Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	8154502	2540	2511	0.0561	NA	NA	NA	0	8109919	8175968
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	8157546	23365898	5882	5805	-0.3979	0	8109919	8175968	0	23352545	23378222
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	23367082	31234311	2980	2930	0.1104	0	23352545	23378222	2.67954647658881e-55	31234311	31234311
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	31235747	31262348	14	13	-1.6999	2.67954647658881e-55	31234311	31234311	2.9532908537505e-54	31262348	31262348
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	31265013	50280393	7624	7509	0.1844	2.9532908537505e-54	31262348	31262348	4.49730801028705e-291	50263462	50294221
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	50282030	52376855	865	845	-0.3852	4.49730801028705e-291	50263462	50294221	7.68259173256642e-10	52376855	52376855
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52378388	52379645	2	2	1.4727	7.68259173256642e-10	52376855	52376855	6.6905692946813e-09	52379645	52382011
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	52382011	58884491	2669	2628	-0.3959	6.6905692946813e-09	52379645	52382011	6.88232217306832e-126	58882252	58886175
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	58886175	59060123	87	87	-1.4475	6.88232217306832e-126	58882252	58886175	9.07486540874605e-138	59054073	59063356
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	59063356	109987341	16933	16702	-0.3841	9.07486540874605e-138	59054073	59063356	5.97043591255115e-08	109984914	109987341
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	-2.1472	5.97043591255115e-08	109984914	109987341	9.74069131619467e-08	109989998	109989998
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	118210028	3074	3029	-0.4035	9.74069131619467e-08	109989998	109989998	2.54636442053464e-224	118190999	118225812
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	118212232	121052394	829	819	0.0946	2.54636442053464e-224	118190999	118225812	1.87122847227928e-21	121005974	143631328
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	141559466	144093719	106	104	-0.2983	1.87122847227928e-21	121005974	143631328	2.57006881366030e-23	143829340	144113654
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	150785448	1844	1824	0.1121	2.5700688136603e-23	143829340	144113654	9.04456366783076e-11	150780557	150799456
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150796077	150823073	14	14	-0.6384	9.04456366783076e-11	150780557	150799456	9.7098581301926e-33	150819879	150823073
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150852858	11	11	1.5549	9.7098581301926e-33	150819879	150823073	2.65439653768001e-31	150851439	150857070
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	153188683	1038	1025	0.1169	2.65439653768001e-31	150851439	150857070	3.8245334821352e-09	153162448	153208052
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153191679	153288718	49	47	0.5028	3.8245334821352e-09	153162448	153208052	2.21186945371855e-10	153275735	153320506
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	153291590	157133150	1673	1647	0.1241	2.21186945371855e-10	153275735	153320506	1.63000713830907e-30	157133150	157133150
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-3.2622	1.63000713830907e-30	157133150	157133150	8.52030129318565e-32	157136342	157136342
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	199587864	14967	14747	0.1215	8.52030129318565e-32	157136342	157136342	2.1257048789981e-11	199573755	199587864
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	199589299	199603162	7	7	-0.6241	2.1257048789981e-11	199573755	199587864	3.66549141688841e-240	199603162	199611322
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	199604731	247186514	17936	17697	0.1282	3.66549141688841e-240	199603162	199611322	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	100688511	32244	31725	0.1245	NA	NA	NA	0	100657424	100741177
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	100701982	112749123	3097	3057	-0.4151	0	100657424	100741177	4.51799218147671e-08	112745189	112752277
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112750646	112769858	7	7	0.5397	4.51799218147671e-08	112745189	112752277	5.80707225617407e-08	112764889	112773459
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	112771424	131353216	4835	4767	-0.4147	5.80707225617407e-08	112764889	112773459	1.25013521215481e-07	131353216	131353216
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131358126	131361678	2	2	-2.1626	1.25013521215481e-07	131353216	131353216	2.84168606178755e-08	131361678	131361678
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131366176	136996650	1788	1767	-0.4019	2.84168606178755e-08	131361678	131361678	0	136973124	137007261
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	136999283	190642250	17536	17279	0.1416	0	136973124	137007261	6.64243228339639e-15	190625381	190664290
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190646216	190760193	41	40	0.6652	6.64243228339639e-15	190625381	190664290	6.79541847892366e-13	190737769	190777673
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	190761367	205873906	4964	4914	0.1703	6.79541847892366e-13	190737769	190777673	6.91897662511567e-53	205863209	205882271
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	205876973	206087643	104	103	-0.4458	6.91897662511567e-53	205863209	205882271	7.3958727450084e-51	206079567	206100091
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	206093903	226928354	7285	7190	0.1467	7.3958727450084e-51	206079567	206100091	0	226891051	226964745
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	226937710	242689978	5924	5834	-0.4379	0	226891051	226964745	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10657	0.1146	NA	NA	NA	2.92826921223904e-13	32074432	32074432
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	2.3087	2.92826921223904e-13	32074432	32074432	1.03130307349859e-13	32080848	32080848
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	44402269	4193	4132	0.0999	1.03130307349859e-13	32080848	32080848	2.25204872687677e-10	44382723	44422831
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	44406220	44468331	29	29	0.6097	2.25204872687677e-10	44382723	44422831	6.28043757390648e-10	44449956	44499636
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	44470835	44470835	1	0	NA	6.28043757390648e-10	44449956	44499636	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	44472250	75366348	11847	11679	0.0972	NA	NA	NA	4.07691656344307e-09	75315388	75798154
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75375983	76086048	51	50	-0.2784	4.07691656344307e-09	75315388	75798154	0	76070315	76099337
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76088381	162173511	26210	25851	0.259	0	76070315	76099337	0	162168868	162179400
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	162177754	162200215	12	12	-0.5764	0	162168868	162179400	1.84517911000696e-16	162195475	162205828
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	162202225	162202225	1	0	NA	1.84517911000696e-16	162195475	162205828	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	162205828	164005577	349	344	0.4932	NA	NA	NA	1.54903519832597e-08	163997228	164009321
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.6828	1.54903519832597e-08	163997228	164009321	2.84003621728388e-09	164023502	164036648
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	194354505	10150	9996	0.4979	2.84003621728388e-09	164023502	164036648	2.05087261844199e-168	194354505	194354505
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-3.9509	2.05087261844199e-168	194354505	194354505	2.27072256491138e-137	194366950	194366950
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1956	0.4166	2.27072256491138e-137	194366950	194366950	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	1654867	536	534	0.0466	NA	NA	NA	3.55446311550069e-13	1638172	1671203
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1656722	1754818	39	39	0.5977	3.55446311550069e-13	1638172	1671203	1.19548100533769e-11	1732474	1789763
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1760183	1760183	1	0	NA	1.19548100533769e-11	1732474	1789763	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1761799	3198475	571	567	0.0795	NA	NA	NA	2.05822608875000e-195	3183412	3214195
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	3200309	64376590	16204	15987	-0.4244	2.05822608875e-195	3183412	3214195	4.57300458164846e-59	64376590	64376590
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-5.023	4.57300458164846e-59	64376590	64376590	1.16190458471477e-57	64390333	64390333
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	64398986	1	0	NA	1.16190458471477e-57	64390333	64390333	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64405760	68893816	1074	1061	-0.3976	NA	NA	NA	6.6660487654485e-14	68886020	68899247
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68896316	69165814	19	19	0.3551	6.6660487654485e-14	68886020	68899247	1.67996070354409e-14	69144974	69677857
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	94073863	8448	8313	-0.3986	1.67996070354409e-14	69144974	69677857	2.67595222509564e-11	94073863	94073863
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94084961	3	3	-2.0823	2.67595222509564e-11	94073863	94073863	2.77492106647599e-11	94084961	94084961
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94086315	117486143	7468	7355	-0.4149	2.77492106647599e-11	94084961	94084961	8.7482764287667e-175	117457670	117511707
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	117492366	119334954	379	372	0.172	8.7482764287667e-175	117457670	117511707	7.07984596632371e-17	119334954	119345371
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-1.8583	7.07984596632371e-17	119334954	119345371	3.28484720663829e-150	119346804	119348829
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	119350354	1	0	NA	3.28484720663829e-150	119346804	119348829	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119351503	148486134	7407	7299	0.2828	NA	NA	NA	0	148482106	148489756
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	148486676	191153613	13005	12836	-0.3936	0	148482106	148489756	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3926	0.3158	NA	NA	NA	6.73759197771081e-58	12857302	12857302
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	-4.1108	6.73759197771081e-58	12857302	12857302	5.31287339726316e-56	12873052	12873052
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	21480789	2375	2344	0.3619	5.31287339726316e-56	12873052	12873052	4.61580988769289e-26	21480789	21480789
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-2.713	4.61580988769289e-26	21480789	21480789	2.84706300893787e-57	21487474	21487474
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	32137514	2374	2336	0.1845	2.84706300893787e-57	21487474	21487474	1.01387934786889e-56	32110504	32157866
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32139800	32228793	45	44	0.5898	1.01387934786889e-56	32110504	32157866	3.35828249344400e-14	32213546	32246002
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	32230421	58195475	6834	6743	0.1	3.358282493444e-14	32213546	32246002	0	58178682	58214211
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	58198581	166873209	32980	32508	-0.3903	0	58178682	58214211	3.09119617674141e-28	166873209	166873209
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	166875838	166881828	5	5	-2.3965	3.09119617674141e-28	166873209	166873209	2.51196016722254e-26	166881828	166881828
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	166883148	172066999	2270	2243	-0.4052	2.51196016722254e-26	166881828	166881828	4.60038753569163e-265	172044123	172107859
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172069979	177333426	1593	1573	0.0613	4.60038753569163e-265	172044123	172107859	6.94821275912769e-08	177316379	177344291
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177340297	177440929	19	19	0.655	6.94821275912769e-08	177316379	177344291	7.29967863533918e-08	177427744	177467378
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	177443684	180194323	1171	1157	0.0645	7.29967863533918e-08	177427744	177467378	2.96118636013277e-37	180194323	180342860
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180362342	10	10	-1.6736	2.96118636013277e-37	180194323	180342860	7.627955700551e-27	180358977	180364670
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180364670	180644810	111	109	0.0425	7.627955700551e-27	180358977	180364670	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	24470775	8300	8172	0.7357	NA	NA	NA	0	24463956	24486289
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	24473147	32558677	3377	3326	0.1367	0	24463956	24486289	2.9540869246573e-38	32548736	32597877
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	15	-1.2439	2.9540869246573e-38	32548736	32597877	1.19335323012543e-16	32628420	32633691
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32745036	44	42	0.5288	1.19335323012543e-16	32628420	32633691	1.32871263325915e-09	32713363	32775858
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32745693	54035000	8251	8136	0.1063	1.32871263325915e-09	32713363	32775858	2.16522725539476e-58	54035000	54035000
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.6688	2.16522725539476e-58	54035000	54035000	1.29058515056011e-57	54042734	54042734
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	62749989	1623	1605	0.0937	1.29058515056011e-57	54042734	54042734	1.74161164591255e-17	62732330	62760049
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	62753063	62870049	49	48	0.5621	1.74161164591255e-17	62732330	62760049	3.79654628200501e-61	62869793	62880282
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	62878786	67078860	1101	1085	-0.4263	3.79654628200501e-61	62869793	62880282	2.60247199593852e-16	67078860	67078860
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67086412	67105238	4	4	-2.1867	2.60247199593852e-16	67078860	67078860	1.31274638032541e-18	67105238	67105238
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	72919733	1758	1734	-0.4281	1.31274638032541e-18	67105238	67105238	1.84337796326576e-10	72917267	72919733
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-1.9641	1.84337796326576e-10	72917267	72919733	5.3818839123779e-09	72924440	72931542
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	82270666	2755	2715	-0.4066	5.3818839123779e-09	72924440	72931542	3.55755449806538e-65	82212085	82312612
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	82275525	83497113	253	250	0.0578	3.55755449806538e-65	82212085	82312612	2.63148713324658e-83	83441538	83551633
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	83501875	102039635	5171	5096	-0.4345	2.63148713324658e-83	83441538	83551633	2.55182046712036e-14	102039635	102039635
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-2.2909	2.55182046712036e-14	102039635	102039635	9.31491413235533e-16	102044331	102044331
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	103841482	487	479	-0.3653	9.31491413235533e-16	102044331	102044331	8.42339478964376e-09	103810611	103841482
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103873584	5	5	0.7601	8.42339478964376e-09	103810611	103841482	4.11609716746632e-09	103873584	103894634
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103882598	146745298	14520	14358	-0.4033	4.11609716746632e-09	103873584	103894634	0	146727133	146759718
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	146746421	151546355	1760	1734	0.0949	0	146727133	146759718	1.6432952990862e-21	151546355	151546355
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151549525	151552684	3	3	-2.1353	1.6432952990862e-21	151546355	151546355	3.98526040506582e-19	151552684	151552684
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151554478	165643653	4822	4748	0.0573	3.98526040506582e-19	151552684	151552684	2.31411093687790e-09	165643653	165643653
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165649379	3	3	-1.5004	2.3141109368779e-09	165643653	165643653	2.93528778018633e-09	165649379	165650610
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165650610	170753106	1805	1783	0.0226	2.93528778018633e-09	165649379	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	13579946	4436	4377	-0.396	NA	NA	NA	0	13568402	13588151
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	13588151	16135701	952	935	0.5184	0	13568402	13588151	1.13995777407175e-57	16135701	16135701
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-4.0592	1.13995777407175e-57	16135701	16135701	7.43308621044209e-60	16140018	16140018
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	19689443	1201	1185	0.5353	7.43308621044209e-60	16140018	16140018	1.83804094150409e-280	19621286	19717146
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	19695608	141690753	43342	42722	0.1162	1.83804094150409e-280	19621286	19717146	2.43563203406739e-54	141689547	141690753
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.3945	2.43563203406739e-54	141689547	141690753	1.06741675346698e-20	141714168	141720303
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147749063	2535	2506	0.1224	1.06741675346698e-20	141714168	141720303	0	147737360	147766644
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147750183	158821263	4217	4154	-0.4153	0	147737360	147766644	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	9533226	2884	2844	-0.4818	NA	NA	NA	8.09529859204851e-18	9533226	9533226
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9535456	9538031	3	3	-2.5207	8.09529859204851e-18	9533226	9533226	2.26098868180312e-16	9538031	9538031
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	9539424	25120552	5272	5202	-0.4487	2.26098868180312e-16	9538031	9538031	1.13252154063430e-19	25120552	25120552
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.8151	1.1325215406343e-19	25120552	25120552	1.05044940987451e-19	25125700	25125700
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	27390859	973	958	-0.4629	1.05044940987451e-19	25125700	25125700	7.19481729207477e-285	27377606	27402146
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	27393726	33603810	2296	2262	0.0885	7.19481729207477e-285	27377606	27402146	9.1566843989233e-11	33599757	33612036
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	33606162	33655224	15	15	-0.639	9.1566843989233e-11	33599757	33612036	3.28884104979108e-11	33643026	33667581
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	33658295	39350798	1628	1611	0.0865	3.28884104979108e-11	33643026	33667581	0	39350798	39352361
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	57	-3.816	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	109609491	20252	19996	0.0517	0	39504332	39505256	0	109581613	109648352
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	109616665	115701209	1486	1466	0.6222	0	109581613	109648352	6.08985465428363e-25	115701209	115701209
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115705898	115711730	2	2	-2.4301	6.08985465428363e-25	115701209	115701209	2.43497715631801e-61	115711730	115711730
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115718942	146264846	9693	9545	0.5635	2.43497715631801e-61	115711730	115711730	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	21019271	7356	7250	0.3036	NA	NA	NA	1.31123337840008e-83	20996940	21049566
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	21020705	22477358	481	474	-0.0565	1.31123337840008e-83	20996940	21049566	1.36220098490431e-13	22477358	22477358
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	2.3094	1.36220098490431e-13	22477358	22477358	9.26467481423959e-15	22492603	22492603
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	43626920	4896	4827	-0.013	9.26467481423959e-15	22492603	22492603	1.69887735458285e-87	39062211	67907649
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43644906	70926188	337	336	-0.4542	1.69887735458285e-87	39062211	67907649	2.64382864983566e-16	70926188	70926188
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.7928	2.64382864983566e-16	70926188	70926188	4.18883008514573e-13	70930528	70930528
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	100348045	9919	9765	-0.4227	4.18883008514573e-13	70930528	70930528	9.43460962825882e-61	100348045	100348045
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	-5.0943	9.43460962825882e-61	100348045	100348045	2.06470032982097e-60	100350814	100350814
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	130603391	11164	10990	-0.4164	2.06470032982097e-60	100350814	100350814	7.26724848602115e-29	130588168	130619645
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130605776	130782397	72	70	0.1355	7.26724848602115e-29	130588168	130619645	1.38153604367019e-22	130762679	130798747
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130783831	137347945	2607	2581	-0.3926	1.38153604367019e-22	130762679	130798747	6.54501778950307e-07	137339424	137347945
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137352394	137356880	3	3	1.0368	6.54501778950307e-07	137339424	137347945	6.88116932312012e-06	137356880	137361870
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	138786186	569	558	-0.374	6.88116932312012e-06	137356880	137361870	4.53376561859528e-07	138784969	138786186
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138787852	138794487	3	3	-1.9185	4.53376561859528e-07	138784969	138786186	3.48453198623555e-06	138794487	138806983
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138804983	140145683	531	524	-0.4205	3.48453198623555e-06	138794487	138806983	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	24260	0.1022	NA	NA	NA	2.37620005644853e-173	77917893	77917893
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77926390	1	0	NA	2.37620005644853e-173	77917893	77917893	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928669	77928738	2	2	2.286	NA	NA	NA	5.08442908063854e-13	77928738	77928738
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19966	0.0371	5.08442908063854e-13	77928738	77928738	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	18696318	7317	7223	-0.4297	NA	NA	NA	0	18684900	18706730
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18698187	32460153	4191	4131	0.1062	0	18684900	18706730	6.83588273237852e-27	32437497	32482743
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	32461984	32461984	1	0	NA	6.83588273237852e-27	32437497	32482743	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	32464669	32670986	81	81	0.601	NA	NA	NA	9.31559007424213e-26	32655576	32690707
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	32672909	46096588	3961	3915	0.1124	9.31559007424213e-26	32655576	32690707	1.61510526719994e-10	46095353	46096588
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46099212	46103800	4	4	1.5263	1.61510526719994e-10	46095353	46096588	1.00939822984383e-17	46103800	46105220
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46105220	55123719	1351	1327	0.1471	1.00939822984383e-17	46103800	46105220	8.4761597192314e-19	55097753	55129329
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	38	0.8045	8.4761597192314e-19	55097753	55129329	1.36522840404930e-25	55205278	55223056
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	126693670	25566	25203	0.0947	1.3652284040493e-25	55205278	55223056	0	126670433	126722985
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	126699571	134450318	2794	2738	-0.4733	0	126670433	126722985	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9939050	3880	3832	0.101	NA	NA	NA	0	9927663	9968496
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9942581	29402386	6789	6690	-0.3881	0	9927663	9968496	0	29383137	29415596
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	29405881	33270966	1267	1247	0.0987	0	29383137	29415596	3.9193263518049e-89	33270966	33270966
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33278235	33283825	2	2	-5.371	3.9193263518049e-89	33270966	33270966	1.67638323271625e-77	33283825	33283825
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33290235	33290235	1	0	NA	1.67638323271625e-77	33283825	33283825	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33294670	71215768	12591	12410	0.1561	NA	NA	NA	0	71201916	71227586
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	71217679	93155542	6025	5941	-0.398	0	71201916	71227586	0	93142161	93167619
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	93158374	110907164	6814	6722	0.1132	0	93142161	93167619	0	110887767	110919895
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	110912636	114656348	1152	1133	-0.4386	0	110887767	110919895	5.8336024923429e-242	114646088	114672016
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	114660385	117832082	1245	1224	0.0918	5.8336024923429e-242	114646088	114672016	0	117814125	117863511
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	117834999	130943064	4843	4782	-0.4443	0	117814125	117863511	1.20066042615315e-13	130943064	130943064
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	1.7933	1.20066042615315e-13	130943064	130943064	6.92458673579339e-12	130946248	130946248
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	543	-0.4093	6.92458673579339e-12	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	49964838	12219	12077	0.0153	NA	NA	NA	2.46536595282553e-59	49964838	49964838
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.7007	2.46536595282553e-59	49964838	49964838	1.48854162514549e-23	49971732	49971732
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56657371	1805	1774	0.3286	1.48854162514549e-23	49971732	49971732	8.88462464729804e-11	56602818	56664197
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56658479	56708261	21	21	0.9743	8.88462464729804e-11	56602818	56664197	1.06936443138678e-161	56697807	56717816
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56711774	89659397	8246	8123	0.023	1.06936443138678e-161	56697807	56717816	2.53227506098606e-149	89659397	89659397
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-4.4093	2.53227506098606e-149	89659397	89659397	1.58612617214695e-237	89662326	89662326
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9221	-0.1187	1.58612617214695e-237	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18537177	5	5	-0.1671	NA	NA	NA	0.0150459514420671	18508651	19325098
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18544772	19494416	55	55	-0.8225	0.0150459514420671	18508651	19325098	1.07360352398752e-55	19490630	19535787
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	20887741	672	662	0.0739	1.07360352398752e-55	19490630	19535787	1.59163983939632e-171	20870346	20905522
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	20889193	73058103	18685	18426	-0.3665	1.59163983939632e-171	20870346	20905522	1.51086416721892e-11	73047267	73082262
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73060301	73112042	16	16	-0.9977	1.51086416721892e-11	73047267	73082262	3.70962629938109e-08	73101327	73130351
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73123455	78551733	2575	2540	-0.3352	3.70962629938109e-08	73101327	73130351	2.28143267826998e-73	78527857	78565328
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	78553639	79176037	334	329	0.1107	2.28143267826998e-73	78527857	78565328	3.28317391551333e-21	79176037	79176037
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79177462	79183154	3	3	-2.0963	3.28317391551333e-21	79176037	79176037	1.38558269582139e-94	79183154	79183154
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	9162	0.1609	1.38558269582139e-94	79183154	79183154	3.8313716898622e-101	105594189	105606424
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105673157	13	13	1.0885	3.8313716898622e-101	105594189	105606424	3.15973203353221e-05	105623070	105739770
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105681007	105681007	1	0	NA	3.15973203353221e-05	105623070	105739770	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105703388	105856972	48	47	0.4133	NA	NA	NA	2.19549908300184e-06	105856591	105856972
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-0.9938	2.19549908300184e-06	105856591	105856972	5.28317516753436e-06	105875924	105881677
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106358491	178	176	0.4769	5.28317516753436e-06	105875924	105881677	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2934	NA	NA	NA	5.40046984417795e-08	18450562	18741716
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20088256	151	150	-0.9922	5.40046984417795e-08	18450562	18741716	0	20065525	20308014
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	74669752	21555	21279	0.1074	0	20065525	20308014	0	74669752	74669752
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-3.556	0	74669752	74669752	1.21200141025263e-197	74680439	74680439
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	98232932	8693	8578	0.179	1.21200141025263e-197	74680439	74680439	2.60351869401077e-209	98232932	98232932
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	-2.9837	2.60351869401077e-209	98232932	98232932	5.57909124247993e-41	98239454	98239454
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99632987	637	627	0.1239	5.57909124247993e-41	98239454	98239454	3.35878574321666e-16	99632987	99632987
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.5335	3.35878574321666e-16	99632987	99632987	2.47370390544875e-14	99635701	99635701
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	268	0.1563	2.47370390544875e-14	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	461	-0.349	NA	NA	NA	1.59205768321691e-13	1296767	1296767
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	2.3288	1.59205768321691e-13	1296767	1296767	6.93662243512263e-18	1300341	1300341
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	12887179	4457	4391	-0.4182	6.93662243512263e-18	1300341	1300341	4.67724499161112e-164	12853920	12913827
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	12892548	14876356	536	527	0.11	4.67724499161112e-164	12853920	12913827	2.60182183581923e-15	14683004	14956177
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14956177	15029941	14	14	-0.7617	2.60182183581923e-15	14683004	14956177	4.37568929290620e-13	15028108	15039224
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	31862577	5090	5015	0.112	4.3756892929062e-13	15028108	15039224	1.46405438372018e-21	31837203	32513457
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	34058222	55	54	-0.4556	1.46405438372018e-21	31837203	32513457	4.10761401338341e-19	33868686	34067812
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34059589	57203733	4282	4223	0.0607	4.10761401338341e-19	33868686	34067812	3.21619644154656e-26	57203733	57203733
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-3.0531	3.21619644154656e-26	57203733	57203733	1.25558023058963e-30	57206772	57206772
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	64250918	1559	1540	0.0331	1.25558023058963e-30	57206772	57206772	1.25919902488948e-316	64211052	64325403
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	64259838	75093957	4053	3993	-0.4157	1.25919902488948e-316	64211052	64325403	1.75826894427982e-22	75093957	75093957
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.8108	1.75826894427982e-22	75093957	75093957	9.63108396285393e-21	75100865	75100865
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	5062	-0.4523	9.63108396285393e-21	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1046523	435	430	0.8538	NA	NA	NA	8.62524906249567e-18	1046523	1046523
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1047609	1048368	2	2	-1.9808	8.62524906249567e-18	1046523	1046523	1.09433678407698e-11	1048368	1048368
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1049874	1903358	416	413	0.4307	1.09433678407698e-11	1048368	1048368	8.55021139375381e-07	1899328	1906319
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1904451	1909874	6	6	1.3813	8.55021139375381e-07	1899328	1906319	7.33304598107773e-33	1909371	1910544
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1910544	8147124	2683	2651	0.1089	7.33304598107773e-33	1909371	1910544	3.00824816789635e-27	8144634	8147124
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8149046	8149084	2	2	1.805	3.00824816789635e-27	8144634	8147124	1.23568181761280e-07	8149084	8154339
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8154339	8267316	56	56	0.1429	1.2356818176128e-07	8149084	8154339	1.70647695503846e-23	8256160	8274833
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	8269248	36673853	10271	10097	-0.4332	1.70647695503846e-23	8256160	8274833	4.40257202456241e-93	36673853	36673853
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-4.2162	4.40257202456241e-93	36673853	36673853	1.36580053952999e-97	36683509	36683509
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	38479844	867	859	-0.4008	1.36580053952999e-97	36683509	36683509	6.42703912227544e-23	38479844	38479844
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38481896	38485666	3	3	-2.8056	6.42703912227544e-23	38479844	38479844	1.24112915865153e-22	38485666	38485666
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38487908	41515622	1140	1125	-0.3854	1.24112915865153e-22	38485666	38485666	1.05767094931769e-41	41506317	41519702
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41518222	41710400	69	69	-1.0796	1.05767094931769e-41	41506317	41519702	3.94590593682613e-40	41704093	42147225
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52440878	3480	3433	-0.4184	3.94590593682613e-40	41704093	42147225	1.31055906766305e-14	52440878	52440878
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-2.344	1.31055906766305e-14	52440878	52440878	3.72114229997585e-14	52447064	52447064
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	56471985	1735	1711	-0.4067	3.72114229997585e-14	52447064	52447064	2.98694022165686e-20	56471985	56471985
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56473793	56480300	6	6	-2.0423	2.98694022165686e-20	56471985	56471985	3.30089156569235e-20	56480300	56480300
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	56484552	61357543	1824	1807	-0.4072	3.30089156569235e-20	56480300	56480300	0	61336412	61376372
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	61367646	78653545	6631	6536	0.0968	0	61336412	61376372	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	17713999	5424	5356	0.0944	NA	NA	NA	0	17699715	17741938
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	17724991	76116026	17540	17313	-0.4419	0	17699715	17741938	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	482	-0.1642	NA	NA	NA	1.33444230481136e-14	1398325	1398325
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.4398	1.33444230481136e-14	1398325	1398325	3.57293881688388e-13	1400840	1400840
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	1797537	185	184	-0.2219	3.57293881688388e-13	1400840	1400840	3.77524805126092e-08	1796213	1797537
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1798246	1799778	2	2	1.8803	3.77524805126092e-08	1796213	1797537	5.0734997823663e-10	1799778	1799778
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1801091	10486862	3975	3915	-0.2455	5.0734997823663e-10	1799778	1799778	3.21872424759789e-77	10453995	10513094
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10488362	11448975	516	512	0.1347	3.21872424759789e-77	10453995	10513094	1.25273117417535e-07	11445761	11448975
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.8971	1.25273117417535e-07	11445761	11448975	1.14186946662013e-07	11452390	11453579
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	40824279	7656	7528	0.0735	1.14186946662013e-07	11452390	11453579	1.44201339907211e-16	40809118	40834217
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40825620	40937838	63	62	-0.399	1.44201339907211e-16	40809118	40834217	8.59679170982365e-173	40924116	40956215
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40939854	63788698	10166	10014	0.0713	8.59679170982365e-173	40924116	40956215	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1516966	589	584	-0.4265	NA	NA	NA	3.08558433969825e-41	1516966	1516966
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1518825	1525300	4	3	-3.5897	3.08558433969825e-41	1516966	1516966	1.71379023792329e-42	1525300	1525300
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1528899	10104852	3159	3125	-0.3939	1.71379023792329e-42	1525300	1525300	7.59898098520542e-153	10078033	10119084
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	10108072	12095485	534	530	0.0913	7.59898098520542e-153	10078033	10119084	8.3862761536019e-10	12089020	12095485
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.8643	8.3862761536019e-10	12089020	12095485	6.3273075655088e-09	12113855	12113855
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	26148060	4747	4687	0.0651	6.3273075655088e-09	12113855	12113855	4.00938299199596e-11	26145205	26148060
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148764	26161111	9	9	-0.8763	4.00938299199596e-11	26145205	26148060	2.90067008848686e-10	26161111	26168610
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	34610230	2369	2335	0.1084	2.90067008848686e-10	26161111	26168610	0	34577612	34641299
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	34612621	58620552	8568	8459	-0.282	0	34577612	34641299	0	58605088	58637277
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	58623508	62419534	1598	1571	0.3492	0	58605088	58637277	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10136303	16	16	-0.1706	NA	NA	NA	3.21810252646415e-07	10115958	10136303
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10144881	10152384	3	3	-1.3674	3.21810252646415e-07	10115958	10136303	1.74536812964156e-10	10152384	10154777
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10154777	36789648	8526	8419	0.086	1.74536812964156e-10	10152384	10154777	7.20989441899911e-11	36789648	36789648
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	2.1005	7.20989441899911e-11	36789648	36789648	6.52009187033188e-12	36791668	36791668
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	40316557	1743	1716	0.0877	6.52009187033188e-12	36791668	36791668	0	40310313	40337374
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	40322640	46922972	3151	3110	-0.4349	0	40310313	40337374	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	15471221	9	9	-0.5902	NA	NA	NA	5.39635822285465e-05	15448186	15532174
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	15472087	18125356	1123	1114	0.0996	5.39635822285465e-05	15448186	15532174	8.0458911766544e-11	18125356	18125356
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	2.2129	8.0458911766544e-11	18125356	18125356	1.03539313224672e-08	18129194	18129194
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	18407719	161	157	0.0556	1.03539313224672e-08	18129194	18129194	1.67191254075962e-08	18401030	18410799
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18409272	18437980	23	23	-0.6	1.67191254075962e-08	18401030	18410799	4.8444506134261e-13	18433172	18451983
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18447247	22696162	1672	1646	0.1003	4.8444506134261e-13	18433172	18451983	2.00833322453604e-10	22679305	22706166
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22701123	22720195	13	13	0.81	2.00833322453604e-10	22679305	22706166	2.17880034148953e-08	22713972	22736990
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	35472378	6549	6471	0.0827	2.17880034148953e-08	22713972	22736990	4.17697410831119e-24	35472378	35472378
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-2.9815	4.17697410831119e-24	35472378	35472378	2.05632897783057e-23	35476942	35476942
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37618187	1187	1171	0.1174	2.05632897783057e-23	35476942	35476942	1.76584369375477e-45	37618187	37618187
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37621766	37621766	1	0	NA	1.76584369375477e-45	37618187	37618187	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	-4.1888	NA	NA	NA	5.77045825878951e-31	37626069	37626069
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	37685496	21	20	0.2052	5.77045825878951e-31	37626069	37626069	2.09541575786418e-07	37678596	37691481
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	16	-0.6782	2.09541575786418e-07	37678596	37691481	1.35896310506950e-10	37706998	37725321
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	39046811	672	664	0.0752	1.3589631050695e-10	37706998	37725321	5.05712801244668e-172	39035237	39057009
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	39048501	49571068	5104	5027	-0.4224	5.05712801244668e-172	39035237	39057009	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	1529	2	2	0.5418	NA	NA	NA	0.0654974468359411	1529	230932
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	3237	266212	125	119	-0.3533	0.0654974468359411	1529	230932	1.35229501947768e-09	264886	266212
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	2.0974	1.35229501947768e-09	264886	266212	4.76384646871178e-15	267079	267079
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	1403541	634	628	-0.3869	4.76384646871178e-15	267079	267079	3.86145433069784e-06	1391526	1406874
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1403586	1420699	17	17	0.1733	3.86145433069784e-06	1391526	1406874	1.06055482387423e-06	1415434	1432953
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1422012	2418980	751	740	-0.3884	1.06055482387423e-06	1415434	1432953	8.36771525192577e-05	2402273	2418980
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2419541	2421183	2	2	0.5218	8.36771525192577e-05	2402273	2418980	1.55888479666854e-39	2421183	2421183
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2421371	2426938	7	7	-0.5541	1.55888479666854e-39	2421183	2421183	1.10021495315764e-31	2426938	2426938
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2428167	2428307	2	2	1.4644	1.10021495315764e-31	2426938	2426938	4.9791896623596e-19	2428307	2428307
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2430156	2509362	68	66	-0.3565	4.9791896623596e-19	2428307	2428307	7.78906761775823e-12	2509362	2509362
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2510821	2510846	2	0	NA	7.78906761775823e-12	2509362	2509362	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2512844	2512881	2	2	1.0409	NA	NA	NA	1.45940413814705e-05	2512881	2514651
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2514651	2708291	179	177	-0.4156	1.45940413814705e-05	2512881	2514651	3.81822893954473e-291	2708113	2711273
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	40886844	14141	13949	0.6975	3.81822893954473e-291	2708113	2711273	0	40874211	40901746
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	40888956	67411027	6274	6185	1.1607	0	40874211	40901746	5.08706560844073e-23	67382805	67424552
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	67412956	67631715	98	98	1.6081	5.08706560844073e-23	67382805	67424552	4.57145077012249e-23	67614854	67660691
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	67632927	76998610	2426	2390	1.1501	4.57145077012249e-23	67614854	67660691	9.32137211806024e-27	76998610	76998610
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	-2.2467	9.32137211806024e-27	76998610	76998610	0	77010018	77010018
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	133150442	15498	15267	1.379	0	77010018	77010018	0	133147416	133156184
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	133151588	133213323	25	25	2.176	0	133147416	133156184	2.25554176813103e-12	133199979	133225226
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	133214820	152652738	5996	5913	1.5299	2.25554176813103e-12	133199979	133225226	1.22228175471242e-11	152651085	152652738
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152655026	152657445	3	3	-0.3237	1.22228175471242e-11	152651085	152652738	1.64306887604103e-08	152657445	152669192
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152669192	154442377	639	629	1.5274	1.64306887604103e-08	152657445	152669192	1.43276189376681e-09	154441943	154442377
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	-0.4376	1.43276189376681e-09	154441943	154442377	3.53867487059465e-19	154450309	154450309
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	27	1.6957	3.53867487059465e-19	154450309	154450309	1.62367742541953e-41	154582414	154599547
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	201	0.4046	1.62367742541953e-41	154582414	154599547	NA	NA	NA
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	129	-3.7367	NA	NA	NA	2.69622394183127e-20	3780462	4272867
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-0.4902	2.69622394183127e-20	3780462	4272867	1.91352786602257e-12	5531459	6688691
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6997136	139	134	-3.4581	1.91352786602257e-12	5531459	6688691	0.000140124268059791	6940618	7197846
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6998513	7653082	195	190	-2.7152	0.000140124268059791	6940618	7197846	0.00156175708528808	7465453	7677056
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	43	-3.7205	0.00156175708528808	7465453	7677056	9.88562167007307e-05	7708716	7774773
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7914104	58	57	-2.6038	9.88562167007307e-05	7708716	7774773	0.000360540778763861	7833760	8059682
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10513747	389	381	-3.3706	0.000360540778763861	7833760	8059682	3.92461946660228e-26	10473791	11660512
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	13128515	220	217	-2.1542	3.92461946660228e-26	10473791	11660512	1.00852853233468e-42	13090026	13138841
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14342834	409	407	-3.5871	1.00852853233468e-42	13090026	13138841	1.86969846100941e-06	14323815	14353244
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14380301	19	19	-2.2114	1.86969846100941e-06	14323815	14353244	0.0529667216932267	14370346	14466597
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14381372	14508021	77	77	-3.1425	0.0529667216932267	14370346	14466597	0.00115967237568958	14478618	14554415
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14700040	49	49	-2.1935	0.00115967237568958	14478618	14554415	8.25680362402706e-14	14691724	14703568
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14883615	43	43	-3.9345	8.25680362402706e-14	14691724	14703568	0.00222786275875033	14823549	15115689
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15277060	122	121	-3.0705	0.00222786275875033	14823549	15115689	0.000720071909019356	15171394	15316364
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15278175	15523178	140	135	-3.7426	0.000720071909019356	15171394	15316364	3.02093843739162e-06	15473709	15549637
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15639408	44	43	-2.5557	3.02093843739162e-06	15473709	15549637	6.89212499989991e-06	15566377	15658114
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15642822	15915466	45	45	-3.9043	6.89212499989991e-06	15566377	15658114	1.82927973610294e-11	15898644	15932535
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15977755	20	20	-2.0438	1.82927973610294e-11	15898644	15932535	0.00102520595703781	15958396	15996118
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15979526	16035717	23	23	-3.3453	0.00102520595703781	15958396	15996118	1.25354653907642e-05	16025800	16035717
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16036892	16042966	6	6	-1.1158	1.25354653907642e-05	16025800	16035717	3.52857764260666e-05	16042966	16062961
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16043782	21689031	954	941	-3.5462	3.52857764260666e-05	16042966	16062961	3.91628405020595e-07	21676262	21692175
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21691199	21761022	12	12	-1.5397	3.91628405020595e-07	21676262	21692175	1.45525040382240e-09	21752451	21768833
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21763911	22139807	85	79	-3.6323	1.4552504038224e-09	21752451	21768833	2.09706527518640e-07	22055660	22139807
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-1.4548	2.0970652751864e-07	22055660	22139807	0.00229693457018177	22175425	22178964
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22182080	4	4	-3.2754	0.00229693457018177	22175425	22178964	0.0119611083944307	22179794	22208351
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22192409	22268552	25	24	-4.4946	0.0119611083944307	22179794	22208351	2.02133168352242e-12	22263267	22308420
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22395796	10	10	-2.67	2.02133168352242e-12	22263267	22308420	0.0137442507264686	22387293	22843728
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22400925	22930737	54	53	-3.7202	0.0137442507264686	22387293	22843728	2.38466763528327e-50	22926726	23283689
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	33	-0.6578	2.38466763528327e-50	22926726	23283689	5.9399915834259e-06	26941769	26990807
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-2.3631	5.9399915834259e-06	26941769	26990807	0.00454422115455511	26990807	27073018
MSK_252152912955_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.9349	0.00454422115455511	26990807	27073018	NA	NA	NA
