Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	750051	5	4	0.6474	NA	NA	NA	3.98988629643536e-05	742580	783569
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	756927	1640562	206	197	0.0738	3.98988629643536e-05	742580	783569	1.00955083900278e-07	1640562	1640562
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1652866	1654026	2	2	-1.0313	1.00955083900278e-07	1640562	1640562	1.98698493077495e-10	1654026	1654026
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	1669998	7497200	2056	1974	0.02	1.98698493077495e-10	1654026	1654026	6.46615399113075e-09	7493247	7497200
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	7498827	7503586	4	3	-0.7764	6.46615399113075e-09	7493247	7497200	1.02033709349256e-09	7503586	7503586
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	7507793	16668773	3506	3375	0.0326	1.02033709349256e-09	7503586	7503586	5.46787648930975e-39	16660353	16817525
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16698906	16698906	1	0	NA	5.46787648930975e-39	16660353	16817525	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16704522	17127039	27	26	-0.5142	NA	NA	NA	1.60353951892019e-39	17104345	17148592
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17148592	27964366	4523	4336	0.0259	1.60353951892019e-39	17104345	17148592	1.06286986484102e-06	27961951	27964366
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27966236	27969341	2	2	-0.7939	1.06286986484102e-06	27961951	27964366	1.11464147571786e-06	27969341	27970847
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	27970847	32944977	1794	1704	0.0201	1.11464147571786e-06	27969341	27970847	3.49060945160386e-27	32937810	32950668
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	32947097	33022558	34	34	0.4133	3.49060945160386e-27	32937810	32950668	3.70643075534099e-30	33016019	33026380
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	33024374	39219041	2326	2228	0.0067	3.70643075534099e-30	33016019	33026380	0	39219041	39219041
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	39223103	39348865	50	48	1.4744	0	39219041	39219041	1.36372673826072e-13	39335023	39363401
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	39350138	41377620	945	900	1.1642	1.36372673826072e-13	39335023	39363401	3.00953790998496e-77	41362100	41381829
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	41381070	41736842	128	123	0.6912	3.00953790998496e-77	41362100	41381829	0	41733949	41738882
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	41738882	62976156	8506	8166	0.0086	0	41733949	41738882	9.41820454932387e-21	62966057	62985147
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62985147	63036818	18	17	0.4697	9.41820454932387e-21	62966057	62985147	1.29811404377710e-23	63035470	63041994
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	63038273	72158657	3560	3424	0.0048	1.2981140437771e-23	63035470	63041994	1.06481889765875e-15	72152880	72160858
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72160858	72183120	15	15	0.4102	1.06481889765875e-15	72152880	72160858	1.19205882840758e-12	72180472	72192490
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72186295	72537426	186	179	0.0322	1.19205882840758e-12	72180472	72192490	1.50660159850556e-205	72537426	72539143
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72574479	13	13	-2.0353	1.50660159850556e-205	72537426	72539143	0	72571158	72574479
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72579311	108533257	11129	10679	0	0	72571158	72574479	9.3905720154965e-07	108531247	108533257
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-0.6016	9.3905720154965e-07	108531247	108533257	4.90678427498303e-07	108538662	108541074
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	111173447	1056	1006	0.0428	4.90678427498303e-07	108538662	108541074	2.39247101229379e-10	111173447	111173447
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111177741	111177741	1	0	NA	2.39247101229379e-10	111173447	111173447	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111180807	111188857	3	2	-0.9051	NA	NA	NA	3.92358493810147e-10	111188857	111188857
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	111190763	120327958	3328	3181	0.0065	3.92358493810147e-10	111188857	111188857	8.15656685359097e-92	120318165	120361983
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	120329400	144003068	179	172	-0.2937	8.15656685359097e-92	120318165	120361983	6.49123680698931e-80	143923947	144107002
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144093719	144093719	1	0	NA	6.49123680698931e-80	143923947	144107002	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	144099302	150823073	1858	1793	0.0201	NA	NA	NA	1.12583653248798e-144	150823073	150836481
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150851439	10	10	1.7154	1.12583653248798e-144	150823073	150836481	6.53960034463869e-156	150848509	150851439
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2646	0.0245	6.53960034463869e-156	150848509	150851439	1.73527977841091e-14	157133150	157133150
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.1767	1.73527977841091e-14	157133150	157133150	7.11972685996512e-17	157136342	157136342
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3928	0.0093	7.11972685996512e-17	157136342	157136342	3.2195670702829e-12	167479184	167493768
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5097	3.2195670702829e-12	167479184	167493768	8.28590727016426e-12	167507882	167523140
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	200613454	11352	10876	0.011	8.28590727016426e-12	167507882	167523140	3.00553901941356e-13	200602881	200629099
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200616638	200665389	18	18	-0.3406	3.00553901941356e-13	200602881	200629099	2.68932143825694e-13	200646926	200670407
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200667381	213528993	4873	4664	0.0268	2.68932143825694e-13	200646926	200670407	9.79139607156829e-09	213519419	213528993
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	213537746	213549516	3	3	-0.7075	9.79139607156829e-09	213519419	213528993	5.48626396364455e-09	213549516	213561420
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	213561420	217760293	1450	1386	-0.0091	5.48626396364455e-09	213549516	213561420	0	217753917	217764654
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	217764654	218913500	469	449	0.745	0	217753917	217764654	4.15258706430848e-50	218913500	218913500
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	218915674	218921231	5	5	-0.6924	4.15258706430848e-50	218913500	218913500	1.88664483189737e-51	218921231	218921231
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	218923714	223228752	1361	1306	0.7458	1.88664483189737e-51	218921231	218921231	1.24580345857080e-07	223225476	223228752
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	223236750	223236753	2	2	-0.1513	1.2458034585708e-07	223225476	223228752	3.01299598818692e-06	223236753	223255683
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	223255683	231682304	3271	3159	0.7377	3.01299598818692e-06	223236753	223255683	0	231638008	231731865
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	231688928	240485842	3425	3283	0.9861	0	231638008	231731865	2.44000157226211e-23	240468647	240505385
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240489591	240611729	39	36	0.6046	2.44000157226211e-23	240468647	240505385	1.78728788911657e-13	240579429	240619273
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	240614574	241340181	121	119	0.9561	1.78728788911657e-13	240579429	240619273	2.44031208553286e-07	241026683	241388227
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241350083	241442091	35	32	0.6809	2.44031208553286e-07	241026683	241388227	1.53198843035899e-12	241415541	241459225
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	241446026	246467829	2156	2064	0.9896	1.53198843035899e-12	241415541	241459225	1.32293321862105e-14	246440949	246501319
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246469461	246644344	68	62	1.2297	1.32293321862105e-14	246440949	246501319	4.0334930100123e-07	246628657	246676851
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246648963	246769018	21	19	0.8347	4.0334930100123e-07	246628657	246676851	4.85653081010326e-05	246755225	246825991
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246794552	246882156	32	32	1.3081	4.85653081010326e-05	246755225	246825991	9.4399488286902e-10	246853406	246907655
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246902260	247186514	93	87	0.9013	9.4399488286902e-10	246853406	246907655	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	251971	86	83	0.1427	NA	NA	NA	2.03619046574234e-59	250757	256408
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	253125	505516	82	78	0.7134	2.03619046574234e-59	250757	256408	4.56877068180498e-37	485052	521074
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	507974	13430872	4042	3894	0.403	4.56877068180498e-37	485052	521074	5.76791255715836e-12	13430872	13430872
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13444674	13454720	2	2	-0.6998	5.76791255715836e-12	13430872	13430872	4.50889241534566e-12	13454720	13454720
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13461042	33617141	6920	6662	0.4118	4.50889241534566e-12	13454720	13454720	1.37538158988062e-38	33617141	33617141
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33619260	33621111	2	2	-1.5546	1.37538158988062e-38	33617141	33617141	3.54138717554750e-38	33621111	33621111
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33622478	35810125	887	837	0.4037	3.5413871755475e-38	33621111	33621111	2.09064995817141e-09	35808788	35812322
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35812322	35844884	5	4	1.0636	2.09064995817141e-09	35808788	35812322	6.78083520702394e-10	35821494	35853977
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35851593	35851593	1	0	NA	6.78083520702394e-10	35821494	35853977	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	35853977	37800512	880	844	0.417	NA	NA	NA	6.95910384967553e-65	37800512	37810001
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37803744	37855837	24	22	-0.2952	6.95910384967553e-65	37800512	37810001	2.74527252751209e-62	37852371	37858379
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	40071119	1008	960	0.4303	2.74527252751209e-62	37852371	37858379	1.93996211393486e-36	40069308	40076072
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40073351	40161283	37	36	8e-04	1.93996211393486e-36	40069308	40076072	5.34048931274813e-37	40157918	40171186
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	40169150	43315202	1183	1131	0.4266	5.34048931274813e-37	40157918	40171186	8.93756169905329e-11	43313677	43315202
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43317157	43322031	3	3	-0.372	8.93756169905329e-11	43313677	43315202	4.93936874418728e-10	43322031	43324963
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	43324963	52600588	3570	3431	0.4117	4.93936874418728e-10	43322031	43324963	3.89237990455794e-13	52588009	52600588
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	1.1019	3.89237990455794e-13	52588009	52600588	6.53125006617382e-13	52635695	52639605
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	70678332	6046	5815	0.417	6.53125006617382e-13	52635695	52639605	0	70669029	70689139
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	70686076	89890854	5572	5335	0.01	0	70669029	70689139	4.09787273946964e-18	89877995	91057122
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	89902365	94942193	22	22	-0.3633	4.09787273946964e-18	89877995	91057122	4.32670025571070e-18	94930518	94948692
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	94944276	95796016	218	210	0.0396	4.3267002557107e-18	94930518	94948692	8.9666096035304e-09	95796016	95796016
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	95968016	95974614	2	2	-0.8779	8.9666096035304e-09	95796016	95796016	6.24929986455538e-09	95974614	95974614
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	96103035	97092174	390	376	0.0495	6.24929986455538e-09	95974614	95974614	1.15831666614736e-10	97049023	97152330
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97128607	97241094	9	9	-0.4342	1.15831666614736e-10	97049023	97152330	8.52813117621742e-10	97221198	97387672
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	97379946	131976434	9339	8968	0.0033	8.52813117621742e-10	97221198	97387672	1.12719951893741e-11	131907075	132366131
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	131982998	132820205	42	41	-0.22	1.12719951893741e-11	131907075	132366131	5.12373123265049e-13	132763461	132859138
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	132823716	142130941	3254	3120	0.0015	5.12373123265049e-13	132763461	132859138	2.89643851644471e-163	142128898	142140523
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142133825	142133825	1	0	NA	2.89643851644471e-163	142128898	142140523	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142140523	142274277	70	65	-0.6096	NA	NA	NA	9.3768421615574e-163	142268692	142277666
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142275581	142275581	1	0	NA	9.3768421615574e-163	142268692	142277666	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142277666	159980870	5286	5051	-0.0025	NA	NA	NA	1.23565361299832e-304	159974814	159984432
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	159982830	160532902	255	242	0.4357	1.23565361299832e-304	159974814	159984432	2.49741687739440e-283	160526018	160536605
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	160534862	175380892	5341	5122	0.0068	2.4974168773944e-283	160526018	160536605	1.05507701309714e-18	175377936	175380892
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	175382663	175402548	11	11	-0.5054	1.05507701309714e-18	175377936	175380892	9.32005187373303e-20	175402548	175403926
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	175403926	179767214	1686	1603	0.0099	9.32005187373303e-20	175402548	175403926	2.13582955851006e-15	179764646	179767214
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.8823	2.13582955851006e-15	179764646	179767214	9.36339032302596e-17	179778919	179778919
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	180117780	104	101	0.0195	9.36339032302596e-17	179778919	179778919	4.07664116274274e-11	180115198	180117780
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180121271	180129680	6	5	-0.521	4.07664116274274e-11	180115198	180117780	1.18528202971893e-08	180129680	180131608
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	180131608	212890878	10740	10313	0.0147	1.18528202971893e-08	180129680	180131608	6.29314073149038e-53	212890878	212890878
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212892884	212896080	3	3	-1.6388	6.29314073149038e-53	212890878	212890878	2.22409901079783e-48	212896080	212896080
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212898875	212898875	1	0	NA	2.22409901079783e-48	212896080	212896080	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	212900857	242482099	10611	10152	0.0015	NA	NA	NA	6.80073632369624e-13	242449108	242524341
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242483535	242689978	77	74	0.1764	6.80073632369624e-13	242449108	242524341	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	586636	198	192	-0.0369	NA	NA	NA	8.55130063377086e-55	586636	586636
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	589224	635754	12	12	-0.8845	8.55130063377086e-55	586636	586636	2.98199607913237e-57	635754	635754
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	641257	73087449	26002	24853	0.0017	2.98199607913237e-57	635754	635754	2.37415765528003e-64	73084173	73093444
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	73090383	73151695	31	31	-0.5827	2.37415765528003e-64	73084173	73093444	2.25206606555470e-73	73148360	73152880
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	73152880	75479859	633	606	-0.0165	2.2520660655547e-73	73148360	73152880	5.68171753238225e-70	75479859	75787094
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75783255	75875904	18	17	-0.7748	5.68171753238225e-70	75479859	75787094	4.52193528833853e-10	75868882	75875904
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	76066005	16	14	-0.0569	4.52193528833853e-10	75868882	75875904	4.60727744321183e-07	76066005	76066005
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76067455	76077386	5	5	-0.6489	4.60727744321183e-07	76066005	76066005	1.90109543959131e-14	76077386	76080028
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76080028	90391698	3926	3773	-0.0117	1.90109543959131e-14	76077386	76080028	0	90369484	95021157
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	95016192	143427797	16423	15715	0.4089	0	90369484	95021157	0	143417144	143440881
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	143430490	164005577	6227	5976	0.7287	0	143417144	143440881	2.88968319912335e-40	164005577	164005577
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	1.9651	2.88968319912335e-40	164005577	164005577	3.79255470035755e-39	164027724	164027724
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	176192686	3952	3764	0.7308	3.79255470035755e-39	164027724	164027724	0	176187380	176199975
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176194670	185218806	2756	2639	0.4232	0	176187380	176199975	2.41718656732164e-25	185218806	185218806
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	185220747	185231271	6	6	1.2527	2.41718656732164e-25	185218806	185218806	1.83525088636758e-21	185231271	185232794
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	185232794	192546280	2854	2734	0.4143	1.83525088636758e-21	185231271	185232794	1.51171169266738e-92	192546280	192546280
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192552734	4	4	-1.7102	1.51171169266738e-92	192546280	192546280	4.95063066444472e-112	192552734	192552734
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192554451	193939576	448	430	0.4105	4.95063066444472e-112	192552734	192552734	8.53792747827648e-63	193932662	193965578
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	193946257	194354505	130	127	0.7238	8.53792747827648e-63	193932662	193965578	2.72720625735221e-249	194354505	194354505
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194358882	194366950	6	6	-2.8779	2.72720625735221e-249	194354505	194354505	4.65968957620074e-77	194366950	194366950
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194368145	194440077	19	19	0.7866	4.65968957620074e-77	194366950	194366950	7.6297156938835e-12	194431746	194453617
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	194441380	196632196	881	849	0.4294	7.6297156938835e-12	194431746	194453617	6.63446137564857e-58	196628768	196643363
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196638626	196822133	96	94	0.0662	6.63446137564857e-58	196628768	196643363	1.36375499877909e-33	196820428	196822133
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196835413	196929826	21	20	-0.5159	1.36375499877909e-33	196820428	196822133	2.94793583696003e-13	196929826	196942158
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	196961238	10	9	7e-04	2.94793583696003e-13	196929826	196942158	1.86751256928279e-06	196957322	196972067
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196964180	198038358	430	419	0.4232	1.86751256928279e-06	196957322	196972067	2.74589341891532e-11	198038358	198038358
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198041362	198042681	2	2	-0.7497	2.74589341891532e-11	198038358	198038358	6.43739899557988e-12	198042681	198042681
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198044259	199321387	519	495	0.425	6.43739899557988e-12	198042681	198042681	0.0344414380232427	199288161	199321387
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	199324677	199329592	2	2	-0.1006	0.0344414380232427	199288161	199321387	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	4340838	1410	1345	-0.4979	NA	NA	NA	0	4335732	4346821
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	4344128	6350373	814	786	0.0049	0	4335732	4346821	0	6348129	6357708
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	6354720	9815760	1169	1113	-0.4961	0	6348129	6357708	1.96257866378929e-22	9815760	9815760
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-1.7809	1.96257866378929e-22	9815760	9815760	1.13005964523206e-26	9842644	9842644
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	38551267	7315	7005	-0.6235	1.13005964523206e-26	9842644	9842644	5.1249868357128e-209	38545379	38556130
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	38552014	39832665	580	558	-0.3426	5.1249868357128e-209	38545379	38556130	1.15402828734190e-147	39820681	39845818
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	39834522	44438572	1579	1518	-0.6112	1.1540282873419e-147	39820681	39845818	0	44438572	44438572
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	44440378	57375318	3168	3042	1.3449	0	44438572	44438572	3.01142267882951e-10	57373711	57375318
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57375526	57380107	2	2	0.2325	3.01142267882951e-10	57373711	57375318	5.81957118436835e-12	57380107	57381433
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	57381433	65268473	1480	1423	1.3417	5.81957118436835e-12	57380107	57381433	0	65268473	65268473
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	65285245	70150576	1043	995	-0.6214	0	65268473	65268473	1.53186919930593e-09	70108511	70150576
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70190682	1	0	NA	1.53186919930593e-09	70108511	70150576	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70207908	70294312	4	3	-1.4455	NA	NA	NA	4.05195092831790e-31	70294312	70336467
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70336467	107275274	12583	12048	-0.5864	4.0519509283179e-31	70294312	70336467	8.90579558920464e-33	107271000	107276428
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107283257	5	5	0.0034	8.90579558920464e-33	107271000	107276428	9.36374281828828e-10	107281410	107284892
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107284892	107463219	77	71	-0.5049	9.36374281828828e-10	107281410	107284892	1.38814639881119e-05	107455020	107468028
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107464576	107474566	6	6	-0.1661	1.38814639881119e-05	107455020	107468028	4.56396484084449e-06	107471812	107480308
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107476246	108246576	168	157	-0.5507	4.56396484084449e-06	107471812	107480308	1.12129851206819e-64	108246576	108246576
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108254855	108263899	5	5	-1.8968	1.12129851206819e-64	108246576	108246576	2.92350180759100e-51	108263899	108263899
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	108267940	119646260	3429	3267	-0.4983	2.923501807591e-51	108263899	108263899	2.38788666024958e-53	119639713	119649083
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119649083	119700930	16	15	0.3274	2.38788666024958e-53	119639713	119649083	1.86134673287465e-56	119698139	119720703
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119720703	173224400	14782	14120	-0.4944	1.86134673287465e-56	119698139	119720703	3.54453938085919e-37	173224400	173224400
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.3373	3.54453938085919e-37	173224400	173224400	3.68927255561502e-36	173228860	173228860
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	185458816	3492	3327	-0.5069	3.68927255561502e-36	173228860	173228860	8.28646400024978e-64	185455390	185467275
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185467275	185541212	32	32	0.1054	8.28646400024978e-64	185455390	185467275	1.11997681669599e-64	185539205	185543555
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	185543555	190717801	1886	1809	-0.5151	1.11997681669599e-64	185539205	185543555	3.14303264045133e-83	190708316	190730982
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190725579	190921041	64	64	-1.0163	3.14303264045133e-83	190708316	190730982	2.90420645137877e-08	190913517	190927969
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190924564	190953947	9	9	-0.6037	2.90420645137877e-08	190913517	190927969	0.000227541099905464	190953947	190953947
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190958901	190969247	4	3	-0.0158	0.000227541099905464	190953947	190953947	1.20657746926148e-06	190969247	190971283
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	190971283	191153613	32	31	-0.6272	1.20657746926148e-06	190969247	190971283	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	401272	87	85	0.3996	NA	NA	NA	4.21026177662389e-38	376412	412977
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	405222	18906909	5622	5378	0.7101	4.21026177662389e-38	376412	412977	1.49953308130245e-257	18857778	18951215
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	18918837	21480789	643	617	0.4036	1.49953308130245e-257	18857778	18951215	1.69770313299415e-29	21480789	21480789
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21485944	21487474	2	2	-1.0992	1.69770313299415e-29	21480789	21480789	2.44249065417534e-15	21487474	21487474
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21488938	21490654	2	2	0.564	2.44249065417534e-15	21487474	21487474	1.03987350054431e-06	21490654	21493505
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21493505	21606184	16	16	0.0817	1.03987350054431e-06	21490654	21493505	3.69433403860727e-10	21600853	21627340
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	21610433	35874948	3653	3496	0.4131	3.69433403860727e-10	21600853	21627340	0	35872062	35889387
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	35883907	46150784	3102	2972	0.0134	0	35872062	35889387	0	46136065	49595677
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	49595677	85425152	10932	10468	-0.6058	0	46136065	49595677	0	85417629	85432045
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	85432045	126133322	10795	10345	0.003	0	85417629	85432045	1.8771456904576e-19	126127629	126142562
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	126135410	126163062	15	15	-0.4323	1.8771456904576e-19	126127629	126142562	4.81391003829842e-20	126156959	126166350
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	126165119	131246969	1572	1509	0.0137	4.81391003829842e-20	126156959	126166350	0	131244168	131277355
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	131274848	131758309	194	187	0.694	0	131244168	131277355	0	131754612	131761336
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	131761336	137469926	2293	2205	0.0278	0	131754612	131761336	1.19514095567241e-07	137432374	137489561
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137471241	137555450	38	37	0.2226	1.19514095567241e-07	137432374	137489561	1.38806863682772e-07	137538788	137582447
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	137557568	138670435	472	457	0.03	1.38806863682772e-07	137538788	137582447	4.39561765159159e-146	138668688	138674864
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	138672518	138957337	116	111	-0.5051	4.39561765159159e-146	138668688	138674864	1.04098408006459e-184	138953788	138959960
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	138959960	155405839	5929	5683	0.0165	1.04098408006459e-184	138953788	138959960	1.29561642475385e-06	155401645	155405839
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155420791	4	4	-0.5197	1.29561642475385e-06	155401645	155405839	1.09463419115048e-06	155420791	155427589
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155421443	172210304	5423	5197	0.0121	1.09463419115048e-06	155420791	155427589	1.76964642126808e-11	172188366	172225670
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172211543	172290572	39	36	0.2413	1.76964642126808e-11	172188366	172225670	1.31492861775161e-08	172271626	172315915
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	172293520	178040439	1787	1722	0.0184	1.31492861775161e-08	172271626	172315915	7.52999571884286e-09	178037603	178040439
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	0.9679	7.52999571884286e-09	178037603	178040439	2.45686899669108e-07	178045608	178047480
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	178865892	326	315	0.0263	2.45686899669108e-07	178045608	178047480	1.62601260562832e-97	178853096	178876304
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178866013	179277948	205	201	0.4531	1.62601260562832e-97	178853096	178876304	3.59313843733821e-85	179268775	179284420
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179280128	179709044	200	194	0.0222	3.59313843733821e-85	179268775	179284420	1.2607278785413e-06	179706790	179709044
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179710347	179711848	2	2	0.8597	1.2607278785413e-06	179706790	179709044	4.34557168712869e-07	179711848	179713960
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179713960	180194323	174	169	0.0269	4.34557168712869e-07	179711848	179713960	5.85355349165852e-09	180189516	180346557
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180342860	180342860	1	0	NA	5.85355349165852e-09	180189516	180346557	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.513	NA	NA	NA	2.1356499819175e-08	180355807	180365950
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	107	0.0215	2.1356499819175e-08	180355807	180365950	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	39	-0.0149	NA	NA	NA	1.50668887516872e-69	198124	202063
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	326323	61	58	-0.6771	1.50668887516872e-69	198124	202063	4.15260865462182e-166	323898	327962
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	20590054	7076	6773	-0.0026	4.15260865462182e-166	323898	327962	1.03422616347321e-34	20587304	20598217
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	20591849	20591849	1	0	NA	1.03422616347321e-34	20587304	20598217	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	20594190	20664635	30	29	0.4365	NA	NA	NA	3.47494749814589e-34	20656980	20667469
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	20666349	26771324	2152	2059	-0.004	3.47494749814589e-34	20656980	20667469	1.58438945713463e-21	26769182	26793415
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26774582	26774582	1	0	NA	1.58438945713463e-21	26769182	26793415	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26793415	26861184	9	9	-0.632	NA	NA	NA	1.60305390736462e-21	26855591	26863540
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	26863540	29207533	918	894	0.0027	1.60305390736462e-21	26855591	26863540	2.60282719832612e-16	29201833	29212476
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29210289	29272802	21	19	0.383	2.60282719832612e-16	29201833	29212476	6.80407118768347e-12	29260745	29287458
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29274297	32558677	1368	1308	0.0194	6.80407118768347e-12	29260745	29287458	5.7773478805201e-21	32558677	32590568
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32600962	9	8	-0.7301	5.7773478805201e-21	32558677	32590568	9.41051466306665e-06	32567462	32609525
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	32713363	36	35	-0.0437	9.41051466306665e-06	32567462	32609525	3.10494177225092e-07	32709263	32720656
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	0.629	3.10494177225092e-07	32709263	32720656	1.15308918959203e-16	32721872	32731072
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	54033505	8258	7887	0.0099	1.15308918959203e-16	32721872	32731072	2.63265677018873e-34	54033505	54033505
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54035000	54035000	1	0	NA	2.63265677018873e-34	54033505	54033505	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-1.423	NA	NA	NA	1.22908782250086e-38	54042734	54042734
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79112799	6449	6161	0.0014	1.22908782250086e-38	54042734	54042734	0	79101978	79127731
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79119694	85465365	1735	1671	0.4261	0	79101978	79127731	0	85461939	85474177
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	85472033	103841482	5023	4803	0.0077	0	85461939	85474177	4.6167440603371e-72	103841482	103841482
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103860573	3	3	-1.8861	4.6167440603371e-72	103841482	103841482	7.8863575781307e-67	103860573	103860573
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103868154	108996738	1644	1569	0.0194	7.8863575781307e-67	103860573	103860573	5.25724547725774e-43	108994984	108998906
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	108998906	109047923	24	24	-0.5261	5.25724547725774e-43	108994984	108998906	7.65972198819472e-44	109038665	109052587
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109050775	109050775	1	0	NA	7.65972198819472e-44	109038665	109052587	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	109052587	170753106	21246	20316	0.008	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	4547320	1662	1608	-0.0041	NA	NA	NA	0	4541384	4555249
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	4549815	7950084	1139	1099	-0.5358	0	4541384	4555249	2.52824925762465e-210	7941040	7952767
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	7952767	8362324	173	165	0.0511	2.52824925762465e-210	7941040	7952767	0	8355601	8369632
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	8369632	16135701	2414	2288	-0.6291	0	8355601	8369632	3.19909545647813e-49	16135701	16135701
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16138579	16140018	2	2	-2.8615	3.19909545647813e-49	16135701	16135701	2.48928520393107e-49	16140018	16140018
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	16141776	26400538	3529	3391	-0.6029	2.48928520393107e-49	16140018	16140018	3.90395135478781e-13	26400538	26400538
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26403038	26404540	2	2	0.5824	3.90395135478781e-13	26400538	26400538	1.52049833455219e-12	26404540	26406021
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	26406021	29325345	1319	1259	-0.5989	1.52049833455219e-12	26404540	26406021	1.66930536768990e-147	29322598	29326663
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29326663	29510106	95	94	-0.0065	1.6693053676899e-147	29322598	29326663	1.68031341981657e-82	29507658	29517230
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	29512913	38258332	3265	3122	0.4009	1.68031341981657e-82	29507658	29517230	1.41192814598212e-14	38240790	38279432
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38262701	38360187	46	43	0.6575	1.41192814598212e-14	38240790	38279432	9.95358046235063e-13	38330907	38386838
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38372692	51348670	4225	4049	0.4135	9.95358046235063e-13	38330907	38386838	9.99172265346376e-09	51346745	51348670
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	51350959	51352821	2	2	1.3539	9.99172265346376e-09	51346745	51348670	1.09708954791945e-12	51352821	51352821
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	51355060	52287180	141	137	0.4034	1.09708954791945e-12	51352821	51352821	3.60837263228124e-113	52279938	52292520
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	52289210	72427668	3825	3657	0.0019	3.60837263228124e-113	52279938	52292520	1.3539295141304e-62	72406970	72469604
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	72433030	72918091	207	200	0.2554	1.3539295141304e-62	72406970	72469604	6.51112750963425e-54	72893198	72930583
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	72919887	78934917	1811	1732	0.024	6.51112750963425e-54	72893198	72930583	0	78932983	78939007
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	78939007	80907844	550	522	-0.6507	0	78932983	78939007	0	80901408	80907844
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	80916301	93162991	4041	3885	-0.004	0	80901408	80907844	4.15398617598876e-14	93162991	93162991
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	1.0262	4.15398617598876e-14	93162991	93162991	9.29223772522486e-12	93168978	93168978
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	110562851	7107	6825	0.0133	9.29223772522486e-12	93168978	93168978	8.95340811053378e-14	110560691	110564691
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110564691	110577359	7	7	-0.5708	8.95340811053378e-14	110560691	110564691	9.16730344410774e-15	110575849	110579985
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110578509	110578509	1	0	NA	9.16730344410774e-15	110575849	110579985	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	110579985	118611324	3700	3511	4e-04	NA	NA	NA	2.83948082439283e-29	118611324	118611324
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118620875	3	3	1.2159	2.83948082439283e-29	118611324	118611324	7.22720932518368e-26	118620875	118620875
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	118622742	1	0	NA	7.22720932518368e-26	118620875	118620875	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118629597	120089714	603	571	-0.0058	NA	NA	NA	6.83736108208142e-16	120089714	120089714
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120092153	120098907	5	5	-0.7552	6.83736108208142e-16	120089714	120089714	1.80910192397960e-16	120098907	120098907
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	120101979	133433384	6218	5965	-0.0122	1.8091019239796e-16	120098907	120098907	1.94629221581263e-139	133433384	133436265
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133436265	133448277	8	7	-1.8175	1.94629221581263e-139	133433384	133436265	2.06749103669437e-135	133447868	133448277
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	133453811	141408013	3698	3554	-0.0022	2.06749103669437e-135	133447868	133448277	2.60246583739481e-16	141405145	141414719
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141409512	141409512	1	0	NA	2.60246583739481e-16	141405145	141414719	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141410894	141440184	15	15	0.4323	NA	NA	NA	1.02259368816303e-13	141435643	141443577
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141690753	116	113	-0.0262	1.02259368816303e-13	141435643	141443577	1.05867422111726e-23	141689547	141690753
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141711513	8	8	0.7686	1.05867422111726e-23	141689547	141690753	1.74945056830882e-27	141711513	141712786
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141712786	151728811	4146	3962	-0.0058	1.74945056830882e-27	141711513	141712786	3.32913625299981e-37	151728811	151728811
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151743145	8	8	-0.9037	3.32913625299981e-37	151728811	151728811	7.65453199948558e-34	151743145	151743145
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151745100	158821263	2600	2490	0.001	7.65453199948558e-34	151743145	151743145	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	1122838	288	276	0.7247	NA	NA	NA	3.73382151178375e-33	1119331	1129099
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1126863	1126863	1	0	NA	3.73382151178375e-33	1119331	1129099	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1129099	1180955	16	16	-0.0368	NA	NA	NA	9.50988687766117e-30	1180955	1180955
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1183963	1191147	3	3	-1.8054	9.50988687766117e-30	1180955	1180955	4.42401432798028e-59	1191147	1191147
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	1194735	5503066	1692	1633	-0.0234	4.42401432798028e-59	1191147	1191147	0	5498581	5511028
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5511028	6926661	391	375	-0.604	0	5498581	5511028	1.64257997293496e-07	6905670	7260442
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	7156900	7824059	10	10	-1.0306	1.64257997293496e-07	6905670	7260442	9.58123355420574e-18	7697025	8143301
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	8137794	25120552	5758	5510	-0.5943	9.58123355420574e-18	7697025	8143301	2.13016139164674e-71	25120552	25120552
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25125700	3	3	1.7783	2.13016139164674e-71	25120552	25120552	4.8014866620049e-79	25125700	25125700
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	34441194	3441	3306	-0.5943	4.8014866620049e-79	25125700	25125700	1.37554124636547e-27	34441194	34441194
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	34448576	34454307	2	2	-2.3236	1.37554124636547e-27	34441194	34441194	1.47902313366618e-25	34454307	34454307
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	34463958	37543218	757	732	-0.648	1.47902313366618e-25	34454307	34454307	0	37538466	37550513
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	37550513	51191560	2950	2838	0.028	0	37538466	37550513	1.13638107384021e-10	51189068	51191560
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-0.6514	1.13638107384021e-10	51189068	51191560	3.48771976713087e-11	51200291	51204788
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	51202490	1	0	NA	3.48771976713087e-11	51200291	51204788	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51204788	60895610	2856	2749	0.0046	NA	NA	NA	1.74520608580114e-10	60885735	60910033
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	60905429	60965254	6	6	-0.5152	1.74520608580114e-10	60885735	60910033	4.68965722349241e-10	60920174	60971208
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	60971208	65356257	1290	1244	0.0011	4.68965722349241e-10	60920174	60971208	0	65345632	65371190
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	65363577	77200609	3852	3714	0.4042	0	65345632	65371190	2.12633223985790e-122	77185146	77212276
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	77202905	78124875	255	246	0.1127	2.1263322398579e-122	77185146	77212276	1.62439524032662e-86	78089330	78162722
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	78132325	85314801	1614	1560	0.3593	1.62439524032662e-86	78089330	78162722	0	85313358	85319195
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	85319195	87552678	737	706	-0.2392	0	85313358	85319195	6.16672107980909e-238	87549321	87557923
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	87554758	88482628	363	345	-0.6716	6.16672107980909e-238	87549321	87557923	1.58440326565318e-126	88465859	88489844
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	88487505	89644241	319	304	-0.2773	1.58440326565318e-126	88465859	88489844	0	89634325	89649310
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	89649310	93522187	1002	951	0.2279	0	89634325	89649310	0	93486236	93560514
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	93530791	113476862	6621	6343	0.5184	0	93486236	93560514	2.83257863102564e-59	113462871	113489752
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	113478701	113774691	134	131	0.2257	2.83257863102564e-59	113462871	113489752	5.92011399244083e-41	113759958	113790615
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	113776006	114820197	386	373	0.4912	5.92011399244083e-41	113759958	113790615	5.79264338056708e-102	114795936	114830400
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	114825473	115770058	130	120	0.0763	5.79264338056708e-102	114795936	114830400	7.22339379079473e-91	115765252	115775435
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	115775435	116478498	101	94	0.5755	7.22339379079473e-91	115765252	115775435	1.38973239410916e-11	116470439	116488181
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	116481061	116481061	1	0	NA	1.38973239410916e-11	116470439	116488181	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	116483777	116523049	20	18	0.2238	NA	NA	NA	8.53833494169794e-13	116520772	116530323
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	116524896	121626342	1768	1694	0.5754	8.53833494169794e-13	116520772	116530323	0	121617433	121643009
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	121627690	137587220	4915	4724	0.8217	0	121617433	121643009	6.7641808342365e-20	137573373	137593896
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137593896	137708196	21	20	0.3613	6.7641808342365e-20	137573373	137593896	3.37039596142352e-19	137702868	137727788
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	137715486	141861057	1275	1225	0.8219	3.37039596142352e-19	137702868	137727788	2.04789771533099e-24	141849899	141870874
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	141864137	141986214	54	51	0.4934	2.04789771533099e-24	141849899	141870874	8.27602804185945e-104	141986214	141988532
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	141988532	142271617	116	112	1.4069	8.27602804185945e-104	141986214	141988532	1.90420671089085e-106	142266999	142274933
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	142273779	143889160	611	580	0.7612	1.90420671089085e-106	142266999	142274933	1.84908759437000e-08	143864703	143948892
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	143893146	144172829	42	39	0.4533	1.84908759437e-08	143864703	143948892	9.71065018965675e-07	143990748	144209380
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	144174834	146264846	760	717	0.7544	9.71065018965675e-07	143990748	144209380	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	4936528	1848	1778	3e-04	NA	NA	NA	1.63459999925837e-35	4931618	4955465
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	4947148	5027892	31	29	0.4411	1.63459999925837e-35	4931618	4955465	2.41701353578995e-37	5019782	5033269
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	5028064	33369952	8790	8400	0.0044	2.41701353578995e-37	5019782	5033269	3.16835164702974e-06	33360763	33369952
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	33374723	33400753	7	7	-0.3741	3.16835164702974e-06	33360763	33369952	4.12686000868758e-06	33400753	33410673
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	33404184	39130211	2054	1969	0.0449	4.12686000868758e-06	33400753	33410673	0.000596780683036428	39088753	43445839
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39146895	39146895	1	0	NA	0.000596780683036428	39088753	43445839	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	43626920	4	3	0.5692	NA	NA	NA	6.9023212381645e-05	43599449	43626920
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43644906	66245109	6	6	-0.2082	6.9023212381645e-05	43599449	43626920	1.32704937038008e-21	45359327	67917803
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67859114	98629748	9629	9224	-0.5969	1.32704937038008e-21	45359327	67917803	0	98629748	98642214
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	98642214	98854648	39	39	-2.1254	0	98629748	98642214	2.06717231412553e-08	98837882	99033513
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	98854918	99207134	100	98	-1.4536	2.06717231412553e-08	98837882	99033513	1.35395716536083e-08	99180399	99237962
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	99209226	99379160	84	80	-1.9806	1.35395716536083e-08	99180399	99237962	0.000263344703333823	99348651	99379160
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	99380520	99406860	11	11	-1.2681	0.000263344703333823	99348651	99379160	8.38940646051344e-23	99405656	99408305
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	99408305	110934680	3719	3588	-0.6002	8.38940646051344e-23	99405656	99408305	2.65309417168751e-06	110919036	110945949
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	110937931	110972567	18	16	-0.3066	2.65309417168751e-06	110919036	110945949	1.45615468360887e-06	110959827	110984852
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	110973956	112062107	505	486	-0.5883	1.45615468360887e-06	110959827	110984852	5.2565544475074e-15	112062107	112062107
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112064860	112069192	2	2	-1.7566	5.2565544475074e-15	112062107	112062107	2.17881920854832e-11	112069192	112069192
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	112070666	125148110	4904	4723	-0.5885	2.17881920854832e-11	112069192	112069192	2.59342966591701e-11	125073136	125177392
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	125150285	125215533	50	49	-0.3903	2.59342966591701e-11	125073136	125177392	1.40308536494351e-05	125200800	125254406
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	125217062	129203524	1695	1606	-0.5634	1.40308536494351e-05	125200800	125254406	9.71454449158097e-23	129185483	129218343
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129205858	129360794	76	73	-0.2828	9.71454449158097e-23	129185483	129218343	1.70116991508117e-09	129326383	129413493
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	129361936	137352394	3266	3135	-0.4814	1.70116991508117e-09	129326383	129413493	8.64383449451721e-23	137352394	137352394
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.3286	8.64383449451721e-23	137352394	137352394	3.32346878005104e-19	137356880	137356880
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1053	-0.4302	3.32346878005104e-19	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	3546593	1292	1238	-0.0103	NA	NA	NA	0	3543930	3553098
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	3550507	9423433	2021	1935	-0.5996	0	3543930	3553098	0	9405383	9432982
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	9432982	13553503	1369	1306	0.0408	0	9405383	9432982	1.76291853014979e-12	13553503	13553503
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-0.9852	1.76291853014979e-12	13553503	13553503	7.19172772095981e-12	13556315	13556315
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	27038538	5045	4860	0.0123	7.19172772095981e-12	13556315	13556315	1.15553303210217e-10	27038538	27038538
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	0.9603	1.15553303210217e-10	27038538	27038538	1.49593830920636e-10	27041812	27041812
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	27614052	228	219	0.0232	1.49593830920636e-10	27041812	27041812	1.28517749582212e-10	27608217	27621321
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27618453	27618453	1	0	NA	1.28517749582212e-10	27608217	27621321	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27621321	27641594	8	8	0.4988	NA	NA	NA	5.08815885386725e-11	27638430	27648567
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27646617	31284926	1324	1269	0.0171	5.08815885386725e-11	27638430	27648567	5.60376941418315e-130	31284926	31284926
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-2.6321	5.60376941418315e-130	31284926	31284926	1.39614475149523e-138	31291525	31291525
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	38544262	2198	2112	0.0048	1.39614475149523e-138	31291525	31291525	1.16888532672032e-10	38537336	38564782
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	38554841	38596435	9	8	0.4639	1.16888532672032e-10	38537336	38564782	3.34099582030103e-09	38588454	38611782
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	38601263	46394835	961	924	1e-04	3.34099582030103e-09	38588454	38611782	2.67519960008063e-23	45487335	46404919
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	46396163	47040444	69	65	-0.26	2.67519960008063e-23	45487335	46404919	2.19518982339443e-28	46561216	47068616
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	47057097	77917893	10060	9571	0.0099	2.19518982339443e-28	46561216	47068616	3.15815462258282e-49	77917893	77917893
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928669	2	2	-2.0002	3.15815462258282e-49	77917893	77917893	4.91435575091781e-49	77928669	77928669
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77928738	86227286	2467	2369	-8e-04	4.91435575091781e-49	77928669	77928669	7.36924139275887e-19	86220811	86228470
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	86228470	86273660	21	20	0.3958	7.36924139275887e-19	86220811	86228470	2.20861240712629e-38	86271745	86289216
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	86285725	127563278	15008	14356	0.0293	2.20861240712629e-38	86271745	86289216	7.89942348063637e-50	127563278	127563278
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127590461	12	11	-0.8522	7.89942348063637e-50	127563278	127563278	5.8782441471993e-51	127590461	127590461
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127592138	131321699	1273	1225	0.0204	5.8782441471993e-51	127590461	127590461	5.0959777664359e-06	131314131	131336635
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	131324184	131345515	11	11	-0.2905	5.0959777664359e-06	131314131	131336635	9.06591055747631e-06	131334743	131355256
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	131346748	132797428	486	475	0.0231	9.06591055747631e-06	131334743	131355256	6.75556588767172e-09	132787561	132797428
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	0.9122	6.75556588767172e-09	132787561	132797428	1.60229611478322e-06	132801463	132802775
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	135285645	934	892	0.0621	1.60229611478322e-06	132801463	132802775	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1710	-0.4765	NA	NA	NA	5.57543229805528e-74	4923300	4923300
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-2.5817	5.57543229805528e-74	4923300	4923300	1.73451224519759e-71	4932214	4932214
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5742476	362	349	-0.6211	1.73451224519759e-71	4932214	4932214	2.1479121601687e-101	5742476	5745329
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5744034	5765438	14	14	-2.2305	2.1479121601687e-101	5742476	5745329	3.40274267287038e-141	5762182	5765438
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	7771593	864	824	-0.597	3.40274267287038e-141	5762182	5765438	8.75967973992137e-45	7771593	7774554
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7774067	7781505	5	5	-2.0425	8.75967973992137e-45	7771593	7774554	1.23217755613649e-47	7776272	7781505
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	7783344	17053724	3562	3399	-0.5848	1.23217755613649e-47	7776272	7781505	0	17052604	17057290
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	17055191	18896166	788	761	-0.017	0	17052604	17057290	1.13656868536990e-43	18896166	18896166
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-1.2171	1.1365686853699e-43	18896166	18896166	2.60216453970658e-53	18917191	18917191
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55123719	9528	9133	-0.0169	2.60216453970658e-53	18917191	18917191	5.43210232248274e-36	55114405	55129329
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55124730	55209626	38	38	0.377	5.43210232248274e-36	55114405	55129329	1.45283608781920e-27	55203706	55221692
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	62867442	3027	2874	0.013	1.4528360878192e-27	55203706	55221692	3.13646763561607e-30	62867442	62867442
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62874768	62897536	11	10	-0.7242	3.13646763561607e-30	62867442	62867442	5.18104235513429e-25	62897536	62899604
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	62899604	66463477	1600	1525	0.0145	5.18104235513429e-25	62897536	62899604	1.32714906370354e-08	66463477	66463477
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66468725	66469412	2	2	0.9996	1.32714906370354e-08	66463477	66463477	2.58003768781170e-09	66469412	66469412
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66473397	66930422	192	186	0.059	2.5800376878117e-09	66469412	66469412	1.84650057922322e-15	66922414	66945699
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	66932103	67021018	37	34	0.397	1.84650057922322e-15	66922414	66945699	1.00910994946069e-06	67008155	67047713
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	67022481	67229665	75	71	0.7896	1.00910994946069e-06	67008155	67047713	9.90948812983998e-62	67186125	67520412
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	67229707	107738928	13531	12980	0.3839	9.90948812983998e-62	67186125	67520412	9.49372118332768e-305	107732630	107743433
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	107741211	108251026	210	203	0.9137	9.49372118332768e-305	107732630	107743433	7.25882671755282e-315	108249113	108253611
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	108253611	120181040	4293	4120	0.3546	7.25882671755282e-315	108249113	108253611	3.25601690897217e-07	120175297	120185349
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	120182989	120198782	9	8	-0.0786	3.25601690897217e-07	120175297	120185349	1.83939981307794e-07	120193301	120203561
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	120200001	124579236	1720	1662	0.3267	1.83939981307794e-07	120193301	120203561	2.00600683611604e-24	124579236	124579236
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124580889	124583056	2	2	-1.1063	2.00600683611604e-24	124579236	124579236	1.25604720451082e-15	124583056	124583056
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124584692	124588223	3	3	-0.7229	1.25604720451082e-15	124583056	124583056	1.43071939673207e-17	124588223	124588223
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	124591102	134432265	3645	3486	0.3135	1.43071939673207e-17	124588223	124588223	1.56379671719861e-12	134432265	134432265
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134439347	134450318	3	3	-0.5675	1.56379671719861e-12	134432265	134432265	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	59822	2	2	-0.151	NA	NA	NA	0.0007074026910341	59822	150703
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	62270	7891273	3246	3118	-0.5712	0.0007074026910341	59822	150703	3.75615943526666e-07	7846566	7926710
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7894681	7981679	37	34	-0.3377	3.75615943526666e-07	7846566	7926710	6.26858946720421e-08	7961626	8011957
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7985677	9523923	457	433	-0.5785	6.26858946720421e-08	7961626	8011957	1.83229284629309e-57	9523923	9531133
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	15	0.4377	1.83229284629309e-57	9523923	9531133	6.16003567643563e-66	9604633	9610054
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11123452	573	550	-0.5994	6.16003567643563e-66	9604633	9610054	1.63949390740038e-25	11123452	11123452
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11125311	11130871	4	4	-1.7621	1.63949390740038e-25	11123452	11123452	1.06016688734373e-25	11130871	11130871
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11140421	31169263	6821	6545	-0.6053	1.06016688734373e-25	11130871	11130871	3.76172282503409e-16	31098259	31177645
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31171313	31237505	16	16	-0.143	3.76172282503409e-16	31098259	31177645	2.13654245866464e-14	31230579	31245432
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	33518282	845	813	-0.5775	2.13654245866464e-14	31230579	31245432	0	33518282	33518282
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33526367	34647417	158	152	0.8829	0	33518282	33518282	0	34424331	34647417
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	36244407	119391362	28271	27104	0.014	0	34424331	34647417	7.71572475270167e-09	119389267	119391362
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	119393595	119396497	3	3	0.738	7.71572475270167e-09	119389267	119391362	4.16623134982079e-07	119396497	119398193
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	119398193	120676541	559	538	0.0514	4.16623134982079e-07	119396497	119398193	4.58321783930700e-247	120673852	120681259
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	120678327	121341150	249	236	-0.4913	4.583217839307e-247	120673852	120681259	6.15475383416596e-312	121338249	121346902
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	121346902	132289090	3904	3751	0.0174	6.15475383416596e-312	121338249	121346902	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	22883555	1523	1456	-0.5868	NA	NA	NA	1.8666261123192e-32	22848539	22898032
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	22886497	22886497	1	0	NA	1.8666261123192e-32	22848539	22898032	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	22887685	23298916	171	166	-0.3593	NA	NA	NA	9.19001155621983e-44	23286304	23320591
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	23303345	29593335	2538	2412	-0.605	9.19001155621983e-44	23286304	23320591	3.06905795313697e-201	29578824	29616833
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	29604380	30262521	282	275	-0.1914	3.06905795313697e-201	29578824	29616833	3.10204573492318e-205	30257678	30275755
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	30265348	37953582	2823	2708	-0.6037	3.10204573492318e-205	30257678	30275755	3.52919131558485e-17	37953582	37953582
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	0.7774	3.52919131558485e-17	37953582	37953582	7.9621844367978e-17	37957844	37957844
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	39763423	700	665	-0.624	7.9621844367978e-17	37957844	37957844	0	39763423	39763423
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	39767863	56650373	5985	5727	0.3245	0	39763423	39763423	0	56650373	56650373
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56657371	56685341	15	14	-2.1751	0	56650373	56650373	0	56685341	56685341
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56686863	62499779	1365	1310	0.319	0	56685341	56685341	5.46461172659417e-28	62499779	62516280
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	62507943	62530764	6	6	-0.5476	5.46461172659417e-28	62499779	62516280	1.34461926397266e-27	62523095	62530764
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	62534030	68142120	1323	1272	0.3065	1.34461926397266e-27	62523095	62530764	2.51933113061075e-10	68134536	68142120
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68144264	68163523	10	10	0.7107	2.51933113061075e-10	68134536	68142120	2.00395236923871e-09	68163523	68169957
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68167758	71375082	919	882	0.3254	2.00395236923871e-09	68163523	68169957	3.130073884732e-28	71375082	71375082
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71376371	71377671	2	2	-1.1611	3.130073884732e-28	71375082	71375082	2.05666039331354e-26	71377671	71377671
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71379555	111134439	12909	12345	0.3311	2.05666039331354e-26	71377671	71377671	0	111128731	111144948
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	111136445	114118270	1069	1033	0.6665	0	111128731	111144948	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	114123340	114123340	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19492531	59	57	-0.6263	NA	NA	NA	1.45556747924163e-134	19489920	19497023
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19494416	19494416	1	0	NA	1.45556747924163e-134	19489920	19497023	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21444352	952	911	0.017	NA	NA	NA	1.09877307306781e-89	21428282	21454347
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21445390	22047168	298	289	0.2742	1.09877307306781e-89	21428282	21454347	4.3008842906347e-113	22035729	22056148
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22048569	31572075	3084	2963	0.0099	4.3008842906347e-113	22035729	22056148	3.39753850461275e-16	31568120	31572075
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	31578554	31578554	1	0	NA	3.39753850461275e-16	31568120	31572075	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	31583374	31606140	10	9	-0.5388	NA	NA	NA	9.35392678896306e-17	31606140	31608980
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	31608980	34674458	1345	1292	0.0185	9.35392678896306e-17	31606140	31608980	2.31983696760615e-26	34674458	34674458
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.2215	2.31983696760615e-26	34674458	34674458	4.74540731669703e-29	34683810	34683810
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1813	0.0174	4.74540731669703e-29	34683810	34683810	6.04346311422219e-11	40663660	40680589
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.4764	6.04346311422219e-11	40663660	40680589	2.10359436137279e-11	40726930	40746865
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	45817034	1039	996	0.0052	2.10359436137279e-11	40726930	40746865	1.05755053886442e-11	45812498	45821374
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	45821374	45839323	4	4	-0.6707	1.05755053886442e-11	45812498	45821374	6.83711902218754e-12	45832717	45839323
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	45843412	65282960	7273	6951	0.0206	6.83711902218754e-12	45832717	45839323	0	65280696	65287352
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	65285378	71122449	2506	2392	-0.5657	0	65280696	65287352	0	71120543	71124111
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	71124111	72764341	790	752	0.1712	0	71120543	71124111	9.09862414033932e-40	72749440	72768333
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72765373	72933169	89	84	-0.1327	9.09862414033932e-40	72749440	72768333	9.24554136371958e-67	72929920	72939816
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	72934290	105787390	12318	11837	-0.5534	9.24554136371958e-67	72929920	72939816	4.52466067762656e-72	105760541	105787390
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105789767	2	2	-1.1075	4.52466067762656e-72	105760541	105787390	0	105789767	105789767
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105790917	105794161	2	2	-1.4625	0	105789767	105789767	0.000349684434659259	105794161	105800545
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105795807	105795807	1	0	NA	0.000349684434659259	105794161	105800545	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105798116	105856591	23	22	-0.5574	NA	NA	NA	2.82383796703864e-13	105856591	105856591
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856972	105856972	1	0	NA	2.82383796703864e-13	105856591	105856591	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105872360	105875924	3	3	-1.9183	NA	NA	NA	5.11393250741782e-18	105875924	105875924
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105881677	106218059	126	122	-0.5964	5.11393250741782e-18	105875924	105875924	9.0184547113887e-06	106199156	106223507
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106255190	17	16	-0.9361	9.0184547113887e-06	106199156	106223507	5.70763167426081e-05	106251081	106281746
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106256498	106358491	35	34	-0.6166	5.70763167426081e-05	106251081	106281746	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	5	0.0304	NA	NA	NA	1.68289413680923e-24	18452491	18452491
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19845942	105	103	-1.2493	1.68289413680923e-24	18452491	18452491	1.86551882058238e-50	19845942	19845942
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-3.5938	1.86551882058238e-50	19845942	19845942	5.14586694304702e-52	19882711	19882711
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20088256	43	42	-1.1891	5.14586694304702e-52	19882711	19882711	0	20088256	20088256
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20308014	38895859	5892	5654	0.0024	0	20088256	20088256	7.58187843707325e-40	38891658	38903602
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	38899206	38971237	38	37	0.4301	7.58187843707325e-40	38891658	38903602	2.29270063509367e-40	38966257	38977021
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	38974069	59152448	8769	8385	0.008	2.29270063509367e-40	38966257	38977021	3.52088279462521e-10	59152448	59152448
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59153917	59155004	2	2	-0.9245	3.52088279462521e-10	59152448	59152448	6.95857824329911e-10	59155004	59155004
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	59156887	63475657	1958	1863	0.0086	6.95857824329911e-10	59155004	59155004	2.96109912059225e-307	63470994	63482794
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	63476768	64338191	446	426	0.3985	2.96109912059225e-307	63470994	63482794	0	64333770	64344570
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	64339540	69850841	2335	2235	0.0054	0	64333770	64344570	1.04532347855601e-08	69843731	69854577
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69853247	69872210	11	10	0.3974	1.04532347855601e-08	69843731	69854577	4.2869728586916e-07	69868471	69882532
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	69872246	74669752	2104	2007	0.018	4.2869728586916e-07	69868471	69882532	5.32331402183925e-79	74669752	74671626
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74671626	74680439	4	4	-1.9398	5.32331402183925e-79	74669752	74671626	4.29435548115966e-73	74680338	74680439
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	74696127	77998469	1294	1241	-0.0469	4.29435548115966e-73	74680338	74680439	4.11519925210232e-07	77995010	77998469
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78000756	78010140	4	3	0.6421	4.11519925210232e-07	77995010	77998469	3.71216369978699e-25	78010140	78012664
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	78012664	99632987	8035	7674	-0.0428	3.71216369978699e-25	78010140	78012664	7.19372925160256e-37	99632987	99632987
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99634434	99635701	2	2	1.7278	7.19372925160256e-37	99632987	99632987	5.33311185069084e-33	99635701	99635701
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	99636724	100217283	268	257	-0.0278	5.33311185069084e-33	99635701	99635701	2.61131127684434e-08	100217181	100282819
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100278665	100298352	4	4	-0.6476	2.61131127684434e-08	100217181	100282819	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	31862577	10572	10150	-0.0769	NA	NA	NA	4.32061976678907e-93	31854794	32379126
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32379126	34054713	53	52	-0.664	4.32061976678907e-93	31854794	32379126	1.78718191767549e-54	33846647	34056516
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	34056516	35004950	188	186	-0.1363	1.78718191767549e-54	33846647	34056516	4.19812997452363e-138	34995910	45087457
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45058242	45058242	1	0	NA	4.19812997452363e-138	34995910	45087457	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	45063104	68693086	7485	7156	-0.5641	NA	NA	NA	1.71149149564558e-27	68687301	68693086
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	10	-1.2963	1.71149149564558e-27	68687301	68693086	5.55657148537554e-24	68753209	68838384
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	69268128	189	178	-0.5015	5.55657148537554e-24	68753209	68838384	3.27751433065721e-06	69252632	69273201
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69268950	69280807	7	7	-0.0105	3.27751433065721e-06	69252632	69273201	1.24988470100944e-09	69279021	69283902
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	69282221	72917554	1256	1206	-0.5632	1.24988470100944e-09	69279021	69283902	6.44772086523421e-20	72915477	72917554
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72918129	72918129	1	0	NA	6.44772086523421e-20	72915477	72917554	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72929786	72964783	7	7	-1.3495	NA	NA	NA	3.76168203397561e-18	72964783	73022578
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73022578	76925748	1367	1312	-0.5864	3.76168203397561e-18	72964783	73022578	1.57706458189556e-23	76923844	76925748
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	0.2221	1.57706458189556e-23	76923844	76925748	2.35995591242761e-56	76940218	76942679
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	87335248	3932	3779	-0.5385	2.35995591242761e-56	76940218	76942679	0	87330963	87340712
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	87337484	88690571	581	552	0.0681	0	87330963	87340712	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	4475597	1987	1906	-0.5092	NA	NA	NA	2.93908022396787e-14	4469912	4475718
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4475718	4488659	6	6	-1.3299	2.93908022396787e-14	4469912	4475718	3.44011271620866e-33	4482413	4492600
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	4492600	15727076	4309	4123	-0.5677	3.44011271620866e-33	4482413	4492600	8.69277082015943e-36	15727076	15727076
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15731356	15733964	2	2	-1.935	8.69277082015943e-36	15727076	15727076	2.3967578568401e-15	15733964	15733964
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	15737241	21144428	1825	1756	-0.517	2.3967578568401e-15	15733964	15733964	1.38038018895305e-06	21123341	21157121
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21146405	21146405	1	0	NA	1.38038018895305e-06	21123341	21157121	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21147675	21201106	20	19	-0.8238	NA	NA	NA	5.55759522005647e-06	21181751	21226416
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	21204422	23851909	650	620	-0.5432	5.55759522005647e-06	21181751	21226416	2.06886294760392e-36	23820330	23886963
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	23853093	24566138	370	345	-0.3479	2.06886294760392e-36	23820330	23886963	3.72044249148748e-45	24541989	24597516
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	24567504	25740372	544	518	-0.5712	3.72044249148748e-45	24541989	24597516	2.42116514456907e-06	25738667	25740372
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25741839	25743471	2	2	0.2985	2.42116514456907e-06	25738667	25740372	2.01207860872502e-06	25743471	25745885
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	25745885	26632627	283	273	-0.5825	2.01207860872502e-06	25743471	25745885	2.43549945010561e-267	26632627	26634102
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26634102	26750459	56	54	-2.0839	2.43549945010561e-267	26632627	26634102	1.14883393990300e-08	26732316	26785378
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26753609	26966040	128	123	-1.4842	1.148833939903e-08	26732316	26785378	6.96541483776076e-42	26960911	26966040
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	26979611	27139795	34	33	0.0093	6.96541483776076e-42	26960911	26966040	5.76983709434405e-49	27131249	27147859
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	27144608	31471890	1826	1741	-0.5802	5.76983709434405e-49	27131249	27147859	1.22743328324974e-14	31468896	31476283
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31473186	31503774	13	13	-1.1001	1.22743328324974e-14	31468896	31476283	1.57154112673667e-06	31492553	31891535
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	31925650	16	16	-0.5351	1.57154112673667e-06	31492553	31891535	0.00618765092822733	31897238	31974650
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31928557	32447831	156	152	-0.3529	0.00618765092822733	31897238	31974650	2.88492507350063e-26	32427893	32463043
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32449417	32828797	193	182	-0.5919	2.88492507350063e-26	32427893	32463043	1.70846746800212e-08	32828797	32828797
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-1.4688	1.70846746800212e-08	32828797	32828797	1.13575323371538e-06	32832642	32836527
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	32833765	1	0	NA	1.13575323371538e-06	32832642	32836527	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32836527	39699778	2762	2648	-0.5114	NA	NA	NA	8.18411762851654e-130	39669778	39713743
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	39701258	41566540	723	702	-0.2736	8.18411762851654e-130	39669778	39713743	1.97749088877659e-57	41564408	41570512
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	43	-0.8008	1.97749088877659e-57	41564408	41570512	9.7227453407826e-54	41706870	42143048
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	45264774	1424	1366	-0.2994	9.7227453407826e-54	41706870	42143048	0.00138451309386683	45241394	45268494
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	45266849	45282777	9	9	-0.0062	0.00138451309386683	45241394	45268494	0.0106053555708839	45271801	45342192
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	45285715	45430889	50	43	-0.2656	0.0106053555708839	45271801	45342192	8.32842047668929e-22	45417120	45443231
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	45436512	67954257	7781	7486	0.0357	8.3284204766893e-22	45417120	45443231	2.38363564643450e-161	67954257	67956935
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	67956935	67970215	6	6	-2.1344	2.3836356464345e-161	67954257	67956935	7.63150229152773e-134	67964115	67970215
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	67974285	78653545	4409	4217	0.0654	7.63150229152773e-134	67964115	67970215	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	500897	175	167	-0.5905	NA	NA	NA	1.32927079219405e-09	497125	500897
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	503208	505456	2	2	0.4366	1.32927079219405e-09	497125	500897	6.92160351065355e-10	505456	505456
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	506827	18528229	5453	5228	-0.594	6.92160351065355e-10	505456	505456	0	18517799	18533141
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	18533141	19247257	247	241	0.0277	0	18517799	18533141	0	19245683	19249153
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	19249153	22639164	1173	1124	-0.6056	0	19245683	19249153	0	22628221	22642677
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	22642677	53092949	9149	8792	0.0091	0	22628221	22642677	1.07544696855754e-21	53092949	53092949
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	1.2963	1.07544696855754e-21	53092949	53092949	7.06565359678946e-21	53099601	53099601
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	58037883	1654	1591	0.023	7.06565359678946e-21	53099601	53099601	0	58036464	58039541
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	58039541	76116026	5109	4898	-0.6176	0	58036464	58039541	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	536113	122	120	-0.6267	NA	NA	NA	8.87126140337688e-17	483987	566634
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	537602	1398325	370	348	-0.3716	8.87126140337688e-17	483987	566634	1.68667556935775e-07	1398325	1398325
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1400798	1400840	2	2	0.6875	1.68667556935775e-07	1398325	1398325	5.35464638328408e-08	1400840	1405308
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	1405308	4624517	1518	1440	-0.413	5.35464638328408e-08	1400840	1405308	0	4616146	4630481
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	4626272	15275156	4853	4628	0.0165	0	4616146	4630481	3.53315541441309e-15	15271136	15275156
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15276730	15296498	12	12	-0.5183	3.53315541441309e-15	15271136	15275156	2.02901936134271e-15	15296498	15300338
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	15298455	17178556	887	848	0.0228	2.02901936134271e-15	15296498	15300338	6.15677515954928e-15	17174835	17180506
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	17180506	17208319	17	16	0.4849	6.15677515954928e-15	17174835	17180506	3.49799834160846e-12	17205181	17215388
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	17210413	23105894	2116	2030	0.0474	3.49799834160846e-12	17205181	17215388	1.82662336838266e-08	23103054	23105894
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23108527	23113720	3	2	1.0859	1.82662336838266e-08	23103054	23105894	2.95283900308715e-11	23113720	23113720
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	23114764	43654517	4182	4005	0.0164	2.95283900308715e-11	23113720	23113720	4.58428538651228e-138	43649924	43667643
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	43656351	44186199	249	239	0.365	4.58428538651228e-138	43649924	43667643	0	44184546	44206453
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	44206453	49735186	2186	2097	-0.5139	0	44184546	44206453	2.81709853585074e-139	49726779	49740763
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	49736291	50291674	270	257	-0.1155	2.81709853585074e-139	49726779	49740763	9.8006874983491e-121	50288131	50297819
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	50292789	56823430	3086	2953	-0.4679	9.8006874983491e-121	50288131	50297819	9.66981884838599e-14	56822197	56823430
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56840346	8	7	0.2472	9.66981884838599e-14	56822197	56823430	6.10975634559355e-16	56840346	56842447
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59249279	1086	1044	-0.5281	6.10975634559355e-16	56840346	56842447	3.19172711779379e-15	59249279	59249279
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59250742	59251831	2	2	-1.9466	3.19172711779379e-15	59249279	59249279	6.02998367000918e-16	59251831	59251831
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59253728	63788698	2090	1996	-0.5125	6.02998367000918e-16	59251831	59251831	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1499421	585	550	-0.0411	NA	NA	NA	9.3953638954281e-28	1499034	1515948
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1506379	1532433	11	10	0.7106	9.3953638954281e-28	1499034	1515948	5.67279004603524e-32	1521410	1532433
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	8537938	2495	2391	-0.0173	5.67279004603524e-32	1521410	1532433	8.1341942728069e-40	8533193	8542220
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8540052	8540052	1	0	NA	8.1341942728069e-40	8533193	8542220	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8542220	8596057	30	30	0.4472	NA	NA	NA	4.12470330492841e-44	8594427	8599643
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	8597463	25680495	5879	5626	-0.0343	4.12470330492841e-44	8594427	8599643	3.09754206901207e-08	25676660	26076860
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26023784	26102923	8	8	-0.4492	3.09754206901207e-08	25676660	26076860	0.00082147191396154	26068587	26115657
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26106478	26147112	25	23	-0.0317	0.00082147191396154	26068587	26115657	5.91736448319881e-17	26145205	26148060
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26148060	26161111	10	9	-0.7721	5.91736448319881e-17	26145205	26148060	1.24157274255055e-13	26158310	26161111
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26162094	26170594	3	3	-0.0088	1.24157274255055e-13	26158310	26161111	5.81976930499319e-60	26170594	26170594
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	26173123	26173123	1	0	NA	5.81976930499319e-60	26170594	26170594	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	28247413	28266113	4	4	-0.7832	NA	NA	NA	8.40343167309687e-17	28266113	28266113
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29297270	29434404	51	49	-0.0173	8.40343167309687e-17	28266113	28266113	1.13705227463450e-36	29427119	29445282
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	29436537	57348556	10399	9959	0.3938	1.1370522746345e-36	29427119	29445282	1.14957389222752e-171	57325176	57375311
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	57350569	58993725	592	565	0.6602	1.14957389222752e-171	57325176	57375311	3.29070592285397e-13	58984423	59002447
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	58998797	59023253	10	10	1.2059	3.29070592285397e-13	58984423	59002447	9.8704075609144e-07	59018635	59047152
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	59025342	62382266	1474	1410	0.6655	9.8704075609144e-07	59018635	59047152	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	62419534	62419534	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10022306	10	9	-0.5757	NA	NA	NA	2.1491408323424e-10	10013263	10057408
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10057408	10167413	12	12	-1.1232	2.1491408323424e-10	10013263	10057408	4.85099260091366e-45	10167413	10167413
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13342486	13612839	5	5	0.3375	4.85099260091366e-45	10167413	10167413	5.54399625067367e-08	13612839	13615502
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13615502	13882260	30	29	-0.3272	5.54399625067367e-08	13612839	13615502	2.40357274615061e-05	13876293	13882260
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13889359	13956118	5	5	-0.8376	2.40357274615061e-05	13876293	13882260	8.70107630118653e-21	13956118	13956118
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	13992109	13992109	1	0	NA	8.70107630118653e-21	13956118	13956118	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	14047236	46922972	13378	12843	0.0068	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	21570227	2520	2422	0.0329	NA	NA	NA	9.64864187845039e-19	21570227	21570227
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21571489	21571489	1	0	NA	9.6486418784504e-19	21570227	21570227	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21574577	21576859	3	3	1.2482	NA	NA	NA	4.33145710670363e-18	21576859	21576859
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	21579649	22667608	459	444	0.0136	4.33145710670363e-18	21576859	21576859	1.72889530651848e-11	22618049	22682428
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22720195	20	20	0.4015	1.72889530651848e-11	22618049	22682428	1.09030640937859e-16	22714979	22735036
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22721042	28606054	3218	3067	0.0045	1.09030640937859e-16	22714979	22735036	7.06084062418194e-13	28599591	28613000
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28610900	28627112	9	9	-0.5177	7.06084062418194e-13	28599591	28613000	2.71717334537639e-13	28618618	28628752
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	28628752	35468035	3320	3177	0.0087	2.71717334537639e-13	28618618	28628752	3.43482168343123e-07	35460712	35469770
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35469770	35476942	4	4	-0.5801	3.43482168343123e-07	35460712	35469770	8.02894039603217e-06	35474894	35478503
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	36810605	759	726	0.0099	8.02894039603217e-06	35474894	35478503	1.12179517361775e-39	36803285	36822645
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36811830	36982489	87	82	0.3625	1.12179517361775e-39	36803285	36822645	2.63639443798568e-27	36965745	36990998
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	36984863	37685496	365	347	0.0401	2.63639443798568e-27	36965745	36990998	8.03237096480128e-159	37685496	37689058
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37689058	37715385	16	15	-1.8652	8.03237096480128e-159	37685496	37689058	1.37221264139861e-217	37715370	37715385
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37718669	39814831	1059	1017	0.0256	1.37221264139861e-217	37715370	37715385	0	39814831	39814831
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	39815262	39838759	29	28	-1.9085	0	39814831	39814831	0	39838759	39838759
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	39840061	48584128	4252	4076	0.025	0	39838759	39838759	5.02470196542652e-318	48584128	48584128
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48585862	48613770	19	19	-1.8607	5.02470196542652e-318	48584128	48584128	5.12210481933584e-171	48613770	48613770
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	48618709	49018338	185	177	0.0323	5.12210481933584e-171	48613770	48613770	8.87312686736195e-11	49007712	49027619
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49020056	49055523	21	20	0.4515	8.87312686736195e-11	49007712	49027619	2.37311358865459e-13	49047484	49059140
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	49056694	49571068	211	206	0.0441	2.37311358865459e-13	49047484	49059140	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	772351	516	490	-0.0718	NA	NA	NA	1.55456022538644e-23	771824	774894
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	773688	793712	16	15	-0.7766	1.55456022538644e-23	771824	774894	3.63948850166542e-21	788996	796371
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	796371	848806	36	35	-0.0886	3.63948850166542e-21	788996	796371	6.55213918819432e-06	841738	851066
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	849437	863270	12	12	-0.4412	6.55213918819432e-06	841738	851066	1.22594683135026e-05	860688	880626
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	863831	2288878	806	770	-0.0733	1.22594683135026e-05	860688	880626	6.39319221033705e-06	2282972	2294018
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2290678	2301365	13	13	-0.4379	6.39319221033705e-06	2282972	2294018	0.000596371856003438	2299188	2302065
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2302065	2304398	5	5	0.1655	0.000596371856003438	2299188	2302065	1.13185941802464e-09	2304008	2306110
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2341732	42	41	-0.4881	1.13185941802464e-09	2304008	2306110	7.51805819758742e-11	2340193	2341732
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2342739	2346149	6	6	-1.1207	7.51805819758742e-11	2340193	2341732	8.14196351545803e-10	2346149	2348093
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2348093	2412914	71	68	-0.493	8.14196351545803e-10	2346149	2348093	2.79152096605789e-40	2410643	2415262
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2414151	2584381	148	145	-0.0332	2.79152096605789e-40	2410643	2415262	1.16719774297686e-17	2574518	2597023
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2586692	2673365	97	92	0.2647	1.16719774297686e-17	2574518	2597023	0.000366398367684252	2661980	2692523
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2674375	2708113	24	24	-0.0028	0.000366398367684252	2661980	2692523	4.76842370934319e-31	2708113	2711273
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2708291	2891940	74	69	1.1202	4.76842370934319e-31	2708113	2711273	1.11355806466131e-09	2810876	2921975
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2894143	5871851	880	851	0.8661	1.11355806466131e-09	2810876	2921975	3.89576464969823e-45	5862401	5881029
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	5873417	6063634	110	107	1.2855	3.89576464969823e-45	5862401	5881029	3.90438744387137e-13	6056398	6068407
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6065511	6110171	24	23	0.7841	3.90438744387137e-13	6056398	6068407	2.5837302250463e-10	6106641	6119936
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6112382	6270533	48	47	1.2988	2.5837302250463e-10	6106641	6119936	2.50966324012479e-27	6213159	6285362
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	6276354	32677278	10413	9981	0.906	2.50966324012479e-27	6213159	6285362	1.15602025257176e-34	32675236	32677278
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32678377	32715187	19	18	0.1954	1.15602025257176e-34	32675236	32677278	9.04655211808887e-31	32715187	32718068
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	32716638	43494774	3395	3255	0.9071	9.04655211808887e-31	32715187	32718068	0	43491814	43495913
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	43495913	46323857	973	910	0.29	0	43491814	43495913	0	46320297	46329239
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	46326333	66487015	4212	4016	0.8558	0	46320297	46329239	1.29046119011539e-64	66480527	66490330
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	66490330	66759656	69	66	0.2437	1.29046119011539e-64	66480527	66490330	3.86115777757987e-68	66757608	66777411
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	66771184	76998610	2723	2599	0.8618	3.86115777757987e-68	66757608	66777411	1.80317973397351e-12	76998610	76998610
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77008500	77010018	2	2	2.3996	1.80317973397351e-12	76998610	76998610	2.64943410655179e-15	77010018	77010018
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	112719474	9106	8723	0.8963	2.64943410655179e-15	77010018	77010018	1.33658588277046e-20	112694949	112735154
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	112724340	112869463	25	24	1.3974	1.33658588277046e-20	112694949	112735154	3.7137303774221e-21	112858755	112884022
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	112875769	149142008	10974	10451	0.8961	3.7137303774221e-21	112858755	112884022	2.68370784111759e-09	149138851	149155516
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	149143914	149164698	11	8	0.308	2.68370784111759e-09	149138851	149155516	1.80520330418934e-05	149155516	149180107
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	149168960	150106834	413	399	0.8649	1.80520330418934e-05	149155516	149180107	0	150097620	150136964
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	150136964	152669616	996	956	0.2726	0	150097620	150136964	0	152669192	152685212
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152676707	152676750	2	0	NA	0	152669192	152685212	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	152680934	154441943	633	615	0.8119	NA	NA	NA	6.33031563207772e-06	154430816	154441943
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154442377	154450309	5	5	1.5538	6.33031563207772e-06	154430816	154441943	1.05493343999257e-05	154447839	154456891
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	0.94	1.05493343999257e-05	154447839	154456891	3.77955989013085e-91	154578922	154586690
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888033	200	193	-0.053	3.77955989013085e-91	154578922	154586690	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154888224	154888224	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	3034907	121	117	-1.845	NA	NA	NA	0.00937426963635588	2855924	6849773
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3219200	8770463	687	653	-1.5328	0.00937426963635588	2855924	6849773	0.00103507013496805	8543430	8960527
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8773734	10515697	158	151	-1.8517	0.00103507013496805	8543430	8960527	2.53641179308373e-09	10501368	10537808
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	12452734	19	19	-0.7153	2.53641179308373e-09	10501368	10537808	3.72661291871878e-13	11698871	12452734
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12502304	12518008	4	4	-2.8551	3.72661291871878e-13	11698871	12452734	5.02054414164748e-05	12518008	12532441
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12527445	13128515	196	188	-0.9695	5.02054414164748e-05	12518008	12532441	1.95170979348510e-14	13077621	13159901
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13868296	257	248	-1.5847	1.9517097934851e-14	13077621	13159901	0.000789603673392643	13580493	13958455
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13869106	14122129	121	115	-1.9536	0.000789603673392643	13580493	13958455	4.01779607380879e-09	14090255	14320016
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14130722	14508894	128	119	-1.3432	4.01779607380879e-09	14090255	14320016	0.000235824914075937	14480242	14528771
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14579298	25	22	-0.6354	0.000235824914075937	14480242	14528771	1.55522389218479e-05	14569287	14685149
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	16387273	579	557	-1.5008	1.55522389218479e-05	14569287	14685149	1.98616182128459e-06	16103913	16929465
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	22192409	952	899	-1.7497	1.98616182128459e-06	16103913	16929465	1.12489638551845e-07	22165808	22205568
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22308420	25	23	-2.837	1.12489638551845e-07	22165808	22205568	1.76933698914496e-08	22252446	22373608
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22367156	22877495	45	43	-1.7236	1.76933698914496e-08	22252446	22373608	2.98468743790417e-05	22868395	22877495
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22878671	22908342	7	7	-2.9905	2.98468743790417e-05	22868395	22877495	0.000203060624849769	22904627	22908342
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22911915	22921089	7	5	-2.0163	0.000203060624849769	22904627	22908342	0.00947366884993473	22916746	26927707
MSK_252152912012_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22923722	57440809	90	88	-0.9738	0.00947366884993473	22916746	26927707	NA	NA	NA
