Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72516942	27882	26201	0.0116	NA	NA	NA	2.11225544635245e-12	72504675	72525842
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72519056	72610316	30	25	0.3482	2.11225544635245e-12	72504675	72525842	2.08032140081626e-12	72567555	72645745
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72616137	109399152	11409	10726	-0.0108	2.08032140081626e-12	72567555	72645745	5.86056780630996e-10	109399092	109399152
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109406558	109407073	3	3	-0.9443	5.86056780630996e-10	109399092	109399152	4.43582878973985e-10	109407073	109411201
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109411201	147329819	4853	4565	-0.0061	4.43582878973985e-10	109407073	109411201	2.60115279447763e-08	146290772	147357754
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147346371	147475854	24	23	0.304	2.60115279447763e-08	146290772	147357754	1.99596893052850e-07	147441409	147847659
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147490553	150819879	1263	1190	0.0157	1.9959689305285e-07	147441409	147847659	5.28111616010511e-34	150819879	150819879
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	1.4519	5.28111616010511e-34	150819879	150819879	7.8704215043004e-15	150839754	150839754
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	5	2.8125	7.8704215043004e-15	150839754	150839754	3.14668879443419e-157	150851439	150851439
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	74	-1e-04	3.14668879443419e-157	150851439	150851439	1.33057228546601e-11	151024118	151028700
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8777	1.33057228546601e-11	151024118	151028700	3.89360645236289e-11	151033188	151038091
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2523	0.0165	3.89360645236289e-11	151033188	151038091	3.92700601908342e-63	157133150	157133150
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.821	3.92700601908342e-63	157133150	157133150	1.16218618451082e-63	157136342	157136342
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	194978218	13296	12559	-0.0061	1.16218618451082e-63	157136342	157136342	9.8756145442094e-13	194976022	195014129
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195095156	11	11	-0.5562	9.8756145442094e-13	194976022	195014129	7.7828557641421e-15	195062793	195103883
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195097118	247186514	19603	18436	-0.0018	7.7828557641421e-15	195062793	195103883	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	37789939	12904	12109	-0.0021	NA	NA	NA	5.0511662403073e-11	37776576	37803744
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	24	-0.351	5.0511662403073e-11	37776576	37803744	7.23311605217978e-11	37846240	37868682
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	40797424	1347	1279	-0.0132	7.23311605217978e-11	37846240	37868682	1.97246358973524e-14	40797424	40797424
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40798586	40800199	2	2	-1.3406	1.97246358973524e-14	40797424	40797424	4.20763106876909e-14	40800199	40800199
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40801749	52600588	4452	4165	-0.002	4.20763106876909e-14	40800199	40800199	4.46935654725434e-11	52588009	52600588
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	4.46935654725434e-11	52588009	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	0.8416	NA	NA	NA	8.77746259688027e-11	52635695	52642716
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	52639605	1	0	NA	8.77746259688027e-11	52635695	52642716	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52642716	180117780	37651	35448	-0.0071	NA	NA	NA	1.49086875901450e-10	180115198	180117780
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180121271	1	0	NA	1.4908687590145e-10	180115198	180117780	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180122518	180127415	4	4	-0.8476	NA	NA	NA	7.48323519279373e-11	180127415	180131608
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180129680	180129680	1	0	NA	7.48323519279373e-11	180127415	180131608	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	227949124	15885	14905	-0.0079	NA	NA	NA	1.70040280389752e-08	227943049	227952131
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227986221	13	12	0.4253	1.70040280389752e-08	227943049	227952131	8.93563488274137e-13	227976902	228016799
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227990692	242689978	5534	5213	0.0028	8.93563488274137e-13	227976902	228016799	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10106	-0.0076	NA	NA	NA	1.86817554617298e-31	32074432	32074432
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.977	1.86817554617298e-31	32074432	32074432	8.05076807701447e-31	32080848	32080848
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	32094956	1	0	NA	8.05076807701447e-31	32080848	32080848	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32098215	44509455	4234	3973	0.0041	NA	NA	NA	2.80018148235295e-26	44505166	44511880
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	44511880	44551556	20	19	0.5977	2.80018148235295e-26	44505166	44511880	3.57249790458295e-27	44547645	44554449
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	44554449	133189686	28656	26972	-0.006	3.57249790458295e-27	44547645	44554449	1.24955546957603e-161	133189686	133189686
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-4.4796	1.24955546957603e-161	133189686	133189686	4.91217013186488e-165	133194685	133194685
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9233	-0.0065	4.91217013186488e-165	133194685	133194685	2.45019244612539e-131	164005577	164005577
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	2.8235	2.45019244612539e-131	164005577	164005577	2.58519480205846e-30	164019640	164027724
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.5586	2.58519480205846e-30	164019640	164027724	3.80380229580876e-26	164107951	164115417
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	199329592	12116	11389	-0.0101	3.80380229580876e-26	164107951	164115417	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9018	0.0031	NA	NA	NA	1.24222720981004e-10	34439897	34445002
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.6781	1.24222720981004e-10	34439897	34445002	1.84420321845949e-10	34491115	34509895
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	107275274	21582	20292	-0.0086	1.84420321845949e-10	34491115	34509895	1.08048062616820e-253	107275274	107275274
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-3.8922	1.0804806261682e-253	107275274	107275274	1.59055390783246e-247	107281410	107281410
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	173224400	18484	17371	-0.013	1.59055390783246e-247	107281410	107281410	2.33609526628737e-32	173224400	173224400
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.9926	2.33609526628737e-32	173224400	173224400	1.60189726116334e-37	173228860	173228860
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	181	-0.0091	1.60189726116334e-37	173228860	173228860	9.9037386095765e-24	173660684	173660684
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.8207	9.9037386095765e-24	173660684	173660684	1.04404935174642e-26	173666072	173666072
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3565	-0.0056	1.04404935174642e-26	173666072	173666072	1.13053718198651e-81	186676034	186676034
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	3.123	1.13053718198651e-81	186676034	186676034	4.20307879729906e-81	186680176	186680176
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1457	-0.005	4.20307879729906e-81	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	8750027	2603	2438	0.0021	NA	NA	NA	1.82839064081487e-17	8744438	8750027
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.8497	1.82839064081487e-17	8744438	8750027	6.32136157571243e-17	8800001	8809384
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	12857302	1366	1287	-0.0153	6.32136157571243e-17	8800001	8809384	2.95096439034825e-11	12857302	12857302
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.1691	2.95096439034825e-11	12857302	12857302	1.49026602392347e-10	12873052	12873052
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	97060205	23494	22097	-0.01	1.49026602392347e-10	12873052	12873052	2.20960930140983e-25	97060205	97060205
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97074064	97119376	7	7	-0.9642	2.20960930140983e-25	97060205	97060205	1.39415837342915e-25	97119376	97126918
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	97126918	155405839	18005	16911	-0.0047	1.39415837342915e-25	97119376	97126918	1.14734052220266e-12	155405839	155405839
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155416484	2	2	-1.2882	1.14734052220266e-12	155405839	155405839	1.04533502796684e-12	155416484	155416484
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155418745	180194323	8160	7677	0.0041	1.04533502796684e-12	155416484	155416484	1.64126029859852e-07	180187846	180346557
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180342860	1	0	NA	1.64126029859852e-07	180187846	180346557	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180357210	7	7	0.5446	NA	NA	NA	1.90194610020501e-06	180352261	180365950
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180358977	180358977	1	0	NA	1.90194610020501e-06	180352261	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	105	0.0115	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	29950805	10587	9981	-4e-04	NA	NA	NA	0	29950805	29962849
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	14	-2.5859	0	29950805	29962849	1.43952947524528e-259	30004636	30010234
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31385778	580	550	0.0045	1.43952947524528e-259	30004636	30010234	7.82705814304623e-11	31383925	31385778
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	5	-0.7657	7.82705814304623e-11	31383925	31385778	3.9230054755032e-12	31418006	31425113
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	459	0.0536	3.9230054755032e-12	31418006	31425113	2.870771641879e-20	32543054	32558677
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32595402	7	7	0.9515	2.870771641879e-20	32543054	32558677	3.66302580428826e-10	32593151	32597877
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32713363	38	36	0.1052	3.66302580428826e-10	32593151	32597877	3.08721654840115e-12	32711957	32716255
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728285	7	7	1.0816	3.08721654840115e-12	32711957	32716255	6.25023812444778e-32	32723722	32728285
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32728487	32728487	1	0	NA	6.25023812444778e-32	32723722	32728285	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54035000	8259	7759	0.0041	NA	NA	NA	8.48314021239935e-226	54035000	54035000
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.3225	8.48314021239935e-226	54035000	54035000	2.54256183376977e-235	54042734	54042734
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79015901	6431	6072	-0.006	2.54256183376977e-235	54042734	54042734	0	79015901	79015901
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79018959	79018959	1	0	NA	0	79015901	79015901	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-5.4325	NA	NA	NA	0	79091850	79091850
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	82855359	972	908	-0.0109	0	79091850	79091850	2.46638520124847e-09	82848797	82855359
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	82860634	82864529	2	2	-1.1025	2.46638520124847e-09	82848797	82855359	1.18029491456994e-09	82864529	82864529
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	82885251	103841482	5788	5446	-0.0114	1.18029491456994e-09	82864529	82864529	1.54018924903216e-27	103841482	103841482
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.2652	1.54018924903216e-27	103841482	103841482	1.13069476646792e-26	103868154	103868154
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	132154299	9540	8936	-0.0079	1.13069476646792e-26	103868154	103868154	2.72283025671831e-11	132154299	132154299
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132156778	132159522	2	2	-1.2	2.72283025671831e-11	132154299	132154299	3.10373259825540e-11	132159522	132159522
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132161292	151542179	6738	6388	-0.0086	3.1037325982554e-11	132159522	132159522	3.53970316102953e-11	151539187	151542179
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151546355	151546355	1	0	NA	3.53970316102953e-11	151539187	151542179	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151549525	151552684	3	3	-0.9789	NA	NA	NA	7.691455996609e-11	151552684	151554478
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151554478	165643653	4822	4530	-0.0137	7.691455996609e-11	151552684	151554478	0	165643653	165643653
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.9619	0	165643653	165643653	0	165650610	165650610
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1696	-0.0097	0	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	16135701	5388	5039	0.0075	NA	NA	NA	2.97001446056518e-162	16135701	16135701
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.4648	2.97001446056518e-162	16135701	16135701	2.08225593586221e-160	16140018	16140018
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	110915032	30334	28511	-0.003	2.08225593586221e-160	16140018	16140018	9.41516785015482e-131	110913446	110917835
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110917835	110989204	34	33	-0.9957	9.41516785015482e-131	110913446	110917835	1.58529403296868e-124	110987458	110989204
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110992816	118611324	3507	3282	-0.0138	1.58529403296868e-124	110987458	110989204	3.52472708967637e-256	118611324	118611324
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.6591	3.52472708967637e-256	118611324	118611324	5.20366979997368e-255	118620875	118620875
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	2971	-0.0071	5.20366979997368e-255	118620875	118620875	2.41937693746546e-105	125831554	125831554
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.0071	2.41937693746546e-105	125831554	125831554	7.3823000643094e-111	125837524	125837524
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3432	-0.0034	7.3823000643094e-111	125837524	125837524	3.03820116473959e-20	133432281	133433384
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7924	3.03820116473959e-20	133432281	133433384	1.2265063482338e-20	133448277	133453811
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3484	-0.0049	1.2265063482338e-20	133448277	133453811	4.08413347121686e-14	141408013	141414719
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141435643	12	11	0.5615	4.08413347121686e-14	141408013	141414719	8.68323019124075e-12	141432778	141440184
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141438504	141690753	118	114	0.0046	8.68323019124075e-12	141432778	141440184	2.22742810686336e-265	141690753	141690753
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	-4.0623	2.22742810686336e-265	141690753	141690753	3.37351653620862e-200	141714168	141714168
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141890215	69	66	0.051	3.37351653620862e-200	141714168	141714168	1.28059199152451e-09	141890215	141898806
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141892876	141904745	4	4	-0.8097	1.28059199152451e-09	141890215	141898806	3.93478378305829e-09	141898806	141908206
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141908206	158821263	6679	6278	-0.0014	3.93478378305829e-09	141898806	141908206	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2234351	737	691	0.0125	NA	NA	NA	3.97872615636126e-09	2231804	2243659
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2261571	6	6	-0.6204	3.97872615636126e-09	2231804	2243659	4.3879067634229e-09	2251011	2269984
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2265853	9533226	2141	2003	-0.0022	4.3879067634229e-09	2251011	2269984	1.88129988552919e-09	9531510	9533226
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	3	-0.8896	1.88129988552919e-09	9531510	9533226	1.78634585983458e-08	9538031	9539424
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	31810293	7825	7413	-0.0056	1.78634585983458e-08	9538031	9539424	4.37965050218875e-07	31805305	31810293
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31811829	31815721	3	3	-0.8199	4.37965050218875e-07	31805305	31810293	1.70426465191013e-08	31815721	31817573
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	31817573	39350798	2359	2221	0.0048	1.70426465191013e-08	31815721	31817573	0	39350798	39352361
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	-4.0321	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	65652834	6423	6047	-0.0048	0	39504332	39505256	1.11421590160533e-10	65652834	65652834
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	65654276	65658010	2	2	-1.1572	1.11421590160533e-10	65652834	65652834	1.09243137992324e-10	65658010	65658010
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	65659201	85687135	5799	5463	-0.0074	1.09243137992324e-10	65658010	65658010	3.07499824302136e-10	85687135	85687135
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85690246	85696461	2	2	-1.134	3.07499824302136e-10	85687135	85687135	1.44850249082097e-09	85696461	85696461
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85698213	146264846	19207	18037	-0.0035	1.44850249082097e-09	85696461	85696461	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5155	-0.0044	NA	NA	NA	6.47524830159791e-11	15802255	15802255
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.1505	6.47524830159791e-11	15802255	15802255	3.04290252842538e-11	15807123	15807123
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2237	-0.0193	3.04290252842538e-11	15807123	15807123	2.97641338476360e-23	22477358	22477358
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	-1.6952	2.9764133847636e-23	22477358	22477358	1.27385997651813e-15	22492603	22492603
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23343915	161	150	-0.0125	1.27385997651813e-15	22492603	22492603	5.9057553781831e-139	23343915	23343915
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.7954	5.9057553781831e-139	23343915	23343915	1.1247157710349e-179	23365926	23365926
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4761	-0.0027	1.1247157710349e-179	23365926	23365926	6.10114461358851e-110	70926188	70926188
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.6401	6.10114461358851e-110	70926188	70926188	1.98940330362467e-105	70930528	70930528
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	137352394	23765	22392	-0.0032	1.98940330362467e-105	70930528	70930528	1.12062008642659e-21	137352394	137352394
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.6725	1.12062008642659e-21	137352394	137352394	5.07277361098887e-17	137356880	137356880
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1032	0.0053	5.07277361098887e-17	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	31284926	11292	10589	-0.007	NA	NA	NA	7.63035704602865e-10	31273478	31284926
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-0.9304	7.63035704602865e-10	31273478	31284926	1.36991066012131e-09	31291525	31293140
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	70900112	10357	9735	-0.0135	1.36991066012131e-09	31291525	31293140	3.94541766265109e-10	70898543	70900112
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70901836	70906816	4	4	-0.8281	3.94541766265109e-10	70898543	70900112	4.25665229964773e-10	70906816	70908176
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70908176	135285645	23152	21769	8e-04	4.25665229964773e-10	70906816	70908176	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1673	0.0089	NA	NA	NA	0	4923300	4923300
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	4	-4.869	0	4923300	4923300	3.68928783557252e-299	4932214	4932214
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5738494	360	341	-0.0187	3.68928783557252e-299	4932214	4932214	5.25366340122049e-18	5733442	5741031
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5741031	5765438	16	16	-0.622	5.25366340122049e-18	5733442	5741031	2.59941226286373e-23	5763749	5769776
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	55118214	14752	13896	-0.0015	2.59941226286373e-23	5763749	5769776	2.08069987295868e-27	55095200	55127355
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	0.4286	2.08069987295868e-27	55095200	55127355	2.02616196975352e-27	55205278	55221692
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	134450318	28360	26647	0.0017	2.02616196975352e-27	55205278	55221692	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	2106791	919	862	0.0281	NA	NA	NA	2.94486018753808e-11	2103711	2115933
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2109441	2109441	1	0	NA	2.94486018753808e-11	2103711	2115933	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2115933	2127537	7	7	-0.6303	NA	NA	NA	2.89075559015796e-10	2125504	2130138
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	2128807	9523923	2815	2650	0.0076	2.89075559015796e-10	2125504	2130138	8.57109661225518e-34	9516067	9543817
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	0.8844	8.57109661225518e-34	9516067	9543817	2.91705859476278e-34	9578398	9599999
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11104973	570	533	-0.0334	2.91705859476278e-34	9578398	9599999	3.38320608655027e-28	11104085	11104973
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	11	0.81	3.38320608655027e-28	11104085	11104973	1.45301640454377e-28	11140421	11143592
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	107249934	31468	29636	-0.0055	1.45301640454377e-28	11140421	11143592	2.09298907338641e-10	107247470	107249934
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	107251758	107256296	3	3	-0.9756	2.09298907338641e-10	107247470	107249934	6.79579030554886e-11	107256296	107259283
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	107259283	132289090	9354	8782	0.0072	6.79579030554886e-11	107256296	107259283	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	11464	-0.0072	NA	NA	NA	1.30423148345353e-67	49964838	49964838
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.8892	1.30423148345353e-67	49964838	49964838	1.74295429038226e-64	49971732	49971732
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	71375082	5442	5128	-0.0124	1.74295429038226e-64	49971732	49971732	1.26493553406295e-187	71375082	71375082
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.9007	1.26493553406295e-187	71375082	71375082	5.57962913615407e-198	71377671	71377671
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4351	-0.0093	5.57962913615407e-198	71377671	71377671	1.71620587671625e-126	89659397	89659397
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-3.9228	1.71620587671625e-126	89659397	89659397	7.75036226619317e-132	89662326	89662326
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4496	-0.0069	7.75036226619317e-132	89662326	89662326	1.88588898946507e-278	100690991	100690991
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.6889	1.88588898946507e-278	100690991	100690991	1.10732031159445e-252	100693892	100693892
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114118270	4561	4265	-0.0122	1.10732031159445e-252	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114123340	114123340	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	54	-0.6542	NA	NA	NA	2.49696713522146e-88	19492531	19497023
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5341	0.002	2.49696713522146e-88	19492531	19497023	9.15930452570749e-17	34674458	34674458
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.229	9.15930452570749e-17	34674458	34674458	8.5717169418658e-18	34683810	34683810
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	73071404	13667	12865	-0.0078	8.5717169418658e-18	34683810	34683810	4.53476931680379e-29	73071404	73071404
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	4.53476931680379e-29	73071404	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	1.1011	NA	NA	NA	2.30884583352532e-26	73092112	73092112
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79174722	2914	2745	0.0045	2.30884583352532e-26	73092112	73092112	3.38082728747722e-182	79174722	79174722
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.508	3.38082728747722e-182	79174722	79174722	1.95048662034107e-189	79183154	79183154
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	8715	5e-04	1.95048662034107e-189	79183154	79183154	0	105597555	105597555
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.7399	0	105597555	105597555	2.87285742849281e-75	105632168	105632168
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	46	-0.0233	2.87285742849281e-75	105632168	105632168	0.000425683655232937	105846004	105856972
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-0.735	0.000425683655232937	105846004	105856972	1.14125715953803e-05	105875924	105881893
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	167	0.0228	1.14125715953803e-05	105875924	105881893	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2355	NA	NA	NA	1.29889532768630e-08	18450562	18692865
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19845942	105	99	-0.5787	1.2988953276863e-08	18450562	18692865	4.57567363661885e-12	19845942	19845942
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-1.8221	4.57567363661885e-12	19845942	19845942	6.76894658641719e-12	19882711	19882711
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	40	-0.6408	6.76894658641719e-12	19882711	19882711	6.72373349409921e-62	20065525	20310916
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	41676221	7356	6878	-0.0095	6.72373349409921e-62	20065525	20310916	1.35907987570752e-09	41676221	41676221
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41682925	41682937	2	2	1.1301	1.35907987570752e-09	41676221	41676221	9.13245851866234e-10	41682937	41682937
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41704248	41704248	1	0	NA	9.13245851866234e-10	41682937	41682937	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41706959	52516459	4484	4189	-0.0146	NA	NA	NA	7.4983617593984e-14	52516459	52516459
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52517110	52517110	1	0	NA	7.4983617593984e-14	52516459	52516459	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52519074	52533227	2	2	-1.3665	NA	NA	NA	2.61360373143794e-14	52533227	52533227
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52540479	99632987	19046	17903	0	2.61360373143794e-14	52533227	52533227	8.60878658009806e-12	99632987	99632987
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.2484	8.60878658009806e-12	99632987	99632987	1.40841508954000e-09	99635701	99635701
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	256	-0.01	1.40841508954e-09	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	68693086	18299	17242	0.007	NA	NA	NA	1.34220409894373e-31	68693014	68693086
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	9	-0.9413	1.34220409894373e-31	68693014	68693086	2.50221854416986e-30	68753209	68838384
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	72918129	1453	1366	-0.02	2.50221854416986e-30	68753209	68838384	7.60046539281781e-09	72915477	72951581
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-0.5967	7.60046539281781e-09	72915477	72951581	1.08838230446943e-09	72951581	73025340
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	75093957	754	713	0.0069	1.08838230446943e-09	72951581	73025340	1.32183061776795e-65	75093957	75093957
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-2.8618	1.32183061776795e-65	75093957	75093957	1.91641782017565e-61	75100865	75100865
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4856	7e-04	1.91641782017565e-61	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	400	0.0225	NA	NA	NA	1.4178195605836e-18	1028979	1028979
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.732	1.4178195605836e-18	1028979	1028979	1.35444131625586e-22	1030766	1030766
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1031233	1	0	NA	1.35444131625586e-22	1030766	1030766	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1032051	21420583	7791	7317	0.0159	NA	NA	NA	6.4402938644404e-46	21396476	21423893
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21421790	22142513	75	66	0.4402	6.4402938644404e-46	21396476	21423893	3.29201922033113e-47	22078642	22418006
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	22399576	36673853	5585	5234	0.0104	3.29201922033113e-47	22078642	22418006	2.41200161317335e-291	36673853	36673853
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-3.5059	2.41200161317335e-291	36673853	36673853	2.16251825507752e-293	36684619	36684619
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	36686013	1	0	NA	2.16251825507752e-293	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36687917	40874079	1806	1694	0.0327	NA	NA	NA	7.23833542504218e-09	40869151	40874079
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41017338	4	4	0.7965	7.23833542504218e-09	40869151	40874079	2.10764428724308e-08	41017338	41026062
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41026062	41519702	200	196	0.0215	2.10764428724308e-08	41017338	41026062	2.70240444022769e-109	41519702	41519702
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41566540	21	21	1.2304	2.70240444022769e-109	41519702	41519702	2.20625780223165e-28	41564408	41570512
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41568539	1	0	NA	2.20625780223165e-28	41564408	41570512	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41704093	42	36	0.7059	NA	NA	NA	5.77987618941235e-70	41700762	41706870
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41706870	52440878	3483	3272	0.0098	5.77987618941235e-70	41700762	41706870	1.03388415782110e-131	52440878	52440878
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52446126	2	2	-4.0192	1.0338841578211e-131	52440878	52440878	9.70257472642989e-126	52446126	52446126
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52447064	52447064	1	0	NA	9.7025747264299e-126	52446126	52446126	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	68326225	5929	5581	0.0064	NA	NA	NA	6.40076918653248e-08	68322875	68326225
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68327352	68331629	3	3	-0.8494	6.40076918653248e-08	68322875	68326225	1.49910512691861e-07	68331629	68335510
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68335510	78653545	4264	4010	0.0177	1.49910512691861e-07	68331629	68335510	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15310	-0.0081	NA	NA	NA	3.66018976567869e-18	53092949	53092949
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.5039	3.66018976567869e-18	53092949	53092949	3.25528541366669e-17	53099601	53099601
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6318	-0.0149	3.25528541366669e-17	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	20833695	9321	8756	0.031	NA	NA	NA	1.37257823088091e-08	20792989	20857921
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20841320	20897098	16	16	-0.3676	1.37257823088091e-08	20792989	20857921	9.49779027043976e-09	20883588	20909791
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20900139	42529266	4209	3988	0.0162	9.49779027043976e-09	20883588	20909791	8.02866189857121e-08	42527233	42530955
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42530955	42537766	3	3	-0.8222	8.0286618985712e-08	42527233	42530955	1.25813024482624e-07	42537766	42544684
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42544684	46046859	1604	1524	0.0259	1.25813024482624e-07	42537766	42544684	5.46193981060357e-07	46027905	46054503
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46054503	46063357	5	4	-0.6792	5.46193981060357e-07	46027905	46054503	4.23388681060505e-07	46059213	46086240
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46086240	56823430	4715	4420	0.0327	4.23388681060505e-07	46059213	46086240	0	56823430	56823430
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-4.0708	0	56823430	56823430	0	56840346	56840346
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58212113	587	547	-0.0067	0	56840346	56840346	1.49054984905229e-06	58197961	58212113
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58213220	58244012	14	12	0.3718	1.49054984905229e-06	58197961	58212113	0.00031038284990182	58241773	58280575
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58247367	59414898	573	533	0.0269	0.00031038284990182	58241773	58280575	1.17626409656283e-15	59414645	59421197
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	9	-0.7224	1.17626409656283e-15	59414645	59421197	4.02409983566918e-17	59434159	59440262
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1881	0.0048	4.02409983566918e-17	59434159	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	552	-0.001	NA	NA	NA	8.91684491553874e-121	1506379	1511632
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	6	-2.5217	8.91684491553874e-121	1506379	1511632	8.7757412410028e-152	1525300	1531162
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	19741	0.0037	8.7757412410028e-152	1525300	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12649	-0.003	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2813	0.0239	NA	NA	NA	0.000564625347796633	22618049	22667608
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22696038	6	5	-0.4616	0.000564625347796633	22618049	22667608	1.36462579480437e-06	22686690	22696162
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22696162	22708012	7	7	0.01	1.36462579480437e-06	22686690	22696162	0.000138209670882478	22704683	22714979
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22710302	22744274	14	14	-0.3397	0.000138209670882478	22704683	22714979	2.81961454326015e-06	22738466	22759551
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22747085	35472378	6542	6140	0.011	2.81961454326015e-06	22738466	22759551	7.54859463481367e-95	35472378	35472378
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.4733	7.54859463481367e-95	35472378	35472378	5.090548007547e-88	35476942	35476942
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49567768	7002	6614	0.0198	5.090548007547e-88	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	29	0.1058	NA	NA	NA	1.17785379616057e-15	122273	127113
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-1.1565	1.17785379616057e-15	122273	127113	3.99516579856673e-22	129544	130528
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1431411	755	702	-0.0099	3.99516579856673e-22	129544	130528	5.53761792795113e-16	1431411	1431411
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.5417	5.53761792795113e-16	1431411	1431411	1.42930533278705e-17	1432953	1432953
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2708291	1002	947	-0.0052	1.42930533278705e-17	1432953	1432953	0	2708291	2711273
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	6145632	1106	1019	0.9582	0	2708291	2711273	3.65542762892542e-07	6141888	6145632
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6146726	6150055	3	3	-0.0332	3.65542762892542e-07	6141888	6145632	5.47543051450113e-10	6150055	6152223
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6152223	37699655	11954	11215	0.9894	5.47543051450113e-10	6150055	6152223	1.20071687304704e-12	37699655	37699655
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	37700374	37706063	2	2	-0.4094	1.20071687304704e-12	37699655	37699655	1.75434409035319e-11	37706063	37706063
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	37718969	118400407	20753	19560	0.9838	1.75434409035319e-11	37706063	37706063	1.19031433578682e-68	118397968	118402697
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118402697	118468235	31	28	0.1004	1.19031433578682e-68	118397968	118402697	2.72760030163872e-70	118464181	118469791
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118469791	154582414	11285	10628	0.9887	2.72760030163872e-70	118464181	118469791	0	154578922	154582414
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	188	-0.0353	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	120	-4.0636	NA	NA	NA	1.64146662435109e-17	3777766	4272867
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.1732	1.64146662435109e-17	3777766	4272867	2.04982859089816e-12	5422507	6652845
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	110	-3.7215	2.04982859089816e-12	5422507	6652845	0.000104895334463891	6912779	7045224
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7996758	336	306	-3.0675	0.000104895334463891	6912779	7045224	1.02940053242933e-07	7905553	8016395
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	8280065	66	60	-4.1099	1.02940053242933e-07	7905553	8016395	0.0013532824578708	8195174	8518479
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8956787	194	184	-3.5322	0.0013532824578708	8195174	8518479	3.18481575641814e-05	8807275	9118845
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10513747	111	102	-4.1082	3.18481575641814e-05	8807275	9118845	1.52651698518755e-50	10512616	10515697
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10646662	14	14	-0.4957	1.52651698518755e-50	10512616	10515697	0.0793494405218651	10620136	11660512
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10655750	11698871	5	5	-1.543	0.0793494405218651	10620136	11660512	7.4910360461774e-05	11660512	12452734
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12536761	10	8	-3.8333	7.4910360461774e-05	11660512	12452734	0.000145450627159167	12530596	12550566
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	51	-1.9954	0.000145450627159167	12530596	12550566	0.00595237077546831	12625208	12682301
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12700767	3	3	-4.3131	0.00595237077546831	12625208	12682301	0.00129998734565636	12700767	12715696
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12710000	12756268	9	9	-2.8516	0.00129998734565636	12700767	12715696	0.000546487371161928	12730281	12764220
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12764220	12796639	6	6	-4.056	0.000546487371161928	12730281	12764220	3.51402006431225e-06	12796639	12825903
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12804329	12905395	30	30	-2.354	3.51402006431225e-06	12796639	12825903	1.56991261638593e-06	12899653	12911576
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12909643	12926941	8	8	-4.1421	1.56991261638593e-06	12899653	12911576	8.90518836099901e-09	12924438	12940175
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13128515	79	78	-1.8668	8.90518836099901e-09	12924438	12940175	5.4642168021188e-14	13112411	13137597
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13261173	45	43	-3.4239	5.4642168021188e-14	13112411	13137597	0.0131701646805507	13151875	13360252
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13262997	13597813	159	146	-3.9698	0.0131701646805507	13151875	13360252	3.49254111560451e-05	13572080	13597813
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13603478	13606316	2	0	NA	3.49254111560451e-05	13572080	13597813	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13633041	13705594	13	9	-2.5834	NA	NA	NA	3.34602055430481e-05	13705594	13760710
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13716000	1	0	NA	3.34602055430481e-05	13705594	13760710	NA	NA	NA
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	14342834	189	179	-4.1148	NA	NA	NA	2.6142415112001e-11	14320016	14368151
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14489032	83	80	-3.2029	2.6142415112001e-11	14320016	14368151	3.2759264991762e-10	14480242	14503927
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14489801	14579298	39	36	-1.859	3.2759264991762e-10	14480242	14503927	1.38624490657934e-14	14559651	14598838
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	392	-3.5841	1.38624490657934e-14	14559651	14598838	0.000153733332495802	15713288	15975479
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16042966	49	45	-2.6994	0.000153733332495802	15713288	15975479	7.61426601090173e-09	16007396	16072965
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	20384639	707	666	-3.7514	7.61426601090173e-09	16007396	16072965	8.703411519614e-05	20358901	20387629
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20387629	20491240	9	8	-1.9613	8.703411519614e-05	20358901	20387629	3.44783298296368e-06	20483950	20598388
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20496781	25737663	439	408	-3.8556	3.44783298296368e-06	20483950	20598388	6.95058638445005e-50	23283689	26870361
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26945893	31	29	-1.0735	6.95058638445005e-50	23283689	26870361	0.000118856775568371	26938967	27003308
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-2.3949	0.000118856775568371	26938967	27003308	8.6672533227356e-06	27003308	27067889
MSK_252152912762_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.653	8.6672533227356e-06	27003308	27067889	NA	NA	NA
