Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	34869589	12894	12351	-0.1421	NA	NA	NA	3.53931804576809e-56	34869589	34869589
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-1.8495	3.53931804576809e-56	34869589	34869589	1.90867673023356e-59	34883375	34883375
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	36757114	819	769	-0.1853	1.90867673023356e-59	34883375	34883375	1.79141225120743e-270	36734448	36781530
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	36761768	38855023	654	629	0.1931	1.79141225120743e-270	36734448	36781530	1.40840839705389e-212	38818996	38891881
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	38864742	41115056	1007	967	0.5106	1.40840839705389e-212	38818996	38891881	6.2626229183128e-17	41113483	41115056
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	41118001	41153389	8	8	1.1367	6.2626229183128e-17	41113483	41115056	5.97206448046021e-18	41153389	41156568
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	41156568	52647279	4633	4457	0.4901	5.97206448046021e-18	41153389	41156568	0	52635815	52653740
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52649078	61881731	3611	3442	0.2008	0	52635815	52653740	1.26720581260084e-08	61878187	61881731
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61884298	61884298	1	0	NA	1.26720581260084e-08	61878187	61881731	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61890388	3	3	-0.4915	NA	NA	NA	1.18558653880400e-07	61890388	61892291
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61892291	66025583	1751	1661	0.2056	1.185586538804e-07	61890388	61892291	0	66003198	66037824
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	66027843	72537426	2509	2403	0.4689	0	66003198	66037824	0	72537426	72537426
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	11	-4.0098	0	72537426	72537426	4.46264665887971e-283	72574479	72574479
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	73213981	92	86	0.4169	4.46264665887971e-283	72574479	72574479	1.55852140266999e-179	73168129	73218419
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	73218419	83664313	3125	3001	-0.2067	1.55852140266999e-179	73168129	73218419	0	83638633	83664313
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	83722257	104122714	6911	6592	0.5447	0	83638633	83664313	1.53179497558910e-108	103956767	104143266
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104126101	105101798	154	149	0.2973	1.5317949755891e-108	103956767	104143266	1.00756166436082e-20	105065980	105135648
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	105111830	105111830	1	0	NA	1.00756166436082e-20	105065980	105135648	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	105120804	105557519	56	54	0.5399	NA	NA	NA	9.60831673500343e-17	105514171	105633958
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	105566560	108203143	678	642	0.3293	9.60831673500343e-17	105514171	105633958	2.70959457165979e-20	108203143	108203143
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108205691	108206802	2	2	-0.8381	2.70959457165979e-20	108203143	108203143	7.63544270336934e-17	108206802	108206802
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108207899	144093719	4681	4471	0.3644	7.63544270336934e-17	108206802	108206802	0	143971430	144105332
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	150819879	1857	1777	0.6884	0	143971430	144105332	1.25153173352013e-56	150819879	150819879
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150839754	4	4	-0.8875	1.25153173352013e-56	150819879	150819879	3.15221951874303e-09	150839754	150839754
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	5	-3.3318	3.15221951874303e-09	150839754	150839754	1.81351806368392e-260	150851439	150851439
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151028700	79	77	0.6208	1.81351806368392e-260	150851439	150851439	2.16071186157978e-07	151026228	151028700
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151032967	151036435	3	3	-0.0073	2.16071186157978e-07	151026228	151028700	2.86274251247616e-10	151036435	151038091
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2568	0.6886	2.86274251247616e-10	151036435	151038091	3.87809830526652e-49	157133150	157133150
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.525	3.87809830526652e-49	157133150	157133150	4.15542999559333e-50	157136342	157136342
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	160667913	1438	1387	0.6614	4.15542999559333e-50	157136342	157136342	5.30202665340795e-63	160645128	160674241
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	160668000	161099582	184	175	0.4001	5.30202665340795e-63	160645128	160674241	1.30546552292696e-09	161099582	161099582
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-0.3992	1.30546552292696e-09	161099582	161099582	1.62966366911163e-07	161104791	161104791
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167087079	2326	2252	0.4221	1.62966366911163e-07	161104791	161104791	4.51898427345294e-22	167039424	167109716
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167094137	167326813	83	78	0.1991	4.51898427345294e-22	167039424	167109716	1.09812645903518e-09	167309113	167353317
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167328728	167483267	75	72	0.3936	1.09812645903518e-09	167309113	167353317	3.80132212261587e-14	167479184	167483267
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.9798	3.80132212261587e-14	167479184	167483267	1.17344850903926e-15	167507898	167520743
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	172986825	2141	2033	0.4188	1.17344850903926e-15	167507898	167520743	4.02019256062605e-315	172966257	173012338
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	172989200	179692688	2678	2560	0.2068	4.02019256062605e-315	172966257	173012338	3.9505360447783e-08	179692688	179692688
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179694500	179694500	1	0	NA	3.9505360447783e-08	179692688	179692688	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179696436	179698210	2	2	-0.6453	NA	NA	NA	1.57528752076212e-08	179698210	179702422
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	179702422	185979586	2387	2275	0.1974	1.57528752076212e-08	179698210	179702422	1.86141868547675e-30	185979586	185979586
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-1.3815	1.86141868547675e-30	185979586	185979586	8.49473609444775e-29	185988138	185988138
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	200598243	4136	3955	0.1905	8.49473609444775e-29	185988138	185988138	3.80938802702039e-18	200585836	200618814
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200665389	23	20	-0.103	3.80938802702039e-18	200585836	200618814	0	200654700	200673525
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	200667381	1	0	NA	0	200654700	200673525	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200668993	227875096	9939	9511	0.2835	NA	NA	NA	0	227875096	227875096
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-3.4854	0	227875096	227875096	8.07289629742699e-209	227882805	227882805
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	228223611	58	53	0.3819	8.07289629742699e-209	227882805	227882805	1.89381483477367e-05	228173301	228245961
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228227748	228268844	15	14	0.7023	1.89381483477367e-05	228173301	228245961	7.98930806190684e-56	228249098	228314113
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	228271750	240489591	4843	4636	0.4783	7.98930806190684e-56	228249098	228314113	1.31011561418135e-57	240461421	240508721
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240493273	240566493	25	25	0.2375	1.31011561418135e-57	240461421	240508721	2.51578051720255e-08	240555115	240596160
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240568872	241340181	134	129	0.5092	2.51578051720255e-08	240555115	240596160	1.04443470061573e-12	241078315	241366280
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241350083	241431284	32	32	0.1988	1.04443470061573e-12	241078315	241366280	6.76387878521988e-21	241418448	241446026
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241433682	247186514	2373	2270	0.5375	6.76387878521988e-21	241418448	241446026	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	17120910	5097	4863	-0.0288	NA	NA	NA	4.62371987872132e-14	17074335	17143573
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17126263	17279606	41	40	-0.2883	4.62371987872132e-14	17074335	17143573	2.66273258695812e-13	17243868	17314843
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17287137	17287137	1	0	NA	2.66273258695812e-13	17243868	17314843	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	17292563	20231737	737	705	-0.0475	NA	NA	NA	5.36370101342983e-11	20231737	20231737
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20234103	20236210	2	2	-1.0008	5.36370101342983e-11	20231737	20231737	4.54697241762505e-10	20236210	20236210
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20237659	33076512	4998	4757	-0.0183	4.54697241762505e-10	20236210	20236210	3.96234388202941e-171	33076512	33076512
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-3.9515	3.96234388202941e-171	33076512	33076512	3.78987224737516e-206	33080437	33080437
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	616	-0.0426	3.78987224737516e-206	33080437	33080437	0	34543992	34551222
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	16	-4.0501	0	34543992	34551222	0	34583814	34589997
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37787637	1363	1301	-0.053	0	34583814	34589997	2.38347653096302e-07	37767547	37818455
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37789939	37855837	28	28	-0.2708	2.38347653096302e-07	37767547	37818455	1.68806030127113e-166	37848754	37866455
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	37858379	1	0	NA	1.68806030127113e-166	37848754	37866455	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37859985	50326003	4968	4743	0.0839	NA	NA	NA	2.26028336076950e-154	50326003	50326003
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50327637	50330765	3	3	-1.3657	2.2602833607695e-154	50326003	50326003	6.29701438519733e-45	50330765	50330765
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50331153	52600588	829	792	0.1095	6.29701438519733e-45	50330765	50330765	1.10116323189838e-17	52588009	52600588
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.8321	1.10116323189838e-17	52588009	52600588	6.35187124592151e-136	52635695	52639605
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	84790999	10278	9823	0.0225	6.35187124592151e-136	52635695	52639605	6.88481065211186e-134	84789406	84793898
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	84793898	84822861	14	14	-0.5307	6.88481065211186e-134	84789406	84793898	4.49077394670975e-13	84814288	84831535
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	84824611	97221198	1964	1879	-0.091	4.49077394670975e-13	84814288	84831535	2.22997422558016e-06	97187531	97221198
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97228759	97231582	2	2	-0.9153	2.22997422558016e-06	97187531	97221198	1.39775709082259e-60	97231582	97241094
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97241094	131794498	9305	8897	-0.1664	1.39775709082259e-60	97231582	97241094	3.84213062622689e-62	131794498	131794498
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131808130	131812279	2	2	-1.0402	3.84213062622689e-62	131794498	131794498	4.86099731227234e-06	131812279	131814520
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131814520	132750789	58	55	-0.1868	4.86099731227234e-06	131812279	131814520	1.16667781072721e-08	132750789	132750789
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132753228	132753228	1	0	NA	1.16667781072721e-08	132750789	132750789	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132754617	132755508	2	2	0.9059	NA	NA	NA	1.18542686543238e-12	132755508	132755508
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132763461	146562545	4710	4498	-0.1331	1.18542686543238e-12	132755508	132755508	1.50912813090669e-09	146546601	146582195
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146571330	146601593	7	7	-0.6188	1.50912813090669e-09	146546601	146582195	3.47917256154396e-10	146592775	146608163
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146606708	161816089	4553	4325	-0.1245	3.47917256154396e-10	146592775	146608163	0	161802653	161832985
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	161820786	196627082	11318	10807	0.1555	0	161802653	161832985	1.38643167504372e-171	196605319	196646263
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	196629822	197878172	585	564	-0.07	1.38643167504372e-171	196605319	196646263	4.22184702426095e-12	197875463	197878172
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197880750	197884226	3	3	0.7465	4.22184702426095e-12	197875463	197878172	3.15602384149151e-11	197884226	197885450
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	197885450	224301992	9549	9110	-0.0683	3.15602384149151e-11	197884226	197885450	1.62016201185797e-68	224280065	224310559
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	224304148	224533665	114	109	0.2585	1.62016201185797e-68	224280065	224310559	1.25061352067317e-68	224526929	224538404
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	224534858	242689978	6625	6318	-0.0828	1.25061352067317e-68	224526929	224538404	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	37953375	12681	12100	-0.1713	NA	NA	NA	1.42650035120393e-35	37953375	37953375
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37954819	1	0	NA	1.42650035120393e-35	37953375	37953375	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37955930	37961110	5	5	-1.29	NA	NA	NA	1.36035684507678e-35	37961110	37961110
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	47460892	3531	3377	-0.1765	1.36035684507678e-35	37961110	37961110	1.45479415054280e-286	47460892	47460892
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-5.1242	1.4547941505428e-286	47460892	47460892	1.19511099195214e-285	47466921	47466921
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	75479859	10656	10201	-0.0873	1.19511099195214e-285	47466921	47466921	3.0691818132476e-26	75474341	75791158
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75875904	18	18	-0.604	3.0691818132476e-26	75474341	75791158	1.13355052313657e-76	75870144	76000715
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	109086361	7873	7517	0.0083	1.13355052313657e-76	75870144	76000715	1.04767604576646e-66	109061699	109095386
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	109090675	109332321	94	91	0.275	1.04767604576646e-66	109061699	109095386	4.9905466289515e-28	109306669	109359304
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	109336048	123711303	4841	4643	0.0501	4.9905466289515e-28	109306669	109359304	0	123694942	123733973
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	123713295	133189686	4007	3837	0.2772	0	123694942	123733973	2.76177908385518e-09	133189686	133189686
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.199	2.76177908385518e-09	133189686	133189686	1.58248094589852e-09	133194685	133194685
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	140817981	2597	2487	0.2802	1.58248094589852e-09	133194685	133194685	0	140811988	140821672
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	140819172	161598804	6567	6302	0.6679	0	140811988	140821672	8.83517725507515e-30	161596536	161606697
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	161599342	161608169	13	13	1.0278	8.83517725507515e-30	161596536	161606697	9.85251810191872e-10	161599841	161611247
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	161608968	164005577	603	572	0.6817	9.85251810191872e-10	161599841	161611247	3.39582249057899e-145	164005577	164005577
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164012645	2	2	-2.5206	3.39582249057899e-145	164005577	164005577	1.48035593531063e-31	164012645	164012645
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164019640	164027724	3	3	-0.6878	1.48035593531063e-31	164012645	164012645	2.78390294455902e-36	164027724	164027724
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	182828075	5923	5669	0.6895	2.78390294455902e-36	164027724	164027724	0	182820616	182835858
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	182831077	194354505	4227	4050	0.3514	0	182820616	182835858	0	194354505	194354505
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-4.5478	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196820428	995	953	0.3479	0	194366950	194366950	2.48758975887360e-10	196803899	196911010
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196822133	196957322	30	28	0.5959	2.4875897588736e-10	196803899	196911010	2.61002888815742e-07	196929805	196983363
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196958467	199253957	929	888	0.3636	2.61002888815742e-07	196929805	196983363	0.000599551574694832	199195290	199288161
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199256407	199329592	26	25	0.1797	0.000599551574694832	199195290	199288161	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	53781	8	7	-0.2297	NA	NA	NA	0.000264133136962688	46828	108016
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	58159	9815760	3385	3237	0.0523	0.000264133136962688	46828	108016	1.11149900050714e-12	9800777	9815760
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	0.8771	1.11149900050714e-12	9800777	9815760	8.1681496672025e-36	9842644	9853710
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34457648	6168	5893	0.0516	8.1681496672025e-36	9842644	9853710	3.21324500038912e-38	34439897	34457648
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34463523	34491115	5	5	0.615	3.21324500038912e-38	34439897	34457648	1.40336699586928e-61	34491115	34509895
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	55208637	5686	5426	0.0634	1.40336699586928e-61	34491115	34509895	0	55201587	55213512
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	55210527	59974335	1233	1175	0.4301	0	55201587	55213512	0	59961416	59992945
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	59986602	64680618	896	850	0.0509	0	59961416	59992945	5.52918870020529e-204	64672942	64697317
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64697317	65246785	133	123	0.5919	5.52918870020529e-204	64672942	64697317	9.07096473224986e-142	65207210	65258148
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	65251596	68905670	915	879	0.1006	9.07096473224986e-142	65207210	65258148	1.08392427235266e-76	68905670	69069651
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	1.1093	1.08392427235266e-76	68905670	69069651	4.56087079243166e-96	69163312	69165814
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	99094856	10095	9646	0.0515	4.56087079243166e-96	69163312	69165814	0	99084104	99116259
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	99102549	106992612	2498	2383	-0.2085	0	99084104	99116259	2.18205296355868e-07	106986141	107000037
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	106999551	107014471	7	7	-0.6353	2.18205296355868e-07	106986141	107000037	1.13052698455058e-07	107009655	107020719
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107016123	118274889	3464	3311	-0.1952	1.13052698455058e-07	107009655	107020719	5.33786457580825e-183	118256803	118311286
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	118284365	119646260	331	320	-0.5171	5.33786457580825e-183	118256803	118311286	1.20080335361055e-12	119633379	119681225
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119649083	119649083	1	0	NA	1.20080335361055e-12	119633379	119681225	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119650402	119817891	23	23	-0.1676	NA	NA	NA	1.15637122799455e-14	119700930	119823738
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119820393	131576115	3084	2960	-0.5119	1.15637122799455e-14	119700930	119823738	0	131525883	131620149
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	131590171	162234201	8466	8098	-0.2152	0	131525883	131620149	3.15075674414569e-145	162234201	162234201
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	162239402	162313725	10	8	-1.9457	3.15075674414569e-145	162234201	162234201	1.80154648681842e-139	162313725	162313725
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	162321802	172451724	3020	2881	-0.2139	1.80154648681842e-139	162313725	162313725	8.3176661392712e-67	172451724	172451724
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	172458094	172473697	4	4	-1.9143	8.3176661392712e-67	172451724	172451724	1.72285537743946e-68	172473697	172473697
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	172483638	172483638	1	0	NA	1.72285537743946e-68	172473697	172473697	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	172497540	187330240	4467	4270	-0.2223	NA	NA	NA	1.13374336040911e-234	187330240	187330240
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-4.6307	1.13374336040911e-234	187330240	187330240	4.35376081977178e-230	187333619	187333619
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1187	-0.2188	4.35376081977178e-230	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	681141	197	190	-0.0078	NA	NA	NA	2.69428815253685e-15	681141	681141
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	1.3214	2.69428815253685e-15	681141	681141	4.25479553087567e-11	686701	689372
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	737829	23	21	0.0355	4.25479553087567e-11	686701	689372	0.000318290276999481	727098	737829
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	819038	5	5	-0.446	0.000318290276999481	727098	737829	1.85332833320273e-05	819038	905462
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	829954	829954	1	0	NA	1.85332833320273e-05	819038	905462	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	12857302	3747	3580	2e-04	NA	NA	NA	2.60420553547195e-07	12853151	12857302
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	0.8076	2.60420553547195e-07	12853151	12857302	6.09944581691936e-08	12873052	13263185
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	15417411	685	656	0.0133	6.09944581691936e-08	12873052	13263185	0	15405041	15429531
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	15429531	20729327	1574	1505	0.5435	0	15405041	15429531	4.05211787460235e-14	20706711	20764816
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	20731640	20989196	42	40	0.2985	4.05211787460235e-14	20706711	20764816	1.06868025583487e-13	20934916	21037318
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	20993078	26147636	1244	1184	0.5209	1.06868025583487e-13	20934916	21037318	0	26137445	26161440
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	26155273	26155273	1	0	NA	0	26137445	26161440	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	26161440	51040169	5940	5652	-0.0237	NA	NA	NA	0	50976914	51095121
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	51050431	73560109	6540	6275	-0.2824	0	50976914	51095121	1.08383795081801e-166	73518808	73614644
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	73567095	75555123	631	599	-0.0503	1.08383795081801e-166	73518808	73614644	1.97151958476805e-07	75555123	75555123
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	75556651	75558706	2	2	-0.8634	1.97151958476805e-07	75555123	75555123	4.56117846103117e-53	75558706	75559826
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	75559826	123654158	13663	13055	-0.0999	4.56117846103117e-53	75558706	75559826	1.27869963844991e-58	123638221	123681817
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	123664764	124078579	97	94	-0.4096	1.27869963844991e-58	123638221	123681817	2.42165800053125e-59	124071443	124084242
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	124081165	127434789	922	882	-0.0999	2.42165800053125e-59	124071443	124084242	6.18919880873266e-13	127434789	127434789
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127439603	3	3	-0.8764	6.18919880873266e-13	127434789	127434789	3.19731398319696e-10	127439603	127442527
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127442527	140203440	4759	4546	-0.0791	3.19731398319696e-10	127439603	127442527	6.29114587283175e-26	140203440	140203440
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140204823	140216524	7	7	-0.8961	6.29114587283175e-26	140203440	140203440	1.90064604755319e-26	140216524	140216524
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	155230328	5340	5118	-0.0975	1.90064604755319e-26	140216524	140216524	8.75463815891115e-07	155227568	155230328
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155232100	155236981	3	3	0.5398	8.75463815891115e-07	155227568	155230328	2.86761432855103e-06	155236981	155240040
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155240040	155405839	53	52	-0.0781	2.86761432855103e-06	155236981	155240040	0.150841717936664	155245328	155405839
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155416484	2	2	0.2297	0.150841717936664	155245328	155405839	4.76597619807826e-25	155416484	155416484
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155418745	155421443	3	3	0.5754	4.76597619807826e-25	155416484	155416484	5.78725187441375e-07	155421443	155427589
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	160166648	1718	1644	-0.0769	5.78725187441375e-07	155421443	155427589	5.00856646406697e-28	160164910	160166648
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	160168056	160208033	12	12	-0.7168	5.00856646406697e-28	160164910	160166648	3.55402852953099e-31	160208033	160209581
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	160209581	161458754	377	362	-0.0788	3.55402852953099e-31	160208033	160209581	4.16269254690968e-61	161440191	161475623
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	161460261	167015034	1064	1016	-0.2668	4.16269254690968e-61	161440191	161475623	9.44729619148944e-12	167012359	167020614
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167016335	167027630	7	7	-0.7901	9.44729619148944e-12	167012359	167020614	8.54380470767216e-11	167024182	167028834
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	167028834	171133684	1819	1743	-0.2268	8.54380470767216e-11	167024182	167028834	0	171116307	171142590
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	171136705	175401806	1328	1277	0.0669	0	171116307	171142590	8.77180748183667e-29	175370453	175401806
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	175491949	175551666	16	16	0.6402	8.77180748183667e-29	175370453	175401806	3.22879513922512e-23	175551666	175589765
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	175589765	180194323	1816	1737	0.0882	3.22879513922512e-23	175551666	175589765	7.93453985837427e-13	180189516	180344964
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180362342	10	10	-0.4348	7.93453985837427e-13	180189516	180344964	6.01485417632650e-11	180358977	180365977
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	105	0.072	6.0148541763265e-11	180358977	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	198124	39	38	-0.1465	NA	NA	NA	3.02644207400057e-11	186875	202063
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	200350	200350	1	0	NA	3.02644207400057e-11	186875	202063	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	230588	11	11	-0.5396	NA	NA	NA	3.70932591471580e-15	230588	234115
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	232366	8704691	3268	3121	-0.0346	3.7093259147158e-15	230588	234115	0	8648842	8769327
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	8713764	8713764	1	0	NA	0	8648842	8769327	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	8723589	26117900	5737	5505	0.1874	NA	NA	NA	1.01336092634640e-57	26116355	26117900
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26119932	26163497	20	19	0.9083	1.0133609263464e-57	26116355	26117900	8.57794841615116e-21	26156229	26167250
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26166088	26811016	289	278	0.4624	8.57794841615116e-21	26156229	26167250	1.27581281304031e-25	26811016	26811016
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.5589	1.27581281304031e-25	26811016	26811016	1.2039249095565e-20	26861184	26861184
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	31385778	1812	1740	0.4457	1.2039249095565e-20	26861184	26861184	2.07910753933236e-15	31385778	31385778
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31390982	3	3	-0.5602	2.07910753933236e-15	31385778	31385778	4.27081703889965e-13	31390982	31390982
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	32558677	492	475	0.4683	4.27081703889965e-13	31390982	31390982	3.15861859997404e-186	32558677	32593151
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32563252	1	0	NA	3.15861859997404e-186	32558677	32593151	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32564884	32633691	16	13	-1.7452	NA	NA	NA	6.57668970454329e-229	32629848	32633691
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	35512952	1222	1163	0.4658	6.57668970454329e-229	32629848	32633691	1.10045190516654e-123	35499807	35534941
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35514101	36886101	641	607	0.7309	1.10045190516654e-123	35499807	35534941	1.64227961429805e-206	36871599	36895955
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	36887429	49417372	4740	4534	0.4678	1.64227961429805e-206	36871599	36895955	0	49405986	49433739
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49420020	53426048	1452	1399	0.7726	0	49405986	49433739	1.31995562717532e-204	53420128	53430596
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	53427536	54035000	240	228	0.367	1.31995562717532e-204	53420128	53430596	2.35444203037831e-28	54035000	54035000
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	1.6203	2.35444203037831e-28	54035000	54035000	4.46287904934358e-32	54042734	54042734
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67055837	2770	2669	0.2968	4.46287904934358e-32	54042734	54042734	5.63691376221355e-33	67048434	67068673
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67060622	67105238	7	7	-0.2448	5.63691376221355e-33	67048434	67068673	2.83849594472188e-09	67086412	67113676
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	74647491	2511	2414	0.2013	2.83849594472188e-09	67086412	67113676	1.7088457744087e-09	74647491	74647491
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74653360	2	2	1.043	1.7088457744087e-09	74647491	74647491	1.34598343089164e-07	74653360	74655219
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74655219	77490500	860	827	0.2299	1.34598343089164e-07	74653360	74655219	0.000110867676456568	77473995	77490500
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	0.7581	0.000110867676456568	77473995	77490500	9.19373291439214e-08	77509983	77517630
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	79018959	279	268	0.1824	9.19373291439214e-08	77509983	77517630	3.9788297461107e-14	79011979	79018959
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.1902	3.9788297461107e-14	79011979	79018959	8.98904614585152e-14	79091850	79101978
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	98515236	5273	5029	0.2265	8.98904614585152e-14	79091850	79101978	1.00221047834924e-20	98515236	98515236
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	98522214	98542531	5	5	-0.5915	1.00221047834924e-20	98515236	98515236	3.26054721465502e-21	98542531	98542531
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	98549452	103841482	1484	1424	0.2143	3.26054721465502e-21	98542531	98542531	2.18955395647867e-19	103841482	103841482
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	1.0767	2.18955395647867e-19	103841482	103841482	1.16355110393209e-19	103868154	103868154
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	104949550	177	166	0.1912	1.16355110393209e-19	103868154	103868154	5.47824196476041e-44	104896395	105030767
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	104956711	112254366	2851	2714	-0.022	5.47824196476041e-44	104896395	105030767	1.37019115448029e-15	112226940	112279264
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	112255632	112510194	85	81	0.1592	1.37019115448029e-15	112226940	112279264	3.59305271293656e-19	112492561	112536988
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	112512104	118576006	1721	1647	-0.0425	3.59305271293656e-19	112492561	112536988	1.77942584630379e-171	118560638	118590723
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	118578708	120244907	580	550	0.2165	1.77942584630379e-171	118560638	118590723	1.4737482593676e-155	120217211	120280373
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	120249327	123939849	1000	968	-0.0522	1.4737482593676e-155	120217211	120280373	6.00989402507563e-07	123919551	123951639
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	123943097	123982642	18	17	-0.3178	6.00989402507563e-07	123919551	123951639	1.73674742258733e-08	123976679	123994417
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	123984230	137578119	5237	5003	-0.0339	1.73674742258733e-08	123976679	123994417	8.96996396775578e-62	137559679	137597081
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	137579565	138436025	213	208	0.1829	8.96996396775578e-62	137559679	137597081	7.21353573133427e-28	138398374	138462888
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	138444664	138919414	221	215	-0.0222	7.21353573133427e-28	138398374	138462888	5.39592389952494e-43	138906322	138932916
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	138920716	140215578	430	407	0.1961	5.39592389952494e-43	138906322	138932916	0	140209662	140226179
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	140218233	170753106	10381	9946	-0.2221	0	140209662	140226179	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	250	-0.0803	NA	NA	NA	5.05483825148945e-15	1038517	1038517
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	1.2046	5.05483825148945e-15	1038517	1038517	0	1047707	1047707
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	48551463	16802	16063	-0.0042	0	1047707	1047707	0	48549993	48551463
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48554059	48562631	7	7	-0.8031	0	48549993	48551463	1.35796687530363e-159	48562631	48562631
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	48572106	81650463	7594	7244	0.0663	1.35796687530363e-159	48562631	48562631	0	81640438	81656453
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	81652306	93162991	3783	3629	0.3943	0	81640438	81656453	6.99149323330225e-12	93162991	93162991
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	1.3297	6.99149323330225e-12	93162991	93162991	2.72379661029526e-09	93168978	93168978
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	100164752	2612	2499	0.4265	2.72379661029526e-09	93168978	93168978	0	100164752	100164752
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100166257	1	0	NA	0	100164752	100164752	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100174991	3	3	-3.8189	NA	NA	NA	3.73176723754942e-311	100174991	100174991
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	118611324	8199	7835	0.4755	3.73176723754942e-311	100174991	100174991	1.43198112550184e-215	118609124	118611324
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118619693	2	2	1.3549	1.43198112550184e-215	118609124	118611324	3.81235280797543e-08	118619693	118622742
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118620875	118620875	1	0	NA	3.81235280797543e-08	118619693	118622742	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3036	0.554	NA	NA	NA	0	125831554	125831554
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-4.2779	0	125831554	125831554	0	125837524	125837524
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	125839386	1	0	NA	0	125837524	125837524	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125840585	128282857	1138	1077	0.5757	NA	NA	NA	2.02805664655053e-13	128279579	128282857
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	128284406	128293395	6	6	1.2205	2.02805664655053e-13	128279579	128282857	2.04792081881967e-13	128293395	128296223
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	128296223	133433384	2509	2384	0.5872	2.04792081881967e-13	128293395	128296223	1.87896328395017e-16	133426996	133433384
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	7	1.2338	1.87896328395017e-16	133426996	133433384	2.27014738804165e-32	133448277	133455682
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	133453811	1	0	NA	2.27014738804165e-32	133448277	133455682	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133455682	141690753	3829	3682	0.5432	NA	NA	NA	1.49272639542708e-35	141690753	141690753
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.3314	1.49272639542708e-35	141690753	141690753	1.04465020739437e-31	141714168	141714168
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142161005	170	164	0.5931	1.04465020739437e-31	141714168	141714168	2.51589119153887e-16	142161005	142161005
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142166710	142167908	3	3	-0.3305	2.51589119153887e-16	142161005	142161005	1.44861973569397e-11	142167908	142176074
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	145624787	1318	1266	0.4922	1.44861973569397e-11	142167908	142176074	1.65756601796817e-96	145623104	145628790
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145628790	145720817	44	42	-0.14	1.65756601796817e-96	145623104	145628790	1.00859016408774e-122	145719392	145723569
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145723569	147702365	977	928	0.5382	1.00859016408774e-122	145719392	145723569	5.90883753230767e-14	147702365	147718415
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147721474	10	10	0.011	5.90883753230767e-14	147702365	147718415	2.27137704282593e-38	147707161	147721474
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147723783	151728811	1622	1544	0.6193	2.27137704282593e-38	147707161	147721474	5.55514045835212e-24	151728811	151730250
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	7	-0.2373	5.55514045835212e-24	151728811	151730250	2.61851975534885e-27	151740878	151743145
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	156483966	1543	1478	0.6367	2.61851975534885e-27	151740878	151743145	3.51761814878835e-27	156483966	156485711
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	3	1.9936	3.51761814878835e-27	156483966	156485711	1.49948895293497e-24	156488598	156490484
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	1006	0.6379	1.49948895293497e-24	156488598	156490484	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	115	-0.2531	NA	NA	NA	5.49407154865457e-16	581533	581533
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.8874	5.49407154865457e-16	581533	581533	3.06373033180489e-26	588865	588865
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2022181	542	518	-0.2448	3.06373033180489e-26	588865	588865	2.28675436648577e-22	2022181	2022181
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2024319	2034042	7	6	-1.0673	2.28675436648577e-22	2022181	2022181	2.44958280176307e-21	2034042	2035440
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2035440	6926661	1721	1654	-0.2569	2.44958280176307e-21	2034042	2035440	1.90360766179613e-21	6909487	7226901
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7824059	10	10	0.3759	1.90360766179613e-21	6909487	7226901	2.04982724945645e-18	7729311	8137794
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	9531510	482	462	-0.2158	2.04982724945645e-18	7729311	8137794	3.2831719834336e-18	9531510	9531510
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9533226	9533226	1	0	NA	3.2831719834336e-18	9531510	9531510	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	3	-1.268	NA	NA	NA	1.22011255141475e-16	9538031	9538031
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	25120552	5272	5052	-0.2354	1.22011255141475e-16	9538031	9538031	1.09114513937506e-27	25120552	25120552
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.0871	1.09114513937506e-27	25120552	25120552	1.08672486405888e-26	25125700	25125700
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	25127887	1	0	NA	1.08672486405888e-26	25125700	25125700	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25129043	32538286	2890	2757	-0.2269	NA	NA	NA	2.23091400675551e-47	32526552	32550276
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32541012	32882718	158	149	0.0251	2.23091400675551e-47	32526552	32550276	4.99880764287959e-05	32872175	32887553
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32885018	32885018	1	0	NA	4.99880764287959e-05	32872175	32887553	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32887553	32898082	6	6	0.382	NA	NA	NA	8.2848960680438e-05	32893150	32904626
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32900958	33287156	71	69	0.0091	8.2848960680438e-05	32893150	32904626	2.01110794307224e-18	33246837	33307589
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	33292366	33633739	152	144	0.2721	2.01110794307224e-18	33246837	33307589	1.15626508472626e-60	33617353	33655224
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	33638629	35928497	606	588	-0.011	1.15626508472626e-60	33617353	33655224	3.39625662483035e-148	35891100	36013545
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	35937423	39350798	1027	979	0.2444	3.39625662483035e-148	35891100	36013545	3.25196386309676e-126	39345557	39352361
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.8837	3.25196386309676e-126	39345557	39352361	5.85233888845317e-131	39504332	39508035
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	51191560	2179	2084	0.2418	5.85233888845317e-131	39504332	39508035	1.42999989341264e-22	51191560	51191560
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.7601	1.42999989341264e-22	51191560	51191560	0	51200291	51200291
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	120200780	20908	20055	0.2483	0	51200291	51200291	0	120188940	120211995
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	120204232	129455746	3068	2945	0.5899	0	120188940	120211995	1.86505163480848e-86	129450827	129465108
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	129465108	129822643	58	55	1.1002	1.86505163480848e-86	129450827	129465108	2.13309376217156e-85	129816064	129859478
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	129859478	131066962	366	351	0.565	2.13309376217156e-85	129816064	129859478	6.73926048749018e-11	131045238	131078251
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131070513	131165834	46	45	0.7726	6.73926048749018e-11	131045238	131078251	0.0155560345531702	131122644	131165834
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131167876	131170662	3	3	0.4598	0.0155560345531702	131122644	131165834	4.12972319106882e-16	131170662	131170662
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131172037	131174041	2	2	0.6936	4.12972319106882e-16	131170662	131170662	3.59938571506393e-101	131174041	131382146
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	131176443	146264846	4799	4582	0.4711	3.59938571506393e-101	131174041	131382146	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	10302003	3815	3664	-0.2425	NA	NA	NA	2.22660297504709e-15	10300712	10302003
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	10303797	10318756	8	7	0.3707	2.22660297504709e-15	10300712	10302003	1.87143568075422e-14	10318756	10321952
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	10321952	15802255	1635	1547	-0.2345	1.87143568075422e-14	10318756	10321952	5.39798091623381e-46	15802255	15802255
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	1.7595	5.39798091623381e-46	15802255	15802255	1.07899470820710e-42	15807123	15807123
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22910921	2468	2367	-0.2205	1.0789947082071e-42	15807123	15807123	2.49891362987813e-17	22896265	22925576
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22915748	23077381	29	28	-0.5628	2.49891362987813e-17	22896265	22925576	1.00005539175818e-10	23032305	23092507
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23082002	23343915	43	42	-0.2431	1.00005539175818e-10	23032305	23092507	3.00115086471059e-15	23343915	23343915
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.6279	3.00115086471059e-15	23343915	23343915	4.23037785623144e-13	23365926	23365926
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	32345205	2222	2122	-0.2349	4.23037785623144e-13	23365926	23365926	1.30533553428620e-93	32329590	32365411
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	32349951	33044597	291	274	0.0172	1.3053355342862e-93	32329590	32365411	2.50634837475326e-61	33025827	33061478
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	33047232	70221479	2245	2133	-0.2026	2.50634837475326e-61	33025827	33061478	4.37056143617664e-52	67910461	70240985
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70223138	70926188	311	294	-0.0074	4.37056143617664e-52	67910461	70240985	1.48092147393669e-13	70926188	70926188
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70935055	3	3	0.8268	1.48092147393669e-13	70926188	70926188	3.15161346413898e-11	70935055	70935055
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70939069	72878785	828	794	0.0238	3.15161346413898e-11	70935055	70935055	2.42448277030880e-28	72861659	72902250
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	72881631	73060367	88	78	-0.2365	2.4244827703088e-28	72861659	72902250	2.93685374962493e-29	73042764	73070334
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	73061523	75410497	912	885	0.0146	2.93685374962493e-29	73042764	73070334	0	75400644	75422581
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75415435	84609373	2699	2605	0.5294	0	75400644	75422581	0	84603216	84613073
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	84613073	85786764	438	419	0.0104	0	84603216	84613073	1.12851054701463e-63	85778895	85800829
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	85788078	86960197	394	380	-0.2216	1.12851054701463e-63	85778895	85800829	1.42195776393385e-11	86960197	86960197
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	0.7725	1.42195776393385e-11	86960197	86960197	3.97758606822759e-10	86965458	86965458
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	116124007	10106	9671	-0.223	3.97758606822759e-10	86965458	86965458	7.36883351754679e-07	116122595	116124007
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116132839	3	3	-0.9026	7.36883351754679e-07	116122595	116124007	1.07795547282653e-32	116132839	116137111
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116137111	137352394	8294	7915	-0.1954	1.07795547282653e-32	116132839	116137111	1.2703986676645e-32	137352394	137352394
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.0458	1.2703986676645e-32	137352394	137352394	1.74586262503342e-10	137356880	137356880
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1061	-0.1429	1.74586262503342e-10	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	11810266	3946	3774	0.2037	NA	NA	NA	0	11794995	11827586
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	11820472	26364811	5526	5267	0.4943	0	11794995	11827586	2.64752020782829e-06	26355340	26380327
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26366253	26366253	1	0	NA	2.64752020782829e-06	26355340	26380327	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26366341	26392771	12	12	0.1806	NA	NA	NA	2.85975085549613e-05	26381520	26417130
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	26395501	27241104	327	309	0.4557	2.85975085549613e-05	26381520	26417130	8.83038900462168e-07	27233823	27241104
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27248943	27264269	3	3	1.0616	8.83038900462168e-07	27233823	27241104	0.000156850194174141	27259830	27277345
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27271564	27577201	131	126	0.4827	0.000156850194174141	27259830	27277345	9.44634802795342e-46	27564282	27589023
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27577470	50534755	5342	5081	0.2264	9.44634802795342e-46	27564282	27589023	2.51348414367990e-10	50529926	50540067
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	50538785	50559521	9	9	0.688	2.5134841436799e-10	50529926	50540067	1.59348062226148e-80	50555052	50567357
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	50560007	68584044	5334	5097	0.2827	1.59348062226148e-80	50555052	50567357	0	68565667	68609830
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	68585387	74890306	2623	2504	0.0545	0	68565667	68609830	1.30213930230113e-25	74882719	74899516
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	74893216	74963547	36	34	-0.3203	1.30213930230113e-25	74882719	74899516	8.24220951955801e-26	74957303	74971083
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	74965426	77917893	1302	1237	0.0524	8.24220951955801e-26	74957303	74971083	4.65450713533426e-81	77917893	77917893
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	2.2308	4.65450713533426e-81	77917893	77917893	1.28961382184643e-81	77928738	77928738
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	91082781	3996	3832	0.0288	1.28961382184643e-81	77928738	77928738	1.23984408453209e-28	91065734	91106959
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	91085457	91239804	70	66	-0.2543	1.23984408453209e-28	91065734	91106959	8.36872142064497e-32	91229639	91247617
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	91241978	100676022	3696	3541	0.0393	8.36872142064497e-32	91229639	91247617	1.45244728501309e-26	100676022	100676022
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-1.0412	1.45244728501309e-26	100676022	100676022	2.9534234978393e-25	100686787	100686787
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	110516016	3624	3472	0.026	2.9534234978393e-25	100686787	100686787	6.76143058112689e-236	110449802	110589663
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	110519957	110519957	1	0	NA	6.76143058112689e-236	110449802	110589663	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	110525961	116155267	1825	1728	0.217	NA	NA	NA	4.57592048579211e-241	116128347	116177576
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	116157402	124337128	3119	2971	0.0192	4.57592048579211e-241	116128347	116177576	3.05774365344244e-09	124337128	124337128
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337860	124340356	2	2	-0.9034	3.05774365344244e-09	124337128	124337128	8.46876780646597e-09	124340356	124340356
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	124368725	1	0	NA	8.46876780646597e-09	124340356	124340356	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124370487	127563278	1157	1116	0.0151	NA	NA	NA	1.59055381376771e-08	127556450	127575540
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127590461	12	11	-0.3745	1.59055381376771e-08	127556450	127575540	5.12349411282377e-08	127581493	127607438
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127592138	131649044	1415	1345	0.006	5.12349411282377e-08	127581493	127607438	2.908155467419e-12	131649044	131649044
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	131650218	131650218	1	0	NA	2.908155467419e-12	131649044	131649044	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	131651597	131652807	2	2	1.0912	NA	NA	NA	1.08863668600973e-09	131652807	131652807
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	131654669	135285645	1288	1232	0.0104	1.08863668600973e-09	131652807	131652807	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2055	-0.1588	NA	NA	NA	3.29020974765322e-124	5741031	5741031
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	14	-1.6376	3.29020974765322e-124	5741031	5741031	9.50077981312074e-159	5765438	5765438
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	18311104	4988	4755	-0.1881	9.50077981312074e-159	5765438	5765438	2.15076326096147e-08	18309008	18314551
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18314551	18321721	5	5	-0.7644	2.15076326096147e-08	18309008	18314551	3.50434273744992e-09	18317427	18325507
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18325507	51239273	9668	9233	-0.2077	3.50434273744992e-09	18317427	18325507	3.16563210296509e-36	50326188	54807283
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	51241169	55123719	92	84	0.0768	3.16563210296509e-36	50326188	54807283	1.57321785003449e-227	55123719	55124730
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55217189	39	37	-4.7265	1.57321785003449e-227	55123719	55124730	0	55209626	55217189
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	64942386	3953	3781	0.1891	0	55209626	55217189	2.16287301235606e-32	64937613	64942386
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	64943449	64951009	6	6	0.6522	2.16287301235606e-32	64937613	64942386	2.42911881357146e-07	64951009	64951009
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	64952572	64958281	6	6	0.2314	2.42911881357146e-07	64951009	64951009	2.56860931082925e-06	64956298	64958281
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	64958943	64962284	5	5	0.5241	2.56860931082925e-06	64956298	64958281	4.61802509635733e-05	64962284	64965868
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	64963765	65003889	26	24	0.1837	4.61802509635733e-05	64962284	64965868	1.50549278211420e-08	64998691	65005694
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65005694	65031336	12	12	0.5509	1.5054927821142e-08	64998691	65005694	1.39772897476412e-05	65027514	65052102
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65034880	66463477	629	607	0.2334	1.39772897476412e-05	65027514	65052102	2.08619803812585e-15	66463477	66463477
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.4929	2.08619803812585e-15	66463477	66463477	7.00945626858576e-19	66469412	66469412
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	66977728	214	205	0.2234	7.00945626858576e-19	66469412	66469412	1.90177237905991e-54	66958213	67006558
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66981036	76491160	3625	3488	-0.0021	1.90177237905991e-54	66958213	67006558	0	76462721	76510490
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	76492756	106733851	9559	9118	0.203	0	76462721	76510490	1.12190495766112e-28	106729616	106733851
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106747920	4	4	0.7056	1.12190495766112e-28	106729616	106733851	3.19889267969075e-94	106747920	106754784
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	134450318	10318	9875	0.1266	3.19889267969075e-94	106747920	106754784	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	7324056	3059	2942	0.8976	NA	NA	NA	1.2311098715924e-142	7301693	7344674
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7343016	7859302	178	165	0.4827	1.2311098715924e-142	7301693	7344674	1.24869456467906e-11	7826281	7884886
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7859373	8023055	62	58	0.6933	1.24869456467906e-11	7826281	7884886	7.98252214362998e-15	8005058	8055254
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8025153	9523923	443	427	0.4766	7.98252214362998e-15	8005058	8055254	0	9523923	9523923
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	-4.995	0	9523923	9523923	5.23845244320685e-44	9554149	9554149
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	10	-1.1607	5.23845244320685e-44	9554149	9554149	1.9640514492497e-144	9610054	9610054
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	10462211	326	311	0.4289	1.9640514492497e-144	9610054	9610054	2.05358635578198e-65	10462211	10464018
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10464018	10485848	10	9	-0.763	2.05358635578198e-65	10462211	10464018	1.22011455083987e-50	10484956	10485848
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	10491341	11104973	231	227	0.4349	1.22011455083987e-50	10484956	10485848	1.32728999189888e-23	11104973	11104973
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11116883	4	4	1.482	1.32728999189888e-23	11104973	11104973	2.17965961318545e-16	11116883	11116883
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	2.8114	2.17965961318545e-16	11116883	11116883	1.01257823365900e-115	11140421	11140421
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11224968	27	26	0.5792	1.012578233659e-115	11140421	11140421	0.00130196487370927	11190308	11247374
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11226237	11389830	41	40	0.3784	0.00130196487370927	11190308	11247374	0.00112927388808566	11354935	11389830
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11393473	11395862	2	0	NA	0.00112927388808566	11354935	11389830	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11433210	5	5	0.0233	NA	NA	NA	2.35691875055049e-06	11433210	11452868
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11435643	11435643	1	0	NA	2.35691875055049e-06	11433210	11452868	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	12422129	390	372	0.4773	NA	NA	NA	5.22794087250749e-12	12419910	12422129
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12423720	12433043	5	5	-0.1404	5.22794087250749e-12	12419910	12422129	4.77834711205493e-11	12433043	12435301
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12435301	16847627	1775	1702	0.4685	4.77834711205493e-11	12433043	12435301	0	16828083	16868227
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	16856323	31132716	4572	4376	0.0214	0	16828083	16868227	1.16194570325052e-25	31084265	31173065
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31132762	31242528	19	19	-0.4488	1.16194570325052e-25	31084265	31173065	5.33774396498065e-27	31231952	31246624
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31245432	33184017	749	705	0.0509	5.33774396498065e-27	31231952	31246624	9.45917156624865e-21	33184017	33184017
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-1.2865	9.45917156624865e-21	33184017	33184017	1.43352802823842e-18	33198331	33198331
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	38163360	578	557	0.0164	1.43352802823842e-18	33198331	33198331	8.7022545408831e-107	38121632	38216593
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	38175220	41303729	1161	1118	0.2299	8.7022545408831e-107	38121632	38216593	6.08481280450977e-15	41303729	41303729
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41307749	41312478	3	3	-0.6439	6.08481280450977e-15	41303729	41303729	5.74705755996944e-14	41312478	41312478
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41315922	46992235	1817	1721	0.2329	5.74705755996944e-14	41312478	41312478	4.80951476981595e-07	46988969	46992235
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-0.5405	4.80951476981595e-07	46988969	46992235	1.03980045933727e-06	46996769	46998876
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	51671726	2086	1993	0.2579	1.03980045933727e-06	46996769	46998876	5.66560581731773e-05	51665955	51671726
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51673863	51681530	4	4	-0.2334	5.66560581731773e-05	51665955	51671726	0.0173165758824544	51673917	51809820
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51685276	56200525	1961	1868	0.0377	0.0173165758824544	51673917	51809820	6.74929101008592e-06	56197453	56200525
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	56201161	56204660	5	5	0.5229	6.74929101008592e-06	56197453	56200525	2.19357111474565e-08	56204660	56206844
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	56205163	56320481	68	65	0	2.19357111474565e-08	56204660	56206844	1.01036623962631e-08	56320481	56320481
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	56348316	56355483	2	2	-0.8155	1.01036623962631e-08	56320481	56320481	1.83451257754052e-07	56355483	56360197
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	56360197	77359710	6450	6154	0.001	1.83451257754052e-07	56355483	56360197	0	77324014	77386544
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	77363814	80662066	1280	1238	-0.2734	0	77324014	77386544	1.06231093086962e-10	80662066	80662066
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-1.2175	1.06231093086962e-10	80662066	80662066	6.28215643540768e-10	80666751	80666751
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	85984276	1403	1354	-0.2749	6.28215643540768e-10	80666751	80666751	0	85926752	86030369
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	85992625	97504486	3356	3221	-0.0136	0	85926752	86030369	6.49548289317167e-12	97497115	97508090
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	97508090	97523341	9	9	-0.4776	6.49548289317167e-12	97497115	97508090	1.64055663863013e-14	97522206	97524663
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	97524663	98316278	368	358	0.0037	1.64055663863013e-14	97522206	97524663	9.7988893018767e-30	98316278	98316278
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98318378	98320165	3	3	-1.1758	9.7988893018767e-30	98316278	98316278	4.08491158038003e-22	98320165	98320165
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98327582	124205755	9961	9546	0.0144	4.08491158038003e-22	98320165	98320165	6.89159868387628e-33	124205755	124205755
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	124209793	124216867	4	4	-1.2359	6.89159868387628e-33	124205755	124205755	2.92752360821882e-60	124216867	124216867
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	124220657	130936199	2161	2070	0.1398	2.92752360821882e-60	124216867	124216867	1.78923609652262e-55	130936199	130936199
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130943064	130943064	1	0	NA	1.78923609652262e-55	130936199	130936199	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.5364	NA	NA	NA	4.95973114788937e-54	130946248	130946248
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	520	0.2045	4.95973114788937e-54	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	18348833	2	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18350392	31428172	4882	4682	-0.1851	NA	NA	NA	4.09192355253904e-41	31428172	31428172
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31431833	31436314	2	2	-2.1685	4.09192355253904e-41	31428172	31428172	2.90122187057358e-46	31436314	31436314
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31441218	36717348	2122	2033	-0.1948	2.90122187057358e-46	31436314	31436314	7.65903113280609e-08	36717348	36717348
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36719486	36729002	2	2	-1.0285	7.65903113280609e-08	36717348	36717348	5.5350547362662e-08	36729002	36734427
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36734427	49964838	5209	4971	-0.1886	5.5350547362662e-08	36729002	36734427	1.38953697530908e-35	49964838	49964838
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-1.9249	1.38953697530908e-35	49964838	49964838	1.75084136380529e-33	49971732	49971732
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1718	-0.2	1.75084136380529e-33	49971732	49971732	3.38831958585999e-17	56610886	56660235
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56657371	1	0	NA	3.38831958585999e-17	56610886	56660235	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56681665	13	13	0.2802	NA	NA	NA	2.02879846909547e-16	56679017	56686863
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	71375082	3624	3468	-0.195	2.02879846909547e-16	56679017	56686863	4.06634024272326e-252	71375082	71375082
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.8489	4.06634024272326e-252	71375082	71375082	5.14266929880295e-286	71377671	71377671
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4425	-0.1781	5.14266929880295e-286	71377671	71377671	2.16980735207761e-08	89657473	89659397
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	0.6504	2.16980735207761e-08	89657473	89659397	3.11717771272515e-07	89662326	89663261
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	100690991	4785	4575	-0.1552	3.11717771272515e-07	89662326	89663261	1.20050647326298e-50	100690991	100690991
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.9052	1.20050647326298e-50	100690991	100690991	7.9975936276238e-48	100693892	100693892
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4352	-0.1638	7.9975936276238e-48	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18537177	5	5	0.9041	NA	NA	NA	2.05096480806161e-13	18527871	18544772
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18544772	19494416	55	54	0.0167	2.05096480806161e-13	18527871	18544772	2.69954685434374e-14	19469681	19548246
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21605129	1026	981	0.2511	2.69954685434374e-14	19469681	19548246	1.77106156541126e-101	21592140	21608294
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21606819	22047168	224	215	0.5762	1.77106156541126e-101	21592140	21608294	7.18495370202866e-163	22042671	22051630
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22048569	30296409	2525	2411	0.2099	7.18495370202866e-163	22042671	22051630	4.8542891371577e-290	30267437	30331253
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	30298571	34674458	1915	1826	0.4237	4.8542891371577e-290	30267437	30331253	0	34674458	34674458
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-5.5309	0	34674458	34674458	0	34683810	34683810
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	57948323	7182	6852	0.3171	0	34683810	34683810	2.8176854400072e-224	57917111	57964766
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	57950850	57967086	7	7	0.6165	2.8176854400072e-224	57917111	57964766	3.2323876383081e-50	57967086	57970611
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	57968846	68283817	4306	4107	0.0407	3.2323876383081e-50	57967086	57970611	0	68270094	68302129
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	68286997	98072365	11282	10778	-0.2041	0	68270094	68302129	2.650795192382e-188	98006033	98159341
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	98080958	100478580	1079	1027	-0.4003	2.650795192382e-188	98006033	98159341	1.63648971445264e-262	100467404	100491792
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	100479441	105597555	2033	1947	-0.1089	1.63648971445264e-262	100467404	100491792	2.07203200959403e-79	105597555	105597555
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-1.3038	2.07203200959403e-79	105597555	105597555	6.76626614596135e-35	105632168	105632168
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	46	-0.2796	6.76626614596135e-35	105632168	105632168	1.76359202295401e-10	105846004	105872360
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	-0.9801	1.76359202295401e-10	105846004	105872360	1.80958621829339e-11	105874293	105881893
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105923159	13	13	-0.1865	1.80958621829339e-11	105874293	105881893	0.000919459321608025	105908702	105961558
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105923686	105998412	20	18	0.0872	0.000919459321608025	105908702	105961558	7.22980494674102e-06	105994646	106032666
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106002179	106358491	143	134	-0.1951	7.22980494674102e-06	105994646	106032666	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19465359	98	95	-0.017	NA	NA	NA	1.09432213795473e-38	19430207	19803092
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20310916	60	57	0.4889	1.09432213795473e-38	19430207	19803092	1.55257562360944e-101	20079935	20321772
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20316992	69260389	19129	18271	-0.0718	1.55257562360944e-101	20079935	20321772	1.81335114553442e-13	69260389	69260389
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69262017	69264503	2	2	-1.1936	1.81335114553442e-13	69260389	69260389	1.59538152509594e-28	69264503	69264503
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69266172	81875274	5014	4810	-0.0747	1.59538152509594e-28	69264503	69264503	2.50963713656233e-59	81795886	81892966
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	81878353	82332155	206	197	0.1716	2.50963713656233e-59	81795886	81892966	1.13283471877263e-17	82332155	82332155
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-1.0213	1.13283471877263e-17	82332155	82332155	1.39608719383096e-15	82334704	82334704
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	99632987	6537	6270	0.1486	1.39608719383096e-15	82334704	82334704	4.91174869316715e-79	99632987	99632987
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.7402	4.91174869316715e-79	99632987	99632987	1.51781683407319e-72	99635701	99635701
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	266	0.0871	1.51781683407319e-72	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	446	0.078	NA	NA	NA	8.49376433762862e-09	1296506	1296767
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.1308	8.49376433762862e-09	1296506	1296767	2.78906229642197e-10	1300341	1300341
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	1402670	42	41	2e-04	2.78906229642197e-10	1300341	1300341	3.8955568405478e-06	1400813	1402670
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1406020	1410910	3	3	0.6882	3.8955568405478e-06	1400813	1402670	8.64467044940554e-07	1410910	1415549
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1415549	17393790	5583	5335	0.0125	8.64467044940554e-07	1410910	1415549	5.05136749158359e-209	17373518	17413960
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	17395679	20875871	976	923	0.2342	5.05136749158359e-209	17373518	17413960	0	20871544	20881363
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	20877490	31862577	3493	3347	-0.1931	0	20871544	20881363	5.28850637998635e-08	31818957	32481309
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	32809658	18	18	-0.5043	5.28850637998635e-08	31818957	32481309	2.04600658448306e-05	32558526	32809658
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33278944	33320529	3	3	-0.0658	2.04600658448306e-05	32558526	32809658	5.43441798293382e-05	33320529	33348511
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33348511	33830585	27	26	-0.6086	5.43441798293382e-05	33320529	33348511	1.09065476749497e-44	33647856	33841331
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33841331	52962547	2767	2640	-0.0889	1.09065476749497e-44	33647856	33841331	4.04652842118344e-33	52962547	52962547
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	52968532	52974457	2	2	-1.3058	4.04652842118344e-33	52962547	52962547	3.76841725156241e-16	52974457	52974457
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	52981789	54292145	283	271	-0.1338	3.76841725156241e-16	52974457	52974457	5.74454364036374e-08	54272600	54310220
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54293885	54365385	29	27	-0.3716	5.74454364036374e-08	54272600	54310220	5.06307778607973e-07	54339225	54408446
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54366535	66412305	3587	3442	-0.1479	5.06307778607973e-07	54339225	54408446	1.15234441132585e-09	66401386	66416121
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	66413998	66429657	10	10	-0.5271	1.15234441132585e-09	66401386	66416121	5.7740761857988e-08	66427165	66435467
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	66431318	69401319	1266	1195	-0.11	5.7740761857988e-08	66427165	66435467	8.22616525399026e-85	69393513	69409493
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69402880	69758635	161	156	0.2413	8.22616525399026e-85	69393513	69409493	1.25942235451815e-118	69752244	69765453
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69761372	74109031	1502	1419	-0.1395	1.25942235451815e-118	69752244	69765453	1.71755637878902e-09	74103442	74109031
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74110599	74122039	7	7	-0.635	1.71755637878902e-09	74103442	74109031	2.05638319242737e-09	74122039	74127552
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	74124510	75092501	288	276	-0.1569	2.05638319242737e-09	74122039	74127552	6.48590915922968e-119	75092501	75092501
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75093957	1	0	NA	6.48590915922968e-119	75092501	75092501	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-3.2761	NA	NA	NA	2.14382896381551e-114	75100865	75100865
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	585	-0.151	2.14382896381551e-114	75100865	75100865	4.9594889423142e-42	76925748	76925748
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76942679	9	9	0.7589	4.9594889423142e-42	76925748	76925748	9.76086706783638e-38	76942679	76942679
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	87892700	4148	3950	-0.1592	9.76086706783638e-38	76942679	76942679	8.2465564865465e-12	87857674	87910423
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87894715	88000069	50	47	0.0518	8.2465564865465e-12	87857674	87910423	1.50543473187499e-11	87982353	88019298
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88001800	88690571	314	296	-0.1845	1.50543473187499e-11	87982353	88019298	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027736	416	406	0.0406	NA	NA	NA	1.14369734586132e-31	1027736	1027736
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1028979	1028979	1	0	NA	1.14369734586132e-31	1027736	1027736	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.7483	NA	NA	NA	1.73531540086584e-26	1030766	1030766
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	419	0.0666	1.73531540086584e-26	1030766	1030766	1.05191991415824e-16	1904451	1904451
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.1602	1.05191991415824e-16	1904451	1904451	3.83414349694940e-17	1906391	1906391
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	9712108	3386	3246	0.0472	3.8341434969494e-17	1906391	1906391	0	9698078	9722477
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	9714749	15727076	2059	1969	-0.2186	0	9698078	9722477	2.79911678023135e-12	15727076	15727076
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	0.8501	2.79911678023135e-12	15727076	15727076	9.7110428873541e-11	15733964	15733964
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	31457889	5733	5493	-0.1948	9.7110428873541e-11	15733964	15733964	6.61443491882898e-23	31447686	31467971
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.6973	6.61443491882898e-23	31447686	31467971	1.05501579150349e-24	31493990	31889566
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36673853	1815	1730	-0.1709	1.05501579150349e-24	31493990	31889566	0	36673853	36673853
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-4.4845	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	39436938	1187	1112	-0.1509	0	36684619	36684619	5.17887008557505e-05	39426653	39440037
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	39440037	39451235	6	6	-0.5791	5.17887008557505e-05	39426653	39440037	1.34982909253685e-05	39448754	39458700
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	39451745	40874079	614	589	-0.1495	1.34982909253685e-05	39448754	39458700	5.09711127442259e-11	40869151	40874079
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41007660	41031191	6	5	-0.8016	5.09711127442259e-11	40869151	40874079	1.11541042249533e-08	41031191	41066163
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41521544	199	193	-0.1322	1.11541042249533e-08	41031191	41066163	5.23328359189004e-16	41515622	41522429
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41522429	41568539	21	20	-0.5912	5.23328359189004e-16	41515622	41522429	4.66659819404394e-06	41561017	41581624
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	41708551	44	44	-0.8754	4.66659819404394e-06	41561017	41581624	3.53130999797731e-124	41706870	42142363
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41710400	41710400	1	0	NA	3.53130999797731e-124	41706870	42142363	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	74875257	12208	11705	-0.1342	NA	NA	NA	3.59432594007254e-48	74872990	74875257
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74877854	74877854	1	0	NA	3.59432594007254e-48	74872990	74875257	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74880525	74904114	14	14	0.687	NA	NA	NA	2.74690835466484e-43	74904114	74905971
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	74905971	78617761	1445	1371	-0.125	2.74690835466484e-43	74904114	74905971	0.0646269122919551	78501630	78633619
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78618887	78653545	11	10	0.0939	0.0646269122919551	78501630	78633619	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	170	0.0115	NA	NA	NA	4.76984943654392e-08	500897	500897
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	0.8816	4.76984943654392e-08	500897	500897	0	505456	506827
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	53092949	16022	15323	-0.0537	0	505456	506827	0	53090140	53092949
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	0.7298	0	53090140	53092949	6.76608226282992e-212	53099601	53101512
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6445	-0.0256	6.76608226282992e-212	53099601	53101512	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	210395	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	216768	1191598	386	368	-0.0799	NA	NA	NA	4.49228952348003e-41	1191598	1191598
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1193659	1198432	3	0	NA	4.49228952348003e-41	1191598	1191598	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1200840	1202176	2	2	2.1322	NA	NA	NA	1.72171231608379e-37	1202176	1202176
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1203447	1398325	100	95	-0.1176	1.72171231608379e-37	1202176	1202176	6.22778874927072e-40	1398325	1398325
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.2224	6.22778874927072e-40	1398325	1398325	2.61938731890318e-44	1400840	1400840
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	2820067	680	647	-0.1162	2.61938731890318e-44	1400840	1400840	9.6671866140194e-47	2820067	2820067
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	2824379	2829316	4	4	-1.8153	9.6671866140194e-47	2820067	2820067	3.06059595554106e-52	2829316	2829316
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	2831131	4863575	973	926	-0.1507	3.06059595554106e-52	2829316	2829316	2.73519865063497e-08	4861668	4863575
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4864733	4865384	2	2	0.8064	2.73519865063497e-08	4861668	4863575	5.16701185590691e-08	4865384	4865384
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4866121	11448975	3019	2890	-0.1565	5.16701185590691e-08	4865384	4865384	2.77217339454438e-34	11448975	11448975
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.7872	2.77217339454438e-34	11448975	11448975	2.11082424393977e-38	11452390	11452390
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	11891730	166	164	-0.1835	2.11082424393977e-38	11452390	11452390	2.23163706779035e-32	11891730	11891730
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11901947	11903427	2	2	-1.9814	2.23163706779035e-32	11891730	11891730	3.21154453617718e-23	11903427	11903427
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11919492	12027913	42	39	-0.1641	3.21154453617718e-23	11903427	11903427	3.25520366450065e-08	11999663	12052936
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12030199	15177401	1426	1366	0.0591	3.25520366450065e-08	11999663	12052936	2.84505128230257e-178	15170876	15183336
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15179782	15179782	1	0	NA	2.84505128230257e-178	15170876	15183336	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15181091	15599929	221	211	0.5152	NA	NA	NA	2.48535189969778e-32	15563512	15632023
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15601421	19694025	1995	1924	0.3257	2.48535189969778e-32	15563512	15632023	1.35839697909509e-12	19692626	19694025
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	1.2815	1.35839697909509e-12	19692626	19694025	1.14862356651530e-23	19700620	19700620
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	39050505	3048	2917	0.2666	1.1486235665153e-23	19700620	19700620	0	38999738	39091852
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	39057993	56823430	7795	7401	0.0304	0	38999738	39091852	2.00007006757296e-53	56823430	56823430
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-1.1467	2.00007006757296e-53	56823430	56823430	2.02159784988612e-50	56840346	56840346
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	57815587	484	466	-0.0179	2.02159784988612e-50	56840346	56840346	2.61042030399086e-41	57805104	57836273
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57828461	58213220	104	100	0.2977	2.61042030399086e-41	57805104	57836273	1.69967161789645e-06	58203159	58213220
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58214720	58241773	12	12	-0.0268	1.69967161789645e-06	58203159	58213220	5.65825763453187e-14	58239871	58310993
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58244012	59421197	575	553	0.195	5.65825763453187e-14	58239871	58310993	3.0157590182465e-20	59414645	59421197
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59422642	59434202	9	9	-0.3616	3.0157590182465e-20	59414645	59421197	1.58433283233999e-34	59434202	59441741
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1926	0.1077	1.58433283233999e-34	59434202	59441741	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	561	0.2117	NA	NA	NA	1.91479767042977e-166	1506379	1515948
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	7	-2.42	1.91479767042977e-166	1506379	1515948	1.16102514657315e-236	1525300	1531162
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	6703758	1959	1873	0.2437	1.16102514657315e-236	1525300	1531162	0	6681501	6717170
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	6705571	22075218	5387	5166	0.0245	0	6681501	6717170	1.27422681361449e-212	21997387	22185743
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	22087369	26147112	1093	1054	0.2287	1.27422681361449e-212	21997387	22185743	8.0747052070077e-14	26145205	26147112
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148060	26158310	9	8	-0.3617	8.0747052070077e-14	26145205	26147112	0.00654213361668885	26156944	28247413
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26161111	28266113	9	9	-0.0823	0.00654213361668885	26156944	28247413	3.59794330218399e-06	28247413	29309668
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	31780439	1105	1053	0.3079	3.59794330218399e-06	28247413	29309668	1.73320447497062e-224	31760801	31809662
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	31784366	46765649	5680	5442	0.0923	1.73320447497062e-224	31760801	31809662	0	46744657	46798827
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	46767642	58543306	4126	3953	0.2876	0	46744657	46798827	3.12918951442246e-133	58543306	58543306
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	58548245	58551938	2	2	-0.7743	3.12918951442246e-133	58543306	58543306	7.97293830922917e-09	58551938	58551938
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	58560297	62419534	1614	1535	0.2092	7.97293830922917e-09	58551938	58551938	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10022306	10	9	-0.3258	NA	NA	NA	1.23990756419822e-05	9994686	10075714
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10057408	10167413	12	11	-0.6906	1.23990756419822e-05	9994686	10075714	4.8075119362568e-07	10152384	13615502
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13342486	1	0	NA	4.8075119362568e-07	10152384	13615502	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13435755	16944582	1209	1154	-0.3408	NA	NA	NA	1.7485649029329e-08	16936984	16944582
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	16952871	16966443	3	3	0.3902	1.7485649029329e-08	16936984	16944582	2.22681802536767e-09	16966443	16973222
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	16973222	28892946	3576	3403	-0.3525	2.22681802536767e-09	16966443	16973222	1.23456775419967e-159	28874125	28911770
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	28896022	29477140	220	212	0.0122	1.23456775419967e-159	28874125	28911770	1.49208733079344e-06	29475959	29477140
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	29478083	29479039	2	2	0.7638	1.49208733079344e-06	29475959	29477140	2.09462743155871e-06	29479039	29482648
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	29481047	29481047	1	0	NA	2.09462743155871e-06	29479039	29482648	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	29482648	31633572	1028	975	0.011	NA	NA	NA	1.05633100692014e-183	31618893	31643340
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	31634547	36789648	2483	2366	-0.2114	1.05633100692014e-183	31618893	31643340	1.16622625186147e-85	36789648	36789648
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	2.6775	1.16622625186147e-85	36789648	36789648	5.69334861884137e-81	36791668	36791668
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46922972	4894	4672	-0.2109	5.69334861884137e-81	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	16519953	405	382	-0.3479	NA	NA	NA	1.37532859750795e-18	16519953	16519953
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16521073	16521073	1	0	NA	1.37532859750795e-18	16519953	16519953	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16523019	16524408	2	2	-1.7386	NA	NA	NA	1.4485613117849e-16	16524408	16524408
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16525922	16632389	64	64	-0.4246	1.4485613117849e-16	16524408	16524408	1.12987350432847e-08	16626310	16633269
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16633269	16642927	8	8	0.0795	1.12987350432847e-08	16626310	16633269	1.93914651443084e-08	16640950	16643838
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16643838	16678515	24	22	-0.4808	1.93914651443084e-08	16640950	16643838	2.14985078227219e-07	16678515	16678515
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16680825	16682124	2	2	0.4304	2.14985078227219e-07	16678515	16678515	1.89883043666646e-05	16682124	16684740
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16684740	16707965	16	16	1.0619	1.89883043666646e-05	16682124	16684740	2.81557712874931e-26	16705999	16710467
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	16709512	18125356	610	580	0.4416	2.81557712874931e-26	16705999	16710467	2.27857400903578e-37	18125356	18125356
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	2.5136	2.27857400903578e-37	18125356	18125356	5.59125060716171e-36	18129194	18129194
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	19792442	695	662	0.4286	5.59125060716171e-36	18129194	18129194	3.04106638605484e-190	19779852	20136668
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	19794060	19794060	1	0	NA	3.04106638605484e-190	19779852	20136668	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	20128705	21571489	691	651	0.0774	NA	NA	NA	1.33831213331394e-14	21571489	21571489
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.0455	1.33831213331394e-14	21571489	21571489	2.80382860607779e-10	21576859	21579649
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	438	0.1514	2.80382860607779e-10	21576859	21579649	3.5897859966356e-90	22667608	22667608
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	1.1832	3.5897859966356e-90	22667608	22667608	3.06647851877322e-106	22725305	22725305
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	25926415	1726	1643	0.1255	3.06647851877322e-106	22725305	22725305	4.47959949612834e-132	25902307	25949078
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	25927319	28657987	1516	1452	0.3164	4.47959949612834e-132	25902307	25949078	0	28657987	28657987
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28660383	28694446	24	24	-1.8999	0	28657987	28657987	0	28694446	28694446
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28696014	30637486	1031	989	0.1766	0	28694446	28694446	0	30635173	30640281
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	30638665	32110063	745	717	-0.3098	0	30635173	30640281	2.93983444593807e-41	32110063	32110063
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32110939	32112051	2	2	-2.3134	2.93983444593807e-41	32110063	32110063	4.42239234117215e-41	32112051	32112051
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	32114341	44399210	6108	5835	-0.1879	4.42239234117215e-41	32112051	32112051	1.51143652511584e-14	44370200	44407652
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44400695	44400695	1	0	NA	1.51143652511584e-14	44370200	44407652	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44401798	44470391	34	33	0.0849	NA	NA	NA	8.48373027638113e-10	44460942	44488098
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44471377	48448446	1863	1773	-0.1711	8.48373027638113e-10	44460942	44488098	6.33920470529318e-13	48448446	48448446
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	1.0082	6.33920470529318e-13	48448446	48448446	2.35670599141721e-12	48452959	48452959
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	49039310	281	271	-0.2058	2.35670599141721e-12	48452959	48452959	7.72758096558931e-09	49033186	49050046
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49044243	49084143	20	20	0.1342	7.72758096558931e-09	49033186	49050046	3.30002752091136e-08	49073326	49101862
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49086704	49086704	1	0	NA	3.30002752091136e-08	49073326	49101862	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49089995	49571068	198	192	-0.2046	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.2079	NA	NA	NA	1.77184498942723e-05	1529	94062
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	95819	1	0	NA	1.77184498942723e-05	1529	94062	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	98390	109064	9	8	-0.96	NA	NA	NA	2.36391569676424e-08	109064	110583
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	127779	15	15	-0.341	2.36391569676424e-08	109064	110583	5.00276682903358e-26	127779	127779
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	130528	3	3	1.4517	5.00276682903358e-26	127779	127779	3.28728913894166e-89	130528	130528
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	159609	19	19	-0.3219	3.28728913894166e-89	130528	130528	2.99682942335255e-07	156047	162802
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	159991	203986	9	9	-0.6678	2.99682942335255e-07	156047	162802	7.22195639784623e-13	170802	203986
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	205706	207641	4	4	-0.0602	7.22195639784623e-13	170802	203986	2.90934191848350e-87	207641	207641
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	208495	208682	2	2	1.0457	2.9093419184835e-87	207641	207641	3.05050038787403e-12	208682	208682
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	210518	266212	59	58	-0.3268	3.05050038787403e-12	208682	208682	3.76994438591434e-06	264886	266212
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	0.6736	3.76994438591434e-06	264886	266212	5.14849659862195e-08	267079	268402
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1937368	1040	1004	-0.413	5.14849659862195e-08	267079	268402	4.02419450365868e-24	1937368	1940247
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1939737	1939737	1	0	NA	4.02419450365868e-24	1937368	1940247	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1940247	1945329	6	5	-1.5913	NA	NA	NA	7.99097929653763e-22	1944462	1945329
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1950424	2668473	585	556	-0.4153	7.99097929653763e-22	1944462	1945329	7.58583583189047e-08	2661980	2686115
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2669225	2708291	32	31	-0.7105	7.58583583189047e-08	2661980	2686115	4.86489035933582e-108	2708291	2711273
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	3366545	266	256	0.4142	4.86489035933582e-108	2708291	2711273	1.84223808526705e-14	3342919	3399353
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3369774	3480169	49	46	0.0657	1.84223808526705e-14	3342919	3399353	2.53948766657161e-29	3472610	3494022
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3488810	8432497	1466	1396	0.4477	2.53948766657161e-29	3472610	3494022	5.47789833649209e-08	8411159	8447855
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8437023	8466917	17	17	0.1187	5.47789833649209e-08	8411159	8447855	1.76372838953812e-09	8452395	8481902
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8475091	2	0	NA	1.76372838953812e-09	8452395	8481902	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8477126	41668856	12698	12135	0.467	NA	NA	NA	0	41657763	41680011
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	41669989	44924544	1063	1023	0.7618	0	41657763	41680011	9.14151908577102e-216	44910896	44946123
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	44928841	44928841	1	0	NA	9.14151908577102e-216	44910896	44946123	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	44930361	58095846	3634	3477	1.0128	NA	NA	NA	0	57971211	61974430
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	58314675	103129950	9250	8831	0.7565	0	57971211	61974430	8.36636514905605e-09	103107068	103155792
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103145335	103191693	20	18	1.0892	8.36636514905605e-09	103107068	103155792	8.22919112232847e-09	103179176	103232959
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	103224094	135714889	11033	10559	0.766	8.22919112232847e-09	103179176	103232959	0	135698329	135726760
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	135716699	144934101	2374	2270	0.4834	0	135698329	135726760	0	144925821	144943629
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	144935935	154442377	3229	3107	0.7617	0	144925821	144943629	2.88074940375878e-110	154442377	154442377
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	-1.7507	2.88074940375878e-110	154442377	154442377	1.67422555226489e-48	154449960	154450309
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.7076	1.67422555226489e-48	154449960	154450309	2.25338534048705e-108	154582414	154582414
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	188	-0.2339	2.25338534048705e-108	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	115	-4.5362	NA	NA	NA	3.59174507125355e-33	3219200	3223585
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	17	-1.7187	3.59174507125355e-33	3219200	3223585	9.71215692020403e-18	5593746	6688691
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	167	-4.0599	9.71215692020403e-18	5593746	6688691	1.03007337471936e-05	7048724	7054924
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7096083	6	5	-1.6306	1.03007337471936e-05	7048724	7054924	0.0258714096989187	7096083	7211779
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7117476	7273713	55	54	-3.3088	0.0258714096989187	7096083	7211779	0.00243798847296421	7254722	7289497
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7274653	7304209	16	16	-2.0009	0.00243798847296421	7254722	7289497	1.49294340550680e-08	7296153	7307884
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7305143	7342985	17	17	-4.2928	1.4929434055068e-08	7296153	7307884	0.075907984121811	7331655	7606496
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7344413	7653082	65	60	-3.4098	0.075907984121811	7331655	7606496	5.17528936696657e-05	7608619	7664085
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7722458	43	43	-4.4375	5.17528936696657e-05	7608619	7664085	1.62119060555472e-06	7709619	7756907
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7997485	78	75	-3.3319	1.62119060555472e-06	7709619	7756907	8.04346242855131e-05	7897073	8005148
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7999759	8178487	39	35	-4.3309	8.04346242855131e-05	7897073	8005148	7.19989046383781e-06	8168499	8179883
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8179883	8195174	6	6	-3.1081	7.19989046383781e-06	8168499	8179883	6.84841213731497e-11	8195174	8199414
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8199414	8280065	20	17	-4.6588	6.84841213731497e-11	8195174	8199414	1.41276998979430e-06	8259766	8304781
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8289709	1	0	NA	1.4127699897943e-06	8259766	8304781	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8463583	40	38	-3.4765	NA	NA	NA	0.000883516400731622	8363122	8544417
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8474062	9164547	190	180	-4.1579	0.000883516400731622	8363122	8544417	5.51687458556577e-07	9147381	9171109
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9171109	10012024	10	10	-2.4971	5.51687458556577e-07	9147381	9171109	6.07414004933795e-05	10004173	10054229
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10014777	10513747	64	60	-4.079	6.07414004933795e-05	10004173	10054229	3.71876749680345e-25	10512616	10515697
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	13	-0.8743	3.71876749680345e-25	10512616	10515697	1.62244066780032e-08	10631941	11660512
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	13119344	205	191	-3.2153	1.62244066780032e-08	10631941	11660512	0.141118668688307	13010597	13119344
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13121152	13128515	2	2	-0.6336	0.141118668688307	13010597	13119344	2.59515341493765e-07	13128515	13129843
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13823928	247	239	-4.166	2.59515341493765e-07	13128515	13129843	1.30242753085091e-05	13785396	13851627
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13868296	10	9	-2.6692	1.30242753085091e-05	13785396	13851627	6.47446242997464e-05	13854528	13872200
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13869106	13869106	1	0	NA	6.47446242997464e-05	13854528	13872200	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13870089	13918652	18	15	-4.3201	NA	NA	NA	0.202655087997671	13872200	14013053
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13918766	14045293	65	63	-4.7367	0.202655087997671	13872200	14013053	1.10495597004651e-06	14039969	14045293
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14046104	14056906	3	3	-2.8176	1.10495597004651e-06	14039969	14045293	2.79060597650039e-05	14056906	14064204
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14063795	14100001	24	24	-4.8162	2.79060597650039e-05	14056906	14064204	0.00362330296375758	14094171	14335755
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14102074	14506319	136	128	-3.9016	0.00362330296375758	14094171	14335755	6.13025301869395e-06	14494397	14538156
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508021	14508894	2	0	NA	6.13025301869395e-06	14494397	14538156	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14572190	24	23	-2.5684	NA	NA	NA	2.64414231260204e-09	14557473	14598838
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	14579298	1	0	NA	2.64414231260204e-09	14557473	14598838	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15206674	151	143	-4.0753	NA	NA	NA	1.59635362767338e-07	15201695	15220050
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15207522	15241527	12	10	-2.1138	1.59635362767338e-07	15201695	15220050	3.93374080419369e-15	15228303	15242592
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15434486	129	119	-4.3619	3.93374080419369e-15	15228303	15242592	2.49779573926071e-10	15433122	15434486
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15443458	15447091	5	5	-1.876	2.49779573926071e-10	15433122	15434486	0.000147277776853741	15447091	15455932
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15448670	15523178	31	30	-4.3021	0.000147277776853741	15447091	15455932	0.0405127938563564	15468160	15552815
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15583573	33	33	-3.3611	0.0405127938563564	15468160	15552815	5.58338398748772e-06	15553682	15614125
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	55	-4.5161	5.58338398748772e-06	15553682	15614125	3.06441350206443e-08	15862122	15969469
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16175250	102	92	-3.5166	3.06441350206443e-08	15862122	15969469	4.153208113791e-09	16133263	16215750
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16176562	19610243	437	419	-4.2874	4.153208113791e-09	16133263	16215750	9.5441951900879e-06	19608039	19610243
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.5015	9.5441951900879e-06	19608039	19610243	1.38113257210277e-07	19613864	19614809
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21036411	291	282	-4.3414	1.38113257210277e-07	19613864	19614809	3.78016630969812e-05	21025500	21036411
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21054519	7	7	-2.6301	3.78016630969812e-05	21025500	21036411	1.93824788545926e-06	21054519	21060047
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21054605	21497583	140	135	-4.2703	1.93824788545926e-06	21054519	21060047	5.64221987224387e-06	21478199	21497583
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21523522	21569358	5	5	-2.4183	5.64221987224387e-06	21478199	21497583	5.7358892674403e-05	21569358	21634923
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21574425	22014413	94	89	-4.2783	5.7358892674403e-05	21569358	21634923	8.92323599964333e-05	22003954	22014413
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22015735	22026566	5	5	-2.445	8.92323599964333e-05	22003954	22014413	5.78568057910516e-13	22026566	22026566
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22028255	22157319	18	16	-4.0369	5.78568057910516e-13	22026566	22026566	2.07608808426733e-20	22157319	22157319
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-2.4189	2.07608808426733e-20	22157319	22157319	9.92147067198233e-08	22177335	22182080
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	25737663	95	87	-4.2725	9.92147067198233e-08	22177335	22182080	1.98550457918883e-51	25737663	25737663
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26905954	15	14	-0.6829	1.98550457918883e-51	25737663	25737663	2.14134065364624e-05	26903353	26909069
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26907147	26920247	6	5	-1.6277	2.14134065364624e-05	26903353	26909069	5.13779244694999e-06	26915670	26924187
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26924187	26945893	10	9	-0.5799	5.13779244694999e-06	26915670	26924187	2.31396504515384e-06	26945893	26965406
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26950080	1	0	NA	2.31396504515384e-06	26945893	26965406	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26952278	27000085	10	9	-2.9005	NA	NA	NA	0.000184240558055511	26984336	27000085
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27003308	27003308	1	0	NA	0.000184240558055511	26984336	27000085	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27006628	27019256	5	5	-0.3601	NA	NA	NA	1.58270669709186e-61	27019256	27019256
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.3873	1.58270669709186e-61	27019256	27019256	2.49432248003870e-31	27039222	27039222
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	14	-0.9595	2.4943224800387e-31	27039222	27039222	2.66661094872630e-20	27137064	27137064
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27167148	2	2	-4.6	2.6666109487263e-20	27137064	27137064	0	27167148	27167148
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27171797	27171797	1	0	NA	0	27167148	27167148	NA	NA	NA
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27172283	27176933	2	2	-1.4031	NA	NA	NA	2.01118681454095e-13	27176933	27176933
MSK_252152912797_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	10	-0.5254	2.01118681454095e-13	27176933	27176933	NA	NA	NA
