Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	4289654	1196	1152	-0.4319	NA	NA	NA	0	4275782	4304784
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	4294854	16698906	4584	4409	0.0504	0	4275782	4304784	6.77571513714712e-19	16659021	16814050
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16704522	17127039	27	27	-0.4581	6.77571513714712e-19	16659021	16814050	2.19570224892685e-17	17112697	17157415
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	24391166	3027	2911	0.0323	2.19570224892685e-17	17112697	17157415	5.29171617526191e-29	24391166	24391166
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-2.2675	5.29171617526191e-29	24391166	24391166	3.34973553257084e-33	24395691	24395691
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	26138527	689	650	0.0562	3.34973553257084e-33	24395691	24395691	0	26132413	26141641
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	26139809	42832115	6543	6308	-0.5227	0	26132413	26141641	0	42825923	42851080
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	42848440	50553422	3075	2958	0.048	0	42825923	42851080	0	50532444	50570705
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	50556697	64396256	5535	5290	0.4211	0	50532444	50570705	6.16930501121256e-27	64376994	64410250
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	64399044	64721399	105	102	0.7152	6.16930501121256e-27	64376994	64410250	7.20796223475688e-21	64706651	64742644
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	64722711	72537426	3111	2982	0.4585	7.20796223475688e-21	64706651	64742644	0	72537426	72537426
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	-3.4927	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	79543228	2304	2210	0.4656	0	72579311	72579311	0	79498382	79568978
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	79550472	103904723	7801	7519	0.0683	0	79498382	79568978	6.44556346237175e-13	103895306	103907903
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103962495	15	14	0.5719	6.44556346237175e-13	103895306	103907903	1.35871237028052e-11	103932025	104109172
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	121052394	5473	5271	0.048	1.35871237028052e-11	103932025	104109172	1.92804517694676e-52	121017531	142721264
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	141559466	144099712	108	105	-0.3529	1.92804517694676e-52	121017531	142721264	3.60003991352846e-53	143994475	144108338
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099998	150819879	1855	1782	0.0553	3.60003991352846e-53	143994475	144108338	7.41022728365533e-158	150819879	150823073
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	10	2.3304	7.41022728365533e-158	150819879	150823073	7.58273054582225e-88	150848509	150851439
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	75	0.0596	7.58273054582225e-88	150848509	150851439	5.75029886929533e-143	151026228	151026228
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-4.1397	5.75029886929533e-143	151026228	151026228	2.7065117819748e-193	151036435	151036435
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	152186678	486	471	0.0901	2.7065117819748e-193	151036435	151036435	9.26997801248694e-09	152176776	152193514
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	152189331	152213604	17	16	0.5326	9.26997801248694e-09	152176776	152193514	1.78865186188483e-08	152206204	152220655
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	152215985	157133150	2176	2103	0.0957	1.78865186188483e-08	152206204	152220655	1.83698735951965e-19	157133150	157133150
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.9312	1.83698735951965e-19	157133150	157133150	2.32402070597469e-24	157136342	157136342
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	163865260	2575	2482	0.0613	2.32402070597469e-24	157136342	157136342	1.55202832576482e-14	163855511	163872864
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	163866559	163917599	25	22	0.5019	1.55202832576482e-14	163855511	163872864	5.81721998764201e-13	163905718	163932909
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	163920906	167483267	1508	1462	0.0664	5.81721998764201e-13	163905718	163932909	1.47549256879805e-08	167477428	167493768
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167520743	9	9	0.6225	1.47549256879805e-08	167477428	167493768	5.66637678551941e-16	167507898	167529221
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167523140	200598243	11346	10943	0.0659	5.66637678551941e-16	167507898	167529221	8.93776383766222e-15	200584100	200625002
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200816497	51	50	-0.2426	8.93776383766222e-15	200584100	200625002	1.44559374684693e-09	200701140	200827476
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200818194	201356041	247	240	0.0197	1.44559374684693e-09	200701140	200827476	2.22689171468733e-96	201347770	201370119
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	201357738	240468647	14579	14028	0.3842	2.22689171468733e-96	201347770	201370119	8.18055033504435e-11	240451154	240489591
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240470722	240563263	30	29	0.0255	8.18055033504435e-11	240451154	240489591	4.01317614681399e-13	240553456	240596160
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240566493	246440949	2317	2242	0.3826	4.01317614681399e-13	240553456	240596160	7.95971853368464e-15	246390841	246467829
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246442698	246633505	73	70	0.6549	7.95971853368464e-15	246390841	246467829	0.00140133150261388	246593134	246676851
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246636010	246751473	21	21	0.3861	0.00140133150261388	246593134	246676851	9.8975711990381e-07	246696599	246794552
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246753652	246862029	31	31	0.7932	9.8975711990381e-07	246696599	246794552	1.79842087928594e-08	246855902	246907655
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	97	0.4063	1.79842087928594e-08	246855902	246907655	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	1941225	750	719	0.0716	NA	NA	NA	1.01242914396725e-05	1921144	1947422
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	1943288	1972827	16	16	0.4357	1.01242914396725e-05	1921144	1947422	3.36928563045916e-07	1966627	1986126
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	1975062	2718085	289	276	0.0672	3.36928563045916e-07	1966627	1986126	2.75618214788827e-10	2701123	2742089
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	2719870	2826739	30	28	0.4113	2.75618214788827e-10	2701123	2742089	9.11840548292689e-12	2793159	2843085
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	2828533	3479364	233	218	0.0487	9.11840548292689e-12	2793159	2843085	1.03345746868493e-25	3468472	3505517
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3480959	3727185	78	73	0.429	1.03345746868493e-25	3468472	3505517	2.31965568756382e-16	3708749	3745223
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3731618	4240100	151	140	0.0589	2.31965568756382e-16	3708749	3745223	4.86605140203603e-14	4206696	4252298
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	4243736	4398852	49	49	0.4344	4.86605140203603e-14	4206696	4252298	1.41305142618903e-15	4381888	4430298
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	4402454	4799696	110	103	0.0671	1.41305142618903e-15	4381888	4430298	6.91564343227241e-11	4776705	4804657
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	4802343	4887109	32	28	0.4197	6.91564343227241e-11	4776705	4804657	6.14488118798876e-10	4880497	4918804
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	4891381	5752460	141	136	0.0743	6.14488118798876e-10	4880497	4918804	3.34825438084044e-08	5725998	5776854
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	5756344	5967446	39	37	0.3737	3.34825438084044e-08	5725998	5776854	1.00051777804337e-08	5893322	6028632
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	5972726	15353628	2653	2561	0.0846	1.00051777804337e-08	5893322	6028632	7.23989119606554e-09	15334842	15359797
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	15356047	15414111	27	24	0.4444	7.23989119606554e-09	15334842	15359797	7.29240489751155e-07	15408060	15420911
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	15417224	15430274	8	8	0.0055	7.29240489751155e-07	15408060	15420911	5.9753420838985e-06	15427643	15442455
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	15433758	15558882	61	58	0.4493	5.9753420838985e-06	15427643	15442455	5.4113244751791e-23	15549928	15572409
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	15561665	17120910	430	417	0.0913	5.4113244751791e-23	15549928	15572409	9.94558529166515e-06	17109609	17120910
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17126263	17135771	4	4	-0.565	9.94558529166515e-06	17109609	17120910	1.30142491757467e-05	17135771	17143573
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17138272	17729151	201	197	0.0837	1.30142491757467e-05	17135771	17143573	5.11290395665908e-10	17715319	17744766
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17730574	17796281	28	27	0.448	5.11290395665908e-10	17715319	17744766	0.00890200831327325	17761928	17796281
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17797682	17806289	6	6	-0.0031	0.00890200831327325	17761928	17796281	0.00276036806106472	17803038	17815937
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17808725	17824070	9	9	0.3543	0.00276036806106472	17803038	17815937	1.00010794109149e-05	17815937	17829446
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17825643	17973457	67	60	0.0025	1.00010794109149e-05	17815937	17829446	2.99778553425783e-18	17965582	17977662
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17975444	18012779	17	17	0.513	2.99778553425783e-18	17965582	17977662	6.90805051366026e-12	18005226	18019695
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	18015619	18355128	66	61	0.0552	6.90805051366026e-12	18005226	18019695	4.86738895900173e-21	18338740	18365682
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	18361231	18608131	41	40	0.4859	4.86738895900173e-21	18338740	18365682	3.51119762250715e-18	18604631	18627877
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	18609868	20709414	536	518	0.0864	3.51119762250715e-18	18604631	18627877	1.19614149101787e-06	20686870	20722873
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20713444	20751884	20	19	0.4406	1.19614149101787e-06	20686870	20722873	1.33120412262039e-07	20743269	20764796
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20753775	22089424	310	299	0.0796	1.33120412262039e-07	20743269	20764796	2.02573281863628e-14	22045245	22106128
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	22093518	22252471	30	29	0.4816	2.02573281863628e-14	22045245	22106128	2.21432483753706e-19	22239557	22259385
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	22254691	22700086	102	98	0.0365	2.21432483753706e-19	22239557	22259385	2.84292631151482e-17	22673150	22759255
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	22710624	23008574	51	50	0.3995	2.84292631151482e-17	22673150	22759255	6.62293717835475e-16	22973317	23058696
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	23013273	24196240	376	366	0.0486	6.62293717835475e-16	22973317	23058696	6.31181274928735e-13	24187733	24200838
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24197394	24266662	31	28	0.458	6.31181274928735e-13	24187733	24200838	5.26802098652647e-16	24258502	24279420
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24267809	24600527	130	127	0.0376	5.26802098652647e-16	24258502	24279420	8.11254362976654e-14	24590297	24627548
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24602602	24708009	44	40	0.4157	8.11254362976654e-14	24590297	24627548	1.18226249128274e-13	24693436	24731824
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24712319	24712319	1	0	NA	1.18226249128274e-13	24693436	24731824	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24712447	25125649	186	180	0.0652	NA	NA	NA	1.64465408910386e-21	25117131	25138553
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	25127140	25218083	48	44	0.4761	1.64465408910386e-21	25117131	25138553	2.85297726762284e-27	25211924	25226863
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	25219680	26840045	752	728	0.0263	2.85297726762284e-27	25211924	25226863	9.13974048215304e-15	26831799	26842564
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	26841339	26876299	19	19	0.5197	9.13974048215304e-15	26831799	26842564	2.91355581706252e-11	26872011	26884027
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	26877944	27036866	78	75	0.0356	2.91355581706252e-11	26872011	26884027	1.47226660843123e-12	27024094	27057498
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27040051	27242294	97	95	0.3842	1.47226660843123e-12	27024094	27057498	4.59615248961414e-19	27211981	27254209
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27247029	27596578	174	170	0.0489	4.59615248961414e-19	27211981	27254209	9.77509970775847e-20	27583373	27617960
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27599983	27775153	77	74	0.3855	9.77509970775847e-20	27583373	27617960	4.8240699273072e-20	27764808	27786943
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	27778689	28029155	108	105	0.0259	4.8240699273072e-20	27764808	27786943	3.45604619930017e-08	28014524	28033890
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28030835	28030835	1	0	NA	3.45604619930017e-08	28014524	28033890	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28032660	28062898	14	14	0.4512	NA	NA	NA	8.71650029491978e-06	28056674	28074060
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28064332	28731719	301	289	0.0679	8.71650029491978e-06	28056674	28074060	4.80140310496842e-09	28721909	28734381
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28734381	28758385	10	10	0.629	4.80140310496842e-09	28721909	28734381	5.24320937438902e-08	28754118	28773246
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28761581	29569865	394	381	0.0823	5.24320937438902e-08	28754118	28773246	3.42240142984253e-59	29562868	29581429
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	29572292	29912935	170	165	0.5342	3.42240142984253e-59	29562868	29581429	1.77934227541984e-58	29899021	29923986
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	29915771	30714869	306	292	0.081	1.77934227541984e-58	29899021	29923986	2.88945574571825e-25	30704331	30727192
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	30717803	30986826	92	88	0.4199	2.88945574571825e-25	30704331	30727192	3.16604481440886e-33	30975070	30996943
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	30988473	33076512	882	851	0.0588	3.16604481440886e-33	30975070	30996943	2.25839713620514e-08	33074522	33076512
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.2218	2.25839713620514e-08	33074522	33076512	5.96944157292598e-09	33080437	33084847
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	33083568	2	0	NA	5.96944157292598e-09	33080437	33084847	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33084847	34543992	642	613	0.0651	NA	NA	NA	1.35164558764008e-10	34524344	34552935
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	19	0.4776	1.35164558764008e-10	34524344	34552935	3.02914775123319e-08	34580533	34608979
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	35122609	215	214	0.0935	3.02914775123319e-08	34580533	34608979	1.04884570121482e-13	35108421	35140152
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35124794	35185289	23	23	0.5471	1.04884570121482e-13	35108421	35140152	7.91783003435646e-12	35182662	35209141
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35199737	35464250	99	95	0.0772	7.91783003435646e-12	35182662	35209141	1.20897846463068e-05	35448164	35469152
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35466320	35491420	14	14	0.4783	1.20897846463068e-05	35448164	35469152	2.11011114888865e-09	35486072	35500034
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35493975	37486877	877	849	0.0324	2.11011114888865e-09	35486072	35500034	1.29346315814592e-07	37466604	37516286
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37488358	37554098	29	29	0.3195	1.29346315814592e-07	37466604	37516286	6.42156254031635e-06	37529469	37580504
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37555729	37789939	106	105	0.0143	6.42156254031635e-06	37529469	37580504	1.98670524402742e-07	37775420	37815049
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	27	-0.3195	1.98670524402742e-07	37775420	37815049	1.24367196390025e-10	37839335	37868682
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	39616236	816	781	0.0305	1.24367196390025e-10	37839335	37868682	1.98837071769230e-35	39609079	39621617
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	39619011	39731940	52	50	0.4955	1.9883707176923e-35	39609079	39621617	3.03729393220429e-27	39724979	39742388
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	39735121	44850149	2045	1961	0.058	3.03729393220429e-27	39724979	39742388	0.000305072419291817	44830730	44858414
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	44852788	44885058	12	11	0.4389	0.000305072419291817	44830730	44858414	2.84069511052033e-06	44874565	44920739
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	44888148	45248256	89	88	0.0292	2.84069511052033e-06	44874565	44920739	1.29571213416736e-05	45236718	45248256
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45252232	45266404	8	8	0.4713	1.29571213416736e-05	45236718	45248256	6.7285151691588e-06	45266404	45276275
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45268763	45889041	270	259	0.0356	6.7285151691588e-06	45266404	45276275	2.48488382799303e-21	45880711	45893476
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45892303	45948599	30	30	0.4779	2.48488382799303e-21	45880711	45893476	7.39686410627302e-19	45943912	45957580
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	45950010	47189248	535	514	0.0446	7.39686410627302e-19	45943912	45957580	9.54420580437054e-11	47173838	47190531
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	47190531	47221830	14	14	0.5203	9.54420580437054e-11	47173838	47190531	9.26911119128386e-12	47221396	47224567
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	47223237	47302322	37	35	0.0076	9.26911119128386e-12	47221396	47224567	3.58954694774791e-17	47295408	47305026
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	47305026	47358490	21	21	0.5148	3.58954694774791e-17	47295408	47305026	2.91901425907736e-10	47355514	47382484
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	47365164	48377221	391	382	0.0823	2.91901425907736e-10	47355514	47382484	1.42376192283861e-15	48360356	48394396
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	48384455	48474225	39	39	0.4879	1.42376192283861e-15	48360356	48394396	8.18974996036617e-19	48448335	48489056
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	48477575	50695052	795	769	0.0918	8.18974996036617e-19	48448335	48489056	4.90475674656329e-15	50685062	50699467
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50696859	50746351	28	28	0.5039	4.90475674656329e-15	50685062	50699467	4.50390291968764e-16	50739891	50756286
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50748608	50748608	1	0	NA	4.50390291968764e-16	50739891	50756286	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50750590	52302856	534	510	0.0975	NA	NA	NA	3.57526955347331e-12	52292596	52315249
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52305253	52365076	18	17	0.5519	3.57526955347331e-12	52292596	52315249	9.93561717751817e-15	52357254	52372868
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52367320	52716885	97	94	0.0192	9.93561717751817e-15	52357254	52372868	3.82048517190847e-14	52707852	52726632
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52722179	52903250	30	27	0.4177	3.82048517190847e-14	52707852	52726632	4.33739626310346e-12	52884557	52940460
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52906249	53506261	117	108	0.075	4.33739626310346e-12	52884557	52940460	1.23958122400124e-11	53479079	53527331
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	53509957	53566337	23	21	0.4809	1.23958122400124e-11	53479079	53527331	2.78870568437491e-12	53555820	53581189
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	53568951	80713158	9352	9000	0.0528	2.78870568437491e-12	53555820	53581189	6.85496281542941e-14	80701117	80718980
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	80715616	80840968	31	29	0.4389	6.85496281542941e-14	80701117	80718980	1.18767444815165e-11	80815696	80882727
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	80850015	87149187	1577	1513	0.0697	1.18767444815165e-11	80815696	80882727	8.31218074498141e-80	86918751	87335913
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87245647	88479424	181	176	0.4756	8.31218074498141e-80	86918751	87335913	1.87595475428789e-48	88471596	88491239
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88481228	89319930	234	228	0.0613	1.87595475428789e-48	88471596	88491239	4.5430210026365e-06	89263354	89379689
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89377705	89624945	13	13	-0.3595	4.5430210026365e-06	89263354	89379689	0.000862841477309797	89401838	89706844
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89635398	89902365	35	35	-0.0271	0.000862841477309797	89401838	89706844	4.37458201226713e-06	89876334	91127894
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	91057122	91270311	14	14	-0.4365	4.37458201226713e-06	89876334	91127894	1.24422100722264e-11	91179406	94892766
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94784165	95722700	224	217	0.0819	1.24422100722264e-11	91179406	94892766	1.62185463332746e-08	95713002	95722700
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	95796016	95974614	3	3	-0.8611	1.62185463332746e-08	95713002	95722700	2.03808859838647e-07	95974614	96103035
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	96103035	124217265	7872	7598	0.0474	2.03808859838647e-07	95974614	96103035	0	124172739	124256061
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	124221989	132023737	1868	1813	0.4288	0	124172739	124256061	3.52816261306962e-17	131925547	132366131
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132049286	132820205	40	38	0.0137	3.52816261306962e-17	131925547	132366131	3.138450550572e-21	132767020	132841126
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132823716	140893071	2683	2580	0.4412	3.138450550572e-21	132767020	132841126	0	140871835	140911659
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	140897279	146571330	2014	1930	0.0885	0	140871835	140911659	0	146571330	146571330
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.6261	0	146571330	146571330	0	146592775	146592775
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	151305298	1208	1167	0.0652	0	146592775	146592775	2.78340940774801e-18	151297112	151305298
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	151320060	151394019	9	9	-0.7238	2.78340940774801e-18	151297112	151305298	6.69202921427914e-20	151394019	151402035
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	151402035	160760934	3049	2944	0.0775	6.69202921427914e-20	151394019	151402035	2.48454388433443e-14	160735881	160770027
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	160762801	160865290	42	39	0.4069	2.48454388433443e-14	160735881	160770027	5.54563630064176e-13	160857981	160886666
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	160868631	192437788	10743	10383	0.0805	5.54563630064176e-13	160857981	160886666	0	192437788	192437788
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	192439533	192480134	18	17	-2.522	0	192437788	192437788	0	192480134	192480134
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	192483924	242689978	17680	17043	0.0554	0	192480134	192480134	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	9670981	3325	3190	0.064	NA	NA	NA	1.83453582369423e-16	9664533	9688593
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9672941	9672941	1	0	NA	1.83453582369423e-16	9664533	9688593	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9675150	9732817	27	26	0.4933	NA	NA	NA	1.25874980313656e-16	9715511	9743979
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	9734169	32074432	7443	7170	0.0496	1.25874980313656e-16	9715511	9743979	1.46273373413190e-21	32074432	32074432
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.8567	1.4627337341319e-21	32074432	32074432	1.38771692512126e-20	32080848	32080848
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	49586711	6388	6143	0.0316	1.38771692512126e-20	32080848	32080848	1.59310242782580e-06	49571161	49604446
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	49588313	49628601	15	15	0.4193	1.5931024278258e-06	49571161	49604446	8.25431123819667e-05	49617147	49638106
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	49629757	49667213	18	18	-0.0074	8.25431123819667e-05	49617147	49638106	5.02972335809324e-05	49658784	49681255
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	49668773	49724154	21	20	0.43	5.02972335809324e-05	49658784	49681255	9.02806935740057e-11	49710748	49735068
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	49725302	75479859	9636	9276	0.0198	9.02806935740057e-11	49710748	49735068	4.74440803178501e-12	75474341	75783255
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75803353	7	7	-0.7101	4.74440803178501e-12	75474341	75783255	3.24432692763259e-05	75799026	75853052
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75845446	76064054	26	24	-0.1243	3.24432692763259e-05	75799026	75853052	0.0276315213626384	75871755	76070315
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76066005	76086048	10	10	-0.4487	0.0276315213626384	75871755	76070315	1.00673493305084e-09	76081578	76091014
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76088381	99891210	5264	5082	0.1048	1.00673493305084e-09	76081578	76091014	4.03098030647075e-26	99891210	99891210
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-1.897	4.03098030647075e-26	99891210	99891210	1.35944498233181e-23	99897201	99897201
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	102528083	912	874	0.0569	1.35944498233181e-23	99897201	99897201	1.10909700900029e-07	102526381	102529978
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	102529978	102533766	3	3	0.9513	1.10909700900029e-07	102526381	102529978	2.34565395298548e-07	102532504	102536271
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	102536271	117762494	4743	4584	0.0702	2.34565395298548e-07	102532504	102536271	3.22452130167613e-124	117759686	117768353
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117764696	117764696	1	0	NA	3.22452130167613e-124	117759686	117768353	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117768353	118117442	94	90	-0.5706	NA	NA	NA	3.94497298160782e-105	118113773	118123566
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	118121284	133189686	5771	5557	0.0386	3.94497298160782e-105	118113773	118123566	1.24754514317448e-22	133189686	133189686
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.947	1.24754514317448e-22	133189686	133189686	4.34217195414801e-23	133194685	133194685
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	4.34217195414801e-23	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	154299758	6647	6427	0.0542	NA	NA	NA	3.45928186555815e-22	154278932	154310112
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	154306331	154359343	21	21	-0.5194	3.45928186555815e-22	154278932	154310112	9.1540895568305e-24	154355250	154364345
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	154360494	163190072	3001	2886	0.0568	9.1540895568305e-24	154355250	154364345	5.71491084549258e-53	163151373	163243937
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163197163	163992903	107	100	0.4519	5.71491084549258e-53	163151373	163243937	1.07782294168644e-24	163987457	163997228
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	26	-0.1653	1.07782294168644e-24	163987457	163997228	1.79146226779713e-29	164105613	164115417
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	187891716	7837	7526	0.438	1.79146226779713e-29	164105613	164115417	1.61040015465234e-09	187890040	187891716
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187893046	187901855	5	5	-0.3615	1.61040015465234e-09	187890040	187891716	2.67545574634784e-08	187901855	187903422
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187903422	196822133	3290	3164	0.3898	2.67545574634784e-08	187901855	187903422	1.98556098411826e-11	196806091	196905767
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196940125	22	22	-0.0277	1.98556098411826e-11	196806091	196905767	4.38924234948795e-10	196928503	196952514
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196942158	199329592	962	920	0.3902	4.38924234948795e-10	196928503	196952514	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	1553201	501	482	0.4035	NA	NA	NA	8.46573829954888e-168	1515004	1583811
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1563721	69099817	17938	17270	0.072	8.46573829954888e-168	1515004	1583811	6.33817352166181e-14	69097336	69120776
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69109815	69165814	8	8	-0.6499	6.33817352166181e-14	69097336	69120776	4.43863294166088e-14	69153675	69643272
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	100535321	10617	10238	0.0879	4.43863294166088e-14	69153675	69643272	0	100525275	100541994
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	100540640	119333701	5680	5486	-0.4716	0	100525275	100541994	1.30800582492009e-17	119333701	119345371
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119334954	119334954	1	0	NA	1.30800582492009e-17	119333701	119345371	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-1.7952	NA	NA	NA	4.6797567164237e-19	119346804	119348829
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	173224400	14892	14322	-0.4278	4.6797567164237e-19	119346804	119348829	5.48817858978356e-32	173224400	173224400
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.7218	5.48817858978356e-32	173224400	173224400	4.0751741227023e-35	173228860	173228860
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	185	-0.404	4.0751741227023e-35	173228860	173228860	3.16652528399851e-44	173660684	173660684
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.9777	3.16652528399851e-44	173660684	173660684	1.72035213328705e-41	173666072	173666072
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	175860235	743	713	-0.4168	1.72035213328705e-41	173666072	173666072	2.17615446768859e-10	175857109	175860235
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	0.8053	2.17615446768859e-10	175857109	175860235	1.55099550976815e-10	175863396	175863396
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	190767854	4480	4313	-0.4408	1.55099550976815e-10	175863396	175863396	8.8402676571991e-19	190735382	190792612
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190772330	190915643	52	49	-0.7741	8.8402676571991e-19	190735382	190792612	3.89225309648768e-08	190896423	190940021
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190917729	191133096	44	44	-0.4622	3.89225309648768e-08	190896423	190940021	0.0240920254217457	191017024	191133096
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191133609	191153613	3	3	0.0252	0.0240920254217457	191017024	191133096	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	197349	33	33	-0.0127	NA	NA	NA	8.69249773044858e-14	190624	216401
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	200640	2056233	605	587	0.4164	8.69249773044858e-14	190624	216401	2.38660552025069e-255	2030407	2073146
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	2061757	8750027	1965	1890	0.0011	2.38660552025069e-255	2030407	2073146	6.93008870746814e-12	8744438	8750027
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8758735	8800001	6	6	-0.7469	6.93008870746814e-12	8744438	8750027	2.47828914156472e-12	8800001	8809384
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	8809384	12857302	1366	1323	0.0287	2.47828914156472e-12	8800001	8809384	8.45845278331402e-132	12857302	12857302
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.2766	8.45845278331402e-132	12857302	12857302	2.83576250263868e-123	12873052	12873052
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	15586863	725	697	0.0273	2.83576250263868e-123	12873052	12873052	1.67376027938463e-66	15583146	15595940
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	15590421	15711120	62	62	-0.5724	1.67376027938463e-66	15583146	15595940	9.77672875275002e-82	15708239	15719017
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	15714099	63913259	12586	12136	0.0606	9.77672875275002e-82	15708239	15719017	0	63909224	63917242
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	63915367	99408563	10500	10122	-0.5093	0	63909224	63917242	6.74869453788204e-15	99406689	99412268
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	99410686	99418325	4	4	0.5539	6.74869453788204e-15	99406689	99412268	2.43680845824471e-15	99412268	99444081
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	99444081	135370990	10247	9818	-0.4987	2.43680845824471e-15	99412268	99444081	0	135366253	135378035
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	135374561	180342860	15545	14976	0.0556	0	135366253	135378035	4.5727495639216e-45	180189516	180348365
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.5731	4.5727495639216e-45	180189516	180348365	3.59258915844226e-07	180355807	180364670
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	106	-0.077	3.59258915844226e-07	180355807	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	236535	54	52	0.293	NA	NA	NA	2.53293634601083e-33	232366	237952
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	237952	327962	48	46	-0.4495	2.53293634601083e-33	232366	237952	5.20528710027778e-98	326323	329100
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	329100	2052771	695	668	0.4241	5.20528710027778e-98	326323	329100	3.46175723758515e-21	2046381	2055274
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	2055274	2116903	31	31	0.9171	3.46175723758515e-21	2046381	2055274	4.13331498149893e-26	2114101	2121646
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	2119533	18371831	5710	5480	0.4025	4.13331498149893e-26	2114101	2121646	4.82985691685503e-09	18368026	18373481
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18373481	18378787	3	3	1.3961	4.82985691685503e-09	18368026	18373481	1.34001151082624e-09	18375068	18380299
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18380299	24314676	1690	1630	0.4117	1.34001151082624e-09	18375068	18380299	0	24302793	24326179
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	24317437	31385778	2951	2851	0.0415	0	24302793	24326179	1.42247810844671e-10	31383925	31385778
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-0.7076	1.42247810844671e-10	31383925	31385778	4.48896762440251e-11	31418006	31425113
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	476	0.0613	4.48896762440251e-11	31418006	31425113	6.72812003997974e-241	32558677	32563252
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32605300	10	10	-3.0543	6.72812003997974e-241	32558677	32563252	0.000327147935238144	32593151	32613538
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32609525	32633691	7	7	-1.0972	0.000327147935238144	32593151	32613538	3.19967086395128e-06	32613538	32633691
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	27	0.0512	3.19967086395128e-06	32613538	32633691	8.20666858988974e-06	32707427	32720656
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	-0.6949	8.20666858988974e-06	32707427	32720656	4.41209774389665e-27	32723366	32731072
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	57327113	9522	9189	0.046	4.41209774389665e-27	32723366	32731072	7.50794347926624e-42	57307563	57340993
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57328286	57672491	133	129	-0.279	7.50794347926624e-42	57307563	57340993	4.97212621036687e-63	57634110	57718525
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57683389	79011979	5037	4867	0.1059	4.97212621036687e-63	57634110	57718525	1.74429403919102e-11	78990768	79024557
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79015901	79091850	15	15	0.5915	1.74429403919102e-11	78990768	79024557	5.48753106259013e-12	79079988	79119694
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	83387075	1090	1051	0.0957	5.48753106259013e-12	79079988	79119694	0	83355865	83397458
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	83392467	102039635	5182	5001	-0.4789	0	83355865	83397458	2.65067024799277e-59	102039635	102039635
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-2.8603	2.65067024799277e-59	102039635	102039635	4.38010600640403e-64	102044331	102044331
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	469	-0.4166	4.38010600640403e-64	102044331	102044331	1.22637646312280e-21	103841482	103841482
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.82	1.2263764631228e-21	103841482	103841482	6.55045504960035e-24	103868154	103868154
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	165643653	21106	20290	-0.4991	6.55045504960035e-24	103868154	103868154	1.91043578658325e-205	165643653	165643653
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.3107	1.91043578658325e-205	165643653	165643653	5.34527409517816e-183	165650610	165650610
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1733	-0.5153	5.34527409517816e-183	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1552369	455	436	-0.4743	NA	NA	NA	9.94850063673615e-16	1548434	1556454
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1554676	1590689	15	15	0.1667	9.94850063673615e-16	1548434	1556454	2.16774042290492e-21	1585620	1592782
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1590699	16135701	4918	4730	-0.503	2.16774042290492e-21	1585620	1592782	2.46523753768750e-119	16135701	16135701
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.7747	2.4652375376875e-119	16135701	16135701	6.58548277459624e-126	16140018	16140018
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	39929343	8923	8584	-0.5207	6.58548277459624e-126	16140018	16140018	0	39905994	39935419
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	39932668	53674606	3933	3788	0.0522	0	39905994	39935419	8.74693849944814e-71	53666817	53682194
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	53675905	53875951	74	68	-0.5247	8.74693849944814e-71	53666817	53682194	8.13233445596477e-72	53864791	53883518
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	53878634	89573426	8742	8460	0.0633	8.13233445596477e-72	53864791	53883518	5.83919794480833e-18	89560932	89586141
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89582337	89628853	11	11	-0.4068	5.83919794480833e-18	89560932	89586141	1.13895191743058e-06	89622481	89637823
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89630189	102294248	4813	4646	0.0576	1.13895191743058e-06	89622481	89637823	0	102291224	102300500
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	102297940	103726703	597	578	-0.5365	0	102291224	102300500	1.56975100489883e-33	103722522	103729535
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103729535	103803513	32	30	0.041	1.56975100489883e-33	103722522	103729535	1.96921713125426e-28	103799671	103810781
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	103807574	109216032	2445	2356	-0.4973	1.96921713125426e-28	103799671	103810781	7.19894249599097e-10	109212149	109216032
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109244233	7	7	0.1673	7.19894249599097e-10	109212149	109216032	1.02596763179287e-09	109244233	109247295
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	109967918	300	291	-0.4855	1.02596763179287e-09	109244233	109247295	3.98494716933398e-22	109967918	109967918
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-2.4215	3.98494716933398e-22	109967918	109967918	3.50674399745066e-26	109974402	109974402
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3836	-0.4811	3.50674399745066e-26	109974402	109974402	4.87950116253446e-18	118611324	118611324
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	0.8337	4.87950116253446e-18	118611324	118611324	6.5117302470442e-17	118620875	118620875
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125291315	2936	2802	-0.47	6.5117302470442e-17	118620875	118620875	0	125285586	125296784
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125292617	135554003	4892	4697	0.0434	0	125285586	125296784	1.07636204207513e-119	135542041	135567031
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	135557144	136102523	232	226	0.4579	1.07636204207513e-119	135542041	135567031	1.86046334469324e-110	136092070	136125457
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136116925	141410894	2475	2376	0.051	1.86046334469324e-110	136092070	136125457	9.33714875865607e-12	141406414	141419692
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	12	0.6082	9.33714875865607e-12	141406414	141419692	4.18617460735737e-06	141431668	141453012
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	142152205	294	277	0.1409	4.18617460735737e-06	141431668	141453012	2.37919689641024e-06	142141101	142152205
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142166710	4	4	-0.6733	2.37919689641024e-06	142141101	142152205	0.0811795181786058	142166710	142166710
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-2.6952	0.0811795181786058	142166710	142166710	2.4261081396585e-46	142167908	142167908
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	149237841	3004	2884	0.0777	2.4261081396585e-46	142167908	142167908	4.77752731056209e-10	149192529	149334852
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149239606	149619471	59	58	-0.166	4.77752731056209e-10	149192529	149334852	1.54559812409311e-08	149533575	149679984
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149626372	151728811	908	866	0.0643	1.54559812409311e-08	149533575	149679984	7.62916741419264e-17	151726377	151728811
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	7	-0.8315	7.62916741419264e-17	151726377	151728811	1.83205959041622e-15	151743145	151745100
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	154628367	852	819	0.0339	1.83205959041622e-15	151743145	151745100	0	154622111	154631748
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	154629988	158821263	1748	1687	0.7129	0	154622111	154631748	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	113	-0.5189	NA	NA	NA	3.68330680683985e-10	581533	581533
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.9961	3.68330680683985e-10	581533	581533	1.07123991309526e-12	588865	588865
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2165688	599	577	-0.4975	1.07123991309526e-12	588865	588865	1.81955202484159e-07	2137441	2171384
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2171384	2229727	15	14	-0.9351	1.81955202484159e-07	2137441	2171384	0.00231736263133183	2223705	2229727
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2231804	2234351	2	2	-0.456	0.00231736263133183	2223705	2229727	4.87982728612551e-83	2234351	2234351
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-2.5706	4.87982728612551e-83	2234351	2234351	3.34722094692936e-61	2251011	2251011
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	7327293	1655	1593	-0.5455	3.34722094692936e-61	2251011	2251011	2.11985594478230e-14	7327293	7327293
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7697025	7824059	5	5	-1.4385	2.1198559447823e-14	7327293	7327293	6.55399734962443e-13	7824059	8137794
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	17563326	3288	3146	-0.5013	6.55399734962443e-13	7824059	8137794	1.59909385746107e-317	17543328	17573204
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	17565997	21481191	1161	1109	-0.1542	1.59909385746107e-317	17543328	17573204	6.63114684398575e-65	21439548	21511172
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	21483334	22109566	237	232	-0.4676	6.63114684398575e-65	21439548	21511172	4.229854045763e-76	22098412	22125509
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	22111614	25820302	1395	1340	-0.1077	4.229854045763e-76	22098412	22125509	6.59864982626356e-223	25810229	25826220
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25821758	27436956	674	647	-0.5085	6.59864982626356e-223	25810229	25826220	3.71484414198383e-130	27432949	27439677
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	27438219	27703861	122	119	0.0888	3.71484414198383e-130	27432949	27439677	1.34202698868981e-166	27699194	27706533
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	27705337	37610537	3095	2976	-0.5231	1.34202698868981e-166	27699194	27706533	8.8964517054645e-147	37590362	37620931
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	37614742	38055507	186	171	-0.038	8.8964517054645e-147	37590362	37620931	1.02447220143022e-09	38055507	38055507
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38055657	38056982	2	2	-1.2242	1.02447220143022e-09	38055507	38055507	1.04932438665152e-17	38056982	38056982
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38069703	42763919	1691	1635	0.0222	1.04932438665152e-17	38056982	38056982	1.22290914114114e-135	42747657	42779620
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	42769175	43647063	229	221	-0.4604	1.22290914114114e-135	42747657	42779620	1.94804843359507e-200	43502304	47060717
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	47058319	86355521	11103	10683	0.0623	1.94804843359507e-200	43502304	47060717	4.11669338992409e-15	86354346	86355521
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	86358601	86370904	7	7	-0.7532	4.11669338992409e-15	86354346	86355521	1.27520909280140e-14	86370904	86374739
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	86374739	102693995	5345	5136	0.0597	1.2752090928014e-14	86370904	86374739	1.99116728161779e-147	102678286	102706762
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102695889	103707248	424	413	0.4021	1.99116728161779e-147	102678286	102706762	0.00155480060440849	103667000	103707248
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	103711541	103719670	5	5	0.8871	0.00155480060440849	103667000	103707248	0.00481745103369033	103718144	103734570
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	103721186	104340146	240	234	1.3456	0.00481745103369033	103718144	103734570	1.58515528034917e-74	104331748	104359602
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	104345401	115701209	3266	3142	0.9979	1.58515528034917e-74	104331748	104359602	1.23902329567198e-19	115701209	115701209
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.8912	1.23902329567198e-19	115701209	115701209	4.48145811574473e-25	115711730	115711730
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	143889160	8891	8553	0.9513	4.48145811574473e-25	115711730	115711730	2.66189645421698e-27	143885581	143899742
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143893146	143949123	17	16	0.361	2.66189645421698e-27	143885581	143899742	2.61132525987127e-06	143917248	143988974
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143951589	146264846	785	753	0.8781	2.61132525987127e-06	143917248	143988974	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	3623019	1284	1231	-0.5244	NA	NA	NA	5.6656661158573e-08	3583224	3635877
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	3626356	3689356	19	19	-0.1614	5.6656661158573e-08	3583224	3635877	4.80065422624804e-08	3672780	3726230
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	3694879	15802255	4155	4013	-0.5187	4.80065422624804e-08	3672780	3726230	9.58976235842527e-11	15802255	15802255
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	0.7405	9.58976235842527e-11	15802255	15802255	3.20618188643899e-10	15807123	15813356
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2437	-0.5095	3.20618188643899e-10	15807123	15813356	1.35236490653634e-161	23343915	23343915
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.4836	1.35236490653634e-161	23343915	23343915	1.19271536890803e-175	23365926	23365926
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	27820251	1039	984	-0.5246	1.19271536890803e-175	23365926	23365926	0	27812030	27828722
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	27828722	32717324	1338	1277	0.057	0	27812030	27828722	1.08605110978118e-11	32713111	32717324
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	32718938	32745236	13	12	0.5719	1.08605110978118e-11	32713111	32717324	1.12456397660644e-09	32745236	32753008
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	32746590	47002187	2347	2255	0.0457	1.12456397660644e-09	32745236	32753008	8.34019784915879e-09	43776365	66245109
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	66245109	67927172	12	12	-0.4574	8.34019784915879e-09	43776365	66245109	6.76879112230639e-11	67923904	70205801
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	306	0.0415	6.76879112230639e-11	67923904	70205801	6.79255583928407e-104	70926188	70926188
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-3.6521	6.79255583928407e-104	70926188	70926188	3.03700786361153e-102	70930528	70930528
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	74610011	1591	1527	0.0513	3.03700786361153e-102	70930528	70930528	6.35779061317034e-61	74597375	74617708
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	74612045	74881095	107	105	0.4645	6.35779061317034e-61	74597375	74617708	3.84307384045651e-66	74866644	74891221
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	74884493	100348045	8221	7924	0.0238	3.84307384045651e-66	74866644	74891221	3.94290119800875e-18	100348045	100348045
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-1.6609	3.94290119800875e-18	100348045	100348045	6.86264830147373e-19	100350814	100350814
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5364	0.0409	6.86264830147373e-19	100350814	100350814	2.76983432584196e-10	116124007	116124007
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.2284	2.76983432584196e-10	116124007	116124007	7.72474237885141e-09	116130333	116130333
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	134968328	7432	7131	0.0304	7.72474237885141e-09	116130333	116130333	5.46633623599656e-09	134968328	134968328
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134971606	134974412	2	2	-1.2385	5.46633623599656e-09	134968328	134968328	2.30802285995496e-07	134974412	134976292
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134976292	139893924	1874	1790	0.0515	2.30802285995496e-07	134974412	134976292	1.55054956488240e-08	139887411	139899704
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139896355	139907548	7	7	-0.6893	1.5505495648824e-08	139887411	139899704	2.53354007225628e-05	139904154	139921681
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139913642	140145683	85	80	-0.0966	2.53354007225628e-05	139904154	139921681	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4506	0.0335	NA	NA	NA	1.24392112108101e-09	13553503	13553503
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-1.2244	1.24392112108101e-09	13553503	13553503	2.03311872941677e-10	13556315	13556315
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	20145844	2377	2296	0.0451	2.03311872941677e-10	13556315	13556315	3.35349767573579e-147	20142296	20150671
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	20147635	20420271	143	135	-0.5384	3.35349767573579e-147	20142296	20150671	3.87405094746801e-146	20416344	20425101
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	20423545	45480572	7251	6998	0.0397	3.87405094746801e-146	20416344	20425101	5.69231561398457e-36	45474003	46391653
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	45487335	47040444	77	74	-0.3496	5.69231561398457e-36	45474003	46391653	3.9252793349713e-43	46558272	47063200
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47057097	69835856	6611	6367	0.0721	3.9252793349713e-43	46558272	47063200	5.92156864064724e-12	69835856	69837432
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69837432	69841183	3	3	1.1902	5.92156864064724e-12	69835856	69837432	2.68010956469015e-10	69839583	69841183
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	69843195	73697220	1610	1549	0.0549	2.68010956469015e-10	69839583	69841183	4.07125121958614e-37	73686829	73707775
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	73699252	73900527	82	78	0.4784	4.07125121958614e-37	73686829	73707775	5.04881974912976e-48	73890384	73910633
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	73902163	77917893	1754	1692	0.0268	5.04881974912976e-48	73890384	73910633	1.50506372935149e-74	77917893	77917893
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.3894	1.50506372935149e-74	77917893	77917893	5.1408933206262e-77	77928669	77928669
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	93907898	4934	4740	0.0502	5.1408933206262e-77	77928669	77928669	0	93904238	93911804
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	93910449	110011257	6373	6110	-0.5086	0	93904238	93911804	0	109988922	110015999
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	110015999	113596342	966	939	0.0751	0	109988922	110015999	8.97317533928905e-134	113583663	113611123
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	113601596	114100979	120	118	-0.5207	8.97317533928905e-134	113583663	113611123	3.64993754820217e-18	114100979	114100979
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-1.9612	3.64993754820217e-18	114100979	114100979	1.31454764006685e-13	114106460	114106460
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	127566573	5102	4915	-0.5007	1.31454764006685e-13	114106460	114106460	1.36391953272192e-08	127556450	127568592
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127568592	127599309	14	13	-0.9618	1.36391953272192e-08	127556450	127568592	9.02884599072365e-09	127592138	127612608
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127607438	132797428	1767	1696	-0.5204	9.02884599072365e-09	127592138	127612608	1.91800832700964e-07	132797428	132797428
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	-1.5589	1.91800832700964e-07	132797428	132797428	6.35734241318644e-06	132801463	132802775
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	902	-0.4661	6.35734241318644e-06	132801463	132802775	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	48561884	16556	15941	-0.5027	NA	NA	NA	0	48556470	48621072
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	48564809	63788958	3795	3665	0.0821	0	48556470	48621072	1.16345378721943e-261	63771921	63818622
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	63790201	66463477	1231	1199	0.409	1.16345378721943e-261	63771921	63818622	1.74016761007823e-32	66463477	66463477
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.244	1.74016761007823e-32	66463477	66463477	7.01743237653082e-39	66469412	66469412
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	66942078	198	192	0.3811	7.01743237653082e-39	66469412	66469412	1.90328167165316e-71	66930422	66954991
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66945699	106733851	13200	12704	0.726	1.90328167165316e-71	66930422	66954991	7.40160385760961e-283	106733851	106733851
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	-4.2256	7.40160385760961e-283	106733851	106733851	3.0900891253932e-314	106747920	106747920
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	113976883	2648	2554	0.7224	3.0900891253932e-314	106747920	106747920	1.01081867484355e-28	113976883	113976883
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113979934	113996548	5	5	-0.6265	1.01081867484355e-28	113976883	113976883	2.58646973481088e-07	113992975	114016954
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113999831	127892629	5063	4862	0.0494	2.58646973481088e-07	113992975	114016954	7.44132801078211e-08	127889011	127900546
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	127895094	127903261	6	6	0.6884	7.44132801078211e-08	127889011	127900546	1.76802371492390e-07	127897121	127909103
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	127904975	131264544	1273	1239	0.0698	1.7680237149239e-07	127897121	127909103	9.19335559473635e-238	131251568	131274943
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131267124	134105421	1223	1170	0.4052	9.19335559473635e-238	131251568	131274943	5.50452355593143e-12	134105421	134105421
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134109095	134111832	2	2	-0.9318	5.50452355593143e-12	134105421	134105421	1.49908201370955e-08	134111832	134111832
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134113671	134450318	98	96	0.374	1.49908201370955e-08	134111832	134111832	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3616	0.3668	NA	NA	NA	9.86830999049103e-22	9516067	9550789
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.1481	9.86830999049103e-22	9516067	9550789	3.12273812411478e-20	9578398	9604633
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11395862	651	618	0.3793	3.12273812411478e-20	9578398	9604633	8.41884113502083e-14	11393473	11395862
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-0.6132	8.41884113502083e-14	11393473	11395862	1.99585161520022e-17	11435643	11435643
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	20507273	3052	2940	0.4381	1.99585161520022e-17	11435643	11435643	0	20489757	20517404
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	20509093	78659582	19085	18343	0.0746	0	20489757	20517404	8.19963055601896e-22	78640753	78659582
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78663063	78676440	5	5	-0.5312	8.19963055601896e-22	78640753	78659582	0.00144785271998375	78668041	78683625
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78679297	78695726	9	9	-0.0089	0.00144785271998375	78668041	78683625	5.22878007006666e-15	78692550	78703796
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78697683	93887483	4259	4120	-0.4749	5.22878007006666e-15	78692550	78703796	2.19534938693266e-13	93884889	93887483
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	93889230	93897400	6	6	0.3295	2.19534938693266e-13	93884889	93887483	2.68858029511041e-12	93897400	93898892
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	93898892	130694393	13687	13150	-0.4696	2.68858029511041e-12	93897400	93898892	2.31745738077445e-11	130694393	130694393
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	0.8639	2.31745738077445e-11	130694393	130694393	5.34445962171808e-11	130701040	130701040
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	86	-0.5169	5.34445962171808e-11	130701040	130701040	2.93709097271593e-28	130943064	130943064
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.6249	2.93709097271593e-28	130943064	130943064	2.11964645446747e-23	130946248	130946248
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	526	-0.4222	2.11964645446747e-23	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	20964814	978	934	-0.1141	NA	NA	NA	0	20952096	20975121
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	20967285	35623951	5553	5338	-0.5186	0	20952096	20975121	2.88425483547047e-09	35620521	35626209
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	35626209	35637089	7	7	0.1238	2.88425483547047e-09	35620521	35626209	4.82342673995843e-09	35632899	35640795
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	35639076	37953582	800	770	-0.4946	4.82342673995843e-09	35632899	35640795	5.9462126434802e-95	37953582	37953582
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.156	5.9462126434802e-95	37953582	37953582	1.72771839986970e-97	37957844	37957844
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4680	-0.5307	1.7277183998697e-97	37957844	37957844	2.64191709471446e-42	49964838	49964838
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.9711	2.64191709471446e-42	49964838	49964838	1.03777218995847e-41	49971732	49971732
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	100690991	14859	14285	-0.485	1.03777218995847e-41	49971732	49971732	3.10280695676710e-170	100690991	100690991
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.4701	3.1028069567671e-170	100690991	100690991	3.53351962640027e-165	100693892	100693892
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4368	-0.5029	3.53351962640027e-165	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19478367	54	51	-0.2453	NA	NA	NA	7.3366660372099e-15	19457688	19497023
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19483933	21523818	995	968	0.0715	7.3366660372099e-15	19457688	19497023	7.33090806003383e-54	21503195	21538431
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21526238	22017734	246	237	0.3679	7.33090806003383e-54	21503195	21538431	0.00510166475035001	21995450	22022060
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22019726	22035729	8	7	0.018	0.00510166475035001	21995450	22022060	8.98898750998823e-07	22035729	22044438
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22038206	26093443	1462	1403	-0.49	8.98898750998823e-07	22035729	22044438	0	26091234	26097945
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	26094841	32454939	2010	1939	0.0738	0	26091234	26097945	1.3215827353231e-17	32425375	32464789
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	32457704	32518985	34	34	0.4712	1.3215827353231e-17	32425375	32464789	4.54104405328971e-20	32514082	32526255
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	32520302	34674458	941	908	0.0434	4.54104405328971e-20	32514082	32526255	7.16698001591068e-18	34674458	34674458
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.3762	7.16698001591068e-18	34674458	34674458	1.67927079837355e-16	34683810	34683810
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40680589	1896	1848	0.0888	1.67927079837355e-16	34683810	34683810	2.24370842572350e-254	40680589	40680589
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40687108	40726930	7	6	-3.4732	2.2437084257235e-254	40680589	40680589	2.16544854351577e-252	40726930	40726930
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	54892724	4178	4007	0.0609	2.16544854351577e-252	40726930	40726930	0	54890063	54903305
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	54895711	56339022	499	477	-0.521	0	54890063	54903305	1.29425648947844e-10	56333217	56339022
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	56340081	56352898	11	11	0.0042	1.29425648947844e-10	56333217	56339022	2.02250022782464e-09	56352898	56362957
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	56353993	60897609	1795	1724	-0.5206	2.02250022782464e-09	56352898	56362957	1.61114969302722e-32	60897609	60897609
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	60898943	60898943	1	0	NA	1.61114969302722e-32	60897609	60897609	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	60901636	60909492	4	4	-2.1106	NA	NA	NA	5.13733238312468e-35	60909492	60909492
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	60912874	72115423	4792	4613	-0.5236	5.13733238312468e-35	60909492	60909492	0	72111477	72121220
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72119162	105597555	12706	12176	0.0487	0	72111477	72121220	9.1265321919358e-275	105597555	105597555
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-2.6762	9.1265321919358e-275	105597555	105597555	4.6488068031885e-161	105632168	105632168
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106358491	231	221	0.1309	4.6488068031885e-161	105632168	105632168	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.1561	NA	NA	NA	4.05924614593066e-07	18450562	18741716
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20079935	150	145	-0.4926	4.05924614593066e-07	18450562	18741716	1.28664125817138e-130	20053008	20308014
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20088256	61250706	15480	14913	0.0356	1.28664125817138e-130	20053008	20308014	5.20197171076898e-09	61240402	61254837
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	61252391	61280370	17	17	0.4558	5.20197171076898e-09	61240402	61254837	2.76030947466361e-10	61278172	61287639
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	61282066	62099677	426	413	0.0342	2.76030947466361e-10	61278172	61287639	2.42114712799749e-08	62099677	62099677
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	62102290	62104777	2	2	-1.0703	2.42114712799749e-08	62099677	62099677	9.85486781320006e-07	62104777	62106001
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	62106001	74669752	5631	5422	0.0205	9.85486781320006e-07	62104777	62106001	2.78723390337492e-123	74669752	74671626
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.1737	2.78723390337492e-123	74669752	74671626	1.13608276386898e-116	74680338	74680439
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	77915192	1253	1201	0.0307	1.13608276386898e-116	74680338	74680439	2.05866431335169e-188	77902730	77924532
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	77916700	79071300	561	545	0.4236	2.05866431335169e-188	77902730	77924532	1.39878698244204e-223	79064911	79081181
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	79074508	85614382	2219	2125	0.0265	1.39878698244204e-223	79064911	79081181	3.5846379048306e-19	85614382	85614382
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	85634537	85671158	8	6	-0.9902	3.5846379048306e-19	85614382	85614382	1.20422831057105e-18	85671158	85678387
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	85678387	91450198	2404	2314	0.0281	1.20422831057105e-18	85671158	85678387	0	91434480	91472002
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	91453533	100217181	3157	3045	0.4384	0	91434480	91472002	4.30953063451142e-05	100208843	100217283
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	-0.1591	4.30953063451142e-05	100208843	100217283	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	729328	273	256	-0.4186	NA	NA	NA	1.04273685791971e-140	718810	741419
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	732200	14687636	5194	5016	0.0307	1.04273685791971e-140	718810	741419	5.53725550819536e-08	14669740	14687636
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14876356	15029941	15	14	-0.4302	5.53725550819536e-08	14669740	14687636	1.65143767507733e-08	15029941	15040558
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	23491821	2407	2321	0.0347	1.65143767507733e-08	15029941	15040558	2.15545001485693e-33	23480931	23504087
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23493301	23661168	81	80	0.4189	2.15545001485693e-33	23480931	23504087	3.00160253719915e-30	23648128	23677722
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23664469	23664469	1	0	NA	3.00160253719915e-30	23648128	23677722	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	23666764	31862577	2601	2504	0.0505	NA	NA	NA	7.9182568496808e-09	31803224	32535587
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33536526	44	44	-0.2213	7.9182568496808e-09	31803224	32535587	0.0053532055958449	33501907	33559207
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33538171	34054713	9	8	-0.627	0.0053532055958449	33501907	33559207	6.55773623183408e-08	33868686	34059589
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34056516	35004950	188	182	-0.0559	6.55773623183408e-08	33868686	34059589	5.32847989787254e-126	34994467	45067187
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45058242	54352394	2883	2767	-0.5179	5.32847989787254e-126	34994467	45067187	6.88029286528168e-35	54352394	54365385
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-1.5451	6.88029286528168e-35	54352394	54365385	0.00167815534265797	54366535	54390060
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54402057	4	4	0.101	0.00167815534265797	54366535	54390060	7.94075722331525e-05	54399890	54408446
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	55439853	394	384	-0.5519	7.94075722331525e-05	54399890	54408446	3.48068524134882e-18	55437248	55442100
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	55441361	55455774	20	20	0.0094	3.48068524134882e-18	55437248	55442100	2.52935042288908e-16	55453448	55458898
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	55456813	57203733	785	751	-0.4952	2.52935042288908e-16	55453448	55458898	1.59110734135440e-09	57201427	57203733
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	0.7142	1.5911073413544e-09	57201427	57203733	4.41171007204428e-09	57206772	57208375
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	70482674	4131	3991	-0.5121	4.41171007204428e-09	57206772	57208375	6.2577967630264e-25	70477889	70486255
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70486255	70531088	22	21	0.1038	6.2577967630264e-25	70477889	70486255	5.00439669741159e-28	70528703	70538064
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	70534361	75093957	1459	1394	-0.5173	5.00439669741159e-28	70528703	70538064	5.18611665720731e-48	75093957	75093957
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.6511	5.18611665720731e-48	75093957	75093957	3.20992047775034e-44	75100865	75100865
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76923844	609	586	-0.5597	3.20992047775034e-44	75100865	75100865	5.93132993803106e-18	76922411	76933534
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76925748	76925748	1	0	NA	5.93132993803106e-18	76922411	76933534	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76942679	9	9	-1.3567	NA	NA	NA	1.73469082553391e-18	76937156	76944661
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	88690571	4512	4344	-0.5121	1.73469082553391e-18	76937156	76944661	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	409	-0.5083	NA	NA	NA	7.98496692982536e-14	1028979	1028979
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.047	7.98496692982536e-14	1028979	1028979	3.86805956668644e-13	1030766	1030766
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	4363781	1519	1461	-0.5009	3.86805956668644e-13	1030766	1030766	2.20230798343312e-19	4356868	4367171
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4365653	4406750	18	18	0.1264	2.20230798343312e-19	4356868	4367171	8.26035227185797e-23	4399862	4411082
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4409871	21130611	6166	5925	-0.5206	8.26035227185797e-23	4399862	4411082	2.09325855263499e-08	21104982	21142297
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21132919	21192152	26	25	-0.8616	2.09325855263499e-08	21104982	21142297	1.07482049199580e-05	21179880	21211558
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21195590	21244934	21	21	-0.4167	1.0748204919958e-05	21179880	21211558	0.000102980680338947	21221645	21250646
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21247217	21342332	21	20	-0.8064	0.000102980680338947	21221645	21250646	1.04199938696575e-05	21318207	21386260
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21346618	21346618	1	0	NA	1.04199938696575e-05	21318207	21386260	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21349001	24454477	920	876	-0.5006	NA	NA	NA	1.82729355328881e-05	24442742	24460020
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24457574	24469944	9	9	-0.0543	1.82729355328881e-05	24442742	24460020	1.75240735921124e-105	24461913	24514945
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24471199	31443186	2914	2779	-0.3823	1.75240735921124e-105	24461913	24514945	3.77249200676031e-104	31419845	31468896
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31447686	31503774	22	22	-0.7021	3.77249200676031e-104	31419845	31468896	1.47561244568702e-14	31492553	31893451
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32910206	403	395	-0.231	1.47561244568702e-14	31492553	31893451	1.60732884512209e-12	32907657	32913131
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32911323	32911323	1	0	NA	1.60732884512209e-12	32907657	32913131	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32913131	32929028	10	10	0.4037	NA	NA	NA	4.39146515259997e-07	32924876	32937964
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32931168	36673853	1401	1343	-0.1078	4.39146515259997e-07	32924876	32937964	6.69639225794097e-52	36673853	36673853
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36680557	3	3	-2.5637	6.69639225794097e-52	36673853	36673853	1.72194373022314e-28	36680557	36680557
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36682031	36683509	2	2	-4.0236	1.72194373022314e-28	36680557	36680557	5.78263616489432e-86	36683509	36683509
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	40874079	1808	1736	-0.0039	5.78263616489432e-86	36683509	36683509	3.24410202744485e-25	40866844	41007660
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41031191	6	6	-0.7791	3.24410202744485e-25	40866844	41007660	1.00271644423367e-11	41026062	41062669
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41566540	219	210	0.0168	1.00271644423367e-11	41026062	41062669	1.80297343747522e-43	41562786	41570512
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	44	-0.5862	1.80297343747522e-43	41562786	41570512	2.04789527625990e-52	41704093	42143048
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	68326225	9412	9042	0.033	2.0478952762599e-52	41704093	42143048	3.43960062739931e-50	68326225	68326225
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68327352	68331629	3	3	-2.2834	3.43960062739931e-50	68326225	68326225	1.48101468983118e-42	68331629	68331629
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68335510	78653545	4264	4095	0.0437	1.48101468983118e-42	68331629	68331629	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	172	0.0841	NA	NA	NA	4.23156535932711e-18	500897	500897
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	1.649	4.23156535932711e-18	500897	500897	2.30080719134624e-17	505456	505456
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	34702218	10412	10032	0.0412	2.30080719134624e-17	505456	505456	1.10906700920899e-125	34638229	34729425
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	34714873	35593916	254	248	0.427	1.10906700920899e-125	34638229	34729425	0.058254780191051	35504303	35603335
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	35595959	35613688	5	5	0.0971	0.058254780191051	35504303	35603335	1.55360380153968e-08	35613688	35615963
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	35615963	36509250	134	131	-0.5359	1.55360380153968e-08	35613688	35615963	1.27503782542119e-30	36509250	36509250
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-2.3892	1.27503782542119e-30	36509250	36509250	3.76619923180557e-23	36519728	36519728
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	76116026	11980	11549	-0.5128	3.76619923180557e-23	36519728	36519728	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	239700	12	11	-0.5419	NA	NA	NA	1.39843896455954e-21	239700	239700
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	1.0637	1.39843896455954e-21	239700	239700	2.22788065591810e-15	243026	244260
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	425082	72	71	-0.4777	2.2278806559181e-15	243026	244260	5.21349060005689e-22	422624	429657
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	426614	478745	17	17	0.2281	5.21349060005689e-22	422624	429657	2.61122085449858e-16	470998	486336
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	483987	1398325	389	377	-0.4135	2.61122085449858e-16	470998	486336	1.17231966883397e-30	1398325	1398325
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.095	1.17231966883397e-30	1398325	1398325	4.26247000591446e-32	1400840	1400840
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	7419866	2826	2715	-0.48	4.26247000591446e-32	1400840	1400840	4.90725906112135e-05	7416910	7419866
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7421436	7425185	3	3	-1.3473	4.90725906112135e-05	7416910	7419866	9.91020790356918e-06	7425185	7427241
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7426168	11448975	1849	1784	-0.5044	9.91020790356918e-06	7425185	7427241	4.2917109184189e-16	11448975	11448975
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.1831	4.2917109184189e-16	11448975	11448975	1.34200977814835e-14	11452390	11452390
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	19694025	3853	3686	-0.4939	1.34200977814835e-14	11452390	11452390	6.18987353968726e-18	19694025	19694025
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-2.0062	6.18987353968726e-18	19694025	19694025	1.21065098923991e-15	19700620	19700620
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	22201559	648	635	-0.504	1.21065098923991e-15	19700620	19700620	0	22152560	22240270
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22206580	22206580	1	0	NA	0	22152560	22240270	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22236096	46783572	5759	5544	0.0244	NA	NA	NA	3.67674194114887e-12	46762323	46795185
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46786954	46882604	46	44	0.3471	3.67674194114887e-12	46762323	46795185	4.23942125381871e-14	46872626	46900853
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46884648	47776417	421	410	-0.0018	4.23942125381871e-14	46872626	46900853	2.49170148368509e-48	47773261	47784688
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	47778341	48437928	55	53	-0.583	2.49170148368509e-48	47773261	47784688	1.31078108922141e-52	48381822	48497883
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	48494496	55769042	3395	3265	0.0296	1.31078108922141e-52	48381822	48497883	7.91789778359543e-70	55769042	55769042
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55770195	55772729	2	2	-3.5784	7.91789778359543e-70	55769042	55769042	3.3606611761296e-78	55772729	55772729
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55776055	56823430	516	494	-0.0127	3.3606611761296e-78	55772729	55772729	4.54894947253845e-08	56816785	56823430
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.6	4.54894947253845e-08	56816785	56823430	9.02254140532062e-07	56840346	56846683
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	63788698	3178	3055	-0.0117	9.02254140532062e-07	56840346	56846683	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	569	-0.1989	NA	NA	NA	7.04264401824689e-94	1506379	1511632
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	1.6468	7.04264401824689e-94	1506379	1511632	3.67996016362571e-83	1531162	1532433
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	12095485	3690	3547	0.0228	3.67996016362571e-83	1531162	1532433	4.16027772315118e-57	12095485	12095485
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.2137	4.16027772315118e-57	12095485	12095485	1.03246265176430e-08	12113855	12127349
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	26148060	4747	4586	0.0207	1.0324626517643e-08	12113855	12127349	4.7242983933184e-20	26147112	26148060
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148764	26161111	9	9	-0.8172	4.7242983933184e-20	26147112	26148060	2.10272914199423e-19	26161111	26162094
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	44942757	6203	5969	0.0384	2.10272914199423e-19	26161111	26162094	1.91507348863165e-29	44927203	44954631
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	44945758	45076353	64	63	0.4368	1.91507348863165e-29	44927203	44954631	1.55985341922359e-33	45067241	45085097
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	45077793	52080395	2530	2436	0.0247	1.55985341922359e-33	45067241	45085097	1.07108332733839e-07	52076473	52081719
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.6835	1.07108332733839e-07	52076473	52081719	8.29059169654185e-39	52089160	52094361
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3589	0.0445	8.29059169654185e-39	52089160	52094361	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9888812	3	3	-0.0901	NA	NA	NA	0.0074772651943679	9888812	10013263
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9905318	10152384	16	15	-0.6376	0.0074772651943679	9888812	10013263	3.28916909977930e-11	10144881	10167413
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10154777	13696483	18	15	0.0302	3.2891690997793e-11	10144881	10167413	0.0162433538044435	13676572	13876293
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13699520	13992109	26	26	-0.2522	0.0162433538044435	13676572	13876293	9.8120853196778e-11	13876293	14294338
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14047236	21390082	2535	2435	0.0945	9.8120853196778e-11	13876293	14294338	1.07075999890034e-09	21390082	21390082
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	21392114	21393351	2	2	1.3174	1.07075999890034e-09	21390082	21390082	7.88072420573463e-22	21393351	21394817
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	21394817	46922972	10841	10430	0.0319	7.88072420573463e-22	21393351	21394817	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	16521073	405	391	-0.4717	NA	NA	NA	2.16086781212677e-11	16521073	16521073
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-1.868	2.16086781212677e-11	16521073	16521073	6.08711109992835e-10	16524408	16524408
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	21571489	2113	2043	-0.4885	6.08711109992835e-10	16524408	16524408	1.35012445822030e-06	21568861	21571489
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	0.3266	1.3501244582203e-06	21568861	21571489	1.35592734230961e-05	21576859	21580865
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	447	-0.4891	1.35592734230961e-05	21576859	21580865	2.05824646444351e-90	22667608	22682428
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22704683	11	11	-2.5125	2.05824646444351e-90	22667608	22682428	0.000226567585333216	22696162	22708012
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22706166	22721042	10	9	-4.7201	0.000226567585333216	22696162	22708012	0	22720195	22721042
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22725305	24074708	630	614	-0.5346	0	22720195	22721042	7.33551878859237e-09	24053870	24082742
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24075755	24136917	26	26	-0.1881	7.33551878859237e-09	24053870	24082742	1.22882025540461e-09	24129523	24162764
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	24146258	35472378	5892	5658	-0.5372	1.22882025540461e-09	24129523	24162764	1.67851791054514e-73	35472378	35472378
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.9112	1.67851791054514e-73	35472378	35472378	2.01753384567475e-64	35476942	35476942
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6723	-0.5141	2.01753384567475e-64	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	28	-0.2652	NA	NA	NA	1.37104898501134e-06	122211	127113
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-1.6597	1.37104898501134e-06	122211	127113	1.64195612636421e-09	129544	132689
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	164913	24	24	-0.3705	1.64195612636421e-09	129544	132689	0.00241718362694411	159609	207612
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	164985	210518	11	11	0.156	0.00241718362694411	159609	207612	4.67948406717392e-09	206524	213885
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	211285	950827	574	552	-0.5019	4.67948406717392e-09	206524	213885	1.62398355624987e-37	939944	1133377
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	953270	1427392	144	140	-0.0945	1.62398355624987e-37	939944	1133377	8.52378743333502e-12	1418334	1437132
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1521019	61	58	-0.4844	8.52378743333502e-12	1418334	1437132	8.4416721890665e-06	1513947	1526804
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1522369	1530474	10	10	-1.1393	8.4416721890665e-06	1513947	1526804	1.75781327211796e-06	1528282	1534998
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	1969292	335	318	-0.5373	1.75781327211796e-06	1528282	1534998	4.5626011970769e-50	1965386	1977201
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1972620	2285992	191	185	-0.0784	4.5626011970769e-50	1965386	1977201	8.01245572712865e-07	2282826	2290704
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2288284	2301365	15	15	-0.5618	8.01245572712865e-07	2282826	2290704	3.30846626445637e-09	2300485	2302065
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2304398	5	5	0.4706	3.30846626445637e-09	2300485	2302065	3.77236597886718e-08	2304008	2307282
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2373235	73	66	-0.5131	3.77236597886718e-08	2304008	2307282	4.75575935098714e-11	2367351	2376763
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2374031	2418980	54	53	-0.9572	4.75575935098714e-11	2367351	2376763	7.98925411988855e-19	2414151	2422411
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2419541	2638587	195	185	-0.5207	7.98925411988855e-19	2414151	2422411	7.88287258615538e-21	2634031	2642145
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2640451	2672401	40	40	-0.0112	7.88287258615538e-21	2634031	2642145	7.49362546037909e-07	2668419	2676476
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	26	-0.4367	7.49362546037909e-07	2668419	2676476	4.50350075443143e-36	2708113	2712641
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	3645713	384	361	0.4681	4.50350075443143e-36	2708113	2712641	4.04756002973983e-08	3634059	3649391
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3647804	3963735	14	13	1.0747	4.04756002973983e-08	3634059	3649391	2.65494693541993e-10	3683476	3972456
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3968442	20362778	6544	6280	0.5596	2.65494693541993e-10	3683476	3972456	2.43277056449308e-11	20353837	20362778
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	20365884	20380856	8	8	1.2461	2.43277056449308e-11	20353837	20362778	1.10615621237824e-10	20380856	20385177
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	20382578	33281341	4922	4723	0.5912	1.10615621237824e-10	20380856	20385177	0	33268799	33300041
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33291697	111776974	19883	19171	1.1227	0	33268799	33300041	1.71304343043150e-18	111776974	111776974
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111778323	111779952	2	2	-0.4241	1.7130434304315e-18	111776974	111776974	9.38269747920012e-15	111779952	111779952
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111780974	118506933	2109	2029	1.1485	9.38269747920012e-15	111779952	111779952	0	118490928	118533679
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	118510308	131371833	3729	3591	1.5123	0	118490928	118533679	0	131352093	131400380
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	131373613	146087729	4499	4338	1.7837	0	131352093	131400380	4.00680104564159e-15	146087729	146087729
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146095685	146095707	2	2	0.0218	4.00680104564159e-15	146087729	146087729	1.12544184142603e-10	146095707	146099525
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146098710	146098710	1	0	NA	1.12544184142603e-10	146095707	146099525	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146099525	154582414	3037	2919	1.7556	NA	NA	NA	0	154578922	154586690
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154880306	192	183	0.6366	0	154578922	154586690	1.17199892502195e-07	154879183	154881198
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154881198	154888224	9	7	-0.2457	1.17199892502195e-07	154879183	154881198	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	120	-3.8476	NA	NA	NA	5.85241306197122e-28	3219200	3773948
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	5.85241306197122e-28	3219200	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.5905	NA	NA	NA	1.80713854806165e-19	5422507	6652845
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	112	-3.6584	1.80713854806165e-19	5422507	6652845	5.68568311989924e-06	6916241	7016002
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7653082	216	210	-2.8316	5.68568311989924e-06	6916241	7016002	0.000445144577225554	7578636	7664085
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7709619	35	34	-3.9246	0.000445144577225554	7578636	7664085	4.49843761951965e-05	7694197	7749796
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8010446	89	87	-2.8129	4.49843761951965e-05	7694197	7749796	1.90118728410018e-07	7930528	8059682
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8289709	63	59	-3.897	1.90118728410018e-07	7930528	8059682	3.15612215901902e-08	8251785	8292347
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8324291	12	11	-2.0545	3.15612215901902e-08	8251785	8292347	1.96162814958363e-05	8316416	8341218
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324328	10515697	293	275	-3.6827	1.96162814958363e-05	8316416	8341218	7.02354856104585e-21	10512616	10537808
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	16	-1.0044	7.02354856104585e-21	10512616	10537808	1.02893190169414e-08	10655750	12452734
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	11698871	1	0	NA	1.02893190169414e-08	10655750	12452734	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12541506	12	11	-3.5837	NA	NA	NA	0.000529000289112132	12533900	12563030
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	54	-2.0624	0.000529000289112132	12533900	12563030	2.53436850683586e-07	12649357	12715696
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-3.7233	2.53436850683586e-07	12649357	12715696	1.31913784793763e-08	12792780	12855363
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12839975	1	0	NA	1.31913784793763e-08	12792780	12855363	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12843307	13040293	76	74	-2.1255	NA	NA	NA	0.00112787955532825	13021620	13045641
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13061201	10	10	-3.5005	0.00112787955532825	13021620	13045641	3.81597115200688e-06	13058512	13078432
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13062151	13062151	1	0	NA	3.81597115200688e-06	13058512	13078432	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13066543	13128515	24	22	-1.7839	NA	NA	NA	1.57249611433175e-06	13111594	13140274
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13301627	57	55	-3.0821	1.57249611433175e-06	13111594	13140274	2.29162408256579e-05	13240240	13347152
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13309879	13633041	150	141	-3.8242	2.29162408256579e-05	13240240	13347152	3.3484268001895e-05	13591921	13691319
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13644667	13705594	12	11	-2.3674	3.3484268001895e-05	13591921	13691319	1.59714996071743e-07	13691319	13718946
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	14342834	190	182	-3.9475	1.59714996071743e-07	13691319	13718946	1.80216973230585e-10	14322984	14382361
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	93	-3.1014	1.80216973230585e-10	14322984	14382361	1.15553348859593e-07	14500820	14524829
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	1.15553348859593e-07	14500820	14524829	NA	NA	NA
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	11	-0.9974	NA	NA	NA	3.19920236987036e-10	14547168	14547168
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14554415	4	4	-3.7214	3.19920236987036e-10	14547168	14547168	3.78241731281775e-08	14554415	14557473
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14555872	14579298	9	9	-1.474	3.78241731281775e-08	14554415	14557473	1.74765743848187e-05	14572190	14598838
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15915466	417	401	-3.5396	1.74765743848187e-05	14572190	14598838	0.00167856337239382	15690301	15987432
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16042966	49	48	-2.7752	0.00167856337239382	15690301	15987432	1.75429983316098e-06	16004746	16093439
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	21036411	783	752	-3.6993	1.75429983316098e-06	16004746	16093439	1.81196651514721e-05	21026715	21036411
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-1.5459	1.81196651514721e-05	21026715	21036411	9.46052169474966e-07	21054519	21060047
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21691199	165	159	-3.8066	9.46052169474966e-07	21054519	21060047	0.000259414201483892	21672600	21692175
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21692175	21761022	11	10	-2.2954	0.000259414201483892	21672600	21692175	7.54536147196024e-06	21755980	21787090
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21763911	22157319	86	83	-3.8154	7.54536147196024e-06	21755980	21787090	9.95377400206175e-06	22055660	22165808
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-2.1146	9.95377400206175e-06	22055660	22165808	0.000700850434509335	22171771	22178964
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-3.7414	0.000700850434509335	22171771	22178964	0.0104088180371235	22181855	22208351
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22252795	21	21	-4.754	0.0104088180371235	22181855	22208351	2.24880842945232e-05	22244581	22387293
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22261337	22930737	67	62	-3.7376	2.24880842945232e-05	22244581	22387293	4.91096301467916e-40	22926726	26870361
MSK_252152912779_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	80	-1.3669	4.91096301467916e-40	22926726	26870361	NA	NA	NA
