Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	61884298	23631	22774	0.0128	NA	NA	NA	5.53104686287083e-35	61878187	61884298
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61887342	61892291	4	4	0.4509	5.53104686287083e-35	61878187	61884298	6.14598714064308e-08	61892291	61893807
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	61893807	72525842	4253	4095	-0.0021	6.14598714064308e-08	61892291	61893807	4.12621075605639e-09	72523186	72533856
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72537426	6	6	-0.3975	4.12621075605639e-09	72523186	72533856	1.51164260074208e-14	72536231	72537426
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72539143	1	0	NA	1.51164260074208e-14	72536231	72537426	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72540240	72579311	13	13	0.3682	NA	NA	NA	4.10276936111311e-18	72571158	72602597
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	72589682	1	0	NA	4.10276936111311e-18	72571158	72602597	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72596993	99174985	8731	8422	-0.006	NA	NA	NA	7.4153482350837e-11	99174985	99174985
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	99178134	99179775	2	2	-0.7529	7.4153482350837e-11	99174985	99174985	1.13934559628615e-10	99179775	99179775
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	99181907	100376747	420	406	7e-04	1.13934559628615e-10	99179775	99179775	9.3523533199165e-07	100372804	100376747
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	100378240	100385204	5	5	0.3844	9.3523533199165e-07	100372804	100376747	2.46967484509679e-07	100385204	100387137
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	100386879	108533257	1969	1900	-0.003	2.46967484509679e-07	100385204	100387137	2.06662976531081e-08	108531247	108533257
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108535814	108538662	3	3	-0.5366	2.06662976531081e-08	108531247	108533257	3.35056854320424e-08	108538662	108541074
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	108541074	109373255	275	267	0.0015	3.35056854320424e-08	108538662	108541074	4.47334713643625e-36	109373255	109373255
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109374790	109376249	2	2	-1.7854	4.47334713643625e-36	109373255	109373255	2.10172563843114e-36	109376249	109376249
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109379566	109379566	1	0	NA	2.10172563843114e-36	109376249	109376249	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109383196	110023268	294	284	0.0121	NA	NA	NA	4.00934283883226e-20	110023268	110023268
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110033018	110039388	3	3	-0.845	4.00934283883226e-20	110023268	110023268	2.13559994037567e-21	110039388	110039388
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110041712	147329819	4563	4400	-0.0051	2.13559994037567e-21	110039388	110039388	1.15063241410215e-23	147315217	147346371
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147346371	147460661	21	21	0.3289	1.15063241410215e-23	147315217	147346371	5.6902309452889e-21	147446584	147471665
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147467273	150819879	1266	1223	0.0189	5.6902309452889e-21	147446584	147471665	0	150819879	150819879
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150823073	150852858	12	12	2.5056	0	150819879	150819879	0	150852858	150852858
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150857070	157133150	2760	2649	0.0168	0	150852858	150852858	4.28539834297834e-40	157133150	157133150
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	1.4795	4.28539834297834e-40	157133150	157133150	4.22849262199486e-44	157136342	157136342
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	3986	-0.0084	4.22849262199486e-44	157136342	157136342	8.50919467780914e-11	167479184	167497116
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	-0.385	8.50919467780914e-11	167479184	167497116	6.27907957724141e-12	167504854	167520743
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	192715640	8702	8420	-0.0022	6.27907957724141e-12	167504854	167520743	2.94034503505396e-17	192715640	192715640
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192718231	192719540	2	2	0.9097	2.94034503505396e-17	192715640	192715640	4.11120522036123e-18	192719540	192719540
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	192723635	194978218	476	460	0.0148	4.11120522036123e-18	192719540	192719540	1.09518231524360e-11	194976022	195009358
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	8	0.375	1.0951823152436e-11	194976022	195009358	9.91898635230278e-10	195065867	195097118
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200609726	2161	2096	0.0078	9.91898635230278e-10	195065867	195097118	5.82717728276633e-21	200600795	200618814
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200612164	200668993	22	21	-0.3234	5.82717728276633e-21	200600795	200618814	3.92315005972767e-21	200652799	200672373
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200670407	222909899	8059	7781	-0.0055	3.92315005972767e-21	200652799	200672373	3.2309309320982e-09	222909899	222909899
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	222914836	222915266	2	2	-0.6978	3.2309309320982e-09	222909899	222909899	4.96601637551792e-09	222915266	222919653
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	222919653	246433956	9137	8830	-0.0059	4.96601637551792e-09	222915266	222919653	1.74672552296089e-27	246409423	246460435
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246440949	246669591	81	78	0.1835	1.74672552296089e-27	246409423	246460435	3.63115867028996e-06	246633505	246691241
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246674083	246751473	14	14	-0.0619	3.63115867028996e-06	246633505	246691241	1.10883468213447e-07	246713340	246755298
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246753652	246875016	34	33	0.2258	1.10883468213447e-07	246713340	246755298	2.06966906180216e-07	246857496	246923366
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246878405	247186514	95	89	0.0343	2.06966906180216e-07	246857496	246923366	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	13113316	4162	4047	-0.0172	NA	NA	NA	1.16029429167888e-35	13108673	13119002
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13119002	13199426	14	14	0.4941	1.16029429167888e-35	13108673	13119002	3.85418875187713e-34	13196226	13200787
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	13200787	33076512	6700	6478	1e-04	3.85418875187713e-34	13196226	13200787	7.95017558630169e-16	33076512	33076512
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33078005	33080437	2	2	0.8991	7.95017558630169e-16	33076512	33076512	4.88546396823921e-18	33080437	33080437
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	33081681	34543992	644	618	0.0023	4.88546396823921e-18	33080437	33080437	4.11270868917563e-57	34543992	34551222
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34589997	18	17	-0.5538	4.11270868917563e-57	34543992	34551222	1.08834594422375e-48	34583814	34591681
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	37787637	1363	1312	-0.0174	1.08834594422375e-48	34583814	34591681	1.99602330339692e-21	37781427	37792669
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37789939	37855837	28	24	-0.3187	1.99602330339692e-21	37781427	37792669	3.30202930913607e-25	37852371	37859985
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	37858379	52600588	5801	5582	3e-04	3.30202930913607e-25	37852371	37859985	0	52600588	52600588
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	-3.79	0	52600588	52600588	0	52635695	52635695
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	65894341	4437	4281	8e-04	0	52635695	52635695	7.87912177126483e-06	65884943	65894341
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	65897884	65909836	5	5	-0.3058	7.87912177126483e-06	65884943	65894341	0.000116241097256539	65909836	65927998
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	65913203	66357387	115	109	-0.019	0.000116241097256539	65909836	65927998	1.23509416114797e-09	66355634	66357387
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66359227	66360747	2	2	-0.6675	1.23509416114797e-09	66355634	66357387	1.16772918725673e-08	66360747	66362975
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66362975	78553451	4158	4004	-0.0025	1.16772918725673e-08	66360747	66362975	2.89463059890337e-07	78545566	78557744
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	78555501	78574729	10	10	0.2717	2.89463059890337e-07	78545566	78557744	4.40918782644157e-07	78569902	78589618
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	78577746	87721951	2444	2355	-0.0017	4.40918782644157e-07	78569902	78589618	3.38054666807376e-11	87661927	87721951
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	87926461	88038874	6	6	0.4369	3.38054666807376e-11	87661927	87721951	4.28006606977076e-11	88038874	88078497
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	88078497	142039625	13675	13163	-0.0058	4.28006606977076e-11	88038874	88078497	2.56170552823526e-19	142039625	142039625
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142041792	142043930	2	2	-1.003	2.56170552823526e-19	142039625	142039625	4.98357533943805e-21	142043930	142043930
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	142051022	146571330	1483	1423	-0.0106	4.98357533943805e-21	142043930	142043930	5.8040087636653e-12	146562545	146571330
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146589486	3	3	-0.6258	5.8040087636653e-12	146562545	146571330	4.94852585010055e-12	146589486	146589486
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146592775	146592775	1	0	NA	4.94852585010055e-12	146589486	146589486	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	154601442	2203	2130	-0.0045	NA	NA	NA	1.08332986944705e-16	154601442	154601442
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154605621	154606943	2	2	0.8873	1.08332986944705e-16	154601442	154601442	4.15067848045389e-16	154606943	154606943
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	154608095	179764819	8998	8687	-0.0091	4.15067848045389e-16	154606943	154606943	5.48384587282566e-22	179764819	179764819
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179767214	179767214	1	0	NA	5.48384587282566e-22	179764819	179764819	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	0.8411	NA	NA	NA	1.46939325264052e-21	179778919	179778919
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	237973687	19744	19037	-0.0015	1.46939325264052e-21	179778919	179778919	1.08483997049947e-26	237973687	237973687
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	237975834	237979236	3	3	-0.9356	1.08483997049947e-26	237973687	237973687	2.65439795219107e-21	237979236	237979236
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	237981552	242506262	1730	1669	-0.0033	2.65439795219107e-21	237979236	237979236	2.15868752059797e-13	242478404	242523086
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242512310	242677069	61	57	0.1691	2.15868752059797e-13	242478404	242523086	0.00310317707204506	242643111	242682950
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242677220	242689978	4	4	-0.0431	0.00310317707204506	242643111	242682950	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	586636	198	181	-0.0224	NA	NA	NA	2.01051267110841e-09	574416	592415
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	589224	635754	12	12	0.2415	2.01051267110841e-09	574416	592415	8.1203844174951e-07	613770	654388
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	641257	641257	1	0	NA	8.1203844174951e-07	613770	654388	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	643285	47460892	16007	15437	-0.0067	NA	NA	NA	8.7299945232914e-22	47460892	47460892
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	1.0381	8.7299945232914e-22	47460892	47460892	5.09870727602065e-20	47466921	47466921
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	52999601	2441	2340	0.0256	5.09870727602065e-20	47466921	47466921	2.18838139269846e-30	52999601	52999601
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53001678	53001678	1	0	NA	2.18838139269846e-30	52999601	52999601	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53003136	53011885	5	5	-0.7603	NA	NA	NA	1.45359963713097e-27	53011885	53011885
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	53014254	65160634	4843	4679	-0.0165	1.45359963713097e-27	53011885	53011885	3.73265622352439e-17	65160634	65160634
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65170560	65184180	2	2	-0.9501	3.73265622352439e-17	65160634	65160634	3.24153075953733e-18	65184180	65184180
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	65195223	99891210	8671	8360	-0.0069	3.24153075953733e-18	65184180	65184180	2.54549707312386e-19	99891210	99891210
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	0.9634	2.54549707312386e-19	99891210	99891210	9.57057382864427e-19	99897201	99897201
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	163992903	21303	20598	-0.0065	9.57057382864427e-19	99897201	99897201	3.14381559362143e-43	163989367	164001657
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	163997228	164093750	24	22	-0.4454	3.14381559362143e-43	163989367	164001657	1.15380296104474e-44	164083826	164100804
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164100804	191217656	9125	8787	-0.0016	1.15380296104474e-44	164083826	164100804	1.05948371835946e-99	191217656	191217656
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191219222	191219222	1	0	NA	1.05948371835946e-99	191217656	191217656	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191221758	191222891	2	2	-2.2256	NA	NA	NA	6.12744070877447e-87	191222891	191222891
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	191224191	196835413	2009	1941	-0.0144	6.12744070877447e-87	191222891	191222891	3.50455130004598e-154	196835413	196904349
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196904349	196929826	20	18	-0.9299	3.50455130004598e-154	196835413	196904349	2.04019190527233e-09	196928503	196940125
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196940125	196958467	9	8	-0.3452	2.04019190527233e-09	196928503	196940125	7.33741499721468e-10	196950095	196964180
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196961238	198823667	735	709	0.0186	7.33741499721468e-10	196950095	196964180	2.63563391923811e-07	198819935	198823667
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198871596	198873921	2	2	-0.6185	2.63563391923811e-07	198819935	198823667	1.31379753948576e-07	198873921	198873921
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	198878828	199329592	217	211	0.0323	1.31379753948576e-07	198873921	198873921	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	34445002	9564	9250	-0.0073	NA	NA	NA	7.47067410751866e-29	34445002	34445002
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34457648	34485596	5	5	-0.7702	7.47067410751866e-29	34445002	34445002	2.73794456180502e-30	34485596	34485596
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34491115	64376590	7782	7526	-0.0032	2.73794456180502e-30	34485596	34485596	0	64376590	64376590
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64381871	64390333	2	2	-5.0706	0	64376590	64376590	0	64390333	64390333
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	64398986	88752705	7679	7415	-8e-04	0	64390333	64390333	8.62164254090247e-15	88752705	88752705
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-0.8667	8.62164254090247e-15	88752705	88752705	5.41234154706141e-16	88756721	88756721
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	94073863	1861	1795	-0.0024	5.41234154706141e-16	88756721	88756721	1.00042542230065e-15	94073863	94073863
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94078581	2	2	-0.8603	1.00042542230065e-15	94073863	94073863	1.03763074397508e-14	94078581	94078581
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94084961	107275274	4255	4102	-0.0029	1.03763074397508e-14	94078581	94078581	0	107275274	107275274
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	-3.6465	0	107275274	107275274	0	107281410	107281410
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	119462240	3648	3522	-0.005	0	107281410	107281410	5.5202607733105e-15	119462240	119462240
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119463989	119466502	2	2	-0.8476	5.5202607733105e-15	119462240	119462240	3.46564796654827e-14	119466502	119466502
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	119468661	173224400	14834	14312	-0.0034	3.46564796654827e-14	119466502	119466502	2.13919878824871e-29	173224400	173224400
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.195	2.13919878824871e-29	173224400	173224400	1.05184253907399e-27	173228860	173228860
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	189	0.0192	1.05184253907399e-27	173228860	173228860	1.02628806628655e-26	173660684	173660684
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	1.166	1.02628806628655e-26	173660684	173660684	7.29155918993668e-28	173666072	173666072
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	191153613	5324	5134	-0.0095	7.29155918993668e-28	173666072	173666072	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	681141	197	190	0.0087	NA	NA	NA	3.36601940066394e-15	681141	681141
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	682455	686701	2	2	-0.8791	3.36601940066394e-15	681141	681141	1.12015935393037e-14	686701	686701
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	689372	155405839	45284	43624	-0.0058	1.12015935393037e-14	686701	686701	1.09212843778471e-16	155405839	155411053
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155411053	155420791	4	4	-0.6614	1.09212843778471e-16	155405839	155411053	1.32736171825806e-16	155418745	155420791
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	155421443	178040439	7249	7001	-0.0043	1.32736171825806e-16	155418745	155420791	1.49396347918214e-15	178040439	178040439
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	0.8957	1.49396347918214e-15	178040439	178040439	5.25076444314588e-13	178045608	178045608
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	179012917	390	374	0.0347	5.25076444314588e-13	178045608	178045608	4.06875137960517e-07	179010815	179012917
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179018160	179019069	2	2	0.6777	4.06875137960517e-07	179010815	179012917	1.49430453313455e-08	179019069	179023414
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179023414	179429409	212	203	0.0321	1.49430453313455e-08	179019069	179023414	4.98436110990368e-22	179429409	179429409
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179430821	179431937	2	2	-0.9946	4.98436110990368e-22	179429409	179429409	2.57080891309577e-21	179431937	179431937
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	179433578	180342860	302	295	0.0166	2.57080891309577e-21	179431937	179431937	1.09850004749382e-28	180342860	180342860
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6094	1.09850004749382e-28	180342860	180342860	1.85551391528312e-23	180357210	180362342
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	107	0.0255	1.85551391528312e-23	180357210	180362342	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	38	-0.0199	NA	NA	NA	1.76083094907825e-64	198124	200350
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	241674	17	15	-0.6959	1.76083094907825e-64	198124	200350	7.27417291972495e-06	237952	256810
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	244363	326323	44	41	-0.4828	7.27417291972495e-06	237952	256810	7.71268908043656e-98	323898	327962
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	327962	29995247	10496	10154	-0.0057	7.71268908043656e-98	323898	327962	7.55778256126957e-18	29992946	30005338
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29998009	30031367	10	10	0.414	7.55778256126957e-18	29992946	30005338	1.81899242058491e-12	30010234	30040901
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30033946	31382291	573	550	0.0202	1.81899242058491e-12	30010234	30040901	4.87362293218348e-41	31382291	31382291
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31385778	2	2	-1.6432	4.87362293218348e-41	31382291	31382291	2.21799770637137e-36	31385778	31385778
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31387708	32558677	495	484	0.0267	2.21799770637137e-36	31385778	31385778	4.19415896373453e-280	32558677	32564884
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32633691	17	17	-2.0167	4.19415896373453e-280	32558677	32564884	3.97961257810718e-07	32629848	32633691
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32634977	32654861	4	4	0.5219	3.97961257810718e-07	32629848	32633691	0.00262733735820307	32653710	32668835
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32657601	32713363	24	24	-0.0299	0.00262733735820307	32653710	32668835	1.42011998875200e-12	32713363	32718991
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32716255	32728487	8	8	1.0353	1.420119988752e-12	32713363	32718991	0.000105021269815048	32721872	32731072
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32731072	32762061	13	13	0.2655	0.000105021269815048	32721872	32731072	9.95110068578393e-07	32739800	32775858
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32766023	35862502	1333	1280	0.0114	9.95110068578393e-07	32739800	32775858	1.98677297463161e-12	35862270	35862502
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35864636	35873335	6	6	0.5051	1.98677297463161e-12	35862270	35862502	2.46592201451852e-15	35873335	35875112
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	35875112	54035000	6907	6670	-0.0019	2.46592201451852e-15	35873335	35875112	0	54035000	54035000
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54042734	3	3	-3.5637	0	54035000	54035000	0	54042734	54042734
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	79015901	6431	6183	0.0017	0	54042734	54042734	5.71663958917984e-23	79011979	79015901
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79018959	79018959	1	0	NA	5.71663958917984e-23	79011979	79015901	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	0.4208	NA	NA	NA	4.81112916003178e-24	79091850	79095415
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	103841482	6762	6520	-0.0043	4.81112916003178e-24	79091850	79095415	8.12033765449587e-32	103841482	103841482
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103845083	103868154	4	4	0.8738	8.12033765449587e-32	103841482	103841482	2.48138984609131e-31	103868154	103868154
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	103873584	126224141	7272	6998	-0.0044	2.48138984609131e-31	103868154	103868154	7.77414776736103e-08	126222708	126224141
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	126226097	126228177	2	2	0.6358	7.77414776736103e-08	126222708	126224141	5.34971016234475e-08	126228177	126231585
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	126231585	134629897	3206	3098	-0.0101	5.34971016234475e-08	126228177	126231585	3.56298339771718e-26	134629897	134629897
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134631701	134635779	4	4	-0.818	3.56298339771718e-26	134629897	134629897	1.91562058754272e-29	134635779	134635779
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	134639397	139643729	1896	1833	-0.0123	1.91562058754272e-29	134635779	134635779	3.39383938596477e-19	139643729	139643729
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139645417	139648318	3	3	0.742	3.39383938596477e-19	139643729	139643729	7.69264165729288e-19	139648318	139648318
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	139651247	145127276	1626	1575	-0.0128	7.69264165729288e-19	139648318	139648318	6.50710248970515e-33	145127276	145127276
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	145129257	145132461	3	3	-1.0054	6.50710248970515e-33	145127276	145127276	4.25119544752463e-30	145132461	145132461
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	145133808	165643653	7094	6826	-0.0052	4.25119544752463e-30	145132461	145132461	0	165643653	165643653
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-3.1329	0	165643653	165643653	0	165650610	165650610
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170182421	1597	1539	-0.0224	0	165650610	165650610	9.47225267886074e-10	170178522	170187881
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	170184612	170192471	4	4	-0.5495	9.47225267886074e-10	170178522	170187881	4.91704676777185e-10	170187881	170195811
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	170195811	170753106	203	194	0.0021	4.91704676777185e-10	170187881	170195811	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1036135	258	254	0.0087	NA	NA	NA	3.14406190062272e-23	1036135	1036135
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1037402	1047707	4	4	-0.8333	3.14406190062272e-23	1036135	1036135	4.90840150467217e-27	1047707	1047707
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	93162991	28186	27246	-0.0014	4.90840150467217e-27	1047707	1047707	3.86709148682594e-16	93162991	93162991
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93165160	93168978	2	2	0.918	3.86709148682594e-16	93162991	93162991	5.32203265541735e-16	93168978	93168978
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	93172507	109216032	6510	6283	0.011	5.32203265541735e-16	93168978	93168978	1.30886948338473e-12	109214735	109216032
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109240210	6	6	0.4784	1.30886948338473e-12	109214735	109216032	4.41200399048031e-14	109240210	109244233
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109244233	109967918	301	293	-0.0106	4.41200399048031e-14	109240210	109244233	6.43488821506765e-10	109967918	109967918
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109970524	109974402	2	2	0.697	6.43488821506765e-10	109967918	109967918	1.64592686106921e-09	109974402	109974402
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109976628	118611324	3996	3849	-0.0076	1.64592686106921e-09	109974402	109974402	3.87905687323367e-31	118611324	118611324
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118618468	118619693	2	2	1.2416	3.87905687323367e-31	118611324	118611324	2.32765561402973e-31	118619693	118619693
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118620875	118620875	1	0	NA	2.32765561402973e-31	118619693	118619693	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	118622742	125831554	3170	3051	-0.003	NA	NA	NA	4.55992242695889e-41	125831554	125831554
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.1573	4.55992242695889e-41	125831554	125831554	1.32241743157915e-40	125837524	125837524
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	141413352	7363	7100	0.0023	1.32241743157915e-40	125837524	125837524	1.55335016809053e-26	141410894	141414719
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141414719	141438504	12	12	0.4717	1.55335016809053e-26	141410894	141414719	2.80998970406102e-22	141435643	141440184
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141440184	142007171	249	243	0.0138	2.80998970406102e-22	141435643	141440184	5.60082693560803e-13	141992419	142036600
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142009000	142196011	58	57	0.1933	5.60082693560803e-13	141992419	142036600	1.2173218224021e-20	142161005	142212348
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142198376	147702365	2332	2269	-0.0044	1.2173218224021e-20	142161005	142212348	1.58431325395216e-64	147702365	147702365
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147704200	147707161	2	2	-1.882	1.58431325395216e-64	147702365	147702365	3.04437253453215e-61	147707161	147707161
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	147708382	158821263	4238	4074	-0.0044	3.04437253453215e-61	147707161	147707161	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	581533	119	114	0.011	NA	NA	NA	1.70673739262078e-116	581533	581533
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	585010	588865	2	2	-2.9298	1.70673739262078e-116	581533	581533	2.51301770587079e-156	588865	588865
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	591112	3771559	1246	1214	-0.0119	2.51301770587079e-156	588865	588865	1.90363655420335e-14	3771559	3771559
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3773975	3776617	2	2	-0.914	1.90363655420335e-14	3771559	3771559	6.25722813454182e-16	3776617	3776617
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	3779135	39350798	11705	11305	-0.0055	6.25722813454182e-16	3776617	3776617	0	39350798	39350798
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	0.8157	0	39350798	39350798	0	39505256	39505256
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	146264846	31433	30284	-0.0044	0	39505256	39505256	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	22477358	7837	7550	-0.0068	NA	NA	NA	5.29140749208242e-14	22477358	22477358
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22486980	22492603	2	2	0.8316	5.29140749208242e-14	22477358	22477358	7.25891872510384e-16	22492603	22492603
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	22499541	28178733	1343	1289	-0.0176	7.25891872510384e-16	22492603	22492603	0	28178733	28178733
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28180047	28338069	77	77	-0.8647	0	28178733	28178733	0	28338069	28338069
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	28344161	39146895	3472	3344	0.0054	0	28338069	28338069	1.79093975112364e-17	39130211	43599449
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	43445839	47002187	9	8	-0.4567	1.79093975112364e-17	39130211	43599449	1.59898440538949e-14	43644906	66245109
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	66245109	70926188	332	319	-0.0173	1.59898440538949e-14	43644906	66245109	1.16746975766012e-24	70926188	70926188
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-1.2059	1.16746975766012e-24	70926188	70926188	4.07094688754995e-29	70930528	70930528
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	116124007	15468	14959	-0.0067	4.07094688754995e-29	70930528	70930528	4.78883419584369e-22	116124007	116124007
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	1.0393	4.78883419584369e-22	116124007	116124007	2.23661149953909e-20	116130333	116130333
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	134542664	7250	6982	0.0046	2.23661149953909e-20	116130333	116130333	3.18872734317144e-16	134542664	134542664
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134544331	134545846	2	2	0.8164	3.18872734317144e-16	134542664	134542664	6.2057396634477e-11	134545846	134545846
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	134548747	137352394	1043	1018	0.0229	6.2057396634477e-11	134545846	134545846	9.98615266522332e-21	137352394	137352394
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.1196	9.98615266522332e-21	137352394	137352394	8.99405985552182e-19	137356880	137356880
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1054	0.0264	8.99405985552182e-19	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4510	-0.0086	NA	NA	NA	8.41173579637611e-12	13553503	13553503
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-0.7989	8.41173579637611e-12	13553503	13553503	6.56764498658828e-13	13556315	13556315
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	27038538	5045	4872	-0.002	6.56764498658828e-13	13556315	13556315	3.10070470237365e-10	27038538	27038538
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27040181	27041812	2	2	0.7115	3.10070470237365e-10	27038538	27038538	1.52909682608248e-10	27041812	27041812
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	27043861	31284926	1561	1503	-6e-04	1.52909682608248e-10	27041812	27041812	0	31284926	31284926
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31287101	31291525	3	3	-5.2843	0	31284926	31284926	0	31291525	31291525
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	31293140	44521469	2830	2740	-0.0079	0	31291525	31291525	6.38264663547402e-100	44513931	44521469
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44529037	44679038	39	37	0.5282	6.38264663547402e-100	44513931	44521469	7.25514092895312e-103	44679038	44684091
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	44684091	70949263	7511	7273	-0.0059	7.25514092895312e-103	44679038	44684091	9.64945085221236e-23	70949263	70949263
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70952973	70960187	4	4	-0.7778	9.64945085221236e-23	70949263	70949263	8.11130479185745e-25	70960187	70960187
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	70964344	77917893	2913	2828	0.0084	8.11130479185745e-25	70960187	70960187	1.68965102026038e-06	77917870	77917893
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	2	0.5934	1.68965102026038e-06	77917870	77917893	1.65984542170183e-06	77928738	77936034
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	90929750	3935	3811	-0.0092	1.65984542170183e-06	77928738	77936034	9.67822812291223e-15	90929750	90929750
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	90932995	90939367	2	2	-0.8964	9.67822812291223e-15	90929750	90929750	2.70259451959797e-15	90939367	90939367
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	90947373	104941875	5659	5463	0.0022	2.70259451959797e-15	90939367	90939367	9.80647291305772e-21	104941875	104946753
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	104943343	104943343	1	0	NA	9.80647291305772e-21	104941875	104946753	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	104946753	104954509	6	6	0.604	NA	NA	NA	4.74671739425967e-23	104952833	104954509
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	104955079	104955079	1	0	NA	4.74671739425967e-23	104952833	104954509	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	104963436	124327243	6729	6482	-0.0046	NA	NA	NA	3.83381449592252e-28	124327243	124327243
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124328915	124328915	1	0	NA	3.83381449592252e-28	124327243	124327243	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124337128	124340356	3	3	-0.9532	NA	NA	NA	3.17972362780986e-26	124340356	124340356
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	124368725	127563278	1158	1108	-0.0118	3.17972362780986e-26	124340356	124340356	3.87467239815023e-07	127551446	127569849
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127566573	127592138	13	12	0.2387	3.87467239815023e-07	127551446	127569849	3.30447907458025e-08	127584068	127607438
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	127598425	132797428	1769	1707	-0.0242	3.30447907458025e-08	127584068	127607438	0	132797428	132797428
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132799212	132801463	2	2	-4.4185	0	132797428	132797428	3.27358191175218e-304	132801463	132801463
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132802775	132802775	1	0	NA	3.27358191175218e-304	132801463	132801463	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	132806049	135285645	933	892	-0.0118	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	4923300	1772	1702	0.0117	NA	NA	NA	0	4923300	4923300
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4926583	4932214	5	5	-4.4867	0	4923300	4923300	0	4932214	4932214
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	4934594	5741031	361	350	0.0079	0	4932214	4932214	9.01151102709502e-55	5738494	5741031
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.6347	9.01151102709502e-55	5738494	5741031	1.32498972082283e-60	5765438	5765438
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	18892456	5218	5008	-0.0012	1.32498972082283e-60	5765438	5765438	5.79001992315619e-13	18890351	18892456
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18896166	18896166	1	0	NA	5.79001992315619e-13	18890351	18892456	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.473	NA	NA	NA	5.01709919017399e-13	18917191	18929375
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	55118214	9527	9214	-0.0012	5.01709919017399e-13	18917191	18929375	1.22197278633065e-80	55114405	55124730
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	39	-0.4528	1.22197278633065e-80	55114405	55124730	9.43258698983835e-09	55202450	55219985
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	55255699	18	18	-0.7751	9.43258698983835e-09	55202450	55219985	0.000122334579865281	55250131	55264250
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55258834	55280090	10	9	-1.088	0.000122334579865281	55250131	55264250	0.000878492293510484	55268056	55287867
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55281217	55302292	9	9	-0.7115	0.000878492293510484	55268056	55287867	7.99515029659236e-47	55300323	55302292
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55306596	58383355	1209	1163	0.0025	7.99515029659236e-47	55300323	55302292	7.75563311273442e-12	58383355	58383355
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58389208	58390670	2	2	-0.7674	7.75563311273442e-12	58383355	58383355	2.15956720142768e-13	58390670	58390670
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	58404501	81177333	8626	8275	0.0134	2.15956720142768e-13	58390670	58390670	3.02111975491551e-25	81177333	81177333
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81187470	81192409	2	2	-1.1349	3.02111975491551e-25	81177333	81177333	4.20540556896996e-26	81192409	81192409
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81202118	81530809	79	78	0.0031	4.20540556896996e-26	81192409	81192409	3.43969516328557e-08	81530809	81530809
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81536990	81538067	2	2	0.642	3.43969516328557e-08	81530809	81530809	2.09296522656610e-08	81538067	81538067
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81540765	99025912	5537	5321	-0.0093	2.0929652265661e-08	81538067	81538067	1.91051017340059e-10	99010068	99030209
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99027331	99074552	22	21	0.2135	1.91051017340059e-10	99010068	99030209	2.33487119221735e-10	99064450	99085113
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99076224	106733851	2522	2448	-0.0065	2.33487119221735e-10	99064450	99085113	1.52743237242076e-05	106732431	106733851
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106744337	106745403	2	2	0.5233	1.52743237242076e-05	106732431	106733851	0	106745403	106745403
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106746568	106747920	2	2	0.7028	0	106745403	106745403	8.9727744512456e-10	106747920	106747920
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	106754784	131427991	9079	8766	-0.006	8.9727744512456e-10	106747920	106747920	8.32318063456596e-06	131424148	131429532
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131429532	131436397	5	5	0.3475	8.32318063456596e-06	131424148	131429532	3.70593218342686e-06	131436397	131441189
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131437885	134450318	1234	1185	-0.0314	3.70593218342686e-06	131436397	131441189	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	736988	296	283	0.0273	NA	NA	NA	3.33703138047696e-29	736988	736988
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	738240	743223	4	4	-0.8423	3.33703138047696e-29	736988	736988	1.39364216873932e-25	743223	743223
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	745410	7899058	2952	2846	9e-04	1.39364216873932e-25	743223	743223	3.03749098946893e-14	7879321	7913049
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7900758	7981679	33	32	0.2258	3.03749098946893e-14	7879321	7913049	1.10415156217655e-13	7975671	8005058
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	7985677	9523923	457	445	0.008	1.10415156217655e-13	7975671	8005058	4.80211415755645e-219	9523923	9523923
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9554149	5	5	2.1762	4.80211415755645e-219	9523923	9523923	3.75722027771306e-13	9554149	9554149
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9555181	9610054	11	10	1.0551	3.75722027771306e-13	9554149	9554149	2.38613286241559e-105	9610054	9610054
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11109483	568	550	-0.0064	2.38613286241559e-105	9610054	9610054	2.60789791212166e-18	11109483	11109483
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11110735	11116883	3	3	-0.8039	2.60789791212166e-18	11109483	11109483	0.00136669755721633	11116883	11123452
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	-2.797	0.00136669755721633	11116883	11123452	9.12700781799818e-122	11128557	11140421
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	70	-0.0126	9.12700781799818e-122	11128557	11140421	1.82770335312729e-11	11389830	11395862
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-0.4096	1.82770335312729e-11	11389830	11395862	4.55619062583106e-09	11435643	11452868
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	31132762	6743	6514	-0.0069	4.55619062583106e-09	11435643	11452868	3.22402917484141e-36	31132716	31173065
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31237505	17	16	0.475	3.22402917484141e-36	31132716	31173065	2.24985398308671e-35	31230579	31242528
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31242528	78668041	15380	14857	0.005	2.24985398308671e-35	31230579	31242528	1.26407685671495e-09	78665408	78668041
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78675711	78686371	6	4	-0.4992	1.26407685671495e-09	78665408	78668041	9.3183270219331e-10	78686371	78688893
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	98316278	5921	5731	-0.0025	9.3183270219331e-10	78686371	78688893	3.29865106493729e-10	98314473	98316278
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98318378	98320165	3	3	-0.5883	3.29865106493729e-10	98314473	98316278	7.75977429909354e-10	98320165	98327582
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	98327582	109825558	4432	4279	1e-04	7.75977429909354e-10	98320165	98327582	3.9818293023454e-07	109823252	109827936
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	109827936	109832642	3	3	-0.5063	3.9818293023454e-07	109823252	109827936	8.90291999055859e-11	109829291	109833966
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	109833966	132289090	8244	7955	0.0089	8.90291999055859e-11	109829291	109833966	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	18843779	184	178	0.0192	NA	NA	NA	1.36018137726677e-15	18841527	18854263
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18846451	18848524	2	0	NA	1.36018137726677e-15	18841527	18854263	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18854263	18864923	6	6	-0.4289	NA	NA	NA	1.59163576544495e-10	18861890	18975185
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18898600	49964838	12027	11592	-0.0064	1.59163576544495e-10	18861890	18975185	6.6687160969779e-225	49964838	49964838
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49968215	49971732	2	2	-3.2765	6.6687160969779e-225	49964838	49964838	3.54389387429162e-220	49971732	49971732
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	49974447	68132217	4509	4364	-0.003	3.54389387429162e-220	49971732	49971732	2.12022364145704e-08	68124722	68147831
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68134536	68161714	13	11	0.2796	2.12022364145704e-08	68124722	68147831	9.4625453537447e-08	68151860	68168882
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	68163523	71703277	1027	984	0.0025	9.4625453537447e-08	68151860	68168882	3.26160318229837e-07	71701508	71703277
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71705959	71708737	2	2	-0.6197	3.26160318229837e-07	71701508	71703277	2.22872962912985e-07	71708737	71720727
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	71720727	99417382	8735	8425	-0.0058	2.22872962912985e-07	71708737	71720727	3.85191471604329e-08	99417382	99417382
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99419235	99421920	2	2	-0.6481	3.85191471604329e-08	99417382	99417382	2.48779544836926e-08	99421920	99421920
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	99423114	100689280	570	549	-0.0027	2.48779544836926e-08	99421920	99421920	0	100689280	100689280
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100690991	100690991	1	0	NA	0	100689280	100689280	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100692746	100693892	2	2	-5.6056	NA	NA	NA	0	100693892	100693892
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	100695073	113788788	4410	4242	-0.0162	0	100693892	100693892	3.45621902866988e-30	113788788	113788788
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-1.2423	3.45621902866988e-30	113788788	113788788	8.8688993153322e-24	113792974	113792974
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	148	-0.0114	8.8688993153322e-24	113792974	113792974	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	18537177	5	5	0.0317	NA	NA	NA	5.26431736440751e-12	18527871	18544772
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18544772	19494416	55	51	-0.6365	5.26431736440751e-12	18527871	18544772	1.35690793946596e-181	19492531	19497023
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21432670	948	916	0.0048	1.35690793946596e-181	19492531	19497023	5.2039232650381e-49	21413242	21455790
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21438704	22048569	303	290	0.1583	5.2039232650381e-49	21413242	21455790	1.06071676936671e-62	22031369	22064175
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22049850	34674458	4439	4273	0.0067	1.06071676936671e-62	22031369	22064175	4.31737778535753e-42	34674458	34674458
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.1914	4.31737778535753e-42	34674458	34674458	1.05402408067672e-42	34683810	34683810
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1835	0.0063	1.05402408067672e-42	34683810	34683810	4.70694935423356e-16	40670538	40676611
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.4566	4.70694935423356e-16	40670538	40676611	1.01865694581758e-16	40726930	40746865
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	40741934	1	0	NA	1.01865694581758e-16	40726930	40746865	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40746865	69086125	9971	9602	-0.0023	NA	NA	NA	7.77214361299018e-25	69086125	69086125
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69088190	69092211	3	3	-0.9091	7.77214361299018e-25	69086125	69086125	5.36376187821139e-24	69092211	69092211
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	69093444	79174722	4710	4529	0.0022	5.36376187821139e-24	69092211	69092211	4.17748434435816e-06	79170216	79174722
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79176037	79183154	4	4	0.4138	4.17748434435816e-06	79170216	79174722	2.02315345876148e-10	79183154	79186704
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	79185548	105597555	9297	8951	-0.0013	2.02315345876148e-10	79183154	79186704	7.92789669054748e-11	105594189	105609466
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	11	-0.3255	7.92789669054748e-11	105594189	105609466	6.64650804257426e-05	105623070	105736164
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105850033	48	48	0.0193	6.64650804257426e-05	105623070	105736164	1.41126011374572e-09	105846004	105850033
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105856591	105881893	7	7	0.585	1.41126011374572e-09	105846004	105850033	2.14839865670452e-11	105881893	105898108
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105897061	105948347	17	16	-0.017	2.14839865670452e-11	105881893	105898108	9.4682371051022e-15	105948347	105951399
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105951399	106002179	17	17	-0.6917	9.4682371051022e-15	105948347	105951399	4.02578598471079e-52	105998412	106002179
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106013552	106358491	142	137	0.0133	4.02578598471079e-52	105998412	106002179	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	4	0.0212	NA	NA	NA	4.09510891732329e-13	18452491	18692865
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	19537035	94	91	-0.7417	4.09510891732329e-13	18452491	18692865	4.65557476155695e-18	19465359	19800789
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19800789	19845942	11	11	-0.1399	4.65557476155695e-18	19465359	19800789	7.774852687366e-07	19845942	19845942
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19874677	19882711	3	3	-1.0524	7.774852687366e-07	19845942	19845942	5.85557555400928e-15	19882711	19910696
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19910696	20321772	47	45	-0.2964	5.85557555400928e-15	19882711	19910696	2.41222676068241e-28	20308014	20339495
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20330200	22021181	320	306	-0.0152	2.41222676068241e-28	20308014	20339495	5.44457584579801e-16	21996787	22021181
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22038880	22250971	5	5	-0.6115	5.44457584579801e-16	21996787	22021181	6.28729692645865e-18	22250971	22351404
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	22351404	75115806	21400	20619	5e-04	6.28729692645865e-18	22250971	22351404	7.12507820613827e-13	75115806	75115806
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	0.8288	7.12507820613827e-13	75115806	75115806	4.07715053407775e-13	75119713	75119713
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	100217181	9430	9120	-0.0051	4.07715053407775e-13	75119713	75119713	3.94061675058955e-09	100212401	100217181
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	100217283	100298352	5	5	-0.4497	3.94061675058955e-09	100212401	100217181	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	22338034	7548	7305	0.0142	NA	NA	NA	1.8777340916386e-15	22324719	22541389
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22541389	22617217	11	11	-0.3751	1.8777340916386e-15	22324719	22541389	6.02335610981204e-16	22609825	22636249
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	32379126	3014	2902	0.0199	6.02335610981204e-16	22609825	22636249	1.90189145903976e-131	31862577	32481309
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33647856	46	46	-0.5289	1.90189145903976e-131	31862577	32481309	7.42708814016192e-130	33559207	33830585
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33830585	54352394	3077	2975	-0.0042	7.42708814016192e-130	33559207	33830585	5.61884439048112e-83	54352394	54368717
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54379839	10	10	-0.9449	5.61884439048112e-83	54352394	54368717	4.51824327576031e-05	54376805	54379839
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54390060	54408446	6	6	0.7555	4.51824327576031e-05	54376805	54379839	5.59910808926997e-29	54400475	54408446
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	57203733	1197	1148	0.0138	5.59910808926997e-29	54400475	54408446	2.58070869305189e-28	57203733	57203733
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	1.2595	2.58070869305189e-28	57203733	57203733	8.17233931547656e-32	57206772	57206772
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3280	0.0139	8.17233931547656e-32	57206772	57206772	3.09080787473242e-21	68693014	68693086
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68753209	10	9	-0.4684	3.09080787473242e-21	68693014	68693086	5.62271564069978e-20	68753209	68838384
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68838384	75093957	2214	2133	0.0073	5.62271564069978e-20	68753209	68838384	1.96618315072168e-21	75093957	75093957
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	0.8593	1.96618315072168e-21	75093957	75093957	9.65612546458395e-20	75100865	75100865
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	88690571	5131	4947	-0.0075	9.65612546458395e-20	75100865	75100865	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11604	0.0177	NA	NA	NA	1.42011155076439e-20	31447686	31462463
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	19	-0.3235	1.42011155076439e-20	31447686	31462463	1.9150636752127e-22	31493990	31891535
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	355	0.0191	1.9150636752127e-22	31493990	31891535	1.84834294440379e-14	32828797	32828797
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	0.8427	1.84834294440379e-14	32828797	32828797	2.66391022988791e-11	32832642	32832642
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1401	0.0294	2.66391022988791e-11	32832642	32832642	0	36673853	36673853
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-2.6757	0	36673853	36673853	0	36684619	36684619
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	36686013	1	0	NA	0	36684619	36684619	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36687917	38785056	917	894	0.0321	NA	NA	NA	1.42071539955532e-08	38784700	38785056
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38793428	38797777	3	3	0.5653	1.42071539955532e-08	38784700	38785056	6.84988576405024e-07	38797777	38801612
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	38800654	41519702	1090	1049	0.0417	6.84988576405024e-07	38797777	38801612	1.02908383799199e-40	41518222	41519702
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41521544	41568539	22	19	0.5365	1.02908383799199e-40	41518222	41519702	4.18058388504341e-49	41568539	41570512
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41570512	78653545	13724	13251	0.0158	4.18058388504341e-49	41568539	41570512	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	13635046	4778	4583	-0.0045	NA	NA	NA	7.72334882863235e-08	13632773	13635046
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	13637267	13642184	3	3	-0.5186	7.72334882863235e-08	13632773	13635046	9.06533336343581e-09	13638863	13644809
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	13644809	76116026	18183	17493	-0.0113	9.06533336343581e-09	13638863	13644809	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	11448975	5172	4992	0.0457	NA	NA	NA	2.53326055587648e-10	11448975	11448975
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11450908	11452390	2	2	0.8363	2.53326055587648e-10	11448975	11448975	1.68874080581889e-21	11452390	11452390
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	11453579	40540618	7519	7247	0.0224	1.68874080581889e-21	11452390	11452390	3.76256522949674e-20	40540618	40540618
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40543992	40553315	3	3	0.8475	3.76256522949674e-20	40540618	40540618	1.39696877783679e-18	40553315	40553315
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40556205	63788698	10363	9995	0.0317	1.39696877783679e-18	40553315	40553315	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	567	-0.009	NA	NA	NA	8.09181865153944e-50	1506379	1515948
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1532433	10	10	0.7667	8.09181865153944e-50	1506379	1515948	5.342126907366e-58	1528899	1532433
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	36439385	11592	11153	-0.001	5.342126907366e-58	1528899	1532433	1.02842684418360e-24	36439385	36439385
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	36443254	36446265	3	3	-0.899	1.0284268441836e-24	36439385	36439385	3.71063235246654e-23	36446265	36446265
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	36450253	62419534	9388	9053	-0.0033	3.71063235246654e-23	36446265	36446265	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	9994686	7	7	-0.4201	NA	NA	NA	2.04043108202074e-11	9975302	10013263
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10004854	46922972	13434	12972	-0.0028	2.04043108202074e-11	9975302	10013263	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22603134	2976	2876	0.0241	NA	NA	NA	1.27145521610213e-25	22592087	22642519
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22603439	22725305	28	28	-0.3057	1.27145521610213e-25	22592087	22642519	7.37222730687463e-26	22715919	22738466
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6316	0.0114	7.37222730687463e-26	22715919	22738466	1.33609630063014e-221	35472378	35472378
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-3.4083	1.33609630063014e-221	35472378	35472378	4.15380347074647e-223	35476942	35476942
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	49571068	7003	6755	0.0175	4.15380347074647e-223	35476942	35476942	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	-0.2086	NA	NA	NA	6.26095304384509e-06	3237	95819
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	106242	8	8	0.6675	6.26095304384509e-06	3237	95819	1.57838220889079e-08	104486	109064
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	108902	124528	15	15	0.0368	1.57838220889079e-08	104486	109064	3.90656523720023e-08	122273	127113
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	127113	130528	5	5	-0.7138	3.90656523720023e-08	122273	127113	5.88402172610312e-18	129544	132721
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132689	132689	1	0	NA	5.88402172610312e-18	129544	132721	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	132721	848806	533	506	0.0362	NA	NA	NA	8.05537958034028e-13	843648	853672
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	849437	859452	8	8	-0.4731	8.05537958034028e-13	843648	853672	2.39792396402435e-13	853836	860688
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	2303192	825	799	0.046	2.39792396402435e-13	853836	860688	5.89701806981801e-53	2303192	2303192
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2303218	2304398	3	3	-1.5969	5.89701806981801e-53	2303192	2303192	9.78808927371953e-71	2304398	2304398
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2306110	2672401	362	349	0.0096	9.78808927371953e-71	2304398	2304398	5.8562193485799e-12	2668419	2686565
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	26	-0.232	5.8562193485799e-12	2668419	2686565	4.19632387714216e-162	2708291	2711273
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	8452395	1791	1721	0.8992	4.19632387714216e-162	2708291	2711273	9.5683256494024e-15	8447855	8458058
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8456422	8466917	7	7	0.3944	9.5683256494024e-15	8447855	8458058	6.82724731973268e-13	8463131	8473482
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	8473482	76992219	21140	20359	0.937	6.82724731973268e-13	8463131	8473482	7.50274144861323e-27	76992219	76992219
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	76998610	77010018	3	3	2.1127	7.50274144861323e-27	76992219	76992219	1.38573906904998e-27	77010018	77010018
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	77014050	104114422	5845	5640	0.9468	1.38573906904998e-27	77010018	77010018	8.7901119588211e-09	104109799	104114422
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	104115936	104121801	4	4	0.3637	8.7901119588211e-09	104109799	104114422	7.72938406921646e-09	104121801	104125921
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	104123787	111776974	2965	2862	0.9348	7.72938406921646e-09	104121801	104125921	2.01485747761139e-11	111776974	111776974
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111778323	111779952	2	2	0.0229	2.01485747761139e-11	111776974	111776974	1.57459241724363e-20	111779952	111780974
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	111780974	154442377	13345	12853	0.9358	1.57459241724363e-20	111779952	111780974	1.24701777010343e-35	154442377	154442377
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154447839	2	2	2.5829	1.24701777010343e-35	154442377	154442377	9.14622621443655e-34	154447839	154447839
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154449960	154449960	1	0	NA	9.14622621443655e-34	154447839	154447839	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154450309	154582414	29	29	0.9612	NA	NA	NA	1.70881652018061e-171	154578922	154582414
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154888224	201	190	0.0316	1.70881652018061e-171	154578922	154582414	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2716461	6	6	-4.6419	NA	NA	NA	0.00857153309277438	2716461	2771455
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2717644	2873138	69	65	-3.2245	0.00857153309277438	2716461	2771455	0.000629779097868263	2809558	2890269
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2874381	3733715	49	46	-3.9624	0.000629779097868263	2809558	2890269	6.75877101606363e-33	3223585	3772482
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5593746	16	16	-1.0411	6.75877101606363e-33	3223585	3772482	4.67133868063816e-14	5422507	6688691
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	5672441	7054924	175	168	-3.2472	4.67133868063816e-14	5422507	6688691	8.45355772027799e-10	7024303	7191629
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7057026	7495687	128	125	-2.3608	8.45355772027799e-10	7024303	7191629	2.20130308360576e-05	7379019	7631265
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7723783	75	71	-3.2559	2.20130308360576e-05	7379019	7631265	0.0497045274058248	7652302	7723783
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7745143	9	7	-1.8713	0.0497045274058248	7652302	7723783	0.000395759692443749	7740903	7781968
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7749796	7897073	45	44	-2.8807	0.000395759692443749	7740903	7781968	7.90266560473695e-05	7870400	7905553
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7905286	7914104	4	4	-1.4423	7.90266560473695e-05	7870400	7905553	8.70193788934568e-06	7914104	7926989
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8555993	157	152	-3.5094	8.70193788934568e-06	7914104	7926989	0.0105397783350859	8540974	8557343
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8557343	8562424	5	5	-2.2416	0.0105397783350859	8540974	8557343	0.000446134441250996	8559479	8568582
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8564257	8633358	20	20	-3.0724	0.000446134441250996	8559479	8568582	1.99194313765938e-05	8623889	8659109
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8637652	8681965	11	11	-2.2104	1.99194313765938e-05	8623889	8659109	1.83432491323549e-05	8674118	8693820
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8683710	10515697	197	186	-3.4132	1.83432491323549e-05	8674118	8693820	3.38584441552935e-38	10513747	10515697
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	10645500	12	12	-0.4465	3.38584441552935e-38	10513747	10515697	8.94127840428961e-06	10631941	12452734
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10646662	12682301	72	69	-2.3198	8.94127840428961e-06	10631941	12452734	0.00637937463660887	12601014	12733867
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12687167	12833424	23	22	-3.4132	0.00637937463660887	12601014	12733867	5.70852183418639e-06	12772155	12855363
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12839975	12994193	56	54	-2.1831	5.70852183418639e-06	12772155	12855363	3.49834295219808e-05	12964087	12996552
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	12996552	13040293	21	21	-1.2546	3.49834295219808e-05	12964087	12996552	5.88258952809014e-23	13040293	13045641
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13041812	13062151	11	11	-3.4374	5.88258952809014e-23	13040293	13045641	4.87703459853149e-05	13058512	13080405
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13066543	13128515	24	24	-1.908	4.87703459853149e-05	13058512	13080405	5.38609873845318e-12	13112411	13138841
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13868296	257	246	-3.251	5.38609873845318e-12	13112411	13138841	3.57662578214753e-06	13644667	13897078
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13869106	14098914	110	104	-3.7438	3.57662578214753e-06	13644667	13897078	5.25519829282988e-06	14084989	14338189
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14100001	14508021	138	132	-3.143	5.25519829282988e-06	14084989	14338189	2.05356880888245e-13	14503927	14508021
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14508894	14524829	2	0	NA	2.05356880888245e-13	14503927	14508021	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14526446	14547168	11	11	-0.6879	NA	NA	NA	2.74022804414810e-06	14540351	14547168
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14563486	9	9	-2.1071	2.7402280441481e-06	14540351	14547168	0.000157153216642842	14561228	14563486
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14566592	14579298	4	4	-0.8028	0.000157153216642842	14561228	14563486	2.65471060006353e-34	14579298	14579298
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14581797	14598838	6	6	-3.7076	2.65471060006353e-34	14579298	14579298	0.00291272147641762	14597771	14689490
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14601309	14700040	17	16	-2.1748	0.00291272147641762	14597771	14689490	1.31218319596622e-06	14687556	14702545
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14701706	14779054	28	27	-3.4063	1.31218319596622e-06	14687556	14702545	1.10584688907184e-05	14765141	14819097
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14793118	14883615	15	14	-4.3272	1.10584688907184e-05	14765141	14819097	1.78188585884634e-05	14852617	14928703
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14894476	15343136	167	158	-3.0049	1.78188585884634e-05	14852617	14928703	0.000638228027426908	15295719	15363339
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15344771	15408015	40	39	-3.7268	0.000638228027426908	15295719	15363339	0.000451994280119578	15388044	15433122
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15409110	15409110	1	0	NA	0.000451994280119578	15388044	15433122	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15410566	15523178	54	54	-2.9562	NA	NA	NA	0.00745074443396673	15470132	15558235
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15524675	15587741	35	30	-2.2067	0.00745074443396673	15470132	15558235	0.00156255559807677	15566377	15587741
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15590299	15617621	5	5	-4.0146	0.00156255559807677	15566377	15587741	6.38565270899173e-06	15617621	15617621
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15621613	15661862	9	9	-2.153	6.38565270899173e-06	15617621	15617621	1.88985679495455e-14	15658114	15675166
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15675166	15915466	40	36	-3.8602	1.88985679495455e-14	15658114	15675166	4.0333253411177e-05	15898644	15986595
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	158	-2.9742	4.0333253411177e-05	15898644	15986595	1.10987254950185e-05	16200557	16517319
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	17087869	105	100	-3.5983	1.10987254950185e-05	16200557	16517319	2.08906232638610e-06	16914237	17101969
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17093068	17214550	22	22	-2.7015	2.0890623263861e-06	16914237	17101969	2.73869882961195e-06	17201569	17251951
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17221481	17482749	46	44	-3.7644	2.73869882961195e-06	17201569	17251951	0.000131675468320158	17409064	17513494
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17487972	17651275	28	27	-2.8996	0.000131675468320158	17409064	17513494	1.07594910287181e-09	17635173	17651275
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17656313	17677303	6	6	-4.652	1.07594910287181e-09	17635173	17651275	0.000426651324805123	17677303	17709484
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17681974	19287655	102	96	-3.0561	0.000426651324805123	17677303	17709484	0.000107590673220906	19263983	19492239
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19293706	19534120	27	27	-3.9279	0.000107590673220906	19263983	19492239	0.000316523600296107	19524870	19577458
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19535961	19535961	1	0	NA	0.000316523600296107	19524870	19577458	NA	NA	NA
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19539425	20105663	152	140	-3.09	NA	NA	NA	0.00732308743506439	19693919	20314244
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20106416	21952551	406	392	-3.4317	0.00732308743506439	19693919	20314244	0.000112445888645019	21911976	21952551
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21953893	21992469	12	12	-4.6921	0.000112445888645019	21911976	21952551	1.9755585146394e-07	21992469	22003954
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21995639	22139807	31	27	-3.4532	1.9755585146394e-07	21992469	22003954	1.52451532235727e-09	22055660	22139807
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22177335	9	9	-1.8794	1.52451532235727e-09	22055660	22139807	2.50976858191616e-09	22177335	22181855
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22178964	22930737	93	88	-3.7692	2.50976858191616e-09	22177335	22181855	8.65314770537443e-62	22926726	22930737
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	26945893	33	30	-1.0328	8.65314770537443e-62	22926726	22930737	3.10094145880146e-21	26945893	26950080
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26950080	26980386	5	5	-3.6655	3.10094145880146e-21	26945893	26950080	2.41101260314979e-05	26965406	26998633
MSK_252152912014_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	26984336	57440809	48	45	-1.014	2.41101260314979e-05	26965406	26998633	NA	NA	NA
