Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16888048	5789	5639	0.0183	NA	NA	NA	4.6045095804541e-08	16814050	16926444
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16917759	17127039	18	16	-0.4335	4.6045095804541e-08	16814050	16926444	1.42839041501905e-07	17104345	17160385
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	72537426	22087	21535	2e-04	1.42839041501905e-07	17104345	17160385	0	72537426	72537426
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.7962	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	147357754	16273	15898	-0.0028	0	72579311	72579311	5.42962606686094e-06	146294654	147420558
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147369818	147497268	23	23	0.3188	5.42962606686094e-06	146294654	147420558	2.16207048125162e-06	147446584	148119298
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150819879	1260	1230	0.0037	2.16207048125162e-06	147446584	148119298	4.81283279655054e-252	150819879	150819879
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	2.9646	4.81283279655054e-252	150819879	150819879	5.18579820617386e-246	150851439	150851439
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2707	0.0018	5.18579820617386e-246	150851439	150851439	9.7943707644805e-12	157133150	157133150
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.4617	9.7943707644805e-12	157133150	157133150	1.34975529224858e-11	157136342	157136342
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4018	-0.0162	1.34975529224858e-11	157136342	157136342	0	167483267	167483267
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-3.8741	0	167483267	167483267	0	167507898	167507898
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	7018	-5e-04	0	167507898	167507898	5.77376221547031e-08	185973975	185979586
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.2194	5.77376221547031e-08	185973975	185979586	1.01154227089641e-07	185988138	186000612
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1933	0.0073	1.01154227089641e-07	185988138	186000612	1.44667956169542e-07	194972886	195014129
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195097118	12	11	-0.5058	1.44667956169542e-07	194972886	195014129	1.40545483546755e-10	195065867	195108311
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195103883	247186514	19602	19148	-0.002	1.40545483546755e-10	195065867	195108311	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10609	-7e-04	NA	NA	NA	5.82140057499896e-07	33074522	33076512
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.1451	5.82140057499896e-07	33074522	33076512	3.96651960042924e-07	33080437	33081681
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	37789939	2026	1979	-0.0109	3.96651960042924e-07	33080437	33081681	5.66277020126989e-09	37775420	37812045
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	27	-0.3642	5.66277020126989e-09	37775420	37812045	8.3535027622199e-10	37846240	37874432
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5639	6e-04	8.3535027622199e-10	37846240	37874432	3.06993932186175e-286	52600588	52600588
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-4.4448	3.06993932186175e-286	52600588	52600588	8.22826315001764e-285	52635695	52635695
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	146571330	26337	25696	-0.0019	8.22826315001764e-285	52635695	52635695	5.01499792326342e-315	146571330	146571330
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.2238	5.01499792326342e-315	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2153	0.0031	0	146592775	146592775	5.0769312717199e-154	154601442	154601442
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	-5.0075	5.0769312717199e-154	154601442	154601442	1.53933643089454e-142	154606943	154606943
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	205820181	17204	16786	-0.0032	1.53933643089454e-142	154606943	154606943	1.03992958313622e-08	205818780	205820181
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	205821508	205821508	1	0	NA	1.03992958313622e-08	205818780	205820181	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	205822822	205829162	4	4	-0.9168	NA	NA	NA	9.78053289527737e-09	205829162	205832678
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	205832678	242689978	13335	12973	6e-04	9.78053289527737e-09	205829162	205832678	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	11383299	4087	3976	0.0055	NA	NA	NA	2.32729939854763e-12	11383299	11383299
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11386892	11389624	3	3	-1.1722	2.32729939854763e-12	11383299	11383299	5.71455409986502e-11	11389624	11392863
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11392863	105555044	29738	28981	-0.0014	5.71455409986502e-11	11389624	11392863	1.01652164849075e-59	105545649	105555044
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	105560490	105749846	26	26	-0.8978	1.01652164849075e-59	105545649	105555044	8.62868679940965e-60	105749846	105753311
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	105753311	164027724	19642	19163	-0.001	8.62868679940965e-60	105749846	105753311	3.0113075958368e-19	164019640	164036648
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	0.6029	3.0113075958368e-19	164019640	164036648	1.25845619488564e-19	164105613	164121847
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9902	-0.0045	1.25845619488564e-19	164105613	164121847	0	194354505	194354505
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.9849	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	198643340	1691	1650	-0.0148	0	194366950	194366950	9.0478058494756e-07	198630593	198643340
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198646034	198664605	6	6	0.6373	9.0478058494756e-07	198630593	198643340	5.0679040462251e-05	198664605	198678985
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198666564	199329592	283	275	-0.0089	5.0679040462251e-05	198664605	198678985	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	68905670	18433	17990	0.0021	NA	NA	NA	4.38625635362428e-17	68899247	69075140
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	-0.6569	4.38625635362428e-17	68899247	69075140	1.3738511700113e-16	69153675	69656183
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	175860235	32133	31447	-3e-04	1.3738511700113e-16	69153675	69656183	7.30775090693118e-37	175860235	175860235
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	-2.5517	7.30775090693118e-37	175860235	175860235	7.39294973269292e-39	175863396	175863396
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	185990783	2762	2706	0.0027	7.39294973269292e-39	175863396	175863396	1.48460713835926e-07	185988502	185990783
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185992856	185995739	3	3	-0.9286	1.48460713835926e-07	185988502	185990783	4.12318427101011e-07	185995739	185998398
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185998398	187330240	571	555	-0.009	4.12318427101011e-07	185995739	185998398	5.72979572848051e-122	187330240	187330240
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-4.5814	5.72979572848051e-122	187330240	187330240	1.9905988338876e-123	187333619	187333619
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1205	-0.0047	1.9905988338876e-123	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	219	0.0115	NA	NA	NA	3.79327506122411e-18	730853	737829
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	1.0238	3.79327506122411e-18	730853	737829	4.30551610250723e-19	829954	870657
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	17395391	5238	5118	-0.0037	4.30551610250723e-19	829954	870657	2.50057378308506e-22	17394016	17395391
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17397258	17411379	9	9	-0.9094	2.50057378308506e-22	17394016	17395391	1.08302262780171e-20	17411379	17414784
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17414784	180644810	48291	47102	-0.0012	1.08302262780171e-20	17411379	17414784	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	218316	46	43	-0.0367	NA	NA	NA	1.81636990236393e-15	210326	230588
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	219639	326323	55	51	-0.4789	1.81636990236393e-15	210326	230588	1.43656495088744e-33	320854	332608
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29995247	10496	10233	-0.0018	1.43656495088744e-33	320854	332608	1.99970956892779e-16	29995247	30000990
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29998009	30010234	5	5	-1.078	1.99970956892779e-16	29995247	30000990	2.48096046068636e-16	30004636	30021908
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	32548736	1074	1036	0.0145	2.48096046068636e-16	30004636	30021908	1.14440318504104e-16	32543054	32563252
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	8	0.8829	1.14440318504104e-16	32543054	32563252	6.53775123256893e-17	32593151	32597877
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	54035000	8305	8079	0.002	6.53775123256893e-17	32593151	32597877	1.14760072343972e-16	54035000	54035000
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.4296	1.14760072343972e-16	54035000	54035000	1.21831950440282e-17	54042734	54042734
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	77490500	6150	5992	0.0032	1.21831950440282e-17	54042734	54042734	7.5062018852675e-129	77490500	77490500
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-3.7897	7.5062018852675e-129	77490500	77490500	5.69353815005898e-120	77509983	77509983
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	79011979	277	273	-0.0126	5.69353815005898e-120	77509983	77509983	7.91642096066411e-07	78977502	79015901
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79015901	79091850	15	14	0.4138	7.91642096066411e-07	78977502	79015901	1.49778014453929e-06	79085247	79146664
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6599	-0.0014	1.49778014453929e-06	79085247	79146664	1.66030468540712e-206	103841482	103841482
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.1765	1.66030468540712e-206	103841482	103841482	1.28451639295523e-205	103868154	103868154
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	155155770	17622	17190	-0.0028	1.28451639295523e-205	103868154	103868154	2.59482967854913e-07	155153090	155157679
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155157679	155163895	5	5	-0.7447	2.59482967854913e-07	155153090	155157679	3.37615662529599e-07	155162293	155168209
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155165959	170753106	5287	5172	-0.0063	3.37615662529599e-07	155162293	155168209	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	109967918	35267	34434	0.0037	NA	NA	NA	1.05977384699822e-33	109967918	109967918
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-2.4391	1.05977384699822e-33	109967918	109967918	3.51839716821255e-32	109974402	109974402
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3898	-0.0033	3.51839716821255e-32	109974402	109974402	7.96616814278667e-136	118611324	118611324
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	-4.0308	7.96616814278667e-136	118611324	118611324	6.26402772759006e-136	118620875	118620875
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	133433384	6827	6647	0	6.26402772759006e-136	118620875	118620875	4.18313272161932e-11	133426938	133436265
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133455682	10	10	0.6482	4.18313272161932e-11	133426938	133436265	3.62365227673148e-12	133448277	133458252
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133456873	141410894	3698	3593	-0.0056	3.62365227673148e-12	133448277	133458252	2.55147865720278e-15	141408013	141414719
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	13	0.6351	2.55147865720278e-15	141408013	141414719	1.46507115501073e-11	141434131	141443577
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	115	0.0157	1.46507115501073e-11	141434131	141443577	2.01724076507056e-178	141690753	141690753
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.6072	2.01724076507056e-178	141690753	141690753	0	141714168	141714168
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2441	0.0072	0	141714168	141714168	5.60254216626663e-23	147702365	147702365
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.1212	5.60254216626663e-23	147702365	147702365	4.56738546600993e-25	147707161	147707161
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4143	-0.003	4.56738546600993e-25	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0042	NA	NA	NA	7.6483461837004e-58	581533	581533
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.3613	7.6483461837004e-58	581533	581533	3.80841831739286e-66	588865	588865
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	18648665	5957	5815	-0.0026	3.80841831739286e-66	588865	588865	2.16834299863319e-07	18644675	18648665
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18650756	18658025	4	4	-0.8262	2.16834299863319e-07	18644675	18648665	3.64540523922854e-07	18658025	18664486
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	18660640	25120552	2077	2026	-0.0074	3.64540523922854e-07	18658025	18664486	2.44818912973792e-25	25120552	25120552
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	2.44818912973792e-25	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	2.1173	NA	NA	NA	7.96070882205852e-26	25125700	25125700
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4783	-0.0032	7.96070882205852e-26	25125700	25125700	9.40467766434456e-118	39345557	39352361
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.841	9.40467766434456e-118	39345557	39352361	4.7201747253232e-101	39504332	39508035
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	435	0.0383	4.7201747253232e-101	39504332	39508035	7.64345906563078e-33	40892587	40892587
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-2.4006	7.64345906563078e-33	40892587	40892587	8.0840985905931e-33	40897469	40897469
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	58268002	3913	3808	0.003	8.0840985905931e-33	40897469	40897469	1.36806776525937e-07	58261218	58271240
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58269746	58300815	8	8	0.5943	1.36806776525937e-07	58261218	58271240	3.32562795368060e-07	58280459	58321468
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58306259	58306259	1	0	NA	3.3256279536806e-07	58280459	58321468	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58313875	146264846	27068	26380	0.0026	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12736	-0.0027	NA	NA	NA	6.14626734497333e-19	70926188	70926188
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.8064	6.14626734497333e-19	70926188	70926188	7.91714258176323e-18	70930528	70930528
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	140145683	24870	24222	-0.0049	7.91714258176323e-18	70930528	70930528	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	31284926	11292	11022	-0.0072	NA	NA	NA	3.69492741999361e-07	31284756	31284926
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-0.948	3.69492741999361e-07	31284756	31284926	7.10181165868792e-07	31291525	31293140
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	77917893	13297	12972	-0.0045	7.10181165868792e-07	31291525	31293140	2.71879682513453e-72	77917893	77917893
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.5712	2.71879682513453e-72	77917893	77917893	1.66578400831842e-72	77928669	77928669
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19709	-0.0037	1.66578400831842e-72	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55118214	16905	16484	0.0012	NA	NA	NA	2.38200273645128e-17	55093758	55129329
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.404	2.38200273645128e-17	55093758	55129329	1.76860091632951e-17	55203706	55230765
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	106733851	18037	17570	0.0024	1.76860091632951e-17	55203706	55230765	1.91924010655932e-148	106733851	106733851
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106746568	3	3	-4.1799	1.91924010655932e-148	106733851	106733851	1.52865170748916e-156	106746568	106746568
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106747920	106747920	1	0	NA	1.52865170748916e-156	106746568	106746568	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134450318	10318	10072	-0.0044	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3664	0.0025	NA	NA	NA	4.65726889322213e-55	9523923	9528590
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	16	1.0981	4.65726889322213e-55	9523923	9528590	3.6403035521915e-52	9607363	9610054
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10470425	330	321	-0.0146	3.6403035521915e-52	9607363	9610054	6.4825226776909e-07	10465787	10480460
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10474825	10491341	7	7	-0.6155	6.4825226776909e-07	10465787	10480460	1.19364844676973e-05	10482217	10498541
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10493984	11109483	231	224	-0.0402	1.19364844676973e-05	10482217	10498541	3.50374658941618e-05	11099711	11110735
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11110735	11121204	4	4	-0.7672	3.50374658941618e-05	11099711	11110735	0.00509817825030985	11121204	11126558
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11123452	11130871	5	5	-3.1315	0.00509817825030985	11121204	11126558	5.89105837816438e-135	11126558	11130871
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	31132762	6820	6649	-0.0031	5.89105837816438e-135	11126558	11130871	1.98149838169003e-44	31098259	31171313
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31298659	43	43	0.6081	1.98149838169003e-44	31098259	31171313	1.64862868477147e-44	31295667	31303495
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	125558844	31606	30831	0.002	1.64862868477147e-44	31295667	31303495	1.942047224331e-09	125558844	125558844
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	125565039	125570308	2	2	-1.3442	1.942047224331e-09	125558844	125558844	2.39841925229805e-10	125570308	125570308
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	125576897	132289090	2355	2281	-0.0033	2.39841925229805e-10	125570308	125570308	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7150	-0.002	NA	NA	NA	2.33346150330124e-39	37953582	37953582
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.6236	2.33346150330124e-39	37953582	37953582	1.7256490063608e-42	37957844	37957844
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4765	-0.0033	1.7256490063608e-42	37957844	37957844	2.38166032482437e-55	49964838	49964838
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.9963	2.38166032482437e-55	49964838	49964838	3.28866653263054e-49	49971732	49971732
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1762	0.0032	3.28866653263054e-49	49971732	49971732	1.56222318358104e-19	56610886	56658479
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	-0.7196	1.56222318358104e-19	56610886	56658479	4.2320681676181e-20	56679017	56686863
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	112355681	16829	16429	-0.0021	4.2320681676181e-20	56679017	56686863	2.35619853091428e-08	112350250	112358590
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	112357528	112357528	1	0	NA	2.35619853091428e-08	112350250	112358590	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	112358590	112375157	9	9	0.5911	NA	NA	NA	7.46174635467237e-07	112373688	112383587
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	112376794	114123340	766	750	0.0128	7.46174635467237e-07	112373688	112383587	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19402284	21	21	-0.0398	NA	NA	NA	0.00176717091078313	19287128	19422841
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19403640	19535787	41	38	0.2723	0.00176717091078313	19287128	19422841	1.19099731846698e-06	19469681	19569200
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19538610	34674458	5688	5553	0.009	1.19099731846698e-06	19469681	19569200	3.12175980757986e-09	34674458	34674458
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34679959	2	2	1.3404	3.12175980757986e-09	34674458	34674458	9.59270444231155e-10	34679959	34683810
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34683810	46775775	3263	3179	0.0073	9.59270444231155e-10	34679959	34683810	3.20150165641424e-14	46774115	46775775
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46778735	46787389	5	4	-1.1228	3.20150165641424e-14	46774115	46775775	1.45476898795763e-13	46787389	46789074
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46789074	73061942	10399	10135	-0.0046	1.45476898795763e-13	46787389	46789074	4.19553305897019e-51	73061942	73061942
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73101327	9	8	-1.5111	4.19553305897019e-51	73061942	73061942	5.83953567500615e-50	73101327	73101327
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73104540	105597555	12214	11900	-0.0013	5.83953567500615e-50	73101327	73101327	1.73840978848430e-274	105597555	105602602
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.8926	1.7384097884843e-274	105597555	105602602	2.48223605403086e-115	105630089	105632168
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106214372	177	173	0.0408	2.48223605403086e-115	105630089	105632168	2.3006043328769e-07	106196705	106219784
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	18	-0.4323	2.3006043328769e-07	106196705	106219784	4.84705860137919e-13	106251081	106255190
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	36	0.125	4.84705860137919e-13	106251081	106255190	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2613	NA	NA	NA	2.63973668073213e-17	18452491	18692865
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	148	-1.1427	2.63973668073213e-17	18452491	18692865	0	20079935	20308014
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74115754	21309	20798	-0.0039	0	20079935	20308014	8.63644373165558e-10	74113558	74115754
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74127210	74133391	4	4	-0.9723	8.63644373165558e-10	74113558	74115754	3.97588026566489e-10	74133391	74137073
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74137073	100298352	9853	9609	-0.0061	3.97588026566489e-10	74133391	74137073	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	54340649	13693	13401	0.0027	NA	NA	NA	5.68636291122891e-12	54333712	54356704
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54343465	54379839	13	13	-0.5822	5.68636291122891e-12	54333712	54356704	5.19055001699747e-06	54376805	54390060
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54402057	4	4	0.6867	5.19055001699747e-06	54376805	54390060	4.40560817224813e-05	54399890	54408446
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	57203733	1199	1170	-0.0127	4.40560817224813e-05	54399890	54408446	8.03391521407759e-44	57203733	57203733
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-2.8013	8.0339152140776e-44	57203733	57203733	1.36642456759474e-44	57206772	57206772
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5485	-0.0017	1.36642456759474e-44	57206772	57206772	6.15361460666185e-69	75093957	75093957
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.8388	6.15361460666185e-69	75093957	75093957	1.24706914240690e-67	75100865	75100865
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	594	-0.0251	1.2470691424069e-67	75100865	75100865	1.38326894588929e-18	76923844	76929598
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.8859	1.38326894588929e-18	76923844	76929598	3.50640610794479e-16	76938723	76942679
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4410	-0.0019	3.50640610794479e-16	76938723	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	36672710	13870	13528	0.005	NA	NA	NA	2.20592152311435e-15	36668730	36672710
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36684619	7	7	0.9123	2.20592152311435e-15	36668730	36672710	4.61375459484653e-15	36684619	36686013
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	78653545	15757	15359	0.0086	4.61375459484653e-15	36684619	36686013	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22424	-0.0072	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	3353960	1420	1385	0.0357	NA	NA	NA	2.94294713528037e-11	3353960	3353960
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	-1.5002	2.94294713528037e-11	3353960	3353960	5.77323448901776e-12	3356334	3356334
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	59491509	19665	19172	0.0173	5.77323448901776e-12	3356334	3356334	2.89354671777632e-111	59491509	59491509
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59492650	59497049	2	2	-4.4678	2.89354671777632e-111	59491509	59491509	2.84184558744419e-110	59497049	59497049
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59500575	63788698	1970	1927	0.0075	2.84184558744419e-110	59497049	59497049	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	569	-0.0115	NA	NA	NA	2.85753661073829e-22	1499421	1506379
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.9063	2.85753661073829e-22	1499421	1506379	6.03125439621265e-23	1532433	1544485
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20464	-0.0024	6.03125439621265e-23	1532433	1544485	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10136303	16	15	0.0645	NA	NA	NA	2.53765256210014e-07	10115958	10136303
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10144881	10152384	3	3	-0.6989	2.53765256210014e-07	10115958	10136303	8.8370742853669e-14	10152384	10152384
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10154777	13615502	9	8	0.1553	8.8370742853669e-14	10152384	10152384	0.00748654458809427	13435755	13696483
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13635227	13635227	1	0	NA	0.00748654458809427	13435755	13696483	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13676572	13869389	23	22	-0.0833	NA	NA	NA	0.000428187362413837	13841760	13876293
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13874295	13882260	5	5	0.2696	0.000428187362413837	13841760	13876293	8.9702295354189e-08	13882260	13889359
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13889359	14092232	9	9	-0.5381	8.9702295354189e-08	13882260	13889359	6.91319865698682e-07	13992109	14296189
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14125179	33916313	7017	6852	-0.0026	6.91319865698682e-07	13992109	14296189	2.86203137285692e-09	33913546	33916313
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	33917537	33921837	4	4	-0.9236	2.86203137285692e-09	33913546	33916313	7.04314233695112e-09	33921837	33925654
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	33925654	46922972	6354	6201	0.0027	7.04314233695112e-09	33921837	33925654	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2914	0.0184	NA	NA	NA	1.33605337319614e-149	22667608	22679305
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22704683	11	11	-2.3014	1.33605337319614e-149	22667608	22679305	0.000312755615488293	22696162	22708012
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22706166	22721042	10	10	-3.9871	0.000312755615488293	22696162	22708012	0	22721042	22721042
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	35472378	6548	6385	5e-04	0	22721042	22721042	3.40803100665273e-55	35472378	35472378
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.1659	3.40803100665273e-55	35472378	35472378	4.95824111646337e-57	35476942	35476942
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1167	0.0341	4.95824111646337e-57	35476942	35476942	2.60384834169587e-27	37621766	37621766
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-2.2513	2.60384834169587e-27	37621766	37621766	2.31943848471925e-26	37626069	37626069
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5672	0.0122	2.31943848471925e-26	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	127779	31	31	0.0496	NA	NA	NA	1.14736005643998e-10	127779	127779
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	130528	3	3	0.914	1.14736005643998e-10	127779	127779	3.42606098526053e-07	130528	132689
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	2708291	1759	1728	0.0032	3.42606098526053e-07	130528	132689	0	2708113	2711273
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154582414	45134	44018	0.9968	0	2708113	2711273	0	154578922	154586690
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	195	0.002	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	121	-3.9855	NA	NA	NA	2.39551590799317e-28	3223585	3733715
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-0.8443	2.39551590799317e-28	3223585	3733715	1.25836635680343e-11	5593746	6696721
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	168	-3.3922	1.25836635680343e-11	5593746	6696721	1.46051832338904e-05	7003768	7210018
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7461576	123	115	-2.5355	1.46051832338904e-05	7003768	7210018	0.000251944730159555	7338262	7619927
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7465453	7723783	82	78	-3.4637	0.000251944730159555	7338262	7619927	4.10399521482382e-05	7703962	7726921
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	16	-1.8209	4.10399521482382e-05	7703962	7726921	1.70119907396093e-05	7758635	7806091
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	37	-3.0717	1.70119907396093e-05	7758635	7806091	0.000132256699863188	7893056	7905286
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.6782	0.000132256699863188	7893056	7905286	9.85833057171657e-05	7914104	7926989
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	372	-3.6739	9.85833057171657e-05	7914104	7926989	3.52006813976377e-22	10511255	10513747
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10631941	12	12	-0.4898	3.52006813976377e-22	10511255	10513747	0.000404340562205845	10622062	12527445
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	12682301	73	70	-2.1148	0.000404340562205845	10622062	12527445	8.7389478499226e-06	12646477	12710000
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12786515	16	16	-3.8985	8.7389478499226e-06	12646477	12710000	1.66134002077406e-08	12756268	12796639
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12792780	12905395	32	31	-2.1171	1.66134002077406e-08	12756268	12796639	3.63593813903366e-07	12901857	12919413
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12909643	12926941	8	8	-4.1457	3.63593813903366e-07	12901857	12919413	1.63188539966325e-05	12924438	12953078
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13048283	47	45	-1.642	1.63188539966325e-05	12924438	12953078	5.5966303073717e-05	13029929	13048283
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13050965	13066849	10	10	-3.6569	5.5966303073717e-05	13029929	13048283	1.13376667816294e-06	13066849	13081856
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13076862	13128515	22	20	-1.9421	1.13376667816294e-06	13066849	13081856	2.37544621403487e-12	13114169	13138841
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14342834	409	394	-3.741	2.37544621403487e-12	13114169	13138841	4.75990936730515e-11	14312365	14379418
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	92	-2.8609	4.75990936730515e-11	14312365	14379418	9.85999847639704e-09	14502379	14508894
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14547168	13	12	-0.7291	9.85999847639704e-09	14502379	14508894	3.96048166721977e-07	14547168	14547168
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14555872	5	4	-3.1065	3.96048166721977e-07	14547168	14547168	1.18079993458939e-07	14555872	14557473
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14557473	14579298	8	8	-1.0388	1.18079993458939e-07	14555872	14557473	0.0110622757645137	14572190	14681738
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14700040	23	22	-2.8486	0.0110622757645137	14572190	14681738	2.71051131794634e-05	14681738	14705129
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14883615	43	40	-4.2412	2.71051131794634e-05	14681738	14705129	3.63157387293578e-07	14852617	15005207
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15284717	128	122	-3.0464	3.63157387293578e-07	14852617	15005207	1.46308434468587e-07	15252823	15299931
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15408015	79	74	-4.0327	1.46308434468587e-07	15252823	15299931	2.13207645821357e-06	15396500	15446156
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15690301	108	104	-3.1265	2.13207645821357e-06	15396500	15446156	1.02920653726215e-05	15614125	15719904
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15695261	15915466	36	36	-4.2325	1.02920653726215e-05	15614125	15719904	2.26024391256674e-11	15898644	15951430
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16042966	49	46	-2.4283	2.26024391256674e-11	15898644	15951430	0.00125953461967834	15987432	16094964
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	16343057	105	102	-3.2468	0.00125953461967834	15987432	16094964	0.0203132427910235	16169603	16756327
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16350833	16350833	1	0	NA	0.0203132427910235	16169603	16756327	NA	NA	NA
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16354465	22015735	924	877	-3.6616	NA	NA	NA	0.000218517246691475	21876007	22049641
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22017259	22192409	35	34	-2.7948	0.000218517246691475	21876007	22049641	8.69844840774251e-18	22179794	22192409
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22263267	23	23	-4.9696	8.69844840774251e-18	22179794	22192409	1.11518615072272e-08	22252795	22382215
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22268552	22930737	65	62	-3.7294	1.11518615072272e-08	22252795	22382215	6.3431856475264e-50	22926726	23283689
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.0525	6.3431856475264e-50	22926726	23283689	9.68960069098415e-10	26945084	26952278
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.6695	9.68960069098415e-10	26945084	26952278	0.092618565850423	26952278	26998633
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27003308	7	6	-1.8055	0.092618565850423	26952278	26998633	0.0509664302314811	26989053	27003308
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	27019256	5	5	-0.4505	0.0509664302314811	26989053	27003308	3.27959657084376e-60	27019256	27019256
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-3.5869	3.27959657084376e-60	27019256	27019256	4.64775151723119e-16	27039222	27053237
MSK_252152912763_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.5721	4.64775151723119e-16	27039222	27053237	NA	NA	NA
