Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	24391166	8834	8651	-0.0096	NA	NA	NA	9.02111502790131e-54	24391166	24391166
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24394076	24395691	2	2	-1.9921	9.0211150279013e-54	24391166	24391166	4.10341612630551e-55	24395691	24395691
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	24397212	32175183	2961	2899	-0.0018	4.10341612630551e-55	24395691	24395691	1.16863145180234e-15	32175183	32175183
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32178669	32182365	2	2	-1.0524	1.16863145180234e-15	32175183	32175183	2.64555502210298e-16	32182365	32182365
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32184691	72537426	16095	15784	-0.0055	2.64555502210298e-16	32182365	32182365	6.16284136511328e-47	72536231	72539143
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.6557	6.16284136511328e-47	72536231	72539143	5.79183871134135e-50	72574479	72579311
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	109373255	11406	11178	-0.006	5.79183871134135e-50	72574479	72579311	4.77041621449779e-285	109373255	109373255
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-4.1558	4.77041621449779e-285	109373255	109373255	9.7229290572932e-139	109376249	109376249
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109399152	5	5	0.2411	9.7229290572932e-139	109376249	109376249	1.36469008168618e-15	109399152	109399152
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109406558	109407073	3	3	-0.9211	1.36469008168618e-15	109399152	109399152	1.00265613896551e-20	109407073	109407073
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109411201	110023268	287	280	-0.0118	1.00265613896551e-20	109407073	109407073	5.62171680956898e-70	110023268	110023268
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-1.7071	5.62171680956898e-70	110023268	110023268	4.98899707172413e-66	110039388	110039388
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	143697723	3914	3843	-0.0236	4.98899707172413e-66	110039388	110039388	1.83218788894551e-25	143651396	143702972
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143700072	143789484	45	44	-0.2991	1.83218788894551e-25	143651396	143702972	6.28853462997458e-37	143787504	143793256
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143791143	147329819	604	591	0.0223	6.28853462997458e-37	143787504	143793256	1.48022592100521e-10	147203277	147357754
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147346371	147497268	27	27	0.2442	1.48022592100521e-10	147203277	147357754	2.76618782137867e-09	147471665	148084402
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150819879	1260	1235	0.0299	2.76618782137867e-09	147471665	148084402	0	150819879	150836481
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150851439	11	7	-2.8399	0	150819879	150836481	0	150844444	150851439
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2710	0.0071	0	150844444	150851439	1.06833407101529e-81	157133150	157133150
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.3629	1.06833407101529e-81	157133150	157133150	2.07519127018759e-85	157136342	157136342
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4038	-0.0196	2.07519127018759e-85	157136342	157136342	6.95455824263625e-19	167481271	167493768
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5224	6.95455824263625e-19	167481271	167493768	3.32118985020112e-19	167507882	167520743
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	185979586	7209	7077	-0.0212	3.32118985020112e-19	167507882	167520743	1.14007053415836e-77	185979586	185979586
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	-2.2059	1.14007053415836e-77	185979586	185979586	3.88538258122787e-79	185988138	185988138
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	192715640	1491	1454	-0.0053	3.88538258122787e-79	185988138	185988138	2.26773411666514e-09	192715640	192715640
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	0.718	2.26773411666514e-09	192715640	192715640	4.60508362449088e-09	192719540	192719540
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	194978218	476	467	0.0013	4.60508362449088e-09	192719540	192719540	2.36921830410567e-34	194977713	195011344
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	-0.6626	2.36921830410567e-34	194977713	195011344	9.8990338156119e-30	195048208	195091758
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200598243	2158	2120	-0.0061	9.8990338156119e-30	195048208	195091758	2.90118150702296e-19	200585836	200618814
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200803726	42	42	-0.2546	2.90118150702296e-19	200585836	200618814	1.44322603297496e-18	200696309	200810641
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200804838	204482369	1585	1558	-0.0049	1.44322603297496e-18	200696309	200810641	1.42429360139838e-32	204482369	204482369
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204483717	204497846	8	8	-0.7458	1.42429360139838e-32	204482369	204482369	3.00007965834901e-34	204497846	204497846
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204637883	237866190	12068	11839	-0.0163	3.00007965834901e-34	204497846	204497846	3.0176958975797e-10	237866190	237866190
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	237867621	237873835	2	2	-0.8342	3.0176958975797e-10	237866190	237866190	3.28025049444944e-10	237873835	237873835
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	237875245	246479941	3533	3460	-0.0115	3.28025049444944e-10	237873835	237873835	4.31045642680415e-22	246460435	246522148
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246481598	246769018	84	81	0.1802	4.31045642680415e-22	246460435	246522148	2.29871764518233e-75	246769018	246794552
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246862029	27	26	-0.7672	2.29871764518233e-75	246769018	246794552	2.97538602872345e-90	246860551	246862029
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	95	-0.031	2.97538602872345e-90	246860551	246862029	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	3708749	1388	1358	-0.0158	NA	NA	NA	1.18879240879633e-17	3708749	3708749
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3713664	3714236	3	3	-0.9087	1.18879240879633e-17	3708749	3708749	6.072134748221e-19	3714236	3714236
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3718746	37810001	11518	11272	-0.0106	6.072134748221e-19	3714236	3714236	5.16296805772932e-114	37810001	37813211
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	22	-0.8144	5.16296805772932e-114	37810001	37813211	4.1325893906855e-121	37852371	37855837
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	57251850	7360	7211	-0.0108	4.1325893906855e-121	37852371	37855837	2.90094694943593e-43	57251850	57251850
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57263450	57300299	5	5	0.9948	2.90094694943593e-43	57251850	57251850	1.79358966584033e-40	57300299	57300299
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	57307517	242501239	57464	56359	-3e-04	1.79358966584033e-40	57300299	57300299	5.71630212409386e-14	242482099	242528768
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242656260	58	57	0.1776	5.71630212409386e-14	242482099	242528768	0.000615851164032604	242632434	242682950
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242665255	242689978	9	9	-0.0697	0.000615851164032604	242632434	242682950	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32064724	10795	10604	-0.0102	NA	NA	NA	2.81627817072256e-11	32064724	32064724
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32074432	32080848	3	3	0.6895	2.81627817072256e-11	32064724	32064724	2.65722798153396e-12	32080848	32094956
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	89475107	19843	19477	0.0037	2.65722798153396e-12	32080848	32094956	3.26305994536259e-86	89475107	89475107
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89477163	89500935	13	13	-0.9102	3.26305994536259e-86	89475107	89475107	1.15522073646495e-92	89500935	89500935
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89502757	99891210	1529	1502	0.0146	1.15522073646495e-92	89500935	89500935	0	99891210	99891210
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	-6.6624	0	99891210	99891210	0	99897201	99897201
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	11296	0.003	0	99897201	99897201	1.64054975755022e-102	133189686	133189686
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-2.5362	1.64054975755022e-102	133189686	133189686	6.18085515272113e-106	133194685	133194685
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	163989367	9776	9588	0.005	6.18085515272113e-106	133194685	133194685	2.58390660007205e-09	163987457	163989367
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163992903	163992903	1	0	NA	2.58390660007205e-09	163987457	163989367	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164005577	3	3	0.633	NA	NA	NA	1.80573502351796e-17	164005577	164005577
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.4667	1.80573502351796e-17	164005577	164005577	1.72807722921098e-34	164027724	164027724
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.6186	1.72807722921098e-34	164027724	164027724	4.10080145222192e-63	164107951	164112873
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	194354505	10130	9935	0.0094	4.10080145222192e-63	164107951	164112873	0	194354505	194354505
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-5.0994	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1940	0.0015	0	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	682752	214	209	-0.0076	NA	NA	NA	1.32629546679250e-15	682752	682752
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	685953	685953	1	0	NA	1.3262954667925e-15	682752	682752	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	1.0427	NA	NA	NA	9.57501367897735e-16	691065	691065
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	34457648	9348	9181	-0.0026	9.57501367897735e-16	691065	691065	1.17682732026363e-12	34445002	34457648
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34463523	34491115	5	5	0.5928	1.17682732026363e-12	34445002	34457648	3.46432869084625e-14	34491115	34506297
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	63808626	7714	7569	0.0018	3.46432869084625e-14	34491115	34506297	5.5506070834618e-17	63808626	63808626
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63817412	63830459	3	3	-0.8296	5.5506070834618e-17	63808626	63808626	1.32998221559569e-15	63830459	63830459
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	63842706	64376590	64	62	0.0313	1.32998221559569e-15	63830459	63830459	5.92016234449218e-10	64376590	64376590
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-0.8029	5.92016234449218e-10	64376590	64376590	1.46404208223121e-10	64390333	64398986
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	68905670	1080	1060	0.0037	1.46404208223121e-10	64390333	64398986	9.99795666549534e-84	68905670	69069651
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69069651	69165814	14	14	0.8588	9.99795666549534e-84	68905670	69069651	3.13779910896395e-88	69163312	69165814
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	138307863	20515	20106	8e-04	3.13779910896395e-88	69163312	69165814	2.30519287301888e-18	138307863	138307863
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138312147	138319409	2	2	-1.053	2.30519287301888e-18	138307863	138307863	4.59132530407347e-18	138319409	138319409
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	138324335	191153613	16197	15896	-0.0038	4.59132530407347e-18	138319409	138319409	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	218	0.0126	NA	NA	NA	2.66486243324603e-10	729262	737829
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	6	0.5507	2.66486243324603e-10	729262	737829	2.1062104201029e-14	829954	870657
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	12857302	3747	3674	0.007	2.1062104201029e-14	829954	870657	0	12857302	12857302
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-5.1855	0	12857302	12857302	0	12873052	12873052
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	140201609	36102	35388	-0.0038	0	12873052	12873052	2.09039978029643e-61	140201609	140201609
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140203440	140216524	8	8	-0.9611	2.09039978029643e-61	140201609	140201609	5.71880382835358e-50	140216524	140216524
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	141056908	378	373	-0.0011	5.71880382835358e-50	140216524	140216524	2.40003333663607e-10	141053380	141056908
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	141060130	141068145	3	3	-0.7214	2.40003333663607e-10	141053380	141056908	5.34489142685279e-12	141068145	141070582
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	141070582	155416484	5017	4914	-0.011	5.34489142685279e-12	141068145	141070582	2.76202483543895e-16	155416484	155416484
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155418745	155421443	3	3	0.8106	2.76202483543895e-16	155416484	155416484	1.35873869131629e-15	155421443	155421443
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	172343113	5485	5374	-0.0121	1.35873869131629e-15	155421443	155421443	2.83094462727909e-11	172341339	172343113
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172345157	172349917	3	3	-0.717	2.83094462727909e-11	172341339	172343113	7.614539017384e-11	172349917	172351264
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172351264	179429409	2366	2313	-6e-04	7.614539017384e-11	172349917	172351264	8.23911587754591e-31	179429409	179429409
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179430821	179431937	2	2	1.4542	8.23911587754591e-31	179429409	179429409	1.68039297881518e-35	179431937	179431937
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179433578	179433578	1	0	NA	1.68039297881518e-35	179431937	179431937	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179435415	180107298	268	260	-0.0081	NA	NA	NA	2.76168779938921e-10	180105808	180107298
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180110133	180115895	3	3	0.6409	2.76168779938921e-10	180105808	180107298	5.32424052427882e-16	180115895	180115895
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180135156	180344964	31	29	-0.0459	5.32424052427882e-16	180115895	180115895	2.68711918646949e-13	180342860	180344964
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180346557	180358977	7	6	0.4884	2.68711918646949e-13	180342860	180344964	5.13286139983188e-08	180358977	180364670
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	109	-0.0242	5.13286139983188e-08	180358977	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	-0.0114	NA	NA	NA	1.04916915188028e-18	191387	210326
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	202063	1	0	NA	1.04916915188028e-18	191387	210326	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	204881	251128	21	21	0.4156	NA	NA	NA	2.90577074219539e-29	248239	252939
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	252939	26811016	9304	9114	0.0095	2.90577074219539e-29	248239	252939	3.75720533148276e-34	26811016	26811016
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26849722	26861184	4	4	-0.9932	3.75720533148276e-34	26811016	26811016	3.68754479821472e-36	26861184	26861184
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29966336	1219	1195	0.0192	3.68754479821472e-36	26861184	26861184	9.32330281508675e-17	29962849	29986370
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29972382	30021908	14	14	0.3955	9.32330281508675e-17	29962849	29986370	3.30165091350923e-10	29998009	30030032
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30025480	31390982	582	568	0.0208	3.30165091350923e-10	29998009	30030032	3.63142899743769e-19	31390982	31390982
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	31418006	3	3	1.1031	3.63142899743769e-19	31390982	31390982	7.03333269518227e-26	31418006	31418006
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32548736	488	481	0.0428	7.03333269518227e-26	31418006	31418006	3.55810090107229e-179	32548736	32548736
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32595402	8	8	1.8048	3.55810090107229e-179	32548736	32548736	7.97093949374843e-15	32593151	32600962
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32742767	53	49	0.3129	7.97093949374843e-15	32593151	32600962	1.12263926458844e-32	32682366	32756637
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32745036	72919733	12790	12530	0.0145	1.12263926458844e-32	32682366	32756637	6.7418369616071e-11	72917267	72919733
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72931542	4	4	-0.593	6.7418369616071e-11	72917267	72919733	5.1301263760132e-12	72931542	72931789
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931789	79018959	1893	1861	0.0124	5.1301263760132e-12	72931542	72931789	3.03710189922421e-38	79015901	79018959
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-0.602	3.03710189922421e-38	79015901	79018959	9.09505320204198e-37	79091850	79095415
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	139643729	19146	18760	-0.0026	9.09505320204198e-37	79091850	79095415	6.47430440727861e-20	139643729	139643729
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	-0.8933	6.47430440727861e-20	139643729	139643729	2.12434312068884e-18	139648318	139648318
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	165643653	8723	8559	-0.0099	2.12434312068884e-18	139648318	139648318	1.29634191021468e-29	165643653	165643653
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	0.9542	1.29634191021468e-29	165643653	165643653	6.15133412966397e-27	165650610	165650610
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1753	-0.0243	6.15133412966397e-27	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	39	0.0508	NA	NA	NA	2.24193902896676e-18	244720	248384
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	5	-0.8696	2.24193902896676e-18	244720	248384	6.6551575413194e-21	250232	254342
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	1038517	215	213	0.0176	6.6551575413194e-21	250232	254342	8.18384773195209e-07	1037402	1038517
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	0.78	8.18384773195209e-07	1037402	1038517	2.65206260226655e-07	1047707	1049599
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	5490146	1715	1679	0.0197	2.65206260226655e-07	1047707	1049599	1.88261606480089e-62	5490146	5490146
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5493076	5513640	12	12	-0.8656	1.88261606480089e-62	5490146	5490146	9.10436538492485e-76	5513640	5513640
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	5514864	29635722	8390	8223	0.0036	9.10436538492485e-76	5513640	5513640	2.43383544102146e-12	29635722	29635722
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29641884	29652543	2	2	-0.8751	2.43383544102146e-12	29635722	29635722	2.86600937007908e-11	29652543	29652543
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29656586	38177662	3177	3119	-0.0066	2.86600937007908e-11	29652543	29652543	3.78447960873912e-07	38174897	38177662
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38183507	38185167	3	3	-0.5784	3.78447960873912e-07	38174897	38177662	4.06254510752797e-11	38185167	38185167
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38186377	38254010	37	37	-0.0022	4.06254510752797e-11	38185167	38185167	8.93766478531959e-23	38254010	38254010
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38257171	38270942	6	6	0.6511	8.93766478531959e-23	38254010	38254010	8.99333549931952e-06	38264758	38279432
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38274436	38360187	42	39	0.2685	8.99333549931952e-06	38264758	38279432	2.07368791909352e-18	38340009	38384435
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38372692	64353539	5853	5733	0.0121	2.07368791909352e-18	38340009	38384435	6.71848923641285e-11	64353539	64353539
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64357426	64358351	2	2	-0.8665	6.71848923641285e-11	64353539	64353539	5.70903971272733e-12	64358351	64358351
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	64364689	93162991	8947	8795	0.0074	5.70903971272733e-12	64358351	64358351	6.65917670214285e-13	93162991	93162991
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.9128	6.65917670214285e-13	93162991	93162991	9.70407916510006e-13	93168978	93168978
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	100164752	2612	2558	0.0189	9.70407916510006e-13	93168978	93168978	8.5322530517268e-12	100162851	100164752
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100178968	5	4	-0.5906	8.5322530517268e-12	100162851	100164752	1.88286479675216e-10	100178968	100181104
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100181104	109217320	3894	3811	0.0101	1.88286479675216e-10	100178968	100181104	1.87816639236208e-10	109214735	109217320
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109244233	6	6	0.4388	1.87816639236208e-10	109214735	109217320	3.77397507313489e-10	109244233	109245944
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	109967918	300	298	0.0145	3.77397507313489e-10	109244233	109245944	4.60247656901807e-82	109967918	109967918
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	-3.6503	4.60247656901807e-82	109967918	109967918	2.09875651402934e-207	109974402	109974402
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	133433384	10826	10610	-0.0054	2.09875651402934e-207	109974402	109974402	2.66508101697671e-09	133426996	133433384
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	7	-0.4231	2.66508101697671e-09	133426996	133433384	1.20193137083106e-09	133448277	133455682
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3631	-2e-04	1.20193137083106e-09	133448277	133455682	0	141410894	141410894
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	14	-5.3136	0	141410894	141410894	0	141440184	141440184
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	113	0.0067	0	141440184	141440184	0	141690753	141690753
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	9	-4.6119	0	141690753	141690753	0	141714168	141714168
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142152205	167	162	0.0974	0	141714168	141714168	9.44330504511044e-11	142140540	142159173
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142156165	142196011	13	11	0.4727	9.44330504511044e-11	142140540	142159173	2.18425467761129e-19	142192030	142198376
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142198376	143582864	480	470	-0.0285	2.18425467761129e-19	142192030	142198376	2.86600376190271e-10	143582864	143582864
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143583309	143584350	2	2	0.8224	2.86600376190271e-10	143582864	143582864	5.00228413553915e-11	143584350	143584350
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	144399712	314	306	-0.0054	5.00228413553915e-11	143584350	143584350	3.89572784488221e-08	144395186	144399712
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144403133	144404463	2	2	-0.7198	3.89572784488221e-08	144395186	144399712	4.18364702603731e-08	144404463	144411778
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	144411778	147702365	1534	1502	0.0012	4.18364702603731e-08	144404463	144411778	2.51092845289337e-110	147702365	147702365
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.8804	2.51092845289337e-110	147702365	147702365	1.67108250331986e-115	147707161	147707161
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	156483966	3181	3128	-0.0046	1.67108250331986e-115	147707161	147707161	2.94626536309431e-20	156483966	156485711
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156490484	3	3	0.9527	2.94626536309431e-20	156483966	156485711	3.58447642440365e-17	156488598	156490484
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156492262	158821263	1054	1039	-0.001	3.58447642440365e-17	156488598	156490484	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	579405	118	112	-0.033	NA	NA	NA	7.9873466927745e-21	579405	579405
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	581533	581533	1	0	NA	7.9873466927745e-21	579405	579405	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.782	NA	NA	NA	5.60523058655619e-35	588865	588865
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	607	-0.0223	5.60523058655619e-35	588865	588865	8.09760530469616e-06	2226694	2234351
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.4966	8.09760530469616e-06	2226694	2234351	3.80477873762897e-07	2251011	2261571
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	10330645	2526	2475	-0.0146	3.80477873762897e-07	2251011	2261571	2.19713807270726e-24	10330645	10330645
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10332803	10332839	2	2	-1.2436	2.19713807270726e-24	10330645	10330645	1.27540582620513e-23	10332839	10332839
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10339001	10339001	1	0	NA	1.27540582620513e-23	10332839	10332839	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	10339780	39350798	9804	9614	-0.0172	NA	NA	NA	6.78475795939586e-227	39350798	39350798
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	58	0.6805	6.78475795939586e-227	39350798	39350798	1.71132848707468e-189	39505256	39505256
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	40892587	441	436	0.0134	1.71132848707468e-189	39505256	39505256	3.56223572376785e-16	40892587	40892587
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.0146	3.56223572376785e-16	40892587	40892587	2.71242413808347e-16	40897469	40897469
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	87255865	12244	11997	0.0074	2.71242413808347e-16	40897469	40897469	0	87255865	87255865
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-6.7291	0	87255865	87255865	0	87262662	87262662
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	107851240	7064	6931	0.0037	0	87262662	87262662	3.10831791007775e-18	107851240	107851240
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107853197	107854801	2	2	-1.0515	3.10831791007775e-18	107851240	107851240	5.54836309413061e-20	107854801	107854801
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107858685	115701209	1982	1935	0.0275	5.54836309413061e-20	107854801	107854801	2.03818840458595e-13	115701209	115701209
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-0.8623	2.03818840458595e-13	115701209	115701209	1.20659251313146e-19	115711730	115711730
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	146264846	9693	9483	0.0263	1.20659251313146e-19	115711730	115711730	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	11951449	4174	4090	-0.0154	NA	NA	NA	1.02563615691466e-25	11951449	11956351
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11956351	11980600	6	5	-0.8002	1.02563615691466e-25	11951449	11956351	1.31592785211793e-25	11974884	11980600
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11985387	23343915	3820	3749	-0.0207	1.31592785211793e-25	11974884	11980600	0	23343915	23343915
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-4.6022	0	23343915	23343915	0	23365926	23365926
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4960	-0.0093	0	23365926	23365926	4.66757516161702e-96	70926188	70926188
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.5604	4.66757516161702e-96	70926188	70926188	1.99067187740422e-92	70930528	70930528
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	77192566	2337	2289	-0.0131	1.99067187740422e-92	70930528	70930528	1.33646894444614e-12	77192566	77192566
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77194207	77200826	3	3	-0.7489	1.33646894444614e-12	77192566	77192566	3.99386621048131e-13	77200826	77200826
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77202889	84556366	2176	2145	-0.0238	3.99386621048131e-13	77200826	77200826	1.40273481478961e-42	84556366	84556366
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	84564109	84568906	4	4	-1.1392	1.40273481478961e-42	84556366	84556366	8.3189322748509e-38	84568906	84568906
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	84580673	86960197	840	822	-0.0209	8.3189322748509e-38	84568906	84568906	1.68746109459141e-12	86960197	86960197
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	0.8991	1.68746109459141e-12	86960197	86960197	6.66561856362996e-13	86965458	86965458
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	107564300	6867	6736	-0.0106	6.66561856362996e-13	86965458	86965458	2.69980033835768e-17	107564300	107564300
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	107567321	107567415	2	2	-1.0575	2.69980033835768e-17	107564300	107564300	5.58942651660787e-16	107567415	107567415
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	107571927	140145683	12639	12394	0.0017	5.58942651660787e-16	107567415	107567415	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	46393097	14462	14184	0.0037	NA	NA	NA	5.3479853459305e-28	45487335	46407311
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46394835	47017598	68	67	0.2338	5.3479853459305e-28	45487335	46407311	7.66210242102678e-33	46552024	47058901
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47021415	77917893	10062	9889	-0.0149	7.66210242102678e-33	46552024	47058901	1.35557600271716e-75	77917893	77917893
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.7495	1.35557600271716e-75	77917893	77917893	7.2024762810782e-74	77928738	77928738
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	104999634	9620	9442	-0.0166	7.2024762810782e-74	77928738	77928738	1.11406324312584e-08	104997953	104999634
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	105001200	105007450	3	3	0.6106	1.11406324312584e-08	104997953	104999634	5.5129613323207e-09	105007450	105008098
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	105008098	124328915	6711	6583	-0.0128	5.5129613323207e-09	105007450	105008098	1.17388502051311e-12	124327243	124328915
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	-0.7456	1.17388502051311e-12	124327243	124328915	5.54973643527025e-11	124340356	124368725
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	132797428	2940	2885	-0.0312	5.54973643527025e-11	124340356	124368725	1.45253956415437e-09	132797428	132797428
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	0.7877	1.45253956415437e-09	132797428	132797428	6.11893790272555e-08	132801463	132802775
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	134739406	723	715	-0.0358	6.11893790272555e-08	132801463	132802775	8.1580054301305e-09	134739406	134739406
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134740920	134743423	2	2	0.8289	8.1580054301305e-09	134739406	134739406	6.6715481638308e-08	134743423	134746574
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	134746574	135285645	209	206	-0.0052	6.6715481638308e-08	134743423	134746574	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	1608676	561	554	0.0646	NA	NA	NA	2.12785554774685e-44	1601041	1616917
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1610476	1780263	73	71	0.4471	2.12785554774685e-44	1601041	1616917	1.28316438260580e-91	1777692	1782966
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1782966	4923300	1138	1115	-0.0084	1.2831643826058e-91	1777692	1782966	8.6606523623855e-17	4923300	4923300
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4931000	4	4	-0.8173	8.6606523623855e-17	4923300	4923300	1.38320179055703e-18	4931000	4931000
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4932214	5741031	362	356	0.0123	1.38320179055703e-18	4931000	4931000	1.18341227707209e-61	5741031	5741031
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.7635	1.18341227707209e-61	5741031	5741031	2.20562605038273e-70	5765438	5765438
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	9624964	1666	1633	-1e-04	2.20562605038273e-70	5765438	5765438	1.42296711458615e-227	9616982	9631379
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	9629309	10261094	276	271	0.3512	1.42296711458615e-227	9616982	9631379	2.2121081632771e-263	10256933	10268169
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	10262555	49666382	12623	12389	-0.005	2.2121081632771e-263	10256933	10268169	3.4323537426632e-23	49663240	49683052
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49671267	49710027	9	9	-0.5876	3.4323537426632e-23	49663240	49683052	2.23124754450685e-20	49699428	49721954
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	55114405	177	173	0.0424	2.23124754450685e-20	49699428	49721954	1.79976701846233e-33	55097806	55124730
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55118214	55209626	40	39	-0.3797	1.79976701846233e-33	55097806	55124730	3.53113504840345e-48	55202450	55219985
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	58438043	1259	1245	0.0143	3.53113504840345e-48	55202450	55219985	1.35571462927756e-07	58438043	58438043
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58439949	58447267	2	2	0.7012	1.35571462927756e-07	58438043	58438043	6.87726106651433e-09	58447267	58449579
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58449579	81540765	8697	8540	0.0231	6.87726106651433e-09	58447267	58449579	2.63029565687460e-08	81538067	81540765
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81544262	81544262	1	0	NA	2.6302956568746e-08	81538067	81540765	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81551675	81557345	3	3	0.646	NA	NA	NA	1.88985653745884e-09	81557345	81561626
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81561626	84939605	1359	1338	0.0047	1.88985653745884e-09	81557345	81561626	1.11581517110643e-32	84939605	84939605
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84942392	84951675	6	6	-0.824	1.11581517110643e-32	84939605	84939605	1.19392087393779e-35	84951675	84951675
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	84961098	99021938	4166	4079	0.0097	1.19392087393779e-35	84951675	84951675	4.92261640880558e-14	99010068	99031550
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99025912	99074552	23	23	0.2812	4.92261640880558e-14	99010068	99031550	2.46512083848265e-13	99054841	99081056
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	134450318	12844	12598	0.0079	2.46512083848265e-13	99054841	99081056	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	11116883	4329	4254	0.0341	NA	NA	NA	0	11116883	11116883
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	-3.5164	0	11116883	11116883	4.49573615384411e-239	11140421	11140421
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	69	0.0415	4.49573615384411e-239	11140421	11140421	4.31689571080871e-11	11393473	11395862
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-0.479	4.31689571080871e-11	11393473	11395862	1.17575729355861e-12	11435643	11440927
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	29732618	6410	6279	0.0297	1.17575729355861e-12	11435643	11440927	1.09173904767176e-10	29732618	29732618
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	29734087	29736426	2	2	-0.7835	1.09173904767176e-10	29732618	29732618	2.12290774795312e-09	29736426	29736426
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	29738417	33184017	1098	1076	0.0469	2.12290774795312e-09	29736426	29736426	8.2511160965104e-10	33178741	33184017
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-0.7995	8.2511160965104e-10	33178741	33184017	9.81704090384445e-11	33198331	33198331
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	46992235	3559	3482	0.0164	9.81704090384445e-11	33198331	33198331	0	46992235	46992235
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46995053	46996769	2	2	-5.6406	0	46992235	46992235	0	46996769	46996769
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46998876	80662066	11856	11621	0.0143	0	46996769	46996769	6.50726949671587e-15	80662066	80662066
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80663923	80666751	2	2	-0.9763	6.50726949671587e-15	80662066	80662066	3.44279539423528e-15	80666751	80666751
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	80668695	98316278	5136	5017	-0.0029	3.44279539423528e-15	80666751	80666751	4.41126226217296e-16	98316278	98316278
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98318378	98320165	3	3	-0.8199	4.41126226217296e-16	98316278	98316278	4.79771599235921e-15	98320165	98320165
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98327582	130943064	12127	11889	0.0013	4.79771599235921e-15	98320165	98320165	1.02703442700533e-15	130943064	130943064
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.0291	1.02703442700533e-15	130943064	130943064	1.03665579246500e-13	130946248	130946248
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	538	-0.0043	1.036655792465e-13	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	31428172	4884	4781	-0.0052	NA	NA	NA	1.04538466006679e-12	31428172	31428172
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31431833	31436314	2	2	-0.9282	1.04538466006679e-12	31428172	31428172	2.65071362023284e-13	31436314	31436314
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	31441218	50819012	7695	7545	-0.0121	2.65071362023284e-13	31436314	31436314	5.30363795564308e-10	50819012	50819012
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50820905	50822114	2	2	-0.813	5.30363795564308e-10	50819012	50819012	8.89150473216825e-10	50822114	50822114
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	50826116	56650373	1442	1424	-0.0016	8.89150473216825e-10	50822114	50822114	7.6021175303233e-31	56646284	56650373
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56657371	1	0	NA	7.6021175303233e-31	56646284	56650373	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56681665	13	13	-0.558	NA	NA	NA	8.53530851986733e-36	56681665	56685341
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56685341	70809457	3349	3291	0	8.53530851986733e-36	56681665	56685341	3.05544339242371e-20	70809457	70809457
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	70814916	70819824	2	2	-1.0756	3.05544339242371e-20	70809457	70809457	3.06112859582891e-19	70819824	70819824
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	70824802	100690991	9690	9498	-0.0019	3.06112859582891e-19	70819824	70819824	1.43097497758290e-51	100690991	100690991
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.7356	1.4309749775829e-51	100690991	100690991	8.1543314664684e-47	100693892	100693892
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4467	-0.0125	8.1543314664684e-47	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18798641	7	7	0.5039	NA	NA	NA	8.86792103758318e-20	18544772	18864561
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18864561	19548246	60	57	-0.1896	8.86792103758318e-20	18544772	18864561	2.01631376049453e-14	19484013	19566615
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19549728	21569312	1004	983	0.004	2.01631376049453e-14	19484013	19566615	3.38132053041435e-98	21556721	21579483
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21569676	22041571	235	230	0.2797	3.38132053041435e-98	21556721	21579483	2.93680991982323e-161	22034704	22046097
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22042671	65138384	14601	14323	-0.0141	2.93680991982323e-161	22034704	22046097	9.47364582371106e-25	65138384	65138384
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	65143023	65145120	3	3	-1.0237	9.47364582371106e-25	65138384	65138384	1.29385054978822e-23	65145120	65145120
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	65149384	73071404	3510	3449	-0.0212	1.29385054978822e-23	65145120	65145120	2.51836268381658e-256	73071404	73071404
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	2.51836268381658e-256	73071404	73071404	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	-2.3787	NA	NA	NA	2.73960928332534e-236	73092112	73092112
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	79174722	2914	2863	-0.0107	2.73960928332534e-236	73092112	73092112	3.66343522248215e-09	79171460	79174722
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	0.5634	3.66343522248215e-09	79171460	79174722	1.07964172050798e-09	79183154	79185548
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105595302	9296	9126	-0.0172	1.07964172050798e-09	79183154	79185548	7.2580719606607e-12	105588527	105597555
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105632168	13	13	-0.3713	7.2580719606607e-12	105588527	105597555	9.43046563500455e-18	105632168	105673157
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	21	-1.0552	9.43046563500455e-18	105632168	105673157	2.03412937901306e-06	105769543	105787390
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105798116	6	6	-1.6886	2.03412937901306e-06	105769543	105787390	1.51614071882156e-16	105798116	105799261
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105799261	105881893	28	25	-0.8367	1.51614071882156e-16	105798116	105799261	5.08450931853606e-28	105881677	105897061
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105948347	17	17	-0.0248	5.08450931853606e-28	105881677	105897061	0.000197652918477300	105919618	105951399
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	105985458	12	12	0.3252	0.0001976529184773	105919618	105951399	6.9226276933336e-09	105985422	106002179
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105989160	106218059	95	94	-0.0197	6.9226276933336e-09	105985422	106002179	1.71243835974303e-14	106214372	106221696
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	15	-0.4342	1.71243835974303e-14	106214372	106221696	4.79626045631788e-09	106252126	106260962
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	35	0.001	4.79626045631788e-09	106252126	106260962	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18749895	8	8	0.0946	NA	NA	NA	0.000111986089603813	18692865	18837737
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18810004	20308014	149	147	-0.2192	0.000111986089603813	18692865	18837737	1.41232617327032e-13	20020938	20335887
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	20482988	57	57	0.0025	1.41232617327032e-13	20020938	20335887	6.37710819357239e-11	20482988	20482988
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20484967	20486192	2	2	-0.7955	6.37710819357239e-11	20482988	20482988	2.57851974045167e-10	20486192	20490569
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20490569	22219332	267	261	0.0017	2.57851974045167e-10	20486192	20490569	7.59293340952906e-16	22219332	22219332
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22238807	22250971	2	2	-0.979	7.59293340952906e-16	22219332	22219332	3.90575767106262e-14	22250971	22250971
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22351404	52677106	11583	11352	-0.0177	3.90575767106262e-14	22250971	22250971	4.98360360306057e-11	52677106	52677106
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52678335	52679547	2	2	-0.8729	4.98360360306057e-11	52677106	52677106	7.53433631810095e-11	52679547	52679547
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52680612	75115806	9815	9613	-0.0202	7.53433631810095e-11	52679547	52679547	8.30147133860243e-14	75115806	75115806
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	-0.9761	8.30147133860243e-14	75115806	75115806	9.78389690078738e-14	75119713	75119713
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	95609756	7443	7293	-0.0258	9.78389690078738e-14	75119713	75119713	9.5044927225019e-48	95609756	95609756
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95616750	95632390	6	6	-1.0312	9.5044927225019e-48	95609756	95609756	1.08386655810552e-48	95632390	95632390
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	95656272	99632987	1712	1685	-0.0302	1.08386655810552e-48	95632390	95632390	1.05072399378479e-16	99632987	99632987
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.0011	1.05072399378479e-16	99632987	99632987	9.95706208345897e-18	99635701	99635701
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	262	-0.02	9.95706208345897e-18	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	460	-0.0037	NA	NA	NA	2.92725707411969e-18	1296767	1296767
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.2504	2.92725707411969e-18	1296767	1296767	1.43503907330137e-16	1300341	1300341
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	2600740	538	527	-0.011	1.43503907330137e-16	1300341	1300341	3.35598217886848e-05	2589724	2600740
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	-0.5981	3.35598217886848e-05	2589724	2600740	3.09592730447989e-08	2639798	2649851
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	14876356	4452	4361	0.0201	3.09592730447989e-08	2639798	2649851	5.28454870190655e-13	14678535	14956177
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15037844	16	15	-0.3234	5.28454870190655e-13	14678535	14956177	6.31380158120485e-13	15034210	15042407
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15039224	22338034	2064	2025	0.0165	6.31380158120485e-13	15034210	15042407	7.81256434690945e-10	22315373	22541389
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22541389	22617217	11	11	-0.3314	7.81256434690945e-10	22315373	22541389	7.88302335998803e-09	22609825	22652265
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	32379126	3014	2939	0.0119	7.88302335998803e-09	22609825	22652265	3.88745000613113e-63	31862577	32481309
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	43	0.4661	3.88745000613113e-63	31862577	32481309	4.03877859416595e-80	33536526	33559207
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	54348362	3078	3021	-0.0209	4.03877859416595e-80	33536526	33559207	9.70881151620455e-17	54343465	54363713
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54352394	54379839	11	10	-0.4904	9.70881151620455e-17	54343465	54363713	1.01914232184445e-05	54376805	54390060
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54402057	4	4	0.6058	1.01914232184445e-05	54376805	54390060	1.11667299591481e-11	54399890	54405667
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54405667	68693086	4589	4510	-0.0032	1.11667299591481e-11	54399890	54405667	6.38281797622143e-08	68674071	68712507
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-0.3303	6.38281797622143e-08	68674071	68712507	4.51585117793281e-08	68747578	68847568
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2176	-0.0099	4.51585117793281e-08	68747578	68847568	0	75093957	75093957
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	2	-4.5479	0	75093957	75093957	9.47050783398476e-290	75100865	75100865
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	598	-0.0108	9.47050783398476e-290	75100865	75100865	0	76925748	76925748
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-4.5722	0	76925748	76925748	0	76940218	76940218
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	83735082	2661	2606	-0.0201	0	76940218	76940218	1.38733506458005e-07	83730032	83735082
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83737935	83741493	2	2	0.7412	1.38733506458005e-07	83730032	83735082	8.78849549973735e-07	83741493	83748460
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83748460	88690571	1850	1823	-0.0179	8.78849549973735e-07	83741493	83748460	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	414	0.0451	NA	NA	NA	1.19882764368159e-71	1028979	1028979
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	2.3209	1.19882764368159e-71	1028979	1028979	3.48711495708856e-67	1030766	1030766
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	427	0.0482	3.48711495708856e-67	1030766	1030766	5.24198546602211e-14	1904451	1904451
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	0.9053	5.24198546602211e-14	1904451	1904451	9.7747926744471e-17	1906391	1906391
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	15727076	5445	5346	0.028	9.7747926744471e-17	1906391	1906391	1.70918352313117e-11	15727076	15727076
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	0.9255	1.70918352313117e-11	15727076	15727076	4.24545446929634e-33	15733964	15733964
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	31457889	5733	5625	0.0174	4.24545446929634e-33	15733964	15733964	1.23209983613972e-38	31447686	31457889
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.4554	1.23209983613972e-38	31447686	31457889	3.06674862776045e-26	31499568	31891535
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	360	-0.0193	3.06674862776045e-26	31499568	31891535	4.21152783089618e-09	32828797	32828797
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	0.7326	4.21152783089618e-09	32828797	32828797	3.16024649732387e-08	32832642	32832642
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	33980676	284	276	-0.018	3.16024649732387e-08	32832642	32832642	0	33980676	33980676
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	33983764	34371361	174	172	0.8095	0	33980676	33980676	5.61013253132947e-62	34368694	34376482
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34372789	34570471	82	77	0.3997	5.61013253132947e-62	34368694	34376482	6.54953784010942e-34	34559735	34581984
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34571847	35225487	335	328	0.6899	6.54953784010942e-34	34559735	34581984	8.95378952484401e-242	35224008	35227013
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	35227013	35692022	207	201	0.1747	8.95378952484401e-242	35224008	35227013	2.57019792213920e-37	35678206	35706513
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	35693674	36673853	366	360	-0.0188	2.5701979221392e-37	35678206	35706513	1.97148038180699e-57	36673853	36673853
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	1.1516	1.97148038180699e-57	36673853	36673853	1.96741158274972e-54	36684619	36684619
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41519702	2011	1974	0.0086	1.96741158274972e-54	36684619	36684619	1.21892637665111e-08	41506317	41526558
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41564408	20	19	-0.2536	1.21892637665111e-08	41506317	41526558	8.19253527795213e-19	41562786	41568539
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41566540	41710400	47	46	-0.6762	8.19253527795213e-19	41562786	41568539	1.19003750404660e-175	41710400	42142363
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52440878	3480	3405	0.0218	1.1900375040466e-175	41710400	42142363	0	52440878	52440878
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-5.1695	0	52440878	52440878	0	52447064	52447064
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	78653545	10196	10027	0.0104	0	52447064	52447064	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15900	-3e-04	NA	NA	NA	7.26708981082045e-42	53092949	53092949
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.5929	7.26708981082045e-42	53092949	53092949	1.63383626660861e-40	53099601	53099601
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6634	-0.0089	1.63383626660861e-40	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	213	0.0414	NA	NA	NA	1.70023215826527e-13	790526	790526
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.3275	1.70023215826527e-13	790526	790526	2.88061077924317e-14	794978	794978
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	266	0.0282	2.88061077924317e-14	794978	794978	5.24429326948737e-32	1398325	1398325
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.9628	5.24429326948737e-32	1398325	1398325	1.69004961851261e-44	1400840	1400840
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3353960	926	906	0.0213	1.69004961851261e-44	1400840	1400840	1.11133594782555e-13	3353960	3353960
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	1.1102	1.11133594782555e-13	3353960	3353960	1.83781953796092e-15	3356334	3356334
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	11448975	3750	3670	0.0247	1.83781953796092e-15	3356334	3356334	1.47781377010174e-14	11448975	11448975
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.0823	1.47781377010174e-14	11448975	11448975	2.24856221536131e-15	11452390	11452390
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	23105894	4723	4636	0.0191	2.24856221536131e-15	11452390	11452390	5.23030361147095e-14	23105894	23108527
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23108527	23113720	3	3	0.8512	5.23030361147095e-14	23105894	23108527	1.50623761459101e-16	23110685	23113720
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23114764	40540618	2793	2744	-0.0065	1.50623761459101e-16	23110685	23113720	1.43781958027249e-08	40539029	40540618
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	-0.6269	1.43781958027249e-08	40539029	40540618	3.3676599205642e-08	40553315	40556205
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	58208527	7771	7643	0.014	3.3676599205642e-08	40553315	40556205	1.04325220814877e-10	58201323	58212113
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58241773	14	14	-0.3198	1.04325220814877e-10	58201323	58212113	3.89408001221513e-10	58239871	58249435
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58244012	58951429	316	314	0.0041	3.89408001221513e-10	58239871	58249435	8.83419944237081e-12	58945391	58951429
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58952695	58955783	3	3	-0.7436	8.83419944237081e-12	58945391	58951429	4.88094954818984e-10	58955783	58959220
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58959220	61557826	1189	1167	0.0026	4.88094954818984e-10	58955783	58959220	4.65219378847936e-09	61556428	61557826
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61559132	61560427	2	2	-0.8659	4.65219378847936e-09	61556428	61557826	1.11370782822598e-10	61560427	61560427
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	61566194	63788698	1068	1049	-0.0225	1.11370782822598e-10	61560427	61560427	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	574	-0.0212	NA	NA	NA	3.00551830788801e-257	1506379	1506379
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	9	2.0207	3.00551830788801e-257	1506379	1506379	2.20877765324258e-293	1532433	1532433
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	51898377	17174	16860	-0.0097	2.20877765324258e-293	1532433	1532433	3.27809645919071e-13	51876866	51898377
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51903443	51906833	2	0	NA	3.27809645919071e-13	51876866	51898377	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51910029	51916264	3	3	0.5163	NA	NA	NA	7.89269306762387e-09	51916264	51917762
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51917762	52080395	66	64	-0.0091	7.89269306762387e-09	51916264	51917762	6.20037451436131e-49	52080395	52080395
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.9638	6.20037451436131e-49	52080395	52080395	1.52656089394297e-34	52090393	52090393
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	56896329	1470	1444	-0.0076	1.52656089394297e-34	52090393	52090393	2.7974868575547e-15	56896329	56896329
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56898026	56899350	2	2	-1.0232	2.7974868575547e-15	56896329	56896329	4.44881270968166e-13	56899350	56899350
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	56901438	59888801	1164	1133	-0.0334	4.44881270968166e-13	56899350	56899350	5.72153699955406e-15	59888801	59888801
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	59892234	59893396	2	2	-1.0888	5.72153699955406e-15	59888801	59888801	3.19570682702807e-14	59893396	59893396
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	59894870	62419534	1095	1071	0.0024	3.19570682702807e-14	59893396	59893396	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9965872	5	5	0.4826	NA	NA	NA	1.51863061704211e-08	9965872	9994686
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9975302	46922972	13436	13181	-0.0028	1.51863061704211e-08	9965872	9994686	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	18125356	1132	1106	0.0065	NA	NA	NA	5.97256709796812e-10	18125356	18125356
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	0.8551	5.97256709796812e-10	18125356	18125356	8.68208695925885e-09	18129194	18129194
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	21570227	1386	1347	0.0049	8.68208695925885e-09	18129194	18129194	1.67173305408415e-08	21564629	21570227
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21571489	21576859	4	4	0.5968	1.67173305408415e-08	21564629	21570227	6.20536626923784e-09	21576859	21579649
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22354945	325	317	-0.0019	6.20536626923784e-09	21576859	21579649	4.19539124000406e-21	22354945	22354945
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22356179	22357051	2	2	-1.374	4.19539124000406e-21	22354945	22354945	6.83259337399285e-27	22357051	22357051
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22358386	37618187	7890	7741	-0.0109	6.83259337399285e-27	22357051	22357051	2.23207373924638e-08	37615031	37618187
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37621766	37626069	3	3	0.625	2.23207373924638e-08	37615031	37618187	2.72914420612231e-08	37626069	37633961
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	48448446	5311	5194	-0.0158	2.72914420612231e-08	37626069	37633961	7.92460455620615e-08	48448446	48448446
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	0.7482	7.92460455620615e-08	48448446	48448446	5.88709480192621e-07	48452959	48455492
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	49567768	499	485	-0.015	5.88709480192621e-07	48452959	48455492	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	124528	29	27	0.0934	NA	NA	NA	2.83465593262946e-14	122273	127113
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	1.1737	2.83465593262946e-14	122273	127113	1.56790954179579e-24	130528	130528
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	266212	93	92	0.0144	1.56790954179579e-24	130528	130528	9.88835370154822e-09	264886	266212
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.064	9.88835370154822e-09	264886	266212	3.60516605164247e-17	267079	267079
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	845758	438	427	0.0416	3.60516605164247e-17	267079	267079	6.03108827524896e-14	843614	849437
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	848806	859452	9	9	0.4816	6.03108827524896e-14	843614	849437	1.95189508387976e-11	856619	860688
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	2426938	964	950	0.0337	1.95189508387976e-11	856619	860688	3.91576308934277e-25	2426938	2426938
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.4254	3.91576308934277e-25	2426938	2426938	3.07770972808002e-41	2428307	2428307
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2510846	70	69	0.0274	3.07770972808002e-41	2428307	2428307	1.85939644585659e-29	2510846	2510846
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	1.1587	1.85939644585659e-29	2510846	2510846	1.42172446345383e-19	2512881	2512881
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2672401	152	150	0.006	1.42172446345383e-19	2512881	2512881	2.0281023874278e-08	2668419	2687984
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2295	2.0281023874278e-08	2668419	2687984	1.72755447323903e-191	2708291	2708291
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1752	0.9491	1.72755447323903e-191	2708291	2708291	1.49576007347497e-07	8450789	8452395
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8458058	2	2	0.0745	1.49576007347497e-07	8450789	8452395	4.80188519447429e-10	8458058	8459880
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8459880	19375467	4680	4592	0.9684	4.80188519447429e-10	8458058	8459880	1.38932947185325e-14	19375467	19375467
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19376772	19378637	2	2	-0.0995	1.38932947185325e-14	19375467	19375467	2.58078948900306e-14	19378637	19378637
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	19381726	76042773	16381	16080	0.9702	2.58078948900306e-14	19378637	19378637	4.98523997089947e-86	76042773	76042773
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	76052473	76060932	14	14	0.0017	4.98523997089947e-86	76042773	76042773	4.89242394027241e-76	76060932	76060932
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	76067576	76998610	69	66	0.9436	4.89242394027241e-76	76060932	76060932	2.27233398586856e-20	76998610	76998610
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.1372	2.27233398586856e-20	76998610	76998610	3.38630068693978e-18	77010018	77010018
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	152655026	21520	21120	0.9625	3.38630068693978e-18	77010018	77010018	4.76131200342186e-12	152655026	152655026
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152656332	152657445	2	2	-0.0049	4.76131200342186e-12	152655026	152655026	3.88257753907972e-09	152657445	152669192
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	154441943	638	623	0.9373	3.88257753907972e-09	152657445	152669192	1.03482127947606e-45	154441943	154441943
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154442377	154442377	1	0	NA	1.03482127947606e-45	154441943	154441943	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	2.6283	NA	NA	NA	4.42071619460925e-80	154450309	154450309
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.9863	4.42071619460925e-80	154450309	154450309	9.77027075033053e-241	154582414	154582414
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	194	-0.0171	9.77027075033053e-241	154582414	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2721922	10	10	-5.7028	NA	NA	NA	0.00203218721821241	2721922	2760469
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2722729	2880328	71	70	-4.5968	0.00203218721821241	2721922	2760469	2.06952899858285e-09	2868108	2888494
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2882209	3223585	42	41	-5.6275	2.06952899858285e-09	2868108	2888494	3.10071047789298e-47	3223585	3773948
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	3.10071047789298e-47	3223585	3773948	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.2088	NA	NA	NA	4.22476746737463e-31	5422507	5672441
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	167	-4.6301	4.22476746737463e-31	5422507	5672441	9.334769930845e-09	7029972	7196517
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7401540	115	109	-3.6784	9.334769930845e-09	7029972	7196517	5.27071233346854e-09	7342985	7456245
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7410906	7709619	81	76	-4.9162	5.27071233346854e-09	7342985	7456245	2.73724685423290e-08	7698960	7719658
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	7782532	27	23	-3.4262	2.7372468542329e-08	7698960	7719658	0.000722069843908702	7726921	7798534
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7905286	37	36	-4.3956	0.000722069843908702	7726921	7798534	1.36400623060399e-10	7897073	7905286
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-1.7205	1.36400623060399e-10	7897073	7905286	7.33567335601318e-15	7914104	7914104
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	7992095	16	16	-4.9052	7.33567335601318e-15	7914104	7914104	5.81937869106799e-12	7992095	7992095
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7992221	7996758	2	2	-1.7204	5.81937869106799e-12	7992095	7992095	1.29687099335658e-17	7996758	7996758
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7997485	8174858	38	35	-5.2128	1.29687099335658e-17	7996758	7996758	0.000162003864822082	8149413	8174858
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8176058	8176058	1	0	NA	0.000162003864822082	8149413	8174858	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8178487	8195174	7	7	-4.2426	NA	NA	NA	1.84713517961705e-13	8195174	8201959
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8199414	8199414	1	0	NA	1.84713517961705e-13	8195174	8201959	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8201959	8280065	19	17	-5.5833	NA	NA	NA	2.80424531184676e-33	8280065	8280065
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8289709	8316416	12	11	-3.7272	2.80424531184676e-33	8280065	8280065	6.53791702712932e-06	8313045	8335081
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8324291	8949553	179	169	-4.9366	6.53791702712932e-06	8313045	8335081	3.00168965357523e-06	8938284	8949553
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8953090	8956787	3	3	-2.5751	3.00168965357523e-06	8938284	8949553	1.60233977451782e-06	8956787	8959151
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	10513747	111	103	-5.0188	1.60233977451782e-06	8956787	8959151	5.7295679948217e-68	10513747	10515697
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11673476	18	17	-1.0772	5.7295679948217e-68	10513747	10515697	4.86072350164475e-06	10645500	12527445
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	12590969	37	34	-3.2645	4.86072350164475e-06	10645500	12527445	0.0147373635519943	12530596	12637987
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12591908	12825903	52	51	-4.2399	0.0147373635519943	12530596	12637987	0.0213641650809708	12658135	12928074
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12833424	13007725	63	57	-3.4931	0.0213641650809708	12658135	12928074	0.0284303820676163	12921790	13007725
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13008662	13029929	10	9	-2.2809	0.0284303820676163	12921790	13007725	2.28089403564839e-07	13029929	13029929
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13031576	13040293	5	5	-1.242	2.28089403564839e-07	13029929	13029929	3.45224992258237e-08	13040293	13045641
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13128515	35	32	-3.2762	3.45224992258237e-08	13040293	13045641	1.21194989825576e-06	13114169	13146483
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13202163	28	26	-4.4785	1.21194989825576e-06	13114169	13146483	0.00242758868307613	13146483	13322865
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13208776	14354682	386	362	-5.0356	0.00242758868307613	13146483	13322865	7.34444668689001e-08	14352278	14356069
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14356069	14368151	6	6	-3.2333	7.34444668689001e-08	14352278	14356069	1.33617455291969e-07	14361297	14370346
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14370346	14407293	20	20	-4.6984	1.33617455291969e-07	14361297	14370346	5.7585703134344e-26	14407293	14407293
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14411113	3	3	-1.5074	5.7585703134344e-26	14407293	14407293	7.85387928508813e-15	14411113	14411113
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14411982	14411982	1	0	NA	7.85387928508813e-15	14411113	14411113	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14413754	14451317	23	22	-4.4959	NA	NA	NA	1.53132814496258e-08	14445814	14454048
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14454048	14466597	10	10	-3.0994	1.53132814496258e-08	14445814	14454048	3.29957532601757e-06	14465758	14478618
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14473497	14473497	1	0	NA	3.29957532601757e-06	14465758	14478618	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14474414	14508021	27	26	-4.507	NA	NA	NA	7.07693903722394e-12	14506319	14530328
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	7.07693903722394e-12	14506319	14530328	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14572190	24	22	-2.2534	NA	NA	NA	5.57014558297821e-19	14566592	14585542
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14579298	15139441	114	110	-4.7179	5.57014558297821e-19	14566592	14585542	0.000822160468653196	15018205	15200639
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15140278	15284717	81	76	-4.0025	0.000822160468653196	15018205	15200639	8.12460151365383e-13	15265021	15295719
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15523178	134	129	-5.106	8.12460151365383e-13	15265021	15295719	2.72329801080317e-12	15517551	15523178
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15546378	13	12	-3.1847	2.72329801080317e-12	15517551	15523178	2.23972544402410e-06	15542314	15549637
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15547576	15564959	14	14	-4.6697	2.2397254440241e-06	15542314	15549637	9.4034860491712e-06	15559959	15573648
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15566377	15630463	16	16	-3.2409	9.4034860491712e-06	15559959	15573648	2.43872061151092e-19	15621613	15642822
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15639408	15928904	48	48	-5.1709	2.43872061151092e-19	15621613	15642822	7.2402223938295e-13	15915466	15947948
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15932535	15932535	1	0	NA	7.2402223938295e-13	15915466	15947948	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15937162	15980898	19	17	-3.48	NA	NA	NA	3.92406772873351e-06	15969469	15985027
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15982684	16035717	21	20	-4.9355	3.92406772873351e-06	15969469	15985027	3.94816082485264e-07	16027648	16037646
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16064208	12	11	-3.4001	3.94816082485264e-07	16027648	16037646	1.90359701765738e-05	16059723	16074125
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16065378	16377188	105	102	-4.7022	1.90359701765738e-05	16059723	16074125	1.30471056445607e-08	16371504	16377188
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16380639	16387273	2	2	-1.0564	1.30471056445607e-08	16371504	16377188	8.48666345719663e-09	16387273	16399608
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	19610243	377	364	-4.8634	8.48666345719663e-09	16387273	16399608	8.03634822462366e-13	19610243	19610243
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.2902	8.03634822462366e-13	19610243	19610243	3.42341089542056e-14	19613864	19613864
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	21683523	460	434	-5.0552	3.42341089542056e-14	19613864	19613864	1.03707807042250e-09	21676262	21687813
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21687813	21752451	12	11	-3.3617	1.0370780704225e-09	21676262	21687813	3.15653272169334e-33	21752451	21752451
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21755980	22139807	87	80	-5.2611	3.15653272169334e-33	21752451	21752451	8.94084081849054e-27	22139807	22158616
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-3.119	8.94084081849054e-27	22139807	22158616	5.64789279817045e-15	22175425	22181855
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22178964	1	0	NA	5.64789279817045e-15	22175425	22181855	NA	NA	NA
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	25737663	94	90	-5.3061	NA	NA	NA	2.55566724967742e-111	25737663	25737663
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	26913408	18	17	-1.1385	2.55566724967742e-111	25737663	25737663	9.90198086813645e-16	26909069	26913408
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26915670	26920247	3	3	-3.5124	9.90198086813645e-16	26909069	26913408	8.77145861193924e-19	26920247	26920247
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26924187	26945893	10	10	-0.907	8.77145861193924e-19	26920247	26920247	0.0125433668528448	26945893	27006628
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	19	-2.6877	0.0125433668528448	26945893	27006628	5.56438871263834e-06	27006628	27053237
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.4207	5.56438871263834e-06	27006628	27053237	1.26229102769368e-08	27137064	27167148
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	4	-3.1485	1.26229102769368e-08	27137064	27167148	8.1279497096769e-09	27172283	27176933
MSK_252152912809_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.103	8.1279497096769e-09	27172283	27176933	NA	NA	NA
