Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	1107653	115	101	0.4839	NA	NA	NA	4.40783928175631e-07	1045806	1151096
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1110266	1599473	92	89	0.7337	4.40783928175631e-07	1045806	1151096	3.82979730333772e-06	1592047	1602041
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1602041	1654026	6	5	-0.0192	3.82979730333772e-06	1592047	1602041	2.78813488955757e-06	1652866	1677600
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1669998	1669998	1	0	NA	2.78813488955757e-06	1652866	1677600	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1673810	2265120	242	227	0.7543	NA	NA	NA	5.27388689225825e-45	2219595	2298088
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	2269096	16698906	5324	5066	0.4839	5.27388689225825e-45	2219595	2298088	6.91934082423209e-16	16659021	16713074
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16704522	17104345	21	21	-0.0387	6.91934082423209e-16	16659021	16713074	1.07721688575670e-15	17094475	17121583
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17107476	26721924	3992	3772	0.4742	1.0772168857567e-15	17094475	17121583	3.19037644422288e-301	26702283	26739225
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	26723750	28773900	906	859	0.8651	3.19037644422288e-301	26702283	26739225	2.03946862160085e-254	28754792	28781646
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	28776841	34869589	2195	2071	0.4787	2.03946862160085e-254	28754792	28781646	3.47269556728821e-256	34869589	34869589
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-4.1059	3.47269556728821e-256	34869589	34869589	1.03812323873312e-276	34883375	34883375
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	72533804	14992	14218	0.4451	1.03812323873312e-276	34883375	34883375	5.4635631850156e-20	72524413	72534975
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72533856	72579311	18	17	0.9528	5.4635631850156e-20	72524413	72534975	9.4613128377584e-18	72571158	72602597
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	85742732	4043	3828	0.4126	9.4613128377584e-18	72571158	72602597	6.38671431627908e-11	85735211	85753561
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85745222	85778723	15	15	-0.0423	6.38671431627908e-11	85735211	85753561	1.91256612187036e-117	85772922	85787136
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	85781420	100662359	5247	4973	0.3915	1.91256612187036e-117	85772922	85787136	0	100657696	100667419
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	100664873	109987341	2383	2267	-0.1367	0	100657696	100667419	5.68890648404414e-10	109987341	109987341
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	0.9681	5.68890648404414e-10	109987341	109987341	2.42003946866996e-17	109989998	109989998
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110014625	11	10	-0.1446	2.42003946866996e-17	109989998	109989998	1.91423679508382e-06	110011494	110023268
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110015739	110041712	6	6	-0.7671	1.91423679508382e-06	110011494	110023268	9.74076594282552e-10	110034542	110058441
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	111751061	689	646	-0.0955	9.74076594282552e-10	110034542	110058441	6.58702727147356e-10	111729961	111758437
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111756287	111808583	26	26	0.23	6.58702727147356e-10	111729961	111758437	1.48011404647807e-12	111803136	111821114
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111812852	119220665	2627	2507	-0.1124	1.48011404647807e-12	111803136	111821114	9.9859737318266e-197	119212310	119228004
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	119223336	120333077	473	444	0.2402	9.9859737318266e-197	119212310	119228004	1.57420577454195e-10	120329400	120358263
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120338395	120338395	1	0	NA	1.57420577454195e-10	120329400	120358263	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120347824	120415520	11	10	-0.3171	NA	NA	NA	0.00793073679394274	120383098	120902680
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120705146	143659690	85	83	0.0298	0.00793073679394274	120383098	120902680	1.10572499462454e-14	143639135	143706304
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	143697723	144003068	79	77	-0.2978	1.10572499462454e-14	143639135	143706304	9.91394795056606e-71	143975987	144099302
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144093719	147313991	568	546	0.2052	9.91394795056606e-71	143975987	144099302	3.98042613075819e-30	147311437	147352661
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147315217	147460661	24	23	0.8095	3.98042613075819e-30	147311437	147352661	3.63916399333826e-27	147438471	147467273
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147467273	150839754	1270	1192	0.2245	3.63916399333826e-27	147438471	147467273	5.91329766176034e-55	150839754	150839754
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150848509	6	3	-2.0228	5.91329766176034e-55	150839754	150839754	2.645306578145e-66	150848509	150848509
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150851439	151026228	79	75	0.2069	2.645306578145e-66	150848509	150848509	6.1679857990574e-212	151026228	151026228
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	-3.8839	6.1679857990574e-212	151026228	151026228	7.91870105660534e-232	151036435	151036435
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	154859697	1782	1694	0.2302	7.91870105660534e-232	151036435	151036435	8.1841606177342e-36	154834331	154892114
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	154862950	155249005	220	211	0.4686	8.1841606177342e-36	154834331	154892114	5.37856134522085e-30	155214884	155276229
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	155250612	157133150	677	648	0.2296	5.37856134522085e-30	155214884	155276229	9.91229547386957e-39	157133150	157133150
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	2.586	9.91229547386957e-39	157133150	157133150	6.60717330155746e-43	157136342	157136342
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	192715640	12818	12109	0.2203	6.60717330155746e-43	157136342	157136342	9.52564526584847e-15	192715640	192715640
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	1.4035	9.52564526584847e-15	192715640	192715640	1.50133750031675e-10	192719540	192719540
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	200598243	2643	2484	0.2078	1.50133750031675e-10	192719540	192719540	9.49547203909848e-08	200580745	200618814
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200600795	200668993	25	23	-0.0985	9.49547203909848e-08	200580745	200618814	9.78910524077051e-70	200646926	200683992
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200670407	246417356	17192	16249	0.2331	9.7891052407705e-70	200646926	200683992	5.34100322998474e-87	246383544	246440949
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246425385	246769018	105	97	0.523	5.34100322998474e-87	246383544	246440949	3.76218821005306e-76	246755298	246794552
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246878405	31	28	-0.4476	3.76218821005306e-76	246755298	246794552	2.01387223512904e-38	246864725	246882156
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246882156	247186514	94	86	0.3304	2.01387223512904e-38	246864725	246882156	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	13430872	4210	3947	0.4116	NA	NA	NA	3.31565692656152e-11	13430872	13430872
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13444674	13454720	2	2	-0.9164	3.31565692656152e-11	13430872	13430872	1.50598010202617e-12	13454720	13454720
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13461042	20444207	1767	1678	0.4162	1.50598010202617e-12	13454720	13454720	1.93933153459664e-08	20444207	20444207
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20445909	20448354	2	2	-0.687	1.93933153459664e-08	20444207	20444207	8.1305990689924e-08	20448354	20448354
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	20451267	28409221	2903	2738	0.4319	8.1305990689924e-08	20448354	20448354	6.10095014934403e-25	28370897	28447177
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28411403	28739686	142	130	0.6807	6.10095014934403e-25	28370897	28447177	8.79480361369345e-26	28703789	28780859
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	28741327	34543992	2496	2373	0.4331	8.79480361369345e-26	28703789	28780859	4.15298516063393e-06	34516600	34552935
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	0.7661	4.15298516063393e-06	34516600	34552935	9.7549439877283e-08	34580533	34608979
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	35821494	484	459	0.4031	9.7549439877283e-08	34580533	34608979	3.66010298343775e-19	35821494	35821494
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	2.0339	3.66010298343775e-19	35821494	35821494	2.60603171440993e-17	35844884	35844884
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	37810001	883	829	0.4323	2.60603171440993e-17	35844884	35844884	5.36196097198322e-45	37803744	37813211
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37812045	37855837	22	20	-0.396	5.36196097198322e-45	37803744	37813211	1.27798088349562e-47	37852371	37858379
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5478	0.4286	1.27798088349562e-47	37852371	37858379	0	52600588	52600588
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52604016	1	0	NA	0	52600588	52600588	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52612881	52635695	4	4	-4.4821	NA	NA	NA	0	52635695	52635695
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	66357387	4557	4298	0.4234	0	52635695	52635695	1.21289115243129e-214	66357387	66357387
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-4.92	1.21289115243129e-214	66357387	66357387	2.42771787319597e-199	66360747	66360747
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	89319930	7012	6622	0.4194	2.42771787319597e-199	66360747	66360747	1.09568673423913e-06	89268081	89387596
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89377705	89624945	13	12	0.001	1.09568673423913e-06	89268081	89387596	7.68228031952703e-07	89400088	89649638
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89635398	89890854	34	30	0.3889	7.68228031952703e-07	89400088	89649638	2.18857409961205e-16	89885961	89902365
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89902365	91270311	15	14	-0.0973	2.18857409961205e-16	89885961	89902365	2.48996130008572e-12	91179406	94892766
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94784165	95722700	224	206	0.4616	2.48996130008572e-12	91179406	94892766	2.43754693739281e-18	95722700	95722700
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	95796016	95974614	3	3	-0.988	2.43754693739281e-18	95722700	95722700	6.26640909320469e-20	95974614	95974614
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	96103035	97128607	391	370	0.4244	6.26640909320469e-20	95974614	95974614	8.0049672009398e-09	97059077	97128607
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97152330	97187531	4	4	-0.4037	8.0049672009398e-09	97059077	97128607	4.84022256748387e-07	97187531	97228759
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97221198	97697578	38	34	0.4344	4.84022256748387e-07	97187531	97228759	0.000205259280006177	97682027	97705707
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97700626	97725784	14	13	0.0402	0.000205259280006177	97682027	97705707	5.55764409639213e-06	97716991	97739430
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97729264	98053574	119	115	0.426	5.55764409639213e-06	97716991	97739430	8.32238193242987e-09	97988736	98096398
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	98055779	98212998	66	64	0.6903	8.32238193242987e-09	97988736	98096398	1.63721656782541e-70	98203271	98219599
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	98216505	132405798	9123	8625	0.1459	1.63721656782541e-70	98203271	98219599	3.13569536212549e-12	132397397	132405798
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132724793	132739926	6	6	-0.6083	3.13569536212549e-12	132397397	132405798	2.96539401300661e-13	132739926	132747227
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132747227	146562545	4715	4453	0.129	2.96539401300661e-13	132739926	132747227	2.60732767953415e-15	146552736	146562545
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146571330	146592775	5	5	-0.7366	2.60732767953415e-15	146552736	146562545	9.50097454979461e-16	146592775	146597405
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	178221444	10517	9931	0.1495	9.50097454979461e-16	146592775	146597405	3.04134854970047e-52	178203759	178251679
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178223165	178735156	230	216	0.3937	3.04134854970047e-52	178203759	178251679	2.25054446172254e-37	178705127	178766122
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	178738092	179764819	456	432	0.146	2.25054446172254e-37	178705127	178766122	2.41468795320006e-14	179764819	179764819
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179767214	179767214	1	0	NA	2.41468795320006e-14	179764819	179764819	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	1.2064	NA	NA	NA	5.00554529826987e-13	179778919	179778919
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	218970587	13138	12380	0.1449	5.00554529826987e-13	179778919	179778919	8.0496189000066e-10	218970587	218970587
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218971708	218972428	2	2	1.2842	8.0496189000066e-10	218970587	218970587	5.20759424493145e-09	218972428	218972428
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	218975318	238994999	7071	6703	0.1463	5.20759424493145e-09	218972428	218972428	4.10234953992158e-10	238994999	238994999
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	238997323	238999739	2	2	1.3475	4.10234953992158e-10	238994999	238994999	8.98280316415094e-09	238999739	239002088
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	239002088	242689978	1329	1261	0.1242	8.98280316415094e-09	238999739	239002088	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	21210959	7469	7074	-0.2708	NA	NA	NA	5.24815563997762e-29	21203157	21210959
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	21224805	21326830	10	9	-1.1398	5.24815563997762e-29	21203157	21210959	5.34856422106994e-33	21326830	21332584
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	21332584	32064724	3316	3121	-0.2715	5.34856422106994e-33	21326830	21332584	3.11885819472521e-32	32064724	32064724
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32074432	32074432	1	0	NA	3.11885819472521e-32	32064724	32064724	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	1.5485	NA	NA	NA	3.40906775493153e-27	32080848	32080848
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	47460892	5420	5101	-0.2589	3.40906775493153e-27	32080848	32080848	1.76715435897487e-145	47460892	47460892
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-4.3966	1.76715435897487e-145	47460892	47460892	7.07171223467471e-135	47466921	47466921
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	51941094	1922	1804	-0.2455	7.07171223467471e-135	47466921	47466921	7.67287278844692e-41	51916646	51951628
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	51942820	52117546	84	75	0.1382	7.67287278844692e-41	51916646	51951628	1.02495530416091e-53	52109923	52124482
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	52118842	75479859	8650	8179	-0.2613	1.02495530416091e-53	52109923	52124482	1.92655220933637e-52	75479859	75784655
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75875904	18	16	-1.1134	1.92655220933637e-52	75479859	75784655	2.87675833977137e-51	75871755	75875904
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	89235805	3617	3411	-0.2949	2.87675833977137e-51	75871755	75875904	5.53910243489726e-39	89229063	89243501
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89237152	89340683	56	54	0.0942	5.53910243489726e-39	89229063	89243501	8.60435666752217e-14	89327688	89358692
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89342126	89342126	1	0	NA	8.60435666752217e-14	89327688	89358692	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	89343749	90359943	268	248	0.3843	NA	NA	NA	1.75385959414202e-53	90276756	95034308
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	90362345	117050755	6699	6345	0.6406	1.75385959414202e-53	90276756	95034308	7.05436199259424e-07	117025329	117057499
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117052036	117107955	28	27	0.3561	7.05436199259424e-07	117025329	117057499	1.77359674541532e-27	117099265	117140550
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	117110078	127151545	3603	3415	0.6354	1.77359674541532e-27	117099265	117140550	1.15573277828924e-22	127151545	127151545
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127155887	127158321	2	2	-0.9051	1.15573277828924e-22	127151545	127151545	6.02793423604261e-13	127158321	127158321
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	127159473	133189686	2541	2411	0.6217	6.02793423604261e-13	127158321	127158321	6.14638522904203e-126	133189686	133189686
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	-4.0375	6.14638522904203e-126	133189686	133189686	5.91131469592731e-153	133194685	133194685
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	5.91131469592731e-153	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	143330849	3509	3312	0.6415	NA	NA	NA	4.40071179197996e-08	143329318	143330849
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	143333168	143336879	3	3	-0.2659	4.40071179197996e-08	143329318	143330849	2.80160212340195e-08	143336879	143343375
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	143343375	164005577	6267	5892	0.6562	2.80160212340195e-08	143336879	143343375	2.90735261885435e-26	164005577	164009321
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	4	-0.7335	2.90735261885435e-26	164005577	164009321	1.61776630288202e-22	164027724	164027724
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	19	1.2634	1.61776630288202e-22	164027724	164027724	6.89979891875432e-23	164100804	164121847
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	191219222	9122	8604	0.6563	6.89979891875432e-23	164100804	164121847	5.66039538244502e-126	191219222	191219222
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-3.6713	5.66039538244502e-126	191219222	191219222	5.75159599118351e-144	191222891	191222891
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	192546280	424	396	0.6334	5.75159599118351e-144	191222891	191222891	1.26119934980673e-179	192546280	192546280
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-2.9106	1.26119934980673e-179	192546280	192546280	2.71123315828819e-163	192552734	192552734
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	198038358	2041	1924	0.6326	2.71123315828819e-163	192552734	192552734	1.16958500261118e-11	198038358	198038358
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	198042681	2	2	-0.7256	1.16958500261118e-11	198038358	198038358	5.87365737745321e-10	198042681	198042681
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198044259	199321387	519	489	0.6275	5.87365737745321e-10	198042681	198042681	0.000268630984792595	199309650	199321387
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199324677	199329592	2	2	-0.2253	0.000268630984792595	199309650	199321387	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	58159	9	9	-0.7935	NA	NA	NA	3.07567306926123e-17	53781	61552
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	61552	682752	205	199	0.0583	3.07567306926123e-17	53781	61552	1.80686783817223e-10	682752	682752
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	685953	685953	1	0	NA	1.80686783817223e-10	682752	682752	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	689619	691065	2	2	1.4592	NA	NA	NA	5.46882670404943e-11	691065	691065
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	693668	3544254	1048	1004	0.1001	5.46882670404943e-11	691065	691065	2.61579204118928e-06	3485676	3576645
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	3546479	3604618	23	23	-0.2134	2.61579204118928e-06	3485676	3576645	1.19452998155204e-06	3579132	3621298
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	3606632	4668609	260	245	0.1271	1.19452998155204e-06	3579132	3621298	5.86093896209853e-14	4612770	4702749
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	4670554	4977377	101	97	0.3814	5.86093896209853e-14	4612770	4702749	3.90705372964776e-23	4952350	5020573
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	4983328	7966171	1266	1195	0.106	3.90705372964776e-23	4952350	5020573	7.06704552807452e-08	7938358	7987600
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	7970054	8045527	40	37	0.3655	7.06704552807452e-08	7938358	7987600	1.94889963565759e-06	8028221	8068546
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	8047828	9800777	437	420	0.1063	1.94889963565759e-06	8028221	8068546	1.98309549896793e-177	9800777	9800777
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9815760	9821327	2	0	NA	1.98309549896793e-177	9800777	9800777	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9827233	9842644	3	3	-4.4313	NA	NA	NA	7.5738121361273e-230	9842644	9842644
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	14262074	982	932	0.0764	7.5738121361273e-230	9842644	9842644	3.08303205810018e-111	14245023	14277510
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	14264345	15388255	446	415	0.3904	3.08303205810018e-111	14245023	14277510	1.15079805389621e-130	15373752	15407102
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	15389891	20367020	1415	1343	0.0798	1.15079805389621e-130	15373752	15407102	1.18469405763144e-204	20363505	20369990
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20368681	20902123	260	248	-0.4005	1.18469405763144e-204	20363505	20369990	2.26339609539663e-250	20899726	20905668
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	20904185	53321926	8079	7643	0.0981	2.26339609539663e-250	20899726	20905668	0	53303439	53336826
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	53323805	59930066	1904	1783	-0.2651	0	53303439	53336826	0	59882947	59961416
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	59936435	67045314	1469	1386	0.0703	0	59882947	59961416	0	67012315	67079993
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	67050117	119334954	16793	15845	-0.27	0	67012315	67079993	1.91350551544046e-63	119334954	119334954
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119345371	119348829	3	3	-2.411	1.91350551544046e-63	119334954	119334954	3.24585149881043e-62	119348829	119348829
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119350354	173224400	14892	14066	-0.2784	3.24585149881043e-62	119348829	119348829	1.07316864895441e-62	173224400	173224400
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.8978	1.07316864895441e-62	173224400	173224400	2.49883696477974e-62	173228860	173228860
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	186676034	3968	3762	-0.2749	2.49883696477974e-62	173228860	173228860	6.97412140908148e-27	186676034	186676034
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186678729	186680176	2	2	-2.0092	6.97412140908148e-27	186676034	186676034	5.50368395906169e-25	186680176	186680176
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	186681553	187330240	306	291	-0.2652	5.50368395906169e-25	186680176	186680176	1.51071293444492e-141	187330240	187330240
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-4.3864	1.51071293444492e-141	187330240	187330240	1.83138658643811e-148	187333619	187333619
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	190752920	1137	1076	-0.2789	1.83138658643811e-148	187333619	187333619	9.43241622840824e-23	190708316	190763677
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190754887	190924564	60	58	-0.5851	9.43241622840824e-23	190708316	190763677	2.85318124737279e-08	190910126	190960746
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190927969	191153613	44	41	-0.3278	2.85318124737279e-08	190910126	190960746	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	829954	228	219	-0.2151	NA	NA	NA	2.3603032689931e-39	829954	829954
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-2.962	2.3603032689931e-39	829954	829954	2.57506164184883e-46	873365	873365
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	905462	1	0	NA	2.57506164184883e-46	873365	873365	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	910211	1335584	165	154	-0.2122	NA	NA	NA	0.000153446936465279	1331674	1335584
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1339297	1339297	1	0	NA	0.000153446936465279	1331674	1335584	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1342021	1346204	3	3	0.5016	NA	NA	NA	3.10365569031541e-07	1346204	1349464
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	1349464	12857302	3575	3386	-0.2698	3.10365569031541e-07	1346204	1349464	6.01511498372227e-14	12857302	12857302
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	12866038	12873052	2	2	1.0197	6.01511498372227e-14	12857302	12857302	8.2705301585549e-14	12873052	12873052
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	13263185	55536383	10923	10335	-0.2572	8.2705301585549e-14	12873052	12873052	3.18285043668643e-56	55530694	55546843
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	55538888	55796980	71	68	0.1782	3.18285043668643e-56	55530694	55546843	4.41758355204435e-58	55767569	55808120
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	55800890	59745401	1302	1231	-0.262	4.41758355204435e-58	55767569	55808120	0	59742717	59751869
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59749078	59749078	1	0	NA	0	59742717	59751869	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	59751869	60500956	285	272	-0.8978	NA	NA	NA	0	60499139	60503568
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	60503568	106069326	12666	11987	-0.2669	0	60499139	60503568	0	106062550	106076344
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	106076344	107783763	563	536	-0.9162	0	106062550	106076344	0	107783763	107783763
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	107795509	109381165	531	499	0.1658	0	107783763	107783763	4.38017343184454e-43	109329477	109453013
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	109394028	110136401	217	202	0.4458	4.38017343184454e-43	109329477	109453013	0	110133273	110138130
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	110138130	113501748	1053	987	-0.2387	0	110133273	110138130	1.30194297273437e-07	113423544	113572362
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	113515153	113617529	20	19	0.076	1.30194297273437e-07	113423544	113572362	1.19604948907968e-70	113617529	113617529
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	113619351	114171938	164	159	-0.8969	1.19604948907968e-70	113617529	113617529	0	114171938	114171938
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	114186738	147094486	10688	10084	0.1255	0	114171938	114171938	4.75412070552926e-24	147083030	147100077
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	147096700	147182423	42	41	-0.2654	4.75412070552926e-24	147083030	147100077	0	147182423	147182423
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	147184321	148492049	518	485	1.5889	0	147182423	147182423	6.78375974910876e-221	148492049	148492049
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	148495015	148495015	1	0	NA	6.78375974910876e-221	148492049	148492049	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	148497280	148544664	24	22	-0.3127	NA	NA	NA	1.25741882462472e-15	148543173	148559105
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	148546194	150603486	972	919	0.1407	1.25741882462472e-15	148543173	148559105	0	150594774	150613143
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	150607207	170441452	6251	5923	-0.2789	0	150594774	150613143	2.59623594757233e-112	170440228	170441452
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	170442706	170571410	56	52	-0.9756	2.59623594757233e-112	170440228	170441452	7.51623771345223e-55	170571410	170580357
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	170574391	170895981	128	118	-0.2805	7.51623771345223e-55	170571410	170580357	4.84110609899114e-61	170849763	170931342
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	170900929	180342860	3193	3016	0.1201	4.84110609899114e-61	170849763	170931342	8.88017586246149e-185	180342860	180344964
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	-2.5077	8.88017586246149e-185	180342860	180344964	1.71570265364572e-103	180357210	180358977
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	105	0.1224	1.71570265364572e-103	180357210	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	244363	58	54	0.3199	NA	NA	NA	7.23932140646031e-29	240119	248239
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	246974	323898	42	38	-0.2171	7.23932140646031e-29	240119	248239	1.80646566902485e-54	322557	327962
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	326323	326323	1	0	NA	1.80646566902485e-54	322557	327962	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29973024	10490	9914	0.4279	NA	NA	NA	2.84118174720434e-12	29950805	29973024
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29980445	30010234	11	11	-0.1533	2.84118174720434e-12	29950805	29973024	8.7482728455497e-10	30010234	30026699
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30021908	32564884	1077	1015	0.4093	8.7482728455497e-10	30010234	30026699	3.19056181229250e-122	32564884	32564884
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32567462	32595402	5	5	-2.4803	3.1905618122925e-122	32564884	32564884	3.29003747034076e-06	32595402	32605300
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32597877	32633691	10	10	-0.2929	3.29003747034076e-06	32595402	32605300	0.00808125897621238	32600962	32634977
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32713363	28	24	0.4124	0.00808125897621238	32600962	32634977	8.49843333239543e-09	32711957	32718991
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	1.0636	8.49843333239543e-09	32711957	32718991	0.00258836636563196	32723366	32758904
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32852112	53	51	0.5485	0.00258836636563196	32723366	32758904	9.59830573702176e-20	32828293	32865771
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32856489	33625674	338	326	0.1348	9.59830573702176e-20	32828293	32865771	3.4543919317256e-18	33595206	33651727
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	33627276	33843689	105	97	0.427	3.4543919317256e-18	33595206	33651727	2.65528914853588e-21	33815284	33867626
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	33845474	35856922	848	804	0.135	2.65528914853588e-21	33815284	33867626	5.32956221110488e-06	35849860	35862502
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35862270	35873335	8	8	-0.3875	5.32956221110488e-06	35849860	35862502	1.20189206410092e-07	35868512	35880489
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	49027493	5147	4836	0.1476	1.20189206410092e-07	35868512	35880489	1.11411704389467e-45	49027493	49027493
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49039318	49045025	2	2	-2.4056	1.11411704389467e-45	49027493	49027493	1.80188903047765e-50	49045025	49045025
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49049568	54035000	1758	1650	0.1462	1.80188903047765e-50	49045025	49045025	9.95873667326475e-22	54035000	54035000
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54037199	1	0	NA	9.95873667326475e-22	54035000	54035000	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54039814	54042734	2	2	1.7858	NA	NA	NA	5.89638636101315e-23	54042734	54042734
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	56395944	850	815	0.1084	5.89638636101315e-23	54042734	54042734	1.46615469267818e-104	56382052	56403287
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	56398549	57307563	401	373	0.4166	1.46615469267818e-104	56382052	56403287	4.78357457378449e-88	57300498	57317587
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57313645	57672491	142	130	-0.0532	4.78357457378449e-88	57300498	57317587	1.15758745671936e-66	57634110	57704050
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	57683389	64091359	557	527	0.361	1.15758745671936e-66	57634110	57704050	3.0236745858124e-74	64074225	64129681
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	64104276	65767409	448	417	0.0882	3.0236745858124e-74	64074225	64129681	7.95757221597947e-16	65767409	65767409
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65769146	65771532	2	2	-1.197	7.95757221597947e-16	65767409	65767409	1.61353172493902e-13	65771532	65771532
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	65778663	74762234	2912	2737	0.1053	1.61353172493902e-13	65771532	65771532	6.29650963083913e-07	74757796	74766480
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74766480	74773321	5	5	0.7054	6.29650963083913e-07	74757796	74766480	1.40775186222175e-06	74772169	74781818
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74780074	79018959	1115	1063	0.1233	1.40775186222175e-06	74772169	74781818	1.61377348794119e-37	79015901	79018959
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	12	-0.7512	1.61377348794119e-37	79015901	79018959	4.71819327255069e-37	79091850	79095415
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	107030587	7554	7162	0.107	4.71819327255069e-37	79091850	79095415	1.47323168193798e-14	107012083	107053025
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	107032147	107131478	45	44	0.3925	1.47323168193798e-14	107012083	107053025	5.08530429743178e-14	107118946	107148624
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	107132999	151928505	15622	14759	0.111	5.08530429743178e-14	107118946	107148624	3.66222794788629e-75	151916630	151934186
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	151932042	152116760	81	77	0.5933	3.66222794788629e-75	151916630	151934186	8.07899484998708e-71	152113479	152123234
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	152121026	170753106	6378	6022	0.1046	8.07899484998708e-71	152113479	152123234	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	39743919	14270	13479	0.3668	NA	NA	NA	6.33654987701361e-102	39694196	39769363
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	39745889	39886602	32	31	0.1269	6.33654987701361e-102	39694196	39769363	3.30317673701976e-05	39847390	39962573
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	39888365	43590850	1185	1118	0.3561	3.30317673701976e-05	39847390	39962573	5.62023003323002e-06	43589344	43590850
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43592620	43597673	3	3	-0.4205	5.62023003323002e-06	43589344	43590850	0	43597673	43601254
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	43601254	109217320	19471	18358	0.5465	0	43597673	43601254	0	109217320	109217320
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109230336	109233214	3	3	-4.3809	0	109217320	109217320	1.3548344328777e-261	109233214	109233214
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109236813	118611324	4301	4045	0.5929	1.3548344328777e-261	109233214	109233214	6.04985707266764e-23	118611324	118611324
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	2.0751	6.04985707266764e-23	118611324	118611324	3.47747395113607e-24	118620875	118620875
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	2982	0.5745	3.47747395113607e-24	118620875	118620875	1.15057167340903e-23	125831554	125831554
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	2.059	1.15057167340903e-23	125831554	125831554	1.08787601305745e-19	125837524	125837524
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141413352	7363	6968	0.61	1.08787601305745e-19	125837524	125837524	1.10167973425824e-16	141410894	141414719
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141414719	141438504	12	10	1.3432	1.10167973425824e-16	141410894	141414719	1.98496599098983e-14	141435643	141440184
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	141690753	117	114	0.6293	1.98496599098983e-14	141435643	141440184	0	141690753	141690753
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	-3.9244	0	141690753	141690753	0	141714168	141714168
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	141720303	1	0	NA	0	141714168	141714168	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720324	143503317	658	622	0.64	NA	NA	NA	7.62603717739607e-07	143497023	143503317
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	-0.2176	7.62603717739607e-07	143497023	143503317	1.43274263025662e-06	143584350	143705425
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	147702365	1850	1754	0.5987	1.43274263025662e-06	143584350	143705425	4.14436223013984e-37	147702365	147702365
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.7298	4.14436223013984e-37	147702365	147702365	1.72100221921536e-30	147707161	147707161
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	149182041	641	605	0.6028	1.72100221921536e-30	147707161	147707161	1.43011027795854e-16	149176475	149190049
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149183338	149215630	19	18	1.1807	1.43011027795854e-16	149176475	149190049	3.36723576803294e-17	149210297	149234081
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	149234006	151728811	970	901	0.5991	3.36723576803294e-17	149210297	149234081	5.07582211260512e-22	151728811	151728811
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151734110	3	3	-0.9828	5.07582211260512e-22	151728811	151728811	7.20803150851968e-24	151734110	151734110
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151735783	151743145	5	4	-0.324	7.20803150851968e-24	151734110	151734110	7.57200553755806e-13	151743145	151743145
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	153134693	273	255	0.62	7.57200553755806e-13	151743145	151743145	1.62099893084729e-47	153078212	153172870
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	153144321	153303541	58	52	1.1866	1.62099893084729e-47	153078212	153172870	1.25828731739009e-51	153290833	153315549
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	153314459	158821263	2269	2129	0.588	1.25828731739009e-51	153290833	153315549	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	-0.4258	NA	NA	NA	1.16802825729410e-91	581533	581533
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-4.1882	1.1680282572941e-91	581533	581533	4.35115073540239e-99	588865	588865
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2163225	598	567	-0.4545	4.35115073540239e-99	588865	588865	9.25463038585971e-07	2137441	2193565
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2165688	2165688	1	0	NA	9.25463038585971e-07	2137441	2193565	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2171384	2234351	17	17	-0.801	NA	NA	NA	7.86914627883353e-10	2223705	2245838
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	25119007	7421	7027	-0.4229	7.86914627883353e-10	2223705	2245838	8.46483293371386e-18	25119007	25119007
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25120552	25120552	1	0	NA	8.46483293371386e-18	25119007	25119007	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	-1.6153	NA	NA	NA	3.57071221062170e-27	25125700	25125700
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	32797545	3031	2850	-0.3803	3.5707122106217e-27	25125700	25125700	1.25174875406601e-24	32797545	32797545
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32800775	32800775	1	0	NA	1.25174875406601e-24	32797545	32797545	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32805686	32808049	2	2	-1.411	NA	NA	NA	2.10993359969846e-12	32808049	32808049
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	32812909	40226471	2165	2056	-0.2702	2.10993359969846e-12	32808049	32808049	2.14957795603121e-152	40192983	40260200
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40236475	40892587	213	200	0.1584	2.14957795603121e-152	40192983	40260200	1.83930593870246e-168	40892587	40892587
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	-4.4536	1.83930593870246e-168	40892587	40892587	7.78307521531054e-141	40897469	40897469
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	42022642	399	386	0.117	7.78307521531054e-141	40897469	40897469	1.22348658575653e-161	42010544	42033764
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	42024677	64661279	5372	5077	0.4785	1.22348658575653e-161	42010544	42033764	2.48556152827878e-132	64554401	64679937
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	64669588	66918038	546	505	0.1911	2.48556152827878e-132	64554401	64679937	4.46033549188567e-151	66906174	66945900
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	66919387	71233042	1600	1523	0.5234	4.46033549188567e-151	66906174	66945900	5.04688912840973e-13	71211463	71247969
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	71234292	71338335	52	50	0.805	5.04688912840973e-13	71211463	71247969	2.6384683932497e-28	71321824	71355491
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	71340505	81701931	2836	2674	0.5151	2.6384683932497e-28	71321824	71355491	1.74290790427728e-121	81693100	81708136
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	81703101	82249652	235	226	0.9306	1.74290790427728e-121	81693100	81708136	3.32604556091562e-159	82223715	82310231
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	82263471	82263471	1	0	NA	3.32604556091562e-159	82223715	82310231	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	82273251	95565411	3600	3376	0.483	NA	NA	NA	9.05901391785819e-18	95557041	95569120
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	95567168	95610198	24	23	0.9458	9.05901391785819e-18	95557041	95569120	1.53916004316753e-16	95602863	95616194
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	95611976	101543539	2289	2182	0.4859	1.53916004316753e-16	95602863	95616194	2.69484832864163e-262	101472977	101573681
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	101550343	105979704	1713	1623	0.2119	2.69484832864163e-262	101472977	101573681	1.73561727359775e-80	105914378	106039537
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	105983816	107295075	393	371	0.4685	1.73561727359775e-80	105914378	106039537	2.41416827322214e-10	107274179	107312538
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107296525	107389193	37	37	0.7471	2.41416827322214e-10	107274179	107312538	5.73599120996617e-09	107376988	107417966
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107390974	107390974	1	0	NA	5.73599120996617e-09	107376988	107417966	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	107392905	110408079	923	876	0.4782	NA	NA	NA	1.66693631484681e-76	110380014	110425091
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	110411222	111198826	253	245	0.8183	1.66693631484681e-76	110380014	110425091	3.15579993135798e-86	111160482	111251882
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	111204031	146264846	10716	10108	0.4784	3.15579993135798e-86	111160482	111251882	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	15802255	5458	5170	-0.2557	NA	NA	NA	5.51319299776441e-24	15802255	15802255
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15805300	15807123	2	2	-1.8808	5.51319299776441e-24	15802255	15802255	4.67162829509691e-23	15807123	15807123
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	15813356	23343915	2540	2389	-0.2446	4.67162829509691e-23	15807123	15807123	1.92573363752189e-168	23343915	23353267
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	-3.8754	1.92573363752189e-168	23343915	23353267	4.76484151845046e-165	23357805	23365926
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	70221479	4758	4482	-0.2507	4.76484151845046e-165	23357805	23365926	8.39890075729605e-188	70212537	70228702
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70223138	70926188	311	296	0.1476	8.39890075729605e-188	70212537	70228702	4.92734776828726e-18	70926188	70926188
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.4096	4.92734776828726e-18	70926188	70926188	7.00982659206535e-17	70930528	70930528
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	71339702	178	169	0.1808	7.00982659206535e-17	70930528	70930528	7.1844962540297e-114	71339702	71339702
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	71340879	71342650	3	3	-2.9983	7.1844962540297e-114	71339702	71339702	7.4704533973549e-125	71342650	71342650
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	71346634	90658388	6332	5988	0.1405	7.4704533973549e-125	71342650	71342650	0	90637295	90697501
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	90670732	116124007	8955	8476	-0.2378	0	90637295	90697501	8.24437440231782e-14	116124007	116124007
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.5458	8.24437440231782e-14	116124007	116124007	3.23263326109864e-13	116130333	116130333
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	133250165	6656	6258	-0.2294	3.23263326109864e-13	116130333	116130333	2.25340283272799e-14	133250165	133250165
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133251786	133254922	2	2	-1.6016	2.25340283272799e-14	133250165	133250165	2.7016564933836e-10	133254922	133254922
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133257756	140145683	2742	2588	-0.2228	2.7016564933836e-10	133254922	133254922	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	33090091	11898	11277	0.427	NA	NA	NA	9.08188329837921e-15	33090091	33090091
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	33096171	33096171	1	0	NA	9.08188329837921e-15	33090091	33090091	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	33096235	33096378	2	2	-1.0827	NA	NA	NA	2.04205062573987e-15	33096378	33096378
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	33102806	38596435	1601	1524	0.417	2.04205062573987e-15	33096378	33096378	1.41922203563938e-07	38537336	38623159
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	38601263	41971605	13	13	0.1043	1.41922203563938e-07	38537336	38623159	0.000140621013181786	38643804	42222615
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	42176875	46384985	943	892	-0.2131	0.000140621013181786	38643804	42222615	6.07548838971454e-47	45480572	46394835
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46388078	47068616	81	75	-0.6404	6.07548838971454e-47	45480572	46394835	3.26234909476745e-57	47058901	47080155
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47072924	77013542	9620	9087	-0.2147	3.26234909476745e-57	47058901	47080155	7.88523314340031e-295	77001623	77021299
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77014572	77884865	420	396	-0.6385	7.88523314340031e-295	77001623	77021299	6.707794147845e-11	77879309	77890347
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77886451	77917893	13	13	-0.1974	6.707794147845e-11	77879309	77890347	1.52046361811690e-05	77917893	77926390
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	-1.4926	1.5204636181169e-05	77917893	77926390	1.08564434224514e-92	77928669	77928738
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	100672415	7761	7296	-0.1584	1.08564434224514e-92	77928669	77928738	6.24200443659695e-90	100670683	100672415
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100676022	100676022	1	0	NA	6.24200443659695e-90	100670683	100672415	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100678817	100686787	4	4	-0.8388	NA	NA	NA	2.74799491847112e-09	100686787	100693036
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	100693036	126353260	9283	8743	-0.0639	2.74799491847112e-09	100686787	100693036	4.67090645611445e-12	126330583	126373863
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126354732	126482549	59	55	0.1729	4.67090645611445e-12	126330583	126373863	7.67818006612756e-12	126465431	126513417
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126484954	135284109	3104	2927	-0.084	7.67818006612756e-12	126465431	126513417	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	135285645	135285645	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1677	0.4345	NA	NA	NA	2.00139644258502e-275	4923300	4923300
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.2797	2.00139644258502e-275	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	29757257	8792	8300	0.4231	0	4932214	4932214	1.41864508334809e-293	29709959	29828166
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	29762617	33469113	1336	1253	0.1497	1.41864508334809e-293	29709959	29828166	9.39056867370753e-295	33461287	33496686
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	33473070	35389083	788	742	0.574	9.39056867370753e-295	33461287	33496686	0	35376073	35396757
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	35392697	47660760	3567	3367	0.1567	0	35376073	35396757	2.94621119982919e-16	47637979	47677124
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47664030	47793873	59	58	0.4411	2.94621119982919e-16	47637979	47677124	1.64861767870505e-15	47782616	47825518
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	47797605	54807283	511	483	0.1433	1.64861767870505e-15	47782616	47825518	2.67814732186375e-17	51270601	54870909
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	54834320	54837079	2	0	NA	2.67814732186375e-17	51270601	54870909	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	54840587	55118214	73	69	0.4427	NA	NA	NA	2.25416070301451e-75	55114405	55123719
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55217189	40	39	-0.6123	2.25416070301451e-75	55114405	55123719	8.89057288887506e-136	55209626	55217189
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55219985	58383355	1245	1183	0.4221	8.89057288887506e-136	55209626	55217189	2.29111569670806e-10	58383355	58383355
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58389208	58390670	2	2	-0.8399	2.29111569670806e-10	58383355	58383355	1.12018449967971e-08	58390670	58390670
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58404501	66463477	3390	3207	0.4544	1.12018449967971e-08	58390670	58390670	7.4836296325733e-08	66460753	66463477
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	1.6892	7.4836296325733e-08	66460753	66463477	2.40656363594931e-09	66469412	66469412
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	93199840	9160	8617	0.4461	2.40656363594931e-09	66469412	66469412	4.07269498573895e-08	93187737	93215120
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93201326	93244026	19	19	0.8248	4.07269498573895e-08	93187737	93215120	3.30936606741329e-10	93222825	93267095
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	93244677	100354532	2153	2028	0.4356	3.30936606741329e-10	93222825	93267095	1.13147510380474e-48	100329490	100368494
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	100356830	101004089	213	198	0.701	1.13147510380474e-48	100329490	100368494	1.05673610494857e-41	100973911	101102904
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	101010330	111642232	3620	3436	0.4539	1.05673610494857e-41	100973911	101102904	1.43127332820261e-07	111633431	111653007
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	111644447	111665473	11	10	0.928	1.43127332820261e-07	111633431	111653007	1.38138653733862e-07	111648789	111673240
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	111667613	113979934	875	824	0.4446	1.38138653733862e-07	111648789	111673240	4.05253624712467e-06	113972484	113983919
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113983919	113996548	4	4	-0.2362	4.05253624712467e-06	113972484	113983919	1.96912675798902e-05	113992975	114016954
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	113999831	118764726	1773	1667	0.4285	1.96912675798902e-05	113992975	114016954	2.48185077029218e-21	118736142	118809829
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	118767403	119116718	129	121	0.6722	2.48185077029218e-21	118736142	118809829	3.80182078910764e-22	119073300	119193683
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	119120401	134450318	5763	5449	0.4375	3.80182078910764e-22	119073300	119193683	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	281	0.7001	NA	NA	NA	1.01975207621765e-11	734832	736988
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.3322	1.01975207621765e-11	734832	736988	3.35176009016508e-08	743223	745410
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	758725	9	8	0.6469	3.35176009016508e-08	743223	745410	0.000126654899553940	752975	758725
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	760146	767071	5	5	1.2606	0.00012665489955394	752975	758725	0.000123684465313455	767071	772933
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	768563	9523923	3428	3222	0.6586	0.000123684465313455	767071	772933	2.04477206375408e-23	9516067	9531133
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	1.4662	2.04477206375408e-23	9516067	9531133	3.74896034870536e-27	9589725	9604633
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	12422129	1047	984	0.6497	3.74896034870536e-27	9589725	9604633	5.93476130007908e-11	12419910	12422129
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12423720	12433043	5	4	-0.2828	5.93476130007908e-11	12419910	12422129	8.53790297278262e-11	12433043	12435301
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	12435301	15578214	1327	1258	0.661	8.53790297278262e-11	12433043	12435301	9.24890137734479e-105	15557675	15590633
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	15580905	17822105	589	560	0.3749	9.2489013773448e-105	15557675	15590633	1.41679917480163e-103	17743350	17928374
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	17831881	23944164	1914	1807	0.6368	1.41679917480163e-103	17743350	17928374	2.59634593985556e-98	23927883	23962524
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	23947155	25202667	574	547	0.3797	2.59634593985556e-98	23927883	23962524	4.51895603608905e-26	25168424	25239944
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	25203817	25556558	155	140	0.6335	4.51895603608905e-26	25168424	25239944	1.08437377176866e-05	25554935	25556558
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	25558932	25560190	2	2	1.5623	1.08437377176866e-05	25554935	25556558	8.3735485611989e-15	25560190	25562380
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	25562380	31680810	1999	1888	0.6302	8.3735485611989e-15	25560190	25562380	8.95737750665552e-270	31646446	31710270
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31681982	44783305	3429	3255	0.375	8.95737750665552e-270	31646446	31710270	2.04525754168578e-96	44750535	44814326
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	44797449	45351728	153	142	0.8168	2.04525754168578e-96	44750535	44814326	7.2161250754448e-88	45337910	45360291
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	45354422	48202147	1056	999	0.3672	7.2161250754448e-88	45337910	45360291	1.4251637422212e-133	48182855	48229737
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	48204644	52110728	1761	1654	0.6361	1.4251637422212e-133	48182855	48229737	4.71251717907873e-202	52090385	52126796
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	52114017	54923114	1175	1105	0.3167	4.71251717907873e-202	52090385	52126796	2.33773953611838e-105	54918237	54927876
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	54924464	55299689	163	158	0.7931	2.33773953611838e-105	54918237	54927876	2.78322893017177e-120	55295590	55304255
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	55301352	69138621	4569	4332	0.3215	2.78322893017177e-120	55295590	55304255	7.45212184076094e-27	69138621	69138621
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69161489	69164231	2	2	-1.6439	7.45212184076094e-27	69138621	69138621	1.71005851415702e-28	69164231	69164231
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	69188981	100624427	9760	9217	0.2941	1.71005851415702e-28	69164231	69164231	3.33978622381463e-248	100624427	100624427
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100626837	100629832	3	3	-4.3352	3.33978622381463e-248	100624427	100624427	1.66992426830185e-221	100629832	100629832
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	100631726	130943064	11171	10576	0.3175	1.66992426830185e-221	100629832	100629832	4.26039773517702e-44	130943064	130943064
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130944468	130946248	2	2	2.8677	4.26039773517702e-44	130943064	130943064	6.23901670054534e-35	130946248	130946248
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	130947790	132289090	550	511	0.3175	6.23901670054534e-35	130946248	130946248	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	23065886	1584	1494	-0.322	NA	NA	NA	0	23064641	23070519
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	23070519	49958475	10634	10029	0.5965	0	23064641	23070519	7.99520325541409e-45	49958475	49958475
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49964838	49964838	1	0	NA	7.99520325541409e-45	49958475	49958475	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-2.0662	NA	NA	NA	2.62219848273683e-47	49971732	49971732
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	56650373	1804	1721	0.5934	2.62219848273683e-47	49971732	49971732	0	56650373	56650373
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	15	-2.9389	0	56650373	56650373	0	56685341	56685341
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	62499779	1365	1268	0.5613	0	56685341	56685341	5.82044123067696e-07	62485058	62523095
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	62507943	62530764	6	6	-0.0239	5.82044123067696e-07	62485058	62523095	6.54917196046827e-09	62516280	62541555
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	62534030	89659397	6882	6539	0.5652	6.54917196046827e-09	62516280	62541555	2.40815859898378e-29	89659397	89659397
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-1.4477	2.40815859898378e-29	89659397	89659397	4.31253151856103e-28	89662326	89662326
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	97327189	3186	3019	0.5987	4.31253151856103e-28	89662326	89662326	1.89525831960250e-88	97327189	97327189
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97329413	97330568	2	2	-3.0066	1.8952583196025e-88	97327189	97327189	3.34564075355603e-80	97330568	97330568
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97331794	114115707	6159	5832	0.5941	3.34564075355603e-80	97330568	97330568	6.02330933725581e-06	114114513	114115707
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114118270	114123340	2	2	-0.4333	6.02330933725581e-06	114114513	114115707	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19297767	13	12	-0.4652	NA	NA	NA	1.08103574646734e-14	19273289	19323579
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19301034	21533558	1040	981	0.1221	1.08103574646734e-14	19273289	19323579	5.27966348674973e-71	21511829	21548222
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21535379	22051630	260	243	0.4403	5.27966348674973e-71	21511829	21548222	1.1761525198321e-83	22041571	22061243
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22052799	26639324	1587	1481	0.1017	1.1761525198321e-83	22041571	22061243	9.52711858003225e-14	26617968	26656430
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	26643626	26766506	24	22	0.5302	9.52711858003225e-14	26617968	26656430	2.78618547740305e-58	26748214	26810803
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	26772194	34674458	2826	2677	0.1687	2.78618547740305e-58	26748214	26810803	1.81206044697632e-51	34674458	34674458
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.4206	1.81206044697632e-51	34674458	34674458	1.68653347746802e-20	34683810	34683810
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	67964757	11331	10669	0.1133	1.68653347746802e-20	34683810	34683810	6.59260928290899e-96	67954635	67979999
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	67973992	68403004	209	203	0.4554	6.59260928290899e-96	67954635	67979999	4.30872737159069e-55	68390465	68411031
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	68405300	69086125	335	316	0.1212	4.30872737159069e-55	68390465	68411031	5.60299343158236e-19	69086125	69086125
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	-1.1595	5.60299343158236e-19	69086125	69086125	1.77962406012342e-18	69092211	69092211
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	73071404	1789	1689	0.1303	1.77962406012342e-18	69092211	69092211	1.87218955355699e-80	73071404	73075500
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73072457	73072457	1	0	NA	1.87218955355699e-80	73071404	73075500	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73075500	73092112	6	6	-1.7829	NA	NA	NA	6.74103614415035e-78	73092018	73092112
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	73101327	105594189	12213	11505	0.1162	6.74103614415035e-78	73092018	73092112	3.71853881353658e-10	105588527	105594189
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105595302	105632168	14	12	0.6154	3.71853881353658e-10	105588527	105594189	1.16485936335921e-06	105632168	105724133
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	106355517	230	219	0.1341	1.16485936335921e-06	105632168	105724133	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106358491	106358491	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	-0.0054	NA	NA	NA	6.41185450724605e-16	18452491	18452491
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	10	-1.3568	6.41185450724605e-16	18452491	18452491	3.29666250439888e-06	18831600	18837737
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-0.5168	3.29666250439888e-06	18831600	18837737	9.99939274677877e-08	18848213	18854068
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	20088256	137	128	-1.4639	9.99939274677877e-08	18848213	18854068	0	20079935	20088256
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	23569315	783	734	-0.2826	0	20079935	20088256	4.2346778073268e-171	23564532	23570898
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	23570898	24157794	198	187	-0.8402	4.2346778073268e-171	23564532	23570898	1.91501640651954e-254	24153253	24160981
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	24160981	32456500	2690	2534	-0.2563	1.91501640651954e-254	24153253	24160981	0	32456500	32514939
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32514939	32594200	25	25	-2.3624	0	32456500	32514939	0	32583146	32594200
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	35636792	989	929	-0.2703	0	32583146	32594200	1.26390496828440e-43	35632785	35656692
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	35642314	35650932	2	0	NA	1.2639049682844e-43	35632785	35656692	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	35656692	35799492	23	23	-0.9064	NA	NA	NA	1.93573758073098e-41	35794602	35810015
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	35810015	41638388	2644	2505	-0.2481	1.93573758073098e-41	35794602	35810015	3.47824584144011e-50	41638388	41638388
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41676219	41676221	2	2	-2.6993	3.47824584144011e-50	41638388	41638388	6.31206528216124e-51	41676221	41676221
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	41682925	50050784	3491	3294	-0.2513	6.31206528216124e-51	41676221	41676221	6.62418198004806e-106	50050784	50050784
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50053032	50059941	3	3	-3.1275	6.62418198004806e-106	50050784	50050784	3.59669960768331e-117	50059941	50059941
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	50062594	52517110	994	941	-0.2743	3.59669960768331e-117	50059941	50059941	8.61857976183597e-11	52517110	52517110
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52519074	52533227	2	2	-1.3467	8.61857976183597e-11	52517110	52517110	7.12102316723932e-09	52533227	52533227
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	52540479	74669752	9709	9232	-0.258	7.12102316723932e-09	52533227	52533227	1.4674253310158e-21	74669752	74669752
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	0.9152	1.4674253310158e-21	74669752	74669752	2.74236220516230e-22	74680439	74680439
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	78855195	1660	1553	-0.2646	2.7423622051623e-22	74680439	74680439	3.1335589099246e-10	78855195	78855195
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78856680	78858227	2	2	0.8796	3.1335589099246e-10	78855195	78855195	3.8235149295122e-11	78858227	78858227
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78861458	82330854	1131	1062	-0.2706	3.8235149295122e-11	78858227	78858227	2.43811810864293e-49	82330854	82330854
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82332155	82332155	1	0	NA	2.43811810864293e-49	82330854	82330854	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82333698	82334704	2	2	-2.6519	NA	NA	NA	8.56774368661278e-51	82334704	82334704
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	82335935	83408661	355	330	-0.2622	8.56774368661278e-51	82334704	82334704	2.48578499927588e-34	83392619	83413371
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	83409844	83525424	50	48	0.1705	2.48578499927588e-34	83392619	83413371	1.62074464977981e-39	83518923	83624634
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	83529798	99448664	6047	5697	-0.2699	1.62074464977981e-39	83518923	83624634	2.80002020727203e-10	99422413	99468368
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99451037	99545698	43	39	-0.0152	2.80002020727203e-10	99422413	99468368	2.38837249790099e-06	99527078	99563078
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99547424	99547424	1	0	NA	2.38837249790099e-06	99527078	99563078	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99549982	99632987	41	40	-0.3041	NA	NA	NA	3.43432072799522e-33	99632987	99632987
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.7125	3.43432072799522e-33	99632987	99632987	1.58049482350226e-31	99635701	99635701
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100298352	272	258	-0.2824	1.58049482350226e-31	99635701	99635701	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	1296767	473	442	-0.1112	NA	NA	NA	2.68619477571698e-12	1296767	1296767
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1299180	1300341	2	2	1.4322	2.68619477571698e-12	1296767	1296767	5.50693647798641e-13	1300341	1300341
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	1302875	2663884	545	517	-0.1202	5.50693647798641e-13	1300341	1300341	7.8110764066036e-74	2639798	2672074
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	2666932	3000392	139	133	0.3756	7.8110764066036e-74	2639798	2672074	2.00925913217114e-11	2967124	3047597
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	3002609	3498415	209	194	0.1367	2.00925913217114e-11	2967124	3047597	9.07721290706584e-33	3457645	3528340
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	3500465	9273040	2132	2015	-0.0997	9.07721290706584e-33	3457645	3528340	0	9224646	9310406
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	9280810	14956252	1970	1870	0.2586	0	9224646	9310406	2.26118618717901e-59	14876356	14958374
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	14958374	15029941	12	11	-0.3036	2.26118618717901e-59	14876356	14958374	4.37638886674963e-07	15028108	15042407
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	15034210	16195573	419	399	0.158	4.37638886674963e-07	15028108	15042407	1.20773175971631e-07	16183557	16803336
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	16197188	16197188	1	0	NA	1.20773175971631e-07	16183557	16803336	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	16199682	16925346	23	19	0.5256	NA	NA	NA	6.2765876412906e-07	16884325	16980402
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	16930485	21258019	1330	1250	0.196	6.2765876412906e-07	16884325	16980402	6.36201084099473e-07	21239284	21382540
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21382540	21501073	10	10	-0.2569	6.36201084099473e-07	21239284	21382540	0.000166331235368771	21492912	21519814
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21504151	35004950	3548	3372	0.1318	0.000166331235368771	21492912	21519814	0	35003634	45058242
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45058242	47876058	931	874	0.8272	0	35003634	45058242	0	47876058	47876058
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	47877097	72941901	8020	7563	-0.2701	0	47876058	47876058	2.00291154796369e-07	72929786	72941901
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	72956298	3	3	-1.0724	2.00291154796369e-07	72929786	72941901	2.47932060867026e-08	72956298	72963578
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72963578	75092501	755	710	-0.2577	2.47932060867026e-08	72956298	72963578	1.20597813983489e-27	75092501	75092501
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75093957	1	0	NA	1.20597813983489e-27	75092501	75092501	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	1.2069	NA	NA	NA	7.85126992176828e-26	75100865	75100865
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	569	-0.279	7.85126992176828e-26	75100865	75100865	1.31709448422623e-30	76923844	76925748
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.7085	1.31709448422623e-30	76923844	76925748	1.50324777531847e-27	76940218	76940218
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4250	-0.2818	1.50324777531847e-27	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	1028979	417	394	-0.0979	NA	NA	NA	2.09080195966020e-42	1028979	1028979
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1030715	1030766	2	2	2.3827	2.0908019596602e-42	1028979	1028979	2.25418490622287e-51	1030766	1030766
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1031233	1161881	63	61	-0.14	2.25418490622287e-51	1030766	1030766	1.21550023551169e-06	1151578	1174154
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1163668	1203082	17	17	-0.4944	1.21550023551169e-06	1151578	1174154	2.3157917282015e-07	1193712	1214180
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1205681	1328438	58	55	-0.0817	2.3157917282015e-07	1193712	1214180	2.8184302433984e-11	1312621	1359756
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1330574	1718892	198	190	0.2177	2.8184302433984e-11	1312621	1359756	2.05385406355802e-23	1703117	1726858
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1721138	1898326	93	90	-0.1345	2.05385406355802e-23	1703117	1726858	1.524125477433e-10	1894898	1903358
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1899328	1899328	1	0	NA	1.524125477433e-10	1894898	1903358	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1899977	1910544	11	11	0.4605	NA	NA	NA	7.81267989154438e-14	1906352	1912424
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	1911059	19847344	6932	6539	-0.1317	7.81267989154438e-14	1906352	1912424	7.50174083642602e-11	19824447	19856187
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19850604	19940361	38	35	0.1639	7.50174083642602e-11	19824447	19856187	1.10909259376292e-10	19929417	19959736
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	19944475	20378146	106	100	-0.1321	1.10909259376292e-10	19929417	19959736	3.46673629221869e-16	20150031	20596699
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	20382837	21138219	190	183	0.1391	3.46673629221869e-16	20150031	20596699	2.83689207818202e-11	21130611	21147675
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21139941	21192152	22	21	-0.3075	2.83689207818202e-11	21130611	21147675	5.9670481760883e-07	21179880	21206027
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21195590	21244934	21	19	0.1522	5.9670481760883e-07	21179880	21206027	2.60319509870624e-05	21234007	21252509
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21247217	21318207	17	17	-0.2322	2.60319509870624e-05	21234007	21252509	5.38847588938634e-06	21268058	21372618
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21325758	22484302	112	102	0.104	5.38847588938634e-06	21268058	21372618	1.28681931071313e-24	22427573	22549963
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	22494955	22761190	77	72	-0.2672	1.28681931071313e-24	22427573	22549963	1.25965786871497e-111	22759318	22762859
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	22762859	22952517	82	76	0.5997	1.25965786871497e-111	22759318	22762859	3.59017974424670e-11	22949773	22952517
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	22954939	22954939	1	0	NA	3.5901797442467e-11	22949773	22952517	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	22957069	22963211	5	5	-0.2483	NA	NA	NA	2.49342813698257e-17	22963211	22966426
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	22966426	23358270	118	107	0.6707	2.49342813698257e-17	22963211	22966426	0	23358270	23358270
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	23362720	23501470	63	62	2.7531	0	23358270	23358270	5.21179296316698e-46	23501470	23501470
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	23503200	23516739	8	8	3.7157	5.21179296316698e-46	23501470	23501470	1.66531374168591e-12	23516739	23518304
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	23518304	23860064	153	140	3.0387	1.66531374168591e-12	23516739	23518304	1.77287711736141e-53	23851909	23870760
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	23862418	24322997	243	229	2.5929	1.77287711736141e-53	23851909	23870760	3.1637909153087e-49	24316914	24330537
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24324107	24532828	107	102	2.067	3.1637909153087e-49	24316914	24330537	0	24532828	24532828
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24536806	25950938	631	600	-0.2513	0	24532828	24532828	5.5042033695357e-15	25900388	26036063
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26024574	26073893	5	5	0.5971	5.5042033695357e-15	25900388	26036063	2.35620882179776e-13	26048478	26128808
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26128808	29768752	1600	1520	-0.2453	2.35620882179776e-13	26048478	26128808	0	29768752	29768752
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	29776132	30150842	86	82	1.9455	0	29768752	29768752	2.50597505331645e-91	30130637	30157046
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	30157046	30520567	179	167	2.7523	2.50597505331645e-91	30130637	30157046	0	30520567	30520567
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	30522078	31461588	382	356	-0.2354	0	30520567	30520567	1.09477988374615e-06	31443186	31473186
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31462463	31483188	11	11	-0.6367	1.09477988374615e-06	31443186	31473186	7.2320201850333e-48	31483188	31483188
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31486540	31503774	7	7	2.0713	7.2320201850333e-48	31483188	31483188	1.82756959663770e-150	31503774	31503774
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	344	-0.2541	1.8275695966377e-150	31503774	31503774	4.02147870441503e-11	32828797	32828797
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	0.9039	4.02147870441503e-11	32828797	32828797	7.72665707978234e-11	32832642	32832642
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	33157484	154	146	-0.2411	7.72665707978234e-11	32832642	32832642	0	33157484	33157484
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	33160290	34654837	425	395	2.6564	0	33157484	33157484	0	34654837	34654837
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	34656607	36673853	869	808	-0.2467	0	34654837	34654837	7.3090236475673e-35	36673853	36673853
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36683509	5	5	-1.6014	7.3090236475673e-35	36673853	36673853	9.49953114931988e-28	36683509	36683509
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36684619	37196712	267	256	-0.2483	9.49953114931988e-28	36683509	36683509	3.58166775236202e-07	37191732	37196712
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	37199419	37211349	7	7	0.3298	3.58166775236202e-07	37191732	37196712	3.26777900126594e-07	37209074	37217581
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	37213335	39392051	895	847	-0.2408	3.26777900126594e-07	37209074	37217581	1.42499254600993e-11	39392051	39395936
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	39395936	39399405	3	3	0.891	1.42499254600993e-11	39392051	39395936	9.54607535666964e-13	39397736	39399405
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	39400227	41015177	639	609	-0.2367	9.54607535666964e-13	39397736	39399405	4.61269040972804e-08	41011530	41015177
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41017338	41031191	3	3	-1.097	4.61269040972804e-08	41011530	41015177	4.56086888915921e-08	41031191	41062669
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41062669	41566540	219	199	-0.2387	4.56086888915921e-08	41031191	41062669	6.14974920590685e-25	41558893	41573295
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	42147225	49	48	-0.6507	6.14974920590685e-25	41558893	41573295	5.77684501880075e-25	41708551	42155643
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42148637	42906929	299	284	-0.2556	5.77684501880075e-25	41708551	42155643	6.82352859862271e-47	42906929	42906929
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42922562	42968632	4	4	1.483	6.82352859862271e-47	42906929	42906929	1.66661542068803e-46	42968632	42968632
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42975134	42975134	1	0	NA	1.66661542068803e-46	42968632	42968632	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	43027760	78653545	13372	12597	-0.2552	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	112131	3	3	-0.2746	NA	NA	NA	0.122029805469918	112131	169042
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	115020	14025194	4899	4639	0.1567	0.122029805469918	112131	169042	6.14846361445879e-25	13961462	14093912
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	14034941	15062735	89	83	0.4424	6.14846361445879e-25	13961462	14093912	4.86982654791131e-22	14889800	16797390
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	15069276	20942393	1531	1450	0.1652	4.86982654791131e-22	14889800	16797390	3.91297126041822e-107	20936065	20950440
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	20945269	20945269	1	0	NA	3.91297126041822e-107	20936065	20950440	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	20947368	21568700	161	152	-0.2771	NA	NA	NA	1.35848919728937e-44	21531881	21598985
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	21592479	21924226	86	79	0.1669	1.35848919728937e-44	21531881	21598985	5.77958914142996e-18	21914204	21928893
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	21926683	22032218	38	37	-0.2129	5.77958914142996e-18	21914204	21928893	3.46429328339877e-17	22032092	22053344
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	22038642	22476696	199	184	0.1549	3.46429328339877e-17	22032092	22053344	5.08808289113944e-66	22464999	22484693
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	22479963	23120800	217	201	-0.2569	5.08808289113944e-66	22464999	22484693	1.21676474082317e-49	23086108	23137836
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	23127607	23795931	142	135	0.1183	1.21676474082317e-49	23086108	23137836	7.49572670603855e-51	23789988	23801509
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	23797518	24306787	142	131	-0.2702	7.49572670603855e-51	23789988	23801509	1.31902773172967e-53	24292677	24333785
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	24321150	25110213	127	120	0.1232	1.31902773172967e-53	24292677	24333785	5.87078290764658e-73	25094839	25143760
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	25114105	25114105	1	0	NA	5.87078290764658e-73	25094839	25143760	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	25120077	53092949	8563	8119	-0.2544	NA	NA	NA	1.74277265825012e-18	53092949	53092949
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-1.739	1.74277265825012e-18	53092949	53092949	4.05265753546662e-18	53099601	53099601
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	76116026	6763	6369	-0.268	4.05265753546662e-18	53099601	53099601	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	239700	12	12	-0.0876	NA	NA	NA	2.81810714957196e-29	239700	239700
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	241442	243026	2	2	2.2142	2.81810714957196e-29	239700	239700	6.93241636043789e-24	243026	243026
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	244260	790526	205	191	0.0935	6.93241636043789e-24	243026	243026	3.69183344706182e-12	790526	790526
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	794978	2	2	1.607	3.69183344706182e-12	790526	790526	4.24171936945879e-12	794978	794978
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	798817	1398325	271	253	0.1494	4.24171936945879e-12	794978	794978	2.60521072506006e-21	1398325	1398325
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	2.0754	2.60521072506006e-21	1398325	1398325	2.22521817490107e-20	1400840	1400840
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	3353960	926	870	0.0997	2.22521817490107e-20	1400840	1400840	5.626761181067e-10	3353960	3353960
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3355220	3356334	2	2	1.4969	5.626761181067e-10	3353960	3353960	2.68681503686931e-11	3356334	3356334
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	3357750	12574803	4192	3956	0.0855	2.68681503686931e-11	3356334	3356334	0	12574803	12574803
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12577630	12747635	85	81	2.0325	0	12574803	12574803	8.85304065192113e-07	12725303	12800853
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	12749310	13023528	137	128	1.7746	8.85304065192113e-07	12725303	12800853	1.81510753988145e-91	13022358	13025169
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13025169	13118814	51	49	3.0289	1.81510753988145e-91	13022358	13025169	2.2451710837609e-26	13115853	13120858
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13120858	13163043	17	15	1.8012	2.2451710837609e-26	13115853	13120858	0.00958418207346831	13141953	13166601
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13166601	13173430	4	4	1.2283	0.0095841820734683	13141953	13166601	0.00322724297189877	13170982	13228178
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	13177350	15304554	973	918	1.7466	0.00322724297189877	13170982	13228178	3.70494259077194e-20	15276730	15326394
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15305934	15305934	1	0	NA	3.70494259077194e-20	15276730	15326394	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15307177	15508216	111	103	1.4222	NA	NA	NA	7.9648493889072e-101	15507259	15509434
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15509434	15763372	103	95	0.5557	7.9648493889072e-101	15507259	15509434	4.96941968016236e-38	15749088	15769963
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15766803	15985258	99	92	1.1049	4.96941968016236e-38	15749088	15769963	1.88117880416713e-49	15963678	15995151
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15986845	15986845	1	0	NA	1.88117880416713e-49	15963678	15995151	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15988687	19261726	1577	1500	0.6049	NA	NA	NA	7.9873027233001e-94	19248478	19266588
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19261949	19563226	191	178	0.1062	7.9873027233001e-94	19248478	19266588	2.77270347204166e-14	19557205	19564497
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19564497	19595433	17	15	0.6294	2.77270347204166e-14	19557205	19564497	6.50066343676808e-11	19591234	19602354
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19597624	20841320	341	313	0.1305	6.50066343676808e-11	19591234	19602354	3.73900204093442e-06	20813981	20854536
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20847760	20865349	5	5	-0.5216	3.73900204093442e-06	20813981	20854536	1.57573964056903e-07	20857921	20872378
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	20870473	21519593	203	196	0.1448	1.57573964056903e-07	20857921	20872378	2.03381656614562e-05	21505251	21549627
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21520695	21629445	25	25	-0.1231	2.03381656614562e-05	21505251	21549627	9.95215546064512e-06	21566519	21678613
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	21632138	22288542	140	135	0.1542	9.95215546064512e-06	21566519	21678613	1.39018007321844e-06	22271894	22329014
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22292839	22292839	1	0	NA	1.39018007321844e-06	22271894	22329014	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22293501	22361859	16	16	-0.2055	NA	NA	NA	6.97022294865063e-06	22344412	22395776
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	22365294	23837869	384	367	0.1264	6.97022294865063e-06	22344412	22395776	4.37713026389657e-254	23837869	23837869
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23846006	24157855	68	63	1.2892	4.37713026389657e-254	23837869	23837869	7.22825694513525e-29	24130129	32964337
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	32545047	33946325	253	241	0.846	7.22825694513525e-29	24130129	32964337	4.49127792235534e-10	33924181	33967896
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	33956854	34054663	15	15	1.3283	4.49127792235534e-10	33924181	33967896	2.61290948598738e-10	34047774	34074193
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	34059801	35238237	406	381	0.8344	2.61290948598738e-10	34047774	34074193	1.22945008276381e-81	35229124	35257884
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35242960	35242960	1	0	NA	1.22945008276381e-81	35229124	35257884	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35247571	35767896	182	173	1.3384	NA	NA	NA	1.17442482561149e-112	35753212	35774944
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	35770023	37861570	549	519	0.7994	1.17442482561149e-112	35753212	35774944	0	37859960	37863857
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	37863857	40308933	1014	960	0.0817	0	37859960	37863857	0	40308933	40310901
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40310901	40539029	108	102	1.2008	0	40308933	40310901	0.000155776920472504	40525502	40539029
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40540618	40560594	8	7	1.8089	0.000155776920472504	40525502	40539029	4.64341745512162e-06	40560594	40576707
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40561772	40963534	206	199	1.1365	4.64341745512162e-06	40560594	40576707	1.14969595809927e-33	40944669	40989402
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40968368	41438493	228	207	0.7332	1.14969595809927e-33	40944669	40989402	1.41152789861927e-34	41421500	41517417
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41500221	41942587	195	181	1.1237	1.41152789861927e-34	41421500	41517417	0.0863745737130653	41840959	41948960
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41944204	41944204	1	0	NA	0.0863745737130653	41840959	41948960	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41948960	41977228	10	8	1.4184	NA	NA	NA	1.54899523564956e-05	41966756	41986201
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41978330	42038948	30	27	1.7813	1.54899523564956e-05	41966756	41986201	2.80067024493371e-07	42027171	42062652
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42041734	42890543	349	334	1.4785	2.80067024493371e-07	42027171	42062652	1.27312619311742e-59	42879047	42908949
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42892380	42892380	1	0	NA	1.27312619311742e-59	42879047	42908949	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	42893852	44543012	756	718	1.8326	NA	NA	NA	1.95929607385524e-47	44534654	44548338
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44545864	44701223	89	85	1.2538	1.95929607385524e-47	44534654	44548338	2.30247559152897e-27	44691789	44704255
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44702473	44808180	43	40	1.8477	2.30247559152897e-27	44691789	44704255	6.16052676965884e-19	44798145	44823382
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44813196	45104353	111	104	1.314	6.16052676965884e-19	44798145	44823382	1.45126111457248e-13	45045813	45112862
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45107461	45235412	58	56	1.7074	1.45126111457248e-13	45045813	45112862	1.63360434128119e-11	45219122	45265226
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45235517	45503308	123	111	1.3488	1.63360434128119e-11	45219122	45265226	4.09643882908104e-50	45497055	45511387
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45506829	45866638	173	164	0.7597	4.09643882908104e-50	45497055	45511387	4.07275270897181e-52	45855020	45870822
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	45868032	46337914	168	155	1.3092	4.07275270897181e-52	45855020	45870822	4.22281919102005e-09	46326794	46359164
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46339923	46393733	18	18	1.8051	4.22281919102005e-09	46326794	46359164	0.000178773860084606	46382214	46415527
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46395857	46478791	43	40	1.5113	0.000178773860084606	46382214	46415527	5.65191688774772e-46	46478791	46485605
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46479781	46679527	100	92	0.7385	5.65191688774772e-46	46478791	46485605	4.84865861229483e-38	46677416	46679527
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46683279	46683279	1	0	NA	4.84865861229483e-38	46677416	46679527	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46690384	46747079	19	17	1.7673	NA	NA	NA	4.27391829395549e-40	46747079	46748534
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	46748534	52244591	2295	2174	0.7722	4.27391829395549e-40	46747079	46748534	0	52236636	52258810
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	52258810	56611496	2048	1926	0.0401	0	52236636	52258810	0	56608500	56613849
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56613849	58781237	932	882	0.7762	0	56608500	56613849	7.65915053593927e-51	58772967	58791745
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58781441	58884760	66	64	1.3419	7.65915053593927e-51	58772967	58791745	3.11837220162754e-35	58883143	58887905
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	58886899	59414898	292	272	0.7546	3.11837220162754e-35	58883143	58887905	7.5590498234869e-83	59414898	59414898
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59434159	9	9	-1.4751	7.5590498234869e-83	59414898	59414898	3.58416719767702e-68	59434159	59434159
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59434202	59434202	1	0	NA	3.58416719767702e-68	59434159	59434159	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440262	59514358	34	33	0.5369	NA	NA	NA	5.05422754911808e-11	59491509	59547034
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59515508	63078947	1616	1516	0.8029	5.05422754911808e-11	59491509	59547034	6.36228751521425e-09	63074383	63078947
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63080364	63089328	2	2	-0.0994	6.36228751521425e-09	63074383	63078947	0.000704718758983682	63089328	63093223
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63091594	63601833	255	242	0.8602	0.000704718758983682	63089328	63093223	3.28074127306184e-15	63583577	63622584
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	63603796	63788698	87	82	0.515	3.28074127306184e-15	63583577	63622584	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	560	0.386	NA	NA	NA	2.31438196335129e-247	1506379	1511632
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	-2.711	2.31438196335129e-247	1506379	1511632	2.11049073327965e-316	1532433	1532433
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	23094552	7628	7223	0.6255	2.11049073327965e-316	1532433	1532433	8.7096860972265e-87	23089064	23094552
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	23097901	23109658	6	6	1.3719	8.7096860972265e-87	23089064	23094552	8.698009323005e-09	23109658	23119886
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	23114692	26130512	791	752	0.6238	8.698009323005e-09	23109658	23119886	7.65684704324997e-05	26117713	26141755
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26134206	26147112	13	12	0.243	7.65684704324997e-05	26117713	26141755	0.0467316137349348	26139120	26156944
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148060	28266113	18	17	-0.2933	0.0467316137349348	26139120	26156944	1.91801005821763e-42	28247413	29306447
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	29297270	1	0	NA	1.91801005821763e-42	28247413	29306447	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29306447	48587545	7531	7090	0.6524	NA	NA	NA	9.58695005856862e-65	48573364	48605606
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48591852	48933481	194	184	1.0105	9.58695005856862e-65	48573364	48605606	1.73760411516842e-64	48914655	48953816
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	48936742	60557051	3994	3762	0.6518	1.73760411516842e-64	48914655	48953816	1.05021813041281e-08	60553440	60557051
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60559058	60561656	3	3	-0.3793	1.05021813041281e-08	60553440	60557051	7.89008252218786e-07	60561656	60563885
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	60562422	62419534	804	748	0.676	7.89008252218786e-07	60561656	60563885	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10022306	10	9	-0.1785	NA	NA	NA	1.02441327022478e-06	10004854	10079654
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10057408	10167413	12	11	-0.8094	1.02441327022478e-06	10004854	10079654	1.31941700733804e-25	10167413	10167413
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13342486	1	0	NA	1.31941700733804e-25	10167413	10167413	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13435755	13612839	4	4	0.7187	NA	NA	NA	0.000284692383776062	13600227	13676572
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13615502	13882260	30	29	0.1455	0.000284692383776062	13600227	13676572	1.62927004075992e-12	13879604	13889359
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13889359	13992109	6	6	-0.7149	1.62927004075992e-12	13879604	13889359	3.28128637486557e-176	13956118	13992109
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14047236	36789648	8482	8027	0.2882	3.28128637486557e-176	13956118	13992109	6.89556223913362e-182	36789648	36789648
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36790648	36791668	2	2	1.755	6.89556223913362e-182	36789648	36789648	5.69398556851814e-14	36791668	36791668
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	36792708	46922972	4894	4607	0.2549	5.69398556851814e-14	36791668	36791668	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2823	-0.2485	NA	NA	NA	3.10201633977372e-22	22643742	22677959
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	21	0.3279	3.10201633977372e-22	22643742	22677959	3.04672789325439e-29	22721042	22736990
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	28606054	3216	3043	-0.2715	3.04672789325439e-29	22721042	22736990	2.06688497497051e-11	28604329	28618618
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28610900	28627112	9	9	-0.8532	2.06688497497051e-11	28604329	28618618	6.6445206414285e-11	28613000	28630731
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28628752	29306862	383	355	-0.246	6.6445206414285e-11	28613000	28630731	2.55922413602886e-07	29305584	29308457
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	29308457	29313676	4	4	0.4815	2.55922413602886e-07	29305584	29308457	1.93235165626898e-08	29311724	29315251
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	29315251	36074159	3276	3094	-0.2603	1.93235165626898e-08	29311724	29315251	7.34251499717373e-07	36071173	36074159
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36075796	36080448	4	4	-0.9328	7.34251499717373e-07	36071173	36074159	1.38462502948013e-05	36080448	36084297
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36082478	37228933	623	592	-0.2561	1.38462502948013e-05	36080448	36084297	1.83254132614103e-13	37228933	37231202
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37231202	37233692	3	3	0.955	1.83254132614103e-13	37228933	37231202	9.464435312351e-17	37232635	37233692
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37234759	40025517	1461	1369	-0.2588	9.464435312351e-17	37232635	37233692	1.36358471601459e-29	40011138	40036168
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40027630	40174196	76	70	0.0807	1.36358471601459e-29	40011138	40036168	2.32425058665292e-32	40167286	40179383
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	40175233	44764113	2269	2145	-0.2857	2.32425058665292e-32	40167286	40179383	2.08017841232620e-35	44759454	44768789
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44765630	44832916	37	34	-0.8312	2.0801784123262e-35	44759454	44768789	1.19474307360315e-30	44828015	44837069
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	44834228	48448446	1689	1596	-0.2914	1.19474307360315e-30	44828015	44837069	7.17118841704582e-09	48448446	48448446
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48451678	48452959	2	2	0.912	7.17118841704582e-09	48448446	48448446	1.60874506874417e-06	48452959	48455492
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48455492	49571068	500	469	-0.2439	1.60874506874417e-06	48452959	48455492	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	5	-0.2046	NA	NA	NA	8.83238057002173e-14	94062	94062
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-2.3498	8.83238057002173e-14	94062	94062	3.55158965484984e-27	104732	104732
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	1431411	776	742	-0.7553	3.55158965484984e-27	104732	104732	1.9558076118529e-07	1431411	1431411
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1432891	1432953	2	2	-2.336	1.9558076118529e-07	1431411	1431411	1.90545428864711e-10	1432953	1432953
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	1522369	58	52	-0.6388	1.90545428864711e-10	1432953	1432953	3.40911199172258e-07	1521019	1522369
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1522391	1526804	3	3	-1.7867	3.40911199172258e-07	1521019	1522369	1.81368632287385e-28	1526804	1526804
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1528179	1528282	2	2	-0.0585	1.81368632287385e-28	1526804	1526804	1.08115198053483e-36	1528282	1528282
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1529356	1530474	4	4	-1.7882	1.08115198053483e-36	1528282	1528282	1.09183528460112e-06	1530474	1533546
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1533361	2375499	623	591	-0.8333	1.09183528460112e-06	1530474	1533546	1.10131033408845e-07	2354920	2387756
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2376763	2418980	50	49	-1.1367	1.10131033408845e-07	2354920	2387756	4.74361572517709e-07	2409743	2435595
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2419541	2419541	1	0	NA	4.74361572517709e-07	2409743	2435595	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2421183	2708291	261	250	-0.8193	NA	NA	NA	0	2708113	2708291
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1686	0.1178	0	2708113	2708291	3.40419221125611e-08	8446489	8461739
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8475091	9	9	-0.3988	3.40419221125611e-08	8446489	8461739	1.31593751643138e-10	8463131	8481280
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8477126	32633018	9726	9182	0.138	1.31593751643138e-10	8463131	8481280	1.21008636519096e-110	32629239	32635921
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32634709	32634709	1	0	NA	1.21008636519096e-110	32629239	32635921	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32635921	32795827	79	72	0.734	NA	NA	NA	5.80551562809815e-110	32793793	32801911
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32800133	32800133	1	0	NA	5.80551562809815e-110	32793793	32801911	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32801911	39850072	2168	2054	0.1304	NA	NA	NA	3.45596369827724e-14	39850072	39850072
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	39852030	39853092	2	2	1.4356	3.45596369827724e-14	39850072	39850072	1.79893900554298e-12	39853092	39853092
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	39854597	76998610	9162	8629	0.1463	1.79893900554298e-12	39853092	39853092	1.31945784381626e-44	76998610	76998610
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.5369	1.31945784381626e-44	76998610	76998610	6.81519927178744e-48	77010018	77010018
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	154582414	22193	20965	0.1436	6.81519927178744e-48	77010018	77010018	0	154582414	154586690
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	192	-0.8189	0	154582414	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	4174561	129	125	-3.8512	NA	NA	NA	7.24432827771498e-09	3772482	4421500
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	4272867	5593746	11	11	-2.0094	7.24432827771498e-09	3772482	4421500	7.5328132510525e-06	4948824	6696721
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6951372	117	110	-3.7415	7.5328132510525e-06	4948824	6696721	0.000215781233983994	6894430	7041712
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6953343	8043008	344	325	-3.1816	0.000215781233983994	6894430	7041712	2.01273862443572e-07	7785973	8193270
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8047462	8047462	1	0	NA	2.01273862443572e-07	7785973	8193270	NA	NA	NA
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8048263	10512616	362	344	-3.6526	NA	NA	NA	8.45530373096976e-23	10506718	10537808
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10513747	11698871	20	19	-1.3732	8.45530373096976e-23	10506718	10537808	1.04352486599930e-07	10655750	12452734
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12452734	12536761	10	8	-4.4225	1.0435248659993e-07	10655750	12452734	4.75391979738298e-05	12533900	12546917
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	56	-2.5323	4.75391979738298e-05	12533900	12546917	5.39032629420411e-05	12618263	12741404
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12890628	43	42	-3.563	5.39032629420411e-05	12618263	12741404	1.20552407743923e-06	12863434	12924438
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12898049	13133803	94	90	-2.5489	1.20552407743923e-06	12863434	12924438	1.46896200900481e-19	13106723	13149825
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13136828	13898474	272	257	-3.635	1.46896200900481e-19	13106723	13149825	1.26075028870823e-05	13751402	13979944
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13903405	14342834	135	124	-4.1375	1.26075028870823e-05	13751402	13979944	5.09568488606069e-16	14328579	14372581
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14694578	140	132	-3.1199	5.09568488606069e-16	14328579	14372581	1.62553806247954e-05	14549297	14729413
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14695441	15208612	135	130	-3.735	1.62553806247954e-05	14549297	14729413	3.21846007059868e-05	15201695	15222741
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15209166	15244060	12	11	-2.3278	3.21846007059868e-05	15201695	15222741	1.19295660404988e-05	15227049	15252823
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15244992	15468160	146	139	-3.9076	1.19295660404988e-05	15227049	15252823	9.75325680518322e-06	15433122	15519963
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15469100	15587741	52	47	-3.0481	9.75325680518322e-06	15433122	15519963	1.39725400685406e-05	15552815	15639408
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15915466	54	47	-4.0251	1.39725400685406e-05	15552815	15639408	4.11169422590385e-09	15873423	15937162
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	15979526	21	20	-2.6524	4.11169422590385e-09	15873423	15937162	0.00316100156422261	15958396	16027648
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15980898	16163786	73	68	-3.5034	0.00316100156422261	15958396	16027648	0.0222580882713725	16083793	16169603
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16165328	16177411	10	10	-2.5313	0.0222580882713725	16083793	16169603	0.000215298921204587	16173830	16194420
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16178192	19610243	435	417	-3.8193	0.000215298921204587	16173830	16194420	2.93197312024956e-06	19608039	19610243
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.2084	2.93197312024956e-06	19608039	19610243	3.6643535668018e-06	19613864	19614809
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	22139807	559	530	-3.7381	3.6643535668018e-06	19613864	19614809	4.92970219751304e-07	22052726	22158616
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	8	-1.8426	4.92970219751304e-07	22052726	22158616	4.76876780956471e-10	22175425	22179794
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	85	-3.9263	4.76876780956471e-10	22175425	22179794	5.8971804102589e-66	22926726	25737663
MSK_252152911457_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	84	-1.2681	5.8971804102589e-66	22926726	25737663	NA	NA	NA
