Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16663329	5777	5674	0.0059	NA	NA	NA	2.80306239243828e-15	16652095	16814050
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16666760	17127039	30	30	0.3841	2.80306239243828e-15	16652095	16814050	2.68291900185964e-15	17094475	17160385
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	34869589	7087	6949	0.0073	2.68291900185964e-15	17094475	17160385	2.85073779932628e-09	34859068	34869589
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34884849	5	5	-0.718	2.85073779932628e-09	34859068	34869589	1.46607237599373e-10	34884849	34886493
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34886493	92767172	21448	21096	0.0073	1.46607237599373e-10	34884849	34886493	7.07574169058152e-14	92767172	92767172
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92767999	92774078	2	2	-1.2945	7.07574169058152e-14	92767172	92767172	3.82389419951815e-14	92774078	92774078
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	92775309	103904723	3664	3589	0.0021	3.82389419951815e-14	92774078	92774078	1.46494947439476e-20	103899771	103907903
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	103906464	103962495	15	15	0.5703	1.46494947439476e-20	103899771	103907903	1.72001242467182e-22	103932025	104108153
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	104012520	109987341	1568	1555	-0.0163	1.72001242467182e-22	103932025	104108153	2.02244964134753e-19	109987341	109987341
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.4698	2.02244964134753e-19	109987341	109987341	4.58603174493752e-17	109989998	109989998
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	147346399	4581	4497	0.0063	4.58603174493752e-17	109989998	109989998	5.40821709993773e-17	147315217	147357754
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147352661	147510532	27	25	0.4146	5.40821709993773e-17	147315217	147357754	5.98898570201426e-37	147490608	148088434
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150839754	1262	1233	0.0894	5.98898570201426e-37	147490608	148088434	4.37921840773252e-36	150839754	150839754
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150851439	7	3	-1.4242	4.37921840773252e-36	150839754	150839754	7.79724575255385e-26	150851439	150851439
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	151026228	78	76	-0.0273	7.79724575255385e-26	150851439	150851439	7.43053820254095e-13	151024118	151026228
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.8418	7.43053820254095e-13	151024118	151026228	1.34396176213643e-10	151036435	151038091
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2632	0.0149	1.34396176213643e-10	151036435	151038091	1.63714671863355e-35	157133150	157133150
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.1087	1.63714671863355e-35	157133150	157133150	2.39571767604755e-37	157136342	157136342
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	161099582	1622	1595	4e-04	2.39571767604755e-37	157136342	157136342	9.35753882115895e-09	161099067	161099582
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161104752	161104791	2	2	-1.0233	9.35753882115895e-09	161099067	161099582	9.46593330043038e-09	161104791	161108722
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161108722	167479184	2482	2448	0.0027	9.46593330043038e-09	161104791	161108722	2.35559479712374e-11	167473499	167483267
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167481271	167507898	10	10	-0.5176	2.35559479712374e-11	167473499	167483267	1.10206376626099e-11	167506259	167523140
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	195009358	9181	9014	0.0026	1.10206376626099e-11	167506259	167523140	3.42380794715009e-10	194977713	195009358
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-0.5428	3.42380794715009e-10	194977713	195009358	1.01395272210341e-09	195065867	195095156
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200609726	2161	2125	0.0158	1.01395272210341e-09	195065867	195095156	7.07530261238051e-12	200587846	200623556
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200787319	35	34	-0.2848	7.07530261238051e-12	200587846	200623556	1.78510107093790e-11	200679934	200808717
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	227875096	9925	9769	0.0066	1.7851010709379e-11	200679934	200808717	2.50823322781289e-10	227872808	227875096
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227882805	4	4	-0.8005	2.50823322781289e-10	227872808	227875096	1.20151185718437e-10	227882805	227889619
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	247186514	7480	7349	0.007	1.20151185718437e-10	227882805	227889619	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	19436088	5681	5580	0.0059	NA	NA	NA	9.31018205934258e-16	19434112	19436088
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	19439869	19447141	4	4	-0.9767	9.31018205934258e-16	19434112	19436088	5.82820577888195e-15	19447141	19447141
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	19456020	33076512	5191	5107	0.0041	5.82820577888195e-15	19447141	19447141	9.39933684279119e-30	33076512	33076512
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-1.9436	9.39933684279119e-30	33076512	33076512	1.92538951873513e-32	33080437	33080437
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	630	-0.0083	1.92538951873513e-32	33080437	33080437	0	34543992	34543992
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34579933	14	14	-5.2986	0	34543992	34543992	6.46577758430329e-09	34575366	34579933
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34580533	34589997	4	4	-3.0156	6.46577758430329e-09	34575366	34579933	6.23220365837129e-146	34589997	34589997
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	474	0.0025	6.23220365837129e-146	34589997	34589997	2.53209927741871e-11	35821494	35821494
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.1628	2.53209927741871e-11	35821494	35821494	6.33411422509274e-11	35844884	35844884
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	35851593	1	0	NA	6.33411422509274e-11	35844884	35844884	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35853977	105027374	21497	21154	0.0044	NA	NA	NA	2.12251764133937e-08	105026195	105027374
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	105028576	105030311	2	2	-1.0235	2.12251764133937e-08	105026195	105027374	9.01937828317285e-09	105030311	105032146
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	105032146	146571330	11548	11349	0.008	9.01937828317285e-09	105030311	105032146	0	146571330	146571330
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146582195	1	0	NA	0	146571330	146571330	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146585707	146592775	3	3	-6.0103	NA	NA	NA	0	146592775	146592775
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	179767214	11204	11042	0.0121	0	146592775	146592775	2.11704978903860e-09	179764819	179767214
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.884	2.1170497890386e-09	179764819	179767214	6.79245669544591e-10	179778919	179791128
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	218970587	13138	12923	0.005	6.79245669544591e-10	179778919	179791128	9.60140759191655e-19	218970587	218970587
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218971708	218972428	2	2	1.4605	9.60140759191655e-19	218970587	218970587	4.60805718966814e-17	218972428	218972428
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218975318	242677011	8397	8256	-0.0087	4.60805718966814e-17	218972428	218972428	1.46948244889691e-07	242454768	242677220
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242677069	242689978	5	5	-0.2036	1.46948244889691e-07	242454768	242677220	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	32074432	10796	10613	-0.0027	NA	NA	NA	3.50759506162719e-18	32074432	32074432
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.445	3.50759506162719e-18	32074432	32074432	9.87790276290662e-17	32080848	32080848
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5333	0.0046	9.87790276290662e-17	32080848	32080848	9.28630404809357e-10	47460892	47460892
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.1185	9.28630404809357e-10	47460892	47460892	2.51565688754103e-10	47466921	47466921
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	120832981	22397	21992	0.0017	2.51565688754103e-10	47466921	47466921	5.43032219605905e-12	120832981	120832981
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	120835103	120836587	2	2	-1.1948	5.43032219605905e-12	120832981	120832981	8.00460223961603e-11	120836587	120836587
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	120838177	133189686	5090	5020	-0.0035	8.00460223961603e-11	120836587	120836587	4.23670295582932e-17	133189686	133189686
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.4792	4.23670295582932e-17	133189686	133189686	1.67105659203910e-18	133194685	133194685
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	1.6710565920391e-18	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	163992903	9776	9603	0.0066	NA	NA	NA	8.85445791795917e-55	163989367	164005577
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164107951	28	26	0.7027	8.85445791795917e-55	163989367	164005577	3.18464823302618e-55	164101776	164112873
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	191219222	9122	8968	0.0123	3.18464823302618e-55	164101776	164112873	7.55779551761549e-264	191219222	191219222
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-5.378	7.55779551761549e-264	191219222	191219222	2.64706891287748e-244	191222891	191222891
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	199329592	2992	2952	-0.0027	2.64706891287748e-244	191222891	191222891	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	682752	214	213	-0.0068	NA	NA	NA	1.40420615560997e-07	679789	682752
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	685953	685953	1	0	NA	1.40420615560997e-07	679789	682752	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	0.9877	NA	NA	NA	6.41439350869451e-07	691065	693668
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	9815760	3176	3129	0.0123	6.41439350869451e-07	691065	693668	0	9815760	9815760
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-4.9544	0	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	34445002	6167	6070	-0.0012	0	9842644	9842644	5.44767943396447e-15	34439897	34445002
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34491115	6	6	-0.7447	5.44767943396447e-15	34439897	34445002	2.37078735249219e-14	34491115	34506297
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34506297	69075140	8865	8700	-0.0031	2.37078735249219e-14	34491115	34506297	1.09911277350799e-24	69069651	69075140
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69085386	69165814	12	12	-0.6843	1.09911277350799e-24	69069651	69075140	3.91507568271012e-25	69165814	69643272
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	173660684	31388	30865	-0.001	3.91507568271012e-25	69165814	69643272	2.50605748869448e-91	173660684	173660684
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-3.1483	2.50605748869448e-91	173660684	173660684	3.34172381330450e-93	173666072	173666072
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	186676034	3773	3709	-0.0039	3.3417238133045e-93	173666072	173666072	3.22739040446545e-76	186676034	186676034
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	2.8421	3.22739040446545e-76	186676034	186676034	5.29623109783384e-75	186680176	186680176
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	191153613	1549	1525	0.0051	5.29623109783384e-75	186680176	186680176	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	140533456	40224	39517	-7e-04	NA	NA	NA	3.17625089815610e-11	140533456	140533456
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140535820	140538666	2	2	-1.168	3.1762508981561e-11	140533456	140533456	1.09604829082985e-10	140538666	140538666
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140541178	180644810	13540	13306	-4e-04	1.09604829082985e-10	140538666	140538666	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	202063	41	39	-0.0431	NA	NA	NA	3.08745691436209e-31	200350	204881
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	204881	271851	31	30	-0.7162	3.08745691436209e-31	200350	204881	4.58011495834004e-08	259527	279694
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	273710	326323	29	29	-1.0917	4.58011495834004e-08	259527	279694	2.86792833458992e-155	326323	326323
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	31385778	11081	10896	0.0022	2.86792833458992e-155	326323	326323	2.00391303853995e-27	31385778	31387708
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	31418006	6	6	-1.0193	2.00391303853995e-27	31385778	31387708	3.72358127376597e-25	31395330	31418006
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32558677	489	481	0.0117	3.72358127376597e-25	31395330	31418006	1.06957092076195e-170	32558677	32564884
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	9	-2.6075	1.06957092076195e-170	32558677	32564884	4.67883887721147e-05	32595402	32600962
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32628420	5	5	-0.1719	4.67883887721147e-05	32595402	32600962	5.38774021334565e-15	32628420	32628420
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32629848	32633691	3	3	-1.703	5.38774021334565e-15	32628420	32628420	4.72403212839623e-14	32633691	32634977
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	28	-0.1212	4.72403212839623e-14	32633691	32634977	5.46960402408522e-05	32707427	32718991
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	7	0.523	5.46960402408522e-05	32707427	32718991	2.20511017626085e-06	32723366	32734957
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	35241285	1065	1050	0.011	2.20511017626085e-06	32723366	32734957	3.16361134260668e-06	35238333	35241285
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35244900	35248528	2	2	0.9541	3.16361134260668e-06	35238333	35241285	2.62020300168818e-07	35248528	35252361
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35252361	79018959	13627	13370	0.0084	2.62020300168818e-07	35248528	35252361	8.19817658574657e-13	79008946	79028813
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.4722	8.19817658574657e-13	79008946	79028813	6.07121925492288e-13	79079988	79101978
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	102039635	6272	6169	0.007	6.07121925492288e-13	79079988	79101978	4.14178013316566e-14	102039635	102039635
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102041299	102044331	3	3	-1.032	4.14178013316566e-14	102039635	102039635	2.76367882203183e-13	102044331	102044331
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	102046884	170753106	23405	22964	0.0012	2.76367882203183e-13	102044331	102044331	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	89479247	27043	26556	-0.0021	NA	NA	NA	1.32585004235803e-36	89479247	89479247
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89484720	89530049	9	9	0.9813	1.32585004235803e-36	89479247	89479247	7.08919547875721e-37	89530049	89530049
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	89533759	100166257	4011	3947	0.0052	7.08919547875721e-37	89530049	89530049	3.17255866052979e-11	100164752	100166257
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100170227	100174991	3	3	-0.9436	3.17255866052979e-11	100164752	100166257	5.57462527928608e-11	100174991	100178968
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	125831554	11372	11175	0.0036	5.57462527928608e-11	100174991	100178968	3.46434661136427e-199	125831554	125831554
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	-3.9055	3.46434661136427e-199	125831554	125831554	5.21650827303896e-217	125837524	125837524
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	126585104	361	355	-0.0059	5.21650827303896e-217	125837524	125837524	9.16694802940223e-15	126583974	126585104
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126587509	126600154	5	5	-0.7941	9.16694802940223e-15	126583974	126585104	2.07939007970433e-12	126600154	126602315
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	126602315	133432281	3287	3216	0.0054	2.07939007970433e-12	126600154	126602315	4.72783803708398e-21	133426996	133432281
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133433384	133433384	1	0	NA	4.72783803708398e-21	133426996	133432281	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.8212	NA	NA	NA	1.15566064640436e-21	133448277	133453811
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141410894	3700	3647	0.0107	1.15566064640436e-21	133448277	133453811	0	141410894	141414719
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	13	-4.4871	0	141410894	141414719	0	141435643	141440184
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	156483966	5821	5717	-0.0047	0	141435643	141440184	4.5590352505204e-11	156480019	156483966
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156485711	156497496	7	6	0.6851	4.5590352505204e-11	156480019	156483966	3.69095982904138e-11	156497496	156498994
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	156498994	158821263	1050	1040	-0.007	3.69095982904138e-11	156497496	156498994	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	118	-0.0028	NA	NA	NA	1.50361213563456e-158	581533	581533
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.1383	1.50361213563456e-158	581533	581533	1.84671067632247e-150	588865	588865
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	87255865	25699	25204	0.0031	1.84671067632247e-150	588865	588865	4.02700742616220e-14	87255865	87255865
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87258019	87262662	3	3	-1.0633	4.0270074261622e-14	87255865	87255865	1.16215064909572e-14	87262662	87262662
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87265435	137748793	15891	15638	0.0069	1.16215064909572e-14	87262662	87262662	5.28999581805782e-135	137748793	137751905
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137751905	137922591	32	32	-0.9646	5.28999581805782e-135	137748793	137751905	1.34934273392283e-107	137919308	137931707
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137931707	146264846	2820	2773	2e-04	1.34934273392283e-107	137919308	137931707	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	2135333	760	748	-0.0041	NA	NA	NA	1.44142156595178e-11	2135333	2135333
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2138129	2139868	2	2	-1.184	1.44142156595178e-11	2135333	2135333	8.66433767322367e-12	2139868	2139868
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	2143843	70926188	12310	12086	-0.0047	8.66433767322367e-12	2139868	2139868	1.29370067267410e-32	70926188	70926188
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.9326	1.2937006726741e-32	70926188	70926188	2.00303469622138e-33	70930528	70930528
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	85391432	4782	4701	-0.0054	2.00303469622138e-33	70930528	70930528	1.52285830859352e-09	85391432	85391432
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	85393201	85394970	2	2	-1.0505	1.52285830859352e-09	85391432	85391432	5.33887177791442e-08	85394970	85394970
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	85396763	137352394	18981	18673	-0.0095	5.33887177791442e-08	85394970	85394970	5.87486093249386e-17	137352394	137352394
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.4651	5.87486093249386e-17	137352394	137352394	1.72831483745624e-13	137356880	137356880
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1084	-0.0196	1.72831483745624e-13	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	77917893	24592	24164	-0.007	NA	NA	NA	5.39580050703915e-127	77917893	77917893
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-3.8361	5.39580050703915e-127	77917893	77917893	1.17685130113458e-119	77928669	77928669
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	124337128	16336	16045	-0.0067	1.17685130113458e-119	77928669	77928669	1.61228920421292e-10	124337128	124337128
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337860	124340356	2	2	-1.1821	1.61228920421292e-10	124337128	124337128	1.23262809716253e-09	124340356	124340356
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	135285645	3876	3809	-0.019	1.23262809716253e-09	124340356	124340356	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1738	2e-04	NA	NA	NA	0	4923300	4923300
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-5.1109	0	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	18896166	5595	5505	-0.0071	0	4932214	4932214	2.25462518933993e-09	18890351	18906505
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	0.6196	2.25462518933993e-09	18890351	18906505	2.71957890983079e-09	18915465	18929375
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55118214	9527	9374	1e-04	2.71957890983079e-09	18915465	18929375	4.72146338054268e-51	55112618	55124730
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.5533	4.72146338054268e-51	55112618	55124730	1.43251666739672e-49	55207305	55223056
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	55219985	1	0	NA	1.43251666739672e-49	55207305	55223056	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55221692	66463477	4636	4562	0.0107	NA	NA	NA	6.363845795105e-49	66463477	66463477
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	-2.4537	6.363845795105e-49	66463477	66463477	4.07315657555225e-48	66469412	66469412
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	81150860	5230	5120	-0.0094	4.07315657555225e-48	66469412	66469412	2.90103792539818e-11	81144958	81165726
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81156648	81202118	7	7	-0.6558	2.90103792539818e-11	81144958	81165726	5.05426282803334e-13	81187470	81208351
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81208351	99030209	5619	5534	-0.0088	5.05426282803334e-13	81187470	81208351	7.6776028207702e-10	99013072	99038263
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99031550	99072015	19	19	0.3352	7.6776028207702e-10	99013072	99038263	7.63400353081728e-09	99054841	99081056
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99074552	134450318	12845	12638	-0.0064	7.63400353081728e-09	99054841	99081056	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	9528590	3743	3675	-0.0081	NA	NA	NA	1.06447843980536e-137	9528590	9528590
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9531133	9554149	4	4	-2.8863	1.06447843980536e-137	9528590	9528590	3.54220920646441e-51	9554149	9554149
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9626623	12	11	-0.4423	3.54220920646441e-51	9554149	9554149	4.66768047600552e-08	9599999	9630105
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626736	11104973	566	558	-0.0152	4.66768047600552e-08	9599999	9630105	1.08879639308411e-24	11104085	11104973
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11140421	11	11	0.7196	1.08879639308411e-24	11104085	11104973	1.93822867934924e-12	11140421	11151185
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	68	0.0221	1.93822867934924e-12	11140421	11151185	9.19296443316536e-33	11395862	11395862
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-1.4241	9.19296443316536e-33	11395862	11395862	1.05221139296782e-54	11435643	11435643
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	41303729	9251	9072	0.0027	1.05221139296782e-54	11435643	11435643	3.62827194762404e-14	41293470	41303729
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41307749	41312478	3	3	-1.0432	3.62827194762404e-14	41293470	41303729	7.06598287709e-14	41312478	41312478
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	41315922	100624427	19769	19451	0.0087	7.06598287709e-14	41312478	41312478	1.24107865058295e-11	100620923	100624427
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100626837	100629832	3	3	-0.9601	1.24107865058295e-11	100620923	100624427	4.10730346875997e-11	100629832	100634203
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100631726	100631726	1	0	NA	4.10730346875997e-11	100629832	100634203	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100634203	110664043	3830	3763	0.0104	NA	NA	NA	8.32500695151776e-75	110659791	110666479
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	110665203	110802429	58	57	0.581	8.32500695151776e-75	110659791	110666479	1.63687340761919e-74	110793255	110805632
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	110803956	130943064	7282	7164	0.0101	1.63687340761919e-74	110793255	110805632	3.30432727059016e-37	130943064	130943064
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.1623	3.30432727059016e-37	130943064	130943064	1.21375757915781e-36	130946248	130946248
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	542	-0.0012	1.21375757915781e-36	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	37953582	7338	7208	-0.0115	NA	NA	NA	1.64720242654358e-66	37953582	37953582
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.7551	1.64720242654358e-66	37953582	37953582	1.48986274854195e-70	37957844	37957844
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	49964838	4879	4794	-0.0066	1.48986274854195e-70	37957844	37957844	3.75716252719219e-45	49964838	49964838
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.2444	3.75716252719219e-45	49964838	49964838	3.75022794181934e-45	49971732	49971732
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	71375082	5442	5351	-7e-04	3.75022794181934e-45	49971732	49971732	4.46155119976806e-304	71375082	71375082
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-5.7313	4.46155119976806e-304	71375082	71375082	2.26414957483966e-294	71377671	71377671
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	114123340	13979	13735	-0.0082	2.26414957483966e-294	71377671	71377671	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19295733	12	12	-0.0848	NA	NA	NA	1.69189778181849e-06	18527871	19325098
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19297767	19538610	51	50	0.3295	1.69189778181849e-06	18527871	19325098	5.74251759718991e-23	19490630	19549728
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19540294	34674458	5687	5579	0.0075	5.74251759718991e-23	19490630	19549728	2.64030959910423e-10	34666996	34674458
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34685308	4	4	0.7794	2.64030959910423e-10	34666996	34674458	7.9476222955271e-10	34685308	34689453
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34689453	88087065	18843	18542	-0.0042	7.9476222955271e-10	34685308	34689453	9.60390408159463e-10	88087065	88087065
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	88089060	88090516	2	2	1.0998	9.60390408159463e-10	88087065	88087065	9.87358855089027e-09	88090516	88092995
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	88092995	105602602	7044	6933	-0.007	9.87358855089027e-09	88090516	88092995	2.35272288049166e-08	105592583	105609466
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105606424	105632168	11	11	-0.47	2.35272288049166e-08	105592583	105609466	5.66717767426192e-26	105632168	105673157
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105856972	50	50	0.4822	5.66717767426192e-26	105632168	105673157	1.91973577136829e-25	105846004	105881677
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	106358491	181	179	0.0381	1.91973577136829e-25	105846004	105881677	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	4	0.1056	NA	NA	NA	0.00509339287447316	18450562	18818949
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19109124	26	25	-0.1973	0.00509339287447316	18450562	18818949	3.42206770038104e-08	18882292	19137963
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19117783	19537035	68	68	0.1066	3.42206770038104e-08	18882292	19137963	1.49759489073058e-14	19421704	19819961
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	20321772	61	60	-0.2116	1.49759489073058e-14	19421704	19819961	1.93913734966907e-08	20029653	20411730
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20330200	32456500	3667	3600	-0.0169	1.93913734966907e-08	20029653	20411730	9.51631831749225e-57	32454294	32514939
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	24	-0.7907	9.51631831749225e-57	32454294	32514939	8.62453139564399e-61	32583146	32661846
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	74669752	17859	17571	-0.009	8.624531395644e-61	32583146	32661846	1.90567706526817e-12	74665386	74669752
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.8798	1.90567706526817e-12	74665386	74669752	6.3710478959728e-12	74680439	74696127
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	78855195	1660	1629	-0.0139	6.3710478959728e-12	74680439	74696127	2.88640077833522e-12	78855195	78855195
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78856680	78858227	2	2	1.2671	2.88640077833522e-12	78855195	78855195	8.34005596443289e-13	78858227	78858227
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78861458	99632987	7671	7521	-0.0151	8.34005596443289e-13	78858227	78858227	3.18004622739752e-35	99632987	99632987
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.0768	3.18004622739752e-35	99632987	99632987	1.65923736726005e-37	99635701	99635701
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	264	-0.0187	1.65923736726005e-37	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	31862577	10572	10401	0.0053	NA	NA	NA	6.17960982191658e-16	31843922	32379126
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	33293241	20	18	-0.4854	6.17960982191658e-16	31843922	32379126	3.51857270705483e-15	33278944	33370459
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33320529	57203733	4317	4241	-0.011	3.51857270705483e-15	33278944	33370459	2.87364888120076e-77	57203733	57203733
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-3.1664	2.87364888120076e-77	57203733	57203733	2.75047220601016e-84	57206772	57206772
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	75093957	5612	5522	0.0018	2.75047220601016e-84	57206772	57206772	8.54987177911083e-07	75092501	75093957
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	0.7668	8.54987177911083e-07	75092501	75093957	7.60070016291602e-08	75100865	75102639
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	599	-0.0103	7.60070016291602e-08	75100865	75102639	2.98278412913303e-21	76923844	76925748
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76942679	9	8	0.7688	2.98278412913303e-21	76923844	76925748	1.26361096311382e-17	76942679	76944661
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	88690571	4512	4456	-0.0196	1.26361096311382e-17	76942679	76944661	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	415	0.0295	NA	NA	NA	5.42318705457402e-24	1028979	1028979
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	1.738	5.42318705457402e-24	1028979	1028979	1.37799858691296e-23	1030766	1030766
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	36673853	13452	13241	0.0013	1.37799858691296e-23	1030766	1030766	4.89432169749768e-301	36673853	36673853
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-3.533	4.89432169749768e-301	36673853	36673853	6.03730326308405e-281	36684619	36684619
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	40869151	1806	1764	0.018	6.03730326308405e-281	36684619	36684619	4.90033388201303e-07	40863808	40874079
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	40874079	41026062	6	6	-0.5562	4.90033388201303e-07	40863808	40874079	3.84910823949179e-06	41017338	41066163
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41031191	41566540	220	217	0.0418	3.84910823949179e-06	41017338	41066163	3.25289723414145e-30	41558893	41570512
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42147225	49	49	-0.449	3.25289723414145e-30	41558893	41570512	7.54128020369923e-42	41710400	42151941
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42148637	52440878	3477	3410	0.0154	7.54128020369923e-42	41710400	42151941	1.87517252037640e-07	52438207	52440878
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-0.7942	1.8751725203764e-07	52438207	52440878	2.18314195472309e-07	52447064	52454171
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	68326225	5929	5831	0.0116	2.18314195472309e-07	52447064	52454171	2.15780476125294e-07	68322875	68326225
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68327352	68329393	2	2	-0.9756	2.15780476125294e-07	68322875	68326225	3.34288965064390e-06	68329393	68335510
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68331629	68331629	1	0	NA	3.3428896506439e-06	68329393	68335510	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	68335510	78653545	4264	4196	0.0082	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15941	-0.0074	NA	NA	NA	7.77444209674709e-14	53092949	53092949
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.2898	7.77444209674709e-14	53092949	53092949	2.15472036931401e-13	53099601	53099601
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6649	-0.0085	2.15472036931401e-13	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	239700	12	11	-0.047	NA	NA	NA	2.4793987961196e-27	239700	239700
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	1.5616	2.4793987961196e-27	239700	239700	9.72402885904637e-17	243026	243026
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	790526	205	201	0.0378	9.72402885904637e-17	243026	243026	2.35340118085924e-09	790492	790526
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.1827	2.35340118085924e-09	790492	790526	5.90774362597314e-09	794978	798817
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	267	0.0196	5.90774362597314e-09	794978	798817	6.98357178094352e-25	1398325	1398325
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	1.9395	6.98357178094352e-25	1398325	1398325	1.17086972584936e-24	1400840	1400840
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	11448975	4678	4599	0.0157	1.17086972584936e-24	1400840	1400840	8.74903038003314e-15	11448975	11448975
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	1.5179	8.74903038003314e-15	11448975	11448975	1.55432025068969e-16	11452390	11452390
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	40843263	7667	7545	0.0144	1.55432025068969e-16	11452390	11452390	8.89798834839262e-09	40841482	40843263
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40847781	40851425	3	3	-0.8952	8.89798834839262e-09	40841482	40843263	6.71953740160782e-10	40851425	40853787
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40853787	41532062	304	300	0.0359	6.71953740160782e-10	40851425	40853787	5.72801775440117e-08	41530835	41532062
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41533405	41538649	2	2	-0.9903	5.72801775440117e-08	41530835	41532062	6.25762178598815e-07	41538649	41542955
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41542955	63788698	9909	9736	0.0049	6.25762178598815e-07	41538649	41542955	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	574	0.002	NA	NA	NA	7.12370458130746e-144	1506379	1511632
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	7	-2.85	7.12370458130746e-144	1506379	1511632	9.31085480572125e-227	1528899	1531162
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	62419534	20984	20619	-2e-04	9.31085480572125e-227	1528899	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13232	0.0036	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2929	-0.0129	NA	NA	NA	0	22667608	22679305
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	-3.3656	0	22667608	22679305	0	22720195	22725305
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	13290	-0.0064	0	22720195	22725305	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.0636	NA	NA	NA	2.15739054264617e-06	4926	95819
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	0.7571	2.15739054264617e-06	4926	95819	1.16808943445679e-12	104486	106242
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	2302065	1387	1362	0.0186	1.16808943445679e-12	104486	106242	2.29810172491493e-12	2301365	2302065
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	0.9813	2.29810172491493e-12	2301365	2302065	3.37812043785094e-13	2304398	2306110
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2674962	366	365	0.0117	3.37812043785094e-13	2304398	2306110	7.70375715981583e-08	2672401	2676476
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2676476	2693493	8	8	-0.5232	7.70375715981583e-08	2672401	2676476	0.000991305314453652	2692498	2697588
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2695630	2708291	15	15	-0.1235	0.000991305314453652	2692498	2697588	5.88418998473848e-49	2708291	2711273
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8450789	1790	1765	0.8744	5.88418998473848e-49	2708291	2711273	4.97468668226251e-08	8446489	8458058
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8452395	8466917	8	8	0.307	4.97468668226251e-08	8446489	8458058	2.07095652599015e-09	8463131	8477126
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	2.07095652599015e-09	8463131	8477126	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	107109041	28199	27725	0.8983	NA	NA	NA	7.31201375234016e-09	107107078	107109041
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	107110519	107111643	2	2	-0.2526	7.31201375234016e-09	107107078	107109041	4.08884002365738e-10	107111643	107112815
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	107112815	154561691	15129	14856	0.8971	4.08884002365738e-10	107111643	107112815	0	154561606	154561691
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154570075	154888224	206	200	-0.0249	0	154561606	154561691	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	126	-4.4418	NA	NA	NA	1.98540563666495e-22	3780462	4174561
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	4272867	1	0	NA	1.98540563666495e-22	3780462	4174561	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4413507	5593746	10	9	-1.282	NA	NA	NA	9.23704008315613e-10	5593746	6688691
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6953343	118	115	-4.005	9.23704008315613e-10	5593746	6688691	5.64230702012565e-06	6919934	7013903
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6954864	7495687	185	181	-3.2014	5.64230702012565e-06	6919934	7013903	0.00593585272209018	7350629	7578636
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7608619	13	13	-4.595	0.00593585272209018	7350629	7578636	0.0139668556229694	7603458	7632577
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7653082	18	18	-3.1319	0.0139668556229694	7603458	7632577	4.4670156313141e-05	7631265	7659535
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7723783	44	43	-4.5566	4.4670156313141e-05	7631265	7659535	1.52414732161779e-13	7719658	7726921
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7745143	9	8	-2.0316	1.52414732161779e-13	7719658	7726921	3.41152810900844e-07	7740117	7745143
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7749796	7776265	7	6	-3.5736	3.41152810900844e-07	7740117	7745143	1.09098221142443e-17	7776265	7776265
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7781968	7782532	2	2	-1.1932	1.09098221142443e-17	7776265	7776265	0.0412322940571698	7782532	7847379
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	8010446	62	60	-3.7626	0.0412322940571698	7782532	7847379	0.00263444505588029	7860364	8086207
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8016395	8241630	56	53	-4.5537	0.00263444505588029	7860364	8086207	0.376377520897756	8036254	8277707
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8245608	8289709	7	7	-4.063	0.376377520897756	8036254	8277707	0.000188031053279636	8259766	8292347
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8313045	10	10	-2.3919	0.000188031053279636	8259766	8292347	2.76485955420455e-05	8304781	8334196
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8316416	8956787	183	182	-3.8874	2.76485955420455e-05	8304781	8334196	9.92440655818496e-10	8921205	8963617
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8958121	9160624	36	34	-5.0418	9.92440655818496e-10	8921205	8963617	0.00034522576042974	9129443	10056943
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	9164547	10513747	75	73	-4.1864	0.00034522576042974	9129443	10056943	5.57994211513219e-31	10512616	10515697
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	10645500	13	11	-0.4972	5.57994211513219e-31	10512616	10515697	0.0507871257484765	10622062	11673476
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12452734	7	7	-2.2705	0.0507871257484765	10622062	11673476	0.00299480394520864	11249952	12452734
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12541506	11	11	-4.4917	0.00299480394520864	11249952	12452734	2.203613616083e-05	12537944	12557151
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12542979	12682301	54	51	-2.4884	2.203613616083e-05	12537944	12557151	6.1463018785681e-07	12651786	12700767
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12776542	15	15	-4.5884	6.1463018785681e-07	12651786	12700767	0.00620381032029426	12730281	12855363
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12786515	12926941	41	41	-3.3574	0.00620381032029426	12730281	12855363	0.00536722719970312	12865349	13001517
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12928074	13128515	79	75	-2.4864	0.00536722719970312	12865349	13001517	1.54442026589063e-06	13086552	13147329
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13254711	42	41	-3.8145	1.54442026589063e-06	13086552	13147329	0.0404904255537542	13138841	13407320
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13256555	13868296	215	206	-4.2483	0.0404904255537542	13138841	13407320	5.39901152796694e-05	13603478	13922080
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13869106	14122129	121	118	-4.7283	5.39901152796694e-05	13603478	13922080	1.20753563768344e-09	14122036	14122129
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14143748	3	3	-1.7884	1.20753563768344e-09	14122036	14122129	2.11805516023611e-05	14143748	14143748
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14214157	4	3	-5.6144	2.11805516023611e-05	14143748	14143748	0.0115568704578867	14203911	14260254
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14225706	14328579	17	17	-4.1467	0.0115568704578867	14203911	14260254	1.45995976123886e-08	14325320	14328579
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14330251	14342834	7	7	-5.7844	1.45995976123886e-08	14325320	14328579	2.85388427007377e-06	14342834	14352278
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508021	96	93	-3.6902	2.85388427007377e-06	14342834	14352278	5.08765709834656e-10	14500820	14530134
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14579298	26	25	-2.0313	5.08765709834656e-10	14500820	14530134	2.37161002788717e-11	14563486	14598838
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	15284717	194	190	-3.9491	2.37161002788717e-11	14563486	14598838	0.000237240175616312	15201695	15309005
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15396880	70	66	-4.7092	0.000237240175616312	15201695	15309005	1.37765463369541e-07	15381088	15433122
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15397704	16194420	269	260	-3.7697	1.37765463369541e-07	15381088	15433122	1.49556055825955e-09	16067790	16430865
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16195788	22157319	985	951	-4.2928	1.49556055825955e-09	16067790	16430865	5.44532096315555e-07	22055660	22157319
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22158616	22177335	8	8	-2.0632	5.44532096315555e-07	22055660	22157319	7.99184063440697e-14	22177335	22177335
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22192409	5	5	-4.1497	7.99184063440697e-14	22177335	22177335	0.00420203092026061	22181855	22208351
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22252795	21	21	-5.2277	0.00420203092026061	22181855	22208351	5.40742545766337e-06	22243796	22382215
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22261337	22930737	67	65	-4.2571	5.40742545766337e-06	22243796	22382215	1.39418427885760e-81	22926726	23283689
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	32	-1.1757	1.3941842788576e-81	22926726	23283689	1.02726265579785e-12	26945084	26950080
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.926	1.02726265579785e-12	26945084	26950080	0.00065777635917373	26965406	26989053
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	27011035	11	10	-1.3482	0.00065777635917373	26965406	26989053	2.52768310377552e-06	27007874	27011035
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019256	27019256	1	0	NA	2.52768310377552e-06	27007874	27011035	NA	NA	NA
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27019306	27039222	4	4	-4.4062	NA	NA	NA	3.10126362096337e-07	27039222	27063070
MSK_252152912979_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	57440809	32	31	-0.6957	3.10126362096337e-07	27039222	27063070	NA	NA	NA
