Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	72537426	27894	27444	0.0047	NA	NA	NA	1.01495941904088e-09	72533804	72545984
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.4426	1.01495941904088e-09	72533804	72545984	1.82327980657260e-10	72567555	72610316
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	146297175	16261	16028	-0.0039	1.8232798065726e-10	72567555	72610316	2.33878046586090e-17	146279228	147313991
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147203277	147644831	38	37	-0.3525	2.3387804658609e-17	146279228	147313991	4.06262355612519e-19	147490553	148088285
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147847659	150839754	1261	1244	-0.0042	4.06262355612519e-19	147490553	148088285	7.81002392586368e-38	150839754	150839754
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-1.4715	7.81002392586368e-38	150839754	150839754	5.02995031589843e-26	150846148	150846148
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150847304	1	0	NA	5.02995031589843e-26	150846148	150846148	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150848509	151026228	80	79	0.0075	NA	NA	NA	5.83837473705127e-13	151024118	151026228
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151028700	151036435	4	4	0.9592	5.83837473705127e-13	151024118	151026228	1.06803146992862e-13	151036435	151038091
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	151038091	157133150	2679	2643	0.0065	1.06803146992862e-13	151036435	151038091	7.43744544053958e-14	157133150	157133150
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.3507	7.43744544053958e-14	157133150	157133150	9.61220392820997e-14	157136342	157136342
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4044	-0.0052	9.61220392820997e-14	157136342	157136342	1.53680457063975e-08	167477428	167483267
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5306	1.53680457063975e-08	167477428	167483267	1.53099850066217e-12	167507898	167525669
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	247186514	28794	28326	-9e-04	1.53099850066217e-12	167507898	167525669	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	33076512	10876	10713	0.003	NA	NA	NA	3.07425477124861e-33	33076512	33076512
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	-2.0528	3.07425477124861e-33	33076512	33076512	2.43496865132829e-33	33080437	33080437
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	632	0.006	2.43496865132829e-33	33080437	33080437	1.24114730696777e-07	34524344	34556434
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34582272	16	15	0.3761	1.24114730696777e-07	34524344	34556434	1.82925772749667e-07	34575366	34597294
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34583814	35821494	486	477	0.0064	1.82925772749667e-07	34575366	34597294	8.96415637073013e-14	35821494	35821494
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35841255	35844884	2	2	1.3592	8.96415637073013e-14	35821494	35821494	1.56267399043968e-14	35844884	35844884
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	52600588	6706	6598	-0.0096	1.56267399043968e-14	35844884	35844884	8.56067245133407e-14	52588009	52600588
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	4	0.9342	8.56067245133407e-14	52588009	52600588	1.74943537701975e-13	52635695	52639605
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	106244482	15173	14947	-0.0034	1.74943537701975e-13	52635695	52639605	1.18156853999206e-15	106244482	106244482
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106247167	106250718	2	2	-1.4262	1.18156853999206e-15	106244482	106244482	3.37459664159905e-15	106250718	106250718
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	106253229	242689978	43915	43235	-5e-04	3.37459664159905e-15	106250718	106250718	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	47460892	16218	15979	5e-04	NA	NA	NA	5.73352743743759e-08	47460892	47460892
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.0326	5.73352743743759e-08	47460892	47460892	1.08620693452106e-07	47466921	47469018
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	133189686	27489	27077	-2e-04	1.08620693452106e-07	47466921	47469018	4.07082281536969e-18	133189686	133189686
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.5306	4.07082281536969e-18	133189686	133189686	4.21746282971759e-18	133194685	133194685
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	164005577	9780	9623	-0.001	4.21746282971759e-18	133194685	133194685	6.62403435279813e-37	164005577	164009321
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.3696	6.62403435279813e-37	164005577	164009321	1.37999935471156e-36	164023502	164027724
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	174730888	3374	3297	-0.0067	1.37999935471156e-36	164023502	164027724	1.63794816189689e-08	174711559	174741344
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174732977	174772331	20	18	0.352	1.63794816189689e-08	174711559	174741344	4.31026094704564e-09	174764036	174785195
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	174775059	194358882	6757	6655	-0.0128	4.31026094704564e-09	174764036	174785195	2.36039586113379e-07	194353315	194358882
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194360242	194366950	5	5	0.6136	2.36039586113379e-07	194353315	194358882	3.44626032966686e-07	194366950	194371608
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	199329592	1980	1947	-0.0093	3.44626032966686e-07	194366950	194371608	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	9815760	3393	3343	0.0199	NA	NA	NA	2.56907830883211e-123	9815760	9815760
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-2.8009	2.56907830883211e-123	9815760	9815760	1.02623045337566e-126	9842644	9842644
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	57827493	12808	12608	-0.0072	1.02623045337566e-126	9842644	9842644	6.1314370189469e-70	57802270	57845040
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57840344	58260342	73	73	0.4812	6.1314370189469e-70	57802270	57845040	3.73145619050622e-68	58244898	58299208
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	58269905	173224400	33362	32862	-0.0033	3.73145619050622e-68	58244898	58299208	1.30312574794748e-39	173224400	173224400
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	-2.2437	1.30312574794748e-39	173224400	173224400	1.82918746819875e-40	173228860	173228860
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	187330240	4276	4211	-0.0061	1.82918746819875e-40	173228860	173228860	1.23519178494871e-13	187330240	187330240
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	-1.3284	1.23519178494871e-13	187330240	187330240	7.77630862969898e-13	187333619	187333619
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1220	-0.0171	7.77630862969898e-13	187333619	187333619	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	737829	222	221	0.03	NA	NA	NA	8.29340126459373e-08	729262	737829
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	776194	829954	6	5	0.6608	8.29340126459373e-08	729262	737829	3.81565499277520e-08	829954	870657
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	25847072	7257	7154	0.001	3.8156549927752e-08	829954	870657	2.86588315007423e-09	25847072	25847072
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	25858052	25864991	2	2	-1.1074	2.86588315007423e-09	25847072	25847072	5.73379945187802e-09	25864991	25864991
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	25875387	140193383	32587	32100	-0.0067	5.73379945187802e-09	25864991	25864991	7.86622931719782e-24	140190643	140195260
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140195260	140207585	8	8	-0.874	7.86622931719782e-24	140190643	140195260	2.34552064990794e-25	140204823	140209312
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	140209312	155405839	5401	5309	0.0036	2.34552064990794e-25	140204823	140209312	1.29637507769015e-07	155404062	155405839
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155416484	2	2	-0.9828	1.29637507769015e-07	155404062	155405839	1.83244397297530e-07	155416484	155418745
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155418745	180644810	8281	8160	0.0014	1.8324439729753e-07	155416484	155418745	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	54035000	19989	19669	0.0033	NA	NA	NA	5.69344257898768e-100	54035000	54035000
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-2.9062	5.69344257898768e-100	54035000	54035000	1.69363350600197e-99	54042734	54042734
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	72919733	4535	4474	-0.0056	1.69363350600197e-99	54042734	54042734	5.26943339969743e-62	72919733	72919733
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72920894	72924440	3	3	-2.3065	5.26943339969743e-62	72919733	72919733	5.23197606295167e-58	72924440	72924440
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	72931542	74762234	774	761	-0.0027	5.23197606295167e-58	72924440	72924440	6.74208228810178e-06	74757796	74762234
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74766480	74773321	5	5	0.5644	6.74208228810178e-06	74757796	74762234	5.06428158543422e-06	74773321	74784318
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	74780074	79024557	1116	1102	-9e-04	5.06428158543422e-06	74773321	74784318	9.61958964426447e-09	79008946	79024557
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79028813	79091850	12	11	-0.4561	9.61958964426447e-09	79008946	79024557	2.67723797934053e-08	79091850	79105311
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6657	-0.0075	2.67723797934053e-08	79091850	79105311	1.68370829896369e-56	103841482	103841482
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	3	-2.1792	1.68370829896369e-56	103841482	103841482	7.30195986180226e-57	103868154	103868154
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	139643729	12380	12199	-0.0063	7.30195986180226e-57	103868154	103868154	6.98611297522229e-08	139641158	139643729
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	0.8353	6.98611297522229e-08	139641158	139643729	1.39839274544668e-07	139648318	139651247
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	170753106	10531	10371	-0.0048	1.39839274544668e-07	139648318	139651247	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	244720	40	40	0.0481	NA	NA	NA	4.22082943016577e-21	244720	244720
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	246786	254342	5	5	-0.8853	4.22082943016577e-21	244720	244720	1.80401119940886e-15	254342	256802
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	256802	1036135	213	209	0.0353	1.80401119940886e-15	254342	256802	4.45979815143292e-13	1036135	1036135
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1047707	4	4	-0.9175	4.45979815143292e-13	1036135	1036135	9.59935019335133e-13	1047707	1049599
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	38254010	13336	13135	0.001	9.59935019335133e-13	1047707	1049599	4.90897707809937e-12	38229583	38280664
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38257171	38372692	49	49	0.2569	4.90897707809937e-12	38229583	38280664	5.9927989662653e-12	38332055	38390271
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38375502	125831554	28791	28356	-8e-04	5.9927989662653e-12	38332055	38390271	9.22721149746264e-17	125831554	125831554
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.2178	9.22721149746264e-17	125831554	125831554	1.36379413428041e-17	125837524	125837524
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	133433384	3654	3603	0.0079	1.36379413428041e-17	125837524	125837524	1.20276332449539e-16	133432281	133437464
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	8	0.7304	1.20276332449539e-16	133432281	133437464	2.51172091142102e-17	133444486	133453811
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141409512	3699	3658	-0.0091	2.51172091142102e-17	133444486	133453811	4.5041119335255e-11	141405145	141413352
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141438504	14	12	0.4776	4.5041119335255e-11	141405145	141413352	2.34680168681225e-09	141434131	141446728
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	153134693	4552	4491	0.0014	2.34680168681225e-09	141434131	141446728	1.22762203098011e-07	153134693	153134693
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	153144321	153158956	2	2	-1.0587	1.22762203098011e-07	153134693	153134693	4.5346016995027e-08	153158956	153165600
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	153165600	158821263	2325	2295	0.0069	4.5346016995027e-08	153158956	153165600	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	118	0.0063	NA	NA	NA	9.58721810670988e-09	579405	581533
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-1.2345	9.58721810670988e-09	579405	581533	5.45311179523286e-10	588865	588865
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	2234351	616	611	0.0109	5.45311179523286e-10	588865	588865	1.36010571387314e-06	2229727	2234351
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2242849	2251011	4	4	-0.704	1.36010571387314e-06	2229727	2234351	4.00814069982866e-07	2251011	2257255
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2257255	7156900	1651	1622	-0.0073	4.00814069982866e-07	2251011	2257255	2.44596751813865e-29	6926661	7226901
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7226901	7824059	9	9	-0.9321	2.44596751813865e-29	6926661	7226901	6.56245367262077e-30	7790934	7824059
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5666	0.0013	6.56245367262077e-30	7790934	7824059	1.21534134521788e-15	25120552	25120552
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	1.21534134521788e-15	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-1.442	NA	NA	NA	1.65282477668132e-15	25125700	25125700
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	40892587	5412	5340	-0.0042	1.65282477668132e-15	25125700	25125700	1.19025045578424e-10	40888127	40892587
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40895468	40897469	2	2	1.1978	1.19025045578424e-10	40888127	40892587	1.27232646078415e-10	40897469	40897469
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	40904488	146264846	30990	30514	-0.0022	1.27232646078415e-10	40897469	40897469	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7725	-0.0017	NA	NA	NA	6.04979557681474e-08	22473542	22477358
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	1.0285	6.04979557681474e-08	22473542	22477358	3.50071907396538e-08	22492603	22499541
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	70926188	5233	5150	-5e-04	3.50071907396538e-08	22492603	22499541	3.08529100254719e-22	70926188	70926188
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	1.6585	3.08529100254719e-22	70926188	70926188	7.35416266592169e-22	70930528	70930528
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	86960197	5360	5268	-0.0067	7.35416266592169e-22	70930528	70930528	9.84601262269772e-08	86956605	86960197
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86962617	86965458	2	2	1.0079	9.84601262269772e-08	86956605	86960197	1.41933662702577e-07	86965458	86968271
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	86968271	116124007	10106	9951	-0.0064	1.41933662702577e-07	86965458	86968271	9.75266519387273e-10	116124007	116124007
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	-1.1451	9.75266519387273e-10	116124007	116124007	8.34096606910803e-10	116130333	116130333
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	137352394	8295	8172	0.0058	8.34096606910803e-10	116130333	116130333	4.3148649193494e-15	137352394	137352394
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.417	4.3148649193494e-15	137352394	137352394	1.41343663582396e-12	137356880	137356880
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1084	-0.0011	1.41343663582396e-12	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	27038538	9729	9588	-0.0129	NA	NA	NA	4.51143901217468e-106	27038538	27038538
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	-3.6195	4.51143901217468e-106	27038538	27038538	6.2333365353172e-104	27041812	27041812
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	70949263	11944	11778	-0.011	6.2333365353172e-104	27041812	27041812	5.51765526130031e-11	70947915	70949263
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.8661	5.51765526130031e-11	70947915	70949263	4.70229039208658e-11	70960187	70964344
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2872	0.0079	4.70229039208658e-11	70960187	70964344	4.36789595237274e-13	77917893	77917893
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-1.3339	4.36789595237274e-13	77917893	77917893	1.38762043418552e-13	77928669	77928669
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	135285645	20214	19881	0.0046	1.38762043418552e-13	77928669	77928669	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	55123719	16906	16652	0.0046	NA	NA	NA	1.36020774426948e-26	55112618	55129329
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55205278	36	36	0.4415	1.36020774426948e-26	55112618	55129329	6.84980489069206e-27	55200744	55217189
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55207305	134450318	28362	27934	0.0037	6.84980489069206e-27	55200744	55217189	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	293	0.0406	NA	NA	NA	3.53202606718185e-10	734832	736988
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	741193	3	3	-0.8992	3.53202606718185e-10	734832	736988	4.52012290339484e-09	741193	743223
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	743223	9523923	3443	3393	0.0084	4.52012290339484e-09	741193	743223	4.83170585199102e-46	9523923	9543817
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9599999	13	13	0.9745	4.83170585199102e-46	9523923	9543817	4.59419297136877e-48	9582696	9604633
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9604633	132289090	41406	40757	-0.0021	4.59419297136877e-48	9582696	9604633	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	19313579	306	299	-0.0389	NA	NA	NA	6.09035345624274e-17	19311820	19317333
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19317333	19343261	12	12	0.5877	6.09035345624274e-17	19311820	19317333	1.22180113061295e-15	19340824	19355808
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	19346267	37953582	7020	6919	-0.0015	1.22180113061295e-15	19340824	19355808	3.2928811195847e-11	37953582	37953582
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	1.2299	3.2928811195847e-11	37953582	37953582	1.57928525831655e-11	37957844	37957844
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	71375082	10323	10133	-0.0067	1.57928525831655e-11	37957844	37957844	1.99161254817955e-33	71375082	71375082
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-2.0735	1.99161254817955e-33	71375082	71375082	2.5581021251589e-33	71377671	71377671
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	89659397	4628	4555	-0.0028	2.5581021251589e-33	71377671	71377671	7.42340807259276e-16	89659397	89659397
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89661345	89662326	2	2	-1.4418	7.42340807259276e-16	89659397	89659397	1.57608220360159e-15	89662326	89662326
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	89663261	114123340	9349	9227	-0.0012	1.57608220360159e-15	89662326	89662326	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	57	-0.7105	NA	NA	NA	9.261796055674e-104	19492531	19497023
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21552515	1004	992	-0.0043	9.261796055674e-104	19492531	19497023	4.99246383039741e-42	21528132	21575909
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21553669	22052799	250	247	0.2267	4.99246383039741e-42	21528132	21575909	3.82108450520931e-46	22035729	22071780
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22054604	31663852	3119	3071	0.0025	3.82108450520931e-46	22035729	22071780	1.06007439023521e-08	31663852	31663852
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	31667913	31668521	2	2	-1.0699	1.06007439023521e-08	31663852	31663852	1.63271445179724e-09	31668521	31668521
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	31673219	34674458	1315	1296	-0.0075	1.63271445179724e-09	31668521	31668521	7.03391023185617e-19	34674458	34674458
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1996	7.03391023185617e-19	34674458	34674458	1.47330579512423e-16	34683810	34683810
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	72595934	13431	13223	-0.0086	1.47330579512423e-16	34683810	34683810	7.59562929955097e-08	72595934	72595934
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72597009	72598971	2	2	-1.0529	7.59562929955097e-08	72595934	72595934	3.38521117068094e-08	72598971	72598971
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72600731	105597555	12456	12273	0.0013	3.38521117068094e-08	72598971	72598971	3.45097709760079e-247	105597555	105602602
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105625010	10	10	-2.4898	3.45097709760079e-247	105597555	105602602	1.75256375167152e-100	105623070	105625010
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105630089	106358491	233	231	0.0576	1.75256375167152e-100	105623070	105625010	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.2242	NA	NA	NA	6.21030526553724e-11	18450562	18692865
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19845942	105	104	-0.5471	6.21030526553724e-11	18450562	18692865	5.21513710499921e-07	19430207	19935729
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	20079935	45	45	-0.3115	5.21513710499921e-07	19430207	19935729	5.42722825765567e-16	20029653	20335887
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20088256	32514939	3673	3605	-0.0048	5.42722825765567e-16	20029653	20335887	5.11298840231751e-46	32456500	32520164
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32517839	32594200	24	23	-0.7275	5.11298840231751e-46	32456500	32520164	3.28122925669853e-20	32583146	32664506
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32661846	32661846	1	0	NA	3.28122925669853e-20	32583146	32664506	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32664506	32714483	18	17	0.0664	NA	NA	NA	6.54792777088458e-35	32708977	32714483
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32721469	32762005	8	8	-0.8948	6.54792777088458e-35	32708977	32714483	3.62971776347988e-25	32762005	32772265
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	32772265	74669752	17832	17565	-0.0048	3.62971776347988e-25	32762005	32772265	1.08065498457463e-26	74669752	74669752
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	1.2903	1.08065498457463e-26	74669752	74669752	2.35125779947107e-26	74680439	74680439
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	100298352	9607	9453	0.0027	2.35125779947107e-26	74680439	74680439	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	34317157	10707	10545	0	NA	NA	NA	4.38732236908393e-38	34302966	34339543
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34325501	34602318	52	51	0.4381	4.38732236908393e-38	34302966	34339543	3.82160286367476e-40	34584793	34621068
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34617260	75093957	9764	9615	-0.0049	3.82160286367476e-40	34584793	34621068	1.24980744789647e-54	75093957	75093957
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	2.1142	1.24980744789647e-54	75093957	75093957	5.36712329992555e-53	75100865	75100865
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	591	-0.0226	5.36712329992555e-53	75100865	75100865	5.21648746854135e-21	76923844	76929598
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76942679	9	9	0.7654	5.21648746854135e-21	76923844	76929598	1.04411029779763e-19	76940218	76944661
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76944661	88304997	4341	4272	0.0109	1.04411029779763e-19	76940218	76944661	1.14928213024372e-09	88301288	88304997
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88306383	88306383	1	0	NA	1.14928213024372e-09	88301288	88304997	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88308291	88312934	3	3	-0.9168	NA	NA	NA	1.36556914092598e-08	88312934	88313418
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	88313418	88690571	167	167	-0.0084	1.36556914092598e-08	88312934	88313418	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	32828797	12421	12231	5e-04	NA	NA	NA	2.22300853933100e-15	32828797	32828797
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-1.4239	2.223008539331e-15	32828797	32828797	2.93347281062288e-15	32832642	32832642
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1427	-0.0052	2.93347281062288e-15	32832642	32832642	2.00869599872815e-16	36672710	36675987
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	0.842	2.00869599872815e-16	36672710	36675987	7.4112550421552e-17	36683509	36686013
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	58435991	7989	7865	7e-04	7.4112550421552e-17	36683509	36686013	1.17789522356310e-06	58427073	58435991
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58439971	58452260	7	7	0.5044	1.1778952235631e-06	58427073	58435991	5.06445601912542e-06	58452260	58462084
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	58454995	78653545	7761	7636	0.0075	5.06445601912542e-06	58452260	58462084	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	76113758	22963	22609	-0.0055	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	76116026	76116026	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	19694025	9027	8912	0	NA	NA	NA	3.02278179562137e-136	19694025	19694025
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19699024	19700620	3	3	-3.4081	3.02278179562137e-136	19694025	19694025	6.74316510020778e-135	19700620	19700620
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	19702214	63788698	14029	13812	0.003	6.74316510020778e-135	19700620	19700620	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1515948	588	578	0.0108	NA	NA	NA	2.92900066425446e-66	1515948	1521410
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1516966	1531162	7	7	-1.7069	2.92900066425446e-66	1515948	1521410	5.15089673224237e-81	1523000	1531162
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	28266113	8457	8316	0.0034	5.15089673224237e-81	1523000	1531162	3.09604414227398e-17	26156026	29321251
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	29485595	70	66	0.2639	3.09604414227398e-17	26156026	29321251	2.35080874897324e-16	29459563	29506631
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29486799	52080395	8719	8588	0.0086	2.35080874897324e-16	29459563	29506631	4.95167501182898e-11	52078884	52080395
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52081719	52090393	5	5	-0.7574	4.95167501182898e-11	52078884	52080395	1.7286195537075e-10	52090393	52092989
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	52092989	62419534	3733	3680	0.0158	1.7286195537075e-10	52090393	52092989	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	46922972	13441	13224	-9e-04	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	22667608	2983	2925	0.0167	NA	NA	NA	8.19912470995215e-289	22667608	22679305
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	20	-2.0282	8.19912470995215e-289	22667608	22679305	4.81679420100006e-319	22720195	22725305
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	49571068	13552	13353	0.0051	4.81679420100006e-319	22720195	22725305	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	106242	14	14	0.3301	NA	NA	NA	2.11763104677854e-05	99430	106242
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	108902	1	0	NA	2.11763104677854e-05	99430	106242	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	109064	124528	14	14	-0.1107	NA	NA	NA	7.30501236694836e-15	122273	127113
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-1.0688	7.30501236694836e-15	122273	127113	5.25968051728753e-19	129544	130528
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	1427392	753	738	-0.0706	5.25968051728753e-19	129544	130528	4.8286118738438e-14	1427392	1431240
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-1.038	4.8286118738438e-14	1427392	1431240	3.13258871069964e-13	1432891	1434970
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2302065	609	599	-0.0479	3.13258871069964e-13	1432891	1434970	8.53209720507497e-17	2301365	2302065
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303192	2304398	4	4	1.0581	8.53209720507497e-17	2301365	2302065	5.65613382763467e-19	2304398	2304398
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2708291	389	384	-0.0817	5.65613382763467e-19	2304398	2304398	0	2708113	2711273
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	154442377	45102	44404	0.9293	0	2708113	2711273	1.89671677402608e-40	154442377	154442377
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	4	2.8627	1.89671677402608e-40	154442377	154442377	9.18152473535683e-29	154450309	154450309
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	28	0.9622	9.18152473535683e-29	154450309	154450309	1.23632487006967e-84	154578922	154586690
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	198	-0.0431	1.23632487006967e-84	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3733715	124	123	-2.6139	NA	NA	NA	4.94999403014211e-12	2973379	3772482
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	15	-0.8069	4.94999403014211e-12	2973379	3772482	8.30244397043254e-09	5531459	6696721
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	6973086	132	127	-2.6255	8.30244397043254e-09	5531459	6696721	2.78787338546525e-09	6940618	7021965
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6983447	7652302	201	196	-1.8141	2.78787338546525e-09	6940618	7021965	2.19185552706706e-08	7625006	7663037
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7653082	7709619	36	36	-3.0372	2.19185552706706e-08	7625006	7663037	4.81957445656789e-05	7693377	7734410
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7711759	8005148	88	87	-2.031	4.81957445656789e-05	7693377	7734410	3.85220591822037e-06	7926989	8069958
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8010446	8289709	64	63	-2.9027	3.85220591822037e-06	7926989	8069958	0.000666262001651419	8204414	8327467
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8292347	8463583	40	40	-2.1202	0.000666262001651419	8204414	8327467	0.000474653427729468	8437780	8463583
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8474062	8493370	5	5	-3.943	0.000474653427729468	8437780	8463583	3.39192224771742e-09	8493370	8498306
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8498306	8697715	73	73	-2.0203	3.39192224771742e-09	8493370	8498306	2.89695494033093e-06	8681965	8770463
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	10513747	186	185	-2.6998	2.89695494033093e-06	8681965	8770463	1.52183789569769e-14	10506718	10535786
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10515697	12452734	20	18	-0.7407	1.52183789569769e-14	10506718	10535786	1.07911023113264e-17	11673476	12452734
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12536761	9	9	-3.4188	1.07911023113264e-17	11673476	12452734	4.21044930377214e-20	12536761	12537944
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12537944	12682301	56	53	-1.1721	4.21044930377214e-20	12536761	12537944	9.40765501490992e-17	12679146	12700767
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12804329	19	18	-3.0435	9.40765501490992e-17	12679146	12700767	1.26285557176423e-06	12764220	12845704
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12809152	13128515	116	115	-1.5822	1.26285557176423e-06	12764220	12845704	2.34270787565252e-18	13090512	13151875
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	14352278	412	405	-2.5298	2.34270787565252e-18	13090512	13151875	0.20327048982356	14013053	14464288
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14353244	14508894	94	93	-2.2378	0.20327048982356	14013053	14464288	5.92360526135154e-05	14494397	14547168
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	25	-1.2189	5.92360526135154e-05	14494397	14547168	3.19503530476897e-05	14549297	14687556
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14581797	1	0	NA	3.19503530476897e-05	14549297	14687556	NA	NA	NA
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14585542	16182565	524	515	-2.2717	NA	NA	NA	2.22399860739653e-05	15975479	16631496
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16183348	22182080	1005	985	-2.5636	2.22399860739653e-05	15975479	16631496	5.08208096031142e-07	22166564	22202315
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22192409	22308420	26	26	-3.7779	5.08208096031142e-07	22166564	22202315	1.95127789752057e-10	22261337	22379285
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22367156	22877495	45	44	-2.4515	1.95127789752057e-10	22261337	22379285	1.53871866492997e-06	22868395	22880349
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22914005	10	10	-3.9473	1.53871866492997e-06	22868395	22880349	9.41445611185934e-10	22911915	22915679
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22915679	26870361	11	11	-2.1886	9.41445611185934e-10	22911915	22915679	7.5765520290344e-13	23283689	26871442
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26871442	26945893	30	29	-0.8293	7.5765520290344e-13	23283689	26871442	1.19895691317591e-05	26943701	27000085
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	27039222	21	21	-1.9851	1.19895691317591e-05	26943701	27000085	9.01486255891925e-06	27007874	27053237
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27053237	27137064	16	16	-0.4757	9.01486255891925e-06	27007874	27053237	4.73791177519213e-08	27131764	27167148
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27163598	27176933	5	5	-2.4732	4.73791177519213e-08	27131764	27167148	1.01250692495198e-10	27171797	27176933
MSK_252152911888_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	27188740	57440809	11	11	-0.26	1.01250692495198e-10	27171797	27176933	NA	NA	NA
