Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	10704007	3632	3448	-0.018	NA	NA	NA	2.76558763678130e-47	10685436	10726640
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	10707016	11019366	123	115	0.542	2.7655876367813e-47	10685436	10726640	1.19380862403229e-51	11009013	11026853
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	11020497	26022917	5717	5410	-0.0296	1.19380862403229e-51	11009013	11026853	2.71974879996494e-260	26015772	26028647
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	26024256	26690698	311	294	0.7835	2.71974879996494e-260	26015772	26028647	1.08111552318529e-239	26683506	26700878
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	26692411	44657564	7043	6677	0.0162	1.08111552318529e-239	26683506	26700878	1.89949350620142e-46	44641574	44669209
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	44659571	44927856	128	123	0.5333	1.89949350620142e-46	44641574	44669209	9.69248338030028e-57	44917632	44941338
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	44930871	44930871	1	0	NA	9.69248338030028e-57	44917632	44941338	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	44932638	52376855	2950	2793	-0.036	NA	NA	NA	1.65029186134816e-31	52367251	52376855
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52378388	52379645	2	2	1.766	1.65029186134816e-31	52367251	52376855	5.6083094108349e-10	52379645	52382011
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52382011	58781646	2626	2500	-0.1013	5.6083094108349e-10	52379645	52382011	8.04944624519643e-48	58775678	58788318
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	58783636	58928762	68	61	-0.8331	8.04944624519643e-48	58775678	58788318	3.48516840434921e-05	58913919	58941916
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	58931539	58969895	18	16	-1.2906	3.48516840434921e-05	58913919	58941916	3.4496257539298e-05	58965251	58976562
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	58972218	58983412	6	6	-2.0563	3.4496257539298e-05	58965251	58976562	1.90925951237073e-05	58976562	58990512
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	58985875	59028169	25	22	-1.338	1.90925951237073e-05	58976562	58990512	1.40429493090584e-54	59028169	59029835
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	59029835	72537426	5244	4969	-0.1254	1.40429493090584e-54	59028169	59029835	3.11933599821024e-286	72537426	72537426
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	13	-3.7372	3.11933599821024e-286	72537426	72537426	1.73707860013381e-308	72579311	72579311
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	92422245	6292	5954	-0.0361	1.73707860013381e-308	72579311	72579311	9.55510297138955e-150	92407190	92443835
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92424681	93541099	475	446	0.4206	9.55510297138955e-150	92407190	92443835	1.07127385322402e-154	93511877	93560713
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	93543244	110014625	4934	4693	-0.0565	1.07127385322402e-154	93511877	93560713	8.87062758761793e-07	110006354	110023268
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110058441	7	7	-0.8477	8.87062758761793e-07	110006354	110023268	1.38506726114932e-61	110039388	110062339
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110060587	148900931	4975	4738	0.0177	1.38506726114932e-61	110039388	110062339	7.87970415805568e-307	148885937	148908127
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	148904088	150144065	617	576	0.6318	7.87970415805568e-307	148885937	148908127	3.20515759392303e-51	150129308	150174581
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150148271	150823073	257	234	0.2133	3.20515759392303e-51	150129308	150174581	5.8034582429394e-27	150819879	150823073
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	10	1.5313	5.8034582429394e-27	150819879	150823073	2.05504665153418e-26	150851439	150852858
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	153427108	1156	1098	0.2385	2.05504665153418e-26	150851439	150852858	4.23784170807127e-06	153416188	153431991
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153427311	153446387	20	19	0.7027	4.23784170807127e-06	153416188	153431991	0.0203121229750281	153438495	153451902
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153446925	153456192	4	4	0.0967	0.0203121229750281	153438495	153451902	1	153451902	153526236
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153457273	153530206	35	34	-0.1789	1	153451902	153526236	1.45987470958245e-09	153509178	153541891
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153532172	154151307	274	265	0.2469	1.45987470958245e-09	153509178	153541891	4.05016791957791e-65	154145448	154159983
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154152858	154555423	198	191	0.8302	4.05016791957791e-65	154145448	154159983	5.83519844466472e-85	154544965	154563482
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154557750	157133150	1074	1017	0.2566	5.83519844466472e-85	154544965	154563482	9.74564138984013e-58	157133150	157133150
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.9644	9.74564138984013e-58	157133150	157133150	7.55184135601058e-57	157136342	157136342
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	178476127	8484	8037	0.1445	7.55184135601058e-57	157136342	157136342	1.80844924708022e-08	178460897	178484190
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	178477463	178524070	24	24	0.6186	1.80844924708022e-08	178460897	178484190	8.46357984372654e-08	178514866	178550999
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	178526624	203202332	8036	7610	0.1463	8.46357984372654e-08	178514866	178550999	6.18819827407858e-169	203191131	203215852
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	203205450	204188401	486	458	0.644	6.18819827407858e-169	203191131	203215852	1.01234253497721e-11	204154480	204376797
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204356461	204497846	68	64	0.2713	1.01234253497721e-11	204154480	204376797	7.01937905278678e-16	204482369	204669228
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	204637883	221322864	5872	5520	-0.1199	7.01937905278678e-16	204482369	204669228	0	221300760	221347219
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	221325854	221325854	1	0	NA	0	221300760	221347219	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	221327734	234922985	5242	4980	0.2807	NA	NA	NA	0	234917235	234928313
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	234924580	238571970	1281	1199	-0.5301	0	234917235	234928313	3.58240813128372e-245	238549124	238587319
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	238574241	247186514	3416	3227	-0.1201	3.58240813128372e-245	238549124	238587319	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10286	0.0473	NA	NA	NA	2.07203555555189e-59	33076512	33076512
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-4.2681	2.07203555555189e-59	33076512	33076512	4.78861800896254e-67	33080437	33080437
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	610	0.1494	4.78861800896254e-67	33080437	33080437	9.44973805946484e-23	34539740	34551222
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	19	0.9968	9.44973805946484e-23	34539740	34551222	6.20160806700391e-25	34589997	34597294
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	35821494	483	454	0.1077	6.20160806700391e-25	34589997	34597294	4.08693227715586e-37	35821494	35821494
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	-3.1832	4.08693227715586e-37	35821494	35821494	8.78230165089391e-45	35844884	35844884
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	85465078	17275	16364	0.0157	8.7823016508939e-45	35844884	35844884	5.54660822165168e-45	85457697	85472333
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85467648	85467648	1	0	NA	5.54660822165168e-45	85457697	85472333	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85469592	85539013	34	31	0.7888	NA	NA	NA	3.88012965917425e-21	85531951	85549381
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85541355	100230798	2735	2579	0.1181	3.88012965917425e-21	85531951	85549381	1.68183765685409e-72	100173227	100255752
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	100232817	101275244	398	383	0.4906	1.68183765685409e-72	100173227	100255752	2.00157381792423e-81	101256879	101296900
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	101277720	114311353	3338	3141	0.1083	2.00157381792423e-81	101256879	101296900	1.42992208807357e-20	114245324	114323493
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	114312856	114512913	92	84	0.5032	1.42992208807357e-20	114245324	114323493	1.68230550789727e-26	114483708	114586612
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	114518531	115796599	478	449	0.0558	1.68230550789727e-26	114483708	114586612	4.17543605452229e-06	115782002	115808228
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115799330	115828114	13	13	0.578	4.17543605452229e-06	115782002	115808228	0.00102133113764572	115817832	115861083
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	115836143	135236471	4925	4660	0.1182	0.00102133113764572	115817832	115861083	2.95552646562447e-33	135209054	135256205
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	135240010	135421719	68	67	-0.4542	2.95552646562447e-33	135209054	135256205	4.98978765333217e-30	135412935	135432307
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	135424317	140948072	1700	1621	0.0794	4.98978765333217e-30	135412935	135432307	1.87614829241317e-177	140944992	140949256
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	140949256	141174430	103	99	-0.9844	1.87614829241317e-177	140944992	140949256	3.09776818279347e-44	141165133	141180123
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141177543	141439494	130	120	-0.3206	3.09776818279347e-44	141165133	141180123	2.72227905563558e-33	141425993	141457393
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	141445094	146571330	1758	1639	0.0888	2.72227905563558e-33	141425993	141457393	2.45396305123095e-241	146571330	146571330
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-5.7137	2.45396305123095e-241	146571330	146571330	2.87770091853066e-236	146592775	146592775
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	190210054	14258	13477	0.1444	2.87770091853066e-236	146592775	146592775	0	190176177	190236873
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190215080	212890878	7799	7410	-0.2514	0	190176177	190236873	1.32183735970234e-34	212890878	212890878
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212898875	4	4	-2.5382	1.32183735970234e-34	212890878	212890878	2.72086694631677e-36	212898875	212898875
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	213406718	202	192	-0.3129	2.72086694631677e-36	212898875	212898875	1.12552867950295e-56	213399855	213406718
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	213416407	213542613	26	26	-1.4277	1.12552867950295e-56	213399855	213406718	1.03576125760307e-55	213542613	213546561
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	213546561	242689978	10460	9895	-0.258	1.03576125760307e-55	213542613	213546561	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	7945793	2723	2579	-0.6287	NA	NA	NA	0	7908790	7968406
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7957609	7957609	1	0	NA	0	7908790	7968406	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7964510	10204420	820	769	0.1744	NA	NA	NA	0	10187587	10215403
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	10206252	40301871	10072	9561	-0.3742	0	10187587	10215403	7.00552473292748e-12	40283555	40309203
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	40304144	40359601	23	23	0.2029	7.00552473292748e-12	40283555	40309203	0.000125621350130577	40336873	40405610
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	40371183	41007006	143	135	0.5507	0.000125621350130577	40336873	40405610	3.77319428351408e-168	41000792	41029285
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	41019369	46769081	2143	2015	-0.3712	3.77319428351408e-168	41000792	41029285	7.3317478754301e-35	46769081	46769081
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-2.069	7.3317478754301e-35	46769081	46769081	4.08383375361449e-29	46825048	46825048
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	47460805	284	270	-0.2415	4.08383375361449e-29	46825048	46825048	1.15145510936112e-37	47460805	47460805
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47460892	47460892	1	0	NA	1.15145510936112e-37	47460805	47460805	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.3544	NA	NA	NA	1.02507110813694e-41	47466921	47466921
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	52648394	2287	2155	-0.4025	1.02507110813694e-41	47466921	47466921	2.59402767427218e-127	52634427	52662105
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	52651013	53761960	492	457	0.0934	2.59402767427218e-127	52634427	52662105	1.50112270295703e-221	53750568	53771713
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53764065	103042640	14277	13549	-0.4525	1.50112270295703e-221	53750568	53771713	0	103039259	103047820
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	103044435	103044435	1	0	NA	0	103039259	103047820	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	103047820	164005577	20214	19180	0.5508	NA	NA	NA	2.22456861995530e-54	164005577	164005577
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	3.1054	2.2245686199553e-54	164005577	164005577	3.44208399877559e-27	164027724	164036648
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	20	1.1474	3.44208399877559e-27	164027724	164036648	6.99502512140506e-12	164101776	164142230
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	164115417	1	0	NA	6.99502512140506e-12	164101776	164142230	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164121847	186927042	7431	7010	0.562	NA	NA	NA	0	186911381	186941688
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	186928558	194354505	2697	2581	0.149	0	186911381	186941688	2.61373142798414e-137	194354505	194354505
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	5	-3.8555	2.61373142798414e-137	194354505	194354505	5.48068208249151e-132	194366950	194366950
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	198293747	1565	1464	0.1811	5.48068208249151e-132	194366950	194366950	3.53169744643273e-40	198263023	198322347
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198294876	199014471	278	260	0.5161	3.53169744643273e-40	198263023	198322347	3.58301053897708e-30	198999061	199032255
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199016513	199324677	136	127	0.0358	3.58301053897708e-30	198999061	199032255	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199329592	199329592	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	1654867	536	511	-0.5518	NA	NA	NA	2.36767196685687e-133	1630552	1671203
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1656722	9815760	2857	2696	-0.0981	2.36767196685687e-133	1630552	1671203	9.89259693333452e-147	9815760	9815760
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-5.0663	9.89259693333452e-147	9815760	9815760	1.16815245252004e-304	9842644	9842644
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	107275274	27755	26270	-0.2721	1.16815245252004e-304	9842644	9842644	4.27927904135006e-314	107275274	107275274
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	3	-5.3728	4.27927904135006e-314	107275274	107275274	1.87834146198497e-128	107281410	107281410
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	119073512	3501	3328	-0.3969	1.87834146198497e-128	107281410	107281410	7.79346178542105e-109	118984979	119111289
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119090207	119844579	221	212	0.1648	7.79346178542105e-109	118984979	119111289	9.77544231969736e-56	119831443	119854347
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119846166	120471667	277	265	-0.3556	9.77544231969736e-56	119831443	119854347	3.45485288315064e-107	120459589	120622236
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	120609897	155581573	9470	8974	0.1389	3.45485288315064e-107	120459589	120622236	1.87798234730055e-74	155578702	155582598
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	155582598	155691791	56	53	1.0524	1.87798234730055e-74	155578702	155582598	2.67215515136922e-99	155689039	155694986
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	155694986	191153613	10480	9922	0.0111	2.67215515136922e-99	155689039	155694986	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	212	0.1373	NA	NA	NA	6.37820310356154e-08	729262	737829
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	870657	7	7	-0.7743	6.37820310356154e-08	729262	737829	2.84410849715645e-08	870657	905462
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	873365	13360963	3761	3548	0.0851	2.84410849715645e-08	870657	905462	1.33938155236642e-135	13325291	13405564
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13371531	14313271	279	260	0.6587	1.33938155236642e-135	13325291	13405564	7.27838202226639e-15	14285021	14343905
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	14314899	14636801	145	137	0.9964	7.27838202226639e-15	14285021	14343905	7.17432421169299e-35	14622304	14646761
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	14640546	15118837	188	183	0.4679	7.17432421169299e-35	14622304	14646761	4.06863588557912e-138	15072069	15159698
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	15125402	155411053	40882	38731	0.0585	4.06863588557912e-138	15072069	15159698	1.63323429905491e-145	155404062	155411053
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155416484	155421443	4	4	1.2115	1.63323429905491e-145	155404062	155411053	6.66708983290695e-18	155421443	155432745
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155427589	180644810	8278	7877	0.169	6.66708983290695e-18	155421443	155432745	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	2382363	924	869	-0.2343	NA	NA	NA	0	2372003	2389598
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	2384001	18371831	5613	5311	0.3639	0	2372003	2389598	1.24751021120345e-38	18363970	18371831
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18373481	18378787	3	3	1.5342	1.24751021120345e-38	18363970	18371831	1.18645153859512e-13	18378787	18382523
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18380299	32548736	5135	4862	0.3308	1.18645153859512e-13	18378787	18382523	1.60740362794267e-89	32548736	32558677
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32558677	32600962	10	10	-2.0004	1.60740362794267e-89	32548736	32558677	1.26141519466342e-33	32597877	32605300
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	33170318	228	218	0.2869	1.26141519466342e-33	32597877	32605300	2.33521717755983e-45	33082556	33194533
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	33179396	54035000	8075	7642	-0.0846	2.33521717755983e-45	33082556	33194533	6.48737273488102e-87	54035000	54035000
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-4.3153	6.48737273488102e-87	54035000	54035000	3.31773777601946e-95	54042734	54042734
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	108021003	14426	13645	0.0066	3.31773777601946e-95	54042734	54042734	6.03217317029353e-159	108008155	108033271
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	108022282	108950530	406	387	-0.4915	6.03217317029353e-159	108008155	108033271	2.41417034037742e-168	108935337	108961249
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	108952285	125493300	5430	5122	0.0339	2.41417034037742e-168	108935337	108961249	3.37133746128322e-14	125455531	125504344
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	125495667	125585019	41	40	0.4631	3.37133746128322e-14	125455531	125504344	1.87535857238315e-14	125578582	125600447
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	125587415	165643653	14014	13290	-0.0112	1.87535857238315e-14	125578582	125600447	1.74075901744837e-138	165643653	165643653
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-4.5465	1.74075901744837e-138	165643653	165643653	2.05868971589207e-134	165650610	165650610
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1696	-0.0188	2.05868971589207e-134	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	94019554	28735	27246	-0.0274	NA	NA	NA	0	94000215	94035020
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	94020811	141690753	21198	20048	0.3747	0	94000215	94035020	5.6739713447002e-43	141687978	141690753
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	2.0302	5.6739713447002e-43	141687978	141690753	3.23142505305693e-44	141714168	141720324
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	3.23142505305693e-44	141714168	141720324	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2368	0.3359	NA	NA	NA	4.53495213990033e-58	147702365	147702365
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.9943	4.53495213990033e-58	147702365	147702365	1.34302491459102e-57	147707161	147707161
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	151728811	1630	1527	0.3936	1.34302491459102e-57	147707161	147707161	6.16642666350114e-10	151724590	151732266
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151747905	10	9	-0.4852	6.16642666350114e-10	151724590	151732266	1.89847761324222e-09	151743145	151753700
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151750057	158783642	2592	2454	0.36	1.89847761324222e-09	151743145	151753700	0.040622155227998	158614135	158811268
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158790943	158821263	6	6	-0.1518	0.040622155227998	158614135	158811268	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	-0.5985	NA	NA	NA	5.67191681366427e-40	581533	581533
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.0025	5.67191681366427e-40	581533	581533	1.30674855603437e-69	588865	588865
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	28208003	9366	8880	-0.5363	1.30674855603437e-69	588865	588865	0	28182114	28217357
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	28210342	37786112	2970	2808	0.0223	0	28182114	28217357	3.27134191341799e-80	37765816	37804892
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	37788872	38458908	283	265	0.4535	3.27134191341799e-80	37765816	37804892	7.05527537633462e-59	38452727	38465886
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38459986	38463561	2	0	NA	7.05527537633462e-59	38452727	38465886	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38465886	38609736	48	45	1.4383	NA	NA	NA	7.09054913406801e-66	38602949	38621141
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38615392	38615392	1	0	NA	7.09054913406801e-66	38602949	38621141	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	38621141	39350798	283	272	0.3998	NA	NA	NA	9.13525657999963e-20	39323411	39367542
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	0.902	9.13525657999963e-20	39323411	39367542	1.18257424641311e-36	39499752	39511632
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	42021132	841	804	0.2695	1.18257424641311e-36	39499752	39511632	1.61023103713362e-17	41992065	42052067
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	42022642	42263387	88	80	0.6489	1.61023103713362e-17	41992065	42052067	6.26338825515923e-30	42248580	42279937
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	42266054	56656195	2933	2779	0.1681	6.26338825515923e-30	42248580	42279937	4.73283999603993e-104	56605158	56737495
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	56666607	58780839	595	561	0.5464	4.73283999603993e-104	56605158	56737495	2.57557683135203e-172	58736064	58829374
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58787720	99550733	12094	11450	0.1171	2.57557683135203e-172	58736064	58829374	3.03459908566741e-17	99534102	99561989
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	99554452	99679146	51	48	-0.3489	3.03459908566741e-17	99534102	99561989	9.45348343356682e-16	99662492	99703264
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	99682257	101811939	912	858	0.0991	9.45348343356682e-16	99662492	99703264	1.76962737035368e-24	101798007	101821397
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	101813128	102059027	81	77	0.5497	1.76962737035368e-24	101798007	101821397	1.50710471184576e-26	102046458	102106768
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102061994	119103403	5070	4773	0.078	1.50710471184576e-26	102046458	102106768	2.306286579888e-09	119060990	119124879
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	119106048	119250655	63	60	0.4011	2.306286579888e-09	119060990	119124879	7.99333026158065e-09	119202761	119300248
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	119254575	146264846	8705	8227	0.0839	7.99333026158065e-09	119202761	119300248	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	11770402	4142	3931	0.3796	NA	NA	NA	6.73864935787217e-08	11736422	11776624
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11776624	11833914	12	12	1.0178	6.73864935787217e-08	11736422	11776624	3.9821626978105e-08	11823016	11861733
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	11841585	15802255	1304	1249	0.393	3.9821626978105e-08	11823016	11861733	4.64505737227675e-13	15802255	15802255
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	2.31	4.64505737227675e-13	15802255	15802255	1.28219176440910e-11	15807123	15807123
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	22477358	2377	2246	0.3994	1.2821917644091e-11	15807123	15807123	5.59201289267507e-11	22473542	22477358
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	2.259	5.59201289267507e-11	22473542	22477358	1.34594647107231e-27	22492603	22492603
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	36409434	4039	3850	0.4079	1.34594647107231e-27	22492603	22492603	0	36396031	36418729
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	36411127	70926188	1194	1127	-0.2241	0	36396031	36418729	6.43886320586051e-54	70926188	70926188
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-4.4422	6.43886320586051e-54	70926188	70926188	4.47183022528167e-56	70930528	70930528
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	83064368	4096	3870	-0.4484	4.47183022528167e-56	70930528	70930528	1.27205143425376e-74	83030016	83114868
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	83071321	83610157	170	161	0.0733	1.27205143425376e-74	83030016	83114868	6.01044048578828e-72	83596915	83621517
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	83612340	122676419	13290	12622	-0.4557	6.01044048578828e-72	83596915	83621517	2.89208098569974e-07	122673784	122676419
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	122678597	122681701	3	3	0.8278	2.89208098569974e-07	122673784	122676419	3.69442020559590e-06	122681701	122683664
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	122683664	135403831	5522	5214	-0.4282	3.6944202055959e-06	122681701	122683664	0	135388510	135449507
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	135405500	140145683	1789	1696	0.209	0	135388510	135449507	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9227	0.0351	NA	NA	NA	1.03792859446402e-16	27036630	27038538
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	1.7354	1.03792859446402e-16	27036630	27038538	1.83029365212594e-28	27041812	27043861
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	74492079	13354	12631	-0.0079	1.83029365212594e-28	27041812	27043861	3.34469817415537e-127	74474846	74503876
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	74493455	75634226	483	455	0.4173	3.34469817415537e-127	74474846	74503876	6.34792101830758e-38	75611181	75661069
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	75635597	76192882	226	212	0.0214	6.34792101830758e-38	75611181	75661069	3.48106025084980e-38	76168061	76235321
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76194936	77206449	456	431	0.4235	3.4810602508498e-38	76168061	76235321	8.13039057089345e-52	77189113	77233994
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77208514	77208514	1	0	NA	8.13039057089345e-52	77189113	77233994	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77210684	77917893	341	317	0.0289	NA	NA	NA	1.12455352767726e-14	77917893	77917893
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	1.6459	1.12455352767726e-14	77917893	77917893	4.86685756790225e-11	77928738	77936034
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	79230922	512	479	0.1475	4.86685756790225e-11	77928738	77936034	8.67210928683819e-15	79228853	79230922
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	79233586	79239495	4	4	1.235	8.67210928683819e-15	79228853	79230922	1.48514474091883e-12	79239495	79245706
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	79242556	83915082	1214	1153	0.1519	1.48514474091883e-12	79239495	79245706	0	83905185	83933606
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	83917795	88905200	1538	1451	-0.4285	0	83905185	83933606	1.51409743484957e-124	88854843	89256027
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	89245881	89872759	244	232	-1.0584	1.51409743484957e-124	88854843	89256027	3.43632211772787e-138	89853455	89899169
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	89879205	102256465	4876	4608	-0.4269	3.43632211772787e-138	89853455	89899169	0	102246419	102266900
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	102258173	102258173	1	0	NA	0	102246419	102266900	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	102260576	135285645	11824	11184	0.0925	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1681	-0.3288	NA	NA	NA	1.53257352927185e-15	4920907	4923300
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-1.8562	1.53257352927185e-15	4920907	4923300	1.10401359768470e-100	4932214	4932214
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	31882601	9580	9046	-0.2314	1.1040135976847e-100	4932214	4932214	1.75855283394845e-115	31855130	31902431
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	31890522	32699498	246	233	0.2998	1.75855283394845e-115	31855130	31902431	4.19839630418723e-74	32685203	32735010
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	32701222	34454061	709	675	-0.2068	4.19839630418723e-74	32685203	32735010	9.31187967901269e-107	34449032	34457136
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34457136	34698777	87	84	0.7384	9.3118796790127e-107	34449032	34457136	3.68779973214045e-15	34653837	34767532
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34705301	34994417	118	112	0.2768	3.68779973214045e-15	34653837	34767532	0.0982351408358809	34896646	35022776
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34996324	35046790	11	10	0.6375	0.0982351408358809	34896646	35022776	3.90835244448792e-07	35037668	35068551
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	35055810	35300412	114	106	-0.091	3.90835244448792e-07	35037668	35068551	1.56853159335521e-25	35294847	35305013
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	35302675	35345643	26	25	-1.0071	1.56853159335521e-25	35294847	35305013	2.26106329552909e-25	35342586	35350610
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	35348055	46809593	3194	3032	-0.182	2.26106329552909e-25	35342586	35350610	4.31968830073001e-21	46789247	46822632
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46811404	46914637	50	49	0.2781	4.31968830073001e-21	46789247	46822632	3.82783835946221e-11	46897571	46951312
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46917892	55118214	993	947	-0.1057	3.82783835946221e-11	46897571	46951312	3.5576455973072e-20	55097753	55124730
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55197848	33	32	0.5531	3.5576455973072e-20	55097753	55124730	6.62889447430008e-30	55194990	55203706
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55200744	61483003	2524	2391	-0.2489	6.62889447430008e-30	55194990	55203706	6.70986337774209e-275	61456471	61551630
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	61485364	71971569	3996	3764	0.1168	6.70986337774209e-275	61456471	61551630	2.25898582360258e-34	71903673	71985542
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	71972771	71998307	22	21	0.4888	2.25898582360258e-34	71903673	71985542	1.60532417007737e-39	71986297	72027432
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	71999375	83095568	3959	3749	0.1473	1.60532417007737e-39	71986297	72027432	3.39695679508884e-274	83094449	83097076
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83097076	83481316	184	170	-0.9184	3.39695679508884e-274	83094449	83097076	2.47657068472519e-181	83478439	83485425
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	83483602	107153485	7546	7130	-0.0921	2.47657068472519e-181	83478439	83485425	7.76351801202357e-41	107146857	107155002
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107155002	107177546	11	11	0.6432	7.76351801202357e-41	107146857	107155002	1.94083479781166e-184	107176389	107183398
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107178916	134450318	10124	9558	-0.214	1.94083479781166e-184	107176389	107183398	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	274	-0.0297	NA	NA	NA	5.91166642513463e-11	734832	736988
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-1.293	5.91166642513463e-11	734832	736988	1.97588224683036e-08	743223	745410
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3258	-0.0786	1.97588224683036e-08	743223	745410	6.64275666659531e-10	9425687	9531133
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	12	0.6789	6.64275666659531e-10	9425687	9531133	9.9202222297126e-14	9589725	9607363
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	11104973	570	538	-0.144	9.9202222297126e-14	9589725	9607363	2.87432825873045e-10	11098025	11109483
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11130871	10	9	0.6803	2.87432825873045e-10	11098025	11109483	1.46965739562030e-07	11126558	11163596
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11140421	1	0	NA	1.4696573956203e-07	11126558	11163596	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	14899666	1530	1456	-0.0637	NA	NA	NA	4.4290984045691e-125	14885204	14929546
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	14914424	16847627	716	667	-0.4693	4.4290984045691e-125	14885204	14929546	0	16839576	16868227
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	16856323	16856323	1	0	NA	0	16839576	16868227	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	16868227	26778829	3248	3087	0.637	NA	NA	NA	0	26769968	26793360
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	26780132	46425386	5399	5139	0.1482	0	26769968	26793360	3.78088047637954e-33	46416613	46425386
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46427549	46446255	10	9	0.9538	3.78088047637954e-33	46416613	46425386	0.00389236168260729	46442532	46462763
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46449556	46484136	18	17	0.4988	0.00389236168260729	46442532	46462763	0.000208307231898431	46470575	46510367
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	46486040	51561606	2266	2133	0.078	0.000208307231898431	46470575	46510367	1.07444089775401e-06	51551348	51561606
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51563617	51577031	7	6	0.9355	1.07444089775401e-06	51551348	51561606	3.74563344723509e-05	51577031	51585623
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	51578320	52604587	395	377	0.1685	3.74563344723509e-05	51577031	51585623	2.41618529684821e-126	52599433	52609937
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52607453	52890136	173	164	1.0052	2.41618529684821e-126	52599433	52609937	1.72559419296891e-75	52875444	52901125
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52892970	65108396	4207	4003	0.4614	1.72559419296891e-75	52875444	52901125	0	65079563	65129332
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	65111208	87799083	6823	6469	0.0802	0	65079563	65129332	3.21581844133885e-15	87779779	87840844
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	87802887	88123167	53	49	0.5255	3.21581844133885e-15	87779779	87840844	1.26149949521156e-13	88073854	88175908
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	88132668	120177998	11613	10981	0.1027	1.26149949521156e-13	88073854	88175908	3.32138337114599e-86	120156948	120206868
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	120179794	121272504	422	404	0.471	3.32138337114599e-86	120156948	120206868	6.06006461166653e-63	121249624	121292866
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121274777	123611400	1010	946	0.0857	6.06006461166653e-63	121249624	121292866	3.66332074196643e-41	123587717	123634712
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123613878	123998045	123	113	0.6119	3.66332074196643e-41	123587717	123634712	6.6551235987927e-59	123984143	124007901
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	123999453	130943064	2259	2123	0.0373	6.6551235987927e-59	123984143	124007901	5.65755749660799e-09	130932920	130943064
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.7094	5.65755749660799e-09	130932920	130943064	6.45821478925858e-08	130946248	130947790
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	516	0.0831	6.45821478925858e-08	130946248	130947790	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	6947	-0.0979	NA	NA	NA	7.26358545322461e-62	37953582	37953582
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	-4.4366	7.26358545322461e-62	37953582	37953582	5.45648346720214e-64	37957844	37957844
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	41468701	1436	1355	-0.1303	5.45648346720214e-64	37957844	37957844	6.44169998275974e-42	41465516	41471361
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	41471361	41502898	16	16	1.1141	6.44169998275974e-42	41465516	41471361	1.08437247636491e-40	41501321	41506658
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	41506658	49964838	3427	3247	-0.1165	1.08437247636491e-40	41501321	41506658	1.02275789960891e-67	49964838	49964838
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-4.5781	1.02275789960891e-67	49964838	49964838	1.45227368200551e-61	49971732	49971732
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1715	-0.1047	1.45227368200551e-61	49971732	49971732	1.48991716713634e-06	56598485	56664197
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56685341	14	14	0.4678	1.48991716713634e-06	56598485	56664197	5.80119521966916e-08	56677538	56697807
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	71375082	3623	3433	-0.1316	5.80119521966916e-08	56677538	56697807	5.81156931691412e-70	71375082	71375082
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-4.6777	5.81156931691412e-70	71375082	71375082	2.38095857877770e-72	71377671	71377671
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	94717927	6731	6408	-0.1118	2.3809585787777e-72	71377671	71377671	7.3527245430378e-28	94697970	94731806
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	94720018	94931489	85	84	0.3316	7.3527245430378e-28	94697970	94731806	1.88860288474236e-21	94915858	94954519
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	94933255	100690991	2599	2455	-0.0753	1.88860288474236e-21	94915858	94954519	4.55337438736096e-75	100690991	100690991
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-4.8825	4.55337438736096e-75	100690991	100690991	5.35026271163802e-73	100693892	100693892
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4296	-0.0743	5.35026271163802e-73	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	55	-0.6738	NA	NA	NA	5.63101853839414e-55	19489920	19535787
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	32106435	4560	4310	0.1297	5.63101853839414e-55	19489920	19535787	0	32096572	32116671
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	32108724	34674458	1130	1065	-0.4069	0	32096572	32116671	8.67414749572999e-08	34666996	34674458
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	-1.6925	8.67414749572999e-08	34666996	34674458	2.81517848193384e-07	34683810	34685308
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	54026444	5636	5350	-0.4435	2.81517848193384e-07	34683810	34685308	4.62856344471645e-289	54014925	54040499
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	54035972	55308684	622	591	0.1228	4.62856344471645e-289	54014925	54040499	9.45294302800057e-224	55299536	55317654
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	55311054	64379548	3574	3381	-0.4006	9.45294302800057e-224	55299536	55317654	1.31534045415086e-27	64364003	64394294
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64381956	64516826	65	60	0.1457	1.31534045415086e-27	64364003	64394294	4.41781750797468e-28	64501355	64528524
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	64520471	74225065	4340	4095	-0.4173	4.41781750797468e-28	64501355	64528524	1.50339204046744e-124	74214336	74231089
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74226917	74684507	234	218	0.2114	1.50339204046744e-124	74214336	74231089	1.86314348175880e-107	74674718	74692824
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74685986	89824708	5139	4863	-0.3567	1.8631434817588e-107	74674718	74692824	3.69386475081681e-44	89816867	89831685
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	89827073	90018873	73	68	0.2863	3.69386475081681e-44	89816867	89831685	1.15675249209179e-05	89976050	90042739
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90026224	90026224	1	0	NA	1.15675249209179e-05	89976050	90042739	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90034244	90078362	15	14	0.8025	NA	NA	NA	0.0568928796388359	90064070	90112887
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90080346	90118965	21	21	0.3671	0.0568928796388359	90064070	90112887	9.2394927905932e-13	90108853	90125846
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90121088	90422910	149	142	-0.3302	9.2394927905932e-13	90108853	90125846	7.42641279414989e-05	90412519	90422910
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90424970	90429240	4	4	0.544	7.42641279414989e-05	90412519	90422910	0.000404082602456552	90429240	90436656
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	90430465	99159383	3264	3110	-0.2971	0.000404082602456552	90429240	90436656	3.98421419494326e-07	99142518	99163905
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	99161012	99191000	14	13	0.3045	3.98421419494326e-07	99142518	99163905	0.000263790014874531	99172688	99215734
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	99192987	105595302	2737	2600	-0.2274	0.000263790014874531	99172688	99215734	8.38126458072659e-30	105594189	105606424
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105597555	105602602	2	0	NA	8.38126458072659e-30	105594189	105606424	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105606424	105632168	11	10	-1.7502	NA	NA	NA	1.70110996760987e-25	105630089	105673157
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106214372	177	166	-0.2999	1.70110996760987e-25	105630089	105673157	1.08378583323567e-06	106199156	106223137
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106216726	106253648	18	18	-0.8713	1.08378583323567e-06	106199156	106223137	1.14570854741950e-09	106242757	106256498
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	34	-0.2257	1.1457085474195e-09	106242757	106256498	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	19430207	97	96	-0.3753	NA	NA	NA	1.75138012829778e-05	19382527	19910696
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19465359	20088256	59	56	-0.0536	1.75138012829778e-05	19382527	19910696	3.41106068333157e-13	20014017	20364680
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	39590440	6228	5901	-0.4559	3.41106068333157e-13	20014017	20364680	4.23403636912182e-10	39574716	39601749
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39591900	39591900	1	0	NA	4.23403636912182e-10	39574716	39601749	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39593881	39637590	25	24	0.0841	NA	NA	NA	2.75967820794913e-10	39626080	39651217
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39640539	57857337	7865	7492	-0.4558	2.75967820794913e-10	39626080	39651217	4.5255507970034e-24	57857337	57857337
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	57867565	57889044	5	5	-2.2294	4.5255507970034e-24	57857337	57857337	9.03240079333778e-25	57889044	57889044
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	57898575	60566229	1041	989	-0.505	9.03240079333778e-25	57889044	57889044	0	60553722	60581015
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	60569552	73805912	6024	5686	0.1044	0	60553722	60581015	0	73780673	73824675
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	73806962	99632987	9703	9205	-0.4389	0	73780673	73824675	1.95457554968557e-10	99632987	99632987
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.4383	1.95457554968557e-10	99632987	99632987	1.07810946389926e-09	99635701	99635701
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	257	-0.4154	1.07810946389926e-09	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	689876	258	243	0.1108	NA	NA	NA	5.57160700747801e-76	686818	696403
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	696403	843695	58	52	1.2463	5.57160700747801e-76	686818	696403	5.96747291401686e-82	837737	857149
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	846538	2896090	804	755	0.0641	5.96747291401686e-82	837737	857149	3.72681196052536e-07	2858130	2919221
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2898672	2995946	37	35	0.4946	3.72681196052536e-07	2858130	2919221	2.37750418547386e-15	2972337	3012339
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2997412	10310833	2689	2564	0.0098	2.37750418547386e-15	2972337	3012339	2.96535537499989e-190	10250531	10348329
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	10319759	10319759	1	0	NA	2.96535537499989e-190	10250531	10348329	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	10325039	11061482	292	283	0.714	NA	NA	NA	6.86138108851682e-12	11036639	11075365
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	11062761	11239641	77	71	1.1273	6.86138108851682e-12	11036639	11075365	9.07120889820667e-09	11216263	11265680
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	11242342	11419176	85	84	0.7474	9.07120889820667e-09	11216263	11265680	3.20338024706026e-56	11406299	11432207
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	11423913	31862577	6271	5932	0.0702	3.20338024706026e-56	11406299	11432207	6.94833359696215e-18	31818957	32515876
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	34063575	59	55	-0.3691	6.94833359696215e-18	31818957	32515876	2.23783308276803e-16	34056516	34074717
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34065120	55438728	3472	3280	0.0734	2.23783308276803e-16	34056516	34074717	1.38478385342642e-22	55434286	55443058
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	55439853	55474002	38	35	0.7222	1.38478385342642e-22	55434286	55443058	3.2968809509485e-25	55466948	55478420
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	55475005	65513073	2696	2552	0.0678	3.2968809509485e-25	55466948	55478420	5.794518386583e-244	65495466	65533614
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	65513968	68693086	1462	1377	-0.3385	5.794518386583e-244	65495466	65533614	1.03460513613184e-13	68693014	68693086
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68710277	1	0	NA	1.03460513613184e-13	68693014	68693086	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68712507	68753209	9	9	-1.3677	NA	NA	NA	9.98637220799735e-13	68753209	68838384
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2117	-0.3665	9.98637220799735e-13	68753209	68838384	4.22394150793539e-28	75093957	75093957
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.9143	4.22394150793539e-28	75093957	75093957	5.62529703394456e-31	75100865	75100865
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	570	-0.4606	5.62529703394456e-31	75100865	75100865	2.24957502081241e-10	76922411	76925748
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	7	0.4877	2.24957502081241e-10	76922411	76925748	3.64195906852937e-08	76940218	76948299
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	77622859	347	323	-0.4504	3.64195906852937e-08	76940218	76948299	1.51409824699095e-99	77618970	77628210
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77626514	77934288	114	107	-1.4174	1.51409824699095e-99	77618970	77628210	7.28326468719785e-166	77919041	77946447
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	77946447	83858867	2229	2112	-0.3814	7.28326468719785e-166	77919041	77946447	1.22497891160097e-08	83858867	83858867
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83860254	83861596	2	2	-2.1021	1.22497891160097e-08	83858867	83858867	4.73266887979391e-07	83861596	83864368
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83864368	88690571	1821	1734	-0.3963	4.73266887979391e-07	83861596	83864368	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1027248	415	397	0.2641	NA	NA	NA	0.0975753441770254	984489	1027248
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1027736	1028979	2	2	1.0499	0.0975753441770254	984489	1027248	0	1028979	1028979
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	2.0728	0	1028979	1028979	1.84342612719014e-07	1030766	1031233
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1592749	277	262	0.3161	1.84342612719014e-07	1030766	1031233	9.76607611142586e-65	1587195	1599959
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1594731	1904451	158	151	-0.4007	9.76607611142586e-65	1587195	1599959	4.15069361230757e-11	1904451	1904451
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.231	4.15069361230757e-11	1904451	1904451	2.75638066189508e-11	1906391	1909371
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	6882158	2080	1960	-0.3962	2.75638066189508e-11	1906391	1909371	3.86732738029191e-190	6877873	6884609
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	6882826	7664173	387	366	0.2509	3.86732738029191e-190	6877873	6884609	2.34264138537959e-167	7655284	7674827
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	7665303	30475082	8292	7827	-0.3133	2.34264138537959e-167	7655284	7674827	2.03763411552528e-185	30466380	30483161
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	30477372	31443186	418	394	0.2594	2.03763411552528e-185	30466380	30483161	2.75383983954964e-109	31431640	31462463
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31447686	32850723	398	380	-0.3469	2.75383983954964e-109	31431640	31462463	1.54732141807190e-50	32850723	32850723
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32853293	32854956	2	2	-4.2387	1.5473214180719e-50	32850723	32850723	5.14715990181176e-46	32854956	32854956
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32857473	34841379	655	612	-0.2913	5.14715990181176e-46	32854956	32854956	2.45299959102001e-68	34828378	34850363
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34843700	35198464	195	186	0.2892	2.45299959102001e-68	34828378	34850363	3.90433354668605e-82	35192331	35207038
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	35200458	36672710	586	562	-0.3352	3.90433354668605e-82	35192331	35207038	3.91617856383662e-10	36664609	36672710
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36687917	9	8	0.5702	3.91617856383662e-10	36664609	36672710	5.3517140798749e-17	36684619	36702327
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36690843	40512921	1653	1574	-0.1649	5.3517140798749e-17	36684619	36702327	1.35703132378026e-57	40502831	40521715
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40514182	41011530	154	144	0.4212	1.35703132378026e-57	40502831	40521715	8.54371533533855e-85	40869151	41026062
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41015177	43384340	745	703	-0.2729	8.54371533533855e-85	40869151	41026062	4.63431915262429e-28	43370580	43398648
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	43387212	43496064	79	77	0.2595	4.63431915262429e-28	43370580	43398648	1.12021633529775e-25	43487614	43508562
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	43497423	44335819	473	448	0.7589	1.12021633529775e-25	43487614	43508562	2.44879991247116e-294	44330019	44340048
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	44336984	54838956	3556	3361	0.0713	2.44879991247116e-294	44330019	44340048	9.24584377280527e-103	54820427	54860129
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54842123	55876724	399	373	0.5096	9.24584377280527e-103	54820427	54860129	1.13102911739799e-101	55864103	55906907
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55879911	55879911	1	0	NA	1.13102911739799e-101	55864103	55906907	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	55884236	78653545	8695	8217	0.0666	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	18156622	5562	5261	-0.1428	NA	NA	NA	0	18126324	18185214
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	18165820	53092949	10637	10071	0.4398	0	18126324	18185214	1.00886500898677e-78	53092949	53092949
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-4.2788	1.00886500898677e-78	53092949	53092949	2.59671113127741e-69	53099601	53099601
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6429	0.3207	2.59671113127741e-69	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	469	-0.0669	NA	NA	NA	1.33766184043178e-13	1395246	1398325
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.3956	1.33766184043178e-13	1395246	1398325	4.47079087828228e-16	1400840	1400840
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	13199527	5425	5086	-0.1301	4.47079087828228e-16	1400840	1400840	4.58454029796725e-288	13192736	13206759
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13201714	14153040	449	425	0.6184	4.58454029796725e-288	13192736	13206759	1.4801023040981e-101	14138779	14245870
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14154925	15953773	817	773	0.1007	1.4801023040981e-101	14138779	14245870	2.43257597224892e-65	15927523	15986845
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15955325	16837680	413	393	0.525	2.43257597224892e-65	15927523	15986845	3.03831576823252e-59	16805010	16869892
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	16840306	34868949	3105	2938	0.1782	3.03831576823252e-59	16805010	16869892	7.54226436771579e-20	34847436	34883921
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	34873624	35120475	83	79	0.6052	7.54226436771579e-20	34847436	34883921	1.63025209653684e-23	35103852	35145418
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35120501	41709950	2437	2306	0.1451	1.63025209653684e-23	35103852	35145418	0	41701855	41720999
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41711652	41712686	2	0	NA	0	41701855	41720999	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41714335	50953828	3902	3695	-0.4084	NA	NA	NA	6.65298746476731e-21	50942254	50965062
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	50957204	51048039	47	41	0.207	6.65298746476731e-21	50942254	50965062	2.91879807009927e-14	51036784	51060002
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51049268	56823430	2699	2549	-0.3175	2.91879807009927e-14	51036784	51060002	2.89414394490947e-23	56822197	56823430
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-1.8151	2.89414394490947e-23	56822197	56823430	2.4385611408226e-22	56840346	56842447
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	57895740	508	471	-0.4539	2.4385611408226e-22	56840346	56842447	1.09543057053883e-28	57895724	57902641
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57900675	57983006	13	13	-1.6951	1.09543057053883e-28	57895724	57902641	2.61936374960420e-26	57958983	57984418
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57984418	59246409	564	544	-0.4627	2.6193637496042e-26	57958983	57984418	1.54161157780393e-11	59246409	59246409
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59249279	59251831	3	3	-2.1348	1.54161157780393e-11	59246409	59246409	1.54948052203762e-11	59251831	59253728
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	63788698	2090	1975	-0.4267	1.54948052203762e-11	59251831	59253728	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	99659	29	28	0.2647	NA	NA	NA	4.18222080978571e-07	86891	131856
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	110552	368294	106	103	0.6884	4.18222080978571e-07	86891	131856	2.37365421830516e-60	365338	376686
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	369932	1506379	451	435	-0.0294	2.37365421830516e-60	365338	376686	4.0721594205448e-90	1506379	1515948
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.8797	4.0721594205448e-90	1506379	1515948	1.98549102742947e-119	1528899	1531162
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	1532433	1	0	NA	1.98549102742947e-119	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	14912459	4681	4453	-0.0627	NA	NA	NA	3.49130154998605e-40	14892155	14933753
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	14915100	15223550	148	136	-0.4909	3.49130154998605e-40	14892155	14933753	3.76307343995453e-46	15201306	15234818
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	15225378	26142400	3606	3399	-0.0233	3.76307343995453e-46	15201306	15234818	7.03621580932318e-12	26136270	26145205
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26144661	26161111	13	13	-0.5782	7.03621580932318e-12	26136270	26145205	8.41928569926483e-10	26156944	28247413
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	32302627	1312	1226	0.1766	8.41928569926483e-10	26156944	28247413	6.82561380157513e-09	32247456	32318381
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	32306316	32422190	47	44	0.5713	6.82561380157513e-09	32247456	32318381	1.56710141798118e-90	32407565	32445339
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	32423410	62419534	11176	10559	0.1606	1.56710141798118e-90	32407565	32445339	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	12748	-0.2718	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	15461843	6	6	-0.6226	NA	NA	NA	7.40751400090675e-05	14866086	15533988
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15464955	17674987	903	857	-0.0609	7.40751400090675e-05	14866086	15533988	1.86083117775536e-83	17656259	17714758
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	17675393	19112942	576	549	0.3693	1.86083117775536e-83	17656259	17714758	2.95460344098327e-152	19098360	19124870
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	19114281	22667608	1498	1420	-0.1662	2.95460344098327e-152	19098360	19124870	1.74311794859618e-28	22643742	22679305
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.8395	1.74311794859618e-28	22643742	22679305	2.33061273901331e-36	22720195	22735036
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	27503426	2613	2480	-0.2223	2.33061273901331e-36	22720195	22735036	1.64042519413429e-17	27486338	27514249
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27504543	27577510	48	47	-0.7203	1.64042519413429e-17	27486338	27514249	2.4851376063924e-58	27574535	27582132
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27579763	27579763	1	0	NA	2.4851376063924e-58	27574535	27582132	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	27582132	28342857	407	388	0.281	NA	NA	NA	2.07193562225575e-100	28317882	28355224
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28344172	41289552	6545	6178	-0.1587	2.07193562225575e-100	28317882	28355224	0	41254513	41319774
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41291691	43837229	1253	1186	-0.6639	0	41254513	41319774	0	43824791	43852802
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	43848238	44926083	555	523	0.2856	0	43824791	43852802	0	44920610	44929677
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44928769	49571068	2130	2028	-0.6601	0	44920610	44929677	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	2708291	1793	1717	-0.046	NA	NA	NA	0	2706218	2711273
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	33027906	11731	11088	0.9106	0	2706218	2711273	0	33023769	33030086
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	33030086	34640838	426	404	1.8522	0	33023769	33030086	0	34635900	34644739
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	34643054	154442377	32945	31277	0.9401	0	34635900	34644739	2.33058569752944e-91	154442377	154442377
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154447839	2	2	2.9601	2.33058569752944e-91	154442377	154442377	1.45275363184172e-13	154447839	154447839
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154449960	154449960	1	0	NA	1.45275363184172e-13	154447839	154447839	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154450309	154582414	29	28	1.0376	NA	NA	NA	3.23215284599668e-51	154578922	154586690
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	-0.1338	3.23215284599668e-51	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2817193	50	48	-4.3735	NA	NA	NA	0.000133845203180086	2808594	2825895
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2819272	2843661	9	7	-2.7883	0.000133845203180086	2808594	2825895	1.58466159983919e-10	2834262	2853217
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2843928	4174561	70	66	-4.7703	1.58466159983919e-10	2834262	2853217	1.91321444097135e-31	4174561	4272867
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	4846477	7	7	-0.9798	1.91321444097135e-31	4174561	4272867	3.15982363709062e-11	4597974	5422507
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4948824	7051884	177	162	-4.1169	3.15982363709062e-11	4597974	5422507	0.00488263530445308	6944497	7310052
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7914104	263	252	-3.6396	0.00488263530445308	6944497	7310052	2.36979563922386e-08	7708716	8057124
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	370	-4.1937	2.36979563922386e-08	7708716	8057124	1.11354848179839e-33	10512616	10515697
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10622062	11	11	-0.8252	1.11354848179839e-33	10512616	10515697	2.92119858175833e-07	10620136	11673476
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10631941	10631941	1	0	NA	2.92119858175833e-07	10620136	11673476	NA	NA	NA
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10645500	12999095	155	150	-3.5161	NA	NA	NA	1.74644460265385e-05	12973132	13007725
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13001517	13040293	18	17	-1.6035	1.74644460265385e-05	12973132	13007725	0.000186552169492584	13029929	13061201
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13133803	37	34	-3.1992	0.000186552169492584	13029929	13061201	1.41122502850499e-09	13090026	13146483
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13136828	13649497	207	194	-4.2463	1.41122502850499e-09	13090026	13146483	6.52074026216437e-05	13587025	13683483
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13663517	13716000	11	10	-3.0877	6.52074026216437e-05	13587025	13683483	9.24052054417408e-08	13701755	13749720
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	14359748	197	189	-4.5018	9.24052054417408e-08	13701755	13749720	2.210706025432e-11	14358464	14361732
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14361297	14375855	7	7	-2.4548	2.210706025432e-11	14358464	14361732	1.30560372194302e-08	14372581	14376942
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14376942	14407293	16	16	-4.6481	1.30560372194302e-08	14372581	14376942	0.105879983147813	14388689	14489032
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14409145	14508021	65	61	-3.7285	0.105879983147813	14388689	14489032	0.00465377423932274	14484920	14561228
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14644293	36	32	-2.5559	0.00465377423932274	14484920	14561228	1.40239512453463e-11	14561228	14691724
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	15932535	410	386	-4.0966	1.40239512453463e-11	14561228	14691724	0.00070054105826511	15682936	15990153
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15937162	16083793	64	58	-3.4831	0.00070054105826511	15682936	15990153	1.60010119155756e-08	16060470	16139806
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16085263	22139807	1033	971	-4.2773	1.60010119155756e-08	16060470	16139806	5.53303757770898e-08	22052726	22157319
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22178964	10	9	-2.3837	5.53303757770898e-08	22052726	22157319	1.19974116523748e-07	22177335	22200078
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	25737663	94	88	-4.3129	1.19974116523748e-07	22177335	22200078	6.5564268061749e-54	23283689	26873861
MSK_252152912811_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	77	-1.5054	6.5564268061749e-54	23283689	26873861	NA	NA	NA
