Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	65380756	25123	24685	0.043	NA	NA	NA	6.00713329102284e-40	65376244	65383339
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	65383339	65404706	11	11	-0.5281	6.00713329102284e-40	65376244	65383339	4.55235427850672e-14	65403263	65408232
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	65407064	72537426	2760	2710	0.0015	4.55235427850672e-14	65403263	65408232	0	72537426	72537426
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	10	-4.5279	0	72537426	72537426	0	72579311	72579311
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	94060783	6990	6872	0.0163	0	72579311	72579311	5.69972905458133e-85	94060783	94060783
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94061619	94062928	2	2	-2.9623	5.69972905458133e-85	94060783	94060783	1.80996682661005e-84	94062928	94062928
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	94064124	103904723	3113	3051	0.0304	1.80996682661005e-84	94062928	94062928	6.3246272672392e-47	103901454	103906464
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	104012520	16	15	0.8497	6.3246272672392e-47	103901454	103906464	3.37735964771857e-52	103962495	104012520
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104108153	109373255	1285	1270	0.0038	3.37735964771857e-52	103962495	104012520	1.47657445983169e-07	109369942	109373255
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-0.8944	1.47657445983169e-07	109369942	109373255	5.9849099305086e-07	109376249	109379566
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	110023268	295	289	0.0891	5.9849099305086e-07	109376249	109379566	4.06665700561831e-17	110023268	110023268
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-1.1626	4.06665700561831e-17	110023268	110023268	4.93754310230845e-18	110039388	110039388
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	113490029	1380	1351	0.0451	4.93754310230845e-18	110039388	110039388	8.23376499092625e-10	113487530	113490029
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113491961	113496030	3	3	-0.8549	8.23376499092625e-10	113487530	113490029	7.51816475762765e-10	113496030	113498735
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	113498735	147203277	3173	3116	0.0141	7.51816475762765e-10	113496030	113498735	2.13441011970149e-17	146283719	147315217
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147306304	147497268	34	33	-0.3323	2.13441011970149e-17	146283719	147315217	9.86764425845746e-22	147467273	147847659
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147508217	150823073	1261	1235	0.0492	9.86764425845746e-22	147467273	147847659	8.99235025712942e-218	150823073	150836481
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	2.3681	8.99235025712942e-218	150823073	150836481	7.51122712084495e-91	150848509	150851439
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151020826	75	73	0.0097	7.51122712084495e-91	150848509	150851439	1.03247478586408e-09	151017439	151028700
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151022179	151036435	7	7	0.6286	1.03247478586408e-09	151017439	151028700	2.01811990069498e-08	151026228	151040463
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2637	0.0742	2.01811990069498e-08	151026228	151040463	2.84329083462218e-16	157133150	157133150
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.4877	2.84329083462218e-16	157133150	157133150	1.52586022788076e-23	157136342	157136342
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	200598243	15463	15166	0.0288	1.52586022788076e-23	157136342	157136342	6.44898458319783e-16	200582647	200633348
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200787319	38	38	-0.2323	6.44898458319783e-16	200582647	200633348	2.65927835303548e-19	200667381	200812072
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	223421991	8206	8048	0.0288	2.65927835303548e-19	200667381	200812072	0	223419014	223439694
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	223436570	224635337	520	507	0.548	0	223419014	223439694	0	224630367	224638251
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	224636613	241340181	6278	6178	0.0066	0	224630367	224638251	1.45549706336032e-19	241054360	241356885
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241350083	241431284	32	32	-0.2963	1.45549706336032e-19	241054360	241356885	4.75783530018889e-13	241421933	241449433
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241433682	246806669	2251	2201	0.0142	4.75783530018889e-13	241421933	241449433	9.69195127336694e-11	246751473	246812425
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246811355	246862029	24	24	0.3402	9.69195127336694e-11	246751473	246812425	4.07424761518766e-11	246857496	246882156
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247186514	98	97	0.0098	4.07424761518766e-11	246857496	246882156	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	3708749	1388	1362	-0.0095	NA	NA	NA	6.7614856171171e-11	3707057	3708749
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3713664	3714236	3	3	-0.9714	6.7614856171171e-11	3707057	3708749	1.81344035628637e-19	3714236	3714236
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	3718746	33076512	9485	9305	0.0224	1.81344035628637e-19	3714236	3714236	1.122994913269e-17	33076512	33076512
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	1.2581	1.122994913269e-17	33076512	33076512	2.76083876393243e-15	33080437	33080437
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	633	0.004	2.76083876393243e-15	33080437	33080437	3.90747745741118e-36	34542224	34543992
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	18	-0.6471	3.90747745741118e-36	34542224	34543992	4.44882880339532e-36	34589997	34591681
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37785655	1362	1346	0.0055	4.44882880339532e-36	34589997	34591681	2.99087865095153e-12	37770889	37800512
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37787637	37855837	29	29	-0.2977	2.99087865095153e-12	37770889	37800512	5.56038503833185e-14	37847519	37866455
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	48481051	4361	4281	0.0275	5.56038503833185e-14	37847519	37866455	1.40239177371978e-08	48477575	48481051
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	48483732	48489056	3	3	-0.7718	1.40239177371978e-08	48477575	48481051	4.81710348754439e-08	48489056	48491032
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	48491032	50922445	905	889	0.0082	4.81710348754439e-08	48489056	48491032	4.18407218201792e-54	50920082	50922445
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50925806	50953916	14	14	-0.9126	4.18407218201792e-54	50920082	50922445	1.03487096204837e-62	50953916	50953916
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	50957309	66038336	5007	4906	0.0137	1.03487096204837e-62	50953916	50953916	8.8924302667303e-10	66032733	66038336
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66041319	66049853	3	3	-0.7965	8.8924302667303e-10	66032733	66038336	1.91537894073333e-08	66049853	66055464
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66055464	106244482	10686	10506	0.0202	1.91537894073333e-08	66049853	66055464	8.90935250826365e-13	106244482	106244482
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.1933	8.90935250826365e-13	106244482	106244482	2.31216314168636e-13	106250718	106250718
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	113473589	1686	1649	0.0235	2.31216314168636e-13	106250718	106250718	0	113473589	113476881
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	113476881	113767572	132	129	0.9506	0	113473589	113476881	0	113757824	113767572
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	113791249	146745033	9381	9197	0.0032	0	113757824	113767572	5.92731308990595e-43	146731212	146745033
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146756306	146756306	1	0	NA	5.92731308990595e-43	146731212	146745033	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146762301	146860777	13	12	-0.8937	NA	NA	NA	3.53647595531142e-47	146860777	146870898
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146870898	179767214	11157	10982	0.0188	3.53647595531142e-47	146860777	146870898	8.18422396980848e-202	179767214	179767214
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	-3.7307	8.18422396980848e-202	179767214	179767214	2.89797080068423e-194	179778919	179778919
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242505261	21476	21073	0.0266	2.89797080068423e-194	179778919	179778919	3.3415973612529e-121	242501239	242512310
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242506262	242689978	66	64	-0.6182	3.3415973612529e-121	242501239	242512310	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	11611059	4184	4110	0.029	NA	NA	NA	8.30744889057445e-14	11611059	11611059
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11613705	11614840	2	2	-1.1793	8.30744889057445e-14	11611059	11611059	1.07750051748952e-12	11614840	11614840
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11616454	37953375	8495	8352	0.0216	1.07750051748952e-12	11614840	11614840	1.98521685149624e-21	37951628	37953375
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37954819	37961110	6	6	-0.87	1.98521685149624e-21	37951628	37953375	1.01979581022678e-21	37961110	37963014
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37963014	66114019	11195	10977	0.025	1.01979581022678e-21	37961110	37963014	0	66106480	66379735
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	66376351	67565335	369	362	0.5398	0	66106480	66379735	0	67560350	67570901
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	67569070	75479859	2625	2564	0.0041	0	67560350	67570901	2.40609006910503e-17	75464737	75799026
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	76045769	27	27	-0.3599	2.40609006910503e-17	75464737	75799026	8.36522537364893e-18	76032165	76057688
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76047989	164005577	26588	26082	0.0217	8.36522537364893e-18	76032165	76057688	4.41634176524066e-87	164005577	164005577
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.9434	4.41634176524066e-87	164005577	164005577	2.86239257458411e-60	164027724	164027724
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	-0.407	2.86239257458411e-60	164027724	164027724	1.15476405367725e-14	164100804	164123806
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	170155504	1482	1454	-0.0026	1.15476405367725e-14	164100804	164123806	0	170150839	170169562
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	170169562	171549510	624	607	0.5504	0	170150839	170169562	0	171533793	171554272
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	171552366	194354505	8024	7870	0.0178	0	171533793	171554272	0	194354505	194354505
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-5.4077	0	194354505	194354505	0	194366950	194366950
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	196835413	997	979	0.0213	0	194366950	194366950	3.35240320422868e-20	196810503	196905767
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196929826	20	20	-0.4641	3.35240320422868e-20	196810503	196905767	1.09401197710226e-18	196928503	196943380
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	198038358	440	433	0.0196	1.09401197710226e-18	196928503	196943380	3.27776764277866e-10	198036999	198038358
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	198042681	2	2	-1.0908	3.27776764277866e-10	198036999	198038358	4.01704105708105e-09	198042681	198044259
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198044259	199329592	521	509	0.0108	4.01704105708105e-09	198042681	198044259	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	682752	214	214	-0.7583	NA	NA	NA	2.11442553713994e-12	682752	682752
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	685953	685953	1	0	NA	2.11442553713994e-12	682752	682752	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	0.5938	NA	NA	NA	2.48080899158898e-10	691065	691065
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	9815760	3176	3119	-0.6892	2.48080899158898e-10	691065	691065	0.000109894583487223	9760366	9827233
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9853710	5	5	-0.1278	0.000109894583487223	9760366	9827233	4.78715802186781e-10	9832823	9873149
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9861329	52948102	11058	10868	-0.8023	4.78715802186781e-10	9832823	9873149	0	52945464	52953746
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	52953746	54201708	499	492	-0.0014	0	52945464	52953746	0	54198051	54207029
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	54204450	54204450	1	0	NA	0	54198051	54207029	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	54207029	87193253	9411	9242	-0.7999	NA	NA	NA	1.72086738782944e-79	87193253	87193253
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87196350	87198840	2	2	-3.7852	1.72086738782944e-79	87193253	87193253	2.75464534431152e-78	87198840	87198840
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	87201443	119334954	10376	10188	-0.7882	2.75464534431152e-78	87198840	87198840	2.14826220710534e-79	119334954	119345371
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-3.2613	2.14826220710534e-79	119334954	119345371	3.630501118402e-38	119346804	119348829
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	119623202	89	87	-0.7888	3.630501118402e-38	119346804	119348829	2.00538559591843e-07	119507631	119639713
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119626575	119814024	27	26	-0.4823	2.00538559591843e-07	119507631	119639713	2.36286453847271e-10	119722485	119825701
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119816015	173660684	14971	14703	-0.793	2.36286453847271e-10	119722485	119825701	3.52526281980655e-40	173660684	173660684
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.3519	3.52526281980655e-40	173660684	173660684	6.43662762597807e-44	173666072	173666072
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	175860235	743	734	-0.7878	6.43662762597807e-44	173666072	173666072	4.04323966220564e-12	175860235	175860235
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	0.3534	4.04323966220564e-12	175860235	175860235	5.48457075941399e-12	175863396	175863396
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	179277855	1010	991	-0.803	5.48457075941399e-12	175863396	175863396	2.68487295795842e-211	179277855	179277855
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	179283412	179331764	7	7	-3.3627	2.68487295795842e-211	179277855	179277855	2.5403957214525e-195	179331764	179331764
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	179339178	190725579	3454	3389	-0.8092	2.5403957214525e-195	179331764	179331764	1.47309947927184e-26	190692881	190756763
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190730982	190930709	66	65	-0.4943	1.47309947927184e-26	190692881	190756763	3.95605263815176e-10	190913517	190960746
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190936155	191153613	42	40	-0.8248	3.95605263815176e-10	190913517	190960746	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	20167620	6081	5991	0.0027	NA	NA	NA	1.28192139922798e-18	20165762	20167620
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	20176351	20188273	5	5	-0.8255	1.28192139922798e-18	20165762	20167620	8.11403165767944e-15	20188273	20192612
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	20192612	21480789	266	265	6e-04	8.11403165767944e-15	20188273	20192612	7.603786057599e-09	21466144	21490654
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21606184	20	20	-0.3251	7.603786057599e-09	21466144	21490654	8.95602032934587e-10	21594627	21627340
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21610433	46150784	6755	6629	0.0041	8.95602032934587e-10	21594627	21627340	0	46136065	49595677
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	49595677	55180469	1604	1577	-0.8104	0	46136065	49595677	3.80649886962981e-11	55180469	55180469
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	55182233	55183650	2	2	-1.9906	3.80649886962981e-11	55180469	55180469	6.9854920017192e-10	55183650	55185132
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	55185132	56198960	343	338	-0.8519	6.9854920017192e-10	55183650	55185132	0	56198960	56198960
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56201410	56557143	114	111	-2.5538	0	56198960	56198960	1.32234444150825e-20	56548393	56560947
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56559543	56679499	38	37	-2.0152	1.32234444150825e-20	56548393	56560947	1.67893131872660e-247	56672997	56679499
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	56689578	133445102	22127	21706	-0.7948	1.6789313187266e-247	56672997	56679499	1.70506772707759e-16	133426915	133451788
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	133447080	133501913	33	31	-0.4955	1.70506772707759e-16	133426915	133451788	2.66139422131363e-08	133492439	133524489
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	133503458	140533456	2836	2783	-0.7653	2.66139422131363e-08	133492439	133524489	3.60752599889737e-07	140532277	140533456
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-1.7528	3.60752599889737e-07	140532277	140533456	2.66115292714532e-26	140538666	140538666
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	180342860	13420	13194	-0.7682	2.66115292714532e-26	140538666	140538666	1.73950803180531e-27	180189516	180342860
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	-0.2411	1.73950803180531e-27	180189516	180342860	1.56204456547263e-09	180358977	180365977
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	109	-0.7903	1.56204456547263e-09	180358977	180365977	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	40	-0.8216	NA	NA	NA	1.42335930370966e-58	198124	204881
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	326323	61	60	-1.7074	1.42335930370966e-58	198124	204881	3.05989468219175e-208	323898	326323
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29981912	10492	10311	-0.801	3.05989468219175e-208	323898	326323	9.82213447582745e-12	29980445	29986370
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29985620	29998009	5	5	-0.0365	9.82213447582745e-12	29980445	29986370	7.71585382489534e-09	29992946	30000990
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30000990	31457884	602	587	-0.7405	7.71585382489534e-09	29992946	30000990	1.80745332380641e-143	31457884	31457884
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31467551	31477207	5	5	-3.6225	1.80745332380641e-143	31457884	31457884	4.17352538969159e-50	31477207	31477207
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31488082	31559059	24	24	-0.7486	4.17352538969159e-50	31477207	31477207	6.90832135829019e-19	31559059	31559059
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31563829	31569053	3	3	0.3698	6.90832135829019e-19	31559059	31559059	1.38546094055187e-11	31569053	31583170
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31583170	32558677	445	440	-0.6811	1.38546094055187e-11	31569053	31583170	1.19357712593095e-141	32558677	32564884
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	15	-2.7429	1.19357712593095e-141	32558677	32564884	5.31687267780487e-18	32628420	32633691
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.7909	5.31687267780487e-18	32628420	32633691	1.41333495797892e-22	32713363	32716255
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32721872	4	4	-2.7597	1.41333495797892e-22	32713363	32716255	2.16995322279239e-59	32720656	32721872
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32723366	54035000	8263	8125	-0.7631	2.16995322279239e-59	32720656	32721872	6.67355301819069e-20	54035000	54035000
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	0.5846	6.67355301819069e-20	54035000	54035000	1.09307671298054e-25	54042734	54042734
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	72919733	4535	4452	-0.8193	1.09307671298054e-25	54042734	54042734	4.89738744080241e-93	72919733	72920894
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-3.4823	4.89738744080241e-93	72919733	72920894	1.14195365903252e-91	72923399	72924440
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	74647491	750	737	-0.7743	1.14195365903252e-91	72923399	72924440	5.99534175230589e-65	74647491	74647491
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74650995	74655219	3	3	-2.9778	5.99534175230589e-65	74647491	74647491	2.14313282195849e-65	74655219	74655219
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74662644	77490500	859	849	-0.7725	2.14313282195849e-65	74655219	74655219	2.80845327178775e-85	77490500	77490500
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77499382	77509983	3	3	-3.2886	2.80845327178775e-85	77490500	77490500	1.63896766207785e-82	77509983	77509983
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77517630	77517630	1	0	NA	1.63896766207785e-82	77509983	77509983	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	77525039	79018959	278	275	-0.8042	NA	NA	NA	1.39067500628606e-12	79008946	79024557
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.3297	1.39067500628606e-12	79008946	79024557	8.28372218607057e-13	79085247	79105311
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103827105	6761	6648	-0.8085	8.28372218607057e-13	79085247	79105311	1.09115015694815e-270	103827105	103827105
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103841482	103841482	1	0	NA	1.09115015694815e-270	103827105	103827105	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	-4.6788	NA	NA	NA	2.46177222098959e-263	103868154	103868154
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	134629897	10480	10287	-0.7895	2.46177222098959e-263	103868154	103868154	1.42799829950659e-101	134629897	134629897
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134631701	1	0	NA	1.42799829950659e-101	134629897	134629897	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134633117	134635779	3	3	-3.588	NA	NA	NA	2.96048252955859e-108	134635779	134635779
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	146314565	3852	3797	-0.8019	2.96048252955859e-108	134635779	134635779	2.23899827275838e-11	146314565	146314565
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	146317671	146319547	2	2	-1.9309	2.23899827275838e-11	146314565	146314565	1.1095100814283e-10	146319547	146319547
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	146321344	162502077	5805	5704	-0.7764	1.1095100814283e-10	146319547	146319547	3.38143350748442e-80	162502077	162502077
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162504290	162505819	2	2	-3.8598	3.38143350748442e-80	162502077	162502077	1.11762464050881e-74	162505819	162505819
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	162508430	165643653	961	944	-0.8369	1.11762464050881e-74	162505819	162505819	3.83911055161061e-10	165642393	165643653
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	3	0.0894	3.83911055161061e-10	165642393	165643653	4.43627437016858e-08	165650610	165653315
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1771	-0.79	4.43627437016858e-08	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	8790893	3160	3098	0.0532	NA	NA	NA	3.70534185063093e-10	8786329	8790893
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8793843	8793843	1	0	NA	3.70534185063093e-10	8786329	8790893	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8804002	8829893	4	4	-0.7733	NA	NA	NA	4.66956028507085e-11	8829893	8838768
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8838768	9084842	47	47	0.0697	4.66956028507085e-11	8829893	8838768	1.35473225650239e-17	9078818	9089076
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	9089076	9121920	8	8	-0.7285	1.35473225650239e-17	9078818	9089076	6.85342884194798e-22	9120007	9126097
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	9126097	16481719	2329	2279	-0.0042	6.85342884194798e-22	9120007	9126097	4.74800363751492e-97	16473598	16485394
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16483807	16720965	121	120	0.3945	4.74800363751492e-97	16473598	16485394	7.75651131597784e-82	16714687	16732263
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16724892	38258332	7930	7812	0.0208	7.75651131597784e-82	16714687	16732263	1.06050398533318e-06	38221154	38281765
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38262701	38335964	38	38	0.2186	1.06050398533318e-06	38221154	38281765	6.70923417449184e-06	38320617	38389189
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	73204680	8488	8345	0.0162	6.70923417449184e-06	38320617	38389189	0	73200778	73214366
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	73212249	73976921	266	261	0.566	0	73200778	73214366	0	73778723	74123703
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	74119417	89131230	4595	4512	0.0223	0	73778723	74123703	0	89114538	89160564
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89152602	90272345	342	336	0.509	0	89114538	89160564	0	90268704	90282433
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	90281175	100164752	3733	3658	0.0303	0	90268704	90282433	1.82685190959968e-09	100162851	100164752
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.6231	1.82685190959968e-09	100162851	100164752	1.70704549364475e-07	100174991	100178968
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	100563487	174	174	0.0714	1.70704549364475e-07	100174991	100178968	3.72613714307993e-117	100560595	100569036
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100565566	101481290	414	409	0.5657	3.72613714307993e-117	100560595	100569036	5.24601113062224e-20	101481290	101481290
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	101489722	101489799	2	2	-1.0648	5.24601113062224e-20	101481290	101481290	3.91050333585438e-23	101489799	101489799
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	101492384	109217320	3305	3234	0.5232	3.91050333585438e-23	101489799	101489799	2.15723120052221e-07	109214735	109217320
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109240210	5	5	1.1043	2.15723120052221e-07	109214735	109217320	4.80065767316177e-07	109240210	109245944
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	121007433	5339	5245	0.5322	4.80065767316177e-07	109240210	109245944	2.6652261044699e-85	120990777	121015819
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	121009667	121472776	220	215	0.829	2.6652261044699e-85	120990777	121015819	5.44599643518202e-109	121465726	121482028
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	121474753	125831554	1913	1884	0.4882	5.44599643518202e-109	121465726	121482028	1.02553397344100e-283	125831554	125831554
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.9536	1.025533973441e-283	125831554	125831554	1.49538910409996e-260	125837524	125837524
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3573	0.5278	1.49538910409996e-260	125837524	125837524	0	133433384	133433384
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	-4.0488	0	133433384	133433384	0	133448277	133448277
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	134089633	301	299	0.5118	0	133448277	133448277	1.88365478944859e-24	134089633	134089633
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	134092408	134100261	4	4	-0.6359	1.88365478944859e-24	134089633	134089633	1.22818799245635e-25	134100261	134100261
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	134102553	141410894	3395	3353	0.5241	1.22818799245635e-25	134100261	134100261	9.6790599779933e-61	141410894	141413352
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	13	-0.4616	9.6790599779933e-61	141410894	141413352	4.46171873549867e-49	141438504	141442231
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	145198051	1428	1396	0.5183	4.46171873549867e-49	141438504	141442231	6.79684156293415e-31	145187748	145199879
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145199879	145259203	27	26	1.0698	6.79684156293415e-31	145187748	145199879	8.5131123029782e-46	145259203	145263476
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	145263476	147702365	1183	1169	0.4756	8.5131123029782e-46	145259203	145263476	2.07023154874195e-58	147702365	147702365
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-2.0299	2.07023154874195e-58	147702365	147702365	1.68262122587384e-49	147707161	147707161
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	147708382	1	0	NA	1.68262122587384e-49	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147710037	151728811	1629	1598	0.5303	NA	NA	NA	1.04928707748665e-53	151728811	151728811
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.7747	1.04928707748665e-53	151728811	151728811	1.05641443021213e-49	151740878	151743145
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	158821263	2600	2550	0.4957	1.05641443021213e-49	151740878	151743145	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	-0.0923	NA	NA	NA	3.4280452498629e-21	581533	581533
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.3361	3.4280452498629e-21	581533	581533	1.41782589401339e-41	588865	588865
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	4677303	1680	1653	-0.0581	1.41782589401339e-41	588865	588865	1.01087274160148e-67	4677303	4681087
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4681087	4728084	19	19	-0.9689	1.01087274160148e-67	4677303	4681087	3.78932811208576e-75	4725650	4728084
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	4734414	6926661	571	563	-0.0114	3.78932811208576e-75	4725650	4728084	1.24206739246226e-11	6907624	7322035
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	8137794	11	11	-0.5176	1.24206739246226e-11	6907624	7322035	6.4550357324362e-13	7729311	8143301
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8139999	39350798	10672	10473	0.0153	6.4550357324362e-13	7729311	8143301	5.58425922250013e-197	39345557	39350798
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	0.8911	5.58425922250013e-197	39345557	39350798	9.50189771326545e-196	39504332	39508035
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	48840230	1628	1608	0.0345	9.50189771326545e-196	39504332	39508035	1.79648941188026e-18	48837927	48846959
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	48846959	48864530	10	9	-0.6391	1.79648941188026e-18	48837927	48846959	1.65141444523221e-14	48862266	48869217
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	48867910	51191560	541	532	-0.0591	1.65141444523221e-14	48862266	48869217	1.57466070344491e-10	51189068	51191560
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.8019	1.57466070344491e-10	51189068	51191560	6.27780232147734e-11	51200291	51202490
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	52735335	485	476	-0.0243	6.27780232147734e-11	51200291	51202490	3.28643708589433e-17	52733501	52735335
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	52737012	52744316	5	5	-0.8946	3.28643708589433e-17	52733501	52735335	7.29506094031345e-22	52744316	52744316
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	52746137	57210373	1403	1375	0.0098	7.29506094031345e-22	52744316	52744316	1.07638937345255e-85	57210373	57210373
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	57212447	57260828	20	20	0.8989	1.07638937345255e-85	57210373	57210373	4.36366082885239e-78	57260828	57260828
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	57262363	77778054	6217	6134	0.0079	4.36366082885239e-78	57260828	57260828	5.06755620756129e-08	77770838	77786486
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	77779880	77805970	14	14	-0.3458	5.06755620756129e-08	77770838	77786486	3.63500704675956e-08	77799190	77815320
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	77807739	105207717	8497	8349	0.0157	3.63500704675956e-08	77799190	77815320	0	105203909	105211146
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	105209353	105846248	264	262	0.5286	0	105203909	105211146	2.37988636476924e-280	105838505	105857203
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	105851720	146264846	12345	12135	0.0268	2.37988636476924e-280	105838505	105857203	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	2135333	760	748	0.0135	NA	NA	NA	2.22338278293905e-10	2133384	2135333
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2138129	2139868	2	2	-1.0955	2.22338278293905e-10	2133384	2135333	1.37594737452916e-11	2139868	2139868
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2143843	22477358	7075	6957	0.0115	1.37594737452916e-11	2139868	2139868	8.06009886849749e-08	22473542	22477358
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	0.9325	8.06009886849749e-08	22473542	22477358	6.10598105324501e-07	22492603	22499541
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	23338535	160	158	0.0074	6.10598105324501e-07	22492603	22499541	3.59617442344381e-09	23331804	23338535
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23365926	4	4	0.7761	3.59617442344381e-09	23331804	23338535	2.17889890397354e-25	23353267	23377660
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70926188	5069	4960	0.0193	2.17889890397354e-25	23353267	23377660	8.78409677791099e-39	70926188	70926188
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.0927	8.784096777911e-39	70926188	70926188	1.49327527460178e-40	70930528	70930528
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	98623268	9293	9141	0.0064	1.49327527460178e-40	70930528	70930528	5.2536070322509e-18	98588137	98642780
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	98625682	98866634	47	45	0.3039	5.2536070322509e-18	98588137	98642780	1.92513627897957e-17	98851081	99036544
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	98873567	115395388	5810	5723	0.0107	1.92513627897957e-17	98851081	99036544	2.81598040801992e-20	115393987	115401067
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	115396601	115437591	14	14	0.5751	2.81598040801992e-20	115393987	115401067	9.5710164076839e-15	115421860	115457453
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	115450100	115721931	90	88	0.0591	9.5710164076839e-15	115421860	115457453	1.36730248596774e-08	115721931	115721931
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	115723165	115724479	2	2	-0.7959	1.36730248596774e-08	115721931	115721931	9.49120766234005e-07	115724479	115731579
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	115731579	116124007	212	208	0.1096	9.49120766234005e-07	115724479	115731579	7.45588624317969e-14	116124007	116124007
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.1756	7.45588624317969e-14	116124007	116124007	3.15523400744683e-22	116130333	116130333
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	130021221	5325	5214	0.0227	3.15523400744683e-22	116130333	116130333	1.03013131239935e-21	130021221	130021221
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130022732	130023601	2	2	1.2154	1.03013131239935e-21	130021221	130021221	6.64525634625351e-09	130023601	130024869
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130024869	137352394	2968	2921	0.0681	6.64525634625351e-09	130023601	130024869	1.00766826314938e-27	137352394	137352394
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	2.0512	1.00766826314938e-27	137352394	137352394	4.34943929518746e-20	137356880	137356880
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1087	0.0809	4.34943929518746e-20	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	23625041	8391	8262	-0.0024	NA	NA	NA	0	23623472	23631196
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	23631196	24912330	534	520	-0.8103	0	23623472	23631196	0	24911134	24916323
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	24916323	31284926	2367	2330	-0.0045	0	24911134	24916323	6.67001156186251e-09	31284756	31284926
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-0.8098	6.67001156186251e-09	31284756	31284926	6.22833025263228e-08	31291525	31293140
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	44684091	2870	2817	-0.014	6.22833025263228e-08	31291525	31293140	3.75080654312254e-06	44679038	44684091
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44686927	44690319	2	2	-0.8793	3.75080654312254e-06	44679038	44684091	8.02429507994626e-06	44690319	44695454
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44693067	44693067	1	0	NA	8.02429507994626e-06	44690319	44695454	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44695454	45487335	288	277	-0.0122	NA	NA	NA	1.55686061723893e-63	45478162	46384985
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	45489823	46568496	73	71	-0.5406	1.55686061723893e-63	45478162	46384985	2.42903839185199e-98	46558272	47017598
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47017598	77917893	10063	9887	0.0174	2.42903839185199e-98	46558272	47017598	3.20464519941681e-22	77917870	77917893
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	0.8437	3.20464519941681e-22	77917870	77917893	1.95277824421156e-08	77928738	77936034
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	114100979	12392	12198	0.0252	1.95277824421156e-08	77928738	77936034	8.7640942978448e-165	114100979	114100979
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114103547	114106460	2	2	-4.2231	8.7640942978448e-165	114100979	114100979	7.86154875953161e-160	114106460	114106460
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	114108041	127566573	5102	5014	0.0292	7.86154875953161e-160	114106460	114106460	2.36515042003564e-13	127559479	127569849
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127568592	127599309	14	14	-0.4464	2.36515042003564e-13	127559479	127569849	2.03516975933464e-11	127592138	127612608
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127607438	135285645	2703	2663	0.0246	2.03516975933464e-11	127592138	127612608	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2089	-0.6919	NA	NA	NA	3.16397916321081e-46	5637220	5747806
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.4564	3.16397916321081e-46	5637220	5747806	2.97611877743326e-05	5760117	5796240
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	18896166	5219	5122	-0.7655	2.97611877743326e-05	5760117	5796240	7.22925943493341e-11	18892456	18896166
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-1.4499	7.22925943493341e-11	18892456	18896166	2.89948281303581e-18	18917191	18932031
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55118214	9527	9343	-0.7775	2.89948281303581e-18	18917191	18932031	3.39891268051301e-23	55097753	55127355
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55207305	38	38	-0.3836	3.39891268051301e-23	55097753	55127355	1.40253500253933e-30	55197848	55230765
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	55209626	1	0	NA	1.40253500253933e-30	55197848	55230765	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	75544439	8133	7995	-0.7162	NA	NA	NA	1.85303686814243e-37	75496709	75557559
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	75546205	75588902	24	24	-0.47	1.85303686814243e-37	75496709	75557559	3.35822086228169e-07	75577113	75607510
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	75590063	77275058	639	627	-0.7524	3.35822086228169e-07	75577113	75607510	1.16559395996496e-05	77267863	77275058
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	77282771	77292392	4	4	-0.1483	1.16559395996496e-05	77267863	77275058	7.40998230011964e-07	77292392	77296458
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	77295422	101494281	7538	7379	-0.7997	7.40998230011964e-07	77292392	77296458	2.81629696657736e-12	101494281	101494281
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	101496791	101499019	2	2	-2.0083	2.81629696657736e-12	101494281	101494281	4.88387757973391e-15	101499019	101499019
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	101501751	128523122	9692	9531	-0.7722	4.88387757973391e-15	101499019	101499019	0	128523122	128523122
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	128539399	128663812	41	40	-3.181	0	128523122	128523122	0	128663812	128663812
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	128665955	134450318	2287	2241	-0.794	0	128663812	128663812	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	6830577	2855	2807	0.0344	NA	NA	NA	2.59658485104123e-125	6826737	6833314
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	6832174	7016662	112	112	0.5693	2.59658485104123e-125	6826737	6833314	4.30125374952294e-126	7011081	7021917
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7018136	9523923	775	766	0.031	4.30125374952294e-126	7011081	7021917	3.22011648578325e-54	9523923	9531133
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.0209	3.22011648578325e-54	9523923	9531133	5.14369434668463e-24	9589725	9604633
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	9698827	36	36	0.0316	5.14369434668463e-24	9589725	9604633	2.55154627972999e-20	9691754	9705282
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9700840	9831443	48	47	0.5228	2.55154627972999e-20	9691754	9705282	2.67684933370548e-56	9817559	9837784
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9835396	11104973	486	477	-0.0024	2.67684933370548e-56	9817559	9837784	5.26326153110982e-31	11104085	11104973
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	9	0.8593	5.26326153110982e-31	11104085	11104973	5.07278570556993e-30	11140421	11143592
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	32222469	7209	7085	0.0177	5.07278570556993e-30	11140421	11143592	1.84393047655716e-08	32218763	32222469
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	32223470	32226304	3	3	-0.7765	1.84393047655716e-08	32218763	32222469	4.04664960705004e-08	32226304	32228397
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	32228397	37336557	718	702	0.0137	4.04664960705004e-08	32226304	32228397	1.08028653454296e-11	37333807	37336557
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	37344438	37357622	5	5	-0.7177	1.08028653454296e-11	37333807	37336557	6.96323204749918e-15	37357622	37359388
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	37359388	49164982	4197	4122	0.0138	6.96323204749918e-15	37357622	37359388	4.60848507854739e-48	49160078	49171528
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	49169206	49278277	46	46	0.493	4.60848507854739e-48	49160078	49171528	3.64376245322912e-47	49273177	49285088
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	49280254	49280254	1	0	NA	3.64376245322912e-47	49273177	49285088	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	49282015	78668041	10037	9870	0.0376	NA	NA	NA	1.22206870533409e-39	78665408	78679297
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78675711	78686371	6	6	-0.634	1.22206870533409e-39	78665408	78679297	6.9886229892836e-12	78681634	78688893
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	100624427	6877	6761	0.0075	6.9886229892836e-12	78681634	78688893	5.99308416239328e-13	100620923	100624427
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100626837	100629832	3	3	-0.9356	5.99308416239328e-13	100620923	100624427	1.45676440967342e-11	100629832	100631726
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100631726	114057095	4970	4858	0.0277	1.45676440967342e-11	100629832	100631726	4.08357841221046e-06	114041320	114065136
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	114057600	114092136	24	23	-0.2313	4.08357841221046e-06	114041320	114065136	1.12454516808046e-09	114075018	114149070
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	114094653	130943064	6177	6047	0.0366	1.12454516808046e-09	114075018	114149070	1.00659643961763e-64	130943064	130943064
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.7844	1.00659643961763e-64	130943064	130943064	5.45946860727225e-50	130946248	130946248
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	535	0.0361	5.45946860727225e-50	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7198	-0.0023	NA	NA	NA	2.61656726998116e-95	37953582	37953582
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	3.2612	2.61656726998116e-95	37953582	37953582	1.44322653956410e-99	37957844	37957844
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	114123340	24304	23846	0.0088	1.4432265395641e-99	37957844	37957844	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19441654	37	35	-0.2974	NA	NA	NA	2.674876551977e-15	19422841	19456276
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19442895	21549262	1025	1008	0.0228	2.674876551977e-15	19422841	19456276	3.29274405555281e-73	21536847	21559744
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21551504	22067749	261	257	0.3065	3.29274405555281e-73	21536847	21559744	5.56872083835459e-86	22057437	22079277
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22069697	34674458	4427	4334	0.0284	5.56872083835459e-86	22057437	22079277	1.17065129231736e-16	34674458	34674458
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1087	1.17065129231736e-16	34674458	34674458	6.4957305183768e-17	34683810	34683810
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1871	0.0154	6.4957305183768e-17	34683810	34683810	2.44174302349067e-16	40670538	40676611
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40722360	7	7	-0.6886	2.44174302349067e-16	40670538	40676611	1.42365717228622e-15	40722360	40726930
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40726930	79174722	14686	14406	0.0248	1.42365717228622e-15	40722360	40726930	1.13463113650100e-287	79174722	79174722
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.939	1.134631136501e-287	79174722	79174722	8.65809726789963e-260	79183154	79183154
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	9125	0.0367	8.65809726789963e-260	79183154	79183154	0	105597555	105597555
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105602602	1	0	NA	0	105597555	105597555	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105606424	105632168	11	11	-3.3875	NA	NA	NA	1.4240556829517e-109	105632168	105632168
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	50	0.0208	1.4240556829517e-109	105632168	105632168	3.56931136251269e-30	105856972	105856972
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-2.0552	3.56931136251269e-30	105856972	105856972	5.81910076146108e-43	105875924	105875924
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	175	0.0063	5.81910076146108e-43	105875924	105875924	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	-0.5545	NA	NA	NA	1.43531246487388e-11	18452491	18741716
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	147	-1.6805	1.43531246487388e-11	18452491	18741716	0	20065525	20088256
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	39944612	6439	6315	-0.8013	0	20065525	20088256	5.0670282917275e-24	39937813	39948500
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39946268	39959553	9	9	-0.3313	5.0670282917275e-24	39937813	39948500	1.20261089278443e-26	39956639	39970837
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	39961226	73729296	14715	14479	-0.7782	1.20261089278443e-26	39956639	39970837	1.17779395481982e-30	73717791	73745955
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	73731977	73731977	1	0	NA	1.17779395481982e-30	73717791	73745955	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	73734914	73797969	21	21	-0.4739	NA	NA	NA	9.64793641628973e-07	73759409	73824675
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	73800832	74669752	370	363	-0.7719	9.64793641628973e-07	73759409	73824675	4.01690415838840e-96	74669752	74669752
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.2973	4.0169041583884e-96	74669752	74669752	1.57722004921790e-81	74680439	74680439
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	74871314	68	65	-0.7469	1.5772200492179e-81	74680439	74680439	0.000199891230389260	74822089	74881670
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74874627	74937236	21	19	-1.0017	0.00019989123038926	74822089	74881670	1.27447915999186e-05	74922457	74950881
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74938729	75115806	81	80	-0.709	1.27447915999186e-05	74922457	74950881	1.83086834396457e-11	75115806	75115806
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	0.6704	1.83086834396457e-11	75115806	75115806	4.26522180998997e-16	75119713	75119713
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	87693085	4648	4571	-0.7682	4.26522180998997e-16	75119713	75119713	3.26225831636247e-06	87681602	87700985
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87693863	87713883	23	22	-0.4917	3.26225831636247e-06	87681602	87700985	0.000857531390500314	87705753	87735019
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	87714609	88145325	221	217	-0.7282	0.000857531390500314	87705753	87735019	0	88143512	88146339
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	88146339	99632987	4269	4184	0.0185	0	88143512	88146339	4.03493308915433e-51	99632987	99632987
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.41	4.03493308915433e-51	99632987	99632987	4.48235929948546e-44	99635701	99635701
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	272	0.0203	4.48235929948546e-44	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	465	-0.5988	NA	NA	NA	5.13174454641698e-12	1296767	1296767
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	0.8233	5.13174454641698e-12	1296767	1296767	7.6908853662392e-12	1300341	1300341
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	2600740	538	529	-0.6448	7.6908853662392e-12	1300341	1300341	1.07156436069463e-33	2600740	2638581
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2638581	2639798	3	3	-2.7193	1.07156436069463e-33	2600740	2638581	6.0424668164236e-42	2638643	2639798
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2649851	32379126	9557	9413	-0.7491	6.0424668164236e-42	2638643	2639798	5.6606061136068e-57	31854794	32481309
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33647856	46	45	-1.3402	5.6606061136068e-57	31854794	32481309	3.50355283369736e-51	33538171	33841331
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	54898052	3228	3174	-0.7883	3.50355283369736e-51	33538171	33841331	2.96620757678716e-09	54898052	54898052
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54899690	54901266	2	2	-1.9223	2.96620757678716e-09	54898052	54898052	5.04647068925497e-10	54901266	54901266
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54903259	57203733	1060	1038	-0.7269	5.04647068925497e-10	54901266	54901266	3.36792042921585e-06	57201427	57203733
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-1.676	3.36792042921585e-06	57201427	57203733	3.59989910569815e-46	57206772	57208375
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	69254899	3583	3530	-0.7662	3.59989910569815e-46	57206772	57208375	1.19153536843543e-47	69235233	69273814
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69258071	69304385	23	22	-0.4723	1.19153536843543e-47	69235233	69273814	0.0463814595373504	69268950	69344816
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69307059	69401319	47	45	-0.656	0.0463814595373504	69268950	69344816	2.31880235479315e-08	69378025	69428633
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69402880	69758635	161	159	-0.4305	2.31880235479315e-08	69378025	69428633	1.79899265949189e-73	69746655	69770318
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69761372	75093957	1798	1769	-0.776	1.79899265949189e-73	69746655	69770318	5.03734306332163e-56	75093957	75093957
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.3464	5.03734306332163e-56	75093957	75093957	1.79310145342705e-58	75100865	75100865
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	598	-0.8151	1.79310145342705e-58	75100865	75100865	6.5687184611583e-112	76925748	76925748
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76942679	9	9	-2.567	6.5687184611583e-112	76925748	76925748	3.9788055596559e-102	76942679	76942679
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	88690571	4512	4432	-0.7393	3.9788055596559e-102	76942679	76942679	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	418104	135	132	0.0494	NA	NA	NA	6.18198757751763e-181	415020	423068
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	423068	1028979	282	278	-0.7307	6.18198757751763e-181	415020	423068	2.74677529677791e-14	1028979	1028979
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	0.7144	2.74677529677791e-14	1028979	1028979	5.21413442933519e-14	1030766	1030766
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	430	-0.6719	5.21413442933519e-14	1030766	1030766	5.50722678570657e-11	1903358	1904451
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	0.3354	5.50722678570657e-11	1903358	1904451	1.72169410882573e-11	1906391	1909371
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	6295076	1812	1773	-0.7364	1.72169410882573e-11	1906391	1909371	0.00125915863072338	6261284	6302032
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	6297323	6336537	17	17	-0.4739	0.00125915863072338	6261284	6302032	1.76317578921186e-15	6329594	6366394
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	6339163	32019682	9431	9249	-0.7548	1.76317578921186e-15	6329594	6366394	3.66908152428176e-13	31982348	32033550
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32022115	32062343	18	18	-0.495	3.66908152428176e-13	31982348	32033550	4.97774008208227e-07	32045630	32106224
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32069339	32828797	286	282	-0.8011	4.97774008208227e-07	32045630	32106224	5.0001860832644e-09	32826928	32828797
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	0.2002	5.0001860832644e-09	32826928	32828797	5.53745225146333e-06	32832642	32833765
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1418	-0.7357	5.53745225146333e-06	32832642	32833765	7.28200073163624e-37	36673853	36673853
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-2.1631	7.28200073163624e-37	36673853	36673853	2.76951742561276e-34	36683509	36683509
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41007660	1809	1781	-0.7008	2.76951742561276e-34	36683509	36683509	8.16666275027654e-07	40869151	41007660
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41011530	41031191	5	5	-1.3711	8.16666275027654e-07	40869151	41007660	3.03910981054668e-07	41026062	41067756
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41566540	219	215	-0.7127	3.03910981054668e-07	41026062	41067756	1.08956508658708e-51	41562786	41570512
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42147225	49	49	-1.3161	1.08956508658708e-51	41562786	41570512	7.92741011716184e-59	42142363	42151941
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42148637	58054500	5744	5631	-0.759	7.92741011716184e-59	42142363	42151941	9.44126172760075e-27	58027036	58072591
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58056292	58087598	19	19	-0.4795	9.44126172760075e-27	58027036	58072591	8.38900147447097e-54	58072591	58132664
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58089807	78636731	7911	7755	-0.7373	8.38900147447097e-54	58072591	58132664	6.22809351931775e-56	78620280	78636731
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	78637954	78653545	2	2	-0.1206	6.22809351931775e-56	78620280	78636731	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	173	-0.8005	NA	NA	NA	8.13586569851931e-19	500897	500897
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	0.6395	8.13586569851931e-19	500897	500897	4.21717825119582e-17	505456	505456
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	36509250	10805	10608	-0.792	4.21717825119582e-17	505456	505456	6.71700119076154e-87	36509250	36509250
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36514792	36519728	2	2	-3.963	6.71700119076154e-87	36509250	36509250	3.87055552471781e-84	36519728	36519728
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	36524577	53092949	5215	5143	-0.7964	3.87055552471781e-84	36519728	36519728	2.87371236174398e-22	53092949	53092949
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-2.4431	2.87371236174398e-22	53092949	53092949	8.49354425229707e-22	53099601	53099601
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6655	-0.8114	8.49354425229707e-22	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	485	-0.5878	NA	NA	NA	1.46852101913984e-35	1398325	1398325
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.0116	1.46852101913984e-35	1398325	1398325	6.37993244228946e-42	1400840	1400840
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	7123224	2696	2648	-0.6512	6.37993244228946e-42	1400840	1400840	0	7123224	7123224
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	7125795	8077282	435	424	1.192	0	7123224	7123224	2.46863744662768e-24	8073708	8083744
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8079411	8144248	31	30	1.728	2.46863744662768e-24	8073708	8083744	1.16692243737730e-05	8114261	8181198
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8146344	8981129	345	338	1.4392	1.1669224373773e-05	8114261	8181198	3.06859422596589e-249	8973909	8987814
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8984513	11448975	1171	1154	0.8972	3.06859422596589e-249	8973909	8987814	1.67420180591824e-22	11448975	11448975
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	2.7218	1.67420180591824e-22	11448975	11448975	2.72923825816795e-25	11452390	11452390
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	12180988	287	283	0.857	2.72923825816795e-25	11452390	11452390	0	12179966	12193087
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12193087	20386500	3754	3692	0.0628	0	12179966	12193087	4.83647059937689e-37	20384757	20420327
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20399700	20507235	17	16	-0.7135	4.83647059937689e-37	20384757	20420327	3.42122719682176e-23	20474417	20510787
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20510787	20841320	90	89	-0.0411	3.42122719682176e-23	20474417	20510787	7.59690946585477e-07	20795869	20857921
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20897098	15	15	-0.3822	7.59690946585477e-07	20795869	20857921	1.61427962583256e-38	20887746	20906926
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20900139	56823430	10536	10352	0.0422	1.61427962583256e-38	20887746	20906926	5.17316418924448e-35	56822197	56823430
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	8	-0.7396	5.17316418924448e-35	56822197	56823430	9.93022950665304e-19	56840346	56842447
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	58208527	586	574	-0.0253	9.93022950665304e-19	56840346	56842447	1.55970283122566e-07	58196296	58219396
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58212113	58252109	18	18	0.2846	1.55970283122566e-07	58196296	58219396	0.00031546381174578	58234974	58297157
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58254174	59414898	570	559	0.0075	0.00031546381174578	58234974	58297157	2.86429561587138e-14	59412581	59414898
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434202	10	10	-0.6529	2.86429561587138e-14	59412581	59414898	8.385291156017e-17	59434202	59440262
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	63788698	1994	1953	0.0101	8.385291156017e-17	59434202	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	577	0.0196	NA	NA	NA	4.32507612769263e-174	1506379	1511632
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	8	-2.4623	4.32507612769263e-174	1506379	1511632	1.30818836112023e-228	1531162	1532433
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	26145205	8437	8305	0.0091	1.30818836112023e-228	1531162	1532433	3.13552415927332e-09	26130512	26155133
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26147112	29306447	21	21	-0.2283	3.13552415927332e-09	26130512	26155133	3.45228484526909e-20	28247413	29351507
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29308105	62419534	12525	12305	0.0429	3.45228484526909e-20	28247413	29351507	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10115958	15	15	-0.2509	NA	NA	NA	2.93194001112647e-17	10079654	10144881
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10136303	22573420	3048	2982	-0.7835	2.93194001112647e-17	10079654	10144881	8.96148278360863e-101	22573420	22573420
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22577751	22585040	3	3	-3.6138	8.96148278360863e-101	22573420	22573420	6.53249344487293e-100	22585040	22585040
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	22589739	36229718	5186	5089	-0.8007	6.53249344487293e-100	22585040	22585040	0	36226578	36233372
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36233372	36772172	282	277	0.0398	0	36226578	36233372	0	36770173	36773813
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36773813	46922972	4907	4805	-0.7437	0	36770173	36773813	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	18093176	1114	1100	-0.7145	NA	NA	NA	3.73438881261817e-17	18088300	18108254
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18095689	18132555	21	20	-0.2276	3.73438881261817e-17	18088300	18108254	7.66287030701115e-13	18116623	18140659
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18135475	22679305	1849	1816	-0.6968	7.66287030701115e-13	18116623	18140659	3.59492790126607e-10	22643742	22686731
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22682428	22714979	15	15	-0.2177	3.59492790126607e-10	22643742	22686731	4.50037385253581e-15	22712211	22721042
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22715919	22715919	1	0	NA	4.50037385253581e-15	22712211	22721042	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22718614	29615121	3769	3695	-0.7507	NA	NA	NA	0	29613775	29619257
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	29619257	30087871	236	233	0.0657	0	29613775	29619257	0	30086218	30091120
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	30091120	34962555	2265	2220	-0.7725	0	30086218	30091120	2.83464801197547e-07	34958412	34962555
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	34963704	34980028	6	6	-0.1896	2.83464801197547e-07	34958412	34962555	2.0700948586379e-05	34980028	34988826
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	34982156	35472378	275	270	-0.6758	2.0700948586379e-05	34980028	34988826	2.78767181406398e-13	35472378	35472378
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.0349	2.78767181406398e-13	35472378	35472378	4.96684305771413e-12	35476942	35476942
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49050046	6789	6658	-0.7052	4.96684305771413e-12	35476942	35476942	1.35096804147477e-12	49047484	49050046
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49051263	49056694	4	4	0.0438	1.35096804147477e-12	49047484	49050046	8.69165903334031e-05	49056694	49064695
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49057875	49571068	210	206	-0.6062	8.69165903334031e-05	49056694	49064695	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1431411	789	772	-0.0424	NA	NA	NA	3.58611012995119e-08	1431240	1431411
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-1.2989	3.58611012995119e-08	1431240	1431411	9.9936506191242e-11	1432953	1432953
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	599	-0.0289	9.9936506191242e-11	1432953	1432953	1.24922598815811e-15	2302065	2302065
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.0541	1.24922598815811e-15	2302065	2302065	1.04502071130654e-19	2304398	2304398
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2416516	123	121	-0.0434	1.04502071130654e-19	2304398	2304398	5.18718778898314e-08	2415736	2416516
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2417450	2418497	3	3	-0.8335	5.18718778898314e-08	2415736	2416516	2.27734831983414e-08	2418497	2418980
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2418980	2672401	236	230	-0.0129	2.27734831983414e-08	2418497	2418980	6.36422736672488e-05	2659678	2692498
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2395	6.36422736672488e-05	2659678	2692498	8.6366453600669e-147	2708291	2708291
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22523	0.9801	8.6366453600669e-147	2708291	2708291	8.19009410252484e-48	76998610	76998610
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	3.5519	8.19009410252484e-48	76998610	76998610	6.51449706935786e-50	77010018	77010018
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	138632881	17413	17098	0.9826	6.51449706935786e-50	77010018	77010018	1.40884543971731e-120	138631731	138634970
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	138634970	138736298	52	51	0.1946	1.40884543971731e-120	138631731	138634970	1.06403279272886e-103	138735184	138737309
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	138737309	154582414	4728	4629	0.9678	1.06403279272886e-103	138735184	138737309	0	154578922	154582414
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	196	-0.0894	0	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	123	-4.5655	NA	NA	NA	7.29318958580249e-18	3780462	4413507
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-1.7062	7.29318958580249e-18	3780462	4413507	6.16005412081401e-08	4948824	6692482
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	169	-3.9934	6.16005412081401e-08	4948824	6692482	1.98655235167742e-06	7011055	7211779
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7485594	128	126	-3.1306	1.98655235167742e-06	7011055	7211779	0.00127765186154835	7401540	7491280
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7491280	7600570	11	10	-5.0747	0.00127765186154835	7401540	7491280	1.73814676072612e-11	7600570	7606496
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7603458	7653082	22	21	-2.645	1.73814676072612e-11	7600570	7606496	1.3844100447297e-13	7647060	7658121
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	44	-4.3981	1.3844100447297e-13	7647060	7658121	1.37012185146171e-12	7719658	7723783
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7751430	11	10	-2.4581	1.37012185146171e-12	7719658	7723783	2.46732654693871e-05	7749796	7785973
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7755522	10513747	436	417	-4.1233	2.46732654693871e-05	7749796	7785973	8.5032275096274e-30	10511255	10515697
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	11698871	19	19	-1.3169	8.5032275096274e-30	10511255	10515697	5.30368155256744e-07	11249952	12533900
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12973899	138	134	-3.2428	5.30368155256744e-07	11249952	12533900	0.000318378601015869	12845704	13022741
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12975651	13128515	63	58	-2.384	0.000318378601015869	12845704	13022741	1.87693645155562e-09	13104920	13138841
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13256555	43	41	-3.8422	1.87693645155562e-09	13104920	13138841	0.000233543471989465	13173328	13327446
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13259414	13603478	162	154	-4.5001	0.000233543471989465	13173328	13327446	4.77114505448696e-05	13568153	13603478
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13606316	13705594	14	10	-3.2493	4.77114505448696e-05	13568153	13603478	1.08736450939075e-05	13705594	13759681
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13716000	1	0	NA	1.08736450939075e-05	13705594	13759681	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716331	14358464	196	192	-4.7127	NA	NA	NA	5.20383803082518e-13	14335755	14382361
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14359748	14508021	89	87	-3.7677	5.20383803082518e-13	14335755	14382361	3.3590151885523e-11	14502379	14536962
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14508894	1	0	NA	3.3590151885523e-11	14502379	14536962	NA	NA	NA
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	24	-1.8966	NA	NA	NA	1.71071495819005e-05	14563486	14579298
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-4.7592	1.71071495819005e-05	14563486	14579298	5.00776240088718e-16	14598838	14598838
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14644293	4	4	-1.2689	5.00776240088718e-16	14598838	14598838	2.59469302437911e-10	14644293	14644293
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14681738	14700040	13	13	-3.6805	2.59469302437911e-10	14644293	14644293	0.000759948562708805	14696387	14708015
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14731122	17	17	-4.705	0.000759948562708805	14696387	14708015	0.000783032750600815	14714948	14734647
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14734647	14747796	6	6	-3.3096	0.000783032750600815	14714948	14734647	2.4959342608328e-08	14744771	14758901
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14754064	14883615	20	18	-5.0936	2.4959342608328e-08	14744771	14758901	0.00100377506375636	14857726	14928703
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	14994704	16	16	-3.9346	0.00100377506375636	14857726	14928703	0.000259414833440230	14958284	14994704
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15005207	15018205	3	3	-1.3957	0.00025941483344023	14958284	14994704	2.13632778486251e-06	15018205	15022037
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15022037	15122414	23	22	-4.3827	2.13632778486251e-06	15018205	15022037	1.60557864755404e-05	15107365	15137457
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15124246	15153922	14	14	-2.9731	1.60557864755404e-05	15107365	15137457	0.0147520231742097	15143138	15179500
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15154705	15208612	31	30	-4.0031	0.0147520231742097	15143138	15179500	0.000563598254220653	15199550	15222741
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15241527	10	10	-2.4791	0.000563598254220653	15199550	15222741	6.09465180542274e-10	15228303	15245772
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15242592	15433122	128	119	-4.4808	6.09465180542274e-10	15228303	15245772	8.89008158666162e-07	15429742	15433122
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15446156	5	5	-2.2306	8.89008158666162e-07	15429742	15433122	1.59998438758141e-05	15446156	15450495
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15447091	15521958	31	31	-4.3112	1.59998438758141e-05	15446156	15450495	0.0135204470839502	15473709	15582236
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15523178	15690301	54	53	-3.4721	0.0135204470839502	15473709	15582236	3.64748448147797e-06	15603855	15716500
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15695261	15915466	36	35	-4.6445	3.64748448147797e-06	15603855	15716500	2.91044284315198e-08	15892492	15949457
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16067790	58	55	-3.3778	2.91044284315198e-08	15892492	15949457	0.00623784820556164	16033774	16067790
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16068838	16079877	7	7	-4.8063	0.00623784820556164	16033774	16067790	1.19498597283406e-16	16079877	16079877
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16082040	16085263	3	3	-2.6263	1.19498597283406e-16	16079877	16079877	3.55507458914774e-11	16085263	16085263
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16087502	16103913	11	11	-4.6959	3.55507458914774e-11	16085263	16085263	7.05387457456353e-10	16103913	16110790
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16107406	16177411	25	22	-3.0305	7.05387457456353e-10	16103913	16110790	1.39013232156853e-05	16169603	16177411
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	16187669	8	8	-4.3916	1.39013232156853e-05	16169603	16177411	7.67493761994076e-07	16187669	16190541
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16189066	16194420	4	4	-2.7934	7.67493761994076e-07	16187669	16190541	0.110455054737611	16190541	16304538
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16195788	22157319	985	953	-4.2945	0.110455054737611	16190541	16304538	1.95515641621693e-07	22055660	22157319
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-2.1807	1.95515641621693e-07	22055660	22157319	1.01061500728176e-10	22177335	22178964
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22216169	15	15	-4.3668	1.01061500728176e-10	22177335	22178964	0.000146324064218420	22203194	22232997
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22232997	22371003	17	17	-5.3496	0.00014632406421842	22203194	22232997	0.000289910557677364	22367156	22789287
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22373608	25737663	63	55	-4.5462	0.000289910557677364	22367156	22789287	1.33206960986067e-44	25737663	26872527
MSK_252152912814_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26870361	57440809	84	80	-1.5448	1.33206960986067e-44	25737663	26872527	NA	NA	NA
