Hybridization REF	chrom	loc.start	loc.end	num.mark	num.informative	seg.mean	pval	l.lcl	l.ucl	r.pval	r.lcl	r.ucl
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	554287	16657837	5774	5587	0.0171	NA	NA	NA	2.02269547345005e-26	16536623	16799711
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16659021	16923767	18	17	-0.0951	2.02269547345005e-26	16536623	16799711	5.80634840263195e-20	16923767	16923767
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	16926444	16963812	3	3	-0.8129	5.80634840263195e-20	16923767	16923767	3.08144078020557e-17	16963812	16963812
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	17080364	34869589	7099	6867	0.009	3.08144078020557e-17	16963812	16963812	0	34869589	34869589
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34876833	34883375	4	4	-4.7679	0	34869589	34869589	0	34883375	34883375
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	34884849	62423503	10993	10672	0.0012	0	34883375	34883375	1.0313646536862e-09	62423091	62423503
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62427698	62429423	2	2	-0.7057	1.0313646536862e-09	62423091	62423503	1.87388408959819e-09	62429423	62429423
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	62431628	72525842	3995	3878	-0.0094	1.87388408959819e-09	62429423	62429423	3.30186527476282e-12	72524413	72525842
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72528790	72537426	6	6	-0.4635	3.30186527476282e-12	72524413	72525842	4.82732815935638e-21	72537426	72539143
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72539143	72579311	14	14	0.3506	4.82732815935638e-21	72537426	72539143	8.45817315963451e-18	72571158	72596993
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	72589682	99174985	8732	8441	-0.0067	8.4581731596345e-18	72571158	72596993	1.91504295097886e-14	99174985	99174985
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	99178134	99179775	2	2	-0.8609	1.91504295097886e-14	99174985	99174985	2.35453363792637e-14	99179775	99179775
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	99181907	109987341	2954	2873	-0.0042	2.35453363792637e-14	99179775	99179775	6.80705340133605e-30	109987341	109987341
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109988743	109989998	2	2	1.2197	6.80705340133605e-30	109987341	109987341	1.04001781995191e-24	109989998	109989998
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	109994195	110033018	14	13	0.0067	1.04001781995191e-24	109989998	109989998	1.39889633080251e-12	110033018	110033018
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110034542	110041712	3	3	-0.7392	1.39889633080251e-12	110033018	110033018	2.42128499732951e-16	110041712	110041712
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	110058441	147306304	4556	4408	0.0056	2.42128499732951e-16	110041712	110041712	2.96248374010458e-27	146294654	147315217
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147308557	147510532	35	33	0.2951	2.96248374010458e-27	146294654	147315217	8.96458283355252e-31	147490608	147847659
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	147644831	150823073	1259	1222	-0.0197	8.96458283355252e-31	147490608	147847659	2.18392292399126e-08	150819879	150836481
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150836481	150839754	3	3	-0.5143	2.18392292399126e-08	150819879	150836481	0.000875617695071339	150836484	150839754
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150841957	150846148	4	4	-1.2902	0.000875617695071339	150836484	150839754	5.15639960339992e-10	150846148	150846148
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150847304	150851439	3	3	-0.4457	5.15639960339992e-10	150846148	150846148	1.76616614279131e-05	150848509	150852858
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	150852858	157133150	2761	2678	0.0078	1.76616614279131e-05	150848509	150852858	2.32379333816077e-48	157133150	157133150
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157134796	157136342	2	2	-1.6147	2.32379333816077e-48	157133150	157133150	1.65870406561197e-52	157136342	157136342
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	157138568	167483267	4108	4000	0.004	1.65870406561197e-52	157136342	157136342	8.15123688121256e-22	167481271	167483267
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167493768	167507898	8	8	0.5226	8.15123688121256e-22	167481271	167483267	1.49336366753967e-21	167507898	167520743
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	167520743	181427692	5507	5317	-0.0015	1.49336366753967e-21	167507898	167520743	1.26779289790255e-06	181425623	181427692
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	181429536	181431556	2	2	-0.5991	1.26779289790255e-06	181425623	181427692	3.03561691247511e-07	181431556	181434214
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	181434214	185979586	1700	1637	-0.0098	3.03561691247511e-07	181431556	181434214	6.88254309784801e-25	185979586	185979586
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	185984652	185988138	2	2	1.0585	6.88254309784801e-25	185979586	185979586	1.47394769840389e-23	185988138	185988138
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	186000612	194978218	1969	1906	-7e-04	1.47394769840389e-23	185988138	185988138	3.22666401873109e-12	194976022	195009358
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195009358	195065867	9	9	0.3629	3.22666401873109e-12	194976022	195009358	1.2623834427653e-09	195062793	195095156
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	195091758	200596027	2157	2095	0.0068	1.2623834427653e-09	195062793	195095156	4.53671203913763e-19	200584100	200625002
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200598243	200787319	39	38	-0.2393	4.53671203913763e-19	200584100	200625002	9.11022501543959e-25	200676505	200803726
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	200797743	209749119	3537	3415	0.0196	9.11022501543959e-25	200676505	200803726	4.23022779177853e-08	209746462	209749119
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	209751952	209755802	2	2	-0.6298	4.23022779177853e-08	209746462	209749119	1.50186746389110e-07	209755802	209759355
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	209759355	225369531	5500	5330	-0.0038	1.5018674638911e-07	209755802	209759355	5.73151840746173e-05	225357253	225374166
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	225371033	225381809	6	5	-0.3063	5.73151840746173e-05	225357253	225374166	7.88306362383687e-05	225377113	225390342
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	225383672	227872808	879	845	0.0215	7.88306362383687e-05	225377113	225390342	8.43589390139519e-22	227872808	227872808
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227875096	227875096	1	0	NA	8.43589390139519e-22	227872808	227872808	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227879152	227880585	2	2	-1.044	NA	NA	NA	0	227880585	227880585
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227882087	227882805	2	2	-0.6381	0	227880585	227880585	4.29045179705366e-08	227882805	227889619
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	227889619	246427528	7252	7058	-0.0153	4.29045179705366e-08	227882805	227889619	1.65589867837256e-56	246405101	246448361
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246429285	246862029	130	125	0.1986	1.65589867837256e-56	246405101	246448361	3.53073788060277e-07	246834936	246902470
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	246863179	247071281	50	45	0.0247	3.53073788060277e-07	246834936	246902470	2.93335561735548e-05	247034455	247087368
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	1	247073548	247186514	48	45	0.1708	2.93335561735548e-05	247034455	247087368	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	7019	197916	58	56	0.1765	NA	NA	NA	1.01298119729787e-20	169773	216706
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	200392	29584051	9376	9062	0.0106	1.01298119729787e-20	169773	216706	4.26988372826442e-17	29584051	29584051
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	29585831	29587044	2	2	-0.93	4.26988372826442e-17	29584051	29584051	6.77543651407771e-18	29587044	29587044
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	29590856	34543992	2086	2012	-0.0111	6.77543651407771e-18	29587044	29587044	0	34543992	34543992
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34551222	34574224	12	11	-4.5192	0	34543992	34543992	6.07012417236478e-10	34574224	34574224
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34575366	34589997	6	6	-3.0287	6.07012417236478e-10	34574224	34574224	0	34589997	34589997
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	34591681	52600588	7192	6946	-0.0042	0	34589997	34589997	7.77578301721598e-31	52600588	52600588
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52604016	52635695	5	5	0.7849	7.77578301721598e-31	52600588	52600588	2.41056415584472e-32	52635695	52635695
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52639605	52639605	1	0	NA	2.41056415584472e-32	52635695	52635695	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	52642716	55764753	1152	1121	-0.0199	NA	NA	NA	6.88340215049885e-07	55756098	55771587
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55766970	55784663	9	9	-0.3047	6.88340215049885e-07	55756098	55771587	1.21521022293979e-09	55778264	55792969
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	55788214	66038336	3322	3232	-0.0104	1.21521022293979e-09	55778264	55792969	3.56010471855619e-16	66038336	66038336
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66041319	66049853	3	3	-0.7415	3.56010471855619e-16	66038336	66038336	3.57804359301367e-16	66049853	66049853
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66055464	66055464	1	0	NA	3.57804359301367e-16	66049853	66049853	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	66060693	78553451	4229	4072	5e-04	NA	NA	NA	5.15442378968077e-06	78542745	78555501
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	78555501	78574729	10	10	0.2553	5.15442378968077e-06	78542745	78555501	6.18336145082548e-08	78572510	78587777
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	78577746	79182762	130	127	-0.0026	6.18336145082548e-08	78572510	78587777	8.0218172404963e-18	79182762	79182762
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79184112	79196200	5	5	0.5495	8.0218172404963e-18	79182762	79182762	1.81933108706132e-14	79196200	79198028
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	79198028	146571330	17475	16909	0.0043	1.81933108706132e-14	79196200	79198028	5.63885119752088e-20	146571330	146571330
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146582195	146592775	4	4	-0.7063	5.63885119752088e-20	146571330	146571330	1.15212615607965e-19	146592775	146592775
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	146597405	179767214	11204	10838	-0.0064	1.15212615607965e-19	146592775	146592775	3.40636790479653e-32	179767214	179767214
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179777850	179778919	3	3	1.0204	3.40636790479653e-32	179767214	179767214	1.15566055244646e-36	179778919	179778919
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	179791128	242501239	21475	20789	-0.0015	1.15566055244646e-36	179778919	179778919	2.27340319928991e-48	242493814	242512310
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242505261	242677069	63	62	0.2719	2.27340319928991e-48	242493814	242512310	0.0765745416526112	242557570	242677069
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	2	242677220	242689978	4	4	0.0594	0.0765745416526112	242557570	242677069	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	37075	90198	9	9	0.3134	NA	NA	NA	5.74127734491912e-10	85053	100713
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	92735	6290643	2145	2077	-0.0021	5.74127734491912e-10	85053	100713	1.68721501794269e-10	6279161	6290643
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	6294232	6309877	3	3	0.5858	1.68721501794269e-10	6279161	6290643	6.13470758239562e-12	6309877	6315789
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	6315789	7373793	357	348	-0.0051	6.13470758239562e-12	6309877	6315789	6.0563481345256e-14	7373793	7373793
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7375107	7376517	2	2	-0.7826	6.0563481345256e-14	7373793	7373793	6.50988010252418e-12	7376517	7376517
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	7378691	32074432	8280	8011	0.0055	6.50988010252418e-12	7376517	7376517	1.27710064011381e-22	32074432	32074432
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32077962	32080848	2	2	-1.0686	1.27710064011381e-22	32074432	32074432	1.10076743421530e-23	32080848	32080848
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32094956	32094956	1	0	NA	1.1007674342153e-23	32080848	32080848	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	32098215	47460892	5419	5260	0.0092	NA	NA	NA	2.27632461434421e-282	47460892	47460892
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47466423	47466921	2	2	-3.65	2.27632461434421e-282	47460892	47460892	1.04946043933227e-270	47466921	47466921
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	47469018	75798154	10661	10315	0.001	1.04946043933227e-270	47466921	47466921	5.28665456690288e-21	75791158	75803353
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	75799026	75875904	13	13	-0.4049	5.28665456690288e-21	75791158	75803353	1.79427093844566e-21	75871755	76000715
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	76000715	77558754	653	634	-0.0057	1.79427093844566e-21	75871755	76000715	1.64207477919791e-74	77558754	77558754
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	77559871	77571080	8	8	-0.9409	1.64207477919791e-74	77558754	77558754	3.55823253239251e-79	77571080	77571080
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	77573039	99891210	4628	4481	0.0059	3.55823253239251e-79	77571080	77571080	1.73743444636696e-14	99891210	99891210
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99893658	99897201	2	2	0.8292	1.73743444636696e-14	99891210	99891210	1.32248868197834e-16	99897201	99897201
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	99900982	133189686	11524	11180	0.0029	1.32248868197834e-16	99897201	99897201	2.82625515626919e-47	133189686	133189686
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133191877	133194685	2	2	1.547	2.82625515626919e-47	133189686	133189686	5.3214026480735e-48	133194685	133194685
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133197276	133197276	1	0	NA	5.3214026480735e-48	133194685	133194685	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	133198618	151002420	5625	5436	7e-04	NA	NA	NA	2.47151672401012e-09	151000848	151002420
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	151009356	151009356	1	0	NA	2.47151672401012e-09	151000848	151002420	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	151012322	151013969	2	2	0.6356	NA	NA	NA	1.03299922445776e-07	151013969	151015453
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	151015453	164001657	4150	4022	-0.0038	1.03299922445776e-07	151013969	151015453	5.53940077787657e-210	164001657	164001657
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164005577	164005577	1	0	NA	5.53940077787657e-210	164001657	164001657	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164009321	164027724	5	5	2.0352	NA	NA	NA	9.4917989326631e-37	164027724	164027724
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164036648	164107951	20	20	0.5642	9.4917989326631e-37	164027724	164027724	2.25617714376758e-66	164105613	164107951
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	164112873	176559755	4109	3967	-0.0047	2.25617714376758e-66	164105613	164107951	2.31822934213332e-11	176559755	176559755
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176563796	176566161	2	2	-0.7616	2.31822934213332e-11	176559755	176559755	3.78411987930711e-11	176566161	176566161
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	176568986	187561703	3602	3505	-0.013	3.78411987930711e-11	176566161	176566161	2.47080746401610e-12	187561703	187561703
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187563163	187564404	2	2	-0.7984	2.4708074640161e-12	187561703	187561703	5.73280826460636e-13	187564404	187564404
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	187565823	192546280	1833	1787	0.0011	5.73280826460636e-13	187564404	187564404	1.00006461391037e-11	192544305	192546280
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192548135	192550989	3	3	-0.6213	1.00006461391037e-11	192544305	192546280	5.07363845253452e-11	192550989	192552734
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	192552734	196795240	1565	1507	-0.0073	5.07363845253452e-11	192550989	192552734	2.67835710123508e-10	196787681	196803899
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196795623	196946355	42	40	0.1575	2.67835710123508e-10	196787681	196803899	1.56325923463733e-11	196927528	196969782
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	3	196950095	199329592	958	923	-0.0225	1.56325923463733e-11	196927528	196969782	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	34020	8641827	3193	3080	0.036	NA	NA	NA	2.07062235459968e-10	8638890	8641827
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	8643834	8646591	3	3	-0.6073	2.07062235459968e-10	8638890	8641827	2.64771295969406e-10	8646591	8649890
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	8649890	9815760	197	191	0.0632	2.64771295969406e-10	8646591	8649890	1.72681050758222e-301	9815760	9815760
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9821327	9842644	4	4	-3.8047	1.72681050758222e-301	9815760	9815760	0	9842644	9842644
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	9853710	25274962	4381	4249	-4e-04	0	9842644	9842644	2.87026132801655e-07	25274962	25274962
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	25276384	25277772	2	2	-0.6041	2.87026132801655e-07	25274962	25274962	9.8687526635028e-08	25277772	25279737
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	25279737	26563737	428	415	-0.0052	9.8687526635028e-08	25277772	25279737	1.16603334245075e-22	26563737	26563737
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26565071	26566345	2	2	-1.0165	1.16603334245075e-22	26563737	26563737	1.69421254509657e-20	26566345	26566345
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	26568376	70150576	10354	10008	-0.0116	1.69421254509657e-20	26566345	26566345	3.7947676140319e-18	70130975	70150576
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70190682	70216707	4	4	-0.6817	3.7947676140319e-18	70130975	70150576	2.06706476288461e-18	70216707	70216707
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	70294312	88752705	6464	6233	-0.0089	2.06706476288461e-18	70216707	70216707	9.31415987214566e-09	88752705	88752705
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88754121	88756721	2	2	-0.677	9.31415987214566e-09	88752705	88752705	1.64652193926928e-09	88756721	88756721
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	88757953	94073863	1861	1797	-0.0084	1.64652193926928e-09	88756721	88756721	3.47492157700709e-16	94073863	94073863
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94076749	94078581	2	2	-0.8719	3.47492157700709e-16	94073863	94073863	1.38791583013452e-15	94078581	94078581
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	94084961	107275274	4255	4104	-0.0069	1.38791583013452e-15	94078581	94078581	3.22987480421133e-18	107275274	107275274
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107276428	107281410	4	4	0.6528	3.22987480421133e-18	107275274	107275274	3.93083169331187e-18	107281410	107281410
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	107283257	159340107	14552	14104	-0.0085	3.93083169331187e-18	107281410	107281410	5.86438225802183e-11	159338158	159340107
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	159341420	159349446	4	3	-0.6104	5.86438225802183e-11	159338158	159340107	8.99138915381167e-11	159349446	159349446
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	159350634	173224400	3928	3802	-0.0146	8.99138915381167e-11	159349446	159349446	2.44663325025329e-74	173224400	173224400
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173226562	173228860	2	2	1.8574	2.44663325025329e-74	173224400	173224400	8.50815013310876e-76	173228860	173228860
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173229983	173660684	193	188	-0.012	8.50815013310876e-76	173228860	173228860	1.81106862476998e-129	173660684	173660684
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173663054	173666072	2	2	-2.4508	1.81106862476998e-129	173660684	173660684	2.51433059739551e-130	173666072	173666072
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	173672958	187330240	4081	3945	-0.0151	2.51433059739551e-130	173666072	173666072	1.05439916994682e-13	187330240	187330240
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187331981	187333619	2	2	0.7906	1.05439916994682e-13	187330240	187330240	1.58781942274408e-11	187333619	187335827
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	4	187335827	191153613	1241	1210	-0.0061	1.58781942274408e-11	187333619	187335827	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	79142	829954	228	220	0.0495	NA	NA	NA	4.29802932184182e-15	829954	829954
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	870657	873365	2	2	-0.9436	4.29802932184182e-15	829954	829954	9.78799714166999e-33	873365	873365
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	905462	68885350	18820	18251	-0.0024	9.78799714167e-33	873365	873365	5.4019838037507e-34	68885350	68885350
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70343857	70345552	2	2	0.9154	5.4019838037507e-34	68885350	68885350	1.64671993256224e-17	70345552	70345552
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	70405656	127434789	16266	15721	-0.0042	1.64671993256224e-17	70345552	70345552	1.05950344906710e-07	127432675	127434789
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127436376	127438118	2	2	0.6234	1.0595034490671e-07	127432675	127434789	6.55982594404561e-07	127438118	127439603
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	127439603	178040439	17416	16856	0.0074	6.55982594404561e-07	127438118	127439603	2.47243387455044e-13	178040439	178040439
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178044111	178045608	2	2	0.8395	2.47243387455044e-13	178040439	178040439	7.26612610961919e-12	178045608	178045608
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	178047480	180342860	908	877	0.0167	7.26612610961919e-12	178045608	178045608	5.84706407100771e-26	180194323	180344964
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180344964	180358977	8	8	0.6225	5.84706407100771e-26	180194323	180344964	1.63119167655801e-30	180357210	180358977
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	5	180362342	180644810	112	106	0.0135	1.63119167655801e-30	180357210	180358977	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	99130	200350	40	35	0.1611	NA	NA	NA	4.56055028956053e-07	176670	210326
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	202063	240119	16	16	0.3437	4.56055028956053e-07	176670	210326	6.38391235152962e-19	237952	244363
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	241674	17482872	6070	5896	0.0042	6.38391235152962e-19	237952	244363	2.86003361702209e-13	17477799	17482872
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17486309	17488010	2	2	-0.6725	2.86003361702209e-13	17477799	17482872	3.50380548425206e-08	17488010	17488010
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	17490237	29950805	4459	4314	-0.0144	3.50380548425206e-08	17488010	17488010	1.45885154005866e-63	29950805	29962849
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	29962849	30005338	14	13	-0.7153	1.45885154005866e-63	29950805	29962849	4.22718364641817e-54	30004636	30005338
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	30010234	31382291	579	562	0.0191	4.22718364641817e-54	30004636	30005338	2.63270992197952e-34	31382291	31382291
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31383925	31390982	5	5	-0.909	2.63270992197952e-34	31382291	31382291	8.1523517039424e-41	31390982	31390982
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	31393624	32558677	492	481	0.0307	8.1523517039424e-41	31390982	31390982	0	32558677	32558677
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32563252	32593151	6	6	-3.072	0	32558677	32558677	7.28869698919655e-07	32588005	32593151
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32595402	32600962	3	3	-1.2498	7.28869698919655e-07	32588005	32593151	1.24739013885442e-46	32600962	32600962
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	32605300	49027493	6543	6333	0.0058	1.24739013885442e-46	32600962	32600962	7.6501735831925e-07	49022360	49027493
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49039318	49045025	2	2	-0.6063	7.6501735831925e-07	49022360	49027493	5.629192430814e-07	49045025	49049568
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	49049568	54035000	1758	1711	-0.0049	5.629192430814e-07	49045025	49049568	5.53111206778864e-41	54035000	54035000
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54037199	54037199	1	0	NA	5.53111206778864e-41	54035000	54035000	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54039814	54042734	2	2	-1.4603	NA	NA	NA	4.78376587343047e-41	54042734	54042734
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	54045472	67060622	2771	2694	-0.0112	4.78376587343047e-41	54042734	54042734	0	67060622	67068673
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67068673	67105238	6	6	-4.0496	0	67060622	67068673	0	67101355	67105238
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	67109079	79018959	3655	3531	-0.0099	0	67101355	67105238	8.7986701488142e-20	79011979	79024557
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79024557	79091850	13	13	-0.4024	8.7986701488142e-20	79011979	79024557	3.90195209604456e-21	79085247	79095415
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	79095415	88062908	2413	2337	-0.0076	3.90195209604456e-21	79085247	79095415	3.66859553650459e-08	88061729	88064392
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	88064392	88067175	3	3	-0.5267	3.66859553650459e-08	88061729	88064392	5.63390716415474e-08	88065728	88075381
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	88075381	132154299	13890	13427	-0.0047	5.63390716415474e-08	88065728	88075381	4.06571567754878e-17	132154299	132154299
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132156778	132159522	2	2	-0.918	4.06571567754878e-17	132154299	132154299	8.8122826992407e-17	132159522	132159522
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	132161292	165643653	11564	11183	-0.0084	8.8122826992407e-17	132159522	132159522	0	165643653	165643653
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165645537	165650610	4	4	-2.9939	0	165643653	165643653	0	165650610	165650610
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	6	165653315	170753106	1804	1751	0.0309	0	165650610	165650610	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	136373	1038517	260	253	0.0141	NA	NA	NA	1.75119785840892e-06	1037402	1038517
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1047636	1047707	2	2	0.6603	1.75119785840892e-06	1037402	1038517	7.17419117126971e-09	1047707	1049599
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	1049599	38254010	13336	12899	0.0023	7.17419117126971e-09	1047707	1049599	3.42655151662115e-20	38252620	38254010
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38257171	38274436	7	6	0.5905	3.42655151662115e-20	38252620	38254010	4.6491767876361e-12	38274436	38277728
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38277728	38335964	33	33	0.1437	4.6491767876361e-12	38274436	38277728	1.79982890490272e-16	38323325	38380333
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	38337912	100164752	17424	16898	-0.0039	1.79982890490272e-16	38323325	38380333	2.82024163238718e-27	100164752	100164752
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100166257	100174991	4	4	-0.8296	2.82024163238718e-27	100164752	100164752	7.61392665119801e-26	100174991	100174991
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	100178968	109216032	3894	3771	-0.0038	7.61392665119801e-26	100174991	100174991	1.36546984175570e-16	109214735	109216032
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109217320	109244233	7	7	0.4994	1.3654698417557e-16	109214735	109216032	6.81474417229919e-18	109244233	109247295
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109245944	109245944	1	0	NA	6.81474417229919e-18	109244233	109247295	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109247295	109966116	298	291	-0.0137	NA	NA	NA	1.4526970500103e-09	109964306	109966116
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109967918	109976628	4	4	0.4867	1.4526970500103e-09	109964306	109966116	1.33672714331599e-09	109976628	109980654
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	109980654	125831554	7168	6929	-0.0027	1.33672714331599e-09	109976628	109980654	5.42560027912951e-58	125831554	125831554
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125833251	125837524	3	3	1.3469	5.42560027912951e-58	125831554	125831554	6.96182322187301e-54	125837524	125837524
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125839386	125839386	1	0	NA	6.96182322187301e-54	125837524	125837524	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	125840585	141410894	7361	7114	2e-04	NA	NA	NA	4.31177286108631e-19	141408013	141414719
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141413352	141440184	14	13	-0.3898	4.31177286108631e-19	141408013	141414719	1.41172327510931e-19	141435643	141443577
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141442231	141689547	115	112	0.0192	1.41172327510931e-19	141435643	141443577	1.65854136584034e-66	141689547	141689547
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141690753	141690753	1	0	NA	1.65854136584034e-66	141689547	141689547	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141698634	141714168	10	10	0.8337	NA	NA	NA	1.15104593562136e-42	141714168	141720303
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	141720303	142156165	168	161	0.1165	1.15104593562136e-42	141714168	141720303	2.55110744106882e-28	142156165	142156165
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142159173	142166710	3	3	-0.9767	2.55110744106882e-28	142156165	142156165	2.69080764882188e-19	142166710	142166710
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142167901	142167908	2	2	-3.3537	2.69080764882188e-19	142166710	142166710	7.14987105434358e-230	142167908	142167908
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	142176074	143503317	486	467	0.0216	7.14987105434358e-230	142167908	142167908	4.54205096001383e-23	143503317	143503317
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143582864	143584350	3	3	0.9045	4.54205096001383e-23	143503317	143503317	5.99884961368191e-23	143584350	143584350
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	143705425	151728811	3482	3365	-0.0043	5.99884961368191e-23	143584350	143584350	4.30235086811311e-11	151723833	151732266
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151730250	151747905	10	10	-0.3502	4.30235086811311e-11	151723833	151732266	5.75791967227411e-13	151743145	151751920
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	151750057	158736863	2578	2499	0.0155	5.75791967227411e-13	151743145	151751920	1.85467150351632e-10	158616651	158751580
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	7	158739897	158821263	20	18	0.2735	1.85467150351632e-10	158616651	158751580	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	151472	2124466	708	693	0.0475	NA	NA	NA	3.51681559455848e-39	2124466	2124466
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2128241	2145922	7	6	-0.8554	3.51681559455848e-39	2124466	2124466	7.82821394491218e-46	2145922	2145922
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	2150932	5574577	1295	1260	-0.0014	7.82821394491218e-46	2145922	2145922	1.08978296822529e-10	5574577	5574577
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5585615	5591702	2	2	-0.7242	1.08978296822529e-10	5574577	5574577	1.71137340191562e-14	5591702	5591702
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	5596343	21631360	4886	4731	-0.0041	1.71137340191562e-14	5591702	5591702	8.39494865377804e-14	21621894	21646816
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	21633367	21724458	19	19	0.2266	8.39494865377804e-14	21621894	21646816	1.06596446299731e-08	21646816	21737591
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	21726574	25120552	1242	1204	0.0058	1.06596446299731e-08	21646816	21737591	3.44546943090592e-26	25120552	25120552
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25123025	25123025	1	0	NA	3.44546943090592e-26	25120552	25120552	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25124428	25125700	2	2	-1.1566	NA	NA	NA	4.52044920868012e-26	25125700	25125700
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	25127887	39350798	4912	4748	-0.009	4.52044920868012e-26	25125700	25125700	0	39350798	39352361
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39352361	39505256	59	59	0.7675	0	39350798	39352361	0	39504332	39505256
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	39508035	51191560	2179	2108	-0.0099	0	39504332	39505256	0	51191560	51191560
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51193977	51200291	4	4	-3.7032	0	51191560	51191560	0	51200291	51200291
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	51202490	58274145	2176	2101	-0.0011	0	51200291	51200291	1.87205132480485e-16	58274145	58274145
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58277102	58280459	2	2	0.914	1.87205132480485e-16	58274145	58274145	5.36738168613242e-48	58280459	58280459
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	8	58290326	146264846	27072	26198	1e-04	5.36738168613242e-48	58280459	58280459	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	189055	23338535	7999	7760	-0.0047	NA	NA	NA	4.99506223437275e-23	23338535	23338535
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23343915	23343915	1	0	NA	4.99506223437275e-23	23338535	23338535	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23353267	23365926	3	3	0.8667	NA	NA	NA	4.76439754095751e-23	23365926	23365926
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	23377660	39062211	4724	4574	-9e-04	4.76439754095751e-23	23365926	23365926	2.87561912732319e-07	38701935	43644906
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	39088753	67923904	24	22	-0.1862	2.87561912732319e-07	38701935	43644906	9.0682359754769e-07	67859114	70215204
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	67927172	70926188	321	305	-0.0065	9.0682359754769e-07	67859114	70215204	1.12750867721777e-119	70926188	70926188
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70928471	70930528	2	2	-2.3445	1.12750867721777e-119	70926188	70926188	1.79246396586206e-106	70930528	70930528
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	70935055	75177268	1792	1743	-0.0107	1.79246396586206e-106	70930528	70930528	4.49658438025872e-16	75177268	75177268
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75208977	75213550	2	2	-0.9309	4.49658438025872e-16	75177268	75177268	1.53054814754249e-19	75213550	75213550
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	75221525	77192566	543	528	-0.0085	1.53054814754249e-19	75213550	75213550	2.33063975153203e-08	77188784	77192566
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77194207	77200826	3	3	-0.5082	2.33063975153203e-08	77188784	77192566	2.79873566333581e-07	77200826	77202889
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	77202889	100348045	7579	7348	-0.0044	2.79873566333581e-07	77200826	77202889	1.54448770480303e-13	100348045	100348045
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100349567	100350814	2	2	0.8206	1.54448770480303e-13	100348045	100348045	3.42186850446364e-15	100350814	100350814
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	100353031	116124007	5547	5375	-0.0037	3.42186850446364e-15	100350814	100350814	8.14063457773945e-25	116124007	116124007
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116126105	116130333	2	2	1.1052	8.14063457773945e-25	116124007	116124007	9.52038331854316e-24	116130333	116130333
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	116132839	126257728	3693	3566	0.0107	9.52038331854316e-24	116130333	116130333	0.000177517324760634	126238816	126262124
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	126259100	126269081	5	5	-0.2434	0.000177517324760634	126238816	126262124	1.49531735902066e-10	126266759	126298070
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	126270945	133250165	2958	2870	0.0027	1.49531735902066e-10	126266759	126298070	3.34688831302438e-12	133250165	133250165
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133251786	133254922	2	2	-0.8397	3.34688831302438e-12	133250165	133250165	1.28764282770754e-13	133254922	133254922
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	133257756	137352394	1637	1590	0.0417	1.28764282770754e-13	133254922	133254922	3.57845275052277e-66	137352394	137352394
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137354256	137356880	2	2	1.955	3.57845275052277e-66	137352394	137352394	9.46169954291103e-57	137356880	137356880
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	9	137359947	140145683	1103	1062	0.033	9.46169954291103e-57	137356880	137356880	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	126361	13553503	4682	4541	0	NA	NA	NA	1.17830769451927e-09	13551930	13553503
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13555034	13556315	2	2	-0.7038	1.17830769451927e-09	13551930	13553503	3.50511970785248e-34	13556315	13556315
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	13557998	49860891	10337	9979	-0.0151	3.50511970785248e-34	13556315	13556315	4.37855891048621e-35	49859259	49860891
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	49863267	49865259	2	2	0.5924	4.37855891048621e-35	49859259	49860891	3.67900106492506e-16	49865259	49866523
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	49866523	76032955	8712	8414	-0.0103	3.67900106492506e-16	49865259	49866523	4.14063673224521e-21	76032955	76032955
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76039511	76044118	3	3	-0.8806	4.14063673224521e-21	76032955	76032955	2.8646234214495e-23	76044118	76044118
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	76051456	77917893	854	826	0.0141	2.8646234214495e-23	76044118	76044118	3.66855730626276e-10	77917870	77917893
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77926390	77928738	3	3	0.6105	3.66855730626276e-10	77917870	77917893	1.54452425197003e-37	77928738	77936034
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	10	77936034	135285645	20213	19600	0.01	1.54452425197003e-37	77928738	77936034	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	187649	1094339	356	345	0.0193	NA	NA	NA	6.37564724259409e-05	1086429	1101187
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1095397	1105351	10	10	-0.2601	6.37564724259409e-05	1086429	1101187	3.31051202604476e-07	1101451	1110318
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	1106234	5741031	1772	1703	0.027	3.31051202604476e-07	1101451	1110318	2.91725114479507e-65	5741031	5741031
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5742476	5765438	15	15	-0.6733	2.91725114479507e-65	5741031	5741031	1.24137208083025e-78	5765438	5765438
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	5766615	6208450	184	177	0.0116	1.24137208083025e-78	5765438	5765438	1.30830356309593e-07	6204027	6208450
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6209875	6215052	4	4	-0.3938	1.30830356309593e-07	6204027	6208450	6.96037411723332e-06	6215052	6218853
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	6217143	18896166	5031	4882	0.0091	6.96037411723332e-06	6215052	6218853	3.87092123115996e-11	18892456	18896166
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18906505	18917191	6	6	-0.4338	3.87092123115996e-11	18892456	18896166	1.76716829413815e-11	18917191	18932031
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	18929375	31187671	3676	3575	0.0087	1.76716829413815e-11	18917191	18932031	7.58723422635493e-21	31187671	31187671
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	31189650	31193545	3	3	-0.8254	7.58723422635493e-21	31187671	31187671	2.66939609213565e-20	31193545	31193545
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	31196493	55118214	5848	5664	-0.0019	2.66939609213565e-20	31193545	31193545	9.64348787903821e-55	55112618	55124730
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55123719	55209626	39	38	0.3761	9.6434878790382e-55	55112618	55124730	2.44611565423392e-50	55205278	55219985
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	55217189	81524127	9954	9684	0.0089	2.44611565423392e-50	55205278	55219985	4.91036736495575e-07	81515157	81536990
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81530809	81544262	5	5	0.4027	4.91036736495575e-07	81515157	81536990	1.86980287595209e-08	81544262	81551675
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	81551675	99021938	5534	5351	-0.0039	1.86980287595209e-08	81544262	81551675	2.58661928220646e-12	99010068	99037126
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99025912	99068718	21	20	0.2394	2.58661928220646e-12	99010068	99037126	3.36580090817042e-27	99051142	99078588
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	99072015	131427991	11607	11281	0.0099	3.36580090817042e-27	99051142	99078588	1.17150177457629e-29	131424148	131427991
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131429532	131434659	4	4	0.4219	1.17150177457629e-29	131424148	131427991	1.25714607022868e-05	131434659	131437885
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	131436397	134103060	1134	1097	0.0415	1.25714607022868e-05	131434659	131437885	1.41989727001334e-06	134099088	134103060
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134105421	134111832	3	3	-0.4322	1.41989727001334e-06	134099088	134103060	1.31723248480922e-07	134111832	134113671
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134113671	134318095	66	65	0.0653	1.31723248480922e-07	134111832	134113671	1.01203591960271e-05	134284106	134353931
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	11	134321471	134450318	32	31	0.2171	1.01203591960271e-05	134284106	134353931	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33854	127303	31	30	0.2288	NA	NA	NA	3.69836848739339e-12	121163	141948
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	128442	9523923	3711	3591	0.0149	3.69836848739339e-12	121163	141948	1.93122842665037e-114	9523923	9523923
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9528590	9610054	16	16	0.8999	1.93122842665037e-114	9523923	9523923	6.464628839461e-109	9610054	9610054
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	9626623	11104973	567	545	-0.0099	6.464628839461e-109	9610054	9610054	8.60541184483107e-13	11104085	11104973
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11109483	11116883	4	4	-0.6095	8.60541184483107e-13	11104085	11104973	7.3674085739289e-14	11116883	11121204
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11121204	11140421	7	7	-2.4681	7.3674085739289e-14	11116883	11121204	2.23435129941085e-218	11140421	11140421
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11143592	11395862	70	69	0.0049	2.23435129941085e-218	11140421	11140421	1.06714286627526e-08	11393473	11419189
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11419189	11435643	6	6	-0.386	1.06714286627526e-08	11393473	11419189	6.17157604580552e-08	11433210	11452868
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	11440927	31132762	6743	6530	-0.009	6.17157604580552e-08	11433210	11452868	3.36358154289912e-141	31132716	31169263
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31169263	31298659	43	43	0.5649	3.36358154289912e-141	31132716	31169263	3.64560972465303e-139	31298659	31299898
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31299898	31890222	248	242	-0.0681	3.64560972465303e-139	31298659	31299898	1.13015569880409e-28	31879835	31890222
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31899792	31949481	8	8	0.5491	1.13015569880409e-28	31879835	31890222	4.27686556811881e-29	31949481	31949481
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	31954769	33184017	468	456	-0.0609	4.27686556811881e-29	31949481	31949481	8.03136320218027e-06	33178741	33184017
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33193255	33198331	2	2	-0.6143	8.03136320218027e-06	33178741	33184017	5.94802599501632e-07	33198331	33201796
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	33201796	78668041	14628	14153	-0.0045	5.94802599501632e-07	33198331	33201796	1.2191434466398e-09	78663063	78676440
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78675711	78686371	6	6	-0.413	1.2191434466398e-09	78663063	78676440	2.48754765757274e-19	78681634	78690106
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	12	78688893	132289090	18603	18032	-0.0043	2.48754765757274e-19	78681634	78690106	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	18194544	36969571	7039	6804	-0.0068	NA	NA	NA	8.26300976838471e-08	36964477	36969571
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36976441	36982877	2	2	0.6415	8.26300976838471e-08	36964477	36969571	1.15341081607645e-08	36982877	36982877
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	36989091	37953582	297	287	0.0056	1.15341081607645e-08	36982877	36982877	5.72464031461206e-188	37953582	37953582
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37955475	37957844	2	2	2.9196	5.72464031461206e-188	37953582	37953582	1.89931347589900e-182	37957844	37957844
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	37959274	56664197	6691	6453	-0.0062	1.899313475899e-182	37957844	37957844	4.12935119415385e-10	56660235	56672324
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56666220	56691355	12	12	0.2841	4.12935119415385e-10	56660235	56672324	1.82547084217968e-10	56686863	56708261
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	56693033	57484503	204	199	-0.011	1.82547084217968e-10	56686863	56708261	3.91822716450298e-17	57484503	57484503
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	57489902	57497079	2	2	-0.9125	3.91822716450298e-17	57484503	57484503	6.33579534981731e-17	57497079	57497079
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	57500241	97327189	11232	10908	-0.0061	6.33579534981731e-17	57497079	57497079	3.57268574392718e-12	97327189	97327189
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97329413	97330568	2	2	-0.781	3.57268574392718e-12	97327189	97327189	4.20454204009667e-23	97330568	97330568
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	97331794	113788788	6009	5823	0.0106	4.20454204009667e-23	97330568	97330568	1.08045230648954e-21	113788788	113788788
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113791151	113792974	2	2	-0.7961	1.08045230648954e-21	113788788	113788788	1.88773854007295e-11	113792974	113794669
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	13	113794669	114123340	150	143	0.0936	1.88773854007295e-11	113792974	113794669	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	18446762	19494416	60	56	-0.627	NA	NA	NA	2.11781581140187e-186	19492531	19494416
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	19497023	21549262	1002	980	-0.0024	2.11781581140187e-186	19492531	19494416	3.50587078760775e-69	21536847	21558492
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	21551504	22047168	248	242	0.1933	3.50587078760775e-69	21536847	21558492	1.9119069893705e-55	22032374	22059557
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	22048569	26230274	1502	1462	0.027	1.9119069893705e-55	22032374	22059557	0.0588299575050814	26128270	26236271
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	26236271	26248110	4	4	-0.1936	0.0588299575050814	26128270	26236271	0.000547662270395299	26243812	26258473
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	26254411	26303603	13	13	-0.0211	0.000547662270395299	26243812	26258473	7.10975852580294e-05	26295343	26307060
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	26307060	26323452	6	6	-0.1843	7.10975852580294e-05	26295343	26307060	6.28763418323998e-11	26319800	26639324
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	26330606	34493940	2825	2728	-0.0185	6.28763418323998e-11	26319800	26639324	1.34441978499007e-12	34493940	34493940
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34498340	34498340	1	0	NA	1.34441978499007e-12	34493940	34493940	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34499884	34501839	2	2	-0.6547	NA	NA	NA	8.54211710458164e-07	34501839	34501839
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34505234	34674458	87	83	-0.0703	8.54211710458164e-07	34501839	34501839	1.49351046854514e-38	34674458	34674458
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34676390	34683810	3	3	1.0825	1.49351046854514e-38	34674458	34674458	1.31537965131556e-37	34683810	34683810
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	34685308	40676611	1895	1844	-0.0094	1.31537965131556e-37	34683810	34683810	1.73253646024284e-19	40670538	40676611
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40680589	40726930	8	8	0.476	1.73253646024284e-19	40670538	40676611	2.15019987409862e-18	40726930	40741934
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	40741934	46775775	1359	1308	-0.0012	2.15019987409862e-18	40726930	40741934	1.91884356177054e-36	46775775	46775775
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46778735	46789074	6	6	-0.7714	1.91884356177054e-36	46775775	46775775	2.82420328197607e-33	46787389	46789074
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	46790609	54087097	2397	2304	-0.0171	2.82420328197607e-33	46787389	46789074	0.00105833808409374	54083890	54087097
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	54088621	54090200	2	2	-0.4759	0.00105833808409374	54083890	54087097	2.02202011006294e-33	54090200	54093613
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	54092146	105597555	20222	19585	0.0022	2.02202011006294e-33	54090200	54093613	2.59213121739261e-31	105594189	105602602
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105602602	105632168	12	12	-0.3666	2.59213121739261e-31	105594189	105602602	7.77313455383901e-10	105632168	105673157
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105673157	105787390	21	20	0.0385	7.77313455383901e-10	105632168	105673157	4.60197833196174e-06	105769543	105787390
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105788623	105795807	5	5	0.4382	4.60197833196174e-06	105769543	105787390	2.53548411830509e-05	105795807	105801812
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	105798116	106218059	153	149	0.0691	2.53548411830509e-05	105795807	105801812	1.81460609348060e-10	106209063	106219784
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106219784	106253648	16	15	-0.2362	1.8146060934806e-10	106209063	106219784	1.16487981773043e-22	106253648	106255190
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	14	106255190	106358491	36	34	0.2467	1.16487981773043e-22	106253648	106255190	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18362555	18452491	5	4	0.1111	NA	NA	NA	1.59632378530341e-10	18450562	18452491
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18692865	18837737	10	10	-0.3717	1.59632378530341e-10	18450562	18452491	9.44427087240651e-10	18837737	18842565
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18842565	18848213	4	4	-0.8502	9.44427087240651e-10	18837737	18842565	6.23847740229746e-11	18846835	18848213
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	18851513	19109124	12	12	-0.4067	6.23847740229746e-11	18846835	18848213	0.0204681588128861	18886649	19231679
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	19117783	20308014	126	122	-0.2273	0.0204681588128861	18886649	19231679	1.82369376462737e-25	20042683	20347935
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	20310916	21606133	266	254	-0.0321	1.82369376462737e-25	20042683	20347935	1.30032632235971e-19	21606133	21606133
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21610007	21612244	2	2	-1.0727	1.30032632235971e-19	21606133	21606133	1.12760789356115e-21	21612244	21612244
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	21622026	75115806	21460	20729	-0.0046	1.12760789356115e-21	21612244	21612244	3.98771935102872e-41	75115806	75115806
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75117799	75119713	2	2	1.4531	3.98771935102872e-41	75115806	75115806	1.27818424610846e-40	75119713	75119713
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	75121466	98234519	8522	8256	0.006	1.27818424610846e-40	75119713	75119713	5.39713289566312e-12	98234519	98234519
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98237721	98239454	2	2	-0.7962	5.39713289566312e-12	98234519	98234519	6.7685060683485e-14	98239454	98239454
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	15	98243586	100298352	911	880	0.031	6.7685060683485e-14	98239454	98239454	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33628	21258019	7255	7047	-2e-04	NA	NA	NA	2.22348238638071e-12	21244385	21258019
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21382540	21501073	10	10	-0.3686	2.22348238638071e-12	21244385	21258019	1.62905404672047e-14	21493483	21507188
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	21504151	22333565	282	265	-0.0116	1.62905404672047e-14	21493483	21507188	3.846975440482e-10	22320911	22553207
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22338034	22541389	2	0	NA	3.846975440482e-10	22320911	22553207	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22547406	22617217	10	10	-0.3111	NA	NA	NA	9.4272797759659e-09	22604851	22647089
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	22625780	32379126	3014	2912	-0.0011	9.4272797759659e-09	22604851	22647089	1.27824288376600e-36	31854794	32521360
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	32481309	33538171	44	43	0.3005	1.278242883766e-36	31854794	32521360	5.47812501437013e-35	33525500	33841331
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	33559207	54352394	3079	2978	0.005	5.47812501437013e-35	33525500	33841331	1.50395187674286e-12	54343465	54368717
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54353978	54390060	11	11	-0.3507	1.50395187674286e-12	54343465	54368717	1.03520587107718e-05	54379834	54390060
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54399890	54408446	5	5	0.6004	1.03520587107718e-05	54379834	54390060	2.0617464107942e-16	54405667	54408446
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	54410800	57203733	1197	1162	0.0119	2.0617464107942e-16	54405667	54408446	1.06561399100758e-56	57203733	57203733
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57204859	57206772	2	2	-1.8143	1.06561399100758e-56	57203733	57203733	1.16448336719347e-64	57206772	57206772
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	57208375	68693086	3388	3288	-0.0042	1.16448336719347e-64	57206772	57206772	2.68386291063145e-20	68693014	68693086
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68710277	68838384	11	11	-0.4294	2.68386291063145e-20	68693014	68693086	4.25650968076441e-20	68838384	68842364
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	68842364	72941901	1454	1415	-0.0086	4.25650968076441e-20	68838384	68842364	8.62614477817165e-17	72929786	72955519
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	72951581	73030029	8	8	-0.4625	8.62614477817165e-17	72929786	72955519	4.02467805444437e-16	73022578	73032723
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	73032723	75092501	750	730	-0.0226	4.02467805444437e-16	73022578	73032723	4.02984197432704e-148	75092501	75092501
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75093957	75093957	1	0	NA	4.02984197432704e-148	75092501	75092501	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75097331	75100865	3	3	-2.1542	NA	NA	NA	8.51463303275192e-138	75100865	75100865
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	75102639	76925748	610	587	-0.0121	8.51463303275192e-138	75100865	75100865	0	76925748	76925748
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76929598	76940218	8	8	-3.7214	0	76925748	76925748	0	76940218	76940218
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	16	76942679	88690571	4513	4389	0.0215	0	76940218	76940218	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	47546	31457889	12037	11667	-0.0034	NA	NA	NA	1.87581160404848e-14	31443186	31467971
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31461588	31503774	19	18	-0.2999	1.87581160404848e-14	31443186	31467971	3.21055794440685e-15	31492553	31893451
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	31889566	32828797	365	357	-0.014	3.21055794440685e-15	31492553	31893451	0	32828797	32828797
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32830127	32832642	2	2	-4.6803	0	32828797	32828797	0	32832642	32832642
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	32833765	36673853	1448	1383	-0.006	0	32832642	32832642	9.71020894226879e-316	36673853	36673853
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36675987	36684619	6	6	-2.413	9.71020894226879e-316	36673853	36673853	8.2014897209647e-322	36684619	36684619
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	36686013	41566540	2032	1972	0.0092	8.2014897209647e-322	36684619	36684619	3.83914435109565e-103	41564408	41568539
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	41568539	41710400	46	43	-0.5005	3.83914435109565e-103	41564408	41568539	3.14378514504087e-105	41708551	42142363
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	42142363	52440878	3480	3365	0.0038	3.14378514504087e-105	41708551	42142363	1.09283231482894e-09	52438207	52440878
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52445183	52447064	3	3	-0.5867	1.09283231482894e-09	52438207	52440878	2.93870540538538e-29	52447064	52454171
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	17	52454171	78653545	10196	9857	-0.0025	2.93870540538538e-29	52447064	52454171	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	4316	53092949	16199	15650	-0.002	NA	NA	NA	4.26785389452632e-19	53092949	53092949
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53097842	53099601	2	2	-0.9743	4.26785389452632e-19	53092949	53092949	4.68070837985102e-25	53099601	53099601
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	53101512	75987864	6708	6486	0.0043	4.68070837985102e-25	53099601	53099601	2.04638230610405e-29	75954059	75999811
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	18	75990192	76116026	55	55	0.1675	2.04638230610405e-29	75954059	75999811	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	210395	790526	219	206	0.0037	NA	NA	NA	2.17337569418200e-06	782819	794978
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	794973	801351	4	4	-0.5306	2.173375694182e-06	782819	794978	3.75266250577206e-09	794978	806292
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	806292	40352568	12386	11993	-0.0062	3.75266250577206e-09	794978	806292	2.72455722263869e-21	40352568	40352568
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40354034	40356341	2	2	-1.1112	2.72455722263869e-21	40352568	40352568	2.05360353775285e-25	40356341	40356341
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	40359145	41532062	537	518	0.0233	2.05360353775285e-25	40356341	40356341	5.90208467481483e-15	41532062	41532062
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41533405	41538649	2	2	-0.8521	5.90208467481483e-15	41532062	41532062	4.24073603781276e-13	41538649	41538649
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	41542955	56823430	6723	6523	-0.008	4.24073603781276e-13	41538649	41538649	6.85395856887321e-33	56823430	56823430
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56825794	56825794	1	0	NA	6.85395856887321e-33	56823430	56823430	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56828073	56840346	7	6	-0.7692	NA	NA	NA	5.95751406293466e-30	56840346	56840346
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	56842447	59414645	1173	1135	-0.0223	5.95751406293466e-30	56840346	56840346	1.65019006307191e-40	59412581	59414645
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59414898	59414898	1	0	NA	1.65019006307191e-40	59412581	59414645	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59421197	59440262	11	11	-0.6624	NA	NA	NA	1.73372719839154e-44	59440262	59440262
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	19	59440274	63788698	1993	1927	-0.0056	1.73372719839154e-44	59440262	59440262	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	12719	1506379	586	565	0.0224	NA	NA	NA	9.79686448685355e-36	1506379	1515948
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1511632	1531162	9	8	0.7242	9.79686448685355e-36	1506379	1515948	6.00846788956798e-52	1523000	1531162
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1532433	1532433	1	0	NA	6.00846788956798e-52	1523000	1531162	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	20	1544485	62419534	20983	20293	0.0054	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	9882922	10152384	19	18	-0.3084	NA	NA	NA	1.61637146441863e-15	10144881	10167413
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	10154777	18982113	1914	1858	-0.0119	1.61637146441863e-15	10144881	10167413	2.23414360745346e-24	18982113	18982113
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	18985550	19002321	6	6	0.6266	2.23414360745346e-24	18982113	18982113	9.65551662785374e-40	19002321	19002321
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	19004062	46843278	11468	11099	0.0016	9.65551662785374e-40	19002321	19002321	1.06867744723043e-45	46811528	46847350
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	21	46845053	46922972	34	33	0.2307	1.06867744723043e-45	46811528	46847350	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14513474	14513474	1	0	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	14866086	22667608	2982	2888	0.0173	NA	NA	NA	6.25423062715517e-38	22644243	22677959
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22677959	22725305	22	22	0.4693	6.25423062715517e-38	22644243	22677959	2.91916901601974e-43	22721042	22735036
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	22735036	35472378	6547	6339	0.0075	2.91916901601974e-43	22721042	22735036	2.24224301208450e-22	35472378	35472378
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35474894	35476942	2	2	-1.1052	2.2422430120845e-22	35472378	35472378	5.10130413858568e-22	35476942	35476942
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	35478503	37621766	1188	1147	0.0277	5.10130413858568e-22	35476942	35476942	8.30333724617131e-12	37621766	37621766
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37624278	37626069	2	2	0.8453	8.30333724617131e-12	37621766	37621766	4.80786373739577e-20	37626069	37626069
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	22	37633961	49571068	5813	5618	0.0157	4.80786373739577e-20	37626069	37626069	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1091	94062	6	6	0.2078	NA	NA	NA	1.06918846299493e-39	94062	94062
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	95819	104732	7	7	-1.1399	1.06918846299493e-39	94062	94062	6.18233715071447e-50	104732	104732
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	106242	218354	67	64	-0.0082	6.18233715071447e-50	104732	104732	5.64617333816457e-14	218354	218354
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	222004	223009	3	3	-0.8948	5.64617333816457e-14	218354	218354	1.04062969619708e-19	223009	223009
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	224571	742385	413	404	-0.0165	1.04062969619708e-19	223009	223009	2.08380887193878e-13	742385	742385
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	742470	747837	4	4	-0.6469	2.08380887193878e-13	742385	742385	4.86073375319588e-09	747837	748909
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	748909	845758	67	67	-0.0774	4.86073375319588e-09	747837	748909	5.56699556880621e-05	839417	849437
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	848806	859452	9	9	0.2065	5.56699556880621e-05	839417	849437	0.00140676934555240	853836	867044
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	859493	883895	16	15	-0.0691	0.0014067693455524	853836	867044	3.26010142174701e-25	883895	883895
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	884973	889079	4	4	-1.1138	3.26010142174701e-25	883895	883895	5.99547872972562e-37	889079	889079
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	889742	1427392	191	180	-0.0462	5.99547872972562e-37	889079	889079	2.29183723831301e-14	1427392	1431240
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1431240	1432953	4	4	-0.7536	2.29183723831301e-14	1427392	1431240	5.75723993134712e-18	1432891	1432953
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	1434970	2672401	975	944	-0.0334	5.75723993134712e-18	1432891	1432953	5.65388280942446e-11	2667362	2687984
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2672477	2708291	27	27	-0.2541	5.65388280942446e-11	2667362	2687984	4.31034167287326e-163	2708291	2708291
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	2711273	9106035	2084	2008	0.8734	4.31034167287326e-163	2708291	2708291	5.44607996547892e-21	9101312	9107817
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	9107817	9112386	3	3	0.2476	5.44607996547892e-21	9101312	9107817	4.06580094846974e-10	9109172	9114018
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	9114018	13679455	1988	1927	0.9334	4.06580094846974e-10	9109172	9114018	9.36566611905352e-12	13677276	13679455
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13681110	13686085	3	3	0.1988	9.36566611905352e-12	13677276	13679455	1.50860294396014e-10	13686085	13688061
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	13688061	39848060	9696	9379	0.9191	1.50860294396014e-10	13686085	13688061	7.65702549146906e-09	39846087	39848060
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	39850072	39850072	1	0	NA	7.65702549146906e-09	39846087	39848060	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	39852030	39853092	2	2	0.1064	NA	NA	NA	3.90889569912278e-07	39853092	39854597
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	39854597	55775536	5047	4890	0.8948	3.90889569912278e-07	39853092	39854597	5.10538229612593e-07	55773446	55775536
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	55775967	55775967	1	0	NA	5.10538229612593e-07	55773446	55775536	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	55782983	55783009	2	2	0.1127	NA	NA	NA	2.18280186628043e-07	55783009	55793888
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	55793888	62321946	410	390	0.9209	2.18280186628043e-07	55783009	55793888	8.61855250253232e-09	62250988	62321946
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	62390645	62418434	4	4	1.5432	8.61855250253232e-09	62250988	62321946	6.6462809361218e-10	62418434	62435471
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	62435471	146087729	22853	22144	0.9159	6.6462809361218e-10	62418434	62435471	2.77851667360963e-07	146086841	146087729
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146095685	146095707	2	2	0.143	2.77851667360963e-07	146086841	146087729	1.90933872391879e-09	146095707	146098710
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	146098710	148789720	854	835	0.9572	1.90933872391879e-09	146095707	146098710	2.20123084631893e-09	148777814	148850158
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148835531	148856479	4	4	0.3785	2.20123084631893e-09	148777814	148850158	2.41373842459541e-05	148850158	148866871
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	148859739	154442377	2148	2093	0.9131	2.41373842459541e-05	148850158	148866871	2.11298211407835e-39	154442377	154442377
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154446801	154450309	4	3	2.5249	2.11298211407835e-39	154442377	154442377	8.08264478882877e-61	154450309	154450309
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154456891	154582414	28	26	0.911	8.08264478882877e-61	154450309	154450309	6.00681244985229e-178	154582414	154582414
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154586690	154771054	115	110	0.0165	6.00681244985229e-178	154582414	154582414	3.49658761560048e-12	154764733	154780503
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	23	154771343	154888224	86	83	0.1722	3.49658761560048e-12	154764733	154780503	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2710450	2714169	4	4	-4.3578	NA	NA	NA	0.00644328059030285	2714169	2728328
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2715688	2875705	73	72	-3.0598	0.00644328059030285	2714169	2728328	2.40420266506367e-08	2865081	2888494
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	2876787	3733715	47	46	-3.9244	2.40420266506367e-08	2865081	2888494	1.55998481705485e-37	3223585	3772482
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	3772482	5672441	17	17	-0.7185	1.55998481705485e-37	3223585	3772482	6.39861114968366e-22	5531459	6688691
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	6652845	7053223	173	167	-3.1868	6.39861114968366e-22	5531459	6688691	3.01386820365105e-05	7024303	7190466
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7054924	7249762	49	46	-2.3518	3.01386820365105e-05	7024303	7190466	0.000162102629973683	7241740	7249762
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7250951	7256919	4	4	-5.0079	0.000162102629973683	7241740	7249762	0.000118208802485013	7256919	7261174
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7258171	7495687	76	73	-2.2762	0.000118208802485013	7256919	7261174	0.000129869031615047	7446842	7578636
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7568006	7608619	13	12	-3.9304	0.000129869031615047	7446842	7578636	0.00170615246993362	7600570	7630477
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7612732	7653082	18	17	-2.3048	0.00170615246993362	7600570	7630477	0.000113434954746013	7632577	7659535
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7655293	7722458	43	42	-3.5572	0.000113434954746013	7632577	7659535	3.53504146607668e-10	7716001	7731490
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7723783	7723783	1	0	NA	3.53504146607668e-10	7716001	7731490	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7726921	7782532	18	17	-1.9623	NA	NA	NA	0.000826089906610185	7755522	7807668
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7784314	7865557	31	31	-2.958	0.000826089906610185	7755522	7807668	0.0162935811676105	7832896	7893056
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7866716	7914104	9	9	-2.0064	0.0162935811676105	7832896	7893056	2.12280087290712e-07	7905553	7926989
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	7918899	8552999	155	148	-3.3873	2.12280087290712e-07	7905553	7926989	8.75861199859985e-08	8539855	8570815
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8554113	8697715	48	44	-2.6495	8.75861199859985e-08	8539855	8570815	9.33125536868914e-08	8681965	8740174
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	8698878	10515697	187	180	-3.4766	9.33125536868914e-08	8681965	8740174	1.24250975781790e-45	10513747	10515697
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	10535786	11673476	17	16	-0.4767	1.2425097578179e-45	10513747	10515697	2.95268356165596e-07	11660512	12527445
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	11698871	13128515	202	193	-2.1848	2.95268356165596e-07	11660512	12527445	2.03158949785546e-12	13066849	13149825
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13129843	13453843	128	124	-3.1236	2.03158949785546e-12	13066849	13149825	0.0390105583681336	13281871	13508638
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13454651	13603478	77	73	-3.5169	0.0390105583681336	13281871	13508638	6.07972063038291e-07	13587025	13649497
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13606316	13606316	1	0	NA	6.07972063038291e-07	13587025	13649497	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13633041	13705594	13	12	-2.3497	NA	NA	NA	1.76602637785824e-09	13701755	13717328
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13716000	13823928	28	26	-3.8791	1.76602637785824e-09	13701755	13717328	0.00101097080059912	13785396	13854447
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13828384	13868296	10	10	-2.7644	0.00101097080059912	13785396	13854447	3.99896787444676e-06	13854447	13870622
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	13869106	14046104	85	82	-3.754	3.99896787444676e-06	13854447	13870622	9.00870099005367e-19	14045293	14047049
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14047049	14070165	6	6	-1.6511	9.00870099005367e-19	14045293	14047049	3.39555143007394e-13	14069173	14070165
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14071430	14122036	29	27	-3.9684	3.39555143007394e-13	14069173	14070165	1.34566574678200e-12	14122036	14122036
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14122129	14143748	4	4	-1.5111	1.345665746782e-12	14122036	14122036	6.8455778403846e-07	14143748	14203911
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14169526	14342834	28	28	-3.5507	6.8455778403846e-07	14143748	14203911	0.0147315630097544	14323815	14416385
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14343139	14508894	97	94	-2.8562	0.0147315630097544	14323815	14416385	8.89437640302364e-11	14503927	14508894
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14524829	14547168	12	12	-0.8136	8.89437640302364e-11	14503927	14508894	0.000425027506777355	14539230	14553021
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14549297	14563486	9	9	-1.816	0.000425027506777355	14539230	14553021	3.07839306815384e-05	14559651	14563486
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14566592	14581797	5	5	-0.4813	3.07839306815384e-05	14559651	14563486	7.65030411673052e-07	14581797	14596156
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14585542	14948350	76	75	-3.2965	7.65030411673052e-07	14581797	14596156	9.62710654075957e-05	14731122	15081727
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	14952770	15284717	117	115	-2.6643	9.62710654075957e-05	14731122	15081727	1.24259972273974e-08	15260075	15301380
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15286805	15407219	78	76	-3.4318	1.24259972273974e-08	15260075	15301380	0.000158734922822749	15400529	15407219
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15408015	15412637	5	5	-1.8183	0.000158734922822749	15400529	15407219	2.85054664920977e-06	15412637	15415508
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15413514	15433122	14	14	-3.6207	2.85054664920977e-06	15412637	15415508	0.0731394005834477	15426319	15582236
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15434486	15713288	94	91	-2.8137	0.0731394005834477	15426319	15582236	9.31264379738872e-06	15614125	15727116
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15716500	15915466	32	32	-3.7675	9.31264379738872e-06	15614125	15727116	3.89850552978949e-05	15892492	15975479
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	15920478	16387273	162	159	-2.8668	3.89850552978949e-05	15892492	15975479	1.05974808316612e-08	16321288	16430865
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16399608	16679419	49	48	-3.8674	1.05974808316612e-08	16321288	16430865	0.000182957564644958	16626771	16762374
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	16680383	17751277	171	169	-3.2463	0.000182957564644958	16626771	16762374	4.12199317912978e-05	17631818	17801068
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17767311	17893954	43	43	-2.5374	4.12199317912978e-05	17631818	17801068	2.96794678363659e-10	17873030	17893954
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	17901399	17999083	17	16	-4.073	2.96794678363659e-10	17873030	17893954	0.00082083825020764	17999083	19275535
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	18002591	19610243	97	93	-3.2555	0.00082083825020764	17999083	19275535	5.22811794160716e-06	19608039	19610243
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19612530	19613864	2	2	-0.3912	5.22811794160716e-06	19608039	19610243	4.93120417939773e-05	19613864	19614809
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	19614809	20558397	228	214	-3.4612	4.93120417939773e-05	19613864	19614809	0.000209070862101315	20357413	20598388
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20585330	20633101	21	21	-2.5554	0.000209070862101315	20357413	20598388	6.08425998170997e-09	20626378	20643543
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	20634214	21036411	42	42	-3.6766	6.08425998170997e-09	20626378	20643543	6.07724674143243e-11	21034708	21041164
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21036503	21059229	10	9	-1.8902	6.07724674143243e-11	21034708	21041164	4.40420724319274e-05	21054519	21078979
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21060047	21892301	199	194	-3.3848	4.40420724319274e-05	21054519	21078979	0.00211069026674529	21680697	21952551
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	21896293	22139807	59	54	-3.9245	0.00211069026674529	21680697	21952551	5.01055168285903e-21	22058759	22139807
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22157319	22178964	10	10	-1.6692	5.01055168285903e-21	22058759	22139807	7.6467295023376e-09	22178964	22178964
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22179794	22192409	4	4	-2.9648	7.6467295023376e-09	22178964	22178964	1.88884856678116e-07	22192409	22200078
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22200078	22268552	24	24	-4.4188	1.88884856678116e-07	22192409	22200078	4.96971255605314e-06	22261337	22767553
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22308420	22308420	1	0	NA	4.96971255605314e-06	22261337	22767553	NA	NA	NA
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	22367156	22930737	63	61	-3.4589	NA	NA	NA	1.63107160929797e-49	22926726	26870361
MSK_252152912015_S01_CGH-v4_10_27Aug08	24	23283689	57440809	86	85	-1.1706	1.63107160929797e-49	22926726	26870361	NA	NA	NA
