Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	17094475	5799	5212	0.1097	NA	NA	NA	4.30922700111926e-10	17086698	17094475
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17102601	17121583	6	6	0.929	4.30922700111926e-10	17086698	17094475	2.96732930344369e-15	17121583	17127039
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17124554	59103163	16872	15142	0.1122	2.96732930344369e-15	17121583	17127039	2.92114444432377e-56	59096396	59109681
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	59106976	59428919	70	64	0.713	2.92114444432377e-56	59096396	59109681	1.37376558535046e-60	59412807	59450868
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	59433580	72537426	5147	4603	0.1244	1.37376558535046e-60	59412807	59450868	6.8080712655018e-274	72537426	72537426
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	12	-2.7576	6.8080712655018e-274	72537426	72537426	8.96926888642792e-244	72579311	72579311
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	8.96926888642792e-244	72579311	72579311	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	76939856	1301	1178	0.0902	NA	NA	NA	2.94534527786871e-11	76926017	76948110
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	76941813	76962818	9	9	0.787	2.94534527786871e-11	76926017	76948110	9.58311499282089e-10	76956611	76969091
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	76964627	109739852	10230	9142	0.1311	9.58311499282089e-10	76956611	76969091	2.60886432653457e-15	109739852	109739852
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109741426	109743299	2	2	1.852	2.60886432653457e-15	109739852	109739852	1.17147215222600e-10	109743299	109745398
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109745398	110023268	160	143	0.1382	1.171472152226e-10	109743299	109745398	3.96821916523548e-19	110023268	110023268
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110041712	4	4	1.7864	3.96821916523548e-19	110023268	110023268	5.47566553725804e-26	110041712	110041712
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	143717399	3922	3539	0.156	5.47566553725804e-26	110041712	110041712	1.52355011223055e-22	143708689	143719710
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143718575	143793256	39	35	-0.3579	1.52355011223055e-22	143708689	143719710	1.10851391697353e-19	143789484	143805209
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143799153	150819879	1888	1682	0.1197	1.10851391697353e-19	143789484	143805209	4.22074933324226e-27	150818222	150819879
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	11	1.1102	4.22074933324226e-27	150818222	150819879	7.52639102592347e-28	150852858	150857070
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	157133150	2760	2530	0.1083	7.52639102592347e-28	150852858	150857070	8.92197951406354e-42	157133150	157133150
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-2.7547	8.92197951406354e-42	157133150	157133150	6.91161733341337e-47	157136342	157136342
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	160405741	1288	1162	0.1491	6.91161733341337e-47	157136342	157136342	1.06590983846577e-84	160385827	160425845
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	160406932	161097383	332	307	0.5071	1.06590983846577e-84	160385827	160425845	7.6110064768426e-112	161088794	161108722
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	161099067	167483267	2488	2227	0.1173	7.6110064768426e-112	161088794	161108722	5.34294785022764e-09	167477428	167483267
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167520743	9	8	0.7255	5.34294785022764e-09	167477428	167483267	2.50521757955527e-19	167520743	167534190
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167523140	167523140	1	0	NA	2.50521757955527e-19	167520743	167534190	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167525669	176167579	3396	3018	0.1002	NA	NA	NA	4.03236894327099e-33	176146402	176184136
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	176169387	176450671	125	107	0.4474	4.03236894327099e-33	176146402	176184136	4.82146256601423e-19	176428953	176479724
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	176452580	177591660	463	425	0.1395	4.82146256601423e-19	176428953	176479724	2.01788214672063e-15	177591660	177591660
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177593746	177596757	3	0	NA	2.01788214672063e-15	177591660	177591660	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177597949	177599597	2	2	-1.7435	NA	NA	NA	2.09197269442598e-17	177599597	177599597
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	177601540	187224389	3422	3091	0.135	2.09197269442598e-17	177599597	177599597	2.71670033556789e-07	187224389	187224389
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	187229169	187232308	2	2	-1.1007	2.71670033556789e-07	187224389	187224389	5.66342773585935e-08	187232308	187232308
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	187237813	192715640	1287	1141	0.1285	5.66342773585935e-08	187232308	187232308	1.00529256173650e-12	192715640	192715640
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	1.6688	1.0052925617365e-12	192715640	192715640	5.18000974134092e-14	192719540	192719540
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	195009358	477	427	0.1145	5.18000974134092e-14	192719540	192719540	9.40357988320668e-21	195009358	195011344
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195011344	195065867	8	8	-0.8441	9.40357988320668e-21	195009358	195011344	0	195048208	195091758
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	229620503	12818	11500	-0.0027	0	195048208	195091758	0	229617833	229622205
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229622205	229628300	4	4	0.8582	0	229617833	229622205	1.95515962535557e-11	229628300	229634245
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	229634245	247186514	6783	6027	-0.1013	1.95515962535557e-11	229628300	229634245	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	24452394	7082	6344	0.0794	NA	NA	NA	1.5957013815239e-09	24446913	24452394
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24455322	24462631	4	3	-0.7677	1.5957013815239e-09	24446913	24452394	3.80073379552138e-14	24462631	24467164
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	24467164	34543992	4436	4013	0.1293	3.80073379552138e-14	24462631	24467164	9.1457689898521e-58	34542224	34551222
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34591681	19	18	1.2712	9.1457689898521e-58	34542224	34551222	3.19330380526709e-64	34589997	34595734
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34595734	43304237	3613	3217	0.1236	3.19330380526709e-64	34589997	34595734	6.76291880476354e-64	43281910	43319729
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43306905	43659922	178	167	0.5087	6.76291880476354e-64	43281910	43319729	2.24560794278196e-67	43646163	43682530
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43661546	52600588	3400	3046	0.1104	2.24560794278196e-67	43646163	43682530	1.75187227105403e-08	52583578	52600588
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.9279	1.75187227105403e-08	52583578	52600588	2.16985196867934e-13	52635695	52642716
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	74172326	7346	6575	0.1263	2.16985196867934e-13	52635695	52642716	5.76013387244944e-26	74156920	74179669
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	74173739	74324329	70	63	0.53	5.76013387244944e-26	74156920	74179669	2.85384574750266e-26	74317997	74331042
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	74326042	74625614	140	124	0.0853	2.85384574750266e-26	74317997	74331042	1.60292922768797e-26	74606526	74643053
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	74628045	74999245	137	123	0.4551	1.60292922768797e-26	74606526	74643053	3.18755186028669e-43	74977410	75010762
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	75000903	85431051	2856	2555	0.0922	3.18755186028669e-43	74977410	75010762	8.29086146915179e-20	85406945	85458025
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85432611	85693635	104	92	0.3794	8.29086146915179e-20	85406945	85458025	1.07833471275981e-16	85660312	85729893
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85696570	85696570	1	0	NA	1.07833471275981e-16	85660312	85729893	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	85697894	176743492	25676	22958	0.1131	NA	NA	NA	1.08988381367978e-11	176739080	176745648
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	176745648	176751951	6	5	0.7876	1.08988381367978e-11	176739080	176745648	9.53457861440722e-05	176750377	176758251
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	176753717	178517425	658	585	0.1867	9.53457861440722e-05	176750377	176758251	8.75853918889623e-65	178483469	178552260
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178521485	180117780	658	593	-0.0962	8.75853918889623e-65	178483469	178552260	4.79100578337432e-09	180115198	180117780
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	3	-1.1762	4.79100578337432e-09	180115198	180117780	1.73906927748122e-09	180129680	180131608
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	195714142	4290	3801	-0.0659	1.73906927748122e-09	180129680	180131608	3.90334692538615e-11	195658088	195752978
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	195721903	195721903	1	0	NA	3.90334692538615e-11	195658088	195752978	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	195727732	195960150	27	23	0.3677	NA	NA	NA	6.27296042416991e-11	195926590	196012510
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	195968400	206005945	3868	3445	-0.0716	6.27296042416991e-11	195926590	196012510	1.69591753202271e-65	205988595	206015014
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	206007635	206582735	221	193	0.3	1.69591753202271e-65	205988595	206015014	3.16480987841346e-76	206569358	206595497
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	206584487	242689978	13025	11618	-0.0942	3.16480987841346e-76	206569358	206595497	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	10438566	3688	3280	-0.1135	NA	NA	NA	8.19268515014104e-104	10425922	10450828
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	10440184	11472304	433	386	0.2274	8.19268515014104e-104	10425922	10450828	1.65331577033082e-06	11460340	11479802
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11475177	11494038	11	11	0.7135	1.65331577033082e-06	11460340	11479802	4.89015035657828e-201	11490062	11511697
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	11495199	46769081	11793	10591	0.0309	4.89015035657828e-201	11490062	11511697	1.42273450288927e-202	46767765	46769081
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46771035	46825048	8	8	-0.8596	1.42273450288927e-202	46767765	46769081	2.31566446568915e-18	46825048	46827727
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	46827727	51973769	2223	1976	0.1031	2.31566446568915e-18	46825048	46827727	7.84771119202747e-13	51958641	51984724
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	51978003	52047055	37	33	0.5038	7.84771119202747e-13	51958641	51984724	0	52040420	52059381
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	52050187	52050187	1	0	NA	0	52040420	52059381	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	52053255	127193022	22989	20503	-0.0409	NA	NA	NA	0	127193022	127193022
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127197114	127203608	3	3	-1.4383	0	127193022	127193022	2.44664804817526e-12	127203608	127203608
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127207956	133469759	2614	2353	-0.1282	2.44664804817526e-12	127203608	127203608	0	133437759	133512484
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133474930	133474930	1	0	NA	0	133437759	133512484	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133480557	163992903	9687	8707	0.2568	NA	NA	NA	9.02143902969877e-73	163992903	164001657
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164027724	8	7	-1.7526	9.02143902969877e-73	163992903	164001657	1.33259649792976e-13	164019640	164027724
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	16	-4.0024	1.33259649792976e-13	164019640	164027724	0	164107951	164107951
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	178171303	4500	4071	0.4882	0	164107951	164107951	1.47740581878112e-48	178171303	178171303
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	178177064	178189013	4	4	-1.2071	1.47740581878112e-48	178171303	178171303	4.02702014992748e-31	178189013	178189013
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	178193140	190469925	4315	3868	0.5367	4.02702014992748e-31	178189013	178189013	1.22465528978430e-09	190448024	190482196
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190472632	190525912	29	27	0.9192	1.2246552897843e-09	190448024	190482196	9.35536613575433e-12	190510956	190554471
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	190530035	194354505	1282	1143	0.5185	9.35536613575433e-12	190510956	190554471	1.00653479890408e-177	194354505	194354505
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	5	-3.0391	1.00653479890408e-177	194354505	194354505	1.03549853073306e-153	194366950	194366950
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	198306094	1571	1429	0.5382	1.03549853073306e-153	194366950	194366950	2.22905874579145e-08	198303616	198306094
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198308315	198310261	2	2	-0.8033	2.22905874579145e-08	198303616	198306094	8.51591459912175e-08	198310261	198312999
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198312999	199329592	407	368	0.5403	8.51591459912175e-08	198310261	198312999	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	1550038	500	454	-0.1132	NA	NA	NA	1.16533366195736e-66	1529176	1574133
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1553201	1953327	170	156	0.3743	1.16533366195736e-66	1529176	1574133	1.66740108375465e-71	1945314	1959573
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	1954307	9815760	2723	2406	-0.0812	1.66740108375465e-71	1945314	1959573	6.85447041927261e-14	9815760	9815760
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9821327	1	0	NA	6.85447041927261e-14	9815760	9815760	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9827233	9842644	3	2	-1.8201	NA	NA	NA	1.36736423057777e-29	9842644	9842644
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	68893816	15031	13400	-0.0984	1.36736423057777e-29	9842644	9842644	3.2404530374822e-36	68892434	68897538
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	68896316	69165814	19	17	0.76	3.2404530374822e-36	68892434	68897538	2.51769753648798e-29	69153675	69643272
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	69643272	95874581	9136	8126	-0.0733	2.51769753648798e-29	69153675	69643272	5.04752641640212e-22	95816716	95899612
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	95878179	96115432	113	96	0.2328	5.04752641640212e-22	95816716	95899612	6.85768639087298e-24	96095141	96141039
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	96119426	119935033	7228	6459	-0.0766	6.85768639087298e-24	96095141	96141039	6.43328288888683e-97	119926288	119944970
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119937021	120327861	168	154	0.4126	6.43328288888683e-97	119926288	119944970	4.21151749167869e-139	120317217	120338216
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	120329853	120329853	1	0	NA	4.21151749167869e-139	120317217	120338216	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	120331802	173224400	14547	12945	-0.1003	NA	NA	NA	1.70879576860747e-137	173224400	173224400
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.9709	1.70879576860747e-137	173224400	173224400	2.2888543924422e-32	173228860	173228860
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	175860235	938	819	-0.3227	2.2888543924422e-32	173228860	173228860	8.98617254597823e-07	175857109	175860235
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175862084	175863396	2	2	0.9152	8.98617254597823e-07	175857109	175860235	1.04248753762744e-28	175863396	175863396
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	175866055	191133096	4576	4025	-0.6143	1.04248753762744e-28	175863396	175863396	4.35574250368042e-25	190996185	191133096
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	191133609	191153613	3	3	-0.0011	4.35574250368042e-25	190996185	191133096	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	12857302	3975	3560	0.1993	NA	NA	NA	4.79986750172793e-16	12857302	12857302
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.9374	4.79986750172793e-16	12857302	12857302	2.23570861415712e-15	12873052	12873052
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	40357647	7493	6738	0.2544	2.23570861415712e-15	12873052	12873052	5.62849798569138e-10	40357647	40357647
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	40370936	40383173	2	2	-1.1161	5.62849798569138e-10	40357647	40357647	1.92174948471746e-09	40383173	40383173
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	40389808	45039508	1376	1241	0.2588	1.92174948471746e-09	40383173	40383173	0	44980872	45111063
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	45048753	45048753	1	0	NA	0	44980872	45111063	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	45055024	113055875	18680	16647	-0.0875	NA	NA	NA	4.75897779653693e-24	113027525	113081863
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	113063570	113340730	40	38	-0.5868	4.75897779653693e-24	113027525	113081863	4.9905394628105e-23	113314428	113363761
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	113351802	140200229	8509	7636	-0.0984	4.9905394628105e-23	113314428	113363761	5.9791707032973e-09	140196482	140200229
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140201609	140215187	8	7	-0.8219	5.9791707032973e-09	140196482	140200229	1.09579805311758e-09	140215187	140221835
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140216524	140216524	1	0	NA	1.09579805311758e-09	140215187	140221835	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140219465	148332001	2851	2590	-0.0898	NA	NA	NA	6.42744523953182e-118	148317682	148339853
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	148333313	148949940	330	306	0.3095	6.42744523953182e-118	148317682	148339853	2.29298667199833e-139	148938416	148960981
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	148953926	174888150	8401	7521	-0.1163	2.29298667199833e-139	148938416	148960981	1.89148241542636e-116	174876313	174901689
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	174890276	176030019	352	310	0.2707	1.89148241542636e-116	174876313	174901689	6.06354911279682e-81	176006239	176062265
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	176032129	180517813	1689	1530	-0.0913	6.06354911279682e-81	176006239	176062265	1.3958343893147e-10	180498779	180536940
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180521012	180582550	29	25	0.3198	1.3958343893147e-10	180498779	180536940	0.000190064706205342	180558321	180595016
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180584989	180644810	27	23	-0.0323	0.000190064706205342	180558321	180595016	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	99130	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109360	273710	72	66	-0.0083	NA	NA	NA	2.36847505993865e-06	256810	284743
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	276159	322557	26	25	-0.3928	2.36847505993865e-06	256810	284743	7.34528887534209e-60	318496	329100
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	323898	13115746	4583	4109	0.1149	7.34528887534209e-60	318496	329100	1.41978887635716e-50	13102544	13122574
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	13118669	13138755	9	8	0.641	1.41978887635716e-50	13102544	13122574	1.18649094116714e-05	13127532	13146762
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	13140660	18371831	1847	1637	0.1341	1.18649094116714e-05	13127532	13146762	2.35370425416694e-08	18368026	18371831
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18373481	18378787	3	3	1.1743	2.35370425416694e-08	18368026	18371831	3.35879446701849e-08	18378787	18380299
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	18380299	29973024	4050	3642	0.1359	3.35879446701849e-08	18378787	18380299	2.90058590343893e-09	29950805	29985620
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29980445	29980445	1	0	NA	2.90058590343893e-09	29950805	29985620	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29981912	30010234	10	10	-0.4671	NA	NA	NA	1.67242538095300e-08	30004636	30030032
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	31390982	583	522	0.1434	1.672425380953e-08	30004636	30030032	1.11208686867562e-08	31389372	31390982
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	31418006	3	3	1.2617	1.11208686867562e-08	31389372	31390982	4.65945419811834e-09	31418006	31425113
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31425113	32563252	490	442	0.149	4.65945419811834e-09	31418006	31425113	5.61334577260218e-15	32558677	32567462
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32564884	32609525	10	8	-0.7367	5.61334577260218e-15	32558677	32567462	2.73322693071902e-14	32600962	32613538
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32613538	68340046	11294	10113	0.111	2.73322693071902e-14	32600962	32613538	1.02417050999056e-138	68291274	68372698
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	68343754	70763011	693	613	0.4125	1.02417050999056e-138	68291274	68372698	0	70760728	70785705
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	70766254	103841482	9524	8463	-0.3087	0	70760728	70785705	1.96211696956237e-119	103827105	103841482
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	3	1.0685	1.96211696956237e-119	103827105	103841482	3.11398269746846e-10	103868154	103873584
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	113321062	3349	3000	-0.0667	3.11398269746846e-10	103868154	103873584	7.18273842889843e-11	113254737	113367327
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	113334438	113439154	31	28	0.3177	7.18273842889843e-11	113254737	113367327	1.64569452542573e-11	113430645	113475642
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	113440394	153675406	13789	12331	-0.0831	1.64569452542573e-11	113430645	113475642	2.43784543784472e-35	153675406	153675406
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	153678908	153678908	1	0	NA	2.43784543784472e-35	153675406	153675406	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	153686896	153697484	3	3	-2.18	NA	NA	NA	1.44662667387904e-33	153697484	153697484
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	153703058	165642393	3932	3499	-0.1031	1.44662667387904e-33	153697484	153697484	8.53517706726e-15	165640218	165642393
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165643653	165643653	1	0	NA	8.53517706726e-15	165640218	165642393	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	1.1035	NA	NA	NA	7.86599456633603e-15	165650610	165653315
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1596	-0.1145	7.86599456633603e-15	165650610	165653315	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	240	0.0113	NA	NA	NA	1.04689243934495e-08	1037402	1038517
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	1.3764	1.04689243934495e-08	1037402	1038517	8.48636660137557e-09	1047707	1047707
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	4214745	1285	1140	-0.0028	8.48636660137557e-09	1047707	1047707	4.11022909769005e-07	4188566	4221905
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	4216066	4280033	32	27	-0.3447	4.11022909769005e-07	4188566	4221905	2.09069035172980e-42	4273274	4298244
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	4281464	63647130	17768	15886	0.0446	2.0906903517298e-42	4273274	4298244	6.88506307671158e-42	63643998	63661242
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	63650322	63668435	7	7	0.6948	6.88506307671158e-42	63643998	63661242	5.47202717665328e-06	63658637	63682086
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	63671043	73774316	3034	2691	0.0881	5.47202717665328e-06	63658637	63682086	9.26010848362646e-122	73758801	74123703
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	73777267	75982631	376	338	0.4879	9.26010848362646e-122	73758801	74123703	2.72022069325837e-16	75900917	76038093
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76026227	76365382	18	18	1.1012	2.72022069325837e-16	75900917	76038093	1.59738951653775e-37	76314744	76561367
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76421843	76421843	1	0	NA	1.59738951653775e-37	76314744	76561367	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	76539954	98646545	7613	6904	0.5273	NA	NA	NA	1.41977219557584e-34	98642522	98646545
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	98648490	98650383	2	2	1.9677	1.41977219557584e-34	98642522	98646545	5.35018785490764e-170	98650383	98650383
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	98652572	118939850	8992	8041	0.356	5.35018785490764e-170	98650383	98650383	4.19934150111231e-169	118939850	118939850
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118941494	118941494	1	0	NA	4.19934150111231e-169	118939850	118939850	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118945497	118949641	3	3	-0.9956	NA	NA	NA	2.77513817420824e-12	118949641	118949641
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118951702	121004865	909	810	0.2663	2.77513817420824e-12	118949641	118949641	7.93172062799564e-16	120983219	121015819
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	121006227	121093822	41	35	-0.1596	7.93172062799564e-16	120983219	121015819	5.58872416699589e-15	121070713	121104262
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	121095697	129109160	3599	3208	0.2424	5.58872416699589e-15	121070713	121104262	8.51386799491814e-126	129098029	129113759
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	129112252	129374690	159	142	0.82	8.51386799491814e-126	129098029	129113759	0.000119879559094229	129369809	129374690
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	129377280	129380261	3	3	1.5911	0.000119879559094229	129369809	129374690	1.21654262938358e-05	129380261	129384606
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	129383186	129675480	142	131	0.8194	1.21654262938358e-05	129380261	129384606	2.37031877087966e-85	129669961	129682668
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	129675668	130781205	551	500	0.3031	2.37031877087966e-85	129669961	129682668	4.98903391252952e-27	130759740	130805960
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	130783557	131077468	143	130	0.6041	4.98903391252952e-27	130759740	130805960	1.16763285551866e-45	131059828	131095855
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	131079356	141690753	4992	4491	0.2446	1.16763285551866e-45	131059828	131095855	2.50112103856703e-16	141686875	141690753
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	1.0174	2.50112103856703e-16	141686875	141690753	3.33776908352169e-16	141714168	141721894
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	3.33776908352169e-16	141714168	141721894	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	147702365	2511	2235	0.2382	NA	NA	NA	1.27374706970632e-64	147702365	147702365
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-3.3487	1.27374706970632e-64	147702365	147702365	2.41045905417164e-65	147707161	147707161
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	151728811	1630	1477	0.2315	2.41045905417164e-65	147707161	147707161	9.4273522348277e-14	151726377	151730250
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.6031	9.4273522348277e-14	151726377	151730250	5.23050511312003e-11	151740878	151745100
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	158821263	2600	2332	0.186	5.23050511312003e-11	151740878	151745100	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	6926661	2391	2129	0.0194	NA	NA	NA	1.25316103304462e-09	6909487	6926661
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7327293	5	4	0.992	1.25316103304462e-09	6909487	6926661	8.60266424256427e-08	7327293	7709141
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7697025	11538092	1453	1313	0.099	8.60266424256427e-08	7327293	7709141	3.44812942414951e-22	11486728	11583362
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	11541744	11541744	1	0	NA	3.44812942414951e-22	11486728	11583362	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	11550712	11864701	130	121	0.3844	NA	NA	NA	8.28960154892148e-27	11843310	11897919
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	11867227	39333945	9090	8138	0.0896	8.28960154892148e-27	11843310	11897919	7.48659204519593e-56	39323431	39350798
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39339800	39341524	2	0	NA	7.48659204519593e-56	39323431	39350798	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39345557	39500219	59	56	0.7087	NA	NA	NA	8.4445112170015e-58	39493887	39505256
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39504332	59327327	4610	4135	0.0759	8.4445112170015e-58	39493887	39505256	1.49789949081869e-99	59278575	59355707
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	59333285	60084914	274	252	-0.3232	1.49789949081869e-99	59278575	59355707	3.51406944406112e-08	60062073	60093196
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	60087371	60150229	34	27	0.0291	3.51406944406112e-08	60062073	60093196	4.29717709597769e-08	60142873	60180511
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	60152826	60152826	1	0	NA	4.29717709597769e-08	60142873	60180511	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	60156901	64115560	1159	1025	-0.341	NA	NA	NA	8.83927598157182e-13	64115560	64115560
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	64125972	64125972	1	0	NA	8.83927598157182e-13	64115560	64115560	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	64126399	64127873	2	2	-2.0247	NA	NA	NA	3.14626993936072e-14	64127873	64127873
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	64130065	68707484	1393	1244	-0.3284	3.14626993936072e-14	64127873	64127873	1.74754405499044e-23	68707484	68707484
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68708619	68708619	1	0	NA	1.74754405499044e-23	68707484	68707484	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68710028	68716099	4	4	-1.8644	NA	NA	NA	1.70465089856151e-271	68716099	68716099
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	68718709	102688379	10323	9223	-0.2231	1.70465089856151e-271	68716099	68716099	4.07715218329652e-265	102688379	102688379
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102690502	102695889	4	4	-1.7228	4.07715218329652e-265	102688379	102688379	2.20706653997669e-26	102695889	102695889
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	102697333	139230830	11047	9805	-0.0998	2.20706653997669e-26	102695889	102695889	1.16197618043554e-08	139162199	139251189
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	139233241	139286216	28	25	0.2032	1.16197618043554e-08	139162199	139251189	4.63704967024927e-07	139274661	139313900
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	139289354	143675131	1669	1518	-0.1622	4.63704967024927e-07	139274661	139313900	1.32325483066928e-11	143658997	143677913
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143677913	143749611	24	22	0.3298	1.32325483066928e-11	143658997	143677913	2.90900418064098e-07	143748922	143772727
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143754169	145841835	716	652	-0.0821	2.90900418064098e-07	143748922	143772727	1.24500206803675e-23	145818158	145868523
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	145843749	146046695	81	75	0.3324	1.24500206803675e-23	145818158	145868523	6.48519709931216e-09	146030294	146077440
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	146047950	146047950	1	0	NA	6.48519709931216e-09	146030294	146077440	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	146049390	146264846	63	54	-0.011	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	32945146	10473	9399	0.3276	NA	NA	NA	7.43729297841148e-164	32929464	32962547
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	32947747	33923063	338	308	0.7342	7.43729297841148e-164	32929464	32962547	4.05130198584187e-29	33893528	33949757
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	33924519	34640762	322	292	0.449	4.05130198584187e-29	33893528	33949757	2.32063875686494e-114	34626747	34656422
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	34643535	130449254	22960	20615	0.0611	2.32063875686494e-114	34626747	34656422	2.61978325965383e-15	130443672	130449254
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130451027	130464445	8	7	0.9019	2.61978325965383e-15	130443672	130449254	1.49148519506412e-10	130464445	130467487
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	130465664	131046229	256	240	0.061	1.49148519506412e-10	130464445	130467487	1.20956920250329e-19	131023107	131083449
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	131049313	131344323	90	83	0.43	1.20956920250329e-19	131023107	131083449	4.50507859508232e-24	131327507	131374039
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	131347096	137352394	2392	2148	0.0584	4.50507859508232e-24	131327507	131374039	7.30426453022628e-28	137352394	137352394
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	-2.4748	7.30426453022628e-28	137352394	137352394	8.79681651925965e-108	137356880	137356880
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	137363951	3	3	-0.0481	8.79681651925965e-108	137356880	137356880	0.00817281498125296	137363951	137582565
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137366363	139876604	1001	902	0.4025	0.00817281498125296	137363951	137582565	2.75194808702764e-48	139852587	139887411
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	139876884	140126228	90	77	-0.1782	2.75194808702764e-48	139852587	139887411	0.0541391788927129	140000283	140132194
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	140128684	140145683	9	8	0.1581	0.0541391788927129	140000283	140132194	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	38541368	13492	12083	0.0835	NA	NA	NA	8.55222406643899e-07	38514422	38554841
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	38544262	39116538	22	21	-0.2852	8.55222406643899e-07	38514422	38554841	2.36114751393608e-226	38669536	42222615
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	41971605	78803778	11409	10189	0.1677	2.36114751393608e-226	38669536	42222615	1.14454183179529e-225	78800155	78803778
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	78806287	78809110	3	3	1.2433	1.14454183179529e-225	78800155	78803778	3.54438284491307e-07	78809110	78810642
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	78810642	89245881	2938	2679	0.2692	3.54438284491307e-07	78809110	78810642	3.77240200595986e-120	88858473	89253592
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	89250565	89628777	156	137	-0.3146	3.77240200595986e-120	88858473	89253592	1.02076994880216e-17	89625505	89641790
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	89630078	89630078	1	0	NA	1.02076994880216e-17	89625505	89641790	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	89633210	89699307	27	25	-0.9042	NA	NA	NA	2.44280827726879e-21	89688233	89704174
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	89701286	97686238	2963	2615	-0.297	2.44280827726879e-21	89688233	89704174	2.04946302305074e-14	97630034	97712540
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	97688579	97912827	98	86	-0.0248	2.04946302305074e-14	97630034	97712540	4.93286950948491e-31	97881407	97956723
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	97913997	121286468	8666	7720	-0.2891	4.93286950948491e-31	97881407	97956723	2.3637702004323e-55	121261383	121310903
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	121288781	121802484	222	192	0.0704	2.3637702004323e-55	121261383	121310903	3.23006576617684e-34	121775530	121818224
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	121804323	122520620	206	187	0.4368	3.23006576617684e-34	121775530	121818224	1.42514038942008e-31	122484418	122555276
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	122525673	123304991	278	257	0.0976	1.42514038942008e-31	122484418	122555276	1.08509448869800e-119	123293192	123316400
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	123306575	135285645	4327	3858	-0.3599	1.085094488698e-119	123293192	123316400	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	5741031	2138	1931	0.1023	NA	NA	NA	9.6822855812821e-18	5736384	5741031
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	12	-0.71	9.6822855812821e-18	5736384	5741031	5.84216548054758e-22	5765438	5766615
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	7758275	862	771	0.1193	5.84216548054758e-22	5765438	5766615	4.75694677801118e-18	7757329	7758275
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7762277	7797993	10	8	-0.8001	4.75694677801118e-18	7757329	7758275	6.29096808437289e-16	7797993	7800021
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7800021	9893598	918	814	0.1312	6.29096808437289e-16	7797993	7800021	4.73924618173711e-07	9887333	9893598
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	9895007	9896149	2	2	-1.1248	4.73924618173711e-07	9887333	9893598	2.28190855074866e-16	9896149	9899871
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	9898583	9898583	1	0	NA	2.28190855074866e-16	9896149	9899871	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	9899871	34331299	8314	7498	0.1171	NA	NA	NA	7.431486401279e-48	34315934	34342831
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34333808	34777883	150	138	0.4867	7.431486401279e-48	34315934	34342831	6.76802589039587e-50	34720754	34820092
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	34786008	46095353	3140	2821	0.1021	6.76802589039587e-50	34720754	34820092	3.71485574626741e-10	46092824	46095353
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46096588	46103800	5	5	1.0147	3.71485574626741e-10	46092824	46095353	4.81387813435058e-11	46103800	46105220
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	46105220	49671267	1164	1043	0.0959	4.81387813435058e-11	46103800	46105220	6.30589824420777e-13	49666382	49685235
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49683052	49701463	7	7	-0.7428	6.30589824420777e-13	49666382	49685235	1.38777325898970e-08	49697128	49725462
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49710027	49710027	1	0	NA	1.3877732589897e-08	49697128	49725462	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	49721954	55123719	179	156	-0.0185	NA	NA	NA	8.63906422957655e-37	55114405	55124730
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55207305	37	34	0.6866	8.63906422957655e-37	55114405	55124730	2.85262575974428e-26	55203706	55221692
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55209626	64994763	3993	3582	0.117	2.85262575974428e-26	55203706	55221692	2.71688237235143e-20	64977019	65003889
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	64995657	65044878	21	17	0.542	2.71688237235143e-20	64977019	65003889	4.89243077869829e-08	65025106	65059836
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	65048052	81329446	5892	5318	0.098	4.89243077869829e-08	65025106	65059836	3.35122453758744e-09	81318195	81329446
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81333047	81363283	12	10	0.714	3.35122453758744e-09	81318195	81329446	5.69303006744966e-277	81363283	81384508
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81365633	134450318	18443	16552	0.1799	5.69303006744966e-277	81363283	81384508	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	477447	189	169	-0.2962	NA	NA	NA	2.34734902238883e-61	463401	487435
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	478623	478623	1	0	NA	2.34734902238883e-61	463401	487435	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	479749	7899058	3062	2775	0.0878	NA	NA	NA	7.8204831587406e-20	7879321	7928083
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7900758	8023055	47	46	0.5055	7.8204831587406e-20	7879321	7928083	4.74962357309233e-13	8003026	8058795
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	8025153	11121204	1031	921	0.1507	4.74962357309233e-13	8003026	8058795	1.91621831595535e-16	11116883	11121204
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11123452	11130871	5	4	1.4516	1.91621831595535e-16	11116883	11121204	2.17315750273760e-10	11130871	11151185
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	11143592	2	0	NA	2.1731575027376e-10	11130871	11151185	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11147675	11395862	69	61	0.179	NA	NA	NA	3.15923162126361e-17	11395862	11395862
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	5	-1.3208	3.15923162126361e-17	11395862	11395862	6.25869323716155e-283	11435643	11435643
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	11440927	1	0	NA	6.25869323716155e-283	11435643	11435643	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11452868	54552526	14361	12883	0.1941	NA	NA	NA	0	54531181	54573589
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	54562950	55105002	242	218	0.7006	0	54531181	54573589	2.05151988980989e-87	55095016	55120029
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	55107583	55107583	1	0	NA	2.05151988980989e-87	55095016	55120029	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	55111059	61389719	1960	1770	0.2893	NA	NA	NA	8.3464012119116e-06	61380504	61389719
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	61391531	61391531	1	0	NA	8.3464012119116e-06	61380504	61389719	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	61393538	61408232	8	7	0.8661	NA	NA	NA	8.47746708035026e-08	61408232	61412498
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	61411244	62642375	304	271	0.2455	8.47746708035026e-08	61408232	61412498	4.56864672181153e-10	62623041	62652763
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	62643930	62699949	29	27	0.6205	4.56864672181153e-10	62623041	62652763	1.45517776056476e-19	62684898	62719950
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	62701775	112056380	16531	14854	0.2666	1.45517776056476e-19	62684898	62719950	9.84135407768246e-17	112014061	112056380
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	112058383	112075138	7	7	0.6528	9.84135407768246e-17	112014061	112056380	1.49148787847173e-09	112075138	112084577
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	112076473	112076473	1	0	NA	1.49148787847173e-09	112075138	112084577	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	112079330	112111435	16	14	0.0583	NA	NA	NA	0.000926435879995913	112105655	112131051
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	112114463	112167829	28	26	0.4729	0.000926435879995913	112105655	112131051	1.10754662832679e-05	112134990	112230899
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	112170176	119752915	2714	2449	0.2199	1.10754662832679e-05	112134990	112230899	7.50874106134216e-124	119731641	119775397
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	119754207	121523846	723	653	0.5269	7.50874106134216e-124	119731641	119775397	5.65370812346756e-152	121504488	121546878
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121525929	130694393	3176	2823	0.1858	5.65370812346756e-152	121504488	121546878	9.77393100981788e-09	130690343	130694393
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130698885	130701040	2	2	1.5345	9.77393100981788e-09	130690343	130694393	4.70694052649337e-13	130701040	130701040
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130718440	130943064	92	84	0.1461	4.70694052649337e-13	130701040	130701040	4.4136936588254e-44	130943064	130943064
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.6975	4.4136936588254e-44	130943064	130943064	2.7914236962306e-29	130946248	130946248
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	505	0.2409	2.7914236962306e-29	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	29151389	4094	3642	-0.3427	NA	NA	NA	3.45096369286418e-15	29070732	29185427
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	29156539	29329096	69	58	-0.0023	3.45096369286418e-15	29070732	29185427	1.84128650873886e-15	29316730	29355503
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	29330242	29330242	1	0	NA	1.84128650873886e-15	29316730	29355503	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	29331951	39383019	3796	3380	-0.3313	NA	NA	NA	0.00056149238348091	39269457	39400286
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	39387346	39435020	6	6	-0.0088	0.00056149238348091	39269457	39400286	0.000102998903053384	39435020	39469423
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	39443345	39812937	87	79	0.4848	0.000102998903053384	39435020	39469423	1.32933564159808e-65	39808792	39820102
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	39816324	56650373	5972	5331	-0.0953	1.32933564159808e-65	39808792	39820102	1.39394133849571e-54	56650373	56650373
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	14	-1.3657	1.39394133849571e-54	56650373	56650373	7.25369515357317e-59	56685341	56685341
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	69929023	3186	2844	-0.0845	7.25369515357317e-59	56685341	56685341	9.8537443139583e-21	69926437	69929023
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	69935702	69935702	1	0	NA	9.8537443139583e-21	69926437	69929023	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	69937749	69960543	9	9	0.8683	NA	NA	NA	6.09674062874196e-22	69960543	69979219
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	69967098	69967098	1	0	NA	6.09674062874196e-22	69960543	69979219	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	69979219	100690991	9843	8817	-0.0991	NA	NA	NA	1.36508296751382e-18	100690991	100690991
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	1.7945	1.36508296751382e-18	100690991	100690991	1.45599440419110e-18	100693892	100693892
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	114123340	4562	4043	-0.1228	1.4559944041911e-18	100693892	100693892	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18544772	6	6	-0.3301	NA	NA	NA	0.0237076611753282	18505611	19301034
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18798641	19494416	54	46	-0.7907	0.0237076611753282	18505611	19301034	3.21410338957489e-89	19490630	19497023
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21569312	1011	885	0.0743	3.21410338957489e-89	19490630	19497023	1.03825867318292e-56	21546738	21582844
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21569676	22035729	232	212	0.4236	1.03825867318292e-56	21546738	21582844	1.18528766103559e-74	22022060	22049850
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22038206	32138455	3332	2957	0.0431	1.18528766103559e-74	22022060	22049850	7.89903491772447e-11	32108724	32154855
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	32140392	32235235	54	44	0.3591	7.89903491772447e-11	32108724	32154855	7.56930151878746e-10	32215049	32255666
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	32236747	34181664	822	721	0.0631	7.56930151878746e-10	32215049	32255666	7.57015033650393e-07	34179872	34181664
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34186009	34189146	4	3	-0.8619	7.57015033650393e-07	34179872	34181664	4.38993518860053e-17	34189146	34195251
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34195251	105850033	26187	23452	0.03	4.38993518860053e-17	34189146	34195251	6.50654118622423e-35	105850033	105850033
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	6	-1.5046	6.50654118622423e-35	105850033	105850033	5.2484022493967e-07	105856972	105881893
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105923686	14	12	-0.134	5.2484022493967e-07	105856972	105881893	2.04704315395323e-05	105917286	105951399
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105945006	106002179	20	19	0.4322	2.04704315395323e-05	105917286	105951399	0.000147489176251632	105973615	106039587
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	127	0.0529	0.000147489176251632	105973615	106039587	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.026	NA	NA	NA	0.000956410554426204	18452491	18824622
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	20400571	169	144	-0.6862	0.000956410554426204	18452491	18824622	5.14740353739482e-37	20316992	20413386
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20402650	32456500	3653	3241	-0.341	5.14740353739482e-37	20316992	20413386	1.09245013655381e-28	32454294	32517839
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32583146	24	20	-1.1355	1.09245013655381e-28	32454294	32517839	0	32580871	32661846
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32594200	32594200	1	0	NA	0	32580871	32661846	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	82392702	20688	18466	-0.2309	NA	NA	NA	0	82392702	82392702
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82394483	82394483	1	0	NA	0	82392702	82392702	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82396121	82397719	2	2	-1.696	NA	NA	NA	6.65175416506896e-26	82397719	82397719
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82400613	98232932	5865	5222	-0.1126	6.65175416506896e-26	82397719	82397719	7.30701254186243e-29	98223721	98232932
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98234519	98239454	3	3	0.7928	7.30701254186243e-29	98223721	98232932	0.000461932719664426	98239454	98247306
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	99011289	359	327	0.0503	0.000461932719664426	98239454	98247306	1.62541879409044e-14	99011289	99011289
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99012581	99012581	1	0	NA	1.62541879409044e-14	99011289	99011289	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99013625	99018948	3	3	-1.3196	NA	NA	NA	1.26280514078984e-15	99018948	99018948
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99020079	99632987	274	252	0.1049	1.26280514078984e-15	99018948	99018948	1.93390974755347e-26	99632987	99632987
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	2.3792	1.93390974755347e-26	99632987	99632987	1.24256354444741e-22	99635701	99635701
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	238	0.1099	1.24256354444741e-22	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	6938727	2732	2467	-0.33	NA	NA	NA	1.94640397522971e-14	6934823	6938727
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6942078	6945539	3	2	0.7697	1.94640397522971e-14	6934823	6938727	3.26540588068353e-07	6945539	6949338
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6948325	6948325	1	0	NA	3.26540588068353e-07	6945539	6949338	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	6949338	7275936	160	145	-0.4332	NA	NA	NA	3.36109355430361e-05	7272430	7275936
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	7278242	7281796	3	3	0.4077	3.36109355430361e-05	7272430	7275936	1.23062486770301e-15	7281796	7292684
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	7284833	32379126	7674	6911	-0.3408	1.23062486770301e-15	7281796	7292684	8.29449388189345e-21	31837203	32529486
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	39	0.0266	8.29449388189345e-21	31837203	32529486	6.56764273537682e-12	33517367	34058222
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	55107359	3327	2945	-0.347	6.56764273537682e-12	33517367	34058222	0	55098525	55117508
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	55110213	68866206	4379	3950	0.0987	0	55098525	55117508	2.26713840938299e-38	68849229	68885854
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68868545	69181327	145	136	0.4307	2.26713840938299e-38	68849229	68885854	0.0775044416260641	69106035	69223767
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69183781	69238861	18	15	0.18	0.0775044416260641	69106035	69223767	4.79101335531548e-09	69227049	69249349
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69241695	72170174	1117	994	-0.3213	4.79101335531548e-09	69227049	69249349	1.32640638550737e-19	72170174	72170174
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72171424	72173767	3	3	-1.9401	1.32640638550737e-19	72170174	72170174	8.68930802211956e-19	72173767	72173767
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72175070	75093957	917	813	-0.3409	8.68930802211956e-19	72173767	72173767	5.6383865411319e-15	75093957	75093957
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75097331	1	0	NA	5.6383865411319e-15	75093957	75093957	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75099083	75100865	2	2	1.4094	NA	NA	NA	2.11760070234946e-16	75100865	75100865
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	540	-0.3747	2.11760070234946e-16	75100865	75100865	1.01802916629161e-19	76923844	76925748
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.604	1.01802916629161e-19	76923844	76925748	1.91936405294654e-16	76940218	76942679
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	83801868	2675	2379	-0.3597	1.91936405294654e-16	76940218	76942679	2.40518956722128e-104	83785533	83819888
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	83809907	84193427	135	126	0.2569	2.40518956722128e-104	83785533	83819888	1.55346191924923e-34	84178429	84216357
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	84197328	86427862	854	764	-0.1162	1.55346191924923e-34	84178429	84216357	2.16356487058104e-17	86410390	86440583
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	86429700	86599633	46	44	0.3123	2.16356487058104e-17	86410390	86440583	1.86114650816900e-14	86585933	86646672
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	86600615	86600615	1	0	NA	1.861146508169e-14	86585933	86646672	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	86611543	88055650	515	461	-0.1293	NA	NA	NA	8.02067422729663e-09	88025022	88064382
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88058576	88130840	42	38	0.2396	8.02067422729663e-09	88025022	88064382	2.06016698330962e-09	88119175	88161844
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88132789	88132789	1	0	NA	2.06016698330962e-09	88119175	88161844	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88136075	88690571	244	218	-0.1029	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	375	0.1278	NA	NA	NA	2.31600021076350e-19	1028979	1028979
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	2.0582	2.3160002107635e-19	1028979	1028979	1.66471067545368e-18	1030766	1030766
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	6846114	2483	2224	0.0829	1.66471067545368e-18	1030766	1030766	8.3277332130152e-09	6844679	6846114
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	6846846	6848856	3	3	1.0213	8.3277332130152e-09	6844679	6846114	1.12222661352866e-05	6848856	6850304
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	6849452	10191029	1565	1410	0.1184	1.12222661352866e-05	6848856	6850304	1.72267212235522e-152	10171674	10216524
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	10193820	14961974	1632	1461	-0.173	1.72267212235522e-152	10171674	10216524	6.02739400397049e-31	14937595	14973925
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	14968655	15163805	70	59	0.2938	6.02739400397049e-31	14937595	14973925	5.03634945371675e-22	15158691	15178496
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15164966	22142513	2114	1887	-0.1107	5.03634945371675e-22	15158691	15178496	4.60646850668918e-187	22119794	22408902
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	22399576	23089419	203	181	0.5791	4.60646850668918e-187	22119794	22408902	4.00331695526064e-12	23005210	23124307
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	23094145	23274142	70	64	0.2596	4.00331695526064e-12	23005210	23124307	4.03525206554058e-19	23256735	23308081
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	23280976	31457889	3478	3121	-0.0951	4.03525206554058e-19	23256735	23308081	1.24875521965492e-12	31443186	31461588
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	15	-0.6906	1.24875521965492e-12	31443186	31461588	4.78417582005564e-11	31503774	31897238
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32112586	87	78	0.0234	4.78417582005564e-11	31503774	31897238	1.72601761722553e-09	32078169	32131060
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32123042	32245633	16	16	0.6762	1.72601761722553e-09	32078169	32131060	1.46206341895836e-34	32240819	32251318
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32251318	43238660	4199	3770	-0.3021	1.46206341895836e-34	32240819	32251318	0	43237484	43244494
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	43242752	43242752	1	0	NA	0	43237484	43244494	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	43244494	44947489	872	786	0.6083	NA	NA	NA	0	44940676	44953929
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	44950547	54548554	3151	2814	-0.0099	0	44940676	44953929	1.90435031009053e-132	54542022	54555304
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54550914	54550914	1	0	NA	1.90435031009053e-132	54542022	54555304	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54551715	54862515	163	147	0.6101	NA	NA	NA	4.39530114509129e-121	54854024	54877563
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	54867626	78653545	9088	8151	0.0152	4.39530114509129e-121	54854024	54877563	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	108760	2	2	-0.5453	NA	NA	NA	8.00310569843905e-05	108760	115020
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	112131	500897	173	160	0.4621	8.00310569843905e-05	108760	115020	7.49166677206553e-19	500897	500897
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	2.4334	7.49166677206553e-19	500897	500897	6.54015189379008e-25	505456	505456
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	828314	139	123	0.4333	6.54015189379008e-25	505456	505456	1.13733403707524e-32	813759	858261
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	830811	830811	1	0	NA	1.13733403707524e-32	813759	858261	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	836025	1961897	340	302	0.0647	NA	NA	NA	2.44823255573528e-44	1959391	1965766
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	1965766	2058902	29	26	0.8928	2.44823255573528e-44	1959391	1965766	1.37340583735003e-17	2051194	2074049
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	2062628	11543336	3268	2949	0.4021	1.37340583735003e-17	2051194	2074049	1.0404693073703e-12	11543336	11543336
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	11549179	11552937	2	2	-1.0118	1.0404693073703e-12	11543336	11543336	3.19265946195272e-49	11552937	11557034
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	11557034	23532828	3366	3009	0.0993	3.19265946195272e-49	11552937	11557034	6.79306407640719e-50	23478708	23546789
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	23537771	23584298	6	6	0.595	6.79306407640719e-50	23478708	23546789	3.03721396777594e-07	23557554	23632482
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	23593424	35800875	3559	3192	0.0848	3.03721396777594e-07	23557554	23632482	0	35765612	35845146
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	35810192	67082123	9389	8292	-0.3411	0	35765612	35845146	3.54176847430480e-52	67032375	67107391
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	67087347	68334598	172	152	0.0409	3.5417684743048e-52	67032375	67107391	9.6399287243182e-54	68300395	68352336
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	68337888	73543490	1620	1460	-0.3562	9.6399287243182e-54	68300395	68352336	2.59907452048905e-52	73508782	73568836
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	73547196	74387530	250	222	-0.023	2.59907452048905e-52	73508782	73568836	6.22241834787037e-42	74367528	74417085
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	74390322	76116026	646	589	-0.3725	6.22241834787037e-42	74367528	74417085	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	239700	12	12	-0.1344	NA	NA	NA	1.31751487928741e-21	239700	239700
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	2.1757	1.31751487928741e-21	239700	239700	6.00966581681198e-20	243026	243026
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	790526	205	185	-0.0761	6.00966581681198e-20	243026	243026	5.65036054461621e-10	790526	790526
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.505	5.65036054461621e-10	790526	790526	5.56961393244478e-08	794978	798817
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1395246	270	231	-0.0316	5.56961393244478e-08	794978	798817	1.43443838345715e-25	1395246	1395246
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1398325	1398325	1	0	NA	1.43443838345715e-25	1395246	1395246	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.6915	NA	NA	NA	2.15087573521176e-31	1400840	1400840
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	1405308	1	0	NA	2.15087573521176e-31	1400840	1400840	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1409386	1797537	184	165	-0.1218	NA	NA	NA	5.32499584463236e-11	1797537	1797537
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1798246	1799778	2	2	1.5707	5.32499584463236e-11	1797537	1797537	9.9919969288044e-11	1799778	1799778
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1801091	8683523	3197	2869	-0.0757	9.9919969288044e-11	1799778	1799778	1.18058999954921e-47	8675779	8694394
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8689849	8913107	88	78	0.4746	1.18058999954921e-47	8675779	8694394	2.06415162007138e-17	8908919	8914174
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8914174	8931093	12	10	-0.404	2.06415162007138e-17	8908919	8914174	7.96774166990315e-15	8926503	8935331
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	8933785	10456539	664	600	0.3645	7.96774166990315e-15	8926503	8935331	6.46785584237371e-55	10430973	10481890
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	10457692	11443816	528	479	0.6578	6.46785584237371e-55	10430973	10481890	1.94455936208721e-17	11443816	11443816
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11445761	11448975	2	0	NA	1.94455936208721e-17	11443816	11443816	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	2.6733	NA	NA	NA	2.2371501916852e-24	11452390	11452390
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	11453579	1	0	NA	2.2371501916852e-24	11452390	11452390	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11455241	12691095	498	455	0.4377	NA	NA	NA	3.99883803942097e-21	12673455	12708554
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12692435	12898751	94	87	0.7896	3.99883803942097e-21	12673455	12708554	5.1656309780672e-13	12878763	12916831
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12900056	13143183	131	115	1.1917	5.1656309780672e-13	12878763	12916831	1.68085304522476e-05	13094878	13173430
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13144350	13144350	1	0	NA	1.68085304522476e-05	13094878	13173430	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13148046	13277993	61	58	0.8954	NA	NA	NA	1.04261392283283e-09	13252817	13302982
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13280203	13808406	217	199	0.6097	1.04261392283283e-09	13252817	13302982	1.16400528759926e-07	13800443	13820920
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13810437	13810437	1	0	NA	1.16400528759926e-07	13800443	13820920	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13811176	13858822	41	37	0.9207	NA	NA	NA	1.34097554118506e-25	13854244	13862890
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13860455	13860455	1	0	NA	1.34097554118506e-25	13854244	13862890	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13861188	14773105	387	341	0.3395	NA	NA	NA	6.59815770128066e-22	14773105	14773105
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14776890	14783573	6	6	-0.9213	6.59815770128066e-22	14773105	14773105	9.81557790495274e-20	14783573	14787533
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	14787533	15993819	586	527	0.2041	9.81557790495274e-20	14783573	14787533	3.90289761147517e-49	15958006	16017964
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15995151	15995151	1	0	NA	3.90289761147517e-49	15958006	16017964	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15997420	16779967	369	331	0.5118	NA	NA	NA	8.3660309378275e-307	16775765	16783464
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	16781725	32545047	2596	2320	-0.2269	8.3660309378275e-307	16775765	16783464	5.76504871782735e-55	24112807	32969482
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	32929768	32929768	1	0	NA	5.76504871782735e-55	24112807	32969482	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	32956938	33203217	45	40	0.2193	NA	NA	NA	2.92200155094813e-07	33175289	33203217
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33208302	33208302	1	0	NA	2.92200155094813e-07	33175289	33203217	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33220375	33255788	5	5	0.9795	NA	NA	NA	0.000442849292592404	33255788	33299366
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33261638	33869450	175	168	0.4527	0.000442849292592404	33255788	33299366	4.58620978103962e-61	33854991	33886938
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33870738	34921384	334	295	-0.0434	4.58620978103962e-61	33854991	33886938	1.23457004044632e-28	34904622	34969982
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	34924470	35266911	118	99	0.3398	1.23457004044632e-28	34904622	34969982	4.25392770897031e-19	35226595	35430640
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35275345	35275345	1	0	NA	4.25392770897031e-19	35226595	35430640	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35279637	42311795	2619	2339	0.0575	NA	NA	NA	6.59815187858016e-25	42274090	42328356
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42313468	42544684	86	81	-0.3287	6.59815187858016e-25	42274090	42328356	1.54354851159353e-100	42537228	42549361
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42546605	44721397	1027	953	0.4407	1.54354851159353e-100	42537228	42549361	0	44713416	44729842
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44723060	51190283	2666	2388	-0.1064	0	44713416	44729842	1.83418222794799e-10	51167691	51201438
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51190313	51237610	33	30	0.2785	1.83418222794799e-10	51167691	51201438	7.77042785189373e-06	51237462	51237610
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51247833	51258559	6	6	-0.4661	7.77042785189373e-06	51237462	51237610	9.5384272538044e-07	51258559	51267177
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	51261234	52262203	439	398	0.27	9.5384272538044e-07	51258559	51267177	1.0597196754326e-233	52244591	52267887
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52263707	55247874	1422	1271	-0.3072	1.0597196754326e-233	52244591	52267887	2.46871185987244e-11	55247874	55247874
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55250187	55252420	2	2	-1.8925	2.46871185987244e-11	55247874	55247874	1.63218262088711e-10	55252420	55252420
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	55253699	57960491	1256	1125	-0.3197	1.63218262088711e-10	55252420	55252420	1.07707581906003e-188	57937824	57984418
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	57983006	58616879	239	222	0.3505	1.07707581906003e-188	57937824	57984418	3.80157667984430e-19	58615499	58616879
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58620201	58646156	8	8	1.3412	3.8015766798443e-19	58615499	58616879	3.28262640117544e-06	58643607	58648456
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58648456	58701688	14	12	0.7744	3.28262640117544e-06	58643607	58648456	0.000514531285097077	58692043	58730775
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58704345	60432934	793	715	0.3665	0.000514531285097077	58692043	58730775	0	60426988	60438263
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60434528	60434528	1	0	NA	0	60426988	60438263	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	60436352	63788698	1603	1429	-0.3306	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	536	0.3143	NA	NA	NA	2.10958288139785e-124	1506379	1506379
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	9	-2.1029	2.10958288139785e-124	1506379	1506379	1.98075760017505e-136	1531162	1531162
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	26147112	8439	7602	0.2538	1.98075760017505e-136	1531162	1531162	8.80087377881644e-11	26142400	26147112
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148060	26161111	10	8	-0.4677	8.80087377881644e-11	26142400	26147112	6.51429848990235e-10	26161111	26162094
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	29740359	192	168	0.2805	6.51429848990235e-10	26161111	26162094	6.29958787784366e-06	29727303	29758778
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29742238	29780872	17	12	0.7777	6.29958787784366e-06	29727303	29758778	1.88350855545792e-08	29766208	29790376
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29784241	45140428	6090	5457	0.2454	1.88350855545792e-08	29766208	29790376	2.74607498251085e-58	45117296	45160558
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	45144243	45148115	2	0	NA	2.74607498251085e-58	45117296	45160558	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	45150468	45700262	223	207	0.577	NA	NA	NA	8.02649156319869e-38	45676397	45729571
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	45702193	51595259	2133	1937	0.2983	8.02649156319869e-38	45676397	45729571	3.23174336529334e-18	51567655	51620047
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51597035	51983724	95	84	0.5966	3.23174336529334e-18	51567655	51620047	3.98037136083761e-24	51950998	52003718
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	51985117	62419534	3783	3409	0.2348	3.98037136083761e-24	51950998	52003718	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	13435755	24	20	-0.4604	NA	NA	NA	1.49021126960608e-25	10165953	13612839
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13562263	17954319	1468	1316	0.1952	1.49021126960608e-25	10165953	13612839	0	17943178	17964277
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	17957847	17957847	1	0	NA	0	17943178	17964277	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	17960484	21779314	1319	1193	-0.4534	NA	NA	NA	0	21771486	21782046
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	21780703	34926206	4798	4345	0.1248	0	21771486	21782046	0	34924672	34936232
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	34926916	34926916	1	0	NA	0	34924672	34936232	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	34929408	36789648	934	824	-0.4449	NA	NA	NA	2.87332715954834e-24	36789648	36789648
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	2.0475	2.87332715954834e-24	36789648	36789648	9.18948063985805e-30	36791668	36791668
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	41971051	2509	2221	-0.6157	9.18948063985805e-30	36791668	36791668	1.60604915585143e-202	41954668	41992402
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	41973308	41973308	1	0	NA	1.60604915585143e-202	41954668	41992402	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	41976713	43484649	790	715	-0.1955	NA	NA	NA	1.89131254479291e-147	43470240	43538351
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	43487901	46922972	1594	1395	-0.5984	1.89131254479291e-147	43470240	43538351	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	18125356	1132	1008	-0.3307	NA	NA	NA	4.88349940740927e-30	18125356	18125356
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18127933	18129194	2	2	2.3018	4.88349940740927e-30	18125356	18125356	1.29157106266384e-28	18129194	18129194
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	18131561	21251449	1224	1093	-0.3212	1.29157106266384e-28	18129194	18129194	9.56651720317805e-17	21251449	21251449
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21253711	21255062	2	2	-2.3376	9.56651720317805e-17	21251449	21251449	3.01205736146694e-15	21255062	21255062
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21259240	22035366	378	337	-0.3702	3.01205736146694e-15	21255062	21255062	1.74220071115015e-58	21995037	22042137
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22036369	22405658	135	122	0.1983	1.74220071115015e-58	21995037	22042137	5.61261497523638e-29	22382030	22413745
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22406615	22667608	110	102	-0.3081	5.61261497523638e-29	22382030	22413745	4.60672775723025e-60	22667608	22682428
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	-2.7589	4.60672775723025e-60	22667608	22682428	1.01517265758225e-246	22714979	22725305
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	5887	-0.2944	1.01517265758225e-246	22714979	22725305	2.45631559991566e-28	35472378	35472378
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	2.2745	2.45631559991566e-28	35472378	35472378	4.2005324456362e-26	35476942	35476942
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37685496	1211	1094	-0.2416	4.2005324456362e-26	35476942	35476942	2.19546383223982e-28	37683516	37689058
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	14	0.7553	2.19546383223982e-28	37683516	37689058	2.21796617971836e-36	37715370	37721849
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	37718669	1	0	NA	2.21796617971836e-36	37715370	37721849	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37721849	39888779	1123	1002	-0.3113	NA	NA	NA	3.01372134466205e-56	39877798	39897908
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	39889918	40217908	183	164	0.1037	3.01372134466205e-56	39877798	39897908	1.31575835818423e-50	40207450	40228996
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40219269	41868113	847	767	-0.3086	1.31575835818423e-50	40207450	40228996	8.4782878830237e-06	41865882	41868113
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41870232	41880110	3	3	0.6574	8.4782878830237e-06	41865882	41868113	2.40648681792818e-06	41880110	41883794
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	41881697	45427377	1757	1558	-0.33	2.40648681792818e-06	41880110	41883794	1.96238245658302e-253	45426469	45435092
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45428468	45430790	2	0	NA	1.96238245658302e-253	45426469	45435092	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45432427	45689898	146	134	0.6215	NA	NA	NA	9.22018112228027e-09	45672560	45697711
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45691411	45752536	37	34	0.1936	9.22018112228027e-09	45672560	45697711	2.23953867879707e-12	45737358	45769413
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	45756464	48425802	1161	1041	-0.1786	2.23953867879707e-12	45737358	45769413	0.000133463703038264	48419439	48425802
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48427435	48434394	4	4	0.5186	0.000133463703038264	48419439	48425802	4.19428010671649e-12	48434394	48434394
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48435590	48448446	10	9	-0.2645	4.19428010671649e-12	48434394	48434394	1.99738791278924e-13	48448446	48448446
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	1.1506	1.99738791278924e-13	48448446	48448446	5.14043698169559e-11	48452959	48458933
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	48455492	1	0	NA	5.14043698169559e-11	48452959	48458933	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48458933	48705025	123	114	-0.1983	NA	NA	NA	1.29448879915287e-06	48694721	48721992
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48706108	48733948	11	11	0.3002	1.29448879915287e-06	48694721	48721992	0.0112933035978539	48708883	48787145
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48735787	49567768	364	332	-0.0838	0.0112933035978539	48708883	48787145	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49571068	49571068	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.5621	NA	NA	NA	1.82677865416778e-09	3237	94062
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	109064	10	10	-0.4718	1.82677865416778e-09	3237	94062	4.40923015184171e-07	108902	111851
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	110101	124528	13	12	-0.0334	4.40923015184171e-07	108902	111851	9.79031350844375e-39	124528	124528
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	127779	2	0	NA	9.79031350844375e-39	124528	124528	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	129104	130528	3	3	1.6135	NA	NA	NA	5.41414438845312e-18	130528	130528
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	662876	404	355	-0.0303	5.41414438845312e-18	130528	130528	1.34226462068841e-05	662815	662876
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	665402	665552	2	2	1.1111	1.34226462068841e-05	662815	662876	1.79253187374526e-06	665552	667172
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	667172	765191	70	58	0.0059	1.79253187374526e-06	665552	667172	1.80292598650726e-09	750694	769172
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	767373	793712	22	20	-0.4462	1.80292598650726e-09	750694	769172	2.04301508037572e-10	788996	804801
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	796371	2708291	1261	1131	0.0389	2.04301508037572e-10	788996	804801	0	2708113	2712641
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	4244902	500	463	0.9642	0	2708113	2712641	4.98367051980246e-11	4243254	4248488
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	4248488	4258174	5	5	-0.1895	4.98367051980246e-11	4243254	4248488	1.26076503710151e-17	4258174	4261500
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	4261500	8452395	1286	1161	1.0416	1.26076503710151e-17	4258174	4261500	2.60318114470535e-08	8446489	8459880
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8466917	7	7	0.3148	2.60318114470535e-08	8446489	8459880	1.73955416764964e-13	8461739	8477126
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	8473482	1	0	NA	1.73955416764964e-13	8461739	8477126	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8475091	16635191	3428	3125	1.0575	NA	NA	NA	1.49654904508656e-240	16631850	16639047
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	16636766	16990830	179	161	1.8527	1.49654904508656e-240	16631850	16639047	2.27935903473537e-37	16970109	17008125
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	16992232	16992232	1	0	NA	2.27935903473537e-37	16970109	17008125	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	16994550	29424906	4599	4199	1.5378	NA	NA	NA	1.50459767907480e-08	29423385	29424906
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	29427771	29435644	2	2	2.8947	1.5045976790748e-08	29423385	29424906	4.86539309400326e-09	29435644	29435644
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	29436712	31492816	889	815	1.5235	4.86539309400326e-09	29435644	29435644	2.15901208122262e-225	31491534	31495694
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	31495694	31780323	153	143	0.6678	2.15901208122262e-225	31491534	31495694	1.97012444999183e-195	31778887	31782156
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	31782156	32349224	302	287	1.5512	1.97012444999183e-195	31778887	31782156	9.93577646368145e-79	32340220	32360996
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32350577	32813202	263	242	2.0348	9.93577646368145e-79	32340220	32360996	2.81857354780015e-124	32805569	32823733
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32814916	43440957	3316	3037	1.5532	2.81857354780015e-124	32805569	32823733	2.56037124528754e-06	43439397	43440957
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	43442479	43444501	2	2	2.7514	2.56037124528754e-06	43439397	43440957	4.09293889700219e-09	43444501	43445763
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	43445763	53492597	3156	2902	1.6239	4.09293889700219e-09	43444501	43445763	5.50878958553433e-29	53492597	53492597
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53493883	53493883	1	0	NA	5.50878958553433e-29	53492597	53492597	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53496402	53507035	6	6	0.0386	NA	NA	NA	1.20677320074363e-52	53507035	53507035
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53510020	53587388	24	21	1.8026	1.20677320074363e-52	53507035	53507035	0.000117711339031931	53581755	53598183
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53588093	53634418	49	43	1.4561	0.000117711339031931	53581755	53598183	2.32602072655946e-15	53629004	53645231
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53635388	53636943	2	0	NA	2.32602072655946e-15	53629004	53645231	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53637812	53864018	90	84	1.9182	NA	NA	NA	1.08142247910028e-165	53861086	53872925
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	53872925	76992219	4677	4259	0.9959	1.08142247910028e-165	53861086	53872925	8.73363995050305e-17	76992219	76992219
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	76998610	76998610	1	0	NA	8.73363995050305e-17	76992219	76992219	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.9149	NA	NA	NA	2.2244581059748e-16	77010018	77010018
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	20179	1.0148	2.2244581059748e-16	77010018	77010018	5.82997462092671e-322	154578922	154599547
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	184	0.1534	5.82997462092671e-322	154578922	154599547	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2810364	47	44	-3.6805	NA	NA	NA	4.94386726071435e-06	2797460	2810364
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2812116	2834262	9	8	-1.7162	4.94386726071435e-06	2797460	2810364	2.55462750134535e-09	2834262	2843661
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2836573	3223585	67	61	-3.5413	2.55462750134535e-09	2834262	2843661	7.69786188398459e-33	3223585	3733715
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3733715	5593746	17	13	-0.4852	7.69786188398459e-33	3223585	3733715	6.97584581333861e-19	4948824	6652845
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7051884	173	155	-3.142	6.97584581333861e-19	4948824	6652845	0.000306558898888293	7009137	7242656
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7053223	7495687	130	120	-2.5414	0.000306558898888293	7009137	7242656	9.63214582151233e-05	7344413	7603458
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7726921	76	63	-3.3549	9.63214582151233e-05	7344413	7603458	6.6025577955004e-09	7716001	7734410
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7729757	7729757	1	0	NA	6.6025577955004e-09	7716001	7734410	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7731490	7782532	16	15	-1.8303	NA	NA	NA	3.06016195329216e-06	7774773	7782532
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7821554	10	7	-3.5636	3.06016195329216e-06	7774773	7782532	0.00528518974490497	7798534	7831268
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7821580	7848999	14	12	-2.7016	0.00528518974490497	7798534	7831268	4.73240048981206e-06	7841425	7853950
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7850883	7905286	13	11	-3.9935	4.73240048981206e-06	7841425	7853950	1.9141864683646e-12	7905286	7905286
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905553	7914104	3	3	-0.9525	1.9141864683646e-12	7905286	7905286	3.59345076830593e-05	7914104	7928317
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	10515697	390	330	-3.3408	3.59345076830593e-05	7914104	7928317	2.07240479117527e-30	10513747	10515697
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11698871	18	14	-0.7101	2.07240479117527e-30	10513747	10515697	8.86772361931764e-05	11698871	12542979
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12452734	1	0	NA	8.86772361931764e-05	11698871	12542979	NA	NA	NA
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12696242	67	58	-2.4006	NA	NA	NA	0.000246291884336219	12619162	12715696
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12700767	12833424	21	19	-3.8293	0.000246291884336219	12619162	12715696	4.12701689276111e-08	12820920	12855363
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	13128515	112	98	-2.1644	4.12701689276111e-08	12820920	12855363	6.03172557179232e-22	13086552	13146483
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13663517	210	191	-3.2904	6.03172557179232e-22	13086552	13146483	1.08409084087067e-08	13644667	13663517
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13670791	13699223	6	6	-1.3302	1.08409084087067e-08	13644667	13663517	1.14863457288262e-08	13699223	13701755
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13700962	14376942	209	187	-3.338	1.14863457288262e-08	13699223	13701755	4.75530808326532e-06	14374313	14376942
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14377844	14381372	4	3	-0.9717	4.75530808326532e-06	14374313	14376942	0.000154460412875282	14381372	14384653
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14382361	14416385	18	16	-3.3068	0.000154460412875282	14381372	14384653	0.04909142373463	14390028	14587291
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14418116	14697315	105	95	-2.5463	0.04909142373463	14390028	14587291	1.13289256453612e-08	14559651	14779054
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14698076	22924754	1596	1391	-3.2205	1.13289256453612e-08	14559651	14779054	5.65284503353627e-61	22916746	25737663
MSK_252152912997_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22926726	57440809	88	76	-1.3045	5.65284503353627e-61	22916746	25737663	NA	NA	NA
