-0.0042	1.47757338898642e-14	588865	588865	4.25165202284221e-12	25120552	25120552
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	4.25165202284221e-12	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	1.856	NA	NA	NA	2.46036804902536e-12	25125700	25125700
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4791	-0.0019	2.46036804902536e-12	25125700	25125700	2.59065612148611e-70	39341524	39354149
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.8168	2.59065612148611e-70	39341524	39354149	3.54973866495965e-70	39500219	39509423
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30628	-0.0021	3.54973866495965e-70	39500219	39509423	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12730	-0.0052	NA	NA	NA	4.86527565423726e-17	70926188	70926188
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	2.1466	4.86527565423726e-17	70926188	70926188	6.9572076510508e-16	70930528	70930528
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	23179	-0.0025	6.9572076510508e-16	70930528	70930528	7.78043035805262e-26	137352394	137352394
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.7091	7.78043035805262e-26	137352394	137352394	2.21686492194158e-19	137356880	137356880
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1076	6e-04	2.21686492194158e-19	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	123957735	40758	39738	-0.0027	NA	NA	NA	4.5833567669072e-07	123956449	123961636
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123959854	123969584	5	5	-0.9451	4.5833567669072e-07	123956449	123961636	7.55072967319784e-07	123964859	123974228
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123971172	135285645	4045	3955	-0.0024	7.55072967319784e-07	123964859	123974228	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2078	0.0084	NA	NA	NA	2.31839170354219e-08	5730121	5744034
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5763749	14	14	-0.6192	2.31839170354219e-08	5730121	5744034	6.45316713789974e-09	5760117	5774108
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	55123719	14754	14373	-0.0023	6.45316713789974e-09	5760117	5774108	0	55123719	55123719
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	38	-4.0598	0	55123719	55123719	0	55207305	55209626
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	27640	0.0052	0	55207305	55209626	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3650	0.0215	NA	NA	NA	5.23271635160854e-44	9523923	9528590
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	4	-2.5272	5.23271635160854e-44	9523923	9528590	1.97827705622211e-37	9543817	9554149
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	10470425	341	330	-0.0359	1.97827705622211e-37	9543817	9554149	1.34473390997790e-21	10470425	10470425
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10474825	10485848	6	6	-1.4705	1.3447339099779e-21	10470425	10470425	7.11162865774118e-20	10485848	10491341
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11109483	232	228	-0.0796	7.11162865774118e-20	10485848	10491341	1.44517284050094e-15	11104973	11110735
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11110735	11140421	10	10	0.8866	1.44517284050094e-15	11104973	11110735	2.02374101066408e-13	11130871	11147675
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	124205755	38107	37146	-2e-04	2.02374101066408e-13	11130871	11147675	1.05393283646700e-07	124204239	124205755
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	124209793	124216867	4	3	-1.1408	1.053932836467e-07	124204239	124205755	1.94575230565762e-06	124216867	124220657
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	124220657	130943064	2162	2107	8e-04	1.94575230565762e-06	124216867	124220657	1.92129591872197e-07	130936199	130943064
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.4971	1.92129591872197e-07	130936199	130943064	4.52072204520124e-07	130946248	130947790
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	536	0.0076	4.52072204520124e-07	130946248	130947790	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7151	-0.0061	NA	NA	NA	4.68951200058439e-42	37953582	37953582
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.3573	4.68951200058439e-42	37953582	37953582	3.74695389212921e-43	37957844	37957844
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4752	-0.0045	3.74695389212921e-43	37957844	37957844	1.12650258543379e-38	49964838	49964838
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.1897	1.12650258543379e-38	49964838	49964838	1.56276379683386e-35	49971732	49971732
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	71375082	5442	5296	-0.0186	1.56276379683386e-35	49971732	49971732	8.35334776305219e-48	71375082	71375082
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-3.6891	8.35334776305219e-48	71375082	71375082	7.74709106851126e-50	71377671	71377671
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13600	-0.0133	7.74709106851126e-50	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34674458	5750	5622	0.0104	NA	NA	NA	1.21484793621336e-98	34674458	34674458
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-4.2656	1.21484793621336e-98	34674458	34674458	2.90885796392378e-97	34683810	34683810
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	106358491	26132	25403	-0.0032	2.90885796392378e-97	34683810	34683810	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2806	NA	NA	NA	0.000570096732716774	18432558	18826924
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19910696	109	104	-0.4049	0.000570096732716774	18432558	18826924	1.54326462954474e-29	19819961	19943587
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19927040	100298352	31208	30404	-0.0023	1.54326462954474e-29	19819961	19943587	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	31862577	10572	10304	0.0212	NA	NA	NA	7.10595005686207e-24	31838577	32481309
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	34054713	53	52	-0.5087	7.10595005686207e-24	31838577	32481309	6.97686472741471e-24	33842125	34063575
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34056516	75093957	9898	9622	0.0033	6.97686472741471e-24	33842125	34063575	1.99199009638453e-20	75093957	75093957
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.4135	1.99199009638453e-20	75093957	75093957	4.86650226911275e-19	75100865	75100865
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4991	0.0044	4.86650226911275e-19	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36673853	13871	13515	0.0201	NA	NA	NA	5.711179982237e-105	36673853	36673853
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-3.1672	5.711179982237e-105	36673853	36673853	5.08397012916658e-103	36684619	36684619
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41568539	2033	1988	0.0333	5.08397012916658e-103	36684619	36684619	1.02671402234151e-26	41561017	41572001
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	42151941	50	49	-0.5426	1.02671402234151e-26	41561017	41572001	4.67497501595625e-26	42147225	42161364
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42153189	74884216	12207	11892	0.0165	4.67497501595625e-26	42147225	42161364	2.00094378298112e-08	74877854	74887944
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74886101	74904114	11	11	0.7068	2.00094378298112e-08	74877854	74887944	2.67234478762347e-07	74900777	74915508
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74905971	78653545	1456	1422	0.0148	2.67234478762347e-07	74900777	74915508	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22417	-0.0116	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	477	0.0208	NA	NA	NA	1.95856836082392e-06	1395246	1398325
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.5615	1.95856836082392e-06	1395246	1398325	4.83723072680767e-06	1400840	1405308
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	2820067	680	669	0.025	4.83723072680767e-06	1400840	1405308	2.58656966228901e-07	2817074	2820067
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	2824379	2829316	4	4	-1.1635	2.58656966228901e-07	2817074	2820067	1.13226611451087e-08	2829316	2831131
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	2831131	59414898	19877	19349	0.0366	1.13226611451087e-08	2829316	2831131	2.52048768675259e-10	59410642	59421197
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.7852	2.52048768675259e-10	59410642	59421197	4.93874191675549e-10	59434159	59441741
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63787171	1993	1942	0.0181	4.93874191675549e-10	59434159	59441741	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63788698	63788698	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	570	0.0022	NA	NA	NA	1.91166164046759e-73	1506379	1515948
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.3368	1.91166164046759e-73	1506379	1515948	1.24587453988941e-91	1525300	1531162
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	12095485	3691	3595	0.0033	1.24587453988941e-91	1525300	1531162	2.8031422618329e-10	12095485	12095485
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.6853	2.8031422618329e-10	12095485	12095485	5.25338981413209e-09	12113855	12113855
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16874	0.0075	5.25338981413209e-09	12113855	12113855	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13110	-0.0041	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22696038	2989	2930	0.0321	NA	NA	NA	9.25992353912848e-08	22677959	22701123
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22696162	22720195	14	14	0.6367	9.25992353912848e-08	22677959	22701123	8.18881027478965e-09	22715919	22738466
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	28657987	3244	3170	0.0204	8.18881027478965e-09	22715919	22738466	9.52000164753046e-34	28654569	28662258
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28660383	28694446	24	24	-0.881	9.52000164753046e-34	28654569	28662258	4.51251563725439e-31	28691873	28697813
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28696014	49571068	10286	9992	0.0213	4.51251563725439e-31	28691873	28697813	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	0.4678	NA	NA	NA	7.19795707758566e-08	94062	98390
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-0.6412	7.19795707758566e-08	94062	98390	1.91191705033931e-06	104732	110101
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	124528	13	13	0.027	1.91191705033931e-06	104732	110101	6.00716078141086e-10	124528	127113
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-1.0661	6.00716078141086e-10	124528	127113	3.04113359283352e-09	129544	132689
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	851066	536	525	-0.0074	3.04113359283352e-09	129544	132689	7.54161923387314e-06	845758	853672
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	851251	859452	6	5	-0.8554	7.54161923387314e-06	845758	853672	1.23168902426561e-05	856619	861050
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	1431411	213	205	0.0218	1.23168902426561e-05	856619	861050	8.07538452482934e-14	1431411	1431411
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-2.1004	8.07538452482934e-14	1431411	1431411	1.00896564529699e-16	1432953	1432953
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1528282	63	63	-0.004	1.00896564529699e-16	1432953	1432953	4.40648544344892e-07	1526804	1528282
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-0.9757	4.40648544344892e-07	1526804	1528282	1.67373113029358e-05	1530474	1534998
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	1937368	311	303	-0.0015	1.67373113029358e-05	1530474	1534998	5.06475279855818e-08	1933131	1937368
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1939737	1945329	7	6	-0.9609	5.06475279855818e-08	1933131	1937368	5.70033662421667e-11	1945329	1950424
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1950424	2301365	223	219	0.0499	5.70033662421667e-11	1945329	1950424	1.35671582612530e-11	2300485	2303192
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2302065	1	0	NA	1.3567158261253e-11	2300485	2303192	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.3222	NA	NA	NA	1.03927415939425e-12	2304398	2306110
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	382	-0.0417	1.03927415939425e-12	2304398	2306110	0	2708113	2711273
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22342	1.0309	0	2708113	2711273	4.16628456926011e-13	76998610	76998610
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.0993	4.16628456926011e-13	76998610	76998610	2.30806967243869e-13	77010018	77010018
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21588	1.031	2.30806967243869e-13	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0237	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2721922	10	10	-4.2958	NA	NA	NA	0.0273522412399276	2716461	2787638
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2722729	2834262	46	44	-3.1502	0.0273522412399276	2716461	2787638	6.15616194844691e-07	2799341	2853217
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2836573	3223585	67	64	-4.1199	6.15616194844691e-07	2799341	2853217	6.59858638967395e-49	3223585	3733715
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	17	-0.9691	6.59858638967395e-49	3223585	3733715	1.90621287800004e-24	5531459	5672441
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6749115	16	15	-4.4067	1.90621287800004e-24	5531459	5672441	0.00208772213775972	6737995	6798710
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6756250	7054924	159	152	-3.1142	0.00208772213775972	6737995	6798710	0.000447867439190029	7005620	7264547
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7057026	1	0	NA	0.000447867439190029	7005620	7264547	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7070931	7495687	127	124	-2.3795	NA	NA	NA	0.000888015144115543	7292494	7663037
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	8010446	155	153	-3.1042	0.000888015144115543	7292494	7663037	0.00092385873893864	7831268	8059682
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8245608	57	56	-3.8787	0.00092385873893864	7831268	8059682	0.000175377384986318	8211300	8378918
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8251785	8956787	199	194	-3.1617	0.000175377384986318	8211300	8378918	0.00096450302534175	8786453	10012024
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10515697	112	109	-3.7005	0.00096450302534175	8786453	10012024	1.46865710258413e-20	10506718	10620136
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12682301	84	78	-1.8683	1.46865710258413e-20	10506718	10620136	3.69722440221547e-05	12627138	12700767
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12786515	16	16	-3.8003	3.69722440221547e-05	12627138	12700767	3.6150604748441e-08	12756268	12820920
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12792780	13129843	120	118	-1.902	3.6150604748441e-08	12756268	12820920	2.08306866541032e-08	13104920	13148290
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13133803	13254711	41	40	-3.2204	2.08306866541032e-08	13104920	13148290	0.0037373633172006	13150942	13396331
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13256555	1	0	NA	0.0037373633172006	13150942	13396331	NA	NA	NA
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	14340202	365	351	-3.7719	NA	NA	NA	1.3374285152441e-09	14244120	14383746
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14342834	14508021	97	96	-2.9744	1.3374285152441e-09	14244120	14383746	2.42195553881291e-11	14498784	14524829
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	24	-1.0442	2.42195553881291e-11	14498784	14524829	1.51376832144898e-17	14566592	14596156
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	402	-3.3993	1.51376832144898e-17	14566592	14596156	1.70606340818611e-05	15655003	15996118
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	101	-2.6843	1.70606340818611e-05	15655003	15996118	5.03941520800616e-12	16118971	16212418
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	21036411	728	710	-3.5897	5.03941520800616e-12	16118971	16212418	3.76286580583240e-05	21026715	21041164
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.4606	3.7628658058324e-05	21026715	21041164	1.88023257441545e-05	21047798	21060047
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21689031	164	162	-3.5697	1.88023257441545e-05	21047798	21060047	0.00093901095166944	21574425	21693809
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21691199	21776479	17	17	-2.4337	0.00093901095166944	21574425	21693809	7.41813969523276e-06	21768635	21839028
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21787090	22157319	81	78	-3.64	7.41813969523276e-06	21768635	21839028	6.89178007099952e-11	22058759	22158616
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22179794	10	10	-1.5756	6.89178007099952e-11	22058759	22158616	5.21313818867683e-15	22179794	22182080
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22181855	22930737	91	87	-3.9629	5.21313818867683e-15	22179794	22182080	2.13449218449016e-72	22926726	25737663
MSK_252152912760_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	81	-1.1867	2.13449218449016e-72	22926726	25737663	NA	NA	NA
