Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	110023268	39611	38380	0.0031	NA	NA	NA	1.97197673427403e-08	110015739	110023268
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	1.0222	1.97197673427403e-08	110015739	110023268	1.08080131441102e-09	110041712	110058441
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147306304	4556	4419	-0.0116	1.08080131441102e-09	110041712	110058441	4.71502141405215e-75	147203277	147308557
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147510532	35	32	0.9822	4.71502141405215e-75	147203277	147308557	1.36315744734191e-69	147508217	147644831
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150823073	1259	1214	-0.0026	1.36315744734191e-69	147508217	147644831	4.70910659312146e-81	150823073	150836481
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	9	2.0059	4.70910659312146e-81	150823073	150836481	1.41372976486069e-80	150848509	150851439
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2670	0.0024	1.41372976486069e-80	150848509	150851439	3.19375130510870e-08	157133150	157133150
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.3889	3.1937513051087e-08	157133150	157133150	3.07055011206425e-08	157136342	157138568
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	247186514	32910	31923	-0.004	3.07055011206425e-08	157136342	157138568	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	106244482	33910	32843	-0.0035	NA	NA	NA	2.09141178220849e-21	106244482	106244482
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-2.1487	2.09141178220849e-21	106244482	106244482	1.57362098376754e-21	106250718	106250718
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	219307853	35681	34623	0.001	1.57362098376754e-21	106250718	106250718	5.08836000912144e-30	219305947	219307853
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	219309702	219350778	18	16	-0.8909	5.08836000912144e-30	219305947	219307853	4.76214110944966e-28	219350778	219352820
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	219352820	242689978	8216	7988	-0.0029	4.76214110944966e-28	219350778	219352820	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10470	8e-04	NA	NA	NA	5.55082616084033e-17	32074432	32074432
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.8851	5.55082616084033e-17	32074432	32074432	2.98119767835557e-16	32080848	32080848
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	46769081	5127	4954	0.0038	2.98119767835557e-16	32080848	32080848	4.45478252443815e-13	46764434	46774480
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.8454	4.45478252443815e-13	46764434	46774480	8.5902508316905e-13	46814662	46829442
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	164005577	37558	36435	0.0033	8.5902508316905e-13	46814662	46829442	4.89900462661671e-71	164005577	164005577
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.4529	4.89900462661671e-71	164005577	164005577	1.38507316060907e-45	164027724	164027724
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164112873	21	21	0.5613	1.38507316060907e-45	164027724	164027724	7.09310606235044e-15	164105613	164126256
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164115417	199329592	12115	11709	-0.0016	7.09310606235044e-15	164105613	164126256	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	173224400	49640	48149	0.0045	NA	NA	NA	2.75093219664336e-46	173224400	173224400
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-3.1161	2.75093219664336e-46	173224400	173224400	1.15589782535203e-54	173228860	173228860
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	182	0.0086	1.15589782535203e-54	173228860	173228860	4.07398045418802e-14	173660684	173660684
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-1.5921	4.07398045418802e-14	173660684	173660684	2.2081685995391e-12	173666072	173666072
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	190710812	5214	5055	0.0051	2.2081685995391e-12	173666072	173666072	9.58376616339235e-22	190678203	190752920
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190717801	190921041	65	64	-0.3675	9.58376616339235e-22	190678203	190752920	3.75169523921848e-08	190896423	190945773
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	191153613	45	44	-0.0273	3.75169523921848e-08	190896423	190945773	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	68862665	19048	18491	0.0029	NA	NA	NA	8.32338990177274e-09	68859738	68862665
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	68864742	70405656	5	5	-0.8893	8.32338990177274e-09	68859738	68862665	1.34662391189112e-08	70405656	70693444
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70693444	140203440	21027	20396	0.0014	1.34662391189112e-08	70405656	70693444	3.86742727731926e-12	140201609	140203440
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140204823	140216524	7	6	-0.951	3.86742727731926e-12	140201609	140203440	1.54682965680000e-12	140216524	140219465
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	180342860	13559	13137	0.0081	1.5468296568e-12	140216524	140219465	1.01708716023965e-11	180342860	180342860
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180346557	2	2	-1.6014	1.01708716023965e-11	180342860	180342860	0.000106279793389134	180346557	180346557
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180348365	180348365	1	0	NA	0.000106279793389134	180346557	180346557	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180351118	180358977	5	5	-4.0272	NA	NA	NA	1.35883055580312e-140	180358977	180358977
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	108	-0.0242	1.35883055580312e-140	180358977	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	32558677	11677	11314	0.0025	NA	NA	NA	1.29835784942019e-15	32543054	32590568
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32634977	18	17	0.63	1.29835784942019e-15	32543054	32590568	8.69789761119409e-15	32626619	32654861
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32650672	54035000	8294	8024	0.0053	8.69789761119409e-15	32626619	32654861	9.7273112470242e-107	54035000	54035000
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.9037	9.7273112470242e-107	54035000	54035000	1.76593418498025e-109	54042734	54042734
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	165643653	34317	33281	-0.0025	1.76593418498025e-109	54042734	54042734	4.1899825520768e-10	165642393	165643653
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	3	1.2356	4.1899825520768e-10	165642393	165643653	4.88731863188068e-10	165650610	165653315
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1753	-0.0108	4.88731863188068e-10	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	141690753	49933	48342	0.002	NA	NA	NA	1.40447630961928e-16	141689547	141698634
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.8711	1.40447630961928e-16	141689547	141698634	5.71574870531496e-16	141712786	141720324
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	147702365	2512	2436	0.0072	5.71574870531496e-16	141712786	141720324	1.02762887738882e-09	147702365	147702365
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.5139	1.02762887738882e-09	147702365	147702365	1.09687858900751e-09	147707161	147707161
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4101	-0.0067	1.09687858900751e-09	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	116	0.0193	NA	NA	NA	1.71602345558608e-48	581533	581533
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-3.1582	1.71602345558608e-48	581533	581533	3.49983061736029e-47	588865	588865
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	40892587	13453	13063	-0.0011	3.49983061736029e-47	588865	588865	2.58957509555581e-102	40892587	40892587
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.6288	2.58957509555581e-102	40892587	40892587	1.16833793776461e-101	40897469	40897469
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	144968840	30537	29582	0.0039	1.16833793776461e-101	40897469	40897469	2.54969048991692e-09	144968840	144968840
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144970607	144970777	2	2	1.4728	2.54969048991692e-09	144968840	144968840	9.998431337576e-08	144970777	144970777
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144972090	146264846	451	439	0.0313	9.998431337576e-08	144970777	144970777	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	70926188	13072	12670	-0.0044	NA	NA	NA	1.48180650910669e-16	70926188	70926188
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.8694	1.48180650910669e-16	70926188	70926188	6.42123400109872e-16	70930528	70930528
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	15014	-0.0128	6.42123400109872e-16	70930528	70930528	2.17712814499039e-09	116122595	116124007
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	1.4371	2.17712814499039e-09	116122595	116124007	9.217011274394e-09	116130333	116130333
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	8033	-0.0022	9.217011274394e-09	116130333	116130333	6.29527502904581e-12	137352394	137352394
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.6608	6.29527502904581e-12	137352394	137352394	1.36686901969633e-10	137356880	137356880
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	138786186	569	549	-0.0066	1.36686901969633e-10	137356880	137356880	5.77656979206483e-07	138784932	138786186
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138787852	138794487	3	3	-1.1194	5.77656979206483e-07	138784932	138786186	5.84458361555638e-06	138794487	138806983
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	138804983	140145683	531	511	-0.0318	5.84458361555638e-06	138794487	138806983	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	67741440	20251	19624	-0.0029	NA	NA	NA	2.31392608608133e-38	67738803	67745379
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67742738	67742738	1	0	NA	2.31392608608133e-38	67738803	67745379	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67745379	67784457	18	18	-0.9563	NA	NA	NA	2.59613693730987e-37	67782096	67787935
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	67787935	135285645	24538	23785	9e-04	2.59613693730987e-37	67782096	67787935	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	2077	-0.003	NA	NA	NA	1.20307058724898e-16	5734978	5741031
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5763749	14	13	-0.7903	1.20307058724898e-16	5734978	5741031	1.35048154096107e-18	5763749	5765438
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5765438	55118214	14753	14279	0.0011	1.35048154096107e-18	5763749	5765438	1.25071990438689e-14	55076294	55134486
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55219985	41	41	-0.3969	1.25071990438689e-14	55076294	55134486	2.08517301813027e-14	55197848	55235968
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55221692	134450318	28358	27484	2e-04	2.08517301813027e-14	55197848	55235968	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	282	0.05	NA	NA	NA	1.70035556479719e-12	734832	736988
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-1.0021	1.70035556479719e-12	734832	736988	1.05782909226905e-08	743223	745410
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	9523923	3442	3332	-0.0032	1.05782909226905e-08	743223	745410	1.70741448517446e-99	9523923	9528590
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.8297	1.70741448517446e-99	9523923	9528590	8.43830167358111e-102	9590351	9599999
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	31173065	7403	7166	-0.0055	8.43830167358111e-102	9590351	9599999	4.72124021824722e-10	31132716	31180019
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31177645	31237505	14	14	0.5651	4.72124021824722e-10	31132716	31180019	2.01458689842737e-09	31231952	31248212
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	130943064	33437	32392	0.0045	2.01458689842737e-09	31231952	31248212	6.41369663815564e-24	130943064	130943064
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.2939	6.41369663815564e-24	130943064	130943064	5.38833589677789e-24	130946248	130946248
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	529	-0.0033	5.38833589677789e-24	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7120	-0.004	NA	NA	NA	3.14203870298729e-33	37953582	37953582
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.6653	3.14203870298729e-33	37953582	37953582	8.42080600677656e-36	37957844	37957844
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4735	-0.0025	8.42080600677656e-36	37957844	37957844	3.68078682696331e-47	49964838	49964838
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.0572	3.68078682696331e-47	49964838	49964838	1.74164176424928e-48	49971732	49971732
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	51296396	587	575	5e-04	1.74164176424928e-48	49971732	49971732	1.49427825483163e-08	51294959	51296396
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51298094	51300398	3	3	-1.0672	1.49427825483163e-08	51294959	51296396	1.66702523464521e-07	51300398	51301682
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	51301682	100690991	14269	13836	0.0064	1.66702523464521e-07	51300398	51301682	2.79703899273583e-154	100690991	100690991
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.673	2.79703899273583e-154	100690991	100690991	6.81278814329874e-151	100693892	100693892
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4418	-0.0066	6.81278814329874e-151	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	58	-0.643	NA	NA	NA	1.04170436807669e-57	19489920	19538610
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	34674458	5690	5501	0.0108	1.04170436807669e-57	19489920	19538610	9.1209670555374e-09	34666996	34674458
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34679959	2	2	1.415	9.1209670555374e-09	34666996	34674458	1.04722972196660e-08	34679959	34683810
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34683810	74152538	14199	13741	-0.006	1.0472297219666e-08	34679959	34683810	6.13663268336368e-09	74150749	74152538
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74154117	74155334	2	2	-1.4445	6.13663268336368e-09	74150749	74152538	1.19030563675248e-08	74155334	74157425
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	74157425	79174722	2388	2312	-0.0027	1.19030563675248e-08	74155334	74157425	7.21367200232867e-128	79174722	79174722
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	-3.8501	7.21367200232867e-128	79174722	79174722	3.23424873591518e-134	79183154	79183154
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105945006	9379	9106	-0.0043	3.23424873591518e-134	79183154	79183154	2.41056405151048e-12	105919618	105948347
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105946993	106002179	19	16	-0.6014	2.41056405151048e-12	105919618	105948347	1.94537456155977e-10	105996176	106019719
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106152561	62	62	0.0072	1.94537456155977e-10	105996176	106019719	1.12495370895969e-05	106145431	106157458
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106153997	106176454	8	8	-0.6188	1.12495370895969e-05	106145431	106157458	1.32453043482433e-08	106165779	106179949
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106178391	106358491	72	70	0.0717	1.32453043482433e-08	106165779	106179949	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18837737	15	15	0.1757	NA	NA	NA	9.99166104610647e-10	18837737	18842565
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	1.1113	9.99166104610647e-10	18837737	18842565	7.48021525560104e-08	18846835	18851513
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19465359	79	78	0.1388	7.48021525560104e-08	18846835	18851513	1.30031802373473e-15	19421704	19806497
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19537035	20316992	61	59	-0.3678	1.30031802373473e-15	19421704	19806497	7.71885733623695e-17	20022359	20385551
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20321772	99632987	30889	29926	-0.008	7.71885733623695e-17	20022359	20385551	4.84981387196771e-20	99632987	99632987
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.111	4.84981387196771e-20	99632987	99632987	4.80556126727227e-19	99635701	99635701
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	257	0.0198	4.80556126727227e-19	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34329518	10709	10373	0.0081	NA	NA	NA	6.44419239742827e-71	34325501	34339543
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34333833	34602318	50	50	0.8074	6.44419239742827e-71	34325501	34339543	5.32654787725525e-75	34588639	34617260
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	88690571	14898	14432	-0.0058	5.32654787725525e-75	34588639	34617260	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	404	0.0343	NA	NA	NA	3.95379331529256e-15	1028979	1028979
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.7606	3.95379331529256e-15	1028979	1028979	4.94378599179289e-13	1030766	1030766
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1904451	435	422	0.0186	4.94378599179289e-13	1030766	1030766	1.92576469187215e-09	1903358	1904451
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1906319	1906391	3	3	1.2389	1.92576469187215e-09	1903358	1904451	9.29979509784086e-10	1906391	1909371
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1909371	31457889	11180	10811	0.0041	9.29979509784086e-10	1906391	1909371	9.29181168563428e-07	31429227	31467971
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.4224	9.29181168563428e-07	31429227	31467971	1.38087340581516e-06	31490899	31906639
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	36672710	1814	1755	-0.0034	1.38087340581516e-06	31490899	31906639	8.76778725911938e-144	36672710	36672710
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36673853	36673853	1	0	NA	8.76778725911938e-144	36672710	36672710	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-3.5847	NA	NA	NA	3.63066763696989e-148	36683509	36683509
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	41519702	2012	1950	0.016	3.63066763696989e-148	36683509	36683509	5.71284796045412e-21	41501967	41529227
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41710400	67	67	0.3946	5.71284796045412e-21	41501967	41529227	9.33019190295914e-22	41697532	42159958
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	78653545	13679	13238	0.005	9.33019190295914e-22	41697532	42159958	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76116026	22964	22276	-0.0047	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	1398325	492	469	0.013	NA	NA	NA	3.73590718308894e-17	1398325	1398325
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.2139	3.73590718308894e-17	1398325	1398325	6.58686013530722e-18	1400840	1400840
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	1797537	185	175	-0.0603	6.58686013530722e-18	1400840	1400840	1.22169821568954e-10	1797537	1797537
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1798246	1799778	2	2	1.6987	1.22169821568954e-10	1797537	1797537	7.60742847962054e-11	1799778	1799778
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1801091	11448975	4491	4332	0.0167	7.60742847962054e-11	1799778	1799778	1.64926979166985e-08	11448975	11448975
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.5165	1.64926979166985e-08	11448975	11448975	3.29573874838683e-09	11452390	11452390
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	63788698	17885	17325	0.0025	3.29573874838683e-09	11452390	11452390	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	574	-0.0135	NA	NA	NA	2.10520339510793e-17	1499421	1515948
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.8505	2.10520339510793e-17	1499421	1515948	5.88152612294963e-17	1525300	1544485
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	12095485	3690	3579	0.0046	5.88152612294963e-17	1525300	1544485	1.31871388777577e-09	12095485	12095485
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12108105	12113855	2	2	1.4416	1.31871388777577e-09	12095485	12095485	1.49642875401218e-08	12113855	12127349
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12127349	62419534	17291	16773	0.0028	1.49642875401218e-08	12113855	12127349	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13005	-0.0038	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22696038	2988	2900	0.0094	NA	NA	NA	1.57130772084844e-10	22682428	22696038
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22696162	22712211	9	9	0.7814	1.57130772084844e-10	22682428	22696038	2.65202718029444e-11	22712211	22714979
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22713972	49571068	13559	13110	2e-04	2.65202718029444e-11	22712211	22714979	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	266212	127	124	0.0223	NA	NA	NA	2.19307812196633e-05	264886	266212
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	267060	267079	2	2	1.3244	2.19307812196633e-05	264886	266212	8.74308729473946e-07	267079	268402
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	268402	2303192	1272	1232	0.0449	8.74308729473946e-07	267079	268402	1.96406592406498e-25	2303192	2303192
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-1.9377	1.96406592406498e-25	2303192	2303192	1.14661854794759e-22	2304398	2304398
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	377	-0.0028	1.14661854794759e-22	2304398	2304398	0	2708113	2711273
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	76998610	22939	22190	0.9564	0	2708113	2711273	1.71786597877232e-11	76998610	76998610
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.6971	1.71786597877232e-11	76998610	76998610	1.24117204744826e-11	77010018	77010018
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	21494	0.9582	1.24117204744826e-11	77010018	77010018	0	154578922	154586690
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	198	0.0036	0	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3223585	123	118	-3.8123	NA	NA	NA	8.83682355057557e-28	3034907	3772482
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	3733715	1	0	NA	8.83682355057557e-28	3034907	3772482	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-0.8847	NA	NA	NA	2.10378723237227e-13	5531459	6688691
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	162	-3.2489	2.10378723237227e-13	5531459	6688691	3.23012470262289e-06	7005620	7231063
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7653082	161	156	-2.4814	3.23012470262289e-06	7005620	7231063	4.09632239530359e-11	7572591	7693408
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	8956787	380	360	-3.2968	4.09632239530359e-11	7572591	7693408	3.17513846312883e-05	8880912	8968640
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9133230	29	29	-4.3478	3.17513846312883e-05	8880912	8968640	0.000265882386719885	9098780	10004173
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9135034	9135034	1	0	NA	0.000265882386719885	9098780	10004173	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9145335	10513747	81	75	-3.3324	NA	NA	NA	1.16958500449018e-11	10504879	10550419
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	19	-1.2124	1.16958500449018e-11	10504879	10550419	3.20581106244249e-10	11660512	12452734
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.2389	3.20581106244249e-10	11660512	12452734	2.51650587837107e-09	12541506	12546917
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	52	-1.8713	2.51650587837107e-09	12541506	12546917	0.000377643687800314	12611624	12786515
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12928074	57	55	-2.7944	0.000377643687800314	12611624	12786515	0.000600290845410983	12888523	12997864
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12939004	13128515	78	77	-1.9299	0.000600290845410983	12888523	12997864	5.7234134871464e-06	13111594	13133803
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13153117	13	13	-3.7784	5.7234134871464e-06	13111594	13133803	0.0258590001909931	13146483	13169265
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13153920	13254711	29	28	-2.7182	0.0258590001909931	13146483	13169265	1.13876059928279e-06	13236901	13261173
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13328273	25	24	-4.1067	1.13876059928279e-06	13236901	13261173	0.00392610981094765	13300861	13390439
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13329968	13524481	98	91	-3.405	0.00392610981094765	13300861	13390439	2.24373452869282e-05	13508776	13527753
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13525650	13525650	1	0	NA	2.24373452869282e-05	13508776	13527753	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13526852	13537520	9	9	-4.7819	NA	NA	NA	9.89152866459084e-05	13533864	13549185
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13539170	13772047	57	53	-3.3103	9.89152866459084e-05	13533864	13549185	8.98153381073967e-05	13716331	13776202
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13773971	13823928	15	15	-4.5105	8.98153381073967e-05	13716331	13776202	1.02625302020265e-10	13823928	13828384
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13863657	8	8	-2.0905	1.02625302020265e-10	13823928	13828384	3.70029995920205e-07	13854528	13869106
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13866668	14342834	154	146	-3.9388	3.70029995920205e-07	13854528	13869106	1.61204389085377e-14	14326935	14377844
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14585542	124	121	-2.8329	1.61204389085377e-14	14326935	14377844	0.000318659848515602	14481337	14793118
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14587291	15521958	325	314	-3.4207	0.000318659848515602	14481337	14793118	0.000115644384390420	15479343	15524675
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15523178	15523178	1	0	NA	0.00011564438439042	15479343	15524675	NA	NA	NA
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15546378	13	12	-1.8061	NA	NA	NA	0.00140112207520338	15542314	15554463
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15547576	15566377	15	15	-3.379	0.00140112207520338	15542314	15554463	0.0147887392576520	15554463	15573579
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15573579	15583573	5	5	-1.5259	0.014788739257652	15554463	15573579	3.1793878594601e-06	15583573	15590299
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15585797	15915466	56	55	-3.7246	3.1793878594601e-06	15583573	15590299	5.24881148592972e-06	15854496	15979526
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16177411	104	100	-2.7432	5.24881148592972e-06	15854496	15979526	7.59004509029129e-09	16091622	16229149
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	22139807	996	952	-3.4917	7.59004509029129e-09	16091622	16229149	1.62829647896008e-08	22052726	22139807
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.1838	1.62829647896008e-08	22052726	22139807	1.05312210187728e-13	22177335	22179794
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	87	-3.9226	1.05312210187728e-13	22177335	22179794	8.68364296592408e-47	22924754	26871442
MSK_252152912977_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	81	-1.3335	8.68364296592408e-47	22924754	26871442	NA	NA	NA
