Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	27673382	10200	9918	-0.248	NA	NA	NA	5.6477648787868e-11	27669893	27673382
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27676247	27679250	2	2	0.8387	5.6477648787868e-11	27669893	27673382	7.71713520662296e-12	27679250	27679250
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27681631	38833248	4166	4061	-0.2515	7.71713520662296e-12	27679250	27679250	0	38795497	38864742
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	38839799	51356475	5086	4941	0.0694	0	38795497	38864742	2.49631953589823e-15	51356475	51356475
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	51357642	51358801	2	2	1.2843	2.49631953589823e-15	51356475	51356475	3.01094554922012e-15	51358801	51358801
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	51359919	72537426	8438	8188	0.0547	3.01094554922012e-15	51358801	51358801	0	72537426	72537426
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-4.3628	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	84654748	3566	3468	0.0535	0	72579311	72579311	0	84646781	84666748
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	84658554	94060783	3424	3336	-0.2718	0	84646781	84666748	4.61317701407488e-14	94060783	94060783
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-1.5043	4.61317701407488e-14	94060783	94060783	6.7829127808834e-15	94062928	94062928
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	103904723	3113	3017	-0.2806	6.7829127808834e-15	94062928	94062928	2.60089398885849e-16	103898005	103906464
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103962495	15	15	0.1852	2.60089398885849e-16	103898005	103906464	6.89246576434757e-16	103956767	104109172
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	110023268	1583	1553	-0.2801	6.89246576434757e-16	103956767	104109172	2.02522481535272e-11	110023268	110023268
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-1.164	2.02522481535272e-11	110023268	110023268	1.91540938040769e-12	110039388	110041712
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	117600213	2847	2766	-0.2722	1.91540938040769e-12	110039388	110041712	0	117590783	117616518
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	117605175	146294654	1707	1661	0.0423	0	117590783	117616518	1.49455519309675e-35	146286735	147306304
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	146297175	148081741	41	39	-0.3581	1.49455519309675e-35	146286735	147306304	2.75562174200113e-39	147510532	148084402
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148081769	150823073	1256	1217	0.0805	2.75562174200113e-39	147510532	148084402	6.9328044053854e-14	150823073	150823073
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	4	-0.7266	6.9328044053854e-14	150823073	150823073	3.85075472255879e-13	150851439	150852858
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	167483267	6871	6693	0.065	3.85075472255879e-13	150851439	150852858	3.97660296880149e-11	167477428	167493768
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167523140	10	10	0.5278	3.97660296880149e-11	167477428	167493768	7.4608758874382e-11	167520743	167530480
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167525669	185979586	7207	7001	0.0612	7.4608758874382e-11	167520743	167530480	4.84582523726841e-11	185973975	185979586
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.1123	4.84582523726841e-11	185973975	185979586	3.15630370663576e-11	185988138	185988138
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	195009358	1970	1905	0.0496	3.15630370663576e-11	185988138	185988138	4.11723198337935e-12	194976022	195014129
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195091758	9	9	-0.4721	4.11723198337935e-12	194976022	195014129	2.32163571719415e-12	195048208	195097118
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195095156	200600795	2158	2102	0.0728	2.32163571719415e-12	195048208	195097118	7.41266672976948e-13	200587846	200634858
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200602881	200803726	41	39	-0.1975	7.41266672976948e-13	200587846	200634858	3.37124359058522e-14	200678532	200813827
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	237722355	13617	13208	0.0698	3.37124359058522e-14	200678532	200813827	2.34554984632947e-15	237722355	237722355
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	237726884	237729095	2	2	-1.1514	2.34554984632947e-15	237722355	237722355	2.81344473030487e-14	237729095	237729095
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	237737483	246429285	3559	3455	0.0462	2.81344473030487e-14	237729095	237729095	3.71919001322746e-16	246383544	246469461
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246430621	246674083	85	83	0.2468	3.71919001322746e-16	246383544	246469461	0.0211285928397621	246618953	246751473
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246676851	246769018	17	16	0.4886	0.0211285928397621	246618953	246751473	2.31248918443468e-33	246769018	246794552
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	27	-4.506	2.31248918443468e-33	246769018	246794552	1.16258423375093e-157	246858820	246862029
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	96	0.0354	1.16258423375093e-157	246858820	246862029	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	34543992	11522	11160	0.0469	NA	NA	NA	0	34543992	34543992
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34556434	4	4	-4.1006	0	34543992	34543992	0.000980116491532385	34556434	34570148
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34558824	34574224	8	8	-5.4574	0.000980116491532385	34556434	34570148	1.49465394245943e-06	34574224	34574224
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34575366	34589997	6	6	-3.3812	1.49465394245943e-06	34574224	34574224	0	34589997	34589997
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37789939	1364	1334	0.0538	0	34589997	34589997	2.27353425720512e-61	37787637	37800512
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37792669	37855837	27	27	-0.6408	2.27353425720512e-61	37787637	37800512	3.07285345426623e-69	37848754	37858379
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	40797424	1347	1318	0.0671	3.07285345426623e-69	37848754	37858379	5.05693662472411e-10	40795823	40797424
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40798586	40800199	2	2	1.0483	5.05693662472411e-10	40795823	40797424	4.53776229807877e-11	40800199	40801749
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40801749	52600588	4452	4313	0.0582	4.53776229807877e-11	40800199	40801749	7.1832076690754e-12	52588009	52600588
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.74	7.1832076690754e-12	52588009	52600588	4.86432175416332e-12	52635695	52639605
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	112749123	16604	16127	0.0535	4.86432175416332e-12	52635695	52639605	7.63308266541177e-11	112747508	112752277
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112750646	112764889	5	5	0.7077	7.63308266541177e-11	112747508	112752277	1.28321778986921e-10	112761950	112768403
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112768403	179767214	20936	20364	0.0476	1.28321778986921e-10	112761950	112768403	1.88781166221705e-18	179767214	179767214
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	1.1517	1.88781166221705e-18	179767214	179767214	1.77695574365787e-18	179778919	179778919
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	218970587	13138	12779	0.0551	1.77695574365787e-18	179778919	179778919	4.18487992715374e-17	218970587	218970587
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218971708	218972428	2	2	1.3491	4.18487992715374e-17	218970587	218970587	9.7550998034099e-18	218972428	218972428
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218975318	222991399	1268	1230	0.0519	9.7550998034099e-18	218972428	218972428	7.62386864211177e-10	222991399	222991399
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	222993145	222998011	3	2	-0.9241	7.62386864211177e-10	222991399	222991399	1.18717346831184e-09	222998011	222998011
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	222999386	227949124	1584	1540	0.0403	1.18717346831184e-09	222998011	222998011	8.55402931668491e-10	227943049	227952131
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227950459	227973265	10	10	0.4755	8.55402931668491e-10	227943049	227952131	1.82094645080979e-09	227967126	227986221
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	227976902	238039750	3766	3670	0.0473	1.82094645080979e-09	227967126	227986221	1.90283717720163e-11	238039750	238042736
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238042736	238048272	3	3	0.9058	1.90283717720163e-11	238039750	238042736	2.97972829442435e-10	238044703	238048272
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238052566	242689978	1768	1706	0.0465	2.97972829442435e-10	238044703	238048272	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	34282340	11577	11253	-0.2785	NA	NA	NA	0	34255517	34301395
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	34291262	37953375	1104	1068	0.0639	0	34255517	34301395	9.84896024026803e-15	37951628	37955930
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.6226	9.84896024026803e-15	37951628	37955930	1.3606708368942e-14	37958685	37963014
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	46769081	3238	3141	0.0599	1.3606708368942e-14	37958685	37963014	2.89127058885157e-29	46769081	46769081
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.7678	2.89127058885157e-29	46769081	46769081	3.94371274112059e-25	46825048	46827727
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	47460892	285	275	0.0792	3.94371274112059e-25	46825048	46827727	9.4712757371610e-170	47460892	47460892
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.2806	9.471275737161e-170	47460892	47460892	9.32146423240793e-188	47466921	47466921
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	53001678	2442	2344	0.0903	9.32146423240793e-188	47466921	47466921	6.13381064674722e-20	53001678	53001678
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.8229	6.13381064674722e-20	53001678	53001678	2.50648978719421e-19	53011885	53011885
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	89475107	11974	11650	0.0474	2.50648978719421e-19	53011885	53011885	2.13913461460983e-77	89475107	89475107
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	13	-1.0178	2.13913461460983e-77	89475107	89475107	4.34776928812916e-76	89500935	89500935
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	116137442	6578	6423	0.0548	4.34776928812916e-76	89500935	89500935	6.99901841613908e-13	116137442	116137442
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116140997	116143347	3	3	-0.8822	6.99901841613908e-13	116137442	116137442	7.76211107637127e-13	116143347	116143347
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	116146946	129861428	5166	5026	0.0537	7.76211107637127e-13	116143347	116143347	1.46461146235474e-62	129861428	129861428
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129867158	129887890	8	8	1.2951	1.46461146235474e-62	129861428	129861428	2.22873758273827e-64	129887890	129887890
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129899070	129899070	1	0	NA	2.22873758273827e-64	129887890	129887890	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	129902698	133939851	1597	1561	0.0647	NA	NA	NA	0	133921104	133957127
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133942039	150748947	5214	5067	0.3256	0	133921104	133957127	9.1626773656189e-60	150748947	150748947
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150751433	150752600	2	2	-2.0572	9.1626773656189e-60	150748947	150748947	8.33847631421273e-39	150752600	150752600
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	150753766	151481767	251	246	0.3399	8.33847631421273e-39	150752600	150752600	7.2083795403779e-102	151444393	151518794
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	151486514	163992903	4014	3910	0.0555	7.2083795403779e-102	151444393	151518794	0	163992903	163992903
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	-4.8254	0	163992903	163992903	9.6026852208228e-24	164005577	164005577
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	3	-0.7028	9.6026852208228e-24	164005577	164005577	3.95195671510192e-22	164027724	164027724
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	-5.1508	3.95195671510192e-22	164027724	164027724	0	164107951	164107951
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	190550918	8856	8629	0.0544	0	164107951	164107951	0	190532527	190588221
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190554471	196905767	2279	2224	0.3206	0	190532527	190588221	7.93934312489696e-22	196835413	196907040
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196907040	196942158	20	19	-0.1513	7.93934312489696e-22	196835413	196907040	3.78724833378402e-20	196940125	196945209
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196943380	199329592	961	937	0.3392	3.78724833378402e-20	196940125	196945209	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	682752	214	209	0.0075	NA	NA	NA	7.15711913451691e-14	682752	682752
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	685953	685953	1	0	NA	7.15711913451691e-14	682752	682752	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	1.1995	NA	NA	NA	5.03784799905367e-13	691065	691065
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	9800777	3175	3083	0.0625	5.03784799905367e-13	691065	691065	0	9800777	9800777
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9815760	9815760	1	0	NA	0	9800777	9800777	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.7112	NA	NA	NA	0	9842644	9842644
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	9853710	1	0	NA	0	9842644	9842644	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9861329	14306920	1002	980	0.0294	NA	NA	NA	0	14301272	14314283
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	14310006	20530602	1920	1863	-0.2941	0	14301272	14314283	2.81066196720382e-12	20530602	20530602
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20532031	20533486	2	2	0.8091	2.81066196720382e-12	20530602	20530602	7.08829611706895e-12	20533486	20534892
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20534892	34445002	3242	3150	-0.2832	7.08829611706895e-12	20533486	20534892	1.32714582964825e-35	34445002	34445002
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	5	-1.4609	1.32714582964825e-35	34445002	34445002	4.9166135870183e-36	34491115	34491115
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	42653280	2830	2765	-0.2749	4.9166135870183e-36	34491115	34491115	4.32755619179301e-13	42653280	42653280
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	42657343	42658748	2	2	-1.4215	4.32755619179301e-13	42653280	42653280	3.14982277896203e-13	42658748	42658748
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	42659948	47755849	1438	1398	-0.2974	3.14982277896203e-13	42658748	42658748	2.13562756258901e-12	47755849	47755849
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	47761088	47761125	2	2	0.7897	2.13562756258901e-12	47755849	47755849	7.71084806245115e-11	47761125	47761125
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	47762581	93785591	12922	12560	-0.2782	7.71084806245115e-11	47761125	47761125	2.6651660542593e-12	93785591	93785591
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	93787564	93788953	2	2	-1.4116	2.6651660542593e-12	93785591	93785591	1.06174720119388e-12	93788953	93788953
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	93793550	95516489	676	651	-0.2678	1.06174720119388e-12	93788953	93788953	4.14044151398682e-10	95504131	95516489
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	95531240	95556931	6	5	0.3798	4.14044151398682e-10	95504131	95516489	2.09779293420349e-10	95556931	95569494
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	95561850	108222370	3953	3847	-0.2798	2.09779293420349e-10	95556931	95569494	3.02110302643927e-13	108219330	108222370
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108226468	108238222	5	5	0.4601	3.02110302643927e-13	108219330	108222370	2.15612382854317e-18	108238222	108238222
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108244711	108367366	44	44	-0.2909	2.15612382854317e-18	108238222	108238222	8.05460571580635e-43	108367366	108367366
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108374099	108381089	3	3	-1.7794	8.05460571580635e-43	108367366	108367366	1.84667555342062e-34	108381089	108381089
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108385219	133725058	6750	6575	-0.2823	1.84667555342062e-34	108381089	108381089	0	133688654	133753862
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	133731961	154077361	5905	5739	0.0589	0	133688654	133753862	2.03308512890788e-34	154060940	154086943
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	154078814	154300703	68	66	0.3746	2.03308512890788e-34	154060940	154086943	7.69677391268399e-36	154292266	154313588
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	154303470	154303470	1	0	NA	7.69677391268399e-36	154292266	154313588	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	154307540	191153613	10984	10660	0.0529	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	213	0.5288	NA	NA	NA	1.11983685757952e-13	730853	737829
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	1.2499	1.11983685757952e-13	730853	737829	4.16752806250432e-14	829954	870657
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	1432463	200	195	0.5352	4.16752806250432e-14	829954	870657	1.81804437007518e-63	1400566	1450114
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1434364	17395391	5038	4888	0.2901	1.81804437007518e-63	1400566	1450114	1.22419926097975e-16	17394016	17397258
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17397258	17409796	8	6	-0.3439	1.22419926097975e-16	17394016	17397258	1.00630254607600e-12	17408371	17411379
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	17411379	38678321	5560	5398	0.3101	1.006302546076e-12	17408371	17411379	0	38652325	38712075
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	38680268	56579735	4169	4057	0.0468	0	38652325	38712075	3.25138462901683e-13	56579735	56579735
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56580969	56582581	2	2	1.186	3.25138462901683e-13	56579735	56579735	3.2880838192013e-13	56582581	56582581
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56584732	65580477	2834	2767	0.0515	3.2880838192013e-13	56582581	56582581	0	65574357	65597664
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	65582325	72774052	1662	1619	-0.2759	0	65574357	65597664	1.35255223599416e-18	72768032	72784365
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	72777815	72839031	28	27	0.1176	1.35255223599416e-18	72768032	72784365	2.49408090609496e-22	72833862	72845576
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	72841417	112573542	11615	11272	-0.2816	2.49408090609496e-22	72833862	72845576	0	112564462	112581143
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	112576114	140201609	8735	8503	0.0443	0	112564462	112581143	0	140201609	140201609
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	7	-5.7784	0	140201609	140201609	0	140216524	140216524
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	150181399	3767	3649	0.0309	0	140216524	140216524	0	150181399	150181399
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150185190	150185190	1	0	NA	0	150181399	150181399	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150191322	150202601	6	6	-3.5355	NA	NA	NA	0	150202601	150202601
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150204134	176252880	8245	8012	0.0322	0	150202601	150202601	3.29744864181351e-19	176252880	176252880
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176254291	176256523	2	2	1.3944	3.29744864181351e-19	176252880	176252880	1.09561431445355e-17	176256523	176256523
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176257850	180194323	1537	1494	0.0659	1.09561431445355e-17	176256523	176256523	2.86034974487141e-09	180187846	180346557
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180362342	10	10	-0.3712	2.86034974487141e-09	180187846	180346557	2.28358435899363e-07	180355807	180365977
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	110	0.0352	2.28358435899363e-07	180355807	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	26226269	9109	8865	0.0363	NA	NA	NA	8.34946766670218e-22	26218969	26232334
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26229233	26294211	36	36	-0.301	8.34946766670218e-22	26218969	26232334	8.51200618199659e-23	26290901	26300821
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26296283	26771324	215	207	0.0502	8.51200618199659e-23	26290901	26300821	6.53746104965466e-114	26766837	26797255
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26774582	29950805	1227	1192	-0.2884	6.53746104965466e-114	26766837	26797255	7.70874583394796e-82	29950805	29962849
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30010234	15	15	-1.2943	7.70874583394796e-82	29950805	29962849	4.66231554396440e-71	30005338	30010234
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31382291	578	560	-0.2634	4.6623155439644e-71	30005338	30010234	2.18792117792902e-24	31382291	31382291
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31385778	2	2	-1.8812	2.18792117792902e-24	31382291	31382291	7.41731366888855e-26	31385778	31385778
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	32548736	494	482	-0.2433	7.41731366888855e-26	31385778	31385778	2.35963172356647e-38	32543054	32588005
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32633691	18	17	0.4931	2.35963172356647e-38	32543054	32588005	5.82634607331181e-09	32626619	32634977
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	27	-0.2052	5.82634607331181e-09	32626619	32634977	0.000367598743515234	32707427	32723366
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	0.3413	0.000367598743515234	32707427	32723366	2.20059255443324e-12	32720656	32731072
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35906197	1367	1330	-0.2546	2.20059255443324e-12	32720656	32731072	0	35889353	35914002
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35908741	65767409	9293	9023	0.025	0	35889353	35914002	1.81252770090190e-16	65767409	65767409
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.22	1.8125277009019e-16	65767409	65767409	2.77755347834306e-17	65771532	65771532
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	72919733	2135	2061	0.0453	2.77755347834306e-17	65771532	65771532	3.7897626317916e-15	72919733	72919733
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-0.925	3.7897626317916e-15	72919733	72919733	2.13540575939396e-15	72924440	72924440
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	79018959	1894	1840	0.0604	2.13540575939396e-15	72924440	72924440	1.15986748867141e-14	79011979	79024557
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	0.5233	1.15986748867141e-14	79011979	79024557	1.35408214643380e-14	79085247	79101978
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	96432775	4573	4425	0.0519	1.3540821464338e-14	79085247	79101978	3.50814896414576e-223	96371180	96467803
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	96439480	98606107	715	695	0.3164	3.50814896414576e-223	96371180	96467803	1.13468165220064e-174	98558900	98683896
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	98610845	98610845	1	0	NA	1.13468165220064e-174	98558900	98683896	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	98620153	103841482	1473	1435	0.0485	NA	NA	NA	3.49054078205346e-27	103841482	103841482
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.2202	3.49054078205346e-27	103841482	103841482	2.80776700764082e-27	103868154	103868154
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	112394531	3081	3006	0.0658	2.80776700764082e-27	103868154	103868154	0	112370637	112432540
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	112405624	155159371	14543	14116	-0.2774	0	112370637	112432540	4.19905567462590e-30	155159371	155159371
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155160734	155163895	3	3	-1.6825	4.1990556746259e-30	155159371	155159371	2.97532462921772e-29	155163895	155163895
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	155165959	170753106	5287	5121	-0.2846	2.97532462921772e-29	155163895	155163895	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	26400538	8919	8669	0.0538	NA	NA	NA	2.78323366984959e-22	26400538	26400538
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26403038	26404540	2	2	1.5426	2.78323366984959e-22	26400538	26400538	5.89922703795563e-24	26404540	26404540
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26406021	33252234	2846	2770	0.0465	5.89922703795563e-24	26404540	26404540	9.69399650204253e-10	33247134	33255702
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	33253918	33272440	12	12	-0.3496	9.69399650204253e-10	33247134	33255702	1.49221558045105e-09	33268600	33280480
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	33275374	48551463	5285	5146	0.0473	1.49221558045105e-09	33268600	33280480	2.75363606061819e-19	48549993	48551463
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48554059	48562631	7	7	-0.6794	2.75363606061819e-19	48549993	48551463	1.22864082953369e-18	48562631	48572106
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48572106	86771217	9069	8814	0.0557	1.22864082953369e-18	48562631	48572106	1.21473482577116e-18	86771217	86771217
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86777920	86785324	4	4	-0.9169	1.21473482577116e-18	86771217	86771217	1.39959828549319e-19	86785324	86785324
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	86789967	100164752	4918	4803	0.0613	1.39959828549319e-19	86785324	86785324	4.08349235263073e-11	100162851	100164752
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.684	4.08349235263073e-11	100162851	100164752	1.51366242030264e-10	100174991	100178968
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	125831554	11372	11049	0.0577	1.51366242030264e-10	100174991	100178968	2.61390985870254e-223	125831554	125831554
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.7539	2.61390985870254e-223	125831554	125831554	6.04704245265168e-229	125837524	125837524
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3544	0.0624	6.04704245265168e-229	125837524	125837524	1.1988483536236e-28	133432281	133433384
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.8986	1.1988483536236e-28	133432281	133433384	1.02815687904038e-27	133448277	133448277
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	133529541	44	42	0.0385	1.02815687904038e-27	133448277	133448277	1.94085314996182e-20	133522718	133539765
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133531534	141410894	3656	3568	-0.27	1.94085314996182e-20	133522718	133539765	4.29995125936829e-14	141408013	141417702
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141438504	13	11	0.2316	4.29995125936829e-14	141408013	141417702	1.12224204622299e-12	141434131	141442231
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	147702365	2639	2568	-0.2848	1.12224204622299e-12	141434131	141442231	8.67498641601072e-23	147702365	147702365
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.8987	8.67498641601072e-23	147702365	147702365	7.50754164607893e-26	147707161	147707161
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158811268	4236	4127	-0.2834	7.50754164607893e-26	147707161	147707161	5.1597318247584e-05	158733294	158811268
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158815157	158821263	2	2	0.1768	5.1597318247584e-05	158733294	158811268	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	7156900	2392	2327	-0.3172	NA	NA	NA	4.53296409712337e-24	6926661	7226901
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	8	-1.0897	4.53296409712337e-24	6926661	7226901	7.61586384400108e-27	7790934	7824059
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	36888926	9864	9610	-0.2851	7.61586384400108e-27	7790934	7824059	0	36884351	36893303
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	36890092	39350798	809	781	0.0756	0	36884351	36893303	6.10469003375794e-182	39345557	39352361
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.8699	6.10469003375794e-182	39345557	39352361	1.21505383210136e-188	39504332	39508035
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	50920695	2070	2012	0.0598	1.21505383210136e-188	39504332	39508035	0	50828174	50975853
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	50929121	116959089	19961	19391	0.2954	0	50828174	50975853	0	116894832	117018006
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	116969946	144968840	8949	8703	0.5328	0	116894832	117018006	2.8839850627542e-26	144968840	144968840
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	2.1632	2.8839850627542e-26	144968840	144968840	4.58605429994594e-19	144970777	144970777
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	435	0.5383	4.58605429994594e-19	144970777	144970777	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23343915	8000	7765	0.0402	NA	NA	NA	2.69260507675495e-20	23343915	23343915
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	1.1657	2.69260507675495e-20	23343915	23343915	1.79636137139018e-19	23365926	23365926
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39088753	4725	4579	0.0528	1.79636137139018e-19	23365926	23365926	1.03436435025829e-08	38731378	43644906
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39091349	67927172	24	21	-0.2342	1.03436435025829e-08	38731378	43644906	1.5853707465975e-08	67911945	70217543
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67942846	70926188	320	307	0.0413	1.5853707465975e-08	67911945	70217543	1.84088262972838e-42	70926188	70926188
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.2808	1.84088262972838e-42	70926188	70926188	2.11225813598588e-58	70930528	70930528
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	89092684	6014	5853	0.0443	2.11225813598588e-58	70930528	70930528	0	89081490	89132663
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	89095395	93434678	1271	1236	-0.2804	0	89081490	89132663	2.36475610001684e-31	93434678	93434678
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93436073	93439862	3	3	-1.7213	2.36475610001684e-31	93434678	93434678	1.60230433319880e-31	93439862	93439862
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93443960	93443960	1	0	NA	1.6023043331988e-31	93439862	93439862	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	93445852	112062107	6483	6304	-0.2779	NA	NA	NA	4.19860337443782e-08	112062107	112062107
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-1.1993	4.19860337443782e-08	112062107	112062107	8.11535088664514e-09	112069192	112069192
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	116118907	1692	1652	-0.2699	8.11535088664514e-09	112069192	112069192	1.93490990295098e-11	116116077	116124007
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116122595	116132839	5	5	-0.9382	1.93490990295098e-11	116116077	116124007	1.07948073832757e-20	116126105	116137111
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	137352394	8294	8046	-0.2571	1.07948073832757e-20	116126105	116137111	1.31885986131079e-19	137352394	137352394
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	0.8692	1.31885986131079e-19	137352394	137352394	1.12510247621372e-09	137356880	137356880
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1063	-0.2026	1.12510247621372e-09	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	4157870	1487	1436	-0.2856	NA	NA	NA	0	4153968	4161707
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	4161707	18397597	4997	4834	0.3121	0	4153968	4161707	0	18367866	18442016
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	18402197	109880782	29400	28577	0.0562	0	18367866	18442016	0	109832365	109925802
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	109887690	124328915	5045	4899	0.3199	0	109832365	109925802	1.78701706365065e-23	124328915	124328915
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	-0.8965	1.78701706365065e-23	124328915	124328915	2.51580635913207e-25	124340356	124340356
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	127563278	1158	1132	0.3341	2.51580635913207e-25	124340356	124340356	8.81395884237824e-12	127556450	127569849
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127608087	17	16	-0.0347	8.81395884237824e-12	127556450	127569849	1.35977964747802e-08	127592138	127619700
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127612608	135285645	2701	2626	0.2956	1.35977964747802e-08	127592138	127619700	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1707	-0.2504	NA	NA	NA	0	4923300	4923300
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4926583	1	0	NA	0	4923300	4923300	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4928045	4932214	4	4	-5.5272	NA	NA	NA	0	4932214	4932214
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	27088984	8056	7828	-0.2763	0	4932214	4932214	0	27080694	27097831
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	27093388	44396486	5129	5003	0.0538	0	27080694	27097831	1.92397938939015e-11	44299576	44468274
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	44402296	44588217	45	44	0.2817	1.92397938939015e-11	44299576	44468274	1.24055732461399e-08	44564888	44630997
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	44589937	55118214	1898	1842	0.0747	1.24055732461399e-08	44564888	44630997	4.24962372584462e-41	55112618	55124730
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.3926	4.24962372584462e-41	55112618	55124730	2.20921875074691e-38	55207305	55221692
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	66463477	4637	4504	0.0672	2.20921875074691e-38	55207305	55221692	7.48335718526444e-10	66460753	66463477
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.1151	7.48335718526444e-10	66460753	66463477	1.12813616071531e-10	66469412	66469412
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	69207361	913	888	0.0753	1.12813616071531e-10	66469412	66469412	1.43411021373477e-268	69191919	69226727
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	69210496	97518972	9522	9254	0.3266	1.43411021373477e-268	69191919	69226727	0	97481030	97589028
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	97525597	107284914	3210	3121	0.0535	0	97481030	97589028	1.88910259704543e-08	107284914	107284914
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107289887	107292148	2	2	-0.9226	1.88910259704543e-08	107284914	107284914	4.22881283793432e-21	107292148	107292148
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107293658	134450318	10073	9800	0.0504	4.22881283793432e-21	107292148	107292148	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9523923	3742	3641	0.0659	NA	NA	NA	5.63293574595031e-64	9523923	9528590
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	15	0.9483	5.63293574595031e-64	9523923	9528590	4.34012578396258e-52	9607363	9626623
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10459455	325	317	0.0529	4.34012578396258e-52	9607363	9626623	8.2458708818643e-09	10449680	10465787
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10462211	10491341	12	12	-0.3503	8.2458708818643e-09	10449680	10465787	7.02620065152492e-09	10482217	10534393
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10493984	11116883	234	228	0.0401	7.02620065152492e-09	10482217	10534393	5.56351252005981e-28	11116883	11116883
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11121204	1	0	NA	5.56351252005981e-28	11116883	11116883	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11123452	11140421	6	6	0.9853	NA	NA	NA	1.24048719505284e-25	11140421	11143592
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	31132762	6819	6628	0.0554	1.24048719505284e-25	11140421	11143592	2.70520221967113e-74	31098259	31169263
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31298659	43	43	0.6432	2.70520221967113e-74	31098259	31169263	3.20623358007871e-77	31296973	31299898
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	44457415	3486	3382	0.0545	3.20623358007871e-77	31296973	31299898	7.07060039767191e-12	44457415	44457415
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	44460345	44461500	2	2	1.1409	7.07060039767191e-12	44457415	44457415	2.66831046480008e-12	44461500	44461500
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	44463392	113067179	23490	22804	0.0616	2.66831046480008e-12	44461500	44461500	0	113042842	113109859
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	113076573	126974281	4917	4773	-0.2597	0	113042842	113109859	3.92300776259479e-11	126961322	126982542
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	126979521	127039633	15	14	-0.6615	3.92300776259479e-11	126961322	126982542	6.56300335925392e-09	127014256	127076145
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	127049038	130694393	1407	1355	-0.2998	6.56300335925392e-09	127014256	127076145	1.82371012603387e-16	130694393	130694393
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	-1.5791	1.82371012603387e-16	130694393	130694393	6.28182690931e-15	130701040	130701040
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	88	-0.3215	6.28182690931e-15	130701040	130701040	3.85079150875430e-45	130943064	130943064
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.8332	3.8507915087543e-45	130943064	130943064	9.8466178475639e-46	130946248	130946248
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132287226	549	539	-0.25	9.8466178475639e-46	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	132289090	132289090	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	33030946	5595	5437	-0.2795	NA	NA	NA	1.16803371336622e-25	33030946	33039089
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33033905	33046417	4	4	-1.4374	1.16803371336622e-25	33030946	33039089	8.52061531664295e-52	33042557	33046417
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	33049401	34849893	548	526	0.0439	8.52061531664295e-52	33042557	33046417	1.36207041376513e-08	34848707	34849893
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34853399	34856446	3	3	0.7979	1.36207041376513e-08	34848707	34849893	4.05412813663634e-08	34854926	34857880
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	34857880	36969571	889	862	0.0514	4.05412813663634e-08	34854926	34857880	0	36969571	36969571
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	-5.8221	0	36969571	36969571	0	36982877	36982877
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	56650373	6984	6793	-0.0172	0	36982877	36982877	1.39687210568647e-155	56650373	56650373
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56681665	14	14	-1.4655	1.39687210568647e-155	56650373	56650373	4.4813939126981e-148	56681665	56681665
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	89659397	8254	8053	-0.0287	4.4813939126981e-148	56681665	56681665	2.65963686995784e-15	89659397	89659397
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	1.2174	2.65963686995784e-15	89659397	89659397	8.45693752781714e-16	89662326	89662326
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9092	-0.0221	8.45693752781714e-16	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	34666996	5749	5594	-0.2641	NA	NA	NA	8.2081140587419e-18	34665545	34666996
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34674458	34683810	4	4	0.7148	8.2081140587419e-18	34665545	34666996	2.84488710372678e-20	34683810	34685308
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1840	-0.2752	2.84488710372678e-20	34683810	34685308	8.89141870323597e-19	40663660	40676611
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40741934	9	9	0.3611	8.89141870323597e-19	40663660	40676611	9.14292162942757e-18	40741934	40746865
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40746865	73061942	11762	11429	-0.2697	9.14292162942757e-18	40741934	40746865	1.12685296859633e-07	73058103	73082262
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73071404	73092112	8	6	-0.7911	1.12685296859633e-07	73058103	73082262	1.98119174478849e-08	73083141	73101327
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79174722	2914	2840	-0.2559	1.98119174478849e-08	73083141	73101327	7.18624047228095e-281	79174722	79174722
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-4.0625	7.18624047228095e-281	79174722	79174722	1.97928513850595e-301	79183154	79183154
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	102388710	8073	7814	-0.2705	1.97928513850595e-301	79183154	79183154	0	102386881	102401445
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	102400822	103359690	455	445	0.3063	0	102386881	102401445	1.96862223107672e-25	103349954	103378147
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	103362514	103575796	105	101	0.5596	1.96862223107672e-25	103349954	103378147	5.81611117802279e-23	103552417	103600807
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	103578084	106218059	855	832	0.3068	5.81611117802279e-23	103552417	103600807	1.07193714179495e-06	106196705	106223137
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106255190	17	17	-0.0131	1.07193714179495e-06	106196705	106223137	5.2901620505236e-07	106251081	106269543
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	34	0.3425	5.2901620505236e-07	106251081	106269543	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18831600	13	13	0.0366	NA	NA	NA	9.35813978575157e-05	18818949	18857376
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18835660	19537035	86	83	0.3457	9.35813978575157e-05	18818949	18857376	6.14161467140129e-38	19415360	19822150
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	32456500	3728	3619	0.0435	6.14161467140129e-38	19415360	19822150	1.04893107320743e-46	32454294	32517839
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	23	-0.5872	1.04893107320743e-46	32454294	32517839	4.46587715362155e-49	32578483	32664506
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	4.46587715362155e-49	32578483	32664506	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	75115806	18032	17481	0.0618	NA	NA	NA	4.79086752865599e-31	75115806	75115806
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.8189	4.79086752865599e-31	75115806	75115806	1.65216258977751e-41	75119713	75119713
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	75518598	166	160	0.057	1.65216258977751e-41	75119713	75119713	2.8979576036222e-18	75518598	75518598
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75519691	75520672	2	2	1.229	2.8979576036222e-18	75518598	75518598	4.10874381807018e-14	75520672	75520672
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75521740	95227081	7143	6933	0.0583	4.10874381807018e-14	75520672	75520672	0	95179332	95272917
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95232989	99632987	1850	1802	0.3118	0	95179332	95272917	1.2823514444562e-58	99632987	99632987
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.6407	1.2823514444562e-58	99632987	99632987	9.03217659385907e-55	99635701	99635701
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	99636724	1	0	NA	9.03217659385907e-55	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99637714	100298352	271	261	0.3018	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1130084	418	397	0.0996	NA	NA	NA	2.6187738396225e-26	1119025	1139773
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1131377	1296767	55	54	-0.2807	2.6187738396225e-26	1119025	1139773	4.59744625997357e-20	1296767	1296767
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.1249	4.59744625997357e-20	1296767	1296767	1.48981103582184e-14	1300341	1300341
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	2600740	538	523	-0.2315	1.48981103582184e-14	1300341	1300341	5.1777302203176e-07	2593067	2638581
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	-1.0196	5.1777302203176e-07	2593067	2638581	2.82355787584726e-08	2638643	2649851
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	22338034	6532	6345	-0.2587	2.82355787584726e-08	2638643	2649851	5.14481855015964e-10	22333565	22338034
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22541389	22561536	4	4	0.461	5.14481855015964e-10	22333565	22338034	2.13476339947726e-10	22561536	22567551
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22567551	24276941	701	676	-0.2585	2.13476339947726e-10	22561536	22567551	3.20716485824185e-278	24269550	24289239
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	24279869	34317157	2454	2385	0.0666	3.20716485824185e-278	24269550	24289239	3.19693958779469e-41	34306513	34329518
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34602318	52	52	0.4743	3.19693958779469e-41	34306513	34329518	1.34083561269853e-48	34588639	34621068
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	57203733	4150	4038	0.0585	1.34083561269853e-48	34588639	34621068	6.95809887407918e-12	57203733	57203733
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.1205	6.95809887407918e-12	57203733	57203733	2.72771697140657e-14	57206772	57206772
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	67340664	2783	2697	0.0546	2.72771697140657e-14	57206772	57206772	1.24708184059574e-15	67338801	67340664
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	67341995	67343922	2	2	0.8882	1.24708184059574e-15	67338801	67340664	3.10285171049806e-09	67343922	67343922
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	67345847	67737041	181	174	0.1047	3.10285171049806e-09	67343922	67343922	1.06036652922224e-107	67734973	67747337
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	67741462	75093957	2646	2577	-0.2518	1.06036652922224e-107	67734973	67747337	6.45621280798147e-84	75093957	75093957
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-3.1262	6.45621280798147e-84	75093957	75093957	1.78261093901818e-83	75100865	75100865
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	589	-0.2903	1.78261093901818e-83	75100865	75100865	0	76925748	76925748
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-4.525	0	76925748	76925748	0	76940218	76940218
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4400	-0.2699	0	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	408	-0.2313	NA	NA	NA	2.34018010050378e-41	1028979	1028979
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.7855	2.34018010050378e-41	1028979	1028979	2.33417426811689e-38	1030766	1030766
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	421	-0.222	2.33417426811689e-38	1030766	1030766	1.41858749621203e-27	1904451	1904451
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.1797	1.41858749621203e-27	1904451	1904451	4.22595254653222e-32	1906391	1906391
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	23780340	7913	7687	-0.2605	4.22595254653222e-32	1906391	1906391	1.42065401845054e-80	23773701	23793434
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	23782449	23782449	1	0	NA	1.42065401845054e-80	23773701	23793434	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	23783715	24018886	111	107	0.1217	NA	NA	NA	1.42404658485396e-80	24014665	24027317
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24023324	31451114	3154	3066	-0.2638	1.42404658485396e-80	24014665	24027317	4.51564862744237e-18	31443186	31461588
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31457889	31503774	20	19	-0.6958	4.51564862744237e-18	31443186	31461588	2.41257103450315e-12	31493990	31893451
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32045630	74	72	-0.2343	2.41257103450315e-12	31493990	31893451	1.00903891935312e-24	32029158	32059702
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32051814	32707677	219	214	0.0551	1.00903891935312e-24	32029158	32059702	1.08786508484953e-18	32707677	32707677
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32709516	32711048	2	2	1.2335	1.08786508484953e-18	32707677	32707677	5.0728702609135e-21	32711048	32711048
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32711885	32828797	70	67	0.0315	5.0728702609135e-21	32711048	32711048	0	32828797	32828797
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-5.1514	0	32828797	32828797	9.12969679563376e-274	32832642	32832642
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	40874079	3261	3162	0.0832	9.12969679563376e-274	32832642	32832642	7.18627582826483e-12	40869151	40874079
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41031191	6	6	-0.5623	7.18627582826483e-12	40869151	40874079	2.28593562733846e-11	41031191	41062669
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41566540	219	213	0.0783	2.28593562733846e-11	41031191	41062669	3.55298571192973e-49	41562786	41570512
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	45	-0.4394	3.55298571192973e-49	41562786	41570512	5.41125850198671e-63	41706870	42142363
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	64754503	8464	8208	0.0735	5.41125850198671e-63	41706870	42142363	0	64738625	64766982
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	64755886	72291032	2662	2589	0.3278	0	64738625	64766982	3.70564598663279e-31	72291032	72291032
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72294735	72294735	1	0	NA	3.70564598663279e-31	72291032	72291032	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72297674	72299153	2	2	-1.4146	NA	NA	NA	7.56780253591123e-49	72299153	72299153
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	72303321	78653545	2550	2486	0.4682	7.56780253591123e-49	72299153	72299153	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15788	0.044	NA	NA	NA	1.67714666796428e-28	53092949	53092949
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.5787	1.67714666796428e-28	53092949	53092949	5.65629531165732e-27	53099601	53099601
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	53930287	307	297	0.048	5.65629531165732e-27	53099601	53099601	4.15144733705143e-09	53929114	53932384
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53932384	53935484	3	3	0.7617	4.15144733705143e-09	53929114	53932384	2.28567616237831e-08	53934133	53936889
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53936889	54078204	68	67	0.0788	2.28567616237831e-08	53934133	53936889	4.82271882634059e-30	54078204	54078204
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54082209	54087468	4	4	-0.9417	4.82271882634059e-30	54078204	54078204	5.7880717308661e-19	54087468	54087468
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	54089357	76116026	6381	6202	0.0248	5.7880717308661e-19	54087468	54087468	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	239700	12	11	-0.2759	NA	NA	NA	1.35072697126508e-25	239700	239700
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	1.2375	1.35072697126508e-25	239700	239700	3.62858570259009e-18	243026	243026
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	5561369	2434	2359	-0.2222	3.62858570259009e-18	243026	243026	0	5551230	5570990
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	5563684	11448975	2724	2637	0.081	0	5551230	5570990	1.57491486529681e-30	11448975	11448975
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.835	1.57491486529681e-30	11448975	11448975	9.65175428628103e-31	11452390	11452390
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	40352568	7435	7221	0.0604	9.65175428628103e-31	11452390	11452390	2.97818098371705e-12	40350432	40352568
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40354034	40356341	2	2	-0.8947	2.97818098371705e-12	40350432	40352568	4.91773321389008e-09	40356341	40356341
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40359145	56823430	7262	7060	0.0693	4.91773321389008e-09	40356341	40356341	9.82027037757947e-18	56822197	56825794
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56837593	7	7	-0.6408	9.82027037757947e-18	56822197	56825794	1.53432956638366e-15	56834433	56844304
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56840346	56842447	2	0	NA	1.53432956638366e-15	56834433	56844304	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56844304	63788698	3177	3077	0.0481	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	4940006	2014	1953	-0.2611	NA	NA	NA	5.32888218311756e-07	4935503	4940006
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	4941194	4947120	3	3	0.4371	5.32888218311756e-07	4935503	4940006	1.19447357497985e-07	4947120	4948455
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	4948455	28250082	7033	6850	-0.289	1.19447357497985e-07	4947120	4948455	0	28247413	28252024
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	28252024	56896329	10266	9944	0.3273	0	28247413	28252024	4.07258513140134e-12	56896329	56896329
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56898026	56899350	2	2	-0.7735	4.07258513140134e-12	56896329	56896329	1.13058256716243e-09	56899350	56901438
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56901438	62419534	2261	2201	0.3051	1.13058256716243e-09	56899350	56901438	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10167413	22	20	-0.1453	NA	NA	NA	0.000936873371238289	10004854	13723418
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13342486	1	0	NA	0.000936873371238289	10004854	13723418	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13435755	17354985	1282	1246	0.0495	NA	NA	NA	0	17324887	17375456
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	17358912	40520958	9094	8833	-0.2878	0	17324887	17375456	3.29736093051421e-46	40520958	40524769
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	40524769	40532662	6	6	-1.4856	3.29736093051421e-46	40520958	40524769	9.3569191750837e-41	40530580	40532662
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	40534218	46922972	3036	2959	-0.2648	9.3569191750837e-41	40530580	40532662	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2889	-0.2446	NA	NA	NA	1.38644953364954e-19	22642519	22679305
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	19	0.2336	1.38644953364954e-19	22642519	22679305	8.66812501269251e-23	22718614	22725305
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	37685496	7762	7557	-0.254	8.66812501269251e-23	22718614	22725305	1.87149785842458e-17	37681158	37690142
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37721849	18	17	-0.707	1.87149785842458e-17	37681158	37690142	3.20369502900855e-18	37715385	37725321
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37723010	41220567	1822	1763	-0.2466	3.20369502900855e-18	37715385	37725321	2.00566838524438e-31	41219395	41226643
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41226643	41295673	16	16	0.3744	2.00566838524438e-31	41219395	41226643	8.04569258239839e-33	41289552	41310667
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41310667	44816157	1733	1680	-0.2563	8.04569258239839e-33	41289552	41310667	5.01856312658397e-09	44814677	44816157
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44817721	44819731	2	2	0.6906	5.01856312658397e-09	44814677	44816157	4.14267910116717e-09	44819731	44821283
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44821283	48448446	1699	1646	-0.2719	4.14267910116717e-09	44819731	44821283	7.49653912035232e-12	48448446	48448446
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	0.8204	7.49653912035232e-12	48448446	48448446	4.83750428731483e-10	48452959	48452959
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	48455492	1	0	NA	4.83750428731483e-10	48452959	48452959	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48458933	49571068	499	478	-0.2416	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2301365	1399	1352	-0.2338	NA	NA	NA	1.43228753961357e-11	2300485	2301365
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2304398	5	5	0.56	1.43228753961357e-11	2300485	2301365	1.98849959556185e-13	2303218	2306110
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2426938	136	131	-0.207	1.98849959556185e-13	2303218	2306110	2.05110658574818e-16	2426938	2426938
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.1162	2.05110658574818e-16	2426938	2426938	1.63656080049414e-15	2428307	2428307
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2672401	224	219	-0.2422	1.63656080049414e-15	2428307	2428307	7.00747151143462e-09	2667362	2692498
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	26	-0.5536	7.00747151143462e-09	2667362	2692498	1.86914825955394e-117	2708291	2711273
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1756	0.632	1.86914825955394e-117	2708291	2711273	3.13447359947157e-08	8446489	8461739
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8466917	7	7	0.1112	3.13447359947157e-08	8446489	8461739	8.06841059954316e-09	8459880	8475091
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	8.06841059954316e-09	8459880	8475091	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	13679455	2276	2210	0.6696	NA	NA	NA	7.02295953813414e-10	13679455	13681110
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13681110	13686085	3	3	-0.2288	7.02295953813414e-10	13679455	13681110	6.21478431948292e-12	13683888	13686085
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13688061	14490026	271	264	0.6974	6.21478431948292e-12	13683888	13686085	8.32765923716652e-12	14490026	14490026
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	14498434	14499794	2	2	1.8047	8.32765923716652e-12	14490026	14490026	6.54967207144648e-10	14499794	14499794
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	14502356	42580246	10405	10123	0.6856	6.54967207144648e-10	14499794	14499794	0	42544453	42625683
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	42588622	115940687	18221	17697	0.9988	0	42544453	42625683	8.83515674061238e-16	115914012	115970645
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	115967087	115982725	10	10	1.5165	8.83515674061238e-16	115914012	115970645	6.0283478587577e-11	115978929	115990000
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	115988866	152655026	11474	11141	0.9815	6.0283478587577e-11	115978929	115990000	4.15302342721975e-09	152652738	152655026
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.1162	4.15302342721975e-09	152652738	152655026	1.02527232733330e-05	152657445	152669192
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	153329988	255	253	0.9377	1.0252723273333e-05	152657445	152669192	5.01123003713689e-08	153323915	153340901
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153332114	153348763	8	8	0.2958	5.01123003713689e-08	153323915	153340901	1.44721344800962e-11	153340901	153352463
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	153351248	154582414	408	394	0.966	1.44721344800962e-11	153340901	153352463	0	154578922	154586690
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	191	0.0048	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2777308	29	27	-4.376	NA	NA	NA	0.000104267449277155	2766355	2777308
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2778371	2784560	6	6	-2.5015	0.000104267449277155	2766355	2777308	1.90596278610203e-05	2784560	2793733
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2787638	3733715	89	86	-4.4417	1.90596278610203e-05	2784560	2793733	2.29625665015241e-28	3223585	3773948
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5672441	17	16	-1.3639	2.29625665015241e-28	3223585	3773948	1.73977182408355e-13	5422507	6692482
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7051884	172	161	-3.9669	1.73977182408355e-13	5422507	6692482	3.7806160607241e-10	7021965	7184431
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7401540	115	108	-2.8595	3.7806160607241e-10	7021965	7184431	2.00363947477812e-09	7355550	7481187
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7410906	7709619	81	72	-4.2222	2.00363947477812e-09	7355550	7481187	0.00119313093066519	7664085	7781968
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8010446	89	85	-3.3653	0.00119313093066519	7664085	7781968	6.2258972598703e-10	7947666	8057124
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8241630	56	49	-4.6372	6.2258972598703e-10	7947666	8057124	7.53056476271325e-05	8204414	8363122
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8245608	8823361	167	163	-3.9045	7.53056476271325e-05	8204414	8363122	0.0230806403797418	8717366	8826900
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8824539	8824539	1	0	NA	0.0230806403797418	8717366	8826900	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8826900	8882995	12	9	-5.0068	NA	NA	NA	8.71332552248044e-07	8856239	8888511
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8888511	8933640	13	11	-4.1767	8.71332552248044e-07	8856239	8888511	1.19392801642047e-06	8928870	8933640
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8935134	8949553	4	3	-5.2056	1.19392801642047e-06	8928870	8933640	7.23326816098019e-13	8949553	8949553
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-1.9211	7.23326816098019e-13	8949553	8949553	2.09488853097653e-12	8956787	8956787
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9160624	36	33	-5.0867	2.09488853097653e-12	8956787	8956787	0.000379315266210461	9119912	10060138
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10513747	75	72	-4.318	0.000379315266210461	9119912	10060138	2.85500302708817e-26	10512616	10550419
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	20	-1.2852	2.85500302708817e-26	10512616	10550419	2.13871916625085e-07	11249952	12502304
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.3902	2.13871916625085e-07	11249952	12502304	7.66331783574617e-21	12537944	12541506
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12557151	7	6	-0.6817	7.66331783574617e-21	12537944	12541506	1.53341880954389e-24	12557151	12557151
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12558585	12558585	1	0	NA	1.53341880954389e-24	12557151	12557151	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12559410	12575215	7	6	-3.4115	NA	NA	NA	1.56561129165792e-05	12575215	12579534
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12576110	12590969	9	8	-2.0841	1.56561129165792e-05	12575215	12579534	6.29808292378842e-05	12588578	12599162
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12591908	12611624	11	10	-3.7183	6.29808292378842e-05	12588578	12599162	6.68588156426365e-05	12605673	12618263
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12613725	12682301	19	19	-1.9228	6.68588156426365e-05	12605673	12618263	1.44718675448267e-17	12668435	12687167
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-4.5918	1.44718675448267e-17	12668435	12687167	2.39426974878981e-14	12820920	12852769
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	109	-2.4067	2.39426974878981e-14	12820920	12852769	9.36344615562792e-08	13100625	13148290
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13256555	43	42	-3.7026	9.36344615562792e-08	13100625	13148290	0.000215742026799142	13165652	13323419
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	14342834	366	346	-4.4141	0.000215742026799142	13165652	13323419	5.77984700687237e-09	14210847	14391767
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	94	-3.6871	5.77984700687237e-09	14210847	14391767	4.27205201261024e-12	14500820	14530328
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	4.27205201261024e-12	14500820	14530328	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14644293	35	32	-1.9249	NA	NA	NA	1.00243623870841e-22	14598838	14684159
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14952770	68	65	-4.3801	1.00243623870841e-22	14598838	14684159	0.000151343693752927	14857726	15140278
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14958284	14958284	1	0	NA	0.000151343693752927	14857726	15140278	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14969835	15299931	125	117	-3.5388	NA	NA	NA	2.99821422347868e-08	15276098	15309005
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15301380	15408015	69	65	-4.6732	2.99821422347868e-08	15276098	15309005	1.21553977541154e-07	15396500	15447091
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15409110	1	0	NA	1.21553977541154e-07	15396500	15447091	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15410566	16190541	257	247	-3.6653	NA	NA	NA	3.28954891963396e-07	16072965	16321288
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16191571	17772524	270	256	-4.2823	3.28954891963396e-07	16072965	16321288	4.60838781399403e-05	17681974	17782139
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17775484	17823594	22	22	-3.1229	4.60838781399403e-05	17681974	17782139	0.000123989437107249	17817586	17823594
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17824715	17832657	6	6	-4.5092	0.000123989437107249	17817586	17823594	8.53690843420927e-05	17832657	17843372
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17833945	17867218	8	8	-3.0452	8.53690843420927e-05	17832657	17843372	0.0175849997331908	17850226	17995508
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17873030	19610243	119	113	-4.2883	0.0175849997331908	17850226	17995508	1.12208777829789e-05	19606814	19610243
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.5918	1.12208777829789e-05	19606814	19610243	8.02422833791771e-07	19613864	19615891
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	19614809	1	0	NA	8.02422833791771e-07	19613864	19615891	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19615891	20384639	214	197	-4.4324	NA	NA	NA	5.36859525112755e-05	20364200	20384639
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20387629	20393111	3	3	-1.7312	5.36859525112755e-05	20364200	20384639	2.02900187441327e-06	20393111	20428887
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20400879	21036411	73	69	-4.4991	2.02900187441327e-06	20393111	20428887	9.90071155736997e-10	21034708	21036503
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-2.1543	9.90071155736997e-10	21034708	21036503	4.55748108056453e-14	21054519	21057446
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21054605	1	0	NA	4.55748108056453e-14	21054519	21057446	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21057446	21224074	60	56	-4.5943	NA	NA	NA	7.33614669211561e-05	21162861	21335456
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21236497	21657525	92	85	-3.8355	7.3361466921156e-05	21162861	21335456	4.30023741857205e-05	21574425	21666200
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21666200	21687813	10	10	-5.4361	4.30023741857205e-05	21574425	21666200	1.83731873820317e-28	21687813	21687813
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21689031	21761022	13	13	-3.0198	1.83731873820317e-28	21687813	21687813	9.87257229402905e-06	21761022	21787852
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21763911	22139807	85	78	-4.5446	9.87257229402905e-06	21761022	21787852	9.94801907807198e-09	22052726	22139807
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-2.2996	9.94801907807198e-09	22052726	22139807	2.04334546709543e-16	22177335	22181855
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22178964	1	0	NA	2.04334546709543e-16	22177335	22181855	NA	NA	NA
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	25737663	94	88	-4.7464	NA	NA	NA	1.10594885614634e-103	25737663	26871442
MSK_252152912780_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	79	-1.2382	1.10594885614634e-103	25737663	26871442	NA	NA	NA
